View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18121_high_4 (Length: 436)

Name: NF18121_high_4
Description: NF18121
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18121_high_4
NF18121_high_4
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (18-416)||(43401655-43402052)
chr3 (18-397)||(49199323-49199701)
chr3 (18-416)||(43403598-43403995)
chr3 (18-397)||(6095458-6095830)
chr3 (18-397)||(46860409-46860784)
chr3 (38-397)||(30236062-30236415)
chr3 (42-397)||(41819404-41819755)
chr3 (18-397)||(54593641-54594016)
chr3 (18-397)||(36018788-36019158)
chr3 (160-397)||(34491150-34491383)
chr3 (42-397)||(47304188-47304543)
chr3 (18-251)||(55301828-55302059)
chr3 (78-251)||(40913374-40913546)
chr3 (148-397)||(4569888-4570135)
chr3 (160-390)||(19683885-19684113)
chr3 (87-389)||(46173311-46173599)
chr3 (160-361)||(7762237-7762437)
chr3 (160-390)||(44331489-44331716)
chr3 (160-390)||(45095109-45095335)
chr3 (160-390)||(40734442-40734669)
chr3 (160-379)||(40735337-40735554)
chr3 (160-390)||(29196383-29196612)
chr3 (160-390)||(9581227-9581454)
chr3 (160-390)||(29810812-29811039)
chr3 (160-390)||(31314389-31314616)
chr3 (160-390)||(44700476-44700703)
chr3 (160-390)||(37408403-37408630)
chr3 (160-379)||(51398768-51398985)
chr3 (188-390)||(5236481-5236680)
chr3 (152-379)||(9636114-9636340)
chr3 (160-391)||(9666463-9666693)
chr3 (160-379)||(16498984-16499200)
chr3 (171-390)||(22835010-22835226)
chr3 (160-379)||(29813017-29813234)
chr3 (160-390)||(5258140-5258368)
chr3 (262-397)||(31340297-31340432)
chr3 (188-390)||(760791-760991)
chr3 (160-390)||(29682303-29682530)
chr3 (171-388)||(32891049-32891264)
chr3 (160-379)||(7764422-7764636)
chr3 (160-390)||(23197935-23198161)
chr3 (160-390)||(23200134-23200360)
chr3 (160-390)||(39153358-39153585)
chr3 (160-390)||(5260319-5260547)
chr3 (171-379)||(53921511-53921717)
chr3 (152-246)||(801178-801272)
chr3 (152-246)||(7779992-7780086)
chr3 (160-390)||(23391906-23392133)
chr3 (260-394)||(5433970-5434106)
chr3 (153-246)||(45283071-45283165)
chr3 (151-232)||(3617550-3617631)
chr3 (157-246)||(6716585-6716674)
chr3 (157-246)||(54635210-54635299)
chr3 (334-394)||(55302133-55302193)
chr3 (39-141)||(5270559-5270662)
chr3 (157-232)||(25637527-25637602)
chr3 (36-386)||(35138577-35138928)
chr3 (151-232)||(4598510-4598591)
chr3 (151-232)||(10056319-10056400)
chr3 (151-232)||(10058541-10058622)
chr3 (151-232)||(10060763-10060844)
chr3 (151-232)||(10062985-10063066)
chr3 (151-232)||(10065207-10065288)
chr3 (151-232)||(10211495-10211576)
chr3 (35-289)||(20937701-20937951)
chr3 (327-397)||(40913276-40913350)
chr3 (302-376)||(26386617-26386692)
chr3 (160-289)||(32744433-32744559)
chr3 (151-232)||(4600731-4600812)
chr3 (151-232)||(10209275-10209356)
chr3 (188-379)||(23410353-23410543)
chr3 (39-180)||(31340101-31340240)
chr3 (188-231)||(27305734-27305777)
chr3 (117-394)||(26323027-26323304)
chr3 (151-203)||(10067435-10067487)
chr3 (182-289)||(33191877-33191980)
chr3 (62-140)||(1683661-1683740)
chr3 (35-121)||(5433818-5433905)
chr3 (187-226)||(5433905-5433944)
chr3 (52-126)||(49228738-49228811)
chr3 (188-233)||(2075099-2075144)
chr3 (169-251)||(4055769-4055851)
chr3 (261-289)||(3148086-3148114)
[»] chr4 (81 HSPs)
chr4 (18-397)||(2209650-2210028)
chr4 (18-397)||(41964351-41964723)
chr4 (18-397)||(379315-379690)
chr4 (39-397)||(12073329-12073681)
chr4 (18-397)||(40632382-40632755)
chr4 (18-397)||(50673706-50674077)
chr4 (89-397)||(54882957-54883260)
chr4 (89-390)||(46703443-46703740)
chr4 (114-397)||(50262651-50262929)
chr4 (78-397)||(6655893-6656205)
chr4 (87-397)||(8665344-8665648)
chr4 (38-397)||(35662377-35662730)
chr4 (87-397)||(41639363-41639666)
chr4 (57-394)||(12119477-12119815)
chr4 (87-397)||(8648075-8648379)
chr4 (90-385)||(27416896-27417180)
chr4 (160-390)||(56178633-56178860)
chr4 (85-345)||(26364225-26364479)
chr4 (160-390)||(26175633-26175860)
chr4 (53-391)||(26699335-26699671)
chr4 (162-390)||(52095361-52095586)
chr4 (160-390)||(5429623-5429850)
chr4 (151-392)||(36463378-36463615)
chr4 (160-390)||(48142986-48143215)
chr4 (160-390)||(9927455-9927681)
chr4 (160-379)||(48893635-48893856)
chr4 (164-388)||(31474096-31474318)
chr4 (162-379)||(36994478-36994693)
chr4 (160-390)||(34570411-34570638)
chr4 (188-390)||(54199930-54200130)
chr4 (160-390)||(47038408-47038633)
chr4 (148-396)||(21688186-21688432)
chr4 (35-229)||(33989948-33990138)
chr4 (160-390)||(5871764-5871991)
chr4 (160-390)||(12739547-12739774)
chr4 (160-390)||(52467351-52467579)
chr4 (162-390)||(37740570-37740794)
chr4 (160-390)||(29254438-29254665)
chr4 (204-389)||(12745476-12745659)
chr4 (206-390)||(24969055-24969238)
chr4 (188-390)||(37229745-37229947)
chr4 (160-345)||(46147388-46147570)
chr4 (263-397)||(55085462-55085596)
chr4 (160-388)||(5370079-5370308)
chr4 (152-246)||(31495304-31495398)
chr4 (164-379)||(29999806-30000019)
chr4 (202-390)||(12747794-12747980)
chr4 (38-163)||(55085320-55085442)
chr4 (202-373)||(3913408-3913578)
chr4 (259-390)||(41639207-41639338)
chr4 (160-390)||(52082660-52082881)
chr4 (160-245)||(13992289-13992374)
chr4 (151-246)||(8393479-8393575)
chr4 (151-246)||(8395688-8395784)
chr4 (18-134)||(46703742-46703859)
chr4 (164-390)||(6542180-6542405)
chr4 (160-390)||(45687179-45687407)
chr4 (202-390)||(4587902-4588089)
chr4 (160-279)||(12743922-12744038)
chr4 (160-279)||(12745311-12745427)
chr4 (35-142)||(32091627-32091733)
chr4 (80-241)||(33089970-33090128)
chr4 (188-389)||(5207866-5208066)
chr4 (302-390)||(13009567-13009655)
chr4 (151-232)||(5136165-5136246)
chr4 (151-232)||(5138390-5138471)
chr4 (304-379)||(51337018-51337094)
chr4 (151-232)||(7125002-7125083)
chr4 (204-279)||(12744087-12744160)
chr4 (188-247)||(13009468-13009527)
chr4 (52-134)||(35369343-35369425)
chr4 (260-392)||(48142472-48142605)
chr4 (114-208)||(38811144-38811235)
chr4 (62-196)||(3786097-3786228)
chr4 (151-232)||(7122783-7122864)
chr4 (164-251)||(51337145-51337231)
chr4 (152-229)||(5396700-5396775)
chr4 (260-289)||(6677514-6677543)
chr4 (160-229)||(16623322-16623389)
chr4 (164-241)||(21703836-21703912)
chr4 (315-390)||(29056301-29056377)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (18-397)||(3808562-3808940)
chr6 (18-397)||(17762926-17763301)
chr6 (6-394)||(22424670-22425056)
chr6 (18-397)||(5043564-5043938)
chr6 (18-397)||(2972794-2973170)
chr6 (18-362)||(17757994-17758334)
chr6 (18-397)||(26829979-26830355)
chr6 (148-397)||(21593601-21593846)
chr6 (18-289)||(26800632-26800897)
chr6 (38-352)||(21588913-21589220)
chr6 (78-397)||(603003-603311)
chr6 (160-390)||(9183028-9183255)
chr6 (160-390)||(5406196-5406422)
chr6 (160-390)||(5410521-5410747)
chr6 (152-390)||(2171520-2171754)
chr6 (188-390)||(28137432-28137632)
chr6 (188-390)||(3038927-3039127)
chr6 (160-390)||(5413391-5413616)
chr6 (160-379)||(31404671-31404887)
chr6 (160-379)||(16452325-16452543)
chr6 (160-390)||(26954283-26954509)
chr6 (160-361)||(30834532-30834733)
chr6 (160-390)||(33211182-33211409)
chr6 (152-246)||(3072747-3072841)
chr6 (157-246)||(6097444-6097533)
chr6 (160-251)||(5409066-5409156)
chr6 (157-246)||(412188-412277)
chr6 (160-247)||(16569107-16569193)
chr6 (160-251)||(33160348-33160439)
chr6 (190-392)||(4045364-4045566)
chr6 (151-232)||(25421406-25421487)
chr6 (153-246)||(27647946-27648039)
chr6 (157-246)||(16578511-16578601)
chr6 (157-246)||(16616779-16616869)
chr6 (157-246)||(16653197-16653287)
chr6 (151-232)||(6027347-6027428)
chr6 (151-232)||(34167180-34167261)
chr6 (52-234)||(9572689-9572868)
chr6 (157-246)||(16554954-16555044)
chr6 (157-246)||(16631510-16631600)
chr6 (151-232)||(13154015-13154096)
chr6 (151-232)||(33342092-33342173)
chr6 (151-232)||(34164958-34165039)
chr6 (80-141)||(25073762-25073823)
chr6 (152-229)||(21356029-21356104)
[»] chr1 (76 HSPs)
chr1 (18-397)||(37032927-37033304)
chr1 (25-397)||(47115108-47115475)
chr1 (18-397)||(29136184-29136557)
chr1 (38-397)||(42297850-42298206)
chr1 (39-397)||(47255216-47255571)
chr1 (22-397)||(11348635-11349006)
chr1 (18-397)||(37168234-37168605)
chr1 (90-397)||(13547020-13547320)
chr1 (39-397)||(13548879-13549231)
chr1 (38-397)||(31925585-31925937)
chr1 (18-251)||(28242386-28242615)
chr1 (87-397)||(19754431-19754734)
chr1 (151-397)||(193548-193790)
chr1 (30-397)||(7482100-7482463)
chr1 (18-397)||(34603512-34603873)
chr1 (78-397)||(19752622-19752932)
chr1 (160-379)||(8550783-8551001)
chr1 (160-390)||(28265551-28265778)
chr1 (18-251)||(37876624-37876853)
chr1 (160-374)||(49918309-49918521)
chr1 (160-361)||(3156837-3157036)
chr1 (261-397)||(37879006-37879142)
chr1 (160-379)||(4552634-4552851)
chr1 (160-379)||(28220223-28220440)
chr1 (160-379)||(31659192-31659409)
chr1 (160-390)||(834164-834391)
chr1 (160-390)||(28223418-28223645)
chr1 (160-399)||(44455095-44455331)
chr1 (160-390)||(50167172-50167399)
chr1 (160-390)||(3189275-3189502)
chr1 (160-390)||(3198092-3198319)
chr1 (160-390)||(3206931-3207158)
chr1 (160-379)||(13659333-13659550)
chr1 (196-379)||(37503589-37503768)
chr1 (160-390)||(196904-197132)
chr1 (160-379)||(46064872-46065089)
chr1 (188-389)||(1833467-1833666)
chr1 (152-390)||(41360859-41361093)
chr1 (160-388)||(13137973-13138196)
chr1 (160-390)||(20762616-20762844)
chr1 (160-390)||(10925167-10925397)
chr1 (160-390)||(3847118-3847345)
chr1 (160-390)||(50169207-50169434)
chr1 (160-334)||(13316348-13316520)
chr1 (188-392)||(15820249-15820451)
chr1 (160-379)||(45644351-45644569)
chr1 (92-251)||(2926589-2926746)
chr1 (160-379)||(37559864-37560083)
chr1 (152-246)||(9987287-9987381)
chr1 (152-246)||(20622225-20622319)
chr1 (152-246)||(40282463-40282557)
chr1 (160-246)||(51765483-51765569)
chr1 (188-390)||(23555290-23555489)
chr1 (152-246)||(9036502-9036596)
chr1 (152-246)||(21054044-21054138)
chr1 (151-232)||(44203732-44203813)
chr1 (51-289)||(6808497-6808730)
chr1 (203-367)||(16455588-16455750)
chr1 (204-390)||(30476486-30476672)
chr1 (213-390)||(928025-928202)
chr1 (160-389)||(40122193-40122421)
chr1 (317-391)||(44650314-44650389)
chr1 (35-208)||(12318397-12318568)
chr1 (35-286)||(9109292-9109540)
chr1 (187-289)||(22079361-22079462)
chr1 (35-141)||(25652272-25652379)
chr1 (188-246)||(36683766-36683824)
chr1 (352-397)||(28242325-28242370)
chr1 (334-397)||(6808382-6808446)
chr1 (182-241)||(5459997-5460056)
chr1 (188-361)||(37282715-37282887)
chr1 (317-391)||(44646935-44647010)
chr1 (191-232)||(8871089-8871130)
chr1 (169-251)||(13938218-13938300)
chr1 (261-289)||(12318618-12318646)
chr1 (349-397)||(25652022-25652070)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (18-397)||(2390219-2390595)
chr7 (18-397)||(8359177-8359548)
chr7 (18-397)||(34310572-34310947)
chr7 (18-397)||(3258931-3259304)
chr7 (18-397)||(4508564-4508937)
chr7 (28-397)||(29608673-29609037)
chr7 (18-397)||(4510406-4510779)
chr7 (18-397)||(4512248-4512621)
chr7 (42-397)||(2360859-2361203)
chr7 (89-397)||(48599264-48599565)
chr7 (152-397)||(22269910-22270151)
chr7 (168-397)||(6431908-6432134)
chr7 (152-390)||(35853859-35854094)
chr7 (160-378)||(30024729-30024945)
chr7 (160-390)||(27347761-27347988)
chr7 (160-390)||(31732966-31733193)
chr7 (188-390)||(48491523-48491723)
chr7 (160-392)||(23554982-23555212)
chr7 (202-379)||(47673981-47674157)
chr7 (160-390)||(47676133-47676360)
chr7 (160-390)||(48489375-48489602)
chr7 (114-289)||(32358009-32358177)
chr7 (160-379)||(14069830-14070047)
chr7 (160-379)||(14379858-14380075)
chr7 (160-390)||(8153286-8153513)
chr7 (202-390)||(4586105-4586291)
chr7 (160-390)||(29990999-29991225)
chr7 (160-390)||(36146405-36146633)
chr7 (188-390)||(1113601-1113801)
chr7 (160-390)||(41317431-41317658)
chr7 (152-389)||(26417261-26417494)
chr7 (162-390)||(43864188-43864413)
chr7 (160-390)||(18126588-18126815)
chr7 (55-289)||(22328285-22328514)
chr7 (164-379)||(31105394-31105607)
chr7 (160-390)||(38671219-38671446)
chr7 (152-389)||(25766948-25767180)
chr7 (39-289)||(6359829-6360075)
chr7 (160-390)||(41649008-41649234)
chr7 (152-390)||(48408747-48408984)
chr7 (188-389)||(496007-496206)
chr7 (160-330)||(25615857-25616025)
chr7 (160-390)||(19502122-19502350)
chr7 (160-390)||(4178719-4178945)
chr7 (160-246)||(39731455-39731541)
chr7 (259-390)||(12097952-12098083)
chr7 (152-246)||(43504142-43504236)
chr7 (152-246)||(24789927-24790021)
chr7 (298-390)||(4538672-4538764)
chr7 (151-232)||(18388747-18388828)
chr7 (151-232)||(18392183-18392264)
chr7 (36-142)||(1360048-1360155)
chr7 (152-246)||(1560654-1560749)
chr7 (327-397)||(6360073-6360143)
chr7 (157-246)||(20343982-20344071)
chr7 (188-384)||(23565085-23565280)
chr7 (151-232)||(6592327-6592408)
chr7 (151-232)||(6594545-6594626)
chr7 (302-390)||(24526033-24526121)
chr7 (222-376)||(31518752-31518905)
chr7 (151-232)||(32060309-32060390)
chr7 (303-390)||(2761439-2761526)
chr7 (188-390)||(4253552-4253754)
chr7 (161-286)||(2759195-2759317)
chr7 (164-241)||(18396409-18396486)
chr7 (188-374)||(23343934-23344117)
chr7 (188-251)||(24525526-24525589)
chr7 (171-251)||(31518983-31519063)
chr7 (162-235)||(30814533-30814605)
chr7 (317-390)||(24514912-24514984)
chr7 (171-251)||(3904624-3904704)
chr7 (171-232)||(26639425-26639486)
chr7 (160-228)||(12097864-12097931)
chr7 (202-251)||(5116685-5116735)
chr7 (93-137)||(43363402-43363446)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (18-386)||(17861-18223)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (18-397)||(40328716-40329085)
chr8 (21-397)||(11383923-11384291)
chr8 (39-397)||(4283461-4283812)
chr8 (18-397)||(18655337-18655712)
chr8 (114-397)||(42434946-42435222)
chr8 (78-397)||(40221682-40221994)
chr8 (78-391)||(10930116-10930424)
chr8 (18-361)||(3772164-3772501)
chr8 (160-390)||(15212730-15212957)
chr8 (160-379)||(27811232-27811449)
chr8 (160-390)||(4731602-4731829)
chr8 (160-390)||(33352094-33352321)
chr8 (160-390)||(43036367-43036594)
chr8 (160-390)||(30143286-30143511)
chr8 (160-392)||(40321022-40321251)
chr8 (160-378)||(42498149-42498366)
chr8 (188-390)||(18141764-18141964)
chr8 (188-392)||(1345395-1345597)
chr8 (202-397)||(44353729-44353923)
chr8 (202-390)||(30291549-30291737)
chr8 (160-390)||(17982597-17982825)
chr8 (160-379)||(34254327-34254543)
chr8 (160-359)||(34256503-34256700)
chr8 (160-390)||(31218201-31218429)
chr8 (152-390)||(19491688-19491922)
chr8 (160-379)||(19945355-19945574)
chr8 (160-392)||(5689213-5689442)
chr8 (160-390)||(3303667-3303894)
chr8 (170-390)||(1292471-1292687)
chr8 (161-390)||(1746216-1746442)
chr8 (160-390)||(6598916-6599143)
chr8 (160-390)||(6674369-6674596)
chr8 (161-390)||(9765693-9765914)
chr8 (164-388)||(8965692-8965914)
chr8 (160-390)||(44303798-44304027)
chr8 (152-244)||(2627824-2627916)
chr8 (160-390)||(12702631-12702862)
chr8 (160-390)||(4743211-4743427)
chr8 (157-246)||(3439589-3439678)
chr8 (157-246)||(25690040-25690129)
chr8 (160-389)||(41366612-41366837)
chr8 (164-251)||(4733787-4733873)
chr8 (188-379)||(4162454-4162640)
chr8 (171-289)||(7597659-7597776)
chr8 (151-232)||(42575311-42575392)
chr8 (169-390)||(18106087-18106302)
chr8 (188-390)||(8153705-8153902)
chr8 (35-133)||(10240318-10240417)
chr8 (35-141)||(11137213-11137320)
chr8 (87-141)||(2999730-2999784)
chr8 (151-232)||(15290624-15290705)
chr8 (151-232)||(15470993-15471074)
chr8 (169-287)||(10015128-10015241)
chr8 (213-379)||(10929753-10929907)
chr8 (179-241)||(32902188-32902250)
chr8 (262-390)||(41364943-41365071)
chr8 (188-251)||(3073898-3073960)
chr8 (182-289)||(11712018-11712124)
chr8 (164-235)||(29796320-29796391)
chr8 (260-289)||(1822337-1822366)
chr8 (260-289)||(1856782-1856811)
chr8 (173-241)||(38863949-38864017)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (21-397)||(213402-213775)
chr5 (42-395)||(27637495-27637843)
chr5 (78-397)||(40147198-40147510)
chr5 (152-397)||(28278253-28278494)
chr5 (114-397)||(5057984-5058258)
chr5 (202-397)||(38746942-38747135)
chr5 (160-390)||(533713-533940)
chr5 (160-390)||(25412706-25412932)
chr5 (160-379)||(42428427-42428644)
chr5 (160-379)||(13488157-13488374)
chr5 (162-390)||(13239696-13239921)
chr5 (91-397)||(27015469-27015758)
chr5 (188-389)||(42426259-42426458)
chr5 (160-379)||(32636778-32636995)
chr5 (160-389)||(537970-538196)
chr5 (160-390)||(13343005-13343232)
chr5 (202-390)||(39468587-39468773)
chr5 (160-379)||(8565943-8566160)
chr5 (188-390)||(28750679-28750879)
chr5 (120-379)||(33831634-33831886)
chr5 (164-379)||(16452035-16452247)
chr5 (35-397)||(16640814-16641172)
chr5 (160-390)||(30182533-30182760)
chr5 (35-289)||(316807-317060)
chr5 (160-251)||(37439222-37439313)
chr5 (157-246)||(9789217-9789306)
chr5 (157-246)||(16409561-16409650)
chr5 (157-246)||(26170848-26170937)
chr5 (157-246)||(26177968-26178057)
chr5 (160-390)||(36074039-36074268)
chr5 (152-246)||(29751148-29751242)
chr5 (188-390)||(3075682-3075882)
chr5 (157-246)||(18441641-18441730)
chr5 (190-389)||(9049368-9049565)
chr5 (60-229)||(4160702-4160866)
chr5 (152-246)||(10593343-10593438)
chr5 (171-379)||(30682930-30683134)
chr5 (152-246)||(29720450-29720544)
chr5 (152-246)||(29722610-29722704)
chr5 (153-246)||(22536279-22536372)
chr5 (259-390)||(5887509-5887640)
chr5 (164-390)||(31182917-31183138)
chr5 (192-379)||(42309963-42310149)
chr5 (151-232)||(25078221-25078302)
chr5 (151-232)||(25136190-25136271)
chr5 (151-232)||(40380191-40380272)
chr5 (151-232)||(40382402-40382483)
chr5 (151-232)||(16544509-16544590)
chr5 (151-232)||(16546731-16546812)
chr5 (18-109)||(40763200-40763288)
chr5 (63-251)||(33905927-33906118)
chr5 (188-384)||(13695714-13695910)
chr5 (302-390)||(19806328-19806415)
chr5 (160-241)||(19806454-19806534)
chr5 (18-109)||(40751195-40751283)
chr5 (35-251)||(10054689-10054904)
chr5 (323-389)||(42926838-42926904)
chr5 (91-241)||(10700580-10700725)
chr5 (323-390)||(37439078-37439144)
chr5 (105-140)||(30793320-30793355)
chr5 (164-251)||(42926972-42927058)
chr5 (261-289)||(3325958-3325986)
chr5 (37-141)||(8445882-8445983)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (18-397)||(42287969-42288341)
chr2 (87-397)||(35446812-35447115)
chr2 (22-397)||(45726866-45727233)
chr2 (18-397)||(1631591-1631963)
chr2 (65-394)||(24397993-24398324)
chr2 (18-397)||(17450527-17450883)
chr2 (36-286)||(7451166-7451410)
chr2 (160-390)||(2334414-2334641)
chr2 (160-390)||(34139767-34139995)
chr2 (160-379)||(17057366-17057583)
chr2 (160-379)||(17085349-17085566)
chr2 (160-379)||(36318006-36318223)
chr2 (160-390)||(36773506-36773733)
chr2 (35-289)||(33648216-33648465)
chr2 (160-380)||(6595002-6595221)
chr2 (160-390)||(723741-723968)
chr2 (160-390)||(29867813-29868040)
chr2 (160-390)||(38312184-38312411)
chr2 (160-390)||(5723252-5723478)
chr2 (160-392)||(33162447-33162676)
chr2 (160-390)||(36988072-36988299)
chr2 (188-390)||(42362296-42362496)
chr2 (160-390)||(45099699-45099926)
chr2 (160-390)||(14633822-14634050)
chr2 (160-390)||(11151588-11151815)
chr2 (160-390)||(11690445-11690672)
chr2 (160-390)||(4503129-4503356)
chr2 (160-390)||(11067249-11067476)
chr2 (160-390)||(30833290-30833518)
chr2 (152-246)||(6266777-6266871)
chr2 (198-390)||(13121712-13121901)
chr2 (160-390)||(36205661-36205887)
chr2 (160-390)||(4484326-4484554)
chr2 (202-390)||(7815311-7815498)
chr2 (157-246)||(32289650-32289739)
chr2 (62-289)||(30217947-30218168)
chr2 (151-232)||(12647373-12647454)
chr2 (259-390)||(24885605-24885736)
chr2 (157-246)||(13656025-13656115)
chr2 (298-390)||(39284829-39284921)
chr2 (188-289)||(17490172-17490271)
chr2 (160-235)||(39284933-39285007)
chr2 (175-241)||(28672022-28672088)
chr2 (35-208)||(42261359-42261527)
chr2 (188-390)||(11049493-11049698)
chr2 (315-390)||(5700271-5700347)
chr2 (202-390)||(14202450-14202631)
chr2 (298-390)||(12123717-12123809)
chr2 (188-285)||(26353233-26353328)
chr2 (188-233)||(42412117-42412161)
chr2 (151-208)||(2838079-2838135)
chr2 (152-208)||(1345590-1345645)
chr2 (305-392)||(17490283-17490368)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (39-386)||(7275-7617)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (152-397)||(11495-11737)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (18-251)||(10570-10799)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (259-397)||(80376-80514)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (160-379)||(149094-149311)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (162-361)||(434504-434703)
scaffold0002 (35-208)||(490194-490362)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (160-390)||(114547-114774)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (162-379)||(20414-20629)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (160-390)||(861-1087)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (160-390)||(11157-11385)
scaffold0491 (160-246)||(8731-8817)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (151-232)||(3713-3794)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (151-232)||(2591-2672)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (175-289)||(27453-27566)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (146-232)||(6373-6459)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (55-134)||(1291-1370)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (354-386)||(25000-25032)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 416
Target Start/End: Original strand, 43401655 - 43402052
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43401655 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaatcacaatctaaccaaaggataa 43401754  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43401755 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttct 43401854  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||    
T  43401855 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-aaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 43401953  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaaaagagaaccaacccatagc 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401954 tttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaatcgtttcccaactctagaaaagagaaccaacccatagc 43402052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 49199323 - 49199701
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199323 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataa 49199422  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49199423 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctct 49199522  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| |||    
T  49199523 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccat 49199621  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199622 tttcccaatctcaccaacgaacaagacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 49199701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 416
Target Start/End: Original strand, 43403598 - 43403995
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43403598 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaagcaataataacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataa 43403697  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403698 acaagataaagagagtggagaaaaataaacaacaacatcaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 43403797  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       || |||||||||||| |||||||||||||||        ||| |||||||||||| |||    
T  43403798 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-aaaacatgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccat 43403896  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaaaagagaaccaacccatagc 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43403897 tttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactttagaaaagagaaccaacccatagc 43403995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 6095458 - 6095830
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||  ||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||||    
T  6095458 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaacgaagtgtatagcaaaaccacaatccaaccaaggcataa 6095557  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6095558 acaagataaagagagtaaagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctct 6095652  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||| ||| |         |||||||||||||||| |||    
T  6095653 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctactcat 6095750  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095751 tttcccaatctcaccaatgaataagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 6095830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 46860784 - 46860409
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46860784 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaaacaacaacaacaatatagacctaatctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataa 46860685  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46860684 acaagataaagagagtaaagaaa---agataacaacaccaa-aaaatgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctct 46860589  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| |||    
T  46860588 ccaatccactatcaatgagttattacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccat 46860491  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcat--gattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46860490 tttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaa 46860409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 38 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 30236415 - 30236062
Alignment:
Q  38 taaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagag 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | ||| ||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  30236415 taaccacaagcaacaacaacaatatagacctagtctataaaccaagtgcataacaaaaacacaatccaaccaaggtataaacaagataaagagagtaaag 30236316  T
Q  138 aaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaat 237  Q
    ||||   || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30236315 aaaa---gataacaacaccaagaaattgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 30236220  T
Q  238 tcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatga 337  Q
    ||||||||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  30236219 tcttacaaagagat--acaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcatcaatga 30236122  T
Q  338 acaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30236121 acaagacactcatgattttcactatcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 30236062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Original strand, 41819404 - 41819755
Alignment:
Q  42 cacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaa 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| || | ||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41819404 cacaagcaacaacaacaatatagacctagtccataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagaaagtagagaaaa 41819503  T
Q  142 atagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
      | | ||||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41819504 --aaataacaacaccaata-aatgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttctt 41819599  T
Q  242 acaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaa 341  Q
    ||||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41819600 acaaagagat-acaaaatgggttacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaa 41819698  T
Q  342 gacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41819699 gacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaa 41819755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 54594016 - 54593641
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagga-ta 116  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || |||| ||| || | | |||||||||||| |||| ||   ||||| ||    
T  54594016 aaccaataaccaaatataaataaccacaagcaataacaagaatatagacatagtctataaaccatgtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaata 54593917  T
Q  117 aacaagataaagagag--tagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatc 214  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||    
T  54593916 aacaagataaagagagactaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagtttggtccaact-tgacatactctggaggagagattgatc 54593822  T
Q  215 tctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |     
T  54593821 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgca 54593724  T
Q  315 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593723 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 54593641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 36019158 - 36018788
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36019158 aaccaataatcaaatgtaaattaccacaagcaacaataacaatctagatctaatctagaaaacaagtgtttaacaaaaccacaatctaaccaaaggataa 36019059  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||| |  || ||  |||| ||||||||| | ||||    
T  36019058 acaagataaagagagtag---aaaaaagataacaacaccaa-aaaatgttcatccagttcggtccaacaa--acata--ctgggggagagattgacctct 36018967  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||       || |||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||| || |||    
T  36018966 ccaatccactat-aatgagttcttacaaagagat-acaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcaacccat 36018869  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018868 tttcccaatttcaccaatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 36018788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 34491383 - 34491150
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  34491383 agattgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 34491287  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcac 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| || ||||||    
T  34491286 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataacacactca-gaatttcac 34491188  T
Q  360 tctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491187 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 34491150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 47304543 - 47304188
Alignment:
Q  42 cacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagta---gaga 138  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||| ||| || | |||||||||||||||| || |   || |    
T  47304543 cacaagcaacaacaataatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaactaaggaataaacaagataaagaaagcaaaagaaa 47304444  T
Q  139 aaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaatt 238  Q
    | || ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  47304443 agaaaagataacaacaccaataaattgttgacccagttcggt-caaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 47304345  T
Q  239 cttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaa 338  Q
    ||||| |||||||       |||||||||||| |||| |||||||||||||        ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47304344 cttacgaagagatacaga--tgggttacaagatattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctcaatctcacaaatgaa 47304247  T
Q  339 caagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  47304246 caagacactcatgattttcactctcccagggtgtttaaaattgttttccaactctagaa 47304188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 55301828 - 55302059
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaac-aagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggat 115  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  55301828 aaccaataaccaaatgtgaataaaccacaagcaataaaaacaatctagatctaatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggat 55301927  T
Q  116 aaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatct 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  55301928 aaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacactaagaaat-gttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatct 55302023  T
Q  216 ctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55302024 ctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 55302059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40913546 - 40913374
Alignment:
Q  78 aacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttc 177  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40913546 aacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagattagagaaaaatagacaataacaccaagagattgttgacccagttc 40913447  T
Q  178 ggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  40913446 ggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagat 40913374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 148 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4570135 - 4569888
Alignment:
Q  148 aacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaag 247  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4570135 aacaacaccaagaaat-gttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 4570037  T
Q  248 agatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacatt 347  Q
    ||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |    
T  4570036 agatacaaa--tgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacact 4569939  T
Q  348 ca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4569938 caatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaa 4569888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 19683885 - 19684113
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  19683885 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 19683982  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19683983 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttca 19684082  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19684083 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19684113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 46173599 - 46173311
Alignment:
Q  87 atagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaacc 186  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||   |||||||||||||||| || | |  ||||  || ||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||     
T  46173599 atagcaaaaccacaatccaactaagaaataaacaagataaagaaagcaaaagaaaa--gataacaacaccaagaaattgttgatctagttcggtccaact 46173502  T
Q  187 atgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
     ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46173501 -tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaag 46173405  T
Q  287 ctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    |||        ||||||||||||||||         |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46173404 ctcacaaagaacaaccctaatttctac---------caattttaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 46173314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762237
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 7762340  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  7762339 gagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttca 7762240  T
Q  359 ctc 361  Q
    |||    
T  7762239 ctc 7762237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331489
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||       |    
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaa--t 44331620  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44331619 ggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 44331520  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44331519 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44331489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 45095335 - 45095109
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  45095335 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 45095238  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  45095237 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 45095139  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  45095138 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45095109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734442
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa--t 40734573  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40734572 gtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 40734473  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40734472 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 40734442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40735554 - 40735337
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  40735554 agattgctgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaact- 40735457  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40735456 -ggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 40735358  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    || | |||| |||||||||||    
T  40735357 cttttccaaggtgtttacaat 40735337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 29196383 - 29196612
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  29196383 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 29196479  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaa-ccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||        ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  29196480 gggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 29196579  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29196580 actcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 29196612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581227
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggat--acaaat 9581357  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| || ||||  |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  9581356 gggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccca-tttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttca 9581258  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9581257 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9581227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29811039 - 29810812
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  29811039 agattgttgacccaattcggtttaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 29810943  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29810942 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttca 29810843  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29810842 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29810812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31314616 - 31314389
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||       |    
T  31314616 agattgttgactcagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaa--t 31314520  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  31314519 gggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttca 31314420  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31314419 ctcacccaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 31314389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700703
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |    
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaa--t 44700571  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44700572 aggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 44700671  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44700672 ctcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 44700703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37408630 - 37408403
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  37408630 agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 37408533  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  37408532 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttca 37408433  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  | || |||||||||| |||||||||||    
T  37408432 ctc-actaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 37408403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51398985 - 51398768
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  51398985 agattgttgaccaagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 51398889  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  51398888 gagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttca 51398789  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    |||  |||| |||||||||||    
T  51398788 ctcatccaaggtgtttacaat 51398768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Original strand, 5236481 - 5236680
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||     
T  5236481 tgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagt 5236577  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  5236578 tcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcc 5236676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 379
Target Start/End: Original strand, 9636114 - 9636340
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9636114 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagat 9636213  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacattc-a 349  Q
            ||||||||||||||||| ||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| ||||||| || |    
T  9636214 acaaaa--gggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaa 9636311  T
Q  350 tgattttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  9636312 tgattttcactc-accaaggtgtttacaat 9636340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 391
Target Start/End: Original strand, 9666463 - 9666693
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |       |    
T  9666463 agattgttgacccagttcggtccaacttt-acctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggt--ataaat 9666559  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||        | ||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  9666560 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 9666659  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaact 391  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9666660 actcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaact 9666693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16499200 - 16498984
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  16499200 agattgttgacccagttcggtccaact-taacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--ataaat 16499104  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  16499103 gggtaacaagaaattagcttcaacaagct-tacaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 16499005  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||  ||||| |||||||||||    
T  16499004 ctaccccaaggtgtttacaat 16498984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 390
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835226
Alignment:
Q  171 ccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaaga 270  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaact-tgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa--tgggttacaaga 22835106  T
Q  271 aattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaag 369  Q
    ||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |    
T  22835107 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 22835206  T
Q  370 tgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  22835207 tgattacaa-tgtttcccaac 22835226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813017
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||       |    
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaac-atgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagat--gcaaat 29813138  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||    
T  29813137 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttca 29813038  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  29813037 ctcacccaatgtgtttacaat 29813017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 5258140 - 5258368
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  5258140 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-- 5258237  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5258238 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5258337  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  5258338 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5258368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 397
Target Start/End: Original strand, 31340297 - 31340432
Alignment:
Q  262 gttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactc 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||        |||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31340297 gttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcatgattttcactc 31340396  T
Q  362 tcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340397 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 31340432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 760991 - 760791
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  760991 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggat--acaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 760894  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||    
T  760893 tcacaaagaacagacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttataa-tgtttcc 760795  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  760794 caac 760791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682303
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaact-tgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa--t 29682434  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttca 358  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||        ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  29682433 gggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttca 29682334  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29682333 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29682303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891049
Alignment:
Q  171 ccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaaga 270  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       || |||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaac-atgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagat--acaaatgagttacaaga 32891168  T
Q  271 aattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaa 368  Q
    |||||||||||||||||||        | || | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| |||| |||||     
T  32891167 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatgatttttactcacccaag 32891068  T
Q  369 gtgtttacaattgtttccca 388  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  32891067 gtgtttacaa-tgtttccca 32891049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7764636 - 7764422
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  7764636 agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 7764539  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7764538 gagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-ccttttccc--tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 7764442  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    |||  |||| |||||||||||    
T  7764441 ctc-accaaggtgtttacaat 7764422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 23197935 - 23198161
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||            
T  23197935 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaa-- 23198032  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||| |||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  23198033 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttca 23198131  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  23198132 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23198161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 23200134 - 23200360
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||            
T  23200134 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaa-- 23200231  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||| |||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  23200232 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttca 23200330  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  23200331 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23200360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153585
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||  ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||       |    
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaact-tgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaa--t 39153454  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  39153455 gagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttca 39153554  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
     || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39153555 ttcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39153585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 5260319 - 5260547
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  5260319 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-- 5260416  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  5260417 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttc 5260516  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  5260517 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5260547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 379
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921717
Alignment:
Q  171 ccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaaga 270  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||       || |||||||||    
T  53921511 ccagttcggt-caaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaa--tgagttacaaga 53921607  T
Q  271 aattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaag 369  Q
    ||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |    
T  53921608 aattagctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 53921707  T
Q  370 tgtttacaat 379  Q
    | ||||||||    
T  53921708 tttttacaat 53921717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 801272 - 801178
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  801272 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 801178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 7779992 - 7780086
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7779992 acaccaagagattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 7780086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 23391906 - 23392133
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||       |    
T  23391906 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaa--t 23392002  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca-ttcatgattttca 358  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||        ||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  23392003 gggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttca 23392102  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23392103 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23392133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 394
Target Start/End: Original strand, 5433970 - 5434106
Alignment:
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaa-ccctaatttctacgcattttctc--aatctcaccaatgaacaagacattca-tgattt 355  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5433970 gggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctac-cattttctcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 5434068  T
Q  356 tcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactcta 394  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5434069 tcactcacc-aaggtgtttacaattgtttcccaactcta 5434106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45283165 - 45283071
Alignment:
Q  153 caccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45283165 caccaagagattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 45283071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3617631 - 3617550
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3617631 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 3617550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6716674 - 6716585
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6716674 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 6716585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 54635299 - 54635210
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54635299 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 54635210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 394
Target Start/End: Original strand, 55302133 - 55302193
Alignment:
Q  334 atgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactcta 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  55302133 atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactcta 55302193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5270662 - 5270559
Alignment:
Q  39 aaccacaagcaataacaaca-atttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagag 137  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||| || |||| |||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5270662 aaccacaagcaacaacaatagatctagatctaatctagcaaccaagtgtaatgcaaaaccacaatcgaaccaaagaataaacatgataaagagagtagag 5270563  T
Q  138 aaaa 141  Q
    ||||    
T  5270562 aaaa 5270559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25637602 - 25637527
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25637602 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 25637527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 386
Target Start/End: Original strand, 35138577 - 35138928
Alignment:
Q  36 aataaccacaagcaataacaaca-atttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagta 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||  | | ||| | |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||   ||    
T  35138577 aataaccacaagcaacaacaacatatttagatccaatctagcaattaggtgtaaaacaaaaccacaatcgaaccaaagaataaaccagataaagaattta 35138676  T
Q  135 g-agaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaat 233  Q
    | ||||||| | | || |||||||||| | |||| | ||  ||||||||||| |||||||||| | | || ||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  35138677 gaagaaaaaaaaaaaaaaacaccaaga-aatgtttatccgattcggttcaacaatgacctacttttg-ggggagattgttctcttccatccactatcaat 35138774  T
Q  234 gaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctc-ac 331  Q
    || ||| ||||||||||||        | ||| |||||||||| ||||||||| |||        ||| | |||||||||| || ||||||||||||       
T  35138775 gagttctttacaaagagatacaaaa--gagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacataatttctaccca-tttctcaatctcttt 35138871  T
Q  332 caatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgttt-acaattgtttcc 386  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35138872 ccatgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttcacaattgtttcc 35138928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 4598510 - 4598591
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  4598510 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 4598591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10056400 - 10056319
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  10056400 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10056319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10058622 - 10058541
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  10058622 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10058541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10060844 - 10060763
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  10060844 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10060763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10063066 - 10062985
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  10063066 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10062985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10065288 - 10065207
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  10065288 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10065207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10211576 - 10211495
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  10211576 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10211495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20937951 - 20937701
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaatt-tagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagt 133  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||  || |||| ||| || |||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20937951 aaataactacaagcagcaacaacaaatctagatctaatctattaatcaagtgtaaagtaaaatcacaatcgaaccaaataataaacaagataaagagagt 20937852  T
Q  134 agagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaat 233  Q
    |||||||   ||| ||| |||| ||   |||||| ||| ||||| || |||| ||||| |||| ||| |||  |||| |||||||||||| | |||||||    
T  20937851 agagaaa---agagaaccacacaaaataattgtttacctagttctgtccaactatgacatactttgggggaacgattgatctctccaatcta-tatcaat 20937756  T
Q  234 gaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    || ||| || |||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20937755 gagttcttttcaaagagatacaaaa--gggttacaagaaattaacttcaacaagctc 20937701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 40913350 - 40913276
Alignment:
Q  327 ctcaccaatgaacaagacattcatgattttcac----tctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40913350 ctcaccaatgaacaagacactcataattttcacgtactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 40913276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Original strand, 26386617 - 26386692
Alignment:
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttac 376  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26386617 cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttac 26386692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 289
Target Start/End: Original strand, 32744433 - 32744559
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||       |    
T  32744433 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgat--acaaat 32744529  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32744530 gagttacaagaaattagcttaaacaagctc 32744559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 4600731 - 4600812
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  4600731 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 4600812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10209356 - 10209275
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  10209356 aacacaaagagattggtcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10209275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 379
Target Start/End: Original strand, 23410353 - 23410543
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||       ||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  23410353 tgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaa--tgggttatacgaaattagcttaaacaagc 23410450  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||         || | |||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23410451 tcacaaagaataaacataatttctacccattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaat 23410543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Original strand, 31340101 - 31340240
Alignment:
Q  39 aaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagaga 138  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||| ||| || | |||||||||||||||| ||   | |    
T  31340101 aaccacaagcaacaacaataatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaactaaggaataaacaagataaagaaag--caaa 31340198  T
Q  139 aaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggt 180  Q
    | || ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  31340199 agaaaagataacaacaccaagaaaatgttgacccagttcggt 31340240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 27305734 - 27305777
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatca 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27305734 tgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 394
Target Start/End: Original strand, 26323027 - 26323304
Alignment:
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactct-ggaggagagatta-atc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||   |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| || ||| | || | ||     
T  26323027 aacaagataaagagagtagagaaa---agagaataacaccaaagaattgtttacccacttcggtccaacaatgacctactctagggggataaataagata 26323123  T
Q  215 tctccaatccactatcaatga-attcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctac 313  Q
    |||||| | ||||||||||||  || |||| |||| ||         ||||||||||||||||||||||||| |||        ||| |||||||| |||    
T  26323124 tctccacttcactatcaatgagttttttaccaagatatacaaaaa--ggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttac 26323221  T
Q  314 gcattttctcaatctca-ccaatgaacaagaca-ttcatgattttcactctcccaaagtgttt-acaattgtttcccaactcta 394  Q
     | |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26323222 -ccttttctcaatctcatcccatgaacaagacacttaatgatgttcactcactcaaggtgtttcccaattgtttcccaactcta 26323304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10067487 - 10067435
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggagg 203  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  10067487 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33191980 - 33191877
Alignment:
Q  182 caaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttc 280  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||         ||||||||||| ||||||||    
T  33191980 caacaatgacctcctctggag-agagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacaaagacataaaat----ggttacaagaacttagcttc 33191886  T
Q  281 aacaagctc 289  Q
    |||||||||    
T  33191885 aacaagctc 33191877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1683740 - 1683661
Alignment:
Q  62 tagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagga-taaacaagataaagagagtagagaaa 140  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| |  ||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1683740 tagatctaatctagaaacctagtgtaaaataaaaccacaatcgaaccaaaaaaataaacaagataaagagagtagagaaa 1683661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 121
Target Start/End: Original strand, 5433818 - 5433905
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatc-tagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| || ||  |||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  5433818 aaataaccacaagcaacaacaacaatctagtcctaatcatataagtcaaatgtatagcaaaaccacaatcgaaccaaagaataaacaa 5433905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Original strand, 5433905 - 5433944
Alignment:
Q  187 atgacctactctggaggagagattaatctctccaatccac 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5433905 atgacctactatggaggagagattgatctctccaatccac 5433944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 126
Target Start/End: Original strand, 49228738 - 49228811
Alignment:
Q  52 aacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataa 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| | | || ||| |||| |||||||||||||    
T  49228738 aacaacaatttagatctaatttag-aaacaagtgtatagtaaaactacattcgaacaaaagaataaacaagataa 49228811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 2075099 - 2075144
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaat 233  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2075099 tgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaat 2075144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 251
Target Start/End: Original strand, 4055769 - 4055851
Alignment:
Q  169 acccagttcggttcaaccatgacctac-tctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatga-attcttacaaagagat 251  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4055769 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagagag--atctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagat 4055851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 289
Target Start/End: Original strand, 3148086 - 3148114
Alignment:
Q  261 ggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3148086 ggttacaagaaattagcttcaacaagctc 3148114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 81)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2210028 - 2209650
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2210028 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaaacaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaatgataa 2209929  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209928 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 2209829  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||    
T  2209828 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccat 2209730  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2209729 tttcccaatctcaacaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaa 2209650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 41964723 - 41964351
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964723 aaccaacaatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataa 41964624  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    |||||||  |||||||| |||||   ||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41964623 acaagat--agagagtaaagaaa---agataacaacaccaaga-aatgctcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctct 41964531  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| |||    
T  41964530 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagggat-acaaaatgggttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 41964432  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964431 tttcccaatttcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 41964351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 379690 - 379315
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  379690 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaaacaacaacaacaatatagacctagtctataaaccaagtgcataacaaaaccacaatctaaccaaaggataa 379591  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  379590 acaagataaagagagtaaagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctct 379495  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| |||    
T  379494 ccaatccactatcaattagttcttacaaagcgat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccat 379397  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcat--gattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  379396 tttctcaatctcacaaatgaacaagatactaattgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 379315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 12073681 - 12073329
Alignment:
Q  39 aaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagaga 138  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  12073681 aaccacaagcaacaacaacaatctagatctaatctagaaaccaagtgcataacaaaaccacaatctaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaaga 12073582  T
Q  139 aaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaatt 238  Q
    ||   ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12073581 aa---agataacaacaccaaga-aatgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 12073486  T
Q  239 cttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaa 338  Q
    |||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |     
T  12073485 cttacaaagagat--acaaatgagttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaataag 12073388  T
Q  339 caagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073387 caagacactcatgattttcacactcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 12073329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 40632755 - 40632382
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggata 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | | |||| | || ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  40632755 aaccaataaccaaatgtaaataaaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctatataccaagtgcatggcaaaaccacaattcaaccaaaggata 40632656  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| | |||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  40632655 aacaagataaagagagta---aaaaaaagataacaacaccaaga-aatgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctc 40632561  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||| ||    
T  40632560 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctaccca 40632463  T
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40632462 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaa 40632382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 50673706 - 50674077
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagga-ta 116  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||| |||| ||   ||||| ||    
T  50673706 aaccaataaccaaatgtaaatcaccataagcaataacaacaatatagatctagtctataat-caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaata 50673804  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50673805 aacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacctagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctc 50673899  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| ||    
T  50673900 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctc-acaaagacaatcctaatttctactca 50673996  T
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50673997 ttttctcaatctcacaaatgaacacgacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaa 50674077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 89 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 54883260 - 54882957
Alignment:
Q  89 agcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccat 188  Q
    |||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  |    
T  54883260 agcaaaaccacaattcaaccaaagaataaataagataaagagagtaaagaaaaa--gataacaacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaact-t 54883164  T
Q  189 gacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagct 288  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54883163 gacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagct 54883066  T
Q  289 cnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttccca 388  Q
    |        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54883065 cacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 54882966  T
Q  389 actctagaa 397  Q
    |||||||||    
T  54882965 actctagaa 54882957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 89 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 46703740 - 46703443
Alignment:
Q  89 agcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccat 188  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||    
T  46703740 agcaaaaccacaatctaaccaaatgataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccaattcggtccaacaat 46703645  T
Q  189 gacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagct 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46703644 gacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagat-acaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagct 46703546  T
Q  289 cnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttccc 387  Q
    |        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46703545 cacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccc 46703446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 397
Target Start/End: Original strand, 50262651 - 50262929
Alignment:
Q  114 ataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaat 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  50262651 ataaacaagataaaaagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgat 50262750  T
Q  214 ctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctac 313  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |     
T  50262751 atctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgat 50262848  T
Q  314 gcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
     ||||||| ||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50262849 ccattttcccaatct---caataaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctagaa 50262929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6656205 - 6655893
Alignment:
Q  78 aacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttc 177  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  6656205 aacaagtgcatagcaaaaccacaatccaacaaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccaattc 6656110  T
Q  178 ggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagc 277  Q
    ||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||||||||||||    
T  6656109 ggtccaact-tgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagc 6656013  T
Q  278 ttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttaca 377  Q
    ||||||||| ||        ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6656012 ttcaacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttcaatctcacaagtgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttaca 6655913  T
Q  378 attgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6655912 attgtttcccaactctagaa 6655893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 87 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8665648 - 8665344
Alignment:
Q  87 atagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaacc 186  Q
    |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||     
T  8665648 atagcaaaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gtacacctagtttggtccaact 8665553  T
Q  187 atgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665552 -tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaag 8665456  T
Q  287 ctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttc 385  Q
    |||        |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8665455 ctctcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacaattgtttc 8665356  T
Q  386 ccaactctagaa 397  Q
    ||||||| ||||    
T  8665355 ccaactccagaa 8665344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 35662730 - 35662377
Alignment:
Q  38 taaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagag 137  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||  || |||| ||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  35662730 taaccataagcaacaacaacaatatagacatagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaag 35662631  T
Q  138 aaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaat 237  Q
    ||||   || ||||||||||| | || |||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  35662630 aaaa---gataacaacaccaaaaaat-gttcattcagttcggtccaact-tgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagt 35662536  T
Q  238 tcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatga 337  Q
    ||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35662535 tcttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcataaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatga 35662438  T
Q  338 acaagacattcatga-ttttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35662437 acaagacactcatgatttttcacactctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 35662377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 87 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 41639666 - 41639363
Alignment:
Q  87 atagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaacc 186  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    || ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||     
T  41639666 atagcaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaac---gataacaacaccaagaaat-gttcactcagttcggtccaact 41639571  T
Q  187 atgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||| |||    
T  41639570 -tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaag 41639474  T
Q  287 ctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
     ||        |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41639473 ttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacactcgtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtttcc 41639374  T
Q  387 caactctagaa 397  Q
    |||||||||||    
T  41639373 caactctagaa 41639363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12119815 - 12119477
Alignment:
Q  57 caatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagaga-aaaatagacaacaacac 155  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  12119815 caatctagatctaatctagaaactaagtgcatagcaaaaccacaatcggaccaaagactaaacaagataaagagagtagagaaaaaatagatgacaacac 12119716  T
Q  156 caagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagatnnn 254  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||       
T  12119715 caagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagataca 12119617  T
Q  255 nnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tga 352  Q
         ||||||||||||||||||||||| ||| ||        | |||| |||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  12119616 aaa--gggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacctatgaacaagacactcattga 12119519  T
Q  353 ttttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactcta 394  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12119518 ttttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactcta 12119477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8648379 - 8648075
Alignment:
Q  87 atagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaacc 186  Q
    |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||     
T  8648379 atagcaaaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagtttggtccaact 8648284  T
Q  187 atgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||     
T  8648283 -tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttataagaaattagcttcaacaaa 8648187  T
Q  287 ctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttc 385  Q
    |||        |||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  8648186 ctcacaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacagttgtttc 8648087  T
Q  386 ccaactctagaa 397  Q
    | ||||| ||||    
T  8648086 ctaactccagaa 8648075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Original strand, 27416896 - 27417180
Alignment:
Q  90 gcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatg 189  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||  ||    
T  27416896 gcaaaaccacaatccaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaagacaa---gataacaacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaact-tg 27416990  T
Q  190 acctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416991 acctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 27417088  T
Q  290 nnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttc 385  Q
            |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  27417089 acaaagaacaaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc----tgtttacaattgtttc 27417180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 56178633 - 56178860
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  56178633 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 56178730  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  56178731 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 56178830  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  56178831 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 56178860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26364479 - 26364225
Alignment:
Q  85 gtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaa 184  Q
    |||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||    
T  26364479 gtatagcaaaaccacaatccaagcaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaattgttgacccagttcagt-caa 26364384  T
Q  185 ccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaaca 284  Q
     | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||    
T  26364383 acttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaaca 26364286  T
Q  285 agctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca 345  Q
    || ||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26364285 agttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 26364225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 26175633 - 26175860
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  26175633 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 26175729  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26175730 gggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 26175829  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26175830 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26175860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 391
Target Start/End: Original strand, 26699335 - 26699671
Alignment:
Q  53 acaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaa 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||      
T  26699335 acaacaatctagatctaatctagaatccaagtgcatagcaaaaccataattgaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaagaaa---agataacgg 26699431  T
Q  153 caccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagat 251  Q
    ||| |||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  26699432 cactaagaaatt-tttacccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagat 26699530  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcatt-ttctcaatctcaccaatgaacaagacattc- 348  Q
            | ||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||| | ||| | || |||| |||||| | ||| ||||||||||||     
T  26699531 acaaaa--gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctataccctttcttctgaatctctctaataaacaagacattca 26699628  T
Q  349 atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaact 391  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26699629 atgattttcactcacccaaagtgtttacaattgtttcccaact 26699671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 162 - 390
Target Start/End: Original strand, 52095361 - 52095586
Alignment:
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgg 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |||    
T  52095361 attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagat--acaaatgg 52095457  T
Q  262 gttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcact 360  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  52095458 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 52095557  T
Q  361 ctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52095558 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 52095586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429623
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       |    
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaact-taacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaa--t 5429754  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5429753 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5429654  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5429653 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5429623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 392
Target Start/End: Original strand, 36463378 - 36463615
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagaga 250  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  36463378 aacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagaga 36463475  T
Q  251 tnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-a 349  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  36463476 t--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa 36463573  T
Q  350 tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactc 392  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36463574 tgaatttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 36463615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48143215 - 48142986
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||            
T  48143215 agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaa-- 48143118  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttcta-cgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  48143117 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 48143018  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48143017 actcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48142986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 9927455 - 9927681
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  9927455 agattgttgactcagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 9927551  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  9927552 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttca 9927651  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  9927652 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9927681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 48893635 - 48893856
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |    
T  48893635 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaa--t 48893731  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnn----caaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48893732 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatt 48893831  T
Q  355 ttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  48893832 ttcactcacccaaggtgtttacaat 48893856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 31474318 - 31474096
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggt 263  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       || ||    
T  31474318 tgtttacccagttcggtccaact-tgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgagt 31474222  T
Q  264 tacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac-cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactc 361  Q
    |||||||||||||||||||||| |||        |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31474221 tacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 31474122  T
Q  362 tcccaaagtgtttacaattgtttccca 388  Q
     |||||||||||||||| |||||||||    
T  31474121 acccaaagtgtttacaa-tgtttccca 31474096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36994693 - 36994478
Alignment:
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgg 261  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |||    
T  36994693 attgttgacccagttcggtccaact-tgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa--tgg 36994597  T
Q  262 gttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcact 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36994596 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 36994497  T
Q  361 ctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  36994496 cacccaaggtgtttacaat 36994478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 34570411 - 34570638
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||  | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  34570411 agattgttgacccagttcgatccaact-taacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaatt 34570507  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34570508 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 34570607  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| |||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  34570608 ctcacccaagatgttttcaa-tgtttcccaac 34570638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Original strand, 54199930 - 54200130
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||     
T  54199930 tgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagt 54200027  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  54200028 tcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcc 54200126  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  54200127 caac 54200130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 47038408 - 47038633
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||            
T  47038408 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaat-- 47038504  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47038505 -gattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc-caatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 47038602  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  47038603 ctcacccaaggtgtttataa-tgtttcccaac 47038633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21688432 - 21688186
Alignment:
Q  148 aacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaag 247  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||  |||  ||||||| ||| | |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||    
T  21688432 aacaacaccaagaaattgttgactcaattcggtctaact-tgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttccgaag 21688334  T
Q  248 agatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcatttt-ctcaatctcaccaatgaacaagacat 346  Q
    ||||       || ||||||| ||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  21688333 agatacaaa--tgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccgatgaacaagacac 21688236  T
Q  347 tcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctaga 396  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21688235 tcatgattttcactcccccaaggtgtttagaattgtttcccaactctaga 21688186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33990138 - 33989948
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagta 134  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33990138 aaataaacacaagcaacaacaacaatctagatctaatctagaaaccaagtgcatagcaaatccagaattgaaccaaagaataaacaagataaagagagta 33990039  T
Q  135 gagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactat 229  Q
    || ||||||  | || |||||||||| | |||| |||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33990038 ga-aaaaat--ataataacaccaaga-aatgtttacccagttcaatccaagaatgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat 33989948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5871991 - 5871764
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||       |    
T  5871991 agattgttgacccagttcggt-caaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaa--t 5871895  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||        ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5871894 gggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5871795  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5871794 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5871764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 12739547 - 12739774
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||       |    
T  12739547 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagat--acaaat 12739643  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  12739644 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttcca 12739743  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| || || |||||||||| |||||||||||    
T  12739744 ctcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12739774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 52467351 - 52467579
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||       |    
T  52467351 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaa--t 52467447  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttca 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  52467448 gggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 52467547  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52467548 ctcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 52467579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 162 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37740794 - 37740570
Alignment:
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgg 261  Q
    |||||| || ||||||||| ||||  ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||    
T  37740794 attgttgacacagttcggtccaact-tgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgg 37740698  T
Q  262 gttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcact 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37740697 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcact 37740598  T
Q  361 ctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  37740597 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 37740570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29254665 - 29254438
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        |    
T  29254665 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagaga--cacaaat 29254569  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||        |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29254568 gggttgcaagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 29254469  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
     || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29254468 ttcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 29254438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 389
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745659
Alignment:
Q  204 agagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccc 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||  ||||| ||        ||||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccc 12745573  T
Q  304 taatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaa 389  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12745574 taatttctacccattttcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-attgtttcccaa 12745659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969055
Alignment:
Q  206 agattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaacccta 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||        |||  |||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaa--tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatcta 24969141  T
Q  306 atttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24969140 atttctacccatttttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 24969055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Original strand, 37229745 - 37229947
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||        ||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  37229745 tgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaa-gggttacaacaaatttgctttaacaagc 37229843  T
Q  288 tcnnnnnnnnca-accctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttc 385  Q
    ||        || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||     
T  37229844 tcacaaagaacacaccctaatttctac-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttt 37229942  T
Q  386 ccaac 390  Q
    |||||    
T  37229943 ccaac 37229947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 345
Target Start/End: Original strand, 46147388 - 46147570
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |    
T  46147388 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagat--acaaat 46147484  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca 345  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  46147485 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccgatgaacaagaca 46147570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 263 - 397
Target Start/End: Original strand, 55085462 - 55085596
Alignment:
Q  263 ttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactc 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  55085462 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctattttc-caatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactc 55085560  T
Q  362 tcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55085561 acccaaggtgtttacaattgtttccgaactctagaa 55085596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 5370079 - 5370308
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||            
T  5370079 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 5370176  T
Q  260 gggttacaagaaattagc-ttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttct---caatctcaccaatgaacaagacattc-atgatt 354  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| ||        ||||||||||||||||   |||| |   ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5370177 gggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatt 5370276  T
Q  355 ttcactctcccaaagtgtttacaattgtttccca 388  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  5370277 ttcactc-accaaagtgtttacaa-tgtttccca 5370308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 31495304 - 31495398
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31495304 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaa 31495398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 379
Target Start/End: Original strand, 29999806 - 30000019
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatnnnnnnntggg 262  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||        | |    
T  29999806 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaa--gag 29999903  T
Q  263 ttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactc 361  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  29999904 ttacaagaaattagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactc 30000002  T
Q  362 tcccaaagtgtttacaat 379  Q
      |||| |||||||||||    
T  30000003 -accaaggtgtttacaat 30000019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747980
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||       |||||||||||||||||||||  ||||| ||        ||||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaa--tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaac 12747891  T
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||    
T  12747892 cctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12747980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Original strand, 55085320 - 55085442
Alignment:
Q  38 taaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagag 137  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  55085320 taactacaagcaataacaacaatctagatctaatttagaaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaag 55085419  T
Q  138 aaaaatagacaacaacaccaagagat 163  Q
    |||   ||| ||||||||||||||||    
T  55085420 aaa---agataacaacaccaagagat 55085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3913578 - 3913408
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||       ||||||| ||||||||||||||||||| |||        || |    
T  3913578 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaa--tgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagc 3913481  T
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtt 373  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  3913480 tctaatttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41639338 - 41639207
Alignment:
Q  259 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |         |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||    
T  41639338 tgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacactcgtgattttca 41639239  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  41639238 ctctcctaaggtgtttacaattgttacccaac 41639207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 52082660 - 52082881
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||  |||||  || | ||||||||||||||||||||| | |||||       ||||||||| || |||||||||||||||       |    
T  52082660 agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttacaaagagatacaaa--t 52082750  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||        |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  52082751 gggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttca 52082850  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52082851 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 52082881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 245
Target Start/End: Original strand, 13992289 - 13992374
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaa 245  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13992289 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaa 13992374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8393575 - 8393479
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8393575 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 8393479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8395784 - 8395688
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8395784 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 8395688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46703859 - 46703742
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaattta--gatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggat 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  || ||| |||| ||  |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46703859 aaccaataaccaaatgtaaataacctcaagcaacaacaacaatatatagacctattctataat-caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggat 46703761  T
Q  116 aaacaagataaagagagta 134  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46703760 aaacaagataaagagagta 46703742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 390
Target Start/End: Original strand, 6542180 - 6542405
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggt 263  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||        || |    
T  6542180 tgtttacccagttcggtccaact-tgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaa--ggct 6542276  T
Q  264 tacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgca--ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcac 359  Q
     |||||||||||| ||||||||||||        | || |||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  6542277 aacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctac-cattttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaataattttcac 6542375  T
Q  360 tctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6542376 tcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6542405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 45687179 - 45687407
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       |    
T  45687179 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagat--acaaat 45687275  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    | |||| |||||||||||||  ||||||||        | || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  | ||||    
T  45687276 gagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttc 45687375  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45687376 actcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45687407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4588089 - 4587902
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aa 300  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||         | ||    
T  4588089 ggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa--gggttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaa 4587992  T
Q  301 ccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
     | ||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4587991 tcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4587902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 279
Target Start/End: Original strand, 12743922 - 12744038
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  12743922 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 12744018  T
Q  260 gggttacaagaaattagctt 279  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12744019 gggttacaagaaattagctt 12744038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 279
Target Start/End: Original strand, 12745311 - 12745427
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  12745311 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 12745407  T
Q  260 gggttacaagaaattagctt 279  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12745408 gggttacaagaaattagctt 12745427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 32091733 - 32091627
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagta 134  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  32091733 aaataactataagtaataacaacaatttagatctaatctagcaaacaagtgtaaag-aaaaccacaattgaactaaagaataaacaagataaagagcgta 32091635  T
Q  135 gagaaaaa 142  Q
    ||||||||    
T  32091634 gagaaaaa 32091627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33090128 - 33089970
Alignment:
Q  80 caagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcgg 179  Q
    |||| ||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||  |||   |||||| | | ||| |||    
T  33090128 caagtgtaaagcaaaaccacaatcgaaccaaaaaataaacaagataaagagagcagagaaaa---gagaacaacttcaaagaattgtttatctagtccgg 33090032  T
Q  180 ttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33090031 tccaacaataacctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctt 33089970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 389
Target Start/End: Original strand, 5207866 - 5208066
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        ||||| ||| |||||||||||||||||     
T  5207866 tgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaa--gggttgcaataaattagcttcaacaagt 5207963  T
Q  288 tcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca-ttcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttc 385  Q
    ||        | ||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5207964 tcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttc-caatcactccaatgaacaagtcactaaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttc 5208062  T
Q  386 ccaa 389  Q
    ||||    
T  5208063 ccaa 5208066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 390
Target Start/End: Original strand, 13009567 - 13009655
Alignment:
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13009567 cctaatttctacccattttcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13009655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5136246 - 5136165
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  5136246 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 5136165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5138471 - 5138390
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  5138471 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 5138390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51337094 - 51337018
Alignment:
Q  304 taatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  51337094 taatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 51337018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7125083 - 7125002
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||     | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  7125083 aacacaaagagattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 7125002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 279
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744160
Alignment:
Q  204 agagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagctt 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagctt 12744160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 13009468 - 13009527
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaag 247  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13009468 tgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 13009527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 35369343 - 35369425
Alignment:
Q  52 aacaacaatt-tagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagta 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  35369343 aacaacaattctagatctaatctagaaa-caagtgtaaagcaaaactataatcaaagcaaaaaataaacaagataaagagagta 35369425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 392
Target Start/End: Original strand, 48142472 - 48142605
Alignment:
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaa-ccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttc 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||        ||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  48142472 gggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctat-catgttcccaatctcatcaatgggcaagacactcaatgattttc 48142570  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactc 392  Q
    |||| ||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  48142571 actcacccgaagtgtttaaaaatgtttcccaactc 48142605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 208
Target Start/End: Original strand, 38811144 - 38811235
Alignment:
Q  114 ataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacacc-aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||    
T  38811144 ataaacaatataaagagagtagagaaaa---gagaacaacaccgaaga-attgtttacccagttcggtccaacaatgacctactcttggggagaga 38811235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3786228 - 3786097
Alignment:
Q  62 tagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagag 161  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||| | |||||  | |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||       
T  3786228 tagatctaatatagcaaccaagtgtaaaacaaaattacaatcgaaccaaagaatgaacaagataaagagagtagagaaa---agagaacaacaccaaata 3786132  T
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctact 196  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  3786131 attgttaactcagtttggtacaacaatgacctact 3786097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7122864 - 7122783
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||     | ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  7122864 aacacaaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 7122783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337145
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtccaact-tgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagat 51337145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5396775 - 5396700
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactat 229  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  5396775 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6677543 - 6677514
Alignment:
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6677543 gggttacaagaaattagcttcaacaagctc 6677514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16623389 - 16623322
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactat 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  16623389 agattgttgacccagttcggttcaa-tatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 16623322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Original strand, 21703836 - 21703912
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21703836 tgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactatgg-ggatagattgatatctccaatccactgtcaatgagttctt 21703912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29056377 - 29056301
Alignment:
Q  315 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  29056377 cattttcccaatctctctaatgaacaaaacactcaatgatttttactcacccaaggtgtttccaaatgtttcccaac 29056301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 3808562 - 3808940
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808562 aaccaataatcaaatgtaaataaccaaaagcaatagcaacaatctagatctaatctagaaaacaaatgcatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 3808661  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3808662 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaaccccaagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctct 3808761  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||  ||    
T  3808762 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctat 3808860  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808861 tttcccaatctcaccaatgaacaagacacttgtgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 3808940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17763301 - 17762926
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  17763301 aaccaataaccaaatgtaaataatcacaaacaataacaacaatctagatctaatctagataacaagtgcatagcaaaactacaatctaaccaaaggatga 17763202  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||  | || || ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17763201 acaagataaagagagt--aaaagaaaagataacaacaccaaga-aatgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcact 17763105  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||       || ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||    
T  17763104 ccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 17763007  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17763006 tttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctctcaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 17762926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 394
Target Start/End: Original strand, 22424670 - 22425056
Alignment:
Q  6 agtagcaaaggtaaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtat--agcaaaaccataatc 103  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||  |  ||||||| ||||    
T  22424670 agtatcaatggtaaccaataaccaaatgtaaataaccacaaacaacaacaacaatctagatctaatatagaaaccaagtgcattgaaaaaaaccacaatc 22424769  T
Q  104 taaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggagg 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||    
T  22424770 taacctaaggataaacaagataaagagagtagagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaagg 22424865  T
Q  204 agagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccc 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||    
T  22424866 agagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccc 22424964  T
Q  304 taatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactcta 394  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22424965 taatttctacccatttttccaatctcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactcta 22425056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 5043938 - 5043564
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaattta--gatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggat 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  || ||| |||| ||  |||| | |||||||||||| |||| ||||||   ||    
T  5043938 aaccaataaccaaatgtaaataacctcaagcaacaacaacaatatatagacctattctataat-caagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaagaaat 5043840  T
Q  116 aaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatct 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5043839 aaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatct 5043744  T
Q  216 ctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc 315  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| |    
T  5043743 ctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactc 5043646  T
Q  316 attttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043645 attttctcaatctcacgaatgaacaagacactcatgattttcactctcacaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 5043564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 2972794 - 2973170
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaa-ccataatctaaccaaaggata 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||| |||  ||| | |||| |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  2972794 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaaacaacaacaacaatatagacctagtctataaactaagtgcatagaaaaaaccacaatctaaccaaatgata 2972893  T
Q  117 aacaagataaagagagtagag-aaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatct 215  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| | | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2972894 aacaagatatagagag-agagtaaaaaaaaataacaacaccaagaaat-gttcacctagttcggtcgaact-tgacctactcttgaggagagattgatct 2972990  T
Q  216 ctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| |    
T  2972991 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccc 2973088  T
Q  316 attttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973089 attttcccaatctcaccaatgaacacgacacttatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 2973170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17758334 - 17757994
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17758334 aaccaataaccaaatgtaaataaccgcaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataa 17758235  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||| ||  | ||  | ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  17758234 acaagataaagagcgt--aaaaggaaagataacaacaccaaga-aatgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctct 17758138  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||    
T  17758137 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 17758040  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactct 362  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  17758039 tttcccaatctcacaaatgaagaagacactcatgaattttcactct 17757994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 26829979 - 26830355
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagga-ta 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||| ||   ||||| ||    
T  26829979 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatataaacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaata 26830078  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    |||||||||||||||| ||  || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26830079 aacaagataaagagag-agtaaagaaaagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcagt-caaacttgacctactttggaggagagattgatctc 26830175  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||| ||    
T  26830176 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctaccca 26830273  T
Q  317 ttttctcaatctca-ccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26830274 tttttccaatctcacccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaa 26830355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21593846 - 21593601
Alignment:
Q  148 aacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaag 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21593846 aacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 21593749  T
Q  248 agatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacatt 347  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21593748 agatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 21593651  T
Q  348 catgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593650 catgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 21593601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26800897 - 26800632
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26800897 aaccaataaccaaatgtaaattaccacaagcaataacaacaatctagatctagtctagaaaacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaagataa 26800798  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26800797 acaagataaaaagagtagagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctct 26800702  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||       |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26800701 ccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatt-agttacaagaaattagcttcaacaagctc 26800632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21589220 - 21588913
Alignment:
Q  38 taaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagag 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||| || |||| ||    
T  21589220 taaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaactaaggaataaacaagataaggaaagtaaag 21589121  T
Q  138 aaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaat 237  Q
    ||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  21589120 aaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 21589026  T
Q  238 tcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatga 337  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21589025 tcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatga 21588928  T
Q  338 acaagacattcatga 352  Q
    |||||||| ||||||    
T  21588927 acaagacactcatga 21588913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 78 - 397
Target Start/End: Original strand, 603003 - 603311
Alignment:
Q  78 aacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttc 177  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  603003 aacaagtgcatagtaaaaccacaatccaaccaaggcataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacatcaagagattgttgacccagttc 603102  T
Q  178 ggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagc 277  Q
    ||| ||| | ||||||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  603103 ggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagc 603199  T
Q  278 ttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttaca 377  Q
    ||||||||||||        |||| | ||||||||        | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  603200 ttcaacaagctcacaaagaacaacacaaatttcta--------cccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactatcccaaggtgtttaca 603291  T
Q  378 attgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  603292 attgtttcccaactctagaa 603311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 9183028 - 9183255
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  9183028 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 9183124  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9183125 gggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 9183224  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9183225 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9183255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 5406196 - 5406422
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  5406196 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 5406293  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5406294 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5406392  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  5406393 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5406422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 5410521 - 5410747
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  5410521 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 5410618  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5410619 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5410717  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  5410718 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5410747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 390
Target Start/End: Original strand, 2171520 - 2171754
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2171520 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 2171619  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-at 350  Q
            ||||||||||||||||||||  ||||| ||        ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  2171620 acaaa---gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 2171716  T
Q  351 gattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  2171717 gattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2171754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Original strand, 28137432 - 28137632
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28137432 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaa--tgggttacaagaaattagcttaaacaagc 28137529  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  28137530 tcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcc 28137628  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  28137629 caac 28137632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Original strand, 3038927 - 3039127
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3038927 tgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaaaaagc 3039024  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  3039025 tcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcc 3039123  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  3039124 caac 3039127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 5413391 - 5413616
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  5413391 agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 5413487  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5413488 gggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctac-ctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5413586  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  5413587 ctc-accaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 5413616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 31404671 - 31404887
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  31404671 agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 31404768  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  31404769 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-cattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttca 31404867  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    |||  |||| |||||||||||    
T  31404868 ctc-accaaggtgtttacaat 31404887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 16452325 - 16452543
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  16452325 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaa-- 16452422  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16452423 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 16452522  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||||  |||| |||||||||||    
T  16452523 actc-accaaggtgtttacaat 16452543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954509
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaact-tgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acagat 26954379  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  26954380 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttatac-caatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttca 26954478  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| || || |||||||||| |||||||||||    
T  26954479 ctccccaaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26954509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 361
Target Start/End: Original strand, 30834532 - 30834733
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  30834532 agattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-- 30834629  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30834630 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 30834729  T
Q  358 actc 361  Q
    ||||    
T  30834730 actc 30834733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211409
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||       |    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagat--acaaat 33211278  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | | |||||||||||| ||||| |||||||        ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  33211279 gagctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttca 33211378  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
     |  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33211379 gtgacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33211409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 3072747 - 3072841
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3072747 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaa 3072841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 6097444 - 6097533
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6097444 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 6097533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 251
Target Start/End: Original strand, 5409066 - 5409156
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5409066 agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 5409156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 412277 - 412188
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  412277 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaa 412188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16569193 - 16569107
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaag 247  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16569193 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 16569107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 251
Target Start/End: Original strand, 33160348 - 33160439
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33160348 agattgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagat 33160439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4045566 - 4045364
Alignment:
Q  190 acctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt-acaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagct 288  Q
    ||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4045566 acctactttggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaat--gattacaagaaattagcttcaacaagct 4045469  T
Q  289 cnnnnnnnncaa-ccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    |        ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  4045468 cataaagaacaaaccctaatttctac-cattttcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttcc 4045370  T
Q  387 caactc 392  Q
    ||||||    
T  4045369 caactc 4045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25421487 - 25421406
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25421487 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 25421406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27648039 - 27647946
Alignment:
Q  153 caccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27648039 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 27647946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 16578511 - 16578601
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16578511 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 16578601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16616869 - 16616779
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16616869 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 16616779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16653287 - 16653197
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16653287 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 16653197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6027428 - 6027347
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6027428 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 6027347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34167261 - 34167180
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  34167261 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 34167180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9572868 - 9572689
Alignment:
Q  52 aacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaaca 151  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| |||| || ||||| ||| | |||||||||| |  ||||||||   || ||||    
T  9572868 aacaataatctagatctaatctagaaaccaagtgcatagaaataccacaatcgaatcaaagaatagataagataaagacacgagagaaaa---gataaca 9572772  T
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatg 234  Q
    ||| ||||| ||  || |||||||||| |||||  ||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9572771 acatcaagaaatattttacccagttcgtttcaatgatgacctactctaaagtagagattgatctctgcaatccactatcaatg 9572689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16555044 - 16554954
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16555044 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 16554954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16631600 - 16631510
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16631600 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 16631510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13154096 - 13154015
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  13154096 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 13154015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 33342092 - 33342173
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  33342092 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 33342173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34165039 - 34164958
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  34165039 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 34164958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25073823 - 25073762
Alignment:
Q  80 caagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaa 141  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25073823 caagtgtattgcaaaaccaatatcaaaccaaagaataaacaagataaagagagcagagaaaa 25073762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 229
Target Start/End: Original strand, 21356029 - 21356104
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactat 229  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  21356029 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 76)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 37032927 - 37033304
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  37032927 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaatcacactctaaccaaaggataa 37033026  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37033027 acaagataaagagagtagag-aaaatagacaacaacacgaatagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctct 37033125  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||    
T  37033126 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-gcaaaatggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 37033224  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37033225 tttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 37033304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 47115475 - 47115108
Alignment:
Q  25 aatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagat 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47115475 aatcaaatgtaaataatcacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcataacaaaaccacaatctaacaaaaggataaacaagat 47115376  T
Q  125 aaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatcc 224  Q
    ||| |||| |||||||   ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47115375 aaaaagagcagagaaa---agataacaacatcaaga-aatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatcc 47115280  T
Q  225 actatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctca 324  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||  |||||| ||    
T  47115279 actatcaatgggtttttacaaagagat-acaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttccca 47115181  T
Q  325 atctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115180 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaa 47115108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 29136557 - 29136184
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29136557 aaccaataaccaaatataactaaccacaagcaataacaacaaaatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataa 29136458  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29136457 acaagataaagagagtagagaaaaatag---acagcaccaaga-aatgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctct 29136362  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||       |||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||    
T  29136361 ccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaat--acaaatgggttccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 29136264  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29136263 tttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcacaactctagaa 29136184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 38 - 397
Target Start/End: Original strand, 42297850 - 42298206
Alignment:
Q  38 taaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagag 137  Q
    |||||| |||||||||||| ||| || | | | |||| ||| |||| | ||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  42297850 taaccataagcaataacaataatatataccaagtctataaaccaagtgcatagcaaaatcacaatccaaccaaataataaacaagataaa-agagtaaag 42297948  T
Q  138 aaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  42297949 aaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagt 42298048  T
Q  238 tcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatga 337  Q
    ||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42298049 tcttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatga 42298146  T
Q  338 acaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42298147 acaagacactcatgatttttactctcccaaggtgtttacaattgtttcacaactctagaa 42298206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 397
Target Start/End: Original strand, 47255216 - 47255571
Alignment:
Q  39 aaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagaga 138  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  47255216 aaccataagcaacaacaataatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaaag 47255315  T
Q  139 aaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaatt 238  Q
    |||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  47255316 aaaaaaaataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 47255414  T
Q  239 cttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaa 338  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  47255415 cttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaa 47255512  T
Q  339 caagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47255513 caagacactcatgattttcactctcccaaggcatttacaattatttcccaactctagaa 47255571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11349006 - 11348635
Alignment:
Q  22 aataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagga-taaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||| ||   ||||| ||||||    
T  11349006 aataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaaca 11348907  T
Q  121 agataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctcca 220  Q
    |||||||||||| ||  || || ||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11348906 agataaagagag-agtaaagaaaagataacaacatcaagaaat-gttcactcagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctcca 11348810  T
Q  221 atccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcatttt 320  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||  |||||    
T  11348809 atccactatcaatgagttcttagaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaatttt 11348712  T
Q  321 ctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348711 cccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 11348635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 37168605 - 37168234
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||| ||| |||| ||  |||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||||    
T  37168605 aaccaataaccaaatgtaaataacctcaagcaacaacaata-tatagacctagtctataat-caagtgcatagcaaaaccacaatcaaaccaaggaataa 37168508  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37168507 acaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctct 37168413  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| |||    
T  37168412 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 37168314  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37168313 tttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 37168234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 90 - 397
Target Start/End: Original strand, 13547020 - 13547320
Alignment:
Q  90 gcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatg 189  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||    
T  13547020 gcaaaaccacaatccaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-tg 13547114  T
Q  190 acctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13547115 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaaatagcttcaacaagctc 13547212  T
Q  290 nnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaa 389  Q
            |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13547213 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 13547312  T
Q  390 ctctagaa 397  Q
     |||||||    
T  13547313 atctagaa 13547320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 397
Target Start/End: Original strand, 13548879 - 13549231
Alignment:
Q  39 aaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaa-gcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagag 137  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13548879 aaccacaagcaacaacaataatatagacctagtctataaaccaaagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaag 13548978  T
Q  138 aaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaat 237  Q
    ||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13548979 aaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 13549073  T
Q  238 tcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatga 337  Q
    ||||||||||||||       ||||||||| |||||||| || |||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13549074 tcttacaaagagat--acaaatgggttacatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatga 13549171  T
Q  338 acaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13549172 acaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaa 13549231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 397
Target Start/End: Original strand, 31925585 - 31925937
Alignment:
Q  38 taaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa-acaagataaagagagtaga 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |    
T  31925585 taaccacaagcaataacaataatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaagaataatacaagataacgagagtaaa 31925684  T
Q  137 gaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaa 236  Q
    ||||||   | ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  31925685 gaaaaa---ataacaacaccaagaaat-gttcacctagttcggtccaact-tgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag 31925779  T
Q  237 ttcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatg 336  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  31925780 ttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacatccctaatttctacccatttttccactctcaccaatg 31925877  T
Q  337 aacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  31925878 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaactgctt-ccaactctagaa 31925937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28242615 - 28242386
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaa-ccataatctaaccaaaggata 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  28242615 aaccaataaccaaatgtaaataacctcaagcaacaacaacaatctagatctaatttagaaaccaagtgaatagcaaaaaccacaatctaacaaaatgata 28242516  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28242515 aacaagataaagagagtagagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctc 28242420  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28242419 tccaatccactat-aatgagttcttacaaagagat 28242386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 19754734 - 19754431
Alignment:
Q  87 atagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaacc 186  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| |||||| | |||||| ||||| |||||| ||||     
T  19754734 atagcaaaaccacaatccaacaaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataaca-caccaaaa-attgttgacccacttcggtccaact 19754640  T
Q  187 atgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
     ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19754639 -tgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tcggttacaagaaattagcttcaacaag 19754543  T
Q  287 ctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcatttt-ctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttc 385  Q
    |||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||    
T  19754542 ctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacgaatgtttc 19754443  T
Q  386 ccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||    
T  19754442 ccaactctagaa 19754431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 151 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 193790 - 193548
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagaga 250  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  193790 aacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-tgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagaga 193693  T
Q  251 tnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcat 350  Q
    |       || |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  193692 tacaaa--tgagttacaagaaattagcttcaacaagctaataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcat 193595  T
Q  351 gattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  193594 gattttcaccctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 193548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 397
Target Start/End: Original strand, 7482100 - 7482463
Alignment:
Q  30 aatgtaaataaccacaagcaataacaacaattta--gatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaa 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  || ||| |||| ||  |||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  7482100 aatgtaaataacctcaagcaacaacaacaatatatagacctagtctataat-caagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaa 7482198  T
Q  128 gagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccact 227  Q
    ||||||| ||||||   ||  |||| |||| || || ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7482199 gagagtaaagaaaa---gatgacaataccatgaaat-gttcacctagttcggtccaact-tgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcact 7482293  T
Q  228 atcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatc 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  7482294 atcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttacccaatc 7482392  T
Q  328 tcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7482393 tcaccaatgaacaatacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgcttcccaactctagaa 7482463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 34603873 - 34603512
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaattta--gatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||  || ||| |||| ||  |||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||    
T  34603873 aaccaataatcaaatgtaaataacctcaagcaccaacagcaatatatagacctagtctataat-caagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaggaat 34603775  T
Q  116 aaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatct 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||| ||               |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34603774 aaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacacctag---------------ttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatct 34603694  T
Q  216 ctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc 315  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| |    
T  34603693 cttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaa-tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 34603595  T
Q  316 attttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603594 attttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 34603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 19752932 - 19752622
Alignment:
Q  78 aacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttc 177  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||   || ||||    ||| |||||||| ||| |||||    
T  19752932 aacaagtgcatagtaaaaccacaatccaacaaaaggataaacaagataaagagagtaaataaaa---gataaca----caaaagattgttgacctagttc 19752840  T
Q  178 ggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagc 277  Q
    ||| ||||  ||||||| | |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||       | |||||||||||||||||    
T  19752839 ggtccaact-tgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tcggttacaagaaattagc 19752743  T
Q  278 ttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcatttt-ctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttac 376  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19752742 ttcaacaagctcgcaaagaacaaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttac 19752643  T
Q  377 aattgtttcccaactctagaa 397  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  19752642 gattatttcccaactctagaa 19752622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 8550783 - 8551001
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  8550783 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggat--acaaat 8550880  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  8550881 gagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 8550980  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  8550981 ctcacccaatgtgtttacaat 8551001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 28265551 - 28265778
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |    
T  28265551 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagat--acaaat 28265647  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28265648 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttca 28265747  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28265748 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 28265778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 37876624 - 37876853
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggata 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||| |||| | |||| ||||||| |||  ||||||| ||||    
T  37876624 aaccaataaccaaatgtaaataaaccacaagcaaaaacaacactatagacctagtctataaaccaagtgcatagaaaaaccacaattcaaccaaatgata 37876723  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  37876724 aacaagataaagagagtaaagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctc 37876818  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  37876819 tgcaatccactatcaatgagttattacaaagagat 37876853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49918521 - 49918309
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  49918521 agattgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 49918425  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  49918424 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 49918325  T
Q  359 ctctcccaaagtgttt 374  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  49918324 ctcacccaaggtgttt 49918309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3157036 - 3156837
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  3157036 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 3156940  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3156939 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 3156840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 397
Target Start/End: Original strand, 37879006 - 37879142
Alignment:
Q  261 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcact 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37879006 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcact 37879105  T
Q  361 ctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879106 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 37879142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 4552634 - 4552851
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||            
T  4552634 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaag-- 4552730  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  4552731 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcc 4552830  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  4552831 ctcacccaaggtgtttacaat 4552851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 28220223 - 28220440
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  28220223 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 28220319  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  28220320 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttca 28220419  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||| ||||    
T  28220420 ctcacccaaggtgttttcaat 28220440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659192
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||       |    
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaa--t 31659313  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31659312 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 31659213  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  31659212 ctcacccaaggtgtttacaat 31659192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 834164 - 834391
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  834164 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggat--acaaat 834260  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  834261 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 834360  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    | | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  834361 cgcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 834391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 28223418 - 28223645
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  28223418 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 28223514  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28223515 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 28223614  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  28223615 ctcacccaaggtgtcttcaa-tgtttcccaac 28223645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 44455331 - 44455095
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       |    
T  44455331 agatcgttgacccagttcggt-caaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaa--t 44455235  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  44455234 gagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttca 44455135  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaaaa 399  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44455134 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaacccaagaaaa 44455095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 50167172 - 50167399
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||       |    
T  50167172 agattgttgacctagttcggtccaact-tgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa--t 50167268  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||        ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  50167269 gggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 50167368  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  50167369 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 50167399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3189502 - 3189275
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            
T  3189502 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaa-- 3189405  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttca 358  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||        |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3189404 gagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttca 3189305  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  3189304 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3198319 - 3198092
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            
T  3198319 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaa-- 3198222  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttca 358  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||        |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3198221 gagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttca 3198122  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  3198121 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3198092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3207158 - 3206931
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            
T  3207158 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaa-- 3207061  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttca 358  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||        |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3207060 gagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttca 3206961  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  3206960 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3206931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 13659333 - 13659550
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  13659333 agattgttgacccagttcggtccaact-taacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--ataaat 13659429  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  13659430 gggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 13659529  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||  ||||| |||||||||||    
T  13659530 ctaccccaaggtgtttacaat 13659550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 379
Target Start/End: Original strand, 37503589 - 37503768
Alignment:
Q  196 tctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnn 295  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||          
T  37503589 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa-----ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag 37503683  T
Q  296 nncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
      |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37503684 aacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 37503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 196904 - 197132
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggagg-agagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnn 258  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||  ||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||           
T  196904 agattgttgatccagttcggtccaact-tgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa-- 197000  T
Q  259 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||        ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  197001 tgagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 197100  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  197101 actcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 197132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46065089 - 46064872
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||       |    
T  46065089 agattgtttacccagttcgatccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagat--acacat 46064993  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||        ||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  46064992 gagttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 46064893  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  46064892 ctcacccaaggtgtttacaat 46064872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 188 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1833666 - 1833467
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       || |||||||||| |||||||||| |       
T  1833666 tgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgagttacaagaatttagcttcaatagat 1833569  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  1833568 tcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcc 1833470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41361093 - 41360859
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||  |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  41361093 acaccaagatattgttgacctagttcggtccaat-atgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagat 41360995  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg 351  Q
           |||||||||||||||||| ||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      
T  41360994 acaaa--tgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 41360897  T
Q  352 attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||    
T  41360896 attttcactcacccaagatgtttacga-tgtttcccaac 41360859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 388
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138196
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |    
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaat-atgacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagat--gcaaat 13138069  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        | | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13138070 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga-cctaatttctatccatttt-tcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 13138167  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttccca 388  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  13138168 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 13138196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20762844 - 20762616
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||            
T  20762844 agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaa-- 20762747  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  20762746 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttc 20762647  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  20762646 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 20762616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10925397 - 10925167
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt---acaaagagatnnnnn 256  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||  | ||||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||         
T  10925397 agattgttgacccagttcgatccaacttt-acctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaa 10925299  T
Q  257 nntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattt 355  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10925298 --tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 10925201  T
Q  356 tcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10925200 tcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 10925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 3847118 - 3847345
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtccaact-tgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa--t 3847214  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| |||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  3847215 gggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 3847314  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3847315 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3847345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 50169207 - 50169434
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||       |    
T  50169207 agattgttgatccagttcggtccaact-tgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaa--t 50169303  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||        |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  50169304 gagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 50169403  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  50169404 ctcacccaaggtatttacaa-tgtttcccaac 50169434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 334
Target Start/End: Original strand, 13316348 - 13316520
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  13316348 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-- 13316445  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  13316446 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 13316520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15820451 - 15820249
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15820451 tgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagat--acaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagc 15820354  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        ||| |||||||| ||| ||| ||  |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  15820353 tcacaaagaacaaacctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcc 15820255  T
Q  387 caactc 392  Q
    ||||||    
T  15820254 caactc 15820249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644569
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 45644447  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca-ttcatgattttc 357  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||||||||        | || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45644448 gagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttc 45644547  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    |||| |||||  ||||||||||    
T  45644548 actcacccaagatgtttacaat 45644569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2926746 - 2926589
Alignment:
Q  92 aaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgac 191  Q
    |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||   |||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  2926746 aaaaccataattaaatcaaagaataaacaagataaagagagtagagtaaaa---agaacaacaccaaagaattgtttacctagttcggtgcaacaatgac 2926650  T
Q  192 ctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagat 251  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  2926649 ctactctgcagaagagattgatctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagagat 2926589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 37559864 - 37560083
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactct-ggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnn 258  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||           
T  37559864 agattgttgaccaagttcggtccaact-tgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa-- 37559960  T
Q  259 tgggttacaagaaattagctt-caacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||        |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37559961 tgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 37560060  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||||| || || |||||||||||    
T  37560061 cactcacctaatgtgtttacaat 37560083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9987381 - 9987287
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9987381 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaa 9987287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 20622225 - 20622319
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20622225 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 20622319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40282557 - 40282463
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40282557 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 40282463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51765569 - 51765483
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51765569 agattgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 51765483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Original strand, 23555290 - 23555489
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       || |||| |||||||||| |||||||||     
T  23555290 tgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgagttataagaaattagtttcaacaagt 23555386  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  23555387 tcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaaagaataagacactcaataattttcattcacccaaggtgtttacaa-tgtttcc 23555485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9036596 - 9036502
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  9036596 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaa 9036502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21054138 - 21054044
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21054138 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 21054044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44203813 - 44203732
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  44203813 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 44203732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6808730 - 6808497
Alignment:
Q  51 taacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaac 150  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||| | | |||    
T  6808730 taacaacaatctagatctgatctagaaaccaagtgtaaagcaaaatcactatcaaactaaagcataaacaagataaagagagtag---aaaacaaagaac 6808634  T
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagag 249  Q
    ||| |||||| | | || | | |||||||  |||| || ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  6808633 aactccaaga-aatatttatctagttcggaccaacaataacctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagag 6808535  T
Q  250 atnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||        | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6808534 atacaaaa--gagttacaagaagttagcttcaacaagctc 6808497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16455750 - 16455588
Alignment:
Q  203 gagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaacc 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||         ||      
T  16455750 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcactagaaa-aaat 16455654  T
Q  303 ctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaa 367  Q
    |||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  16455653 ctaatttctcaccattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaa 16455588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 390
Target Start/End: Original strand, 30476486 - 30476672
Alignment:
Q  204 agagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccc 303  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| |||||| |||||||||| ||        ||||||    
T  30476486 agagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaaccc 30476583  T
Q  304 taatttctacgcattttctcaatctcaccaa---tgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||   |||||||||  |  ||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30476584 taatttctacctattttcccaatctcaccaatattgaacaagaactcaatgattttcacccacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 30476672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 390
Target Start/End: Original strand, 928025 - 928202
Alignment:
Q  213 tctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaa-ccctaatttct 311  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||    
T  928025 tctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaa--gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttct 928122  T
Q  312 acgcattttctc-aatctcaccaatgaacaagacattcat-gattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |  |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  928123 at-cattttttccaatatcaccaaagaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 928202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 389
Target Start/End: Original strand, 40122193 - 40122421
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactat--caatgaattcttacaaagagatnnnnnn 257  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||| |||          
T  40122193 agattgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaa- 40122290  T
Q  258 ntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
     || |||| ||||||||||||| |||||||||        |||  |||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40122291 -tgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgatttt 40122389  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaa 389  Q
     |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40122390 tactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 40122421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 44650314 - 44650389
Alignment:
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaact 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44650314 ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaagtgtttacaaatgttttccaact 44650389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 12318397 - 12318568
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaaca-atttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagt 133  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| || ||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12318397 aaataagcacacgcaacaacaacagatctagatttaacctagcaaccaattgtaaagcaaaatcataattgaaccaaagaataaacaagataaagggagt 12318496  T
Q  134 agagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagaga 208  Q
    | |||||   ||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||    
T  12318497 aaagaaa---agagaacaacaccaaaaaattgtttacctagttcggtccaataatgaactactatgggggagaga 12318568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Original strand, 9109292 - 9109540
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaaca-atttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaac-aagataaagagag 132  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| || |||  ||  |||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9109292 aaataaccacaagtaataacaacagatctagatctaagctagcaaccaactgtgaagcataaccacaatcaaaccaaagaataaacaaagataaagagag 9109391  T
Q  133 tagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    |||||   | || | |||| | |||| | | |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||   | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9109392 tagag---actaaataacagccccaa-aaaatgtttacctagtttggttcaacgatgacttactctatggaagagattgatctctccaatacactatcaa 9109487  T
Q  233 tgaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
     |  ||| ||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9109488 cgtgttctttacaaagagatacaaaa--gggttacaagaaattaacttcaacaag 9109540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22079462 - 22079361
Alignment:
Q  187 atgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaa 285  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||||    
T  22079462 atgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaat--ggttacaagaaattagctttaacaa 22079365  T
Q  286 gctc 289  Q
    ||||    
T  22079364 gctc 22079361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25652379 - 25652272
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaa-tttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagt 133  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| |  | |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  25652379 aaataatcacaagtaacaacaacaaatttagatctaatctagcaactaagtgtaaagcaaaaccacaggcaaaccaaataataaacaaaataaagagagt 25652280  T
Q  134 agagaaaa 141  Q
    ||||||||    
T  25652279 agagaaaa 25652272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36683824 - 36683766
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36683824 tgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttacaaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 28242370 - 28242325
Alignment:
Q  352 attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28242370 attttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaa 28242325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6808446 - 6808382
Alignment:
Q  334 atgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  6808446 atgaacaagacactcaataattttcactctcccaaagtgtttcccaatgtttctcaactctagaa 6808382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5460056 - 5459997
Alignment:
Q  182 caaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
    |||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5460056 caacaatgatctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctt 5459997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 361
Target Start/End: Original strand, 37282715 - 37282887
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||    
T  37282715 tgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaa--gggttaccataaattagcttcaacaag 37282812  T
Q  287 ctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactc 361  Q
    |||        | ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  37282813 ctcacaaggaacaaaccctaatttatac-catttt-tcaatctctccaatgaacaagacactcaatggttttcactc 37282887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 44646935 - 44647010
Alignment:
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaact 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  44646935 ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcatccaaagtatttacaaatattttccaact 44647010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 232
Target Start/End: Original strand, 8871089 - 8871130
Alignment:
Q  191 cctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8871089 cctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13938300 - 13938218
Alignment:
Q  169 acccagttcggttcaaccatgacctac-tctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatga-attcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13938300 acccagttcagcccaacaatgacctacatctgggggagagag--atctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagat 13938218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 289
Target Start/End: Original strand, 12318618 - 12318646
Alignment:
Q  261 ggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318618 ggttacaagaaattagcttcaacaagctc 12318646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 25652070 - 25652022
Alignment:
Q  349 atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25652070 atgattttcacacacttaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 25652022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2390595 - 2390219
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  2390595 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaatcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaaatgtatagcaaaaccacaatccaacaaaaggataa 2390496  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2390495 acaagataaagagagtagagaaaaataaacaacaacaccaagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctct 2390397  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||    
T  2390396 ccaatccactatatatgagttattacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 2390299  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||   ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390298 ttttcgaatttcaccaatgaacaagacacttatgattttcgctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 2390219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 8359177 - 8359548
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8359177 aaccaacaatcaaaagtaaat---cacaagcaacaacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataa 8359273  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8359274 acaagataatgagagtagagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctct 8359369  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||| || |||||||||         ||||||||||||||| |||    
T  8359370 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccat 8359468  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8359469 tttcccaatctccccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgttttccaactcaagaa 8359548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 34310572 - 34310947
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaata-accacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagga-t 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  34310572 aaccaataaccaaatgtaaatagaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggaat 34310671  T
Q  116 aaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatct 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34310672 aaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatct 34310767  T
Q  216 ctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       || ||||||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||||||| |    
T  34310768 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagat--acaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 34310865  T
Q  316 attttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34310866 attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaa 34310947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 3259304 - 3258931
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||| | ||||    
T  3259304 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacacgggcatagcaaaaccacaatccaaccaaggaataa 3259205  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3259204 acaagataaagagagtaaagaaa---agataacaacaccagga-aatgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctct 3259110  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||       || ||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||| ||||||| |||    
T  3259109 ccaatccactatcaatgggtttttacaaagagat--acaaatgagttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctagtttctacccat 3259012  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259011 tttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 3258931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 4508564 - 4508937
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggata 116  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  4508564 aaccaataaccaaatataaataaaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggata 4508663  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    | ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  | |||||||||| || ||||||| |||||    
T  4508664 aacaagataaagagagtaaagaaaat---ataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-taacctactctgaagaagagattgatctc 4508758  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca 316  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||| ||    
T  4508759 tccaatccactctcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctactca 4508856  T
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4508857 ttttcccaatctcaccaatcaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 4508937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 29609037 - 29608673
Alignment:
Q  28 caaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaa-ccataatctaaccaaaggataaacaagataa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29609037 caaatgtaaataaccacaagcaacaacaacaatctagatctaatatagaaaccaagtgcatatcaaaaaccacaatctaagcaaaggataaacaagataa 29608938  T
Q  127 agagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccac 226  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  29608937 agagagtagagaaaa---gataacaacaccaagaaata-ttcactcagttcggtccaact-tgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccac 29608843  T
Q  227 tatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaat 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29608842 tatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 29608745  T
Q  327 ctcaccaatgaacaagacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608744 ctcaccaaagaacaagacactcatgaagtttcgctctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 29608673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 4510406 - 4510779
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggata 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | ||||||||| || |||  ||| || |||||    
T  4510406 aaccaataaccaaatgtaaataaaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaatcaagtgcatagcaaaaacacaattcaactaatggata 4510505  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    |||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||  |||||||||| || ||    
T  4510506 aacaagatcaagagagtaaagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttc 4510600  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca 316  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| || |||        ||||| |||||||||| ||    
T  4510601 ttcaatccactatcaatgagttcttataaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctaccca 4510698  T
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4510699 ttttccaaatctcaccaatcaacaaggcactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 4510779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 4512248 - 4512621
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggata 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | ||||||||| || |||  ||| || |||||    
T  4512248 aaccaataaccaaatgtaaataaaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaatcaagtgcatagcaaaaacacaattcaactaatggata 4512347  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    |||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||  |||||||||| || ||    
T  4512348 aacaagatcaagagagtaaagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttc 4512442  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca 316  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| || |||        ||||| |||||||||| ||    
T  4512443 ttcaatccactatcaatgagttcttataaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctaccca 4512540  T
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4512541 ttttccaaatctcaccaatcaacaaggcactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 4512621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Original strand, 2360859 - 2361203
Alignment:
Q  42 cacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaa 141  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| ||| |||||||| |||| | ||| |||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  2360859 cacaagcaacaacatcaatatagacctagtctagaaaccaagtgcatatcaaaaccacaattcaaccaaggaataaacaagataaagagaataaagaaaa 2360958  T
Q  142 atagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
       ||||    |||||| || || || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||    
T  2360959 ---gaca----caccaa-aggttattgacccagttcggttcaact-tgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttctt 2361049  T
Q  242 acaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaa 341  Q
    ||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2361050 acaaagagatacaaa--tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaa 2361147  T
Q  342 gacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361148 gacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 2361203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 89 - 397
Target Start/End: Original strand, 48599264 - 48599565
Alignment:
Q  89 agcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccat 188  Q
    |||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||  |    
T  48599264 agcaaaactacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacatcaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-t 48599358  T
Q  189 gacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagct 288  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||    
T  48599359 gatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaa--tgagttacaagaaattagcttcaacaagct 48599456  T
Q  289 cnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttccca 388  Q
    |        |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  48599457 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaatgaacaagacaatcatgattttcactcctccaaggtgtttacaattgtttccca 48599556  T
Q  389 actctagaa 397  Q
    |||||||||    
T  48599557 actctagaa 48599565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22270151 - 22269910
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22270151 acaccaagagat-gttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagat 22270054  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg 351  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22270053 acaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 22269956  T
Q  352 -attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22269955 aattttcactctcccaaggtgtttagaattgttt-ccaactctagaa 22269910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 168 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431908
Alignment:
Q  168 cacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttaca 267  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaact-tgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttaca 6432038  T
Q  268 agaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6432037 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaa 6431938  T
Q  368 agtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431937 tgtgtttacaattgtttcccaactctagaa 6431908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35854094 - 35853859
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35854094 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 35853995  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-at 350  Q
            ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  35853994 acaaaa--gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 35853897  T
Q  351 gattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  35853896 gattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 35853859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 378
Target Start/End: Original strand, 30024729 - 30024945
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |    
T  30024729 agattgttgatccagttcggtccaact-tgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaa--t 30024825  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30024826 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 30024925  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaa 378  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  30024926 ctcacccaaggtgtttacaa 30024945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27347988 - 27347761
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  27347988 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 27347892  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27347891 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 27347792  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27347791 ctcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 27347761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733193
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||       |    
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 31733062  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31733063 gggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 31733162  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31733163 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31733193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48491723 - 48491523
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||     
T  48491723 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagt 48491626  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48491625 tcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgtttcc 48491527  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  48491526 caac 48491523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23555212 - 23554982
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |       |    
T  23555212 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagt 23555113  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca--ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23555112 --gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-cattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 23555016  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactc 392  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23555015 cactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 23554982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 202 - 379
Target Start/End: Original strand, 47673981 - 47674157
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||    
T  47673981 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaac 47674078  T
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47674079 cctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 47674157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 47676133 - 47676360
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||       |    
T  47676133 agattgttgatccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaa--t 47676229  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47676230 gggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttca 47676329  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47676330 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 47676360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48489602 - 48489375
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||       |    
T  48489602 agattgtttacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaa--t 48489506  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca-ttcatgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  48489505 gggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttca 48489406  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48489405 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48489375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 289
Target Start/End: Original strand, 32358009 - 32358177
Alignment:
Q  114 ataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaat 213  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  32358009 ataaacaagttaaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgat 32358103  T
Q  214 ctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32358104 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 32358177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 14069830 - 14070047
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  14069830 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 14069926  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14069927 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 14070026  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  14070027 ctcacccaaggtgtttacaat 14070047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 14379858 - 14380075
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  14379858 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 14379954  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14379955 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 14380054  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  14380055 ctcacccaaggtgtttacaat 14380075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153286
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||       |    
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaa--t 8153417  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| |||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8153416 gagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 8153317  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8153316 ctcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 8153286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4586291 - 4586105
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||| ||        ||||    
T  4586291 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaa--tgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaac 4586194  T
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4586193 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4586105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29991225 - 29990999
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||            
T  29991225 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaa-- 29991128  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29991127 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttcta-tccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 29991029  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  29991028 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29990999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 36146405 - 36146633
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  36146405 agattgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 36146501  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaacc-ctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||        ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36146502 gggttaca-gaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 36146600  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36146601 actcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 36146633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1113801 - 1113601
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1113801 tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttataagaaattagcttcaacaagc 1113704  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  1113703 tcacaaagaacaaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaa-tgtttcc 1113605  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  1113604 caac 1113601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 41317431 - 41317658
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  41317431 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggat--acaaat 41317527  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||        ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  41317528 ggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttca 41317627  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  41317628 ctcatccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41317658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26417494 - 26417261
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||| |||   |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26417494 acaccaagaaattgttgacccagtttggtccaatt-tgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagat 26417397  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-at 350  Q
           ||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26417396 acaaa--tgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 26417299  T
Q  351 gattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaa 389  Q
    ||||||||| | | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26417298 gattttcacccgctcaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 26417261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 162 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 43864413 - 43864188
Alignment:
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgg 261  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||       |||    
T  43864413 attgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaa--tgg 43864317  T
Q  262 gttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcact 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  43864316 gttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 43864217  T
Q  361 ctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43864216 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43864188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18126815 - 18126588
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  18126815 agattgttgacccaggtcggt-caaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 18126719  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||        |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  18126718 gggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttca 18126619  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  18126618 ctcacccaagttgtttacaa-tgtttcccaac 18126588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 289
Target Start/End: Original strand, 22328285 - 22328514
Alignment:
Q  55 aacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaaca 154  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  22328285 aacaatctagatctaatcgagaaaccaagtgcataacaaaaccacaatcgaacaaaagaataaacaagataaagagagtagagaaa---agataacaaca 22328381  T
Q  155 ccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaatt-cttacaaagagatnn 253  Q
    |||| | | | || |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||||      
T  22328382 ccaa-aaaatatttacccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatac 22328480  T
Q  254 nnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
          | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328481 aaaa--gagttacaagaaattagcttcaacaagctc 22328514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 379
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105607
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggt 263  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||       |||||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaact-tgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaa--tgggt 31105490  T
Q  264 tacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactct 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||     
T  31105491 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca 31105590  T
Q  363 cccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||||| |||||||||||    
T  31105591 cccaaggtgtttacaat 31105607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 38671219 - 38671446
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  38671219 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaa--t 38671315  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  38671316 gtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcg 38671415  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  38671416 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 38671446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 389
Target Start/End: Original strand, 25766948 - 25767180
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  25766948 acaccaagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagat 25767047  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-at 350  Q
            ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||||  ||||||   |||||||||||||| || ||    
T  25767048 acaaaag-gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccaatct---caatgaacaagacactcaat 25767143  T
Q  351 gattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaa 389  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  25767144 gattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 25767180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Original strand, 6359829 - 6360075
Alignment:
Q  39 aaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagga-taaacaagataaagagagtagag 137  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || | ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||| || | |     
T  6359829 aaccacaagcaacaacaataatatatacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaacttaaggaataaacaagataaagaaagcaaat 6359928  T
Q  138 aaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaat 237  Q
     ||||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||  ||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  6359929 gaaaa--gataacaacaccaagaaattgttgacccagttcgatccaact-tgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagt 6360025  T
Q  238 tcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360026 tcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 6360075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 41649008 - 41649234
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  41649008 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggat--acaaat 41649104  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||        ||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  41649105 gggttacaagaaattagc-taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 41649203  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41649204 cttacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41649234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48408984 - 48408747
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagaga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||    
T  48408984 acaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagaga 48408885  T
Q  251 tnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-a 349  Q
    |        ||||||||||||||||||||  ||||| |         ||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  48408884 tacaaaag-gggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa 48408786  T
Q  350 tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  48408785 tgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48408747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 389
Target Start/End: Original strand, 496007 - 496206
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  496007 tgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagat--acaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagc 496104  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca-ttcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  496105 tcacaaagaactaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcacccaaggtttttacaa-tgtttcc 496203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25616025 - 25615857
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||       |    
T  25616025 agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgat--acaaat 25615928  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctca 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25615927 gggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctca 25615857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19502350 - 19502122
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  19502350 agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 19502253  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttct-acgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||        ||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  19502252 gagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctc 19502153  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  19502152 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19502122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4178945 - 4178719
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  4178945 agattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaa-- 4178849  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||        ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4178848 gggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 4178749  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  4178748 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4178719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39731541 - 39731455
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39731541 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 39731455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 390
Target Start/End: Original strand, 12097952 - 12098083
Alignment:
Q  259 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  12097952 tgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcaatgattttc 12098051  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  12098052 actcacccaagatgtttacaa-tgtttcccaac 12098083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 43504142 - 43504236
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43504142 acaccaagagattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaa 43504236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24790021 - 24789927
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  24790021 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaa 24789927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 298 - 390
Target Start/End: Original strand, 4538672 - 4538764
Alignment:
Q  298 caaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4538672 caaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatt-tttcccaac 4538764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 18388747 - 18388828
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  18388747 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 18388828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 18392183 - 18392264
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  18392183 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 18392264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 142
Target Start/End: Original strand, 1360048 - 1360155
Alignment:
Q  36 aataaccacaagcaataacaacaattt-agatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagta 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||    
T  1360048 aataaccacaagcaacaacaacaattttagatctaatctaaaaactaagtgtaaagcaaaaccacaatcgaacaaaagaagaaacaagataaagagaata 1360147  T
Q  135 gagaaaaa 142  Q
    ||||||||    
T  1360148 gagaaaaa 1360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 1560654 - 1560749
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1560654 acaccaagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 397
Target Start/End: Original strand, 6360073 - 6360143
Alignment:
Q  327 ctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6360073 ctcaccaatgaacaagtcactcatgattttcattctcccaaggtgtttaaaattgtttcccaactctagaa 6360143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20344071 - 20343982
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20344071 aagagattgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 20343982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 384
Target Start/End: Original strand, 23565085 - 23565280
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23565085 tgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa--gagttacaagaaattagtttcaacaagc 23565182  T
Q  288 tcnnnnnnnncaa-ccctaatttctacgcattttctc--aatctcaccaatgaacaagaca-ttcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtt 383  Q
    ||        |||  ||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  23565183 tcacaaagaacaagacctaatttctacctattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacttcatg---ttcactcacccaaggtgtttacaaatgtt 23565279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 6592327 - 6592408
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  6592327 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 6592408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 6594545 - 6594626
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  6594545 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 6594626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 390
Target Start/End: Original strand, 24526033 - 24526121
Alignment:
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24526033 cctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24526121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518752
Alignment:
Q  222 tccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttc 321  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||       || ||||||||||| ||||||||| ||||||        ||| ||||||||||||  ||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttc 31518808  T
Q  322 tcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttac 376  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31518807 ccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttac 31518752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 32060309 - 32060390
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  32060309 aacacaaagagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 32060390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 390
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761526
Alignment:
Q  303 ctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2761439 ctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 2761526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Original strand, 4253552 - 4253754
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4253552 tgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaa--gggttacatgaaattagcttcaacaag 4253649  T
Q  287 ctcnnnnnnnncaa-ccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgttt 384  Q
    |||        ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  4253650 ctcacaaagaacaaaccctaatttctac-cattttaccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaaatgttt 4253748  T
Q  385 cccaac 390  Q
     |||||    
T  4253749 tccaac 4253754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 286
Target Start/End: Original strand, 2759195 - 2759317
Alignment:
Q  161 gattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntg 260  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||    
T  2759195 gattgttgaccaagttcggtccaact-tgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--ataaatg 2759291  T
Q  261 ggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  2759292 agttacaagaaattagcttcaacaag 2759317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396409
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
    |||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctt 18396409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23344117 - 23343934
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23344117 tgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatatactaaa--gggttacaagaaattagcttcaacaagc 23344022  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccct-aatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgttt 374  Q
    ||         || ||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23344021 tcacaaagaataaaccttaatttctaccc-ttttccaaatctcaccaatgaactagacattcaatgattttcactcacccaaggtgttt 23343934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 251
Target Start/End: Original strand, 24525526 - 24525589
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24525526 tgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 24525589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518983
Alignment:
Q  171 ccagttcggttcaaccatgacctactctggag-gagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaact-tgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagat 31518983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30814605 - 30814533
Alignment:
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatga 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30814605 attgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatga 30814533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Original strand, 24514912 - 24514984
Alignment:
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  24514912 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24514984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 251
Target Start/End: Original strand, 3904624 - 3904704
Alignment:
Q  171 ccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagat 251  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3904624 ccagttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgat-cactatcaatgagttctttacaaagagat 3904704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26639486 - 26639425
Alignment:
Q  171 ccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  26639486 ccagttcggtacaacaatgacatactatggaggagagattgatctctctaatccattatcaa 26639425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 12097864 - 12097931
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccacta 228  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12097864 agattgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta 12097931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5116735 - 5116685
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagat 251  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5116735 ggagagatttatctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagat 5116685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Original strand, 43363402 - 43363446
Alignment:
Q  93 aaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagag 137  Q
    |||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43363402 aaaccacaatcgaaccaaagaacaaacaagataaagagagtagag 43363446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 17861 - 18223
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagg-ata 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17861 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaaatgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggaata 17960  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17961 aacaagataaagagagtaaagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctc 18056  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca 316  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||  |    
T  18057 tccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaa 18153  T
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18154 ttttcccactctcaccaatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 18223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 40329085 - 40328716
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40329085 aaccaacaaccaaatgtaaataaccacaagcaataacaacagtctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataa 40328986  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    |||||| || |||||||||||||   ||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| || |||     ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40328985 acaagaaaaggagagtagagaaa---agataacaacaccaaga-aatgttcactcagttccgtccaa-----acctactctggaggagagattgatctct 40328895  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||||||||||| || |||||||||        ||| |||||||||||| |||    
T  40328894 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccat 40328796  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328795 tttcccaatctcacaaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaa 40328716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11384291 - 11383923
Alignment:
Q  21 caataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaaca 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11384291 caataaccaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaaca 11384192  T
Q  121 agataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctcca 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| | || |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  11384191 agataaagagagtaaagaaaaatagacaaca---ccaaaaaat-gttcacccagttcggtccaact-taacctactctggaggagagatcgatgtctcca 11384097  T
Q  221 atccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcatttt 320  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||| ||||||    
T  11384096 atccagtatcaatgggttcttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 11383999  T
Q  321 ctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
      ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11383998 tccaatctca-taatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaa 11383923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 39 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4283812 - 4283461
Alignment:
Q  39 aaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagaga 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4283812 aaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaaga 4283713  T
Q  139 aaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaatt 238  Q
    ||   ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  4283712 aa---agataacaacaccaaga-aatgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 4283618  T
Q  239 cttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaa 338  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4283617 cttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaa 4283520  T
Q  339 caagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283519 caagacactcatgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 4283461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18655712 - 18655337
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataat-ctaaccaaaggata 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||| ||| | || ||| | |||    
T  18655712 aaccaataaccaaatgtaaataaacacaagcaataacaacaatatagatctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaata 18655613  T
Q  117 aacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    |||||||||||||||| ||  || || ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18655612 aacaagataaagagag-agtaaagaaaagataacaacaccaa-aaaatgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctc 18655516  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca 316  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| ||    
T  18655515 tctaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctaccca 18655418  T
Q  317 ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  18655417 ttttctcaatctcaccaatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcctaagtctagaa 18655337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 114 - 397
Target Start/End: Original strand, 42434946 - 42435222
Alignment:
Q  114 ataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaat 213  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  42434946 ataaacaagataaagaaagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgat 42435040  T
Q  214 ctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctac 313  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  42435041 ttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 42435138  T
Q  314 gcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42435139 ccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttaccaactctagaa 42435222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 78 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 40221994 - 40221682
Alignment:
Q  78 aacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttc 177  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  40221994 aacaagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaagaatgaacaagataaagagagtaaagacaa---gataacaacaccaa-agattattgacccagttc 40221899  T
Q  178 ggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagc 277  Q
    ||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||     
T  40221898 ggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagt 40221802  T
Q  278 ttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttaca 377  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40221801 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaaagaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttaca 40221702  T
Q  378 attgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40221701 attgtttcccaactctagaa 40221682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Original strand, 10930116 - 10930424
Alignment:
Q  78 aacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttc 177  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| | |  ||||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10930116 aacaagtgcatagcaaaaccacaatccaacaaaagaataaacaagataaagggagcaaaagaaaa--gataacaacaccaagaaattgttgacccagttc 10930213  T
Q  178 ggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagc 277  Q
    ||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  10930214 ggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaa--tgggttacaagaaattagc 10930310  T
Q  278 ttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttaca 377  Q
    |||||| |||||        |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10930311 ttcaacgagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccgatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaaatgtttaca 10930410  T
Q  378 attgtttcccaact 391  Q
    ||||||||||||||    
T  10930411 attgtttcccaact 10930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3772501 - 3772164
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3772501 aaccaatcaccaaaagaaaataaccacaagcaacaacaacaatctagatttaatctagaaatcaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagaataa 3772402  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||| | | || | |||||| ||| ||| | ||||||||||||   || ||||| ||||||    
T  3772401 acaagataaagagagtagagaaa---agataacaccaccaaga-aatatttatccagtttggtccaa-cttgacctactctgagagatagattgatctct 3772307  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||       || |||||||||||||||||| || ||||||        ||| |||||||||||   ||    
T  3772306 ccaatccactatcaataaattcttacaaagatat--acaaatgagttacaagaaattagcttaaataagctcacaaagaacaaacctaatttctatcaat 3772209  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactc 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  3772208 tttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactc 3772164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15212957 - 15212730
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||       |    
T  15212957 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 15212861  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15212860 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttca 15212761  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15212760 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 15212730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811232
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |    
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaa--t 27811353  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27811352 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 27811253  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  27811252 ctcacccaaggtgtttacaat 27811232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4731829 - 4731602
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||  ||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  4731829 agattgttgacccaattcggtccaact-tgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 4731733  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4731732 gggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 4731633  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4731632 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4731602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352094
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 33352225  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||        |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33352224 gggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 33352125  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
     || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33352124 atcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33352094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 43036594 - 43036367
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  43036594 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 43036498  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43036497 gaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 43036398  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43036397 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43036367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30143511 - 30143286
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| || |||||| |||||||  ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  30143511 agattgttgactcagttcagttcaact-tgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 30143415  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||   |||||||||||    
T  30143414 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagaca-caatgattttcac 30143316  T
Q  360 tctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30143315 tcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 30143286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321022
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||       |    
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaa--t 40321155  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  40321154 gggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttca 40321055  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactc 392  Q
     || | ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40321054 gtcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 40321022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42498366 - 42498149
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||            
T  42498366 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaa-- 42498269  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttcta-cgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42498268 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 42498169  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaa 378  Q
    ||||  |||| ||||||||||    
T  42498168 actc-accaaggtgtttacaa 42498149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18141964 - 18141764
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18141964 tgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagc 18141867  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  18141866 tcacaaagaacaacc-taatttctacccattttcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggtgtttacaaatgtttcc 18141768  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  18141767 caac 18141764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 392
Target Start/End: Original strand, 1345395 - 1345597
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||| || |    
T  1345395 tgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacata--tgggttacaagaaattagcttcaataaac 1345492  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  1345493 tcacaaagaacaaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tatttcc 1345591  T
Q  387 caactc 392  Q
    ||||||    
T  1345592 caactc 1345597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 202 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353729
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac 301  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||| ||        ||||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaac 44353826  T
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353825 cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaa 44353729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30291737 - 30291549
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       || ||||||||||||||||||||||||||||        |||     
T  30291737 ggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaa--tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa 30291640  T
Q  302 -cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30291639 acctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 30291549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17982825 - 17982597
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  17982825 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-- 17982728  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||        |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17982727 gggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 17982628  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  17982627 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 17982597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 34254327 - 34254543
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||            
T  34254327 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaa-- 34254424  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34254425 gggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 34254523  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    |||  |||| |||||||||||    
T  34254524 ctc-accaaggtgtttacaat 34254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 359
Target Start/End: Original strand, 34256503 - 34256700
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  34256503 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 34256600  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34256601 gggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 34256699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31218429 - 31218201
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  31218429 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaa-- 31218332  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca--ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31218331 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-cattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 31218233  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  31218232 cactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31218201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 390
Target Start/End: Original strand, 19491688 - 19491922
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||  |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19491688 acaccaagatattgttgacctagttcggtccaat-atgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagat 19491786  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg 351  Q
           |||||||||||||||||| ||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      
T  19491787 acaaa--tgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 19491884  T
Q  352 attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||    
T  19491885 attttcactcacccaagatgtttacga-tgtttcccaac 19491922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 19945355 - 19945574
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |    
T  19945355 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagt 19945454  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| ||        ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19945455 -ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 19945553  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||||  |||| |||||||||||    
T  19945554 actc-accaaggtgtttacaat 19945574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689213
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaact-tgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 5689346  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||        | ||| |||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  5689345 gggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttca 5689246  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactc 392  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  5689245 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttccaaactc 5689213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 3303667 - 3303894
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  3303667 agattgtttacccagttcggtccaact-tgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 3303763  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||        ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  3303764 gagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttca 3303863  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  3303864 ctcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3303894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 390
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292687
Alignment:
Q  170 cccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaag 269  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaact-tgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgagttacaag 1292566  T
Q  270 aaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaa 368  Q
    ||||||||||||||||||||        ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||| |||||     
T  1292567 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataattttcactcacccaag 1292666  T
Q  369 gtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||| || | |||||||||||    
T  1292667 gtgttcac-agtgtttcccaac 1292687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 390
Target Start/End: Original strand, 1746216 - 1746442
Alignment:
Q  161 gattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntg 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||        |    
T  1746216 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaa--g 1746312  T
Q  261 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttcta-cgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||        ||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1746313 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 1746412  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  1746413 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 1746442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6598916
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |       |    
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaa-ag-tatacaaat 6599047  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca-ttcatgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  6599046 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttca 6598947  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  6598946 ctcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6598916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674369
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |       |    
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaa-ag-tatacaaat 6674500  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca-ttcatgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  6674499 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttca 6674400  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  6674399 ctcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6674369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765693
Alignment:
Q  161 gattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntg 260  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcag-ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tg 9765819  T
Q  261 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcact 360  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||    
T  9765818 ggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc---aatttcact 9765722  T
Q  361 ctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9765721 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9765693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 388
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965914
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggt 263  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||        ||||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaa--gggt 8965788  T
Q  264 tacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaa-ccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactc 361  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||        ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8965789 tataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctac-ctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 8965887  T
Q  362 tcccaaagtgtttacaattgtttccca 388  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||    
T  8965888 acccaaggtgtttacaaatgtttccca 8965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44304027 - 44303798
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||            
T  44304027 agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaa-- 44303930  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc--attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| ||        ||||| |||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44303929 ggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 44303830  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  44303829 cactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44303798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2627916 - 2627824
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttaca 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2627916 acaccaagagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaca 2627824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 12702631 - 12702862
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||             
T  12702631 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagaga--cacaaaa 12702727  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-----attttctcaatctcaccaatgaacaagaca-ttcatgat 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| |      ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12702728 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgat 12702827  T
Q  354 tttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  12702828 tttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12702862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 4743211 - 4743427
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||            |    
T  4743211 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa------------t 4743297  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | |        ||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  4743298 gggttacaagattttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcg 4743396  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4743397 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4743427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3439678 - 3439589
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3439678 aagagattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 3439589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25690129 - 25690040
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25690129 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 25690040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 389
Target Start/End: Original strand, 41366612 - 41366837
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||       |    
T  41366612 agattgttgtcccagttcggtccaact-tgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaa--t 41366707  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||         ||| | |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||||    
T  41366708 aggttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacccattttctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttca 41366807  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaa 389  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41366808 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 41366837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733787
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 4733787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4162640 - 4162454
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||     
T  4162640 tgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagt 4162544  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||        ||| ||||| |||||| |||||||    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  4162543 tctcaaagaacaaacctaacttctacccattttc---ctctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgctcaaggtgtttacaat 4162454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597659
Alignment:
Q  171 ccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaag 269  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||        || ||| |||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaa--ggattataag 7597679  T
Q  270 aaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7597678 aaattagcttcaacaagctc 7597659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 42575311 - 42575392
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  42575311 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 42575392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 390
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106302
Alignment:
Q  169 acccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaa 268  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||       || |||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaact-tgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaa-agat--acaaatgagttacaa 18106180  T
Q  269 gaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||        ||||  || ||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||| |||||    
T  18106181 gaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaatctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcacccaa 18106280  T
Q  368 agtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  18106281 ggtgtttacaa-tgtttcccaac 18106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8153902 - 8153705
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaac-aag 286  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||        | |||||| ||| ||||||||||| |||    
T  8153902 tgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagatatacaaaa--gagttacacgaatttagcttcaacaaag 8153805  T
Q  287 ctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca---ttcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtt 383  Q
    |||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   |  |||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||    
T  8153804 ctcaga------aaccctaatttctac-cattttctcaatctcaccaatgaacatgacacactcaatgattttcactcatccaaggtgtatacaaatgtt 8153712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10240417 - 10240318
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaacc-aaaggataaacaagataaagagagt 133  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  10240417 aaatagccacaaacaataacaacaatctagatctaatctagaaacgaaatgtaaagcaaaaccacaatcgaaccaaaaaaataaacaagataaagagagt 10240318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11137320 - 11137213
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaaca-atttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagt 133  Q
    |||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||| || ||||  || || ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11137320 aaataaccacaagcaacaataacatatctaaatctaatctagcaatcaagtataaagaaaaaccacaatcgaaccaatgaataaacaagataaagagagt 11137221  T
Q  134 agagaaaa 141  Q
    ||||||||    
T  11137220 agagaaaa 11137213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 141
Target Start/End: Original strand, 2999730 - 2999784
Alignment:
Q  87 atagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaa 141  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2999730 atagcaaaatcacaatctaaccaaagaataaacaagataaagagagtagagaaaa 2999784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15290705 - 15290624
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  15290705 aacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 15290624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15471074 - 15470993
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  15471074 aacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 15470993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10015241 - 10015128
Alignment:
Q  169 acccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaa 268  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||       || |||||||    
T  10015241 acccagttcggtccaact-tgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagat--acaaatgagttacaa 10015147  T
Q  269 gaaattagcttcaacaagc 287  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10015146 gaaattagcttcaacaagc 10015128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929753
Alignment:
Q  213 tctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||        ||| | |||||||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga-------------gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttcta 10929821  T
Q  313 cgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    | |||||||   |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  10929820 cccattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaat 10929753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 32902188 - 32902250
Alignment:
Q  179 gttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32902188 gttcaacaatgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctt 32902250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 390
Target Start/End: Original strand, 41364943 - 41365071
Alignment:
Q  262 gttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcact 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||        ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41364943 gttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcact 41365042  T
Q  361 ctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41365043 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41365071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 251
Target Start/End: Original strand, 3073898 - 3073960
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3073898 tgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagat 3073960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 289
Target Start/End: Original strand, 11712018 - 11712124
Alignment:
Q  182 caaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaatt-cttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttc 280  Q
    |||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||        ||||| |||||||||||||||    
T  11712018 caacaatgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaa--gggtttcaagaaattagcttc 11712115  T
Q  281 aacaagctc 289  Q
    |||||||||    
T  11712116 aacaagctc 11712124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 235
Target Start/End: Original strand, 29796320 - 29796391
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatga 235  Q
    |||| ||| |||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  29796320 tgtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatga 29796391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1822366 - 1822337
Alignment:
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1822366 gggttacaagaaattagcttcaacaagctc 1822337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1856811 - 1856782
Alignment:
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1856811 gggttacaagaaattagcttcaacaagctc 1856782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38864017 - 38863949
Alignment:
Q  173 agttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
    ||||||||  ||| || ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38864017 agttcggtctaacaataacctactatgcaggggagattgatctctccaatccactatcaacgagttctt 38863949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 213775 - 213402
Alignment:
Q  21 caataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagga-taaac 119  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||  ||  ||| | |||||||||||| |||| ||   ||||| |||||    
T  213775 caataaccaaatgtaaaaaaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctattaactaagtgcatagcaaaaccacaatcaaaagcaaggaataaac 213676  T
Q  120 aagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctcc 219  Q
    ||||||||||||| ||  ||  | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  213675 aagataaagagag-agtaaaggaaagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctcc 213578  T
Q  220 aatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattt 319  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| |||||    
T  213577 aatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattt 213480  T
Q  320 tctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  213479 tcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 213402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 395
Target Start/End: Original strand, 27637495 - 27637843
Alignment:
Q  42 cacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaa 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27637495 cacaagcaacaacaacaatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaactaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaa 27637594  T
Q  142 atagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
       || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27637595 ---gataacaacaccaagaaata-ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttctt 27637689  T
Q  242 acaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaa 341  Q
    ||||||||||       |||||||||||||||||| || |||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27637690 acaaagagat-acaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaa 27637788  T
Q  342 gacattcatg-attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctag 395  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27637789 gacactcatgaattttcactcttccaaggtgttcacaattgtttcccaactctag 27637843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 40147510 - 40147198
Alignment:
Q  78 aacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttc 177  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   || || ||||| || | || |||||||||||||    
T  40147510 aacaagtgcataacaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaatagagtaaagaaaa---gataaaaacacaaaaaaat-gttcacccagttc 40147415  T
Q  178 ggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagc 277  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||||||||||||    
T  40147414 ggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgagttacaagaaattagc 40147318  T
Q  278 ttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttaca 377  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40147317 ttcaacaagctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgatttccactctcccaaggtgtttaca 40147218  T
Q  378 attgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40147217 attgtttcccaactctagaa 40147198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 28278494 - 28278253
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28278494 acaccaaga-attgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagat 28278397  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatg 351  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28278396 acaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 28278299  T
Q  352 attttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28278298 attttcactctcccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaa 28278253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 114 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 5058258 - 5057984
Alignment:
Q  114 ataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaat 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5058258 ataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-tgacctactctagaggagagattgat 5058164  T
Q  214 ctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctac 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||| ||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  5058163 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggatacaagaaaatagcttcaacaagctcacagaa--caaccctaatttctac 5058068  T
Q  314 gcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5058067 ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactcttccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaa 5057984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 202 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 38747135 - 38746942
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||    
T  38747135 ggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaac 38747038  T
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38747037 cctaatttctacccattttcccaatctcattaatgaacaagatactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 38746942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 533940 - 533713
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  533940 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 533844  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  533843 gggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttca 533744  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  533743 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 533713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25412932 - 25412706
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  25412932 agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 25412835  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25412834 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 25412736  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  25412735 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 25412706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428644
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 42428523  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||         |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42428524 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 42428623  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  42428624 ctcacccaaggtgtttacaat 42428644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13488374 - 13488157
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  13488374 agattattgacccagttcggtccaact-tgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 13488278  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||||    
T  13488277 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttca 13488178  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  13488177 ctcacccaaggtgtttacaat 13488157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13239921 - 13239696
Alignment:
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgg 261  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |     
T  13239921 attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa--ga 13239824  T
Q  262 gttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttct-caatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13239823 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctac-cattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 13239725  T
Q  360 tctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  13239724 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13239696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27015758 - 27015469
Alignment:
Q  91 caaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatga 190  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||  |||    
T  27015758 caaaaccacaattcaaccaaagcataaacaagataaagagagtaaagaaaaa---ataaca-caccaaaaaat-gttcacccagttcggtccaact-tga 27015665  T
Q  191 cctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcn 290  Q
    |||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||        ||||||||||||||| ||     
T  27015664 cctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggt--------attagcttcaacaagttca 27015575  T
Q  291 nnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
           ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27015574 caaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaccaa-acactcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaac 27015476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 389
Target Start/End: Original strand, 42426259 - 42426458
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||      
T  42426259 tgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttgcaagaaattagcttcaacaatt 42426356  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  42426357 tcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcc 42426455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32636995 - 32636778
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |    
T  32636995 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagat--acaaat 32636899  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  32636898 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttca 32636799  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  32636798 ctcacccaaggtgtttacaat 32636778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 538196 - 537970
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  538196 agattgttgatccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 538100  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  538099 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttca 538000  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaa 389  Q
    ||| ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  537999 ctcacccaaggtgtttacga-tgtttcccaa 537970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13343232 - 13343005
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  13343232 agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaa-- 13343136  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13343135 ggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 13343036  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  13343035 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13343005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Original strand, 39468587 - 39468773
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac 301  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||    
T  39468587 ggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaac 39468684  T
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  39468685 cctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 8565943 - 8566160
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||       |    
T  8565943 agattgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaa--t 8566039  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  8566040 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 8566139  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  8566140 ctcacccaaggtgtttacaat 8566160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Original strand, 28750679 - 28750879
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       ||||||||| ||||||| |||||||||      
T  28750679 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaa--tgggttacaggaaattaacttcaacaatt 28750776  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||    
T  28750777 tcataaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttcaa-tgtttcc 28750875  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  28750876 caac 28750879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33831886 - 33831634
Alignment:
Q  120 aagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctcc 219  Q
    ||||||||||||| ||||| |||    ||| |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||| |    
T  33831886 aagataaagagagaagagagaaa----caaaaacaccaa-agattgttgacccagttcagtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctcttc 33831793  T
Q  220 aatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattt 319  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| |||||    
T  33831792 aatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattt 33831695  T
Q  320 tctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    |  ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33831694 ttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 33831634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16452247 - 16452035
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggt 263  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||       |||||    
T  16452247 tgtttacccagttcggtccaact-tgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggt 16452151  T
Q  264 tacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactct 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        ||| | |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |    
T  16452150 tacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcact-t 16452052  T
Q  363 cccaaagtgtttacaat 379  Q
     |||| |||||||||||    
T  16452051 accaaggtgtttacaat 16452035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 397
Target Start/End: Original strand, 16640814 - 16641172
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagta 134  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||  | ||| |||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||| |||| |    
T  16640814 aaataaccacaagcaacaacaaaaatctagatttaatctagaaatcaaatgcataacaaaaccacaatttaactaaagaataagcaagataaatagag-a 16640912  T
Q  135 gagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatg 234  Q
    |  || || ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  16640913 gcaaagaaaagataacaacaccaagaaat-gtttacccagttcggccctact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca--- 16641007  T
Q  235 aattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgca---ttttctcaatctca 330  Q
    | |||||||||||||||        | ||||  |||||| |||||||||||||||        | ||| ||||||||||| ||   |||||||||||||     
T  16641008 agttcttacaaagagatacaaaa--gagttatcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctac-catttttttctcaatctcg 16641104  T
Q  331 ccaatgaacaagaca-ttcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16641105 ccaatgaacaagacacttaatgaatttcactcactcaaggtgtttacaaatgttccccaactctagaa 16641172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30182760 - 30182533
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  30182760 agattgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaa-- 30182663  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30182662 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 30182563  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  30182562 ctc-accaaggtgtttgcaa-tgtttcccaac 30182533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 317060 - 316807
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaa----tttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagag 130  Q
    |||||||||||||||| |||||| |    | ||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  317060 aaataaccacaagcaacaacaacgacagatctagatcttatctagcaaccaagtgtaaagcaaaaccacaattgaaccaaagaataaacaaaataaagag 316961  T
Q  131 agtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc 230  Q
    ||||| |||||   || |||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  316960 agtagggaaaa---gagaacaacacaaaga-attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatc 316865  T
Q  231 aatgaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||| ||| ||||||||||||        || |||||||||||||||||||||||||||    
T  316864 aatgagttctttacaaagagatacaaaa--ggattacaagaaattagcttcaacaagctc 316807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37439313 - 37439222
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37439313 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 37439222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 9789217 - 9789306
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9789217 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 9789306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16409650 - 16409561
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16409650 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 16409561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26170937 - 26170848
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26170937 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 26170848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26178057 - 26177968
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26178057 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 26177968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 36074039 - 36074268
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  36074039 agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaa-- 36074135  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc---attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattt 355  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| |    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36074136 gagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 36074235  T
Q  356 tcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  36074236 tcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36074268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 29751148 - 29751242
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29751148 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 29751242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Original strand, 3075682 - 3075882
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3075682 tgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaaagatacaaa--tgggttacaagaaattagattcagcaagc 3075779  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||  | || |||||||||| |||||||    
T  3075780 tcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgattttcactcatcaaaggtgtttacaa-tgtttcc 3075878  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  3075879 caac 3075882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 18441641 - 18441730
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18441641 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 18441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 389
Target Start/End: Original strand, 9049368 - 9049565
Alignment:
Q  190 acctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9049368 acctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaat--ggttacaagaaattagcttcaacaagctc 9049465  T
Q  290 nnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttccca 388  Q
             ||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9049466 acaaaaacaaacactaatttcta-tcattttcccaaactcactaatcaacaagacactcagtgatttttactcacccaaagtgtttacaaatgtttccca 9049564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4160866 - 4160702
Alignment:
Q  60 tttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaag 159  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||   || |||||||| ||     
T  4160866 tttagatctaatctacaac-caagtgtaaagcaaaaccataatcgaaccaaagaataaacaagataatgagaacatagaaaa---gataacaacactaat 4160771  T
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactat 229  Q
    | ||  || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4160770 aaatattt-acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10593438 - 10593343
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10593438 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 10593343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 379
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683134
Alignment:
Q  171 ccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatga--attcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaa 268  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||        |||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaa--gggttacaa 30683026  T
Q  269 gaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaa 367  Q
    |||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||    
T  30683027 gaaattagcttcaacaagttcacaaag---aaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaa 30683122  T
Q  368 agtgtttacaat 379  Q
     |||||||||||    
T  30683123 ggtgtttacaat 30683134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29720544 - 29720450
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29720544 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 29720450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29722704 - 29722610
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29722704 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 29722610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Original strand, 22536279 - 22536372
Alignment:
Q  153 caccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22536279 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaa 22536372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 390
Target Start/End: Original strand, 5887509 - 5887640
Alignment:
Q  259 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||        |||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5887509 tgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttc 5887608  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5887609 actcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5887640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31183138 - 31182917
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggt 263  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||         |||    
T  31183138 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaat---ggt 31183043  T
Q  264 tacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactct 362  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  31183042 tacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctacccattttc-caatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca 31182944  T
Q  363 cccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    || || |||||||||| |||||||||||    
T  31182943 cctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31182917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 379
Target Start/End: Original strand, 42309963 - 42310149
Alignment:
Q  192 ctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnn 291  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||      
T  42309963 ctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaa--gagttacaagaaattagcttcaacaagctcac 42310060  T
Q  292 nnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaat 379  Q
          ||| | | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  42310061 aaagatcaaacttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcacttacccaaaatgtttacaat 42310149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25078302 - 25078221
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25078302 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 25078221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25136271 - 25136190
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25136271 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 25136190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40380272 - 40380191
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  40380272 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaa 40380191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40382483 - 40382402
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  40382483 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaa 40382402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16544590 - 16544509
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  16544590 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 16544509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16546812 - 16546731
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  16546812 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 16546731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 40763288 - 40763200
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaacca 109  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  40763288 aaccaataatcaaatgtaaa---ccataagcaataacaacaatatagacctaatctataaaccaagtgcatagcaaaaccataatttaacca 40763200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 251
Target Start/End: Original strand, 33905927 - 33906118
Alignment:
Q  63 agatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaa--aaatagacaacaacaccaaga 160  Q
    |||| |||||||| || |||| ||| || ||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||| | | || ||||| ||      
T  33905927 agatttaatctagcaatcaagtgtaaagtaaaaccacattcgaaccaatgaataaacaagataaagagagtatagaattaaaaaaaaaaaaacacaaaag 33906026  T
Q  161 gattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagat 251  Q
     |||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33906027 aattgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagat 33906118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 384
Target Start/End: Original strand, 13695714 - 13695910
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13695714 tgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaa--gggttacaagaaattagctttaacaag 13695811  T
Q  287 ctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgttt 384  Q
    |||        | ||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||| | || ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  13695812 ctcacaaagaacaaaccctaatttgtac-ccttttcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatgattttcactcacacaaggtgtttacaaatgttt 13695910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19806415 - 19806328
Alignment:
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19806415 cctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-tttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19806328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806454
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt 19806454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 40751283 - 40751195
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaacca 109  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||    
T  40751283 aaccaataaccaaatgtaaa---ccacaagcaataacaacaatatagacctaatctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaatttaacca 40751195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 251
Target Start/End: Original strand, 10054689 - 10054904
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaatt-tagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagt 133  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| | |||||||||||||| || |||| ||| |||||||  | |||| || ||||  |||||||||||||| |||||    
T  10054689 aaataaccacatgcaacatcaacaaatctagatctaatctagcaaccaagtgtaaagcaaaattacaatcgaagcaaaaaataaacaagataaaaagagt 10054788  T
Q  134 agagaaaaatagacaacaacacc-aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    | || ||||| |  ||||||||| ||||| | ||| ||| |||| ||| |||| || ||| ||| ||| ||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  10054789 acag-aaaatgg--aacaacaccaaagag-tcgtttacctagtttggtccaacaattacccactttgggggagatattgatatctccaatacactatcaa 10054884  T
Q  233 tgaattc-ttacaaagagat 251  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  10054885 tgagttcattacaaagagat 10054904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 42926904 - 42926838
Alignment:
Q  323 caatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaa 389  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42926904 caatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42926838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 241
Target Start/End: Original strand, 10700580 - 10700725
Alignment:
Q  91 caaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatga 190  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||   || |||||||| ||   ||| || || |||||||||  ||| ||||    
T  10700580 caaaaccacaatcaaatcaaagaataagcaagataaagagcgtagagaaaa---gagaacaacacgaaagaattatttactcagttcggtgaaacaatga 10700676  T
Q  191 cctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
    |||||| ||| |||||||   ||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  10700677 cctactatgggggagagag--atctctccacttcactatcaatgagttctt 10700725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37439144 - 37439078
Alignment:
Q  323 caatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37439144 caatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactc-accaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 37439078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30793355 - 30793320
Alignment:
Q  105 aaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaa 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30793355 aaccaaagaataaacaagataaagagagtagagaaa 30793320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42927058 - 42926972
Alignment:
Q  164 tgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||   |||||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42927058 tgtttacccagttcggtccaact-tgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagat 42926972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3325986 - 3325958
Alignment:
Q  261 ggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3325986 ggttacaagaaattagcttcaacaagctc 3325958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8445983 - 8445882
Alignment:
Q  37 ataaccacaagcaataacaaca-atttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtag 135  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    || |||| ||| | |||||||  |||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  8445983 ataaccacaagcaacaacaacagatctagatctaatc----aaccaagtgtaaaacaaaaccgcaatcgaactaaaggataaataagatagagagggtag 8445888  T
Q  136 agaaaa 141  Q
    ||||||    
T  8445887 agaaaa 8445882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 42287969 - 42288341
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| |||||| | ||||    
T  42287969 aaccaataaccaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcatagaaaaaccacaatccaaccaaggaataa 42288068  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||   ||| |||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  42288069 acaagttaaagagggtaaagaaa---agataacagcaccaagaaattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctct 42288163  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||       |||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| |||    
T  42288164 ccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaat--acaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccat 42288261  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288262 tttcccaatctcaccaatgcacaagacactcgtgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 42288341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 397
Target Start/End: Original strand, 35446812 - 35447115
Alignment:
Q  87 atagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaacc 186  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||     
T  35446812 atagcaaaaccacaattcaaccaaagcataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact 35446907  T
Q  187 atgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35446908 -tgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagattcaacaag 35447004  T
Q  287 ctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
     ||        ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35447005 atcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 35447104  T
Q  387 caactctagaa 397  Q
    |||||||||||    
T  35447105 caactctagaa 35447115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 45727233 - 45726866
Alignment:
Q  22 aataatcaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaaca 120  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||| |||  ||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||      
T  45727233 aataaccaaatgtaaataaaccacaagcaacaacaataatatagacctagtctataaactaagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaagaataaa-- 45727136  T
Q  121 agataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctcca 220  Q
    |||||||||||||| ||||||   || |||||||| || | || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45727135 agataaagagagtaaagaaaa---gataacaacactaaaaaat-gttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctcca 45727041  T
Q  221 atccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcatttt 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||| ||||||    
T  45727040 atccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttt 45726943  T
Q  321 ctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45726942 cccaatctcaccaatgaataagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcctaaccctagaa 45726866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Original strand, 1631591 - 1631963
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaattta--gatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaagga 114  Q
    |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  || ||| | || |||| |||||||||||||| |||| ||  || | |    
T  1631591 aaccaacaaccaaatataaataaaccacaagcaataacaacaatatatagacttagtct-gtaatcaagtgtatagcaaaaccacaatccaa--aaggaa 1631687  T
Q  115 taaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatc 214  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||   || |||||||| |||| ||  ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  1631688 taaacaagataaagagagcaaggaaaa---gataacaacactaagaaata-ttcactcagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatt 1631782  T
Q  215 tctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||     
T  1631783 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacc 1631880  T
Q  315 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631881 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 1631963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24398324 - 24397993
Alignment:
Q  65 atctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagatt 164  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||  ||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  24398324 atctaatctagaaactaagtgcatagcaaaaccgcaatcggaccaa-gactaaacaagataaagagagtagagaaaaatagataacaacaccaagtaatt 24398226  T
Q  165 gttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggt 263  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||        ||||    
T  24398225 gttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaa--gggt 24398128  T
Q  264 tacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnnc-aaccctaatttctacgcatt-ttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcact 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        | |||| ||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24398127 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcact 24398028  T
Q  361 ctcccaaa-gtgtttacaattgtttcccaactcta 394  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24398027 cttccaaaggtgtttacaattgtttcccaactcta 24397993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17450883 - 17450527
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    |||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17450883 aaccgataaccaaatgtaaat---cacaagcaacaacaacaatctaaacctaatctagaaaccaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataa 17450787  T
Q  118 acaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctct 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  17450786 acaagataaagagagtacagaaa---agataacaacaccaa-agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactct-gtggagagattgatctct 17450693  T
Q  218 ccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||            |||||||||| ||||||||||||||||||||        ||| |||||| ||||| |||    
T  17450692 ccaatccactatcaatgagttc--acaaa------------tgggttacaa-aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatctctacccat 17450608  T
Q  318 tttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  17450607 ttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttgcaaatgtttgccaactctagaa 17450527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7451410 - 7451166
Alignment:
Q  36 aataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagag--t 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  7451410 aataaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaagtgcataacaaaaccacaatcgaaccaaagaataaacaagataaagagagagt 7451311  T
Q  134 agagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaat 233  Q
    ||||||||||||||||||   |||| | || ||||||||||||||  || | | ||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7451310 agagaaaaatagacaaca---ccaataaat-gttcacccagttcg--tccaacttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaat 7451217  T
Q  234 gaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaag 286  Q
    || || ||||||||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7451216 gagttattacaaagagat--acaaatgaattacaagaaattagcttcaacaag 7451166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 2334414 - 2334641
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  2334414 agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 2334511  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||        ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2334512 gagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 2334611  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  2334612 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2334641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 34139767 - 34139995
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||         |    
T  34139767 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-agggatacatat 34139864  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  34139865 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 34139964  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34139965 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 34139995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 17057366 - 17057583
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  17057366 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 17057462  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17057463 gagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 17057562  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  17057563 ctcacccaaggtgtttacaat 17057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 17085349 - 17085566
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  17085349 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 17085445  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17085446 gagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 17085545  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  17085546 ctcacccaaggtgtttacaat 17085566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 36318006 - 36318223
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  36318006 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--acaaat 36318102  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36318103 gggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 36318202  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  36318203 ctcacccaaggtgtttacaat 36318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36773733 - 36773506
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |    
T  36773733 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaa--t 36773637  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36773636 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 36773537  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36773536 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36773506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33648465 - 33648216
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagta 134  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| |||  |||||||| ||  |||| | ||||||||| || |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33648465 aaataactacgagcaacaacaacaatctaggcctaatctataagccaagtgcatagcaaaatcacaattaaactaaagaataaacaagataaagagagta 33648366  T
Q  135 gagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatg 234  Q
    |||||||   |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33648365 gagaaaa---gacaacaacaccaataaat-gtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatg 33648270  T
Q  235 aattc-ttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    | ||| ||||||||| ||        |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33648269 agttctttacaaagaaatacaaaa--gggttacaggaaattagcttcaacaagctc 33648216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 380
Target Start/End: Original strand, 6595002 - 6595221
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||            
T  6595002 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaa-- 6595099  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctc--aatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||  | |||||| |    
T  6595100 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-cattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattct 6595198  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaatt 380  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  6595199 cactct-ccaaagtgtttacaatt 6595221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 723741 - 723968
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |    
T  723741 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggat--acaaat 723837  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  723838 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 723937  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  723938 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29868040 - 29867813
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       |    
T  29868040 agattattgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaa--t 29867944  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29867943 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 29867844  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29867843 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29867813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312184
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||       |    
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa--t 38312315  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38312314 gggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 38312215  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| | ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  38312214 ctcacacaaggtgtatacaa-tgtttcccaac 38312184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 5723252 - 5723478
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  5723252 agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaa- 5723350  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| ||        ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5723351 -ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctac-ccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5723448  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  5723449 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5723478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 33162447 - 33162676
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||       |    
T  33162447 agattgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaa--t 33162543  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33162544 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttca 33162643  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactc 392  Q
     || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33162644 atcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 33162676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 36988072 - 36988299
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  36988072 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 36988169  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||||||        |||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36988170 gagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttca 36988269  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||| | |||||||||||    
T  36988270 ctc-accaaggtgtttacta-tgtttcccaac 36988299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 42362496 - 42362296
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42362496 tgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa--tgggttacaagaaattagcttaaacaagc 42362399  T
Q  288 tcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  42362398 tcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcc 42362300  T
Q  387 caac 390  Q
    ||||    
T  42362299 caac 42362296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 45099926 - 45099699
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  45099926 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaa-- 45099830  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45099829 gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 45099730  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  45099729 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45099699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 14633822 - 14634050
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||         |    
T  14633822 agattgttgactcagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaa-agggatacaaat 14633919  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  14633920 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 14634019  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14634020 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 14634050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 11151588 - 11151815
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||       |    
T  11151588 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaa--t 11151684  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        |||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  11151685 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttca 11151784  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11151785 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11151815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11690672 - 11690445
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||  |||| || | ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||       |    
T  11690672 agattgttgatccagttcggtccaact-tgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaa--t 11690576  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  11690575 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 11690476  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11690475 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11690445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 4503129 - 4503356
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  4503129 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaa-- 4503225  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgca--ttttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  4503226 gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac-cattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgatttt 4503324  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  4503325 cactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4503356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11067476 - 11067249
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||       |    
T  11067476 agattgttgaccgagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaa--t 11067380  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||        |||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  11067379 gggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatttttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttca 11067280  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11067279 ctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11067249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30833518 - 30833290
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatnnnnnnn 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||           
T  30833518 agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaa- 30833420  T
Q  259 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
     |||||||||||||||| |||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||| || |||||||     
T  30833419 -gggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattta 30833322  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30833321 cactc-accaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 30833290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6266871 - 6266777
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6266871 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 6266777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121712
Alignment:
Q  198 tggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnn 297  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||            
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaa----ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaa 13121806  T
Q  298 caa-ccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13121805 caaaccctaatttctac-cattttcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 13121712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 36205661 - 36205887
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||            
T  36205661 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaa-- 36205757  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| ||        ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36205758 gagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 36205857  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||| | |||||||||||    
T  36205858 ctc-accaaggtgtttacca-tgtttcccaac 36205887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 4484326 - 4484554
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatnnnnnnn 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||           
T  4484326 agattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaa- 4484424  T
Q  259 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||| |||||||||| || |||||||     
T  4484425 -gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaa-gaacaagacactcaatgattta 4484522  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  4484523 cactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4484554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Original strand, 7815311 - 7815498
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc-tcnnnnnnnncaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||| ||         ||    
T  7815311 ggagagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaa--gagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaa 7815408  T
Q  301 ccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | || || |||||||||| |||||| ||||    
T  7815409 ccctaatttcaac-ctttttctcaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgtttctcaac 7815498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32289739 - 32289650
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  32289739 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaa 32289650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 289
Target Start/End: Original strand, 30217947 - 30218168
Alignment:
Q  62 tagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagag 161  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| | || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    | ||||||| |     
T  30217947 tagatccaatctagaaaccaagtgtaaaacacaaccacaatcaaaccaaagaataaacaagataaagagagtagagaaaaagag----ctacaccaa-aa 30218041  T
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaatt-cttacaaagagatnnnnnnntg 260  Q
    | |||| ||| ||||| || |||| ||||| |||||||| |||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||             
T  30218042 aatgtttaccgagttcagtccaacaatgacttactctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattatttacaaagagatacaaaat-- 30218139  T
Q  261 ggttacaagaaattagcttcaacaagctc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30218140 ggttacaagaaattagcttcaataagctc 30218168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 12647373 - 12647454
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  12647373 aacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 12647454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24885736 - 24885605
Alignment:
Q  259 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||| || |||||||||    
T  24885736 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttacaaatgaacaagacactcaatgattttc 24885637  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24885636 actcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24885605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 13656025 - 13656115
Alignment:
Q  157 aagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13656025 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 13656115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 39284921 - 39284829
Alignment:
Q  298 caaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39284921 caaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39284829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 289
Target Start/End: Original strand, 17490172 - 17490271
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17490172 tgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaa--gagttacaagaaattagcttcaacaagc 17490269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284933
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatga 235  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatga 39284933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28672022
Alignment:
Q  175 ttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattctt 241  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctt 28672022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 42261359 - 42261527
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaaca-atttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagt 133  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || | |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  42261359 aaataaccgcaagcaacaacaatatatctagatctaatctagcaaccaagtgtatagcaaaaccacaaacaaaccaaa--ataatcaagataaagagagt 42261456  T
Q  134 agagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagaga 208  Q
    | ||||||    | ||||||| |||   |||||| ||||||||| |||||||  | ||||||| ||| |||||||    
T  42261457 aaagaaaa----agaacaacatcaaataattgtttacccagttcagttcaacactaacctactatgggggagaga 42261527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11049698 - 11049493
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagc 287  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11049698 tgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttacaaagagatactaaaa-gggttataagaaattagcttcaacaagc 11049600  T
Q  288 tcnnnnnnnncaac----cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattca-tgattttcactctcccaaagtgtttacaattgt 382  Q
    ||         |||    |||||||| ||| |||||||  |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  11049599 tcacaaattagaacaaaccctaatttatac-cattttcctaatctcaccaaaaaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaaatgt 11049501  T
Q  383 ttcccaac 390  Q
    ||||||||    
T  11049500 ttcccaac 11049493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 390
Target Start/End: Original strand, 5700271 - 5700347
Alignment:
Q  315 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5700271 cattttctcaatctctccaatgaacaagacactcaatgtttttcattcacccaaagtgtttacaaatgtttctcaac 5700347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Original strand, 14202450 - 14202631
Alignment:
Q  202 ggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaac 301  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||        || |||||||||||||||||| |||||||||        |||     
T  14202450 ggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaag-ga--------tgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa 14202540  T
Q  302 cctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagaca---ttcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||   |  || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14202541 cataatttctacccattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 14202631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 390
Target Start/End: Original strand, 12123717 - 12123809
Alignment:
Q  298 caaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||||||    
T  12123717 caactctaatttatactcattttc-caatctctcaaatgaacaagacactcgatgattttcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaac 12123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26353328 - 26353233
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaa 285  Q
    |||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||       |  ||||||||||||||||||||||||    
T  26353328 tgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagt--gttacaagaaattagcttcaacaa 26353233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42412161 - 42412117
Alignment:
Q  188 tgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaat 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42412161 tgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2838135 - 2838079
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagaga 208  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  2838135 aacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctactctgggggagaga 2838079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1345645 - 1345590
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagaga 208  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  1345645 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctactctgggggagaga 1345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 392
Target Start/End: Original strand, 17490283 - 17490368
Alignment:
Q  305 aatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactc 392  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  |||||| ||| ||||| |||||||    
T  17490283 aatttctac-cattttc-caatctcaacaatgaacaagacattcaatgattttcacccacccactgtgtttgcaa-tgttttccaactc 17490368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7617 - 7275
Alignment:
Q  39 aaccacaagcaataacaacaattta--gatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtaga 136  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||  || ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7617 aaccacaagcaacaacaataatatatagacctagtctataaaccaagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa 7518  T
Q  137 gaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaa 236  Q
    |||||   || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  7517 gaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaact-taacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgag 7423  T
Q  237 ttcttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatg 336  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  7422 ttcttacaaagagat--acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaatg 7325  T
Q  337 aacaagacattcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7324 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11737 - 11495
Alignment:
Q  152 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11737 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 11638  T
Q  252 nnnnnnntgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-at 350  Q
           || ||||||||||||||||||  ||||| ||        ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11637 --acaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 11540  T
Q  351 gattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11539 gattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaactctagaa 11495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10799 - 10570
Alignment:
Q  18 aaccaataatcaaatgtaaataaccacaagcaataacaacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataa 117  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  10799 aaccgataaccaaaagaaaataaccacaagcaacaacaacaatctagatttaatctagaaatcaagtgtatagtaaaactacaatctaatcaaagaataa 10700  T
Q  118 acaagat-aaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctc 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10699 acaagataaaagagagtagaggaa---agataacaacaccaaga-aatgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctc 10605  T
Q  217 tccaatccactatcaatgaattcttacaaagagat 251  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10604 ttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagat 10570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 259 - 397
Target Start/End: Original strand, 80376 - 80514
Alignment:
Q  259 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattcatgattttca 358  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  80376 tgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcagcaatgaacaagacactcatgattttca 80475  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaa 397  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  80476 ctctcccaaggtgttcacaattgtttcctaactctagaa 80514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 379
Target Start/End: Original strand, 149094 - 149311
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |    
T  149094 agattgttgacccagttcggtccaact-taacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat--ataaat 149190  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  149191 gggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 149290  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    ||  ||||| |||||||||||    
T  149291 ctaccccaaggtgtttacaat 149311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 162 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 434703 - 434504
Alignment:
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgg 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||    
T  434703 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa--gg 434606  T
Q  262 gttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcatttt-ctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcac 359  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  434605 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 434506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 490194 - 490362
Alignment:
Q  35 aaataaccacaagcaataacaaca-atttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagt 133  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || | |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  490194 aaataaccgcaagcaacaacaatatatctagatctaatctagcaaccaagtgtatagcaaaaccacaaacaaaccaaa--ataatcaagataaagagagt 490291  T
Q  134 agagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagaga 208  Q
    | ||||||    | ||||||| |||   |||||| ||||||||| |||||||  | ||||||| ||| |||||||    
T  490292 aaagaaaa----agaacaacatcaaataattgtttacccagttcagttcaacactaacctactatgggggagaga 490362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114547
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    |||||||||| ||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaa-- 114677  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttca 358  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| ||        ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  114676 gcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 114577  T
Q  359 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  114576 ctc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 114547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 379
Target Start/End: Original strand, 20414 - 20629
Alignment:
Q  162 attgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnntgg 261  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||    
T  20414 attgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagat--acaaatgg 20510  T
Q  262 gttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttcact 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||        ||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| || | | || ||||||||||||    
T  20511 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgctcattttcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgattttcact 20610  T
Q  361 ctcccaaagtgtttacaat 379  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  20611 cacccaaggtgtttacaat 20629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 861
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatnnnnnnnt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||            
T  1087 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaa-- 991  T
Q  260 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgc-attttctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgattttc 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||        |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  990 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttc 892  T
Q  358 actctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  891 actc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 390
Target Start/End: Original strand, 11157 - 11385
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatnnnnnnn 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||           
T  11157 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaa- 11255  T
Q  259 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcnnnnnnnncaaccctaatttctacgcattt-tctcaatctcaccaatgaacaagacattc-atgatttt 356  Q
     ||||||||||||||||| ||  ||||| ||        |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||| || |||||||     
T  11256 -gggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattta 11353  T
Q  357 cactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaac 390  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11354 cactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 246
Target Start/End: Original strand, 8731 - 8817
Alignment:
Q  160 agattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8731 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaa 8817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 3713 - 3794
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3713 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa 3794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 2591 - 2672
Alignment:
Q  151 aacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2591 aacacaaaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 2672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 289
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27566
Alignment:
Q  175 ttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgaatt-cttacaaagagatnnnnnnntgggttacaagaaat 273  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||       || ||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagat--acaaatgagttacaagaaat 27550  T
Q  274 tagcttcaacaagctc 289  Q
    ||||||||||||||||    
T  27551 tagcttcaacaagctc 27566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6459 - 6373
Alignment:
Q  146 acaacaacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa 232  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  6459 acaataacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Original strand, 1291 - 1370
Alignment:
Q  55 aacaatttagatctaatctagaaaacaagcgtatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagta 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  1291 aacaatctagatctaatctagaaaccaagtgtaaagtaaaaccacaatcaaaccaaaaaataaataagataaagagagta 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25032 - 25000
Alignment:
Q  354 tttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc 386  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25032 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 25000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University