View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18125_low_2 (Length: 712)

Name: NF18125_low_2
Description: NF18125
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18125_low_2
NF18125_low_2
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (10-696)||(77371-78057)
chr1 (44-696)||(20821125-20821781)
chr1 (325-693)||(5769556-5769923)
chr1 (287-692)||(41213010-41213414)
chr1 (295-696)||(5471724-5472123)
chr1 (300-693)||(21193600-21193989)
chr1 (313-693)||(22144737-22145110)
chr1 (306-693)||(37235305-37235688)
chr1 (81-286)||(33395637-33395841)
chr1 (10-252)||(20192358-20192603)
chr1 (530-693)||(8539296-8539457)
chr1 (530-693)||(8604535-8604696)
chr1 (372-693)||(13378106-13378423)
chr1 (527-693)||(33396002-33396166)
chr1 (382-678)||(38034983-38035273)
chr1 (382-678)||(36357699-36357989)
chr1 (559-693)||(22836597-22836729)
chr1 (309-415)||(40437903-40438010)
chr1 (239-286)||(20252652-20252699)
chr1 (639-682)||(49998674-49998717)
chr1 (636-682)||(17607725-17607771)
chr1 (390-436)||(22407893-22407938)
chr1 (430-484)||(33395904-33395958)
chr1 (390-436)||(49966107-49966152)
chr1 (391-436)||(2422732-2422776)
chr1 (617-681)||(40437629-40437694)
chr1 (390-437)||(20956625-20956671)
chr1 (390-437)||(22836909-22836955)
chr1 (639-682)||(46144567-46144610)
chr1 (330-416)||(49998931-49999017)
chr1 (561-659)||(51657705-51657802)
chr1 (391-436)||(9785898-9785942)
chr1 (439-483)||(49998876-49998920)
chr1 (639-678)||(17022347-17022386)
chr1 (393-436)||(18505814-18505856)
chr1 (330-385)||(29217597-29217652)
chr1 (639-682)||(52399418-52399461)
chr1 (391-437)||(20444267-20444312)
chr1 (599-692)||(20956315-20956406)
chr1 (391-437)||(37846064-37846109)
chr1 (453-483)||(40437830-40437860)
chr1 (391-424)||(20895400-20895433)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (10-696)||(21676372-21677058)
chr7 (36-696)||(8564917-8565579)
chr7 (101-696)||(28718684-28719281)
chr7 (10-437)||(4482898-4483314)
chr7 (295-693)||(9322406-9322803)
chr7 (38-682)||(15979429-15980086)
chr7 (478-696)||(4483337-4483555)
chr7 (10-278)||(14278175-14278444)
chr7 (306-693)||(9057976-9058359)
chr7 (35-278)||(44306948-44307194)
chr7 (330-617)||(20587030-20587314)
chr7 (423-682)||(19066166-19066428)
chr7 (35-278)||(39293418-39293662)
chr7 (128-286)||(45147926-45148084)
chr7 (9-268)||(9128984-9129242)
chr7 (28-267)||(4072272-4072509)
chr7 (561-693)||(13617518-13617646)
chr7 (35-193)||(19065888-19066046)
chr7 (613-691)||(20584228-20584305)
chr7 (372-696)||(13388470-13388790)
chr7 (527-693)||(16382214-16382378)
chr7 (639-693)||(45148356-45148410)
chr7 (382-693)||(13376187-13376489)
chr7 (535-679)||(3193397-3193546)
chr7 (619-682)||(21539528-21539592)
chr7 (639-682)||(4437648-4437691)
chr7 (639-682)||(4445049-4445092)
chr7 (341-416)||(16382072-16382147)
chr7 (528-605)||(4069860-4069938)
chr7 (342-483)||(15366883-15367012)
chr7 (639-683)||(33558488-33558532)
chr7 (239-286)||(14253003-14253050)
chr7 (342-416)||(14939290-14939364)
chr7 (390-436)||(44863667-44863712)
chr7 (438-484)||(45148156-45148202)
chr7 (48-113)||(3172393-3172458)
chr7 (392-436)||(142094-142137)
chr7 (390-434)||(15824105-15824148)
chr7 (204-279)||(17999356-17999432)
chr7 (602-693)||(10862200-10862290)
chr7 (639-682)||(17225272-17225315)
chr7 (639-682)||(31500005-31500048)
chr7 (309-415)||(33558170-33558277)
chr7 (391-437)||(12753405-12753450)
chr7 (390-436)||(13867687-13867732)
chr7 (430-484)||(14278050-14278104)
chr7 (306-415)||(4437319-4437433)
chr7 (306-415)||(4444720-4444834)
chr7 (438-483)||(14939374-14939419)
chr7 (166-230)||(16369976-16370040)
chr7 (535-579)||(13463061-13463105)
chr7 (438-486)||(16382157-16382205)
chr7 (639-679)||(34242472-34242512)
chr7 (391-437)||(12545402-12545448)
chr7 (220-279)||(14280109-14280168)
chr7 (639-682)||(14939570-14939613)
chr7 (639-682)||(15367163-15367206)
chr7 (639-678)||(16918365-16918404)
chr7 (639-682)||(16921281-16921324)
chr7 (220-263)||(19066049-19066092)
chr7 (639-682)||(48354133-48354176)
chr7 (438-484)||(4437444-4437490)
chr7 (438-484)||(4444845-4444891)
chr7 (391-437)||(11285672-11285717)
chr7 (390-436)||(12249770-12249815)
chr7 (648-682)||(17910748-17910782)
chr7 (441-483)||(34242665-34242707)
chr7 (220-268)||(16064991-16065040)
chr7 (426-483)||(16921476-16921533)
chr7 (390-419)||(47288200-47288229)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (10-696)||(18533967-18534654)
chr2 (10-693)||(43640973-43641647)
chr2 (10-693)||(19434813-19435484)
chr2 (10-678)||(19658089-19658753)
chr2 (384-696)||(24562211-24562524)
chr2 (102-484)||(20271619-20272005)
chr2 (500-693)||(24276516-24276707)
chr2 (133-305)||(24840520-24840693)
chr2 (81-286)||(6093142-6093347)
chr2 (357-693)||(22137170-22137500)
chr2 (35-286)||(45619740-45619994)
chr2 (10-252)||(29112396-29112640)
chr2 (287-498)||(24272477-24272686)
chr2 (391-693)||(25304090-25304388)
chr2 (382-678)||(23824824-23825114)
chr2 (60-268)||(22330941-22331149)
chr2 (525-682)||(45619390-45619552)
chr2 (382-678)||(23822880-23823170)
chr2 (382-678)||(23831959-23832249)
chr2 (478-693)||(19670487-19670697)
chr2 (527-693)||(6093508-6093672)
chr2 (390-693)||(24088721-24089015)
chr2 (391-678)||(4649-4929)
chr2 (559-693)||(721156-721288)
chr2 (81-268)||(23157706-23157896)
chr2 (81-268)||(23568963-23569153)
chr2 (382-678)||(24295944-24296234)
chr2 (641-693)||(19665434-19665486)
chr2 (10-193)||(22575548-22575727)
chr2 (239-286)||(7513722-7513769)
chr2 (639-678)||(25132979-25133018)
chr2 (220-278)||(22576474-22576532)
chr2 (391-437)||(36892358-36892403)
chr2 (617-693)||(20272145-20272222)
chr2 (42-127)||(24382434-24382519)
chr2 (220-268)||(21652743-21652791)
chr2 (639-682)||(24881399-24881442)
chr2 (317-415)||(25132665-25132764)
chr2 (430-484)||(6093410-6093464)
chr2 (640-678)||(24342740-24342778)
chr2 (391-437)||(25877616-25877661)
chr2 (174-246)||(24343096-24343168)
chr2 (390-425)||(22691616-22691651)
chr2 (390-425)||(22696263-22696298)
chr2 (453-484)||(25132790-25132821)
chr2 (190-268)||(34135957-34136035)
chr2 (639-678)||(40641652-40641691)
chr2 (239-286)||(42180069-42180116)
chr2 (391-437)||(20629015-20629061)
chr2 (391-437)||(25600482-25600527)
chr2 (368-413)||(16294375-16294420)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (36-696)||(21930060-21930723)
chr6 (102-696)||(23219933-23220527)
chr6 (162-696)||(16134575-16135110)
chr6 (10-286)||(17085022-17085298)
chr6 (10-339)||(7828895-7829212)
chr6 (306-693)||(22846567-22846954)
chr6 (295-575)||(19852700-19852979)
chr6 (81-286)||(29162182-29162387)
chr6 (44-268)||(31162576-31162801)
chr6 (287-536)||(34965365-34965615)
chr6 (554-683)||(18104826-18104955)
chr6 (563-693)||(34965604-34965733)
chr6 (35-286)||(16374630-16374882)
chr6 (42-165)||(16131941-16132064)
chr6 (175-286)||(11374523-11374634)
chr6 (527-693)||(16375041-16375211)
chr6 (527-682)||(31162241-31162399)
chr6 (74-278)||(22595171-22595375)
chr6 (42-230)||(4173389-4173576)
chr6 (42-230)||(4228998-4229185)
chr6 (527-693)||(29161857-29162021)
chr6 (372-693)||(18383030-18383346)
chr6 (430-693)||(11374198-11374460)
chr6 (535-681)||(17857741-17857892)
chr6 (28-268)||(5486020-5486261)
chr6 (306-366)||(12310672-12310732)
chr6 (514-693)||(16889094-16889268)
chr6 (643-693)||(5485678-5485727)
chr6 (643-693)||(19852973-19853022)
chr6 (430-484)||(29162065-29162119)
chr6 (317-415)||(15006266-15006365)
chr6 (640-683)||(18630970-18631013)
chr6 (239-286)||(19627784-19627831)
chr6 (639-682)||(22463467-22463510)
chr6 (639-682)||(32350874-32350917)
chr6 (239-286)||(35010983-35011030)
chr6 (103-189)||(15294200-15294286)
chr6 (438-484)||(17375307-17375353)
chr6 (390-436)||(18422259-18422304)
chr6 (309-412)||(22467725-22467829)
chr6 (602-693)||(15738981-15739071)
chr6 (639-682)||(25649943-25649986)
chr6 (372-437)||(31626948-31627009)
chr6 (438-484)||(32350668-32350714)
chr6 (391-436)||(25646517-25646561)
chr6 (391-424)||(35017313-35017346)
chr6 (643-682)||(4228641-4228680)
chr6 (441-484)||(4228841-4228884)
chr6 (391-438)||(11214674-11214721)
chr6 (639-674)||(15006013-15006048)
chr6 (81-144)||(15294286-15294349)
chr6 (391-438)||(16238899-16238946)
chr6 (639-682)||(29604353-29604396)
chr6 (559-661)||(25368731-25368833)
chr6 (391-436)||(25745897-25745941)
chr6 (454-483)||(29604171-29604200)
[»] chr3 (87 HSPs)
chr3 (40-696)||(5229416-5230074)
chr3 (36-693)||(38377155-38377817)
chr3 (36-626)||(15989147-15989735)
chr3 (306-693)||(41660052-41660435)
chr3 (10-279)||(38812692-38812960)
chr3 (325-678)||(38812350-38812699)
chr3 (35-286)||(11400829-11401080)
chr3 (484-693)||(33370207-33370414)
chr3 (225-437)||(12951345-12951557)
chr3 (372-667)||(9592119-9592411)
chr3 (44-279)||(25105631-25105867)
chr3 (12-160)||(12951193-12951340)
chr3 (37-279)||(8602926-8603168)
chr3 (39-278)||(15551175-15551415)
chr3 (77-222)||(18738158-18738300)
chr3 (382-692)||(48420184-48420492)
chr3 (10-278)||(17760114-17760383)
chr3 (10-278)||(19061434-19061703)
chr3 (391-692)||(12490078-12490376)
chr3 (50-249)||(14181852-14182052)
chr3 (28-265)||(8022496-8022733)
chr3 (42-278)||(31413958-31414192)
chr3 (10-232)||(40040982-40041205)
chr3 (535-682)||(17392009-17392164)
chr3 (382-694)||(15874677-15874983)
chr3 (530-696)||(47983557-47983721)
chr3 (530-696)||(47992844-47993008)
chr3 (530-696)||(48002131-48002295)
chr3 (530-696)||(48011417-48011581)
chr3 (527-690)||(17759785-17759945)
chr3 (514-693)||(11330353-11330525)
chr3 (309-415)||(17320192-17320299)
chr3 (157-286)||(17391711-17391841)
chr3 (309-415)||(43429152-43429259)
chr3 (559-693)||(12951737-12951869)
chr3 (617-682)||(17319934-17320000)
chr3 (617-690)||(19061105-19061178)
chr3 (617-682)||(25105316-25105382)
chr3 (37-204)||(37918261-37918429)
chr3 (35-114)||(2548285-2548364)
chr3 (639-682)||(21168078-21168121)
chr3 (309-411)||(21168336-21168439)
chr3 (599-693)||(15516459-15516552)
chr3 (535-678)||(11401237-11401384)
chr3 (390-548)||(14060724-14060881)
chr3 (390-437)||(14523004-14523050)
chr3 (646-693)||(27050518-27050564)
chr3 (345-436)||(33370962-33371051)
chr3 (559-693)||(39654601-39654731)
chr3 (330-416)||(6230253-6230339)
chr3 (390-436)||(16183664-16183709)
chr3 (391-436)||(6148456-6148500)
chr3 (330-414)||(4147289-4147373)
chr3 (639-682)||(8603466-8603509)
chr3 (390-437)||(11883921-11883967)
chr3 (390-437)||(17536604-17536650)
chr3 (639-682)||(43428892-43428935)
chr3 (390-437)||(47983418-47983464)
chr3 (390-437)||(47992705-47992751)
chr3 (390-437)||(48001992-48002038)
chr3 (390-437)||(48011278-48011324)
chr3 (240-286)||(54049534-54049580)
chr3 (438-483)||(4147236-4147281)
chr3 (391-424)||(11813360-11813393)
chr3 (438-483)||(14817255-14817300)
chr3 (391-436)||(19572429-19572473)
chr3 (390-437)||(7852328-7852374)
chr3 (390-437)||(14296956-14297002)
chr3 (390-437)||(14302583-14302629)
chr3 (390-425)||(17099137-17099172)
chr3 (639-678)||(17203454-17203493)
chr3 (639-682)||(18968887-18968930)
chr3 (174-245)||(25607031-25607102)
chr3 (639-682)||(34558659-34558702)
chr3 (391-437)||(319206-319251)
chr3 (453-483)||(4163775-4163805)
chr3 (430-484)||(8603238-8603292)
chr3 (391-437)||(8630368-8630413)
chr3 (438-484)||(17320135-17320181)
chr3 (643-693)||(17385638-17385687)
chr3 (559-692)||(11883610-11883741)
chr3 (359-416)||(14817310-14817367)
chr3 (453-482)||(18968699-18968728)
chr3 (439-484)||(21168275-21168320)
chr3 (391-436)||(22145881-22145925)
chr3 (438-483)||(43429096-43429141)
chr3 (392-437)||(51160066-51160110)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (42-696)||(20455436-20456091)
chr5 (10-693)||(24226811-24227485)
chr5 (10-435)||(5452432-5452854)
chr5 (10-437)||(3672076-3672499)
chr5 (238-696)||(11964319-11964777)
chr5 (289-566)||(23412377-23412643)
chr5 (306-678)||(21615453-21615821)
chr5 (306-678)||(19860674-19861042)
chr5 (10-279)||(14343555-14343820)
chr5 (372-696)||(37189469-37189790)
chr5 (561-693)||(23413918-23414046)
chr5 (108-278)||(21107963-21108134)
chr5 (10-105)||(11964234-11964329)
chr5 (37-268)||(16837067-16837289)
chr5 (527-693)||(21108213-21108376)
chr5 (553-692)||(431111-431248)
chr5 (372-678)||(13793636-13793939)
chr5 (178-278)||(11765101-11765202)
chr5 (391-678)||(23492528-23492808)
chr5 (382-678)||(32967533-32967824)
chr5 (559-678)||(3672679-3672797)
chr5 (639-682)||(5622791-5622834)
chr5 (309-411)||(5623049-5623152)
chr5 (330-416)||(29912550-29912636)
chr5 (639-682)||(6455471-6455514)
chr5 (599-678)||(7727304-7727383)
chr5 (639-682)||(24082907-24082950)
chr5 (639-682)||(26561149-26561192)
chr5 (639-682)||(29912850-29912893)
chr5 (239-286)||(34937905-34937952)
chr5 (642-693)||(37982199-37982249)
chr5 (37-103)||(11765200-11765266)
chr5 (639-682)||(14343118-14343161)
chr5 (390-437)||(23453410-23453456)
chr5 (390-437)||(23460654-23460700)
chr5 (390-437)||(23464915-23464961)
chr5 (58-145)||(33150378-33150465)
chr5 (390-436)||(21392654-21392699)
chr5 (640-678)||(22055125-22055163)
chr5 (174-232)||(22055495-22055553)
chr5 (330-416)||(24082607-24082693)
chr5 (617-682)||(33627746-33627812)
chr5 (599-692)||(28888645-28888737)
chr5 (438-483)||(29912646-29912691)
chr5 (174-246)||(18532517-18532589)
chr5 (649-693)||(24851810-24851853)
chr5 (559-678)||(5452173-5452291)
chr5 (639-678)||(21224068-21224107)
chr5 (317-415)||(26561403-26561502)
chr5 (394-436)||(1170320-1170361)
chr5 (356-418)||(17473568-17473624)
chr5 (640-678)||(18532161-18532199)
chr5 (453-483)||(24082718-24082748)
chr5 (438-484)||(33627832-33627878)
chr5 (439-484)||(5622988-5623033)
chr5 (391-424)||(11582371-11582404)
chr5 (395-436)||(24470765-24470805)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (51-693)||(54364915-54365561)
chr4 (194-696)||(5372037-5372540)
chr4 (51-437)||(15043062-15043445)
chr4 (51-437)||(15110979-15111362)
chr4 (290-692)||(49070244-49070650)
chr4 (287-696)||(19557761-19558159)
chr4 (287-693)||(47469679-47470084)
chr4 (287-693)||(50223505-50223909)
chr4 (41-425)||(17377049-17377433)
chr4 (306-693)||(41257697-41258079)
chr4 (290-618)||(10238853-10239181)
chr4 (428-693)||(24237447-24237712)
chr4 (423-682)||(17213199-17213460)
chr4 (35-278)||(40902413-40902658)
chr4 (42-177)||(5372534-5372669)
chr4 (514-638)||(17376880-17377004)
chr4 (96-268)||(15215564-15215737)
chr4 (50-278)||(41918463-41918691)
chr4 (390-693)||(14900001-14900296)
chr4 (372-693)||(12245602-12245918)
chr4 (382-678)||(15852682-15852972)
chr4 (529-692)||(43282730-43282890)
chr4 (28-193)||(21958452-21958618)
chr4 (50-249)||(12135557-12135757)
chr4 (309-415)||(12732621-12732728)
chr4 (382-678)||(34197530-34197821)
chr4 (559-693)||(52266812-52266944)
chr4 (382-678)||(37958422-37958713)
chr4 (559-696)||(15043625-15043760)
chr4 (559-696)||(15110664-15110799)
chr4 (223-278)||(12410090-12410145)
chr4 (239-286)||(19699273-19699320)
chr4 (239-286)||(19709858-19709905)
chr4 (639-693)||(10238798-10238851)
chr4 (639-681)||(42707546-42707588)
chr4 (478-693)||(41167286-41167495)
chr4 (617-680)||(12732921-12732985)
chr4 (375-414)||(16227882-16227921)
chr4 (639-682)||(18275608-18275651)
chr4 (599-678)||(27959755-27959834)
chr4 (639-682)||(38763573-38763616)
chr4 (390-437)||(43283041-43283087)
chr4 (643-693)||(7187257-7187307)
chr4 (640-678)||(10105523-10105561)
chr4 (640-678)||(15676248-15676286)
chr4 (640-678)||(31114569-31114607)
chr4 (391-437)||(44345290-44345335)
chr4 (372-437)||(12837920-12837983)
chr4 (391-436)||(16366360-16366404)
chr4 (390-435)||(33738687-33738731)
chr4 (391-424)||(53909441-53909474)
chr4 (390-437)||(52267123-52267169)
chr4 (639-693)||(10115710-10115763)
chr4 (391-437)||(30236145-30236190)
chr4 (438-483)||(38763375-38763420)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (10-693)||(45560560-45561245)
chr8 (28-693)||(24237699-24238368)
chr8 (102-695)||(22311900-22312494)
chr8 (10-437)||(25294151-25294568)
chr8 (10-437)||(25756140-25756557)
chr8 (299-693)||(22498643-22499036)
chr8 (287-693)||(33170682-33171084)
chr8 (341-693)||(23116161-23116512)
chr8 (44-425)||(11542516-11542899)
chr8 (478-696)||(11543122-11543340)
chr8 (478-696)||(18042900-18043118)
chr8 (306-693)||(37654990-37655372)
chr8 (313-693)||(33612404-33612779)
chr8 (35-278)||(20177709-20177955)
chr8 (35-278)||(20222436-20222682)
chr8 (10-278)||(17500242-17500511)
chr8 (35-268)||(17265157-17265391)
chr8 (478-693)||(23148500-23148713)
chr8 (514-696)||(25756598-25756778)
chr8 (35-278)||(23217281-23217524)
chr8 (35-278)||(19333307-19333551)
chr8 (514-696)||(25294609-25294795)
chr8 (372-678)||(23835723-23836025)
chr8 (372-679)||(21192105-21192407)
chr8 (314-576)||(23153267-23153525)
chr8 (392-678)||(21199533-21199814)
chr8 (37-279)||(25608403-25608636)
chr8 (639-693)||(25608800-25608854)
chr8 (617-693)||(17265646-17265723)
chr8 (527-693)||(19332972-19333136)
chr8 (526-693)||(39448170-39448330)
chr8 (135-278)||(31195954-31196097)
chr8 (313-415)||(24554190-24554293)
chr8 (28-193)||(24623066-24623228)
chr8 (514-678)||(31195644-31195804)
chr8 (28-168)||(18823999-18824138)
chr8 (639-682)||(7469045-7469088)
chr8 (239-286)||(16041206-16041253)
chr8 (239-286)||(16042882-16042929)
chr8 (239-286)||(18610714-18610761)
chr8 (390-437)||(41244157-41244203)
chr8 (239-286)||(41508835-41508882)
chr8 (390-436)||(19994801-19994846)
chr8 (390-436)||(24719076-24719121)
chr8 (390-436)||(25120968-25121013)
chr8 (640-682)||(29296693-29296735)
chr8 (640-693)||(23227366-23227419)
chr8 (641-682)||(24266800-24266841)
chr8 (390-425)||(16416766-16416801)
chr8 (559-678)||(18768121-18768239)
chr8 (639-678)||(24553935-24553974)
chr8 (390-437)||(28543396-28543442)
chr8 (58-145)||(34013036-34013123)
chr8 (438-483)||(38637206-38637251)
chr8 (426-482)||(17265468-17265524)
chr8 (639-683)||(38637020-38637064)
chr8 (453-484)||(7468854-7468885)
chr8 (639-682)||(15932117-15932160)
chr8 (390-425)||(20480122-20480157)
chr8 (453-484)||(24554133-24554164)
chr8 (391-437)||(270270-270315)
chr8 (391-437)||(645605-645650)
chr8 (391-437)||(831340-831385)
chr8 (391-437)||(16203921-16203966)
chr8 (453-483)||(24266609-24266639)
chr8 (391-437)||(39448419-39448464)
chr8 (313-406)||(23228928-23229020)
chr8 (368-413)||(45476021-45476066)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (35-693)||(2320-2971)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (290-692)||(4361-4767)
[»] scaffold0090 (3 HSPs)
scaffold0090 (10-380)||(6313-6686)
scaffold0090 (32-268)||(36479-36716)
scaffold0090 (559-678)||(6004-6122)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (287-693)||(25977-26380)
scaffold0004 (295-693)||(84847-85242)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (287-693)||(130306-130709)
scaffold0022 (391-693)||(106269-106563)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (306-693)||(44953-45330)
[»] scaffold0174 (5 HSPs)
scaffold0174 (36-485)||(21640-22095)
scaffold0174 (639-682)||(1378-1421)
scaffold0174 (527-683)||(21435-21597)
scaffold0174 (331-385)||(1079-1133)
scaffold0174 (438-480)||(1174-1216)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (424-693)||(9338-9609)
scaffold0183 (92-286)||(9089-9284)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (101-379)||(17617-17898)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (330-696)||(13955-14316)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (81-286)||(9824-10030)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (306-678)||(24970-25339)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (357-693)||(180-510)
scaffold0786 (357-693)||(5235-5565)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (357-693)||(3768-4098)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (520-693)||(34805-34978)
scaffold0049 (390-424)||(31046-31080)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (10-278)||(10853-11120)
scaffold0017 (639-693)||(11387-11441)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (35-279)||(12669-12912)
scaffold0468 (535-591)||(12449-12505)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (390-692)||(3640-3939)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (359-692)||(117950-118280)
scaffold0016 (391-437)||(163858-163903)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (287-425)||(99548-99686)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (372-696)||(78174-78495)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (68-279)||(11039-11251)
scaffold0013 (382-693)||(33985-34292)
scaffold0013 (527-693)||(10699-10872)
scaffold0013 (426-484)||(10915-10973)
[»] scaffold0317 (3 HSPs)
scaffold0317 (92-279)||(15558-15746)
scaffold0317 (529-693)||(15234-15404)
scaffold0317 (438-484)||(15450-15496)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (309-565)||(3199-3453)
scaffold0193 (609-693)||(3450-3533)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (52-268)||(224-440)
scaffold0396 (391-437)||(13788-13833)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (35-204)||(256148-256318)
scaffold0009 (535-690)||(255769-255928)
scaffold0009 (639-682)||(68283-68326)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (391-692)||(4701-4995)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (559-693)||(7284-7416)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (527-682)||(12371-12531)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (400-540)||(55922-56061)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (53-278)||(19985-20212)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (28-181)||(14703-14856)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (526-693)||(7013-7173)
scaffold0095 (391-437)||(7262-7307)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (514-693)||(78325-78499)
scaffold0028 (331-415)||(64090-64173)
scaffold0028 (391-424)||(90610-90643)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (639-682)||(1152-1195)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (527-690)||(1562-1723)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (330-416)||(9848-9934)
scaffold0253 (330-416)||(19273-19359)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (220-269)||(28807-28856)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (639-682)||(2316-2359)
scaffold0387 (438-483)||(2497-2542)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (239-286)||(26760-26807)
scaffold0138 (514-675)||(23790-23947)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (654-693)||(5541-5580)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (390-437)||(138404-138450)
scaffold0021 (640-682)||(19130-19172)
scaffold0021 (640-682)||(23395-23437)
scaffold0021 (640-682)||(28706-28748)
scaffold0021 (391-437)||(76810-76855)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (390-436)||(3706-3751)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (330-416)||(6231-6317)
scaffold0357 (438-483)||(6327-6372)
scaffold0357 (639-682)||(6531-6574)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (639-681)||(3321-3363)
scaffold0327 (514-693)||(4674-4848)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (313-379)||(8634-8699)
scaffold0292 (391-436)||(18108-18152)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (391-437)||(26414-26459)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (314-483)||(106165-106335)
scaffold0032 (640-693)||(105953-106006)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (391-437)||(256558-256603)
scaffold0011 (391-436)||(124992-125036)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (317-385)||(1625-1694)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (390-438)||(8600-8647)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (356-424)||(20916-20978)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (174-246)||(8177-8249)
scaffold0025 (639-682)||(52087-52130)
scaffold0025 (391-437)||(145061-145106)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (639-690)||(350-400)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (390-437)||(7954-8000)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (204-266)||(13758-13821)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (390-437)||(6068-6114)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (239-286)||(23322-23369)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (390-437)||(68849-68895)
scaffold0031 (639-682)||(98518-98561)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (391-437)||(3182-3227)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (390-436)||(13433-13478)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (391-437)||(7255-7300)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (390-424)||(3474-3508)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (390-436)||(21084-21129)
scaffold0008 (390-435)||(28674-28718)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (391-436)||(759-803)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (391-436)||(1045-1089)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (390-435)||(7013-7057)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (391-424)||(31261-31294)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (368-413)||(20615-20660)
scaffold0165 (368-413)||(28599-28644)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (391-424)||(28284-28317)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (641-682)||(12231-12272)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (390-434)||(14200-14243)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (646-678)||(23832-23864)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (330-385)||(25585-25640)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (390-437)||(32049-32095)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (599-678)||(71641-71720)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (639-682)||(29887-29930)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (639-682)||(198716-198759)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (220-274)||(1622-1676)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (392-437)||(6308-6352)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (391-424)||(40055-40088)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 587; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 78057 - 77371
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78057 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacctcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 77958  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77957 aagcacaagtaagcaagatatgcaattagagcatagatcacttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 77858  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctatt 309  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  77857 atcattcaacaatttcaccaatgcaaaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaataaatccaaatgtcacaagtatgtatt 77758  T
Q  310 catcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77757 catcaaacacacttatcattaacaatcatccttcatgtgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 77658  T
Q  410 taccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaacc 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  77657 taccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacagaacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtaaaagagtaacc 77558  T
Q  510 ctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatata 609  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  77557 ctcttttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgtaaaatcacttcataatatttaacaacaatata 77458  T
Q  610 aaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  77457 aaggataacctccatttatattgatcacctcaacaacaatttcattatcaaatatttacgtccacgcaatcaatcaagtcataaatc 77371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 696
Target Start/End: Original strand, 20821125 - 20821781
Alignment:
Q  44 atatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcat 143  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||    
T  20821125 atatataattctcacctcattactattaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacaaataagtaagacatgaaattagagcat 20821224  T
Q  144 aaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcataaattc 241  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  20821225 agttcaattatttacaaccatcaacaaagtccaccaatgtacatatacaccaatccacatagatcacaacattcaacaaatttcaccaatgcacaaattc 20821324  T
Q  242 atcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaa-caatcatcc 340  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  20821325 accaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccattcaaatccaatgtcacaaatatgtattcatcaaacacacttatcatcaaacaatcatca 20821424  T
Q  341 ttcacatgcaa-caactaagactcatgccaat-atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctc 438  Q
    |||||||  || ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  20821425 ttcacatataaacagttaagactcatgccaattatgctatgcgcctattcccgacacatatatgcatgtggtatcaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-c 20821522  T
Q  439 aagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatg 537  Q
    | ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20821523 atgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacgcccgtcttacattatcgccgaagtaaaagagtaaccctcttttacaacatcaagactcaacatg 20821622  T
Q  538 actatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcac 637  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20821623 actatgatgcatggacatacaagcaaagattcgacaatgcaaaatcacctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttatattgatcac 20821722  T
Q  638 ctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20821723 ctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 20821781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 325 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 5769923 - 5769556
Alignment:
Q  325 tcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5769923 tcatcaacagtcatcattcacatgcaacaaataagactcatgccaatatgatatgcgcctaatcccaacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 5769824  T
Q  425 aaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacat 523  Q
    | |||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  5769823 a-ggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagtactcctcctttataacat 5769726  T
Q  524 caagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctcc 622  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5769725 caagactcaacatgactatgacgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataaatattcaacaacaatataaaggatagcctcc 5769626  T
Q  623 atttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
      ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5769625 gattatattgatcacctcaaccacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-caatcaagtcataa 5769556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 287 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 41213414 - 41213010
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctat 386  Q
    ||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||  |||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||     
T  41213414 tccaaatatcacgggtatatattgatcaaacacatatatcataatcaataatcattcacatgcaacaaataagtgtcatgtcaatatgatatgtgcctaa 41213315  T
Q  387 acacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacat 485  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |  | || ||| ||||||||| | |||  || ||||||||    
T  41213314 tcccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatacaataaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacat 41213217  T
Q  486 tatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcac 585  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41213216 tatcatcgaagtaaaagagtaactctcctttacaacatcaagactcaacatgacaatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcac 41213117  T
Q  586 cccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatc 684  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41213116 ctcataaatattcaacaaaaatataaaggataacctccgattatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-caatc 41213018  T
Q  685 aagtcata 692  Q
    ||||||||    
T  41213017 aagtcata 41213010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 295 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 5472123 - 5471724
Alignment:
Q  295 tcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgaca 394  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||||  | |||||    
T  5472123 tcacaaatatgtattcatcaaatacacttatcatcaacaaccatcattcaaatgcagcaaataagactcatgctaatatgatatactcctaatcccgaca 5472024  T
Q  395 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||    
T  5472023 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcaccccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccg 5471925  T
Q  494 aagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataat 593  Q
    || || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  5471924 aaataaaagagtacccctcatttacaacttcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcatgac 5471825  T
Q  594 attcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  5471824 attc-acaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcacctccaccacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-ctatcaagtcacaa 5471727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 300 - 693
Target Start/End: Original strand, 21193600 - 21193989
Alignment:
Q  300 agtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatat 399  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| || |||||| ||||  |  |||||||||    
T  21193600 agtatgtattcatcaaatgcacgtatcatcaataatcatcattcacatgccacaaacgagactcatgccaacataatatgcacctagtct-gacacatat 21193698  T
Q  400 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagta 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||    
T  21193699 atgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggttgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagta 21193796  T
Q  499 caagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattca 598  Q
     ||||| | ||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  21193797 aaagagcacccctcttttacagctacaaaactcaacatgactatgatgcatggacattctagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataattttc- 21193895  T
Q  599 acaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21193896 acaacaatataaaggataacttccaaatatattgatcatctccacaacaattacattctcaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 21193989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 313 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22145110 - 22144737
Alignment:
Q  313 caaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtac 412  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22145110 caaacacatttatcatcaacaatcatcattcacatgca-caaataagacttatgtcta-atgatatgcgcctaaac-cgacacatatatgcatgtggtac 22145014  T
Q  413 caaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacata-acatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccc 510  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||| | ||||| ||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |   |    
T  22145013 caaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgt-aacaaacacatcatatgtaaaatttcacactcgtcttacattatcaccgaagtaaaagagcatatc 22144917  T
Q  511 tcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataa 610  Q
     | |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | || ||||||||||||    
T  22144916 ccttttacagccacaagactcatcatgactatgatgcatgtacatacaagcaaagactcgacaatgcaacatcacctca-aaaagtc-acaacaatataa 22144819  T
Q  611 aggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | || ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22144818 aagacaactttcaattatattgatcacctcaacaacatttgcattatcaagtgtttacgtccacataa-caatcaagtcataa 22144737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 306 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 37235688 - 37235305
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||     |||||||||||||||    
T  37235688 tatttatcaaacacacttatcatcaacaatcatcagtcatatgccacaaataagactcatgtcaacatgaaatgcgcctagttt-gacacatatatgcat 37235590  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagag 504  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||| ||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  37235589 gtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatttaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 37235492  T
Q  505 t--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaa 602  Q
       |||| |  |||| | |  ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||    
T  37235491 ctcaaccat--tttatagctacaagactcaacatgattatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaagatcacctcataattttca-caa 37235395  T
Q  603 caatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| ||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37235394 caatttaaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 37235305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Original strand, 33395637 - 33395841
Alignment:
Q  81 ttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaa 180  Q
    ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  33395637 ttatcatcaaattgattcaccaagtgtataagcacaagtaagtaagatatgcaatcagagcatatatcatttatttacaacaaccaacaaaa-ccaccaa 33395735  T
Q  181 tgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaacc 280  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33395736 tctacatatacacaatcaacatagatcacaacattcaacaatttcaccaatacacaaattcatcaagtcacatatccaattgtgacacaattcatcaacc 33395835  T
Q  281 aatcaa 286  Q
    | ||||    
T  33395836 actcaa 33395841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 20192358 - 20192603
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactatt-accaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgta 108  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| | ||||| | ||||||| || | | |||| ||||||||    
T  20192358 caaagaaatcaccacatcatatatatacatatacatatacaattctcacctcattactatttatcaaaataattatcatcaaattgtttcaccaagtgta 20192457  T
Q  109 taagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatc 207  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||| || |||||||| |||    
T  20192458 taagcacaaacaagtaagacatgcaattagagcatagctcaattatttacaaccatcaacaaagtccaccaatgtatgtatacaccattccacatagatc 20192557  T
Q  208 acatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcaca 252  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20192558 acaacattcaacaaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcaca 20192603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 530 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 8539457 - 8539296
Alignment:
Q  530 tcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttata 629  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||  ||||    
T  8539457 tcaacacgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcagcaatgcaaaatcacctcataattttca-cgacaatataaatgataacttccaaatata 8539359  T
Q  630 atgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8539358 ttgatcatctccacaacaattgcattatcaaatatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 8539296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 530 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 8604696 - 8604535
Alignment:
Q  530 tcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttata 629  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||  ||||    
T  8604696 tcaacacgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcagcaatgcaaaatcacctcataattttca-cgacaatataaatgataacttccaaatata 8604598  T
Q  630 atgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8604597 ttgatcatctccacaacaattgcattatcaaatatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 8604535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 372 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 13378423 - 13378106
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtac 471  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |    
T  13378423 atgatatgtccctaaacatgacacctaaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttc 13378326  T
Q  472 acctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagag--taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagact 568  Q
    ||  || |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  13378325 acacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagcttaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggact 13378228  T
Q  569 cgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttac 668  Q
    | ||||||| |||||||| |  ||  ||| |||| |||||||| || | | ||||  |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13378227 caacaatgc-aaatcacctccaaactttc-acaaaaatataaatgacatcttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaagtaattac 13378130  T
Q  669 gtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  13378129 gtccacacaa-cattcaagtcataa 13378106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 527 - 693
Target Start/End: Original strand, 33396002 - 33396166
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 626  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| || | ||||||||||||  |  | |    |||||||||| |||| |   ||||||||||    
T  33396002 gactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagaatcaataatgcaaaatcatacattcac---caacaacaatgtaaaagtacacctccattt 33396098  T
Q  627 ataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33396099 acattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaaaatcaatcaagtcataa 33396166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 38035273 - 38034983
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || | |    
T  38035273 cctaaacaagacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcacattc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgttt 38035176  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  38035175 tacataatctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcgacatgactatgatgcatgcacatacaagtaaggactcaacaatgca 38035078  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |  ||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38035077 a--tcacctca--attttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa 38034983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 36357989 - 36357699
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc--tc 479  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| |||  ||    
T  36357989 cctagacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcatcttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcac-tccagtc 36357893  T
Q  480 ttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaa 579  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||     ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   | ||||||| || ||||| |||||||||    
T  36357892 ttacataatctctgaagtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatgaatatacaagtaaggactcaacaatgcaa 36357793  T
Q  580 aatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
      ||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  36357792 --tcacctca--attttca-caacaatataaaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattatgtccacacaa 36357699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 559 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22836729 - 22836597
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||  || ||||||||||||||| |    
T  22836729 agcaaagactcgataatgcgacatcacctcataattttca-caacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatttccacaacaattgcattacc 22836631  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22836630 aagtgtttacgtccacacaa-cgatcaagtcataa 22836597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 40438010 - 40437903
Alignment:
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcat-gccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgt 407  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| || |||||||  | |||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  40438010 tcatcaagcacacttatcatcaataatcatcattcacatgcaacaattacgactcatatcaaatatgttatgcgcctaattccgacacatatatgcatgt 40437911  T
Q  408 ggtaccaa 415  Q
    ||||||||    
T  40437910 ggtaccaa 40437903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 20252652 - 20252699
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20252652 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 20252699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 49998717 - 49998674
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49998717 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 49998674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 682
Target Start/End: Original strand, 17607725 - 17607771
Alignment:
Q  636 acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17607725 acctcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 17607771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22407938 - 22407893
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22407938 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 22407893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Original strand, 33395904 - 33395958
Alignment:
Q  430 cgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33395904 cgtcaccccaagatgccaatagcacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 33395958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Original strand, 49966107 - 49966152
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49966107 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 49966152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 2422776 - 2422732
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2422776 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaa-gtcgtcacc 2422732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 617 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 40437694 - 40437629
Alignment:
Q  617 acctccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatca 681  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40437694 acctccatttacattgatcaacttcaacaacaattgcattattaagtatttatgtccacacaatca 40437629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20956671 - 20956625
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20956671 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttc-aaggtcgtcacct 20956625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22836955 - 22836909
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22836955 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttc-aaggtcgtcacct 22836909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 46144567 - 46144610
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46144567 tcaacaacaattacattatcaagtatttacatccacacaatcaa 46144610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 49999017 - 49998931
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49999017 aacaattatcattcatatgcaacaattacgactcatgttaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaaa 49998931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 561 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 51657802 - 51657705
Alignment:
Q  561 caaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatca 659  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  || ||| |||| || |||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51657802 caaagactcgataatgcaacatcacttcacaattttcacca-caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatca 51657705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 9785942 - 9785898
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9785942 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 9785898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 49998920 - 49998876
Alignment:
Q  439 aagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998920 aagatgccaaccacacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 49998876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Original strand, 17022347 - 17022386
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17022347 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaa 17022386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 436
Target Start/End: Original strand, 18505814 - 18505856
Alignment:
Q  393 cacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18505814 cacatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 18505856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 385
Target Start/End: Original strand, 29217597 - 29217652
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgccta 385  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29217597 aacaattatcattcacatgctacaattacgactcatgtcaatatgatatgcgccta 29217652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 52399418 - 52399461
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  52399418 tcaacagcaattgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 52399461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 20444267 - 20444312
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  20444267 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcc-aaaaggtcgtcacct 20444312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 599 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 20956406 - 20956315
Alignment:
Q  599 acaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcata 692  Q
    ||||||||||| |||| ||| | ||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||  |||||||||||||    
T  20956406 acaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaatcacgtccataca--caatcaagtcata 20956315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37846109 - 37846064
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  37846109 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcc-aaaaggtcgtcacct 37846064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 40437860 - 40437830
Alignment:
Q  453 acatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40437860 acatcttatgtaagagtacacctcctcttac 40437830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 20895433 - 20895400
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20895433 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctca 20895400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 555; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 21677058 - 21676372
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21677058 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacctcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcataatgtgtat 21676959  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676958 aagcacaagtaaaaaagatatgcaattagagcatagatcatttatttacaaccatcaacaaaatccactaatgtacatatacacaatccacataaatcac 21676859  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctatt 309  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21676858 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaactaattaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatgtatt 21676759  T
Q  310 catcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 409  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676758 catcaaacacacttatcaacaacaatcatccttcacgtgcaacaacaaagactcatggcaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 21676659  T
Q  410 taccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaacc 509  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21676658 taccaaatcgcctcaaaggtcgtcacctcaagatgctaacagaacatcttatgtaagattacacatcctcttacattatcaccgaagtaaaagagtagcc 21676559  T
Q  510 ctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatata 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21676558 ctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgtaaaatcacctcataatattcaacaacaatata 21676459  T
Q  610 aaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676458 aaggataacctccatttatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 21676372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 8565579 - 8564917
Alignment:
Q  36 atatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaat 135  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||| || | |||||| ||||| |||||||| || |||| |||  ||||||     
T  8565579 atatatacatatacaattctcacctcatcattattatcaaaataattatcatcaaattgattcaccaagtatataagcaaaaaaaagtaaggaatgcaac 8565480  T
Q  136 tagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgc 233  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  8565479 tagagcatagctcaattatttacaaccatcaacaaggtccacaattgtacatatacaccaatccacatagatcacaacattcaacaaatttcaccaatgc 8565380  T
Q  234 ataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaat-ccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaac 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8565379 acaaattcatcaagtcacatattcaattatgacataattcatcaaccaatcgattccaaatgtcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaac 8565280  T
Q  333 aatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgt 432  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8565279 aatcatcattcacatgcaacaattaagacttatgccaatatgatatgcgcctaatcccgacaaatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgt 8565181  T
Q  433 cacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactc 531  Q
    |||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  8565180 cacc-catgatgcaataaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagtaaccctcttttacaacatcaagtctc 8565082  T
Q  532 aacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataat 631  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8565081 aacatgactatgatccatgaacatacaagcaaagagtcgacaatgcaaaattacctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttatatt 8564982  T
Q  632 gatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8564981 gaccacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccaaacaatcaatcaagtcataaatc 8564917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 696
Target Start/End: Original strand, 28718684 - 28719281
Alignment:
Q  101 caagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatcca 199  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  28718684 caagtgtacaagcacaaacaagcaagacatgcaattagagcataactcaattatttgcaaccatcaacaaagtccacaattgtacatatacaccaatcca 28718783  T
Q  200 cataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtca 297  Q
    |||| |||||| ||||||  || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28718784 catagatcacaacattcaataaatttcaccaatgcacaaattcatgaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaattccaaatgtca 28718883  T
Q  298 caagtatctattcatcaaacacacttatcat-taacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacaca 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  28718884 caagtatgtattcatcaaacacacttatcatgaaacaatcatcattcccatgcaacaattaagactcatatcaatattatattcgcctaatcacgacaca 28718983  T
Q  397 tatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagt--acacctcctcttacattatcaccga 494  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |  | || |||  |||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    
T  28718984 tatatgcatgtggtaccaagtcacctc-aaggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaatatcacatgtaagatttcacacct-gtcttacattatcaccga 28719080  T
Q  495 agtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataata 594  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28719081 agtaaacgagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataata 28719180  T
Q  595 ttcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaa 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28719181 ttcaacaacaatataaaggataacctcca-ttatattgatcacctcaacaacatttgcattatcaagtatttacatccacacaatcaatcaagtcataaa 28719279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 437
Target Start/End: Original strand, 4482898 - 4483314
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||    
T  4482898 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatatgcatatacaattctcacctcatcactattaccaaaacatttatcat-------------caagtgtat 4482984  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4482985 aagcacaagtaagcaatatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccacatagatcac 4483084  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcacaagtatctat 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  4483085 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacacttcatcaaccaatcaattccaaatatcacaagtttgtat 4483184  T
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatg-caacaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatg 406  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4483185 tcatcaagcacacttatcatcaacaatcatcattcacatgtaaacaattaagactcatgccaattatgctatgcgcctattcccgacacatatatgcatg 4483284  T
Q  407 tggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4483285 tggtaccaaatcacgtc-aaggtcgtcacct 4483314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 295 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 9322803 - 9322406
Alignment:
Q  295 tcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgaca 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||  |  ||||    
T  9322803 tcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacagtcatcattcacatgcaacaaataagacttatgccaatatgatatgcacttaatccggaca 9322704  T
Q  395 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccg 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||||||||| |    
T  9322703 catatatgcatgtggtaccaaatcacatcaa-ggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcactg 9322606  T
Q  494 aagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataa- 592  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9322605 aagtaaaagagtattcctcctttataacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataaa 9322506  T
Q  593 tattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcata 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9322505 tattcaacaacaatataaaggataacctccatttatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccatacaa-caatcaagtcata 9322407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 38 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15980086 - 15979429
Alignment:
Q  38 atacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaatta 137  Q
    ||||||||||  || |||||| | |||| ||||| ||||| | ||||||| || | |||||| | |||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||     
T  15980086 atacacatatccaaatctcacctgatcattattatcaaaataattatcatcaaattgattcaccgagtgtataagcataaacaagtaaggcatgcaattg 15979987  T
Q  138 gagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcat 235  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  15979986 gagcatagctcaattatttacaaccatcaacaaagtccaccaatatacatatactccaatccacataaattacaacattcaacaaatttcaccaatgcac 15979887  T
Q  236 aaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaa 334  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  15979886 aaattgatcaagtcacgtattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaattccaaatgtcacaagtatgtactcaacaaacacatttatcatcaacaa 15979787  T
Q  335 tcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacc----tcaaaggt 429  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||     |||||||    
T  15979786 tcaccattcacatgcaacaactaagactcatgtcaattatgctatgcgcatattcccgacacatatatgcatgtgatacc-gatcaccaacaacaaaggt 15979688  T
Q  430 cgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaaca---tcaa 526  Q
    |||||||||| ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||| | ||| ||| | ||| ||||||| |||   | | ||| |||||||||     |     
T  15979687 cgtcacctcatgatgcaacaaaaacatcatatgtaaga-ttcaccacttctcacaat-tcagcgaagtaaaagttcaccactcttttacaacacatatat 15979590  T
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atattcaac---aacaatataaaggataacctcc 622  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||||| |||  ||| ||||||    
T  15979589 gactcaatatgactatgatgcatggacatacgagcaaagacccgacaatgcaaaatcacctcatatatattcaacaataacaatgtaagagatcacctcc 15979490  T
Q  623 atttataatgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  15979489 atttacattgatcaacttcaacaacaattgcattattaactatttacgtccccacaatcaa 15979429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 478 - 696
Target Start/End: Original strand, 4483337 - 4483555
Alignment:
Q  478 tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgc 577  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |    
T  4483337 tcttacattatcaccgaagtaaaagagtaaccttcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatac 4483436  T
Q  578 aaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaca 677  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483437 aacatcacctcataatattcaacagcaatataaaggataacctcaaattatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaca 4483536  T
Q  678 atcaatcaagtcataaatc 696  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4483537 atcaatcaagtcataaatc 4483555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14278444 - 14278175
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14278444 caaaggaatcaacaaaacttatatgtatatacacatatacaattctgacctcatcactattaccaaaacatttatcattaagtacattcaccaagtgtat 14278345  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatca 208  Q
    |||||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14278344 aagcacgagcaagtaatacatgcaattagagcataattcaattattcacaaccatcaccaaaatccaccaatgtacatatacaccaatccacat-aatca 14278246  T
Q  209 catcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    || |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14278245 caacattcaccaaattccaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaactcatcaa 14278175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 306 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 9058359 - 9057976
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  9058359 tatttatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcatatgccacaaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagtt-cgacacatatatgcat 9058261  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagag 504  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  9058260 gtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 9058163  T
Q  505 t--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaa 602  Q
       ||||||  |||| | |  ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  9058162 ctcaaccct--tttaaagctacaagactcaacttgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataattttca-caa 9058066  T
Q  603 caatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9058065 caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 9057976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44307194 - 44306948
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  44307194 tatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcataagcaagtaagacatgcaa 44307095  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac--aatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaat 231  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  44307094 ttagaacataattcaattattcacaaccgtcaacaaaatccacaaatgtacatatacaccaaatccacataaatcacaacattcaccgaattccaccaat 44306995  T
Q  232 gcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  44306994 gcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgaaacgactcatcaa 44306948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 20587314 - 20587030
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggt 429  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20587314 aacaattatcattcacatccaacaattacgactcatgctaatatgctatgcgcctaattccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggt 20587216  T
Q  430 cgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaaga 528  Q
    |||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20587215 cgtcac-tcatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaaataaaagagtacccctcctttataacatcaaga 20587117  T
Q  529 ctcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataa 617  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20587116 ctcaacatgactatgatgcatggacatataagcaatgactcgacaattcaaaatcacttcataatattca--cacaatataaaggataa 20587030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 423 - 682
Target Start/End: Original strand, 19066166 - 19066428
Alignment:
Q  423 caaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaac 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||| |  || | ||||| ||    
T  19066166 caaaggtcgtcaccttaagatgccaacaaaacatcctatgtaagatttcacgtccgtcttacattttcgccgaagtaaaagagcacaccccttttacgac 19066265  T
Q  522 atcaagac-tcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atattcaacaacaatataaaggataacc 619  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19066266 atcaacacctcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaa-tcacctgatatactttcaacaacaatataaaggataacc 19066364  T
Q  620 tccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19066365 tccatttatattgaacaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 19066428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39293662 - 39293418
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||| ||||| || | |||| || ||| |||| ||||||    
T  39293662 tatatacacatatacaattctcatctcatcactatcaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtataaaggcacgagcaagtaagacatgcaa 39293563  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatg 232  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| | | |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||    
T  39293562 ttagagcataattcaattattcacaaccgtcaacaaaattcaccaaggtacataaataccaatccacat-aatcacaacattcaccgaattctaccaatg 39293464  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39293463 cacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacgactcatcaa 39293418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 286
Target Start/End: Original strand, 45147926 - 45148084
Alignment:
Q  128 tatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcac 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  45147926 tatgcaattagagcatagatcatttatttgtaacctccaacaaaatccatcaatctacatatacacaatccacatagatcacaacattcaacaatttcac 45148025  T
Q  228 caatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45148026 caatacacaaattcaccaagtcacatatccaattgtgacacaattcatcaaccactcaa 45148084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9129242 - 9128984
Alignment:
Q  9 gcaaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgta 108  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||    
T  9129242 gcaaagaaatcatcaaaccatatatatatatatatatatataattctcatctcattgctattaccaaaataattatcattaa-tagattcaccaagggta 9129144  T
Q  109 taagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatc 207  Q
    ||| |||||| ||| |||| || |||||||||| |   ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||  |||| ||||    
T  9129143 taatcacaagcaagtaagacatccaattagagcctgcttcaattattcacaaccatcaacaaaatccaccaatgcacatatataccaatttacat-aatc 9129045  T
Q  208 acatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    ||| |||||   ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9129044 acaacattcccaaattttaccaatgcacaaattcaccaagtcacatattcaattatgacac 9128984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4072509 - 4072272
Alignment:
Q  28 atatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga 127  Q
    |||||| |||||| ||| | | ||||||||| |||| |||||||||| || | ||||| | || |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4072509 atatatatatatatacacacacaattctcacctcattactattaccacaataattatc-tcaaatagattcc-caagtgtataagcacaagcaagtaaga 4072412  T
Q  128 tatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttc 225  Q
     |||||||||||  || | |||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  4072411 catgcaattagaagatgattcaactattcacaaccatcaacaaaatccaccaatgcacatatacaccaatccacataa-tcacaacattcaccaaatttc 4072313  T
Q  226 accaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgaca 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4072312 accaatgcacaaattcatcaagtcacat-ttcaattatgaca 4072272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 561 - 693
Target Start/End: Original strand, 13617518 - 13617646
Alignment:
Q  561 caaagactcgacaatgcaaaatcaccccataa-tattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatca 659  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  13617518 caaagactcgacaatgcaaaatc--ctcataaatattcaaaaacaatataaaggatagcctccatttatattgatcacctcaacaacaattgcattat-- 13617613  T
Q  660 agtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13617614 -gtatttatgtccacacaatcaatcaagtcataa 13617646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 193
Target Start/End: Original strand, 19065888 - 19066046
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||| | ||||||| || | |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||  || ||    
T  19065888 tatatacacatatacaatcttcacctcattactattaccaaaataattatcatcaaatggatttaccaagtgtataagcacaagcaagtaagacgtgtaa 19065987  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac 193  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19065988 ttagagcataattcaattattcacaaccgtcaacaaaatccaccaatgtacatatacac 19066046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 613 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 20584305 - 20584228
Alignment:
Q  613 gataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcat 691  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20584305 gataacctccaattatattgattacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-caatcaagtcat 20584228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 372 - 696
Target Start/End: Original strand, 13388470 - 13388790
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaaca-taacatcttatgtaagagta 470  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||| |||||  |||||| ||||||||| |     
T  13388470 atgatatgtccctaaacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctc-aaggtcgtcacct-tcgatg-caacagaaacatcgtatgtaagattt 13388566  T
Q  471 cac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagag--taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagac 567  Q
    ||| | | | |||||| |||||||||||| |||||   ||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||    
T  13388567 cacacccgtattacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactataagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggac 13388664  T
Q  568 tcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtattta 667  Q
    || ||||||| |||||||| |  ||  ||| |||||||||||||||| |   ||||  |||| |||||| |||  |||||||| |||||| ||||| |||    
T  13388665 tcaacaatgc-aaatcacctccaaactttc-acaacaatataaaggacatattccaaatatattgatcatctcctcaacaattacattattaagtaatta 13388762  T
Q  668 cgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  13388763 cgtccacacaa-cattcaaatcataaatc 13388790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 527 - 693
Target Start/End: Original strand, 16382214 - 16382378
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 626  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||| |  |  | |    |||||||||| |||| |   ||||||||||    
T  16382214 gactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcaataatgcaaaattatacattcac---caacaacaatgtaaaagtacacctccattt 16382310  T
Q  627 ataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16382311 acattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaaatatttacgtccacacaatcaattaagtcataa 16382378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 639 - 693
Target Start/End: Original strand, 45148356 - 45148410
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45148356 tcaacaacaattgtattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 45148410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 382 - 693
Target Start/End: Original strand, 13376187 - 13376489
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctctt 481  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  | ||||    
T  13376187 cctaaacatgacacataaatgcatatggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacaccgtctt 13376284  T
Q  482 acattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaa 579  Q
    |||| |||||||||||| |||||   ||||||  ||||||||   |||||| || ||||||||||||||   |||| |||| || ||||| |||||||||    
T  13376285 acataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaaccataagactaaatatgactatgatgcatggacatgcaagtaaggactcaacaatgcaa 13376382  T
Q  580 aatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaat 679  Q
      ||||| ||  |  |||| |||||||||||| |||||| |||| | ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  13376383 --tcacctca--actttca-caacaatataaatgataacttccaat-atattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa- 13376475  T
Q  680 caatcaagtcataa 693  Q
    || |||||||||||    
T  13376476 cattcaagtcataa 13376489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 535 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 3193546 - 3193397
Alignment:
Q  535 atgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atatt---caacaacaatataaaggataacctccatttataa 630  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |   |||||||||| |||  ||| |||||||  ||||     
T  3193546 atgactatgatgcatggacatgcaagcaaagactcgacaatgcaacatcacctcatatataatcaacaacaacaatgtaagagatcacctccaactatat 3193447  T
Q  631 tgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaat 679  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3193446 tgaacaacttcaacaacaattgcattattaagtatttatgtccacacaat 3193397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 619 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 21539592 - 21539528
Alignment:
Q  619 ctccatttataatgatcacctc-aacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21539592 ctccatttacattgatcaactccaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 21539528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 4437648 - 4437691
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4437648 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 4437691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 4445049 - 4445092
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4445049 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 4445092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 416
Target Start/End: Original strand, 16382072 - 16382147
Alignment:
Q  341 ttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16382072 ttcacatgcaacaattacgactcatgccaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaaa 16382147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 4069938 - 4069860
Alignment:
Q  528 actcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atattcaacaacaa 605  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  4069938 actcaatatggctatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcatatatatttaacaacaa 4069860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 483
Target Start/End: Original strand, 15366883 - 15367012
Alignment:
Q  342 tcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaag 441  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||            ||||    
T  15366883 tcacatgcaacaattacgactcatgtcaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaaataacaacaa------------caag 15366970  T
Q  442 atgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15366971 atgccaaccgcacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 15367012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 683
Target Start/End: Original strand, 33558488 - 33558532
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaat 683  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33558488 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaat 33558532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14253050 - 14253003
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14253050 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 14253003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 416
Target Start/End: Original strand, 14939290 - 14939364
Alignment:
Q  342 tcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14939290 tcacatgcaacaattacgactcatgtcaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaaa 14939364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Original strand, 44863667 - 44863712
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44863667 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 44863712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Original strand, 45148156 - 45148202
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45148156 caagatgtcaacatcacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 45148202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3172458 - 3172393
Alignment:
Q  48 ataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagc 113  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3172458 ataattctcacctcattactattgccaaaataattatcattaaatagattcaccaagtgtataagc 3172393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 436
Target Start/End: Original strand, 142094 - 142137
Alignment:
Q  392 acacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  142094 acacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 142137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15824148 - 15824105
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtca 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15824148 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtca 15824105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17999432 - 17999356
Alignment:
Q  204 aatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  17999432 aatcacaacattcaccaaatttcaccaatgcacatattcatcacgtcacatattcaagtatgacacatttcaccaac 17999356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 602 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 10862290 - 10862200
Alignment:
Q  602 acaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||| |||| ||| ||||  || | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10862290 acaatatagaggacaacttccaaatacattgatcatctccacaacaattgcattaccaagtgtttacgtccacacaa-cgatcaagtcataa 10862200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 17225315 - 17225272
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17225315 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 17225272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 31500005 - 31500048
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31500005 tcaacaacaattgtattatcaagtatttacctccacacaatcaa 31500048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 309 - 415
Target Start/End: Original strand, 33558170 - 33558277
Alignment:
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgt 407  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||   || ||||  |||||||||    ||||||||| ||||||||    
T  33558170 tcatcaagcacacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaattacaactcatattaattatgcaatgcgcctaattccgacacatacatgcatgt 33558269  T
Q  408 ggtaccaa 415  Q
    ||||||||    
T  33558270 ggtaccaa 33558277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 12753405 - 12753450
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12753405 gacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 12753450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13867732 - 13867687
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13867732 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 13867687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14278104 - 14278050
Alignment:
Q  430 cgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14278104 cgtcaccccatgatgccaacagaacatcatatgcaagagtacacctcctcttaca 14278050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 415
Target Start/End: Original strand, 4437319 - 4437433
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatca----tccttcacatgcaacaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacacatata 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||| ||  |||||||  || ||||  |||||||||    ||||||||| |    
T  4437319 tattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcattcacatgcaacaattacaactcatgttaattatgcaatgcgcctaattccgacacataca 4437418  T
Q  401 tgcatgtggtaccaa 415  Q
    |||||||||||||||    
T  4437419 tgcatgtggtaccaa 4437433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 415
Target Start/End: Original strand, 4444720 - 4444834
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatca----tccttcacatgcaacaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacacatata 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||| ||  |||||||  || ||||  |||||||||    ||||||||| |    
T  4444720 tattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcattcacatgcaacaattacaactcatgttaattatgcaatgcgcctaattccgacacataca 4444819  T
Q  401 tgcatgtggtaccaa 415  Q
    |||||||||||||||    
T  4444820 tgcatgtggtaccaa 4444834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 483
Target Start/End: Original strand, 14939374 - 14939419
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14939374 caagatgccaaccgcacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 14939419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16370040 - 16369976
Alignment:
Q  166 aacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaa 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  16370040 aacgagatccaccaatgtacatatacatcaatccacat-aatcacaacattccacaatttcaccaa 16369976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 535 - 579
Target Start/End: Original strand, 13463061 - 13463105
Alignment:
Q  535 atgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaa 579  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13463061 atgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaa 13463105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 486
Target Start/End: Original strand, 16382157 - 16382205
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacatt 486  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16382157 caagatgccaaccacacatcttatgtaagagtacacctccttttacatt 16382205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 34242512 - 34242472
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaat 679  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34242512 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaat 34242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12545448 - 12545402
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtacc-aaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12545448 gacacatatatgcatgtggtaccaaaatcacctc-aaggtcgtcacct 12545402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14280168 - 14280109
Alignment:
Q  220 aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  14280168 aatttcaccaatgcacttattcaccaagtcacatattcaagtgtgacacatttcatcaac 14280109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 14939570 - 14939613
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  14939570 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatcaacacaatcaa 14939613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 15367163 - 15367206
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15367163 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatcaacacaatcaa 15367206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Original strand, 16918365 - 16918404
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16918365 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaa 16918404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 16921324 - 16921281
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  16921324 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacactatcaa 16921281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Original strand, 19066049 - 19066092
Alignment:
Q  220 aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattat 263  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19066049 aattccaccaatgcacaaattcatcaagtcacattttcaattat 19066092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 48354133 - 48354176
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  48354133 tcaacaacaactgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 48354176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Original strand, 4437444 - 4437490
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4437444 caagatgccaaccacacatcttaggtaagagtacacctcctcttaca 4437490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Original strand, 4444845 - 4444891
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4444845 caagatgccaaccacacatcttaggtaagagtacacctcctcttaca 4444891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 11285672 - 11285717
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  11285672 gacacatatatgcatgtggtaccaaattaactc-aaggtcgtcacct 11285717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12249815 - 12249770
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  12249815 cgacacatatatgcatgtggtaccatatcacttcaaa-gtcgtcacc 12249770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 648 - 682
Target Start/End: Original strand, 17910748 - 17910782
Alignment:
Q  648 attgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17910748 attgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 17910782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 441 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 34242707 - 34242665
Alignment:
Q  441 gatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34242707 gatgccaacagcacatcatatgtaagagtacacctcctcttac 34242665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 268
Target Start/End: Original strand, 16064991 - 16065040
Alignment:
Q  220 aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacata-ttcaattatgacac 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16064991 aatttcaccaatgcacaaattcaccaagtcacatatttcaattctgacac 16065040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 16921533 - 16921476
Alignment:
Q  426 aggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||| ||| || |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16921533 aggtcgttaccccatgatgccaaccacacatcgtatgtaagagtacacctcctcttac 16921476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 419
Target Start/End: Original strand, 47288200 - 47288229
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatca 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47288200 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatca 47288229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 479; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 696
Target Start/End: Original strand, 18533967 - 18534654
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18533967 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 18534066  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18534067 aagcacaagtaagcaagatatgtaattagagcatagatcatttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtatatatacacaatccacatatatcac 18534166  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctatt 309  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18534167 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatgtatt 18534266  T
Q  310 catcaaacacacttatcat-taacaatcatccttcacatg-caacaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatg 406  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18534267 catcaaacacacttatcatcaaacaatcaccattcacatgtaaacaattaagactcatgacaattatgatatgcgcctattcccgacacatatatgcatg 18534366  T
Q  407 tggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagagt 505  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18534367 tggtaccaaatcacctc-aacgtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagattgcacactcgtcttacattatcaccgaagtaaaagagt 18534464  T
Q  506 aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaa 605  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18534465 aaccctcttttacaacatcaagactcaacatgagtatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataatattcaacaacaa 18534564  T
Q  606 tataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534565 tataaaggataacctcaaattatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagta-ttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 18534654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 693
Target Start/End: Original strand, 43640973 - 43641647
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43640973 caaagaaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaacatttatcattaaatagattcatcaagtgtat 43641072  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  43641073 aagcacaagtaagcaagatatgcaattagagcatagatcatttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccgc----atcac 43641168  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctatt 309  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  43641169 atcattcaaaaattccaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacgattcatcaa-caatcgattcaaatgtcacaagtatgtatt 43641267  T
Q  310 catcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 409  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||    ||||||||||||||||||||    
T  43641268 cttcaaacacacttatcattaacaatcatcattcacatgccacaaataagactcaggtcaacattatatgcaccta-gttcgacacatatatgcatgtgg 43641366  T
Q  410 taccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagag--ta 506  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||   |    
T  43641367 taccgaatcacctc-aaggtcgtcacct-tcgatgcaataaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctca 43641464  T
Q  507 accctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaat 606  Q
    |||||  |||||  |  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  43641465 accct--tttacggctacaagactcaacatgactatgatgcatagacatacaagcaaagactcgacaatgaaaaatcatctcataattttc-acaacaat 43641561  T
Q  607 ataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
     ||| ||| ||| | ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43641562 gtaatggacaactttcaaatatattgatcacctccacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 43641647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 19435484 - 19434813
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19435484 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaacatttatcatcaagtagattcatcaagtgtat 19435385  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||    
T  19435384 aagcacaggtaagcaagatatgcaattagaacataaatcaattatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtgcatatacccaatccac----atcac 19435289  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctatt 309  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19435288 atcattcaacaattccaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgatacaattcatcaaccaatcaatccaaatatcacaagtatgtatt 19435189  T
Q  310 catcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 409  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| |   ||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||    
T  19435188 catcaaacacacttatcatcaacaatcctcatccacatgccacaaataagactcatgtc---atgatatgcaccta-gttcgacacatatatgcatgtgg 19435093  T
Q  410 taccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagag--ta 506  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||   ||||| |  | |||||| || |||||| | ||| | | |||||||| ||| |||||||| |||||   |    
T  19435092 tatcaaatcacctc-aaggtcgtcacct-tcgatgcaacaaaaacatcgtacgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagta-aagagctca 19434996  T
Q  507 accctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaat 606  Q
    |||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  19434995 accct--ttttcaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcatctcataattttc-acaacaat 19434899  T
Q  607 ataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19434898 ataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgaattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 19434813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 678
Target Start/End: Original strand, 19658089 - 19658753
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19658089 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatacaattctcacctcatcactatttccaaaacatttatcgtcaagtagattcatcaagtgtat 19658188  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19658189 aagcacaagtaagcaagacatgcatttagagcatagatcatttatttacaaccatcaacaaaattcaccaatgtacatatacacaatccacatagatcac 19658288  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatc-aatccaaatgtcacaagtatctat 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  19658289 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacatgcttcatcaaacaatcaaatccaaatatcacaagtatgtat 19658388  T
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatg-caacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgt 407  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19658389 tcatcaaacacacttatcatcgacaatcatcattcacatgtaaacaattaagactcatgtcaacgtgatatgcgcctaaac-cgacacatatatgcatgt 19658487  T
Q  408 ggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagag-t 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| | | |||||||| |||  ||||||| ||||| |    
T  19658488 ggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct-tcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcttcgaagtaaaagagct 19658585  T
Q  506 aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaa 605  Q
     | |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||| | |||||  ||||||| || ||| ||| |||||||    
T  19658586 caacct-ttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatataagtaaagactcaagaatgc--aatcacctcaaaat-ttc-acaacaa 19658680  T
Q  606 tataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||||||||| ||| ||||  |||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  19658681 tataaaggacaacttccagatatgttgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacatccatacaa 19658753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 384 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 24562524 - 24562211
Alignment:
Q  384 tatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24562524 tatacacgacacatatttgcatgtggtaccaaatcacctcaaagatcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 24562425  T
Q  484 attatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatc 583  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24562424 attatcaccgaagtaaaagagtaaccctcttttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatgaacatacaagcaaatactcgacaatgcaaaatc 24562325  T
Q  584 accccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacc-tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24562324 acctcataatattcaacaacaaaataaaggataacctccatttatattgatcaccttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 24562225  T
Q  683 tcaagtcataaatc 696  Q
    ||||||||||||||    
T  24562224 tcaagtcataaatc 24562211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 102 - 484
Target Start/End: Original strand, 20271619 - 20272005
Alignment:
Q  102 aagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccac 200  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||  |||| |||  | || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||    
T  20271619 aagtgtataagcacaaacaagtaagacatggaattagaagataattcaactgttcacaaccatcaacaaaatctaccaatgcacatatgcaccaattcac 20271718  T
Q  201 ataaatcacatcattca-gcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcac 298  Q
    |||| || || |||||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20271719 ataa-tctcaacattcacgaaaatttaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaatcaatcaattccaaatgtcac 20271817  T
Q  299 aagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgca-acaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacaca 396  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||    
T  20271818 aagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcgctcacatgtagccaattaagactcatgccaattatgctatgcgcctattcccgacaca 20271917  T
Q  397 tatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20271918 tatatgcatgtggtaccaattaccaacaaaggtcgtcaccccaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacatcctcttaca 20272005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 500 - 693
Target Start/End: Original strand, 24276516 - 24276707
Alignment:
Q  500 aagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaa 599  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  24276516 aagagtacccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatgaacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcatctcataatattc-a 24276614  T
Q  600 caacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  24276615 caacaatataaaggataacctccaattatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgaccagacaa-caattaagtcataa 24276707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 133 - 305
Target Start/End: Original strand, 24840520 - 24840693
Alignment:
Q  133 aattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatg 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||    
T  24840520 aattagagcatagatcatttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccacatagatcacatcgttgaacaatttcactaatg 24840619  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatc-aatccaaatgtcacaagtatc 305  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24840620 cacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaaattcaaatgtcacaagtatc 24840693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Original strand, 6093142 - 6093347
Alignment:
Q  81 ttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaa 180  Q
    ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6093142 ttatcatcaaattgattcaccaagtgtataagcacaagtaagtaagatatgcaattagagcataaattatttatttacaaccaccaacaaaatccaccaa 6093241  T
Q  181 tgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaacc 280  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6093242 tctacatatacacaatccacatagatcacaacattcaaaaatttcaccaatacacaaattcaccaagtcacatatccaattgtgacacaattcatcaacc 6093341  T
Q  281 aatcaa 286  Q
    | ||||    
T  6093342 actcaa 6093347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22137500 - 22137170
Alignment:
Q  357 aagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacata-aca 455  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||| | |||    
T  22137500 aagactcatgtcaa-atgatatgagcctaaac-cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgt-aacaaacaca 22137406  T
Q  456 tcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttaca 554  Q
    || ||||||||| | |||  || |||||||||||||||||| || ||||| |   | | |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  22137405 tcatatgtaagatttcacacccatcttacattatcaccgaaataaaagagcacatcccttttacagccacaagactcaacatgactataatgcatggaca 22137306  T
Q  555 tacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcat 654  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||| |  | || || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  22137305 tacaagcaaagactcaacaatgcaacatcacctca-aataatca-caacaatataaaggacaactttaaattgtattgatcaccttaacaacatttgcat 22137208  T
Q  655 tatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22137207 tatcaagtatttacgtccacacaa-caatcaagtcataa 22137170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45619994 - 45619740
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||  ||  |||| ||||||    
T  45619994 tatatatacctatacaattctcacctcattactattaccaaaataattatcatcaaatagattcactaagagtataagcacaaacaaataagacatgcaa 45619895  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaat-gtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaat 231  Q
    ||||| ||||  ||| | |||  ||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  45619894 ttagaacatagttcaatcattcgcaatcatcaacaaagtccaccaattgtacatatacaccaatccaaataaatcacaacattcaacaaatttcaccaat 45619795  T
Q  232 gcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45619794 gcacaaattcaccaagtcacgtattcaattatgacacaattcatcaaccattcaa 45619740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 29112396 - 29112640
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| || | | |||| |||||||||    
T  29112396 caaagaaatcaccacatcatatatatacatatacatatacaattctcacctcattactattaccaaaataattatcatcaaattgtttcaccaagtgtat 29112495  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatca 208  Q
    ||| | ||  ||| |||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| || | |||||| ||||    
T  29112496 aagaataaacaagtaaggcatgcaattagagcatagctcaattatttacaaccatcaacaaagtccaccagtgtacgtatacaccatttcacatagatca 29112595  T
Q  209 catcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcaca 252  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29112596 caacattcaacaaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcaca 29112640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 498
Target Start/End: Original strand, 24272477 - 24272686
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctat 386  Q
    ||||||| |||||| | | ||||||||||| ||||||||||| || || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  24272477 tccaaatctcacaattctgtattcatcaaatacacttatcatcaaaaaccatcattcgcatgcaacaaataagactcatgccaatatgatatgtg-ttaa 24272575  T
Q  387 acacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacat 485  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  24272576 tcccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttc-aaggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacactcgtcttacat 24272673  T
Q  486 tatcaccgaagta 498  Q
    |||||||||||||    
T  24272674 tatcaccgaagta 24272686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 391 - 693
Target Start/End: Original strand, 25304090 - 25304388
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcct-cttacattatc 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  ||| ||||||| |||    
T  25304090 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccttcttacataatc 25304187  T
Q  490 accgaagtacaagag--taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccc 587  Q
     |||||||| || ||  |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||     
T  25304188 tccgaagtaaaatagcttaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgcaaa-tcacct 25304284  T
Q  588 cataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaag 687  Q
    |  ||  |||| |||||||||||| || ||| ||||  |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  25304285 ccaaactttca-caacaatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaagtaattacgtccacacaa-cattcaag 25304382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 23825114 - 23824824
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||||||  |||    
T  23825114 cctagacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtct 23825017  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23825016 tacataatctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaaaatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgca 23824919  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |  ||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23824918 a--tcacctca--attttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa 23824824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 22330941 - 22331149
Alignment:
Q  60 tcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttaca 159  Q
    |||||| ||||| ||||| | ||||||| || | |||| |  || ||||||| |||||  ||| |||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  22330941 tcatcattattatcaaaataattatcatcaaattgatttactaaatgtataaccacaaacaagtaaggcatgcaattagagcatagctcaattatttaca 22331040  T
Q  160 accatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattc 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  22331041 accatcaacaaaatccaccaatgcacatatacaccaatccacat-aatcacaacattcaccaaatttcatcaatgca-caattaaccaagtcacatattc 22331138  T
Q  258 aattatgacac 268  Q
    |||||||||||    
T  22331139 aattatgacac 22331149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 525 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 45619552 - 45619390
Alignment:
Q  525 aagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atatt---caacaacaatataaaggataacct 620  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||   |||||||||| |||  |||  |||    
T  45619552 aagactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaagtcacctcatatgtattcaacaacaacaatgtaagagatcccct 45619453  T
Q  621 ccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||| | |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45619452 ccatttacattgattaactccaacaacaattgcattatcaagtatttacgtctacacaatcaa 45619390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 23823170 - 23822880
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||||||  |||    
T  23823170 cctagacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtct 23823073  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23823072 tacataatctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaaaatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgca 23822975  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |  ||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  23822974 a--tcacctca--attttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattatgtccacacaa 23822880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 23832249 - 23831959
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||||||  |||    
T  23832249 cctagacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtct 23832152  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23832151 tacataatctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaaaatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgca 23832054  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |  ||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  23832053 a--tcacctca--attttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattatgtccacacaa 23831959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 478 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 19670697 - 19670487
Alignment:
Q  478 tcttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaat 575  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  |||| |||||    
T  19670697 tcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaagaactcaacaat 19670600  T
Q  576 gcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccaca 675  Q
    ||||  ||||| |  | | |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  19670599 gcaa--tcacctccaagt-ttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccaca 19670504  T
Q  676 caatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  19670503 caa-caatcaagtcataa 19670487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 527 - 693
Target Start/End: Original strand, 6093508 - 6093672
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 626  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||| | ||||||||||||  |  | |    |||||||||| |||| |   ||||||||||    
T  6093508 gactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcacagactcaataatgcaaaatcatgcactcac---caacaacaatgtaaaagtacacctccattt 6093604  T
Q  627 ataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6093605 acattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacacccacacaatcaatcaagtcataa 6093672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 24089015 - 24088721
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattat 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||| ||    
T  24089015 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcatcttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataat 24088918  T
Q  489 caccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacc 586  Q
    | |||| ||| |||||   ||||||  ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||   ||||||| | || ||||| ||||||||| |  |||    
T  24088917 ctccgacgtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaaaacccaacatgactatgatgcatggacataca-gtaaggactcaacaatgcaata--acc 24088823  T
Q  587 ccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaa 686  Q
     ||    |||  |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  24088822 tca----atttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgattatctccacaacaattgcattaccaagtgtttacgtccacacaa-cgatcaa 24088728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 4929 - 4649
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatc 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||  ||||||||| | |||| || |||||||| |||    
T  4929 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacccccgtcttacataatc 4832  T
Q  490 accgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccc 587  Q
     |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |   || |||||| || ||||| |||||||||  |||||     
T  4831 tccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcatcatgactatgatggatggacgtacaagtaaggactcaacaatgcaa--tcacct 4736  T
Q  588 cataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4735 ca--attttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaattacgtccacacaa 4649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 559 - 693
Target Start/End: Original strand, 721156 - 721288
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||  || ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  721156 agcaaagactcgataatgcgacatcactacacaattttca-caacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattacc 721254  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  721255 aagtgtttacgtccacacaa-caatcaagtcataa 721288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 268
Target Start/End: Original strand, 23157706 - 23157896
Alignment:
Q  81 ttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaa-tccacca 179  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||   |||  |||| | |||| ||||| ||| |||||||    
T  23157706 ttatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacaagcaagtaaaatatacaattagagcatggttcaaatattcaaaaccttcaacaaaagtccacca 23157805  T
Q  180 atgtacatataca-caatccacataaatcaca-tcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  23157806 atgcacatatacaccaattcacat-aatcacaggcattcaccaaatttcaccaatgctcatattcaccaaatcacttattcaattatgacac 23157896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 268
Target Start/End: Original strand, 23568963 - 23569153
Alignment:
Q  81 ttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaa-tccacca 179  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||   |||  |||| | |||| ||||| ||| |||||||    
T  23568963 ttatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacaagcaagtaaaatatacaattagagcatggttcaaatattcaaaaccttcaacaaaagtccacca 23569062  T
Q  180 atgtacatataca-caatccacataaatcaca-tcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  23569063 atgcacatatacaccaattcacat-aatcacaggcattcaccaaatttcaccaatgctcatattcaccaaatcacttattcaattatgacac 23569153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 24296234 - 24295944
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||||    |||    
T  24296234 cctaaacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaactaaaacatcgtatgtaagatttcacccaagtct 24296137  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaa 580  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||     ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || || |  |||||||||     
T  24296136 tacataatctccgaagtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggagttaacaatgcaa- 24296038  T
Q  581 atcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
     ||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24296037 -tcacctca--attttca-caacaatataaaggacaactttcaaatatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa 24295944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 641 - 693
Target Start/End: Original strand, 19665434 - 19665486
Alignment:
Q  641 aacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19665434 aacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaattaagtcataa 19665486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 22575548 - 22575727
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||||||    |||| ||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  22575548 caaacgaatcaccaaatcatatacatatata----tatacaattctcacctcattactattaccaagataattatcatcaaatagatccaccaagtatat 22575643  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac 193  Q
     |||||||| ||| || | |  |||||||||| |   |||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22575644 gagcacaagcaagtaacacacacaattagagcttggttcaaatattcacaaccatcaacaaaatccaccaatgcacatatacac 22575727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7513769 - 7513722
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7513769 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 7513722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Original strand, 25132979 - 25133018
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25132979 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 25133018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 278
Target Start/End: Original strand, 22576474 - 22576532
Alignment:
Q  220 aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22576474 aatttcaccaatgcacagattcatcaagtcacatattcaactatgacacgactcatcaa 22576532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 36892403 - 36892358
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36892403 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 36892358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 617 - 693
Target Start/End: Original strand, 20272145 - 20272222
Alignment:
Q  617 acctccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| |||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20272145 accttcatttacattgatcaacttcaacaacaatttcattatcaaatatttatgtccactcaatcaatcaagtcataa 20272222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Original strand, 24382434 - 24382519
Alignment:
Q  42 acatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga 127  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| | ||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24382434 acatatacaattctcgcctcattactattaccaaaataattatcatcaaattgattcaccaagtgtatacgcacaagaaagtaaga 24382519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 268
Target Start/End: Original strand, 21652743 - 21652791
Alignment:
Q  220 aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21652743 aatttcaccaatgcccaaattcaccaagtcacatattcaattatgacac 21652791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 24881399 - 24881442
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24881399 tcaacatcaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 24881442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 415
Target Start/End: Original strand, 25132665 - 25132764
Alignment:
Q  317 cacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatg-ccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaa 415  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||| | |||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25132665 cacacttatcaccaacactcatcattcacatgcaacaattacgactgatgtcaaatatgctatgcgcctaatttcgacacatacatgcatgtggtaccaa 25132764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Original strand, 6093410 - 6093464
Alignment:
Q  430 cgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6093410 cgtcaccccaagttgcaaacaacacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 6093464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 24342778 - 24342740
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24342778 caacaacaattgcattatcaagtaattacgtccacacaa 24342740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25877661 - 25877616
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25877661 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacct 25877616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24343168 - 24343096
Alignment:
Q  174 ccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaa 246  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| | || ||||||||    
T  24343168 ccaccaatgtacatccatacaatccacatagatcacatcattcaataaattcaccaatgtacaagttcatcaa 24343096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22691651 - 22691616
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22691651 cgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaa 22691616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22696298 - 22696263
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22696298 cgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaa 22696263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 484
Target Start/End: Original strand, 25132790 - 25132821
Alignment:
Q  453 acatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25132790 acatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 25132821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34136035 - 34135957
Alignment:
Q  190 acacaatccacataaatcacatcattcagcaatt-tcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  34136035 acacaattcacataa-tcacaacattcaccaaatgtcaccaatgcacaaattcaccaagtggcatattcaattatgacac 34135957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 40641691 - 40641652
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  40641691 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaa 40641652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 42180116 - 42180069
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  42180116 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcgccaaccaatcaa 42180069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20629061 - 20629015
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  20629061 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaagatcgtcacct 20629015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 25600482 - 25600527
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  25600482 gacacatatatgcatgtggtaccatattacctc-aaggtcgtcacct 25600527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16294420 - 16294375
Alignment:
Q  368 caatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtacc 413  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16294420 caatatgatatgcccctagacacgacacataaatgcatgcggtacc 16294375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 696
Target Start/End: Original strand, 21930060 - 21930723
Alignment:
Q  36 atatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaat 135  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||| |  |||||| ||   ||||||  |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  21930060 atatatacatatacaattctcacctcatcattgttatcaaaataaatatcatcaatgtgattcactaagtgtataagcccaagcaagtaagacatgcaat 21930159  T
Q  136 tagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgc 233  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  21930160 tagagcataattcaattattcacaaccatcaacaaaatccatcaatgtacatatacaccaatccacataa-tcacaacattcaacaaatttcaccaatgc 21930258  T
Q  234 ataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaat-ccaaatgtcacaagtatctattcatcaa-acacacttatcattaa 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  21930259 accaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaattccaaatgtcacaagtatgtattcgtcaacacacacttatcatcaa 21930358  T
Q  332 caatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcg 431  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21930359 caatcatcattcacatgcaacaactaagactcataccaatatgatatatgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcg 21930458  T
Q  432 tcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactc 531  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21930459 tcacctcaagatgccaacagaacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatctccgaagtaaaagagtaatcctcttttacaacatcaagactc 21930558  T
Q  532 aacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataat 631  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21930559 aacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgtaaaatcacctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttatatt 21930658  T
Q  632 gatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21930659 gatcacctcaacaacaattacattatcaattatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 21930723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 696
Target Start/End: Original strand, 23219933 - 23220527
Alignment:
Q  102 aagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccac 200  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||  |||| | ||||||||||||| |||||||    
T  23219933 aagtgtatgagcacaagcaagtaagacattcaattagagcatagttcaattatttacaaccatcaataaagcccacaattgtacatatacaccaatccac 23220032  T
Q  201 ataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcaca 299  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23220033 atagatcacaacattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaattccaaatatcaca 23220132  T
Q  300 agtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatat 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23220133 agtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacaattat-cttcacatgcaacaattaagacccatgccaatatgatatgcgcctaatcccgacacatat 23220231  T
Q  400 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagta 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23220232 atgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgttatc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacatccgtcttatattatcactgaagta 23220329  T
Q  499 caagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattca 598  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23220330 aaagagtaaccctcttttacaacatcaagactcaacatgactatgaagcatggaaatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataatattca 23220429  T
Q  599 acaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23220430 acaacaatataaaggataacctccatttatattgatcaacccaacaacaatttcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtaataaatc 23220527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 162 - 696
Target Start/End: Original strand, 16134575 - 16135110
Alignment:
Q  162 catcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaatt 261  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16134575 catcaacaaaattcaccaatgtacgtatacacaatcaacatagatcacaacattcaacaatttcaccaatgcaaaaattcaccaagtcatatattcaatt 16134674  T
Q  262 atgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaa-caatcatccttcacatgcaacaactaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16134675 atgacacaattcatcaaccaatcaaatccaaatgtcataagtatgtattaatcaaacacacttatcatcaaacaatcatcattcacatgcaacaattaag 16134774  T
Q  360 actcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatctt 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  | |||||| |    
T  16134775 actcatgccaatatgatatgcgtctattctcgacaca-atatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcttcacc-catgatgcaacaaaaacatcat 16134871  T
Q  460 atgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacataca 558  Q
    |||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||    
T  16134872 atgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcatgatgactatgatgcatggacataca 16134971  T
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataa-tattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16134972 agcaaagactcgacaatgcaaaatcatctcataaatattcaacaataatataaaggataacctctatttatattgatcacctcaacaacaattgcattat 16135071  T
Q  658 caagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16135072 caaatatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 16135110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17085298 - 17085022
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17085298 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaacatctatcatcaagtaaattcatcaagtgtat 17085199  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17085198 aagcacaagtaaacaagatatgcaattagagcaaagatcatttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacaaaatccacatagatcac 17085099  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17085098 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcatgtcacatattcaattatgtcacaattcatcaactaatcaa 17085022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7829212 - 7828895
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||             |||||||||    
T  7829212 caaaggaatcacaaaaacatatatgtacatacacgtatacaattctcacctcatcactattaccgaaacatttatcat-------------caagtgtat 7829126  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7829125 aagcacaagtaagcaagatgtgcaattagagcatagatcatttatttacaaccatcgacaaaatccaccaatgaaaatatacacaatccacataaatcac 7829026  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcacaagtatctat 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  7829025 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacttattccattatgacataattcatcaaccaatcaattccaaatatcacaagtatgtat 7828926  T
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatc 339  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7828925 tcattaaacacatttatcatcaacaatcatc 7828895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 306 - 693
Target Start/End: Original strand, 22846567 - 22846954
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  22846567 tattcatcaaacacacttatcaccaacaatcatcattcacatgtcacaaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagtt-cgacacatatatgcat 22846665  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatct----tatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtaca 500  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||| |  | ||||||     ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||| |    
T  22846666 gtagtaccaaatcaccgcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaa 22846763  T
Q  501 agagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaac 600  Q
    |||| | ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| ||    
T  22846764 agagcacccctcttttacagctacaagactcaacatgactattatgcaaggacatacaagcaaagactcgacaaggcaaaaccacctcataatcttc-ac 22846862  T
Q  601 aacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||| |||||||||||||| ||||  |||| |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22846863 aacgatataaaggataacttccaaatatattgattatctccacaacaattgaattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 22846954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Original strand, 19852700 - 19852979
Alignment:
Q  295 tcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgaca 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  19852700 tcacaaatatgtgttcatcaaatacacttatcatcaacaatcatcattcaaatgcaacaaataagactcatgccaatatgatatgcgcctaatcccgaca 19852799  T
Q  395 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||    
T  19852800 catatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacactcgtcttacattatcatcg 19852897  T
Q  494 aagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaat 575  Q
    || || ||||||| || ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  19852898 aaataaaagagtacccttcctttataacattaaatctcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcaacaat 19852979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29162387 - 29162182
Alignment:
Q  81 ttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaa 180  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  29162387 ttatcattaaattgattcaccaagtgtataaacacaagtaagtaagatatgcaattaaagcatagatcatttatttacaatcaccaacaaaatccaccaa 29162288  T
Q  181 tgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaacc 280  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29162287 tctacatatacacaatccacatagatcacaacattcaacaatttcaccgatacacaaattcatcaagtcacatatccaattgtgacacaattcatcaacc 29162188  T
Q  281 aatcaa 286  Q
    | ||||    
T  29162187 actcaa 29162182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31162801 - 31162576
Alignment:
Q  44 atatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  31162801 atatacaattctcacctcattactattaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacaagcaagtaaggcatgcaattagagcat 31162702  T
Q  144 aaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattc 241  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  31162701 agttcaattatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacaccaatccaca-caatcacaacattcaccaaattccaccaatgcacaaattc 31162603  T
Q  242 atcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31162602 atcaagtcacatattcaattatgacac 31162576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 536
Target Start/End: Original strand, 34965365 - 34965615
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaa-caactaagactcatgccaat-atgatatgcgcct 384  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  34965365 tccaaatatcacaagtatgtattcatcaaacacagtcttcatcaacaatcatcattcacatgtaaacaattaagactcatgccaattatgctatgcgtct 34965464  T
Q  385 atacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttac 483  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |  | || ||| ||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  34965465 attcccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct-tcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacatccgtcttac 34965562  T
Q  484 attatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacat 536  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965563 attatcaccgaagtaaaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacat 34965615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 554 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18104955 - 18104826
Alignment:
Q  554 atacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgca 653  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18104955 atacaagtaaagactcgacaatgcaaaatcatctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccaattatattgatcacctcaaaaacaattgca 18104856  T
Q  654 ttatcaagtatttacgtccacacaatcaat 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18104855 ttatcaagtatttacgtccacacaatcaat 18104826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 563 - 693
Target Start/End: Original strand, 34965604 - 34965733
Alignment:
Q  563 aagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagt 662  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965604 aagactcaacattgcaaaatcacctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccaattatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagt 34965703  T
Q  663 atttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34965704 atttacgttcacacaa-caatcaagtcataa 34965733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Original strand, 16374630 - 16374882
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  16374630 tatatatacatatacaattctcacctcattactattactaaaataattatcatcaaattgattcaccaagtgtataagcacaaacaagtaagaaatgcaa 16374729  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattc-agcaatttcaccaatg 232  Q
    |||||||| |  ||| | | | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |  |||||| ||||||    
T  16374730 ttagagcaaagttcaatcactcacaaccatcaacaaagtccaccgatgtacatatacaccaatccacat-gatcacaacattcgacaaatttccccaatg 16374828  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16374829 cacaaattgaccaagtcacatattcaattatgacacaactcatcaaccattcaa 16374882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Original strand, 16131941 - 16132064
Alignment:
Q  42 acatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagc 141  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16131941 acatatacaattctcacctcatcactattaccaaaacaattatcatcaaatagattcatcaagtgtataagtacaactaagcaagatatgcaattagagc 16132040  T
Q  142 ataaatcatttatttacaaccatc 165  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  16132041 atagatcatttatttacaaccatc 16132064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11374634 - 11374523
Alignment:
Q  175 caccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11374634 caccaatgtacatatacacaatccacatagatcacaacattcaacaatttcaccaatacacaaattcacaaagtcacatattcaattgtgacacaattca 11374535  T
Q  275 tcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||| ||||    
T  11374534 tcaaccactcaa 11374523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 527 - 693
Target Start/End: Original strand, 16375041 - 16375211
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atattcaacaacaata---taaaggataacctcc 622  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |   |||  ||| |||| |    
T  16375041 gactcaatatgactatgatgcatgaacatataagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcatatatattcaacaacaacaatgtaagagatcaccttc 16375140  T
Q  623 atttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16375141 atttacattgagcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacataatcaa-caagtcataa 16375211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 527 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 31162399 - 31162241
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaata---taaaggataacctcca 623  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |   |||  ||| |||||||    
T  31162399 gactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaaagcaaaatcatctcata-tattcaacaacaacaatgtaagagatcacctcca 31162301  T
Q  624 tttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31162300 tttacattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacttccacacaatcaa 31162241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22595375 - 22595171
Alignment:
Q  74 aaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaat 173  Q
    |||||| ||||||| || | |||| | ||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||    
T  22595375 aaaacaattatcatcaaattgatttaccaagtatataaccacaaacaagtaaggtatgcaattagagcatagctcaattatttacaaccatcaacacaat 22595276  T
Q  174 ccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaat 271  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| |     
T  22595275 ccaccaatgcacatatacaccaatccacat-aatcactacatccaccaaatttcaccaatgca-caattaaccaagtcacatattcaattatgacacgac 22595178  T
Q  272 tcatcaa 278  Q
    |||||||    
T  22595177 tcatcaa 22595171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4173576 - 4173389
Alignment:
Q  42 acatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagc 141  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| | |  |||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  4173576 acatatacaattctcacctcattactgttaccaaaataatattcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacaagcaagtaaaacatgcaattagagc 4173477  T
Q  142 ataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaa 230  Q
     ||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4173476 -tagttcaattattcacaaccatcaacaaaatccaccaatgcacatatacaccaatctacat-aatcacaacattcaccaaattcaccaa 4173389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4229185 - 4228998
Alignment:
Q  42 acatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagc 141  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||| | |  |||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  4229185 acatatacaattctcacctcattattgttaccaaaataatattcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacaagcaagtaagacatgcaattagagc 4229086  T
Q  142 ataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaa 230  Q
     ||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4229085 -tagttcaattattcacaaccatcaacaaaatccaccaatgcacatatacaccaatctacat-aatcacaacattcaccaaattcaccaa 4228998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 527 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 29162021 - 29161857
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 626  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||  | ||||||||||||  |  | |    |||||||||| |||| |   ||||||||||    
T  29162021 gactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagacttaataatgcaaaatcatacattcac---caacaacaatgtaaaagtacacctccattt 29161925  T
Q  627 ataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29161924 acaatgatcaacttcaacaacaattgcattatcaaatatttacgtccacacaatcaataaagtcataa 29161857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 372 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 18383346 - 18383030
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtac 471  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||  ||||||||| | |    
T  18383346 atgatatgtccctaaacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttc 18383249  T
Q  472 acctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagag-taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactc 569  Q
    ||  || |||||||| ||||| |||||| ||||| ||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||| || |||||    
T  18383248 acacccgtcttacataatcactgaagtaaaagagctaaacc-cttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcttggacatacaagtaaggactc 18383150  T
Q  570 gacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacg 669  Q
     ||||||| |||||||| |  || |||| ||||||||| |||||| ||| ||||   ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||     
T  18383149 aacaatgc-aaatcacctccaaacattc-acaacaatacaaaggacaacttcca-aaatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaagtaattaca 18383053  T
Q  670 tccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||| || || |||||||||||    
T  18383052 tccacataa-cattcaagtcataa 18383030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 430 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 11374460 - 11374198
Alignment:
Q  430 cgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttaca----acatca 525  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||| ||| |  |||  | ||||||     ||| |    
T  11374460 cgtcaccccaagatgccaacaacacatcttatgtaagagtacacctcctcttacaat-tcaactatgtaaaag-gacacctccttttacatttctcat-a 11374364  T
Q  526 agactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatt 625  Q
     ||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||| || | ||||||||||||    | | |   |||||||||| |||| |   |||||||||    
T  11374363 tgactcaatatgactatgatgtatggacatacaagcaaagattcaataatgcaaaatca---tacattcaccaacaacaatgtaaaagtacacctccatt 11374267  T
Q  626 tataatgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    || | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11374266 tacattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttatatccacacaatcaatcaagtcataa 11374198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 535 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 17857892 - 17857741
Alignment:
Q  535 atgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atatt---caacaacaatataaaggataacctccatttataa 630  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |   |||||||||| |||  ||| |||||||  || |     
T  17857892 atgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaacatcacctcatatataatcaacaacaacaatgtaagagatcacctccaactacat 17857793  T
Q  631 tgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatca 681  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17857792 tgaacaacttcaacatcaattgcattatcaagtatttacatccacacaatca 17857741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5486261 - 5486020
Alignment:
Q  28 atatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga 127  Q
    |||||| |||||| | ||||  ||||||||| || | || |||||||||| | ||||| | || |||| ||| |||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  5486261 atatatatatatatatatatgcaattctcacctcgttaccattaccaaaataattatcctcaaatagaatcaccaagtgaataaacacaagcaagtaaga 5486162  T
Q  128 tatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttc 225  Q
     || |||||||||| |    ||  ||   |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| ||||| | |||| ||| ||||    
T  5486161 catacaattagagcctggtccaaatacccacaaccatcaacaaaatccaccaaagcacatatacaccaattcacataa-tcacaacgttcaccaaatttc 5486063  T
Q  226 accaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  5486062 accaatgcacaaattcactaagtcatatattcaattatgacac 5486020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12310732 - 12310672
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  12310732 tattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgccacaaataagactcatg 12310672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 514 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16889268 - 16889094
Alignment:
Q  514 tttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaagg 613  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||  |||||||||  ||| | |  ||| |||| ||||||||||||||    
T  16889268 tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggacttaacaatgcaa--tcatctccaaat-ttca-caacaatataaagg 16889173  T
Q  614 ataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | ||| ||||  |||| |||||| ||| ||| || ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16889172 acaacttccaaatatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaattacatccacacaa-caatcaagtcataa 16889094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 643 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 5485727 - 5485678
Alignment:
Q  643 caacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5485727 caacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa-caagtcataa 5485678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 643 - 693
Target Start/End: Original strand, 19852973 - 19853022
Alignment:
Q  643 caacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19852973 caacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-caatcaagtcataa 19853022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 29162119 - 29162065
Alignment:
Q  430 cgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29162119 cgtcaccccaagatgccaacaacacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 29162065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15006365 - 15006266
Alignment:
Q  317 cacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgcca-atatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaa 415  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15006365 cacatttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaattacaactcatgtcagatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaa 15006266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18631013 - 18630970
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaat 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18631013 caacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaat 18630970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 19627784 - 19627831
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19627784 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 19627831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 22463510 - 22463467
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22463510 tcaacaacaattgcattatcaagtatctacgtccacacaatcaa 22463467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 32350874 - 32350917
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32350874 tcaacaacaattgcattaccaagtatttacgtccacacaatcaa 32350917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35011030 - 35010983
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35011030 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 35010983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15294286 - 15294200
Alignment:
Q  103 agtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatat 189  Q
    |||||||||| ||||  ||| || | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  15294286 agtgtataagtacaaataagtaatacatgcaattagagcatagctcaattatttacaaccatcaacaatgtccaccaatgtacatat 15294200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 17375353 - 17375307
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17375353 caagatgtcaacataacatcttatgtaagagtacaactcctcttaca 17375307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Original strand, 18422259 - 18422304
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18422259 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 18422304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22467829 - 22467725
Alignment:
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatg-ccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgt 407  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| ||||||||||    ||| ||||| ||||||||    
T  22467829 tcatcaagcacacttatcatcaataatcatcattcacatgcaacaattacaactcatgtcaaatatgttatgcgcctaatttcgaaacatacatgcatgt 22467730  T
Q  408 ggtac 412  Q
    |||||    
T  22467729 ggtac 22467725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 602 - 693
Target Start/End: Original strand, 15738981 - 15739071
Alignment:
Q  602 acaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15738981 acaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagaaattacgtccacacaa-cgatcaagtcataa 15739071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 25649943 - 25649986
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25649943 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 25649986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 437
Target Start/End: Original strand, 31626948 - 31627009
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31626948 atgatatgcacctata---gacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 31627009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Original strand, 32350668 - 32350714
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32350668 caagatgcctacctcacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 32350714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25646561 - 25646517
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25646561 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 25646517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 35017346 - 35017313
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017346 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 35017313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 643 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 4228680 - 4228641
Alignment:
Q  643 caacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4228680 caacaattgcattatcaactatttacgtacacacaatcaa 4228641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4228884 - 4228841
Alignment:
Q  441 gatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4228884 gatgccaatagaacatcatatgtaagagtacacctcctcttaca 4228841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 438
Target Start/End: Original strand, 11214674 - 11214721
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctc 438  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  11214674 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaaggtcgtcacctc 11214721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 15006048 - 15006013
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccac 674  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15006048 tcaaaaacaattgcattatcaagtatttacgtccac 15006013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15294349 - 15294286
Alignment:
Q  81 ttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcata 144  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15294349 ttatcatcaaatagattcaccaagtgtataagtacaaataagtaagacatgcaattagagcata 15294286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 438
Target Start/End: Original strand, 16238899 - 16238946
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctc 438  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  16238899 gacacatatatgcatgtggtacaaaatctccaaaaaggtcgtcacctc 16238946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 29604353 - 29604396
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  29604353 tcaacaacaattgcattatcaaatatttgcatccacacaatcaa 29604396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 559 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 25368833 - 25368731
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||  ||  || |||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25368833 agcaaagactcgataatgcgacatcactccacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc 25368734  T
Q  659 aag 661  Q
    |||    
T  25368733 aag 25368731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25745941 - 25745897
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25745941 gacacataaattcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 25745897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 454 - 483
Target Start/End: Original strand, 29604171 - 29604200
Alignment:
Q  454 catcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29604171 catcttatgtaagagtacacctcctcttac 29604200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 5230074 - 5229416
Alignment:
Q  40 acacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattaga 139  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  5230074 acacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaccaattatcatcaaatagattcatcaagtgtataagcacaagtaaacaagacatgcaattaga 5229975  T
Q  140 gcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaat 239  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5229974 gcatagatcatttatttacaactatcaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccgcatagaacacatcgttcaacaatttcaccaatgcacaaat 5229875  T
Q  240 tcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatc-aatccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcat-taacaatca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5229874 tcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaaatccaaatgtcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaaacaatca 5229775  T
Q  338 tccttcacatg-caacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5229774 tcattcacatgtaaacaattaagactcatgccaatatgatatgcgcatattcccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 5229676  T
Q  437 tcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaaca 535  Q
    |   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229675 t-tcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaaca 5229577  T
Q  536 tgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatc 635  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5229576 tgactatgatgcatggacatacaagcaaaaactcgacaatgcaaaatcacctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccaattatattgatc 5229477  T
Q  636 acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229476 acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 5229416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 38377817 - 38377155
Alignment:
Q  36 atatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaat 135  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||| | |||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||  || ||||    
T  38377817 atatatacatatacaattatcacttcatcattattatcaaaataattatcatcgaattgattcaccaagtatataagcacaaacaagtaaggcatacaat 38377718  T
Q  136 tagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgc 233  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  38377717 tagagcatagctcaattatttacaaccatcaacaaagtccacaattgtacatataaaccaatccacatagatcacaacattcaacaaatttcaccaatgc 38377618  T
Q  234 ataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaat-ccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaac 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38377617 acaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccgatcaattccaaatgtcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaac 38377518  T
Q  333 aatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgt 432  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38377517 aatcatcattcacgtgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgtctatacacgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcaccttaaaggtcgt 38377418  T
Q  433 cacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactca 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38377417 cacctcaagatgccaacagaacatcttatgcaagagtacacctcctcttacattatcgccgaagtaaaagagtaaccctcttttacaacatcaagactca 38377318  T
Q  533 acatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataat 631  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  38377317 acatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataaatattcaacaacaatataaaggataacctccatctatatt 38377218  T
Q  632 gatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| || || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38377217 gatcgacttcgacaataatttcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 38377155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 626
Target Start/End: Original strand, 15989147 - 15989735
Alignment:
Q  36 atatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaat 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  15989147 atatacacatatacaattctcacctcatcattattatcaaaacaattatcatcaatttgattcactaagtgtataagcacaagcaagtaagacatgcaat 15989246  T
Q  136 tagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgc 233  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  15989247 tagagcataattcaattattcacaaccgtcaacaaaatctatcaatgtacatatacaccaatccacataa-tcacaacattcaacaaatttcaccaatgc 15989345  T
Q  234 ataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaat-ccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaac 332  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15989346 accaattcttcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaattccaaatgtcaaaagtatgtattcgtcaaacacacttatcattaac 15989445  T
Q  333 aatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgt 432  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15989446 aatcatcatttacatgcaacaactaagactcgtgtcaatattatatgtgcctatacacgatacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgt 15989545  T
Q  433 cacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactca 532  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15989546 cacctcaagatgccaacagaacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcgccgaa----aagagtaaccctcttttacaacatcaggactca 15989641  T
Q  533 acatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 626  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15989642 acatggctatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgaaaaatcacctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 15989735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 306 - 693
Target Start/End: Original strand, 41660052 - 41660435
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  41660052 tattcatcaaatacacttatcatcaacaaccatcattcaaatgcaacaaata-gactcatgccaatatgatatgcgcctaatcccgacacatatatgcat 41660150  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagt--acacctcctcttacattatcaccgaagtacaaga 503  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||| || ||||    
T  41660151 gtggtaccaaatcacctcaa-gatcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacctg-tcttacattatcaccgaaataaaaga 41660247  T
Q  504 gtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaac 603  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     
T  41660248 gtacccctcctttataacatcaatactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccttataatattc-acaat 41660346  T
Q  604 aatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41660347 aatataaaggataacctccaattatattgaccacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-caatcaggtcataa 41660435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38812960 - 38812692
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38812960 caaaggattcacaaaaacatatatgtatatacacatatacaattctccctt-atcactattaccaaaatatttatcatcaagtagattcatccagtgtat 38812862  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38812861 aagcacaagtaagcaagatgtgcaattagagcatagatcatttatttacaaccatcgacaaaatccaccaatgcacgtatacacaatccacataaatcac 38812762  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812761 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 38812692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 325 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 38812699 - 38812350
Alignment:
Q  325 tcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||| ||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38812699 tcatcaacaatcatcattcacatgcaaccaataagactcatgtcaccatgatatgcacctagtt-cgacacatatatgcatgtcgtaccaaatcacctca 38812601  T
Q  425 aaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaaca 522  Q
    | |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||| | | |||| | |||||||| ||| |||||||| |||||   ||||||  ||||||||     
T  38812600 a-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaatatttcaccccgtcttacataatctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaact 38812505  T
Q  523 tcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctcc 622  Q
     | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  38812504 actagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaagatcacctcataattttca-caacaatataaaggacaacttcc 38812406  T
Q  623 atttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812405 aaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 38812350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Original strand, 11400829 - 11401080
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |  ||| || || ||||||||  ||||||| ||||||||  ||| |||| | ||||    
T  11400829 tatatatacatatacaattctcacctcattactattatcaaaatacatattatcaaatagattcactaagtgtacaagcacaaacaagtaagacaggcaa 11400928  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgca 234  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  11400929 ttagagcatagctcaattattttcaaccatcaacaaaatccaccaatgtacacatacacaatccacatatatcacaacaatcaacaatttcaccaatgca 11401028  T
Q  235 taaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11401029 caaatccatcaagtcacatattaaattatgacacaattcatcaaccattcaa 11401080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 484 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 33370414 - 33370207
Alignment:
Q  484 attatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatc 583  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370414 attatcaccgaagtaaaagagcacccctcttttacagctacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatc 33370315  T
Q  584 accccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaat 683  Q
    ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33370314 acctcataattttc-acaataatataaaggataacttccaattatattgatcatctcaaccacaattgcattatcaagtatgtacgtccacacaa-caat 33370217  T
Q  684 caagtcataa 693  Q
    ||||||||||    
T  33370216 caagtcataa 33370207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 225 - 437
Target Start/End: Original strand, 12951345 - 12951557
Alignment:
Q  225 caccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaa-tcaat-ccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacact 322  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12951345 caccaatgtacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacataattcatcaaccaaatcaattccaaatatcacaagtatgtattcatcaaacacact 12951444  T
Q  323 tatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacct 422  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||    |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12951445 tatcatcaacaatcatcattcacatgcagcaaataagactcatgtcaacatgatatgcacgta-gttcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcactt 12951543  T
Q  423 caaaggtcgtcacct 437  Q
    | |||||||||||||    
T  12951544 c-aaggtcgtcacct 12951557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 372 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9592411 - 9592119
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacata-acatcttatgtaagagta 470  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||| | ||||| | ||||||| |     
T  9592411 atgatatgcgcttaaac-cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgt-aacaaacacatcatgtgtaagattt 9592316  T
Q  471 cacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactc 569  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |   | | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  9592315 cacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagcacatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatgcatagacatacaagcaaagactc 9592216  T
Q  570 gacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtattta 667  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9592215 gacaatgcaacatcacttcataataatcaa-aacaatataaatgacaacttccaattatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtattta 9592119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25105867 - 25105631
Alignment:
Q  44 atatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||    
T  25105867 atatacaattctcacctcattactattaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtgcataagcacaagtaagtaagacatgcatttagagcat 25105768  T
Q  144 aaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattc 241  Q
    |  | | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  25105767 agtttaatcattcacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatataccaatccacat-aatcacaacattcatcaaatttcaccaatgcacaaattc 25105669  T
Q  242 atcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25105668 aacaaggcacatattcaattatgacacgactcatcaac 25105631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Original strand, 12951193 - 12951340
Alignment:
Q  12 aaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12951193 aaggaatcaccaaa-catatatgtatatacacatatacaactctcacctcatcactattaccaaaacatttatcatcaagtagattcatcaagtgtataa 12951291  T
Q  112 gcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaa 160  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  12951292 gcacaagtgagcaagatgcgcaattagagaatagatcatttagttacaa 12951340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 279
Target Start/End: Original strand, 8602926 - 8603168
Alignment:
Q  37 tatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaatt 136  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  8602926 tatatacatatacaattctcacctcattgctattaccaaaataattatcatcaattagattcaccaagtgtataagcacaagcaagtgagacatgcaatt 8603025  T
Q  137 agagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgca 234  Q
    ||||||||  | | | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  8603026 agagcatagtttaatcattcgcaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacattaatccacat-aatcacaacattcaccaaatttcaccaatgca 8603124  T
Q  235 taaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
      |||||| |||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  8603125 -caattcaacaagtcacttattcaattgtgacacgactcatcaac 8603168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15551415 - 15551175
Alignment:
Q  39 tacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattag 138  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||||||||| || |||| | ||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||     
T  15551415 tacacatatacgattatcacctcatcactatcactaaaataattatcatcaaacacattcaccaagtgtataagcacgagcaagtaagacatgcaattat 15551316  T
Q  139 agcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcata 236  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||| || |    
T  15551315 agcataattcaattattcacaaccgtcaacaaaatccacccatgtacatatacaccactccacat-aatcacaacattcaccgaattccaccaattcaca 15551217  T
Q  237 aattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  15551216 aattcatcaagtcacatattcatttatgacacgactcatcaa 15551175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 222
Target Start/End: Original strand, 18738158 - 18738300
Alignment:
Q  77 acatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatcca 176  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  18738158 acatatatcatgaagtagattcatcaagtgtataa-caca-gtaagcaagatatgcaattacagcatagatcatttatctacaaccattaac-aaattca 18738254  T
Q  177 ccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  18738255 ccaatgtacatatacacaatccacatagatcatatcattcaacaat 18738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 382 - 692
Target Start/End: Original strand, 48420184 - 48420492
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | || ||| ||||||||| | |||  || |||    
T  48420184 cctaaacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtct 48420281  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| |||||||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  48420282 tacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgacaatgatgcatggacatacaagtaaagactcgacaatgca 48420379  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcac-ctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaca 677  Q
    | |||| | |||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||   | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48420380 agatcatctcataattttc-acaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacaaaccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacaca 48420478  T
Q  678 atcaatcaagtcata 692  Q
    | || ||||||||||    
T  48420479 a-cattcaagtcata 48420492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17760383 - 17760114
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcacta-ttaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgta 108  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||| | ||| | || |||| || | | |||| ||||||||    
T  17760383 caaaggaatcaccacatcatatatatacatatacatatacaattctcacctcattactacttatccaaataattgtcatcaaattgtttcaccaagtgta 17760284  T
Q  109 taagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatc 207  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17760283 taagcacaaacaagtaagacatgcaattagagcataattcaattattcacaaccgt-aaaaaaatccactaatgtacatatacaccaatccacat-aatc 17760186  T
Q  208 acatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    ||| |||||  | |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  17760185 acaacattctccgaattccaccaatgcacgaatttatcaagtcacatattcaattatgatacgactcatcaa 17760114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19061703 - 19061434
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcacta-ttaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgta 108  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||| | ||| | || |||| || | | |||| ||||||||    
T  19061703 caaaggaatcaccacatcatatatatacatatacatatacaattctcacctcattactacttatccaaataattgtcatcaaattgtttcaccaagtgta 19061604  T
Q  109 taagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatc 207  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19061603 taagcacaaacaagtaagacatgcaattagagcataattcaattattcacaaccgt-aaaaaaatccactaatgtacatatacaccaatccacat-aatc 19061506  T
Q  208 acatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    ||| |||||  | |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  19061505 acaacattctccgaattccaccaatgcacgaatttatcaagtcacatattcaattatgatacgactcatcaa 19061434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 391 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 12490376 - 12490078
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatc 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||| |||    
T  12490376 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcatctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 12490279  T
Q  490 accgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccc 587  Q
     |||||||| |||||   ||||||  ||||||    |||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  12490278 tccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacagatacaagactcaacatgacaatgatccatggacatacaagtaaagactcgacaatgcaagatcatct 12490181  T
Q  588 cataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaag 687  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  12490180 cataattttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacattttcattatcaagaaattacgtccacacaa-cattcaag 12490083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14182052 - 14181852
Alignment:
Q  50 aattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatca 149  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||| || | |||||| || ||||||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||| || |||    
T  14182052 aattctcacctcatcattattatcaaaataattatcatcaaattgattcaccatgtgtataagtacaaacaagtaaggcatgcaattagagcacaactca 14181953  T
Q  150 tttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaag 247  Q
     | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14181952 at-atttacaaccatcaacaaagtccaccaatgtacatatacaccattccacatatatcacaatattcaacaaatttcaccaatgcacaaattcatcaag 14181854  T
Q  248 tc 249  Q
    ||    
T  14181853 tc 14181852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 8022496 - 8022733
Alignment:
Q  28 atatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga 127  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||  || || |||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  8022496 atatatatatatatatatatataattctcacctcattactattaccaaat-agttatcaacaaatatattcatcaagtgtataagcacaagcaagtgaga 8022594  T
Q  128 tatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttc 225  Q
     |  |||||||||  | | |||  |||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  || ||||    
T  8022595 cacacaattagagtctgattcaaatattcacaaccataaacaaaatccaccaacgcacatatacaccaattcacataa-tcacaacattcacaaaatttc 8022693  T
Q  226 accaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatga 265  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8022694 accaatgcacaaattcacctagtcacatattcaattatga 8022733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31414192 - 31413958
Alignment:
Q  42 acatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagc 141  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||| || | |||| |  |||||||||| |||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  31414192 acatatacaattctcac-tcatcattattatcaaaacaatcatcatcaaattgatttactaagtgtataaccacaaacaagtaagacatgcaattagagc 31414094  T
Q  142 ataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaat 239  Q
    |||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||| |  |||    
T  31414093 atagctcaattattcacaaccatcaacaaaatccaccattgcatatatacaccaatccacat--atcacaacattcaccaaatttcaccaatgta-caat 31413997  T
Q  240 tcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31413996 taaccaagtcacatattcaattatgacacgactcatcaa 31413958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40041205 - 40040982
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| || ||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| | | |||| |||||||||    
T  40041205 caaagaaatcaccacatcatatatatacatatacatatacgattctcacttcattactattaccaaaataattatcattaaattgtttcaccaagtgtat 40041106  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatca 208  Q
    ||||||||  ||  |||  ||||||||||||||||  | | ||||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  40041105 aagcacaaataaataaggcatgcaattagagcatagtttaattattcacaaccgtcaataaagtccaccaatgtacatatacatgaatccacat-aatca 40041007  T
Q  209 catcattcagc-aatttcaccaatg 232  Q
    |  |||||| | |||||||||||||    
T  40041006 cgacattcaacaaatttcaccaatg 40040982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 535 - 682
Target Start/End: Original strand, 17392009 - 17392164
Alignment:
Q  535 atgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata---atattcaaca--acaatataaaggataacctccatttata 629  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||  ||||| |||  ||| || |||||||| |    
T  17392009 atgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcatatatatattcaacaacacaatgtaagagatcacttccatttaca 17392108  T
Q  630 atgatc-acctcaacaacaattgcattatcaag--tatttacgtccacacaatcaa 682  Q
     || || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17392109 ttgttcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatatttacgtccacacaatcaa 17392164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 382 - 694
Target Start/End: Original strand, 15874677 - 15874983
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||    
T  15874677 cctaaacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtct 15874774  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||   ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||| || ||||| ||||||||    
T  15874775 tacataatcactgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactttgatgcatggacattaaagtaaggactcaacaatgca 15874872  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |  ||||| || | | |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15874873 a--tcacctcaaact-ttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaatttacgtccacacaa 15874968  T
Q  679 tcaatcaagtcataaa 694  Q
     ||||| |||||||||    
T  15874969 -caatctagtcataaa 15874983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 530 - 696
Target Start/End: Original strand, 47983557 - 47983721
Alignment:
Q  530 tcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcga-caatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttat 628  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||||| ||| | |||||  ||||| |||||||||||||| | | ||||  |||    
T  47983557 tcaacatgactatgatgcatggacatacgagcaaagactggatcaatgcaaa-tcatctcataactttcaa-aacaatataaaggacaccttccaaatat 47983654  T
Q  629 aatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  47983655 attgatcatctccacaacaattggattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaactcataaatc 47983721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 530 - 696
Target Start/End: Original strand, 47992844 - 47993008
Alignment:
Q  530 tcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcga-caatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttat 628  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||||| ||| | |||||  ||||| |||||||||||||| | | ||||  |||    
T  47992844 tcaacatgactatgatgcatggacatacgagcaaagactggatcaatgcaaa-tcatctcataactttcaa-aacaatataaaggacaccttccaaatat 47992941  T
Q  629 aatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  47992942 attgatcatctccacaacaattggattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaactcataaatc 47993008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 530 - 696
Target Start/End: Original strand, 48002131 - 48002295
Alignment:
Q  530 tcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcga-caatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttat 628  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||||| ||| | |||||  ||||| |||||||||||||| | | ||||  |||    
T  48002131 tcaacatgactatgatgcatggacatacgagcaaagactggatcaatgcaaa-tcatctcataactttcaa-aacaatataaaggacaccttccaaatat 48002228  T
Q  629 aatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  48002229 attgatcatctccacaacaattggattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaactcataaatc 48002295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 530 - 696
Target Start/End: Original strand, 48011417 - 48011581
Alignment:
Q  530 tcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcga-caatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttat 628  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||||| ||| | |||||  ||||| |||||||||||||| | | ||||  |||    
T  48011417 tcaacatgactatgatgcatggacatacgagcaaagactggatcaatgcaaa-tcatctcataactttcaa-aacaatataaaggacaccttccaaatat 48011514  T
Q  629 aatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  48011515 attgatcatctccacaacaattggattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaactcataaatc 48011581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 527 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 17759945 - 17759785
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 626  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||  |  | |    |||||||||| |||| |   ||||||||||    
T  17759945 gactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcaataatgcaaaatcatacattcac---caacaacaatgtaaaagtacacctccattt 17759849  T
Q  627 ataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtca 690  Q
    | | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17759848 acattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgt-cacacaatcaatcaagtca 17759785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 514 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 11330525 - 11330353
Alignment:
Q  514 tttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaagg 613  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | || ||||| |||||||||  ||||| ||  ||  ||| ||||||||||||||    
T  11330525 tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacataca-gtaaggactcaacaatgcaa--tcacctca--attatca-caacaatataaagg 11330432  T
Q  614 ataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | ||| |||| ||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11330431 acaacttccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 11330353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17320299 - 17320192
Alignment:
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatg-ccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgt 407  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||    || |||||||||||||||    
T  17320299 tcatcaagcacacttatcatcaataatcatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaaatatgctatgcgcctaattccgccacatatatgcatgt 17320200  T
Q  408 ggtaccaa 415  Q
    ||||||||    
T  17320199 ggtaccaa 17320192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 286
Target Start/End: Original strand, 17391711 - 17391841
Alignment:
Q  157 acaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcataaattcatcaagtcacata 254  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||  || |||||| |||  | ||||||| |||||||||||    
T  17391711 acaaccatcaacaaaatccacccatgtacatatacaccaattcacacaa-tcacaacattcacaaaatttcacgaataaaaaaattcaccaagtcacata 17391809  T
Q  255 ttcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  17391810 ttcaattatgacatacttcgtcaaccaatcaa 17391841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 43429259 - 43429152
Alignment:
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatg-ccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgt 407  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||    | ||||||||||||||||    
T  43429259 tcatcaagcacacttatcatcaacattcatcattcacatgcaacaattatgactcatgtcaaatatgttatgcgcctaattccaacacatatatgcatgt 43429160  T
Q  408 ggtaccaa 415  Q
    ||||||||    
T  43429159 ggtaccaa 43429152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 559 - 693
Target Start/End: Original strand, 12951737 - 12951869
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||| | || ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12951737 agcaaagactcgataatgcgacatcatctcacaattttca-caacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc 12951835  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
     ||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  12951836 cagtatttacttccacacaa-cattcaagtcataa 12951869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 617 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 17320000 - 17319934
Alignment:
Q  617 acctccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17320000 acctccatttacattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 17319934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 617 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 19061178 - 19061105
Alignment:
Q  617 acctccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtca 690  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19061178 acctccatttacattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgt-cacacaatcaatcaagtca 19061105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 617 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 25105382 - 25105316
Alignment:
Q  617 acctccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25105382 acctccatttacactgatcatcttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 25105316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37918429 - 37918261
Alignment:
Q  37 tatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaatt 136  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| || | | |||| |||||||||| ||||||  ||  |||  ||||||||    
T  37918429 tatatacatatacaattctcacctcattactattaccaaaataattatcatcaaattgtttcaccaagtgtatacgcacaaacaaataaggcatgcaatt 37918330  T
Q  137 agagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataa 204  Q
    | ||||||  ||| ||||| |||||  ||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37918329 aaagcatagttcaattattcacaacggtcaataatgtccaccaatgtacatatacatcaatccacataa 37918261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 2548364 - 2548285
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagca 114  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  2548364 tatatatatatatataattctcacctcattactattaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagca 2548285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 21168121 - 21168078
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21168121 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 21168078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21168439 - 21168336
Alignment:
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgcc-aatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgt 407  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||    ||||||||| ||||||||    
T  21168439 tcatcaaatgcacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaattacgactcatgccaaatatgttatgcgcttaattccgacacatacatgcatgt 21168340  T
Q  408 ggta 411  Q
    ||||    
T  21168339 ggta 21168336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 693
Target Start/End: Original strand, 15516459 - 15516552
Alignment:
Q  599 acaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15516459 acaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagtgtttacgtccacacaa-cgatcaagtcataa 15516552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 678
Target Start/End: Original strand, 11401237 - 11401384
Alignment:
Q  535 atgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atatt---caacaacaatataaaggataacctccatttataa 630  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||| |   |||||||||| |||  ||| |||||||  || |     
T  11401237 atgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaactccacctcatatataatcaacaacaacaatgtaagagatcacctccaactacat 11401336  T
Q  631 tgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||| || |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11401337 tgaacaactcctcaacaattgcattatcaagtattcacgtccacacaa 11401384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 14060881 - 14060724
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattat 488  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |  | || |||  |||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  14060881 cgacacgtatatgcatgtgataccaaatcacctc-aaggtcgtcacct-ttgatgcaacaaaaatatcgaatgtaagagttcacccccatcttacataat 14060784  T
Q  489 caccgaagtacaagag--taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgca 548  Q
    | |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14060783 ctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgca 14060724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14523050 - 14523004
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14523050 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 14523004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 646 - 693
Target Start/End: Original strand, 27050518 - 27050564
Alignment:
Q  646 caattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27050518 caattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa-caagtcataa 27050564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 33371051 - 33370962
Alignment:
Q  345 catgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33371051 catgccacaaataagactcatgtcaacatgatatccacctagtc-caacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 33370962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 559 - 693
Target Start/End: Original strand, 39654601 - 39654731
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||| | |    
T  39654601 agcaaagactcgataatgcaacatcacctcacaattttca-caacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcatcacc 39654699  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||  | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39654700 aag--tgtacgtccacacaa-cgatcaagtcataa 39654731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6230339 - 6230253
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6230339 aacaattatcattcacatgcaaaaattacgactcatgtcaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaaa 6230253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16183709 - 16183664
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16183709 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaa-gtcgtcacc 16183664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6148500 - 6148456
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6148500 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 6148456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 4147373 - 4147289
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtacca 414  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    | ||||||| |||||||||||||||    
T  4147373 aacaattatcattcacatgcaacaattacgactcatgacaatatgctatgcgcctaattccaacacatacatgcatgtggtacca 4147289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 8603466 - 8603509
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8603466 tcaacaacgattgcattatcaagtatttacgtccacgcaatcaa 8603509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11883967 - 11883921
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11883967 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaa-gtcgtcacct 11883921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 17536650 - 17536604
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17536650 cgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctc-aaggtcgtcacct 17536604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 43428935 - 43428892
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43428935 tcaacaacaattccattatcaagtatttacgtccacgcaatcaa 43428892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 47983418 - 47983464
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47983418 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctc-aaggtcgtcacct 47983464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 47992705 - 47992751
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47992705 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctc-aaggtcgtcacct 47992751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 48001992 - 48002038
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48001992 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctc-aaggtcgtcacct 48002038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 48011278 - 48011324
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48011278 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctc-aaggtcgtcacct 48011324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 54049580 - 54049534
Alignment:
Q  240 tcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  54049580 tcatcaagtcacatattcaatcatgacatacttcatcaaccaatcaa 54049534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 4147281 - 4147236
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4147281 caagatgccaaccacacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 4147236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 424
Target Start/End: Original strand, 11813360 - 11813393
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11813360 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 11813393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 14817300 - 14817255
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14817300 caagatgccaactgcacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 14817255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19572473 - 19572429
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19572473 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 19572429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 7852328 - 7852374
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7852328 cgacacatacatgcatgtgataccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 7852374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 14296956 - 14297002
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14296956 cgacacgtatatgcatgtggtaccatatcacctc-aaggtcgtcacct 14297002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 14302583 - 14302629
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14302583 cgacacgtatatgcatgtggtaccatatcacctc-aaggtcgtcacct 14302629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 425
Target Start/End: Original strand, 17099137 - 17099172
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17099137 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaa 17099172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Original strand, 17203454 - 17203493
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17203454 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaa 17203493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 18968887 - 18968930
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  18968887 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatcgacacaatcaa 18968930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25607102 - 25607031
Alignment:
Q  174 ccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatca 245  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| | || |||||||    
T  25607102 ccaccaatgtacatccatacaatccacatagatcacatcattcaataaattcaccaatgtacaagttcatca 25607031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 34558659 - 34558702
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  34558659 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacactcaa 34558702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 319251 - 319206
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  319251 gacacataaatgcatgtggtaccagatcacctc-aaggtcgtcacct 319206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 4163805 - 4163775
Alignment:
Q  453 acatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4163805 acatcttatgtaagagtacacctcctcttac 4163775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Original strand, 8603238 - 8603292
Alignment:
Q  430 cgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||| || |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8603238 cgtcaccccatgatgccaactgaaaatcatatgtaagagtacacctcctcttaca 8603292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 8630368 - 8630413
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8630368 gacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctc-caggtcgtcacct 8630413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 17320181 - 17320135
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17320181 caagatgccaaccgcacatcttatgtaagagtacacctcttcttaca 17320135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 643 - 693
Target Start/End: Original strand, 17385638 - 17385687
Alignment:
Q  643 caacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  17385638 caacatttgcattatcaagtatttacatccatacaatcaa-caagtcataa 17385687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 559 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11883741 - 11883610
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| || | | ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| | ||||||      
T  11883741 agcaaagactcgataatgcgacatcacctcacact-ttccacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacattagcattacg 11883643  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcata 692  Q
    |||| | || |||||||||| | |||||||||||    
T  11883642 aagtgtctatgtccacacaa-cgatcaagtcata 11883610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14817367 - 14817310
Alignment:
Q  359 gactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14817367 gactcatgtcaatatgttatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaaa 14817310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 482
Target Start/End: Original strand, 18968699 - 18968728
Alignment:
Q  453 acatcttatgtaagagtacacctcctctta 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18968699 acatcttatgtaagagtacacctcctctta 18968728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 21168320 - 21168275
Alignment:
Q  439 aagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21168320 aagatgcccaccaaacatcttatgcaagagtacacctcctcttaca 21168275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22145925 - 22145881
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22145925 gacacataaatgcatgtggtaccaaattacctc-aaggtcgtcacc 22145881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 43429141 - 43429096
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43429141 caagatgccaaccacacatcttacgtaagagtacacctcctcttac 43429096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 51160110 - 51160066
Alignment:
Q  392 acacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  51160110 acacatatatgcatgtggtaccaaatctcc-aaaaggtcgtcacct 51160066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 20456091 - 20455436
Alignment:
Q  42 acatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagc 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20456091 acatatataattctcacctcatcactattaccaaaataattatcatcaaatagattcatcaagtgtataagcacaagtaagcaagatatgcgattagagc 20455992  T
Q  142 ataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattc 241  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20455991 atagatcatttatttacaactatcaacaaaatccataaatgtacatatacacaatccacatagatcacatcattcaacaatttcaccaatgcacaaattc 20455892  T
Q  242 atcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatcct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  20455891 atcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaaaaatcatcat 20455792  T
Q  342 tcacatg-caacaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctca 439  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  20455791 tcacatgtaaacaattaagactcatgccaattatgctatgcggctattcccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aagatcgttacc-ca 20455694  T
Q  440 agatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatga 538  Q
     ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20455693 tgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacatccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatga 20455594  T
Q  539 ctatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacc 638  Q
     |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20455593 ttatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgtaaaatcacctcataatattcaacaacaatataaatgataagctccaattatattgatcacc 20455494  T
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20455493 tcaacaacaatggcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 20455436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 24227485 - 24226811
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24227485 caaaagaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatacaattctcacctcatcattattaccaaaacatttatcattaaatagattcatcaagtgtat 24227386  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  24227385 aagcacaagtaagcaagatatgcaattagagcatagatcatttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccac----atcac 24227290  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctatt 309  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  24227289 atcattcaacaattccaccaatgcacaaattcatcaagtgacatattcaattatgacacacttcatcaa-caatcaattcaaatgtcacaaatatgtatt 24227191  T
Q  310 catcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |    
T  24227190 catcaaacacacttatcattaacaatcatcattcacatgccacaaataagactcatgtcaacatgatatgcaccta-gttcgacacatatatgcatgtcg 24227092  T
Q  410 taccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagag--ta 506  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| | | |||||||| |||||||||||| |||||   |    
T  24227091 taccgaatcacctc-aaggtcgtcacct-tcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctca 24226994  T
Q  507 accctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaat 606  Q
    |||||  |||||| |  |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||    
T  24226993 accct--tttacagctacaagactcaacatgaccatgatgcatgaacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcatctcataattttc-acgacaat 24226897  T
Q  607 ataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24226896 ataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 24226811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5452854 - 5452432
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  5452854 caaaggaatcacaaaaacatatatgtatatgcacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaacatttattatcaaatagattcatcaagtgtat 5452755  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5452754 aagcacaagtaagcaagatgtgcaattagagcatagatcatttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 5452655  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctatt 309  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5452654 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtctcatattcaattatgacacaattcgtcaa-caatcaatccaaatgtcacaagtatgtatt 5452556  T
Q  310 catcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 409  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||    
T  5452555 cattaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaaataagactcatgtcaacatgatatgcaccta-gttcgacacatatatgcatgtgg 5452457  T
Q  410 taccaaatcacctcaaaggtcgtcac 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5452456 taccaaatcacctc-aaggtcgtcac 5452432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 437
Target Start/End: Original strand, 3672076 - 3672499
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3672076 caaaggaatcacaaaaacatatatgtatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaatatttatcatcaagtagattcatcaagtgtat 3672175  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3672176 aagcacacgtaagcaagatgtgcaattagagcatatatcatttatttacaaccatcgacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 3672275  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcacaagtatctat 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  3672276 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacataattcatcaaccaatcaattccaaaaatcacaagtatgtat 3672375  T
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtg 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    ||||||||  |||    |||||||||||||||||||    
T  3672376 tcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaaataagactcatgtc---ttgatatgcatcta-gttcgacacatatatgcatgtg 3672471  T
Q  409 gtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  3672472 gtaccaactcacttc-aaggtcgtcacct 3672499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 238 - 696
Target Start/End: Original strand, 11964319 - 11964777
Alignment:
Q  238 attcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaa-caat 335  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11964319 attcatcaagtcacat--tcaattacgacacaattcatcaaccaaccaaatccaaatgtcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaaacaat 11964416  T
Q  336 catccttcacatgcaac-aactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtca 434  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11964417 catcattcacatgtaaccaattaagactcatgtcaatattatatgcgcctaatcccgacacatacatgcatgtggtaccaaaccacctcaa-ggtcgtca 11964515  T
Q  435 cctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaa 533  Q
    |||  | |||| |  | |||||| ||||||||| | ||   || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11964516 ccttca-atgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcaaacccgtattacattatcaccgaagtaaaagagtaaccctcttttacaacatcaagactcaa 11964614  T
Q  534 catgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatga 633  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  11964615 catgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaacatcacctcataatattcaacaacaatatgaaggataaactccaattatattga 11964714  T
Q  634 tcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11964715 ccacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 11964777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 289 - 566
Target Start/End: Original strand, 23412377 - 23412643
Alignment:
Q  289 caaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatac 388  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23412377 caaatatcacatgtatgtattcatcaaactcacttatcatcaacaatcatcattcaaatgcatcaattgagattcatgccaatatgatattcgcctatac 23412476  T
Q  389 acgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattat 488  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||| ||   ||           |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23412477 tcgaaacctatatgcatgtggtaccaaatctccaacaa-----------caagatgccaacataatatcttatgtaagagtacatctcctcttacaatat 23412565  T
Q  489 caccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaaga 566  Q
    | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23412566 cgccgaactaaatgagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaaga 23412643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 306 - 678
Target Start/End: Original strand, 21615453 - 21615821
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||    
T  21615453 tatttatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattaatatgccacaaataagactcatgtcaacatgaaatgcgcctagtt-cgacacatatatgcat 21615551  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagag 504  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||| | | |||  || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  21615552 gtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaaaatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 21615649  T
Q  505 taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaaca 604  Q
    |    ||| |||||| |  ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||| | ||||| || ||| |||| |||||    
T  21615650 ttcaactcttttacagctacaagactcaacatgattatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgcaga-tcacctcaaaattttca-caaca 21615747  T
Q  605 atataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21615748 atataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaagtaattacgtccacacaa 21615821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 306 - 678
Target Start/End: Original strand, 19860674 - 19861042
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||    
T  19860674 tatttatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcatatgccacaaataagactcatgtcaacatgaaatgcgcctagtt-cgacacatatatgcat 19860772  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagag 504  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||| | |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  19860773 gtggtaccaaatcaccccaa-ggtcgtcaccttc-gatacaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 19860870  T
Q  505 taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaaca 604  Q
         ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||||||||||  |||| || ||| || | |||||    
T  19860871 ctcaactcttttacagctacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgcaaac-cacctcaaaattttta-caaca 19860968  T
Q  605 atataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19860969 atataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaagtaattacgtccacacaa 19861042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14343820 - 14343555
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    |||||||||||||| | |||||  |||||||||  |||| ||||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14343820 caaaggaatcaccacatcatat--gtatataca--tatacaattctcacctcattgttattaccaaaataattatcatcaattagattcaccaagtgtat 14343725  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatca 208  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||  | | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14343724 aagcacaagcaagtgagacatgcaattagagcatagtttaatcattcacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacaccaatccacat-aatca 14343626  T
Q  209 catcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
    || |||||| | |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14343625 caacattcaccaaatttcaccaatgca-caattaaacaagtcacatattcaattatgacacgaatcatcaac 14343555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 372 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 37189790 - 37189469
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtac 471  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||| | | |    
T  37189790 atgatatgtccctaaacatgacacataaatgcaagtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaatatttc 37189693  T
Q  472 acctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagact 568  Q
    ||  || |||||||| |||||||||||| |||||   ||||||  |||||| |  ||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||    
T  37189692 acacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacagctacaagactcaacatgattatgatgcatggacatacatgcaaagact 37189595  T
Q  569 cgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttac 668  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||  || |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  37189594 cgacaatgcaagaccatctcataatatt-aacaacaatataaaggacaacctccaaatatattgatcatttccacaacatttgcatcatcaagaatttac 37189496  T
Q  669 gtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  37189495 gtctacacaa-cattcaagtcataaatc 37189469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 561 - 693
Target Start/End: Original strand, 23413918 - 23414046
Alignment:
Q  561 caaagactcgacaatgcaaaatcaccccataa-tattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatca 659  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  23413918 caaagactcgacaatgcaaaatc--ctcataaatattcaaaaacaatataaaggatagcctccatttatattgatcacctcaacaacaattgcattat-- 23414013  T
Q  660 agtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23414014 -gtatttatgtccacacaatcaatcaagtcataa 23414046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 278
Target Start/End: Original strand, 21107963 - 21108134
Alignment:
Q  108 ataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaat 206  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  21107963 ataagcacgagaaagtaagacatgcaattagagcataattcaattattcacaactgtcaacaaaatccaccaatgtacatatacaccaatccacat-att 21108061  T
Q  207 cacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
     ||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21108062 tacaacattcaccgaattccaccaatgcacaaattcatcaaatcacatattcaattatgacacgactcatcaa 21108134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 11964234 - 11964329
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11964234 caaaggaatcaccaaaacatatatctatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaacatttatcatcaaatagattcatcaagt 11964329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16837289 - 16837067
Alignment:
Q  37 tatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaatt 136  Q
    |||| ||||||  |||||||||  |||  |||||||||||| | ||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  16837289 tatatacatatgcaattctcaccccattgctattaccaaaataattatcatcattcagattcaccaagtgtataagcacaaacaagtaagacatgcaatt 16837190  T
Q  137 agagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcat 235  Q
    |||||||||  || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||         ||||||||||||     
T  16837189 agagcataatccagttattcacaaccgtcaacaaaatccaccaatgtacatatacaccaatccaca-caatcataaca---------ttcaccaatgcac 16837100  T
Q  236 aaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16837099 aaattcaacaagtctcatattcaattatgacac 16837067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 527 - 693
Target Start/End: Original strand, 21108213 - 21108376
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 626  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| | ||||||||||||  |  | |    |||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  21108213 gactcaatatgactatgatgcatggacacacaagcaaagactcaataatgcaaaatcatacattcac---caacaacaatgtaaagtaca-cctccattt 21108308  T
Q  627 ataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21108309 acattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 21108376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 553 - 692
Target Start/End: Original strand, 431111 - 431248
Alignment:
Q  553 catacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgc 652  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  431111 catacaagtaaagactcgacaatgcaagatcatctcataattttca-caacaatacaaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgc 431209  T
Q  653 attatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcata 692  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  431210 attatcaagaaattacgtccacacaa-cattcaagtcata 431248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 678
Target Start/End: Original strand, 13793636 - 13793939
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtac 471  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||| |||||   |    
T  13793636 atgatatgtccctaaacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttt-gatgcaacaaaaacatcgtatataagatctc 13793733  T
Q  472 acctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagact 568  Q
    ||  || |||||||| |||||||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  13793734 acacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaaccacaagactcaacatgactatgatgcatgaacatacaagtaaggact 13793831  T
Q  569 cgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttac 668  Q
    | ||||||| |||| | | |  ||  ||| |||| ||||||||||| | | ||||  |||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13793832 caacaatgc-aaatgatctccaaactttc-acaataatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgtattatcaagtaattac 13793929  T
Q  669 gtccacacaa 678  Q
    ||||||||||    
T  13793930 gtccacacaa 13793939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11765202 - 11765101
Alignment:
Q  178 caatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaatttc-accaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcat 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11765202 caatgtacatatacaccaatccacataa-tcacaacattcaccaaattctactaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacgactcat 11765104  T
Q  276 caa 278  Q
    |||    
T  11765103 caa 11765101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 678
Target Start/End: Original strand, 23492528 - 23492808
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatc 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||| |||    
T  23492528 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 23492625  T
Q  490 accgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccc 587  Q
     |||||||| ||||||  |||| |  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||     
T  23492626 tccgaagtaaaagagttcaacctt--tttacaactacaagacttaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacagtgcaa--tcacct 23492721  T
Q  588 cataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||  || |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  23492722 ca--attttca-caacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaac-atttcattatcaagaaattacatccacacaa 23492808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 32967824 - 32967533
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||    
T  32967824 cctaaacatgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtct 32967727  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||     
T  32967726 tacataatctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgc- 32967630  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
     ||||||| |  ||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  32967629 -aatcacctc-caactttc-acaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacatccatacaa 32967533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 559 - 678
Target Start/End: Original strand, 3672679 - 3672797
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||  || ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3672679 agcaaagactcgataatgcgatatcacatcacaattttca-caacaatatagaggacaacttccaagtatattgatcatctccacaacaattgcattatc 3672777  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  3672778 aagtgtttacgtccacacaa 3672797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 5622834 - 5622791
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5622834 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 5622791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5623152 - 5623049
Alignment:
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgcc-aatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgt 407  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||    ||||||||| ||||||||    
T  5623152 tcatcaaatgcacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaattacgactcatgccaaatatgttatgcgcttaattccgacacatacatgcatgt 5623053  T
Q  408 ggta 411  Q
    ||||    
T  5623052 ggta 5623049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 416
Target Start/End: Original strand, 29912550 - 29912636
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29912550 aacaattatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaaa 29912636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 6455471 - 6455514
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6455471 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 6455514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 678
Target Start/End: Original strand, 7727304 - 7727383
Alignment:
Q  599 acaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7727304 acaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccataacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa 7727383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 24082907 - 24082950
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24082907 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 24082950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 26561192 - 26561149
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26561192 tcaacaacaattgcattatcaagtattcacgtccacacaatcaa 26561149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 29912850 - 29912893
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29912850 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 29912893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 34937905 - 34937952
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34937905 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 34937952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 642 - 693
Target Start/End: Original strand, 37982199 - 37982249
Alignment:
Q  642 acaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37982199 acaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 37982249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11765266 - 11765200
Alignment:
Q  37 tatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||||    
T  11765266 tatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaataattatcatcaattagattgatcaa 11765200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 14343161 - 14343118
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14343161 tcaacaacaattgcattatcaagtatttatgtcaacacaatcaa 14343118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 23453410 - 23453456
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23453410 cgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctc-aaggtcgtcacct 23453456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 23460654 - 23460700
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23460654 cgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctc-aaggtcgtcacct 23460700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 23464915 - 23464961
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23464915 cgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctc-aaggtcgtcacct 23464961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33150465 - 33150378
Alignment:
Q  58 catcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataa 145  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||||| || || ||||| ||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  33150465 catcatcactatcatcaaaataattatcatcaaatacattcaccaagtgtataagcatgagcaagtaagacatgcaattagagcataa 33150378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Original strand, 21392654 - 21392699
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21392654 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaactc-aaggtcgtcacc 21392699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 22055163 - 22055125
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22055163 caacaacaattgcattatcaagtaattacgtccacacaa 22055125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22055553 - 22055495
Alignment:
Q  174 ccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatg 232  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22055553 ccaccaatgtacatctatacaatccacatagttcacatcattcaacaaattcaccaatg 22055495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 416
Target Start/End: Original strand, 24082607 - 24082693
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24082607 aacaattatcattcacatgcaacaatcacgactcatgtcaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatttggtaccaaa 24082693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 33627812 - 33627746
Alignment:
Q  617 acctccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33627812 acctccatttacattgatcaacttcaaccacaattgcattatccagtatttacgtccacacagtcaa 33627746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 692
Target Start/End: Original strand, 28888645 - 28888737
Alignment:
Q  599 acaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcata 692  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||  || || ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28888645 acaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatatccactacatttgcattatcaagaagttacgtccacacaa-cattcaagtcata 28888737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 483
Target Start/End: Original strand, 29912646 - 29912691
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29912646 caagatgccaaccgcacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 29912691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18532589 - 18532517
Alignment:
Q  174 ccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaa 246  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||| | |||||||||||    
T  18532589 ccaccaatgtacatccatacaatccacatacatcagatcattcaataaattcaccaatgtacaaattcatcaa 18532517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 649 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 24851853 - 24851810
Alignment:
Q  649 ttgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24851853 ttgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa-caagtcataa 24851810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 559 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 5452291 - 5452173
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| || ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||   ||| |||||| ||| | ||||||||||||| |    
T  5452291 agcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttca-caacaatatagaggacaacttccaaacatattgatcatctccagaacaattgcattacc 5452193  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||| |||  ||||||||||    
T  5452192 aagtgtttgtgtccacacaa 5452173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 21224107 - 21224068
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21224107 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaa 21224068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26561502 - 26561403
Alignment:
Q  317 cacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatg-ccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaa 415  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| || |||||||    ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26561502 cacatttatcatcaacaattatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaaatatgctacgcgcctaattccgacacatacatgcatgcggtaccaa 26561403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1170361 - 1170320
Alignment:
Q  394 acatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1170361 acatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 1170320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 17473624 - 17473568
Alignment:
Q  356 taagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 418  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17473624 taagactcatgcca---tgatatgcacctat---cgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 17473568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 640 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 18532199 - 18532161
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18532199 caacaacaattgcattattaagtaattacgtccacacaa 18532161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 483
Target Start/End: Original strand, 24082718 - 24082748
Alignment:
Q  453 acatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24082718 acatcttatgtaagagtacacctcctcttac 24082748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 33627878 - 33627832
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33627878 caagatgccaaccacacatcttatgtaagagtacacatcctcttaca 33627832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5623033 - 5622988
Alignment:
Q  439 aagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5623033 aagatgcccaccaaacatcttatgcaagagtacacctcctcttaca 5622988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 424
Target Start/End: Original strand, 11582371 - 11582404
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11582371 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctca 11582404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 436
Target Start/End: Original strand, 24470765 - 24470805
Alignment:
Q  395 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24470765 catatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 24470805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 54365561 - 54364915
Alignment:
Q  51 attctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcat 150  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||||||||||  |||     
T  54365561 attctcacctcatcattattatcaaaataattatcatcaaattgattcaccaagtgtataagcaccaataagtaaaacatgcaattagagcatagctcaa 54365462  T
Q  151 ttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcataaattcatcaagt 248  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  54365461 tcatttacaaccatcaacaaagtccacaattgtacatatacaccaatccacatagatcacaacattcaacaaatttcaccaatgcacaaattcattaagt 54365362  T
Q  249 cacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaat-ccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  54365361 cacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaattccaaatgtcacaagtatgtattcatcaaacactcttatcatcaacaatcatcattcacat 54365262  T
Q  348 gcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgcca 447  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54365261 gcaacgactaagactcatgccaatatgatgtgtgcctatacacgatacgtatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcaccccaagatgcca 54365162  T
Q  448 acataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgc 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54365161 acataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcgccgaagtaaaagagtaaccctcttttacaacatcaagactcaacatgactatgatgc 54365062  T
Q  548 acttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacc-tcaacaac 646  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  54365061 atggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttatattgatcaccttcaacaac 54364962  T
Q  647 aattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54364961 aattgaattatcaagtgtttacatccacacaatcaatcaagtcataa 54364915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 194 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 5372540 - 5372037
Alignment:
Q  194 aatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaat 293  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372540 aatccacatagatcacatcactcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaat 5372441  T
Q  294 gtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaa-caactaagactcatgccaat-atgatatgcgcctatacacg 391  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  5372440 gtcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaaaaatcatcattcacatgtaaacaattaagactcatgccaattatgttatgcagctattcccg 5372341  T
Q  392 acacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatca 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||||||||    
T  5372340 acacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-gatcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagacttcacacccgtcttacattatca 5372243  T
Q  491 ccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccat 590  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5372242 ccgaagtaaaagagtaactctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatgaacatacaacaaaagactcgacaatgcaaaatcacctcat 5372143  T
Q  591 aatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtca 690  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372142 aatattcaacaacaatataaaggataacctccaattatattgatcacctcaacaacaatgacattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtca 5372043  T
Q  691 taaatc 696  Q
    ||||||    
T  5372042 taaatc 5372037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 51 - 437
Target Start/End: Original strand, 15043062 - 15043445
Alignment:
Q  51 attctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcat 150  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  15043062 attctcacctcatcactattaccaaaacatttatcatcaagtagattcatcaagtgtataagcacaagtaagcaagatgtgcaattagagcatagaccat 15043161  T
Q  151 ttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtca 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15043162 ttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcatacatcaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtca 15043261  T
Q  251 catattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15043262 catattcaattatgacacaattcatcaa-caatcagtccaaatgccacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgca 15043360  T
Q  351 acaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15043361 acaaagaagactcatgtcaacatgatatgcaccta-gttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatgacctc-aaggtcgtcacct 15043445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 51 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15111362 - 15110979
Alignment:
Q  51 attctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcat 150  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  15111362 attctcacctcatcactattaccaaaacatttatcatcaagtagattcatcaagtgtataagcacaagtaagcaagatgtgcaattagagcatagaccat 15111263  T
Q  151 ttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtca 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15111262 ttatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcatacatcaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtca 15111163  T
Q  251 catattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15111162 catattcaattatgacacaattcatcaa-caatcagtccaaatgccacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgca 15111064  T
Q  351 acaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15111063 acaaagaagactcatgtcaacatgatatgcaccta-gttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatgacctc-aaggtcgtcacct 15110979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 290 - 692
Target Start/End: Original strand, 49070244 - 49070650
Alignment:
Q  290 aaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaat-atgatatgcgcctatac 388  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||| |    
T  49070244 aaatatcacaagtatatattcatcgaacacacttatcattaacaatcatcattcacatgcaacaattaagactcgtgtcaattatgctatgcgcctatcc 49070343  T
Q  389 acgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacct-caaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacatt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||    
T  49070344 acgacacatatatgcatgtggtaccaa-tcaccaacaaaggtcgtcacctcaagatgccaacagaacatcttatgtaagatttcatgtccgtcttacatt 49070442  T
Q  487 atcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacc 586  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49070443 atcgccgaagtaaaagagtaacccttctttacagcatcaatactcaacatgactatgattcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacc 49070542  T
Q  587 ccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatc 684  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49070543 tcataaatattcaacaacaatataaaggataacctccatctatattgatcgacttcaacaacaattgcattatcaagtattaacgtccacataatcaatc 49070642  T
Q  685 aagtcata 692  Q
    ||||||||    
T  49070643 aagtcata 49070650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 287 - 696
Target Start/End: Original strand, 19557761 - 19558159
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctat 386  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||  |  ||||| |||||||||| |||| ||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  19557761 tccaaatataacaagtatgtattcatcaatcatccc-atcatcaacaatcatcattcaaatgcatcaattaggattcatgccaatatgatatgcgcctat 19557859  T
Q  387 acacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacatt 486  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19557860 actcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcgccaacaa-----------caagatgccaacagaacatcttatgtaagagtacacctactcttacaat 19557948  T
Q  487 atcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacc 586  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19557949 atcgccgaagtaaaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcaacaatgcaaaattacc 19558048  T
Q  587 ccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatca 685  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19558049 tcataaatattcaacaacaatataaagaataacctccaattatattgatcgcctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatca 19558148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 287 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 47470084 - 47469679
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctat 386  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47470084 tccaaatatcacaagtatgcattcatcaaacacactgatcatcaacattcttcattcacatgcaacagataagactcatgccaatatgatatgcgcctaa 47469985  T
Q  387 acacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacat 485  Q
     | | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || ||||||||    
T  47469984 tcccaagacatatatgcatgtggtaccaaataaccccaa-ggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacat 47469887  T
Q  486 tatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcac 585  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47469886 tatcaccgaagtaaaagagtaatcctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagacttgacaatgcaaaatcac 47469787  T
Q  586 cccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatc 684  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47469786 ctcataaatattcaacaacaatataaaggataacctccaattatattgatcacctcgacaacgattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-caatc 47469688  T
Q  685 aagtcataa 693  Q
    |||| ||||    
T  47469687 aagttataa 47469679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 287 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 50223909 - 50223505
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctat 386  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50223909 tccaaatatcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaaataagactcatgccaatatgatatgcgcctaa 50223810  T
Q  387 acacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacat 485  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  | |||||| ||||| ||| | ||   || ||||||||    
T  50223809 tcccgacacatatatgcatgtgataccaaatcacctcaa-ggtcatcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgttagatttcatacccgtcttacat 50223712  T
Q  486 tatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcac 585  Q
    ||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  50223711 tatcaccgaagtaaaataataaccttcctttacagcatcaagactcaacatgaccatgatgcatggacatataagcaaagacttaacaatgcaaaatcac 50223612  T
Q  586 cccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatca 685  Q
     |   | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50223611 tcatgagtattcaacaacaatataaaagataaccttcaattatattgatcacctcgacaacaattgcattattaagtatttacgtccacacaa-caatca 50223513  T
Q  686 agtcataa 693  Q
    ||||||||    
T  50223512 agtcataa 50223505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 41 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17377433 - 17377049
Alignment:
Q  41 cacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagag 140  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||| | ||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| || | |||  ||||||||| ||    
T  17377433 cacatatacaattctcaccacatcattattatcaaaataattatcatcaaattgattcaccaagtatataagcacaacaa-gtaaggcatgcaattaaag 17377335  T
Q  141 cataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcataaa 238  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  17377334 catagctcaattatttacaaccatcaacaaagtccacaattgtacatatacaccaatccacatagatcacaacattcaacaaatttcaccaatgcacaaa 17377235  T
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaat-ccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatca 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17377234 ttcattaagtcacatattcaatt--gacacaattcatcaaccaatcaattccaaatatcacaagtatgtattcatcaaacacactgatcatcaacaatca 17377137  T
Q  338 tccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 425  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17377136 tgattcacatgcaacaattaagactcatcccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgaatgtggtaccaaatcacctcaa 17377049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 306 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 41258079 - 41257697
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  41258079 tattcgtcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgtcacaaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagtc-cgacacatatatgcat 41257981  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagag 504  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  | || ||| ||||||||| | |||  || |||||||||||||| |||||| |||||    
T  41257980 gtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcactgaagtagaagag 41257883  T
Q  505 taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaaca 604  Q
     | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  41257882 ca-ccctcttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataattttc-acaaca 41257785  T
Q  605 atataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41257784 atataaaggataacttccaattatattgatcatctcaaccacaattgcattatcaagtatttacatccacacaa-caatcaagtcataa 41257697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 290 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 10239181 - 10238853
Alignment:
Q  290 aaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctataca 389  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |     
T  10239181 aaatatcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcatcaatcatcattcaaatacatcaattaagactcacgccaatatgatatgtgcctaatcc 10239082  T
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattat 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |  | |||||| ||||||| | | |||  || |||||||||||    
T  10239081 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcaca-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaaaatttcacacccgtcttacattat 10238984  T
Q  489 caccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacccc 588  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10238983 caccaaagtaaaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaaggaaagacttgacaatgcaaaatcacctc 10238884  T
Q  589 at-aatattcaacaacaatataaaggataac 618  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238883 ataaatattcaacaacaatataaaggataac 10238853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 428 - 693
Target Start/End: Original strand, 24237447 - 24237712
Alignment:
Q  428 gtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaa 526  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  24237447 gtcgtcaccttgagatgccaacataacatcctatgtaagatttcacgcacgtcttacattatcgccgaagtaaaagagtaagtctcttttacaacatcaa 24237546  T
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctccatt 625  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||  ||     
T  24237547 gactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataaatatt---caacaatataaaggataacctttatc 24237643  T
Q  626 tataatgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24237644 tatattgatcgacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccactcaatcaatcaagtcataa 24237712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 423 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 17213460 - 17213199
Alignment:
Q  423 caaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaac 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||  || ||||||||| || |||||||| ||||| |  || ||||||||||    
T  17213460 caaaggtcgtcaccttaagatgccaacagaacatcctatttaagatttcacacccgtcttacattttcgccgaagtaaaagagcacacc-cctttacaac 17213362  T
Q  522 atcaaga-ctcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atattcaacaacaatataaaggataacc 619  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  17213361 atcaacaactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgc-aaatcacctcatatacaatcaacaacaatataaaagataacc 17213263  T
Q  620 tccatttataatgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    | |||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17213262 ttcatttatattgaacaacttcaacaacaagtgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 17213199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40902658 - 40902413
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga-tatgca 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||||||| || || ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||    
T  40902658 tatatacacatatataattatcacctcatcactatcaccaaaataattatcatcaaatacattcaccaagtgtataagcacgagcaagtaagacaatgca 40902559  T
Q  134 attagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattca-gcaatttcaccaat 231  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||||||    
T  40902558 attagagcataattcaattattcacaaccgtcaacaaaattcaccaatgtacatatacaccaatccacat-aatcacaacattcactaaattccaccaat 40902460  T
Q  232 gcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40902459 gcacaaattcattaggtcacatattcaattatgacacgactcatcaa 40902413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5372669 - 5372534
Alignment:
Q  42 acatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagc 141  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5372669 acatatacaattctcacctcatcactattaccaaaataattatcatcaaatagattcatcaagtgtataagcacaagtaagcaagatatgcaattagagc 5372570  T
Q  142 ataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccac 177  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5372569 atagatcatttatttacaactatcaacaaaatccac 5372534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 514 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 17377004 - 17376880
Alignment:
Q  514 tttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaagg 613  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17377004 tttacaacatcaagactcaacacgactatgatgcatgaacatacaagtaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataatattcaacaaaaatataaagg 17376905  T
Q  614 ataacctccatttataatgatcacc 638  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  17376904 ataacctccatttatattgatcacc 17376880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15215737 - 15215564
Alignment:
Q  96 ttcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-a 194  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  |||  |||||||||||||| || ||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15215737 ttcaccaagtgtataagcacaaacaaataagccatgcaattagagcacaagtcaattattcacaacagtcaacaaaatccaccaatgtacatatacacca 15215638  T
Q  195 atccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15215637 atccacataa-tcacaacattcaccgaattccaccaatgcacaaattcatcaagtcgcatattcaattatgacac 15215564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41918691 - 41918463
Alignment:
Q  50 aattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatca 149  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||   |||| ||||||| ||||| |||||  ||| |||  ||||||||||||||||  |||    
T  41918691 aattctcatctcatcattattatcaaaacaattatcatcaaagtgatttatcaagtatataaccacaaacaagtaaggcatgcaattagagcatagctca 41918592  T
Q  150 tttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaag 247  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||  |||  | ||||    
T  41918591 attatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgcacatatacaccaatccacat-aatcacaacattcaccaaatttcaccaatgca-caatcaaccaag 41918494  T
Q  248 tcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  41918493 tcacatattcatttatgacacgactcatcaa 41918463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 693
Target Start/End: Original strand, 14900001 - 14900296
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattat 488  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||  ||    
T  14900001 cgacacatatatgcatgtgataccaaatcacctc-aaggtcgtcacctc-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacaaaat 14900098  T
Q  489 caccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacc 586  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  14900099 caccgaagtaaaagagttcaaccct--tttacaactacaagactc-acatgactatgatgcatggacata-tagcaaagactcgacaatgcaacatcatc 14900194  T
Q  587 ccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaa 686  Q
     ||    |||  |||||||||||||||| ||| | ||  |||| |||||| ||| || || ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||    
T  14900195 tca----atttcacaacaatataaaggacaactttcaaatatattgatcatctccaccacgattgcattaccaagtattcatgtccacacaa-caatcaa 14900289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 372 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 12245918 - 12245602
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtac 471  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |    
T  12245918 atgatatgtccctaaacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttc 12245821  T
Q  472 ac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagag-taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactc 569  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| || | |||||||   |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  |||     
T  12245820 acactcgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctaaacc-cttttacaaatacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaagaacta 12245722  T
Q  570 gacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacg 669  Q
     |||||||||| ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| | | ||||  |||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12245721 aacaatgcaaa-tcacctcc-aatcttca-caacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcgtctcctcaataattgcattatcaagtaattacg 12245625  T
Q  670 tccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  12245624 tccacacaa-cattcaagtcataa 12245602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 15852972 - 15852682
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| || | |||||| ||||||||| | ||||    |||    
T  15852972 cctagacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaaaaaaaacatcgtatgtaagatttcaccaaagtct 15852875  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  15852874 tacataatctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacattactatgatgcatggacaaacaagtaaggactcaacaatgca 15852777  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |  ||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15852776 a--tcacctca--attttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa 15852682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 529 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 43282890 - 43282730
Alignment:
Q  529 ctcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttat 628  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||  | |||||||||||| ||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||    
T  43282890 ctcaacacgactatgatgcattgacatgta-gcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttca-caacaatataaaggacaacttccaaatat 43282793  T
Q  629 aatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcata 692  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  43282792 attgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa-cattcaagtcata 43282730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 21958452 - 21958618
Alignment:
Q  28 atatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga 127  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||   | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||    
T  21958452 atatatatatatatacatatataattctcacctcattactattaccaaggtaattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacaagcaaataaga 21958551  T
Q  128 tatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaa-tccaccaatgtacatatacac 193  Q
     || |||||||||  |   |||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||    
T  21958552 catacaattagagtttggttcaaatattcacaaccatcaacaaaagtccaccaatgcacatttacac 21958618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12135757 - 12135557
Alignment:
Q  50 aattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatca 149  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||| || | |||| | ||||||||||| |||||   || |||  ||||||||||||||||  |||    
T  12135757 aattctcacctcatcattattatcaaaatatt-atcatcaaattgattaaccaagtgtataaccacaaacgagtaaggcatgcaattagagcatagctca 12135659  T
Q  150 tttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaag 247  Q
     |||||| ||| ||||||| || |||||||||||  ||||||| || ||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12135658 attattttcaatcatcaacaaagtccaccaatgtgtatatacaccattccacataggtcacaacattcaacaaatttcaccaatgtacaaattcatcaag 12135559  T
Q  248 tc 249  Q
    ||    
T  12135558 tc 12135557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 415
Target Start/End: Original strand, 12732621 - 12732728
Alignment:
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatg-ccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgt 407  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  12732621 tcatcaagcacacttatcatcaataatcatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaaatatgttatgcgcctaattccgacacatatatgcatgt 12732720  T
Q  408 ggtaccaa 415  Q
    | ||||||    
T  12732721 gataccaa 12732728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 34197821 - 34197530
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||    
T  34197821 cctaaacatgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtct 34197724  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||     
T  34197723 tacataatctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgc- 34197627  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
     ||||||| |  ||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  34197626 -aatcacctc-caactttc-acaacaatataaaggacaacttccaaatatattggtcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacatccatacaa 34197530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 559 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 52266944 - 52266812
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||  || ||| |||| || ||||||| |||||||| ||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52266944 agcaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcacca-caatatagaggataacttccaaatatattgatcatctctacaacaattgcattatc 52266846  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||| | |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  52266845 aagaaattacgtccacacaa-cgatcaagtcataa 52266812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 37958713 - 37958422
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tct 480  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||    
T  37958713 cctaaacatgacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcatcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtct 37958616  T
Q  481 tacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgca 578  Q
    ||||| ||| | |||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||     
T  37958615 tacataatctctgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgc- 37958519  T
Q  579 aaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
     ||||||| |  ||  ||| ||||||||| |||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  37958518 -aatcacctc-caactttc-acaacaatacaaaggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaattacgtccatacaa 37958422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 559 - 696
Target Start/End: Original strand, 15043625 - 15043760
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| || ||| |||| |||||||||| |||| ||| | ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  15043625 agcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttca-caacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcattacc 15043723  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    || | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  15043724 aactgtttacgtccacacaat-gatcgagtcataaatc 15043760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 559 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 15110799 - 15110664
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| || ||| |||| |||||||||| |||| ||| | ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  15110799 agcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttca-caacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcattacc 15110701  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    || | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  15110700 aactgtttacgtccacacaat-gatcgagtcataaatc 15110664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12410145 - 12410090
Alignment:
Q  223 ttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12410145 ttcaccaatgcacatattcaccaagtcacatattcaattatgacacatttcatcaa 12410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19699320 - 19699273
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19699320 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 19699273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19709905 - 19709858
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19709905 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 19709858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 10238851 - 10238798
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10238851 tcaacaacaattgcattatcaaatatttacgtccacacaa-caataaagtcataa 10238798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 681
Target Start/End: Original strand, 42707546 - 42707588
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatca 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42707546 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatca 42707588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 478 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 41167495 - 41167286
Alignment:
Q  478 tcttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaat 575  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||   ||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   |||| |||| || ||||| |||||    
T  41167495 tcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaaccacaagagtcaacatgactatgatgcatggacatgcaagtaaggactcaacaat 41167398  T
Q  576 gcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccaca 675  Q
    ||||  ||||| ||  |  |||| || ||||||||| || ||| | ||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  41167397 gcaa--tcacctca--actttca-cagcaatataaatgacaactttcaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccaca 41167303  T
Q  676 caatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||| || |||||||||||    
T  41167302 caa-cattcaagtcataa 41167286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 680
Target Start/End: Original strand, 12732921 - 12732985
Alignment:
Q  617 acctccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatc 680  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12732921 acctccatttacattgatcaacttcaacaacaattgcattattaagtatttgcgtccacacaatc 12732985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16227921 - 16227882
Alignment:
Q  375 atatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtacca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16227921 atatgcgcctatacacgacacatatatacatgtggtacca 16227882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 18275608 - 18275651
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18275608 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 18275651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 678
Target Start/End: Original strand, 27959755 - 27959834
Alignment:
Q  599 acaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||| || ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27959755 acaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccactacgtttgcattatcaagaaattacgtccacacaa 27959834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 38763573 - 38763616
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38763573 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 38763616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 43283087 - 43283041
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  43283087 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttc-aaggtcgtcacct 43283041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 643 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 7187307 - 7187257
Alignment:
Q  643 caacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  7187307 caacaattgcactatcaagtatttacatccacacagtcaattaagtcataa 7187257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 10105561 - 10105523
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10105561 caacaacaattgcattatcaagtaattacgtccacacaa 10105523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 15676286 - 15676248
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15676286 caacaacaattgcattatcaagtaattacgtccacacaa 15676248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 678
Target Start/End: Original strand, 31114569 - 31114607
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31114569 caacaacaattgcattatcaagtaattacgtccacacaa 31114607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 44345290 - 44345335
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44345290 gacacatatatgcatgtggtaacaaatcacctc-aaggtcgtcacct 44345335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12837983 - 12837920
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12837983 atgatatgcacctatat-cgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacatc-aaggtcgtcacct 12837920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16366404 - 16366360
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16366404 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 16366360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 435
Target Start/End: Original strand, 33738687 - 33738731
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcac 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33738687 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacct-taaggtcgtcac 33738731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 53909474 - 53909441
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909474 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 53909441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 52267169 - 52267123
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  52267169 cgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacttc-aaggtcgtcacct 52267123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 639 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 10115763 - 10115710
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10115763 tcaacatcatttgcattatcaagtttttacatccacacaatcaa-caagtcataa 10115710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 30236190 - 30236145
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30236190 gacacatatatggatgtggtaccatatcacctc-aaggtcgtcacct 30236145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 483
Target Start/End: Original strand, 38763375 - 38763420
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38763375 caagatgccaaccgcacatcttatgtaagagtacacctcatcttac 38763420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 45561245 - 45560560
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45561245 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacctcatcactattaccaaaacatttatcatcaagtagattcatcaagtgtat 45561146  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45561145 aagcacaagtaagcaagatgttcaattagtgcatagatcatttatttacaagcatcgacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 45561046  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatc-aatccaaatgtcacaagtatctat 308  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||| ||||||||| |||||| |||    
T  45561045 accattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcatatattcaattatggcacgattcatcaatgaatcaaattcaaatgtcagaagtatgtat 45560946  T
Q  309 tcatcaaacacacttatcat-taacaatcatccttcacatg-caacaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  45560945 tcatcaaacacacttatcatcgaacaatcatcattcacatgtaaacaattaagactcatgtcaattatgttatgcgcctattcccgacacatacatgcat 45560846  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaaga--gtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaaga 503  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |  | |||||| |||||||||   |||||| | |||||||||||||||||| || ||||    
T  45560845 gtggtaacaaatcacctc-aaggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagattttacacc-cgtcttacattatcaccgaattaaaaga 45560749  T
Q  504 gtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaac 603  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  45560748 gtacccctcatttacatcatcaagactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcatctcataatattc-acaac 45560650  T
Q  604 aatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45560649 aatataaaggataacctccaattatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacgcaatcaatcaagtcataa 45560560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 693
Target Start/End: Original strand, 24237699 - 24238368
Alignment:
Q  28 atatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga 127  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| || | |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  24237699 atatatatatataaacatatacaattctcacctcatcactattatcaaaataattatcatcaaattgattcaccaaatgtataagcacaaacaagtaaga 24237798  T
Q  128 tatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttc 225  Q
     |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||| | ||||||    
T  24237799 catgcaagtagagcataactcaattatttacaaccatcaacaaagtccaccaatgtacttacacaccaatccacatagatcacaacattcaacaaatttc 24237898  T
Q  226 accaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacactta 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24237899 accaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaattccaaatgtcacaagtatgtatttatcaaacacactta 24237998  T
Q  325 tcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaa-tatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc 423  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24237999 tcatcaacaatcatcattcacatgcaacaattaagactcatgccaattatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcagctc 24238098  T
Q  424 aaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacat 523  Q
     |||||||||||| || ||||| |  | |||||| |||||| || | |  | | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24238099 -aaggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcgtatgtacgatttcgtc-catcttacattatcgccgaagtaaaagagtaaccctcctttacaacat 24238195  T
Q  524 caa-gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atattcaacaacaatataaaggataacctc 621  Q
     ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24238196 taacaactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcatatatattcaacaacaatataaaggataacctc 24238295  T
Q  622 catttataatgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24238296 catttatattgatcaacttcaacaacaatttcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 24238368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 695
Target Start/End: Original strand, 22311900 - 22312494
Alignment:
Q  102 aagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccac 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||  |||| | ||||||||||| | |||||||    
T  22311900 aagtgtataagcacaagcaagtaagacattcaattagagcatagttcaattatttacaaccatcaataaagcccacaattgtacatataccccaatccac 22311999  T
Q  201 ataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaat-ccaaatgtcaca 299  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  22312000 atagatcacaacattcaacaatttcaccaatgcacagattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaatcaatcaattccaaatatcaca 22312099  T
Q  300 agtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatat 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  22312100 agtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaattaagactcatgccaatatgatatgcgcctaattccgacacatat 22312199  T
Q  400 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagta 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  22312200 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaa-gtcatcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagta 22312297  T
Q  499 caagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattca 598  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22312298 aaagagtaaccctcttttacaacatcaagactcaacatgactatgaaacatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcatctcataatattca 22312397  T
Q  599 acaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaat 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22312398 acaacaatataaaggataacctccatttatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaat 22312494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 437
Target Start/End: Original strand, 25294151 - 25294568
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25294151 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacatatatacaactctcacctcatcactattaccaaaacatttatcattagatagattcatcaagtgtat 25294250  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  25294251 aagcacaagtaagcaagatatgcaattagagcatatatcatttatttacaaccattaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccac----atcac 25294346  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctatt 309  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25294347 atcattcaacaattccaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgaccaaattcatcaa-caatcaatccaaatgtcacaagtatgtatt 25294445  T
Q  310 catcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |   |||||||||  |||    |||| |||||||||||||||    
T  25294446 catcaaacacatttatcattaacaatcatcatccacatgccacaaataagactcatgtc---atgatatgcatcta-gttcgacgcatatatgcatgtgg 25294541  T
Q  410 taccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25294542 taccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 25294568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 437
Target Start/End: Original strand, 25756140 - 25756557
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25756140 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacatatatacaactctcacctcatcactattaccaaaacatttatcattagatagattcatcaagtgtat 25756239  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  25756240 aagcacaagtaagcaagatatgcaattagagcatatatcatttatttacaaccattaacaaaatccaccaatgtacatatacacaatccac----atcac 25756335  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatccaaatgtcacaagtatctatt 309  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25756336 atcattcaacaattccaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgaccaaattcatcaa-caatcaatccaaatgtcacaagtatgtatt 25756434  T
Q  310 catcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtgg 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |   |||||||||  |||    |||| |||||||||||||||    
T  25756435 catcaaacacatttatcattaacaatcatcatccacatgccacaaataagactcatgtc---atgatatgcatcta-gttcgacgcatatatgcatgtgg 25756530  T
Q  410 taccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25756531 taccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 25756557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 299 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22499036 - 22498643
Alignment:
Q  299 aagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacata 398  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22499036 aagtatgtattcatcaaacaccct-atcatcaacaatcatcattcaaatgcatcaattaggattcatgccaatatgatatgcgcctatattcgacacata 22498938  T
Q  399 tatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||    
T  22498937 tatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagt 22498840  T
Q  498 acaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataat-att 596  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||    
T  22498839 aaaagagtaactctcctttacgacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgccaaatcacctcataaacatt 22498740  T
Q  597 caacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498739 caacaacaatataatggataacctccatttatattgatcacctcaacaacaattgcataatcacgtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 22498643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 287 - 693
Target Start/End: Original strand, 33170682 - 33171084
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctat 386  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33170682 tccaaatatcacatgtatgaattcatcaaacacacttatcttcaacagtcatcattcacatgcaacacataagactcatgccaatatgatatgcgcctaa 33170781  T
Q  387 acacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacat 485  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||    
T  33170782 tcccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacat 33170879  T
Q  486 tatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcac 585  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33170880 tatcaccgaag---cagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgagtatgatgcatggacataaaagcaaagactcgacaatgcaaaatcac 33170976  T
Q  586 cccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatc 684  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33170977 ctcataaatattcaacaacaatataaaggatagcctccaattatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-caatc 33171075  T
Q  685 aagtcataa 693  Q
    | |||||||    
T  33171076 aggtcataa 33171084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 341 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 23116512 - 23116161
Alignment:
Q  341 ttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaa 440  Q
    |||| ||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||     
T  23116512 ttcaaatgcatcaattaggattcatgccaatatgatatgtgcctatacttgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacatcaa-ggtcgtcacc-cat 23116415  T
Q  441 gatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgac 539  Q
    ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116414 gatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagtaatcctcctttacaacatcaagactcaacatgac 23116315  T
Q  540 tatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacc 638  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23116314 tatgatgcatggacatacaagcaaagactagacaatgcaaaatcacctcataaatattcaacaacaatataaaggatagcctccatttatattgatcacc 23116215  T
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23116214 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtacacacaa-caatcaagtcataa 23116161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 425
Target Start/End: Original strand, 11542516 - 11542899
Alignment:
Q  44 atatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||| || | |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  11542516 atatacaattctcacctcatcattattatcaaaataattatcatcaaattgattcaccgagtatataagcacaaacaagtaagacatgcaattagagcat 11542615  T
Q  144 aaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcataaattc 241  Q
    || ||| |||||||||| ||||||| || || |  | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  11542616 aactcaattatttacaatcatcaac-aagtctataattgtacatatacaccaatccacatagatcacaacattcaacaaatttcaccaatgcacaaattc 11542714  T
Q  242 atcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaatc-caaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatcc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||      
T  11542715 atcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaattacaaatgtcacaagtatgtattcatcaaacacactcatcatcaacaatcataa 11542814  T
Q  341 ttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 425  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11542815 ttcacatgcaacaattaagactcatgccaatattatatgcgcctaattccgagacatatatgcacgtggtatcaaatcacctcaa 11542899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 478 - 696
Target Start/End: Original strand, 11543122 - 11543340
Alignment:
Q  478 tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgc 577  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  11543122 tcttacattatcaccgaaataaaagagtaaccctcttttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgc 11543221  T
Q  578 aaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaca 677  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11543222 aaaatcacatcataatattcaacaacaatataaagaataacctccatttatattgatcacctcaacaacaattgtattatcaagtatttacgtccacaca 11543321  T
Q  678 atcaatcaagtcataaatc 696  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11543322 atcaatcaagtcataaatc 11543340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 478 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 18043118 - 18042900
Alignment:
Q  478 tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgc 577  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||    
T  18043118 tcttacattatcatcgaagtaaaagagtaactctcctttacaacattaagactcaacatgactatgatgcatggacataaaagcaaagactcgacattgc 18043019  T
Q  578 aaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaca 677  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18043018 aaaatcacctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccaattatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaca 18042919  T
Q  678 atcaatcaagtcataaatc 696  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18042918 atcaatcaagtcataaatc 18042900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 306 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 37655372 - 37654990
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  37655372 tattcatcaaagacacttatcatcaacaatcatcattcacatgccacaaataagactcatgtcaacatgatatgcacctagtt-cgacacatatatgcat 37655274  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagag 504  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  37655273 gtggtgccaaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 37655176  T
Q  505 taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaaca 604  Q
     | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  37655175 cacccctcttttacagctacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactatacaatgcaaaatca-ctcataattttc-acaaca 37655078  T
Q  605 atataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
     ||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37655077 gtataaaggataacttccacatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 37654990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 313 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 33612779 - 33612404
Alignment:
Q  313 caaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtac 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| |||||||| || ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  33612779 caaacacacttatcatcaacaatcatcattcacataca-caaataagactcgtgtcaacatgatatgcgcctaaac-cgacatatatatgcatgtggtac 33612682  T
Q  413 caaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacata-acatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccc 510  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||| | ||||| ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |   |    
T  33612681 caaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgt-aacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagcacatc 33612585  T
Q  511 tcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataa 610  Q
     | |||| | |  ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  33612584 ccttttaaagctacaagactcaacatgaatatgatgcatgggcatacaagcaaagactcgacaatgcaacatcatctcataataatca-caacaatataa 33612486  T
Q  611 aggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33612485 aggacaacttccaattatattgatcacctcaacaacaattgcattattaagtattcacgtccacacaa-caatcaaatcataa 33612404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20177955 - 20177709
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  20177955 tatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcataagcaagtaagacatgcaa 20177856  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac--aatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaat 231  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  20177855 ttagaacataattcaattattcacaaccgtcaacaaaatccacaaatgtacatatacaccaaatccacataaatcacaacattcaccgaattccaccaat 20177756  T
Q  232 gcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  20177755 gcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgaaacgactcatcaa 20177709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20222682 - 20222436
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  20222682 tatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcataagcaagtaagacatgcaa 20222583  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac--aatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaat 231  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  20222582 ttagaacataattcaattattcacaaccgtcaacaaaatccacaaatgtacatatacaccaaatccacataaatcacaacattcaccgaattccaccaat 20222483  T
Q  232 gcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  20222482 gcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgaaacgactcatcaa 20222436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 17500242 - 17500511
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||| |||||||| | |||||||  | ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  17500242 caaagaaatcaccacatcatatatacaaatatacatatacaattctcacctcattactattaccaaataatt-atcatcaaatagattcaccaagtgtat 17500340  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaa---tcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaa 205  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |   ||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17500341 aagcacaagcaagtaagacatgcaattagagcatatagtttca-ttattcacaatcatcaac-aaacccaccaatgtacatatacaccaatccacat-aa 17500437  T
Q  206 tcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17500438 tcacaacattcaccaaatttcaccaatgcacaaattcaacaagtcacatattcaattatgacacaactcatcaa 17500511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 268
Target Start/End: Original strand, 17265157 - 17265391
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||| || || ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  17265157 tatatgcacatatacaattctcacctcatcactgtcaccaaaataattatcatcaaatacattcaccaagtgtataagcacgagcaagtaagatatgcaa 17265256  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatg 232  Q
    ||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||| | |||||| | |||| ||||||||    
T  17265257 ttaaagcataattcaattattcacaaccgtcaacaaaatccatcaatgtacatatacaccaattcacatat-tcataacattcaccgaattccaccaatg 17265355  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17265356 cacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 17265391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 478 - 693
Target Start/End: Original strand, 23148500 - 23148713
Alignment:
Q  478 tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgc 577  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |   | | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23148500 tcttacattatcaccgaagttaaagagcacatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaagactcgacaatgc 23148599  T
Q  578 aaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaca 677  Q
    || |||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23148600 aacatcatctcataataatcaa-aacaatataaaggacaacttccaattatattgatcacctcaacaacatttgcattatcaagtgtttgcgtccacaca 23148698  T
Q  678 atcaatcaagtcataa 693  Q
    | ||||||||||||||    
T  23148699 a-caatcaagtcataa 23148713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 514 - 696
Target Start/End: Original strand, 25756598 - 25756778
Alignment:
Q  514 tttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaagg 613  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  25756598 tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcaacaatgcaatatcacctcataattttc-acaacaatataaagg 25756696  T
Q  614 ataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    | ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25756697 acaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattataaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataaatc 25756778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Original strand, 23217281 - 23217524
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||| || ||  |||| ||||||    
T  23217281 tatatacacatatacaattctcacctcatcactatcaccaaaataattatcatcaaa-acattcaccaagtgtataagcacgagcaaataagacatgcaa 23217379  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatg 232  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||| |||  |||    
T  23217380 ttagagcataattcaattattcacaaccgtaaacaaaattcaccaatgtacatatacaccaatccacat-aatcacaaaattcaccgaattccacgtatg 23217478  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23217479 cacaaattcatcaagtcacatattcaattatgacacgactcatcaa 23217524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19333551 - 19333307
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||| || |||| | ||||||| || || ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  19333551 tatatacatatatacgattcacacctcatcactatcactaaaataattatcatcaaatacattcaccaagtgtataagcacgagcaagtaagacatgcaa 19333452  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatg 232  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||   |||||| | |||| || |||||    
T  19333451 ttagagcataattcaattattcacaaccgtcaacaaaatccaccaatgtacagatacaccaatccacat-gatcatgacattcaccgaattccatcaatg 19333353  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||    
T  19333352 cacaaattcatcaagtcacatattcaatgttgacacgactcatcaa 19333307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 514 - 696
Target Start/End: Original strand, 25294609 - 25294795
Alignment:
Q  514 tttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaagg 613  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  25294609 tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcaacaatgcaatatcacctcataattttc-acaacaatataaagg 25294707  T
Q  614 ataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgc------attatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    | ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25294708 acaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaatattataaagtatttacgtccacacaa-cattcaagtcataaatc 25294795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 372 - 678
Target Start/End: Original strand, 23835723 - 23836025
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagt-- 469  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| |      
T  23835723 atgatatgtccctaaacatgacacataaatgcatgtggtaccgaa-cacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttt 23835819  T
Q  470 acacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagac 567  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||    
T  23835820 acacc-cgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggac 23835916  T
Q  568 tcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtattta 667  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  23835917 tcgacaatgc-aaatcacctccaaactttc-acaacaatataaaggaaaacttccaaatatattgatcatttcctcaacaattgcattatcaagtaatta 23836014  T
Q  668 cgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||    
T  23836015 cgtccacacaa 23836025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 372 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 21192407 - 21192105
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtac 471  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |    
T  21192407 atgatatgtccctaaacatgacacataaatgcatgtggtaccgaatcaccttaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttc 21192310  T
Q  472 acctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagact 568  Q
    ||  || |||||||| |||||||||||| |||||   ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  21192309 acacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcattgacatacaagtaaggact 21192212  T
Q  569 cgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttac 668  Q
    | |||||||  ||||||| || ||  ||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  21192211 caacaatgc--aatcacctca-aactttc-acaacaatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgtattatcaagaaattac 21192116  T
Q  669 gtccacacaat 679  Q
    |||||||||||    
T  21192115 gtccacacaat 21192105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 23153525 - 23153267
Alignment:
Q  314 aaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtacc 413  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23153525 aaacacatttatcaccaacattcatcattcatatgca-caaataagactcatgtcta-atgatatgcgcctaaac-cgacacatatatgcatgtggtacc 23153429  T
Q  414 aaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacata-acatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccct 511  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || | ||  |||| | ||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||   |     
T  23153428 aaatcacctc-aagatcgtcacc-catggtg-taacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagtatatcc 23153332  T
Q  512 cctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatg 576  Q
    | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||    
T  23153331 cttttacagccacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcatagactcgataatg 23153267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 392 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 21199814 - 21199533
Alignment:
Q  392 acacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatca 490  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || |||||||| ||||    
T  21199814 acacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-gctcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatca 21199717  T
Q  491 ccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacccc 588  Q
    | |||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||||  ||||| |    
T  21199716 ctgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgcaa--tcacctc 21199621  T
Q  589 ataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    | | | |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21199620 aaact-ttca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa 21199533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 279
Target Start/End: Original strand, 25608403 - 25608636
Alignment:
Q  37 tatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaatt 136  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||   |||||| |||| |  |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  25608403 tatatacatatacaattctcacctcattgttattactaaaataaatatcatcaattagattcaccaagtgtataagcacaagcaagtgagacatgcaatt 25608502  T
Q  137 agagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcat 235  Q
    ||||||||  | | | ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||| | |||            
T  25608503 agagcatagtttaatcattcacaaccatcaacaaacttcaccaatgtacatatacaccaatccatat-aatcacaacattcaccaaatgcac-------- 25608593  T
Q  236 aaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25608594 -aattcgacaagtcacatattcaattatgacacaactcgtcaac 25608636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 639 - 693
Target Start/End: Original strand, 25608800 - 25608854
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25608800 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 25608854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 617 - 693
Target Start/End: Original strand, 17265646 - 17265723
Alignment:
Q  617 acctccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17265646 acctccatttacattgatcaacttcaacaacaattgcattatcaattatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 17265723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 527 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 19333136 - 19332972
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 626  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |  | |    |||||||||| |||| |   ||||||||||    
T  19333136 gactcaatatgactatgatgcatggacatacgagcaaagactcaataatgcaaaatcaaacattcac---caacaacaatgtaaaagtacacctccattt 19333040  T
Q  627 ataatgatcacctc-aacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19333039 acattgatcaactttaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagttataa 19332972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 526 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 39448330 - 39448170
Alignment:
Q  526 agactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatt 625  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||| || || ||||| |||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||| || | |    
T  39448330 agactcaacatgactatgatgcatggacatac-agtaaggactcaacaatgc--aatcacccc--aattttc-acaacaatataaaggacaacttcaaat 39448237  T
Q  626 tataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||    
T  39448236 tatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa-cattcaagtcataa 39448170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31196097 - 31195954
Alignment:
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatg 232  Q
    ||||||||||  ||| |||||  ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  31196097 ttagagcatagctcaattattctcaaccatcaacaaagtctaccaatgtgcatatacatcaattcacataa-tcacaacattcaacgaatttcaccaatg 31195999  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    || ||||  | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31195998 cacaaata-accaagtcacatattcaattatgacacgactcatcaa 31195954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24554293 - 24554190
Alignment:
Q  313 caaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatg-ccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggta 411  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  24554293 caaacacacttatcatcaataattatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggta 24554194  T
Q  412 ccaa 415  Q
    ||||    
T  24554193 ccaa 24554190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 24623066 - 24623228
Alignment:
Q  28 atatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga 127  Q
    |||||| |||||| | || |||||||||||| |||| ||||||| ||| | | |||||||||| |||||||| ||| |    ||||||||| ||| ||||    
T  24623066 atatatatatatatatatgtataattctcacctcattactattaacaacataattatcattaaatagattcaccaact----aagcacaagcaagtaaga 24623161  T
Q  128 tatgcaattagag-cataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac 193  Q
     || ||||| ||| | | | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24623162 catacaattggagtcttgattcaattattcacaaccatcaacaaaatccaccaatgcacatatacac 24623228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 514 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 31195804 - 31195644
Alignment:
Q  514 tttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaagg 613  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||  ||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||    
T  31195804 tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgc--aatcacctccaaat-ttc-acaacaatataaagg 31195709  T
Q  614 ataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    | ||| ||||  |||| |||| | |||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  31195708 acaacttccaaatatattgattatctccgcaacatttgcattatcaagaaattacgtccatacaa 31195644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 168
Target Start/End: Original strand, 18823999 - 18824138
Alignment:
Q  28 atatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga 127  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||   | |||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18823999 atatatatatatatatatatataattctcacctcattactattgccaaggtaattataatcaaatagatt-atcaagtgtataagcacaagcaagtaaga 18824097  T
Q  128 tatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaac 168  Q
     || |||||||||| |   ||| ||||| ||||||||||||    
T  18824098 catacaattagagcctggttcaattattcacaaccatcaac 18824138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 7469045 - 7469088
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7469045 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgcccacacaatcaa 7469088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16041253 - 16041206
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16041253 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 16041206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16042929 - 16042882
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16042929 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 16042882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 18610714 - 18610761
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18610714 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 18610761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 41244157 - 41244203
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41244157 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 41244203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41508882 - 41508835
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41508882 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 41508835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19994846 - 19994801
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19994846 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 19994801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24719121 - 24719076
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24719121 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 24719076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Original strand, 25120968 - 25121013
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25120968 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 25121013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 682
Target Start/End: Original strand, 29296693 - 29296735
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29296693 caacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 29296735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 640 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 23227419 - 23227366
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  23227419 caacaaaaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaattaggtcataa 23227366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 641 - 682
Target Start/End: Original strand, 24266800 - 24266841
Alignment:
Q  641 aacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24266800 aacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 24266841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 425
Target Start/End: Original strand, 16416766 - 16416801
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16416766 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 16416801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 559 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 18768239 - 18768121
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||  || ||| |||| || ||||||| |||| ||| ||||  |||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18768239 agcaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcacca-caatatagaggacaacttccaaatatatttatcatctccacaacaattgcattatc 18768141  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  18768140 aagaaattacgtccacacaa 18768121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 24553974 - 24553935
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24553974 tcaacaataattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 24553935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 28543396 - 28543442
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28543396 cgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctc-aaggtcgtcacct 28543442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34013123 - 34013036
Alignment:
Q  58 catcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataa 145  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||||| || || ||||| ||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  34013123 catcatcactatcatcaaaataattatcatcaaatacattcaccaagtgtataagcatgagcaagtaagacatgcaattagagcataa 34013036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 38637251 - 38637206
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38637251 caagatgccaaccgcacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 38637206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 482
Target Start/End: Original strand, 17265468 - 17265524
Alignment:
Q  426 aggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctctta 482  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17265468 aggtcgtcaccccaggatgccaactgcacatcatatgtaagagtacacctcctctta 17265524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 38637064 - 38637020
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaat 683  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  38637064 tcaacaacaattgcattatcaatcatttacatccacacaatcaat 38637020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 484
Target Start/End: Original strand, 7468854 - 7468885
Alignment:
Q  453 acatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7468854 acatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 7468885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 15932117 - 15932160
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15932117 tcaacaacatttgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 15932160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 425
Target Start/End: Original strand, 20480122 - 20480157
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20480122 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaa 20480157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 24554164 - 24554133
Alignment:
Q  453 acatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24554164 acatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 24554133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 270270 - 270315
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  270270 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcc-aaaaggtcgtcacct 270315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 645650 - 645605
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  645650 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcc-aaaaggtcgtcacct 645605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 831385 - 831340
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  831385 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcc-aaaaggtcgtcacct 831340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16203966 - 16203921
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  16203966 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcc-aaaaggtcgtcacct 16203921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 483
Target Start/End: Original strand, 24266609 - 24266639
Alignment:
Q  453 acatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266609 acatcttatgtaagagtacacctcctcttac 24266639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 39448464 - 39448419
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39448464 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctc-aaggtcgtcacct 39448419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23229020 - 23228928
Alignment:
Q  313 caaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatg 406  Q
    |||||||| ||||||   ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  23229020 caaacacatttatcacccacaatcaccattcacatacaacaagtaagactcatgtcaacacgatatgcgcctaaac-cgacacctacatgcatg 23228928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45476066 - 45476021
Alignment:
Q  368 caatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtacc 413  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45476066 caatatgatatgcccctagacacgacacataaatgcatgcggtacc 45476021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 2971 - 2320
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| || || ||||| || |||||||||||| || ||| || ||||||||    
T  2971 tatatacacatatacaattctcacctcatcactatcaccaaaataattatcatcaaatacattcaccaggtgtataagcacgagcaagtaatatatgcaa 2872  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatccacataaatcacatcattcagcaatttc-accaatg 232  Q
    ||||||||||         || |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | | ||| |||||||    
T  2871 ttagagcata---------ttcacaaccgtcaacaaaatgcaccaatgtacatatacaccaatccacataa-tcacaacattcaccgaattctaccaatg 2782  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaat-ccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  2781 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcattaaccaatcaattccaaatgtcaaaagtatgtactcatcaaacacacttatcatcaa 2682  T
Q  332 caatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcg 431  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2681 caatcatcattcacgtgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcatatagacaacacatatatgcgtgtggtaccaaatcacctcaaaggtcg 2582  T
Q  432 tcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactc 531  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2581 tcacctcaagatgccaacagaacatcttacgtaagagcacacctcctcttacattatcgtcgaagtaatagagtaaccctcctttacaacatcaagatgc 2482  T
Q  532 aacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataat 631  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  2481 aacatgactataatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataatattcaacaacaatataaaggataacctccatctatatt 2382  T
Q  632 gatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2381 gatcgacttcaacaacaattgcattatcaagtattta-gtccacacaattaatcaagtcataa 2320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 290 - 692
Target Start/End: Original strand, 4361 - 4767
Alignment:
Q  290 aaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaat-atgatatgcgcctatac 388  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |    
T  4361 aaatatcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaattaagactcatgccaattatgttatgcgtctatcc 4460  T
Q  389 acgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacct-caaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacatt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  4461 acgacacatatatgcatgtggtaccaa-tcaccaacaaaggttgtcacctcaagatgccaatataacatcttatgtaagatttcacgtccgtcttacatt 4559  T
Q  487 atcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacc 586  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4560 atctccgaagtaaaagagtaaccctcctttacaatatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgataatgcaaaatcacc 4659  T
Q  587 ccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatc 684  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4660 tcataaatactcaacaacaatataaaggataacctccatctatattgatcgacttcaacaacaattgcattatcaagtatttatgtccacacaatcaatc 4759  T
Q  685 aagtcata 692  Q
    ||||||||    
T  4760 aagtcata 4767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6686 - 6313
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6686 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaacatttatctttaaatagattcatcaagtgtat 6587  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcac 209  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6586 aagcacaagtaagcaagatgtgcaattagagcatagatcatttatttacaaccatcgacaaaattcaccaatgtacatatacaaaatccacataaatcac 6487  T
Q  210 atcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatc-aaccaatc-aatccaaatgtcacaagtatcta 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6486 atcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatggcacgattcatcgatcaaatcaaatccaaatgtcacaagtatgta 6387  T
Q  308 ttcatcaaacacacttatcatt-aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgc 380  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   || | ||||||||||| ||| |||||||||    
T  6386 ttcatcaaacacacttatcattgaacaatcatcattcacatttcaccaataagactcatgtcaacatgatatgc 6313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36716 - 36479
Alignment:
Q  32 atgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatg 131  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  36716 atgtaaatacacatatacaattctcacctcatcactattaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacaagcaagtaagacatg 36617  T
Q  132 caattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcacca 229  Q
    |||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  36616 caattagagcatagttcaattattcacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacaccaatccaca-aaatcacaacattcaccaaatttcacca 36518  T
Q  230 atgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacac 268  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36517 atgcacaaattcaacaagtcacatattcaattatgacac 36479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 559 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 6122 - 6004
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  6122 agcaaagactcgataatgcaacatcacctcacaattttca-caacaatatagaggacaacttccaaatatattgataatctccacaacaatttcattatc 6024  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaa 678  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6023 aagtatttacgtccacacaa 6004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 287 - 693
Target Start/End: Original strand, 25977 - 26380
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctat 386  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25977 tccaaatctcacaagtatgtattcatcaaacacacctatcaacaacaatcatcattcacatgcaacacgtaagactcatgccaatatgatatgcgcctaa 26076  T
Q  387 acacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacat 485  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||    
T  26077 tcacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacct-aaaggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacacgtcttacat 26174  T
Q  486 tatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcac 585  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26175 tatcaccgaagtaaaagagtacccctcctttacaacatcaagactcaacatgactacgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatggaaaatcac 26274  T
Q  586 cccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatca 685  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26275 ctcataatattc-ataacaatataaaggataacctccaattatattgatcacctcaacaacaattggattatcaagtatttacgtccacacaa-caatca 26372  T
Q  686 agtcataa 693  Q
    ||||||||    
T  26373 agtcataa 26380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 295 - 693
Target Start/End: Original strand, 84847 - 85242
Alignment:
Q  295 tcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgaca 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  84847 tcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacagtcatcattcacatgcaacaaataagactcatgccaatatgatatgagcctattcccgaca 84946  T
Q  395 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||    
T  84947 catatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccg 85044  T
Q  494 aagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataat 593  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  85045 aagtaaaagagtaaaactcctttaaaacatcaagactcaacatgactatgaagcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataat 85144  T
Q  594 attcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  85145 attc-acagcaatataaaggataacctccaaatatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-caatcaagttataa 85242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 287 - 693
Target Start/End: Original strand, 130306 - 130709
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctat 386  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  130306 tccaaatatcacaggtatatattcatcaaccacacttatcatcaacaaccatcaatcatatgcaacaaataagactcatgccaatatgatatgcacctaa 130405  T
Q  387 acacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacat 485  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  |  |||||| |    
T  130406 tcccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacaccggtcttacgt 130503  T
Q  486 tatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcac 585  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  130504 tatcaccgaagtaaaagagcacccctcctttataacatcaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaattcac 130603  T
Q  586 cccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatca 685  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  130604 ctcataatattc-acaacaatataaaggataacctccaattatattgatcacctcaaccacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa-caatca 130701  T
Q  686 agtcataa 693  Q
    ||||||||    
T  130702 agtcataa 130709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 391 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 106563 - 106269
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatc 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | || ||| ||||||||| | |||  || |||||||| |||    
T  106563 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 106466  T
Q  490 accgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccc 587  Q
     |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |   ||||||| | || ||||| | |||||||  |||||     
T  106465 tccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgtatgaacataca-gtaaggactcaaaaatgcaa--tcacct 106371  T
Q  588 cataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaag 687  Q
    ||  || |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||    
T  106370 ca--attttca-caacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa-cattcaag 106275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 306 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 45330 - 44953
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| || || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45330 tattcatcagacacacttatcatcaacaatcatcattcaaatgcatcaattaggattcttgccaatatgatatgcgcctatactcgacacatatatgcat 45231  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagt 505  Q
    || |||||||||| ||   ||           ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  45230 gtagtaccaaatcgccaacaa-----------caagatgtcaatagaacatcttatgtaagagtacacctcctcttacaatatcaccgaagtaaaagagc 45142  T
Q  506 aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccat-aatattcaacaaca 604  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||    
T  45141 aacactcctttacaatatcaagactcaacatgactatgatacatggacatactagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcataaacattccacaaca 45042  T
Q  605 atataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45041 atataaaggataacctccatttatattgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtattcacgtccacacaatcaatcaagtcataa 44953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 5)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 36 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22095 - 21640
Alignment:
Q  36 atatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaat 135  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||| | ||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||  ||| | |  |||||||    
T  22095 atatacacatatacaattctcacg-catcattattatcaaaataattatcatcaaattgattcaccaagtatataagcacaaacaagtatggcatgcaat 21997  T
Q  136 tagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagcaa--tttcaccaatg 232  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  21996 tagagcatagctcaattatttacaaccatcaacaaagtccacaattgtacatatacatcaatccacatagatcacaacattcaacaaaatttcaccaatg 21897  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa-tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaa 331  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21896 cacaaattcatcaagtcatatatttaattatgacacaattcatcaaccaatcaattccaaatgtcacaagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaa 21797  T
Q  332 caatcatccttcacatgca-acaactaagactcatgc-caatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacc-tcaaagg 428  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||  | |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  21796 caatcatcattcacatgcagagaattaagactcatgcttattatgctatgcgcctaatcccgacacatatatgcatgcggtaccagatcaccaacaaagg 21697  T
Q  429 tcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacat 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21696 tcgtcaccccaagatgccaacagaacatcttatgtaagagtacacatcctcttacat 21640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 1378 - 1421
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1378 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 1421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 21597 - 21435
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata---atattca---acaacaatataaaggataacct 620  Q
    ||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |   | |||||   |||||||| ||||     | ||    
T  21597 gactcaatatgactataatgcatggacatacaagcaaagactcaataatgcaaaatcacctcacatatacattcaccaacaacaatgtaaaattacatct 21498  T
Q  621 ccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaat 683  Q
    ||||||| | |||| |  ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21497 ccatttacattgattagttcaccaacaattttattatcaagtatttacgtccacacaatcaat 21435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 385
Target Start/End: Original strand, 1079 - 1133
Alignment:
Q  331 acaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgccta 385  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1079 acaattatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaatatgctatgcgccta 1133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 480
Target Start/End: Original strand, 1174 - 1216
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctct 480  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1174 caagatgccaaccgcacatcttatgtaagagtacacctcctct 1216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 424 - 693
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9609
Alignment:
Q  424 aaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacat 523  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  9338 aaaggtcgtcaccccaagatgccaacaaaacatcttatgtaagagtgcaccttctcttacattatcgccgaagtaaaagagtaaccctcttttacaaaat 9437  T
Q  524 caagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccat-aatattcaacaacaatataaaggataacctcc 622  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9438 caagactcgacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgtaaaatcacctcataaatattcaacaacaatataaaggataacctcc 9537  T
Q  623 atttataatgatc-acctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538 atttatattgatcgacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 9609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 286
Target Start/End: Original strand, 9089 - 9284
Alignment:
Q  92 tagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatac 191  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9089 tagattcactaagtgtacaagcacaaacaagtaagacatgcaattagagcatagctcaattatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgtacatatac 9188  T
Q  192 acaatccacataaatcacatcattc-agcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    | |||||||||| |||| | ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9189 aaaatccacatatatcataacattcaaaaaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcatatattcgattatgacacaattcatcaaccattcaa 9284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 101 - 379
Target Start/End: Original strand, 17617 - 17898
Alignment:
Q  101 caagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatacac-aatcca 199  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  17617 caagtgtataagcacaaacaagtaagacatgcaattagagcatagctcaattatttacaaccatcaacaaggtccacaattgtacatatacaccaatcca 17716  T
Q  200 cataaatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaat-ccaaatgtca 297  Q
    |||| |||||| | |||| ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||    
T  17717 catagatcacaacgttcaacaaatttcaccaatgtacaagttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcattaatcaatcaattccaaatatca 17816  T
Q  298 caagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatg 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17817 caagtatgtattcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaattaagactcatgccaatatgatatg 17898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 330 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 14316 - 13955
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggt 429  Q
    |||||| ||| |||||||| | ||| || |||||||| |||||||  |||||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14316 aacaattatcattcacatgaatcaattacgactcatgtcaatatgccatgcgcctaattccgacagatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggt 14218  T
Q  430 cgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaaga 528  Q
    ||| ||| || ||||| |  | |||||| ||||||| | | |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  14217 cgttacc-catgatgcaacaaaaacatcatatgtaaaatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagtacccctcttttacaacttcaaga 14119  T
Q  529 ctcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttat 628  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  14118 ctcaacatgactatgatgcatggacgtacaagcaaagacttgacaatgcaaaatcacctcataatattc-acaacaatataaaggacaacttccaattat 14020  T
Q  629 aatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    | ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14019 attgatcacctc--caccaatttcattaccaagtatttacgtccacacaa-caatcaagtcataaatc 13955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Original strand, 9824 - 10030
Alignment:
Q  81 ttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaatt-agagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccacca 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  9824 ttatcatcaagtagattcatcaactgtataagcacaagtaaacaagatatgcaatttagagcaaaggtcatttatttacaaccatcaacaaaagtcacca 9923  T
Q  180 atgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9924 atgtacatatacacagtccacatagatcacatcattcaacaatttcaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaattatgtcacaattcatcaac 10023  T
Q  280 caatcaa 286  Q
    |||||||    
T  10024 caatcaa 10030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 306 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 25339 - 24970
Alignment:
Q  306 tattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcat 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  25339 tattcatcaaacacatttatcatcaacaatcatcagtcacatgccacaaataagactgatgtcaacatgatatgcacctagtt-cgacacatatatgcat 25241  T
Q  406 gtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagag 504  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||| |  | || ||| ||||||||| | |||  || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  25240 gtggtacaaaatcacctcaa-ggtcgtcaccttaa-atgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 25143  T
Q  505 taaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaaca 604  Q
     |  |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  25142 cacacctcttttacagctacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacctcatacttttc-acaaca 25044  T
Q  605 atataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
     ||||||| | ||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25043 gtataaagcacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaatttcattatcaagtatttacgtccacacaa 24970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 357 - 693
Target Start/End: Original strand, 180 - 510
Alignment:
Q  357 aagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacata-aca 455  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||| | |||    
T  180 aagactcatgtcaa-atgatatgtgcctaaac-cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgt-aacaaacaca 274  T
Q  456 tcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttaca 554  Q
    || ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |   | | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  275 tcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagcacgtcccttttacaaccacaagactcagcatgactatgatgcatggaca 374  T
Q  555 tacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcat 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| |||||||||| ||||||    
T  375 tacaagcaaagactcgacaatgcaacatcacctca-aataatca-caacaatgtaaaggataacttccaattgtattgatcatctcaacaacatttgcat 472  T
Q  655 tatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  473 tatgaagtatttacgtccacacaa-caatcaagtcataa 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 357 - 693
Target Start/End: Original strand, 5235 - 5565
Alignment:
Q  357 aagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacata-aca 455  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||| | |||    
T  5235 aagactcatgtcaa-atgatatgtgcctaaac-cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgt-aacaaacaca 5329  T
Q  456 tcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttaca 554  Q
    || ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |   | | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  5330 tcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagcacgtcccttttacaaccacaagactcagcatgactatgatgcatggaca 5429  T
Q  555 tacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcat 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| |||||||||| ||||||    
T  5430 tacaagcaaagactcgacaatgcaacatcacctca-aataatca-caacaatgtaaaggataacttccaattgtattgatcatctcaacaacatttgcat 5527  T
Q  655 tatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5528 tatgaagtatttacgtccacacaa-caatcaagtcataa 5565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 357 - 693
Target Start/End: Original strand, 3768 - 4098
Alignment:
Q  357 aagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacata-aca 455  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||| | |||    
T  3768 aagactcatgtcaa-atgatatgcgcctaaac-cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcacc-catgatgt-aacaaacaca 3862  T
Q  456 tcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttaca 554  Q
    || ||||||||| | |||  || |||||||||||||||||| || ||||| |   | | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  3863 tcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaaataaaagagcacatcccttttacaaccacaagactcaccatgactatgatgcatggaca 3962  T
Q  555 tacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcat 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| |||||||||| ||||||    
T  3963 tacaagcaaagactcgacaatgcaacatcacctca-aataatca-caacaatgtaaaggataacttccaattgtattgatcatctcaacaacatttgcat 4060  T
Q  655 tatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4061 tatgaagtatttacgtccacacaa-caatcaagtcataa 4098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 34978 - 34805
Alignment:
Q  520 acatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataa-tattcaacaacaatataaaggataac 618  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34978 acatcaatactcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcggaaatgcaaaatcacctcataaatattcaacaacaatataaaggataac 34879  T
Q  619 ctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34878 ctccatttatattgatctcctcaacaacaattacattatcaagtatttacgtccacacaa-caatcaagtcataa 34805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 424
Target Start/End: Original strand, 31046 - 31080
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31046 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 31080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 10853 - 11120
Alignment:
Q  10 caaaggaatcaccaaaacatatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtat 109  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  10853 caaaggaatcacaaaatcatatatgtatataca--tattcaattctcacctcatcaatattatcaaaataattatcattaaatacattcatcaagtgtat 10950  T
Q  110 aagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatca 208  Q
    |||||| |  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||| || || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10951 aagcacgaacaagtaagacatgaaattagagcataattcaattgttcacaaccattaataaaatccagcaatgtacatatacaccaatccacat-aatca 11049  T
Q  209 catcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    || |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  11050 caacattcaccgaattccaccaatgcacaaattcatcaagtcacatattcaatcatgacacgactcatcaa 11120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 639 - 693
Target Start/End: Original strand, 11387 - 11441
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11387 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12912 - 12669
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||  || |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  12912 tatatatacatatacaattctcacctcattactattatcaaaataattatcaacaaatagattcaccaaatgtataagcacaagcaagtaagacatgcaa 12813  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatg 232  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  12812 ttagagcatagctcaatcatttac--ccatcaacaaaatccaccaatgtacatatacaccaatccaca-caatcacaacattcaccaaatttcaccaatg 12716  T
Q  233 cataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  12715 cacaaattcaacaagtcacatattcaattattacacgactcatcaac 12669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 535 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 12505 - 12449
Alignment:
Q  535 atgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata 591  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  12505 atgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcagcaatgcaaaatcacctcata 12449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 390 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 3939 - 3640
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattat 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || ||||| || ||    
T  3939 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttatataat 3842  T
Q  489 caccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacc 586  Q
    | |||||||| |||||   ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  3841 ctccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatggacatacaagtaaagactcgacaatgcaagatcatc 3744  T
Q  587 ccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaa 686  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||    
T  3743 tcataattttc-acaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa-cattcaa 3646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 359 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 118280 - 117950
Alignment:
Q  359 gactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatct 458  Q
    ||||||||| |  ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||   ||| | |  | ||||||     
T  118280 gactcatgcaacaatgatatgtccctaaacatgacacatatatgcatgtggtactgaatcacctcaa-ggtcgtcaccttc-gattcaacaaaaacatcg 118183  T
Q  459 tatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacat 555  Q
    ||||||||| | |||  || |||||||| |||||||||||| |||||   ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  118182 tatgtaagatttcacagccatcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcattgacat 118085  T
Q  556 acaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcatt 655  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  118084 acaagtaaagactcgacaatgcaagatcatctcataattttc-acaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcatt 117986  T
Q  656 atcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcata 692  Q
    || ||| | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  117985 attaagaaattacgtccacacaa-cattcaagtcata 117950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 163858 - 163903
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  163858 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 163903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 287 - 425
Target Start/End: Original strand, 99548 - 99686
Alignment:
Q  287 tccaaatgtcacaagtatctattcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctat 386  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  99548 tccaaatatcacaagtatgtattcatcaaacacacttaccatcaacaatcatcattcacctgcaacaaataagactcatgtcaatatgatatgcgcctat 99647  T
Q  387 acacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 425  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  99648 tcccgacacatatatgtatgtggtaccaaatcacctcaa 99686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 372 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 78495 - 78174
Alignment:
Q  372 atgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtac 471  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |    
T  78495 atgatatgtccctaaacatgacacataaatgcatgtggtactgaatcacctcaa-ggttgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttc 78398  T
Q  472 acctcc-tcttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagact 568  Q
    ||  || |||||||| |||||||||||| |||||   ||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  78397 acacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacacctacaagactcaacataactatgatgcatggacatacaggcaaagact 78300  T
Q  569 cgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttac 668  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  78299 cgacaatgcaagaccatctcataatattca-caataatataaaggacagcctccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaatttac 78201  T
Q  669 gtccacacaatcaatcaagtcataaatc 696  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  78200 gtccacacaa-cattcaagtcataaatc 78174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11251 - 11039
Alignment:
Q  68 attaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaa 167  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  11251 attaccaaaataattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacaagcaagtaagacatgcaattgaagcatagtttatttattcacaaccatcaa 11152  T
Q  168 cgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatga 265  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11151 caaaatccaccaatgtacatatataccaatccaca-caatcacaacattcaccaaattttaccaacgcacaaattcaacaagtcatatattcaattatga 11053  T
Q  266 cacaattcatcaac 279  Q
     || | ||||||||    
T  11052 tacgactcatcaac 11039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 382 - 693
Target Start/End: Original strand, 33985 - 34292
Alignment:
Q  382 cctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagt--acacctcctc 479  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||| | |  ||||||  ||    
T  33985 cctaaacatgacacataaatacatgtggtaccgaatcacctcaaag-tcgtcaccttc-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaacatttcacacctg-tc 34081  T
Q  480 ttacattatcaccgaagtacaagagt--aaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgc 577  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| || ||||| |||||||    
T  34082 ttacataatcaccgaagtaaaagagctcaaccct--tttacagctacaagactcaacatgactttgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgc 34179  T
Q  578 aaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaca 677  Q
    ||| ||||| |  ||   ||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34180 aaa-tcacctccaaactgtca-caacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaagtatttacgtccacaca 34277  T
Q  678 atcaatcaagtcataa 693  Q
    | || |||||||||||    
T  34278 a-cattcaagtcataa 34292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 527 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 10872 - 10699
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacccc--ata-atattca---acaacaatataaaggataacct 620  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |  ||| | |||||   |||||||| |||| |   | ||    
T  10872 gactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagaatcaataatgcaaaatcacctcgcatatacattcaccaacaacaatgtaaaagtacatct 10773  T
Q  621 ccatttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    || |||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10772 ccttttacattgatcaacttcaacaacaattgcatcatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 10699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 10973 - 10915
Alignment:
Q  426 aggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10973 aggtcgtcaccccatgatgccaactgaacatcatatgtaagagtacacctcctcttaca 10915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15746 - 15558
Alignment:
Q  92 tagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatatac 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  | || ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15746 tagattcaccaagtgtataagcacgagcaactaggacatgcaattagagcatagttcaattattcacaaccatcaacaaaatcctccaatgtacatatac 15647  T
Q  192 a-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaac 279  Q
    | |||||||||  ||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15646 accaatccaca-caatcataacattaaccaaatttcaccaatgcacaaattcaacaagtcacatattcaattatgacacgactcatcaac 15558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 15404 - 15234
Alignment:
Q  529 ctcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata---atattcaacaa---caatataaaggataacctcc 622  Q
    ||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |   | ||||| |||   |||| |||| |   ||||||    
T  15404 ctcaatatgactatgttgcatggacatacaagcaaagactcaataatgcaaaatcacctcacatatacattcaccaaaaacaatgtaaaagtacacctcc 15305  T
Q  623 atttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||| | |||| |  ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15304 atttacattgattagttcaccaacaattgaattataaagtatttacttccacacaatccatcaagtcataa 15234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 15496 - 15450
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttaca 484  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15496 caagatgccaacagaacatcttaagtaagagtacacctcctcttaca 15450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 309 - 565
Target Start/End: Original strand, 3199 - 3453
Alignment:
Q  309 tcatcaaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtg 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  3199 tcatcaaacacacttatcatcaacaatcatcattcacatgccacaaataagactcatgtgaacatgatatgcaccta-gttcgacacatatatgcatgtg 3297  T
Q  409 gtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacac-ctcctcttacattatcaccgaagtacaagagtaa 507  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||   ||||| |  | |||||  ||||||||| | ||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||     
T  3298 gtaccaaatcacctc-taggtcgtcacct-tcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacgcccgtcttacataatcaccgaagtataagagtac 3395  T
Q  508 ccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaag 565  Q
    || || ||||||    ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3396 ccttcttttacagttacaagattcaacatgactatgatgcatggacatacaagcaaag 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 609 - 693
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3533
Alignment:
Q  609 aaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  3450 aaaggataacttccaaatatattgatcatctccacaacaatttcattatcaagtatttgcgtccacacaa-cattcaagtcataa 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 440 - 224
Alignment:
Q  52 ttctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcatt 151  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||| | |||||||||||  ||||  ||| |||  ||||||||||||| ||  ||| |    
T  440 ttctcacctcatcattattaccaaaacaattatcatcaaattgatttaccaagtgtataattacaaacaagtaaggcatgcaattagagcctagctcaat 341  T
Q  152 tatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataaatcacatcattca-gcaatttcaccaatgcataaattcatcaagtc 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| ||||||  |||| | ||||||    
T  340 tatttacaaccatcaacaaaatccaccaatgcacatatacaccaatccacat-aatcacaacattcactaaatttcactaatgca-caattaaccaagtc 243  T
Q  250 acatattcaattatgacac 268  Q
    |||||||||||||||||||    
T  242 acatattcaattatgacac 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13833 - 13788
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13833 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 13788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 256318 - 256148
Alignment:
Q  35 tatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaa 134  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  256318 tatatacacatatacaatcctcacctcatcactattaccaaaacaattatcatcaaatagattcaccaagtgtataagcacgagcaagtaagacatgcaa 256219  T
Q  135 ttagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaatgtacatataca-caatccacataa 204  Q
    |||||  |||| ||| | ||| ||||||||| || || | || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  256218 ttagaatataattcaatcattcacaaccatcgacaaagttcatcaatgtacatatacaccaatccacataa 256148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 535 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 255928 - 255769
Alignment:
Q  535 atgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atattcaacaa---caatataaaggataacctccatttataa 630  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||   |||| |||  ||| |||||||  || |     
T  255928 atgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgcaacatcacctcatatataaacaacaatgacaatgtaagagatcacctccaactacat 255829  T
Q  631 tgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtca 690  Q
    |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  255828 tgaagaacttcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatc-atcaagtca 255769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 68283 - 68326
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  68283 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacgtccacacaatcaa 68326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 391 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 4995 - 4701
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatc 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||| |  | |||||| ||||||||| | |||  || || ||||| |||    
T  4995 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaa-ggtcgtcacctt--gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcatacataatc 4899  T
Q  490 accgaagtacaagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcacccca 589  Q
     |||||||| |||||     ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| | |||||||  ||||| |     
T  4898 tccgaagtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatgaacatacaagtaaggactcaataatgcaa--tcacctcc 4801  T
Q  590 taatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtc 689  Q
     ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  4800 -aattttca-caacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaattacgtccacacaa-cattcaagtc 4704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 559 - 693
Target Start/End: Original strand, 7284 - 7416
Alignment:
Q  559 agcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatc 658  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7284 agcaaagactcgataatgcgacatcaccccacaat-ttccacaacaatataaaggacaacatccaaatatattgatcacctctacaacaattacattatc 7382  T
Q  659 aagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||| | |||||||||||||| || |||||||||||    
T  7383 aagaacttacgtccacacaa-cattcaagtcataa 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 527 - 682
Target Start/End: Original strand, 12371 - 12531
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccata-atattcaacaa---caatataaaggataacctcc 622  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||   |||| |||   || ||||||    
T  12371 gactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcgacaatgtaagatcacctcatatatattcaacaaaaacaatgtaagaaatcacctcc 12470  T
Q  623 atttataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12471 atttacattgatcatcttcaaaatcaattgcattatcaagtatttacgtgcacacaatcaa 12531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 540
Target Start/End: Original strand, 55922 - 56061
Alignment:
Q  400 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcc-tcttacattatcaccgaagta 498  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||| |  | || ||| ||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||    
T  55922 atgcatgtggtacaaaatcccctcaa-ggtcgtcacc-catgatgcaacaaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagta 56019  T
Q  499 caagagtaaccctcctttacaacatcaagactcaacatgact 540  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56020 aaagagtaagcctcctttacaacatcaagactcaacatgact 56061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 278
Target Start/End: Original strand, 19985 - 20212
Alignment:
Q  53 tctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaagatatgcaattagagcataaatcattt 152  Q
    |||||| |||||| || || ||||||| ||||||| || | |||| |  |||||||||| |||||  ||| |||  ||| ||||||||||||  ||| ||    
T  19985 tctcacctcatcattaatatcaaaacaattatcatcaaattgatttactaagtgtataaccacaaacaagtaaggcatgtaattagagcatagctcaatt 20084  T
Q  153 atttacaaccatcaacgaaatccaccaat--gtacatataca-caatccacataaatcacatcattcagc-aatttcaccaatgcataaattcatcaagt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||  |||| | |||||    
T  20085 atttacaaccatcaacaaaatccaccaatacacacatatacaccaatccacat-aatcacaacattcgccaaatttcaccaatgca-caattaaccaagt 20182  T
Q  249 cacatattcaattatgacacaattcatcaa 278  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20183 cacataatcaattatgacacgactcatcaa 20212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14856 - 14703
Alignment:
Q  28 atatatgtatatacacatatataattctcacatcatcactattaccaaaacatttatcattaagtagattcatcaagtgtataagcacaagaaagcaaga 127  Q
    |||||| |||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||   || ||||    
T  14856 atatatatatatatatatacacaattctcacctcatcactattaccaaaataattataatcaaatagtttcaccaagtgtacaagcacaaacgagtaaga 14757  T
Q  128 tatgcaattagagcataaatcatttatttacaaccatcaacgaaatccaccaat 181  Q
     ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  14756 catgcaattagagcatagctcaattacttacaaccatcaacaaagtccaccaat 14703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 526 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 7173 - 7013
Alignment:
Q  526 agactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccatt 625  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||| || || ||||| |||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||| || | |    
T  7173 agactcaacatgactatgatgcatggacatac-agtaaggactcaacaatgc--aatcacccc--aattttc-acaacaatataaaggacaacttcaaat 7080  T
Q  626 tataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||    
T  7079 tatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa-cattcaagtcataa 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 7262
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7307 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctc-aaggtcgtcacct 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 514 - 693
Target Start/End: Original strand, 78325 - 78499
Alignment:
Q  514 tttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaagg 613  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||   | ||||||| || ||||| |||||||||  |||||   | | |||  |||||||||||||||    
T  78325 tttacaactacaagactcaacataactatgatgcatgaatatacaagtaaggactcaacaatgcaa--tcacct--tcaaatttcacaacaatataaagg 78420  T
Q  614 ataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | ||| ||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  78421 acaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattacgtccacacaa-caatcaagtcataa 78499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 331 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 64173 - 64090
Alignment:
Q  331 acaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaa 415  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||    
T  64173 acaatcaccattcacatacaacaagtaagactcatgtcaacatgatatgcgcctaaac-cgacacctacatgcatgtggtaccaa 64090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 90643 - 90610
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  90643 gacacatatatgcatttggtaccaaatcacctca 90610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 1195 - 1152
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1195 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 1152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 527 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 1723 - 1562
Alignment:
Q  527 gactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaaggataacctccattt 626  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |  | |    |||||||||| |||| |   || |||||||    
T  1723 gactcaatatgactatgatgcatggacatacaagcaaagactcaataatacaaaatcatacattcac---caacaacaatgtaaaagtacacatccattt 1627  T
Q  627 ataatgatcacct-caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtca 690  Q
    | | |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1626 acattgatcaacttcaacaacaattgcaatatcaagtaattacgtccacataatcaatcaagtca 1562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 416
Target Start/End: Original strand, 9848 - 9934
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9848 aacaattatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaaa 9934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 416
Target Start/End: Original strand, 19273 - 19359
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19273 aacaattatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaatatgctatgcgcctaattccgacacatacatgcatgtggtaccaaa 19359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 28807 - 28856
Alignment:
Q  220 aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacaca 269  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807 aatttcaccaatgcacatattcatcaagtcacatattcaattatgacaca 28856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 2359 - 2316
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2359 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 2316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 2542 - 2497
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2542 caagatgccaaccacacatcttatgtaacagtacacctcctcttac 2497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 26760 - 26807
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26760 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaaccaatcaa 26807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 514 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 23947 - 23790
Alignment:
Q  514 tttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaagg 613  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||  ||||| | |  ||  ||| |||||||||||||||    
T  23947 tttacaactacaagactcaacatgactatgatgcatgtacatacaagtaaggactcaacaatgc--aatcagctc-caagtttc-acaacaatataaagg 23852  T
Q  614 ataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccaca 675  Q
    | ||| ||||  |||| |||| | ||| | |||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  23851 acaacttccaaatatattgattatctccataacatttgcattatcaagaaattacgtccaca 23790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 5580 - 5541
Alignment:
Q  654 ttatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5580 ttatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 5541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 138450 - 138404
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  138450 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 138404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 19172 - 19130
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19172 caacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 19130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 23437 - 23395
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23437 caacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 23395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 28748 - 28706
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28748 caacaacaattgcattatcaagtatttacatccacacaatcaa 28706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 76810 - 76855
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  76810 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 76855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3751 - 3706
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3751 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 3706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 416
Target Start/End: Original strand, 6231 - 6317
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaa 416  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6231 aacaattatcattcacatgcaacaattacgactcatggaaatatgctatgcgcctaatttcgacacatacatgcatgtggtaccaaa 6317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 483
Target Start/End: Original strand, 6327 - 6372
Alignment:
Q  438 caagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327 caagatgccaaccgcacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 6372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 6531 - 6574
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6531 tcaacaacaattgcattatcaagaatttacatccatacaatcaa 6574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 3363 - 3321
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatca 681  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3363 tcaacaacaattacattatcaagtatttacgtccacacaatca 3321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 514 - 693
Target Start/End: Original strand, 4674 - 4848
Alignment:
Q  514 tttacaacatcaagactcaacatgactatgatgcacttacatacaagcaaagactcgacaatgcaaaatcaccccataatattcaacaacaatataaagg 613  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||  ||||||| |  ||  ||| |||||||||||||||    
T  4674 tttacaactacaagactcagcatgactatgatgcatggacatacaagtaaggactcaacaatgc--aatcacctc-caagtttc-acaacaatataaagg 4769  T
Q  614 ataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    | ||| ||||  |||| |||| | ||| ||||||  |||||| ||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  4770 acaacttccaaatatattgattatctccacaacatctgcattctcaagaaattacatccacacaa-caattaagtcataa 4848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8699 - 8634
Alignment:
Q  313 caaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatg 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8699 caaacacacttatcatcaacaatcatcaatcacatgc-acaaataagactcatgtcaatatgatatg 8634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Original strand, 18108 - 18152
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18108 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacc 18152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 26459 - 26414
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26459 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 26414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 106335 - 106165
Alignment:
Q  314 aaacacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtacc 413  Q
    ||||||| ||||||   ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  106335 aaacacatttatcacccacaatcaccattcacatacaacaagtaagactcatgtcaacatgatatgcgccta-aca-gacacctacatgcatgtggtacc 106238  T
Q  414 aaatcacctcaa-----aggtcgtcacctcaagatgccaacataacatcttatgtaagagtacacctcctcttac 483  Q
     || |||  |||     ||||||| ||| || |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  106237 -aagcacaacaacgtctaggtcgttacc-catgatgccaactacacatcatatgtaagagtacacctcctcttac 106165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 640 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 106006 - 105953
Alignment:
Q  640 caacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtcataa 693  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  106006 caacaacatttgcattatcaagtatttacatccacacaatcagttaagtcataa 105953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 256603 - 256558
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  256603 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 256558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 125036 - 124992
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  125036 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcc-caagggtcgtcacc 124992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1694 - 1625
Alignment:
Q  317 cacacttatcattaacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatg-ccaatatgatatgcgccta 385  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||    
T  1694 cacacttatcatcaacaatcatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaaatatgctatgcgccta 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Original strand, 8600 - 8647
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacctc 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8600 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggccgtcacctc 8647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 20978 - 20916
Alignment:
Q  356 taagactcatgccaatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978 taagactcatgcca---tgatatgcacctat---cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 20916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 246
Target Start/End: Original strand, 8177 - 8249
Alignment:
Q  174 ccaccaatgtacatatacacaatccacataaatcacatcattcagcaatttcaccaatgcataaattcatcaa 246  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| | |||||||||||    
T  8177 ccaccaatgtacatcaatacaatccacataaatcaaatcattcaataaattcaccaatgtacaaattcatcaa 8249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 52087 - 52130
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  52087 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 52130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 145061 - 145106
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  145061 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcc-aaaaggtcgtcacct 145106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 690
Target Start/End: Original strand, 350 - 400
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaatcaagtca 690  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  350 tcaacaacaattgcattataaagtatttacgtccacataatc-atcaagtca 400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 7954 - 8000
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7954 cgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 8000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13821 - 13758
Alignment:
Q  204 aatcacatcattcagcaa-tttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgac 266  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13821 aatcatatcattcaccaaatttcaccaatgcaaatattcaccaagtcacatattcaattatgac 13758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 6068 - 6114
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6068 cgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 6114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 23322 - 23369
Alignment:
Q  239 ttcatcaagtcacatattcaattatgacacaattcatcaaccaatcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23322 ttcatcaagtcacatattcaattatgacatacttcatcaacaaatcaa 23369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 68849 - 68895
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  68849 cgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctc-aaggtcgtcacct 68895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 98561 - 98518
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  98561 tcaacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 98518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 3182 - 3227
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3182 gacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcacct 3227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13478 - 13433
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13478 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttc-aaggtcgtcacc 13433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 437
Target Start/End: Original strand, 7255 - 7300
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7255 gacacatatatgcatgtggtactaaatcacctc-aaggtcgtcacct 7300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 424
Target Start/End: Original strand, 3474 - 3508
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3474 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 436
Target Start/End: Original strand, 21084 - 21129
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21084 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 21129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 435
Target Start/End: Original strand, 28674 - 28718
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcac 435  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  28674 cgacacatatatgcatgtggtgccaaatctcctc-aaggtcgtcac 28718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Original strand, 759 - 803
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  759 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcct-aaaggtcgtcacc 803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 1045
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1089 gacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctc-aaggtcgtcacc 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7057 - 7013
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcac 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7057 cgacacatatatgcatgtggtaccaaataacctc-aaggtcgtcac 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 424
Target Start/End: Original strand, 31261 - 31294
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31261 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 31294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 413
Target Start/End: Original strand, 20615 - 20660
Alignment:
Q  368 caatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtacc 413  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20615 caatatgatatgcccctatacacgacacataaatgcatgcggtacc 20660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 413
Target Start/End: Original strand, 28599 - 28644
Alignment:
Q  368 caatatgatatgcgcctatacacgacacatatatgcatgtggtacc 413  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28599 caatatgatatggccctagacacgacacataaatgcatgtggtacc 28644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 424
Target Start/End: Original strand, 28284 - 28317
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28284 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 28317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 641 - 682
Target Start/End: Original strand, 12231 - 12272
Alignment:
Q  641 aacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12231 aacaacaattgcattatcaagcatttacatccacacaatcaa 12272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 434
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14243
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtca 434  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14200 cgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtca 14243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 646 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 23864 - 23832
Alignment:
Q  646 caattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23864 caattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 23832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25585
Alignment:
Q  330 aacaatcatccttcacatgcaacaactaagactcatgccaatatgatatgcgccta 385  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25640 aacaattatcattcacatgcaacaattacgactcatgtcaatatgctatgcgccta 25585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 437
Target Start/End: Original strand, 32049 - 32095
Alignment:
Q  390 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32049 cgacacatatatgcatgtggtaccatttcacctc-aaggtcgtcacct 32095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 71720 - 71641
Alignment:
Q  599 acaacaatataaaggataacctccatttataatgatcacctcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaa 678  Q
    |||||||||||||||| | | |||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  71720 acaacaatataaaggacaccttccaattatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaattacgtccatacaa 71641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Original strand, 29887 - 29930
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  29887 tcaacaacaattgcattaccaagcatttacatccacacaatcaa 29930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 198759 - 198716
Alignment:
Q  639 tcaacaacaattgcattatcaagtatttacgtccacacaatcaa 682  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  198759 tcaacaacaattgcattatcaaacatttacatccacacaatcaa 198716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1676 - 1622
Alignment:
Q  220 aatttcaccaatgcataaattcatcaagtcacatattcaattatgacacaattca 274  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  1676 aatttcaccaatgtacaaattcaccaagtcacatagtcaagtatgacacatttca 1622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 6352 - 6308
Alignment:
Q  392 acacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcacct 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  6352 acacatatatgcatgtggtaccaaatcatctc-agggtcgtcacct 6308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 424
Target Start/End: Original strand, 40055 - 40088
Alignment:
Q  391 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctca 424  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40055 gacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctca 40088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University