View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18127_low_34 (Length: 254)

Name: NF18127_low_34
Description: NF18127
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18127_low_34
NF18127_low_34
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (3-231)||(15772768-15772994)
chr3 (81-228)||(43346812-43346959)
chr3 (81-228)||(37990660-37990807)
chr3 (81-228)||(37990998-37991145)
chr3 (79-225)||(29644926-29645072)
chr3 (80-233)||(12114578-12114731)
chr3 (91-228)||(22304569-22304706)
chr3 (83-228)||(54017837-54017982)
chr3 (81-228)||(42342409-42342556)
chr3 (79-217)||(35946510-35946648)
chr3 (81-231)||(15773182-15773334)
chr3 (81-225)||(29644605-29644749)
chr3 (80-228)||(32589693-32589840)
chr3 (81-228)||(54018219-54018366)
chr3 (81-228)||(32462921-32463069)
chr3 (80-228)||(52634665-52634812)
chr3 (81-228)||(42342111-42342258)
chr3 (84-228)||(33803273-33803417)
chr3 (100-228)||(39934976-39935104)
chr3 (81-228)||(25739446-25739593)
chr3 (81-228)||(31190007-31190146)
chr3 (81-228)||(41359786-41359929)
chr3 (84-228)||(21832366-21832508)
chr3 (81-228)||(22303976-22304116)
chr3 (80-228)||(53577353-53577501)
chr3 (81-230)||(45901703-45901853)
chr3 (84-209)||(8327897-8328022)
chr3 (80-228)||(39914241-39914389)
chr3 (91-217)||(39389070-39389196)
chr3 (81-217)||(32462590-32462727)
chr3 (83-228)||(45395674-45395819)
chr3 (81-228)||(3135475-3135629)
chr3 (81-228)||(25755384-25755531)
chr3 (98-223)||(3135099-3135224)
chr3 (91-228)||(4823655-4823792)
chr3 (79-210)||(49336726-49336857)
chr3 (81-228)||(53117996-53118142)
chr3 (91-226)||(50612470-50612610)
chr3 (80-209)||(1634354-1634484)
chr3 (84-209)||(9240142-9240267)
chr3 (91-229)||(51886561-51886693)
chr3 (81-228)||(11661941-11662088)
chr3 (84-199)||(33175711-33175829)
chr3 (84-223)||(47964544-47964683)
chr3 (86-223)||(39336257-39336392)
chr3 (101-207)||(42584864-42584970)
chr3 (83-215)||(44160579-44160710)
chr3 (88-198)||(3384317-3384427)
chr3 (81-147)||(43346640-43346706)
chr3 (87-183)||(7767380-7767476)
chr3 (91-228)||(37726504-37726633)
chr3 (149-228)||(22303680-22303759)
chr3 (85-215)||(33362327-33362460)
chr3 (81-158)||(11661525-11661602)
chr3 (91-146)||(22304246-22304301)
chr3 (84-199)||(46546375-46546490)
chr3 (133-219)||(39336000-39336086)
chr3 (84-209)||(47964955-47965080)
chr3 (141-201)||(52634990-52635050)
chr3 (133-228)||(12749211-12749306)
chr3 (94-223)||(25317161-25317290)
chr3 (83-123)||(12747878-12747918)
chr3 (83-191)||(33809066-33809174)
chr3 (161-225)||(54017572-54017636)
chr3 (175-228)||(41359512-41359565)
chr3 (93-209)||(25991405-25991521)
chr3 (158-205)||(48127859-48127906)
chr3 (158-209)||(53596027-53596078)
chr3 (158-209)||(53596342-53596393)
chr3 (161-199)||(16868433-16868471)
chr3 (146-203)||(17731950-17732007)
chr3 (146-203)||(19033181-19033238)
chr3 (159-203)||(16871005-16871049)
chr3 (159-203)||(17735037-17735081)
chr3 (159-203)||(19036306-19036350)
chr3 (174-209)||(11661603-11661638)
chr3 (158-209)||(53596542-53596593)
chr3 (171-209)||(25413125-25413163)
chr3 (158-203)||(16143505-16143550)
chr3 (162-203)||(16869843-16869884)
chr3 (96-157)||(36986040-36986101)
chr3 (96-157)||(37011479-37011540)
chr3 (83-115)||(2299968-2300000)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (79-228)||(36492238-36492387)
chr5 (81-228)||(40296336-40296483)
chr5 (84-228)||(13415781-13415925)
chr5 (81-231)||(26074602-26074752)
chr5 (79-228)||(15370087-15370236)
chr5 (81-228)||(299479-299626)
chr5 (81-228)||(6224186-6224333)
chr5 (93-228)||(18603141-18603276)
chr5 (97-228)||(41170640-41170771)
chr5 (83-228)||(3295366-3295509)
chr5 (91-228)||(6500451-6500587)
chr5 (91-228)||(6500823-6500959)
chr5 (78-225)||(26075185-26075333)
chr5 (81-228)||(25327925-25328072)
chr5 (84-231)||(26074164-26074311)
chr5 (87-225)||(3295039-3295176)
chr5 (91-228)||(27502057-27502194)
chr5 (91-228)||(32487394-32487530)
chr5 (86-231)||(35150002-35150146)
chr5 (84-225)||(41632775-41632916)
chr5 (81-228)||(11416998-11417143)
chr5 (81-228)||(34753046-34753193)
chr5 (84-228)||(36568590-36568732)
chr5 (80-228)||(12662673-12662821)
chr5 (81-228)||(42405619-42405764)
chr5 (81-223)||(26074807-26074950)
chr5 (91-226)||(29549278-29549413)
chr5 (91-228)||(624196-624333)
chr5 (103-228)||(33747783-33747908)
chr5 (91-211)||(9498692-9498812)
chr5 (84-228)||(1028538-1028682)
chr5 (91-228)||(623818-623955)
chr5 (91-228)||(5723812-5723949)
chr5 (84-228)||(24489227-24489369)
chr5 (91-231)||(26590928-26591068)
chr5 (117-228)||(15370428-15370539)
chr5 (80-226)||(300948-301086)
chr5 (79-228)||(35167859-35168008)
chr5 (81-214)||(35914839-35914972)
chr5 (96-231)||(38427553-38427687)
chr5 (83-186)||(31509615-31509718)
chr5 (83-186)||(42508604-42508707)
chr5 (94-231)||(2411010-2411147)
chr5 (84-223)||(36521922-36522061)
chr5 (80-228)||(41635212-41635360)
chr5 (93-168)||(26074320-26074395)
chr5 (93-166)||(7768852-7768925)
chr5 (84-209)||(36522277-36522402)
chr5 (84-161)||(39309677-39309754)
chr5 (105-216)||(31509745-31509857)
chr5 (81-133)||(35150737-35150789)
chr5 (81-133)||(35151028-35151080)
chr5 (158-209)||(13042606-13042657)
chr5 (148-227)||(36527117-36527196)
chr5 (84-209)||(13786041-13786166)
chr5 (83-216)||(19275524-19275653)
chr5 (94-151)||(6225047-6225104)
chr5 (175-227)||(795254-795306)
chr5 (158-205)||(13112604-13112651)
chr5 (177-228)||(26900038-26900089)
chr5 (80-137)||(26900082-26900139)
chr5 (162-203)||(34103625-34103666)
chr5 (178-231)||(38427306-38427359)
chr5 (93-186)||(42524719-42524811)
chr5 (162-228)||(9498344-9498410)
chr5 (84-126)||(13785732-13785774)
chr5 (162-203)||(41340350-41340391)
chr5 (149-209)||(32445943-32446003)
chr5 (83-123)||(36527209-36527249)
chr5 (158-209)||(36389016-36389067)
chr5 (171-209)||(13042784-13042822)
chr5 (171-209)||(13112782-13112820)
chr5 (193-231)||(24489583-24489621)
chr5 (190-225)||(795152-795188)
chr5 (159-203)||(41341523-41341567)
chr5 (149-209)||(42435486-42435545)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (81-228)||(7517570-7517717)
chr7 (81-228)||(1085637-1085784)
chr7 (81-226)||(22567062-22567206)
chr7 (81-226)||(30244260-30244405)
chr7 (81-220)||(7554015-7554154)
chr7 (81-211)||(30245067-30245197)
chr7 (91-231)||(37533029-37533168)
chr7 (80-228)||(40094795-40094943)
chr7 (81-228)||(23398-23545)
chr7 (81-224)||(24177425-24177568)
chr7 (81-228)||(45433231-45433378)
chr7 (81-228)||(45434626-45434773)
chr7 (79-226)||(45754704-45754850)
chr7 (98-228)||(11845198-11845328)
chr7 (81-210)||(22566702-22566830)
chr7 (91-228)||(29157565-29157702)
chr7 (93-228)||(6054562-6054697)
chr7 (80-226)||(34218057-34218203)
chr7 (82-228)||(36939754-36939900)
chr7 (99-228)||(19122740-19122868)
chr7 (84-228)||(8128462-8128606)
chr7 (81-228)||(118320-118469)
chr7 (81-211)||(16569186-16569316)
chr7 (81-211)||(16596346-16596476)
chr7 (77-226)||(24838724-24838874)
chr7 (94-228)||(37533385-37533519)
chr7 (81-217)||(1085280-1085417)
chr7 (81-228)||(9901635-9901780)
chr7 (81-228)||(47129085-47129232)
chr7 (81-227)||(36622950-36623096)
chr7 (91-208)||(14681510-14681627)
chr7 (86-231)||(40230309-40230454)
chr7 (80-212)||(43241484-43241616)
chr7 (81-228)||(30032557-30032704)
chr7 (80-231)||(20599303-20599456)
chr7 (80-208)||(36534825-36534953)
chr7 (81-186)||(41910657-41910762)
chr7 (81-164)||(30245484-30245567)
chr7 (81-164)||(30255329-30255412)
chr7 (81-228)||(41854625-41854771)
chr7 (81-161)||(30244691-30244771)
chr7 (84-179)||(28301613-28301708)
chr7 (82-159)||(36109007-36109084)
chr7 (133-211)||(30253534-30253612)
chr7 (83-209)||(4124128-4124254)
chr7 (137-226)||(28300276-28300366)
chr7 (150-228)||(37167840-37167918)
chr7 (84-141)||(40094502-40094559)
chr7 (96-196)||(44361517-44361616)
chr7 (172-228)||(47129450-47129506)
chr7 (81-143)||(36967335-36967397)
chr7 (158-209)||(21416181-21416232)
chr7 (174-228)||(28300589-28300644)
chr7 (133-227)||(15902342-15902436)
chr7 (160-208)||(23569043-23569091)
chr7 (84-209)||(37345909-37346036)
chr7 (179-228)||(37532772-37532821)
chr7 (159-228)||(40094434-40094503)
chr7 (91-126)||(14681287-14681322)
chr7 (158-203)||(21619091-21619136)
chr7 (88-152)||(10341829-10341893)
chr7 (174-226)||(45755010-45755062)
[»] chr2 (74 HSPs)
chr2 (91-228)||(36178626-36178763)
chr2 (81-228)||(6421375-6421522)
chr2 (81-225)||(15880253-15880397)
chr2 (91-228)||(41283496-41283633)
chr2 (91-228)||(14745688-14745825)
chr2 (79-228)||(36005901-36006049)
chr2 (91-228)||(37105924-37106061)
chr2 (91-228)||(37106188-37106325)
chr2 (84-228)||(962591-962735)
chr2 (81-228)||(15511516-15511661)
chr2 (81-228)||(28254260-28254405)
chr2 (91-226)||(5542648-5542783)
chr2 (80-226)||(38796641-38796789)
chr2 (88-228)||(1769889-1770029)
chr2 (91-226)||(5543021-5543156)
chr2 (84-209)||(28531354-28531479)
chr2 (79-228)||(33731634-33731785)
chr2 (84-228)||(42514642-42514786)
chr2 (86-228)||(35580745-35580886)
chr2 (84-228)||(40679650-40679794)
chr2 (107-228)||(6422126-6422247)
chr2 (82-231)||(12529046-12529195)
chr2 (81-226)||(40733507-40733652)
chr2 (81-228)||(6712966-6713114)
chr2 (109-225)||(36178195-36178311)
chr2 (79-228)||(5367443-5367592)
chr2 (81-198)||(16542439-16542556)
chr2 (81-199)||(31468800-31468914)
chr2 (81-231)||(29676893-29677048)
chr2 (81-179)||(31899496-31899594)
chr2 (102-231)||(40163390-40163520)
chr2 (88-226)||(7598606-7598736)
chr2 (81-226)||(40733873-40734017)
chr2 (91-211)||(14745332-14745452)
chr2 (84-228)||(37632618-37632762)
chr2 (88-226)||(7598225-7598363)
chr2 (83-223)||(30313170-30313309)
chr2 (84-228)||(23346228-23346373)
chr2 (91-198)||(36178320-36178427)
chr2 (81-168)||(38796299-38796386)
chr2 (79-207)||(31259658-31259789)
chr2 (84-209)||(33561491-33561616)
chr2 (99-231)||(29676543-29676669)
chr2 (83-208)||(30323456-30323581)
chr2 (83-203)||(37895107-37895227)
chr2 (87-205)||(29874067-29874185)
chr2 (83-223)||(29873563-29873703)
chr2 (81-148)||(36785664-36785731)
chr2 (84-228)||(16590881-16591020)
chr2 (86-209)||(37894732-37894855)
chr2 (145-228)||(3673122-3673205)
chr2 (153-227)||(6421793-6421867)
chr2 (144-222)||(36784287-36784365)
chr2 (84-231)||(9231242-9231389)
chr2 (84-199)||(33953821-33953936)
chr2 (81-139)||(6421294-6421352)
chr2 (84-198)||(12910221-12910335)
chr2 (107-196)||(28254165-28254254)
chr2 (83-222)||(31385728-31385868)
chr2 (163-228)||(3672773-3672838)
chr2 (153-226)||(6421688-6421761)
chr2 (84-198)||(41678419-41678534)
chr2 (81-126)||(3673075-3673120)
chr2 (84-153)||(42515005-42515078)
chr2 (79-126)||(3672707-3672754)
chr2 (84-227)||(33954284-33954426)
chr2 (86-231)||(3594196-3594341)
chr2 (155-209)||(35580478-35580534)
chr2 (133-209)||(30312831-30312907)
chr2 (133-188)||(2336666-2336721)
chr2 (83-123)||(43443108-43443148)
chr2 (158-209)||(28226404-28226455)
chr2 (181-231)||(31899120-31899170)
chr2 (79-108)||(43779809-43779838)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (81-226)||(26661545-26661690)
chr1 (79-228)||(41156979-41157128)
chr1 (83-228)||(41157367-41157512)
chr1 (80-231)||(29798188-29798339)
chr1 (81-228)||(41142362-41142510)
chr1 (83-214)||(17294569-17294700)
chr1 (91-228)||(44290845-44290983)
chr1 (81-226)||(26661921-26662066)
chr1 (81-228)||(39066221-39066368)
chr1 (81-231)||(34364915-34365065)
chr1 (81-226)||(37556101-37556246)
chr1 (83-228)||(5319986-5320131)
chr1 (91-228)||(44290479-44290616)
chr1 (80-228)||(31767182-31767330)
chr1 (91-217)||(32594748-32594874)
chr1 (82-228)||(40082398-40082543)
chr1 (91-228)||(41759483-41759620)
chr1 (81-228)||(34364497-34364644)
chr1 (84-226)||(22077518-22077660)
chr1 (92-213)||(3550721-3550842)
chr1 (83-228)||(38804376-38804521)
chr1 (91-228)||(48588509-48588646)
chr1 (96-228)||(3537620-3537752)
chr1 (81-228)||(34649428-34649575)
chr1 (87-231)||(45084378-45084516)
chr1 (84-228)||(24600335-24600479)
chr1 (81-228)||(37850621-37850768)
chr1 (79-185)||(41184489-41184595)
chr1 (83-228)||(66493-66638)
chr1 (83-228)||(3875352-3875497)
chr1 (94-231)||(50052042-50052178)
chr1 (78-228)||(9955894-9956046)
chr1 (81-228)||(11977270-11977417)
chr1 (99-228)||(14318875-14319004)
chr1 (82-226)||(37555721-37555864)
chr1 (91-226)||(45493997-45494137)
chr1 (83-209)||(5575098-5575222)
chr1 (84-228)||(24132009-24132150)
chr1 (84-228)||(19283476-19283620)
chr1 (91-168)||(3537228-3537305)
chr1 (83-227)||(22793270-22793415)
chr1 (80-227)||(45839616-45839767)
chr1 (101-228)||(5528775-5528902)
chr1 (84-200)||(66136-66254)
chr1 (84-199)||(22077160-22077287)
chr1 (91-228)||(32168719-32168845)
chr1 (84-185)||(44685449-44685551)
chr1 (84-227)||(30630660-30630803)
chr1 (86-207)||(22077871-22077991)
chr1 (80-168)||(21378122-21378210)
chr1 (84-223)||(1188614-1188753)
chr1 (91-211)||(44043810-44043935)
chr1 (81-138)||(35154150-35154207)
chr1 (86-209)||(1187404-1187527)
chr1 (84-150)||(50469180-50469246)
chr1 (118-217)||(4956218-4956319)
chr1 (84-157)||(4878796-4878869)
chr1 (133-209)||(10351202-10351278)
chr1 (84-226)||(24448270-24448412)
chr1 (146-206)||(35154046-35154106)
chr1 (97-156)||(4266875-4266934)
chr1 (173-212)||(11977026-11977065)
chr1 (86-159)||(30630912-30630986)
chr1 (132-225)||(9499020-9499113)
chr1 (140-185)||(41184152-41184197)
chr1 (91-143)||(47379891-47379943)
chr1 (91-123)||(50051777-50051809)
chr1 (83-227)||(50556443-50556587)
chr1 (161-228)||(50051710-50051776)
chr1 (106-167)||(44091909-44091970)
chr1 (162-199)||(47380217-47380254)
chr1 (173-209)||(12466365-12466401)
chr1 (84-160)||(35530403-35530479)
[»] chr4 (91 HSPs)
chr4 (80-228)||(25483325-25483473)
chr4 (84-228)||(36629230-36629374)
chr4 (79-228)||(1731666-1731815)
chr4 (80-228)||(34646668-34646816)
chr4 (81-228)||(10245910-10246056)
chr4 (81-228)||(39404388-39404535)
chr4 (84-228)||(39792879-39793023)
chr4 (81-228)||(50002416-50002563)
chr4 (86-228)||(3340802-3340944)
chr4 (91-225)||(50630777-50630911)
chr4 (84-228)||(52884688-52884833)
chr4 (84-228)||(54108908-54109049)
chr4 (80-228)||(4955336-4955484)
chr4 (81-225)||(22027983-22028127)
chr4 (88-228)||(54017614-54017754)
chr4 (81-228)||(22183283-22183430)
chr4 (81-228)||(36608680-36608827)
chr4 (86-228)||(39404013-39404155)
chr4 (81-226)||(36572009-36572154)
chr4 (91-228)||(41370357-41370494)
chr4 (81-209)||(52884877-52885006)
chr4 (81-228)||(22028388-22028537)
chr4 (83-209)||(41707503-41707628)
chr4 (91-216)||(55933155-55933280)
chr4 (85-225)||(44620654-44620793)
chr4 (100-231)||(44620362-44620493)
chr4 (80-228)||(54108526-54108674)
chr4 (106-220)||(45496820-45496934)
chr4 (94-228)||(50459724-50459858)
chr4 (91-228)||(49880160-49880296)
chr4 (80-228)||(4390120-4390268)
chr4 (81-228)||(16888835-16888983)
chr4 (84-228)||(32941142-32941286)
chr4 (84-226)||(3244472-3244614)
chr4 (101-228)||(54343027-54343147)
chr4 (84-228)||(20825829-20825973)
chr4 (100-228)||(44621011-44621139)
chr4 (81-209)||(54936190-54936314)
chr4 (81-231)||(3341118-3341268)
chr4 (84-209)||(2740693-2740818)
chr4 (79-228)||(49076850-49076998)
chr4 (84-209)||(54741216-54741341)
chr4 (80-231)||(16889552-16889704)
chr4 (86-228)||(34004604-34004744)
chr4 (89-228)||(49302902-49303043)
chr4 (84-200)||(2741064-2741180)
chr4 (109-225)||(18932771-18932887)
chr4 (83-222)||(3700357-3700488)
chr4 (82-231)||(51768076-51768225)
chr4 (81-185)||(49076510-49076614)
chr4 (80-199)||(54017750-54017871)
chr4 (81-225)||(43174496-43174641)
chr4 (97-228)||(20826223-20826354)
chr4 (79-228)||(19504693-19504833)
chr4 (84-209)||(28034222-28034347)
chr4 (131-231)||(43827480-43827579)
chr4 (91-214)||(6975489-6975612)
chr4 (145-228)||(23817700-23817783)
chr4 (93-231)||(40067045-40067184)
chr4 (81-228)||(45489351-45489497)
chr4 (84-180)||(10246340-10246436)
chr4 (96-223)||(760194-760320)
chr4 (89-223)||(23556890-23557024)
chr4 (142-216)||(31691203-31691279)
chr4 (81-157)||(44620286-44620362)
chr4 (85-157)||(44621420-44621492)
chr4 (112-209)||(48111736-48111833)
chr4 (80-179)||(11348396-11348495)
chr4 (133-228)||(15841387-15841482)
chr4 (137-228)||(18879852-18879943)
chr4 (83-209)||(34544096-34544225)
chr4 (81-157)||(44620934-44621011)
chr4 (83-139)||(45050593-45050649)
chr4 (91-143)||(50788087-50788139)
chr4 (113-209)||(3271806-3271904)
chr4 (79-132)||(11706636-11706689)
chr4 (97-228)||(45489733-45489864)
chr4 (83-209)||(6876138-6876261)
chr4 (158-209)||(10396483-10396534)
chr4 (158-209)||(11197293-11197344)
chr4 (158-210)||(922485-922537)
chr4 (85-209)||(15841023-15841146)
chr4 (170-230)||(50788011-50788071)
chr4 (149-207)||(11706584-11706641)
chr4 (83-151)||(12197370-12197438)
chr4 (158-209)||(10396198-10396249)
chr4 (183-226)||(43174233-43174276)
chr4 (158-209)||(53468038-53468089)
chr4 (174-223)||(12197450-12197499)
chr4 (81-110)||(23817783-23817812)
chr4 (171-231)||(41370738-41370798)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (91-228)||(3409259-3409396)
chr6 (80-228)||(2579893-2580041)
chr6 (79-228)||(2377742-2377891)
chr6 (91-228)||(29518503-29518640)
chr6 (91-228)||(29518920-29519057)
chr6 (91-228)||(32741179-32741316)
chr6 (84-228)||(10074384-10074528)
chr6 (81-228)||(2578464-2578610)
chr6 (81-228)||(16454565-16454712)
chr6 (91-228)||(2378126-2378263)
chr6 (80-228)||(16107667-16107815)
chr6 (81-228)||(16454897-16455044)
chr6 (91-231)||(3058226-3058366)
chr6 (91-228)||(14748363-14748496)
chr6 (91-228)||(1846748-1846885)
chr6 (91-228)||(35210204-35210341)
chr6 (95-227)||(3415462-3415594)
chr6 (84-228)||(10074012-10074156)
chr6 (96-231)||(2579510-2579645)
chr6 (81-228)||(6999817-6999964)
chr6 (80-228)||(2843543-2843692)
chr6 (84-228)||(10073637-10073779)
chr6 (91-228)||(26544049-26544186)
chr6 (84-227)||(2578857-2578999)
chr6 (91-228)||(3409660-3409797)
chr6 (91-231)||(1127360-1127500)
chr6 (81-228)||(5832048-5832194)
chr6 (79-209)||(593749-593879)
chr6 (81-228)||(1950206-1950353)
chr6 (84-210)||(10911558-10911685)
chr6 (81-228)||(2579130-2579273)
chr6 (83-223)||(6071124-6071264)
chr6 (96-199)||(32460630-32460733)
chr6 (81-231)||(16108053-16108191)
chr6 (80-216)||(9062383-9062518)
chr6 (79-211)||(5958641-5958773)
chr6 (83-210)||(8481919-8482045)
chr6 (84-223)||(12092508-12092647)
chr6 (84-228)||(12085055-12085198)
chr6 (89-228)||(12071712-12071851)
chr6 (95-226)||(17135092-17135223)
chr6 (106-207)||(2975567-2975668)
chr6 (111-164)||(35210498-35210551)
chr6 (159-210)||(11637760-11637811)
chr6 (89-200)||(31714669-31714778)
chr6 (128-168)||(14789285-14789325)
chr6 (159-203)||(21130103-21130147)
chr6 (83-118)||(7588355-7588390)
chr6 (83-150)||(33605646-33605713)
chr6 (98-223)||(30618643-30618766)
chr6 (159-203)||(22605301-22605345)
chr6 (87-150)||(33605971-33606034)
chr6 (183-227)||(10902452-10902496)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (81-228)||(34834866-34835013)
chr8 (91-228)||(3669687-3669824)
chr8 (80-228)||(3038311-3038459)
chr8 (81-228)||(33113388-33113535)
chr8 (81-228)||(34835199-34835346)
chr8 (86-228)||(45122078-45122220)
chr8 (81-209)||(9309345-9309473)
chr8 (81-228)||(147441-147588)
chr8 (91-228)||(3670060-3670197)
chr8 (80-228)||(25561836-25561985)
chr8 (80-217)||(30359260-30359397)
chr8 (81-228)||(6876883-6877031)
chr8 (91-231)||(20870591-20870733)
chr8 (79-231)||(70292-70443)
chr8 (81-228)||(9482625-9482770)
chr8 (91-228)||(30441081-30441222)
chr8 (81-230)||(30359599-30359748)
chr8 (84-228)||(9608738-9608882)
chr8 (81-228)||(34835464-34835612)
chr8 (81-228)||(34835730-34835878)
chr8 (83-228)||(40518061-40518208)
chr8 (81-231)||(8918782-8918932)
chr8 (86-228)||(40518577-40518719)
chr8 (91-228)||(1014266-1014403)
chr8 (89-222)||(45121937-45122070)
chr8 (105-226)||(45122638-45122759)
chr8 (84-226)||(41972151-41972296)
chr8 (82-228)||(5915863-5916004)
chr8 (116-228)||(9483208-9483320)
chr8 (81-228)||(37544511-37544658)
chr8 (86-228)||(1513936-1514078)
chr8 (101-228)||(18372015-18372142)
chr8 (93-228)||(40579527-40579662)
chr8 (91-228)||(1013892-1014029)
chr8 (84-223)||(4154694-4154831)
chr8 (91-231)||(6731904-6732035)
chr8 (81-229)||(45122996-45123144)
chr8 (83-226)||(5420643-5420786)
chr8 (81-228)||(45121677-45121823)
chr8 (82-228)||(32640553-32640694)
chr8 (84-209)||(9308970-9309100)
chr8 (81-209)||(8794101-8794229)
chr8 (80-204)||(43274824-43274948)
chr8 (81-228)||(147819-147957)
chr8 (85-228)||(12283867-12284009)
chr8 (98-231)||(6651510-6651634)
chr8 (83-207)||(9507769-9507898)
chr8 (84-223)||(9620704-9620841)
chr8 (114-228)||(9609108-9609222)
chr8 (81-195)||(18372988-18373098)
chr8 (95-207)||(18380059-18380171)
chr8 (83-209)||(4154321-4154446)
chr8 (89-163)||(18372785-18372859)
chr8 (117-231)||(32305503-32305617)
chr8 (98-168)||(41416252-41416322)
chr8 (95-231)||(43398086-43398225)
chr8 (101-164)||(25561729-25561792)
chr8 (98-209)||(18371701-18371807)
chr8 (89-163)||(18372342-18372416)
chr8 (86-223)||(5274770-5274907)
chr8 (93-199)||(18372656-18372758)
chr8 (173-228)||(8919165-8919220)
chr8 (94-181)||(3037776-3037865)
chr8 (96-196)||(20130454-20130553)
chr8 (170-228)||(40579290-40579348)
chr8 (84-189)||(33831971-33832076)
chr8 (170-231)||(41129067-41129128)
chr8 (84-148)||(20995502-20995566)
chr8 (89-135)||(18372485-18372531)
chr8 (170-223)||(20995442-20995495)
chr8 (172-228)||(16524446-16524502)
chr8 (128-183)||(18373236-18373291)
chr8 (84-123)||(18645713-18645752)
chr8 (145-219)||(40417746-40417820)
chr8 (94-188)||(40991756-40991850)
chr8 (96-188)||(11442859-11442950)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (79-228)||(535-684)
scaffold0702 (91-228)||(168-300)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (83-211)||(5349-5477)
scaffold0078 (80-228)||(4971-5119)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (81-228)||(1127-1274)
scaffold0391 (81-142)||(3092-3153)
scaffold0391 (138-209)||(1731-1802)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (79-226)||(5384-5532)
scaffold0734 (81-226)||(5767-5917)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (80-231)||(47349-47500)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (81-207)||(17496-17624)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (81-168)||(10192-10279)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (86-223)||(39452-39588)
scaffold0113 (83-216)||(39830-39963)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 15772768 - 15772994
Alignment:
Q  3 attgatggatcaaaatgtaggtatactaannnnnnnnnggtacaaaagatatactattttctttcttaatctgagcattgttgttgtgtgcaagtgtgag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15772768 attgatggatcaaaatgtaggtatactaattttttt--ggtacaaaaaatatactattttctttcttaatctgagtattgttgtcgtgtgcaagtgtgag 15772865  T
Q  103 ttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtg 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15772866 ttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggataagagtgtggtg 15772965  T
Q  203 tctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15772966 tctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 15772994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43346959 - 43346812
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43346959 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaa 43346860  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43346859 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 43346812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37990807 - 37990660
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37990807 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaa 37990708  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37990707 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttcta 37990660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37991145 - 37990998
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37991145 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaa 37991046  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37991045 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttcta 37990998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29645072 - 29644926
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29645072 attgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtctt 29644973  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  29644972 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgtt 29644926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12114731 - 12114578
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12114731 ttgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtctta 12114632  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccac 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  12114631 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccac 12114578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 22304569 - 22304706
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22304569 tgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggt 22304668  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22304669 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 22304706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54017982 - 54017837
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||||||    
T  54017982 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaagg 54017883  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54017882 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcta 54017837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42342556 - 42342409
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  42342556 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaa 42342457  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42342456 ggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 42342409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Original strand, 35946510 - 35946648
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35946510 attgctgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgcctt 35946609  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 217  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35946610 aaggttttgggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtg 35946648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Original strand, 15773182 - 15773334
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15773182 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaa 15773281  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15773282 agttttgggtaagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacc 15773334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29644749 - 29644605
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  29644749 tgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaa 29644650  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  29644649 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgtt 29644605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 32589693 - 32589840
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32589693 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 32589791  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589792 aggttttgggtaagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 32589840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54018366 - 54018219
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  54018366 tgttgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaa 54018267  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54018266 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttcta 54018219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32463069 - 32462921
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  32463069 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgcctta 32462970  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32462969 aggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 32462921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 52634665 - 52634812
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52634665 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaaga-gacccataaacccattgcctta 52634763  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  52634764 aggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttcta 52634812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42342258 - 42342111
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42342258 tgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaa 42342159  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42342158 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 42342111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33803417 - 33803273
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33803417 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggt 33803318  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     |||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  33803317 attgggtaagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttcta 33803273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39935104 - 39934976
Alignment:
Q  100 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtg 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  39935104 gagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaagttttgagtaagagtgtg 39935005  T
Q  200 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935004 atgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 39934976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25739593 - 25739446
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25739593 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgctttta 25739494  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  25739493 ggttttgggtaagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttcta 25739446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 31190007 - 31190146
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||    
T  31190007 tgttgttgtgtgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaa 31190098  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31190099 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttcta 31190146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41359929 - 41359786
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41359929 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 41359834  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41359833 ggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttcta 41359786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21832508 - 21832366
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21832508 tgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggt 21832409  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21832408 tttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttcta 21832366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22304116 - 22303976
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22304116 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcggacccataaacccattgccttaa 22304024  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22304023 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttcta 22303976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 53577353 - 53577501
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  53577353 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgcctta 53577452  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  53577453 aggtcttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttcta 53577501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 230
Target Start/End: Original strand, 45901703 - 45901853
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45901703 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggcctta 45901802  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaac 230  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  45901803 aagtttttggtaagagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaac 45901853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 8327897 - 8328022
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  8327897 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggt 8327996  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8327997 tttgggtaagagtgtggtgtctctct 8328022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 39914241 - 39914389
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||    
T  39914241 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgcctta 39914340  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  39914341 atattttggataagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttcta 39914389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 217
Target Start/End: Original strand, 39389070 - 39389196
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  39389070 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 39389169  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 217  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39389170 aagagtgtggtgtctcttttgcctgtg 39389196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32462727 - 32462590
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| |||    
T  32462727 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgcttta 32462628  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32462627 aggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtg 32462590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45395819 - 45395674
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  45395819 ttgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatg 45395720  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  45395719 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctcta 45395674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3135629 - 3135475
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaactcatt 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||| ||||    
T  3135629 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccatt 3135530  T
Q  174 gccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3135529 gccttaaggttttagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttcta 3135475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 25755384 - 25755531
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||    
T  25755384 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaa 25755483  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755484 agttgtgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 25755531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3135224 - 3135099
Alignment:
Q  98 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||    
T  3135224 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtg 3135125  T
Q  198 tggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  3135124 tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 4823655 - 4823792
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4823655 tgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggt 4823754  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||| | |||||| || || |||||||    
T  4823755 aagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttcta 4823792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 49336857 - 49336726
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  49336857 attgttgttgtgtacaagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtctt 49336758  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctctt 210  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  49336757 aaagttctgggtaagagtgtggtgtctctctt 49336726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53118142 - 53117996
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||    
T  53118142 tgttgttgtgggcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaa 53118044  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  53118043 gattttgggtaagagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttcta 53117996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50612610 - 50612470
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||||||||||    
T  50612610 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatcttaaggttt 50612511  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50612510 tgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttc 50612470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1634484 - 1634354
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1634484 ttgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggctt 1634385  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  1634384 aaggttttgggtaagagtgcggtatctctct 1634354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 9240142 - 9240267
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |    
T  9240142 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagat 9240241  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    || |||||||| ||||||||||||||    
T  9240242 ttcggataagaatgtggtgtctctct 9240267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Original strand, 51886561 - 51886693
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  51886561 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------gttttggat 51886654  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaa 229  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  51886655 aagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaa 51886693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 11661941 - 11662088
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  11661941 tgttgttgtatgtaagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaa 11662040  T
Q  181 gg-ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  11662041 ggtttttgggtaagagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttcta 11662088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33175829 - 33175711
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||    
T  33175829 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaa 33175730  T
Q  181 ggttttggataagagtgtg 199  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  33175729 ggttttgggtaagagtgtg 33175711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47964683 - 47964544
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47964683 tgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggt 47964584  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964583 tttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39336392 - 39336257
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39336392 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttt 39336293  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||    
T  39336292 tggataatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttg 39336257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584864
Alignment:
Q  101 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||   ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  201 tgtctct 207  Q
    |||||||    
T  42584870 tgtctct 42584864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44160710 - 44160579
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  44160710 ttgttgtatgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaagg 44160611  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttg 215  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  44160610 ttttgg-taagaatgtggcgtctctcttacttg 44160579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3384427 - 3384317
Alignment:
Q  88 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttg 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  3384427 gtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgccttaaagttttg 3384328  T
Q  188 gataagagtgt 198  Q
    | |||||||||    
T  3384327 ggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Original strand, 43346640 - 43346706
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacctta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43346640 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7767476 - 7767380
Alignment:
Q  87 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  7767476 tgtgtgtaagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 37726504 - 37726633
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |        ||||||||| |||||||||||    
T  37726504 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagaggatc--------cattgcctttaggttttggat 37726595  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||  || | |||| ||||| | |||||||||    
T  37726596 aagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttcta 37726633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303680
Alignment:
Q  149 aagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttcta 22303680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33362460 - 33362327
Alignment:
Q  85 gttgtgtgcaagtgtgagttatatg---tcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||||  ||||||||||||||||   || ||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33362460 gttgtgtataagtgtgagttatatgatatctcatgtcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaag 33362361  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttg 215  Q
     |||||| |||| |||  || |||||||||||||    
T  33362360 attttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Original strand, 11661525 - 11661602
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 158  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  11661525 tgttggtgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg 11661602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 146
Target Start/End: Original strand, 22304246 - 22304301
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacctt 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22304246 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 46546490 - 46546375
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  46546490 tgttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggt 46546391  T
Q  184 tttggataagagtgtg 199  Q
    ||||  ||||||||||    
T  46546390 tttgtgtaagagtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  133 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 219  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47965080 - 47964955
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||| |    
T  47965080 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagat 47964981  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47964980 tttgggtaagagtgtggcgtctctct 47964955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  141 caccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749306
Alignment:
Q  133 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttcta 12749306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  94 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataag 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  194 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12747918 - 12747878
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747918 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33809174 - 33809066
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || | |  |  |||||||| |||| |||||||  ||  |||||||| ||| |||||||    
T  33809174 ttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaattgcatattgaacactttatgagtaagaaaactaataaactcgttgtcttaagg 33809075  T
Q  183 ttttggata 191  Q
    |||||||||    
T  33809074 ttttggata 33809066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017572
Alignment:
Q  161 ccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgtt 54017572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41359565 - 41359512
Alignment:
Q  175 ccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41359565 ccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttcta 41359512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 209
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  93 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataa 192  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||  | |||||||||||||||| | |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  193 gagtgtggtgtctctct 209  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtct 205  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16868471 - 16868433
Alignment:
Q  161 ccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtg 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16868471 ccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtg 16868433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  146 tataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  146 tataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  159 acccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  159 acccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  159 acccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 209
Target Start/End: Original strand, 11661603 - 11661638
Alignment:
Q  174 gccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11661603 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 209
Target Start/End: Original strand, 25413125 - 25413163
Alignment:
Q  171 attgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25413125 attgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctct 25413163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  162 cataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 115
Target Start/End: Original strand, 2299968 - 2300000
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2299968 ttgttgtgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36492387 - 36492238
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  36492387 attgttgttgtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctt 36492288  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492287 taggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 36492238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40296483 - 40296336
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  40296483 tgttggtgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttga 40296384  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40296383 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 40296336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13415925 - 13415781
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  13415925 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggt 13415826  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13415825 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 13415781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Original strand, 26074602 - 26074752
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26074602 tgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 26074701  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  26074702 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacc 26074752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Original strand, 15370087 - 15370236
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||    
T  15370087 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagcctt 15370186  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15370187 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttcta 15370236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 299479 - 299626
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  299479 tgttgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaa 299578  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  299579 ggttttgtgtaagagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttcta 299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 6224186 - 6224333
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6224186 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaa 6224285  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||    
T  6224286 ggtttttggtaagagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtcta 6224333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18603276 - 18603141
Alignment:
Q  93 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18603276 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 18603177  T
Q  193 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18603176 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttcta 18603141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 41170640 - 41170771
Alignment:
Q  97 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41170640 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 41170739  T
Q  197 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41170740 gtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttcta 41170771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3295509 - 3295366
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3295509 ttgttgtgtggaagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaagg 3295411  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295410 ttttgg-taagagtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 3295366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 6500451 - 6500587
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6500451 tgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaaggttttgggt 6500549  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6500550 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 6500587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 6500823 - 6500959
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500823 tgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 6500921  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  6500922 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattcta 6500959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26075333 - 26075185
Alignment:
Q  78 cattgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcct 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26075333 cattgttgttgtgtacaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcct 26075234  T
Q  178 taaggttttggat-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  26075233 taaggttttgggtaaagagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgtt 26075185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 25327925 - 25328072
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  25327925 tgttgttgtgtctaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaa 25328024  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25328025 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttcta 25328072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26074311 - 26074164
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26074311 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggt 26074212  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  26074211 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacc 26074164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3295176 - 3295039
Alignment:
Q  87 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttt 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3295176 tgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggtttt 3295078  T
Q  187 ggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3295077 gggtatgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgtt 3295039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27502194 - 27502057
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |    
T  27502194 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaagatttttggt 27502095  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502094 aaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 27502057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 32487394 - 32487530
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32487394 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32487492  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||    
T  32487493 aagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttcta 32487530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 35150002 - 35150146
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  35150002 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttt 35150100  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  35150101 tgggtaaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacc 35150146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 41632775 - 41632916
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |    
T  41632775 tgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagat 41632874  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41632875 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgtt 41632916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11417143 - 11416998
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11417143 tgttgttgtgtgcaagtg--agttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaa 11417046  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  11417045 ggttttgtgtaagagtgtgatctctctcttgcttgtgggattgttcta 11416998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34753193 - 34753046
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  34753193 tgttgttgtgtacaaatgtaagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaa 34753094  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34753093 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 34753046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36568732 - 36568590
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36568732 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggt 36568633  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36568632 ttttggtaagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttcta 36568590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12662821 - 12662673
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||    
T  12662821 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtctta 12662722  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  12662721 agtttttgggtaagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttcta 12662673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42405764 - 42405619
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | ||||||||    
T  42405764 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaa 42405665  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  42405664 ggttttgggtaagagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttcta 42405619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26074950 - 26074807
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||    
T  26074950 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaa 26074851  T
Q  181 ggttttggat-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074850 ggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29549413 - 29549278
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29549413 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttggat 29549314  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549313 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 624196 - 624333
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  624196 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggt 624295  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  624296 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttcta 624333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747908
Alignment:
Q  103 ttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  203 tctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttcta 33747908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9498812 - 9498692
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  9498812 tgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttgggt 9498713  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9498712 aagagtgtggtgtctctcttg 9498692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1028682 - 1028538
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  1028682 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggt 1028583  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  1028582 ttttggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttcta 1028538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 623818 - 623955
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||  |    
T  623818 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaaggttttgagt 623917  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  623918 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttcta 623955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5723949 - 5723812
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| || | |||| |||||||||||||      
T  5723949 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaaggttttggga 5723850  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5723849 aagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 5723812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24489369 - 24489227
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| |    
T  24489369 tgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagat 24489272  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||    
T  24489271 tttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttcta 24489227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590928
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacc 26590928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370539
Alignment:
Q  117 tcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgt 216  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  217 gtggttgttcta 228  Q
    | ||||||||||    
T  15370528 ggggttgttcta 15370539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 300948 - 301086
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        ||  ||||||||||    
T  300948 ttgtttttgtgtacaagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgcctta 301039  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  301040 agatttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttc 301086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35168008 - 35167859
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||    
T  35168008 attgttgttgtgtacaagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgcctt 35167909  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     | ||||| | |||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||    
T  35167908 gatgtttttggtaagagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttcta 35167859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Original strand, 35914839 - 35914972
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||    
T  35914839 tgttgttgtgtataagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaa 35914938  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgctt 214  Q
      | |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35914939 attattggataagaatgtggtatctctcttgctt 35914972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Original strand, 38427553 - 38427687
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagag 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  38427553 gtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagt-agaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagag 38427651  T
Q  196 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  38427652 tgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacc 38427687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 31509615 - 31509718
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31509615 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgagg 31509714  T
Q  183 tttt 186  Q
    ||||    
T  31509715 tttt 31509718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 42508604 - 42508707
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42508604 ttgttgtgtacaagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaagg 42508703  T
Q  183 tttt 186  Q
    ||||    
T  42508704 tttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411147
Alignment:
Q  94 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataag 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  194 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacc 2411147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36522061 - 36521922
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36522061 tgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggt 36521962  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36521961 tttgggtaagagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41635360 - 41635212
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||    
T  41635360 ttgttgttgtgtataagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtctta 41635261  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |  |||| | ||||||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635260 aaattttaggtaagagtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 168
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074395
Alignment:
Q  93 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaac 26074395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 166
Target Start/End: Original strand, 7768852 - 7768925
Alignment:
Q  93 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 166  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768852 caagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36522402 - 36522277
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  36522402 tgttgtatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggt 36522303  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36522302 tttgggtaagagtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Original strand, 39309677 - 39309754
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 161  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39309677 tgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagaggacc 39309754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  105 atatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg-ttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  204 ctctcttgcttgt 216  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Original strand, 35150737 - 35150789
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35150737 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Original strand, 35151028 - 35151080
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35151028 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  148 taagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13786166 - 13786041
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||     
T  13786166 tgttgtgcacaagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaaga 13786068  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13786067 ttttggataagagtgtgatgtctctct 13786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 19275524 - 19275653
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||     
T  19275524 ttgttgtgtgcaagtgtga---atatgtcttaaatcagatagaaaagtagaggttgaaca-cttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaaga 19275619  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgt 216  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275620 ttttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 151
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  94 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataag 151  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  175 ccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtct 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900038
Alignment:
Q  177 ttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttcta 26900038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26900139 - 26900082
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtt 137  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26900139 ttgttgttgtgtacaaatttgagttatatgtcccacatcagataaaagagttaaggtt 26900082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 203
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  162 cataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 231
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427359
Alignment:
Q  178 taaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacc 38427359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 186
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  93 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttt 186  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498344
Alignment:
Q  162 cataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcta 9498344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13785774 - 13785732
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785774 tgttgtgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 203
Target Start/End: Original strand, 41340350 - 41340391
Alignment:
Q  162 cataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41340350 catacactcattgccttaagattttggataagagtgtggtgt 41340391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 209
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  149 aagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 36527249 - 36527209
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36527249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagata 36527209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 209
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  171 attgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 209
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  171 attgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489621
Alignment:
Q  193 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacc 24489621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 795188 - 795152
Alignment:
Q  190 taagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795188 taagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  159 acccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 209
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435545
Alignment:
Q  149 aagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctct 42435545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 7517570 - 7517717
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7517570 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 7517669  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7517670 ggttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttcta 7517717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1085784 - 1085637
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1085784 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 1085685  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1085684 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttcta 1085637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22567206 - 22567062
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22567206 tgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 22567108  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22567107 ggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttc 22567062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Original strand, 30244260 - 30244405
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30244260 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaa 30244359  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30244360 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttc 30244405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 220
Target Start/End: Original strand, 7554015 - 7554154
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  7554015 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaa 7554114  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7554115 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 81 - 211
Target Start/End: Original strand, 30245067 - 30245197
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30245067 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaa 30245166  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttg 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30245167 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 30245197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37533168 - 37533029
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37533168 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 37533069  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37533068 aa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacc 37533029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40094943 - 40094795
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  40094943 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtctta 40094844  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40094843 aggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttcta 40094795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23545 - 23398
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23545 tgttgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaa 23446  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23445 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttcta 23398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 24177425 - 24177568
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24177425 tgttgttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaa 24177524  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 224  Q
     ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24177525 agtttttggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgt 24177568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 45433231 - 45433378
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||    
T  45433231 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaa 45433330  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45433331 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcta 45433378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 45434626 - 45434773
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45434626 tgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaa 45434725  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  45434726 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttcta 45434773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 45754704 - 45754850
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  45754704 attgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagcctt 45754802  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45754803 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 45754850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 228
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845328
Alignment:
Q  98 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtg 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  198 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttcta 11845328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22566830 - 22566702
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22566830 tgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 22566731  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctctt 210  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22566730 ggttttgggtaagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 29157565 - 29157702
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  29157565 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggttttgggt 29157664  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  29157665 aagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctcta 29157702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054697
Alignment:
Q  93 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataa 192  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  193 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttcta 6054697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34218203 - 34218057
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34218203 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtctta 34218104  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34218103 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtatggttgttc 34218057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36939900 - 36939754
Alignment:
Q  82 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36939900 gttgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaag 36939801  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  36939800 gttttgggtaaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttcta 36939754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122868
Alignment:
Q  99 tgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgt 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  199 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttcta 19122868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8128606 - 8128462
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  8128606 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggt 8128507  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  8128506 tttggttaagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttcta 8128462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 118469 - 118320
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  118469 tgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaa 118370  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  118369 ggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttcta 118320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 211
Target Start/End: Original strand, 16569186 - 16569316
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16569186 tgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 16569285  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttg 211  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  16569286 ggtttttggtaagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16596476 - 16596346
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16596476 tgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 16596377  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttg 211  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  16596376 ggtttttggtaagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24838874 - 24838724
Alignment:
Q  77 gcattgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaag-aggacccataaactcattgc 175  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||     
T  24838874 gcattgttgttgtgtataagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgt 24838775  T
Q  176 cttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838774 cttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37533519 - 37533385
Alignment:
Q  94 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataag 193  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  37533519 aagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggtaag 37533420  T
Q  194 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37533419 agtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttcta 37533385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1085417 - 1085280
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1085417 tgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgcctta 1085318  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085317 aggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 9901635 - 9901780
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  9901635 tgttattgtgtataagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaa 9901732  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9901733 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttcta 9901780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 47129085 - 47129232
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  47129085 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaa 47129184  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  47129185 ggttttgggtaggagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttcta 47129232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 227
Target Start/End: Original strand, 36622950 - 36623096
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  36622950 tgttattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaa 36623049  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    |||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  36623050 ggttttgggtaggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttct 36623096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 208
Target Start/End: Original strand, 14681510 - 14681627
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  14681510 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggt 14681609  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctc 208  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14681610 aagagtgtggtgtctctc 14681627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40230454 - 40230309
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  40230454 ttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttt 40230355  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  40230354 tgggtaaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacc 40230309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Original strand, 43241484 - 43241616
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  43241484 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgactta 43241583  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgc 212  Q
    ||||||| | ||| ||| || ||||||||||||    
T  43241584 aggttttaggtaaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 30032557 - 30032704
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||    
T  30032557 tgttgttgcgtacatgtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaa 30032656  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30032657 ggttttgggtaagagtgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttcta 30032704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 20599303 - 20599456
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  20599303 ttgttgttgtctataagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgcctta 20599402  T
Q  180 aggttttggata--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20599403 acgttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaacc 20599456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36534953 - 36534825
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||    
T  36534953 ttgttgttgtgtgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtctta 36534854  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctc 208  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36534853 aggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 36534825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41910762 - 41910657
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41910762 tgttgttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaa 41910663  T
Q  181 ggtttt 186  Q
    | ||||    
T  41910662 gatttt 41910657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 164
Target Start/End: Original strand, 30245484 - 30245567
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245484 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 164
Target Start/End: Original strand, 30255329 - 30255412
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30255329 tgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 41854625 - 41854771
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||    
T  41854625 tgtttttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaa 41854723  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||    
T  41854724 ggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttcta 41854771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 161
Target Start/End: Original strand, 30244691 - 30244771
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244691 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28301708 - 28301613
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28301708 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36109084 - 36109007
Alignment:
Q  82 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109084 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 211
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253612
Alignment:
Q  133 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttg 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 30253612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4124254 - 4124128
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4124254 ttgttgtgtgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaagg 4124155  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4124154 ttttggataaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300276
Alignment:
Q  137 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttc 28300276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 37167840 - 37167918
Alignment:
Q  150 agtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37167840 agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 37167918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40094559 - 40094502
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40094559 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagag 195  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||  ||||| |||||| | ||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129506
Alignment:
Q  172 ttgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatcta 47129506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36967397 - 36967335
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacac 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967397 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300589
Alignment:
Q  174 gccttaaggttttgga-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattcta 28300589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 227
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902436
Alignment:
Q  133 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct 15902436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  160 cccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctc 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 37345909 - 37346036
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||     
T  37345909 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaa 37346008  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  37346009 gttttgagtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532772
Alignment:
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttcta 37532772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094434
Alignment:
Q  159 acccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttcta 40094434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 126
Target Start/End: Original strand, 14681287 - 14681322
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14681287 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaa 14681322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 152
Target Start/End: Original strand, 10341829 - 10341893
Alignment:
Q  88 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagt 152  Q
    |||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||    
T  10341829 gtgtgcaaatataagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagt 10341893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755062
Alignment:
Q  174 gccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttc 45755062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 74)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36178763 - 36178626
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  36178763 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 36178664  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178663 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 36178626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 6421375 - 6421522
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  6421375 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttga 6421474  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6421475 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 6421522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 225
Target Start/End: Original strand, 15880253 - 15880397
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15880253 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 15880352  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15880353 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtt 15880397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41283633 - 41283496
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  41283633 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttaggt 41283534  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41283533 aagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttcta 41283496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14745825 - 14745688
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14745825 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 14745726  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  14745725 aagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcta 14745688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36006049 - 36005901
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36006049 attgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 36005951  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36005950 aaggttttgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttcta 36005901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 37105924 - 37106061
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37105924 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagattttgggt 37106023  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37106024 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttcta 37106061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 37106188 - 37106325
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37106188 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaaggttttgggt 37106287  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  37106288 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttcta 37106325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 962591 - 962735
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  962591 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggt 962690  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  962691 tttgggtaagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttcta 962735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15511661 - 15511516
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15511661 tgttgttgtgtgcaagtg--agttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaa 15511564  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15511563 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 15511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28254405 - 28254260
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28254405 tgttgttgtgtgccagtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 28254306  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  28254305 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttcta 28254260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5542783 - 5542648
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  5542783 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggt 5542684  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5542683 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 5542648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38796789 - 38796641
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  38796789 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgcctta 38796690  T
Q  180 aggttttggataagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38796689 aggttttgggtaagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttc 38796641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Original strand, 1769889 - 1770029
Alignment:
Q  88 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | | ||||    
T  1769889 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaagctttg 1769988  T
Q  188 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1769989 aataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttcta 1770029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5543156 - 5543021
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  5543156 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaagattttgggt 5543057  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5543056 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttc 5543021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28531479 - 28531354
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  28531479 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagat 28531380  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28531379 tttgggtaagagtgtggtgactctct 28531354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Original strand, 33731634 - 33731785
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgt--gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcc 176  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  33731634 attgttgttgtgttcaagtgtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgcc 33731733  T
Q  177 ttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33731734 ttaaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgcttatgcggttgttcta 33731785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 42514642 - 42514786
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  42514642 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagat 42514741  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42514742 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttcta 42514786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35580886 - 35580745
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35580886 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagagga-ccataaacccattgccttaaggttt 35580788  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| |||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35580787 tgggtaagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttcta 35580745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40679794 - 40679650
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  40679794 tgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagat 40679695  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40679694 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttcta 40679650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 228
Target Start/End: Original strand, 6422126 - 6422247
Alignment:
Q  107 atgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctc 206  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6422126 atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctc 6422225  T
Q  207 tcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6422226 tcttgcttgtgtggttgttcta 6422247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12529195 - 12529046
Alignment:
Q  82 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  12529195 gttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaa 12529096  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12529095 gttttagataagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacc 12529046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Original strand, 40733507 - 40733652
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||    
T  40733507 tgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaa 40733606  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40733607 agttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttc 40733652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 6712966 - 6713114
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  6712966 tgttgttgtatacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaa 6713065  T
Q  181 gg-ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  6713066 ggtttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttcta 6713114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178195
Alignment:
Q  109 gtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctc 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  209 ttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgtt 36178195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Original strand, 5367443 - 5367592
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||    
T  5367443 attgatgttgtgtacaagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataacctt 5367542  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  5367543 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttcta 5367592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 198
Target Start/End: Original strand, 16542439 - 16542556
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16542439 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaa 16542538  T
Q  181 ggttttggataagagtgt 198  Q
    | |||||  |||||||||    
T  16542539 gattttgagtaagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31468914 - 31468800
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468914 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaactcattgccttaa 31468819  T
Q  181 ggttttggataagagtgtg 199  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  31468818 ggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Original strand, 29676893 - 29677048
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag-----gacccataaactcattgc 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||     ||||||||||| ||||||    
T  29676893 tgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgc 29676992  T
Q  176 cttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||||| |||   |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  29676993 cttaaggctttaagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacc 29677048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31899594 - 31899496
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899594 tgttgttgtgtgaaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163390
Alignment:
Q  102 gttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattg-ccttaaggttttggataagagtgtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | || | |||||||||||| ||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  201 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 40163390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 226
Target Start/End: Original strand, 7598606 - 7598736
Alignment:
Q  88 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||     
T  7598606 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaacgttttt 7598697  T
Q  188 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7598698 ggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttc 7598736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Original strand, 40733873 - 40734017
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |  |||||||    
T  40733873 tgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataacct-acagccttaa 40733971  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40733972 agttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttc 40734017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14745452 - 14745332
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14745452 tgcaactgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 14745353  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  14745352 aagagtgtggcgtctctcttg 14745332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37632762 - 37632618
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||    
T  37632762 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggt 37632663  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||    
T  37632662 tttgggtaagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttcta 37632618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 226
Target Start/End: Original strand, 7598225 - 7598363
Alignment:
Q  88 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttg 187  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7598225 gtgtgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttg 7598324  T
Q  188 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    | ||||| | ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  7598325 ggtaagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttc 7598363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 30313170 - 30313309
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  30313170 ttgttgtgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaaga 30313268  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30313269 ttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 30313309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 23346228 - 23346373
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  23346228 tgttgtgtgcgagtgtgagttatatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaag 23346326  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23346327 gttttcggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 23346373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36178427 - 36178320
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  36178427 tgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaaggttttgggt 36178328  T
Q  191 aagagtgt 198  Q
    ||||||||    
T  36178327 aagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 38796386 - 38796299
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38796386 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaac 38796299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31259789 - 31259658
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgc 175  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |    
T  31259789 attgttgttgtgtgtaagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcac 31259690  T
Q  176 cttaaggttttggataagagtgtggtgtctct 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31259689 cttaaggttttgggtaagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33561616 - 33561491
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33561616 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggt 33561517  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||    
T  33561516 tttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676669
Alignment:
Q  99 tgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgt 198  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||      |||||| |||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcc------ttttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  199 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacc 29676669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 208
Target Start/End: Original strand, 30323456 - 30323581
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30323456 ttgttgtgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaagg 30323555  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctc 208  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  30323556 ttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37895227 - 37895107
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  37895227 ttgttgtgtgcgagtttgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaagg 37895128  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  37895127 ttttgggtaagagtgtggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29874185 - 29874067
Alignment:
Q  87 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttt 186  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29874185 tgtgtacaagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggtttt 29874086  T
Q  187 ggataagagtgtggtgtct 205  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  29874085 ggataagagtgtggcgtct 29874067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29873703 - 29873563
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29873703 ttgttgtgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggaggactcataaactcattgccttaagg 29873604  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    |||||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  29873603 ttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttg 29873563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36785731 - 36785664
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36785731 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 16590881 - 16591020
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16590881 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaagg 16590974  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||   ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16590975 ttttaagtaagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttcta 16591020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37894855 - 37894732
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| |||    
T  37894855 ttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagattt 37894756  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894755 tggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673205
Alignment:
Q  145 ttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  3673122 ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttcta 3673205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 227
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421867
Alignment:
Q  153 aagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttct 6421867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784287
Alignment:
Q  144 cttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggtt 36784287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 9231242 - 9231389
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||| ||  ||||||| ||    
T  9231242 tgttgtgtgtaagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagt 9231341  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||  ||| || |||| ||||||||    
T  9231342 tttggttaagagtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaacc 9231389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33953936 - 33953821
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||   |||||||||  |    
T  33953936 tgttgtgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaat 33953837  T
Q  184 tttggataagagtgtg 199  Q
    ||||| ||||||||||    
T  33953836 tttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 139
Target Start/End: Original strand, 6421294 - 6421352
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 139  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421294 tgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Original strand, 12910221 - 12910335
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  ||||| |||||| ||||||||    
T  12910221 tgttgtgtgtaagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggt 12910320  T
Q  184 tttggataagagtgt 198  Q
    ||||| |||||||||    
T  12910321 tttgggtaagagtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  107 atgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagt 196  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| || |||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 31385728 - 31385868
Alignment:
Q  83 ttgttgtgt-gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31385728 ttgttgtgtagcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaag 31385827  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 222  Q
    |||||||  |  |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385828 gttttgggaataagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672838
Alignment:
Q  163 ataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttcta 3672838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421761
Alignment:
Q  153 aagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttc 6421761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41678534 - 41678419
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41678534 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaac-ctttgccttaag 41678436  T
Q  182 gttttggataagagtgt 198  Q
    ||||||  |||||||||    
T  41678435 gttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 3673075 - 3673120
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3673075 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaa 3673120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 153
Target Start/End: Original strand, 42515005 - 42515078
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatg----tcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagta 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42515005 tgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 126
Target Start/End: Original strand, 3672707 - 3672754
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3672707 attgttgttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaa 3672754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33954426 - 33954284
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| ||  ||||||| | |    
T  33954426 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaa-tctatgccttacgat 33954328  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||    
T  33954327 tttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttct 33954284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3594341 - 3594196
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| |||    
T  3594341 ttgtgtgaaagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattt 3594242  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||  |||||||||| | |||||| | || ||||| || ||||||||    
T  3594241 tgagtaagagtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacc 3594196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580478
Alignment:
Q  155 gaggacccataaactcattgccttaaggttttggata--agagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctct 35580478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  133 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 188
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336721
Alignment:
Q  133 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgg 188  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgg 2336721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43443148 - 43443108
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43443148 ttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagata 43443108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899120
Alignment:
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacc 31899120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 108
Target Start/End: Original strand, 43779809 - 43779838
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43779809 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatat 43779838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26661690 - 26661545
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26661690 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaa 26661591  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26661590 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttc 26661545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Original strand, 41156979 - 41157128
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41156979 attgttgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcttt 41157078  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41157079 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttcta 41157128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Original strand, 41157367 - 41157512
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  41157367 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttagg 41157466  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41157467 ttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttcta 41157512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 29798188 - 29798339
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29798188 ttgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgcctta 29798287  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29798288 aggtcttggataagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacc 29798339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 41142362 - 41142510
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41142362 tgttgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaa 41142461  T
Q  181 gg-ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41142462 ggtttttggtaaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 41142510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 17294569 - 17294700
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17294569 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 17294668  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgctt 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17294669 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgctt 17294700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44290983 - 44290845
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44290983 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 44290884  T
Q  191 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44290883 aaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttcta 44290845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26662066 - 26661921
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  26662066 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaa 26661967  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661966 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39066368 - 39066221
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  39066368 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaa 39066269  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39066268 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttcta 39066221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Original strand, 34364915 - 34365065
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  34364915 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaa 34365014  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||    
T  34365015 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacc 34365065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Original strand, 37556101 - 37556246
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaag-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  37556101 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagcctta 37556199  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556200 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 37556246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5320131 - 5319986
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5320131 ttgttgtatgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaagg 5320032  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5320031 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttcta 5319986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44290616 - 44290479
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44290616 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 44290517  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  44290516 aagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttcta 44290479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31767330 - 31767182
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||    
T  31767330 ttgttgttgtgtgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgcctta 31767231  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31767230 aggttttgggtaagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttcta 31767182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32594874 - 32594748
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  32594874 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggt 32594775  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594774 aagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 40082398 - 40082543
Alignment:
Q  82 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  40082398 gttgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaag 40082496  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  40082497 gttttgggtaagagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttcta 40082543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 41759483 - 41759620
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  41759483 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaaggttttgggt 41759582  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41759583 aagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttcta 41759620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 34364497 - 34364644
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  34364497 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaa 34364596  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  34364597 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctcta 34364644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22077660 - 22077518
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22077660 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggt 22077561  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||    
T  22077560 tttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttc 22077518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 213
Target Start/End: Original strand, 3550721 - 3550842
Alignment:
Q  92 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggata 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  3550721 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaagttttgggta 3550820  T
Q  192 agagtgtggtgtctctcttgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3550821 agagtgtggtgtctctcttgct 3550842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38804521 - 38804376
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  38804521 ttgttgtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaagg 38804422  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38804421 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 38804376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48588646 - 48588509
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  48588646 tgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggt 48588547  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48588546 aagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttcta 48588509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3537752 - 3537620
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagag 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3537752 gtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaaggttttgggtaagag 3537653  T
Q  196 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3537652 tgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 3537620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 34649428 - 34649575
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||  | ||||||||    
T  34649428 tgttgttgtatacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaa 34649527  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34649528 ggttttgggtaagagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttcta 34649575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Original strand, 45084378 - 45084516
Alignment:
Q  87 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttt 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||    
T  45084378 tgtgtgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggtttt 45084471  T
Q  187 ggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45084472 gggtaagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacc 45084516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24600479 - 24600335
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  24600479 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggt 24600380  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24600379 tttgtgtaagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttcta 24600335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37850768 - 37850621
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||  ||||    
T  37850768 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaa 37850669  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  37850668 ggtttcggataagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctcta 37850621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41184595 - 41184489
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41184595 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 41184496  T
Q  179 aaggttt 185  Q
    |||||||    
T  41184495 aaggttt 41184489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 66638 - 66493
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  66638 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaagg 66539  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||| ||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  66538 ttttgggtaagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttcta 66493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3875497 - 3875352
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3875497 ttgttgtgtgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaagg 3875398  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||| | ||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  3875397 ttttaggtaagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttcta 3875352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50052178 - 50052042
Alignment:
Q  94 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataag 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||| ||||    
T  50052178 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaagttttgggtaag 50052079  T
Q  194 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  50052078 agtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacc 50052042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 9955894 - 9956046
Alignment:
Q  78 cattgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaga-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaactcattgc 175  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  9955894 catttttgttgtgtgttagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgc 9955993  T
Q  176 cttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9955994 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctcta 9956046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 11977270 - 11977417
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  11977270 tgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaa 11977369  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  11977370 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttcta 11977417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319004
Alignment:
Q  99 tgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgt 198  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  199 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttcta 14319004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 226
Target Start/End: Original strand, 37555721 - 37555864
Alignment:
Q  82 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||  | | ||||||||    
T  37555721 gttgttgtgtaaaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaag 37555819  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37555820 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 37555864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45494137 - 45493997
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  45494137 tgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgccttaaagttt 45494038  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  45494037 tggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttc 45493997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 5575098 - 5575222
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||    
T  5575098 ttgttgtgtgca--tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaagg 5575195  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5575196 ttttggataagagtgtggcgtctctct 5575222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24132150 - 24132009
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  24132150 tgttgtatgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg- 24132052  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  24132051 tttgggta--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttcta 24132009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19283620 - 19283476
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19283620 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggt 19283521  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  19283520 tttggataagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctcta 19283476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3537305 - 3537228
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537305 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 3537228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 227
Target Start/End: Original strand, 22793270 - 22793415
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactca-ttgccttaag 181  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |    
T  22793270 ttgttgtgagcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacg 22793369  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22793370 gttttgagtaagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttct 22793415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Original strand, 45839616 - 45839767
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaactcattg 174  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||    
T  45839616 ttgttgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatg 45839714  T
Q  175 ccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45839715 ccttaaggttttgggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttct 45839767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528775
Alignment:
Q  101 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtgg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  201 tgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     |||||||||  || || ||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttcta 5528775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 66254 - 66136
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaagagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  66254 tgttgtgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaag 66155  T
Q  182 gttttggataagagtgtgg 200  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  66154 gttttgggtaagagtgtgg 66136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22077287 - 22077160
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaga------------gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |            |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077287 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactca 22077188  T
Q  172 ttgccttaaggttttggataagagtgtg 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22077187 ttgccctaaggttttggataagagtgtg 22077160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32168845 - 32168719
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  32168845 tgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 32168757  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32168756 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 32168719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Original strand, 44685449 - 44685551
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  44685449 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg 44685548  T
Q  183 ttt 185  Q
    |||    
T  44685549 ttt 44685551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30630803 - 30630660
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  30630803 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 30630704  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    ||||| |||||||| || ||| || |  ||| ||||||||||||    
T  30630703 tttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttct 30630660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22077991 - 22077871
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22077991 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggttt 22077893  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctct 207  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  22077892 ggggtaagagtgtggcgtctct 22077871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21378210 - 21378122
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 168  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21378210 ttgttgttgtgtgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaac 21378122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1188753 - 1188614
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  1188753 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggt 1188654  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  1188653 tttgggtaaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttg 1188614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44043935 - 44043810
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||      | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  44043935 tgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgtcttaagatt 44043837  T
Q  185 ttggataagagtgtggtgtctctcttg 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44043836 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35154207 - 35154150
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35154207 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1187527 - 1187404
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1187527 ttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattt 1187428  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||  ||| ||||||  ||||||||    
T  1187427 tgagtaaaagtgtgacgtctctct 1187404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 50469246 - 50469180
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469246 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956319
Alignment:
Q  118 cggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 215  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  216 tg 217  Q
    ||    
T  4956318 tg 4956319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Original strand, 4878796 - 4878869
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878796 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  133 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Original strand, 24448270 - 24448412
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   |||||  | | || |||  | ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |    
T  24448270 tgttgtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaagaaaagtggaagttgaacattttataagtgagagggctcataaactcattgtcttaagat 24448369  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||  ||| || ||||||||    
T  24448370 tttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgttc 24448412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  146 tataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctc 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4266934 - 4266875
Alignment:
Q  97 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 156  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266934 tgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 212
Target Start/End: Original strand, 11977026 - 11977065
Alignment:
Q  173 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgc 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11977026 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 11977065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30630986 - 30630912
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 159  Q
    |||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630986 ttgtgtgcgaatgcgagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 225
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499113
Alignment:
Q  132 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgtt 9499113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  140 acaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47379943 - 47379891
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacac 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  47379943 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 50051809 - 50051777
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051809 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 227
Target Start/End: Original strand, 50556443 - 50556587
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||  |||  |||||||    
T  50556443 ttgttgcgtgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaagg 50556542  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    ||||| |||| ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556543 ttttgaataaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051710
Alignment:
Q  161 ccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttcta 50051710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 167
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44091970
Alignment:
Q  106 tatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 167  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaa 44091970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380217
Alignment:
Q  162 cataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtg 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 47380217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  173 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 35530479 - 35530403
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 160  Q
    |||| |||| || |||| |||||||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  35530479 tgttatgtgtaaatgtgtgttatatgtcccacgtcgaataaaaaaattaaggttgaacattttatatgtaagaggac 35530403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 91)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 25483325 - 25483473
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25483325 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 25483424  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483425 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 25483473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 36629230 - 36629374
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629230 tgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 36629329  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629330 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 36629374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1731815 - 1731666
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1731815 attgttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgcctt 1731716  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1731715 aaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttcta 1731666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34646816 - 34646668
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34646816 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgcctta 34646717  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  34646716 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttcta 34646668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 10245910 - 10246056
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  10245910 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaacccaaagccttaa 10246008  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10246009 ggttttgggtaagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttcta 10246056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 39404388 - 39404535
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  39404388 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaa 39404487  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404488 ggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 39404535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39793023 - 39792879
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39793023 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggt 39792924  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39792923 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 39792879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 50002416 - 50002563
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  50002416 tgttgttgtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaa 50002515  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  50002516 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttcta 50002563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 3340802 - 3340944
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3340802 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttt 3340901  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3340902 tgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttcta 3340944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50630911 - 50630777
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50630911 tgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 50630812  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50630811 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgtt 50630777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 52884688 - 52884833
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  52884688 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggt 52884787  T
Q  184 ttt-ggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  52884788 tttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatcta 52884833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 54108908 - 54109049
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  54108908 tgttgtgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gt 54109004  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54109005 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 54109049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4955484 - 4955336
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4955484 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgcctta 4955385  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  4955384 aggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctcta 4955336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22028127 - 22027983
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22028127 tgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaa 22028028  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22028027 ggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgtt 22027983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54017754 - 54017614
Alignment:
Q  88 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  54017754 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttta 54017655  T
Q  188 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  54017654 ggtaagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 54017614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22183430 - 22183283
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22183430 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaa 22183331  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||    
T  22183330 ggttttggataagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttcta 22183283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36608827 - 36608680
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  36608827 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaa 36608728  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  36608727 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttcta 36608680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 39404013 - 39404155
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  39404013 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttt 39404112  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39404113 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 39404155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Original strand, 36572009 - 36572154
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  36572009 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaa 36572108  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36572109 ggttttgggttagagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttc 36572154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 41370357 - 41370494
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  41370357 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggt 41370456  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41370457 aagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttcta 41370494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 52884877 - 52885006
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52884877 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaa 52884976  T
Q  181 ggtttt-ggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  52884977 ggttttggggtaagaatgtggtgtctctct 52885006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22028537 - 22028388
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22028537 tgttgttgtgtgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtctt 22028438  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22028437 aatgttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttcta 22028388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41707628 - 41707503
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  41707628 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaagg 41707529  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41707528 ttttgg-taagagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55933280 - 55933155
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  55933280 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggt 55933181  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  55933180 aagagtgtggtgtctctcttacttgt 55933155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 225
Target Start/End: Original strand, 44620654 - 44620793
Alignment:
Q  85 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  44620654 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaac-cataaccttaaggtt 44620752  T
Q  185 ttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44620753 ttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgtt 44620793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620493
Alignment:
Q  100 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtg 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  200 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaacc 44620493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 54108526 - 54108674
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgt-gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaact-cattgcct 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  54108526 ttgttgttgtgttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgcct 54108623  T
Q  178 taaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54108624 taaggttttggctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttcta 54108674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 220
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  106 tatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtct 205  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  206 ctcttgcttgtgtgg 220  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459858
Alignment:
Q  94 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataag 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| | ||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  194 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 50459858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 49880160 - 49880296
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  49880160 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 49880259  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  49880260 aagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttcta 49880296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4390268 - 4390120
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| |||    
T  4390268 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgtta 4390169  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  4390168 aggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttcta 4390120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16888983 - 16888835
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtg-caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  16888983 tgttgttgtgtggcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtctta 16888884  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  16888883 cggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttcta 16888835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32941286 - 32941142
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32941286 tgttgtctgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggt 32941187  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32941186 tttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 32941142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3244614 - 3244472
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3244614 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagt 3244515  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||  ||||| |||||||||    
T  3244514 tttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttc 3244472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343027
Alignment:
Q  101 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  201 tgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttcta 54343027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 20825829 - 20825973
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   | ||||||||||    
T  20825829 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggt 20825928  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||    
T  20825929 tttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttatgcggttgttcta 20825973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621139
Alignment:
Q  100 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtg 199  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  200 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattcta 44621139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 54936190 - 54936314
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54936190 tgttgttgtgtacaagtgtgagttat----cccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaa 54936285  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54936286 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Original strand, 3341118 - 3341268
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  3341118 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaa 3341217  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    | |||||| |||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || |||||    
T  3341218 gattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacc 3341268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 2740693 - 2740818
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  2740693 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggt 2740792  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||   ||||||||||| ||||||||    
T  2740793 tttacgtaagagtgtggcgtctctct 2740818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49076998 - 49076850
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||    
T  49076998 attgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataacctt 49076900  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  49076899 aaggttttgggttagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttcta 49076850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 54741341 - 54741216
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  54741341 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggt 54741242  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  54741241 tttggataagagtgtagtctctctct 54741216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16889704 - 16889552
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtg-caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||    
T  16889704 ttgttgttgtgtggcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgcctt 16889605  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16889604 aaagttttgggtaagagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacc 16889552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34004744 - 34004604
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34004744 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttt 34004647  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | ||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  34004646 tcgataagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttcta 34004604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Original strand, 49302902 - 49303043
Alignment:
Q  89 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttt 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49302902 tgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 49303001  T
Q  187 ggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||    
T  49303002 gggtaagagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttcta 49303043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 200
Target Start/End: Original strand, 2741064 - 2741180
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  2741064 tgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggt 2741163  T
Q  184 tttggataagagtgtgg 200  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2741164 tttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18932887 - 18932771
Alignment:
Q  109 gtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctc 208  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18932887 gtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctc 18932788  T
Q  209 ttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    || |||| |||||||||    
T  18932787 ttacttgagtggttgtt 18932771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 3700357 - 3700488
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||    
T  3700357 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaagg 3700448  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 222  Q
    |||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||    
T  3700449 ttttggataagagtatgatgtctctctcatttgtgtggtt 3700488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51768225 - 51768076
Alignment:
Q  82 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51768225 gttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaag 51768126  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||||| ||| |||  | |||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  51768125 gttttgggtaaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacc 51768076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 49076614 - 49076510
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  49076614 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaa 49076515  T
Q  181 ggttt 185  Q
     ||||    
T  49076514 agttt 49076510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54017871 - 54017750
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcct 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||    
T  54017871 ttgttgttgtgtgcaaatgtgagttatatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtct 54017772  T
Q  178 taaggttttggataagagtgtg 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||    
T  54017771 taaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 225
Target Start/End: Original strand, 43174496 - 43174641
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-gagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||    
T  43174496 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgacctta 43174595  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 225  Q
    | || |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||    
T  43174596 aagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgtt 43174641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 20826223 - 20826354
Alignment:
Q  97 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |||| | |||||||    
T  20826223 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagt 20826322  T
Q  197 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| |||||||||| ||| || | ||||||||    
T  20826323 gtgatgtctctcttccttatgcgattgttcta 20826354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Original strand, 19504693 - 19504833
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||         |||||||||||||||   ||||||||    
T  19504693 attgttgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgcctt 19504783  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19504784 aaagttttgggtaagagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttcta 19504833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 28034222 - 28034347
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  28034222 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggt 28034321  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  28034322 tttaggtaagagtgtggcgtctctct 28034347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827579
Alignment:
Q  131 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaac 230  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6975612 - 6975489
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||| |||||| |    
T  6975612 tgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaagattttgggt 6975513  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgctt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  6975512 aagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817700
Alignment:
Q  145 ttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttcta 23817700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067184
Alignment:
Q  93 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggata 191  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| |  || | ||||||| |||||| ||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  192 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctaacc 40067184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45489497 - 45489351
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||  | ||  ||||    
T  45489497 tgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactg-tttaa 45489399  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | |||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  45489398 gatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttcta 45489351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 180
Target Start/End: Original strand, 10246340 - 10246436
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10246340 tgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 223
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760320
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagattttgg-taaaag 760292  T
Q  196 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttg 760320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23557024 - 23556890
Alignment:
Q  89 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgg 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23557024 tgtgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttgg 23556925  T
Q  189 ataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556924 ataagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691279
Alignment:
Q  142 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtc--tctcttgcttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgt 31691279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Original strand, 44620286 - 44620362
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 157  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620286 tgttgttgtgtacaaatatgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Original strand, 44621420 - 44621492
Alignment:
Q  85 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621420 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111736
Alignment:
Q  112 ccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctct 48111736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11348495 - 11348396
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  11348495 ttgttgttgtgtgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841387
Alignment:
Q  133 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctcta 15841387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 228
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879943
Alignment:
Q  137 tgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttcta 18879943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 34544096 - 34544225
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34544096 ttgttgtgagtaagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaa 34544195  T
Q  181 gg-ttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  34544196 ggtttttgggtaagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Original strand, 44620934 - 44621011
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 157  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620934 tgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 45050593 - 45050649
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  45050593 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 50788139 - 50788087
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacac 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50788139 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271904
Alignment:
Q  113 cacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgt-gtgtctctct 3271904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11706689 - 11706636
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaa 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706689 attgttgttgtgtgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489733
Alignment:
Q  97 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac-tcattgccttaaggttttggataagag 195  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||| | |  |  |||||||||||| ||| ||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagt-ttaaggttttgggtaatag 45489766  T
Q  196 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  45489765 tgtggtgtctctctcgcttgcatggttgttcta 45489733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6876261 - 6876138
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| | |  |||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||| ||| | |||||||    
T  6876261 ttgttgtgtgcaagtgtgatttatatatcttacatcggataaaa-actggaggtcgaacactttataag--agagaaccaataaacgcatcgacttaagg 6876165  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  6876164 ttttggataaaagtgtgacgtctctct 6876138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctctt 210  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15841146 - 15841023
Alignment:
Q  85 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtt 184  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | |||||| |||||| |||| |||    
T  15841146 gttgtgtacaaatgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gtt 15841048  T
Q  185 ttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||| |||||||||  |||||||||    
T  15841047 ttgggtaagagtgtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50788071 - 50788011
Alignment:
Q  170 cattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaac 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||    
T  50788071 cattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaac 50788011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  149 aagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctct 207  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 151
Target Start/End: Original strand, 12197370 - 12197438
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataag 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||| |||||| || || |||||||    
T  12197370 ttgttgtgtgcaagtgtgagttataggtcccacatcaaatagaaaagtgaaggttcaatactttataag 12197438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174276
Alignment:
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttc 43174276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 53468089 - 53468038
Alignment:
Q  158 gacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  53468089 gacccataaactcattgttttaagcttttggataagtgtgtgatgtctctct 53468038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 12197450 - 12197499
Alignment:
Q  174 gccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  12197450 gcctcaaggttttggataaaagtgtggtgtttctctcacttgtgtggttg 12197499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23817812 - 23817783
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817812 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgt 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 231
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370798
Alignment:
Q  171 attgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||||||||| |||| | ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacc 41370798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 3409259 - 3409396
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3409259 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 3409358  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3409359 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 3409396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2580041 - 2579893
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  2580041 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagcctta 2579942  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2579941 aggttttgggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 2579893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Original strand, 2377742 - 2377891
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2377742 attgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 2377841  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  2377842 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttcta 2377891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 29518503 - 29518640
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  29518503 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 29518602  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29518603 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 29518640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 29518920 - 29519057
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  29518920 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 29519019  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29519020 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 29519057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 32741179 - 32741316
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  32741179 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 32741278  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32741279 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 32741316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10074528 - 10074384
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074528 tgttgtgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 10074429  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  10074428 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttcta 10074384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2578610 - 2578464
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2578610 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaa 2578512  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2578511 ggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttcta 2578464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 16454565 - 16454712
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16454565 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 16454664  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454665 gattttggataagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 16454712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 2378126 - 2378263
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  2378126 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggt 2378225  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2378226 aagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttcta 2378263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 16107667 - 16107815
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16107667 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgcctta 16107766  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16107767 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctcta 16107815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 16454897 - 16455044
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  16454897 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaa 16454996  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454997 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 16455044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 3058226 - 3058366
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3058226 tgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 3058325  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  3058326 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacc 3058366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14748496 - 14748363
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14748496 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaaggttttgggt 14748397  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  14748396 aagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttcta 14748363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 1846748 - 1846885
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1846748 tgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggttttggat 1846847  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1846848 aagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttcta 1846885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 35210204 - 35210341
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  35210204 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaaggttttgggt 35210303  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  35210304 aagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctcta 35210341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 227
Target Start/End: Original strand, 3415462 - 3415594
Alignment:
Q  95 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataaga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  3415462 agtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaaga 3415561  T
Q  195 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3415562 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 3415594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10074156 - 10074012
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10074156 tgttgtgtgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 10074057  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  10074056 tttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttcta 10074012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2579645 - 2579510
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2579645 gtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaag 2579546  T
Q  196 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579545 tatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 2579510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6999964 - 6999817
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6999964 tgttattgtgtataagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaa 6999865  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6999864 ggttttggataagagtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttcta 6999817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 2843543 - 2843692
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaactcattgcctt 178  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2843543 ttgttgttgtgcacaattgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgcctt 2843642  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2843643 aaggttttgggtaagagtgtggtatctctcttgcttgagtggttgttcta 2843692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10073779 - 10073637
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  10073779 tgttgtgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagat 10073682  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  10073681 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttcta 10073637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 26544049 - 26544186
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |    
T  26544049 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaaggttttgagt 26544148  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26544149 aagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttcta 26544186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2578999 - 2578857
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2578999 tgttgtgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaactcattaccttaaggt 2578901  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2578900 tttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttct 2578857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 3409660 - 3409797
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |    
T  3409660 tgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggt 3409759  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3409760 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 3409797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 1127360 - 1127500
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  1127360 tgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggt 1127459  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  1127460 aagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacc 1127500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5832194 - 5832048
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||    
T  5832194 tgttgttgtgcacaagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaa 5832096  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5832095 gattttgggtaaaagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcta 5832048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 593879 - 593749
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||    
T  593879 attgttgctgagtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgcctt 593780  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  593779 aaggttttgggtaatagtgtggtatctctct 593749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1950353 - 1950206
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||    
T  1950353 tgttgttgcgtataagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaa 1950254  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1950253 ggttttgagtaagagtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttcta 1950206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 10911558 - 10911685
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaga-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10911558 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaag 10911657  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctctt 210  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10911658 ttttgaataagagtgtgatgtctctctt 10911685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2579273 - 2579130
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||| |||||||| |||  | ||||    
T  2579273 tgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctta----taagaggaaccataaacccataactttaa 2579178  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2579177 ggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttcta 2579130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 6071124 - 6071264
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||     
T  6071124 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaaga 6071223  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071224 ttttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  196 tgtg 199  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Original strand, 16108053 - 16108191
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16108053 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 16108152  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16108153 gg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttataacc 16108191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9062518 - 9062383
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9062518 ttgttattgtgtataaatgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtctta 9062419  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgt 216  Q
    | ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  9062418 a-gttttgggtaaaagtgtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5958773 - 5958641
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||    
T  5958773 attgttgtggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtctt 5958674  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttg 211  Q
    || |||||||   |||||||| |||||||||||    
T  5958673 aaagttttgggatagagtgtgatgtctctcttg 5958641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 8481919 - 8482045
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  8481919 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatgactcataaactcattgccttaaga 8482017  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctctt 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8482018 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12092647 - 12092508
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12092647 tgttgtgtgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggt 12092548  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  12092547 tttgagtaagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttg 12092508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12085198 - 12085055
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  12085198 tgttttgtgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggt 12085100  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  12085099 tttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttcta 12085055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12071851 - 12071712
Alignment:
Q  89 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||  ||  ||||||||||||||    
T  12071851 tgtgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgg 12071752  T
Q  189 ataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  12071751 gtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttcta 12071712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135092
Alignment:
Q  95 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataaga 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||||    || |||||||||||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  195 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttc 17135092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Original strand, 2975567 - 2975668
Alignment:
Q  106 tatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtct 205  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  2975567 tatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtct 2975666  T
Q  206 ct 207  Q
    ||    
T  2975667 ct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 164
Target Start/End: Original strand, 35210498 - 35210551
Alignment:
Q  111 cccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 164  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35210498 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  159 acccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctctt 210  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 200
Target Start/End: Original strand, 31714669 - 31714778
Alignment:
Q  89 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgg 188  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  31714669 tgtgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttga 31714766  T
Q  189 ataagagtgtgg 200  Q
     |||||||||||    
T  31714767 gtaagagtgtgg 31714778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789285
Alignment:
Q  128 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaac 14789285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  159 acccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7588390 - 7588355
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7588390 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 7588355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 150
Target Start/End: Original strand, 33605646 - 33605713
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataa 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  33605646 ttgttgtgtgcaagtgtgagctatatgtctcacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataa 33605713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618643
Alignment:
Q  98 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtg 197  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||| ||| ||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaac-cgttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  198 tggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttg 30618643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  159 acccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Original strand, 33605971 - 33606034
Alignment:
Q  87 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataa 150  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  33605971 tgtgtgcaaatgtaagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902452
Alignment:
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttct 10902452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 34834866 - 34835013
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34834866 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaa 34834965  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834966 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 34835013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 3669687 - 3669824
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3669687 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggt 3669786  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3669787 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 3669824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3038459 - 3038311
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3038459 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgcctta 3038360  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3038359 aggttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttcta 3038311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33113535 - 33113388
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33113535 tgttgttgtgtacaagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 33113436  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33113435 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttcta 33113388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 34835199 - 34835346
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835199 tgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 34835298  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34835299 agttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattcta 34835346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45122220 - 45122078
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  45122220 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttt 45122121  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45122120 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttcta 45122078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 9309345 - 9309473
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9309345 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaa 9309444  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  9309445 ggtgtcgggtaagagtgtggtgtctctct 9309473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 147441 - 147588
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  147441 tgttgttgcgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaa 147540  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  147541 agttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttcta 147588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 3670060 - 3670197
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |    
T  3670060 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggt 3670159  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3670160 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 3670197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25561985 - 25561836
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25561985 ttgttgttgtctacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtctta 25561886  T
Q  180 aggtttt-ggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25561885 aggttttggggtaagagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctcta 25561836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 217
Target Start/End: Original strand, 30359260 - 30359397
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30359260 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagcctta 30359359  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30359360 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctctttcttgtg 30359397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6877031 - 6876883
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  6877031 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtctta 6876932  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6876931 gggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttcta 6876883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20870733 - 20870591
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgg 188  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  20870733 tgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagattttgg 20870634  T
Q  189 ataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20870633 ataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 20870591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 70443 - 70292
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  70443 attgttgttgtgtacaaa-gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgcctt 70345  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70344 aaggttttaggtaagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacc 70292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9482770 - 9482625
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  9482770 tgttgttgtgtacaagtg--agttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaa 9482673  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9482672 gattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttcta 9482625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Original strand, 30441081 - 30441222
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441081 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgccttaaggtttt 30441180  T
Q  187 ggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30441181 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 30441222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 230
Target Start/End: Original strand, 30359599 - 30359748
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||    
T  30359599 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaa 30359698  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaac 230  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  30359699 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaac 30359748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 9608738 - 9608882
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  9608738 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggt 9608837  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9608838 tttgggtatgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttcta 9608882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 34835464 - 34835612
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835464 tgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 34835563  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34835564 aagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattcta 34835612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 34835730 - 34835878
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835730 tgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 34835829  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34835830 aagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattcta 34835878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Original strand, 40518061 - 40518208
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaga--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||    
T  40518061 ttgttgtgttcaagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaa 40518160  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40518161 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 40518208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8918932 - 8918782
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  8918932 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaa 8918833  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  8918832 ggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacc 8918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 40518577 - 40518719
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  40518577 ttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttt 40518676  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40518677 tgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttcta 40518719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1014403 - 1014266
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| |    
T  1014403 tgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaagttttgggt 1014304  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1014303 aagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttcta 1014266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45122070 - 45121937
Alignment:
Q  89 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45122070 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgg 45121971  T
Q  189 ataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 222  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  45121970 gtaacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggtt 45121937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Original strand, 45122638 - 45122759
Alignment:
Q  105 atatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtc 204  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||    
T  45122638 atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtc 45122737  T
Q  205 tctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45122738 tctcttgcttgtgtggttgttc 45122759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Original strand, 41972151 - 41972296
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  41972151 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagt 41972250  T
Q  184 t---ttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |   |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41972251 tttgttgggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttc 41972296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 5915863 - 5916004
Alignment:
Q  82 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915863 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaag 5915957  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5915958 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 5916004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483208
Alignment:
Q  116 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  216 tgtggttgttcta 228  Q
    || ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttcta 9483208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37544658 - 37544511
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||    
T  37544658 tgttgttgtgcacaagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaa 37544559  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  37544558 ggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttcta 37544511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1514078 - 1513936
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  1514078 ttgtgtacaagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttt 1513979  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  1513978 tgggtaaaagtgtggtatctctcttacatgtggggttattcta 1513936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18372015
Alignment:
Q  101 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtgg 200  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  201 tgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctcta 18372015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40579662 - 40579527
Alignment:
Q  93 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataa 192  Q
    ||||||||| ||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||    
T  40579662 caagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggttttaggtaa 40579563  T
Q  193 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  40579562 gagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttcta 40579527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1014029 - 1013892
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||  |    
T  1014029 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagt 1013930  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||    
T  1013929 aagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttcta 1013892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4154831 - 4154694
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||    
T  4154831 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggt 4154732  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  4154731 tttgggtaagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttg 4154694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 6731904 - 6732035
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  6731904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa---------agtaagagaacccataaattcattgccttaaggttttgagt 6731994  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6731995 aagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacc 6732035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Original strand, 45122996 - 45123144
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||  |||  |||||    
T  45122996 tgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaa 45123093  T
Q  181 ggttttggata--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaa 229  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  45123094 ggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaa 45123144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 226
Target Start/End: Original strand, 5420643 - 5420786
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5420643 ttgttgtatgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaagg 5420742  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    ||||   ||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||    
T  5420743 ttttttgtaagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttc 5420786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45121823 - 45121677
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||    
T  45121823 tgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaa 45121725  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||  |||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||    
T  45121724 ggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggttgttcta 45121677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32640694 - 32640553
Alignment:
Q  82 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32640694 gttgttgcgtggaagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaag 32640600  T
Q  182 gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32640599 gttttgggtaagagtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttcta 32640553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 9308970 - 9309100
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9308970 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaag 9309069  T
Q  182 gttttggataag---agtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  9309070 gttttgggcaagagtagtgtggtgtctctct 9309100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 8794101 - 8794229
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||    
T  8794101 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaa 8794200  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||    
T  8794201 ggttttgggtgagagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43274948 - 43274824
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43274948 ttgttgttgtgtataagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtctta 43274849  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtc 204  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  43274848 aggttttgagtaagagtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 147819 - 147957
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||         ||||||||||  ||||||||||    
T  147819 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatata---------acccataaacctattgccttaa 147909  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  147910 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttcta 147957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 228
Target Start/End: Original strand, 12283867 - 12284009
Alignment:
Q  85 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtt 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||||||  | |||||||||    
T  12283867 gttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactca-agtcttaaggtt 12283965  T
Q  185 ttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12283966 ttggataagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttcta 12284009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 231
Target Start/End: Original strand, 6651510 - 6651634
Alignment:
Q  98 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtg 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |         |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6651510 gtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacccataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtg 6651600  T
Q  198 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6651601 tggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacc 6651634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 9507769 - 9507898
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaag---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcct 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  9507769 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattacct 9507868  T
Q  178 taaggttttggataagagtgtggtgtctct 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9507869 taaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 9507898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9620841 - 9620704
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9620841 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagat 9620742  T
Q  184 tttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    |||  |||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  9620741 ttt--ataagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttg 9620704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  114 acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgct 213  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  214 tgtgtggttgttcta 228  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18373098 - 18372988
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |    
T  18373098 tgttgttgtgtaca-gtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---a 18373003  T
Q  181 ggttttggataagag 195  Q
    |||||||| ||||||    
T  18373002 ggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380059
Alignment:
Q  95 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataaga 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || | |||||||||||||  |||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  195 gtgtggtgtctct 207  Q
    |||||||| ||||    
T  18380071 gtgtggtgcctct 18380059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4154446 - 4154321
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||      
T  4154446 ttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaga-gacccataaactcattgccttaata 4154348  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||    
T  4154347 ttttgggtaagtgtgtgatgtctctct 4154321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18372859 - 18372785
Alignment:
Q  89 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 163  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372859 tgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 32305503 - 32305617
Alignment:
Q  117 tcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgt 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||| |    
T  32305503 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagattttggataagagtgtggcgtctttattacttat 32305602  T
Q  217 gtggttgttctaacc 231  Q
    |  ||||||||||||    
T  32305603 gcagttgttctaacc 32305617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41416322 - 41416252
Alignment:
Q  98 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41416322 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaac 41416252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398086
Alignment:
Q  95 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaactcattgccttaaggttttggata 191  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  192 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacc 43398086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  101 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18371807 - 18371701
Alignment:
Q  98 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtg 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  18371807 gtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtg 18371713  T
Q  198 tggtgtctctct 209  Q
    |||||| |||||    
T  18371712 tggtgtgtctct 18371701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18372416 - 18372342
Alignment:
Q  89 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 163  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372416 tgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Original strand, 5274770 - 5274907
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5274770 ttgtgtgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattt 5274869  T
Q  186 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||  |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274870 tgagtaagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  93 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataa 192  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||| |||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  193 gagtgtg 199  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919165
Alignment:
Q  173 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttcta 8919165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  94 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 181  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagag 195  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||  ||||| |||||| | ||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40579348 - 40579290
Alignment:
Q  170 cattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40579348 cattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 40579290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 189
Target Start/End: Original strand, 33831971 - 33832076
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||   |||||||    
T  33831971 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaacacttttttttaaggt 33832070  T
Q  184 tttgga 189  Q
    ||||||    
T  33832071 tttgga 33832076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Original strand, 41129067 - 41129128
Alignment:
Q  170 cattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41129067 cattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacc 41129128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20995566 - 20995502
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995566 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18372531 - 18372485
Alignment:
Q  89 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaagg 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18372531 tgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20995495 - 20995442
Alignment:
Q  170 cattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20995495 cattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttg 20995442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524502
Alignment:
Q  172 ttgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctcta 16524502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18373291 - 18373236
Alignment:
Q  128 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  18373291 agtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18645752 - 18645713
Alignment:
Q  84 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645752 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417746
Alignment:
Q  145 ttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 219  Q
    |||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtg 40417746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 188
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991850
Alignment:
Q  94 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgg 188  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgg 40991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Original strand, 11442859 - 11442950
Alignment:
Q  96 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgg 188  Q
    |||||||||| | ||||||| | ||||  ||||||  ||||||| || | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11442859 gtgtgagttaaa-gtcccacgttggatggaagagttgaggttgagcaacatacaagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgg 11442950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 684 - 535
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  684 attgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 585  T
Q  179 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  584 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttcta 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 300 - 168
Alignment:
Q  91 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||| |||||| || |    
T  300 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaac-cat--actttaggtttagg-t 206  T
Q  191 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  205 aagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttcta 168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 211
Target Start/End: Original strand, 5349 - 5477
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  5349 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaga 5448  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5449 ttttggataagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Original strand, 4971 - 5119
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4971 ttgttgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgcctta 5070  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  5071 tggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctcta 5119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1274 - 1127
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  1274 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaa 1175  T
Q  181 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 228  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1174 ggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttcta 1127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3153 - 3092
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 142  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3153 tgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  138 gaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 5384 - 5532
Alignment:
Q  79 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  5384 attgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtctt 5483  T
Q  179 -aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5484 aaagtttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttc 5532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 226
Target Start/End: Original strand, 5767 - 5917
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5767 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 5866  T
Q  181 g-----gttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 226  Q
    |      |||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  5867 gattaaattttgagtaagagtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttc 5917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 47349 - 47500
Alignment:
Q  80 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 179  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  47349 ttgttgatgtgtgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgcctta 47448  T
Q  180 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacc 231  Q
    | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47449 aagttttgggtaaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacc 47500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17624 - 17496
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17624 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaa 17525  T
Q  181 gg--ttttggataagagtgtggtgtctct 207  Q
    ||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  17524 ggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10279 - 10192
Alignment:
Q  81 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 168  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10279 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Original strand, 39452 - 39588
Alignment:
Q  86 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttt 185  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   ||||||||| ||||    
T  39452 ttgtgttcaagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaa-gttt 39549  T
Q  186 tggataagagtg-tggtgtctctcttgcttgtgtggttg 223  Q
    ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39550 tgggtaaaagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 39830 - 39963
Alignment:
Q  83 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| ||| ||   ||||||| ||| ||||||      
T  39830 ttgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaa 39929  T
Q  183 ttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgt 216  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39930 ttttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University