View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18140_high_2 (Length: 802)

Name: NF18140_high_2
Description: NF18140
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18140_high_2
NF18140_high_2
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (256-785)||(12257855-12258387)
chr2 (518-785)||(12235051-12235317)
chr2 (547-777)||(11999764-11999994)
chr2 (544-785)||(7542588-7542829)
chr2 (547-785)||(12244974-12245212)
chr2 (548-785)||(14703770-14704007)
chr2 (256-452)||(7543242-7543438)
chr2 (241-448)||(14705432-14705639)
chr2 (553-784)||(16661566-16661797)
chr2 (547-753)||(16657085-16657291)
chr2 (253-449)||(12244341-12244537)
chr2 (289-450)||(12000300-12000461)
chr2 (252-452)||(12235763-12235963)
chr2 (547-739)||(43625821-43626010)
chr2 (319-448)||(16656604-16656733)
chr2 (314-445)||(16661065-16661196)
chr2 (248-449)||(43626288-43626489)
chr2 (238-293)||(12000786-12000841)
chr2 (547-590)||(39373417-39373460)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (546-785)||(35132810-35133047)
chr4 (546-785)||(9335458-9335697)
chr4 (256-457)||(35133414-35133615)
chr4 (314-449)||(9323063-9323198)
chr4 (314-449)||(9377542-9377677)
chr4 (547-782)||(30775617-30775852)
chr4 (314-449)||(9335035-9335169)
chr4 (338-449)||(30776085-30776196)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (547-785)||(13333024-13333262)
chr7 (554-785)||(10493949-10494180)
chr7 (546-785)||(8667781-8668020)
chr7 (547-784)||(8585274-8585511)
chr7 (554-754)||(8654843-8655043)
chr7 (546-749)||(6789910-6790113)
chr7 (566-785)||(8671217-8671436)
chr7 (547-755)||(1301856-1302064)
chr7 (553-785)||(8659725-8659957)
chr7 (553-778)||(17268308-17268533)
chr7 (554-785)||(3147634-3147865)
chr7 (553-718)||(8628961-8629126)
chr7 (226-448)||(27829256-27829478)
chr7 (256-450)||(17261359-17261553)
chr7 (314-449)||(3148339-3148474)
chr7 (554-781)||(27830450-27830677)
chr7 (232-449)||(6790378-6790595)
chr7 (547-785)||(8647239-8647474)
chr7 (547-781)||(8545998-8546232)
chr7 (325-413)||(7876844-7876932)
chr7 (256-416)||(8582664-8582824)
chr7 (234-413)||(8660248-8660427)
chr7 (314-449)||(8668433-8668568)
chr7 (553-771)||(17260617-17260835)
chr7 (256-416)||(8572591-8572751)
chr7 (543-781)||(8582066-8582304)
chr7 (314-448)||(13332149-13332283)
chr7 (318-407)||(8635502-8635591)
chr7 (225-413)||(1302315-1302503)
chr7 (322-413)||(8546679-8546770)
chr7 (314-449)||(8647669-8647804)
chr7 (319-453)||(8591362-8591496)
chr7 (314-448)||(8630197-8630331)
chr7 (256-450)||(17269067-17269261)
chr7 (351-416)||(8568839-8568904)
chr7 (314-448)||(8584535-8584669)
chr7 (314-448)||(10493000-10493134)
chr7 (256-416)||(8538805-8538965)
chr7 (594-739)||(8640164-8640306)
chr7 (666-785)||(8591000-8591119)
chr7 (314-449)||(8655317-8655452)
chr7 (319-413)||(8602738-8602832)
chr7 (646-781)||(8636010-8636145)
chr7 (699-781)||(8570677-8570759)
chr7 (328-416)||(8577290-8577378)
chr7 (543-778)||(8559702-8559937)
chr7 (543-590)||(8570868-8570915)
chr7 (318-416)||(8610665-8610763)
chr7 (316-413)||(8104069-8104166)
chr7 (698-751)||(8576722-8576775)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (547-782)||(28220316-28220551)
chr5 (314-448)||(42554186-42554320)
chr5 (242-449)||(28220915-28221122)
chr5 (565-785)||(42555530-42555750)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (548-782)||(34466362-34466596)
chr1 (225-452)||(34465158-34465385)
chr1 (546-739)||(15595447-15595638)
chr1 (234-449)||(4677459-4677674)
chr1 (547-745)||(4678126-4678324)
chr1 (314-416)||(15596060-15596162)
chr1 (557-642)||(52549098-52549183)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (553-785)||(43745209-43745441)
chr8 (226-416)||(12529869-12530059)
chr8 (253-448)||(43745793-43745985)
chr8 (548-655)||(12528996-12529103)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (553-689)||(28911040-28911176)
chr6 (379-413)||(28911318-28911352)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 256 - 785
Target Start/End: Original strand, 12257855 - 12258387
Alignment:
Q  256 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 355  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || || || |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| || ||| |    
T  12257855 ggaattgaccttggcacaacgtattcatgcgttgctgtttggcaggaacaatattgtcgagctgagatcattcacaacgatcaaggaaacagaacaacgc 12257954  T
Q  356 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaatttaaa 455  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |     
T  12257955 cttcttgtgttgcttttactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatcaagctgctgccaaccctcaacacactgtctttggtatttctat 12258054  T
Q  456 t-ttttcacttccttttatatacttaatat---tgttttgatatgattaat---gctgaagtgctgaataattgaatgttgagaattacaaatgttaatt 548  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||  |||   ||||||  ||||||||||   |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  12258055 tctttttacttccttt-atatacttgttataattgttttactatgattaataatgctgaagtactgaataatttaat--tgagaattacaaatgttaaat 12258151  T
Q  549 tttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatg 648  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12258152 ttc-cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagtagttcaagatgatataatgttgtggccatttaaagtcactgctggtgtcaatg 12258250  T
Q  649 acaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctga 748  Q
     |||||| |||||||| || |||||||||  ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  12258251 gcaaacccatgattacggtaaagtacaagaatcaagagaagcagctttgtgccgaggaagtatcatctgtggtattgacaaagatgcgagaaattgctga 12258350  T
Q  749 ggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12258351 ggcatatttagaatcacccgttaagaatgcagttgtt 12258387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 518 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 12235317 - 12235051
Alignment:
Q  518 aattgaatgttgagaattacaaatgttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttg 617  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12235317 aattgaatgatgaaagttactaatgttaattttt-cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatgtgatgttg 12235219  T
Q  618 tggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatcta 717  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  12235218 tggccattcaaggtcgctgctggtgtcaatgacaaacccatgattattgtcaagtacaagggtcgagagaagcagctatgtcccgaagaagtatcatcta 12235119  T
Q  718 tgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||    
T  12235118 tggtactcacaaagatgcgagaaatcgctgaggcatatttacaatttccagttaagaatgcagttgtt 12235051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 547 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 11999994 - 11999764
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11999994 ttttttcagatgctaagaggttaattggttggaagtttagtgatcttgttgttcaagatgatggattgttatggccattcaaggtcactgctgatgtcaa 11999895  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 746  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  11999894 tgacaaaccaataattactgttaagtacaaaggccaggagaagcagctatgtgctgaagaagtatcatctatggtactaacgaagatgcgagaaattgct 11999795  T
Q  747 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatg 777  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11999794 gaggcatatttagaatcaccggtaaagaatg 11999764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 544 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 7542829 - 7542588
Alignment:
Q  544 taatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgt 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||     
T  7542829 taatttttgtagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcctgttgttcaagatgatatactgttatggccattcaaggtgactgcgggtga 7542730  T
Q  644 caatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaatt 743  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7542729 caatgacagacccatgattaccgttaagtacaaggatcaggagaaacaactccatgctgaagaggtatcatctatggtactcacaaagatgcgagaaatt 7542630  T
Q  744 gctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    |||||| | ||||||||| || | || | |||||||||||||    
T  7542629 gctgagtcgtatttagaaacaactgtgacgaatgcagttgtt 7542588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 547 - 785
Target Start/End: Original strand, 12244974 - 12245212
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||  | | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12244974 ttttttcagatgctaagagattaattggtaggaagtttagtgatcctattgttctggatgatgcattattatggccgttcaaggtcactgctggtgtcaa 12245073  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 746  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12245074 tgacaaaccaataattactgttaactacaaaggccaggagaagcagctatgtgctgaagaagtatcatctatggtactaacaaagatgcgagaaattgct 12245173  T
Q  747 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12245174 gaggcatatttagaatcaccggtaaagaatgctgttgtt 12245212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 548 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 14704007 - 14703770
Alignment:
Q  548 ttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaat 647  Q
    |||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  14704007 tttttcagatgctaagaggttgttgggaaggaagtttagcgatcctattgttcaagatgatatacttttatggccatttaaggtcactgctggagtcgat 14703908  T
Q  648 gacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctg 747  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  14703907 gacaaacccatgattacggttaagtacaaggatcaggagaagaagctctatgccgaagaagtatcatctatggtactggtgaagatgcgagaaattgctg 14703808  T
Q  748 aggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    || |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  14703807 agacatatttagagtcaactgttaagaatgcagttgtt 14703770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 256 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 7543438 - 7543242
Alignment:
Q  256 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 355  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  7543438 ggaatagaccttggcacaacgtactcttgtgttgcagtatggcaggatcaacactatcgagttgaaatcattcacaacgaccaaggcaacagaacaacac 7543339  T
Q  356 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaattt 452  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7543338 cttcttttgttgctttcaccgaaaatcagaggttgatcggtgataatgctaagaatcaagctgcttccaaccctcaaaacactgtctttggtaattt 7543242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 241 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14705639 - 14705432
Alignment:
Q  241 gaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaag 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  14705639 gaaggatgtgctgtgggaatagaccttggtacaacgtactcatgtgttgcagtatggcaggaacaacattatcgagttgaaatcattcacaacgatcaag 14705540  T
Q  341 gcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgt 440  Q
    |||| | || ||| ||||||| ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  14705539 gcaatagaacaactccttcttttgttgctttcaccgaaaatcagcggttgattggtgatgctgctaagaatcaagctgctgccaaccctcgaaacactgt 14705440  T
Q  441 ctttggta 448  Q
    ||||||||    
T  14705439 ctttggta 14705432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 553 - 784
Target Start/End: Original strand, 16661566 - 16661797
Alignment:
Q  553 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16661566 cagatgctaagaggttaattggtaggaaatttagtgaccccgttgttcaaaaagatatactgttgtggccgttcaaggttattgctggtgttaatgacaa 16661665  T
Q  653 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 752  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||||||  | |||||||| |||   ||  |||| |||||     
T  16661666 acctacgattagtgttaagtacaagggtcaggagaagctcctttgtgccgaggaaatctcatctattgtcctcacaaacatgaaggaggttgcagaggct 16661765  T
Q  753 tatttagaatcaccggttaagaatgcagttgt 784  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16661766 tatttggaatcaccggttaaaaatgcagttgt 16661797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 547 - 753
Target Start/End: Original strand, 16657085 - 16657291
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || ||    
T  16657085 ttttttcagatgctaaaaggttaatcggtaggaagtttagtgatcctgttgttcaaaatgatatcatcttgtggccattcaaggtcattgccggagtgaa 16657184  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 746  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||| |||||||| ||||  ||  |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  16657185 tgacaaaccaatgattactcttcagtataagggtcaagagagccaattttgtgctgaggaaatatcatctatgatccttacaaagatgcgagaagttgct 16657284  T
Q  747 gaggcat 753  Q
    |||||||    
T  16657285 gaggcat 16657291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 253 - 449
Target Start/End: Original strand, 12244341 - 12244537
Alignment:
Q  253 gtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataa 352  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |  || ||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||    
T  12244341 gtgggaatagaccttggtacaacgtattcatgtgttgcagtatggcaggaacaacactctcgtgttgaaatcattcacaacgatcagggcaacagaacaa 12244440  T
Q  353 caccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12244441 caccttcttgtgttgctttcactgaagatcaaaggtttattggtgatgctgctaaaaatcaagctgctgctaactctcaaaacactgtctttggtaa 12244537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 289 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12000461 - 12000300
Alignment:
Q  289 gcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggt 388  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12000461 gcagtgtggctggaacaacactctcgagttgaaatcattcacaacgatcaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactgaaaatcaaaggt 12000362  T
Q  389 tgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaat 450  Q
    |  ||||||||||||| || || ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12000361 ttgttggtgatgctgctaaaaaccaagccgctgccaactctcaaaacactgtttttggtaat 12000300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 12235963 - 12235763
Alignment:
Q  252 tgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaata 351  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||| | || |    
T  12235963 tgtggggatagaccttggtacaacatattcatgtgttgcagtatggcaggaacagcactctcgagttgagatcattcacaacgatcaaggcaatagaaca 12235864  T
Q  352 acaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaatt 451  Q
    || ||||||| ||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12235863 accccttcttttgttgctttcaccgaaaatcagaggttgattggtgatgctgctaagaatcaagctgcttccaacccgcaaaacaccgtctttggtaatt 12235764  T
Q  452 t 452  Q
    |    
T  12235763 t 12235763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 547 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 43626010 - 43625821
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    ||| ||  |    
T  43626010 tttttccagatgctaagaggttaatcggtaggaagtttagtgattctgttgttcaaaatgatatcatgttgtggccattcagggtca---ttggggtgga 43625914  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgaga 739  Q
    ||||||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  43625913 tgacaaaccaatgattattgtaaaatacaagggtcaagagaagcgtttttgtcctgaggaaatatcgtctatgatcctcacaaagatgcgaga 43625821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 319 - 448
Target Start/End: Original strand, 16656604 - 16656733
Alignment:
Q  319 gagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcag 418  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  16656604 gagatcatacacaatgaccagggaaacagaacaacaccttcttttgttgctttcactcatgatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatcaagttg 16656703  T
Q  419 ctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 448  Q
    | |  ||||| ||||||||  |||||||||    
T  16656704 ccgctaacccacaaaacaccatctttggta 16656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 445
Target Start/End: Original strand, 16661065 - 16661196
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||| | |||| |||||| ||| ||||    
T  16661065 gagttgagattatccacaacgatgaaggcaacaaaattacaccttcttttgttgcttttactgatgctcaaaggttggtcggtggtgctgctaaggatca 16661164  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttg 445  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16661165 agctgctatcaacccacaaaacaccgtctttg 16661196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 43626489 - 43626288
Alignment:
Q  248 gtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaa 347  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||||  ||  || |  |  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||     
T  43626489 gtgttgtgggaatagaccttggaacaacgtattcttgtattgctgtgtggcttgatgaaaacagaagagtagagattatccacaatgaccaaggaaacag 43626390  T
Q  348 aataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggt 447  Q
    ||  |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |   | ||||  |||||||||||||||||    
T  43626389 aactacaccttcttttgtttctttcactaaggaccaaaggttgattggtgatgctgctaagggtcaagctacctccgaccccgaaaacactgtctttggt 43626290  T
Q  448 aa 449  Q
    ||    
T  43626289 aa 43626288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12000841 - 12000786
Alignment:
Q  238 tatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagt 293  Q
    |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12000841 tatgaaggacttgctgtgggagtagacctcggcacaacatactcttgtgttgcagt 12000786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 547 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 39373460 - 39373417
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgat 590  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39373460 ttttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttaatgat 39373417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 546 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 35133047 - 35132810
Alignment:
Q  546 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 645  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  35133047 attttttcagatgctaaaaggttaattggtaggaagtttagtgatcctattgttcaagatgatatactgctatggccattcaaggtcactgccggtgtaa 35132948  T
Q  646 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 745  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35132947 atgacaaacccatgattacggttaagtacaaggatgaggaaaagcaactctatgcggaagaagtatcatccatggtactcacaaagatgcgagaaattgc 35132848  T
Q  746 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
      ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35132847 --aggcatatttagaatcaactgttaagaatgcagttgtt 35132810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 546 - 785
Target Start/End: Original strand, 9335458 - 9335697
Alignment:
Q  546 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 645  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |    
T  9335458 atttttgcagatgctaagagattaactggtaggaagtttagtgatctggttgttcaaagagatatattgttgtggccattcaaggttatttctggtgtta 9335557  T
Q  646 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 745  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||| | || ||||||||| ||||  ||||    
T  9335558 atgacaaacctatgattactgttaactacaagggtcaagagaagcacttttgtgctgaggaaatatcttctatgttgcttacaaagatgagagaggttgc 9335657  T
Q  746 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
     ||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||    
T  9335658 ggaggcatatttggggtcgccggtcaagaatgccgttgtt 9335697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 256 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 35133615 - 35133414
Alignment:
Q  256 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 355  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||    
T  35133615 ggaatagacctcggaacaacgtattcatgtgttgcagtatggcaagaacaacactatcgagtcgaaatcattcacaacgatcaaagcaacaaaacaacac 35133516  T
Q  356 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaatttaaa 455  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||   | |||||||||| ||||||||||| ||    
T  35133515 cttcttgtattgctttcactaaggatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatcaagctgctgccaattttgaaaacactgtatttggtaatttcaa 35133416  T
Q  456 tt 457  Q
    ||    
T  35133415 tt 35133414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 449
Target Start/End: Original strand, 9323063 - 9323198
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9323063 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaacaacaccttcttttgttgctttcaacaatgagcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 9323162  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 449  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9323163 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 9323198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 449
Target Start/End: Original strand, 9377542 - 9377677
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9377542 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaacaacaccttcttttgttgctttcaacaatgagcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 9377641  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 449  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9377642 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 9377677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 547 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 30775852 - 30775617
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||   | ||||||| ||    
T  30775852 ttttttcagatgctaaaaggttaattggtaggaaatttagcgaccctgttgttcaaaaagatattttgttgtggccattcaaggttgtttctggtgttaa 30775753  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 746  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||||||| |  || ||||| || ||| | ||||| ||  | |||||||| ||| |||| |||||     
T  30775752 tgacaaacccatgatttcccttaagttcaagggccaggagaaactcctctgtgccgaggaaatttcatcaatagtcctcacaaatatgagagagattgca 30775653  T
Q  747 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagtt 782  Q
    |||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  30775652 gagatgtatttggaatccccagttaaaaatgcagtt 30775617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 449
Target Start/End: Original strand, 9335035 - 9335169
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9335035 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaacaacaccttcttttgttgctttcaacaatgagcaaaggttga-tggtgatgctgctaagaatca 9335133  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 449  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9335134 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 9335169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30776196 - 30776085
Alignment:
Q  338 aaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacac 437  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| | |||| |||||| ||| | || || ||| ||||||||||||||||    
T  30776196 aaggcagcaaaatcacaccttcttttgttgctttcactgatggtcaaaggttggtcggtgctgctgctaaggaccaggctgctatcaaccctcaaaacac 30776097  T
Q  438 tgtctttggtaa 449  Q
    ||||||||||||    
T  30776096 tgtctttggtaa 30776085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 547 - 785
Target Start/End: Original strand, 13333024 - 13333262
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13333024 ttttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatccggttgttcaaaatgatataatgttgtggccattcaaggttacttctggtgtcaa 13333123  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 746  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||     
T  13333124 cgacaagcctatgattaccgctaagtgcaagggtcaagagaagcacttttgtgccgaggaaatatcatctatggtccttacaaagatgcgagaggttgca 13333223  T
Q  747 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    ||||||||| | |  ||||| || |||||||| ||||||    
T  13333224 gaggcatatatggggtcaccagtcaagaatgccgttgtt 13333262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 554 - 785
Target Start/End: Original strand, 10493949 - 10494180
Alignment:
Q  554 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 653  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10493949 agatgctaagaggttaattggcaggaagtttagtgatccggttgttcaaaacgatataatgttgtggccattcaaggttacttcaggtgtcaatgacaaa 10494048  T
Q  654 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcat 753  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||| | || | ||||||||||||  |||| |||||||    
T  10494049 cctatgattaccgctaagtacaagggtcaagagaagcacttttgtgccgaggaaatatcatctatggtccttataaagatgcgagaggttgcagaggcat 10494148  T
Q  754 atttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    |||| |  ||||| || |||||||| ||||||    
T  10494149 atttggggtcaccagtcaagaatgctgttgtt 10494180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 546 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 8668020 - 8667781
Alignment:
Q  546 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |    
T  8668020 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgaccccgttgttcaaagagatatattgttgtggccattcaaggttatttctggtgtta 8667921  T
Q  646 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 745  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||| | || ||||||||||||||  ||||    
T  8667920 atgacaaacctatgattactgttaagtacaagggtcaagagaagcacttttgtgctgaggaaatatcttctatggtgcttacaaagatgcgagaggttgc 8667821  T
Q  746 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
     ||||||||| | |  || ||||| |||||||| ||||||    
T  8667820 ggaggcatatctggggtcgccggtcaagaatgccgttgtt 8667781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 547 - 784
Target Start/End: Original strand, 8585274 - 8585511
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||    
T  8585274 ttttttcagatgccaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcccgttgttcaaaatgatataatgttgtggccattcaaggttatctctggtgttaa 8585373  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaa-attgc 745  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||  |||| |||||    
T  8585374 tgacaaacctatgattactgttaagtacaagggtcaagaaaagaacctatgtgctgaggaaatatcatctatcatcctcacaaacatg-aagaagattgc 8585472  T
Q  746 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgt 784  Q
     ||| |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||    
T  8585473 agagacatatttgaaatcacctgttcaaaatgcagttgt 8585511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 554 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 8655043 - 8654843
Alignment:
Q  554 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  8655043 agatgctaagaggttaattggtaggaagtatagtgatcctattgttcaaaaggatatcatgttgtggccattcatggttacttctggtgttaatgacaaa 8654944  T
Q  654 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcat 753  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||  | | || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8654943 cccatgattactgttaagtacaaaggtcaagagaagcaattttgtgctgaggaaatatcatctgcggttcttacaaagatgcgagagattgcagaggcat 8654844  T
Q  754 a 754  Q
    |    
T  8654843 a 8654843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 546 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 6790113 - 6789910
Alignment:
Q  546 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtca 645  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6790113 attttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgattctgttgttcaaaatgatatgatgttttggccattcaaggtcattgctggcgtca 6790014  T
Q  646 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 745  Q
    ||||||| || ||||||   ||| |||| |||||| |||||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  6790013 atgacaagcccatgattgttgttgagtataagggtgaggagaagcaactatgtgttgaggaagtttcgtctatgatcctcaccaagatgcgggagattgc 6789914  T
Q  746 tgag 749  Q
    ||||    
T  6789913 tgag 6789910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 566 - 785
Target Start/End: Original strand, 8671217 - 8671436
Alignment:
Q  566 gttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattacc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8671217 gttaattggtaggaagtttagtgatccggttgttcaaagagatatattgttgtggccattcaaggttatttctggtgttaatgacaaacctatgattact 8671316  T
Q  666 gttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcac 765  Q
    || |||||| | ||||  ||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||| | || ||||||||||||||  |||| ||||||||| | || ||||    
T  8671317 gtcaagtacgaaggtctagagaagcaattttgtgctgaggaaatatcttctatggtgcttacaaagatgcgagaggttgcggaggcatatctggagtcac 8671416  T
Q  766 cggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  8671417 cggtcaagaatgccgttgtt 8671436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 547 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 1302064 - 1301856
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  1302064 ttttttcagatgctaagagattaattggtaggaagtttagtgattcagttgttcaaaaagacatgatgttgtggccattcaaggtcatcgccggtgtgaa 1301965  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 746  Q
    |||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||| |  || ||| ||||||||||| | || || |||||||||||||||||     
T  1301964 tgacaaacccgtgattgttgttaagtacaagggtcaggagaagcacttttgcgtggaggaaatatcatctatggtccttacgaagatgcgagaaattgca 1301865  T
Q  747 gaggcatat 755  Q
    ||| |||||    
T  1301864 gagacatat 1301856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 553 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 8659957 - 8659725
Alignment:
Q  553 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 652  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  8659957 cagatgcaaagagattaattggtaggaagtttagtgattcagttgttcaaaaagacatgatgttgtggccattcaaggttatcgctggtgtgaacgacaa 8659858  T
Q  653 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 752  Q
    ||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  8659857 actcatgattaatgttcagtacaagggtcaggagaagcacttttgtgcggaggaaatatcatctatggtacttacaaaaatgcgagaagttgcagagaca 8659758  T
Q  753 tatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    ||| ||   ||||| || |||||||| ||||||    
T  8659757 tatctaatgtcacctgtgaagaatgctgttgtt 8659725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 553 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 17268533 - 17268308
Alignment:
Q  553 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 652  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||    
T  17268533 cagatgctaagagactaattggtaggaagtttagtgatcctgtggtccaaaaagatataatgtcgtggccattcaaggtcattgcggatatgaatgacaa 17268434  T
Q  653 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 752  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| | |||||| ||  ||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  17268433 accaatgatttccctcaagtacaagggacgggagaaacacttttgtgcagaggaaatttcgtctatggtactcacaaagatgcgggagattgctgaggaa 17268334  T
Q  753 tatttagaatcaccggttaagaatgc 778  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  17268333 tatctagaatcatcggttatgaatgc 17268308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 554 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 3147865 - 3147634
Alignment:
Q  554 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 653  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |   || || |||||||||    
T  3147865 agatgcaaagaggttaattggtaggaagtttggtgattctgttgttcaaaatgatatgatgttgtggccattcaaggtcatttgcggagtgaatgacaaa 3147766  T
Q  654 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcat 753  Q
    || |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| | || |||||||||||  | | ||| ||||  |    
T  3147765 cccatgatttcggttaagtgcaagggacaggagaagcacctatgtgctgaagaaatctcatctatggttctaacaaagatgcgcaagactgcagaggagt 3147666  T
Q  754 atttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
     ||||||||  || || |||||||||||||||    
T  3147665 ttttagaattgcctgtcaagaatgcagttgtt 3147634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 553 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 8629126 - 8628961
Alignment:
Q  553 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 652  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| | ||||||||    
T  8629126 cagatgccaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcctgttgttcaaaaggatatcatgttctggccattcaaggttatttctggtcttaatgacaa 8629027  T
Q  653 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctat 718  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||| ||||||||||    
T  8629026 gcctatgattgctgttaagtacaagggtcaagagaagaacctatgtgctgaggaaatatcatctat 8628961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 226 - 448
Target Start/End: Original strand, 27829256 - 27829478
Alignment:
Q  226 atggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatca 325  Q
    ||||| ||||||||||||||   |  ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||   | |||| ||||| |    
T  27829256 atggcgaaaaagtatgaagggctttctgtgggaattgacctaggtacaacgtactcgtgcgttgcagcgtggcaggatcaacacaacagagtggagatta 27829355  T
Q  326 ttcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaa 425  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||    
T  27829356 ttcacaatgaacaaggcaacaagacaacaccttcttgtgttgctttcacggacaaacagaggttgattggtgatgctgctaagaaccaagctgcttccaa 27829455  T
Q  426 ccctcaaaacactgtctttggta 448  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  27829456 ccctcaaaacactatctttggta 27829478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 256 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17261553 - 17261359
Alignment:
Q  256 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 355  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  17261553 ggaatagaccttgggacgacatactcttgtgttgccgtatggcatgaagaacatggtagagttgagatcattcacaatgatcaaggaaacaaaattactc 17261454  T
Q  356 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaat 450  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  17261453 cttcttttgttgcttttgctaaagatgaaaggttgatcggtgatgccgctaagaatcaagctgccataaacccagaaaacaccgtctttggtaat 17261359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 314 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3148474 - 3148339
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3148474 gagttgagattattcacaatgaccaaggcaacaaaaccacaccttcttttgttgctttcactgatgatcaaaggttggttggtgatgctgctaagaatca 3148375  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 449  Q
    |||  |    |||||| |||||||||| ||||||||    
T  3148374 agctcccacaaaccctgaaaacactgtttttggtaa 3148339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 554 - 781
Target Start/End: Original strand, 27830450 - 27830677
Alignment:
Q  554 agatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaa 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| | |||||||  ||||||| |||||| |||| | ||| ||| ||  |||||    
T  27830450 agatgctaagaggttaattggtaggaagttcagcgatgatgttgttcaaaaagatataaacttgtggctattcaaagtcattactgatgtaaacaacaaa 27830549  T
Q  654 cctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcat 753  Q
    || ||| ||   |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||| | ||||| ||| | || |||||||||||||| || || |||||||    
T  27830550 cccatgtttgttgttaagtacaagagtcaggagaaacacttatgtgcggaggaaatttcatcaatggtccttacaaagatgcgagagatcgcggaggcat 27830649  T
Q  754 atttagaatcaccggttaagaatgcagt 781  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27830650 atttgcaatcaccggttaagaatgcagt 27830677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 232 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6790595 - 6790378
Alignment:
Q  232 aaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcaca 331  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||  ||  ||||     |||||||||| |||||||    
T  6790595 aaaaaatacgaaggatgtgctgtgggaatagacctgggaacaacatattcttgtgttggtgtgtggcttgatgaacacaatagagttgagattattcaca 6790496  T
Q  332 atgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctca 431  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||   |||||| ||    
T  6790495 atgaccaaggtaacaaaaccacaccttcttttgttgctttcaccgatgaccaaaggttgatcggtgatgctgctaagtatcaagctgccaccaacccgca 6790396  T
Q  432 aaacactgtctttggtaa 449  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  6790395 aaacactatcttcggtaa 6790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 547 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 8647474 - 8647239
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||| ||   | || ||    
T  8647474 tttttccagatgctaagaggttaatcggtaggaagttttttgattctgttgttcagaatgataagaagttgtggccattcaaggtcattg---gggtgaa 8647378  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 746  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| | ||||||| |  ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||     
T  8647377 tgacaaacccatgattattgttaaatacaagggtgaagagaagcgttattgtgctgaggaaatatcatcgatgatcctcacaaagatgcgagaggttgca 8647278  T
Q  747 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    |||  |||||||   || || || |||||||||||||||    
T  8647277 gagaaatatttaatgtcccctgtaaagaatgcagttgtt 8647239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 547 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 8546232 - 8545998
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    |||||||  ||||| || |||||||||| || ||||||| | | ||||| ||    
T  8546232 tttttgcagatgcaaagaggttaattggaaggaaatatagtgattcctttgttcagaatgatctactgttgtggccctttaaggtcatttccggtgttaa 8546133  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgt-gctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 745  Q
    ||||||||| |  |||   || || ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||    
T  8546132 tgacaaaccgacaattcttgtgaactacaagggtgaggaaaagca-ctttgttgctgaagaaatatcatctgtgatcctctcacagatgcgagagattgc 8546034  T
Q  746 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagt 781  Q
     ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  8546033 agaggcatttttggagtcacctgttaagaatgcagt 8545998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 325 - 413
Target Start/End: Original strand, 7876844 - 7876932
Alignment:
Q  325 attcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7876844 attcacaatgaacaaggcaacagaacaacaccttcttttgttgctttcacgaatgatcaaaggttgattggtgatgctgccaaaaatca 7876932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8582824 - 8582664
Alignment:
Q  256 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 355  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |    || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  8582824 ggaattgaccttggtacaacctactcatgtgttggagtgtggcaggagcaaaacgatcgtgtggaaatcatacacaatgatcaaggaaacaaaacaacac 8582725  T
Q  356 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 416  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8582724 cttcttgtgttgcttttactaattctcaaagattgattggtgatgctgccaaaaatcaagc 8582664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8660427 - 8660248
Alignment:
Q  234 aaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaat 333  Q
    |||||| |||||| ||| | | ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||| |||| | ||    ||||| ||||||||  ||||     
T  8660427 aaagtacgaaggacgtgctattggaatagaccttggaacaacctattcgtgtgttgctgtgtggctggagaatcacaatcgagtcgagatcatctacaac 8660328  T
Q  334 gaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8660327 gaccaaggaaacaaaacaacaccttcatttgttgctttcactgacgatcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 8660248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8668568 - 8668433
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8668568 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaaccgaataacaccttcttttgttgctttcaacaatgaacaaaggttgattggcgatgctgctaagaatca 8668469  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 449  Q
    | | |||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  8668468 atctgctactaaccctgaaaacactatctttggtaa 8668433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 553 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 17260835 - 17260617
Alignment:
Q  553 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 652  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  || || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||    
T  17260835 cagatgctaagagactagttggtaggaagtttagtgatcctgtggtccaaaaagatataatgtcgtggccattcaaggtcattgcggatatgaatgacaa 17260736  T
Q  653 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 752  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| | |||||| ||  ||||||| || ||| | || |||||| ||||    |||||||| || |||||||||| |    
T  17260735 accaatgatttccctcaagtacaagggacgggagaaacacttttgtgcagaggaaatctcgtctatggtacttgtgaagatgcgggagattgctgaggta 17260636  T
Q  753 tatttagaatcaccggtta 771  Q
    ||| | |||||| ||||||    
T  17260635 tatcttgaatcatcggtta 17260617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8572751 - 8572591
Alignment:
Q  256 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 355  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||| |    
T  8572751 ggaattgaccttggcacgacttactcatgtgttggagtgtggcaggagcaaaatgatcgtgttgaaatcatacacaatgaccaaggaaacagaacaactc 8572652  T
Q  356 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 416  Q
    | |||||||||||||| |||||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8572651 cctcttgtgttgcttttactaattctcaaagattgatcggtgatgctgccaaaaatcaagc 8572591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 543 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 8582304 - 8582066
Alignment:
Q  543 ttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtg 642  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    |||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  8582304 ttaattttttcagatgcaaagaggttaattggaaggaaatatagtgattccattgttcaaaaggatatcaagttgtggcccttcaaggtcaccgcaggtg 8582205  T
Q  643 tcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaat 742  Q
      ||||||||||| |  ||    || || ||||||||| |||| || ||  ||  |||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||| ||    
T  8582204 ctaatgacaaaccgacaatcgttgtgaactacaagggtaaggaaaaacactttcttgctgaagaaatatcatctgttattctgacacagatgcgagagat 8582105  T
Q  743 tgctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagt 781  Q
    ||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  8582104 tgcagaggcatttttggagtcacctgttaagaatgcagt 8582066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 448
Target Start/End: Original strand, 13332149 - 13332283
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13332149 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaatagaactacaccttcttttgttgctttcaacaatgatcaaagattgattggtgatgctgccaagaatca 13332248  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 448  Q
    | | ||    |||||| |||||||| |||||||||    
T  13332249 atctgccactaaccctgaaaacactatctttggta 13332283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 407
Target Start/End: Original strand, 8635502 - 8635591
Alignment:
Q  318 tgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaa 407  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8635502 tgagatcatccacaatgagcaagggaacagaatcacaccttcttgtgttgctttcactgacgcacaaaggttgattggtgatgctgccaa 8635591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1302503 - 1302315
Alignment:
Q  225 catggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatc 324  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| || || || || || ||||| || ||||||| |||| | ||     |||| ||||||    
T  1302503 catggcgataaagtacgaaggacgtgctgttggaatagaccttggaactacttattcgtgtgttgctgtgtggctggagaatcacaatagagtagagatc 1302404  T
Q  325 attcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    ||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1302403 atctacaacgaccaaggcaacaaaacaacaccgtcttttgttgctttcaccgatgatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatca 1302315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8546770 - 8546679
Alignment:
Q  322 atcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8546770 atcattcacaatgatcaaggaaacaaaacaacaccttcttgtgttgctttcacaaattcccaaaggctgattggtgatgctgccaaaaatca 8546679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8647804 - 8647669
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  8647804 gagttgagattattcacaatgatcaaggaaacagaactacaccttcttttgttgctttcaccgatgatcaaaggttgattggtgatgccgctaaaaatca 8647705  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 449  Q
     || |||   ||||||   |||||||||||||||||    
T  8647704 ggctgcttctaaccctaccaacactgtctttggtaa 8647669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 319 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 8591496 - 8591362
Alignment:
Q  319 gagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcag 418  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || |    
T  8591496 gagattattcacaatgatcaaggaaatagaattacaccttcttttgttgcttttactaatgatcaaaggttgattggtgatgctgcaaaaaaccaggctg 8591397  T
Q  419 ctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaattta 453  Q
    ||   |||||   |||||||||||| |||||||||    
T  8591396 cttctaacccagcaaacactgtcttcggtaattta 8591362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8630331 - 8630197
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||  | |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  8630331 gagttgagattattcacaatgatgaaggcaataaaatcacaccttccttcgttgcttttaccgatgatcaaaggttggttggtggtgctgctaaggatca 8630232  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 448  Q
     || ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8630231 ggctgccatcaacccacaaaacactgtctttggta 8630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17269261 - 17269067
Alignment:
Q  256 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 355  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||  |  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||  || |    
T  17269261 ggaatagaccttgggacgacatactcatgtgttgctgtgtggcatgaagaacacggtagagttgagattatacacaatgatcaaggcaacaaaactactc 17269162  T
Q  356 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaat 450  Q
    | |||| |||||||||  |||||||| ||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  17269161 cgtcttttgttgcttttgctaaagatgaaaggtttatcggtgattccgctaagaatcaagctgccatgaacccagaaaacaccgtctttggtaat 17269067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8568904 - 8568839
Alignment:
Q  351 aacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8568904 aacaccttcttgtgttgctttcactaaatctcaaagattgattggtgatgctgccaaaaatcaagc 8568839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 448
Target Start/End: Original strand, 8584535 - 8584669
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  8584535 gagttgagattattcacaacgatgaaggcaataaaatcacaccttcctttgttgcttttaccgatgatcaaaggttggttggtggtgctgctaaggatca 8584634  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 448  Q
     || ||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  8584635 ggctgctatcaacccagagaacactgtctttggta 8584669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 448
Target Start/End: Original strand, 10493000 - 10493134
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10493000 gagttgaaattattcacaatgatcaaggaaatagaactacaccttcttttgttgctttcaacaatgatcaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatca 10493099  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 448  Q
    | | ||    |||||| ||||||| ||||||||||    
T  10493100 atctgccactaaccctgaaaacaccgtctttggta 10493134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8538965 - 8538805
Alignment:
Q  256 ggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacac 355  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||| |    || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  8538965 ggaattgaccttggcacgacctactcatgtgttggagtgtggcaggagcaaaacgatcgtgtggagatcatacacaacgatcaaggaaacaaaaccacac 8538866  T
Q  356 cttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 416  Q
    |||||||||||| ||| | |||   |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8538865 cttcttgtgttggttttagtaattctcaacgattgattggtgatgctgccaaaaatcaagc 8538805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 739
Target Start/End: Original strand, 8640164 - 8640306
Alignment:
Q  594 gttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatc 693  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||   | || ||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||| | ||||||| |     
T  8640164 gttgttcaaaatgatatgaagttgtggccattcaaggtcattg---gggtgaatgacaaacccacgattattgttaaatacaagggtgaagagaagcgtt 8640260  T
Q  694 tttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgaga 739  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  8640261 tttgtgccgaggaaatatcatctatgatcctttcgaagatgcgaga 8640306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 8591119 - 8591000
Alignment:
Q  666 gttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcac 765  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    | ||| || ||||    
T  8591119 gttaagtacaagggtgaggaaaagcgtctttgtgcggaggaaatctcatccatggttctcacaaagatgcgagagattgctgaaaagtttttggagtcac 8591020  T
Q  766 cggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    | || |||||||||||||||    
T  8591019 ctgtcaagaatgcagttgtt 8591000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8655452 - 8655317
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||  ||  |||||||    
T  8655452 gagttgagattattcacaatgatcaaggcaatagaactacaccttctgttgttgctttcactgattatcaaaggttgattggcaatggagctgagaatca 8655353  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggtaa 449  Q
    | | |||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8655352 atctgctaccaaccccgaaaacactgtatttggtaa 8655317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8602832 - 8602738
Alignment:
Q  319 gagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  || ||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8602832 gagattattcacaatgatcaaggaaacagaactactccttcttttgttgcttttactgatgataaaaggttgatcggtgatgctgccaaaaatca 8602738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 646 - 781
Target Start/End: Original strand, 8636010 - 8636145
Alignment:
Q  646 atgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 745  Q
    |||||||||| ||||||   || || ||||||||| |  | ||||| |||| | |||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||| |||||    
T  8636010 atgacaaacccatgattgttgtgaaatacaagggtgaacaaaagcaactttttcctgaggaaatatcgtctatggtcctgacaaagatgcgagagattgc 8636109  T
Q  746 tgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagt 781  Q
    |||||||||| | |||||| | || |||||||||||    
T  8636110 tgaggcatatctggaatcatctgtcaagaatgcagt 8636145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 8570759 - 8570677
Alignment:
Q  699 gctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagt 781  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||| || || || ||||||||||||||    
T  8570759 gctgaagaaatatcatctgtgattctctcaaagatgcgagagattgcagaagcatttttggagtctcctgttaagaatgcagt 8570677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8577378 - 8577290
Alignment:
Q  328 cacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 416  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8577378 cacaatgatcaaggaaacagaaccactccttcttgtgttgcttttaccaattctcaaagattgattggcgatgctgccaaaaatcaagc 8577290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 8559937 - 8559702
Alignment:
Q  543 ttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtg 642  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||    | || |||  |||| || |||||||||| || |||||||  ||||| |    
T  8559937 ttaatttttgcagatgcaaagaggttaattggaaggaaatacagtgattccatagtccaaagtgatgtactgttgtggccctttaaggtcatcgctggcg 8559838  T
Q  643 tcaatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaat 742  Q
      ||||||||||| | | |    || || |||| |||  |||| |||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  8559837 ataatgacaaaccaacggtccttgtgaaatacaggggcaaggaaaagcatcttgttgccgaagaaatatcagctatgattctcacacagatgcgagagat 8559738  T
Q  743 tgctgaggcatatttagaatcaccggttaagaatgc 778  Q
    ||| || |||| ||| || ||  ||||| |||||||    
T  8559737 tgcagaagcatttttggagtcgacggttgagaatgc 8559702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 8570915 - 8570868
Alignment:
Q  543 ttaatttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgat 590  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8570915 ttaatttttgcagatgtaaagaggttaattggaaggaagtatagtgat 8570868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 318 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8610763 - 8610665
Alignment:
Q  318 tgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 416  Q
    |||||| || || ||||| ||||| |||| ||  || ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8610763 tgagataatccataatgagcaaggaaacagaaccactccttcttttgttgctttctctggtgatcaaaggttgataggtgatgctgctaaaaatcaagc 8610665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8104166 - 8104069
Alignment:
Q  316 gttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| |   | |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8104166 gttgagatcattgctaatgatcaagggaacagaacgacaccgtcttatgttgctttcactgatagtgaaaggttgatcggtgatgctgctaagaatca 8104069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 8576775 - 8576722
Alignment:
Q  698 tgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggc 751  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  8576775 tgctgaagaaatatcatctgtgattctctcaaagatgcgagagattgcagaggc 8576722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 547 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28220551 - 28220316
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||    ||    
T  28220551 ttttttcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgactctgttgttcaagatgatataaagttgtggccattcaaggtcatttccggaacgaa 28220452  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgct 746  Q
     |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||| || |||||     
T  28220451 cgacaaacccatgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatctcatctatggttctaacaaagatgcgtgagattgca 28220352  T
Q  747 gaggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagtt 782  Q
    ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||||    
T  28220351 gaggcctttttggaatttcctgtcaagaatgcagtt 28220316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 314 - 448
Target Start/End: Original strand, 42554186 - 42554320
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  42554186 gagttgagattattcacaatgatcaaggcaacaaaacaacaccttcttttgttgcttttactcatcatgaaaggttgattggtgatgctgctaaggatca 42554285  T
Q  414 agcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 448  Q
    | | ||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  42554286 aaccgccaccaacccccaaaacactgtctttggta 42554320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28221122 - 28220915
Alignment:
Q  242 aaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaagg 341  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||||| || || ||||| || |||||||| ||  ||||     | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28221122 aaggatgtgctgtgggaatagatcttggaacaacgtattcatgtgttgctgtgtggcaagatgaacacaatagggttgagattattcacaatgatcaagg 28221023  T
Q  342 caacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtc 441  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||   |||||| ||||| || |||    
T  28221022 caacaaaacaactccttcttttgttgctttcaccgatgatgaaaggttgattggcgatgctgctaaaaatcaaacggccaacaacccccaaaataccgtc 28220923  T
Q  442 tttggtaa 449  Q
    ||||||||    
T  28220922 tttggtaa 28220915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 565 - 785
Target Start/End: Original strand, 42555530 - 42555750
Alignment:
Q  565 ggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaaacctatgattac 664  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| | | ||  | |||| ||| || ||||||      
T  42555530 ggttaattggtaggaagtttaatgattatgttgttcaaaatgacatgaagttgtggccattcaaggtcatttccggaataaatggcaagcccatgattta 42555629  T
Q  665 cgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggcatatttagaatca 764  Q
     || | |||| |||| |||||||| || || || || |||||| | ||||||||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||| ||| |||       
T  42555630 tgtaacgtacgagggacaggagaaacacctatgcgccgaagaaatctcatctatgattctaacaaagatgcgcaagattgcagaggcatttttggaaatg 42555729  T
Q  765 ccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    || || |||||||||||||||    
T  42555730 cctgtcaagaatgcagttgtt 42555750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 548 - 782
Target Start/End: Original strand, 34466362 - 34466596
Alignment:
Q  548 ttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaat 647  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  | |||||||   ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  34466362 tttttcagatgctaagaggttaattggcagaaaatttagtgatcctgatgttcaaacagatatgatgttatggccattcaaagttattgctggtgttaat 34466461  T
Q  648 gacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctg 747  Q
    ||||| || |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||  |||||||||| || | ||| |    
T  34466462 gacaagccaatgatttcccttaagtataagggtcaggagaagcacctatgtgctgaggaaatctcatctatgatcctttcaaagatgcgggatactgcag 34466561  T
Q  748 aggcatatttagaatcaccggttaagaatgcagtt 782  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  34466562 aggaatatttggaatcaccaattaagaatgcagtt 34466596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 452
Target Start/End: Original strand, 34465158 - 34465385
Alignment:
Q  225 catggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatc 324  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  |  |||| |||||     
T  34465158 catggcgaaaaaatgtgaaggacgtgctgtgggaatagaccttggcacaacctactcatgtgttgcagtatggcaggaacaacacagtagagtagagatt 34465257  T
Q  325 attcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtca 424  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||  ||    
T  34465258 attgacaatgaccaaggtaacacaaccacaccttcttttgttgcttttactcatgatcaaagattgatcggtaatgctgctaagaatcaaactgctacca 34465357  T
Q  425 accctcaaaacactgtctttggtaattt 452  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||    
T  34465358 acccacagaacactgtttttggtaattt 34465385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 546 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 15595638 - 15595447
Alignment:
Q  546 atttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagtt-gttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtc 644  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  15595638 attttttcagatgctaagagattaatcagtaggaagtttagtgattctgtttgttcaaaatgatataaagttgtggccattcaaggtcattg---gtgtg 15595542  T
Q  645 aatgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgaga 739  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  15595541 aatgacaaacccatgattattgttaaatacaagggtcaagaaaagcgcttttgtgctgaggaaatatcgtctatgattctcaaaaagatgcgaga 15595447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 4677459 - 4677674
Alignment:
Q  234 aaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaat 333  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||| |||| | ||   | |||| ||||| ||| |||||    
T  4677459 aaagtatgaaggacgtgctgtgggaatagatcttggaactacttattcatgtgttgctgtgtggctggagaatcacaacagagtggagattatttacaat 4677558  T
Q  334 gaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaa 433  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |||| || |||    
T  4677559 gaacaaggcaacaaaacaacaccttcttttgttgcttttactgatgatcaaaggttgattggtaatgctgctaagaatcaatctgccaccaactctgaaa 4677658  T
Q  434 acactgtctttggtaa 449  Q
    ||||||||||||||||    
T  4677659 acactgtctttggtaa 4677674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 547 - 745
Target Start/End: Original strand, 4678126 - 4678324
Alignment:
Q  547 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||| | || || |||||||||||||| | |||||   ||||||  ||    
T  4678126 tttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaggtatagtgattctgttgttcaaaaagacatcatgttgtggccatttagggtcatcactggtgagaa 4678225  T
Q  647 tgacaaacctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgc 745  Q
    ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  4678226 tgataaaccgatgattagtgttaagtacaagggtcaagagaagcaagttagtgttgaggaaatatcatcgatgatccttacaaagatgagagaagttgc 4678324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15596162 - 15596060
Alignment:
Q  314 gagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15596162 gagtcgagattatccacaatgaccaaggaaacagaattacaccttcttttgtttctttcactaatgatcaaaggttgattggtgatgctgctaagagtca 15596063  T
Q  414 agc 416  Q
    |||    
T  15596062 agc 15596060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 557 - 642
Target Start/End: Original strand, 52549098 - 52549183
Alignment:
Q  557 tgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtg 642  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  52549098 tgctaagaggttaattggtaagaagtttagtgatcctgttgttcaagatgatatattgttatggtcattcaaggtcactgccggtg 52549183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 43745441 - 43745209
Alignment:
Q  553 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| | | ||  | ||||||||    
T  43745441 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttaatgattctgatgttcaaaatgatatgaagttgtggccgttcaaggtcatttccggattgaatgacaa 43745342  T
Q  653 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaagcatctttgtgctgaagaagtatcatctatgatactcacaaagatgcgagaaattgctgaggca 752  Q
    |||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||    
T  43745341 acccgtgatttctgttaagtacaagggacaggagaagcacctatgtgccgaagaaatctcatctatgattctaacaaagatgcgtgagattgcagagaca 43745242  T
Q  753 tatttagaatcaccggttaagaatgcagttgtt 785  Q
    | |||  |||  || || |||||||||||||||    
T  43745241 tttttgcaattgcctgtcaagaatgcagttgtt 43745209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12530059 - 12529869
Alignment:
Q  226 atggctaaaaagtatgaaggatgtgttgtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatca 325  Q
    ||||| |||||||||||||||  || | | ||||| || || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||  |   || || || || |    
T  12530059 atggcaaaaaagtatgaaggagttgctataggaattgatcttggcacaacttactcatgtgttggagtatggcaagagcaaactgatcgtgtggaaataa 12529960  T
Q  326 ttcacaatgaccaaggcaacaaaataacaccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagc 416  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12529959 ttcacaatgatcaaggaaacaaaacaacaccttcttgtgttgcttttactaattctcagagattgattggtcatgctgccaaaaatcaagc 12529869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 43745985 - 43745793
Alignment:
Q  253 gtgggaatagacctcggcacaacatactcttgtgtcgcagtgtggcaggagcaacattgccgagttgagatcattcacaatgaccaaggcaacaaaataa 352  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||  ||||     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||    
T  43745985 gtgggaatagaccttggaacaacgtattcgtgtgttgctgtgtggcaagatgaacaaaatagagttgagattattcacaatgatcaaggcaacaa---aa 43745889  T
Q  353 caccttcttgtgttgctttcactaaagatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatcaagcagctgtcaaccctcaaaacactgtctttggta 448  Q
    || |||||| ||||||||| ||| |  || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||   |||||||||||||||  |||||||||    
T  43745888 caacttcttttgttgcttttactgatcatgaaaggttgataggtgacgctgctaagaatcaaaccgccaccaaccctcaaaacaccatctttggta 43745793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 548 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 12529103 - 12528996
Alignment:
Q  548 ttttgcagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtga-tcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaa 646  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || | | |||||  | |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  12529103 ttttgcagatgcaaagaggttaattggaagaaagtatagtgactcca-tagttcagaaggatcaactgttgtggccatttaaggtcactgctggtgctaa 12529005  T
Q  647 tgacaaacc 655  Q
    |||||||||    
T  12529004 tgacaaacc 12528996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 553 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 28911176 - 28911040
Alignment:
Q  553 cagatgctaagaggttaattggtaggaagtttagtgatcaagttgttcaagatgatataatgttgtggccattcaaggtcactgctggtgtcaatgacaa 652  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||  |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28911176 cagatgctaagaggataattgataggaagtttagtgatcccgttgttcaaaacgattcaatgttgtcgccgttcaaggtcattgccggtgtcaatgacaa 28911077  T
Q  653 acctatgattaccgttaagtacaagggtcaggagaag 689  Q
     || |||||  | || |||||||||| ||||||||||    
T  28911076 ccccatgatatctgtcaagtacaaggatcaggagaag 28911040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28911352 - 28911318
Alignment:
Q  379 gatcaaaggttgattggtgatgctgccaagaatca 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28911352 gatcaaaggttgattggtgatgctgctaagaatca 28911318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University