View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18140_low_14 (Length: 335)

Name: NF18140_low_14
Description: NF18140
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18140_low_14
NF18140_low_14
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (16-335)||(1108106-1108425)
chr2 (189-335)||(30420226-30420373)
chr2 (187-335)||(31517274-31517423)
chr2 (184-335)||(33906106-33906258)
chr2 (187-335)||(3873303-3873452)
chr2 (190-335)||(28329896-28330042)
chr2 (184-335)||(26323245-26323397)
chr2 (186-331)||(18806947-18807093)
chr2 (186-335)||(39635448-39635598)
chr2 (200-334)||(1482963-1483096)
chr2 (186-335)||(4232201-4232351)
chr2 (184-335)||(19901197-19901348)
chr2 (190-335)||(4016039-4016185)
chr2 (186-335)||(6174887-6175037)
chr2 (200-335)||(16066353-16066488)
chr2 (204-335)||(5733414-5733545)
chr2 (186-335)||(42937715-42937866)
chr2 (186-335)||(2178828-2178978)
chr2 (184-335)||(30270738-30270890)
chr2 (186-335)||(16588835-16588985)
chr2 (203-335)||(19383994-19384126)
chr2 (203-333)||(429830-429960)
chr2 (190-331)||(850997-851139)
chr2 (200-314)||(44947622-44947736)
chr2 (186-321)||(42446642-42446778)
chr2 (225-331)||(22101210-22101316)
chr2 (191-329)||(3585291-3585430)
chr2 (212-322)||(12517256-12517366)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (184-335)||(9008116-9008268)
chr5 (186-335)||(27679228-27679378)
chr5 (186-335)||(1579035-1579185)
chr5 (186-335)||(1605630-1605780)
chr5 (184-335)||(24105730-24105882)
chr5 (184-335)||(27420855-27421007)
chr5 (184-335)||(33491255-33491407)
chr5 (184-335)||(35782703-35782855)
chr5 (184-335)||(16069350-16069502)
chr5 (200-335)||(3386545-3386680)
chr5 (200-335)||(16737506-16737641)
chr5 (186-335)||(8374397-8374547)
chr5 (184-335)||(19358523-19358675)
chr5 (185-335)||(4120935-4121086)
chr5 (184-335)||(20992205-20992357)
chr5 (186-335)||(33991139-33991289)
chr5 (203-335)||(1165660-1165792)
chr5 (184-335)||(3921578-3921730)
chr5 (186-335)||(38598509-38598659)
chr5 (187-335)||(5202972-5203121)
chr5 (185-331)||(31883142-31883289)
chr5 (184-321)||(20992354-20992496)
chr5 (223-334)||(26603002-26603113)
chr5 (203-327)||(33284642-33284766)
chr5 (204-333)||(31410494-31410623)
chr5 (231-335)||(27025001-27025105)
chr5 (186-320)||(25634581-25634714)
chr5 (215-322)||(31638174-31638281)
chr5 (252-305)||(41818552-41818605)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (187-335)||(23776506-23776655)
chr4 (189-335)||(1756811-1756958)
chr4 (185-335)||(54189540-54189691)
chr4 (184-335)||(14987786-14987938)
chr4 (184-335)||(20877041-20877193)
chr4 (186-335)||(50055148-50055298)
chr4 (187-335)||(19913677-19913826)
chr4 (187-335)||(38055154-38055303)
chr4 (184-335)||(8932225-8932377)
chr4 (184-335)||(50353795-50353947)
chr4 (204-335)||(37968804-37968935)
chr4 (186-335)||(27488695-27488845)
chr4 (186-335)||(53717511-53717661)
chr4 (191-335)||(16700782-16700927)
chr4 (188-335)||(11639625-11639773)
chr4 (203-335)||(28032759-28032891)
chr4 (184-335)||(30423611-30423763)
chr4 (184-335)||(45424581-45424733)
chr4 (185-335)||(44784964-44785115)
chr4 (189-335)||(54412627-54412774)
chr4 (186-335)||(2481455-2481605)
chr4 (186-335)||(6611407-6611557)
chr4 (191-335)||(19165019-19165164)
chr4 (190-335)||(35490820-35490966)
chr4 (186-334)||(37464717-37464866)
chr4 (188-335)||(40428767-40428915)
chr4 (186-333)||(50053439-50053587)
chr4 (186-335)||(15241075-15241225)
chr4 (186-335)||(43290007-43290157)
chr4 (186-335)||(48909842-48909992)
chr4 (184-335)||(23704256-23704408)
chr4 (204-335)||(31969696-31969827)
chr4 (203-334)||(38071368-38071499)
chr4 (186-335)||(15669179-15669329)
chr4 (190-335)||(52139203-52139349)
chr4 (200-335)||(8591139-8591274)
chr4 (191-333)||(53875658-53875801)
chr4 (190-335)||(1617084-1617230)
chr4 (187-335)||(6688674-6688817)
chr4 (203-335)||(28360444-28360577)
chr4 (191-335)||(30171581-30171726)
chr4 (188-335)||(47632032-47632181)
chr4 (203-331)||(27583683-27583811)
chr4 (184-335)||(53353049-53353209)
chr4 (186-335)||(27536151-27536297)
chr4 (203-335)||(33703855-33703987)
chr4 (186-335)||(44379234-44379384)
chr4 (211-334)||(16703843-16703966)
chr4 (189-335)||(44375844-44375991)
chr4 (203-331)||(40680089-40680217)
chr4 (186-335)||(55344872-55345022)
chr4 (184-274)||(23265865-23265956)
chr4 (184-331)||(44548192-44548341)
chr4 (266-335)||(23269093-23269162)
chr4 (255-331)||(51780769-51780845)
chr4 (226-331)||(17493370-17493475)
chr4 (186-243)||(9595974-9596031)
chr4 (276-333)||(55344724-55344781)
chr4 (291-327)||(9595946-9595982)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (184-335)||(42307950-42308102)
chr3 (189-335)||(38856089-38856236)
chr3 (186-335)||(37698188-37698338)
chr3 (187-335)||(25999382-25999531)
chr3 (184-335)||(15520187-15520339)
chr3 (186-335)||(22175035-22175185)
chr3 (186-335)||(50528922-50529072)
chr3 (184-335)||(8042598-8042750)
chr3 (203-335)||(21581053-21581185)
chr3 (187-335)||(25494330-25494479)
chr3 (188-335)||(20699144-20699292)
chr3 (186-335)||(15520629-15520779)
chr3 (186-335)||(29445481-29445631)
chr3 (186-335)||(46452207-46452357)
chr3 (186-335)||(54534373-54534521)
chr3 (184-335)||(12117703-12117855)
chr3 (184-335)||(20842393-20842545)
chr3 (184-335)||(32244111-32244263)
chr3 (186-335)||(35226440-35226590)
chr3 (186-331)||(54870223-54870369)
chr3 (184-335)||(32359250-32359402)
chr3 (200-335)||(44609378-44609513)
chr3 (187-335)||(26122808-26122957)
chr3 (186-330)||(38933939-38934083)
chr3 (203-335)||(2895196-2895328)
chr3 (188-331)||(35643212-35643356)
chr3 (203-335)||(42105016-42105148)
chr3 (203-326)||(50529827-50529950)
chr3 (186-331)||(34700334-34700480)
chr3 (186-335)||(24835744-24835894)
chr3 (213-335)||(44688782-44688903)
chr3 (184-320)||(49128040-49128177)
chr3 (225-335)||(16354379-16354489)
chr3 (200-331)||(48925052-48925181)
chr3 (186-335)||(53028218-53028360)
chr3 (215-335)||(12915930-12916049)
chr3 (184-242)||(24366083-24366142)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (185-335)||(18594534-18594685)
chr8 (186-335)||(39206584-39206734)
chr8 (187-335)||(14422702-14422851)
chr8 (187-335)||(29938060-29938209)
chr8 (187-335)||(35118090-35118239)
chr8 (190-335)||(13110406-13110552)
chr8 (188-335)||(34842424-34842572)
chr8 (184-335)||(40117911-40118063)
chr8 (186-335)||(10836814-10836964)
chr8 (186-335)||(22260689-22260839)
chr8 (186-335)||(33287084-33287234)
chr8 (192-335)||(2042583-2042727)
chr8 (184-335)||(4035843-4035995)
chr8 (184-326)||(26783801-26783944)
chr8 (182-335)||(6144332-6144486)
chr8 (186-335)||(24113225-24113375)
chr8 (186-335)||(39218775-39218925)
chr8 (190-333)||(8021721-8021865)
chr8 (184-335)||(34998955-34999107)
chr8 (191-335)||(144397-144542)
chr8 (200-335)||(34679516-34679651)
chr8 (187-335)||(38167214-38167363)
chr8 (191-335)||(41575516-41575661)
chr8 (200-333)||(44805005-44805138)
chr8 (187-335)||(33278399-33278548)
chr8 (200-335)||(7774777-7774912)
chr8 (200-335)||(28639291-28639430)
chr8 (189-335)||(7791412-7791559)
chr8 (187-333)||(5320563-5320710)
chr8 (185-335)||(36491154-36491305)
chr8 (186-335)||(7811993-7812143)
chr8 (192-331)||(42571598-42571735)
chr8 (184-331)||(2322075-2322223)
chr8 (200-335)||(66239-66374)
chr8 (200-315)||(5005179-5005294)
chr8 (266-333)||(9807339-9807406)
chr8 (203-331)||(39220272-39220400)
chr8 (190-274)||(9806875-9806960)
chr8 (203-322)||(18683726-18683844)
chr8 (203-322)||(18729288-18729406)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (185-335)||(30181073-30181224)
chr7 (189-335)||(7164184-7164331)
chr7 (185-335)||(12101227-12101378)
chr7 (186-335)||(33846573-33846723)
chr7 (187-335)||(33359139-33359288)
chr7 (184-335)||(42204149-42204302)
chr7 (184-331)||(42965049-42965197)
chr7 (186-335)||(24792381-24792531)
chr7 (182-335)||(43068022-43068176)
chr7 (184-335)||(4347268-4347420)
chr7 (188-335)||(20346487-20346635)
chr7 (187-333)||(22649745-22649892)
chr7 (184-331)||(3511318-3511466)
chr7 (184-335)||(15655907-15656059)
chr7 (184-335)||(933280-933432)
chr7 (184-335)||(36890879-36891030)
chr7 (191-333)||(4477372-4477515)
chr7 (184-334)||(6394746-6394897)
chr7 (186-335)||(32041539-32041689)
chr7 (203-335)||(1803041-1803173)
chr7 (184-335)||(5280855-5281007)
chr7 (200-335)||(43156725-43156860)
chr7 (184-333)||(19828265-19828415)
chr7 (187-335)||(25748485-25748634)
chr7 (203-335)||(38866559-38866691)
chr7 (188-333)||(8630665-8630811)
chr7 (187-335)||(12097639-12097788)
chr7 (223-335)||(16894556-16894668)
chr7 (191-335)||(42673467-42673608)
chr7 (190-335)||(9452591-9452737)
chr7 (189-331)||(17753600-17753743)
chr7 (190-335)||(46891388-46891535)
chr7 (223-335)||(48865665-48865780)
chr7 (174-331)||(37005864-37006022)
chr7 (189-335)||(46134353-46134500)
chr7 (184-283)||(37704975-37705075)
chr7 (184-323)||(43405015-43405155)
chr7 (184-314)||(43021646-43021777)
chr7 (187-331)||(36849590-36849735)
chr7 (204-277)||(27691433-27691506)
chr7 (184-331)||(15655465-15655613)
chr7 (187-323)||(30075292-30075426)
chr7 (255-322)||(20163886-20163953)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (186-335)||(36701-36851)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (186-335)||(6086658-6086808)
chr6 (178-335)||(30691841-30691999)
chr6 (186-335)||(2837543-2837693)
chr6 (187-335)||(26946935-26947084)
chr6 (186-335)||(52834-52984)
chr6 (187-335)||(26704398-26704547)
chr6 (184-335)||(3347582-3347734)
chr6 (189-335)||(3955825-3955972)
chr6 (190-335)||(17261132-17261278)
chr6 (186-335)||(21893453-21893603)
chr6 (187-335)||(9459562-9459711)
chr6 (186-334)||(35198282-35198430)
chr6 (184-335)||(18613534-18613686)
chr6 (186-335)||(11167238-11167388)
chr6 (191-335)||(34887351-34887496)
chr6 (200-335)||(1153606-1153741)
chr6 (186-335)||(16307067-16307217)
chr6 (187-331)||(20726790-20726931)
chr6 (190-335)||(28199567-28199714)
chr6 (203-335)||(30698988-30699120)
chr6 (257-335)||(33464399-33464477)
chr6 (185-265)||(33463698-33463779)
chr6 (280-335)||(53001-53056)
chr6 (224-322)||(12835084-12835183)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (186-335)||(1168499-1168649)
chr1 (186-335)||(39260405-39260555)
chr1 (186-335)||(52753206-52753356)
chr1 (184-335)||(16052090-16052242)
chr1 (184-335)||(20089465-20089617)
chr1 (186-335)||(25897370-25897520)
chr1 (186-335)||(26580329-26580479)
chr1 (186-335)||(29288145-29288295)
chr1 (184-335)||(26663252-26663404)
chr1 (200-335)||(29078527-29078662)
chr1 (182-333)||(32671571-32671723)
chr1 (185-331)||(43905649-43905796)
chr1 (186-335)||(1170503-1170653)
chr1 (186-335)||(1940806-1940956)
chr1 (190-335)||(8079768-8079914)
chr1 (187-335)||(52696788-52696937)
chr1 (184-335)||(38829063-38829215)
chr1 (190-335)||(2473722-2473868)
chr1 (186-335)||(33510480-33510630)
chr1 (186-335)||(41928554-41928704)
chr1 (187-335)||(970583-970734)
chr1 (184-335)||(46409429-46409581)
chr1 (189-335)||(5215384-5215531)
chr1 (187-335)||(40092488-40092637)
chr1 (187-335)||(42370854-42371003)
chr1 (187-328)||(12682817-12682959)
chr1 (184-333)||(49146166-49146316)
chr1 (191-334)||(8120870-8121014)
chr1 (182-333)||(13996784-13996936)
chr1 (186-335)||(2347652-2347803)
chr1 (190-331)||(19715224-19715366)
chr1 (190-335)||(46760966-46761112)
chr1 (187-335)||(15203109-15203258)
chr1 (187-335)||(51359276-51359424)
chr1 (186-335)||(17591687-17591834)
chr1 (205-335)||(17587564-17587694)
chr1 (188-335)||(29695673-29695822)
chr1 (200-335)||(23498471-23498606)
chr1 (223-334)||(40149497-40149608)
chr1 (184-335)||(7145201-7145353)
chr1 (184-335)||(6765453-6765605)
chr1 (203-335)||(15717799-15717930)
chr1 (186-333)||(15554213-15554353)
chr1 (186-318)||(52086263-52086396)
chr1 (202-331)||(23322903-23323032)
chr1 (203-306)||(38171846-38171949)
chr1 (186-323)||(5217855-5217992)
chr1 (184-260)||(5675099-5675176)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (187-335)||(23010-23159)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (190-335)||(145304-145450)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (188-335)||(3708-3856)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (186-335)||(65-215)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (184-335)||(10232-10384)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (189-335)||(354-501)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (190-335)||(65-212)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 1108106 - 1108425
Alignment:
Q  16 ctcacaacaccactagcatcagctagaagagacaatcattctacagccgtttctgataagatataaattttgtatcttgtagttatctgatctaacactt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108106 ctcacaacaccactagcatcagctagaagagacaatcattctacagccgtttctgataagatataaattttgtatcttgtagttatctgatctaacactt 1108205  T
Q  116 caagtgtaatcaaccaaaaacaattaacaaagccaacttagagtccaattaatcaataagtttagcagtaaggccccgtttggatggcttattttgagct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108206 caagtgtaatcaaccaaaaacaattaacaaagccaacttagagtccaattaatcaataagtttagcagtaaggccccgtttggatggcttattttgagct 1108305  T
Q  216 tatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatatttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1108306 tatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgccatatttt 1108405  T
Q  316 aataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1108406 aataagcctaaattttcagc 1108425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30420373 - 30420226
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30420373 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30420274  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420273 ggttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 30420226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31517423 - 31517274
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31517423 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 31517324  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517323 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 31517274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33906258 - 33906106
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906258 taaggccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 33906159  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906158 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 33906106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3873452 - 3873303
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3873452 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatca 3873353  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873352 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 3873303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329896
Alignment:
Q  190 cccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 28329896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26323397 - 26323245
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26323397 taaggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagctta 26323298  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323297 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 26323245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18807093 - 18806947
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807093 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 18806994  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18806993 atagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttt 18806947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 39635448 - 39635598
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatg-gcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39635448 aggccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatc 39635547  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39635548 atagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagc 39635598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1483096 - 1482963
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1483096 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgtttcataagct 1482998  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1482997 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcag 1482963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4232351 - 4232201
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232351 aggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 4232252  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4232251 atagtttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagc 4232201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19901348 - 19901197
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19901348 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagctta 19901250  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19901249 tcatagtttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagc 19901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016185
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagc 4016185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6175037 - 6174887
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6175037 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatc 6174938  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6174937 atagtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagc 6174887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16066488 - 16066353
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16066488 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaag-tgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagc 16066390  T
Q  299 tgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066389 tgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 16066353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 204 - 335
Target Start/End: Original strand, 5733414 - 5733545
Alignment:
Q  204 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  5733414 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgctt 5733513  T
Q  304 atgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5733514 atgtcatattttaataagcctaaattttcagc 5733545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 42937715 - 42937866
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42937715 aggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 42937814  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaat-aagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42937815 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagc 42937866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2178978 - 2178828
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatggctt-attttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2178978 aggccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 2178879  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178878 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 2178828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30270890 - 30270738
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||    
T  30270890 taaggccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagttta 30270791  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30270790 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 30270738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16588985 - 16588835
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16588985 aggctccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 16588886  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16588885 atagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagc 16588835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19384126 - 19383994
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  19384126 cttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgtt 19384027  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384026 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 19383994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 203 - 333
Target Start/End: Original strand, 429830 - 429960
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  429830 cttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataatttcataagttgct 429929  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  429930 tatgcgatattttaataagcctaaattttca 429960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 331
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851139
Alignment:
Q  190 cccgtttggatg-gcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  851097 ttttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttt 851139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44947736 - 44947622
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44947736 tggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagct 44947637  T
Q  300 gcttatgccatattt 314  Q
    |||||||||||||||    
T  44947636 gcttatgccatattt 44947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42446778 - 42446642
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||    
T  42446778 aggccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatc 42446679  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 321  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42446678 acaatttcataagctgcttatgccatattttaataag 42446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22101316 - 22101210
Alignment:
Q  225 ttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 324  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22101316 ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagccc 22101217  T
Q  325 aaatttt 331  Q
    |||||||    
T  22101216 aaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 329
Target Start/End: Original strand, 3585291 - 3585430
Alignment:
Q  191 ccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| |||  ||||| | || ||||| |||||| ||||||| |||||||| |  |||||  | |    
T  3585291 ccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaat 3585390  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3585391 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaatt 3585430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12517366 - 12517256
Alignment:
Q  212 agcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccata 311  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||||||  |||| |||||||| ||  | ||| |||| |||||||| || |||||||||| ||||| || |||    
T  12517366 agcttatgtgagcttatctactaaaataagctttcctaaaagtgtttggataccttaattaaaagagcttatcctaatttcataagcagcttaagcaata 12517267  T
Q  312 ttttaataagc 322  Q
    |||||| ||||    
T  12517266 ttttaacaagc 12517256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9008268 - 9008116
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008268 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 9008169  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008168 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 9008116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27679378 - 27679228
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679378 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 27679279  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679278 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 27679228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 1579035 - 1579185
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1579035 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 1579134  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579135 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 1579185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1605780 - 1605630
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1605780 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 1605681  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605680 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 1605630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24105882 - 24105730
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105882 taaggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 24105783  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24105782 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagc 24105730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 27420855 - 27421007
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27420855 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagttta 27420954  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27420955 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 27421007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33491407 - 33491255
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491407 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 33491308  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491307 tcatagtttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagc 33491255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35782855 - 35782703
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatggc-ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782855 taaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 35782756  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35782755 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagc 35782703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 16069350 - 16069502
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16069350 taaggtcccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctta 16069449  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069450 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 16069502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3386680 - 3386545
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3386680 tggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagct 3386581  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386580 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 3386545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16737641 - 16737506
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16737641 tggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagct 16737542  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737541 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 16737506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8374547 - 8374397
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatggc-ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8374547 aggccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 8374448  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374447 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 8374397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 19358523 - 19358675
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatggc-ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358523 taaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 19358622  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19358623 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagc 19358675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Original strand, 4120935 - 4121086
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttgga-tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  4120935 aaggccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttat 4121034  T
Q  284 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121035 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 4121086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20992357 - 20992205
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20992357 taaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcata 20992258  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992257 tcatagtttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagc 20992205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 33991139 - 33991289
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991139 aggccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33991238  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991239 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 33991289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1165792 - 1165660
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1165792 cttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgct 1165693  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165692 tatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 1165660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 3921578 - 3921730
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatggctt-attttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3921578 taaggtcccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 3921677  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921678 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 3921730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38598659 - 38598509
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38598659 aggcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatc 38598560  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598559 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 38598509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 5202972 - 5203121
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5202972 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 5203071  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5203072 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagc 5203121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 31883142 - 31883289
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 283  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31883142 aaggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 31883241  T
Q  284 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31883242 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttt 31883289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20992496 - 20992354
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgt----gggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 278  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992496 taaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 20992397  T
Q  279 cttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 321  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992396 catatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26603113 - 26603002
Alignment:
Q  223 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26603113 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagc 26603014  T
Q  323 ctaaattttcag 334  Q
     ||| |||||||    
T  26603013 ataatttttcag 26603002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 203 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33284766 - 33284642
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  33284766 cttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagttttataaactgct 33284667  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaa 327  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284666 tataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 333
Target Start/End: Original strand, 31410494 - 31410623
Alignment:
Q  204 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgctt 303  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31410494 ttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagttttataagctgctt 31410593  T
Q  304 atgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31410594 atgccatatttcaataagcctaaattttca 31410623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 335
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025105
Alignment:
Q  231 actcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattt 330  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattt 27025100  T
Q  331 tcagc 335  Q
    |||||    
T  27025101 tcagc 27025105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 320
Target Start/End: Original strand, 25634581 - 25634714
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | | |||||||||  |||||||| ||| |||   ||||||||||||||   ||||||||||||     
T  25634581 aggccccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataa--taaaatagcttata 25634678  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataa 320  Q
      | |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25634679 acaatttcataagccgcttataccatattttaataa 25634714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 322
Target Start/End: Original strand, 31638174 - 31638281
Alignment:
Q  215 ttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattt 314  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||  | ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31638174 ttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataagcttcttatgtcatattt 31638273  T
Q  315 taataagc 322  Q
    ||||||||    
T  31638274 taataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  252 ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttat 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23776655 - 23776506
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23776655 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23776556  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776555 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 23776506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1756958 - 1756811
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1756958 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 1756859  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756858 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 1756811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Original strand, 54189540 - 54189691
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189540 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 54189639  T
Q  284 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189640 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 54189691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 14987786 - 14987938
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987786 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 14987885  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987886 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 14987938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 20877041 - 20877193
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20877041 taaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 20877140  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877141 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 20877193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 50055298 - 50055148
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50055298 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatc 50055199  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055198 atggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 50055148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19913826 - 19913677
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  19913826 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatca 19913727  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913726 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 19913677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 38055154 - 38055303
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  38055154 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 38055253  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055254 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 38055303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8932377 - 8932225
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8932377 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctta 8932278  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8932277 acgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagc 8932225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 50353795 - 50353947
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353795 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 50353894  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50353895 tgatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagc 50353947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 204 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37968935 - 37968804
Alignment:
Q  204 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37968935 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 37968836  T
Q  304 atgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37968835 atgccatatttcaataagcctaaattttcagc 37968804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27488845 - 27488695
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488845 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 27488746  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27488745 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagc 27488695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53717661 - 53717511
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717661 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 53717562  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53717561 atagtttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagc 53717511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700927
Alignment:
Q  191 ccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 16700927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11639773 - 11639625
Alignment:
Q  188 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgt 286  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11639773 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 11639674  T
Q  287 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639673 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 11639625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28032891 - 28032759
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28032891 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtatcataagctgct 28032792  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28032791 tatgccatattttaataagtctaaattttcagc 28032759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30423763 - 30423611
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423763 taaggtcccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 30423664  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  30423663 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagc 30423611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45424733 - 45424581
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45424733 taaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 45424634  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424633 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 45424581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44785115 - 44784964
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44785115 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttat 44785016  T
Q  284 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44785015 catagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagc 44784964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Original strand, 54412627 - 54412774
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  54412627 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 54412726  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54412727 gtttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagc 54412774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2481605 - 2481455
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2481605 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatc 2481506  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2481505 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagc 2481455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6611557 - 6611407
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611557 aggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 6611458  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6611457 atagtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagc 6611407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19165019
Alignment:
Q  191 ccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19165064 tttcataagctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagc 19165019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35490966 - 35490820
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35490966 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 35490867  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35490866 tttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 35490820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 334
Target Start/End: Original strand, 37464717 - 37464866
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37464717 aggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 37464816  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag 334  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464817 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag 37464866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40428915 - 40428767
Alignment:
Q  188 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgt 286  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40428915 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 40428816  T
Q  287 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40428815 agtttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagc 40428767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 186 - 333
Target Start/End: Original strand, 50053439 - 50053587
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50053439 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatc 50053538  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50053539 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttca 50053587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15241225 - 15241075
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15241225 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 15241126  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241125 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 15241075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43290157 - 43290007
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43290157 aggctccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatc 43290058  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290057 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 43290007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 48909842 - 48909992
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48909842 aggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 48909941  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48909942 atagtttcataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagc 48909992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23704408 - 23704256
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23704408 taaggccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 23704309  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23704308 tcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagc 23704256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 204 - 335
Target Start/End: Original strand, 31969696 - 31969827
Alignment:
Q  204 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgctt 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31969696 ttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 31969795  T
Q  304 atgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31969796 atgctatattttaataagcctaaattttcagc 31969827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 203 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38071499 - 38071368
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38071499 cttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgct 38071400  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcag 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38071399 tatgccatattttaataagcctgaattttcag 38071368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 15669179 - 15669329
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15669179 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 15669278  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15669279 atagtttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagc 15669329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139349
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 52139302  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139303 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 52139349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8591274 - 8591139
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8591274 tggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagct 8591175  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8591174 gcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagc 8591139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 333
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875801
Alignment:
Q  191 ccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  53875758 tttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttca 53875801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617230
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagc 1617230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6688817 - 6688674
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6688817 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6688718  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688717 tagttt------ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 6688674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 28360444 - 28360577
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  28360444 cttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataagctgct 28360543  T
Q  303 tatgcca-tattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28360544 tatgccattatttttataagcctaaattttcagc 28360577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171726
Alignment:
Q  191 ccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagc 30171726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 47632032 - 47632181
Alignment:
Q  188 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  47632032 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctca 47632131  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47632132 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagc 47632181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 203 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27583811 - 27583683
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  27583811 cttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgcataagctgct 27583712  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27583711 tatgccatattttcataagcctaaatttt 27583683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 53353049 - 53353209
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagctta----tgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353049 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 53353148  T
Q  279 cttatcgtagtttcataagctgcttatgccatatttta----ataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  53353149 cttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagc 53353209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27536297 - 27536151
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27536297 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 27536202  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536201 atagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 27536151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 33703855 - 33703987
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  33703855 cttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgct 33703954  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703955 tatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 33703987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44379384 - 44379234
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44379384 aggccctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 44379285  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44379284 atagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 44379234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 334
Target Start/End: Original strand, 16703843 - 16703966
Alignment:
Q  211 gagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccat 310  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16703843 gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccat 16703942  T
Q  311 attttaataagcctaaattttcag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16703943 attttaataagcctaaattttcag 16703966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Original strand, 44375844 - 44375991
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44375844 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 44375943  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375944 gtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 44375991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 203 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40680217 - 40680089
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40680217 cttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgct 40680118  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40680117 tatgccatattttcataagcctaaatttt 40680089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 55345022 - 55344872
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55345022 aggccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 55344923  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     || || ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55344922 atatttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagc 55344872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23265956 - 23265865
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 274  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265956 taaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44548341 - 44548192
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg--cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 281  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||    
T  44548341 taaggccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatctt 44548242  T
Q  282 atcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    |||  | ||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  44548241 atcacaattttataagttgtttatgccctattttattaagcccaaatttt 44548192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269093
Alignment:
Q  266 taaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagc 23269093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 255 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780769
Alignment:
Q  255 gtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaatttt 51780769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 331
Target Start/End: Original strand, 17493370 - 17493475
Alignment:
Q  226 tatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccta 325  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  17493370 tatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttataagctgcttataccatgttttaataagctca 17493469  T
Q  326 aatttt 331  Q
    ||||||    
T  17493470 aatttt 17493475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9596031 - 9595974
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagct 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9596031 aggccccgtttggattggcttattt-gagtttatgtgggcttatctactctcataagct 9595974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 55344781 - 55344724
Alignment:
Q  276 tagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    ||||||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344781 tagcttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595946
Alignment:
Q  291 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaa 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaa 9595946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42308102 - 42307950
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42308102 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagctta 42308003  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42308002 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 42307950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Original strand, 38856089 - 38856236
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38856089 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 38856188  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856189 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 38856236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37698338 - 37698188
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698338 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 37698239  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698238 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 37698188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 25999382 - 25999531
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25999382 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25999481  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999482 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 25999531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15520339 - 15520187
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15520339 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataactta 15520240  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520239 tcatcgtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 15520187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22175185 - 22175035
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22175185 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 22175086  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175085 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 22175035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 50528922 - 50529072
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50528922 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 50529021  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529022 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 50529072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 8042598 - 8042750
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8042598 taaggccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagttta 8042697  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042698 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 8042750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 21581053 - 21581185
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21581053 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgct 21581152  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581153 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 21581185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25494479 - 25494330
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25494479 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25494380  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494379 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 25494330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 20699144 - 20699292
Alignment:
Q  188 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgt 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  20699144 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 20699243  T
Q  287 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699244 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 20699292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 15520629 - 15520779
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15520629 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatc 15520728  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520729 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 15520779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 29445481 - 29445631
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445481 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 29445580  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29445581 atagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagc 29445631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 46452357 - 46452207
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46452357 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 46452258  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452257 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 46452207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 54534521 - 54534373
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54534521 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 54534422  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  54534421 atggttt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagc 54534373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12117855 - 12117703
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12117855 taaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagttta 12117756  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117755 tcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 12117703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20842545 - 20842393
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20842545 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaactta 20842446  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842445 tcatagtttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagc 20842393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 32244111 - 32244263
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32244111 taaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 32244210  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32244211 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagc 32244263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 35226440 - 35226590
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35226440 aggccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatc 35226539  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226540 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 35226590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 54870369 - 54870223
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870369 aggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 54870270  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54870269 atcgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttt 54870223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 32359250 - 32359402
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  32359250 taaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagttta 32359349  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359350 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 32359402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44609513 - 44609378
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44609513 tggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagct 44609414  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609413 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 44609378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 26122808 - 26122957
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26122808 ggcccagtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 26122907  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26122908 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagc 26122957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Original strand, 38933939 - 38934083
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38933939 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 38934037  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattt 330  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38934038 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaattt 38934083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 2895196 - 2895328
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  2895196 cttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcatagtttcataagctgct 2895295  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895296 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 2895328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 331
Target Start/End: Original strand, 35643212 - 35643356
Alignment:
Q  188 gccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgt 286  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35643212 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35643311  T
Q  287 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35643312 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttt 35643356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42105148 - 42105016
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42105148 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgct 42105049  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105048 tatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 42105016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 203 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 50529950 - 50529827
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50529950 cttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgct 50529851  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaa 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  50529850 tatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Original strand, 34700334 - 34700480
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34700334 aggccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatc 34700433  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34700434 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttt 34700480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24835894 - 24835744
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatggctt-attttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24835894 aggccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatt 24835795  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24835794 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagc 24835744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 335
Target Start/End: Original strand, 44688782 - 44688903
Alignment:
Q  213 gcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatat 312  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44688782 gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catat 44688880  T
Q  313 tttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  44688881 tttaataagcttaaattttcagc 44688903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 320
Target Start/End: Original strand, 49128040 - 49128177
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49128040 taaggccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataactta 49128139  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataa 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49128140 tcgtaatttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Original strand, 16354379 - 16354489
Alignment:
Q  225 ttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 324  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16354379 ttatctacactcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcct 16354478  T
Q  325 aaattttcagc 335  Q
    |||||||||||    
T  16354479 aaattttcagc 16354489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48925181 - 48925052
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48925181 tggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagct 48925084  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48925083 gtttatgtcatattttaataagtctaaatttt 48925052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 53028218 - 53028360
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||        ||||||||||||||||||||||    
T  53028218 aggccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatc 53028309  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028310 atattttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 53028360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 335
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916049
Alignment:
Q  215 ttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattt 314  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttactcc-ataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatattt 12916028  T
Q  315 taataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||| ||| ||||||||    
T  12916029 aaataagcttaagttttcagc 12916049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 242
Target Start/End: Original strand, 24366083 - 24366142
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagc 242  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24366083 taaggccccttttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagc 24366142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Original strand, 18594534 - 18594685
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594534 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 18594633  T
Q  284 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594634 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 18594685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 39206584 - 39206734
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206584 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 39206683  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39206684 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagc 39206734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 14422702 - 14422851
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14422702 ggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 14422801  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422802 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 14422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 29938060 - 29938209
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  29938060 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatca 29938159  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938160 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 29938209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35118239 - 35118090
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35118239 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 35118140  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118139 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 35118090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110552
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 13110552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34842572 - 34842424
Alignment:
Q  188 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgt 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34842572 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 34842473  T
Q  287 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34842472 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagc 34842424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40118063 - 40117911
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40118063 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 40117964  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40117963 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagc 40117911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10836964 - 10836814
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10836964 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 10836865  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836864 atagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 10836814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22260839 - 22260689
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22260839 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatc 22260740  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260739 ctagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 22260689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33287234 - 33287084
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33287234 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 33287135  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287134 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 33287084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042583
Alignment:
Q  192 cgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtt 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  291 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 2042583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 4035843 - 4035995
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4035843 taaggccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagctta 4035942  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035943 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 4035995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26783944 - 26783801
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26783944 taaggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagctta 26783845  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26783844 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6144486 - 6144332
Alignment:
Q  182 agtaaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 280  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144486 agtaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagct 6144387  T
Q  281 tatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6144386 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagc 6144332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24113375 - 24113225
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24113375 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatc 24113276  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113275 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 24113225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 39218775 - 39218925
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  39218775 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatc 39218874  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39218875 atagcttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagc 39218925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 333
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021865
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 8021820  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8021821 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca 8021865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34999107 - 34998955
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34999107 taaggtcccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 34999008  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34999007 tcttagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 34998955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144542
Alignment:
Q  191 ccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144497 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 144542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34679651 - 34679516
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34679651 tggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagct 34679552  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34679551 gcttataccatattttaataagcctaaattttcagc 34679516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38167363 - 38167214
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  38167363 ggccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatca 38167264  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167263 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 38167214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575661
Alignment:
Q  191 ccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagt 41575615  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41575616 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagc 41575661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44805138 - 44805005
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44805138 tggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagct 44805039  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44805038 gcttatgtcatattttaataagcctaaattttca 44805005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 33278399 - 33278548
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  33278399 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33278498  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278499 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 33278548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 7774777 - 7774912
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7774777 tggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagct 7774876  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7774877 gcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagc 7774912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 28639291 - 28639430
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccata----agcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcata 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28639291 tggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcata 28639390  T
Q  296 agctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639391 agctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 28639430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Original strand, 7791412 - 7791559
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7791412 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 7791511  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  7791512 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagc 7791559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Original strand, 5320563 - 5320710
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||     
T  5320563 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatca 5320662  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5320663 tagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttca 5320710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Original strand, 36491154 - 36491305
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 283  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36491154 aaggccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttat 36491253  T
Q  284 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36491254 catagtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 36491305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 7811993 - 7812143
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7811993 aggccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 7812092  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7812093 atagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagc 7812143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 331
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571735
Alignment:
Q  192 cgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtt 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  291 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||    
T  42571697 tcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttt 42571735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2322223 - 2322075
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2322223 taaggccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagctta 2322124  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    ||  | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  2322123 tcacaatttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaatttt 2322075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 66374 - 66239
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  66374 tggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagtttcataagct 66275  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  66274 gcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagc 66239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 315
Target Start/End: Original strand, 5005179 - 5005294
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||| ||    
T  5005179 tggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactctcataaact 5005278  T
Q  300 gcttatgccatatttt 315  Q
    |||||||| |||||||    
T  5005279 gcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 333
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807406
Alignment:
Q  266 taaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca 9807406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 331
Target Start/End: Original strand, 39220272 - 39220400
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  39220272 cttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaatttcataagctgct 39220371  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
     || | ||||||||||||||  |||||||    
T  39220372 catactatattttaataagctcaaatttt 39220400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  190 cccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 274  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 322
Target Start/End: Original strand, 18683726 - 18683844
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||| |||||||  | |||||||||||  |||||||| ||| |||   |||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||| |||||| |||    
T  18683726 cttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtttataccaattttataagccgct 18683824  T
Q  303 tatgccatattttaataagc 322  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  18683825 tataccatattttcataagc 18683844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 322
Target Start/End: Original strand, 18729288 - 18729406
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||| |||||||  | |||||||||||  |||||||| ||| |||   |||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||| |||||| |||    
T  18729288 cttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtttataccaattttataagccgct 18729386  T
Q  303 tatgccatattttaataagc 322  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  18729387 tataccatattttcataagc 18729406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30181224 - 30181073
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181224 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 30181125  T
Q  284 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181124 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 30181073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Original strand, 7164184 - 7164331
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7164184 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 7164283  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164284 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 7164331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12101378 - 12101227
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 283  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101378 aaggccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 12101279  T
Q  284 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101278 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 12101227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33846723 - 33846573
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846723 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33846624  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846623 atagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 33846573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33359288 - 33359139
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33359288 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33359189  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359188 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 33359139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 42204149 - 42204302
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 281  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42204149 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagctt 42204248  T
Q  282 atcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204249 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 42204302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42965197 - 42965049
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965197 taaggccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 42965098  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965097 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 42965049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24792531 - 24792381
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792531 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 24792432  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792431 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 24792381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43068176 - 43068022
Alignment:
Q  182 agtaaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 280  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068176 agtaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 43068077  T
Q  281 tatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068076 tatcatagtttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 43068022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 4347268 - 4347420
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347268 taaggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 4347367  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4347368 ccatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagc 4347420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 20346487 - 20346635
Alignment:
Q  188 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgt 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20346487 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 20346586  T
Q  287 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20346587 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagc 20346635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22649892 - 22649745
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22649892 ggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 22649793  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649792 taatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 22649745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 3511318 - 3511466
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3511318 taaggtcccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagctta 3511417  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511418 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 3511466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 15655907 - 15656059
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15655907 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 15656006  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656007 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 15656059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 933280 - 933432
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  933280 taaggccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 933379  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933380 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 933432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36891030 - 36890879
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36891030 taaggccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 36890932  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36890931 tcatagtttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagc 36890879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477372
Alignment:
Q  191 ccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4477415 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttca 4477372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 6394746 - 6394897
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  6394746 taaggccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagttta 6394845  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag 334  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6394846 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcag 6394897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 32041539 - 32041689
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041539 aggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 32041638  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32041639 atagtttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagc 32041689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 1803041 - 1803173
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1803041 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgct 1803140  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1803141 tatacgatattttattaagcctaaattttcagc 1803173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 5280855 - 5281007
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5280855 taaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 5280954  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5280955 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagc 5281007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 43156725 - 43156860
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43156725 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagct 43156824  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43156825 gtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagc 43156860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 333
Target Start/End: Original strand, 19828265 - 19828415
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19828265 taaggccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagctta 19828364  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828365 tcatagtttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 25748485 - 25748634
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25748485 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25748584  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748585 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 25748634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 38866559 - 38866691
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  38866559 cttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgtt 38866658  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38866659 tatgccatattttaataagcataaattttcagc 38866691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 188 - 333
Target Start/End: Original strand, 8630665 - 8630811
Alignment:
Q  188 gccccgtttggatg-gcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgt 286  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8630665 gccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcat 8630764  T
Q  287 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630765 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 8630811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12097788 - 12097639
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12097788 ggccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 12097689  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097688 tagtttcataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 12097639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 223 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16894668 - 16894556
Alignment:
Q  223 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894668 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 16894569  T
Q  323 ctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||    
T  16894568 ctaaattttcagc 16894556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Original strand, 42673467 - 42673608
Alignment:
Q  191 ccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||    
T  42673467 ccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatagt 42673562  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673563 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 42673608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452737
Alignment:
Q  190 cccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagc 9452737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 331
Target Start/End: Original strand, 17753600 - 17753743
Alignment:
Q  189 ccccgtttggatg-gcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17753600 ccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacata 17753699  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753700 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 17753743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 46891535 - 46891388
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagc-ttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  46891535 cccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcata 46891436  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46891435 gttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagc 46891388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 223 - 335
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865780
Alignment:
Q  223 gcttatctactcccataagc---ttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaata 319  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 48865764  T
Q  320 agcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||    
T  48865765 agcctaaattttcagc 48865780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37006022 - 37005864
Alignment:
Q  174 agtttagcagtaaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataa 272  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  37006022 agttttgcattaaggctccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaa 37005923  T
Q  273 aaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  37005922 aaatagcttatcgtaatttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttt 37005864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 46134500 - 46134353
Alignment:
Q  189 ccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  46134500 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattata 46134401  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46134400 gtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagc 46134353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Original strand, 37704975 - 37705075
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704975 taaggccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 37705074  T
Q  283 t 283  Q
    |    
T  37705075 t 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 323
Target Start/End: Original strand, 43405015 - 43405155
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43405015 taaggccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagctta 43405114  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 323  Q
    ||||| ||||||||| || || | | |||||||||||||||    
T  43405115 tcgtaatttcataagttgtttctactatattttaataagcc 43405155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43021777 - 43021646
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43021777 taaggccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataactta 43021678  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattt 314  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43021677 ttatagtttcataagctgcttatggcatattt 43021646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36849735 - 36849590
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| | ||||||   |||||||||||| || ||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||     
T  36849735 ggccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatca 36849636  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
     | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  36849635 caatttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27691506 - 27691433
Alignment:
Q  204 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 277  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27691506 ttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15655613 - 15655465
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15655613 taaggccgcgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagctta 15655514  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
     |  | ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  15655513 ccacaattttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaatttt 15655465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30075426 - 30075292
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||  ||| | |   |||||||||||||| ||||||||||||||      
T  30075426 ggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaataa-taaaaatagcttata- 30075329  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 323  Q
    || |||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  30075328 ta-tttcataaaccgcttataccatattttaataagcc 30075292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 322
Target Start/End: Original strand, 20163886 - 20163953
Alignment:
Q  255 gtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 322  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20163886 gtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttcataagctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 36701 - 36851
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36701 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 36800  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36801 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 36851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6086808 - 6086658
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086808 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 6086709  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086708 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 6086658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 335
Target Start/End: Original strand, 30691841 - 30691999
Alignment:
Q  178 tagcagtaaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 276  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691841 tagcattagggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 30691940  T
Q  277 agcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691941 agcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 30691999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 2837543 - 2837693
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837543 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 2837642  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837643 atagtttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagc 2837693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26947084 - 26946935
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26947084 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26946985  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946984 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 26946935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 52834 - 52984
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52834 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 52933  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52934 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 52984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26704547 - 26704398
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26704547 ggccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26704448  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704447 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 26704398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3347734 - 3347582
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3347734 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagctta 3347635  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347634 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 3347582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3955972 - 3955825
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3955972 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 3955873  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3955872 gtttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagc 3955825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17261278 - 17261132
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  17261278 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatat 17261179  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17261178 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagc 17261132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 21893453 - 21893603
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatggctt-attttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21893453 aggccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatc 21893552  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21893553 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagc 21893603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 9459562 - 9459711
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  9459562 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatca 9459661  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459662 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 9459711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 334
Target Start/End: Original strand, 35198282 - 35198430
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198282 aggccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 35198380  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag 334  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35198381 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcag 35198430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 18613534 - 18613686
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18613534 taaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctta 18613633  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613634 tcatagttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 18613686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 11167238 - 11167388
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167238 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 11167337  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167338 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 11167388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887351
Alignment:
Q  191 ccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagc 34887351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 1153606 - 1153741
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1153606 tggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataagct 1153705  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153706 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 1153741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16307217 - 16307067
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16307217 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatc 16307118  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16307117 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagc 16307067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 187 - 331
Target Start/End: Original strand, 20726790 - 20726931
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||     
T  20726790 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg----taaataaaaataacttatca 20726885  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726886 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 20726931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28199714 - 28199567
Alignment:
Q  190 cccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28199714 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 28199616  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28199615 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagc 28199567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30699120 - 30698988
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| || | | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  30699120 cttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttttattagctgct 30699021  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699020 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 30698988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 335
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464477
Alignment:
Q  257 ttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 33464477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 33463698 - 33463779
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaa 265  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33463698 aaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 335
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53056
Alignment:
Q  280 ttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 53056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 322
Target Start/End: Original strand, 12835084 - 12835183
Alignment:
Q  224 cttatctactcccataagcttttttaaag-gtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 322  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||| || || ||| |||| | |||||  || |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12835084 cttatctactaacataagcttttgtaaaaagtgtttggatacattaatcaaaagaacttatactaatttcataagctgcttaagcaatattttaataagc 12835183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 1168499 - 1168649
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168499 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 1168598  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168599 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 1168649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39260555 - 39260405
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260555 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 39260456  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260455 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 39260405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52753356 - 52753206
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753356 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 52753257  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753256 atagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 52753206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 16052090 - 16052242
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052090 taaggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 16052189  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16052190 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagc 16052242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 20089465 - 20089617
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20089465 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 20089564  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089565 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 20089617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 25897370 - 25897520
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897370 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 25897469  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897470 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 25897520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26580479 - 26580329
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26580479 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatc 26580380  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580379 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 26580329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 29288145 - 29288295
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29288145 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 29288244  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288245 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 29288295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 26663252 - 26663404
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26663252 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 26663351  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663352 tcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 26663404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 29078527 - 29078662
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29078527 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagct 29078626  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29078627 gcttatgccatattttaataaacctaaattttcagc 29078662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 333
Target Start/End: Original strand, 32671571 - 32671723
Alignment:
Q  182 agtaaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32671571 agtaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagct 32671670  T
Q  281 tatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671671 tatcatagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttca 32671723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 43905649 - 43905796
Alignment:
Q  185 aaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905649 aaggctccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 43905748  T
Q  284 cgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905749 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 43905796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1170653 - 1170503
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1170653 aggccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 1170554  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170553 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 1170503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1940956 - 1940806
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940956 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 1940857  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940856 atagtttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 1940806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8079914 - 8079768
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8079914 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8079815  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8079814 tttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagc 8079768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 52696788 - 52696937
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  52696788 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 52696887  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696888 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 52696937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 38829063 - 38829215
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829063 taaggctctgtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 38829162  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829163 tcatagtttcataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagc 38829215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 2473722 - 2473868
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2473722 cccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 2473821  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2473822 tttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagc 2473868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 33510480 - 33510630
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33510480 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 33510579  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510580 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 33510630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41928704 - 41928554
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41928704 aggccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 41928605  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41928604 atagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagc 41928554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 970734 - 970583
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc- 284  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  970734 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 970635  T
Q  285 -gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  970634 tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagc 970583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 46409429 - 46409581
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409429 taaggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 46409528  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46409529 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagc 46409581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Original strand, 5215384 - 5215531
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5215384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 5215483  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215484 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 5215531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 40092488 - 40092637
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  40092488 ggccctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatca 40092587  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092588 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 40092637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42371003 - 42370854
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  42371003 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatca 42370904  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370903 tagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagc 42370854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 328
Target Start/End: Original strand, 12682817 - 12682959
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12682817 ggccctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 12682916  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaat 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12682917 tagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaat 12682959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 333
Target Start/End: Original strand, 49146166 - 49146316
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49146166 taaggctccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 49146265  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49146266 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttca 49146316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 334
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8121014
Alignment:
Q  191 ccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagt 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 8120969  T
Q  290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8120970 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcag 8121014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13996936 - 13996784
Alignment:
Q  182 agtaaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 280  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13996936 agtaaggccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagct 13996837  T
Q  281 tatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13996836 tataatggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 13996784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 2347652 - 2347803
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatg-gcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2347652 aggccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 2347751  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccata-ttttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2347752 atagtttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagc 2347803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715224
Alignment:
Q  190 cccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttt 19715224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761112
Alignment:
Q  190 cccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46761066 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 46761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203258
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15203109 ggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatca 15203208  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15203209 tagtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagc 15203258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51359424 - 51359276
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  51359424 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatca 51359326  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359325 tagtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 51359276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Original strand, 17591687 - 17591834
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17591687 aggccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 17591783  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17591784 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagc 17591834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 205 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587564
Alignment:
Q  205 tattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgctta 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  305 tgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagc 17587564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 29695673 - 29695822
Alignment:
Q  188 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagctttt-ttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||     
T  29695673 gccctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatca 29695772  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29695773 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 29695822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Original strand, 23498471 - 23498606
Alignment:
Q  200 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagct 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |    
T  23498471 tggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcatagtttcataagtt 23498570  T
Q  300 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23498571 gcttatatcatattttaataagcctaaattttcagc 23498606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149608
Alignment:
Q  223 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataagc 40149596  T
Q  323 ctaaattttcag 334  Q
    ||||||||||||    
T  40149597 ctaaattttcag 40149608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 7145201 - 7145353
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttatttt-gagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 281  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  7145201 taaggtcccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagttt 7145299  T
Q  282 atcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145300 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 7145353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 6765453 - 6765605
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6765453 taagaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 6765552  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765553 tcatattttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 6765605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 15717799 - 15717930
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15717799 cttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtttcataagctgct 15717897  T
Q  303 tatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15717898 tatgccataatttaataagcctaaattttcagc 15717930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15554353 - 15554213
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  15554353 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc----- 15554259  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 333  Q
        |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554258 ---atttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttca 15554213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 318
Target Start/End: Original strand, 52086263 - 52086396
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  52086263 aggccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatc 52086362  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaat 318  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52086363 ataatttcataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23323032 - 23322903
Alignment:
Q  202 gcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgc 301  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  23323032 gcttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgc 23322933  T
Q  302 ttatgccatattttaataagcctaaatttt 331  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  23322932 ttatgtcatactttaataagcgcaaatttt 23322903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 306
Target Start/End: Original strand, 38171846 - 38171949
Alignment:
Q  203 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtagtttcataagctgct 302  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  38171846 cttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatagtttcataagctgct 38171945  T
Q  303 tatg 306  Q
    ||||    
T  38171946 tatg 38171949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5217992 - 5217855
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5217992 aggcctcgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaataa-taaaaatagcttata 5217894  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 323  Q
      | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  5217893 ccaatttcataagccgcttataccatatttttataagcc 5217855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Original strand, 5675099 - 5675176
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  5675099 taaggccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23159 - 23010
Alignment:
Q  187 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23159 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23060  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23059 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 23010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145304
Alignment:
Q  190 cccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgtag 288  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  289 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 145304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 3708 - 3856
Alignment:
Q  188 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgt 286  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3708 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 3807  T
Q  287 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 3856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 65
Alignment:
Q  186 aggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 284  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  215 aggccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 116  T
Q  285 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  115 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagc 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 335
Target Start/End: Original strand, 10232 - 10384
Alignment:
Q  184 taaggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 282  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10232 taaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 10331  T
Q  283 tcgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10332 tcatagtttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagc 10384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 354
Alignment:
Q  189 ccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcgta 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  501 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 402  T
Q  288 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  401 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagc 354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 65
Alignment:
Q  190 cccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcg 285  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  212 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 114  T
Q  286 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  113 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagc 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University