View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18156_low_13 (Length: 583)

Name: NF18156_low_13
Description: NF18156
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18156_low_13
NF18156_low_13
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (83-573)||(25421208-25421698)
chr6 (83-573)||(6027151-6027638)
chr6 (83-573)||(33341878-33342370)
chr6 (82-573)||(34166983-34167473)
chr6 (113-580)||(16653008-16653470)
chr6 (83-573)||(34164761-34165251)
chr6 (113-573)||(16554772-16555227)
chr6 (113-573)||(16631328-16631783)
chr6 (113-573)||(16578328-16578783)
chr6 (113-573)||(16616597-16617052)
chr6 (83-496)||(13153893-13154308)
chr6 (113-562)||(27647777-27648209)
chr6 (207-562)||(412016-412369)
chr6 (139-562)||(3072596-3073014)
chr6 (138-562)||(6097285-6097695)
chr6 (288-562)||(2171512-2171792)
chr6 (288-559)||(31404656-31404932)
chr6 (83-220)||(6136079-6136216)
chr6 (288-555)||(16452310-16452583)
chr6 (288-559)||(5406181-5406456)
chr6 (288-559)||(5410506-5410781)
chr6 (288-559)||(30834517-30834794)
chr6 (288-559)||(5413376-5413650)
chr6 (83-195)||(13159051-13159164)
chr6 (207-476)||(33160254-33160521)
chr6 (311-476)||(21588931-21589095)
chr6 (311-476)||(21593664-21593828)
chr6 (299-476)||(3808699-3808877)
chr6 (288-559)||(16568953-16569208)
chr6 (288-391)||(5409051-5409151)
chr6 (290-476)||(9183015-9183199)
chr6 (311-473)||(17758026-17758188)
chr6 (311-476)||(2972943-2973107)
chr6 (311-476)||(17762990-17763155)
chr6 (311-474)||(26830127-26830289)
chr6 (311-476)||(22424829-22424995)
chr6 (319-476)||(28137420-28137576)
chr6 (311-456)||(5043648-5043792)
chr6 (304-473)||(26954283-26954450)
chr6 (304-391)||(33211182-33211267)
chr6 (315-391)||(26800674-26800748)
chr6 (300-391)||(603081-603170)
chr6 (331-476)||(3038926-3039071)
chr6 (406-476)||(4045423-4045494)
chr6 (139-232)||(2171366-2171456)
chr6 (288-352)||(21356021-21356084)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (82-573)||(10593161-10593651)
chr5 (83-573)||(25078023-25078513)
chr5 (83-573)||(25135992-25136482)
chr5 (78-573)||(40382206-40382699)
chr5 (83-573)||(40379995-40380483)
chr5 (83-573)||(16544312-16544804)
chr5 (83-573)||(16546534-16547026)
chr5 (114-562)||(29720278-29720721)
chr5 (114-562)||(29722438-29722881)
chr5 (112-562)||(29750968-29751414)
chr5 (113-566)||(22536104-22536545)
chr5 (117-562)||(9789042-9789478)
chr5 (117-562)||(18441462-18441902)
chr5 (187-562)||(16409389-16409764)
chr5 (207-562)||(26177797-26178150)
chr5 (254-562)||(26170688-26170983)
chr5 (288-559)||(25412672-25412947)
chr5 (207-559)||(30182499-30182852)
chr5 (304-559)||(13342971-13343232)
chr5 (199-546)||(13239674-13240025)
chr5 (288-559)||(36074024-36074302)
chr5 (288-457)||(37439161-37439328)
chr5 (311-476)||(213465-213630)
chr5 (207-476)||(32636824-32637088)
chr5 (311-476)||(40147261-40147425)
chr5 (296-476)||(28278316-28278494)
chr5 (20-76)||(193289-193345)
chr5 (304-476)||(42428427-42428598)
chr5 (313-476)||(13488203-13488365)
chr5 (311-391)||(5058131-5058209)
chr5 (288-546)||(16452003-16452266)
chr5 (311-476)||(27637616-27637781)
chr5 (315-559)||(30682930-30683178)
chr5 (288-559)||(31182883-31183157)
chr5 (288-559)||(33831590-33831866)
chr5 (291-476)||(533769-533952)
chr5 (285-458)||(8565926-8566095)
chr5 (331-476)||(13695713-13695859)
chr5 (313-392)||(28750661-28750738)
chr5 (304-376)||(19806463-19806534)
chr5 (311-391)||(27015609-27015687)
chr5 (304-473)||(39468546-39468714)
chr5 (329-376)||(16640961-16641008)
chr5 (328-476)||(42426255-42426403)
chr5 (315-473)||(538028-538185)
chr5 (313-373)||(4160702-4160762)
chr5 (319-422)||(9049354-9049455)
chr5 (288-376)||(3075640-3075726)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (83-573)||(3617352-3617842)
chr3 (83-573)||(25637331-25637822)
chr3 (83-573)||(4598299-4598788)
chr3 (83-573)||(4600520-4601009)
chr3 (83-573)||(10211298-10211788)
chr3 (83-573)||(10209078-10209568)
chr3 (83-573)||(10056122-10056612)
chr3 (83-573)||(10058344-10058834)
chr3 (83-573)||(10060566-10061056)
chr3 (83-573)||(10062788-10063278)
chr3 (83-573)||(10065010-10065500)
chr3 (113-562)||(45282897-45283344)
chr3 (135-562)||(54635039-54635462)
chr3 (113-562)||(6716414-6716858)
chr3 (186-562)||(801005-801376)
chr3 (117-513)||(7779821-7780208)
chr3 (83-347)||(10067435-10067699)
chr3 (374-573)||(10067232-10067431)
chr3 (187-562)||(23200020-23200398)
chr3 (189-562)||(23197823-23198199)
chr3 (442-562)||(6718598-6718718)
chr3 (288-559)||(45095075-45095350)
chr3 (288-559)||(9636106-9636385)
chr3 (288-559)||(5258125-5258402)
chr3 (190-473)||(19683774-19684054)
chr3 (288-559)||(5260304-5260581)
chr3 (288-476)||(37408458-37408645)
chr3 (304-476)||(7762265-7762437)
chr3 (190-465)||(7764476-7764747)
chr3 (304-559)||(9581193-9581454)
chr3 (289-476)||(34491212-34491397)
chr3 (296-476)||(49199457-49199638)
chr3 (288-476)||(29196368-29196555)
chr3 (313-476)||(4569952-4570115)
chr3 (296-476)||(43401789-43401970)
chr3 (304-473)||(39153358-39153526)
chr3 (289-559)||(40735293-40735568)
chr3 (296-472)||(30236129-30236304)
chr3 (300-391)||(43403736-43403826)
chr3 (288-391)||(16499115-16499215)
chr3 (304-476)||(40734498-40734669)
chr3 (311-476)||(41819526-41819691)
chr3 (304-476)||(44331545-44331716)
chr3 (288-559)||(760757-761033)
chr3 (315-473)||(22835010-22835167)
chr3 (311-391)||(6095603-6095681)
chr3 (304-457)||(29813083-29813234)
chr3 (296-391)||(40913379-40913472)
chr3 (289-458)||(51398833-51398999)
chr3 (288-474)||(31314447-31314631)
chr3 (311-391)||(54593790-54593868)
chr3 (304-476)||(44700476-44700646)
chr3 (289-476)||(5236440-5236624)
chr3 (304-559)||(29682269-29682530)
chr3 (288-559)||(32744418-32744684)
chr3 (319-476)||(46860474-46860631)
chr3 (315-476)||(53921511-53921671)
chr3 (296-457)||(46173377-46173536)
chr3 (328-456)||(29810889-29811016)
chr3 (288-458)||(9666448-9666616)
chr3 (296-388)||(47304340-47304430)
chr3 (311-391)||(55301975-55302054)
chr3 (316-375)||(27305719-27305777)
chr3 (315-474)||(32891105-32891264)
chr3 (288-471)||(4055745-4055926)
chr3 (288-391)||(23391891-23391991)
chr3 (404-476)||(5433971-5434046)
chr3 (313-376)||(2075081-2075143)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (80-573)||(18388533-18389024)
chr7 (83-573)||(18391972-18392460)
chr7 (81-573)||(32060096-32060590)
chr7 (83-573)||(6594334-6594822)
chr7 (83-573)||(6592116-6592604)
chr7 (113-562)||(20343811-20344254)
chr7 (82-397)||(1560440-1560755)
chr7 (241-562)||(24789755-24790074)
chr7 (139-562)||(43503991-43504409)
chr7 (187-562)||(39731283-39731656)
chr7 (406-573)||(1562103-1562268)
chr7 (288-559)||(35853825-35854102)
chr7 (288-562)||(25766940-25767215)
chr7 (288-559)||(29990965-29991240)
chr7 (288-562)||(48408709-48408992)
chr7 (190-546)||(25615785-25616137)
chr7 (190-476)||(23555039-23555323)
chr7 (304-476)||(34310712-34310884)
chr7 (288-559)||(19502088-19502365)
chr7 (289-476)||(22269973-22270158)
chr7 (288-476)||(41317416-41317602)
chr7 (191-559)||(4178685-4179054)
chr7 (290-476)||(14069817-14070001)
chr7 (290-476)||(14379845-14380029)
chr7 (207-476)||(27347817-27348081)
chr7 (311-476)||(8359319-8359485)
chr7 (288-457)||(41648993-41649158)
chr7 (296-458)||(2390301-2390461)
chr7 (311-476)||(29608737-29608901)
chr7 (315-476)||(30024740-30024900)
chr7 (311-391)||(32358058-32358136)
chr7 (312-476)||(6431971-6432134)
chr7 (328-476)||(48491579-48491727)
chr7 (289-476)||(18126644-18126829)
chr7 (311-476)||(3258995-3259159)
chr7 (139-245)||(24790230-24790333)
chr7 (311-476)||(48599338-48599502)
chr7 (304-476)||(8153342-8153513)
chr7 (313-476)||(2360978-2361140)
chr7 (288-476)||(4253510-4253697)
chr7 (313-476)||(43864244-43864406)
chr7 (289-476)||(48489431-48489616)
chr7 (311-476)||(4508710-4508874)
chr7 (304-458)||(31732966-31733118)
chr7 (316-546)||(47673953-47674189)
chr7 (288-476)||(36146390-36146576)
chr7 (313-476)||(4586161-4586323)
chr7 (289-476)||(26417316-26417501)
chr7 (289-476)||(47676119-47676304)
chr7 (288-559)||(38671204-38671480)
chr7 (315-457)||(23565069-23565210)
chr7 (288-391)||(24525484-24525584)
chr7 (315-391)||(31518988-31519063)
chr7 (288-473)||(495965-496148)
chr7 (288-391)||(1113743-1113843)
chr7 (296-391)||(6359941-6360034)
chr7 (313-376)||(18396418-18396481)
chr7 (313-376)||(30814536-30814598)
chr7 (313-392)||(31105399-31105476)
chr7 (317-391)||(2759207-2759279)
chr7 (404-476)||(23343975-23344048)
chr7 (405-476)||(24525992-24526065)
chr7 (311-387)||(4510552-4510626)
chr7 (311-387)||(4512394-4512468)
chr7 (288-372)||(12097849-12097931)
chr7 (313-455)||(22328395-22328538)
chr7 (474-559)||(24514934-24515018)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (82-573)||(44203536-44204025)
chr1 (113-573)||(9036320-9036774)
chr1 (112-562)||(21053872-21054315)
chr1 (139-562)||(40282291-40282711)
chr1 (112-562)||(9987116-9987559)
chr1 (139-562)||(20622072-20622492)
chr1 (187-562)||(51765302-51765684)
chr1 (190-473)||(8550670-8550952)
chr1 (304-477)||(13316348-13316521)
chr1 (288-559)||(20762582-20762859)
chr1 (288-476)||(3189330-3189517)
chr1 (288-476)||(3198147-3198334)
chr1 (288-476)||(3206986-3207173)
chr1 (311-476)||(37168297-37168462)
chr1 (296-476)||(42297963-42298143)
chr1 (311-476)||(13547093-13547257)
chr1 (290-476)||(28220210-28220394)
chr1 (304-476)||(37033068-37033241)
chr1 (288-473)||(834149-834332)
chr1 (311-476)||(13549004-13549168)
chr1 (311-476)||(29136247-29136412)
chr1 (311-476)||(47255343-47255508)
chr1 (289-559)||(3156776-3157050)
chr1 (288-476)||(4552619-4552805)
chr1 (288-457)||(28265536-28265702)
chr1 (311-476)||(7482234-7482399)
chr1 (313-476)||(44455160-44455322)
chr1 (311-476)||(11348698-11348862)
chr1 (288-391)||(13659318-13659418)
chr1 (289-476)||(37503540-37503722)
chr1 (289-476)||(49918350-49918535)
chr1 (311-458)||(31925711-31925856)
chr1 (311-476)||(47115171-47115337)
chr1 (290-476)||(28223405-28223589)
chr1 (311-391)||(28242391-28242469)
chr1 (304-476)||(45644351-45644523)
chr1 (288-391)||(46065004-46065104)
chr1 (288-476)||(50169192-50169378)
chr1 (312-458)||(34603595-34603740)
chr1 (311-391)||(193697-193775)
chr1 (313-476)||(19754494-19754657)
chr1 (328-476)||(23555286-23555433)
chr1 (304-476)||(31659238-31659409)
chr1 (288-476)||(50167157-50167343)
chr1 (331-476)||(1833522-1833667)
chr1 (288-473)||(3847103-3847286)
chr1 (288-391)||(36683766-36683866)
chr1 (311-391)||(37876770-37876848)
chr1 (304-422)||(13137973-13138089)
chr1 (315-457)||(196915-197056)
chr1 (304-476)||(19752685-19752857)
chr1 (332-471)||(22079322-22079461)
chr1 (313-455)||(927982-928123)
chr1 (328-458)||(15820326-15820455)
chr1 (400-458)||(32736952-32737009)
chr1 (317-457)||(37282701-37282841)
chr1 (288-391)||(40122178-40122280)
chr1 (319-376)||(8871074-8871130)
chr1 (288-389)||(16455709-16455807)
chr1 (404-471)||(12318618-12318685)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (83-573)||(12647162-12647650)
chr2 (83-496)||(13655805-13656220)
chr2 (139-562)||(6266605-6267023)
chr2 (117-562)||(32289479-32289916)
chr2 (187-562)||(4484211-4484592)
chr2 (187-478)||(30833342-30833633)
chr2 (188-559)||(4503017-4503390)
chr2 (288-559)||(45099665-45099941)
chr2 (288-559)||(5723237-5723512)
chr2 (190-559)||(36987961-36988333)
chr2 (288-559)||(36205646-36205921)
chr2 (288-544)||(2334399-2334661)
chr2 (288-457)||(6594987-6595154)
chr2 (288-458)||(34139752-34139920)
chr2 (311-476)||(45726929-45727093)
chr2 (207-476)||(29867869-29868133)
chr2 (288-458)||(723726-723893)
chr2 (288-458)||(14633807-14633975)
chr2 (311-391)||(35446888-35446966)
chr2 (288-476)||(36773562-36773748)
chr2 (304-476)||(38312240-38312411)
chr2 (289-391)||(17057352-17057451)
chr2 (289-391)||(17085335-17085434)
chr2 (328-559)||(42362262-42362500)
chr2 (311-391)||(1631736-1631814)
chr2 (313-471)||(33648176-33648335)
chr2 (288-476)||(11151573-11151759)
chr2 (288-391)||(36317991-36318091)
chr2 (296-476)||(24398055-24398238)
chr2 (313-422)||(17490154-17490261)
chr2 (313-476)||(26353184-26353346)
chr2 (288-458)||(11067324-11067491)
chr2 (288-458)||(33162432-33162599)
chr2 (304-376)||(39284936-39285007)
chr2 (342-476)||(13121769-13121901)
chr2 (315-473)||(11690504-11690661)
chr2 (304-376)||(17450678-17450748)
chr2 (313-391)||(42288117-42288192)
chr2 (311-391)||(7451204-7451281)
chr2 (358-476)||(7815323-7815441)
chr2 (319-371)||(28672036-28672088)
chr2 (331-376)||(42412118-42412162)
chr2 (288-352)||(1345590-1345653)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (83-573)||(8395508-8395996)
chr4 (83-573)||(7124804-7125294)
chr4 (83-573)||(8393299-8393787)
chr4 (83-573)||(7122585-7123075)
chr4 (82-573)||(5138193-5138685)
chr4 (83-573)||(5135967-5136459)
chr4 (139-546)||(31495143-31495556)
chr4 (288-559)||(13992274-13992544)
chr4 (311-559)||(29999809-30000063)
chr4 (288-546)||(56178618-56178882)
chr4 (190-462)||(5369968-5370237)
chr4 (288-476)||(52095344-52095530)
chr4 (296-472)||(2209717-2209894)
chr4 (288-476)||(48143042-48143230)
chr4 (311-476)||(41964415-41964580)
chr4 (289-476)||(9927441-9927626)
chr4 (288-476)||(47038393-47038577)
chr4 (296-476)||(26364236-26364415)
chr4 (289-476)||(12739533-12739718)
chr4 (289-457)||(12743908-12744073)
chr4 (289-457)||(12745297-12745462)
chr4 (311-476)||(46703500-46703666)
chr4 (296-476)||(54883020-54883199)
chr4 (289-476)||(26175619-26175804)
chr4 (289-476)||(34570397-34570582)
chr4 (313-476)||(40632445-40632607)
chr4 (311-458)||(6655975-6656120)
chr4 (288-474)||(46147373-46147557)
chr4 (311-476)||(12073392-12073557)
chr4 (311-476)||(41639426-41639590)
chr4 (311-422)||(50673851-50673960)
chr4 (328-476)||(8665408-8665556)
chr4 (304-476)||(36463386-36463557)
chr4 (288-476)||(45687164-45687351)
chr4 (288-422)||(48893620-48893751)
chr4 (296-391)||(50262689-50262783)
chr4 (313-469)||(5207848-5208003)
chr4 (296-456)||(12119559-12119719)
chr4 (313-476)||(36994524-36994686)
chr4 (315-458)||(379399-379541)
chr4 (317-476)||(37229731-37229890)
chr4 (311-391)||(8648225-8648303)
chr4 (316-559)||(37740536-37740784)
chr4 (288-457)||(6542161-6542328)
chr4 (304-391)||(5429765-5429850)
chr4 (316-476)||(27416974-27417133)
chr4 (316-391)||(35662527-35662600)
chr4 (328-476)||(54199926-54200074)
chr4 (313-422)||(4588014-4588121)
chr4 (288-377)||(52467336-52467423)
chr4 (291-391)||(5871906-5872003)
chr4 (348-457)||(12744087-12744195)
chr4 (313-450)||(26699447-26699585)
chr4 (288-422)||(31474206-31474337)
chr4 (289-391)||(29254580-29254679)
chr4 (346-476)||(12747794-12747924)
chr4 (288-476)||(52082645-52082825)
chr4 (328-391)||(13009464-13009526)
chr4 (346-391)||(3913534-3913578)
chr4 (332-373)||(33989948-33989989)
chr4 (334-386)||(33089970-33090021)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (83-573)||(2380-2868)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (83-573)||(6177-6667)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (126-573)||(3545-3990)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (83-573)||(15290427-15290917)
chr8 (83-573)||(15470796-15471286)
chr8 (83-573)||(42575100-42575589)
chr8 (113-566)||(25689865-25690312)
chr8 (113-562)||(3439418-3439860)
chr8 (117-562)||(2627649-2628087)
chr8 (288-559)||(34254312-34254586)
chr8 (288-559)||(17982563-17982840)
chr8 (188-559)||(31218167-31218541)
chr8 (288-559)||(34256488-34256762)
chr8 (207-476)||(42498193-42498459)
chr8 (288-559)||(44303764-44304042)
chr8 (288-559)||(19945340-19945618)
chr8 (288-457)||(1746200-1746366)
chr8 (289-476)||(15212786-15212971)
chr8 (311-476)||(42434995-42435159)
chr8 (289-476)||(43036423-43036608)
chr8 (311-476)||(4283524-4283688)
chr8 (304-476)||(33352150-33352321)
chr8 (304-474)||(40321082-40321251)
chr8 (311-476)||(18655400-18655564)
chr8 (288-476)||(3303652-3303838)
chr8 (288-391)||(4743196-4743296)
chr8 (304-476)||(27811278-27811449)
chr8 (212-458)||(12702542-12702783)
chr8 (296-391)||(10930188-10930281)
chr8 (313-476)||(40221745-40221907)
chr8 (334-473)||(40328782-40328922)
chr8 (288-391)||(1345353-1345453)
chr8 (304-391)||(5689357-5689442)
chr8 (289-476)||(4731658-4731843)
chr8 (314-476)||(18141821-18141981)
chr8 (304-393)||(6599056-6599143)
chr8 (304-393)||(6674509-6674596)
chr8 (328-470)||(30143346-30143488)
chr8 (314-422)||(41366622-41366727)
chr8 (316-476)||(30291606-30291767)
chr8 (313-391)||(4733792-4733868)
chr8 (314-476)||(1292471-1292631)
chr8 (313-476)||(8965697-8965859)
chr8 (358-476)||(9765745-9765863)
chr8 (311-458)||(11384004-11384149)
chr8 (288-376)||(10015180-10015265)
chr8 (346-473)||(44353796-44353923)
chr8 (319-391)||(8153844-8153914)
chr8 (313-393)||(18106087-18106163)
chr8 (313-458)||(4162516-4162658)
chr8 (313-391)||(3073880-3073955)
chr8 (315-376)||(7597715-7597776)
chr8 (213-250)||(32902096-32902133)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (126-340)||(1-214)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (187-562)||(11042-11423)
scaffold0491 (187-478)||(8616-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (207-559)||(434443-434798)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (288-476)||(11557-11745)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (304-559)||(827-1087)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (304-476)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (311-457)||(18007-18151)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (288-391)||(149079-149179)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (311-476)||(7327-7491)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (207-476)||(20319-20583)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (313-391)||(10575-10651)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (319-376)||(27453-27510)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421208
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421698 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25421599  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25421598 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 25421501  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421500 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 25421401  T
Q  382 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421400 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 25421301  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421300 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25421208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6027638 - 6027151
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||     
T  6027638 tgttgtgaatccccggatctccaagactggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagaggggtaaccacctaacaaggtg 6027539  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  6027538 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa-atg--gagggaa 6027442  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027441 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 6027342  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027341 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 6027242  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027241 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6027151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Original strand, 33341878 - 33342370
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33341878 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 33341977  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaac-aaggagagg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  33341978 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagg 33342075  T
Q  280 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 378  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33342076 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 33342175  T
Q  379 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342176 gagttctttacaaaaggagtacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 33342275  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342276 gacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 33342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 82 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 34167473 - 34166983
Alignment:
Q  82 ctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  34167473 ctgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaaaa 34167374  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34167373 atattgagcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 34167276  T
Q  282 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 380  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34167275 agaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataa 34167176  T
Q  381 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 478  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167175 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 34167076  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34167075 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 16653470 - 16653008
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16653470 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16653376  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16653375 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16653277  T
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16653276 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16653177  T
Q  412 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653176 gaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 16653077  T
Q  512 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttgcttctcc 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16653076 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttgattctcc 16653008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 34165251 - 34164761
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  34165251 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 34165152  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34165151 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 34165055  T
Q  281 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 379  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34165054 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 34164955  T
Q  380 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 477  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164954 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 34164855  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34164854 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34164761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16555227 - 16554772
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16555227 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16555133  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16555132 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16555034  T
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16555033 cacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16554934  T
Q  412 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554933 gaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 16554834  T
Q  512 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16554833 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16554772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16631783 - 16631328
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16631783 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16631689  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16631688 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16631590  T
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16631589 cacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16631490  T
Q  412 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631489 gaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 16631390  T
Q  512 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16631389 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16631328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 573
Target Start/End: Original strand, 16578328 - 16578783
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16578328 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16578422  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16578423 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16578521  T
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16578522 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16578621  T
Q  412 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16578622 gaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcc 16578721  T
Q  512 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16578722 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16578783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16617052 - 16616597
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16617052 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16616958  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16616957 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16616859  T
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16616858 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16616759  T
Q  412 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16616758 gaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcc 16616659  T
Q  512 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16616658 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16616597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 83 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13154308 - 13153893
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13154308 tgttgtgaatcctcggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 13154209  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13154208 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 13154111  T
Q  282 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 380  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154110 agaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 13154011  T
Q  381 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 478  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154010 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 13153911  T
Q  479 cactcaatgattctctct 496  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13153910 cactcaatgattctctct 13153893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 113 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27648209 - 27647777
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||    
T  27648209 atcgaaccacaccaatacaag----aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccgaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 27648115  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||       |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  27648114 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaataca-------caagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttc 27648024  T
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaag 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27648023 acccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 27647925  T
Q  413 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 512  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  27647924 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacatggtgtttccc 27647827  T
Q  513 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647826 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 27647777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 207 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 412369 - 412016
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gag 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||  || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  412369 aacagcacctagatctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagag 412273  T
Q  306 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |    
T  412272 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaag 412174  T
Q  406 --ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 502  Q
      |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  412173 agttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaa 412075  T
Q  503 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  412074 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 412016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 139 - 562
Target Start/End: Original strand, 3072596 - 3073014
Alignment:
Q  139 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaac-accacctagatctaatctaggaaccaag 237  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||  |||||||| |   |||||||||| || ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3072596 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaatctaggaaacaag 3072691  T
Q  238 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 337  Q
    ||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3072692 tgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 3072788  T
Q  338 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcact 434  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  3072789 actctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcaca 3072887  T
Q  435 atgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagata 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||      
T  3072888 atgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaag 3072986  T
Q  534 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||    
T  3072987 ctctaatcaaag-actctaaaccctagag 3073014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 138 - 562
Target Start/End: Original strand, 6097285 - 6097695
Alignment:
Q  138 aatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaccaa 236  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||| |   |||||||| | || |||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||    
T  6097285 aatgatgtgtggagcaacggaaagtagtaaccact-aacaaagtgt---gtgcaagctataatcaacaaaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaa 6097380  T
Q  237 gtgtgaaa-cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttga 334  Q
    |||  ||| |||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6097381 gtggaaaaacacaataca-caatcacaagata--caaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttga 6097477  T
Q  335 cctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcac 433  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6097478 cctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcac 6097566  T
Q  434 tatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagat 532  Q
     | |||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  6097567 aaagaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagat 6097665  T
Q  533 actctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097666 actctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6097695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 288 - 562
Target Start/End: Original strand, 2171512 - 2171792
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2171512 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 2171610  T
Q  388 caaaagggatgcaagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||    
T  2171611 c-aaagagatacaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaaga 2171708  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2171709 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 2171792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 31404656 - 31404932
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31404656 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 31404753  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  31404754 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaaga 31404851  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31404852 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaacccta 31404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 220
Target Start/End: Original strand, 6136079 - 6136216
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6136079 tgttgtgaatccccggacctccaaggccggatcgaaccataccaatacaaagaataatgatgtgtggagcaacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 6136178  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136179 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 6136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 555
Target Start/End: Original strand, 16452310 - 16452583
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16452310 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttc 16452407  T
Q  388 caaa-agggatgcaagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 476  Q
    |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  16452408 caaagagatatgaaag-ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 16452505  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 555  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16452506 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaac 16452583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 5406181 - 5406456
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5406181 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5406278  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  5406279 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 5406376  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406377 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5406456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 5410506 - 5410781
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5410506 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5410603  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  5410604 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 5410701  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410702 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5410781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 30834517 - 30834794
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30834517 aaacaaacacaccaa-agattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 30834613  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 476  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  30834614 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 30834712  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||||| || ||   | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30834713 gacactcaatgattttcactcaccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaacccta 30834794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 5413376 - 5413650
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5413376 aaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5413472  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  5413473 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaaga 5413570  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5413571 cactcaatgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5413650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13159164 - 13159051
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13159164 tgttgtgaatcctcggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 13159065  T
Q  182 ttattgtgcaagca 195  Q
    |||||| |||||||    
T  13159064 ttattgagcaagca 13159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 476
Target Start/End: Original strand, 33160254 - 33160521
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 305  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  || |||||| | |||| || |||||||| ||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||    
T  33160254 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaa-aaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-ag 33160349  T
Q  306 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag- 404  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||     
T  33160350 attgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaga 33160447  T
Q  405 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  33160448 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21589095 - 21588931
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  21589095 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 21588999  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21588998 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21593828 - 21593664
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  21593828 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 21593732  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21593731 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 299 - 476
Target Start/End: Original strand, 3808699 - 3808877
Alignment:
Q  299 ccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatg 398  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||     
T  3808699 ccaagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagata 3808796  T
Q  399 caaga--ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 476  Q
    ||| |  |||||||||||||||| || | |||| |||| | |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  3808797 caaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 16569208 - 16568953
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16569208 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16569112  T
Q  388 caaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactcaa 485  Q
    |||            ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||    
T  16569111 caa------------aggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaa 16569027  T
Q  486 tgattctctctt-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||| || |||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16569026 tgattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 5409051 - 5409151
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5409051 aaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5409147  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  5409148 caaa 5409151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 290 - 476
Target Start/End: Original strand, 9183015 - 9183199
Alignment:
Q  290 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 389  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9183015 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 9183110  T
Q  390 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9183111 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17758188 - 17758026
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  17758188 tcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 17758091  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17758090 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 2972943 - 2973107
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  2972943 tcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 2973039  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2973040 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 17763155 - 17762990
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||  | |||||    
T  17763155 tcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatc-aatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagttac 17763058  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  17763057 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 474
Target Start/End: Original strand, 26830127 - 26830289
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttac 409  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||    
T  26830127 tcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatggattac 26830223  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 474  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  26830224 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 22424829 - 22424995
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga---ggtt 407  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||| |   ||||    
T  22424829 tcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatgggtt 22424925  T
Q  408 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22424926 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 476
Target Start/End: Original strand, 28137420 - 28137576
Alignment:
Q  319 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaatt 417  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || | ||  ||||||||||||||    
T  28137420 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggttacaagaaatt 28137516  T
Q  418 agctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  28137517 agcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5043792 - 5043648
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  5043792 tcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 5043695  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 456  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  5043694 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 5043648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 473
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954450
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgca-ag 402  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || |     
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacagat 26954379  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 473  Q
      ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954380 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 391
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211267
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttcttacaaa 33211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26800748 - 26800674
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26800748 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa 26800674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 391
Target Start/End: Original strand, 603081 - 603170
Alignment:
Q  300 caagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  603081 caagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatc-aacgagttcttacaaa 603170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 476
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  331 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaag 428  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  | |||    
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaag 3039023  T
Q  429 ttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3039024 ctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 4045494 - 4045423
Alignment:
Q  406 ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  4045494 ttacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttctaccattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 232
Target Start/End: Original strand, 2171366 - 2171456
Alignment:
Q  139 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa 232  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||  |||||||| |   |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2171366 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa 2171456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Original strand, 21356021 - 21356084
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 352  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  21356021 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctggaggagaga 21356084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 82 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10593651 - 10593161
Alignment:
Q  82 ctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10593651 ctgttgtgtatccccgtatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 10593552  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10593551 gtattgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagaggga 10593453  T
Q  282 agaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593452 agtagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 10593353  T
Q  382 ttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 481  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10593352 ttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacac 10593253  T
Q  482 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10593252 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttccccctttg 10593161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 25078513 - 25078023
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||  | |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078513 tgttgtgaatccccaaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25078414  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25078413 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 25078316  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078315 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 25078216  T
Q  382 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078215 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 25078116  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078115 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25078023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 25136482 - 25135992
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||  | |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136482 tgttgtgaatccccaaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25136383  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25136382 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 25136285  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136284 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 25136185  T
Q  382 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136184 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 25136085  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136084 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25135992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 78 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 40382699 - 40382206
Alignment:
Q  78 attcctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaaca 177  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40382699 attcctgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcggcggagagtggtaaccaccaaaca 40382600  T
Q  178 aagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40382599 aagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--ga 40382502  T
Q  278 gggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40382501 gggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaa 40382402  T
Q  377 atgagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcacca 475  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40382401 atgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcacca 40382302  T
Q  476 agacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382301 agacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40382206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 40380483 - 40379995
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40380483 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 40380384  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40380383 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 40380286  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40380285 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgag 40380186  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380185 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 40380086  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380085 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40379995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16544804 - 16544312
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaag-atcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16544804 tgttgtgaatccccgagcctccaaggaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 16544705  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaac-aaggagagg 279  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  16544704 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagg 16544607  T
Q  280 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 378  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16544606 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 16544507  T
Q  379 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544506 gagttctttacaaaagggatacaagaggttatgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 16544407  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544406 gacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16544312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16547026 - 16546534
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaag-atcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  16547026 tgttgtgaatccccgagcctccaaggaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtgataaccaccaaacaaagc 16546927  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaac-aaggagagg 279  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  16546926 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagg 16546829  T
Q  280 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 378  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16546828 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 16546729  T
Q  379 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16546728 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaa 16546629  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546628 gacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16546534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 114 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29720721 - 29720278
Alignment:
Q  114 tcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacca 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||||    
T  29720721 tcgaaccacaccaatacaagaaata-tgttgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacacca 29720624  T
Q  214 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtca 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29720623 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttca 29720527  T
Q  314 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaaga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29720526 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 29720428  T
Q  414 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 512  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29720427 aattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 29720328  T
Q  513 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720327 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29720278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 114 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29722881 - 29722438
Alignment:
Q  114 tcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacca 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||||    
T  29722881 tcgaaccacaccaatacaagaaata-tggtgtgtggagcaaagtagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacacca 29722784  T
Q  214 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtca 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29722783 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttca 29722687  T
Q  314 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaaga 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29722686 cccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 29722588  T
Q  414 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 512  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29722587 aattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 29722488  T
Q  513 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722487 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29722438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 112 - 562
Target Start/End: Original strand, 29750968 - 29751414
Alignment:
Q  112 aatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || | | |||||||||| || |||||||||||    
T  29750968 aatcgaaccacaccaatacaagaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaatgtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacac 29751065  T
Q  212 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgg 310  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||   || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  29751066 cacctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtaca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgt 29751162  T
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29751163 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 29751261  T
Q  411 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 509  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29751262 agaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgttt 29751361  T
Q  510 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751362 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29751414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 113 - 566
Target Start/End: Original strand, 22536104 - 22536545
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaa-caaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||||| || |||||||| ||    
T  22536104 atcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaagcaaagtgtat---gcaagcaacaatcaacaaaaaac 22536197  T
Q  212 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 311  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22536198 -acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaaca-caatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgtt 22536293  T
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22536294 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 22536392  T
Q  412 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 511  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||    
T  22536393 gaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tgcagggtgtttcc 22536490  T
Q  512 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536491 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 22536545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 117 - 562
Target Start/End: Original strand, 9789042 - 9789478
Alignment:
Q  117 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacct 216  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| |   |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  9789042 aaccacaccaatacaaagtat---gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaaaaatcaacaaaacagcacct 9789134  T
Q  217 agatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacc 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||  || ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  9789135 agatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaac--ggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacc 9789231  T
Q  316 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaa 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  9789232 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaa 9789330  T
Q  415 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 513  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||    
T  9789331 attagatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttccca 9789429  T
Q  514 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9789430 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 9789478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 117 - 562
Target Start/End: Original strand, 18441462 - 18441902
Alignment:
Q  117 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacct 216  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| |   |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  18441462 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacagcacct 18441554  T
Q  217 agatctaatctaggaaccaagtgtgaaa----cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 311  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||    |||||  || ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18441555 agatctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaataca-caagcacaagataaac--ggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgtt 18441651  T
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  18441652 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttaca 18441750  T
Q  411 agaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 509  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||    
T  18441751 agaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttt 18441849  T
Q  510 cccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18441850 cccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 18441902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 187 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16409764 - 16409389
Alignment:
Q  187 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 284  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  16409764 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 16409668  T
Q  285 agaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 383  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16409667 ggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagtt 16409569  T
Q  384 cttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 481  Q
    |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16409568 cttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacac 16409470  T
Q  482 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  16409469 tcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 16409389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 207 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 26178150 - 26177797
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-ga 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  26178150 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga 26178054  T
Q  305 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag 404  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  26178053 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaag 26177955  T
Q  405 -gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 502  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||    
T  26177954 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaa 26177857  T
Q  503 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26177856 ggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 26177797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 254 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 26170983 - 26170688
Alignment:
Q  254 acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 352  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26170983 acaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 26170886  T
Q  353 ttgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatt 451  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  26170885 ttgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatt 26170798  T
Q  452 tctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccc 550  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||||||| || |    
T  26170797 tcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaag-actc 26170700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 25412947 - 25412672
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25412947 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 25412850  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||    
T  25412849 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaaga 25412752  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412751 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 207 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 30182852 - 30182499
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||    
T  30182852 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-ag 30182759  T
Q  306 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggat-gcaagag 404  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| | ||  |    
T  30182758 attgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatagaaaagg 30182661  T
Q  405 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 495  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  30182660 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 30182562  T
Q  496 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30182561 tcaccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatcccta 30182499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 304 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 13343232 - 13342971
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||| ||| |    
T  13343232 agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--caaagagatacaaaa 13343136  T
Q  404 gg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 492  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  13343135 ggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 13343037  T
Q  493 ctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    | ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13343036 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcagag-accctaaacccta 13342971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13240025 - 13239674
Alignment:
Q  199 aacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaata 296  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||   ||||||| |    
T  13240025 aacaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaaca 13239930  T
Q  297 caccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggga 396  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  13239929 caccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaga 13239833  T
Q  397 tgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaat 486  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||       |||||||||||||    
T  13239832 tacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 13239734  T
Q  487 gattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 546  Q
    |||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239733 gattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 36074024 - 36074302
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36074024 aaacaaacacaccaa-agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 36074120  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc----ctttcccaatctcac-------c 474  Q
      |||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||       |    
T  36074121 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaac 36074218  T
Q  475 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074219 aagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 37439328 - 37439161
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37439328 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 37439231  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    | |||| ||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  37439230 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 213630 - 213465
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  213630 tcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 213533  T
Q  410 aagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  213532 aagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 32637088 - 32636824
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 305  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  |||| ||||   |||| |||||||||||    | |||||||||   ||||||| ||||||| ||    
T  32637088 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaa----gggagggaagagagaaacaaacacaccaa-ag 32636994  T
Q  306 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagag 404  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  |    
T  32636993 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgg 32636897  T
Q  405 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32636896 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 40147425 - 40147261
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  40147425 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 40147329  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40147328 aagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 28278494 - 28278316
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  28278494 acaccaaga-attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagag 28278399  T
Q  396 atgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    || | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28278398 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 193345 - 193289
Alignment:
Q  20 atttcatgcacaacaataagagtaattttaaattcaaataaaaccctgactttctaa 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193345 atttcatgcacaacaataagagtaattttaaattcaaataaaaccctgactttctaa 193289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428598
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 42428523  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42428524 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13488365 - 13488203
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||    
T  13488365 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 13488269  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13488268 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5058209 - 5058131
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5058209 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 5058131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16452266 - 16452003
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16452266 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactat-gaatgagttctta 16452170  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc-------accaag 477  Q
    | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||  | ||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||       | ||||    
T  16452169 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaa-cttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaag 16452072  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaaga 546  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16452071 acactcaatgattgtcacttaccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaaga 16452003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 27637616 - 27637781
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 408  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  27637616 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 27637712  T
Q  409 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||  | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  27637713 caagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 559
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683178
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag--ttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaa 411  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||  || ||| | ||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtattcttac-aaagaaatacaaaagggttacaa 30683026  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaa 502  Q
    |||||||||||  ||||||||||    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||    
T  30683027 gaaattagcttcaacaagttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaa 30683122  T
Q  503 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683123 ggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 31183157 - 31182883
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31183157 aaacaaacacaccaa-agaatgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatc-aatgagttctta 31183061  T
Q  388 caaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagac 479  Q
    | |||||||| |||  ||||||||||||||| |||  ||||  |||| | |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||    
T  31183060 c-aaagggatacaaatggttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagac 31182963  T
Q  480 actcaatgattctctctttac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||| || ||   | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31182962 actcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 31182883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831590
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaa-agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 33831770  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 477  Q
    | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||        |||    
T  33831769 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataag 33831672  T
Q  478 acactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33831671 acactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 33831590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 533952 - 533769
Alignment:
Q  291 caaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaa 390  Q
    |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  533952 caaagacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-a 533857  T
Q  391 aagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||| ||| | ||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  533856 aagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 533769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 458
Target Start/End: Original strand, 8565926 - 8566095
Alignment:
Q  285 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 384  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8565926 agaaaacaaacacaccaaga--ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc 8566021  T
Q  385 ttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||| | |||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  8566022 ttac-agagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctaccc 8566095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 476
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695859
Alignment:
Q  331 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagcttga-caag 428  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||| || |||||||||   |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaa-tgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaag 13695811  T
Q  429 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13695812 ctcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Original strand, 28750661 - 28750738
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa 392  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28750661 acccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa 28750738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806463
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 19806463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27015687 - 27015609
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27015687 tcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatc-aatgagttcttacaaa 27015609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 473
Target Start/End: Original strand, 39468546 - 39468714
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||      
T  39468546 agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaat 39468642  T
Q  404 gg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39468643 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 39468714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 376
Target Start/End: Original strand, 16640961 - 16641008
Alignment:
Q  329 acttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16640961 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 16641008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Original strand, 42426255 - 42426403
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 425  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||| ||||||||||||||  ||    
T  42426255 aacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaac 42426352  T
Q  426 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    || ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  42426353 aatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 42426403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 538185 - 538028
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||    
T  538185 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 538089  T
Q  414 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    |||||||||  ||||| |||| | || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  538088 aattagcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcac 538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 373  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 422
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049455
Alignment:
Q  319 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaatt 417  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaatt 9049450  T
Q  418 agctt 422  Q
    |||||    
T  9049451 agctt 9049455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 3075640 - 3075726
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3075640 aaacaaacacaccaagaaat-gttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaa 3075726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3617842 - 3617352
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617842 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaataagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 3617743  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3617742 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 3617645  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617644 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 3617545  T
Q  382 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617544 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 3617445  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617444 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3617352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 25637822 - 25637331
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25637822 tgttgtgaatccccggacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtg 25637723  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagc-aacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637722 tattgtgcaagcaggaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagaggga 25637623  T
Q  282 agaagaaaacaaatacacc-aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 380  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637622 agaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 25637523  T
Q  381 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 479  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637522 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 25637423  T
Q  480 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25637422 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagatacccctttg 25637331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Original strand, 4598299 - 4598788
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4598299 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagct 4598398  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598399 tattgagcaagcaagaaacaataaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 4598496  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598497 gaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 4598596  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 479  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598597 ttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 4598696  T
Q  480 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598697 actcaatgattctctc--tacagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4598788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Original strand, 4600520 - 4601009
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4600520 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagct 4600619  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600620 tattgagcaagccagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 4600717  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600718 gaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 4600817  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 479  Q
    ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600818 ttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 4600917  T
Q  480 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4600918 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4601009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10211788 - 10211298
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  10211788 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaatcaaagc 10211689  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211688 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 10211591  T
Q  282 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 380  Q
    ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211590 agatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 10211491  T
Q  381 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 478  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211490 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 10211391  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10211390 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10211298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10209568 - 10209078
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||     
T  10209568 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagtgacggagagtggtaaccaccaatcaaagc 10209469  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209468 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 10209371  T
Q  282 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 380  Q
    ||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209370 agatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 10209271  T
Q  381 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 478  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209270 gttctttacaaaaggactacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 10209171  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10209170 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10209078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10056612 - 10056122
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10056612 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10056513  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10056512 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10056416  T
Q  281 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 379  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10056415 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10056316  T
Q  380 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 477  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056315 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10056216  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10056215 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10056122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10058834 - 10058344
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10058834 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10058735  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10058734 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10058638  T
Q  281 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 379  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10058637 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10058538  T
Q  380 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 477  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058537 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10058438  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10058437 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10058344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10061056 - 10060566
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10061056 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10060957  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10060956 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10060860  T
Q  281 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 379  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10060859 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10060760  T
Q  380 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 477  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060759 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10060660  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10060659 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10060566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10063278 - 10062788
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10063278 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10063179  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10063178 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10063082  T
Q  281 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 379  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10063081 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10062982  T
Q  380 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 477  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062981 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10062882  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10062881 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10062788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10065500 - 10065010
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10065500 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10065401  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10065400 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10065304  T
Q  281 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 379  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10065303 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10065204  T
Q  380 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 477  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065203 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10065104  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10065103 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10065010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 45283344 - 45282897
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  45283344 atcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaataatcaacaaaacacc 45283249  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  45283248 acctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttc 45283150  T
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa---gggatgcaagaggttac 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||    
T  45283149 actcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaaggttac 45283050  T
Q  410 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45283049 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgcaaggtgttt 45282950  T
Q  510 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282949 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 45282897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 135 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 54635462 - 54635039
Alignment:
Q  135 aataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaacc 234  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54635462 aataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaac 54635364  T
Q  235 aagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttg 333  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54635363 aagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 54635267  T
Q  334 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcac 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635266 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcac 54635168  T
Q  434 tatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 533  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635167 aatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 54635068  T
Q  534 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635067 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagag 54635039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 113 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 6716858 - 6716414
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaac-aaaacac 211  Q
    |||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||| |||||||    
T  6716858 atcgaaccacaccaatgcaaagagt---gatgtgtggagcaacggaaagcggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaaccaaaacac 6716763  T
Q  212 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||     
T  6716762 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgt 6716665  T
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6716664 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 6716566  T
Q  411 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716565 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 6716466  T
Q  511 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716465 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6716414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 186 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 801376 - 801005
Alignment:
Q  186 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacac--cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaag 283  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  801376 tgtgcaagcaataatcaacaaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtg-gaaaaaca---caata--cacaagataaa--aggagagggaag 801285  T
Q  284 aagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 383  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  801284 aagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc-aatgagtt 801186  T
Q  384 cttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    |||||||||| ||| ||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  801185 cttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagaca 801087  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  801086 ctcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 801005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 117 - 513
Target Start/End: Original strand, 7779821 - 7780208
Alignment:
Q  117 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaa-caccacc 215  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || |||||||| || ||||    
T  7779821 aaccacaccaatacgaag--taa-gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaaacagcacc 7779913  T
Q  216 tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaa-cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcac 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7779914 tagatctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaataca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcac 7780010  T
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaa 414  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  7780011 ccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaa 7780109  T
Q  415 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 513  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7780110 attagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 83 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10067699 - 10067435
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10067699 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10067600  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 280  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10067599 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10067503  T
Q  281 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 347  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067502 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 374 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10067431 - 10067232
Alignment:
Q  374 caaatgagttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 471  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067431 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 10067332  T
Q  472 accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctt 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10067331 accaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctt 10067234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 187 - 562
Target Start/End: Original strand, 23200020 - 23200398
Alignment:
Q  187 gtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag-tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 285  Q
    |||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  23200020 gtgcaagcaataatcaacaataaaacacctagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcataagataaa--aggagagggaagaa 23200116  T
Q  286 gaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 385  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23200117 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttct 23200214  T
Q  386 tacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------caa 476  Q
    |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |||    
T  23200215 tacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaa 23200312  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23200313 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23200398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 562
Target Start/End: Original strand, 23197823 - 23198199
Alignment:
Q  189 gcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag-tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 287  Q
    |||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  23197823 gcaagcaataatcaacaataaaacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagagaagagga 23197919  T
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23197920 aaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttctta 23198017  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------caaga 478  Q
    |||||  ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |||||    
T  23198018 caaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaaga 23198115  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23198116 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23198199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718598
Alignment:
Q  442 aaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 541  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  542 aaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagag 6718598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 45095350 - 45095075
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45095350 aaacaaatacgccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 45095253  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  45095252 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 45095155  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095154 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 9636106 - 9636385
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9636106 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 9636204  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctc-------accaa 476  Q
    |||||  ||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||       |||||    
T  9636205 caaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaa 9636302  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636303 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 9636385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 5258125 - 5258402
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5258125 aaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 5258221  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 476  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  5258222 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 5258320  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5258321 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5258402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 190 - 473
Target Start/End: Original strand, 19683774 - 19684054
Alignment:
Q  190 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 287  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  19683774 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 19683869  T
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19683870 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19683967  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19683968 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 5260304 - 5260581
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5260304 aaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 5260400  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctc-------accaa 476  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||       |||||    
T  5260401 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaa 5260499  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260500 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5260581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 37408645 - 37408458
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37408645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 37408548  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37408547 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762265
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaa 7762340  T
Q  404 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7762339 gagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7764747 - 7764476
Alignment:
Q  190 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 287  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||  || |||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  7764747 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaa--aggagag--aagagag 7764652  T
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7764651 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatc-aatgagttctta 7764554  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttccc 465  Q
    | |||| ||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7764553 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 304 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581193
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||     
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 9581357  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 494  Q
     ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       ||||||||||||||||| ||     
T  9581356 gggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttca 9581258  T
Q  495 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9581257 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 9581193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 34491397 - 34491212
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34491397 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttac 34491301  T
Q  389 aaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34491300 aaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 296 - 476
Target Start/End: Original strand, 49199457 - 49199638
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  49199457 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gag 49199554  T
Q  396 atgcaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    || ||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  49199555 atacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 29196368 - 29196555
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29196368 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 29196464  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||| ||| | ||  |||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29196465 c-aaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 4570115 - 4569952
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||||    
T  4570115 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaa 4570018  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4570017 gaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 476
Target Start/End: Original strand, 43401789 - 43401970
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  43401789 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 43401886  T
Q  396 atgcaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||  || |   ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43401887 ataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 304 - 473
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153526
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||      
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttctta-taaagggatacaaat 39153454  T
Q  404 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39153455 gagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 40735568 - 40735293
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40735568 aacaaatacaccaa-agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 40735472  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
     |||| ||| | ||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       |||||    
T  40735471 -aaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaga 40735374  T
Q  479 cactcaatgattctctc-tttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  40735373 cactcaatgattttcacttttccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaacccta 40735293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 30236304 - 30236129
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  30236304 acaccaagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gag 30236208  T
Q  396 atgcaag-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 472  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30236207 atacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 300 - 391
Target Start/End: Original strand, 43403736 - 43403826
Alignment:
Q  300 caagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43403736 caagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 43403826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16499215 - 16499115
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16499215 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16499119  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  16499118 caaa 16499115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734498
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||      
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 40734573  T
Q  404 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40734572 gtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 41819526 - 41819691
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 408  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  41819526 tcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat--aatgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 41819622  T
Q  409 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41819623 caagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331545
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||      
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-taagttcttacaaa-gagatacaaat 44331620  T
Q  404 gg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    || ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  44331619 ggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 761033 - 760757
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  761033 aaacaaacacaccaa-agattgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 760937  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 477  Q
    | |||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  760936 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaag 760839  T
Q  478 acactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||| || ||  | ||||||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  760838 acactcaatgattttcactcatccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 760757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 315 - 473
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835167
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaaga 22835106  T
Q  414 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22835107 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Original strand, 6095603 - 6095681
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6095603 tcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 6095681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813083
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagagatgcaaat 29813138  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  29813137 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 29813083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 40913472 - 40913379
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40913472 acaccaagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttacaaa 40913379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 51398999 - 51398833
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51398999 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaa-tgagttcttac 51398903  T
Q  389 aaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    ||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51398902 aaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctaccc 51398833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 31314631 - 31314447
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31314631 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 31314535  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 474  Q
    |||||  ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  31314534 caaaa-agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 54593868 - 54593790
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54593868 tcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 54593790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaag- 402  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||      
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaa-gagatacaaat 44700571  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44700572 aggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Original strand, 5236440 - 5236624
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  5236440 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaa-tgagttcttac 5236535  T
Q  389 aaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||| | ||| |||  || |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5236536 aaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682269
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||     
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 29682434  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 493  Q
     ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  29682433 gggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttc 29682335  T
Q  494 tct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
     ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29682334 actcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 29682269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 32744418 - 32744684
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32744418 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaa-gagttctta 32744514  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactca 484  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||  |||  |||||||| ||| | |||||    
T  32744515 caaa-gtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctacccattttttcaatctca-caaaatactca 32744610  T
Q  485 atgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32744611 atgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 32744684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 46860631 - 46860474
Alignment:
Q  319 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaatt 417  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| | ||  ||||||||||||||    
T  46860631 ttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgggttacaagaaatt 46860534  T
Q  418 agctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  46860533 agcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 476
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921671
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaaga 413  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||  | |||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaaga 53921607  T
Q  414 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||| || ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  53921608 aattagctttaacaagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 46173536 - 46173377
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    ||||||||| |||| | | | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  46173536 acaccaagaaattgttgatctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac-aaagag 46173440  T
Q  396 atgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    || | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  46173439 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810889
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 425  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 29810919  T
Q  426 aagttcactatgaacaaaccctaatttctac 456  Q
    |||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  29810918 aagttcacaaagaac-aactctaatttctac 29810889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 458
Target Start/End: Original strand, 9666448 - 9666616
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9666448 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaa-gaattctta 9666544  T
Q  388 caaa-agggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||| ||| ||  | || ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||    
T  9666545 caaagaggtataaatga-gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctaccc 9666616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 47304430 - 47304340
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47304430 acaccaataaattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 47304340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Original strand, 55301975 - 55302054
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  55301975 tcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 55302054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 375
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  316 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatca 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891105
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaaga 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||  | |||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaac-gagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaaga 32891168  T
Q  414 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 474  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  32891167 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 471
Target Start/End: Original strand, 4055745 - 4055926
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag-ttct 385  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||  |  |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  4055745 aaacaaatacaccaaga-tttggttacccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatc-aatgagtttct 4055840  T
Q  386 tacaaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 471  Q
    ||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||| | || |||||||| | | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4055841 tac-aaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttctacccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 23391891 - 23391991
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  23391891 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaa-gagttcttg 23391987  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  23391988 caaa 23391991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 476
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  404 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Original strand, 2075081 - 2075143
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2075081 acccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaa 2075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 80 - 573
Target Start/End: Original strand, 18388533 - 18389024
Alignment:
Q  80 tcctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaa 179  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388533 tcctgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaa 18388632  T
Q  180 gtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  18388633 gtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaagagagg 18388730  T
Q  280 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 378  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388731 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 18388830  T
Q  379 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 477  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388831 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 18388930  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388931 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18389024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Original strand, 18391972 - 18392460
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18391972 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacagagagtggtaaccaccgaacaaagtt 18392071  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18392072 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 18392169  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392170 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 18392269  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392270 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 18392369  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392370 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18392460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 81 - 573
Target Start/End: Original strand, 32060096 - 32060590
Alignment:
Q  81 cctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaag 180  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060096 cctgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaag 32060195  T
Q  181 tttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  32060196 tttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--gg 32060293  T
Q  281 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 379  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060294 aagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 32060393  T
Q  380 agttctt-acaaaa--gggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060394 agttctttacaaaaaggggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 32060493  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32060494 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttaccctttg 32060590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Original strand, 6594334 - 6594822
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6594334 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6594433  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6594434 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 6594531  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594532 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 6594631  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594632 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 6594731  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594732 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6594822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Original strand, 6592116 - 6592604
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6592116 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6592215  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  6592216 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaag--gagggaa 6592313  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592314 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 6592413  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6592414 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagaca 6592513  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592514 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6592604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 113 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20344254 - 20343811
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || | |||||| |||    
T  20344254 atcgaaccacaccaatgcaaagaat---gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaatcgacaaaaaacc 20344161  T
Q  213 a---cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagatt 308  Q
    |   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  20344160 agcacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaaca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagatt 20344064  T
Q  309 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggtta 408  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20344063 gttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 20343965  T
Q  409 caagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343964 caagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 20343865  T
Q  509 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343864 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20343811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 82 - 397
Target Start/End: Original strand, 1560440 - 1560755
Alignment:
Q  82 ctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1560440 ctgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagt 1560539  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560540 atattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 1560639  T
Q  282 agaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560640 agaagaaaacaaatacaccaagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 1560739  T
Q  382 ttcttacaaaagggat 397  Q
    ||||||||||||||||    
T  1560740 ttcttacaaaagggat 1560755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 241 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24790074 - 24789755
Alignment:
Q  241 gaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa-caaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctac 339  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790074 gaaacacaatgca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 24789978  T
Q  340 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatga 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24789977 tctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaa-gagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatga 24789879  T
Q  439 acaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 538  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789878 acaaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 24789779  T
Q  539 atcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24789778 atcaaagaaccctaaaccctagag 24789755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 139 - 562
Target Start/End: Original strand, 43503991 - 43504409
Alignment:
Q  139 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaa-g 237  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||   || |||||||||||||||||| ||| |    
T  43503991 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccacc-aacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaaa--cagctagatctaatctaggaatcaaag 43504086  T
Q  238 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 337  Q
    ||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43504087 tgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcgatccaaacttgacct 43504183  T
Q  338 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcact 434  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  43504184 actatggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcaca 43504282  T
Q  435 atgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagata 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||      
T  43504283 atgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaag 43504381  T
Q  534 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||    
T  43504382 ctctaatcaaag-actctaaaccctagag 43504409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 187 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 39731656 - 39731283
Alignment:
Q  187 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 284  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  39731656 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 39731560  T
Q  285 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 384  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39731559 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 39731462  T
Q  385 ttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagct-tgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 482  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39731461 ttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacact 39731363  T
Q  483 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39731362 caatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 39731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 406 - 573
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562268
Alignment:
Q  406 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggt 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggt 1562200  T
Q  506 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 1562268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 35854102 - 35853825
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35854102 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 35854004  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 477  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  35854003 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaag 35853906  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35853905 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaacccta 35853825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 288 - 562
Target Start/End: Original strand, 25766940 - 25767215
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25766940 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 25767037  T
Q  388 caaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc----accaagac 479  Q
    |||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    | ||||||    
T  25767038 caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagac 25767136  T
Q  480 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25767137 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttt---cccaaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 25767215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 29991240 - 29990965
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  29991240 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttatta 29991143  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
      |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||    
T  29991142 -gaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaaga 29991045  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29991044 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 29990965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 288 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 48408992 - 48408709
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  48408992 aaacaaacacaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatc-aatgagttattt 48408894  T
Q  388 caaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caa 476  Q
    |||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||       |||    
T  48408893 caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaa 48408795  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408794 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 48408709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 190 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 25616137 - 25615785
Alignment:
Q  190 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaacc-aagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 287  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||| | |||| |||||||||||      ||| ||||||||    
T  25616137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaa------gagagaagaaga 25616044  T
Q  288 ---aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 384  Q
       ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25616043 gagaaacaaacacaccaa-agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc 25615946  T
Q  385 ttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacac 481  Q
    ||||||||  ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||  |||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||    
T  25615945 ttacaaaa-tgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacac 25615851  T
Q  482 tcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 546  Q
    ||||||||| |||||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615850 tcaatgattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23555323 - 23555039
Alignment:
Q  190 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 287  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||  | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  23555323 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 23555228  T
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23555227 aaacaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctta 23555130  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||  || | ||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  23555129 caaagagg-tacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||      
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaat 34310809  T
Q  404 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34310810 gtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 19502365 - 19502088
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19502365 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19502268  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 476  Q
    | |||| ||| ||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||| ||||||||| ||   |||| |||||||||       |||    
T  19502267 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaa 19502170  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19502169 gacactcaatgattctcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 19502088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22270158 - 22269973
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22270158 aacaaacacaccaagagat-gttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatcagttcttac 22270062  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22270061 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 41317416 - 41317602
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41317416 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 41317512  T
Q  388 caaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41317513 c-aaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 4179054 - 4178685
Alignment:
Q  191 aagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 288  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| || ||| || || |||||  |||||||  ||||   |    
T  4179054 aagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaacca-caagcaaaatataaa--aggagag--aagagaga 4178960  T
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||      
T  4178959 aacaaacacaccaa-agattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatc-aatgagttctt-- 4178864  T
Q  389 aaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
     |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||    
T  4178863 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaaga 4178765  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4178764 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 4178685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 290 - 476
Target Start/End: Original strand, 14069817 - 14070001
Alignment:
Q  290 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 389  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14069817 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 14069912  T
Q  390 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14069913 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 290 - 476
Target Start/End: Original strand, 14379845 - 14380029
Alignment:
Q  290 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 389  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14379845 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 14379940  T
Q  390 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14379941 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 27348081 - 27347817
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||    | ||| |||||    |||||| ||||||| ||    
T  27348081 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa----gtgagagaagagaggaacaaacacaccaa-ag 27347987  T
Q  306 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagag 404  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |    
T  27347986 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgg 27347890  T
Q  405 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27347889 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 8359319 - 8359485
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 408  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  8359319 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 8359416  T
Q  409 caagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||| || | |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  8359417 caagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 288 - 457
Target Start/End: Original strand, 41648993 - 41649158
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41648993 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 41649089  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    | |||||||| | ||  ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41649090 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 41649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 2390461 - 2390301
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |    
T  2390461 acaccaagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-atatgagttattac-aaagag 2390365  T
Q  396 atgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    || | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  2390364 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 29608901 - 29608737
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  29608901 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 29608805  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29608804 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 476
Target Start/End: Original strand, 30024740 - 30024900
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||    
T  30024740 ccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 30024836  T
Q  414 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30024837 aattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Original strand, 32358058 - 32358136
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32358058 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 32358136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttaca 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| | ||  |||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttaca 6432038  T
Q  411 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  6432037 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 425  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 48491630  T
Q  426 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48491629 aagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18126829 - 18126644
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18126829 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatc-aatgagttcttac 18126733  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  18126732 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 3259159 - 3258995
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||| |||  | |||||    
T  3259159 tcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaatgagttac 3259063  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    || ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  3259062 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24790333 - 24790230
Alignment:
Q  139 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||     ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24790333 atgatgtgtggagcaacggaaagtggtaaccaccaaacaaagtgc---gtgcaagtaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaggt 24790237  T
Q  239 gtgaaac 245  Q
    | |||||    
T  24790236 gagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 48599338 - 48599502
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||| |||  | |||||    
T  48599338 tcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagctctt-ccaaagagatacaaatgagttac 48599434  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48599435 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||      
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttattacaaa-gagatacaaat 8153417  T
Q  404 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8153416 gagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361140
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 411  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaa 2361074  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2361075 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 4253510 - 4253697
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||||| || | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||     
T  4253510 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaa-tgagttcttt 4253606  T
Q  388 caaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||| |||  || ||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  4253607 ccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 43864406 - 43864244
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||| | ||  |||||||     
T  43864406 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aattagtttttac-aaagagatacaaatgggttacag 43864310  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43864309 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 48489616 - 48489431
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  48489616 aacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttattgc 48489520  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||  | | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48489519 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 4508710 - 4508874
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  4508710 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 4508806  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4508807 aagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 458
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733118
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 31733062  T
Q  403 aggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  31733063 gggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 31733118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 546
Target Start/End: Original strand, 47673953 - 47674189
Alignment:
Q  316 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaa 414  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||    
T  47673953 cagttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 47674048  T
Q  415 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaagg 504  Q
    ||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||    
T  47674049 attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 47674147  T
Q  505 tgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 546  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47674148 tgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 36146390 - 36146576
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36146390 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttctta 36146486  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||| ||| | ||  |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36146487 c-aaagagatacaaatgggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 4586323 - 4586161
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggat-gcaagaggttacaa 411  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||   ||  ||||||||    
T  4586323 acccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagataaaaatgggttacaa 4586227  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     ||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4586226 aaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4586161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26417501 - 26417316
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26417501 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac 26417405  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26417404 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26417316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Original strand, 47676119 - 47676304
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  47676119 aacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatc-attgagttcttac 47676215  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  47676216 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47676304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 38671204 - 38671480
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38671204 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaa-tgagttctta 38671300  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 477  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  38671301 caaa-gtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaag 38671398  T
Q  478 acactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38671399 acactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 38671480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 457
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565210
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaaga 413  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaaga 23565165  T
Q  414 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    |||||| ||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  23565166 aattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 24525484 - 24525584
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24525484 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 24525580  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  24525581 caaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518988
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtc-aatgagttcttacaaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 473
Target Start/End: Original strand, 495965 - 496148
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  495965 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 496061  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
      |||| ||| | ||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  496062 -taaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1113843 - 1113743
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | || || ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1113843 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttctta 1113747  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  1113746 caaa 1113743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 391
Target Start/End: Original strand, 6359941 - 6360034
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6359941 acaccaagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaa 6360034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18396481 - 18396418
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18396481 acccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaa 18396418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30814598 - 30814536
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30814598 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 30814536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Original strand, 31105399 - 31105476
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa 392  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31105399 acccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatc-aatgagttcttacaaaa 31105476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 391
Target Start/End: Original strand, 2759207 - 2759279
Alignment:
Q  317 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2759207 agttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 2759279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23344048 - 23343975
Alignment:
Q  404 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23344048 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 476
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  405 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 387
Target Start/End: Original strand, 4510552 - 4510626
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4510552 tcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta 4510626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 387
Target Start/End: Original strand, 4512394 - 4512468
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4512394 tcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta 4512468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 372
Target Start/End: Original strand, 12097849 - 12097931
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccacta 372  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  12097849 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta 12097931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 455
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328538
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 411  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||| |   |||| ||| ||| || |||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactat-taatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaa 22328493  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 455  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||||||| ||||||||||    
T  22328494 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttcta 22328538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 474 - 559
Target Start/End: Original strand, 24514934 - 24515018
Alignment:
Q  474 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24514934 caagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 24515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 82 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 44204025 - 44203536
Alignment:
Q  82 ctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44204025 ctgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 44203926  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44203925 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 44203828  T
Q  282 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 380  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203827 agaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 44203728  T
Q  381 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 479  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203727 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 44203628  T
Q  480 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203627 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 44203536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9036774 - 9036320
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9036774 atcgaaccacaccaatgcaaaggat---gatgtgtggagctaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 9036679  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9036678 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttc 9036580  T
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaag 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9036579 acccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 9036481  T
Q  413 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 512  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036480 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 9036381  T
Q  513 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9036380 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 9036320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 112 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21054315 - 21053872
Alignment:
Q  112 aatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |   |||||||||| || |||||||||||    
T  21054315 aatcgaaccacaccaatacaagaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaactaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacac 21054220  T
Q  212 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054219 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 21054123  T
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  21054122 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaa 21054024  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 510  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  21054023 gaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctacaaggtgtttc 21053924  T
Q  511 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053923 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 21053872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 139 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 40282711 - 40282291
Alignment:
Q  139 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaa-caaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag 237  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40282711 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag 40282613  T
Q  238 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 337  Q
    || |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40282612 tgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 40282516  T
Q  338 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactat 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  40282515 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaat 40282417  T
Q  437 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 536  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282416 gaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 40282317  T
Q  537 taatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40282316 taatcaaagaaccctaaaccctagag 40282291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 112 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9987559 - 9987116
Alignment:
Q  112 aatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 211  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |   |||||||||| || |||||||||||    
T  9987559 aatcgaaccacaccaatacgaaaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaatcaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacac 9987464  T
Q  212 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  9987463 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgt 9987367  T
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttaca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  9987366 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa-tgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttgca 9987268  T
Q  411 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 509  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9987267 agaaattagattagacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgttt 9987169  T
Q  510 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987168 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 9987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 139 - 562
Target Start/End: Original strand, 20622072 - 20622492
Alignment:
Q  139 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 238  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20622072 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 20622170  T
Q  239 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgaccta 338  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622171 gagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 20622267  T
Q  339 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa--gggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacta 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  20622268 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaa 20622366  T
Q  436 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 535  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622367 tgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 20622465  T
Q  536 ctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20622466 ctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 51765684 - 51765302
Alignment:
Q  187 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 284  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  51765684 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 51765588  T
Q  285 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 384  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51765587 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 51765490  T
Q  385 ttacaaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------ 473  Q
    ||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||          
T  51765489 ttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaa 51765390  T
Q  474 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51765389 caagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 51765302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 190 - 473
Target Start/End: Original strand, 8550670 - 8550952
Alignment:
Q  190 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga-ag 286  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||   |||| ||||||||||| |  |||| | |||| ||    
T  8550670 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaaga--gagaag-aagagag 8550766  T
Q  287 aaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 386  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8550767 aaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8550864  T
Q  387 acaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    || |||||||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8550865 ac-aaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 304 - 477
Target Start/End: Original strand, 13316348 - 13316521
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||| |    
T  13316348 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaa 13316445  T
Q  404 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaag 477  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13316446 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 20762859 - 20762582
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20762859 aaacaaacacaccaa-agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 20762762  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 476  Q
    |  ||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||       |||    
T  20762761 c-gaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaa 20762664  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    || ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20762663 gatactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 20762582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 3189517 - 3189330
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3189517 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3189420  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||  ||| ||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3189419 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 3198334 - 3198147
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3198334 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3198237  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||  ||| ||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3198236 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 3207173 - 3206986
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3207173 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3207076  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||  ||| ||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3207075 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 37168462 - 37168297
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 408  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  37168462 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 37168366  T
Q  409 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37168365 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 296 - 476
Target Start/End: Original strand, 42297963 - 42298143
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  42297963 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gag 42298060  T
Q  396 atgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 476  Q
    || |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42298061 atacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 13547093 - 13547257
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  13547093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 13547189  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13547190 aagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 476
Target Start/End: Original strand, 28220210 - 28220394
Alignment:
Q  290 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 389  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28220210 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 28220305  T
Q  390 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28220306 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatgcaaaa 37033165  T
Q  404 --ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
      | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37033166 tggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 473
Target Start/End: Original strand, 834149 - 834332
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  834149 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttctta 834245  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcac 473  Q
    | |||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  834246 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 13549004 - 13549168
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  13549004 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 13549100  T
Q  410 aagaaatta-gcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | ||||||| | || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13549101 atgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 29136412 - 29136247
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  || | ||  |||| |    
T  29136412 tcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggttcc 29136315  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29136314 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 47255343 - 47255508
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  47255343 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 47255440  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  47255441 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 289 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 3157050 - 3156776
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3157050 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 3156954  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       |||||    
T  3156953 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaga 3156856  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   || ||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3156855 cactcaatgattttcactcaccagggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 3156776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 4552619 - 4552805
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4552619 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctta 4552715  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4552716 c-aaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 4552805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 288 - 457
Target Start/End: Original strand, 28265536 - 28265702
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28265536 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 28265632  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28265633 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 28265702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 7482234 - 7482399
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 408  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  7482234 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 7482330  T
Q  409 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482331 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 44455322 - 44455160
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||  | |||||||    
T  44455322 acccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaatgagttacaa 44455226  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44455225 gaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 11348862 - 11348698
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| | ||  ||||||    
T  11348862 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta-gaaagagatacaaatgggttac 11348766  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11348765 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 13659318 - 13659418
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13659318 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 13659414  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  13659415 caaa 13659418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Original strand, 37503540 - 37503722
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37503540 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 37503636  T
Q  389 aaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  37503637 -aaagagataca--aggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 37503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 49918535 - 49918350
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49918535 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 49918439  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  49918438 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 458
Target Start/End: Original strand, 31925711 - 31925856
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  31925711 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 31925807  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  31925808 aagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctaccc 31925856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 47115337 - 47115171
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 408  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||| ||| |  |||||    
T  47115337 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaaatgggtta 47115240  T
Q  409 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47115239 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 476
Target Start/End: Original strand, 28223405 - 28223589
Alignment:
Q  290 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 389  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28223405 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 28223500  T
Q  390 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||  | || | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28223501 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28223589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28242469 - 28242391
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28242469 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||      
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 45644447  T
Q  404 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  45644448 gagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 46065104 - 46065004
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46065104 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttctta 46065008  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  46065007 caaa 46065004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 50169192 - 50169378
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  50169192 aaacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaa-tgagtactta 50169288  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||| | ||| |||  | |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  50169289 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603595
Alignment:
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttac 409  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||  || |  ||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatc-aatgagttcttac-aaagagataaaaaatgggttac 34603644  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  34603643 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 34603595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 193775 - 193697
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  193775 tcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattacaaa 193697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19754657 - 19754494
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 411  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||    
T  19754657 acccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatcggttacaa 19754561  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  19754560 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555433
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagcttga-c 425  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||| |||||||||| || | |    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttataagaaattagtttcaac 23555382  T
Q  426 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  23555383 aagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659238
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| | ||     
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaat 31659313  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  31659312 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 31659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 50167157 - 50167343
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  50167157 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttta 50167253  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  50167254 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833522
Alignment:
Q  331 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagcttgacaag- 428  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||  | |||||||||| ||||||| |  ||     
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaataga 1833570  T
Q  429 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1833569 ttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 1833522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 473
Target Start/End: Original strand, 3847103 - 3847286
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847103 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3847199  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    | |||||||| | ||  |||||||| || |||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3847200 c-aaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 3847286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 36683866 - 36683766
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| |||||||||||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36683866 aaacaaacacaccaagagat-gtttactcagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatc-aatgagttctta 36683770  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  36683769 caaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Original strand, 37876770 - 37876848
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37876770 tcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaa 37876848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 422
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138089
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||     
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatc-aatgtgttcttac-aaagagatgcaaat 13138069  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt 422  Q
     |||||||||||||||||||    
T  13138070 gggttacaagaaattagctt 13138089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 457
Target Start/End: Original strand, 196915 - 197056
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaag 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||    
T  196915 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgagttacaag 197011  T
Q  413 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    |||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  197012 aaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 197056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752685
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 19752761  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcaccaa 476  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| || | | |||| ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  19752760 cggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 332 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  332 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 429  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||     
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagc 22079363  T
Q  430 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 471  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  22079362 tcacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 455
Target Start/End: Original strand, 927982 - 928123
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaa 411  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||| |||  ||||| |||||||||| || |||||| ||||||| | ||| ||| ||| ||||||    
T  927982 acccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaa-tgagtttttacaaa-gagatccaaaagggttacaa 928078  T
Q  412 gaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 455  Q
    ||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928079 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820326
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gac 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatc-aatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaac 15820358  T
Q  426 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    ||| |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  15820357 aagctcacaaagaacaaa-cctaatttttaccc 15820326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 400 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 32737009 - 32736952
Alignment:
Q  400 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  32737009 aagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 457
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282841
Alignment:
Q  317 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaa 415  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||   |||| ||||||| | |||||| | |||    
T  37282701 agttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccacta-ctaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaa 37282798  T
Q  416 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    |||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||    
T  37282799 ttagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttatacc 37282841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 40122178 - 40122280
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac--tatcaaatgagttct 385  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  40122178 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaa-gagttct 40122274  T
Q  386 tacaaa 391  Q
    ||||||    
T  40122275 tacaaa 40122280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 376
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871130
Alignment:
Q  319 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8871074 ttcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 16455807 - 16455709
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||||||||||||| || | | || ||||| |||||||  |||||| ||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16455807 aaacaaatacaccaagaaat-gtttacacagtttggtccaat-ttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16455711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 471
Target Start/End: Original strand, 12318618 - 12318685
Alignment:
Q  404 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 471  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12318618 ggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatctc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Original strand, 12647162 - 12647650
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647162 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 12647261  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12647262 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 12647359  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647360 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 12647459  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647460 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 12647559  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647560 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 12647650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 496
Target Start/End: Original strand, 13655805 - 13656220
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13655805 tgttgtgaatccccggacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagta 13655904  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13655905 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 13656004  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 380  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656005 gaagaaaacaacaaacaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 13656104  T
Q  381 gttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656105 gttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 13656204  T
Q  481 ctcaatgattctctct 496  Q
    ||||||||||||||||    
T  13656205 ctcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 139 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 6267023 - 6266605
Alignment:
Q  139 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 238  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  6267023 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgtaagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagt 6266927  T
Q  239 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 337  Q
    |  ||||||||  || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6266926 gaaaaacacaataca-caagcacaagataaac--ggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 6266830  T
Q  338 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactat 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  6266829 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaat 6266731  T
Q  437 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 536  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266730 gaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 6266631  T
Q  537 taatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6266630 taatcaaagaaccctaaaccctagag 6266605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 117 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 32289916 - 32289479
Alignment:
Q  117 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacc 215  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||  ||||||||     |||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  32289916 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgg---gtgcaagcaataatcaacaataacaacacc 32289824  T
Q  216 tagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtca 313  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  32289823 tagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttca 32289727  T
Q  314 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaag 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||    
T  32289726 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaag 32289628  T
Q  413 aaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 511  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |    
T  32289627 aaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 32289530  T
Q  512 catgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  32289529 catgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 32289479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 187 - 562
Target Start/End: Original strand, 4484211 - 4484592
Alignment:
Q  187 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaag-caacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 284  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||  | |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  4484211 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaa-gtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaaga 4484307  T
Q  285 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 384  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4484308 agaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 4484405  T
Q  385 ttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------c 474  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||      |    
T  4484406 ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaac 4484504  T
Q  475 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4484505 aagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 4484592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 30833633 - 30833342
Alignment:
Q  187 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 284  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30833633 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 30833537  T
Q  285 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 384  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30833536 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 30833439  T
Q  385 ttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 478  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  30833438 ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 30833342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 188 - 559
Target Start/End: Original strand, 4503017 - 4503390
Alignment:
Q  188 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 285  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||  ||||     
T  4503017 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaa--aggagag--aagag 4503111  T
Q  286 gaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 385  Q
      ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4503112 agaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 4503209  T
Q  386 tacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctc-------acc 474  Q
    |   |||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||       | |    
T  4503210 t--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaac 4503306  T
Q  475 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503307 aagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaacccta 4503390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 45099941 - 45099665
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45099941 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 45099845  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 476  Q
      |||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  45099844 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 45099747  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45099746 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 5723237 - 5723512
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5723237 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5723334  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||       |||||    
T  5723335 c-aaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaaga 5723432  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5723433 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaacccta 5723512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 559
Target Start/End: Original strand, 36987961 - 36988333
Alignment:
Q  190 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 287  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  36987961 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 36988056  T
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36988057 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 36988154  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 477  Q
    | |||| ||| ||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||       ||||    
T  36988155 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaag 36988252  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36988253 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 36988333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 36205646 - 36205921
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||     
T  36205646 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtc-aatgagttctt- 36205742  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caag 477  Q
      |||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       ||||    
T  36205743 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaag 36205840  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36205841 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 288 - 544
Target Start/End: Original strand, 2334399 - 2334661
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2334399 aaacaaacacaccaa-agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 2334496  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 477  Q
    | |||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  2334497 c-aaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaag 2334594  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaa 544  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2334595 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaa 2334661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 457
Target Start/End: Original strand, 6594987 - 6595154
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6594987 aaacaaacacaccaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6595084  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    | |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  6595085 c-aaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 6595154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 288 - 458
Target Start/End: Original strand, 34139752 - 34139920
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34139752 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 34139848  T
Q  388 caaaagggatgca-agaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  34139849 caaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 34139920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 45727093 - 45726929
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaag-aggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  |||||||    
T  45727093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaataggttac 45726997  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45726996 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 29868133 - 29867869
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 305  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  |||| |||| | |||| ||||||||||||  ||||||  ||||   ||||||| ||| ||| ||    
T  29868133 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaac--ggagag--aagagagaaacaaacacatcaa-ag 29868039  T
Q  306 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagag 404  Q
    |||  | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  |    
T  29868038 attattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgg 29867942  T
Q  405 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29867941 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 458
Target Start/End: Original strand, 723726 - 723893
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  723726 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 723822  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    | |||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  723823 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 458
Target Start/End: Original strand, 14633807 - 14633975
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14633807 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-tatgagttctta 14633903  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||    
T  14633904 caaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctaccc 14633975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Original strand, 35446888 - 35446966
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35446888 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 35446966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 36773748 - 36773562
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36773748 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 36773652  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  36773651 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312240
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| | ||     
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagatcttac-aaagagatacaaat 38312315  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38312314 gggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 38312240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 391
Target Start/End: Original strand, 17057352 - 17057451
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17057352 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17057448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 391
Target Start/End: Original strand, 17085335 - 17085434
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17085335 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17085431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362262
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 425  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaac 42362403  T
Q  426 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgt 516  Q
    ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||    
T  42362402 aagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgt 42362304  T
Q  517 tt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42362303 ttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 42362262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Original strand, 1631736 - 1631814
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1631736 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 1631814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 33648335 - 33648176
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaa 411  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||  || ||| | |||||||     
T  33648335 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatc-aatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacag 33648237  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 471  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  33648236 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 11151573 - 11151759
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11151573 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaa-gagttctta 11151669  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  11151670 c-aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 11151759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 36317991 - 36318091
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36317991 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 36318087  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  36318088 caaa 36318091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 296 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 24398238 - 24398055
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| |    
T  24398238 acaccaagtaattgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctttacaaagag 24398140  T
Q  396 atgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct--ttcccaatctcaccaa 476  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  24398139 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 422
Target Start/End: Original strand, 17490154 - 17490261
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||| || |||||||    
T  17490154 acccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagttacaaaagagttacaa 17490250  T
Q  412 gaaattagctt 422  Q
    |||||||||||    
T  17490251 gaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26353346 - 26353184
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 411  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  26353346 acccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagtacttacaaaa-agatacaaaagtgttacaa 26353250  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||  ||||  |||| | ||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  26353249 gaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 11067491 - 11067324
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  11067491 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattat-aaatgagttctta 11067395  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    | |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||| |||||||||||||    
T  11067394 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctaccc 11067324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 458
Target Start/End: Original strand, 33162432 - 33162599
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33162432 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctta 33162528  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    | | || ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  33162529 c-agagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 33162599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284936
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 39284936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  342 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaac 440  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | ||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaa-tgagtttctacaaa-gagatacaa-aggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac 13121805  T
Q  441 aaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13121804 aaaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11690661 - 11690504
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 413  Q
    |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||||    
T  11690661 ccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatc-aacgatttcttac-aaagggatacaaatgggttacaaga 11690565  T
Q  414 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11690564 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 11690504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450678
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 17450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 391
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288192
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  42288117 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagctcttacaaa 42288192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7451281 - 7451204
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7451281 tcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaa 7451204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 476
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  358 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 455  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||| |    | ||||||||||||||||| |    
T  7815323 ctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaa 7815420  T
Q  456 cccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||  |||| ||||||||||||    
T  7815421 cctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28672036
Alignment:
Q  319 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 371  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact 28672036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412118
Alignment:
Q  331 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 42412118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1345653 - 1345590
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 352  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  1345653 aaacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctactctgggggagaga 1345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 8395996 - 8395508
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8395996 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 8395897  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8395896 tattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaa 8395798  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395797 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 8395698  T
Q  382 ttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 481  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8395697 ttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacac 8395598  T
Q  482 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395597 tcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 8395508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7125294 - 7124804
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125294 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 7125195  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7125194 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 7125097  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125096 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 7124997  T
Q  382 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124996 ttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 7124897  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124896 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7124804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 8393787 - 8393299
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8393787 tgttgtgaatccccggacctcaaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacgaagtt 8393688  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8393687 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaa 8393589  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393588 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 8393489  T
Q  382 ttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 481  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8393488 ttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacac 8393389  T
Q  482 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8393388 tcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttcccctttg 8393299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7123075 - 7122585
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7123075 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 7122976  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7122975 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 7122878  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122877 gaagaaaacaataaacacaaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 7122778  T
Q  382 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122777 ttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 7122678  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122677 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7122585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 82 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5138685 - 5138193
Alignment:
Q  82 ctgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaag 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5138685 ctgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaag 5138586  T
Q  181 tttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggagag 278  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  5138585 cttattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaaccaaaacacaagataaacaaggagag 5138489  T
Q  279 ggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa 377  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5138488 ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa 5138389  T
Q  378 tgagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcacca 475  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138388 tgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcacca 5138289  T
Q  476 agacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138288 agacactcaatgattctctc--tacaaggtatttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5138193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5136459 - 5135967
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5136459 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 5136360  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggagagg 279  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  5136359 ttattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagg 5136263  T
Q  280 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 378  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5136262 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 5136163  T
Q  379 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136162 gagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 5136063  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136062 gacactcaatgattctctc--tacaaggtatttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5135967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 139 - 546
Target Start/End: Original strand, 31495143 - 31495556
Alignment:
Q  139 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaa-g 237  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||| | |||||||| | | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31495143 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccatc-aacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaaag 31495240  T
Q  238 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaac------aaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaact 331  Q
    ||  || || ||| || ||| |||||||||||       |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31495241 tgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaact 31495339  T
Q  332 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaag 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||||||||  ||||||||    
T  31495340 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaag 31495438  T
Q  429 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 527  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31495439 ttcacaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaa 31495537  T
Q  528 gagatactctaatcaaaga 546  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  31495538 gagaagctctaatcaaaga 31495556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 13992274 - 13992544
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13992274 aaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttctta 13992371  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcaccaagacactc 483  Q
    ||| ||  || ||| || ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13992372 caagag--atacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactc 13992468  T
Q  484 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992469 aatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 13992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 311 - 559
Target Start/End: Original strand, 29999809 - 30000063
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| || |||||    
T  29999809 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttac 29999907  T
Q  410 aagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttaca 501  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||| |||| || ||   ||    
T  29999908 aagaaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcacca 30000006  T
Q  502 aggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30000007 aggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 30000063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 546
Target Start/End: Original strand, 56178618 - 56178882
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56178618 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 56178715  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 477  Q
    | |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  56178716 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaag 56178813  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 546  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  56178814 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 56178882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 462
Target Start/End: Original strand, 5369968 - 5370237
Alignment:
Q  190 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 287  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  5369968 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagat 5370063  T
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  5370064 aaacaaacacatcaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatc-aatgagttctta 5370161  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 462  Q
    | |||| ||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5370162 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttt 5370237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 52095344 - 52095530
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  52095344 aaacaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gatttctta 52095440  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52095441 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2209894 - 2209717
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  2209894 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gag 2209797  T
Q  396 atgcaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 472  Q
    || ||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2209796 atacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 48143230 - 48143042
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48143230 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 48143133  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 476  Q
       ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  48143132 -tgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 408  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggtta 41964484  T
Q  409 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  41964483 caataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Original strand, 9927441 - 9927626
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9927441 aacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 9927537  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9927538 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 47038393 - 47038577
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47038393 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagtcctta 47038489  T
Q  388 caaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||  | || |||  | ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038490 caaacag-atacaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26364415 - 26364236
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| | |    
T  26364415 acaccaagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaa-tgagttcttacaaa-gag 26364319  T
Q  396 atgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    || |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26364318 atacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Original strand, 12739533 - 12739718
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12739533 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcatac 12739629  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||  ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12739630 -aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 289 - 457
Target Start/End: Original strand, 12743908 - 12744073
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12743908 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12744004  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
     |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12744005 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 289 - 457
Target Start/End: Original strand, 12745297 - 12745462
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12745297 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12745393  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
     |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12745394 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 46703666 - 46703500
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 408  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  46703666 tcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 46703569  T
Q  409 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  46703568 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 54883199 - 54883020
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  54883199 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 54883103  T
Q  396 atgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    || | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54883102 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Original strand, 26175619 - 26175804
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26175619 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 26175715  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  26175716 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaa 26175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Original strand, 34570397 - 34570582
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34570397 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34570493  T
Q  389 aaaagggatgcaa-gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| |||   |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34570494 -aaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 40632607 - 40632445
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaag-aggttacaa 411  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  |||||||||    
T  40632607 acccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaataggttacaa 40632511  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40632510 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 6656120 - 6655975
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  6656120 tcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 6656024  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  6656023 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 474
Target Start/End: Original strand, 46147373 - 46147557
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46147373 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaa-gagttctta 46147469  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 474  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  46147470 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12073557 - 12073392
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  12073557 tcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 12073460  T
Q  410 aagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 476  Q
    || |||||||||| | |||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12073459 aataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 41639590 - 41639426
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||    
T  41639590 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttac-aaatagatacaaatgggttac 41639494  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  41639493 aagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Original strand, 50673851 - 50673960
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  50673851 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 50673947  T
Q  410 aagaaattagctt 422  Q
    |||||||||||||    
T  50673948 aagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 8665459  T
Q  426 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||| || | | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  8665458 aagctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| | ||     
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 36463482  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36463483 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 45687164 - 45687351
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45687164 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttctta 45687260  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||  ||| |||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  45687261 c-aaatagatacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 422
Target Start/End: Original strand, 48893620 - 48893751
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48893620 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 48893716  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt 422  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  48893717 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctt 48893751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 391
Target Start/End: Original strand, 50262689 - 50262783
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  50262689 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaa 50262783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 469
Target Start/End: Original strand, 5207848 - 5208003
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatgcaagaggttacaa 411  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||| |||| |||    
T  5207848 acccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaa-tgagttcttacaaatagatatacaag-ggttgcaa 5207944  T
Q  412 gaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatc 469  Q
     |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5207945 taaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12119719 - 12119559
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 395  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |    
T  12119719 acaccaagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagag 12119622  T
Q  396 atgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 456  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12119621 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctac 12119559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 36994686 - 36994524
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 411  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||    
T  36994686 acccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaa 36994590  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36994589 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 379541 - 379399
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 413  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||    
T  379541 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aattagttcttac-aaagcgatacaaatgggttacaaga 379444  T
Q  414 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  379443 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 379399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 476
Target Start/End: Original strand, 37229731 - 37229890
Alignment:
Q  317 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatgcaagaggttacaagaaa 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||  ||  |||||||| |||    
T  37229731 agttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagagatataaaaagggttacaacaaa 37229828  T
Q  416 ttagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    || || || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37229829 tttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8648303 - 8648225
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8648303 tcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttacaaa 8648225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 37740784 - 37740536
Alignment:
Q  316 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaa 414  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||    
T  37740784 cagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 37740688  T
Q  415 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 505  Q
    ||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||       ||||||||||| ||||| || ||   ||||||    
T  37740687 attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaaggt 37740589  T
Q  506 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37740588 gtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 37740536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 457
Target Start/End: Original strand, 6542161 - 6542328
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6542161 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6542257  T
Q  388 caaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    | |||| ||| ||| ||| | |||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  6542258 c-aaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctacc 6542328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429765
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 5429765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 476
Target Start/End: Original strand, 27416974 - 27417133
Alignment:
Q  316 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaa 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| | ||  |||||||||||    
T  27416974 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 27417070  T
Q  415 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  27417071 attagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662527
Alignment:
Q  316 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 35662527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 476
Target Start/End: Original strand, 54199926 - 54200074
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagctt-gac 425  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  || |||||||||||||||||  ||    
T  54199926 aacttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 54200023  T
Q  426 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54200024 aagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4588121 - 4588014
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaa 411  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||    
T  4588121 acccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaa 4588025  T
Q  412 gaaattagctt 422  Q
    |||||||||||    
T  4588024 gaaattagctt 4588014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 377
Target Start/End: Original strand, 52467336 - 52467423
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa 377  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52467336 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaa 52467423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5872003 - 5871906
Alignment:
Q  291 caaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaa 390  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  5872003 caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaa-gagttcttgcaa 5871907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 457
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  348 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaacc 445  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aacc 12744183  T
Q  446 ctaatttctacc 457  Q
    ||||||||||||    
T  12744184 ctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 450
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699585
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 411  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||   |||| ||| ||| || |||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaa 26699545  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaat 450  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  26699546 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaat 26699585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31474337 - 31474206
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31474337 aaacaaacacaccaagatat-gtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaa-tgagttctta 31474241  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt 422  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  31474240 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctt 31474206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29254679 - 29254580
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29254679 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac 29254583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 476
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747924
Alignment:
Q  346 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaa 443  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | || |||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcatacaaatag-atacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aa 12747890  T
Q  444 ccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12747891 ccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 52082645 - 52082825
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |       |||||||||||| || ||||||    
T  52082645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatc-------tccactatcaaa-gatttctta 52082735  T
Q  388 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||| ||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  52082736 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 52082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 391
Target Start/End: Original strand, 13009464 - 13009526
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13009464 aacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 13009526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3913578 - 3913534
Alignment:
Q  346 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3913578 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 3913534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989948
Alignment:
Q  332 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat 33989948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089970
Alignment:
Q  334 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 386  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctt 33089970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Original strand, 2380 - 2868
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2380 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 2479  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2480 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 2577  T
Q  283 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578 gaagaaaacaataaacacaaaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 2677  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 2777  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2778 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 2868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6667 - 6177
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 182  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6667 tgttgtgaatccccgagtctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatatgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6568  T
Q  183 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat-aaacaaggagaggga 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6567 tattgtgcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagaggga 6468  T
Q  282 agaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 381  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6467 agaagaaaacaataacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 6368  T
Q  382 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 480  Q
    ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6367 ttctttacaaaagggatacaagggcttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 6268  T
Q  481 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6267 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 6177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 126 - 573
Target Start/End: Original strand, 3545 - 3990
Alignment:
Q  126 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3545 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 3644  T
Q  226 ctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggt 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3645 ctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggt 3742  T
Q  325 ccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3743 ccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttg 3842  T
Q  424 acaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaac 523  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3843 acatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaac 3940  T
Q  524 ccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3941 ccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15290917 - 15290427
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15290917 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 15290818  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15290817 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 15290720  T
Q  282 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 380  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290719 agaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 15290620  T
Q  381 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 478  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290619 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 15290520  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15290519 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15290427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15471286 - 15470796
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15471286 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 15471187  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 281  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15471186 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 15471089  T
Q  282 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 380  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471088 agaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 15470989  T
Q  381 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 478  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470988 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 15470889  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15470888 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15470796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 573
Target Start/End: Original strand, 42575100 - 42575589
Alignment:
Q  83 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 181  Q
    |||||||||||||||   |||||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  42575100 tgttgtgaatccccgagcctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaactataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 42575199  T
Q  182 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaa-caatcacaagataaacaaggagaggg 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  42575200 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaaccaaacacaagat--acaaggagaggg 42575295  T
Q  281 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 379  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42575296 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 42575395  T
Q  380 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 477  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575396 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 42575495  T
Q  478 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42575496 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 42575589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 113 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 25690312 - 25689865
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25690312 atcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaagaatcaacaaaacacc 25690217  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaa-gagattgg 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||     
T  25690216 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaaca-cactcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgt 25690120  T
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25690119 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 25690021  T
Q  411 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690020 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 25689921  T
Q  511 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689920 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 25689865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 113 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 3439860 - 3439418
Alignment:
Q  113 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 212  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  3439860 atcgaaccacaccaatactaaaaa-aatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaatcaacaaaacacc 3439765  T
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |    
T  3439764 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaaca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 3439668  T
Q  312 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3439667 catccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 3439569  T
Q  412 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 511  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3439568 gaaattagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaaggtgtttcc 3439469  T
Q  512 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439468 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 3439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 117 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2628087 - 2627649
Alignment:
Q  117 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaa-caacaa-aacaccac 214  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||  ||||||||     |||||||||| ||| |||||| |||| |||    
T  2628087 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgg---gtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacac 2627995  T
Q  215 ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcac 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  2627994 ctagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattattcac 2627898  T
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaag 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |   ||| ||||    
T  2627897 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaag 2627799  T
Q  413 aaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 511  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  2627798 aaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcc 2627700  T
Q  512 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2627699 catgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 2627649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 34254312 - 34254586
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34254312 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttctta 34254409  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||    
T  34254410 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaaga 34254507  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34254508 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 34254586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 17982840 - 17982563
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17982840 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 17982744  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 476  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  17982743 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 17982645  T
Q  477 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982644 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 17982563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 188 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 31218541 - 31218167
Alignment:
Q  188 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 285  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||  || |||||||||||  |||||||  ||||     
T  31218541 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacat-aagcacaagataaa--aggagag--aagag 31218447  T
Q  286 gaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 385  Q
      ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31218446 agaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttct 31218349  T
Q  386 tacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcac-------c 474  Q
    | | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||       |    
T  31218348 t-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaac 31218251  T
Q  475 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31218250 aagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 31218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 34256488 - 34256762
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34256488 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 34256585  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 478  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||    
T  34256586 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaaga 34256683  T
Q  479 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    |||||||||||| || |    |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256684 cactcaatgattttcacacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaacccta 34256762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 207 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 42498459 - 42498193
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  |||| | ||||||| ||||||| ||    
T  42498459 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagggaaacaaacacaccaa-ag 42498365  T
Q  306 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-g 404  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||| | |    
T  42498364 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaaagg 42498267  T
Q  405 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  42498266 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 44304042 - 44303764
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44304042 aaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 44303945  T
Q  388 caaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc---ctttcccaatctcac-------ca 475  Q
     ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    ||||||||||||||       ||    
T  44303944 -aaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaaca 44303847  T
Q  476 agacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44303846 agacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 44303764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 288 - 559
Target Start/End: Original strand, 19945340 - 19945618
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19945340 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 19945436  T
Q  388 caaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------ca 475  Q
    | |||| ||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||       ||    
T  19945437 ccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaaca 19945535  T
Q  476 agacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  19945536 agacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccgacccaagaga-actctaatcaaag-actctaaacccta 19945618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 457
Target Start/End: Original strand, 1746200 - 1746366
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1746200 aaacaaacacaccaac-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 1746296  T
Q  388 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
      |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  1746297 -caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 1746366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15212971 - 15212786
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15212971 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttcttac 15212875  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15212874 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Original strand, 42434995 - 42435159
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  42434995 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 42435091  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  42435092 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 43036608 - 43036423
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43036608 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttcttac 43036512  T
Q  389 aaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| |||  |  |||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43036511 -aaagagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 4283688 - 4283524
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  4283688 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 4283592  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4283591 aagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352150
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 33352225  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33352224 gggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 304 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| | ||     
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagtttttac-aaagagatactaat 40321155  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 474  Q
     ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40321154 gggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18655564 - 18655400
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  18655564 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 18655468  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18655467 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Original strand, 3303652 - 3303838
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3303652 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaa-tgagttctta 3303748  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 476  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||| || | |||| |||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3303749 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaact-taatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 4743196 - 4743296
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4743196 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 4743292  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  4743293 caaa 4743296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811278
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| | ||     
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgggttcttac-aaagagatacaaat 27811353  T
Q  403 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27811352 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 458
Target Start/End: Original strand, 12702542 - 12702783
Alignment:
Q  212 cacctagatctaatctaggaa--ccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattg 309  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||    | ||| |||||   ||||||| | ||||| ||||||    
T  12702542 cacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaa----gggagagaagagagaaacaaacataccaa-agattg 12702636  T
Q  310 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggtta 408  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||  ||| | |||||    
T  12702637 ttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttac-aaagagacacaaaagggtta 12702733  T
Q  409 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  12702734 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 12702783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 391
Target Start/End: Original strand, 10930188 - 10930281
Alignment:
Q  296 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10930188 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgtgttcttacaaa 10930281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 40221907 - 40221745
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||    
T  40221907 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 40221811  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40221810 gaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  334 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagtt 430  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |   ||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagct 40328825  T
Q  431 cactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40328824 cacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 1345353 - 1345453
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  1345353 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatc-aatgagttcttt 1345449  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  1345450 caaa 1345453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689357
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 5689357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 4731843 - 4731658
Alignment:
Q  289 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 388  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4731843 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 4731747  T
Q  389 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | || | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4731746 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4731658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141821
Alignment:
Q  314 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaag 412  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaag 18141885  T
Q  413 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18141884 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6599056
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaag 393  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaag 6599056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674509
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaag 393  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaag 6674509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30143488 - 30143346
Alignment:
Q  328 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 425  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  30143488 aacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 30143391  T
Q  426 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatct 470  Q
    ||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30143390 aagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct 30143346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 422
Target Start/End: Original strand, 41366622 - 41366727
Alignment:
Q  314 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaag 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||| |||    
T  41366622 cccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagggatacaaataggttaaaag 41366717  T
Q  413 aaattagctt 422  Q
    ||||||||||    
T  41366718 aaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 30291767 - 30291606
Alignment:
Q  316 cagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaaga 413  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |||  | |||||||||    
T  30291767 cagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gaattcttacaaa-gtgatacaaatgagttacaaga 30291671  T
Q  414 aattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||| | |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30291670 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 313 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4733868 - 4733792
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4733868 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 4733792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 476
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292631
Alignment:
Q  314 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaag 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | ||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaag 1292566  T
Q  413 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  1292567 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 476
Target Start/End: Original strand, 8965697 - 8965859
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaa 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||  || ||| ||| ||    
T  8965697 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatataaaagggttataa 8965793  T
Q  412 gaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||| ||| | |||  |||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8965794 gaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765745
Alignment:
Q  358 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 9765767  T
Q  456 ccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  9765766 cccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 11384149 - 11384004
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  11384149 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaa-tgggttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 11384053  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  11384052 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 11384004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10015265 - 10015180
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  10015265 aaacaaatacaccaagaaat-gattacccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaa 10015180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  346 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 443  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aa 44353827  T
Q  444 ccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 473  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44353826 ccctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153844
Alignment:
Q  319 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaa 8153844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 393
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106163
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaag 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaa-tgagttcttacaaaag 18106163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 4162658 - 4162516
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 411  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||||    
T  4162658 acccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaa 4162563  T
Q  412 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 458  Q
    |||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4162562 gaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctaccc 4162516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 391
Target Start/End: Original strand, 3073880 - 3073955
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  3073880 acccagttcggcccaa-cttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaa-tgagttcttacaaa 3073955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597715
Alignment:
Q  315 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 7597715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 250
Target Start/End: Original strand, 32902096 - 32902133
Alignment:
Q  213 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32902096 acctagatctaatctaggaaccaagtgaaaaacacaaa 32902133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 126 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 1
Alignment:
Q  126 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 115  T
Q  226 ctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggt 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  114 ctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggt 17  T
Q  325 ccaaacttgacctact 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  16 ccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 562
Target Start/End: Original strand, 11042 - 11423
Alignment:
Q  187 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 284  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  11042 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 11138  T
Q  285 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 384  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  11139 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttc 11236  T
Q  385 ttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------c 474  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||  || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||      |    
T  11237 ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaac 11335  T
Q  475 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 562  Q
    ||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11336 aagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagag 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 478
Target Start/End: Original strand, 8616 - 8907
Alignment:
Q  187 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 284  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  8616 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--agaagagggaaga 8712  T
Q  285 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 384  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  8713 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttc 8810  T
Q  385 ttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 478  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||  || | |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8811 ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 207 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 434798 - 434443
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  ||| ||| |||||   ||||||| ||||||| |     
T  434798 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaa--agg-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-at 434704  T
Q  306 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-g 404  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | |    
T  434703 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagg 434606  T
Q  405 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 494  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  434605 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 434507  T
Q  495 ctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
    ||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  434506 ctcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 434443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 11745 - 11557
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11745 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttctta 11647  T
Q  388 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||| | ||| |||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11646 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 304 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 827
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||| ||| |    
T  1087 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttgtt--caaagagatacaaaa 991  T
Q  404 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac------caagacactcaatgattctc 493  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||    
T  990 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttc 892  T
Q  494 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 559  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  891 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 304 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114602
Alignment:
Q  304 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 403  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaa 114677  T
Q  404 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  114676 gcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 457
Target Start/End: Original strand, 18007 - 18151
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||  | |||||    
T  18007 tcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagttac 18103  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 457  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18104 aagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 149079 - 149179
Alignment:
Q  288 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 387  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  149079 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 149175  T
Q  388 caaa 391  Q
    ||||    
T  149176 caaa 149179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 7491 - 7327
Alignment:
Q  311 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 409  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  7491 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 7395  T
Q  410 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 476  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7394 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 476
Target Start/End: Original strand, 20319 - 20583
Alignment:
Q  207 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||    | ||| |||||    |||||| ||||||| |     
T  20319 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa----gggagagaagagaggaacaaacacaccaaaa- 20413  T
Q  306 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagag 404  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  |    
T  20414 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgg 20510  T
Q  405 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 476  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  20511 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10575
Alignment:
Q  313 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  10651 acccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aacgagttcttacaaa 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 376
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27510
Alignment:
Q  319 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 376  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 27510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University