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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF18156_low_25 (Length: 474)
Name: NF18156_low_25
Description: NF18156
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18156_low_25 |
 |  |
|
| [»] scaffold0223 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0140 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0379 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0473 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0074 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0252 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0260 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1148 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0174 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0042 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0040 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0278 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0146 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0186 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0436 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0358 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0109 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0098 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0090 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0265 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0089 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0656 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0216 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0303 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0096 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0048 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0217 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0126 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0862 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0242 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0233 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0029 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0572 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0259 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0144 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0005 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0553 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0065 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0248 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0133 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1212 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0586 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0423 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0088 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0055 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0052 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0585 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0249 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0229 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0683 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1618 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1207 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0546 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0600 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0002 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0043 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0063 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0232 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0205 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0193 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0111 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0231 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0500 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0371 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0130 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1424 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0510 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1813 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0299 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0672 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0426 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 206 - 456
Target Start/End: Original strand, 22079595 - 22079845
Alignment:
| Q |
206 |
tgttccaccattaaacaccaaccgaaatggatgatcagttgcttttatgctcatttcatctcactcgacatcaaagttttgcagagtaaaggtagtgttc |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22079595 |
tgttccaccattaaacaccaaccaaaatggatgatcagttgcttttatactcatttcatttttctcgacatcaaagttttgcagagtaaaggtagtgttc |
22079694 |
T |
 |
| Q |
306 |
tcagcaattatacccttaaacttatctttgagttcagatggcagaattatttgaatacgatcaccctgatggaaattaggagtgaattatacatactttt |
405 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22079695 |
tcaacaattctacccttaaactgatctttgagttcaaatggcagaattatttgaatacgatcaacctgatggaaattagaagtgaattatacatactttt |
22079794 |
T |
 |
| Q |
406 |
taaaacattagtttctattaaaattaattatagatcagtgatgttgtaacc |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22079795 |
taaaacattagtttctattaaaattaattatagatgagtgatgttgtaacc |
22079845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27608083 - 27607905
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27608083 |
gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttgagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
27607985 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27607984 |
tatcccgttgctt-gatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttacat |
27607905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27614689 - 27614512
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27614689 |
gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttgagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
27614591 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27614590 |
tatcccgttgctt-gatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
27614512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23609268 - 23609089
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgtttta--tgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23609268 |
gtgccaaaacgtttcacatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggactacgttatatgtg |
23609169 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23609168 |
atatcccgttg-attgatgtttactctaataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
23609089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23840664 - 23840485
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgtttta--tgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23840664 |
gtgccaaaacgtttcacatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggactacgttatatgtg |
23840565 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23840564 |
atatcccgttg-attgatgtttactctaataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
23840485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 41098988 - 41099168
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41098988 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
41099087 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41099088 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttacat |
41099168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 24473012 - 24473191
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24473012 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
24473111 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24473112 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
24473191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 1693205 - 1693381
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1693205 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttctgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
1693304 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1693305 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
1693381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 27664555 - 27664734
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27664555 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgcagcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
27664654 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27664655 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
27664734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 27681455 - 27681631
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27681455 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgttcaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
27681554 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27681555 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
27681631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 27688097 - 27688273
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27688097 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgttcaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
27688196 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27688197 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
27688273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 37294252 - 37294431
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37294252 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaatcattatttaactgatgggttacgttatatgtgat |
37294351 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttg-atattggg-aaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37294352 |
atcccgttgttttgatgtttactctgataaatgttatgttttt-aagaatttttgaatattgggaaaaacggggtgttaca |
37294431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22264294 - 22264098
Alignment:
| Q |
24 |
tgtgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatg |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22264294 |
tgtgtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatg |
22264195 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatg----tttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttacatgttccacca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22264194 |
tgatatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttacacattccacca |
22264098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 171
Target Start/End: Original strand, 37287549 - 37287693
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37287549 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaatcattatttaactgatgggttacgttatatgtgat |
37287648 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaa |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37287649 |
atcccgttgttttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaa |
37287693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Original strand, 27671194 - 27671344
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27671194 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
27671293 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaat |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27671294 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaat |
27671344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Original strand, 18039437 - 18039618
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18039437 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatggttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgatatatgtgat |
18039536 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt--gatattgggaaaacggggtgttacatgtt |
209 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18039537 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaattttttaaatattaggaaaacggtgtgttacatgtt |
18039618 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 205
Target Start/End: Original strand, 17707694 - 17707869
Alignment:
| Q |
29 |
gccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgata |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17707694 |
gccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgata |
17707792 |
T |
 |
| Q |
128 |
tcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
17707793 |
tcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattggg-aaacggagtgttaca |
17707869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23249304 - 23249167
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
23249304 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaacgtttaagatattggttaaattattatttaattgttttggattatgttttatgtg |
23249205 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23249204 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
23249167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19767693 - 19767556
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
19767693 |
gtgccaaaacgttttatgagttatgactatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
19767594 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19767593 |
atatcccgttgtttatgatgctttctctgataaatgtt |
19767556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19774289 - 19774152
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
19774289 |
gtgccaaaacgttttatgagttatgactatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
19774190 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19774189 |
atatcccgttgtttatgatgctttctctgataaatgtt |
19774152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21632107 - 21631934
Alignment:
| Q |
28 |
tgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21632107 |
tgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttttggattatgttatatgt |
21632010 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21632009 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatatttatattgggaaaacggggtgttaca |
21631934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37543366 - 37543255
Alignment:
| Q |
53 |
ttatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttact |
149 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37543366 |
ttatgaatttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttttggattaagttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttact |
37543267 |
T |
 |
| Q |
150 |
ctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
37543266 |
ctgataaatgtt |
37543255 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 25809043 - 25809177
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
25809043 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatattggttgaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
25809139 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25809140 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
25809177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Original strand, 15442695 - 15442862
Alignment:
| Q |
33 |
aaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatc |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15442695 |
aaacgttttatggattatgat-ataa-tttccactgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgtgatatc |
15442792 |
T |
 |
| Q |
130 |
ccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15442793 |
ccgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacgaggtgttaca |
15442862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20775208 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgac-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgt |
20775113 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20775112 |
gatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaattttgataatgggaaaacggggtgttaca |
20775037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22352247 - 22352114
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22352247 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
22352151 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22352150 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
22352114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactgt--tggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33725164 |
ttccgctgcaatgttaaggatattatgttaaatcattatttaaccgtcttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgct-actctgataa |
33725066 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgttttt--aaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33725065 |
atgctatgtttttttaaagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttacat |
33725014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
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27 |
gtgccaaaacgttttatgaatt-atgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt-ggattacgttatatg |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
14360554 |
gtgccaaaacgttttatggatttatgat-ataa-tttccgctgcaaatgtttaagttatttggttaaattatcatttaactgtttggattatgttatatg |
14360651 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14360652 |
tgatatcccgttgtttatgatgcttactctaataaatg-------ttttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
14360728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22342817 - 22342684
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gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatat-tggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22342817 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-at-agtttccgctgcaatgattaagatatatggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
22342721 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttg-ttttgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22342720 |
gatatcccgttgattatgatgcttactctgataaatg |
22342684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 21668619 - 21668760
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60 |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21668619 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
21668717 |
T |
 |
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156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21668718 |
aatgttttg-------agaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
21668760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 22326736 - 22326839
Alignment:
| Q |
60 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22326736 |
tttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgtgatatcccattttttatgatgcttactctgata |
22326835 |
T |
 |
| Q |
156 |
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159 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
22326836 |
aatg |
22326839 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
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| T |
21295979 |
gtgccaaaacgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgt |
21296076 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |
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|
| T |
21296077 |
gatatcccgttgtttatgttgtttactctgataaatgtt |
21296115 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24553920 - 24553784
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| || | |
|
|
| T |
24553920 |
gtgccaaaacgttttatggattat-attataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggaatatgttaaatat |
24553823 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24553822 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
24553784 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 23338021 - 23338157
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
23338021 |
gtgccaaaacgttttatggattatga-tat-aaattccgcttcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
23338118 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
23338119 |
gatatcccgttgtttacgatgtttactctgataaatgtt |
23338157 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25526093 - 25525957
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |
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|
| T |
25526093 |
gtgccaaagcgttttatggattataat-ataattttc-gctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
25525996 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25525995 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
25525957 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 29315754 - 29315650
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29315754 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
29315656 |
T |
 |
| Q |
155 |
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160 |
Q |
| |
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|||||| |
|
|
| T |
29315655 |
aaatgt |
29315650 |
T |
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Target: chr5; HSP #37
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Target Start/End: Complemental strand, 24019603 - 24019462
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| Q |
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ttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24019603 |
ttccgctgcaatgtttacgcctttcggttaaattattatttaactgttttggatcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgattcttactctgataa |
24019504 |
T |
 |
| Q |
157 |
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205 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24019503 |
atg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
24019462 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26171867 - 26171693
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| Q |
27 |
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122 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26171867 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattggattatgttaaatg |
26171770 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || || |||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26171769 |
tgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataa--------ttgtttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 17731111 - 17731249
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| Q |
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122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |
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|
| T |
17731111 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttattgaattatgttaaatg |
17731208 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17731209 |
tgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataattgtt |
17731249 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
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Target Start/End: Original strand, 21343523 - 21343665
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| Q |
60 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
21343523 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaatttttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
21343622 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21343623 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
21343665 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 21885891 - 21886066
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| Q |
27 |
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122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
21885891 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttctgctgcaacgtttaagttatttggttaaatttttatttaactgttattggattatgttaaatg |
21885988 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || || |||||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21885989 |
tgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataa--------ttgttgaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacat |
21886066 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
26666862 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
26666961 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26666962 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 26938459 - 26938601
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
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tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
26938558 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26938559 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
26938601 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
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| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
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25230248 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25230249 |
taaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
25230292 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
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tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactattattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
25294404 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25294405 |
taaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
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|
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T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27516004 |
tctatgtgatatcccgtt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27522641 |
tctatgtgatatcccgtt |
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T |
 |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
4035582 |
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4035483 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
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taaatgtt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
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27 |
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115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
22063580 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
22063679 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
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|
| T |
22063680 |
ttctatgtgatatcccgtt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 34295308 - 34295426
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34295308 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
34295407 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34295408 |
ttctatgtgatatcccgtt |
34295426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20231924 - 20231818
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaa-ttattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
20231924 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
20231825 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
20231824 |
aaatgtt |
20231818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Original strand, 24533779 - 24533921
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaact--gttggattacgttatatgtgatatccc-gttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |
|
|
| T |
24533779 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactaatttggattatgttaaatgtgatatcccatttgtttatgtggtttactctgata |
24533878 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24533879 |
aatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacat |
24533921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16673426 - 16673392
Alignment:
| Q |
171 |
aagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16673426 |
aagaaatgtttatattgggaaaacggggtgttaca |
16673392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Original strand, 21905327 - 21905379
Alignment:
| Q |
85 |
ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21905327 |
ggttaaattatcatttaactgtttttggattacgttctatgtgatatcccgtt |
21905379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25405699 - 25405622
Alignment:
| Q |
86 |
gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25405699 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgt--ttatggttcttactctgataaatgtt |
25405622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18773464 - 18773431
Alignment:
| Q |
172 |
agaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18773464 |
agaaatgttcatattgggaaaacggggtgttaca |
18773431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 5535202 - 5535381
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5535202 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttgtatgtgat |
5535301 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5535302 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttacat |
5535381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 12277742 - 12277919
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12277742 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgatatatgtgat |
12277841 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12277842 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
12277919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 17508155 - 17508333
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17508155 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
17508254 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17508255 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
17508333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 17670336 - 17670514
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17670336 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
17670435 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17670436 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
17670514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 17676988 - 17677166
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17676988 |
gtgccaaaacgttttgcgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
17677087 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17677088 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
17677166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 29532128 - 29532308
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29532128 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
29532227 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29532228 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttacat |
29532308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24657139 - 24656963
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24657139 |
gtgccaaaacgttt-atgatatatgtttatga-tttccgctgcaaatgtttgagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
24657042 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24657041 |
tatcccgttgctt-gatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
24656963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 21916331 - 21916509
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21916331 |
gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
21916429 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21916430 |
tatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
21916509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 22986889 - 22987068
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22986889 |
gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttattacgttatatgtga |
22986987 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22986988 |
tatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttacat |
22987068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 20024683 - 20024820
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
20024683 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
20024782 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20024783 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
20024820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20526838 - 20526665
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20526838 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgat-ataa-tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattacgttatatgt |
20526742 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20526741 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacat |
20526665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 20706355 - 20706487
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20706355 |
gtgccaaaacgttttatggattaggat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttagattatgttatatgtga |
20706452 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20706453 |
tatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
20706487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 22124153 - 22124250
Alignment:
| Q |
26 |
tgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22124153 |
tgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaaggtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgatatatgt |
22124250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20880068 - 20879957
Alignment:
| Q |
53 |
ttatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttact |
149 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20880068 |
ttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttact |
20879969 |
T |
 |
| Q |
150 |
ctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
20879968 |
ctgataaatgtt |
20879957 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 23846555 - 23846659
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60 |
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156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23846555 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataa |
23846654 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
23846655 |
atgtt |
23846659 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 27 - 159
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27135456 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatattgggttaaattattatttaactattttggattatgttatatgt |
27135360 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27135359 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
27135323 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3215583 - 3215450
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3215583 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
3215487 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3215486 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
3215450 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 60 - 159
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| Q |
60 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26935994 |
tttccgctacaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgata |
26936093 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatg |
159 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
26936094 |
aatg |
26936097 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18064624 - 18064483
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| Q |
60 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18064624 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttgaatcattatttaactgttttggattatgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
18064526 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18064525 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
18064483 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19904846 - 19904740
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| Q |
60 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
19904846 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
19904747 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
19904746 |
aaatgtt |
19904740 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 208
Target Start/End: Original strand, 22166380 - 22166553
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| Q |
30 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||| |
|
|
| T |
22166380 |
ccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatttgat |
22166477 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatgt |
208 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || || |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22166478 |
atcccgtttgtttatgttgtttactctgataa--------ttgtttaagaaatgttcatattgggaaaatggggtgttacatgt |
22166553 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 24446204 - 24446380
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| Q |
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121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
24446204 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaacgtttaagtttatttggttaaattgttatttaactgttattggattatgttaaat |
24446301 |
T |
 |
| Q |
122 |
gtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24446302 |
gtgatatcccgttgtttatattgtttactctgat-aatg------ttttaaagaaattttcatattgggaaatcggggtgttacat |
24446380 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 17829315 - 17829457
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| Q |
60 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
17829315 |
tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttaagttgtttactctgat |
17829414 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|| || |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17829415 |
aa----ta-gttt---aagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
17829457 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 208
Target Start/End: Original strand, 22135231 - 22135404
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| Q |
30 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||| |
|
|
| T |
22135231 |
ccaaaacgttttatggattatga--aataattttcgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatttgat |
22135328 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatgt |
208 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || || |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22135329 |
atcccgtttgtttatgctgtttactctgataa--------ttgtttaagaaatgttcatattgggaaaatggggtgttacatgt |
22135404 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Original strand, 22113730 - 22113833
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| Q |
32 |
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128 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
22113730 |
aaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatgtgatat |
22113827 |
T |
 |
| Q |
129 |
cccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
22113828 |
cccgtt |
22113833 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
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| Q |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
30309454 |
gtgccaaaacgttttatggagtatga--aataatttccgctgcaatgtttaagttatatggttaaattgttatttaactgatttggattatcttaaatgt |
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T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30309552 |
gatatctcgtttgtttatgttgtttactctgataaatgtt |
30309591 |
T |
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Target: chr8; HSP #27
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| Q |
27 |
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116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
24264746 |
gtgccaaaacgttt-atgagttatgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtt |
24264844 |
T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24264845 |
tctatgtgatatcccgtt |
24264862 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #28
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27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
30325695 |
gtgccaaaacgttttatggagtatga--aataatttccgctgcaatgtttaagttatatggttaaattgttatttaactgatttggtttattttaaatgt |
30325792 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatccc-gttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| || || ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30325793 |
gatatcccatttgtttatgttgtttactctgataaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #29
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115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19110577 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
19110478 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19110477 |
ttctatgtgatatcccgtt |
19110459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
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| Q |
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gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19116868 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
19116769 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19116768 |
ttctatgtgatatcccgtt |
19116750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
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catgtgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt------ggttaaattattatttaac--tgttggatta |
113 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
28092366 |
catgcgtgccaaaacgttt-atgatttatgattatgattttccgctgctacgttaaagatatttgtgacggttaaattatcatttaactattttggatta |
28092268 |
T |
 |
| Q |
114 |
cg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28092267 |
cgtttctatgtgatatcccgtt |
28092246 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #32
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tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
12473419 |
tttccactgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
12473320 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||| |||| |
|
|
| T |
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taattgtt |
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T |
 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
17056083 |
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T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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gatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataattgtt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgtt-gttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||| || |||||| |||| |||||||||| |||| |||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
32604582 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttagttaaattgttatttaactattattggattatgttaaatgtgatatctcgtttgtttatgttgtttactctga |
32604483 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32604482 |
taaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
32604439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9239181 - 9239143
Alignment:
| Q |
167 |
tttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9239181 |
tttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
9239143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Original strand, 16884003 - 16884080
Alignment:
| Q |
86 |
gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16884003 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgt--ttatgatttttactctgataaatgtt |
16884080 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 207
Target Start/End: Original strand, 16411143 - 16411179
Alignment:
| Q |
171 |
aagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatg |
207 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16411143 |
aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacatg |
16411179 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19495697 - 19495615
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19495697 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
19495615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19497745 - 19497663
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19497745 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
19497663 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22047253 - 22047171
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22047253 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
22047171 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22579040 - 22578958
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22579040 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
22578958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28454058 - 28453976
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28454058 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
28453976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 12842439 - 12842616
Alignment:
| Q |
27 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12842439 |
gtgccaaaatgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgatatatgtgat |
12842538 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12842539 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
12842616 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 16752812 - 16752990
Alignment:
| Q |
27 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16752812 |
gtgccaaaacgttttatgaattacgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggcttacgttatatgtgat |
16752911 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16752912 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtatttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
16752990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 16759337 - 16759515
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16759337 |
gtgccaaaacgttttatgaattacgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggcttacgttatatgtgat |
16759436 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16759437 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtatttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
16759515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 10154548 - 10154724
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10154548 |
gtgccaaaaccttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagttattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
10154647 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10154648 |
atcccgttgttttgaagcttactctgataaatgttatgtttt--aagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
10154724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6596608 - 6596429
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgacttt-ccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6596608 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgtttatgacttttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggcttacgttatatgtga |
6596509 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6596508 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtatttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
6596429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 10847046 - 10847224
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttgg-attacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10847046 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatgtttatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggaattacgttatatgtga |
10847145 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10847146 |
tatcccgttg-tttggtgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
10847224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5220760 - 5220583
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5220760 |
gtgccaaaacattttatgaactatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagttattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
5220661 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5220660 |
atcccgttgtgttgatgcttactctgataaatgttatgtttt--aagaaattttgatattgggaaaacggggtgttacat |
5220583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15360065 - 15359893
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15360065 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
15359966 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15359965 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatg------tttttaagaattttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
15359893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 15398635 - 15398806
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15398635 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
15398734 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15398735 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataa-----atgtttttaa--gaatgtttatgttgggaaaacggggtgttaca |
15398806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 15405253 - 15405387
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15405253 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
15405352 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15405353 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgtt |
15405387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 2028365 - 2028544
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2028365 |
gtgccaaaacgttacatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
2028464 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2028465 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
2028544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 5107648 - 5107827
Alignment:
| Q |
27 |
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125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5107648 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattctccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
5107747 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5107748 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
5107827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6598070 - 6597896
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| Q |
27 |
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126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6598070 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgtttatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattatt---taactgttggcttacgttatatgtgat |
6597974 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
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|
| T |
6597973 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaaggctatgtatttaatgaaattttgatatt-ggaaaacggggtgttaca |
6597896 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12817147 - 12816968
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125 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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12817048 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12817047 |
tatcccattg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
12816968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21390732 - 21390560
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| Q |
27 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21390732 |
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T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21390632 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgtt-----tttaaa--aatttttatgttgggaaaacggggtgttacat |
21390560 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12066483 - 12066306
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| Q |
27 |
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126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
12066385 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12066384 |
atcccgttg-cttgttgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
12066306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6604750 - 6604576
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| Q |
27 |
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126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtgccaaaacgttttacgaattatgtttatgacttttcgctgcaatgtttaagatattggttaaattatt---taactgttggcttacgttatatgtgat |
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T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6604653 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaaggctatgtatttaatgaaattttgatatt-ggaaaacggggtgttaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15336806 - 15336634
Alignment:
| Q |
27 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| | || || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15336706 |
atcccattgttttgatgcttactttgataaatg------tttttaagaattttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37614733 - 37614551
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| Q |
27 |
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125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
37614733 |
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37614634 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatg---tttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37614633 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgttttttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
37614551 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 19291531 - 19291709
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| Q |
27 |
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125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19291531 |
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19291629 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19291630 |
tatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgagaaaacggggtgttaca |
19291709 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 31423318 - 31423497
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| Q |
27 |
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125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31423318 |
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T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31423418 |
tatcctgttg-tttgatgtttactctgataaatgtattgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
31423497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 411504 - 411641
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| Q |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
411504 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
411603 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
411604 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 1146306 - 1146443
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| Q |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
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gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
1146405 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1146406 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
1146443 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 5147552 - 5147689
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| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
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gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
5147651 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5147652 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
5147689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 15344359 - 15344496
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
15344359 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
15344458 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15344459 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
15344496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 15351003 - 15351140
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
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15351102 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15351103 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 61 - 205
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ttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactgtt-ggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaat |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttccgctgcaatgattaagatgttttgttaaatcattatttaaccgtttggattatgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaat |
16709990 |
T |
 |
| Q |
159 |
gttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16709989 |
gctatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 27 - 161
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
8721910 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttagctgtttttggattatgttttatgt |
8722009 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgtt-gttttgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gatatcccgttggttatgatgcttactctgataaatgtt |
8722048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
9073797 |
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9073896 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgtt-gttttgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9073897 |
gatatcccgttggttatgatgcttactctgataaatgtt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13316915 |
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13317011 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------atttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
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16864851 |
T |
 |
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gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
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| |
|
||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
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gtgccgaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
28369273 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28369274 |
gatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacggagtgttaca |
28369349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 28376994 - 28377167
Alignment:
| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28376994 |
gtgccgaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
28377091 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28377092 |
gatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacggagtgttaca |
28377167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 28384816 - 28384989
Alignment:
| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28384816 |
gtgccgaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
28384913 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28384914 |
gatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacggagtgttaca |
28384989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Original strand, 16624832 - 16624943
Alignment:
| Q |
53 |
ttatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttact |
149 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16624832 |
ttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttttggattatgtcttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttact |
16624931 |
T |
 |
| Q |
150 |
ctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
16624932 |
ctgataaatgtt |
16624943 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10325225 - 10325090
Alignment:
| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
10325225 |
gtgccaagacgttttatggattatg-ttataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggatcatgttatatgt |
10325128 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10325127 |
gatatcccgtgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
10325090 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7985079 - 7984906
Alignment:
| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
7985079 |
gtgccaaaatgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattatgtcatatgt |
7984982 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7984981 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgagaaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacagggtgttaca |
7984906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12890724 - 12890591
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12890724 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
12890628 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12890627 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
12890591 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 17253844 - 17253977
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17253844 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactattttggattatgttatatgt |
17253940 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttg-ttttgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17253941 |
gatatcccgttgcttgtgatgcttactctgataaatg |
17253977 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24892728 - 24892556
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24892728 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgac-ataa-tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgttttatgt |
24892632 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24892631 |
gatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
24892556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 838627 - 838454
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatat-tggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||| || | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
838627 |
gtgccaaaacgttttatggattacgat-ataa-tttctgctgcaatgtttaagttatctggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
838530 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttg-ttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
838529 |
gatatcccattgattgtgatgcttactctgataaatg------ttttaaa-aaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
838454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 5421076 - 5421218
Alignment:
| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5421076 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
5421175 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5421176 |
aatg-------ttttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
5421218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10002944 - 10002795
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactgt--tggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10002944 |
ttccgctgcaatgttaaggatattatgttaaatcattatttaaccgtcttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgct-actctgataa |
10002846 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgttttt--aaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10002845 |
atgctatgtttttttaaagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttaca |
10002795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10009591 - 10009442
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| Q |
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ttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactgt--tggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10009591 |
ttccgctgcaatgttaaggatattatgttaaatcattatttaaccgtcttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgct-actctgataa |
10009493 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgttttt--aaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10009492 |
atgctatgtttttttaaagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttaca |
10009442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367824
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
15367690 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
15367786 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15367787 |
atatgctgttgtttatgatgcttactctaataaatgtt |
15367824 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Original strand, 3344143 - 3344284
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga-tattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3344143 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggatcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataa |
3344242 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3344243 |
atg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
3344284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 5427483 - 5427588
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| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5427483 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
5427582 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
5427583 |
aatgtt |
5427588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
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| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5200520 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
5200422 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5200421 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
5200379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10903533 - 10903382
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| Q |
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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ttccgctgcaatgttaaggatattatgttaaatcattatttaaccgtcttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgc-tactctgataa |
10903435 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatg---tttttaaagaaatgttg-atattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10903434 |
atgctatgttttttttaaagaaattttgtatgttgggaaaacggggtgttaca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
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Target Start/End: Complemental strand, 10910205 - 10910054
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10910205 |
ttccgctgcaatgttaaggatattatgttaaatcattatttaaccgtcttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgc-tactctgataa |
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T |
 |
| Q |
157 |
atgttatg---tttttaaagaaatgttg-atattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10910106 |
atgctatgttttttttaaagaaattttgtatgttgggaaaacggggtgttaca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
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Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 55148368 - 55148232
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27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
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55148271 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55148270 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
55148232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13320295 - 13320162
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
13320295 |
gtgccaaaacgttttatgt-ttatgat-ataa-tttccgctacaatggttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgt |
13320199 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttg-ttttgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13320198 |
gatatcccgttgcttatgatgcttactctgataaatg |
13320162 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 206
Target Start/End: Original strand, 21282520 - 21282663
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga-tatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21282520 |
ttccgctgcaatgtttacgactatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
21282619 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21282620 |
aatg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacat |
21282663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24187167 - 24187031
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
24187167 |
gtgccaaagcgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
24187070 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24187069 |
gatatcctgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
24187031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16332552 - 16332441
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaac--tgttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16332552 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactattttggattatgttatatgt |
16332456 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| |
|
|
| T |
16332455 |
gatacctcgttgttt |
16332441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4709678 - 4709503
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactgt--tggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||| |
|
|
| T |
4709678 |
gtgccaaaacactttatga-ttatgat-atgattttctgctgcaatgtttaagataattggttaaattattatttaacagttctggactatgttttatgc |
4709581 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttg-ttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatg |
207 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4709580 |
gatacctcgttgattatgatgcttactctgataaatg----gctt---aagaaattttgatattgggaaaacagggtgttacatg |
4709503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19802744 - 19802663
Alignment:
| Q |
83 |
ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19802744 |
ttggttaaattattatttaactgttttggatcatgttatatgtgatattccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
19802663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12481690 - 12481548
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga--tattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12481690 |
ttccgctgcaatgtttacgaccatttggttagatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
12481591 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12481590 |
aatg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
12481548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15824954 - 15824878
Alignment:
| Q |
86 |
gttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttg-ttttgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15824954 |
gttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgtgatatcccgttgcttatgatgcttactctgataaatg |
15824878 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 417354 - 417237
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt------ggttaaattattatttaactg---ttggattacg-t |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
417354 |
gtgccaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtt |
417255 |
T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
417254 |
tctatgtgatatcccgtt |
417237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 26196313 - 26196431
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg---ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26196313 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttattggattacgt |
26196412 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26196413 |
ttctatgtgatatcccgtt |
26196431 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23957600 - 23957484
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt------ggttaaattattatttaactg---ttggattacg-t |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
23957600 |
gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgactttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtt |
23957502 |
T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23957501 |
tctatgtgatatcccgtt |
23957484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 23420088 - 23420165
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23420088 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtt |
23420165 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 14673954 - 14674072
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14673954 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
14674053 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14674054 |
ttctatgtgatatcccgtt |
14674072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17684100 - 17683994
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
17684100 |
tttcagctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
17684001 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
17684000 |
aaatgtt |
17683994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9181342 - 9181229
Alignment:
| Q |
86 |
gttaaattattatttaactg-ttggattacg-ttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgat |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || || | ||||||||||||||| |||| ||||||| | || |
|
|
| T |
9181342 |
gttaaattattatttaactgtttggattacgtttctatgtgatatcccgt--ttatggtttttactctgataaatg------tttttaagaaatttgtat |
9181251 |
T |
 |
| Q |
184 |
attgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9181250 |
attgggaaaacggggtgttaca |
9181229 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 50964190 - 50964075
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| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50964190 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
50964091 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatccc |
131 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |
|
|
| T |
50964090 |
ttctatgtgatatccc |
50964075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
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Query Start/End: Original strand, 83 - 161
Target Start/End: Original strand, 23413952 - 23414034
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| Q |
83 |
ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt-gttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23413952 |
ttggttaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgtggtttactctgataaatgtt |
23414034 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt--gttttgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| || || || |||||||||| |
|
|
| T |
31098286 |
tttccgctgcaacgtttaagttattatgttgaattgttatttaactgatttgtattatgttaaatgtgatatcccgtttatttatgttgtttactctgat |
31098385 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatgt |
208 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31098386 |
aaatgtt---------tagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacatgt |
31098430 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 106 - 205
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| Q |
106 |
ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttac |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4290455 |
ttggtttatgttttatgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaat-tttatattgggaaaacggggtgttac |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1333875 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
1333957 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3689928 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
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106 |
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Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0223 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:
Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28793 - 28614
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28793 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
28694 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28693 |
atccctttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttacat |
28614 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 19781055 - 19781234
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19781055 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
19781154 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19781155 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttacat |
19781234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 14269207 - 14269382
Alignment:
| Q |
28 |
tgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgata |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14269207 |
tgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagttattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgata |
14269306 |
T |
 |
| Q |
128 |
tcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14269307 |
tcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttt--aagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
14269382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23960149 - 23959970
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23960149 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
23960050 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23960049 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
23959970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23953487 - 23953307
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23953487 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
23953388 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23953387 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggagtgttacat |
23953307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Original strand, 2536390 - 2536563
Alignment:
| Q |
31 |
caaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcc |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2536390 |
caaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaatttgttatttaactgtttgattacgttatatgtgatatcc |
2536489 |
T |
 |
| Q |
131 |
cgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttg-atattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2536490 |
cgttgtgttgatgcttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttgaatattgggaaaacggggtgttaca |
2536563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 36885497 - 36885674
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36885497 |
gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
36885595 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36885596 |
atcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatacttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
36885674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 3108269 - 3108446
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3108269 |
gtgccaaaacgttttatgaattaagattatgattttccgctgcaatggttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
3108368 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3108369 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgttttaagaatttttttaatattgggaaaacggggtgttaca |
3108446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15361475 - 15361297
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15361475 |
gtgccaaaacgttt-acgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
15361377 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15361376 |
tatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
15361297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 15384246 - 15384424
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15384246 |
gtgccaaaacgttt-acgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
15384344 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15384345 |
tatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
15384424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 16206916 - 16207095
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16206916 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattagttaaattattatttaactgttagattacattatatgtga |
16207015 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16207016 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
16207095 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 17963113 - 17963295
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17963113 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagactttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
17963212 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatg---tttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17963213 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgctatgttttttttaaagaaattttaaatattgggaaaatggggtgttaca |
17963295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4771461 - 4771324
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
4771461 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
4771362 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4771361 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
4771324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 16232605 - 16232781
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16232605 |
gtgccaaaacgttt-acgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
16232703 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16232704 |
tatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattggg--aacggggtgttaca |
16232781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20114826 - 20114690
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
20114826 |
gtgccaaaacgttttatgagttatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattatgatatatgtgat |
20114727 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatg |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20114726 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatg |
20114690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13282172 - 13282035
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
13282172 |
gtgccaaaacgttttatgaattatggttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
13282073 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13282072 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
13282035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 19942909 - 19943046
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
19942909 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
19943008 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19943009 |
atatcccgttgtttatgatgcttacactgataaatgtt |
19943046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23080938 - 23080801
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
23080938 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttttggattatgttttatgtg |
23080839 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23080838 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
23080801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27709096 - 27708959
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
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|
| T |
27709096 |
gtgccaaaacgttttaagaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
27708997 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27708996 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
27708959 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
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Target Start/End: Original strand, 21340405 - 21340580
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123 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
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|
| T |
21340405 |
gtgccaaaacgttttatgaattatga-tat-aatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
21340502 |
T |
 |
| Q |
124 |
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206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21340503 |
gatatcccgtttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacat |
21340580 |
T |
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Target: chr4; HSP #20
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156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15322903 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttgtgtgatatcccgttgtttgtgatgtttactctgataa |
15323002 |
T |
 |
| Q |
157 |
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159 |
Q |
| |
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||| |
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15323003 |
atg |
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T |
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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
123 |
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159 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
30235865 |
tgatatcccgttgcttatgatgcttactctgataaatg |
30235902 |
T |
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Target: chr4; HSP #22
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggttcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataa |
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T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55794654 |
atgtt-----ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Target: chr4; HSP #23
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41386560 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
41386598 |
T |
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Target: chr4; HSP #24
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123 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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35613242 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgt-tttgatgcttactctgataaatgt |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |
|
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| T |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 12350387 - 12350528
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
12350387 |
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T |
 |
| Q |
156 |
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205 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12350486 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
12350528 |
T |
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Target: chr4; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 12409935 - 12410040
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12409935 |
tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgata |
12410034 |
T |
 |
| Q |
156 |
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161 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
12410035 |
aatgtt |
12410040 |
T |
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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
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Target Start/End: Complemental strand, 15143443 - 15143385
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| Q |
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161 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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ctgttggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgtt |
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T |
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Target: chr4; HSP #28
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || || | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
23837822 |
gtgccaaaacgttttatggattataat-ataattttc-gctgcaatgtttaagattttggttaaattgttatttaactgttttggattatattaaatgtg |
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T |
 |
| Q |
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atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23837724 |
atatcccgttgtttataatgtttactctgataaatgtt |
23837687 |
T |
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Target: chr4; HSP #29
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155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12300744 |
ttccgctgcaatgtttacgactatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
12300843 |
T |
 |
| Q |
156 |
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205 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12300844 |
aatg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
12300886 |
T |
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Target: chr4; HSP #30
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
12521465 |
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12521368 |
T |
 |
| Q |
124 |
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138 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| |
|
|
| T |
12521367 |
gatacctcgttgttt |
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T |
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Target: chr4; HSP #31
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14654480 |
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T |
 |
| Q |
156 |
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161 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
14654380 |
aatgtt |
14654375 |
T |
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Target: chr4; HSP #32
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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tttccgctgcaatgtttaagttgtttggttaaattgttatttaactgttttagattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgata |
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T |
 |
| Q |
156 |
aatgtt |
161 |
Q |
| |
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|||||| |
|
|
| T |
14684429 |
aatgtt |
14684424 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
20806763 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactattattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctga |
20806664 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20806663 |
taaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
20806620 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9272970 |
ttccgctgcaatgttcacgacttttggttaaattactatttaattgttttggatcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgata- |
9273068 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9273069 |
----tatgttt---aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
9273110 |
T |
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116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
|
|
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gtgccaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtt |
12474272 |
T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12474271 |
tctatgtgatatcccgtt |
12474254 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
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| T |
12481001 |
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12480902 |
T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
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|
| T |
12480901 |
tctatgtgatatcccgtt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
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116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
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|
| T |
12528780 |
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12528681 |
T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12528680 |
tctatgtgatatcccgtt |
12528663 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
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Target Start/End: Original strand, 26244363 - 26244536
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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gtgccaaaacgttttatggattatgag-ataa-tttccgctgcaatgtttgagttatttggttaaattgttatttaaccgatttggattatgtttaatgt |
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T |
 |
| Q |
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gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26244461 |
gatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
26244536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Original strand, 28570127 - 28570230
Alignment:
| Q |
28 |
tgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
28570127 |
tgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagctatttggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatgtg |
28570224 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcc |
130 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
28570225 |
atatcc |
28570230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Original strand, 13020997 - 13021133
Alignment:
| Q |
64 |
cgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt--tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13020997 |
cgctgcaatgtttacgacttttggtaaattattatttaactgttttggatcatgttatatgtgatatcccgttgttttatgatgattactctgat----- |
13021091 |
T |
 |
| Q |
160 |
ttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13021092 |
ttatgtt----aagaaatttttatgttgggaaaacggggtgttaca |
13021133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Original strand, 18617874 - 18618017
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| Q |
60 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
18617874 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttaagttgtttactctgat |
18617973 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|| || |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18617974 |
aa----ta-gttt---aagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacat |
18618017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 18603468 - 18603610
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
18603468 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttaagttgtttactctgat |
18603567 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|| || |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18603568 |
aa----ta-gttt---aagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
18603610 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35170027 - 35169853
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatg |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
35170027 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttctgctgtaaagtttaagttatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatg |
35169930 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || || |||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35169929 |
tgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataa--------ttgtttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
35169853 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 18025183 - 18025301
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| Q |
27 |
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115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18025183 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
18025282 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18025283 |
ttctatgtgatatcccgtt |
18025301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18294975 - 18294857
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18294975 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
18294876 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18294875 |
ttctatgtgatatcccgtt |
18294857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 45937523 - 45937441
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaact---gttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45937523 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactactgttggattatggtaaatgtgatatcccgttgttt |
45937441 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23138645 - 23138503
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||| || || ||||||| || |
|
|
| T |
23138645 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatctcgtttgtttatgttgtttactctaat |
23138546 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23138545 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
23138503 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35668898 - 35668779
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg---ttggattacg |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35668898 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttttggattacg |
35668799 |
T |
 |
| Q |
116 |
-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35668798 |
tttctatgtgatatcccgtt |
35668779 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18236265 - 18236188
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18236265 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgatttggactatgttaaatgtgatatcccgtt |
18236188 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 1952461 - 1952569
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
1952461 |
gtgccaaaacgatttatggattatga--aataatttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaactgatttggattatgttgaatgt |
1952558 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
1952559 |
gatatcccgtt |
1952569 |
T |
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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19781448 - 19781329
Alignment:
| Q |
83 |
ttggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaat |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
19781448 |
ttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataa--------ttgtttaagaaat |
19781357 |
T |
 |
| Q |
178 |
gttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19781356 |
ttttatattgggaaaacggggtgttaca |
19781329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 106 - 205
Target Start/End: Original strand, 16957476 - 16957568
Alignment:
| Q |
106 |
ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttac |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16957476 |
ttggtttatgttttatgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaat-tttatattgggaaaacggggtgttac |
16957567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17807724 - 17807562
Alignment:
| Q |
47 |
ttatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt------ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgtta-tatgtgatatcccgttgtt |
137 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
17807724 |
ttatgtttatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt--t |
17807627 |
T |
 |
| Q |
138 |
ttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatgttc |
210 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17807626 |
atggtttttactctgataattgttt--------aagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacatgttc |
17807562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22528055 - 22527972
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| Q |
83 |
ttggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22528055 |
ttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgataattgtt |
22527972 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #55
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Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3412137 - 3412058
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| Q |
86 |
gttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt-gttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3412137 |
gttaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatgtcccgtttgtttatgttgtttactctgataaatgtt |
3412058 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
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Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8384124 - 8384042
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8384124 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
8384042 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8390779 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
8390697 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #58
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Target Start/End: Original strand, 17090795 - 17090877
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17090795 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17105689 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
17105771 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 83 - 134
Target Start/End: Original strand, 19758358 - 19758412
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| Q |
83 |
ttggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19758358 |
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19758412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0140 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:
Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38047 - 37869
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27 |
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126 |
Q |
| |
|
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| T |
38047 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
37948 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37947 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
37869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29866 - 29688
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
29866 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
29767 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29766 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
29688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 61628 - 61484
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
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| T |
61628 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttatttgattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctga |
61529 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
61528 |
taaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacat |
61484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17246725 - 17246547
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17246725 |
gtgctaaaacgtttcatgaattatggttatgattttccgccgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
17246626 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17246625 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggagtgttaca |
17246547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 16408058 - 16408234
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16408058 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaaccgtcggattacgttatatgtgat |
16408157 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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| T |
16408158 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttt--aagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttaca |
16408234 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Original strand, 40524144 - 40524298
Alignment:
| Q |
51 |
gattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactc |
150 |
Q |
| |
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| T |
40524144 |
gattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactc |
40524243 |
T |
 |
| Q |
151 |
tgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
40524244 |
tgataaatgttatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
40524298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13683798 - 13683622
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13683798 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
13683699 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13683698 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
13683622 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13690429 - 13690253
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13690429 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
13690330 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13690329 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
13690253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 18165439 - 18165618
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18165439 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
18165538 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18165539 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
18165618 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11365533 - 11365357
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11365533 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
11365434 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11365433 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaataatgggaaaacggggtgttaca |
11365357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 9511773 - 9511951
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9511773 |
gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
9511871 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9511872 |
tatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
9511951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17053421 - 17053242
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17053421 |
gtgccaaaacgtttcatgacttatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaatcattatttaactgttggattacgttatatgtga |
17053322 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17053321 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
17053242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6336422 - 6336243
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6336422 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
6336323 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttg--atattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6336322 |
tatcccattg-tttaataattactctgataaatgttatgtttttaaagaaat-ttgaaatattgggaaaacggggtgttaca |
6336243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Original strand, 12704182 - 12704335
Alignment:
| Q |
53 |
ttatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactct |
151 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12704182 |
ttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcccgttg-cttgatgcttactct |
12704280 |
T |
 |
| Q |
152 |
gataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12704281 |
gataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
12704335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 11725780 - 11725957
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11725780 |
gtgccaaaatgttttatgaattaagattatgattttccgctgcaatggttaagatattggttaaattgttatttaactgctggattacgatatatgtgat |
11725879 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt--gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11725880 |
atcccgttg-attgatgtttactctgataaatgttatgcttt--aagaaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
11725957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19729218 - 19729081
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
19729218 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccactgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
19729119 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19729118 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
19729081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 205
Target Start/End: Original strand, 11857144 - 11857270
Alignment:
| Q |
79 |
gatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatg |
178 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11857144 |
gatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatt |
11857242 |
T |
 |
| Q |
179 |
tt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11857243 |
ttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
11857270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 163
Target Start/End: Original strand, 4319318 - 4319459
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| Q |
24 |
tgtgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttata |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
4319318 |
tgtgtgccaaaacgttttatggattatgac-ataa-tttccactgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttata |
4319415 |
T |
 |
| Q |
121 |
tgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttat |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4319416 |
tgtgatatcctgttgtttatgatgcttactctgataaatgttat |
4319459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 23520747 - 23520919
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23520747 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgac-ataa-tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgttttatgt |
23520843 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23520844 |
gatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgttct-------aagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
23520919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10874805 - 10874664
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| Q |
61 |
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10874805 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataa |
10874706 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10874705 |
atg-------ttttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
10874664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15770439 - 15770337
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| Q |
60 |
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156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15770439 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattattttttatgtgatatcccgttgtttgtgatgtttactctgataa |
15770340 |
T |
 |
| Q |
157 |
atg |
159 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
15770339 |
atg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7539990 - 7539888
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| Q |
60 |
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7539990 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttggattatgttatatgtgatattccgttgtttatgatgtttactctgataa |
7539891 |
T |
 |
| Q |
157 |
atg |
159 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
7539890 |
atg |
7539888 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Original strand, 6017989 - 6018132
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6017989 |
tttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactattttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgata |
6018088 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6018089 |
aatg-------atttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacat |
6018132 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9409318 - 9409146
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
9409318 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgt |
9409222 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgt-tttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9409221 |
gatatcccgttgtctaagatgcttactctgataaatg-------atttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
9409146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 18554346 - 18554487
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18554346 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgata |
18554444 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18554445 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
18554487 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 18586087 - 18586228
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18586087 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgata |
18586185 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18586186 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
18586228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10868725 - 10868584
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| Q |
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ttccgctgcaatgtttaaga-tattggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10868725 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggattacgttttatatgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataa |
10868626 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10868625 |
atg-------ttttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
10868584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18530627 - 18530494
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18530627 |
gtgccaaaacgtcttatga-ttatgat-ataattttc-gctgcaatgtttacgataattggttaaattattatttaactgttttggattctgttatatgt |
18530531 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18530530 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
18530494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8705288 - 8705147
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8705288 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
8705190 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8705189 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
8705147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26419390 - 26419253
Alignment:
| Q |
26 |
tgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatg |
122 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |
|
|
| T |
26419390 |
tgtgccaaagcgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatg |
26419293 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26419292 |
tgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
26419253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8711959 - 8711855
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8711959 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
8711861 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
8711860 |
aatgtt |
8711855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13143243 - 13143110
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
13143243 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttctgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgt |
13143147 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13143146 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctaataaatg |
13143110 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8916830 - 8916657
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
8916830 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagttaattggttaaattgttatttaactagtttggattatgttaaatgt |
8916733 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8916732 |
gatatcccgtttgtttatgttgcttactctgataaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
8916657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Original strand, 10492238 - 10492380
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga-tatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10492238 |
ttccgctgcaatgtttacgactatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
10492337 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10492338 |
aa-------ttttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
10492380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11261717 - 11261581
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| Q |
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gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
11261717 |
gtgccaaaacgtattatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
11261620 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11261619 |
gatattccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
11261581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 25045325 - 25045461
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
25045325 |
gtgccaaagcgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggactatgttaaatgt |
25045422 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25045423 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
25045461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12691885 - 12691749
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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gtgccaaagcgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttaattaactgttttggattatgttatatgt |
12691788 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
12691787 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctaataattgtt |
12691749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
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Target Start/End: Original strand, 44409023 - 44409164
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24 |
tgtgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattac-gttat |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
44409023 |
tgtgtgccaaagcgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttttggatttttgttaa |
44409120 |
T |
 |
| Q |
120 |
atgtgatatcccgtt-gttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44409121 |
atgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataaatgtt |
44409164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
13461131 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattattatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcctgtttgtttatgttgtttactctgat |
13461032 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
13461031 |
aaatgtt |
13461025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16274925 - 16274751
Alignment:
| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
16274925 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaaagtttaagttatttggttaaattgttatttaactggttttgattatgtta-atgt |
16274829 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttttgatgc---ttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16274828 |
gatatcccgtttgttttatgctgtttactctgataa--------ttgtttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacat |
16274751 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
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Target Start/End: Original strand, 14141139 - 14141283
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| Q |
58 |
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152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || || || |||||||| |
|
|
| T |
14141139 |
actttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtttatttatgttgtttactctg |
14141238 |
T |
 |
| Q |
153 |
ataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14141239 |
ataaatgtt---------tagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacat |
14141283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15021460 - 15021342
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| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt------ggttaaattattatttaactg---ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15021460 |
gtgccaaaatcgctttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttggattacgt |
15021361 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15021360 |
ttctatgtgatatcccgtt |
15021342 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35151008 - 35150866
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgtt-gttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |
|
|
| T |
35151008 |
tttccactgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttattgaattatgataaatgtgatatcccgtttgtttatgctatttactctga |
35150909 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35150908 |
taaatgtt---------aagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
35150866 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 44787230 - 44787348
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| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44787230 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
44787329 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44787330 |
ttctatgtgatatcccgtt |
44787348 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 44793871 - 44793989
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| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44793871 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
44793970 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44793971 |
ttctatgtgatatcccgtt |
44793989 |
T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 48814253 - 48814359
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt--gttttgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || || || |||||||||| |
|
|
| T |
48814253 |
tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtttatttatgttgtttactctgat |
48814352 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
48814353 |
aaatgtt |
48814359 |
T |
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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 16727398 - 16727504
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
16727398 |
tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatcgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
16727497 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
16727498 |
aaatgtt |
16727504 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 17704470 - 17704576
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| Q |
60 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
17704470 |
tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatcgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
17704569 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
17704570 |
aaatgtt |
17704576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 16725367 - 16725509
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||| |||| |
|
|
| T |
16725367 |
tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatcgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactatgat |
16725466 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16725467 |
aaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
16725509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 17702381 - 17702523
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||| |||| |
|
|
| T |
17702381 |
tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatcgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactttgat |
17702480 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17702481 |
aaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
17702523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14952919 - 14952819
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| Q |
67 |
tgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattac-gttatatgtgatatcccgtt-gttt-tgatgcttactctgataaatgt |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14952919 |
tgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttttggatttttgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataaatgt |
14952820 |
T |
 |
| Q |
161 |
t |
161 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
14952819 |
t |
14952819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Original strand, 11233157 - 11233210
Alignment:
| Q |
85 |
ggttaaattattatttaactg---ttggattacgtta-tatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11233157 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgttactatgtgatatcccgtt |
11233210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Original strand, 11239844 - 11239897
Alignment:
| Q |
85 |
ggttaaattattatttaactg---ttggattacgtta-tatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239844 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgttactatgtgatatcccgtt |
11239897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 159
Target Start/End: Original strand, 20480 - 20522
Alignment:
| Q |
118 |
atatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20480 |
atatgtgatatcccattgtttatgatgcttactctgataaatg |
20522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 4840404 - 4840485
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg--ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4840404 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
4840485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 60 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14207603 - 14207499
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttgga-ttacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
14207603 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaatcgttatttaactgatttggatttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
14207504 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaat |
158 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
14207503 |
taaat |
14207499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14216293 - 14216189
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttgga-ttacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
14216293 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaatcgttatttaactgatttggatttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
14216194 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaat |
158 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
14216193 |
taaat |
14216189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15380512 - 15380471
Alignment:
| Q |
67 |
tgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15380512 |
tgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgtt |
15380471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1346739 - 1346689
Alignment:
| Q |
85 |
ggttaaattattatttaactg---ttggattacgtta-tatgtgatatccc |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1346739 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgttactatgtgatatccc |
1346689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0379 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0379
Description:
Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11690 - 11508
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttt--tatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11690 |
gtgccaaaacgtttcatatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtg |
11591 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatgt |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11590 |
atatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttacatgt |
11508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 157 - 333
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
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| T |
157 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactattggattacgttatatgtgat |
256 |
T |
 |
| Q |
127 |
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205 |
Q |
| |
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| T |
257 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0379; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 12458 - 12590
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
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| T |
12458 |
gtgccaaagcgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
12555 |
T |
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| Q |
124 |
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157 |
Q |
| |
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|
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| T |
12556 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactatgataaa |
12590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29232884 - 29232708
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
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|
| T |
29232884 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagttattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
29232785 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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| T |
29232784 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttt--aagaaattttgatattggaaaaacggggtgttaca |
29232708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29346183 - 29346007
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
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| T |
29346183 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagttattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
29346084 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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| T |
29346083 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttt--aagaaattttgatattggaaaaacggggtgttaca |
29346007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 23867166 - 23867344
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
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| T |
23867166 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
23867265 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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|
| T |
23867266 |
attccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
23867344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 207
Target Start/End: Original strand, 26878330 - 26878511
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
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|
| T |
26878330 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
26878429 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttacatg |
207 |
Q |
| |
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| T |
26878430 |
tatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttacatg |
26878511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 22327905 - 22328084
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
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| T |
22327905 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
22328004 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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| T |
22328005 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
22328084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 25191701 - 25191880
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
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| T |
25191701 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
25191800 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
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| T |
25191801 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
25191880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33484936 - 33484760
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
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|
| T |
33484936 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
33484837 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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| T |
33484836 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
33484760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 22321752 - 22321931
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
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|
| T |
22321752 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
22321851 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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|
| T |
22321852 |
tatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacgaggtgttaca |
22321931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24266400 - 24266224
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24266400 |
gtgccaaaacgttttatgaattaagattatgattttccgctgcaatggttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
24266301 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24266300 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
24266224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24261317 - 24261140
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24261317 |
gtgccaaaacgttttatgaattaagattatgattttccgctgcaatggttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
24261218 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24261217 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattggaaaaacggggtgttacat |
24261140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 28432697 - 28432874
Alignment:
| Q |
28 |
tgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28432697 |
tgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttcccctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggataacgttatatgtgat |
28432795 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28432796 |
atcccgttg-attgatgattactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
28432874 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14888105 - 14887927
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14888105 |
gtgccaaaacgttt-atgatttaggtttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
14888007 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
14888006 |
tatcccgttg-cttgttgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaataatgggaaaacggggtgttaca |
14887927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 13971125 - 13971262
Alignment:
| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13971125 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
13971224 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13971225 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
13971262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24714063 - 24713926
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24714063 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
24713964 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24713963 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
24713926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 45058185 - 45058322
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
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|
| T |
45058185 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgactatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
45058284 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45058285 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
45058322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 205
Target Start/End: Original strand, 22382573 - 22382707
Alignment:
| Q |
72 |
tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatg--ttttt |
169 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22382573 |
tgtttgagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgttttttt |
22382671 |
T |
 |
| Q |
170 |
aaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22382672 |
taagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
22382707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33491150 - 33491048
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
33491150 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgatatatgtgat |
33491051 |
T |
 |
| Q |
127 |
atc |
129 |
Q |
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||| |
|
|
| T |
33491050 |
atc |
33491048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11676821 - 11676649
Alignment:
| Q |
28 |
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124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11676821 |
tgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgtg |
11676724 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11676723 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctaataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
11676649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 24641687 - 24641820
Alignment:
| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24641687 |
gtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttagttaaattattatttaactgtttggattatgttatatgtg |
24641784 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24641785 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
24641820 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23898861 - 23898727
Alignment:
| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
23898861 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
23898765 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23898764 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
23898727 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 21148021 - 21148154
Alignment:
| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21148021 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
21148117 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21148118 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
21148154 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 374
Target Start/End: Original strand, 23699892 - 23700060
Alignment:
| Q |
206 |
tgttccaccattaaacaccaaccgaaatggatgatcagttgcttttatgctcatttcatctcactcgacatcaaagttttgcagagtaaaggtagtgttc |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||| | ||| || ||||||| ||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
23699892 |
tgttccaccattaaacacctacctaaattgatgatcagttactttgatggtcatatcatttttctctacctcaaagtcttgcagagtgaaagtagcgttc |
23699991 |
T |
 |
| Q |
306 |
tcagcaattatacccttaaacttatctttgagttcagatggcagaattatttgaatacgatcaccctga |
374 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23699992 |
tcagcaattctactcttaaacttatctttgaattcagttggcaaaattacttgaattcgatcaccctga |
23700060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 15697062 - 15697198
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15697062 |
gtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattgcgttatatgt |
15697159 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15697160 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
15697198 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 22688926 - 22689028
Alignment:
| Q |
60 |
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156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
22688926 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtgatatcccgttgtttgtgaagtttactctgataa |
22689025 |
T |
 |
| Q |
157 |
atg |
159 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
22689026 |
atg |
22689028 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 24873167 - 24873300
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24873167 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttctgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
24873263 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24873264 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
24873300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 15670553 - 15670689
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
15670553 |
gtgccaaaacgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
15670650 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15670651 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
15670689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 24881082 - 24881185
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24881082 |
tttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaattgttttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgata |
24881181 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatg |
159 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
24881182 |
aatg |
24881185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 29023821 - 29023962
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29023821 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
29023919 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29023920 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
29023962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24502502 - 24502366
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
24502502 |
gtgccaaagcgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
24502405 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24502404 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
24502366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Original strand, 44382015 - 44382157
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| Q |
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156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44382015 |
ttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataa |
44382113 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaa-tgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44382114 |
atg------ttttaatgaaatttttcatattgggaaaacggggtgttaca |
44382157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Original strand, 44391069 - 44391211
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44391069 |
ttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataa |
44391167 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaa-tgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44391168 |
atg------ttttaatgaaatttttcatattgggaaaacggggtgttaca |
44391211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 207
Target Start/End: Original strand, 30657982 - 30658126
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30657982 |
tttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactatttcggatcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgata |
30658081 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatg |
207 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30658082 |
aatg-------atttacgaaatttttatattgggaaaacggggtgttacatg |
30658126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 44375487 - 44375631
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
44375585 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaa-tgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44375586 |
aaatg------ttttaatgaaatttttcatattgggaaaacggggtgttaca |
44375631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27368595 - 27368453
Alignment:
| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27368595 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
27368497 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27368496 |
aaatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
27368453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
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122 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||| |
|
|
| T |
20450382 |
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20450479 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20450480 |
tgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
20450519 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
25584984 |
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25584887 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| |
|
|
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gatacctcgttgttt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
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| |
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|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
27375266 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgacatgccgttgtttacgatgcttactctgat |
27375168 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27375167 |
aaatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
27375124 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 23115501 - 23115603
Alignment:
| Q |
60 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
23115501 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttttggattaagttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
23115600 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaa |
157 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
23115601 |
aaa |
23115603 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27195187 - 27195082
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
27195187 |
ttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgtaatatcccgtttgtttatgctgtttactctgata |
27195088 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
27195087 |
aatgtt |
27195082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27845001 - 27844896
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
27845001 |
ttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgtaatatcccgtttgtttatgctgtttactctgata |
27844902 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
27844901 |
aatgtt |
27844896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 38688371 - 38688508
Alignment:
| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
38688371 |
gtgccaaagcgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
38688468 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||| || || |||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38688469 |
gatttctcgtttgtttatgctgtttactctgataaatgtt |
38688508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41666359 - 41666223
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
41666359 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactggttttgattatgtta-atgt |
41666263 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41666262 |
gatatcccgtttgtttatgctgcttactctgataattgtt |
41666223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 13307366 - 13307484
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| Q |
27 |
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115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13307366 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
13307465 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13307466 |
ttctatgtgatatcccgtt |
13307484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16996400 - 16996282
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16996400 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
16996301 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16996300 |
ttctatgtgatatcccgtt |
16996282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17003033 - 17002915
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| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17003033 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
17002934 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17002933 |
ttctatgtgatatcccgtt |
17002915 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 19123843 - 19123961
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19123843 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
19123942 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19123943 |
ttctatgtgatatcccgtt |
19123961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 19490644 - 19490762
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| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19490644 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
19490743 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19490744 |
ttctatgtgatatcccgtt |
19490762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25934360 - 25934242
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25934360 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
25934261 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25934260 |
ttctatgtgataacccgtt |
25934242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 60181 - 60038
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||| |
|
|
| T |
60181 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttagttaaattgttatttaactattattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgc |
60082 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60081 |
taaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
60038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16921693 - 16921637
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata |
82 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
16921693 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagata |
16921637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 22461921 - 22462027
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
22461921 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaatttttatttaactgatattgatttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
22462020 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
22462021 |
aaatgtt |
22462027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Original strand, 41605559 - 41605636
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| Q |
86 |
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41605559 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgtttttatgtgatatcccgt--ttatgatttttactctgataaatgtt |
41605636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 20949878 - 20949960
Alignment:
| Q |
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ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20949878 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
20949960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22675124 - 22675042
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22675124 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
22675042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24734732 - 24734655
Alignment:
| Q |
86 |
gttaaattattatttaactgttg---gattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24734732 |
gttaaattgttatttaactgttttgcgattatgttgaatgtgatatcccgttattt-gatgtttactctgataaatgtt |
24734655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0473 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:
Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 1359 - 1537
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1359 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
1458 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1459 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaaagaaattttaatattgggaaaatggggtgttaca |
1537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 13287293 - 13287471
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13287293 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
13287392 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13287393 |
atcccgttgctttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
13287471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 41479324 - 41479500
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41479324 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
41479423 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
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|
| T |
41479424 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacgggatgttaca |
41479500 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20934675 - 20934535
Alignment:
| Q |
27 |
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126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20934675 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
20934576 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttt |
168 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20934575 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt |
20934535 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 203
Target Start/End: Original strand, 20216700 - 20216865
Alignment:
| Q |
39 |
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137 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20216700 |
tttatgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacattatatgtgatatcccgttg-c |
20216798 |
T |
 |
| Q |
138 |
ttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgtta |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20216799 |
ttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgtta |
20216865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15743853 - 15743716
Alignment:
| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
15743853 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
15743754 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15743753 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
15743716 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 21807956 - 21808093
Alignment:
| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
21807956 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgatattccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
21808055 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21808056 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
21808093 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21834716 - 21834579
Alignment:
| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
21834716 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgatattccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
21834617 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21834616 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
21834579 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 33386978 - 33387114
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| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
33386978 |
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33387076 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33387077 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
33387114 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 33393623 - 33393759
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| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
33393623 |
gtgccaaaacgttt-atgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
33393721 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33393722 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
33393759 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23762600 - 23762426
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23762600 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
23762503 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23762502 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacat |
23762426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8304523 - 8304390
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
8304523 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgat-ataa-tttccgctgcaatatttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggtttatgttatatgt |
8304427 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8304426 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
8304390 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 205
Target Start/End: Original strand, 19302211 - 19302335
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| Q |
86 |
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180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
19302211 |
gttaaattattatttaactgtttttggattacgttttttatgtgatatcccgttgttt-gatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaagtttt |
19302309 |
T |
 |
| Q |
181 |
gatatt-gggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19302310 |
gatattggggaaaacggggtgttaca |
19302335 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19104133 - 19103997
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| Q |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19104133 |
gtgccaaaacgttatatgaattatgat-ataa-tttccgccgaaatgttgaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattacgttatatgt |
19104036 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19104035 |
gatatcccgttgtttgtgatacttactctgataaatgtt |
19103997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19110782 |
gtgccaaaacgttatatggattatgat-ataa-tttccgctgaaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattacgttatatgt |
19110685 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19110684 |
gatatctcgttatttgtgatacttactctgataaatgtt |
19110646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 61 - 161
Target Start/End: Original strand, 18627130 - 18627234
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| Q |
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18627130 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataa |
18627229 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
18627230 |
atgtt |
18627234 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33384363 - 33384221
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33384363 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
33384265 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33384264 |
aaatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
33384221 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
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| Q |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44755398 |
tttccgctgcgatgttaaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatctgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
44755300 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44755299 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
44755257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
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tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
49333866 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcaatagttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
49333768 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49333767 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
49333725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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20526037 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| |
|
|
| T |
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gatacctcgttgttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
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123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
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21435942 |
T |
 |
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124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
21435941 |
gatatcccgttgtttatgatgtttcctctgataaatgtt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
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Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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aaatgt |
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Q |
| |
|
|||||| |
|
|
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aaatgt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
27899483 |
atgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattaagtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatgtt |
27899576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 17040989 - 17041132
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
17040989 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactattattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
17041088 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17041089 |
taaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
17041132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 17046527 - 17046670
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
17046527 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactattattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
17046626 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17046627 |
taaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
17046670 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 51329434 - 51329552
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| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51329434 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
51329533 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
51329534 |
ttctatgtgatatcccgtt |
51329552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
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Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51336068 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
51336167 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
51336168 |
ttctatgtgatatcccgtt |
51336186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23507824 - 23507716
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| Q |
36 |
cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg-ttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
23507824 |
cgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgtttctatgtga |
23507725 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
23507724 |
tatcccgtt |
23507716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12646243 - 12646137
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
12646243 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactgatattgatttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
12646144 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
12646143 |
aaatgtt |
12646137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27367037 - 27366943
Alignment:
| Q |
106 |
ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttac |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27367037 |
ttggtttatgttttatgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaat-tttatattgggaaaacggggtgttac |
27366946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 16346572 - 16346654
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16346572 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
16346654 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 16353221 - 16353303
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16353221 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
16353303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 207
Target Start/End: Original strand, 21238250 - 21238286
Alignment:
| Q |
171 |
aagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatg |
207 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21238250 |
aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacatg |
21238286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 41349649 - 41349731
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41349649 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
41349731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 41357086 - 41357168
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41357086 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
41357168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 46158137 - 46158219
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46158137 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
46158219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 47658522 - 47658440
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47658522 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
47658440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:
Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33769 - 33591
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33769 |
gtgccaagacgttttatga-ttatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggcttacgttatatgtgat |
33671 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33670 |
atcccgttgctttgatgcttactctgataaatgctatgtatttaatgaaaatttgatattgggaaaacggggtgttacat |
33591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 28259216 - 28259393
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28259216 |
gtgccaaaacgttttatgaattatatttacgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
28259315 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28259316 |
atcccgttg-tttgatg-ttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttcgatattgggaaaacggggtgttaca |
28259393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 28265840 - 28266017
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28265840 |
gtgccaaaacgttttatgaattatatttacgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
28265939 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28265940 |
atcccgttg-tttgatg-ttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttcgatattgggaaaacggggtgttaca |
28266017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28286700 - 28286523
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28286700 |
gtgccaaaacgttttatgaattatatttacgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
28286601 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28286600 |
atcccgttg-tttgatg-ttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttcgatattgggaaaacggggtgttaca |
28286523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 28337965 - 28338142
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28337965 |
gtgccaaaacgttttatgaattatatttacgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
28338064 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28338065 |
atcccgttg-tttgatg-ttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttcgatattgggaaaacggggtgttaca |
28338142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 28344589 - 28344766
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28344589 |
gtgccaaaacgttttatgaattatatttacgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
28344688 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28344689 |
atcccgttg-tttgatg-ttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttcgatattgggaaaacggggtgttaca |
28344766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 4234235 - 4234411
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4234235 |
gtgccaaaacgttt-atgaattatgtttatgattttctgctgcaatatttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgtcatatgtgat |
4234333 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4234334 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattggg-aaacggggtgttaca |
4234411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 18194921 - 18195100
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgacttt-ccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18194921 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgatttttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtg |
18195020 |
T |
 |
| Q |
125 |
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206 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18195021 |
atatcccgttgttttgatgtttactctgataaatgttatg--tttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttacat |
18195100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30596567 - 30596388
Alignment:
| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30596567 |
gtgccaaaacatttcatatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggactacgttatatgtg |
30596468 |
T |
 |
| Q |
125 |
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205 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30596467 |
atatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
30596388 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16262883 - 16262714
Alignment:
| Q |
37 |
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136 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16262883 |
gttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgatataccgttgt |
16262784 |
T |
 |
| Q |
137 |
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206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16262783 |
tttgatgcttactctgataaatgctatgtatttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttacat |
16262714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6980004 - 6979827
Alignment:
| Q |
27 |
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125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6980004 |
gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcaaatgtttgagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
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T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6979905 |
taacccgttgctt-gatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
6979827 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 27563439 - 27563618
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| Q |
27 |
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125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtgccaaaacgttt-atgatttatgtttatgattttccgctgcgaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
27563537 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27563538 |
tatcccgttg-cttgatgcttactctgataaatgttatgcttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttacat |
27563618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 24291800 - 24291937
Alignment:
| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
24291800 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
24291899 |
T |
 |
| Q |
125 |
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24291900 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
24291937 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 24315829 - 24315966
Alignment:
| Q |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
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gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
24315928 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24315929 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
24315966 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Original strand, 2877476 - 2877611
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| Q |
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168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2877476 |
aatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggatttacgttatatgtgatatcccgttgttt-gatgttgactctgataaatgttatgtttt |
2877574 |
T |
 |
| Q |
169 |
taaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2877575 |
taaagaagttttgatattgggaaaacggggtgttaca |
2877611 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 31317841 - 31317978
Alignment:
| Q |
27 |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
31317841 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
31317940 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31317941 |
atatcccgttgtttatgattcttactctgataaatgtt |
31317978 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Original strand, 2870861 - 2870996
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| Q |
70 |
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168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2870861 |
aatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggatttacgttatatgtgatatcccgttgttt-gatgtttactctgataaatattatgtttt |
2870959 |
T |
 |
| Q |
169 |
taaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2870960 |
taaagaagttttgctattgggaaaacggggtgttaca |
2870996 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22758233 - 22758100
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| Q |
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124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22758233 |
gtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttagattatgttatatgtg |
22758136 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22758135 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
22758100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 20650562 - 20650704
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgac----tttccgctgcaatgtttaagatattggtt-aaattattatttaactg--ttggattacgttat |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
20650562 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgactatgatataatttccgctgcaatgtttaagatattggttaaaattattatttaactgttttggattatgtttt |
20650661 |
T |
 |
| Q |
120 |
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20650662 |
atgtgatatcccgttgattatgatgcttactctaataaatgtt |
20650704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 23278204 - 23278337
Alignment:
| Q |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23278204 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
23278300 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23278301 |
ggtatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
23278337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
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155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5835279 |
tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttggattatgttatatgtgatatcccgttgttttatgatgcttactctgata |
5835378 |
T |
 |
| Q |
156 |
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159 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
5835379 |
aatg |
5835382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 1545852 - 1545954
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60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1545852 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtgatatcccgttgtttgtgatgtttactctgataa |
1545951 |
T |
 |
| Q |
157 |
atg |
159 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
1545952 |
atg |
1545954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21414547 - 21414411
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21414547 |
gtgccagaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatctggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
21414450 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21414449 |
gatatctcgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
21414411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
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ttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgtgatatcccgttgttatgatgcttactctgataaa |
25110085 |
T |
 |
| Q |
158 |
tg |
159 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
25110084 |
tg |
25110083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25116787 - 25116686
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25116787 |
ttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgtgatatcccgttgttatgatgcttactctgataaa |
25116688 |
T |
 |
| Q |
158 |
tg |
159 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
25116687 |
tg |
25116686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
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122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
19807899 |
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19807802 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19807801 |
tgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
19807725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 25597387 - 25597520
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
25597387 |
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T |
 |
| Q |
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gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25597484 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
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Target Start/End: Complemental strand, 4167303 - 4167131
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27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
4167303 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgt |
4167207 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4167206 |
gatatcccgttgtttaagatgcttactctgata-----tatgattt--aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
4167131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4207983 - 4207811
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
4207983 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgt |
4207887 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4207886 |
gatatcccgttgtttaagatgcttactctgata-----tatgattt--aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
4207811 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
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Target Start/End: Complemental strand, 20176253 - 20176150
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60 |
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155 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20176253 |
tttctgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttggattatgttatatgtgatatcccgttgttttatgatgcttactctgata |
20176154 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatg |
159 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
20176153 |
aatg |
20176150 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
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60 |
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155 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22159738 |
tttcagctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgtttggattatgttatatgtgatatcccgttgttttatgatgcttactctgata |
22159837 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatg |
159 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
22159838 |
aatg |
22159841 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
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27 |
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122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| |
|
|
| T |
22331464 |
gtgccaaaacgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggaattatgttaaatg |
22331367 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22331366 |
tgatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
22331327 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 17038137 - 17038309
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17038137 |
gtgccaaaacgttttatg-attatga-tat-aaattccgctgcaatgtttaagttattgggttaaattcttatttaactgtttggattacgtttatatgt |
17038233 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17038234 |
gatatcccgttgtttatgatg-ttactctgata-----tatgttttt-aagaaattttcatgttgggaaaacggagtgttaca |
17038309 |
T |
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Target: chr6; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 32566055 - 32566197
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60 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
32566055 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
32566153 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32566154 |
aaatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
32566197 |
T |
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Target: chr6; HSP #34
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Target Start/End: Original strand, 25804960 - 25805106
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga-tattggttaaattattatttaactgttg--gattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25804960 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttagattaagtttaatatgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataa |
25805059 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25805060 |
atgttatgctttaaaataaat-ttgattttggg-aaacggggtgttaca |
25805106 |
T |
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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
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Target Start/End: Original strand, 34299338 - 34299474
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27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
34299338 |
gtgccaaagcgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaaattatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
34299435 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34299436 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
34299474 |
T |
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Target: chr6; HSP #36
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Target Start/End: Original strand, 16552833 - 16552975
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
16552931 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16552932 |
aaatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
16552975 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16576120 - 16575978
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16576120 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
16576022 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16576021 |
aaatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
16575978 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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Target Start/End: Original strand, 16619260 - 16619402
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16619260 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
16619358 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16619359 |
aaatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
16619402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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| Q |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16629389 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgacatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
16629487 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16629488 |
aaatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
16629531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 34370700 - 34370810
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29 |
gccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34370700 |
gccaaaacgtttcatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgtga |
34370797 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
|| | |||||||| |
|
|
| T |
34370798 |
tacctcgttgttt |
34370810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
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| Q |
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ttccgctgcaatgtttaaga-tatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17017768 |
ttccgctgcaatgtttacgactatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccattgtttacgatgcttactctgata |
17017867 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17017868 |
aatg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
17017910 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 138
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| Q |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16371057 |
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T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| |
|
|
| T |
16370959 |
gatacctcgttgttt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34831946 - 34831865
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| Q |
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tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34831946 |
tttccgctgcaatgtttaagatattgggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgtgatatcatgttgttt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8796472 - 8796396
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134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8796472 |
ttccgctgcaatgtttaagatattttgttaaatcattatttaactgttttggattacgttatatgtgatatcccgtt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21701687 - 21701549
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27 |
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122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |
|
|
| T |
21701687 |
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21701590 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccgtt-gttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21701589 |
tgatattccgtttgtttatgctatttactctgataaatgtt |
21701549 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 22334312 - 22334455
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
22334312 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattattatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
22334411 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
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Q |
| |
|
|| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22334412 |
aattg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 20804255 - 20804392
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatat-tggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
20804255 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagttatatggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatgt |
20804352 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcc-cgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20804353 |
gatatcctatttgtttatgttgtttactctgataaatgtt |
20804392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23435872 - 23435754
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg---ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23435872 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgtttttggattacgt |
23435773 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23435772 |
ttttatgtgatatcccgtt |
23435754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 25136333 - 25136471
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
25136333 |
gtgccaaaacgttttatggattatga-cataattttccgctgcaatgtttaagttattcggttaaaatgttatttaactggttttgattaagtttaatgt |
25136431 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25136432 |
gatatcccgtttgtttatgctccttactctgataactgtt |
25136471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 9485047 - 9485189
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaac---tgttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
9485047 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactaatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
9485146 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9485147 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
9485189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Original strand, 5617556 - 5617634
Alignment:
| Q |
64 |
cgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5617556 |
cgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattggattacattaaatgtgatatcccgttgttt |
5617634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12495682 - 12495540
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||| || |
|
|
| T |
12495682 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttgaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactcttat |
12495583 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12495582 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
12495540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 2686050 - 2686126
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
2686050 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatctcgtt |
2686126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12762055 - 12761937
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12762055 |
gtgccaaaatcgttctacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
12761956 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12761955 |
ttctatgtgatatcccgtt |
12761937 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8228176 - 8228094
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8228176 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
8228094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11564714 - 11564686
Alignment:
| Q |
185 |
ttgggaaaacggggtgttacatgttccac |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11564714 |
ttgggaaaacggggtgttacatgttccac |
11564686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18930367 - 18930285
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18930367 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
18930285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19662173 - 19662067
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
19662173 |
tttccgctgtattgtttaagtatttggttaaattgttatttacctaatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
19662074 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
19662073 |
aaatgtt |
19662067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 23382237 - 23382319
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg---ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23382237 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtatttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
23382319 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0252 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0252
Description:
Target: scaffold0252; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24648 - 24468
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttt--tatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24648 |
gtgccaaaacgtttcatatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattattttatatgtg |
24549 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24548 |
atatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttacat |
24468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0183 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:
Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 14336 - 14514
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14336 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatataggttaaattattatttaactgttggattatgttatatgtgat |
14435 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14436 |
ataccattgatttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
14514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 101492 - 101668
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
101492 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattactttatatgtgat |
101591 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
101592 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgttttt-aagaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
101668 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 64153 - 64071
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
64153 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
64071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0260 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:
Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22602 - 22424
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22602 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
22503 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttg-atattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22502 |
atcccgttgttttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttgaatattgggaaaatggggtgttacat |
22424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1148 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1148
Description:
Target: scaffold1148; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2542 - 2366
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2542 |
gtgccaaaatgttttatgaattatgtttatgattttccgctgcaatgtttatgatattggttaaattattatttaattgttggattacgttatatgtgat |
2443 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2442 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttt--aagaaattttgatgttgtgaaaacggggtgttaca |
2366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 121558 - 121380
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
121558 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgcattgtttatgatattggttaaattattatttgactgttggattatgttatatgtgat |
121459 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
121458 |
attcctttgttttgatgcttactctgataaatgctatgtttttaatgaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
121380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29661 - 29485
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29661 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggtttacgttatatgtgat |
29562 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29561 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgatatatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
29485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0174 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:
Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 83 - 260
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
83 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattgttatttaactgttggattaagatatatgtgat |
182 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt--gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
183 |
atcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgcttt--aagaaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0042 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:
Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 98042 - 98188
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaat |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
98042 |
tttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgatatcccgttg-tttgatgtttactctgataaat |
98140 |
T |
 |
| Q |
159 |
gttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
98141 |
gttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
98188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 69570 - 69454
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt------ggttaaattattatttaactg---ttggattacg-t |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
69570 |
gtgccaaaac-ttttatgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagttatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtt |
69472 |
T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
69471 |
tctatgtgatatcccgtt |
69454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 63238 - 63095
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
63238 |
tttccactgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
63139 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
63138 |
taaatg--------attaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
63095 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0040 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:
Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 6635 - 6811
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtgat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6635 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttcagctgcaatgttaaagatattggttaaattgttatttaactgttggattacgttatatgtgat |
6734 |
T |
 |
| Q |
127 |
atcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6735 |
atcacattg-tttaatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaatttttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
6811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 59891 - 59709
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttatatgtga |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
59891 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggatttcgttatatgtga |
59792 |
T |
 |
| Q |
126 |
tatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatg---tttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
59791 |
tatcccgttg-cttgatgtttgctctgataaatgttatgttttttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
59709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4962 - 4789
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
4962 |
gtgccaaaacgttttatggattatgat-ataattttc-gctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattattttatatgt |
4865 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4864 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaacagggtgttaca |
4789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46537 - 46455
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46537 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
46455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0278 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:
Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 3346 - 3483
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |
|
|
| T |
3346 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgattttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgag |
3445 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3446 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
3483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0146 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:
Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 695
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
832 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgatattccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
733 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
732 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0186 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:
Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33445 - 33297
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga-tattggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33445 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataa |
33346 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33345 |
atgttatgcttttaaagaaattcgtatattgggaaaacggggtgttaca |
33297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 66849 - 66669
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaa-tgtttaagatattggttaaattattatttaactgttggattacgttata----- |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
66849 |
gtgccaaaacgtttcatgaattatggttaagattttccgctgcaaatgtttaagatattggttagattattatttaactgttggattacgttataaatat |
66750 |
T |
 |
| Q |
121 |
tgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgtt-gatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
66749 |
tgggata----cttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaacggggtgttaca |
66669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 56428 - 56257
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
56428 |
gtgccaaaacgttttatgt-ttatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtg |
56332 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56331 |
atatcctgttgtttgtgatgtttactctgataaatg-------atttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
56257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40891 - 40750
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40891 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgtgatatcctgttgtttgtgatgtttactctgataa |
40792 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40791 |
atg-------atttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
40750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Original strand, 124737 - 124897
Alignment:
| Q |
214 |
cattaaacaccaaccgaaatggatgatcagttgcttttatgctcatttcatctcactcgacatcaaagttttgcagagtaaaggtagtgttctcagcaat |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
124737 |
cattaaacaccagcctaaacttatgattagttgctttgatggtcatctcatttttctcaacatcaaagttttgcagagtaaaagtagtgttctcagcaac |
124836 |
T |
 |
| Q |
314 |
tatacccttaaacttatctttgagttcagatggcagaattatttgaatacgatcaccctga |
374 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
124837 |
tctactcttaaactgatctttgaattcatttggcaaaatgacttgaatacgatcaccctga |
124897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0436 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:
Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13240 - 13107
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt-ggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13240 |
gtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgtttggattatgttatatgtg |
13143 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13142 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
13107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0358 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:
Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14367 - 14193
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14367 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttaattaactgttttggattatgttatatgt |
14270 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14269 |
gatatcccgttgtttgtgatgcttactctgataaatg-------tcttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacat |
14193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Original strand, 3384 - 3532
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactgt--tggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3384 |
ttccgctgcaatgttaagaatattatgttaaatcattatttaaccgtcttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgct-actctgataa |
3482 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttt-taaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3483 |
atgctatgttttttaaagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttaca |
3532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8712 - 8539
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8712 |
gtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccactgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
8615 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8614 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaatggggtgttaca |
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T |
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134 |
Q |
| |
|
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|
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tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaatttttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccgtt |
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T |
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T |
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42482 |
atatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
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T |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
6333 |
tttccgctgcaatgtttaagttatttgattaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcctgtttgtttatgttgtttactctgat |
6234 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6233 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| |
|
|
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12006 |
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12103 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
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gatatcccgtt |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
39523 |
gtgccaaaacgttttatggattatga-cataattttccgctgcaatg-ttaagttatttggttaaattgttatttaactagttttgattaagtttcatgt |
39620 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
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gatatcccgtt |
39631 |
T |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9336 |
gtgccaaaacgttttatga-ttatgat-ataattttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattatgttatatgt |
9239 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttg-ttttgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9238 |
gatatcccgttgcttatgatgcttactctgataaatg |
9202 |
T |
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Target: scaffold0090; HSP #1
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39562 |
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39659 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39660 |
gatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
39696 |
T |
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Target: scaffold0265 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
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Target: scaffold0265; HSP #1
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24819 |
ttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactgttttggattatgttttatgagatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaa |
24720 |
T |
 |
| Q |
158 |
tgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
24719 |
tgtt |
24716 |
T |
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Target: scaffold0089 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:
Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
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Target Start/End: Original strand, 20361 - 20533
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
20361 |
gtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgcttcaaagtttaagttatttggttaaattatcatttaactgttttggattatgctatatgt |
20458 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20459 |
gatatcccgttgttatgatgcttactctgata-----tatgtttt--aagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
20533 |
T |
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Target: scaffold0656 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
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Target: scaffold0656; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 731 - 596
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
731 |
gtgccaaaacgttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggtttaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
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T |
 |
| Q |
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gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgt |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
633 |
gatatctcgttgtttgtgatgcttactctgataaatgt |
596 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0216 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:
Target: scaffold0216; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9560 |
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9656 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9657 |
gatatcccgttgtttatgatggttactctgataaatg-------atttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacat |
9733 |
T |
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Name: scaffold0303
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Target: scaffold0303; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15625 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggatcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataa |
15526 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15525 |
atgtt------tttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
15483 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0096 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
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Target: scaffold0096; HSP #1
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| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttacgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
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T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15872 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
15908 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0048 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
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Target: scaffold0048; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9581 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttcactgctttggattatgttatatgt |
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T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9678 |
gatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
9714 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
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Target: scaffold0039; HSP #1
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123 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34170 |
gtgccgaaactttttatggattatgat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaatttttatttaactgttttggattatgttatatgt |
34073 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34072 |
gatatcccgttgtttacgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttttatattgggaaaaccgggtgttaca |
33997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
153852 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcaatgattaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
153756 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
153755 |
gatatctcgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0217
Description:
Target: scaffold0217; HSP #1
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ttccgctgcaatgtttaaga-tattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
279 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggatcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataa |
378 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
379 |
atg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
420 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0120; HSP #1
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| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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cgttatatgtgatatcccgttgttt-gatgtttactctgataaatgttatgtttttaaagaaattttaaatattgggaaaatggggtgttacatg |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target Start/End: Complemental strand, 25619 - 25525
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| Q |
115 |
gttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgttttt---aaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatg |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25619 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-gatgtttactctgataaatgctatgttttttttaaagaaattttgatattgggaaaacggggtgttacatg |
25525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47593 - 47422
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47593 |
gtgccaaaacgttttatgact-atgat-ataa-tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgt |
47498 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47497 |
gatatcccgttgtttacgatgcttactcttataaatg-------tttaaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
47422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0126 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:
Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
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Target Start/End: Original strand, 4891 - 5032
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4891 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
4989 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4990 |
aatg-------tataaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttaca |
5032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0862 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0862
Description:
Target: scaffold0862; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4516
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4690 |
gtgccaaaatgttttatga-ttatgat-ataa-tttccgctacaatgtttaagatatttggttaaattattatttaactgttttggattttgttatatgt |
4594 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tg-atgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4593 |
gatatcccgttgtttatgaatgcttactctgataaatg-------atttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacat |
4516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0242 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:
Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19127 - 18991
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
19127 |
gtgccaaaacattttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgt |
19030 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19029 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
18991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25274 - 25138
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
25274 |
gtgccaaaacattttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaatttatttggttaaattgttatttatttgttttggattatgttaaatgt |
25177 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25176 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactctgataaatgtt |
25138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0233 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:
Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 15263 - 15371
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| Q |
27 |
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15263 |
gtgccaaaacgttttatggattatcat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattattatttaactgttttggattacgttatatgt |
15360 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15361 |
gatatcccgtt |
15371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:
Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Original strand, 106685 - 106826
Alignment:
| Q |
61 |
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
106685 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggatcatgttatatgtaatatcccgttgtttatgatgcttactctgataa |
106784 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
106785 |
atg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
106826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Original strand, 126919 - 127060
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga-tattggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126919 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgtttttgatcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataa |
127018 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
127019 |
atg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
127060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 241447 - 241311
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
241447 |
gtgccaaagcgttttatggattataat-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttatatgt |
241350 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
241349 |
gatatcccgttgtttatgatgtttactttgataaatgtt |
241311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7536 - 7432
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga-tattggttaaattattatttaactgttg--gattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7536 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttagattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgataa |
7437 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
7436 |
atgtt |
7432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0572 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:
Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9173 - 9069
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga-tattggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9173 |
ttccgctgcaatgtttacgacttttggttaaattattatttaactgttttggatcatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgctgactctgataa |
9074 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
9073 |
atgtt |
9069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0259 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:
Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9559 - 9387
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
9559 |
gtgccaaaacgttttatggatcatgat-ataa-tttccgctgcgatgtttaagttattttgttaaattattatttaactgtttgggattatgt-atatgt |
9463 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9462 |
gatatcccgttttttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaggaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
9387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0144 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:
Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20081 - 19928
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| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaac--tgttggattacgttatatgtgatatcccgtt-gttttgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |
|
|
| T |
20081 |
ttccgctgcaatgtttaagatattatgttaaatcattatttaaccgtcttggattatgatatatgtgatatcccgttggttatgatgc-tactctgacaa |
19983 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgttttt------aaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19982 |
atgctatgttttttttttaaaagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttaca |
19928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Original strand, 33121 - 33274
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaac--tgttggattacgttatatgtgatatcccgtt-gttttgatgcttactctgataa |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |
|
|
| T |
33121 |
ttccgctgcaatgtttaagatattatgttaaatcattatttaaccgtcttggattatgatatatgtgatatcccgttggttatgatgc-tactctgacaa |
33219 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgttatgttttt------aaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33220 |
atgctatgttttttttttaaaagaaattttgatgttgggaaaacggggtgttaca |
33274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Original strand, 267477 - 267619
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
267477 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcactatttaactgttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
267575 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
267576 |
aatg------ttttaataaaat-ttcatattgggaaaacggggtgttacat |
267619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005; HSP #2
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tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
304122 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactattattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttg-ttactctga |
304220 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
304221 |
taattg------tttttaagaaatttttatattgggaaagcggggtgttaca |
304266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0553 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:
Target: scaffold0553; HSP #1
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8125 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
8027 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgt |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
8026 |
aaatgt |
8021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0065 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:
Target: scaffold0065; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29112 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgtttttggattacgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgat |
29014 |
T |
 |
| Q |
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aaatgt |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
29013 |
aaatgt |
29008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 28218 - 28323
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28218 |
tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaaatgttttggattatgttaaatgtgatatcccgttgtttatgatgtttactctgata |
28317 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
28318 |
aatgtt |
28323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0248 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0248
Description:
Target: scaffold0248; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25858 - 25716
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgtttt-gatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25858 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcactatttaactgttttggattacgtt-tatatgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
25760 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25759 |
aatg-------ttttaagaaaatttcatattgggaaaacggggtgttacat |
25716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0133 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:
Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21464 - 21322
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaaga-tatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21464 |
ttccgctgcaatgtttacgactatttggttaaatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccattgtttacgatgcttactctgata |
21365 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21364 |
aatg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
21322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1212 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1212
Description:
Target: scaffold1212; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2395 - 2300
Alignment:
| Q |
108 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttgttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgt-tgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2395 |
ggattacgttatatgtgatatcccgttg-tttgatgtttactctgataaatgttatgtttt--aagaattttaaaatattgggaaaacggggtgttaca |
2300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 206
Target Start/End: Original strand, 143 - 286
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagata--ttggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
143 |
ttccgctgcaatgtttacgaccatttggttagatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
242 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
243 |
aatg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacat |
286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 206
Target Start/End: Original strand, 8398 - 8541
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagata--ttggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8398 |
ttccgctgcaatgtttacgaccatttggttagatcattatttaactgttttggattacgttttatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
8497 |
T |
 |
| Q |
156 |
aatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacat |
206 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8498 |
aatg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttacat |
8541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41101 - 41008
Alignment:
| Q |
106 |
ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttac |
204 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41101 |
ttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaa-------ttttttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttac |
41009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:
Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1642 - 1468
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatg |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
1642 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttattggattatgttaaatg |
1545 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatccc-gttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || || ||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1544 |
tgatatcccatttgtttatgttgtttactctaataaatg--------tttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
1468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0586 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:
Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4254 - 4115
Alignment:
| Q |
24 |
tgtgtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt--ggattacgttata |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||| || || | || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
4254 |
tgtgtgccaaagcgttttatggattataat-ataattt--cgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaa |
4158 |
T |
 |
| Q |
121 |
tgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4157 |
tgtgatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataaatgtt |
4115 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0423 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:
Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5408 - 5235
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
5408 |
gtgccaaaacgttttatgaattatga--aataatttccgctgcaaagtgtaagttatttggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatgt |
5311 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || || |||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5310 |
gatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataa--------ttgtttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
5235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0088 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:
Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 27747 - 27864
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt------ggttaaattattatttaactg---ttggattacg-t |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
27747 |
gtgccaaaacgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtt |
27846 |
T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27847 |
tctatgtgatatcccgtt |
27864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:
Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24660 - 24562
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24660 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattatgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
24562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0052
Description:
Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9649 - 9551
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9649 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattatgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
9551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 56071 - 55973
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgata |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
56071 |
tttccgctgcgatgtttaagatatttggttaaatcattatttaactgttttggattatgtt-tatgtgatatcccgttgtttacgatgcttactctgata |
55973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0585 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:
Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8741 - 8566
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
8741 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccactgcaaagtttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatgt |
8644 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatg |
207 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || || |||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8643 |
gatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataa--------ttgtttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttacatg |
8566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0249 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:
Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 161
Target Start/End: Original strand, 148 - 204
Alignment:
| Q |
106 |
ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
148 |
ttggattatgttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatgtt |
204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0229 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:
Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 12507 - 12624
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt------ggttaaattattatttaactg---ttggattacg-t |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
12507 |
gtgccaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagatatttgtgaaggttaaattatcatttaactgtttttggattacgtt |
12606 |
T |
 |
| Q |
117 |
tatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12607 |
tctatgtgatatcccgtt |
12624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0683 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:
Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8110 - 7937
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
8110 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataattttctctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatgt |
8013 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || || ||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8012 |
gatatcccgtttgtttatgctgtttactctgata-----tttgttt---aagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
7937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1618 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1618
Description:
Target: scaffold1618; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 135 - 280
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatccc-gttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
135 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccatttgtttatgttgtttactctgat |
234 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttacatgt |
208 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
235 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttacatgt |
280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1207
Description:
Target: scaffold1207; HSP #1
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
372 |
gtgccaaaacgttttatggattacgat-ataa-tttccactgcaatgttttagatgtttggttaaattattatttaactgttttggattatgttatatgt |
469 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgttgtt |
137 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||| |
|
|
| T |
470 |
gatacctcgttgtt |
483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0546 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:
Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 6974 - 7116
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
6974 |
tttccgctgcaatgtttaagttatttgattaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcctgtttgtttatgttgtttactctgat |
7073 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7074 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
7116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 1193
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
1301 |
gtgccaaaacgttttatggattatga-cataattttccgctgcaatg-ttaagttatttggttaaatttttatttaactggttttgattaagtttaatgt |
1204 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
1203 |
gatatcccgtt |
1193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0600 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:
Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 1519 - 1412
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
1519 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
1420 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
1419 |
taaatgtt |
1412 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 304793 - 304877
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| Q |
115 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
304793 |
gttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------ttttaagaaatttgtatattgggaaaacggggtgttaca |
304877 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
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Target: scaffold0498; HSP #1
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| Q |
83 |
ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
191 |
ttggttaaattgttatttaactgttttggattatgttaaatgtgatatcctgttgtttatgatgtttactctgataaatg |
270 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0043 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
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Target: scaffold0043; HSP #1
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| Q |
28 |
tgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
77874 |
tgccaaaaccttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtctaagttatttggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatgtg |
77971 |
T |
 |
| Q |
125 |
atatcccgtt--gttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || || |||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77972 |
atatcccgtttctttatgctgtttactctgataa--------ttgtttaagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
78046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0063 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:
Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 73332 - 73158
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatg |
122 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
73332 |
gtgccaaaaagatttatggattatgaa-ataattttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattggattacgttaaatg |
73234 |
T |
 |
| Q |
123 |
tgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| | || |||||||||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
73233 |
tgataccccattgtttaagttgtttactctgataa----ta-gttt---aagaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
73158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0232 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:
Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1323 - 1187
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
1323 |
gtgccaaaacgttttatggatgatga--aataatttccgctgcaatgtttaagatatttggttaaattgttatttaattggttttgattatgtta-atgt |
1227 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1226 |
gatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataattgtt |
1187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0205 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:
Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 68 - 186
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| Q |
27 |
gtgccaaaa-cgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-------ggttaaattattatttaactg--ttggattacg- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
68 |
gtgccaaaatcgttttacgaattatgattatgattttccgctgctatgttaaagataatttgtgaaggttaaatcattatttaactgttttggattacgt |
167 |
T |
 |
| Q |
116 |
ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
168 |
ttctatgtgatatcccgtt |
186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 100477 - 100304
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactgtt--ggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
100477 |
gtgccaaaacgatttatggattatga--agtaatttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaactgatctggattatgttaaatgt |
100380 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgtt--gttttgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
100379 |
gatatcccgtttatttatgctgtttactctgataaatgtttt--------agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
100304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 139085 - 138943
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatccc-gttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||||| || || |||||||| | |
|
|
| T |
139085 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattgttatttaactgatattggattatgttaaatgtcatatcccatttgtttatgttgtttactctggt |
138986 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138985 |
aaatg--------tttaagaaatttttatattgggaaaacggggtgttaca |
138943 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
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| Q |
115 |
gttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatg |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
168304 |
gttatatgtgatatcccgttgtttatgatgcttactctgataaatg |
168259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0193 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
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Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8792 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattggattatgttaaatgtgatatcccgtt |
8714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
33595 |
tttccgctgcattgtttaagtatttggttaaattggtatttaactgatattggattatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctgat |
33496 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
33495 |
aaatgtt |
33489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:
Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | | |||| |
|
|
| T |
15022 |
gtgccaaaacgttttatggattatgac-ataa-tttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactggttttgattaagcttaatgt |
14925 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccg-ttgttt-tgatgcttactctgataaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14924 |
gatatcccgtttgtttatgctgtttactctgataactgtt |
14885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
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Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1278 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataatttccgctgcaatgtttaagttatttggttaaattgttatttaactg |
1201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg---ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
138509 |
tttccgctgcaacgtttaagttatttggttaaattgttatttaactgttattggattacgttaaatgtaataccccgttgttt |
138591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0231 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:
Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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| Q |
106 |
ttggattacgttatatgtgatatcccgttgttt-tgatgcttactctgataaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttac |
204 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
644 |
ttggtttatgttttatgtgatacctcgttgtttatgatgcttactctgataaatg-------tttaaagaaat-tttatattgggaaaacggggtgttac |
735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0500 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:
Target: scaffold0500; HSP #1
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Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagatattg-gttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt--gttttgatgcttactctgat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || || || |||||||||| |
|
|
| T |
216 |
tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatatcccatttatttatgttgtttactctgat |
315 |
T |
 |
| Q |
155 |
aaatgtt |
161 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
316 |
aaatgtt |
322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0371 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:
Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14737 - 14630
Alignment:
| Q |
27 |
gtgccaaaacgttttatgaattatgattatgactttccgctgcaatgtttaagatatt-ggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
14737 |
gtgccaaaacgttttatggattatga--aataaattccgctgcaaagtttaagttatttggttaaattgttatttaactggttttgattatgtta-atgt |
14641 |
T |
 |
| Q |
124 |
gatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
14640 |
gatatcccgtt |
14630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 138
Target Start/End: Original strand, 46738 - 46796
Alignment:
| Q |
83 |
ttggttaaattattatttaactgtt---ggattacgttatatgtgatatcccgttgttt |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46738 |
ttggttaaattgttatttaactgttattggattatgttaaatgtgatatcccgttgttt |
46796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:
Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 6739 - 6882
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggatt-acgttatatgtgatatcccgtt-gttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
6739 |
tttccgctgcaacgtttaagttaatttgttaaatcgttatttaactgatttggatttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
6838 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6839 |
taaatgtttt--------agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
6882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 8729 - 8872
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggatt-acgttatatgtgatatcccgtt-gttt-tgatgcttactctga |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
8729 |
tttccgctgcaacgtttaagttaatttgttaaatcgttatttaactgatttggatttatgttaaatgtgatatcccgtttgtttatgttgtttactctga |
8828 |
T |
 |
| Q |
154 |
taaatgttatgtttttaaagaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8829 |
taaatgtttt--------agaaattttcatattgggaaaacggggtgttaca |
8872 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1424 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:
Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1822 - 1769
Alignment:
| Q |
83 |
ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1822 |
ttggttaaattgttatttaactggtttggattatgttaaatgtgatatcccgtt |
1769 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0510 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0510
Description:
Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 1482 - 1563
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactg--ttggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1482 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgttttggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
1563 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 25700 - 25777
Alignment:
| Q |
60 |
tttccgctgcaatgtttaagata-ttggttaaattattatttaactg--ttggattacgttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25700 |
tttccgctgcaacgtttaagttattttgttaaattgttatttaactgatttggattatgttaaatgtgatgtcccgtt |
25777 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1813 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1813
Description:
Target: scaffold1813; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 205
Target Start/End: Original strand, 101 - 134
Alignment:
| Q |
172 |
agaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
101 |
agaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
134 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0299 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:
Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5095 - 5066
Alignment:
| Q |
182 |
atattgggaaaacggggtgttacatgttcc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5095 |
atattgggaaaacggggtgttacatgttcc |
5066 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0672 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:
Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 4094 - 4176
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4094 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtatatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
4176 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0426 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:
Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15465 - 15383
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15465 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
15383 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37348 - 37266
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37348 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
37266 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0084 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:
Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 131
Target Start/End: Original strand, 38469 - 38519
Alignment:
| Q |
85 |
ggttaaattattatttaactg---ttggattacgtt-atatgtgatatccc |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38469 |
ggttaaattattatttaactgtttttggattacgttaatatgtgatatccc |
38519 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 77464 - 77546
Alignment:
| Q |
61 |
ttccgctgcaatgtttaagatattg-----gttaaattattatttaactgt---tggattacg-ttatatgtgatatcccgtt |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
77464 |
ttccgctgctatgttaaagatattgtgaaggttaaattattatttaactgtttatggattacgtttctatgtgatatcccgtt |
77546 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 205
Target Start/End: Original strand, 17878 - 17910
Alignment:
| Q |
173 |
gaaatgttgatattgggaaaacggggtgttaca |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17878 |
gaaattttgatattgggaaaacggggtgttaca |
17910 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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