View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18156_low_6 (Length: 677)

Name: NF18156_low_6
Description: NF18156
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18156_low_6
NF18156_low_6
[»] chr2 (89 HSPs)
chr2 (19-669)||(23877749-23878399)
chr2 (22-669)||(21907159-21907825)
chr2 (335-642)||(23102391-23102696)
chr2 (347-642)||(23089975-23090268)
chr2 (373-632)||(9241282-9241539)
chr2 (375-669)||(23263894-23264188)
chr2 (370-645)||(6482257-6482531)
chr2 (366-631)||(23169262-23169525)
chr2 (366-631)||(23580519-23580782)
chr2 (370-645)||(6485724-6485998)
chr2 (374-587)||(26582668-26582880)
chr2 (368-632)||(20260773-20261034)
chr2 (364-587)||(200634-200856)
chr2 (364-587)||(27367545-27367767)
chr2 (347-580)||(22809882-22810115)
chr2 (364-587)||(6744286-6744508)
chr2 (364-587)||(43693394-43693616)
chr2 (375-637)||(21073951-21074214)
chr2 (368-587)||(5706980-5707198)
chr2 (375-580)||(2105577-2105782)
chr2 (401-632)||(10685624-10685852)
chr2 (373-535)||(19703451-19703615)
chr2 (378-580)||(27295980-27296181)
chr2 (347-580)||(20724032-20724267)
chr2 (502-669)||(23269110-23269276)
chr2 (502-669)||(23275979-23276145)
chr2 (374-580)||(23290925-23291133)
chr2 (378-580)||(12572311-12572512)
chr2 (378-580)||(12578793-12578994)
chr2 (373-602)||(19649512-19649743)
chr2 (347-580)||(24943376-24943612)
chr2 (27-156)||(23062996-23063126)
chr2 (401-580)||(27785695-27785872)
chr2 (401-580)||(27790916-27791093)
chr2 (58-156)||(23264424-23264523)
chr2 (374-580)||(23752791-23752998)
chr2 (373-620)||(26884113-26884361)
chr2 (374-580)||(24658773-24658981)
chr2 (373-620)||(27210947-27211196)
chr2 (373-620)||(6261516-6261763)
chr2 (19-132)||(23089628-23089742)
chr2 (495-645)||(23062436-23062585)
chr2 (374-535)||(24652374-24652537)
chr2 (22-156)||(24660889-24661024)
chr2 (373-632)||(19662792-19663052)
chr2 (19-132)||(23102056-23102170)
chr2 (373-463)||(28971246-28971336)
chr2 (373-632)||(29280890-29281150)
chr2 (347-463)||(21133193-21133310)
chr2 (565-639)||(21124038-21124112)
chr2 (36-156)||(26884518-26884639)
chr2 (373-491)||(27208612-27208733)
chr2 (335-465)||(22796556-22796688)
chr2 (566-634)||(24660403-24660470)
chr2 (19-128)||(29281336-29281446)
chr2 (335-463)||(23062668-23062796)
chr2 (19-71)||(26583185-26583237)
chr2 (566-668)||(15643412-15643514)
chr2 (373-620)||(9482-9731)
chr2 (25-87)||(5706696-5706758)
chr2 (19-128)||(25181506-25181615)
chr2 (493-602)||(21133345-21133453)
chr2 (19-67)||(9978-10026)
chr2 (579-639)||(17633763-17633823)
chr2 (373-535)||(25181800-25181966)
chr2 (493-587)||(28971371-28971463)
chr2 (566-646)||(32911606-32911685)
chr2 (374-463)||(20648191-20648282)
chr2 (374-463)||(25267321-25267412)
chr2 (493-646)||(38931652-38931803)
chr2 (495-644)||(45028446-45028590)
chr2 (335-463)||(22860421-22860550)
chr2 (599-646)||(6744532-6744580)
chr2 (608-648)||(22840804-22840844)
chr2 (493-646)||(25590256-25590402)
chr2 (22-124)||(27208319-27208422)
chr2 (22-124)||(27210654-27210757)
chr2 (374-463)||(8889935-8890026)
chr2 (596-639)||(24528348-24528391)
chr2 (588-646)||(8890163-8890221)
chr2 (588-646)||(23672360-23672418)
chr2 (588-646)||(25267126-25267184)
chr2 (523-580)||(22703489-22703545)
chr2 (373-417)||(24660629-24660674)
chr2 (599-646)||(11465994-11466042)
chr2 (566-642)||(13101297-13101372)
chr2 (599-646)||(19649753-19649801)
chr2 (596-648)||(20914534-20914585)
chr2 (374-417)||(25107437-25107481)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (19-657)||(14057219-14057860)
chr8 (19-354)||(25111101-25111437)
chr8 (370-645)||(44476172-44476446)
chr8 (370-645)||(44479434-44479708)
chr8 (386-669)||(18609704-18609987)
chr8 (350-602)||(23825102-23825353)
chr8 (336-587)||(17053590-17053840)
chr8 (364-587)||(23865427-23865649)
chr8 (368-587)||(19902894-19903112)
chr8 (350-587)||(30766897-30767133)
chr8 (347-580)||(22025528-22025762)
chr8 (402-631)||(25409503-25409731)
chr8 (347-545)||(22063531-22063731)
chr8 (350-510)||(25110911-25111071)
chr8 (371-580)||(41009426-41009637)
chr8 (373-587)||(21282051-21282266)
chr8 (373-535)||(21668901-21669064)
chr8 (378-580)||(9273159-9273360)
chr8 (375-580)||(22177586-22177790)
chr8 (375-580)||(22050201-22050405)
chr8 (374-580)||(21326818-21327027)
chr8 (27-156)||(18613534-18613663)
chr8 (378-580)||(1804467-1804668)
chr8 (378-580)||(36799376-36799577)
chr8 (374-580)||(21322230-21322439)
chr8 (347-580)||(10606931-10607168)
chr8 (375-580)||(22055719-22055923)
chr8 (401-580)||(18681526-18681703)
chr8 (401-580)||(31567835-31568012)
chr8 (401-580)||(31573056-31573233)
chr8 (493-646)||(23653079-23653230)
chr8 (347-580)||(20973966-20974201)
chr8 (375-489)||(21300114-21300229)
chr8 (374-580)||(19988159-19988367)
chr8 (336-632)||(8728943-8729240)
chr8 (347-451)||(22176003-22176105)
chr8 (493-646)||(23653773-23653924)
chr8 (373-620)||(24321570-24321819)
chr8 (576-668)||(21930525-21930618)
chr8 (453-632)||(27942223-27942401)
chr8 (384-632)||(8596070-8596318)
chr8 (493-637)||(39363417-39363565)
chr8 (335-463)||(21683620-21683749)
chr8 (335-463)||(21687969-21688098)
chr8 (596-668)||(21839390-21839463)
chr8 (553-629)||(25110821-25110896)
chr8 (597-647)||(20012406-20012456)
chr8 (373-459)||(31412477-31412563)
chr8 (373-459)||(31418659-31418745)
chr8 (374-511)||(20839893-20840032)
chr8 (19-70)||(24321276-24321327)
chr8 (27-156)||(21931031-21931161)
chr8 (373-463)||(19859627-19859719)
chr8 (596-648)||(22743629-22743681)
chr8 (374-463)||(21690400-21690491)
chr8 (374-463)||(36445719-36445810)
chr8 (588-646)||(21686300-21686358)
chr8 (497-587)||(31412606-31412695)
chr8 (497-587)||(31418788-31418877)
chr8 (19-71)||(23865950-23866002)
chr8 (374-463)||(20783840-20783931)
chr8 (27-93)||(21839798-21839865)
chr8 (373-463)||(16259633-16259726)
chr8 (588-646)||(21683875-21683933)
chr8 (588-646)||(21688224-21688282)
chr8 (588-646)||(21690624-21690682)
chr8 (566-643)||(14416689-14416765)
chr8 (608-645)||(22522104-22522141)
chr8 (599-646)||(3697566-3697614)
chr8 (608-648)||(15267017-15267057)
chr8 (599-646)||(30767157-30767205)
chr8 (566-646)||(43687337-43687414)
[»] chr1 (79 HSPs)
chr1 (68-649)||(19663794-19664375)
chr1 (373-587)||(20438502-20438716)
chr1 (22-331)||(18711883-18712196)
chr1 (350-587)||(42095851-42096087)
chr1 (364-587)||(21542049-21542271)
chr1 (347-581)||(20045824-20046057)
chr1 (373-587)||(41110807-41111021)
chr1 (336-580)||(32650102-32650345)
chr1 (347-535)||(29554387-29554578)
chr1 (378-580)||(27280192-27280393)
chr1 (373-514)||(20242599-20242740)
chr1 (375-543)||(23066673-23066842)
chr1 (347-580)||(3706707-3706939)
chr1 (374-580)||(19778430-19778639)
chr1 (347-580)||(19961135-19961370)
chr1 (374-580)||(20941826-20942034)
chr1 (374-580)||(16883510-16883719)
chr1 (376-515)||(20838140-20838280)
chr1 (375-580)||(22448241-22448440)
chr1 (374-489)||(20824329-20824445)
chr1 (347-465)||(955010-955128)
chr1 (58-156)||(11157454-11157553)
chr1 (555-647)||(21987118-21987210)
chr1 (347-463)||(24108965-24109082)
chr1 (493-646)||(36614870-36615018)
chr1 (373-620)||(16371497-16371746)
chr1 (373-620)||(20852033-20852282)
chr1 (373-620)||(20858659-20858908)
chr1 (374-488)||(21732569-21732683)
chr1 (374-463)||(19666701-19666791)
chr1 (373-620)||(21705182-21705431)
chr1 (493-637)||(11156904-11157047)
chr1 (493-646)||(23195568-23195732)
chr1 (374-463)||(21664280-21664370)
chr1 (27-156)||(22030361-22030491)
chr1 (493-646)||(43088326-43088474)
chr1 (347-463)||(15316447-15316565)
chr1 (374-463)||(19853151-19853241)
chr1 (374-463)||(19859286-19859376)
chr1 (36-136)||(19961521-19961622)
chr1 (596-648)||(20108731-20108783)
chr1 (566-646)||(20848958-20849037)
chr1 (374-602)||(23195443-23195675)
chr1 (19-70)||(20851738-20851789)
chr1 (19-70)||(20858365-20858416)
chr1 (19-70)||(21705674-21705725)
chr1 (19-70)||(21710217-21710268)
chr1 (493-668)||(49327945-49328115)
chr1 (370-463)||(20086446-20086540)
chr1 (493-587)||(24079544-24079637)
chr1 (347-463)||(24079672-24079790)
chr1 (493-587)||(24109117-24109210)
chr1 (25-71)||(41111277-41111323)
chr1 (335-463)||(11157127-11157255)
chr1 (579-639)||(7792987-7793047)
chr1 (588-648)||(31927611-31927671)
chr1 (596-648)||(41312073-41312125)
chr1 (493-646)||(47484043-47484189)
chr1 (576-639)||(5380635-5380698)
chr1 (608-647)||(8682877-8682916)
chr1 (597-648)||(24959826-24959877)
chr1 (439-489)||(29535019-29535070)
chr1 (564-634)||(16669433-16669502)
chr1 (588-646)||(23712403-23712461)
chr1 (597-647)||(25092578-25092628)
chr1 (477-580)||(955116-955219)
chr1 (373-463)||(11140970-11141062)
chr1 (579-639)||(21734641-21734701)
chr1 (579-639)||(21745846-21745906)
chr1 (599-646)||(42096111-42096159)
chr1 (374-463)||(21410644-21410735)
chr1 (608-647)||(21529035-21529074)
chr1 (607-646)||(21698062-21698101)
chr1 (599-646)||(24850021-24850068)
chr1 (610-648)||(24475215-24475253)
chr1 (588-646)||(30491622-30491680)
chr1 (374-417)||(20849192-20849236)
chr1 (607-646)||(21541977-21542017)
chr1 (371-399)||(21698280-21698308)
[»] chr7 (143 HSPs)
chr7 (19-649)||(11389942-11390571)
chr7 (19-640)||(11383454-11384074)
chr7 (179-642)||(20328024-20328487)
chr7 (373-649)||(16676124-16676398)
chr7 (373-649)||(17650361-17650634)
chr7 (350-669)||(21231981-21232298)
chr7 (373-645)||(18606801-18607072)
chr7 (373-587)||(13006299-13006513)
chr7 (373-632)||(14421303-14421561)
chr7 (22-337)||(21231594-21231910)
chr7 (368-632)||(11302801-11303062)
chr7 (376-632)||(23665802-23666055)
chr7 (368-587)||(13123937-13124155)
chr7 (364-587)||(4279956-4280178)
chr7 (364-587)||(19616288-19616510)
chr7 (347-587)||(12591580-12591819)
chr7 (376-632)||(29795679-29795932)
chr7 (376-632)||(29799498-29799751)
chr7 (368-587)||(12710866-12711084)
chr7 (368-587)||(13742498-13742716)
chr7 (336-580)||(6411821-6412065)
chr7 (347-580)||(14281589-14281822)
chr7 (375-580)||(35962709-35962914)
chr7 (371-580)||(11220079-11220290)
chr7 (375-580)||(15338826-15339030)
chr7 (375-580)||(15723188-15723392)
chr7 (373-580)||(1612623-1612830)
chr7 (375-578)||(19599844-19600046)
chr7 (19-158)||(20311657-20311796)
chr7 (378-580)||(23201479-23201679)
chr7 (378-580)||(23507606-23507806)
chr7 (375-580)||(15710964-15711168)
chr7 (379-580)||(16109044-16109243)
chr7 (376-580)||(14431989-14432192)
chr7 (378-580)||(806973-807174)
chr7 (373-632)||(147016-147277)
chr7 (401-580)||(11631940-11632117)
chr7 (401-580)||(18049230-18049407)
chr7 (401-580)||(18055709-18055886)
chr7 (401-580)||(20579941-20580118)
chr7 (347-632)||(31154316-31154600)
chr7 (27-132)||(13678799-13678905)
chr7 (19-132)||(16676660-16676774)
chr7 (19-132)||(17650896-17651010)
chr7 (373-535)||(3289749-3289911)
chr7 (373-620)||(14320533-14320782)
chr7 (376-507)||(14128244-14128374)
chr7 (376-465)||(36306032-36306121)
chr7 (373-620)||(14565668-14565917)
chr7 (555-648)||(19145498-19145591)
chr7 (555-648)||(20744897-20744990)
chr7 (373-632)||(18871815-18872075)
chr7 (495-645)||(13678217-13678366)
chr7 (347-463)||(18958367-18958484)
chr7 (373-632)||(15166723-15166984)
chr7 (373-620)||(20907328-20907577)
chr7 (27-156)||(46625272-46625402)
chr7 (373-632)||(3858324-3858583)
chr7 (555-639)||(14266155-14266239)
chr7 (373-620)||(2965891-2966140)
chr7 (373-463)||(37244273-37244363)
chr7 (347-463)||(15085861-15085978)
chr7 (555-648)||(19151800-19151893)
chr7 (555-648)||(20751199-20751292)
chr7 (347-463)||(26289706-26289823)
chr7 (555-639)||(14255879-14255963)
chr7 (347-463)||(14178947-14179065)
chr7 (373-620)||(16008044-16008293)
chr7 (373-632)||(2464262-2464521)
chr7 (567-639)||(46624783-46624855)
chr7 (347-461)||(16952175-16952290)
chr7 (373-465)||(832950-833043)
chr7 (373-465)||(1198130-1198223)
chr7 (335-489)||(16187655-16187810)
chr7 (347-463)||(3327920-3328038)
chr7 (597-647)||(41783304-41783354)
chr7 (373-461)||(836993-837082)
chr7 (373-461)||(1202173-1202262)
chr7 (25-86)||(12591316-12591377)
chr7 (19-87)||(13743029-13743097)
chr7 (19-146)||(16090407-16090535)
chr7 (374-465)||(14945836-14945928)
chr7 (493-587)||(15086013-15086105)
chr7 (374-465)||(15373429-15373521)
chr7 (493-602)||(3327778-3327885)
chr7 (493-602)||(32771473-32771580)
chr7 (25-71)||(13006769-13006815)
chr7 (580-649)||(11312224-11312293)
chr7 (19-146)||(29181714-29181842)
chr7 (608-648)||(12202268-12202308)
chr7 (347-399)||(14169473-14169525)
chr7 (22-128)||(14320240-14320347)
chr7 (608-648)||(15689766-15689806)
chr7 (608-648)||(15697359-15697399)
chr7 (608-648)||(15704339-15704379)
chr7 (564-620)||(16089981-16090037)
chr7 (579-639)||(16575613-16575673)
chr7 (579-639)||(16589989-16590049)
chr7 (564-620)||(29182212-29182268)
chr7 (477-587)||(36306109-36306220)
chr7 (495-587)||(37244400-37244491)
chr7 (608-647)||(12208882-12208921)
chr7 (597-648)||(14348509-14348560)
chr7 (597-648)||(16668748-16668799)
chr7 (600-639)||(23442194-23442233)
chr7 (374-463)||(46682157-46682248)
chr7 (349-399)||(12547358-12547408)
chr7 (493-587)||(18958519-18958612)
chr7 (493-644)||(19439249-19439394)
chr7 (597-647)||(42041238-42041288)
chr7 (588-646)||(45185384-45185442)
chr7 (580-637)||(11308928-11308985)
chr7 (596-645)||(12694515-12694564)
chr7 (335-463)||(13678447-13678575)
chr7 (477-580)||(14945916-14946020)
chr7 (477-580)||(15373509-15373613)
chr7 (610-647)||(17643131-17643168)
chr7 (19-71)||(12710511-12710563)
chr7 (19-71)||(13123582-13123634)
chr7 (608-648)||(21519484-21519524)
chr7 (19-70)||(2464763-2464814)
chr7 (19-70)||(3858031-3858082)
chr7 (373-620)||(10897152-10897400)
chr7 (374-463)||(15104307-15104398)
chr7 (493-646)||(15104434-15104585)
chr7 (493-586)||(16952327-16952418)
chr7 (588-646)||(12547098-12547156)
chr7 (566-644)||(13019645-13019722)
chr7 (596-646)||(16476334-16476384)
chr7 (374-427)||(46348719-46348773)
chr7 (370-399)||(15142385-15142414)
chr7 (495-535)||(26289860-26289898)
chr7 (569-646)||(30271898-30271972)
chr7 (373-417)||(46625014-46625059)
chr7 (607-646)||(4279884-4279924)
chr7 (374-417)||(11857669-11857713)
chr7 (371-399)||(14581412-14581440)
chr7 (373-420)||(16090190-16090238)
chr7 (607-646)||(19616216-19616256)
chr7 (373-420)||(29182011-29182059)
chr7 (93-125)||(31154735-31154767)
chr7 (607-646)||(32771389-32771429)
chr7 (370-398)||(41783042-41783070)
[»] chr6 (113 HSPs)
chr6 (58-669)||(24513457-24514093)
chr6 (335-642)||(21566120-21566425)
chr6 (368-632)||(12941749-12942010)
chr6 (368-631)||(29615165-29615426)
chr6 (373-587)||(12167230-12167444)
chr6 (373-587)||(19286139-19286353)
chr6 (373-587)||(19877323-19877537)
chr6 (373-587)||(19883099-19883313)
chr6 (335-587)||(19786805-19787057)
chr6 (376-632)||(28290182-28290435)
chr6 (364-587)||(24562275-24562497)
chr6 (356-587)||(25470645-25470875)
chr6 (373-581)||(23837579-23837787)
chr6 (368-587)||(34647618-34647836)
chr6 (368-587)||(34640944-34641162)
chr6 (347-499)||(18788439-18788591)
chr6 (347-499)||(18799419-18799571)
chr6 (375-580)||(19726606-19726810)
chr6 (347-576)||(22906969-22907198)
chr6 (347-580)||(19588525-19588760)
chr6 (58-337)||(9186621-9186902)
chr6 (373-500)||(19439782-19439909)
chr6 (378-580)||(33682180-33682380)
chr6 (375-582)||(1592757-1592963)
chr6 (347-580)||(14375253-14375489)
chr6 (347-537)||(8760370-8760562)
chr6 (375-545)||(937655-937825)
chr6 (347-506)||(11289547-11289705)
chr6 (373-648)||(29416435-29416718)
chr6 (401-580)||(23835057-23835234)
chr6 (374-580)||(2708368-2708577)
chr6 (401-580)||(14033142-14033319)
chr6 (347-580)||(19300611-19300846)
chr6 (378-580)||(28359831-28360032)
chr6 (347-535)||(14724409-14724600)
chr6 (347-632)||(15457414-15457697)
chr6 (347-632)||(15464009-15464292)
chr6 (347-513)||(14616213-14616382)
chr6 (378-580)||(27562514-27562715)
chr6 (19-156)||(18799762-18799900)
chr6 (374-580)||(19818899-19819106)
chr6 (347-489)||(8768117-8768260)
chr6 (19-132)||(21565785-21565899)
chr6 (375-545)||(21724733-21724903)
chr6 (347-605)||(31251344-31251604)
chr6 (336-535)||(14995882-14996084)
chr6 (22-156)||(19471943-19472077)
chr6 (372-580)||(14581825-14582034)
chr6 (493-646)||(18785996-18786148)
chr6 (347-463)||(23234869-23234986)
chr6 (373-632)||(4476314-4476574)
chr6 (373-632)||(21365435-21365695)
chr6 (373-632)||(23969417-23969677)
chr6 (576-648)||(25749639-25749711)
chr6 (493-669)||(19472418-19472596)
chr6 (539-649)||(18799318-18799425)
chr6 (335-463)||(17414114-17414242)
chr6 (493-640)||(25395940-25396086)
chr6 (493-646)||(23021420-23021568)
chr6 (539-649)||(18788338-18788445)
chr6 (27-156)||(25396496-25396626)
chr6 (373-463)||(26418633-26418723)
chr6 (588-648)||(23105117-23105177)
chr6 (373-620)||(20008847-20009097)
chr6 (347-463)||(10582781-10582899)
chr6 (36-136)||(19300359-19300460)
chr6 (374-463)||(23233377-23233467)
chr6 (25-87)||(34640661-34640723)
chr6 (25-87)||(34647335-34647397)
chr6 (19-87)||(29614814-29614882)
chr6 (336-463)||(5290073-5290200)
chr6 (597-648)||(22346491-22346542)
chr6 (597-648)||(29265387-29265438)
chr6 (25-71)||(12167700-12167746)
chr6 (25-71)||(19286609-19286655)
chr6 (25-71)||(19786541-19786587)
chr6 (25-71)||(19877793-19877839)
chr6 (25-71)||(19883569-19883615)
chr6 (542-587)||(11283984-11284029)
chr6 (335-463)||(19451403-19451531)
chr6 (493-632)||(25347031-25347167)
chr6 (566-646)||(12447336-12447415)
chr6 (566-646)||(17894661-17894740)
chr6 (564-620)||(20011100-20011156)
chr6 (493-587)||(5290235-5290326)
chr6 (608-647)||(18137381-18137420)
chr6 (19-70)||(20008553-20008604)
chr6 (374-427)||(19467977-19468031)
chr6 (493-581)||(23235021-23235107)
chr6 (335-463)||(25396121-25396250)
chr6 (25-87)||(25470376-25470438)
chr6 (493-587)||(26418758-26418851)
chr6 (495-646)||(17207811-17207956)
chr6 (520-620)||(31250252-31250350)
chr6 (564-632)||(9100170-9100236)
chr6 (373-427)||(19472292-19472348)
chr6 (597-649)||(21469625-21469677)
chr6 (564-632)||(29096755-29096821)
chr6 (36-125)||(11289294-11289384)
chr6 (19-70)||(21365144-21365195)
chr6 (19-70)||(23969126-23969177)
chr6 (374-463)||(24720716-24720807)
chr6 (596-646)||(18316178-18316228)
chr6 (588-646)||(22798703-22798761)
chr6 (596-646)||(24412487-24412537)
chr6 (347-399)||(14132983-14133036)
chr6 (563-632)||(25634097-25634165)
chr6 (373-420)||(9099971-9100019)
chr6 (597-649)||(21476165-21476217)
chr6 (599-646)||(23235137-23235185)
chr6 (607-646)||(24562203-24562243)
chr6 (607-639)||(25772524-25772556)
chr6 (373-420)||(29096972-29097020)
[»] chr3 (142 HSPs)
chr3 (335-649)||(17156993-17157305)
chr3 (335-649)||(16802382-16802694)
chr3 (335-649)||(24191694-24192006)
chr3 (110-645)||(18888901-18889456)
chr3 (336-648)||(23174091-23174399)
chr3 (358-587)||(41456103-41456332)
chr3 (375-665)||(17243651-17243942)
chr3 (49-337)||(17243260-17243549)
chr3 (364-646)||(24123165-24123445)
chr3 (373-587)||(9532842-9533056)
chr3 (339-645)||(18899940-18900248)
chr3 (368-632)||(12304698-12304959)
chr3 (364-587)||(13968795-13969017)
chr3 (364-587)||(13974270-13974492)
chr3 (423-649)||(17190768-17190992)
chr3 (364-587)||(14084524-14084746)
chr3 (364-587)||(14089925-14090147)
chr3 (364-587)||(49399466-49399688)
chr3 (364-587)||(8583256-8583478)
chr3 (378-580)||(12200203-12200403)
chr3 (375-580)||(14544163-14544368)
chr3 (374-649)||(18913937-18914213)
chr3 (375-580)||(14652688-14652892)
chr3 (347-580)||(12961345-12961580)
chr3 (373-577)||(14292706-14292911)
chr3 (373-587)||(31690565-31690781)
chr3 (378-580)||(13909529-13909728)
chr3 (378-580)||(13939988-13940187)
chr3 (375-580)||(13203511-13203715)
chr3 (375-580)||(16382852-16383056)
chr3 (373-648)||(34852178-34852451)
chr3 (376-580)||(16838475-16838677)
chr3 (373-587)||(31943434-31943650)
chr3 (378-580)||(13946474-13946673)
chr3 (19-226)||(24192134-24192342)
chr3 (401-580)||(8742909-8743086)
chr3 (401-580)||(8761079-8761256)
chr3 (373-537)||(17199010-17199175)
chr3 (401-580)||(4677164-4677341)
chr3 (401-580)||(41175477-41175654)
chr3 (401-580)||(41180615-41180792)
chr3 (357-580)||(19443469-19443696)
chr3 (374-632)||(38312118-38312378)
chr3 (367-580)||(11964865-11965080)
chr3 (401-580)||(44775201-44775378)
chr3 (401-580)||(44780385-44780562)
chr3 (347-580)||(18719077-18719312)
chr3 (337-465)||(23173876-23174004)
chr3 (371-561)||(13303228-13303422)
chr3 (372-516)||(13313905-13314051)
chr3 (30-131)||(18914451-18914553)
chr3 (376-489)||(16829952-16830065)
chr3 (110-247)||(18892548-18892683)
chr3 (19-133)||(16802061-16802176)
chr3 (374-515)||(18129772-18129915)
chr3 (372-516)||(13324817-13324963)
chr3 (20-132)||(55499721-55499834)
chr3 (347-489)||(12255215-12255358)
chr3 (374-535)||(18136286-18136448)
chr3 (335-489)||(12479637-12479791)
chr3 (373-463)||(10597701-10597791)
chr3 (373-632)||(23371844-23372104)
chr3 (74-217)||(17157443-17157587)
chr3 (373-632)||(14764098-14764358)
chr3 (373-632)||(51300051-51300311)
chr3 (454-580)||(12363445-12363572)
chr3 (576-648)||(42109046-42109118)
chr3 (493-668)||(8374009-8374179)
chr3 (335-489)||(12362451-12362605)
chr3 (373-463)||(18756930-18757020)
chr3 (378-489)||(12355944-12356056)
chr3 (374-484)||(15518591-15518703)
chr3 (477-580)||(23173786-23173888)
chr3 (493-668)||(30596943-30597113)
chr3 (439-636)||(10553818-10554014)
chr3 (373-620)||(20249104-20249353)
chr3 (373-634)||(10390365-10390627)
chr3 (373-634)||(10415474-10415736)
chr3 (373-634)||(10422144-10422406)
chr3 (450-580)||(16830050-16830178)
chr3 (373-463)||(17496239-17496330)
chr3 (373-620)||(12034315-12034564)
chr3 (347-463)||(12419511-12419629)
chr3 (576-638)||(14289150-14289212)
chr3 (25-87)||(41455772-41455834)
chr3 (375-463)||(11305740-11305829)
chr3 (22-149)||(13324397-13324525)
chr3 (336-463)||(11850594-11850721)
chr3 (597-648)||(9785-9836)
chr3 (520-587)||(11850781-11850847)
chr3 (354-463)||(13692040-13692151)
chr3 (566-632)||(3802486-3802551)
chr3 (19-146)||(14865166-14865295)
chr3 (610-648)||(15012240-15012278)
chr3 (493-637)||(17512473-17512624)
chr3 (275-337)||(18900266-18900330)
chr3 (580-637)||(46723597-46723654)
chr3 (564-620)||(17130657-17130713)
chr3 (493-602)||(10597826-10597933)
chr3 (374-463)||(11644786-11644877)
chr3 (608-647)||(15232021-15232060)
chr3 (608-647)||(15237889-15237928)
chr3 (336-399)||(17512726-17512788)
chr3 (335-463)||(12152971-12153100)
chr3 (76-149)||(13313539-13313613)
chr3 (373-463)||(2270227-2270319)
chr3 (599-646)||(8583502-8583550)
chr3 (493-587)||(12419384-12419476)
chr3 (596-648)||(13037185-13037237)
chr3 (579-639)||(13342652-13342712)
chr3 (599-646)||(13969069-13969117)
chr3 (599-646)||(13974544-13974592)
chr3 (564-620)||(14864748-14864804)
chr3 (566-646)||(15374615-15374694)
chr3 (493-668)||(16331678-16331846)
chr3 (564-632)||(19236167-19236233)
chr3 (596-648)||(24284653-24284705)
chr3 (493-646)||(49163087-49163232)
chr3 (566-646)||(54519977-54520056)
chr3 (78-125)||(12034078-12034125)
chr3 (347-401)||(12255748-12255803)
chr3 (608-647)||(12856165-12856204)
chr3 (591-646)||(14569724-14569779)
chr3 (566-668)||(32388169-32388271)
chr3 (596-639)||(35984627-35984670)
chr3 (599-646)||(48774816-48774863)
chr3 (76-149)||(13302863-13302937)
chr3 (588-646)||(15935185-15935243)
chr3 (588-646)||(16823937-16823995)
chr3 (596-646)||(16833153-16833202)
chr3 (78-128)||(17131091-17131141)
chr3 (493-587)||(18757055-18757148)
chr3 (36-70)||(24192544-24192578)
chr3 (566-632)||(29545315-29545380)
chr3 (607-646)||(14084452-14084492)
chr3 (607-646)||(14089853-14089893)
chr3 (607-646)||(14648384-14648424)
chr3 (373-420)||(14864949-14864997)
chr3 (566-646)||(18957698-18957777)
chr3 (373-420)||(19235968-19236016)
chr3 (607-646)||(20187587-20187627)
chr3 (607-646)||(49399394-49399434)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (250-649)||(14-412)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (335-642)||(4551-4856)
scaffold0077 (374-580)||(23767-23975)
scaffold0077 (374-580)||(18136-18344)
scaffold0077 (19-132)||(4215-4329)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (335-649)||(4232-4544)
scaffold0476 (6-132)||(3885-4011)
[»] chr4 (85 HSPs)
chr4 (373-645)||(18212074-18212344)
chr4 (347-649)||(15406843-15407144)
chr4 (347-631)||(11847003-11847285)
chr4 (368-632)||(15533735-15533996)
chr4 (368-587)||(8046863-8047081)
chr4 (347-658)||(14485432-14485745)
chr4 (20-239)||(15407319-15407536)
chr4 (347-577)||(14484432-14484662)
chr4 (378-580)||(635739-635940)
chr4 (347-580)||(16156630-16156867)
chr4 (373-648)||(4831057-4831330)
chr4 (373-648)||(4834352-4834625)
chr4 (375-580)||(23121599-23121804)
chr4 (347-585)||(11171202-11171440)
chr4 (347-545)||(17000111-17000310)
chr4 (336-632)||(14910534-14910831)
chr4 (347-535)||(15324919-15325108)
chr4 (375-580)||(43284868-43285072)
chr4 (376-580)||(20940260-20940463)
chr4 (373-537)||(26077681-26077847)
chr4 (368-560)||(14048218-14048414)
chr4 (374-580)||(14556050-14556260)
chr4 (401-580)||(53748750-53748927)
chr4 (375-580)||(14062908-14063116)
chr4 (401-580)||(41799951-41800128)
chr4 (401-580)||(42701226-42701403)
chr4 (401-580)||(51602072-51602249)
chr4 (401-580)||(51607953-51608130)
chr4 (374-580)||(41529054-41529263)
chr4 (347-545)||(1651000-1651203)
chr4 (373-580)||(2585138-2585346)
chr4 (347-545)||(27905244-27905446)
chr4 (407-580)||(16152484-16152661)
chr4 (500-669)||(10977120-10977289)
chr4 (27-156)||(13887097-13887227)
chr4 (27-156)||(13887954-13888084)
chr4 (357-580)||(40908583-40908809)
chr4 (27-134)||(15307453-15307562)
chr4 (347-459)||(37881521-37881634)
chr4 (452-580)||(16221226-16221356)
chr4 (439-535)||(14048121-14048219)
chr4 (347-463)||(13453847-13453964)
chr4 (566-639)||(14821297-14821370)
chr4 (566-634)||(13886612-13886680)
chr4 (566-669)||(15306909-15307015)
chr4 (497-602)||(13452204-13452307)
chr4 (493-669)||(15244007-15244185)
chr4 (373-489)||(30146857-30146975)
chr4 (19-146)||(16147436-16147564)
chr4 (588-648)||(15546494-15546554)
chr4 (596-648)||(27849673-27849725)
chr4 (373-433)||(49051081-49051141)
chr4 (36-133)||(11847439-11847537)
chr4 (493-646)||(46044920-46045068)
chr4 (27-156)||(8834198-8834327)
chr4 (580-630)||(22726056-22726106)
chr4 (25-87)||(53483023-53483085)
chr4 (603-648)||(13444135-13444180)
chr4 (27-90)||(14486049-14486112)
chr4 (27-128)||(15244554-15244657)
chr4 (564-620)||(16147934-16147990)
chr4 (566-646)||(20889260-20889339)
chr4 (374-463)||(12931958-12932049)
chr4 (347-417)||(17176528-17176599)
chr4 (566-632)||(36037462-36037527)
chr4 (607-648)||(30237673-30237714)
chr4 (566-646)||(20894879-20894958)
chr4 (566-646)||(31664945-31665024)
chr4 (566-646)||(41404825-41404904)
chr4 (566-646)||(42220317-42220396)
chr4 (566-646)||(49548702-49548781)
chr4 (373-463)||(53905283-53905375)
chr4 (608-647)||(15318015-15318054)
chr4 (588-646)||(13899812-13899870)
chr4 (610-648)||(15075187-15075225)
chr4 (588-646)||(18261226-18261284)
chr4 (588-646)||(18271191-18271249)
chr4 (607-646)||(13452121-13452161)
chr4 (374-417)||(15360792-15360836)
chr4 (373-420)||(16147733-16147781)
chr4 (347-399)||(18166228-18166280)
chr4 (335-399)||(18261483-18261546)
chr4 (335-399)||(18271448-18271511)
chr4 (566-646)||(33096979-33097058)
chr4 (566-646)||(33221256-33221334)
[»] scaffold0025 (6 HSPs)
scaffold0025 (335-649)||(15389-15701)
scaffold0025 (347-515)||(71154-71322)
scaffold0025 (19-226)||(15053-15261)
scaffold0025 (566-646)||(76649-76728)
scaffold0025 (373-462)||(76837-76928)
scaffold0025 (36-70)||(14828-14862)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (373-645)||(10229-10499)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (335-631)||(10150-10443)
scaffold0247 (19-156)||(10623-10761)
[»] scaffold0124 (8 HSPs)
scaffold0124 (336-632)||(36751-37045)
scaffold0124 (439-665)||(44054-44280)
scaffold0124 (138-489)||(43708-44080)
scaffold0124 (22-93)||(34935-35006)
scaffold0124 (414-531)||(40549-40664)
scaffold0124 (347-463)||(9344-9463)
scaffold0124 (374-463)||(45014-45105)
scaffold0124 (535-580)||(8493-8538)
[»] chr5 (101 HSPs)
chr5 (364-649)||(22439687-22439970)
chr5 (370-645)||(19510935-19511209)
chr5 (347-587)||(1857448-1857687)
chr5 (347-587)||(21675416-21675655)
chr5 (368-632)||(37805282-37805543)
chr5 (373-587)||(23527441-23527656)
chr5 (376-632)||(9775416-9775669)
chr5 (339-632)||(23112673-23112965)
chr5 (22-314)||(18408550-18408843)
chr5 (347-580)||(20937594-20937827)
chr5 (347-580)||(22312773-22313005)
chr5 (375-580)||(758224-758427)
chr5 (378-580)||(17264770-17264971)
chr5 (378-580)||(22175014-22175216)
chr5 (378-580)||(17271252-17271453)
chr5 (347-580)||(22007865-22008102)
chr5 (375-545)||(22509142-22509312)
chr5 (373-648)||(23538736-23539009)
chr5 (374-632)||(34828977-34829236)
chr5 (378-580)||(21678242-21678443)
chr5 (373-648)||(10816709-10816982)
chr5 (347-511)||(6728201-6728368)
chr5 (374-580)||(6404465-6404673)
chr5 (373-632)||(28371393-28371653)
chr5 (373-632)||(38145722-38145980)
chr5 (337-580)||(22232569-22232813)
chr5 (493-669)||(18409124-18409299)
chr5 (373-632)||(42960031-42960289)
chr5 (373-632)||(22336056-22336316)
chr5 (373-632)||(22339594-22339854)
chr5 (373-485)||(18408968-18409081)
chr5 (373-632)||(22749702-22749963)
chr5 (493-646)||(19801961-19802109)
chr5 (373-620)||(19235807-19236056)
chr5 (374-463)||(21829622-21829712)
chr5 (373-620)||(22466686-22466935)
chr5 (347-463)||(20843263-20843381)
chr5 (596-669)||(21574219-21574292)
chr5 (373-634)||(20819078-20819339)
chr5 (373-634)||(20826178-20826439)
chr5 (493-587)||(27635969-27636061)
chr5 (493-646)||(19362533-19362681)
chr5 (493-668)||(24057512-24057682)
chr5 (373-620)||(22460062-22460311)
chr5 (373-463)||(27635844-27635934)
chr5 (596-648)||(10035042-10035094)
chr5 (579-639)||(21494871-21494931)
chr5 (336-463)||(24668923-24669050)
chr5 (336-463)||(24738692-24738819)
chr5 (336-463)||(24751461-24751588)
chr5 (19-70)||(19236299-19236350)
chr5 (58-132)||(22439361-22439436)
chr5 (19-70)||(22460555-22460606)
chr5 (493-646)||(23081815-23081963)
chr5 (520-587)||(24751648-24751714)
chr5 (597-648)||(25013521-25013572)
chr5 (347-463)||(427337-427455)
chr5 (25-71)||(23527967-23528013)
chr5 (580-637)||(24617894-24617951)
chr5 (580-637)||(24714125-24714182)
chr5 (580-637)||(24747153-24747210)
chr5 (493-646)||(18941290-18941436)
chr5 (373-420)||(20772078-20772126)
chr5 (588-648)||(21888474-21888534)
chr5 (566-646)||(23076436-23076515)
chr5 (564-632)||(37599454-37599521)
chr5 (597-648)||(17023086-17023137)
chr5 (520-587)||(24669110-24669176)
chr5 (520-587)||(24738879-24738945)
chr5 (566-668)||(39609017-39609119)
chr5 (493-644)||(5341795-5341940)
chr5 (493-668)||(25419732-25419903)
chr5 (564-634)||(28890519-28890588)
chr5 (564-634)||(28897223-28897292)
chr5 (564-634)||(28910423-28910492)
chr5 (564-634)||(28925691-28925760)
chr5 (564-634)||(28932114-28932183)
chr5 (564-634)||(28933618-28933687)
chr5 (564-634)||(28946818-28946887)
chr5 (495-646)||(37565973-37566118)
chr5 (607-648)||(15194241-15194282)
chr5 (596-645)||(18818836-18818885)
chr5 (19-68)||(22467181-22467230)
chr5 (373-420)||(20780853-20780901)
chr5 (347-399)||(23561550-23561602)
chr5 (566-646)||(26650339-26650416)
chr5 (566-646)||(26921924-26922001)
chr5 (373-420)||(37599254-37599302)
chr5 (493-643)||(7773725-7773867)
chr5 (599-645)||(19800531-19800577)
chr5 (599-643)||(20831702-20831747)
chr5 (596-648)||(21902061-21902114)
chr5 (564-632)||(20780635-20780702)
chr5 (19-47)||(22439342-22439370)
chr5 (566-646)||(23545006-23545085)
chr5 (373-420)||(28896999-28897047)
chr5 (373-420)||(28910247-28910295)
chr5 (373-420)||(28931939-28931987)
chr5 (373-420)||(28933442-28933490)
chr5 (373-420)||(28946642-28946690)
chr5 (607-646)||(43243873-43243913)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (350-649)||(41564-41862)
scaffold0107 (27-337)||(41192-41503)
[»] scaffold0154 (3 HSPs)
scaffold0154 (347-658)||(29671-29979)
scaffold0154 (22-156)||(30212-30347)
scaffold0154 (275-321)||(30044-30090)
[»] scaffold0634 (2 HSPs)
scaffold0634 (366-631)||(2516-2779)
scaffold0634 (19-92)||(3050-3123)
[»] scaffold0461 (4 HSPs)
scaffold0461 (22-489)||(655-1142)
scaffold0461 (36-489)||(7605-8078)
scaffold0461 (439-665)||(1116-1343)
scaffold0461 (439-665)||(8052-8279)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (375-665)||(102900-103190)
scaffold0020 (22-156)||(102526-102661)
scaffold0020 (597-648)||(177809-177860)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (22-337)||(15536-15853)
scaffold0235 (378-669)||(16914-17203)
scaffold0235 (109-337)||(14933-15162)
scaffold0235 (22-113)||(23253-23345)
[»] scaffold0004 (8 HSPs)
scaffold0004 (375-649)||(115667-115941)
scaffold0004 (347-535)||(326816-327007)
scaffold0004 (347-580)||(321062-321298)
scaffold0004 (27-156)||(116178-116308)
scaffold0004 (22-156)||(129244-129380)
scaffold0004 (495-640)||(129788-129932)
scaffold0004 (373-463)||(129659-129751)
scaffold0004 (608-648)||(383332-383372)
[»] scaffold0026 (7 HSPs)
scaffold0026 (368-631)||(12842-13104)
scaffold0026 (377-580)||(63168-63370)
scaffold0026 (373-580)||(124441-124649)
scaffold0026 (373-632)||(110142-110402)
scaffold0026 (597-639)||(35487-35529)
scaffold0026 (597-639)||(24617-24659)
scaffold0026 (607-639)||(118045-118077)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (368-587)||(110751-110969)
scaffold0029 (373-632)||(92102-92361)
scaffold0029 (373-632)||(97828-98087)
scaffold0029 (520-587)||(116786-116853)
scaffold0029 (19-70)||(91807-91858)
scaffold0029 (19-70)||(97533-97584)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (364-646)||(46941-47234)
scaffold0028 (373-587)||(52355-52568)
scaffold0028 (27-156)||(65417-65547)
scaffold0028 (27-148)||(1388-1510)
scaffold0028 (599-649)||(64888-64938)
scaffold0028 (335-463)||(65086-65215)
scaffold0028 (597-639)||(92888-92930)
scaffold0028 (599-646)||(52592-52640)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (364-587)||(38394-38616)
scaffold0106 (374-580)||(46728-46936)
scaffold0106 (374-580)||(51001-51209)
scaffold0106 (607-646)||(38322-38362)
[»] scaffold0076 (6 HSPs)
scaffold0076 (364-587)||(30107-30329)
scaffold0076 (364-587)||(35508-35730)
scaffold0076 (347-574)||(51644-51872)
scaffold0076 (599-646)||(30353-30401)
scaffold0076 (599-646)||(35754-35802)
scaffold0076 (566-641)||(1-75)
[»] scaffold0011 (11 HSPs)
scaffold0011 (364-587)||(174523-174745)
scaffold0011 (373-585)||(152356-152567)
scaffold0011 (374-580)||(258491-258700)
scaffold0011 (374-580)||(197409-197618)
scaffold0011 (374-463)||(252004-252094)
scaffold0011 (374-463)||(154248-154338)
scaffold0011 (378-463)||(147127-147213)
scaffold0011 (608-648)||(21986-22026)
scaffold0011 (599-646)||(174769-174817)
scaffold0011 (493-646)||(56861-57012)
scaffold0011 (374-463)||(75251-75342)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (368-587)||(9598-9816)
scaffold0117 (19-71)||(9243-9295)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (376-631)||(174535-174790)
scaffold0001 (419-581)||(489126-489288)
scaffold0001 (374-580)||(95848-96055)
scaffold0001 (373-620)||(493927-494174)
scaffold0001 (493-646)||(178938-179086)
scaffold0001 (36-156)||(493650-493771)
scaffold0001 (27-156)||(525075-525204)
scaffold0001 (576-648)||(524575-524647)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (336-580)||(5148-5392)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (378-669)||(392-681)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (439-665)||(1953-2181)
[»] scaffold0222 (3 HSPs)
scaffold0222 (22-198)||(16041-16218)
scaffold0222 (375-580)||(4978-5184)
scaffold0222 (566-639)||(27935-28008)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (347-580)||(14441-14673)
scaffold0239 (375-545)||(7186-7356)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (375-580)||(17477-17682)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (373-580)||(6001-6208)
[»] scaffold0249 (3 HSPs)
scaffold0249 (374-658)||(7778-8064)
scaffold0249 (347-632)||(14741-15025)
scaffold0249 (577-648)||(6968-7039)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (375-580)||(41931-42135)
scaffold0114 (374-463)||(47790-47881)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (375-580)||(56418-56623)
scaffold0067 (375-580)||(47384-47589)
scaffold0067 (375-580)||(62804-63009)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (347-535)||(7293-7482)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (347-580)||(27861-28096)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (347-515)||(20462-20630)
scaffold0023 (439-580)||(156804-156944)
scaffold0023 (347-427)||(153285-153365)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (453-587)||(4-138)
[»] scaffold0348 (4 HSPs)
scaffold0348 (373-592)||(2907-3128)
scaffold0348 (374-580)||(1696-1904)
scaffold0348 (375-580)||(15451-15641)
scaffold0348 (373-420)||(8465-8513)
[»] scaffold0034 (7 HSPs)
scaffold0034 (373-587)||(17371-17587)
scaffold0034 (347-587)||(10048-10291)
scaffold0034 (347-580)||(72229-72464)
scaffold0034 (493-625)||(35816-35947)
scaffold0034 (374-463)||(400-489)
scaffold0034 (374-463)||(6559-6648)
scaffold0034 (599-646)||(10315-10363)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (375-580)||(141326-141529)
scaffold0021 (373-580)||(146566-146775)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (374-580)||(16017-16225)
scaffold0243 (374-537)||(7997-8162)
[»] scaffold1584 (1 HSPs)
scaffold1584 (373-602)||(298-529)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (373-580)||(10341-10548)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (379-580)||(50948-51148)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (378-580)||(265100-265300)
scaffold0005 (378-580)||(258674-258874)
scaffold0005 (566-639)||(18339-18412)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (374-580)||(8410-8619)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (347-580)||(16834-17071)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (53-668)||(1198-1817)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (335-535)||(171741-171945)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (493-646)||(4217-4368)
scaffold0395 (597-646)||(10151-10200)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (347-515)||(34842-35013)
scaffold0008 (596-639)||(125118-125161)
[»] scaffold1773 (2 HSPs)
scaffold1773 (368-561)||(1-183)
scaffold1773 (19-71)||(516-568)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (30-156)||(15604-15730)
scaffold0139 (493-645)||(16137-16288)
scaffold0139 (373-427)||(15966-16021)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (347-516)||(11884-12055)
scaffold0483 (36-135)||(11631-11731)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (19-155)||(6825-6959)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (347-535)||(5845-6035)
[»] scaffold0317 (3 HSPs)
scaffold0317 (27-132)||(692-798)
scaffold0317 (495-645)||(110-259)
scaffold0317 (335-463)||(340-468)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (375-580)||(14544-14747)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (375-535)||(14052-14212)
scaffold0063 (375-580)||(24209-24413)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (347-580)||(24444-24680)
scaffold0261 (36-128)||(24192-24285)
scaffold0261 (335-399)||(10588-10651)
scaffold0261 (335-399)||(18767-18830)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (364-535)||(881-1055)
scaffold1427 (492-646)||(559-707)
[»] scaffold0301 (2 HSPs)
scaffold0301 (347-580)||(13358-13593)
scaffold0301 (347-463)||(3326-3444)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (377-502)||(16972-17096)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (347-489)||(44282-44426)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (493-645)||(1830-1981)
scaffold0089 (373-427)||(2098-2153)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (27-156)||(1130-1260)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (374-502)||(55939-56069)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (373-580)||(27737-27945)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (375-489)||(5638-5753)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (394-484)||(4-94)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (347-580)||(3270-3496)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (27-156)||(121213-121343)
scaffold0031 (27-156)||(132090-132220)
scaffold0031 (493-668)||(74207-74377)
scaffold0031 (588-644)||(108778-108834)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (441-580)||(2376-2516)
scaffold0203 (347-489)||(17046-17190)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (374-580)||(44086-44294)
scaffold0010 (374-580)||(49152-49360)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (374-580)||(6939-7147)
scaffold0167 (588-648)||(19730-19789)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (493-646)||(39-190)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (373-632)||(2817-3077)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (566-669)||(4478-4584)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (555-639)||(97493-97577)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (576-669)||(5835-5929)
[»] scaffold0053 (6 HSPs)
scaffold0053 (27-156)||(81827-81957)
scaffold0053 (19-146)||(80096-80224)
scaffold0053 (576-648)||(61297-61368)
scaffold0053 (564-620)||(80594-80650)
scaffold0053 (576-648)||(73085-73156)
scaffold0053 (373-420)||(80393-80441)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (439-581)||(52671-52815)
scaffold0098 (599-646)||(52846-52894)
[»] scaffold0094 (3 HSPs)
scaffold0094 (36-156)||(51557-51678)
scaffold0094 (566-640)||(51071-51145)
scaffold0094 (376-463)||(51252-51341)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (555-639)||(43049-43133)
[»] scaffold0232 (2 HSPs)
scaffold0232 (27-153)||(19023-19150)
scaffold0232 (566-640)||(19565-19639)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (347-463)||(25703-25821)
[»] scaffold0085 (2 HSPs)
scaffold0085 (19-124)||(4277-4382)
scaffold0085 (373-483)||(4571-4684)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (374-580)||(370396-370594)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (347-461)||(4949-5065)
scaffold0556 (596-648)||(10833-10885)
[»] scaffold1726 (2 HSPs)
scaffold1726 (373-464)||(344-435)
scaffold1726 (493-587)||(217-310)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (350-463)||(17373-17488)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (375-465)||(57154-57245)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (375-465)||(141388-141479)
[»] scaffold0192 (3 HSPs)
scaffold0192 (374-463)||(6758-6848)
scaffold0192 (597-648)||(20676-20727)
scaffold0192 (597-648)||(31343-31394)
[»] scaffold1684 (1 HSPs)
scaffold1684 (596-649)||(1419-1472)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (347-427)||(2284-2365)
[»] scaffold0377 (3 HSPs)
scaffold0377 (373-465)||(7344-7437)
scaffold0377 (373-447)||(3323-3398)
scaffold0377 (477-580)||(7253-7356)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (22-132)||(17503-17614)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (597-648)||(113-164)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (347-463)||(8356-8475)
scaffold0298 (347-463)||(18440-18559)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (576-639)||(25440-25503)
[»] scaffold0720 (3 HSPs)
scaffold0720 (500-620)||(4264-4385)
scaffold0720 (36-128)||(3882-3975)
scaffold0720 (373-420)||(4161-4209)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (493-645)||(6062-6211)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (597-647)||(1718-1768)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (597-647)||(27126-27176)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (563-620)||(9-66)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (374-489)||(38636-38752)
scaffold0022 (374-489)||(136696-136812)
[»] scaffold0575 (2 HSPs)
scaffold0575 (596-639)||(193-236)
scaffold0575 (597-648)||(8473-8524)
[»] scaffold0104 (5 HSPs)
scaffold0104 (576-639)||(41808-41871)
scaffold0104 (493-602)||(26069-26176)
scaffold0104 (493-602)||(27451-27558)
scaffold0104 (374-463)||(26211-26302)
scaffold0104 (374-463)||(27593-27684)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (348-417)||(567-637)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (374-463)||(3267-3357)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (348-417)||(8640-8710)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (495-646)||(41168-41311)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (603-648)||(4951-4996)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (608-649)||(7320-7361)
scaffold0371 (588-646)||(1105-1163)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (27-156)||(3230-3359)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (596-648)||(9493-9545)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (347-399)||(5004-5056)
scaffold0120 (373-463)||(5094-5186)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (566-646)||(143897-143976)
[»] scaffold2016 (1 HSPs)
scaffold2016 (596-639)||(952-995)
[»] scaffold1979 (1 HSPs)
scaffold1979 (597-648)||(989-1040)
[»] scaffold0669 (1 HSPs)
scaffold0669 (613-648)||(1943-1978)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (374-463)||(27358-27449)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (347-463)||(9357-9476)
[»] scaffold1290 (2 HSPs)
scaffold1290 (588-646)||(1460-1518)
scaffold1290 (370-399)||(1189-1218)
[»] scaffold1098 (1 HSPs)
scaffold1098 (597-639)||(1801-1843)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (588-646)||(2176-2234)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (610-648)||(2844-2882)
[»] scaffold0453 (2 HSPs)
scaffold0453 (36-128)||(11174-11267)
scaffold0453 (373-465)||(11452-11546)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (597-647)||(22920-22970)
scaffold0266 (599-668)||(15001-15071)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (588-646)||(45429-45487)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (588-646)||(29728-29786)
scaffold0102 (374-463)||(44702-44792)
scaffold0102 (493-537)||(38466-38508)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (588-646)||(207977-208035)
[»] scaffold0326 (4 HSPs)
scaffold0326 (576-649)||(5594-5665)
scaffold0326 (336-463)||(323-450)
scaffold0326 (520-581)||(510-570)
scaffold0326 (599-646)||(600-648)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (36-135)||(18021-18121)
[»] scaffold1469 (3 HSPs)
scaffold1469 (425-632)||(242-448)
scaffold1469 (373-420)||(463-511)
scaffold1469 (36-144)||(679-788)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (564-620)||(297-353)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (596-648)||(26159-26211)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (373-535)||(13-179)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (596-648)||(2178-2230)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (596-648)||(3957-4009)
[»] scaffold0188 (3 HSPs)
scaffold0188 (373-463)||(31540-31631)
scaffold0188 (493-535)||(31666-31706)
scaffold0188 (599-646)||(31782-31830)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (374-463)||(2989-3080)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (588-646)||(1548-1606)
[»] scaffold0309 (3 HSPs)
scaffold0309 (478-580)||(20803-20907)
scaffold0309 (579-639)||(5799-5859)
scaffold0309 (579-639)||(7951-8011)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (588-646)||(206-264)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (597-646)||(11818-11867)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (493-545)||(247052-247102)
scaffold0009 (493-545)||(253566-253616)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (607-646)||(553-593)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (596-636)||(4681-4721)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (374-417)||(18668-18712)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (596-648)||(9451-9502)
scaffold0244 (596-648)||(13524-13575)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (374-417)||(10611-10655)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (596-636)||(81437-81477)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 623; Significance: 0; HSPs: 89)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 623; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 23878399 - 23877749
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23878399 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggga 23878300  T
Q  119 tccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagttta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23878299 tccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattctgaatcctactaaacgcattgttaaatcgagttgatatagttta 23878200  T
Q  219 atgaatttgtggattgaagtgagtgtgaaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatgacttgatgtattagtatgattgacattaattatacattttctga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23878199 atgaatttgtggattgaagtgagtgtgaaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatgacttgatgtattagtatgattgacattaattatacattttccga 23878100  T
Q  319 tgttggattggttgagatggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23878099 tgttggattggttgagatggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataa 23878000  T
Q  419 aagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23877999 aagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtagttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaagacttatgtcctgatga 23877900  T
Q  519 taatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatg 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23877899 taatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatg 23877800  T
Q  619 tcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23877799 tcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 23877749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 21907825 - 21907159
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||    
T  21907825 actttctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgtactagggaatc 21907726  T
Q  121 cttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaat 220  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | || ||||||    
T  21907725 cttttgagtattcttaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctactgaacacattgttaa-tcgaattggtgtaatttaat 21907627  T
Q  221 gaatttgtggattgaagtgagtgtgaa-ccaagtgaaaagatgttgcgttgaatga-cttgatgtattagtatgattgacattaattatacatttt-ctg 317  Q
    || || |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  21907626 gatttcg--gattggagtgagtatgaaaccaagtgaaaatatactatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattgttattaattatacatttttctg 21907529  T
Q  318 atgttggattggt---------------tgag--atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg- 399  Q
    |||||||||||||               |||   ||| |||||||||||||||| | | ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||     
T  21907528 atgttggattggtctgtgatgatgttgttgaactatgaagtcgtatgtcatatatacatatatgcatt-gtcgggttgtatgtagatatacacaagtgga 21907430  T
Q  400 gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggt 498  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  21907429 gtcagttgcataagcataaaagtgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgttttgcggt 21907330  T
Q  499 gaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcgggg 597  Q
    |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||  ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21907329 gaggacttatgtcctgaaaagaatgttttaaccattcgattagcggtgagggctccggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgagg 21907231  T
Q  598 agtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  21907230 agtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgtagttggttgaattgctatattattgatgatgt 21907159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 335 - 642
Target Start/End: Original strand, 23102391 - 23102696
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23102391 atggagttgtaagtcatatatacaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcctaaaagtgggagagcttcg 23102490  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23102491 gctctggaactccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtttttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccatt 23102590  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||    
T  23102591 cgacagcggtgtgggtcacggccctg-aatatggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgt 23102688  T
Q  635 tgttgttg 642  Q
    ||||||||    
T  23102689 tgttgttg 23102696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 347 - 642
Target Start/End: Original strand, 23089975 - 23090268
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23089975 gtcatatatacaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgc 23090074  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgt 546  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23090075 cttgtcgttaaaagcggtggaacactagttattcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgt 23090174  T
Q  547 gggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttg 642  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23090175 gggtcacgaccctg-aatatggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgttgttgttg 23090268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 9241539 - 9241282
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9241539 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtggaagaacttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacatt 9241440  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  9241439 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctg-attatggtacc 9241341  T
Q  573 acatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  9241340 acatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 9241282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 375 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 23264188 - 23263894
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta 473  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23264188 gttgtatgtagatatacaccagtggagtctgttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacta 23264089  T
Q  474 gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| |||   |||||||| ||||||||||||    
T  23264088 gttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaatcattcgatagtggtgagggctccggccctg-aatatggtacca 23263990  T
Q  574 catgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  23263989 catgcttagttgcaattgtcgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaattgctatattattgatgatgt 23263894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 370 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6482531 - 6482257
Alignment:
Q  370 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6482531 gtggagttgtatgtagagatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaac 6482432  T
Q  470 actagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6482431 actagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggt 6482332  T
Q  570 accacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6482331 accacatgcatagttgcatttattgaggagtattagggggaatgtcatgtc-ttgcatgagtcgttgttgttggtt 6482257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 366 - 631
Target Start/End: Original strand, 23169262 - 23169525
Alignment:
Q  366 attagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  || || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23169262 attagtggagttgtatgtggatatacacgggttgggtagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 23169361  T
Q  466 gaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaata 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23169362 gaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-atta 23169460  T
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagt 631  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||    
T  23169461 tggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtcttatagg-ggtgtcatgtcatttcatgagt 23169525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 366 - 631
Target Start/End: Original strand, 23580519 - 23580782
Alignment:
Q  366 attagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  || || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23580519 attagtggagttgtatgtggatatacacgggttgggtagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 23580618  T
Q  466 gaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaata 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23580619 gaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-atta 23580717  T
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagt 631  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||    
T  23580718 tggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtcttatagg-ggtgtcatgtcatttcatgagt 23580782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 370 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6485998 - 6485724
Alignment:
Q  370 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6485998 gtggagttgtatgtagagatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaac 6485899  T
Q  470 actagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6485898 actagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggt 6485799  T
Q  570 accacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6485798 accacatgcatagttgcatttattgaggagtattagggggaaggtcatgtc-ttgcatgagtcgttgttgttggtt 6485724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 374 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 26582880 - 26582668
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta 473  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26582880 agttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacta 26582781  T
Q  474 gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  26582780 gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-gttatggtacca 26582682  T
Q  574 catgcatagttgca 587  Q
    ||||||||||||||    
T  26582681 catgcatagttgca 26582668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 368 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 20261034 - 20260773
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20261034 tagttgagttgtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgga 20260935  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
     ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||    
T  20260934 gcactagttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctg-attttg 20260837  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  20260836 gtaccacatgcatagttgcttttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 20260773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 200856 - 200634
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  200856 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 200758  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  200757 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 200659  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  200658 ttatggtaccacatgcatatttgca 200634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Original strand, 27367545 - 27367767
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  27367545 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcata-gcatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 27367643  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27367644 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 27367742  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  27367743 ttatggtaccacatgcatatttgca 27367767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22810115 - 22809882
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22810115 gtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcaggagagcttcggctctggaacgc 22810016  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||    
T  22810015 cttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctatagcggtg 22809916  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
     ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22809915 agggcctcggccctg-gatatggtaccacatgcat 22809882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Original strand, 6744286 - 6744508
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  6744286 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 6744384  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6744385 tggaacactggttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 6744483  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  6744484 ttatggtaccacatgcatatttgca 6744508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 43693616 - 43693394
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  43693616 gcatttgttgagttgtatgtagatatccacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 43693518  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43693517 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctg-a 43693419  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  43693418 ttatggtaccacatgcatatttgca 43693394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 375 - 637
Target Start/End: Original strand, 21073951 - 21074214
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggtt-agtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | | |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  21073951 gttgtatgtagatatacacaagtggattcaattgcataaccataaaagcgggagggcttcggccctggaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacactt 21074050  T
Q  474 gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| |||||||||||    
T  21074051 gttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacccatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggctccggccctg-aatatggtacc 21074149  T
Q  573 acatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 637  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21074150 acatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagaagtgtcgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 21074214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Original strand, 5706980 - 5707198
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  5706980 tagtagagttgtatgtagatatacactggttgggtagttgcataatcatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgcttcgtcgttcaaagcggtgga 5707078  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5707079 gcactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattacg 5707178  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5707179 gtaccacatgcatatttgca 5707198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 2105782 - 2105577
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  2105782 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 2105683  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||    
T  2105682 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgaattatggtacca 2105584  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  2105583 catgcat 2105577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 401 - 632
Target Start/End: Original strand, 10685624 - 10685852
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||| || |||||    
T  10685624 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtt-agtggtga 10685722  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagt 600  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  10685723 ggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-attttggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagt 10685821  T
Q  601 cttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  10685822 cttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 10685852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 373 - 535
Target Start/End: Original strand, 19703451 - 19703615
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19703451 gagttgtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 19703550  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc 535  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  19703551 tagttgttcaaagcggtgtttatcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 19703615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 27295980 - 27296181
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||| ||||||  |||||||     
T  27295980 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtactagtta 27296079  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  27296080 ctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 27296178  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  27296179 cat 27296181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 20724267 - 20724032
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  20724267 gtcatatgaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcaaaaaagcgggagggcttcggccctagaacg 20724168  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcgg 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| |  |||||    
T  20724167 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcgg 20724068  T
Q  544 tgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    || |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  20724067 tgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcat 20724032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 502 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 23269276 - 23269110
Alignment:
Q  502 gacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtc 601  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  23269276 gacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctgaa-tatggtaccacatgcttagttgcaattgtcgaagagtc 23269178  T
Q  602 ttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  23269177 ttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaattgctatattattgatgatgt 23269110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 502 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 23276145 - 23275979
Alignment:
Q  502 gacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtc 601  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  23276145 gacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctgaa-tatggtaccacatgcttagttgcaattgtcgaagagtc 23276047  T
Q  602 ttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  23276046 ttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaattgctatattattgatgatgt 23275979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 23291133 - 23290925
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  23291133 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgaaacact 23291034  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  23291033 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaacgaatgctttaaccattcgattagcggtgagggctccggccctg-aatatggta 23290935  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  23290934 ccacatgcat 23290925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 12572512 - 12572311
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtggg-ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  12572512 gtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 12572413  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  12572412 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 12572315  T
Q  577 gcat 580  Q
    ||||    
T  12572314 gcat 12572311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 12578994 - 12578793
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtggg-ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  12578994 gtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 12578895  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  12578894 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 12578797  T
Q  577 gcat 580  Q
    ||||    
T  12578796 gcat 12578793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 373 - 602
Target Start/End: Original strand, 19649512 - 19649743
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19649512 gagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagttgcataagtataaaagcgggagggctttggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 19649611  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  19649612 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctg-aatatggt 19649710  T
Q  570 accacatgcatagttgcaattgtcggggagtct 602  Q
    ||||||||||||  |||| |||| | |||||||    
T  19649711 accacatgcatatctgcatttgttgaggagtct 19649743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24943612 - 24943376
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||| |||  |||  | ||||    
T  24943612 gtcatataaatacatatgcattttttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatacgcacaaaagtgggagggctctggccctagaac 24943513  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcg 542  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||    
T  24943512 accttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttcgcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgattagcg 24943413  T
Q  543 gtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    ||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24943412 gtgagggctgcggccctg-aatatggtaccacatgcat 24943376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23063126 - 23062996
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23063126 ctgtaagccggtcgcttaagcgaaccagccgtcgcttaagcgaagttgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcattaggggatcctttt 23063027  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  23063026 gagcatttaaaaatgtttctttcaacttgta 23062996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 27785872 - 27785695
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  27785872 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 27785775  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  27785774 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 27785695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 27791093 - 27790916
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  27791093 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 27790996  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  27790995 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 27790916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23264523 - 23264424
Alignment:
Q  58 tcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23264523 tcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttaaatgttcctttcaacttgta 23264424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 23752998 - 23752791
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  23752998 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggctctggccctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacact 23752899  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |  ||||||| | |   |||||||| ||||||||    
T  23752898 ttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctgaatg--aatgctttaaccattcaattagcggtgagagctccggccctg-aatatggt 23752802  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  23752801 accacatgcat 23752791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 26884361 - 26884113
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| |||  | ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26884361 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt-gcataagcataaaaatggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaca 26884263  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataa---tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    ||| |||||||||||||||||| |  ||  |||||| |||||||||| | ||   |||||||||||||| | | ||||| ||| | |||||||||  |||    
T  26884262 ctatgttgttcaaagcggtgttaatggg--aggactcatgtcctgataaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggccccggccctga--tat 26884167  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  26884166 ggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 26884113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24658981 - 24658773
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24658981 agttgtatgtagatatacacaagtggagtaagttgtataagtataaaagcgggagggctttggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 24658882  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | ||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  24658881 ttgttgttcaaagtggtgtttagcagtgagaacttatgtcctgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctg-aatatggta 24658783  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  24658782 ccacatgcat 24658773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 27210947 - 27211196
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  || |||  | ||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27210947 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacggtgaggacctcggtcctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaca 27211046  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatg---ataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    ||| |||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||   | |||| ||||||||||| | | ||||| |||   ||||||||  ||||    
T  27211047 ctatgttgttcaaagcggtgttaa--tgggaggactcatgtcctgatgaaaagaatgttttaaccattctataacggtgagggctccggccctg--atat 27211142  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  27211143 ggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 27211196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 6261516 - 6261763
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||  | |||  | ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6261516 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcggtgcataagcataaaatggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 6261615  T
Q  473 -agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatg---ataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
     ||||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||| | | ||||| ||||  |||| |||  ||||||    
T  6261616 aagttgttcaaagcggtgttaa--tgggaggactcatgtcctgatgaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggtttcggctctg--atatgg 6261711  T
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  | |||||||||||    
T  6261712 taccacatgcatagttgcatttgttgaggagttttagtagagttgtcatgtc 6261763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 23089628 - 23089742
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |    
T  23089628 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactggacgtcgcttaagcgaagttgaccttagtcagccactttttgaacgttgcctcgtgcattaggag 23089727  T
Q  118 atccttttgagcatt 132  Q
    | || ||||||||||    
T  23089728 acccctttgagcatt 23089742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 495 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23062585 - 23062436
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23062585 cggtgaggacttatgtcctga--atgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcacttgt 23062489  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
     | ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  23062488 tgaggagtcttagaagtgttgtcatgttattgcatgtgtcgttgtcgttggtt 23062436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 374 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 24652537 - 24652374
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||| ||||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24652537 agttgtatgtagatatacacaagtggagtctgttgtataagtataaaagcgggagggctctggccctggaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacact 24652438  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc 535  Q
      |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||    
T  24652437 ttgttgttcaaagcagtgtttagcggtgaggacttatgtcttgaaatgaatgctttaaccattc 24652374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24661024 - 24660889
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatc 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||    
T  24661024 actttctgtgagccggtcgcttaagcgagccagccgtcgcttaagcaaagaaggtcttagtcagccactttttgaattttacttcgtgcactaggggatc 24660925  T
Q  121 cttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  24660924 cttttgagcattttaaaatgtttctttcaacttgta 24660889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 19662792 - 19663052
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  19662792 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 19662891  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  19662892 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 19662988  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19662989 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 19663052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 23102056 - 23102170
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |    
T  23102056 cagacttactgtaagccgatcacttaagcgaactggacgtcgcttaagcgaagttgaccttagtcagccactttttgaacgttgcctcgtgcattaggag 23102155  T
Q  118 atccttttgagcatt 132  Q
    | || ||||||||||    
T  23102156 acccctttgagcatt 23102170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 28971246 - 28971336
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  28971246 gagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagggcttctgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 28971336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 29281150 - 29280890
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  29281150 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 29281051  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | |  | || |||   |||| ||||  ||||    
T  29281050 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataaagatgagggcttcggctctga--tatg 29280954  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  29280953 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 29280890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Original strand, 21133193 - 21133310
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  21133193 gtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagggcttctgccctagaacg 21133292  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||| |||||||||||    
T  21133293 ccttgtcgttcaaagcgg 21133310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 565 - 639
Target Start/End: Original strand, 21124038 - 21124112
Alignment:
Q  565 atggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21124038 atggtaccacatgcatagtcgaatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 21124112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26884639 - 26884518
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcattt 133  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26884639 ggtcgcttaagcgagctacccttcgcttaagcgaac-tgagccttagtcagcctctttctgaaccttgcttcgtgcactaggggacccttttgagtattt 26884541  T
Q  134 ttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||| ||||| |||| | ||||||    
T  26884540 ttaaatgtttcttttagcttgta 26884518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 373 - 491
Target Start/End: Original strand, 27208612 - 27208733
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  || |||  | ||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27208612 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacggtgaggacctcggtcctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaca 27208711  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgtt 491  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  27208712 ctatgttgttcaaagcggtgtt 27208733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 465
Target Start/End: Original strand, 22796556 - 22796688
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggag-ttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagctt 432  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||     
T  22796556 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatttgttgaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctc 22796655  T
Q  433 cggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
     |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22796656 tggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 22796688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 24660470 - 24660403
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24660470 tggtaccacatgcatagtcgca-ttgttgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 24660403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29281446 - 29281336
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggg 116  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||   ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  29281446 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaa-ctgagtgttagtcagcctttttctgaaccttgcttcgtgcactaagg 29281348  T
Q  117 gatccttttgag 128  Q
    ||||||||||||    
T  29281347 gatccttttgag 29281336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 23062796 - 23062668
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||      
T  23062796 atggagtcgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctct 23062698  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||  |||||||||| || |||||||||||    
T  23062697 ggccctggaacgcctcgtcgttcaaagcgg 23062668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 26583237 - 26583185
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26583237 cagacctactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 26583185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 668
Target Start/End: Original strand, 15643412 - 15643514
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgat 664  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||    
T  15643412 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtccttgttgttggttgtgattgttatattgatgat 15643510  T
Q  665 gatg 668  Q
    ||||    
T  15643511 gatg 15643514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 9731 - 9482
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  9731 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 9632  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| ||||||||||  | |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| |||   ||||    
T  9631 ctatgttgttcaaaatgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctgt--tatg 9535  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||||||| || |||||||||||    
T  9534 gtaccacatgcatagttgcattttttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 9482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Original strand, 5706696 - 5706758
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagcc 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5706696 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagtgaaccttagtcagcc 5706758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 25181506 - 25181615
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||   ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  25181506 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcaaactagccgtcgcttaagcgaa-ctgagtgttagtcagccttttctgaatcttgcttcgtgcactagggg 25181604  T
Q  118 atccttttgag 128  Q
    | |||||||||    
T  25181605 acccttttgag 25181615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 602
Target Start/End: Original strand, 21133345 - 21133453
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaatt 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||   |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  21133345 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctg-aatatggtactacatgcatatttgcattt 21133441  T
Q  591 gtcggggagtct 602  Q
    || | |||||||    
T  21133442 gttgaggagtct 21133453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10026 - 9978
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagc 67  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10026 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagc 9978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 17633823 - 17633763
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17633823 atagttgcatttgttgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtcagtgcatgagtcgttgttg 17633763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 535
Target Start/End: Original strand, 25181800 - 25181966
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  25181800 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 25181899  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattc 535  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  25181900 ctatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattc 25181966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Original strand, 28971371 - 28971463
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28971371 agcagtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggtcctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 28971463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Original strand, 32911606 - 32911685
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32911606 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 32911685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 20648282 - 20648191
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  20648282 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 20648191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 25267412 - 25267321
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  25267412 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 25267321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 38931652 - 38931803
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagc-ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | | |||| |||   | |||||| ||  ||||||||||||||| || ||| |||    
T  38931652 agcggtgagggcttatgccctgatga--atgctttaaccattcaatatccggtgagggcttctgccctgtaaattggtaccacatgcattgtcgca-ttg 38931748  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    | | |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  38931749 ttgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcattgttgttggttg 38931803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 495 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 45028590 - 45028446
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcg 594  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |||    
T  45028590 cggtgaggacttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctgt--tttggtaccacatgcataattgcatttatcg 45028495  T
Q  595 gggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggt 644  Q
     || ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  45028494 aggggtcttagtgatgtcgtcatgtca-tgcatgagtcttggttgttggt 45028446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 22860550 - 22860421
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagctt 432  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||     
T  22860550 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gttgagttgtatgtaaatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctc 22860452  T
Q  433 cggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
      ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  22860451 ttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 22860421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 6744532 - 6744580
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6744532 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 6744580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 22840844 - 22840804
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22840844 gtgttgttatgtcattgcataagtcgttgttgttggttgaa 22840804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 25590256 - 25590402
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  25590256 agcggtgagtgcttttgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttggtaccacatgcataattgca-ttat 25590349  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25590350 tgaggggtcttaatggtgtcgtcatgtcat-gcatgagtctttgttgttggttg 25590402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Original strand, 27208319 - 27208422
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggat 119  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||     
T  27208319 actttctgtgagctggtcgcttaagcgagctacccttcgcttaagcgaa-ctgagccttagtcagcctttttctgaaccttgtttcgtgcactaggggac 27208417  T
Q  120 ccttt 124  Q
    |||||    
T  27208418 ccttt 27208422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Original strand, 27210654 - 27210757
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggat 119  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||     
T  27210654 actttctgtgagctggtcgcttaagcgagctacccttcgcttaagcgaa-ctgagccttagtcagcctttttctgaaccttgtttcgtgcactaggggac 27210752  T
Q  120 ccttt 124  Q
    |||||    
T  27210753 ccttt 27210757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 8889935 - 8890026
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  || |||||||||| |||||||||||    
T  8889935 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctgcaacgccttgtcgttcaaagcgg 8890026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 24528391 - 24528348
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24528391 ggagtcttaatggtgtagtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 24528348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 8890163 - 8890221
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  8890163 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcaaatagttgcatgagtcattgttgttggttg 8890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 23672360 - 23672418
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  23672360 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtaattgcatgagttgttgttattggttg 23672418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 25267184 - 25267126
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  25267184 attgtcgaggagtcttagtggtgttgtcgagtagttgcatgagtcattgttgttggttg 25267126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22703545 - 22703489
Alignment:
Q  523 gctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22703545 gctttaaccattctaaagcggtgagggctacggccctg-aatatggtaccacatgcat 22703489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24660674 - 24660629
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  24660674 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 24660629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 11466042 - 11465994
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11466042 gtcttagctgtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 11465994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 642
Target Start/End: Original strand, 13101297 - 13101372
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttg 642  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  13101297 tggtaccacatgcatatatgcatttattgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttattgttg 13101372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 19649753 - 19649801
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19649753 gtcttagcggtgttgacatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 19649801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 20914534 - 20914585
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20914534 ggagtcttagcggt-ttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 20914585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 417
Target Start/End: Original strand, 25107437 - 25107481
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  25107437 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 25107481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 657
Target Start/End: Original strand, 14057219 - 14057860
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggga 118  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14057219 cagactttctgtgagccggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaagatgaccttaatcagccacttttgaactttgcctcatgcactagggga 14057318  T
Q  119 tccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagttta 218  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14057319 tccttttgagtatttctaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatgtaccctgaatcctactaaacacattgtt-aatcgagttggtatagttta 14057417  T
Q  219 atgaatttgtggattgaagtgagtgtg-----aaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatgacttgatgtattagtatgattgacattaattataca-tt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14057418 atgaatttgtggattgaagtgggtatgaatgaaaccaagtgaaaagatgttacgttgaatgacttgatgtattagtatgattgacaataattatacattt 14057517  T
Q  313 ttctgatgttggattggttgagatggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataa 412  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14057518 ttctgatgttggattggttgtgatgaagttgtatgtcatatatatacatatgcattagttgagttgtatgtaaatatacacaagtgggttagttgcataa 14057617  T
Q  413 gcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14057618 gcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcc 14057717  T
Q  513 tgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgtt 612  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  14057718 tgataagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctg-aatatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagagg-gtt 14057815  T
Q  613 gtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatat 657  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14057816 gtcatgtcattacatgagttgttgttgttggttgaattgttatat 14057860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25111437 - 25111101
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggga 118  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25111437 cagactttctgtgagtcggtcgcttaagcgaactggccgtcgcttaagcgaagatgaccatagtcagccacttttgaactttgcctcgtgcactagggga 25111338  T
Q  119 tccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagttta 218  Q
    |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25111337 tccttttgagtatttctaagtgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctactaaacacattgtt-aatcgagttggtatagttta 25111239  T
Q  219 atgaatttgtggattgaagtgagtgtg-aaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatgacttgatgtattagtatgattgacattaattataca-ttttct 316  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25111238 atgtatttgtggattgaagtgggtatgaaaccaagtgaaaatatgttacgttgaatgacttgatgtattagtatgattgacattaattatacatttttct 25111139  T
Q  317 gatgttggattggttgagatggagtcgtatgtcatata 354  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  25111138 gatgttggattggttgtgatgaagttgtatgtcatata 25111101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 370 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44476446 - 44476172
Alignment:
Q  370 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44476446 gtggagttgtatgtagagatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaac 44476347  T
Q  470 actagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44476346 actagttgttcaaaacggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggt 44476247  T
Q  570 accacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44476246 accacatgcatagttgcatttattgaggagtattagggggaaggtcatgtc-ttgcatgagtcgttgttgttggtt 44476172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 370 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44479708 - 44479434
Alignment:
Q  370 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44479708 gtggagttgtatgtagagatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaac 44479609  T
Q  470 actagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44479608 actagttgttcaaaacggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggt 44479509  T
Q  570 accacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44479508 accacatgcatagttgcatttattgaggagtattagggggaaggtcatgtc-ttgcatgagtcgttgttgttggtt 44479434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 386 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 18609987 - 18609704
Alignment:
Q  386 atatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaag 484  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18609987 atatacaccagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaatgccttgtcgttgaaagcggtggaacactagttgttcaaag 18609888  T
Q  485 cggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagtt 584  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18609887 cggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcagtgagggctccggccctg-aatatggtaccacatgcatagtt 18609789  T
Q  585 gcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  18609788 gcaattatcgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggatgaattgctatattattgatgatgt 18609704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 350 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 23825353 - 23825102
Alignment:
Q  350 atatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgcctt 449  Q
    ||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23825353 atatatatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgcctt 23825255  T
Q  450 gttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 548  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23825254 gtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 23825155  T
Q  549 gtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtct 602  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  23825154 gtcacggccctg-attatggtaccacatgcatatttgcatttgttgaggagtct 23825102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 336 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 17053840 - 17053590
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcgg 435  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| | | | || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  17053840 tggagtagtatgtcatatg-atacatatgtagtggtcgagttgtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcag 17053742  T
Q  436 ctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc 535  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17053741 ctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaaactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattc 17053642  T
Q  536 gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17053641 ggcagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcatagttgca 17053590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 23865649 - 23865427
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23865649 gcattagttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataaacatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 23865551  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaa 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |     
T  23865550 tggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccatttgacagcggtgtgggtcatggccctggat 23865451  T
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  23865450 tatggtaccacatgcatacttgca 23865427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Original strand, 19902894 - 19903112
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||  || || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19902894 tagttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataaatatcaa-gtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 19902992  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19902993 acactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatg 19903092  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  19903093 gtaccacatgcataattgca 19903112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 350 - 587
Target Start/End: Original strand, 30766897 - 30767133
Alignment:
Q  350 atatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgcctt 449  Q
    ||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30766897 atatatatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgagtagttgcata-gcatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgcctt 30766995  T
Q  450 gttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 548  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30766996 gtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtccttatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 30767095  T
Q  549 gtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  30767096 gtcacggccctg-attatggtaccacatgcatatttgca 30767133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 22025528 - 22025762
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22025528 gtcatatacatatatatgcataggttgagttgtatgtagatatagacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgc 22025627  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga--taatgctttaaccattcgacagcggt 544  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||| ||||||||    
T  22025628 cttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggt 22025727  T
Q  545 gtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    | |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  22025728 gagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcat 22025762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 402 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 25409731 - 25409503
Alignment:
Q  402 tagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 501  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  25409731 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggatcgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgat 25409632  T
Q  502 gacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtc 601  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || | | ||||      
T  25409631 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-gttatggtaccacatgcatagttgcatttattgaggagaa 25409533  T
Q  602 ttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagt 631  Q
    |||| || | |||||||||||| |||||||    
T  25409532 ttaggggggatgtcatgtcatttcatgagt 25409503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 347 - 545
Target Start/End: Original strand, 22063531 - 22063731
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22063531 gtcatatacatatatatgcataggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctccggaacgc 22063630  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga--taatgctttaaccattcgacagcggt 544  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||| ||||||||    
T  22063631 cttgtcgttcaaagcggtggagcactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggt 22063730  T
Q  545 g 545  Q
    |    
T  22063731 g 22063731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 350 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25111071 - 25110911
Alignment:
Q  350 atatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgcctt 449  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  25111071 atatatatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaatgtctt 25110972  T
Q  450 gttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgt 510  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25110971 gtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgt 25110911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 371 - 580
Target Start/End: Original strand, 41009426 - 41009637
Alignment:
Q  371 tggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41009426 tggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaac 41009525  T
Q  470 actagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  ||||||| ||||  |||||||| | ||||    
T  41009526 actagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggtttcggccctg-attatg 41009624  T
Q  568 gtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||    
T  41009625 gtaccacatgcat 41009637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 21282266 - 21282051
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21282266 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacaccttgtcgttcaaaacggtggaacact 21282167  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
     |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  21282166 tgttgttcaaagcggtgtatagcggtgacgactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctg-aatatggta 21282068  T
Q  571 ccacatgcatagttgca 587  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21282067 ccacatgcatatttgca 21282051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 373 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 21669064 - 21668901
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21669064 gagttgtatgtatatatacacaagtgagtcagttacataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 21668965  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc 535  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21668964 agttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 21668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 9273159 - 9273360
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||  |||||||     
T  9273159 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgcttggtcgttcaaagtggtggagtactagtta 9273258  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  9273259 ctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgttctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 9273357  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  9273358 cat 9273360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22177790 - 22177586
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  22177790 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcaaaaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcacaag 22177691  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  22177690 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaagacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 22177593  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  22177592 catgcat 22177586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22050405 - 22050201
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  22050405 gttgtatgtagatatactcaagtgggtcatttgcataagcataacagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 22050306  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| | |||| |||||| || |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  22050305 ttgcttaaagtggtgtt-agtggtgaggacttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 22050208  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  22050207 catgcat 22050201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 21326818 - 21327027
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggtt-agtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21326818 agttgtatgtagatatacacaagtggatttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 21326917  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg--atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| | ||||||    
T  21326918 agttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctg-attatggt 21327016  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  21327017 accacatgcat 21327027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18613663 - 18613534
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18613663 ctgtaagcaggtcgcttaagcgaaccagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcggccacttttgaactttgcctcgtgcactaggggatcctcttg 18613564  T
Q  127 agcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  18613563 agcatttaaaaatgttcctttcaacttgta 18613534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 1804467 - 1804668
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtggg-ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  1804467 gtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 1804566  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  1804567 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 1804664  T
Q  577 gcat 580  Q
    ||||    
T  1804665 gcat 1804668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 36799577 - 36799376
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtggg-ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  36799577 gtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 36799478  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  36799477 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 36799380  T
Q  577 gcat 580  Q
    ||||    
T  36799379 gcat 36799376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 21322230 - 21322439
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||| |  |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21322230 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggtctcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 21322329  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg--atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| | ||||||    
T  21322330 agttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctg-attatggt 21322428  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  21322429 accacatgcat 21322439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 10607168 - 10606931
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||    
T  10607168 gtcatataaatacatatgcatttgtcggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 10607069  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaaca-ctagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagc 541  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |  |||    
T  10607068 gccttgtcgttcaaagcggtggaacaccttgttgttcaacgcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcaattagc 10606969  T
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  10606968 ggtgagggctccggccctg-attatggtaccacatgcat 10606931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22055923 - 22055719
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  22055923 gttgtatgtagatatactcaagtgggtcatttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 22055824  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| | |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  22055823 ttgcttaaagtggtgtt-agtggtgaggatttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 22055726  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  22055725 catgcat 22055719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 18681526 - 18681703
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  18681526 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 18681623  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  18681624 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 18681703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 31567835 - 31568012
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  31567835 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 31567932  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  31567933 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 31568012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 31573056 - 31573233
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  31573056 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 31573153  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  31573154 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 31573233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 23653079 - 23653230
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23653079 agcggtgaggacttatgtcctgataa--atgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttg 23653175  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23653176 ttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 23653230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 20973966 - 20974201
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  | ||| |    
T  20973966 gtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatataaacaagcgggtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctagaaag 20974065  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcgg 543  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |  |||||    
T  20974066 ccttatagttcaaagcggtggaacacaagttgttcaaagcggtgtttagcgatgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattctattagcgg 20974165  T
Q  544 tgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    || |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  20974166 tgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcat 20974201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 375 - 489
Target Start/End: Original strand, 21300114 - 21300229
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  21300114 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccttggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactt 21300213  T
Q  474 gttgttcaaagcggtg 489  Q
    ||||||||||||||||    
T  21300214 gttgttcaaagcggtg 21300229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 19988159 - 19988367
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataa-aagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||  ||| ||||| |||    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19988159 agttgtatgtagatatacactagtgggtcagttgcaaaagcatatgaagcgggagggctctttccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacatt 19988258  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  19988259 ttgttgttgaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccct-aaatatggta 19988357  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  19988358 ccacatgcat 19988367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 632
Target Start/End: Original strand, 8728943 - 8729240
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagag--ctt 432  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||   |  |||  |||    
T  8728943 tggagtcataagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaaacgatgaggactt 8729041  T
Q  433 cggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaa 529  Q
    |||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  |||||||||    
T  8729042 cggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaacactatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaa 8729140  T
Q  530 ccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatga 629  Q
    |||||| | | || || |||   |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8729141 ccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatga 8729237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 451
Target Start/End: Original strand, 22176003 - 22176105
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  22176003 gtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaa--gggagagattcggctctggaacgc 22176100  T
Q  447 cttgt 451  Q
    |||||    
T  22176101 cttgt 22176105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23653924 - 23653773
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  23653924 agcggtgaggacttatgtcctaatga--atgctttaaccattctattagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttc 23653828  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    | | |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23653827 ttgaggagtc-taggggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 23653773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 24321570 - 24321819
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  24321570 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 24321669  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| |||   ||||    
T  24321670 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctgt--tatg 24321766  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  24321767 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 24321819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 576 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 21930618 - 21930525
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  21930618 tgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaaattgccatattgttgatgatg 21930525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 453 - 632
Target Start/End: Original strand, 27942223 - 27942401
Alignment:
Q  453 gttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataa---tgctttaaccattcgacagcggtgtgg 548  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||  |||||| |||||||||||| ||   || ||||||||||| | | ||||| ||    
T  27942223 gttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgttaatggg--aggactcatgtcctgatgaaaagaatgttttaaccattctataacggtgagg 27942320  T
Q  549 gtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |   |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  27942321 gcttcggctctga--tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagttgagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 27942401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 632
Target Start/End: Original strand, 8596070 - 8596318
Alignment:
Q  384 agatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttc 480  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||| | |||||||    
T  8596070 agatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaacacgatgttgttc 8596169  T
Q  481 aaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgca 579  Q
    ||| || |||| | || |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| | | || || | |   |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  8596170 aaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctga--tatggtaccacatgca 8596266  T
Q  580 tagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    || ||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  8596267 taattgcatttgttgaggagtcttagaagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 8596318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 493 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 39363565 - 39363417
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat------agttg 585  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||      |||||    
T  39363565 agcggtgaggacctgggtcctgatga--atgttttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatgtgtccagttg 39363469  T
Q  586 caattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 637  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39363468 catttgtcgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcattgt 39363417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Original strand, 21683620 - 21683749
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagctt 432  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| || || |||     
T  21683620 atggagttgtaagtcatatacatatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcggcagggctc 21683718  T
Q  433 cggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
      || |||||||||||||| |||||||||||    
T  21683719 ttgccttggaacgccttgtcgttcaaagcgg 21683749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Original strand, 21687969 - 21688098
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagctt 432  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| || || |||     
T  21687969 atggagttgtaagtcatatacatatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcggcagggctc 21688067  T
Q  433 cggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
      || |||||||||||||| |||||||||||    
T  21688068 ttgccttggaacgccttgtcgttcaaagcgg 21688098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 21839463 - 21839390
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  21839463 ggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttggtgttggttgaaattgccatattgttgatgatg 21839390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 553 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 25110896 - 25110821
Alignment:
Q  553 cggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatga 629  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25110896 cggccctgaa-tatggtaccacatgcatggctgcatttgtcgaggagtcttaggggtgttgtcatgtcattacatga 25110821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 597 - 647
Target Start/End: Original strand, 20012406 - 20012456
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20012406 gagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgatggttga 20012456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 459
Target Start/End: Original strand, 31412477 - 31412563
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaa 459  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  31412477 gagttgtatgtggatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgagagggcttctgccctggaacgccttgtcgttcaaa 31412563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 459
Target Start/End: Original strand, 31418659 - 31418745
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaa 459  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  31418659 gagttgtatgtggatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgagagggcttctgccctggaacgccttgtcgttcaaa 31418745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 511
Target Start/End: Original strand, 20839893 - 20840032
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||| ||||| ||   | |  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||     
T  20839893 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgtataagtataaaagcgggagggccctgaccatggaacgccttgtcgttcaaagaagtggaacact 20839992  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtc 511  Q
    | ||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||    
T  20839993 ttgttgttcaaagaggtgtttagcaatgaagacttatgtc 20840032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 24321276 - 24321327
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24321276 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaa 24321327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21931161 - 21931031
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgacc-ttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||  |  |||| || | |||||||| |||| | |    
T  21931161 ctgtaagtcggtcgcttaagtgaaccagccttcgcttaagcgaagaaggcctttggtcagccactttttgattttgcttcctccactagggaatccatct 21931062  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  21931061 gagcattctaaaatgtttctttcaacttgta 21931031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19859719 - 19859627
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  19859719 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 19859627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 22743681 - 22743629
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22743681 ggagtcttagcggtgttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 22743629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 21690400 - 21690491
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  21690400 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 21690491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 36445719 - 36445810
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  36445719 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 36445810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 21686300 - 21686358
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21686300 attgtcggggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcattgttgttggttg 21686358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Original strand, 31412606 - 31412695
Alignment:
Q  497 gtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  31412606 gtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcatatttgca 31412695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Original strand, 31418788 - 31418877
Alignment:
Q  497 gtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  31418788 gtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcatatttgca 31418877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23866002 - 23865950
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23866002 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaag 23865950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 20783840 - 20783931
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| |||| |||||||||   ||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  20783840 agttgtatgtagatatacacaaggggagtcagttgcataagcatataaagcgggagagctcttgccctggaacgcgttgtcgttcaaagcgg 20783931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21839865 - 21839798
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgacc-ttagtcagccactttt 93  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  21839865 ctgtaagtcggtcgcttaagcgaaccagccttcacttaagcgaagaaggcctttggtcagccactttt 21839798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16259726 - 16259633
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagt-gggttagtcgcataagcat--aaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||  ||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  16259726 gagttgtatgtagatatacacaagtagagttagttacataagcataaaaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttctaagcgg 16259633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 21683875 - 21683933
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  21683875 attgtcgaggagtcttagtggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttattggttg 21683933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 21688224 - 21688282
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  21688224 attgtcgaggagtcttagtggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttattggttg 21688282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 21690624 - 21690682
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21690624 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcattgttgttggttg 21690682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 643
Target Start/End: Original strand, 14416689 - 14416765
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttgg 643  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  14416689 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttattgttgg 14416765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 645
Target Start/End: Original strand, 22522104 - 22522141
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22522104 gtgttgtcatgtcattgcctaagtcgttgttgttggtt 22522141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 3697614 - 3697566
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3697614 gtcttagcggtgttgtaatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 3697566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15267057 - 15267017
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15267057 gtgttgtcgtgtcattgcataagtcgttgttattggttgaa 15267017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 30767157 - 30767205
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30767157 gtcttagcggtgttgttatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 30767205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 43687414 - 43687337
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | | || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43687414 tggtaccacatgcatatctgca-ttattgaggggtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagtc-ttgttgttggttg 43687337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 649
Target Start/End: Original strand, 19663794 - 19664375
Alignment:
Q  68 gaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattata 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19663794 gaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagtatttctaagtgttccttttaacttgtaagaccattata 19663893  T
Q  168 tgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatgaatttgtggattgaagtgagtgtgaa-ccaagtgaaaagatgttgc 266  Q
    | ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |    
T  19663894 tataccctgaatcctactaaacacattgttaa-tcgagtgggtatagtttaatgaatttgtggattgaagtgggtatgaaaccaagtgaaaatatgttac 19663992  T
Q  267 gttgaatgacttgatgtattagtatgattgacattaattatacatttt-ctgatgttggattggttgagatggagtcgtatgtcatatacatacatacgc 365  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  19663993 attgaatgacttgatgttttagtatgattaacattaattatacatttttctgatgttggattggttgtgatgaagttgtatgtcatatatatacatatgc 19664092  T
Q  366 attagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19664093 attagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcattaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 19664192  T
Q  466 gaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaata 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||| ||||    
T  19664193 gaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgatagcagtgagggctccggccctg-aata 19664291  T
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19664292 tggtaccacatgcatagctgcatttgttgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattacatgagttgttgttgttggttgaat 19664375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Original strand, 20438502 - 20438716
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20438502 gagttgtatgtagagatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 20438601  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20438602 agttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtacc 20438701  T
Q  573 acatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||    
T  20438702 acatgcatagttgca 20438716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18712196 - 18711883
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaacctt-gcctcgtgcactaggggat 119  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18712196 actttctgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccaccttttgaacttttgcctcgtgcactaggggat 18712097  T
Q  120 ccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaa 219  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |  | |||||    
T  18712096 tcttttgagtatttttaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctacttaacacattgtt-aatcgaattggtggaatttaa 18711998  T
Q  220 tgaatttgtggattgaagtgagtgtg-aaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaattataca-ttttct 316  Q
    |||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  18711997 tgaattttcggattggagtgagtatgaaaccaagtgaaaatatactatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattgttattaattatacatttttct 18711898  T
Q  317 gatgttggattggtt 331  Q
    |||||||||||||||    
T  18711897 gatgttggattggtt 18711883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 350 - 587
Target Start/End: Original strand, 42095851 - 42096087
Alignment:
Q  350 atatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgcctt 449  Q
    ||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42095851 atatatatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgcctt 42095949  T
Q  450 gttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 548  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42095950 gtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 42096049  T
Q  549 gtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  42096050 gtcacggccctg-attatggtaccacatgcatatttgca 42096087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 21542271 - 21542049
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  21542271 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 21542173  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21542172 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 21542074  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  21542073 ttatggtaccacatgcatatttgca 21542049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 347 - 581
Target Start/End: Original strand, 20045824 - 20046057
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  20045824 gtcatataaatacatacgtaatagtatagttgtatgtagatatacacaggttgggtagtttcataaacatcaa-gcgggagagcttcggctctggaacgc 20045922  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgt 546  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20045923 ctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattctacagcggtgt 20046022  T
Q  547 gggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcata 581  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20046023 gggtcacggccctgaattatggtaccacatgcata 20046057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 41111021 - 41110807
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41111021 gagttgtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 41110922  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||| |    
T  41110921 agtcgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcatgctgagaatgctttaaccattcgacaatggtgtgggtcatgaccctgaattatggtatc 41110822  T
Q  573 acatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||    
T  41110821 acatgcatagttgca 41110807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 336 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 32650345 - 32650102
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32650345 tggagtcataagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcg 32650247  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  32650246 gctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacattagttgttcaaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccatt 32650147  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    ||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32650146 cgacaacggtgtgggctacggtcctg-aatatggtaccacatgcat 32650102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 535
Target Start/End: Original strand, 29554387 - 29554578
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||  ||||||    
T  29554387 gtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 29554486  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc 535  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  29554487 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 29554578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 27280393 - 27280192
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||| ||||||  |||||||     
T  27280393 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtactagtta 27280294  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  27280293 ctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 27280195  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  27280194 cat 27280192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 373 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 20242740 - 20242599
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20242740 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcatttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcact 20242641  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg 514  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20242640 agttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctg 20242599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Original strand, 23066673 - 23066842
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  23066673 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 23066772  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcgg 543  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||    
T  23066773 ttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcgg 23066842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 3706707 - 3706939
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || |  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3706707 gtcatatacatatatatgcataggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgc 3706806  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  3706807 cttgtcgttcaaagtggtggagcactaattgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtg 3706905  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
     |||  |||| |||| | | |||||||||||||||    
T  3706906 agggctacggtcctg-attttggtaccacatgcat 3706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 19778430 - 19778639
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||| || |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19778430 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 19778529  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg--atgataatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||   || ||||| | ||||||    
T  19778530 agttgttcaaagctgtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgaacagcggtgagggctgcgaccctg-attatggt 19778628  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  19778629 accacatgcat 19778639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 19961370 - 19961135
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||||   ||||||    
T  19961370 gtcatataaatacatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcggtgagggcctcggtcctggaac 19961271  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagc 541  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||   | |||||||||||||||| | |||    
T  19961270 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcgaagcggtgtt-agcggtgaggactcatgtccggataaaagaatgctttaaccattctatagc 19961172  T
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  19961171 ggtgagggctccggctctg--atatggtaccacatgcat 19961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 20941826 - 20942034
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||  |||   ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20941826 agttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcatataaagcgggaaggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 20941925  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
      |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||  | ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  20941926 ttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctgaaatgaatgctttaaccattcaaatagcggtgagggctccggccctg-aatatggta 20942024  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  20942025 ccacatgcat 20942034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 16883510 - 16883719
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaa-gcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16883510 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaaagcggtggaacac 16883609  T
Q  472 ta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  16883610 tttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctg-aatatggt 16883708  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||| ||||||    
T  16883709 accatatgcat 16883719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 376 - 515
Target Start/End: Original strand, 20838140 - 20838280
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataa-aagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | |    
T  20838140 ttgtatgtggatatacacaagtgggttagttgcataagcataataagcgggagggattctgccctggaatgccttgtcgttcaaagtggtggaacatttg 20838239  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctga 515  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20838240 ttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctga 20838280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 22448241 - 22448440
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggt----tagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    || | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  22448241 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcaattaattgcataagcataaaagtagaagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagca 22448340  T
Q  471 ctagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    ||||||| ||||          || |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| | ||||||    
T  22448341 ctagttgctcaa----------agtggtgaggacttatgtcctgtaaatgaatgctttaaccattcaacagcggtgagggctacggccctg-attatggt 22448429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 374 - 489
Target Start/End: Original strand, 20824329 - 20824445
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataa-aagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20824329 agttgtatgtagatatacacaagtaggttagttgcataagcataataagcgggagggcttctgctctagaacgccttgtcgttcaaagaggtggaacact 20824428  T
Q  473 agttgttcaaagcggtg 489  Q
     ||||||||||||||||    
T  20824429 tgttgttcaaagcggtg 20824445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 347 - 465
Target Start/End: Original strand, 955010 - 955128
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  955010 gtcatatacatatatatgcatgggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagtagcatgagcataaaagtggaagagcttcggctctggaacgc 955109  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  955110 cttgtcgttcaaagtggtg 955128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11157553 - 11157454
Alignment:
Q  58 tcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  11157553 tcgcttaagcgaagatgaccttagtcaaccactttttgaactttgcctcgtgcattaggggatccttttgagcatttaaaaatgtttctttcaacttgta 11157454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 555 - 647
Target Start/End: Original strand, 21987118 - 21987210
Alignment:
Q  555 gccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21987118 gccctgtaaaatggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttgattga 21987210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Original strand, 24108965 - 24109082
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  24108965 gtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagggcttctgccctggaacg 24109064  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||| |||||||||||    
T  24109065 ccttgtcgttcaaagcgg 24109082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 36615018 - 36614870
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  36615018 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaagcggtgagggtttcggccctg--ttttggtaccacatgcataattgcatttat 36614923  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36614922 tgaggggtcttagtggtgtcttcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 36614870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 16371746 - 16371497
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||| || | ||||| ||||||| ||||||| || |||| ||    
T  16371746 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttgggttctggaaagccttgtcgttcaaaacgatggagca 16371647  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  16371646 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggacttatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 16371550  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  16371549 gtaccacatgcatggttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 16371497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 20852033 - 20852282
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  20852033 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 20852132  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| |||   ||||    
T  20852133 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctgt--tatg 20852229  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  20852230 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 20852282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 20858659 - 20858908
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  20858659 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 20858758  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| |||   ||||    
T  20858759 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctgt--tatg 20858855  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  20858856 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 20858908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 21732683 - 21732569
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | ||||| |||  |||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21732683 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-gcgggagggctctggccctagaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacact 21732585  T
Q  473 agttgttcaaagcggt 488  Q
     |||||||||||||||    
T  21732584 tgttgttcaaagcggt 21732569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 19666701 - 19666791
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19666701 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgttgttcaaagcgg 19666791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 21705431 - 21705182
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  21705431 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 21705332  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| |||   ||||    
T  21705331 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctgt--tatg 21705235  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  21705234 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 21705182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 493 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 11157047 - 11156904
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |  || |||| |||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11157047 agcggtgaggacttatgtcctgaacg-aatgctttaaccattcaattagtggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacacgcatagttgcacttg 11156950  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 637  Q
    | | |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11156949 ttgaggagtcttggaagtgtagtcatgttattgcatgagtcgttgt 11156904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 23195568 - 23195732
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23195568 agcggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatatttgcatttg 23195664  T
Q  592 tcggggagtct------------tagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    | | |||||||            ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23195665 ttgaggagtctaaggtgttgtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 23195732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21664370 - 21664280
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  21664370 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 21664280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 22030361 - 22030491
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaa-ccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||   |||| || |||||||||  ||||||||    
T  22030361 ctgtaagccagtcgcttaagcgagccagccttcgcttaagcgaagaaggtcttagtcagccactttttaatttttgcttcttgcactaggaaatcctttt 22030460  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  22030461 gagcattctataatgtttctttcaacttgta 22030491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 43088474 - 43088326
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  43088474 agcggtgaggacttatgtcctaatga--atactttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctgt--tttggtaccacatgcataattgcatttat 43088379  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  43088378 tgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgatgttggttg 43088326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Original strand, 15316447 - 15316565
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||    
T  15316447 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 15316546  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    || |||| |||||||||||    
T  15316547 gcattgtcgttcaaagcgg 15316565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19853241 - 19853151
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  19853241 agttgtatgtagatatacacaattggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 19853151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19859376 - 19859286
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  19859376 agttgtatgtagatatacacaattggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 19859286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19961622 - 19961521
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcattt 133  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19961622 ggtcgcttaagcgagctacccttcgcttaagcga-gatgagccttagtcagcctctatctgaactttgcttcgtgcactaggggacccttttgagtattt 19961524  T
Q  134 tta 136  Q
    |||    
T  19961523 tta 19961521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 20108731 - 20108783
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20108731 ggagtcttagtggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 20108783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20849037 - 20848958
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20849037 tggtaccacatgcattgttgca-ttgtcgaggagtcttagcggtgttgtccagtagttgcatgagtcattgttgttggttg 20848958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 602
Target Start/End: Original strand, 23195443 - 23195675
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||  | ||       
T  23195443 agttgtatgtagatatacacatgtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgggaggactaa 23195542  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttg-----agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
     ||  |  ||  |  |||||     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||   |||||||| |||||    
T  23195543 tgtcatgaaacaccttgttgttcaaagcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccctg-aatat 23195639  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtct 602  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  23195640 ggtaccacatgcatatttgcatttgttgaggagtct 23195675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 20851738 - 20851789
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20851738 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaa 20851789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 20858365 - 20858416
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20858365 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaa 20858416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21705725 - 21705674
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21705725 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaa 21705674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21710268 - 21710217
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21710268 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaa 21710217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 49328115 - 49327945
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  49328115 agcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttggtaccacatgcataattgcatttat 49328021  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||    
T  49328020 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggtggtaattgttataatgatgatgatg 49327945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 463
Target Start/End: Original strand, 20086446 - 20086540
Alignment:
Q  370 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||| |||||||| ||||| ||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  20086446 gtggagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataaacataaaagcgggagggcttatgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 20086540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24079637 - 24079544
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24079637 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcatatttgca 24079544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 24079790 - 24079672
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcat-aaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||    
T  24079790 gtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtaggtatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaaagcgggagggcttctgccctggaac 24079691  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||| | | |||||||||||    
T  24079690 gccatatcgttcaaagcgg 24079672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Original strand, 24109117 - 24109210
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24109117 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcatatttgca 24109210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 41111323 - 41111277
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41111323 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 41111277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11157255 - 11157127
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||| ||||| |||      
T  11157255 atggagtcgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcatgaaagcgggagggctct 11157157  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
     ||  |||||||||| || |||||||||||    
T  11157156 agccctggaacgcctcgtcgttcaaagcgg 11157127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Original strand, 7792987 - 7793047
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7792987 atagttgcatttgttgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtcagtgcatgagtcgttgttg 7793047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 648
Target Start/End: Original strand, 31927611 - 31927671
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31927611 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 31927671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41312125 - 41312073
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41312125 ggagtcttagcggtgttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 41312073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 47484189 - 47484043
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| | |   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  47484189 agcggtgagggcttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaagcggtgagagcttcggtcctg---tttggtaccacatgcataattgcatttat 47484095  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
       || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47484094 taaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtc-ttgttgttggttg 47484043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 576 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 5380698 - 5380635
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5380698 tgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatggatcgttgttg 5380635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 608 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 8682916 - 8682877
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8682916 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttga 8682877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24959877 - 24959826
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24959877 gagtcgtagtggagttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttgaa 24959826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 29535070 - 29535019
Alignment:
Q  439 tggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtg 489  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29535070 tggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtg 29535019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 634
Target Start/End: Original strand, 16669433 - 16669502
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  16669433 tatggtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 16669502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23712461 - 23712403
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23712461 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtctagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 23712403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 647
Target Start/End: Original strand, 25092578 - 25092628
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25092578 gagtcttagcagtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgtcgatggttga 25092628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 580
Target Start/End: Original strand, 955116 - 955219
Alignment:
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    |||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| |||| | | ||||||||||    
T  955116 gttcaaagtggtgtttagtggtgagggcttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagtggtgagggctacggtcctg-attttggtaccaca 955214  T
Q  576 tgcat 580  Q
    |||||    
T  955215 tgcat 955219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 11140970 - 11141062
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagt-gggttagtcgcataagcat-aaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  11140970 gagttgtatgtagatatacacaagtagagttagttacataagcataaaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttctaagcgg 11141062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Original strand, 21734641 - 21734701
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  21734641 atagttgcatttgttgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtcagcgcatgagtcgttgttg 21734701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Original strand, 21745846 - 21745906
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21745846 atagttgcatttgttgaggagtcttagtcgtgtcgtcatgtcagtgcatgagtcgttgttg 21745906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 42096111 - 42096159
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42096111 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 42096159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 21410644 - 21410735
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  21410644 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttttcgttcaaagcgg 21410735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 647
Target Start/End: Original strand, 21529035 - 21529074
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21529035 gtgttgtcatgtcattggataagtcgttgttgttggttga 21529074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21698101 - 21698062
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21698101 ggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 21698062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 24850068 - 24850021
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24850068 gtcttagcagtgttgtcatgtcattgcatgagtcttggttgttggttg 24850021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24475253 - 24475215
Alignment:
Q  610 gttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24475253 gttgtcatgtcattgcatgagttgttgttgttgattgaa 24475215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 30491622 - 30491680
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  30491622 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagttgttgttgttggttg 30491680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20849236 - 20849192
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  20849236 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 20849192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21542017 - 21541977
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21542017 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 21541977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21698308 - 21698280
Alignment:
Q  371 tggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21698308 tggagttgtatgtagatatacacaagtgg 21698280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 143)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 19 - 649
Target Start/End: Original strand, 11389942 - 11390571
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  11389942 cagacttactgtgagtcggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcactaaggg 11390041  T
Q  118 atccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagttt 217  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||   |||||||  |   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  11390042 atccctttgagtatttctaaatgttcctttcaacttgtaaggctattatatacaccctgattcctactaaacacattgttaaa-cgagttggtatagctt 11390140  T
Q  218 aatgaatttgtggattgaagtgagtgtgaacc-aagtgaaaagatgttgcgttgaatgacttgatgtattagtatgattgacattaattatacattt-tc 315  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11390141 aatgaatttc-ggattgaagtgagtatgaaactaagtgaaaatatgttatgttgaatgacttgttgtattggaatgattgtcattaattatacatttctc 11390239  T
Q  316 tgatgttggattggttgagatggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagca 415  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  11390240 tggtgttggattggttgcgatgaagtcgtaggtcatatttatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataatca 11390339  T
Q  416 taaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11390340 taaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctga 11390439  T
Q  516 tgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtc 615  Q
      | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||    
T  11390440 aaagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggctacggtcctg-aacatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagtgg-ggtgtc 11390537  T
Q  616 atgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| | ||||||    
T  11390538 atgtcattacatgagttgttattgtggattgaat 11390571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 19 - 640
Target Start/End: Original strand, 11383454 - 11384074
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11383454 cagacttactgtgagcctgtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcactagggg 11383553  T
Q  118 atccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagttt 217  Q
    |||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||   |||||||  |   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  11383554 atccctttcagtatttctaaatgttcctttcaacttgtaaggctattatatacaccctgattcctactaaacacattgttaaa-cgagttggtatagctt 11383652  T
Q  218 aatgaatttgtggattgaagtgagtgtgaacc-aagtgaaaagatgttgcgttgaatgacttgatgtattagtatgattgacattaattatacattt-tc 315  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11383653 aatgaatttc-ggattgaagtgagtatgaaactaagtgaaaatatgttatgttgaatgacttgttgtattggaatgattgtcattaattatacatttctc 11383751  T
Q  316 tgatgttggattggttgagatggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagca 415  Q
    || |||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  11383752 tggtgttggattggttgcggtgaagtcgtaggtcatatttatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataatca 11383851  T
Q  416 taaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctga 515  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11383852 taaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtggttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttaagtcctga 11383951  T
Q  516 tgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtc 615  Q
      | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||    
T  11383952 aaagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggctacggtcctg-aacatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagtgg-ggtgtc 11384049  T
Q  616 atgtcattgcatgagtcgttgttgt 640  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  11384050 atgtcattacatgagttgttattgt 11384074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 179 - 642
Target Start/End: Original strand, 20328024 - 20328487
Alignment:
Q  179 tcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatgaatttgtggattgaagtgagtgtgaacc-aagtgaaaagatgttgcgttgaatgact 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  |||||||| ||| | |||| | ||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  20328024 tcctactaaacacattgttaaa-cgagtcggtatagcctaatgaatttc-ggattgaattgattatgaaactaagtgaaaatatgttatgttgaacgact 20328121  T
Q  278 tgatgtattagtatgattgacattaattatacattttct--gatgttggattggttgagatggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggag 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||| |||||||| |||    
T  20328122 tgatgtattagtatgattgtcattgattatacattttctctggtgttgaattggttgcggtgaagtcgtaggtcatatttatatatatgcattagttgag 20328221  T
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20328222 ttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 20328321  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||    
T  20328322 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggctacggtcctg-tatatggtaccaca 20328420  T
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttg 642  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  20328421 tgcatagtagcatttgtcgaggggtcttagaggtgttgtcatgtcattacatgaattgctgttgttg 20328487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 373 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16676398 - 16676124
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16676398 gagttgtatgtagatatacataagtgggttggttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 16676299  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  16676298 agttgttcaaagcggtgtcgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcct-taatatggtacc 16676200  T
Q  573 acatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  16676199 acatgcatagttgcatttatcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgttattgttgattgaat 16676124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 373 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 17650634 - 17650361
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17650634 gagttgtatgtagatatacataagtgggttggttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaa-gcggtggaacact 17650536  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17650535 agttgttcaaagcggtgtcgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcct-aaatatggtacc 17650437  T
Q  573 acatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  17650436 acatgcatagttgcatttatcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgttattgttgattgaat 17650361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 350 - 669
Target Start/End: Original strand, 21231981 - 21232298
Alignment:
Q  350 atatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgcctt 449  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21231981 atatatatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatatacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgcctt 21232080  T
Q  450 gttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 548  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||| | ||    
T  21232081 gtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcattagcgg-gagg 21232179  T
Q  549 gtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21232180 gcttcggccctg-aatatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgttgtcatggcattacatgagtcgttgttgttggtcgaa 21232278  T
Q  649 tcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  21232279 ttgttatatt-ttgatgatgt 21232298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 373 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 18607072 - 18606801
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18607072 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgagagagcttcgactctggaacgccttgtggttcaaagcggtggaacact 18606973  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||    
T  18606972 agtggttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgttctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggctacggtcctg-aacatggtacc 18606874  T
Q  573 acatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18606873 acatgcataattgcatttgttgaggagtcttagaagtgtcgtcatgtcattgcatgagtcgttgtcgttggtt 18606801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 13006513 - 13006299
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13006513 gagttgtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 13006414  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13006413 agttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtacc 13006314  T
Q  573 acatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||    
T  13006313 acatgcatagttgca 13006299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 14421561 - 14421303
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14421561 gagttgtatatagagatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacgct 14421462  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14421461 agttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtacc 14421362  T
Q  573 acatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||| || | | ||||| |||| || |  |||||||| |||||||||||    
T  14421361 acatgcatagttgcatttattgaggagtattaggggggaggtcatgtc-ttgcatgagtc 14421303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Original strand, 21231594 - 21231910
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcc 121  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21231594 actttctgtgagctggtcgcttaagcaaactggtcgtcgcttaagcgaagatgacctttgtcagccacttttgaactttgcctcgtgcactaggggatcc 21231693  T
Q  122 ttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatg 221  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  21231694 ttttgagtatttctaaatgttcctttcaacgtgtaagaccattatatataccctgaatcctactaaacacattgtt-aaccgagttggtataatttaatg 21231792  T
Q  222 aatttgtggattgaagtgagtgtg-aaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaattataca-ttttctga 318  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| || ||  || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  21231793 aattt-tggattggagtgagtatgaaaccaagtgaaaatatattatgtagaatgaacttgatgtattagtatgattgttattaattatacatttttctga 21231891  T
Q  319 tgttggattggttgagatg 337  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  21231892 tgttggactggttgtgatg 21231910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 368 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 11303062 - 11302801
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11303062 tagttgagttgtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgga 11302963  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
      |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | ||    
T  11302962 gtactagttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaaaggtgtgggtcacggccctg-attttg 11302865  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  11302864 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttttcatgtc-ttgcatgagtc 11302801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 376 - 632
Target Start/End: Original strand, 23665802 - 23666055
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  23665802 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 23665901  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    || |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  23665902 tgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctg-attttggtaccaca 23665999  T
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  23666000 tgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 23666055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Original strand, 13123937 - 13124155
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13123937 tagttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataaacatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 13124035  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13124036 acactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggattatg 13124135  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  13124136 gtaccacatgcatatttgca 13124155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 4280178 - 4279956
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  4280178 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 4280080  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4280079 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 4279981  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  4279980 ttatggtaccacatgcatatttgca 4279956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19616510 - 19616288
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  19616510 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 19616412  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19616411 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 19616313  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  19616312 ttatggtaccacatgcatatttgca 19616288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 587
Target Start/End: Original strand, 12591580 - 12591819
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||  || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12591580 gtcatataaatacatatgtaatagtagagttgtatgtagatatacactggttgggtagttgcataatcatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgc 12591678  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgt 546  Q
     | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12591679 ttcgtcgttcaaagcggtggagcactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgt 12591778  T
Q  547 gggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12591779 gggtcacggccctgaattatggtaccacatgcatatttgca 12591819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 376 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 29795932 - 29795679
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29795932 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 29795833  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    || |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||||||||    
T  29795832 tgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtatgggtcacggccctg-gttttggtaccaca 29795735  T
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  29795734 tgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 29795679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 376 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 29799751 - 29799498
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29799751 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 29799652  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    || |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||||||||    
T  29799651 tgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtatgggtcacggccctg-gttttggtaccaca 29799554  T
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  29799553 tgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 29799498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Original strand, 12710866 - 12711084
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||  || || |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12710866 tagttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataaatatcaa-gtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 12710964  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12710965 acactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggattatg 12711064  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  12711065 gtaccacatgcatatttgca 12711084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 13742716 - 13742498
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || || |||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13742716 tagtcgagttgtatgttgatatacacaggttgggtagttgcataaacatcaa-gtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 13742618  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  13742617 acactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtaacggccctaaattatg 13742518  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  13742517 gtaccacatgcataattgca 13742498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 336 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 6412065 - 6411821
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcgg 435  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6412065 tggagtggtaagtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagagggttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcgg 6411966  T
Q  436 ctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccatt 534  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||    
T  6411965 ctctggaacgcattgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcagtgtatagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaacaatt 6411866  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    | ||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  6411865 ctacagcggtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcat 6411821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 14281589 - 14281822
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14281589 gtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaatgc 14281688  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  14281689 cttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtg 14281788  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
     |||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14281789 agggctacggccctg-attatggtaccacatgcat 14281822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 35962709 - 35962914
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  35962709 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 35962808  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | | ||||||||    
T  35962809 ttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attttggtacca 35962907  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  35962908 catgcat 35962914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 580
Target Start/End: Original strand, 11220079 - 11220290
Alignment:
Q  371 tggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11220079 tggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagttgcagaagcataaaagtgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaac 11220178  T
Q  470 actagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  | ||||||| |||   |||||||| | ||||    
T  11220179 actagttgttcaaagcggtgttaagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaaatagcggtgagggcttcggccctg-attatg 11220277  T
Q  568 gtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||    
T  11220278 gtaccacatgcat 11220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 15339030 - 15338826
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  15339030 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 15338931  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | | ||||||||    
T  15338930 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attttggtacca 15338833  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  15338832 catgcat 15338826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 15723188 - 15723392
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  15723188 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 15723287  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | | ||||||||    
T  15723288 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attttggtacca 15723385  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  15723386 catgcat 15723392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 373 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 1612830 - 1612623
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1612830 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttggataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacac 1612731  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    || ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | |||||||    
T  1612730 tatttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgggggctacggtcctg-attatggta 1612633  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  1612632 ccacatgcat 1612623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 375 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19600046 - 19599844
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  19600046 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgtataagcataatagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggatcactag 19599947  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  19599946 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaataaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 19599849  T
Q  574 catgc 578  Q
    |||||    
T  19599848 catgc 19599844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Original strand, 20311657 - 20311796
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggga 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20311657 cagacttactgcaagccggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaagatgacctcagttagccacttttgaactttgcctcgtgcactagggga 20311756  T
Q  119 tccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaag 158  Q
    ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  20311757 tccctttgagtatttctaaatgttcctttcaacttgtaag 20311796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 23201479 - 23201679
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||     
T  23201479 gtatgtggatatactcaaggggattagttgcataaacataaaagtgagagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtta 23201578  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23201579 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 23201676  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  23201677 cat 23201679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 23507606 - 23507806
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||     
T  23507606 gtatgtggatatactcaaggggattagttgcataaacataaaagtgagagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtta 23507705  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23507706 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 23507803  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  23507804 cat 23507806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 15710964 - 15711168
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||    
T  15710964 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggatctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagtactag 15711063  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | | ||||||||    
T  15711064 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgatttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attttggtacca 15711161  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  15711162 catgcat 15711168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 379 - 580
Target Start/End: Original strand, 16109044 - 16109243
Alignment:
Q  379 tatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgt 478  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||     
T  16109044 tatgtagat-tacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgc 16109142  T
Q  479 tcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||||||    
T  16109143 tcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtaccacatg 16109240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 376 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 14432192 - 14431989
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14432192 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 14432093  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    || |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | | |||||||||    
T  14432092 tgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attttggtaccac 14431995  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  14431994 atgcat 14431989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 806973 - 807174
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtggg-ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  806973 gtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 807072  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  807073 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 807170  T
Q  577 gcat 580  Q
    ||||    
T  807171 gcat 807174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 147277 - 147016
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  || |||  | ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  147277 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaca 147178  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat---gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    | |||||||||||||||| | | ||||| |||   |||| |||  ||||    
T  147177 ctatgttgttcaaagcggtgtt-aacggtgaggactcatgtcctgataaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggcttcggctctg--atat 147081  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  147080 ggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 147016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 11631940 - 11632117
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  11631940 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 11632037  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  11632038 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 11632117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 18049230 - 18049407
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  18049230 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagaggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 18049327  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  18049328 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 18049407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 18055709 - 18055886
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  18055709 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 18055806  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  18055807 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 18055886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 20579941 - 20580118
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  20579941 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 20580038  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20580039 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcat 20580118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 31154600 - 31154316
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  || |||  | ||||   ||||||    
T  31154600 gtcatataagtacatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagtcgcataa-catgaaaacggtgaggacctcggtcctggaac 31154503  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatg---ataatgctttaaccattcgacag 540  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||  |||||| ||||||||||    | |||||||||||||||| | |     
T  31154502 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgataatggg--aggactcatgtcctgatataaagaatgctttaaccattctataa 31154405  T
Q  541 cggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  31154404 cggtgagggcctcggccctga--tatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggagtcgtcatgtca-tgcatgagtc 31154316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13678905 - 13678799
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13678905 ctgtaagccggtcgcttaagcgaaccagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcattaggggatcctttt 13678806  T
Q  126 gagcatt 132  Q
    |||||||    
T  13678805 gagcatt 13678799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16676774 - 16676660
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16676774 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagtcgtcgcttaagcgaagttgaccttagtcagccactttttgaacgttgcctcgtgcattagggg 16676675  T
Q  118 atccttttgagcatt 132  Q
    | |||||||||||||    
T  16676674 acccttttgagcatt 16676660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17651010 - 17650896
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17651010 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagtcgtcgcttaagcgaagttgaccttagtcagccactttttgaacgttgcctcgtgcattagggg 17650911  T
Q  118 atccttttgagcatt 132  Q
    | |||||||||||||    
T  17650910 acccttttgagcatt 17650896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 373 - 535
Target Start/End: Original strand, 3289749 - 3289911
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| ||   |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3289749 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtagaacac 3289848  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattc 535  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  3289849 ttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctgaatg--aatgctttaaccattc 3289911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 14320533 - 14320782
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  || |||  | ||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14320533 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcgatggaaca 14320632  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatg---ataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    ||| |||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||| | | ||||| |||   ||||||||  ||||    
T  14320633 ctatgttgttcaaagcggtgttaa--tgggaggactcatgtcctgatgaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggctccggccctg--atat 14320728  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  14320729 ggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 14320782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 376 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14128374 - 14128244
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14128374 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 14128275  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggactta 507  Q
    || |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  14128274 tgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggactta 14128244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 376 - 465
Target Start/End: Original strand, 36306032 - 36306121
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36306032 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 36306121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 14565917 - 14565668
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||  || |||  | ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14565917 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcgttgcataagcataaaaacggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacac 14565818  T
Q  472 ta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat----gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    || |||||||||||||||||| |   | ||||||| ||||||||||     | |||||||||||||||| | | ||||| |||   |||| |||  ||||    
T  14565817 tatgttgttcaaagcggtgttaa--tgggaggactcatgtcctgataaaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggcttcggctctg--atat 14565722  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  | |||||||||||    
T  14565721 ggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc 14565668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 555 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19145591 - 19145498
Alignment:
Q  555 gccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19145591 gccctgtaaaatggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 19145498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 555 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20744990 - 20744897
Alignment:
Q  555 gccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20744990 gccctgtaaaatggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 20744897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 18872075 - 18871815
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  18872075 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 18871976  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  18871975 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 18871879  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  18871878 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 18871815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 495 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 13678366 - 13678217
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  || |||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13678366 cggttaggacttatgtcctga--atgaatgctttaaccattcaattagaggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttgt 13678270  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
     | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13678269 tgaggagtcttagaagtgtcgtcatgtcattgcatgagtcgttgtcgttggtt 13678217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Original strand, 18958367 - 18958484
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||    
T  18958367 gtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagagcttctgccctggaacg 18958466  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||| |||||||||||    
T  18958467 ccttgtcgttcaaagcgg 18958484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 15166984 - 15166723
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagag--cttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||   |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  15166984 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaac 15166885  T
Q  470 acta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    |||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  |||    
T  15166884 actatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tat 15166788  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15166787 ggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 15166723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 20907328 - 20907577
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  20907328 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgccttgtcgttcaaaacgatggaaca 20907427  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   || | ||||  ||||    
T  20907428 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcgactctga--tatg 20907524  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  20907525 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 20907577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 46625402 - 46625272
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccact-tttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  46625402 ctgtaagcaggtcgcttaagcgagccagccgtcgcttaagcgaagtaggtcttagtcagccactctttgaattttgtttcgtgcactagggaatcctttt 46625303  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  46625302 gagcattttaaaatgtttctttcaacttgta 46625272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 3858324 - 3858583
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  3858324 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 3858423  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat-gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||  ||||||    
T  3858424 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctg--atatgg 3858520  T
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  3858521 taccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagaagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 3858583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 555 - 639
Target Start/End: Original strand, 14266155 - 14266239
Alignment:
Q  555 gccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266155 gccctgtaaaatggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 14266239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 2966140 - 2965891
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  2966140 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 2966041  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| |||   ||||    
T  2966040 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctgt--tatg 2965944  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  2965943 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggggttgtcatgtc 2965891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 37244273 - 37244363
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  37244273 gagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagggcttctgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 37244363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Original strand, 15085861 - 15085978
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  15085861 gtcatatacatatatatgcatttgatcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcccatatgcataaaagcgggagggcttctgccctggaacg 15085960  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||| |||||||||||    
T  15085961 ccttgtcgttcaaagcgg 15085978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 555 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19151893 - 19151800
Alignment:
Q  555 gccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||  || ||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19151893 gccctgtaaaatggtaccacatgcatagtcacatttgttaaggagtcttagtggtgttgtcgtgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 19151800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 555 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20751292 - 20751199
Alignment:
Q  555 gccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||  || ||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20751292 gccctgtaaaatggtaccacatgcatagtcacatttgttaaggagtcttagtggtgttgtcgtgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 20751199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Original strand, 26289706 - 26289823
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  26289706 gtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagggcttctgccctggaacg 26289805  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  26289806 ccttgtcattcaaagcgg 26289823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 555 - 639
Target Start/End: Original strand, 14255879 - 14255963
Alignment:
Q  555 gccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14255879 gccctgtaaaatggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgttattgcatgagtcgttgttg 14255963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Original strand, 14178947 - 14179065
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |||  ||||||    
T  14178947 gtcatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctctggccctggaac 14179046  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14179047 gccttgtcgttcaaagcgg 14179065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 16008293 - 16008044
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  16008293 gagttgtatgtagatatatacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgccttgtcgttcaaaacgatggagca 16008194  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  16008193 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 16008097  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  16008096 gtaccacatgcatggttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 16008044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 2464521 - 2464262
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  2464521 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 2464422  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| | | || || | |   || | ||||  |||||    
T  2464421 cgatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcgactctga--tatgg 2464325  T
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  2464324 taccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagaagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 2464262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 567 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 46624855 - 46624783
Alignment:
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46624855 ggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagaggtgttgtgatgtcattgcatgagtcgtcgttg 46624783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 461
Target Start/End: Original strand, 16952175 - 16952290
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| |||||  |  |||||||    
T  16952175 gtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgagagggcttctaccctggaacg 16952274  T
Q  446 ccttgttgttcaaagc 461  Q
    |||||| |||||||||    
T  16952275 ccttgtcgttcaaagc 16952290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 465
Target Start/End: Original strand, 832950 - 833043
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  832950 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggccttggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 833043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 465
Target Start/End: Original strand, 1198130 - 1198223
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1198130 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggccttggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 1198223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 489
Target Start/End: Original strand, 16187655 - 16187810
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| ||       
T  16187655 atggagtcgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaagttgtacgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggccct 16187753  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact-agttgttcaaagcggtg 489  Q
    |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16187754 ggccctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactctgttgttcaaagtggtg 16187810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3328038 - 3327920
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagt-gggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||||    
T  3328038 gtcatatacatatatatgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagtagagtcagttgcataagcataaaagcgggaggacttttgccctggaac 3327939  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  3327938 gccttgtcgttcaaagcgg 3327920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 597 - 647
Target Start/End: Original strand, 41783304 - 41783354
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41783304 gagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgatggttga 41783354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 461
Target Start/End: Original strand, 836993 - 837082
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagc 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  836993 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggctctggaacgccttgtcgttcaaagc 837082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 461
Target Start/End: Original strand, 1202173 - 1202262
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagc 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1202173 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggctctggaacgccttgtcgttcaaagc 1202262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 12591316 - 12591377
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagc 86  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12591316 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagtgaaccttagtcagc 12591377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13743097 - 13743029
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagcc 87  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13743097 cagacctactataagccggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag-tgagccttagtcagcc 13743029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16090535 - 16090407
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggg 116  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||   ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  16090535 cagacctactgtaagatggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaa-ctgagtgttagtcagcctttttctgaaccttgcttcgtgcactaagg 16090437  T
Q  117 gatccttttgagcatttttagatgttcctt 146  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||    
T  16090436 gatccttttgagtacttctaggtgttcctt 16090407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 465
Target Start/End: Original strand, 14945836 - 14945928
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||| ||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14945836 agttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataaacatataaagcgggagggctttttccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 14945928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Original strand, 15086013 - 15086105
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||   | |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15086013 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcagccctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 15086105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 465
Target Start/End: Original strand, 15373429 - 15373521
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||| ||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15373429 agttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataaacatataaagcgggagggctttttccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 15373521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 3327885 - 3327778
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||| |||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3327885 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaaagcggtgagggctttggccctg-aatatggtaccacatgcatatttgcatttg 3327789  T
Q  592 tcggggagtct 602  Q
    | | |||||||    
T  3327788 ttgaggagtct 3327778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 32771580 - 32771473
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  32771580 agcggtgagggcttatgccctgatga--atgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatatttgcatttg 32771484  T
Q  592 tcggggagtct 602  Q
    | | |||||||    
T  32771483 ttgaggagtct 32771473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13006815 - 13006769
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13006815 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 13006769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 580 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 11312293 - 11312224
Alignment:
Q  580 tagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11312293 tagttgcatttgtcgaggagtcttggtggtgttgtcatgccattgcatgagtcattgttggtgattgaat 11312224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 29181714 - 29181842
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgacc-ttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggg 116  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||   |||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  29181714 cagacctactgtaagatggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcaaac-tgagtgttagtcagtctttttctgaaccttgcttcgtgcactaagg 29181812  T
Q  117 gatccttttgagcatttttagatgttcctt 146  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  29181813 gatccttttgagcacttctaggtgttcctt 29181842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Original strand, 12202268 - 12202308
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12202268 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttgaa 12202308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Original strand, 14169473 - 14169525
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14169473 gtcatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtgg 14169525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Original strand, 14320240 - 14320347
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggat 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  14320240 actttctgtgagccggtcgcttaagcgagctacccttcgcttaagcgaa-ctgagccttagtcagcctttttctgaaccttgtttcctgcactaggggac 14320338  T
Q  120 ccttttgag 128  Q
    |||||||||    
T  14320339 ccttttgag 14320347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15689806 - 15689766
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15689806 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttgaa 15689766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15697399 - 15697359
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15697399 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttgaa 15697359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15704379 - 15704339
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15704379 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttgaa 15704339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 16090037 - 16089981
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||    
T  16090037 tatggtaccacatgcatagttgcaattgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc 16089981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Original strand, 16575613 - 16575673
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||| ||| |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575613 atagtcgcatttgttgaggagtcatagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 16575673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 16590049 - 16589989
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||| ||| |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590049 atagtcgcatttgttgaggagtcatagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 16589989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 620
Target Start/End: Original strand, 29182212 - 29182268
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||    
T  29182212 tatggtaccacatgcatagttgcaattgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc 29182268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 587
Target Start/End: Original strand, 36306109 - 36306220
Alignment:
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||| || |||| |||   ||| | || |||||||||||||    
T  36306109 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgactagtggtgagggcttcggtcttg-aatatggtaccac 36306207  T
Q  575 atgcatagttgca 587  Q
    ||||||| |||||    
T  36306208 atgcatatttgca 36306220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 587
Target Start/End: Original strand, 37244400 - 37244491
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  37244400 cggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcatatttgca 37244491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 608 - 647
Target Start/End: Original strand, 12208882 - 12208921
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12208882 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttga 12208921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14348560 - 14348509
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348560 gagtcgtagtggggttgtcatatcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 14348509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Original strand, 16668748 - 16668799
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16668748 gagtcgtagtggagttgtcatatcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 16668799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 600 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 23442233 - 23442194
Alignment:
Q  600 tcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23442233 tcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 23442194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 46682157 - 46682248
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  46682157 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 46682248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12547408 - 12547358
Alignment:
Q  349 catatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12547408 catatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtgg 12547358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Original strand, 18958519 - 18958612
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  18958519 agcggtgaggacttatgtcatgatg--aatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcatatttgca 18958612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 19439394 - 19439249
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | || ||||||||||||| ||||| || |    
T  19439394 agcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttgataccacatgcataattgcatttat 19439300  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggt 644  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19439299 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggt 19439249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 42041288 - 42041238
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42041288 gagtcttagcagtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgtcgatggttga 42041238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 45185442 - 45185384
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45185442 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 45185384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 11308985 - 11308928
Alignment:
Q  580 tagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 637  Q
    |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11308985 tagttgcatttgtcgaggagtcttggtggtgttgtcatgccattgcatgagtcattgt 11308928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 12694564 - 12694515
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12694564 ggagtcttagcggtgttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggtt 12694515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13678575 - 13678447
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtg-ggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || |||  |||||||||||||| ||||| |||      
T  13678575 atggagtcgtaagtcatatatacatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacgcaagtgaagtcagttacataagcataaaagagggagggctct 13678477  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||  |||||||||| ||  ||||||||||    
T  13678476 ggccctggaacgcctcgtcattcaaagcgg 13678447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 580
Target Start/End: Original strand, 14945916 - 14946020
Alignment:
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| | |||||||||||    
T  14945916 gttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctgtaaatgaatgctttaaccattctattagcggtgagggctccggccctg-attatggtaccac 14946014  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  14946015 atgcat 14946020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 580
Target Start/End: Original strand, 15373509 - 15373613
Alignment:
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| | |||||||||||    
T  15373509 gttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctgtaaatgaatgctttaaccattctattagcggtgagggctccggccctg-attatggtaccac 15373607  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  15373608 atgcat 15373613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 647
Target Start/End: Original strand, 17643131 - 17643168
Alignment:
Q  610 gttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17643131 gttgtcatgtcattgcatgagttgttgttgttggttga 17643168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Original strand, 12710511 - 12710563
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12710511 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaag 12710563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Original strand, 13123582 - 13123634
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13123582 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaag 13123634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Original strand, 21519484 - 21519524
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21519484 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgtcgttgttggttgaa 21519524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 2464814 - 2464763
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2464814 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaa 2464763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 3858031 - 3858082
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3858031 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaa 3858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 10897152 - 10897400
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  10897152 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 10897251  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || ||||    | |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | |  | || |||   |||| |||   ||||    
T  10897252 ctatgttgttcaaaacgatgtt--atgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataaagatgagggcttcggctctg--ttatg 10897347  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||  | |||||||||||    
T  10897348 gtaccacatgcatagttgcatttgttgagaagtcttagtagagttgtcatgtc 10897400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 15104307 - 15104398
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||  ||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  15104307 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggaggactcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 15104398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 15104434 - 15104585
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagc-ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | | |||| |||   | |||||| ||  ||||||||||||||| || | | |||    
T  15104434 agcggtgagggcttatgccctgatga--atgctttaaccattcaatatccggtgagggcttctgccctgtaaattggtaccacatgcattgtcgta-ttg 15104530  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||| |||||||||| |||||||||   |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  15104531 tcgaggagtcttagcggtgttgtcgaatagttgcatgagtcattgttgttggttg 15104585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 586
Target Start/End: Original strand, 16952327 - 16952418
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgc 586  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||| ||    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  16952327 agcggtgaggacttatgtcctga--agaatgctttaaccattcaaacagcggtgaggtcttcggccctg-aatatggtaccgcatgcatatttgc 16952418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12547156 - 12547098
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  12547156 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtggttgcatgagttgttgttgttggttg 12547098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 566 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 13019722 - 13019645
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggt 644  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13019722 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtatcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggt 13019645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Original strand, 16476334 - 16476384
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16476334 ggagtcttagcggtgttgtcaagtagttgcatgagtcgttcttgttggttg 16476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Original strand, 46348719 - 46348773
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggag 427  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  46348719 agttgtacgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 46348773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15142414 - 15142385
Alignment:
Q  370 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15142414 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 15142385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 535
Target Start/End: Original strand, 26289860 - 26289898
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26289860 cggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattc 26289898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 646
Target Start/End: Original strand, 30271898 - 30271972
Alignment:
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||  |||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30271898 taccacatgcataactgca-ttatcgaggggtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagtc-ttgttgttggttg 30271972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 46625059 - 46625014
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  46625059 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 46625014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 4279924 - 4279884
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4279924 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 4279884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 417
Target Start/End: Original strand, 11857669 - 11857713
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  11857669 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 11857713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Original strand, 14581412 - 14581440
Alignment:
Q  371 tggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14581412 tggagttgtatgtagatatacacaagtgg 14581440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16090238 - 16090190
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  16090238 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 16090190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 19616256 - 19616216
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19616256 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 19616216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 29182011 - 29182059
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  29182011 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 29182059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31154767 - 31154735
Alignment:
Q  93 tgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31154767 tgaactttgcctcgtgcactaggggatcctttt 31154735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 32771429 - 32771389
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32771429 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 32771389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 398
Target Start/End: Original strand, 41783042 - 41783070
Alignment:
Q  370 gtggagttgtatgtagatatacacaagtg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41783042 gtggagttgtatgtagatatacacaagtg 41783070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 113)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 58 - 669
Target Start/End: Original strand, 24513457 - 24514093
Alignment:
Q  58 tcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24513457 tcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttaaatgttcctttcaacttgta 24513556  T
Q  157 agatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatgaatttgtggattgaagt------gagtgtgaa-cc 249  Q
    ||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||  |||||| |||      |||| |||| ||    
T  24513557 agaccattatatataccctgaatcctactgaacacattgttaa-tcgagttggtttaatttaatgaaatttcggattggagttggagtgagtatgaaacc 24513655  T
Q  250 aagtgaaaagatgttgcgttgaatga-cttgatgtattagtatgattgacattaattataca-ttttctgatgttggattggttgagatggagt------ 341  Q
    ||| ||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||          
T  24513656 aagcgaaaatatattatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattgctattaattatacagttttctgatgttggattggttgtgatgaagttgtcga 24513755  T
Q  342 ----------cgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagc 430  Q
              ||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||| |     
T  24513756 attatgaagtcgtatgtcatatatacacatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagcgggagggt 24513854  T
Q  431 ttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaa 529  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  24513855 ttcggccctggaacgccttgtcgtttaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcctgaaaagaatgctttaa 24513954  T
Q  530 ccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatg 628  Q
    ||||||| | ||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||   |||||||||| |||| ||||    
T  24513955 ccattcgaatagcggtgagggctccggccctg-aatatggtaccacatgcata-ttgcatttgtcgaggagtcttagtaatgttgtcatgccattacatg 24514052  T
Q  629 agtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||    
T  24514053 agtcgttgttgttgattgtattgttgtattattgatgatgt 24514093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 335 - 642
Target Start/End: Original strand, 21566120 - 21566425
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21566120 atggagttgtaagtcatatatacaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcg 21566219  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21566220 gctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcatgatgagaatgctttaaccatt 21566319  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||    
T  21566320 cgacaacggtgtgggtcacggccctg-aatatggtaccacgtgcatagttgcatttatcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtctttacatgagttgt 21566417  T
Q  635 tgttgttg 642  Q
    ||||||||    
T  21566418 tgttgttg 21566425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 368 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 12942010 - 12941749
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12942010 tagttgagttgtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgga 12941911  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
     ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  12941910 gcactagttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-attttg 12941813  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  12941812 gtaccacatgcatagtttcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 12941749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 368 - 631
Target Start/End: Original strand, 29615165 - 29615426
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29615165 tagtcgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 29615264  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  29615265 acactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-gttatg 29615363  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagt 631  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||  || | |||||||||||| |||||||    
T  29615364 gtaccacatgcatagttgc-attattggggagtattaagggggatgtcatgtcatttcatgagt 29615426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 12167444 - 12167230
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12167444 gagttgtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 12167345  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12167344 agttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtacc 12167245  T
Q  573 acatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||    
T  12167244 acatgcatagttgca 12167230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19286353 - 19286139
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19286353 gagttgtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 19286254  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19286253 agttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtacc 19286154  T
Q  573 acatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||    
T  19286153 acatgcatagttgca 19286139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19877537 - 19877323
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19877537 gagttgtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacact 19877438  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19877437 agttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtacc 19877338  T
Q  573 acatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||    
T  19877337 acatgcatagttgca 19877323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19883313 - 19883099
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19883313 gagttgtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacact 19883214  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19883213 agttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtacc 19883114  T
Q  573 acatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||    
T  19883113 acatgcatagttgca 19883099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 335 - 587
Target Start/End: Original strand, 19786805 - 19787057
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcat-aagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  19786805 atggagtagtaagtcatatg-atacatatgtagtagtcgagttgtatgtagatatacacaggtggggtagttgcattaaacatcaaagtgggagagcttc 19786903  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccat 533  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  19786904 ggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccat 19787003  T
Q  534 tcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19787004 tcgacagtggtgtgggtaatggccctgaattatggtaccacatgcatagttgca 19787057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 376 - 632
Target Start/End: Original strand, 28290182 - 28290435
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  28290182 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 28290281  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    || |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28290282 tgctcaaagtgatgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-attatggtaccaca 28290379  T
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  28290380 tgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 28290435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24562497 - 24562275
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  24562497 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 24562399  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24562398 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 24562300  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  24562299 ttatggtaccacatgcatatttgca 24562275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 356 - 587
Target Start/End: Original strand, 25470645 - 25470875
Alignment:
Q  356 atacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgtt 455  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||  || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  25470645 atacatatgtattagtagagttgtatgtaggtatacactggttgggtagttgcataatcatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgtt 25470743  T
Q  456 caaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25470744 caaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagaggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 25470843  T
Q  556 ccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25470844 ccctgaattatggtaccacatgcatatttgca 25470875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 373 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 23837787 - 23837579
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23837787 gagttgtatgtagagatacacaggttgggtagttccataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacaccttgtcgttcaaaacggtggaacact 23837688  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23837687 agttgttcaaagcggtgtggagcggtgagaacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtacc 23837588  T
Q  573 acatgcata 581  Q
    |||||||||    
T  23837587 acatgcata 23837579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Original strand, 34647618 - 34647836
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  34647618 tagtagagttgtatgtagatatacactggttgggtagttgcataaacatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtgga 34647716  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  34647717 acactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctgaattacg 34647816  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  34647817 gtaccacatgcatatttgca 34647836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Original strand, 34640944 - 34641162
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  34640944 tagtagagttgtatgtagatatacactggttgggtagttgcataaacatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgcctcgccgttcaaagcggtgga 34641042  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  34641043 acactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctgaattacg 34641142  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  34641143 gtaccacatgcatatttgca 34641162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 347 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 18788591 - 18788439
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18788591 gtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 18788492  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtg 499  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18788491 cttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtg 18788439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 347 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 18799571 - 18799419
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18799571 gtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 18799472  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtg 499  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18799471 cttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtg 18799419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 19726810 - 19726606
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  19726810 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 19726711  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  19726710 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 19726613  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  19726612 catgcat 19726606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 347 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 22907198 - 22906969
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22907198 gtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagctgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgc 22907099  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  22907098 cttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtg 22906999  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
     |||  |||| |||| | |||||||||||||    
T  22906998 agggctacggtcctg-attatggtaccacat 22906969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 19588525 - 19588760
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  19588525 gtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacg 19588624  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcgg 543  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||||| |  |||||    
T  19588625 ccttatcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcatgaaaatgaatactttaaccattcaattagcgg 19588724  T
Q  544 tgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    || |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  19588725 tgagggattcggccctg-attatggtaccacatgcat 19588760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9186902 - 9186621
Alignment:
Q  58 tcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9186902 tcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcttcgtgcactaggggatccttttgagcatttctaaatgttcctttcaacttgta 9186803  T
Q  157 agatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatgaatttgtggattgaagtgagt-gtgaaccaagtga 255  Q
    ||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| | || ||||||||| ||  |||||  ||||| |    ||| ||||||    
T  9186802 agaccattatatataccctgaatcctactgaacacattgat-aatcgaattggtgtaatttaatgaaatt-cggattagagtgaatacaaaactaagtga 9186705  T
Q  256 aaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaattataca-ttttctgatgttggattggttgagatg 337  Q
    ||| ||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9186704 aaatatactatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattattattaattatacatttttctgatgttggattggttgtgatg 9186621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 373 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19439909 - 19439782
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19439909 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttacataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 19439810  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19439809 agttgttcaaagcggtgtttagcggtga 19439782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 33682180 - 33682380
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||     
T  33682180 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagctttggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtta 33682279  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  33682280 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 33682377  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  33682378 cat 33682380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 375 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 1592963 - 1592757
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||    
T  1592963 gttgtatgtaggtatacacaagtgggtcagttgcaaaagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttctcgttcaaagtggtggagtactag 1592864  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| | | ||||||||    
T  1592863 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcgacagcggtgagggctacggtcctg-attttggtacca 1592766  T
Q  574 catgcatag 582  Q
    |||||||||    
T  1592765 catgcatag 1592757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 14375253 - 14375489
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  14375253 gtcatataaatacatatacattgttggagttgtatgtagatatacactagtggagttatttgcataagcttaaaagcgggagggcttcggccctggaacg 14375352  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcg 542  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |  ||||    
T  14375353 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatcctttaaccattcaattagcg 14375452  T
Q  543 gtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    ||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  14375453 gtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcat 14375489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 8760370 - 8760562
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||    
T  8760370 gtcatatacatatatatgcatttggttgagttgtatgtgaatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagctggagggcttctgccctggaacg 8760469  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga 537  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  8760470 ccttgttgttcaaagtggtggaacactagtcgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcga 8760562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 375 - 545
Target Start/End: Original strand, 937655 - 937825
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  937655 gttgtatgtagatatacacgagtgggtcaattgcataagcatagaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactcg 937754  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  937755 ttgctcaaagtggtgtt-agaggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagaggtg 937825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 506
Target Start/End: Original strand, 11289547 - 11289705
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11289547 gtcatataaatacatatgtaatagtagagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataaacatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgc 11289645  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggactt 506  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11289646 ctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggactt 11289705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 373 - 648
Target Start/End: Original strand, 29416435 - 29416718
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| |||||| |||    
T  29416435 gagttgtatgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggagcaccttgtcgttcaaagtggtggagcac 29416534  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||| || || |||||||||    
T  29416535 tagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagctgtgagggctacgaccttg-aatatggta 29416633  T
Q  571 ccaca------tgcatagttgca-attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||      ||||| || |||  |||| |  ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29416634 ccacatgcatgtgcattgtcgcattttgttgttgagtcgtagtggagttgtcgtgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 29416718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 23835234 - 23835057
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  23835234 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 23835137  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  23835136 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 23835057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 2708577 - 2708368
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2708577 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataggcacaaaagcgggagggctccggccctggaacgccttatcgttcaaagcggtggaacact 2708478  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||| |||||||||    
T  2708477 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgagaacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccct-aaatatggt 2708379  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  2708378 accacatgcat 2708368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 14033319 - 14033142
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  14033319 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 14033222  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  14033221 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 14033142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 19300611 - 19300846
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| || ||| |||||||  |||||||    
T  19300611 gtcatataaatacatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacataagtgggtcaattgcataagcataaaagcggtgagggcttcggtcttggaac 19300710  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagc 541  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||    
T  19300711 gctttgtcgttcaaagtggtggaacactatgttgttcaaagcggtgtt-agcggtgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctatagc 19300809  T
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||| |||   ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  19300810 ggtgagggcttcggtcctg--atatggtaccacatgcat 19300846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 28359831 - 28360032
Alignment:
Q  378 gtatgtagatataca-caagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  28359831 gtatgtagatatacaacaaggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 28359930  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  28359931 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacaaaggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 28360028  T
Q  577 gcat 580  Q
    ||||    
T  28360029 gcat 28360032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 14724600 - 14724409
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||  ||||||    
T  14724600 gtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaac 14724501  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc 535  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  14724500 gccttgtcgttcaaagcagtggaacacttgttgttcaaagcggtgattagcggtgagaacttatatcctgaaaatgaatgctttaaccattc 14724409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 15457697 - 15457414
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  | |||  | ||||   |||||||    
T  15457697 gtcatataagtacatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtcgcataa-cataaaacggtgaggacctcggtcctggaacg 15457600  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatg---ataatgctttaaccattcgacagc 541  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||  |||||| ||||||||||    | |||||||||||||||| | | |    
T  15457599 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgttaatggg--aggactcatgtcctgatataaagaatgctttaaccattctataac 15457502  T
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||| |||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15457501 ggtgagggcttcggccctga--tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagaggagtcgtcatgtca-tgcatgagtc 15457414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 15464292 - 15464009
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  | |||  | ||||   |||||||    
T  15464292 gtcatataagtacatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtcgcataa-cataaaacggtgaggacctcggtcctggaacg 15464195  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatg---ataatgctttaaccattcgacagc 541  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||  |||||| ||||||||||    | |||||||||||||||| | | |    
T  15464194 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgttaatggg--aggactcatgtcctgatataaagaatgctttaaccattctataac 15464097  T
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||| |||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15464096 ggtgagggcttcggccctga--tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagaggagtcgtcatgtca-tgcatgagtc 15464009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 347 - 513
Target Start/End: Original strand, 14616213 - 14616382
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||  ||||||    
T  14616213 gtcatatagatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaac 14616312  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcct 513  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14616313 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcct 14616382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 27562514 - 27562715
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtggg-ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  27562514 gtatgtagatatactcaatggggattagttgcattaacataacagcgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 27562613  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  27562614 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattcttggtaccacat 27562711  T
Q  577 gcat 580  Q
    ||||    
T  27562712 gcat 27562715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18799900 - 18799762
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  18799900 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagtcaaccttagtcagccactttttgaactttgcctcatgcattagggg 18799801  T
Q  118 atccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    | |||||| ||||||   | |||||||||||||||||||    
T  18799800 accctttttagcattcaaacatgttcctttcaacttgta 18799762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 19819106 - 19818899
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19819106 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagcgggag-gctccggccctggaatgccttgtcgttcaaagaggtggaacact 19819008  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||| |  |||||||  ||   |||||||| |||||||||    
T  19819007 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcctgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgaaggctccggccctg-aatatggta 19818909  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  19818908 ccacatgcat 19818899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Original strand, 8768117 - 8768260
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||    
T  8768117 gtcatatacatatatatgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagctggagggcttctgccctggaacg 8768216  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtg 489  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8768217 ccttgtcgttcaaaatggtggaacactagttgttcaaagcggtg 8768260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 21565785 - 21565899
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |    
T  21565785 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactggacgtcgcttaagcgaagttgaccttagtcagccactttttgaacgttgcctcgtgcattaggag 21565884  T
Q  118 atccttttgagcatt 132  Q
    | |||||||||||||    
T  21565885 acccttttgagcatt 21565899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 375 - 545
Target Start/End: Original strand, 21724733 - 21724903
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||| ||||||  |||||    
T  21724733 gttgtatgtaggtatacacaagtgggtcagttgcaaaagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgcctaatagatcaaagtggtggagtactag 21724832  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||    
T  21724833 ttgctcaaagtggtatt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctatagcggtg 21724903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 347 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 31251604 - 31251344
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||  ||  | ||||   ||||||    
T  31251604 gtcatataagtacatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcataaaaacggttaggacctcggtcctggaac 31251505  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat---gataatgctttaaccattcgacag 540  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   | ||||||| ||||||||||    | |||||||||||||||| | |     
T  31251504 gccttgtcattcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgttaa--tgggaggactcatgtcctgataaaaagaatgctttaaccattctataa 31251407  T
Q  541 cggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttag 605  Q
    ||||| |||   ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  31251406 cggtgagggcttcggccctg--atatggcgccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttag 31251344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 336 - 535
Target Start/End: Original strand, 14995882 - 14996084
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttc 433  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||| || ||| ||||     
T  14995882 tggagtcgtaagtcacatacatatatgtgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagcggagtcagttgcataatcataaaagcggtgagggctta 14995980  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga-taatgctttaacc 531  Q
     ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||    
T  14995981 tgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacattgttgttcaaagcggtgtttaatggtgaggactcatgtcctgaaaaggaatgctttaacc 14996080  T
Q  532 attc 535  Q
    ||||    
T  14996081 attc 14996084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 19471943 - 19472077
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatc 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  19471943 actttctgtgagccggtcgcttaagcgagccagccatcgcttaagcgaagaaggtctt-gtcagccactttttgaattttgcttcgtgcactaggggatc 19472041  T
Q  121 cttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  19472042 cttttgagcattttgaaatgtttccttcaacttgta 19472077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 372 - 580
Target Start/End: Original strand, 14581825 - 14582034
Alignment:
Q  372 ggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || || |||  ||||||   ||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  14581825 ggagttgtatgtatatatacataag-gggttagttgcataagcataatagcggtgaggacttcggtcctggaatgccttgtcattcaaagtggaggaaca 14581923  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatg--ataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | | |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||   ||||    
T  14581924 caatgttgttcaaagcggtgtttaacggtgaggactcatgtcctgatgaaagaatgctttaaccattctatagcggtgagggcctcggccctg--ttatg 14582021  T
Q  568 gtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||    
T  14582022 gtaccacatgcat 14582034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18786148 - 18785996
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |  ||||||| |||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18786148 agcggtgaggacttatgtcctgaata-aatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttctgccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttg 18786051  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |   |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18786050 ttcaggagtcttattggtgttgtcctgtaattgcatgagtcgttgttgttggttg 18785996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Original strand, 23234869 - 23234986
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  23234869 gtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttctgccctggaacg 23234968  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||| |||||||||||    
T  23234969 ccttgtcgttcaaagcgg 23234986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 4476574 - 4476314
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  4476574 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 4476475  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  4476474 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 4476378  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  4476377 gtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 4476314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 21365435 - 21365695
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  21365435 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 21365534  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||  |||||    
T  21365535 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctg--atatg 21365631  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  21365632 gtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagaagggttgtcatgtc-ttgcatgagtc 21365695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 23969417 - 23969677
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  23969417 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 23969516  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||  |||||    
T  23969517 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctg--atatg 23969613  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  23969614 gtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagaagggttgtcatgtc-ttgcatgagtc 23969677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 576 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 25749711 - 25749639
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25749711 tgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 25749639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 493 - 669
Target Start/End: Original strand, 19472418 - 19472596
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcg-gtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | |  ||| ||| | | |||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||    
T  19472418 agcggtgagggcttatgccctgatga--atgctttaaccattcaatatctcgtgagggcctctgccctgtaaattggtaccacatgcatagtcgcatttg 19472515  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatga---gtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  19472516 ttgaggggtcttagaggtattgtcatgtcattgcatgagtcgtcgttgtcgttggtcgaattgtcatattattgatgatgt 19472596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 539 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18799425 - 18799318
Alignment:
Q  539 agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgtt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||  || ||    
T  18799425 agcggtgtgggtcacggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttttcgaggagtcttagagg-ggcgtcatgtcatt-catgagttattatt 18799329  T
Q  639 gttggttgaat 649  Q
    |||| ||||||    
T  18799328 gttgattgaat 18799318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 17414242 - 17414114
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||      
T  17414242 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctct 17414144  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  17414143 ggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 17414114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 493 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 25396086 - 25395940
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagc-ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | | |||| |||   | |||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||    
T  25396086 agcggtgagggcttatgccctgatga--atgctttaaccattcaatatctggtgagggcttctgccctgtaaattggtaccacatgcatagtcgcatttg 25395989  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgt 640  Q
    | | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25395988 ttgaggagtcttagaggtgtcgtcatatcattgcatgagtcgtcgttgt 25395940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 23021420 - 23021568
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  23021420 agcggtgaggacttatgtcctgatga--attctttaaccattctaaagcggtgagggcttcggtcctgt--tttggtaccacatgcataattgcatttat 23021515  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23021516 tgaggtgtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 23021568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 539 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18788445 - 18788338
Alignment:
Q  539 agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgtt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||  || ||    
T  18788445 agcggtgtgggtcacggccctgaa-tatggtaccacatgtatagttgcatttttcgaggagtcttaga-gtggcgtcatgtcatt-catgagttattatt 18788349  T
Q  639 gttggttgaat 649  Q
    |||| ||||||    
T  18788348 gttgattgaat 18788338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25396626 - 25396496
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |  |||||||| |||||||| |||   ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  25396626 ctgtaagtcggtcgcttaagcgagccagccgtcgcttaagcgaagtaggtcttagtcaaccactttttgaattatgcttagtgcactagggaatcctttt 25396527  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  25396526 gagcattctaaaatgtttctttcaacttgta 25396496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 26418633 - 26418723
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |   ||||||||||||| |||||||||||    
T  26418633 gagttgtatgtaggtatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagggcttctgtcctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 26418723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 588 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 23105177 - 23105117
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23105177 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 23105117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 20008847 - 20009097
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaag-cggtggaac 469  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  |||||| | |||||||| |||| |||||||  || ||||||    
T  20008847 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaaacgatggaac 20008946  T
Q  470 acta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    |||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| |||   |||    
T  20008947 actatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctgt--tat 20009043  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  20009044 ggtaccacatgcatagttacatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 20009097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Original strand, 10582781 - 10582899
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   |   ||||||    
T  10582781 gtcatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgtcctggaac 10582880  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  10582881 gccttgtcgttcaaagcgg 10582899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 136
Target Start/End: Original strand, 19300359 - 19300460
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcattt 133  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19300359 ggtcgcttaagcgagctacccttcgcttaagcga-gatgagccttagtcagcctctatctgaactttgcttcgtgcactaggggacccttttgagtattt 19300457  T
Q  134 tta 136  Q
    |||    
T  19300458 tta 19300460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 23233377 - 23233467
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23233377 agttgtatgtagatatacacaagtggagtaagttgcatgagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 23233467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Original strand, 34640661 - 34640723
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagcc 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  34640661 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagtgaaccttagtcagcc 34640723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Original strand, 34647335 - 34647397
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagcc 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  34647335 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagtgaaccttagtcagcc 34647397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Original strand, 29614814 - 29614882
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagcc 87  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29614814 cagacctactgtaagtcggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag-tgagccttagtcagcc 29614882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 463
Target Start/End: Original strand, 5290073 - 5290200
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||| || |||    
T  5290073 tggagtcataagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcataaaagcgggagggcctcg 5290171  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |    |||||||||||| |||||||||||    
T  5290172 gtccgggaacgccttgtcgttcaaagcgg 5290200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 22346542 - 22346491
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22346542 gagtcgtagtggagttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 22346491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29265438 - 29265387
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29265438 gagtcgtagtggagttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 29265387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12167746 - 12167700
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12167746 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 12167700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19286655 - 19286609
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19286655 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 19286609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Original strand, 19786541 - 19786587
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19786541 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 19786587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19877839 - 19877793
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19877839 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 19877793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19883615 - 19883569
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19883615 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 19883569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 587
Target Start/End: Original strand, 11283984 - 11284029
Alignment:
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11283984 ggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcataattgca 11284029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19451531 - 19451403
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||| |||      
T  19451531 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagtataaaagcgggagggctct 19451433  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
      |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  19451432 ttccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 19451403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 25347167 - 25347031
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||   || ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||     
T  25347167 agcggtgagggcctaggtcctgatga--atgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcgaccctgat-tatggtaccacatgcatagttgcatttt 25347071  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    | | || ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  25347070 ttgaggtgtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 25347031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Original strand, 12447336 - 12447415
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12447336 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 12447415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Original strand, 17894661 - 17894740
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| |||||  | | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  17894661 tggtaccacatgcataattgcatattttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagtcttagttgttggttg 17894740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 620
Target Start/End: Original strand, 20011100 - 20011156
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  20011100 tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 20011156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Original strand, 5290235 - 5290326
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5290235 agcggtgagagcttatgctctgatga--atgctttaaccattctacagcggtgagggctacgtccctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 5290326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 608 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 18137420 - 18137381
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18137420 gtgttgtcatatcattgcatgagtcgttgttgttggttga 18137381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 20008553 - 20008604
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20008553 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgttgcttaagcgaa 20008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19468031 - 19467977
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggag 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  19468031 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 19467977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 581
Target Start/End: Original strand, 23235021 - 23235107
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcata 581  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||   ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23235021 agcggtgagtacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccttg-aatatggtaccacatgcata 23235107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 25396250 - 25396121
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagctt 432  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||     
T  25396250 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gttgagttgtatgtatatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctc 25396152  T
Q  433 cggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
      ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  25396151 ttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 25396121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Original strand, 25470376 - 25470438
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagcc 87  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  25470376 tactgtaagttggtcgcttaagcgaactagacgtcgcttaagcgaagtgaaccttagtcagcc 25470438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Original strand, 26418758 - 26418851
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||   |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    
T  26418758 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctg-attatgataccacatgcatatttgca 26418851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 495 - 646
Target Start/End: Original strand, 17207811 - 17207956
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcg 594  Q
    |||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||   | |||||||||||||||| |||| ||| | |    
T  17207811 cggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggtttcggtcctgt--tttggtaccacatgcataattgc-attattg 17207905  T
Q  595 gggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     |||||||||| || || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  17207906 aggagtcttagtggggtcgtcatgtca-tgcatgagtctttattgttggttg 17207956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 31250350 - 31250252
Alignment:
Q  520 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgt 619  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| |||   |||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  31250350 aatgctttaaccattctataacggtgagggcttcggccctga--tatggcgccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgt 31250253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 632
Target Start/End: Original strand, 9100170 - 9100236
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  9100170 tatggtaccacatgcatagttgc-attgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 9100236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 427
Target Start/End: Original strand, 19472292 - 19472348
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggag 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19472292 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagtgggag 19472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 597 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21469677 - 21469625
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  21469677 gagtcttagtagtgttgtcatgtcgtcgcatgagtcgttgttgatggttgaat 21469625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 29096821 - 29096755
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  29096821 tatggtaccacatgcatagttgc-attgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 29096755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 125
Target Start/End: Original strand, 11289294 - 11289384
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11289294 ggtcgcttaagcaagctacccttcgcttaagcga-gctgagccttagccagcccctttctgaactttgcctcgtgcactaggggaccctttt 11289384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 21365144 - 21365195
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21365144 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaa 21365195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 23969126 - 23969177
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23969126 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaa 23969177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 24720807 - 24720716
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| | ||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  24720807 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgagagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 24720716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Original strand, 18316178 - 18316228
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  18316178 ggagtcttagaggtgttgtcaagtagttgcatgaatcgttgttgctggttg 18316228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 22798703 - 22798761
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  22798703 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagttgttgttgttggttg 22798761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Original strand, 24412487 - 24412537
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24412487 ggagtcttagcggtgttgtctagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 24412537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Original strand, 14132983 - 14133036
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14132983 gtcatatacatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtgg 14133036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 25634165 - 25634097
Alignment:
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  25634165 atatggtaccacatgcatagttgcatttgttgataagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 25634097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 9099971 - 9100019
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  9099971 gagttgtatgtagatatacactagtggagtcagttgcataagcataaaa 9100019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 597 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21476217 - 21476165
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  21476217 gagtcttagtagtgttgtcatgtcgtcgcatgattcgttgttgatggttgaat 21476165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 23235137 - 23235185
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23235137 gtcttagcagtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 23235185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 24562243 - 24562203
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24562243 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 24562203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 25772556 - 25772524
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25772556 ggtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttg 25772524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 29097020 - 29096972
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  29097020 gagttgtatgtagatatacactagtggagtcagttgcataagcataaaa 29096972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 142)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 335 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 17157305 - 17156993
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17157305 atggagttgtatgtcatatacataaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagggggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcg 17157206  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17157205 gctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccatt 17157106  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||    
T  17157105 cgacagcggtgtgggtcacggccctg-aatacggtaccacatgcatagttgcatttattgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgt 17157008  T
Q  635 tgttgttggttgaat 649  Q
    | |||||| ||||||    
T  17157007 tattgttgattgaat 17156993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 335 - 649
Target Start/End: Original strand, 16802382 - 16802694
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16802382 atggagtcgtaagtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 16802481  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16802482 gctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtagaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgatgacttatgtcctgatgagaatgttttaaccatt 16802581  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||    
T  16802582 cgacagcggtgtgggtcacggccctg-aatatggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtcttaga-gaggtgtcatgtcattacatgagttgt 16802679  T
Q  635 tgttgttggttgaat 649  Q
    ||| |||| ||||||    
T  16802680 tgtcgttgattgaat 16802694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 335 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 24192006 - 24191694
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24192006 atggagttgtatgtcatatacataaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagggggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcg 24191907  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24191906 gctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgagaacttatgtcctgatgagaatgctttaaccatt 24191807  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||    
T  24191806 cgacagcggtgtgggtcacggccccg-aatacggtaccacatgcatagttgcatttattgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgt 24191709  T
Q  635 tgttgttggttgaat 649  Q
    | |||||| ||||||    
T  24191708 tattgttgattgaat 24191694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 18889456 - 18888901
Alignment:
Q  110 actaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttga 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  18889456 actaggggatccttttgagtatttctaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctactaaacacattgttaa-tcgagttag 18889358  T
Q  210 tatagtttaatgaatttgtggattgaagtgagtgtgaa-ccaagtgaaaagatgttgcg-ttgaatga-cttgatgtattagtatgattgacattaatta 306  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18889357 tatagtttaatgaatttc-ggattgaagtgagtatgaaaccaagtgaatatatattatgattgaatgaacttgatgtattggtatgattgatattaatta 18889259  T
Q  307 tacatttt-ctgatgttggattggttg------ag----------atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatat 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||      ||          ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  18889258 tacatttttctgatgttggattggttgtaatgaagttgttgaattatgaagtcgtatgtcatatatatacatatgcattacttgagttgtatgtagatat 18889159  T
Q  390 acacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag-ttgttcaaagcgg 487  Q
    |||||||||  ||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18889158 acacaagtgcagtcggttgcacaagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttattgttcaaagcgg 18889059  T
Q  488 tgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgc 586  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18889058 tgttcagtgatgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggctccggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgc 18888960  T
Q  587 aattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    | |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18888959 atttgttgaggagtcttagaagtgtcgtcatgtcattgcatgagtcgttgtcgttggtt 18888901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 336 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 23174399 - 23174091
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcgg 435  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23174399 tggagtcataagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcaaaagcataaaagtgggagagcttcgg 23174301  T
Q  436 ctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc 535  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  23174300 ctcttgaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtt-agcggtgaggacttatgtcctga-aaaaatgctttaaccattc 23174203  T
Q  536 gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgtt 635  Q
    ||||||||||||||  |||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  23174202 gacagcggtgtgggctacggtcttg-aacatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattacatgagttgct 23174104  T
Q  636 gttgttggttgaa 648  Q
    ||||||| |||||    
T  23174103 gttgttgattgaa 23174091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 358 - 587
Target Start/End: Original strand, 41456103 - 41456332
Alignment:
Q  358 acatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttca 457  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41456103 acatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaggtgggatagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttca 41456202  T
Q  458 aagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggcc 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41456203 aagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggcc 41456302  T
Q  558 ctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41456303 ctgaattatggtaccacatgcataattgca 41456332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 375 - 665
Target Start/End: Original strand, 17243651 - 17243942
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta 473  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  17243651 gttgtatgtagatatacatcagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctagaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacactt 17243750  T
Q  474 gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||| |||||||||||    
T  17243751 gttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgactagcggtgagggctccgaccctg-aatatggtacc 17243849  T
Q  573 acatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatg 665  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  17243850 acatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatcagtcgttgttgttggttgaattgctatattattgatg 17243942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 49 - 337
Target Start/End: Original strand, 17243260 - 17243549
Alignment:
Q  49 aactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17243260 aactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaactttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttccttcc 17243359  T
Q  149 aacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatgaatttgtggattgaagtgagtgtg-aa 247  Q
    ||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||| || ||    
T  17243360 aacttgtaagaccattatatataccatgaatcctactgaacacattgtt-aatcgagttggtgtaatttaatgaattt-tggattggagtgagtatgaaa 17243457  T
Q  248 ccaagtgaaaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaattatacatt-ttctgatgttggattggttgagatg 337  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17243458 ccaagtgaaaatatattatgttgaatgaacttgatgtattggtatgattgttatggattatacattgttctgatgttggattggttgcgatg 17243549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 364 - 646
Target Start/End: Original strand, 24123165 - 24123445
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  24123165 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 24123263  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24123264 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 24123362  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| || | | |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24123363 ttatggtaccacgtgcatatttgcatttattgaggagtc-tag-ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 24123445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 9533056 - 9532842
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9533056 gagttgtatgtagagatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 9532957  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9532956 agttgttcaaagtggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtacc 9532857  T
Q  573 acatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||    
T  9532856 acatgcatagttgca 9532842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 339 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 18900248 - 18899940
Alignment:
Q  339 agtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggct 437  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  18900248 agtcgtatgtcatatatatacatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagcgggagggcttcggcc 18900149  T
Q  438 ttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcg 536  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  18900148 ctggaacgccttgtcgttcaaatcggtggaacactttgttgttcaaagcgatgtttagaggtgaggacttatgtcctgaaaaaaatgctttaaccattcg 18900049  T
Q  537 ac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgtt 635  Q
    |  ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18900048 attagcggtgagggctctggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagaagtgtcgtcatgtcattgcataagtcgtt 18899950  T
Q  636 gttgttggtt 645  Q
    || |||||||    
T  18899949 gtcgttggtt 18899940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 368 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 12304959 - 12304698
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12304959 tagttgagttgtatgtagatatacacaggtgagtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgga 12304860  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
     ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||    
T  12304859 gcactagttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctg-attttg 12304762  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
     |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  12304761 ataccacatacatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 12304698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Original strand, 13968795 - 13969017
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13968795 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcata-gcatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 13968893  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13968894 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 13968992  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  13968993 ttatggtaccacatgcatatttgca 13969017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Original strand, 13974270 - 13974492
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13974270 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcata-gcatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 13974368  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13974369 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 13974467  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  13974468 ttatggtaccacatgcatatttgca 13974492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 423 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 17190992 - 17190768
Alignment:
Q  423 gggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataat 522  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  17190992 gggagagcttcggctctggaacgccttgtctttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgatcggtgaggacttatgtcctgatgagaat 17190893  T
Q  523 gctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcat 622  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  17190892 gctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctg-aatttggtaccacatgcatagttgcatttattgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcat 17190795  T
Q  623 tgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    | ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  17190794 tacatgagttgttattgttgattgaat 17190768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14084746 - 14084524
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  14084746 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 14084648  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14084647 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 14084549  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  14084548 ttatggtaccacatgcatatttgca 14084524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14090147 - 14089925
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  14090147 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 14090049  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14090048 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 14089950  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  14089949 ttatggtaccacatgcatatttgca 14089925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 49399688 - 49399466
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  49399688 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 49399590  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49399589 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctggtgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 49399491  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  49399490 ttatggtaccacatgcatatttgca 49399466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Original strand, 8583256 - 8583478
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || | || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  8583256 gcatttgttgagttgtatgtagatatccataggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 8583354  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8583355 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 8583453  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  8583454 ttatggtaccacatgcatatttgca 8583478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 12200403 - 12200203
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  12200403 gtatgtagatatactcaagtgggtaagttgcataagcataacagtgggagagcttcagctctggaacaacttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 12200304  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  12200303 ctcaaagtggtgtt-agtggtgagaacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-attttggtaccacatg 12200206  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  12200205 cat 12200203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 14544163 - 14544368
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14544163 gttgtatgtagatatacacaagcgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactag 14544262  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  14544263 ttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 14544361  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  14544362 catgcat 14544368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 374 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18914213 - 18913937
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   |   |||||| |||||| |||||||| ||||||||||     
T  18914213 agttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcatataaagcgggagggctattgtcctggaacaccttgtcgttcaaagtggtggaacact 18914114  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||| || |||||||||    
T  18914113 ttgttgttcaaagcggtgtttag-ggagatgacttatgtcctgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccttg-aatatggta 18914016  T
Q  571 ccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18914015 ccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcaatgcatgagtcgttgttgttggttgaat 18913937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 14652688 - 14652892
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  14652688 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataatagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 14652787  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  14652788 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 14652885  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  14652886 catgcat 14652892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 12961345 - 12961580
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||    
T  12961345 gtcatatacatatatatgcatttggttgagttttatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagtataaaagcggaagggcttcggccctggaacg 12961444  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcgg 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  |||||    
T  12961445 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcgg 12961544  T
Q  544 tgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||    
T  12961545 tgagggtttcggccctg-attatggtaccacatgcat 12961580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 373 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 14292911 - 14292706
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  14292911 gagttgtatgtagaaatatacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcgttggagcact 14292812  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga--taatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |   |||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| | |||||||    
T  14292811 agttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctaaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctg-attatggta 14292713  T
Q  571 ccacatg 577  Q
    |||||||    
T  14292712 ccacatg 14292706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Original strand, 31690565 - 31690781
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  31690565 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataaacataaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 31690664  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  31690665 ttgttgtttaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctg-aatatggt 31690763  T
Q  570 accacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||| |||||    
T  31690764 accacatgcatatttgca 31690781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13909728 - 13909529
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||     
T  13909728 gtatgtagatatactcaag-gggttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtta 13909630  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13909629 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 13909532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13940187 - 13939988
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||     
T  13940187 gtatgtagatatactcaag-gggttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtta 13940089  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13940088 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 13939991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 13203511 - 13203715
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  13203511 gttgtatgtagatatactcaagtgggttagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 13203610  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||| ||||   ||||||||||    
T  13203611 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttaggtcctgaaaatgaatgctttaactattctacagcggtgagggctacggtcctg-tttatggtacca 13203708  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  13203709 catgcat 13203715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 16382852 - 16383056
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  16382852 gttgtgtgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcattacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 16382951  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | | ||||||||    
T  16382952 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attttggtacca 16383049  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  16383050 catgcat 16383056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 373 - 648
Target Start/End: Original strand, 34852178 - 34852451
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  34852178 gagttgtatgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcac 34852277  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  34852278 tagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacaacggtgagggctacggccctg-aatatggta 34852376  T
Q  571 ccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||||||    || ||||| | |||||||||| || || ||   ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34852377 ccacatgcat--gcgc-attgttgaggagtcttagtggagtcgttgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 34852451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 376 - 580
Target Start/End: Original strand, 16838475 - 16838677
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16838475 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 16838574  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    || |||||| |||||| || |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||| | |||||||||||    
T  16838575 tgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctggaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaggct-acggtcctg-attatggtaccac 16838671  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  16838672 atgcat 16838677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 31943650 - 31943434
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31943650 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcatgaaagcgagagggcttcggctctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 31943551  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  | |||| |||||||||||||   |||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  31943550 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatttcctgaaaaagaatgttttaaccattcgatttgcggtgagggcttcggccctg-aatatggt 31943452  T
Q  570 accacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||| |||||    
T  31943451 accacatgcatatttgca 31943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13946673 - 13946474
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||     
T  13946673 gtatgtagatatactcaag-gggttagttgcattaacataacagtgggagagtttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtta 13946575  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13946574 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 13946477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24192342 - 24192134
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| |     
T  24192342 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagtggaccttagtcagccacctttgaattttacctcgtgcactaggag- 24192244  T
Q  119 tccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatat--gtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatag-t 215  Q
     ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |    
T  24192243 cccttttgagtacttctaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatacataccctgaatcctactaaacacattgttaagt-gagttggtatagtt 24192145  T
Q  216 ttaatgaattt 226  Q
    |||||||||||    
T  24192144 ttaatgaattt 24192134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 8742909 - 8743086
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  8742909 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 8743006  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8743007 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattttggtaccacatgcat 8743086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 8761079 - 8761256
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  8761079 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 8761176  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8761177 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattttggtaccacatgcat 8761256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 373 - 537
Target Start/End: Original strand, 17199010 - 17199175
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaa-agtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17199010 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcggttgcatagtcatatacagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacac 17199109  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga 537  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  17199110 tagttgttcaaagcggtgtt-agcggtgaggacttaggtcctgtaaaagaatgctttaaccattcga 17199175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 4677341 - 4677164
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  4677341 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 4677244  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4677243 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcat 4677164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 41175654 - 41175477
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  41175654 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 41175557  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41175556 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcat 41175477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 41180792 - 41180615
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  41180792 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 41180695  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41180694 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcat 41180615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 357 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 19443696 - 19443469
Alignment:
Q  357 tacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttg 453  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||  ||||||||||||| |    
T  19443696 tacatatgcattagttggagttgtatgtagatatacacaagcggagtcagttgcataagcataaaagcggtgagggcttctgccctggaacgccttgtcg 19443597  T
Q  454 ttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggt 550  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||||||| |||     
T  19443596 ttcaaagcggtggaacacattgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctatagcggtgagggc 19443497  T
Q  551 cacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
      ||||||||   |||||||||||||||||    
T  19443496 tccggccctg--ttatggtaccacatgcat 19443469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 374 - 632
Target Start/End: Original strand, 38312118 - 38312378
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  38312118 agttgtatgtaaatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacc 38312217  T
Q  473 a-gttg-ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat---gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    | |||| ||||||||||| | | ||||| |||   ||||||||  |||||    
T  38312218 atgttgtttcaaagcggtgtt-agcggtgaggactcatgtcctgataaaaagaatgttttaaccattctataacggtgagggctccggccctg--atatg 38312314  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  38312315 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 38312378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 580
Target Start/End: Original strand, 11964865 - 11965080
Alignment:
Q  367 ttagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||  ||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  11964865 ttagcggagttgtaagtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaacgccatgtcgttcaaagtggtg 11964964  T
Q  466 gaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaa 563  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| ||    
T  11964965 gaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttaggtcctgaaatgaatgctttaaccattctattagcggtgagggctccggccctg-aa 11965063  T
Q  564 tatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||||||    
T  11965064 tatggtaccacatgcat 11965080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 44775378 - 44775201
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  44775378 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 44775281  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  44775280 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 44775201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 44780562 - 44780385
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  44780562 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 44780465  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  44780464 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 44780385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 18719077 - 18719312
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| | ||| | ||||||  |||||||    
T  18719077 gtcatatacatatatatgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagtat-aaagcgtgagggtttcggccctggaacg 18719175  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcg 542  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||    
T  18719176 ccttctcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgataagcg 18719275  T
Q  543 gtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    ||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  18719276 gtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcat 18719312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 337 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23174004 - 23173876
Alignment:
Q  337 ggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggc 436  Q
    ||||| ||| |||||||| | | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23174004 ggagttgtaagtcatatatacatatatgcattagttaagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgtgagagcttcggc 23173905  T
Q  437 tttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23173904 tctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 23173876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 561
Target Start/End: Original strand, 13303228 - 13303422
Alignment:
Q  371 tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13303228 tggagttgtatgtagatatatacaagtgggtcagttgcataaacataaaagcggtgagggcttctgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaac 13303327  T
Q  470 ac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 561  Q
    || | |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||   | ||| |||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||    
T  13303328 acattgttgttcaaaacggtgattagcggtgaggactcatgtcctgataaaagaatactttaaccattctatagcggtgagggccccggccctga 13303422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 372 - 516
Target Start/End: Original strand, 13313905 - 13314051
Alignment:
Q  372 ggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13313905 ggagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcggtgagggcttctgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaca 13314004  T
Q  471 c-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat 516  Q
    | | |||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  13314005 cattgttgttcaaaacggtgattagtggtgaggactcatgtcctgat 13314051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18914553 - 18914451
Alignment:
Q  30 taagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaa-ccttgcctcgtgcactaggggatccttttgag 128  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18914553 taagccggtcgcttaagcgaacctgccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaatttttgcctcgtgcattaggggatccttttgag 18914454  T
Q  129 cat 131  Q
    |||    
T  18914453 cat 18914451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 376 - 489
Target Start/End: Original strand, 16829952 - 16830065
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16829952 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 16830051  T
Q  476 tgttcaaagcggtg 489  Q
    || |||||| ||||    
T  16830052 tgctcaaagtggtg 16830065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18892683 - 18892548
Alignment:
Q  110 actaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttga 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  18892683 actaggggatccttttgagtatttctaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctactaaacacattgtt-aatcgagttag 18892585  T
Q  210 tatagtttaatgaatttgtggattgaagtgagtgtgaa 247  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18892584 tatagtttaatgaattt-cggattgaagtgagtatgaa 18892548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 16802061 - 16802176
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  16802061 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgagctagccgtcgtttaagcgaagttgaccttagttagccactttttgaactttgcctcatgcattagggg 16802160  T
Q  118 atccttttgagcattt 133  Q
    | ||||||||||||||    
T  16802161 acccttttgagcattt 16802176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 18129772 - 18129915
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| ||   |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18129772 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcatgaaagcgggagggccctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 18129871  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctga 515  Q
    | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  18129872 ttgttgttcaaagcggtgattagtggtgaggacttatgtcctga 18129915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 372 - 516
Target Start/End: Original strand, 13324817 - 13324963
Alignment:
Q  372 ggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13324817 ggagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagtataaaagcggtgagggcttctgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaca 13324916  T
Q  471 c-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat 516  Q
    | | ||||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  13324917 cattgttgttcaaaatggtgattagcggtgaggactcatgtcctgat 13324963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 132
Target Start/End: Original strand, 55499721 - 55499834
Alignment:
Q  20 agacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactagggga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| ||    
T  55499721 agacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagacgtcgcttaagcgaagttgatcttagtcagccactttttgaacgttgcctcgtgtattaggaga 55499820  T
Q  119 tccttttgagcatt 132  Q
     |||||||||||||    
T  55499821 cccttttgagcatt 55499834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 12255358 - 12255215
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||    
T  12255358 gtcatatacatatatatgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagtataaa-gcgggagggcttcggctctggaacg 12255260  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtg 489  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12255259 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgatcaaagcggtg 12255215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 535
Target Start/End: Original strand, 18136286 - 18136448
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||     || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18136286 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatgaaagcgggaggttcccgaccctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 18136385  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattc 535  Q
    | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  18136386 ttgttgttcaaagcggtgattagtggtgaggacttatgtcctgaatg--aatgctttaaccattc 18136448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 335 - 489
Target Start/End: Original strand, 12479637 - 12479791
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |||      
T  12479637 atggagtcgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctct 12479735  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtg 489  Q
    |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12479736 ggccctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagcggtg 12479791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 10597701 - 10597791
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  10597701 gagttgtatgtagatatacacaagtgagttagtcgcataagcataaaagcgggagggcttctgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 10597791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 23371844 - 23372104
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  23371844 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 23371943  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  23371944 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 23372040  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  23372041 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 23372104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17157587 - 17157443
Alignment:
Q  74 gaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatg--ta 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||| | || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  17157587 gaccttagtcagccacctttgaattttgcctcgtgcactaggagccccttttgagtacttctaaatgttcctttcagcttgtaagaccattatatgcata 17157488  T
Q  172 ttttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagttt 217  Q
       ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17157487 ccctgaatcctactaaacacattgttaagt-gagttggtatagttt 17157443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 14764098 - 14764358
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  14764098 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 14764197  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| |  | |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  14764198 ctatgttgttcaaaacgatgttaat-gatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 14764294  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  14764295 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 14764358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 51300311 - 51300051
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  51300311 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 51300212  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  51300211 cgatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 51300115  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  51300114 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 51300051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 454 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 12363572 - 12363445
Alignment:
Q  454 ttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtc 551  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||      
T  12363572 ttcaaagcggtggaacactttgttgttcgaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggct 12363473  T
Q  552 acggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12363472 ccggccctg-aatatggtaccacatgcat 12363445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 576 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 42109118 - 42109046
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42109118 tgcatagtcgcagttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 42109046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 493 - 668
Target Start/End: Original strand, 8374009 - 8374179
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  8374009 agcggtgagggctttggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttggtaccacatgcatatttgcatttat 8374103  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
     | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  8374104 tgaggggtcttagaggtgttgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttgtaattgccatattgttgatgatg 8374179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 489
Target Start/End: Original strand, 12362451 - 12362605
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || || |||      
T  12362451 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtgaagtggtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcggaagggctct 12362549  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtg 489  Q
    |||  || ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12362550 ggccctgcaacgcctcgtcgttcaaagcagtggaacacttgttgttcaaagcggtg 12362605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 18756930 - 18757020
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||    
T  18756930 gagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagggcttctgccctggaacgcctcgtcgttcaaagcgg 18757020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 489
Target Start/End: Original strand, 12355944 - 12356056
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || || |||  |||  || ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||    
T  12355944 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcggaagggctctggccctgcaacgcctcgtcgttcaaagcagtggaacacttgtt 12356043  T
Q  477 gttcaaagcggtg 489  Q
    |||||||||||||    
T  12356044 gttcaaagcggtg 12356056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 15518703 - 15518591
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  15518703 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaacgccttatcgttcaaagcggtggaacact 15518604  T
Q  472 tagttgttcaaag 484  Q
    | |||||||||||    
T  15518603 ttgttgttcaaag 15518591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 477 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 23173888 - 23173786
Alignment:
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  23173888 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacagaggtgagggttac-accctg-aatatggtaccaca 23173791  T
Q  576 tgcat 580  Q
    |||||    
T  23173790 tgcat 23173786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 493 - 668
Target Start/End: Original strand, 30596943 - 30597113
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  30596943 agcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttggtaccacatgcataattgcatttat 30597037  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  30597038 tgaggagtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagtcattgttgctgcttgtaattgttatattgatgatgatg 30597113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 439 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10554014 - 10553818
Alignment:
Q  439 tggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattc 535  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  10554014 tggaacgccttgtcgttcaaaacgatggaacacgatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattc 10553916  T
Q  536 gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgtt 635  Q
     ||| || || | |    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||    
T  10553915 tacaacgatgagagctttggctctga--tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagtcgtcatgtca-tgcatgagtcgtt 10553819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 20249104 - 20249353
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||| ||    
T  20249104 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcaattgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggagca 20249203  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || ||||  |||| ||||  ||||    
T  20249204 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggtttcggctctga--tatg 20249300  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||  || |||||||||||    
T  20249301 gtaccacatgcatggttgcatttgttgaggagtcttaatggagttgtcatgtc 20249353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 634
Target Start/End: Original strand, 10390365 - 10390627
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  10390365 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 10390464  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||||  |||    
T  10390465 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctgaa--atg 10390561  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||| ||||| | || | ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||    
T  10390562 gtaccacatgcataattgcattagttgaggagtcttagtagagttgtcgtgtc-ttgcatgagtcgt 10390627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 634
Target Start/End: Original strand, 10415474 - 10415736
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  10415474 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 10415573  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||||  |||    
T  10415574 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctgaa--atg 10415670  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||| ||||| | || | ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||    
T  10415671 gtaccacatgcataattgcattagttgaggagtcttagtagagttgtcgtgtc-ttgcatgagtcgt 10415736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 634
Target Start/End: Original strand, 10422144 - 10422406
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  10422144 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 10422243  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||||  |||    
T  10422244 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctgaa--atg 10422340  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||| ||||| | || | ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||    
T  10422341 gtaccacatgcataattgcattagttgaggagtcttagtagagttgtcgtgtc-ttgcatgagtcgt 10422406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 580
Target Start/End: Original strand, 16830050 - 16830178
Alignment:
Q  450 gttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 548  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16830050 gttgctcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctggaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagg 16830148  T
Q  549 gtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
     | |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  16830149 ct-acggtcctg-attatggtaccacatgcat 16830178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 17496330 - 17496239
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||| || |||||||||||    
T  17496330 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgcctcgtcgttcaaagcgg 17496239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 12034315 - 12034564
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  12034315 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 12034414  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | |  | || |||   |||| ||  | ||||    
T  12034415 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataaagatgagggcttcggctct--attatg 12034511  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  12034512 gtaccacatgcatatttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 12034564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12419629 - 12419511
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcat-aaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||  |||| ||||| ||  ||||||    
T  12419629 gtcatatacatatatatgcatttgatcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaaagcaggagggcttctgccatggaac 12419530  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  12419529 gccttgtcattcaaagcgg 12419511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 638
Target Start/End: Original strand, 14289150 - 14289212
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgtt 638  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14289150 tgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgtt 14289212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Original strand, 41455772 - 41455834
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagcc 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  41455772 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagtgaaccttagtcagcc 41455834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 463
Target Start/End: Original strand, 11305740 - 11305829
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  11305740 gttgtatatagatatacacaagtggagttacttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 11305829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 13324397 - 13324525
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggat 119  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||||     
T  13324397 actttctgcaagccagtcgcttaagcgagccagccttcgcttaagcg-agctgagccttagtcagccactttctgaattttgcttcgtgcattaggggac 13324495  T
Q  120 ccttttgagcatttttagatgttcctttca 149  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  13324496 ccttttgagcattcaaagatgtttctttca 13324525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 463
Target Start/End: Original strand, 11850594 - 11850721
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||| ||||| || |||    
T  11850594 tggagtcataagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagtataaaagcgggagggcctcg 11850692  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |   ||||||||||||| |||||||||||    
T  11850693 gtcctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 11850721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 9836 - 9785
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9836 gagtcgtagtggagttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 9785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 520 - 587
Target Start/End: Original strand, 11850781 - 11850847
Alignment:
Q  520 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11850781 aatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctg-aatatggtaccacatgcataattgca 11850847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13692151 - 13692040
Alignment:
Q  354 acatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgt 451  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  |||||||||||||    
T  13692151 acatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgt 13692052  T
Q  452 tgttcaaagcgg 463  Q
     |||||||||||    
T  13692051 cgttcaaagcgg 13692040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 3802551 - 3802486
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  3802551 tggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 3802486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14865295 - 14865166
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccat-cgcttaagcgaagatgacc-ttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactagg 115  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||   ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |    
T  14865295 cagacctactctaagctggtcgcttaagcgaactagccgttcgcttaagcgaac-tgagtgttagtcagcctttttctgaaccttgcttcgtgcactaag 14865197  T
Q  116 ggatccttttgagcatttttagatgttcctt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||    
T  14865196 ggatccttttgagtacttctaggtgttcctt 14865166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 648
Target Start/End: Original strand, 15012240 - 15012278
Alignment:
Q  610 gttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15012240 gttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 15012278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 17512624 - 17512473
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta---ccacatgcat------ag 582  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||||| |||||||   |||||| |||      ||    
T  17512624 agcggtgaggacctaggtcctgatga--atgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaggaccacatacatgtgtctag 17512528  T
Q  583 ttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 637  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17512527 ttgcatttgtcgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcataagtcattgt 17512473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18900330 - 18900266
Alignment:
Q  275 acttgatgtattagtatgattgacattaattataca--ttttctgatgttggattggttgagatg 337  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18900330 acttgatatattggtatgattgatattaattatacattttttctgatgttggattggttgtgatg 18900266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 580 - 637
Target Start/End: Original strand, 46723597 - 46723654
Alignment:
Q  580 tagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 637  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  46723597 tagttgcatttgtcgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgggtcattgt 46723654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 17130713 - 17130657
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  17130713 tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 17130657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 602
Target Start/End: Original strand, 10597826 - 10597933
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||  ||   |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10597826 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaacagtggtgacggcttcggccctg-attatggtaccacatgcatatttgcatttg 10597922  T
Q  592 tcggggagtct 602  Q
    | | |||||||    
T  10597923 ttgaggagtct 10597933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 11644786 - 11644877
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  11644786 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 11644877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 608 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15232060 - 15232021
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15232060 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttga 15232021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 608 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15237928 - 15237889
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15237928 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttga 15237889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17512788 - 17512726
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17512788 tggagttgtaagtcatatacatatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtgg 17512726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12153100 - 12152971
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtg-ggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagctt 432  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||     
T  12153100 atggagttgtaagtcatatacatatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacactagtgaagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctc 12153002  T
Q  433 cggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
      ||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  12153001 ttgccctggaacgccttgtcgttcatagcgg 12152971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Original strand, 13313539 - 13313613
Alignment:
Q  76 ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttca 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  13313539 ccttagtcagccactttctgaattttgcttcgtgcattaggggacccttttgagcatttaaagatgtttctttca 13313613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 2270227 - 2270319
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcat-aaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| |||| || |||||||||||    
T  2270227 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtttcataagcataaaaagcgggagggctttggccctggaatgcctcgtcgttcaaagcgg 2270319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 8583502 - 8583550
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8583502 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 8583550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 12419476 - 12419384
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||| |||   |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  12419476 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaacagcagtgagggcttcggccctg-attatggtaccatatgcatatttgca 12419384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 13037185 - 13037237
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13037185 ggagtcttagcggtgttgtcaagtagttgcatgagtctttgttgttggttgaa 13037237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 13342712 - 13342652
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13342712 atagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcattagtcgtcgttg 13342652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 13969069 - 13969117
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13969069 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 13969117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 13974544 - 13974592
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13974544 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 13974592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 14864804 - 14864748
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  | |||||||||||    
T  14864804 tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc 14864748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15374694 - 15374615
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  15374694 tggtaccacatgcatatctgcatttattgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttattgttggttg 15374615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 668
Target Start/End: Original strand, 16331678 - 16331846
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| |||||  | |    
T  16331678 agcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tctggtaccacatgcataattgca--tat 16331770  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
     | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  16331771 tgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgactctttattgttggttgtagttgttatattgatgatgatg 16331846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 632
Target Start/End: Original strand, 19236167 - 19236233
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  19236167 tatggtaccacatgcatagttgc-attgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 19236233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 24284653 - 24284705
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24284653 ggagtcttagtggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgctgttagttgaa 24284705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 49163232 - 49163087
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||| | |   ||| ||||   | |||||||||||||||| |||| ||| |    
T  49163232 agcggtgagggcttatgtcctgatga--atgcttgaaccattcaaaagcggtgagagcttcggtcctg---tttggtaccacatgcataattgc-attat 49163139  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49163138 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtc-ttgttgttggttg 49163087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 54520056 - 54519977
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| |||||  | | | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  54520056 tggtaccacatgcataattgcatattttgaggagtattagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagtcttagttgttggttg 54519977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 125
Target Start/End: Original strand, 12034078 - 12034125
Alignment:
Q  78 ttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12034078 ttagtcagccatttctgaaccttgcttcgtgcactaggggaccctttt 12034125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12255803 - 12255748
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggt 401  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12255803 gtcatatacatatatatgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggt 12255748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 647
Target Start/End: Original strand, 12856165 - 12856204
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12856165 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcattgttgatggttga 12856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14569779 - 14569724
Alignment:
Q  591 gtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14569779 gtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 14569724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 668
Target Start/End: Original strand, 32388169 - 32388271
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgat 664  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| || ||||    
T  32388169 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtgtcatcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggtggtaattgttataatgatgat 32388267  T
Q  665 gatg 668  Q
    ||||    
T  32388268 gatg 32388271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 35984670 - 35984627
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35984670 ggagtcttaatggtgtagtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 35984627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 48774816 - 48774863
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  48774816 gtcttagcagtgttgtcatgtcattgcatgagtcttggttgttggttg 48774863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Original strand, 13302863 - 13302937
Alignment:
Q  76 ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttca 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  13302863 ccttagtcagccactttctgaattttgcttcgtgcattaggggacccttttgagcattcaaagatgtttctttca 13302937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 15935185 - 15935243
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  15935185 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcattgttgttggttg 15935243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 16823937 - 16823995
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  16823937 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtatttgcatgagttgttgttgttggttg 16823995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16833202 - 16833153
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16833202 ggagtcttagtggtgtcgtcatgtcat-gcatgagtctttgttgttggttg 16833153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17131141 - 17131091
Alignment:
Q  78 ttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgag 128  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17131141 ttagtcagccttttttgaatcttgcttcgtgcactaggggacccttttgag 17131091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Original strand, 18757055 - 18757148
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga--cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| |  |||||||| |||   |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  18757055 agcggtgaggacttttgtcctaatgat--tgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctgat-tatggtaccacatgcatatttgca 18757148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24192578 - 24192544
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24192578 ggtcgcttaagcgaagtagccatcgcttaagcgaa 24192544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 566 - 632
Target Start/End: Original strand, 29545315 - 29545380
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  29545315 tggtaccacatgcataattgcattttttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 29545380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14084492 - 14084452
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14084492 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 14084452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14089893 - 14089853
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14089893 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 14089853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Original strand, 14648384 - 14648424
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14648384 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 14648424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14864997 - 14864949
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  14864997 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 14864949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18957777 - 18957698
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||    
T  18957777 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgattcattgtagttggttg 18957698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 19235968 - 19236016
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  19235968 gagttgtatgtagatatacactagtggagtcagttgcataagcataaaa 19236016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20187627 - 20187587
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20187627 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 20187587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 49399434 - 49399394
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  49399434 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 49399394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 250 - 649
Target Start/End: Original strand, 14 - 412
Alignment:
Q  250 aagtgaaaagatgttgcgttgaatgacttgatgtattagtatgattgacattaattatacattt-tctgatgttggattggttgagatggagtcgtatgt 348  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| | || ||||||| ||    
T  14 aagtgaaaatatgttatgttgaatgacttgatgtattggtatgattgtcattgattatacatttctctggtgttgaattggttgcggtgaagtcgtaggt 113  T
Q  349 catatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgcct 448  Q
    |||||    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  114 catattttgatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgcct 213  T
Q  449 tgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 548  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 tgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 313  T
Q  549 gtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |  |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  314 gctacggtcctg-aacatggtaccacatgcataattgcatttgtcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgttattgttgattgaa 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 335 - 642
Target Start/End: Original strand, 4551 - 4856
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| ||| ||||||||   | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4551 atggagttgtaagtcatatatgcaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacataagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcg 4650  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4651 gctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaacaatt 4750  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||    
T  4751 cgacagcggtgtgggtcacggccctg-aatatggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgt 4848  T
Q  635 tgttgttg 642  Q
    ||||||||    
T  4849 tgttgttg 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 23767 - 23975
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23767 agttgtatgcagatatacacaagtgggtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 23866  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  23867 ttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacctatgtcctgaaatgaatgctttaaccattctattagcggtgagggctccggccctg-aatatggta 23965  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  23966 ccacatgcat 23975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 18136 - 18344
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18136 agttgtatatagatatacacaagtgggtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 18235  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    ||||||||| |||||| |  ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  18236 ttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacctatgtcctgaaatgaatgctttagccattctattagcggtgagggctccggccctg-aatatggta 18334  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  18335 ccacatgcat 18344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 4215 - 4329
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactt-ttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| |    
T  4215 cagacttactgtaagctgatcgcttaagcgaactagacgtcgcttaagcgaagttgaccttagtcagtcacttcttgaacgttgcctcgtgcattaggag 4314  T
Q  118 atccttttgagcatt 132  Q
    | |||||||||||||    
T  4315 aaccttttgagcatt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 335 - 649
Target Start/End: Original strand, 4232 - 4544
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232 atggagtcgtaagtcatatatacaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtggattagttgcataagcataaaagtgggagagcttcg 4331  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4332 gctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactaattgttcacagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccatt 4431  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  4432 cgacagcggtgtgggtcacggccctg-aatatggtaccgcatgcatagttgcatttatcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacttgagttgt 4529  T
Q  635 tgttgttggttgaat 649  Q
    |||||||| ||||||    
T  4530 tgttgttgattgaat 4544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 132
Target Start/End: Original strand, 3885 - 4011
Alignment:
Q  6 ttgagcagcaacacagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcct 104  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3885 ttgagcag-aacccagactcactgtaagccggtcgcttaagcgaactagacgtcgcttaagcgaagttgaccttagtcagccactttttgaacgttgcct 3983  T
Q  105 cgtgcactaggggatccttttgagcatt 132  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||    
T  3984 cgtgcattaggagacccttttgagcatt 4011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 85)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 373 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 18212344 - 18212074
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18212344 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 18212245  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18212244 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-aatatggtacc 18212146  T
Q  573 acatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18212145 acatgcatagttgcatttgt-gaggagtcttagatgtatcgtcatgtctttgcatgagtcgttgtcgttggtt 18212074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15407144 - 15406843
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  15407144 gtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataaacatgaaagcgagagagcttcggctctggaacgc 15407045  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||| |    
T  15407044 ctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcattagcgg-g 15406946  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
     |||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15406945 agggcttcggccctg-aatatggtaccacatgcatagctgcatttgtcaaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattacatgagttgttgttgttggtt 15406847  T
Q  646 gaat 649  Q
    ||||    
T  15406846 gaat 15406843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 11847285 - 11847003
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||| |||||||   | |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11847285 gtcatatatatacatatataatagtcgagttgtatgaagatatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgc 11847186  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgt 546  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11847185 ctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgt 11847086  T
Q  547 gggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagt 631  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||    
T  11847085 gggtcacggccctg-tttatggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtcttagtgg-ggtgtcatgtcatttcatgagt 11847003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 368 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 15533996 - 15533735
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15533996 tagttgagttgtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgga 15533897  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
     ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||    
T  15533896 gcactagttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctg-attttg 15533799  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15533798 gtaccacatgcatagttgcttttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 15533735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Original strand, 8046863 - 8047081
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8046863 tagtcgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagtggcataaacatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 8046961  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8046962 acactagttgttcaaagcggtgtggagcagtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatg 8047061  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8047062 gtaccacatgcatagttgca 8047081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 347 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 14485745 - 14485432
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||     
T  14485745 gtcatataaatacatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaaca 14485646  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcg 542  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||    
T  14485645 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcg 14485546  T
Q  543 gtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttg 642  Q
    ||| |||   |||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14485545 gtgagggcttcggccct--aatatggtaccacaagcatagtcgtaattatcgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcaatgcatgagtcgttgttgttg 14485448  T
Q  643 gttgaatcgttatatt 658  Q
    ||||||| | ||||||    
T  14485447 gttgaattgctatatt 14485432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15407536 - 15407319
Alignment:
Q  20 agacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggat 119  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15407536 agactttctgtgagccggtcgcttaagcgaactggccgtcgcttaagcgaagatgaccatagtcagccacttttgaactttgcctcgtgcactaggggat 15407437  T
Q  120 ccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaa 219  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  15407436 ccttttgagtatttctaaatgttcctttcaacttttaagaccattatatataccttgaatcctactaaacacattgtt-aagcaagttggtatagtttaa 15407338  T
Q  220 tgaatttgtggattgaagtg 239  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  15407337 tgaattt-cggattgaagtg 15407319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 14484662 - 14484432
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || | |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14484662 gtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatacacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgc 14484563  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  14484562 cttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgttttaaccattctacagcggtg 14484463  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||  |||| |||| | ||||||||||||||    
T  14484462 agggctacggtcctg-attatggtaccacatg 14484432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 635739 - 635940
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||  |||||||     
T  635739 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgcttggtcgttcaaagtggtggagtactagtta 635838  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  635839 ctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 635937  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  635938 cat 635940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 16156867 - 16156630
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataa-aagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16156867 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacgagtgggtcagttgcataatcataataagtgggagggcttcggccttggaacg 16156768  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga--taatgctttaaccattcga-cagc 541  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||| |  |||    
T  16156767 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctattagc 16156668  T
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16156667 ggtgagggctccggccctg-aatatggtaccacatgcat 16156630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 373 - 648
Target Start/End: Original strand, 4831057 - 4831330
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  4831057 gagttgtatgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcac 4831156  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  4831157 tagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctg-aatatggta 4831255  T
Q  571 ccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||||||    || ||||| | |||||||||| || || ||   ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4831256 ccacatgcat--gcgc-attgttgaggagtcttagtggagtcgttgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 4831330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 373 - 648
Target Start/End: Original strand, 4834352 - 4834625
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  4834352 gagttgtatgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcac 4834451  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  4834452 tagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctg-aatatggta 4834550  T
Q  571 ccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||||||    || ||||| | |||||||||| || || ||   ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4834551 ccacatgcat--gcgc-attgttgaggagtcttagtggagtcgttgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 4834625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 23121804 - 23121599
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  23121804 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaatgcctcgtcgttcaaagtggtggagcactag 23121705  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | | ||||||||    
T  23121704 ttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attttggtacca 23121606  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  23121605 catgcat 23121599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 585
Target Start/End: Original strand, 11171202 - 11171440
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11171202 gtcatatacatatatatgcataggttgagtggtatgtatatatacacaagtgggtcagttgcataaacataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 11171301  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||| | ||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||    
T  11171302 cttatcgtttaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacggcggtg 11171401  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttg 585  Q
     |||  ||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  11171402 agggctacgaccctg-attatggtactacatgcatggttg 11171440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 347 - 545
Target Start/End: Original strand, 17000111 - 17000310
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  17000111 gtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgagagagcttcggctctggaacac 17000210  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||  |||||||||    
T  17000211 cttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgagaacttatgtcctgaaaatgaatgttttaaccattttacagcggtg 17000310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 336 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 14910831 - 14910534
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttc 433  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||    
T  14910831 tggagtcataagtcatatatacacatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcggtgagggcctc 14910732  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaac 530  Q
    ||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| ||   | |||||||||||    
T  14910731 ggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcgatggaacactatgttgttcaaagcgatgtt-ag-ggtgaggactcatgtccttataaaagaatgctttaac 14910634  T
Q  531 cattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgag 630  Q
    ||||| | ||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  14910633 cattctatagcggtgagggctccggccctg-attatggtaccacatgcatagttgcatttgttgagtagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgag 14910536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 347 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 15325108 - 15324919
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  15325108 gtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagttacataagcataaaagcgggagggcttctgccctggaacg 15325009  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc 535  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15325008 ccttgtcgttcaaagcggtggaacacttgatgttcaaagcggt-tttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 15324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 43284868 - 43285072
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43284868 gttgtatgtagatatacaagagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgttgttcaaagtggtggagcactag 43284967  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||| || | |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  43284968 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgatttaaccattctacagaggagagggctacggtcctg-attatggtacca 43285065  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  43285066 catgcat 43285072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 376 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 20940463 - 20940260
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20940463 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtgggagagcttcagctctggaacgccttgttgttcaaagtggtggagcactagt 20940364  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    || |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||| |||| | | |||||||||    
T  20940363 tgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacaacggtgagggctacggtcctg-attttggtaccac 20940266  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  20940265 atgcat 20940260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 373 - 537
Target Start/End: Original strand, 26077681 - 26077847
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26077681 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcaattacataagcataaaagcgggagggcttcggctctgaaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 26077780  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga 537  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  26077781 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcga 26077847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 368 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 14048414 - 14048218
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgg 466  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14048414 tagttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggctttggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgg 14048315  T
Q  467 aacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctg 560  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  14048314 aacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgatcagcggtgagggtttcggccctg 14048218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 14556050 - 14556260
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14556050 agttgtatgtagatatacacaagtgggtcagtagcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 14556149  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg--atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| |||||||    
T  14556150 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctg-aatatgg 14556248  T
Q  569 taccacatgcat 580  Q
    ||||||||||||    
T  14556249 taccacatgcat 14556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 53748750 - 53748927
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  53748750 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 53748847  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53748848 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccacatgcat 53748927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 14063116 - 14062908
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta 473  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  14063116 gttgtatgtaggtatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactt 14063017  T
Q  474 -gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| | |||||||    
T  14063016 tgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctg-attatggta 14062918  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  14062917 ccacatgcat 14062908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 41799951 - 41800128
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  41799951 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 41800048  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  41800049 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 41800128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 42701403 - 42701226
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  42701403 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 42701306  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  42701305 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 42701226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 51602072 - 51602249
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  51602072 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 51602169  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  51602170 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 51602249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 580
Target Start/End: Original strand, 51607953 - 51608130
Alignment:
Q  401 ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 500  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  51607953 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 51608050  T
Q  501 ggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  51608051 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 51608130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 41529054 - 41529263
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||  || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41529054 agttatatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctgaaacgccttatcgttcaaagcggtggaacact 41529153  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  41529154 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctg-aatatggt 41529252  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  41529253 accacatgcat 41529263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 545
Target Start/End: Original strand, 1651000 - 1651203
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||  ||||||    
T  1651000 gtcatataagtacatatgcattagtggagttgtaagtagatatacacaagcggagtcagttgcataagcataaaagcggtgagggcttctgccctggaac 1651099  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagc 541  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||    
T  1651100 gccttgtcgttcaaagcggtggaacacattgttgttcaaagcggagtttgacggtgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctatagc 1651199  T
Q  542 ggtg 545  Q
    ||||    
T  1651200 ggtg 1651203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 373 - 580
Target Start/End: Original strand, 2585138 - 2585346
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| ||   |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2585138 gagttgtatgtagatatgcacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacac 2585237  T
Q  472 ta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |  ||||||| |||   |||||||||| |||||    
T  2585238 tttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctga--atgaatgctttaatcattcaattagcggtgagggcttcggccctgaa-tatgg 2585334  T
Q  569 taccacatgcat 580  Q
    ||||||||||||    
T  2585335 taccacatgcat 2585346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 347 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27905446 - 27905244
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||| || ||||   | ||||    
T  27905446 gtcatataaatacatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgaataagcataaaagcggtgagggcctcggtcctagaac 27905347  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagc 541  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||    
T  27905346 gccttgtcgttcaaagcgatggaacactatgttgttcaaagcggtgtt-agcggagaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctatagc 27905248  T
Q  542 ggtg 545  Q
    ||||    
T  27905247 ggtg 27905244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 16152661 - 16152484
Alignment:
Q  407 gcataagcataa-aagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggac 504  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16152661 gcataatcataataagtgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggac 16152562  T
Q  505 ttatgtcctgatga--taatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||  |   |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16152561 ttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctattagcggtgagggctccggccctg-aatatggtaccacatgcat 16152484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 500 - 669
Target Start/End: Original strand, 10977120 - 10977289
Alignment:
Q  500 aggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcgggga 598  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || | | |||    
T  10977120 aggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggctctg-aatatggtaccacatgcatagtcgcatttattgagga 10977216  T
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggtt-gaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  10977217 gtcttagtggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcgttattgttggttggaattgctatattgatgatgatgt 10977289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13887227 - 13887097
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttg 126  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13887227 ctgtaagccggtcgtttaagcgagccagccgtcgcttaagcgaagaaggtcttagttagccacttttgaattttgcttcgtgcactagggaatccttttg 13887128  T
Q  127 agcatttt-tagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    | ||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  13887127 aacattttaaaaatgtttctttcaacttgta 13887097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13888084 - 13887954
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttg 126  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13888084 ctgtaagccggtcgtttaagcgagccagccgtcgcttaagcgaagaaggtcttagttagccacttttgaattttgcttcgtgcactagggaatccttttg 13887985  T
Q  127 agcatttt-tagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    | ||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  13887984 aacattttaaaaatgtttctttcaacttgta 13887954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 357 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 40908809 - 40908583
Alignment:
Q  357 tacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgt 454  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| |   | ||| | |||||   ||||| |||||||  |    
T  40908809 tacatatgcattagttggagttgtatgtagatatacacaagcggagtcagttgcataagcatacagcggtgagggtttcggtcctggaatgccttgtcat 40908710  T
Q  455 tcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 551  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | ||||||| |||      
T  40908709 tcaaagtggtggaacacaatgttgttcaaagcggtgtttaacggtgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctatagcggtgagggct 40908610  T
Q  552 acggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
     ||||||||   |||||||||||||||||    
T  40908609 ccggccctg--ttatggtaccacatgcat 40908583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15307562 - 15307453
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt--gaaccttgcctcgtgcactaggggatccttt 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  15307562 ctgtaagtcggtcgcttaagcgagccagccatcgcttaagcgaagaaggtcttagtcagccacttttcgaaactttgcttcgtgcactagggaatccttt 15307463  T
Q  125 tgagcatttt 134  Q
     |||||||||    
T  15307462 cgagcatttt 15307453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 37881634 - 37881521
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  37881634 gtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtaagtcgcatatgcataaaagcgggagggcttctgccctggaacg 37881535  T
Q  446 ccttgttgttcaaa 459  Q
    |||||| |||||||    
T  37881534 ccttgtcgttcaaa 37881521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 452 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 16221356 - 16221226
Alignment:
Q  452 tgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgg 548  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  16221356 tgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcgttgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagg 16221257  T
Q  549 gtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |   || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16221256 gcttcgtccctg-aatatggtaccacatgcat 16221226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 439 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 14048219 - 14048121
Alignment:
Q  439 tggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattc 535  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  14048219 tggaacgccttgtcgttcaaaacggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattc 14048121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13453964 - 13453847
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  13453964 gtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagttaaataagcataaaagcgggagggcttctgccctggaacg 13453865  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||| |||||||||||    
T  13453864 ccttgtcgttcaaagcgg 13453847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 566 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 14821370 - 14821297
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14821370 tggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgttgttgcatgagtcgttgttg 14821297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 13886680 - 13886612
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13886680 tggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttaggggtgttgtcaagtcattgcatgagtcgt 13886612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 566 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15307015 - 15306909
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgag---tcgttgttgttggttgaatcgttatattgttg 662  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||| |||||| |||| |  ||||| |||    
T  15307015 tggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgggtgagtcatcgttgtcgttggtcgaattgccatattattg 15306916  T
Q  663 atgatgt 669  Q
    |||||||    
T  15306915 atgatgt 15306909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 13452307 - 13452204
Alignment:
Q  497 gtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcgg 595  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  13452307 gtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatatttgcatttgttga 13452211  T
Q  596 ggagtct 602  Q
    |||||||    
T  13452210 ggagtct 13452204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15244185 - 15244007
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagc-ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | | |||| |||   | |||||| ||  ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  15244185 agcggtgagggcttatgccctgatga--atgctttaaccattcaatatccggtgagggcttctgccctgtaaattggtaacacatgcatagtcgcatttg 15244088  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg---ttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    | | ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||   |||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  15244087 ttgaggagtcttagaggggttgtgatatcattgcatgagtcgtcgttgtcattggttgaattgccatattattgatgatgt 15244007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 30146975 - 30146857
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| ||   ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30146975 gagttgtatctacatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacac 30146876  T
Q  472 -tagttgttcaaagcggtg 489  Q
     | ||||||||||||||||    
T  30146875 tttgttgttcaaagcggtg 30146857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 16147436 - 16147564
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggg 116  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||   ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  16147436 cagacctactgtaagatggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaa-ctgagtgttagtcagcctttttctgaaccttgcttcgtgcactaagg 16147534  T
Q  117 gatccttttgagcatttttagatgttcctt 146  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||    
T  16147535 gatccttttgagtacttctaggtgttcctt 16147564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 588 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15546554 - 15546494
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15546554 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcaagttgttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 15546494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 27849673 - 27849725
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27849673 ggagtcttagcggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 27849725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 49051141 - 49051081
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  49051141 gagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagggcttc 49051081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11847537 - 11847439
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcattt 133  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11847537 ggtcgcttaagcgaactacccgtcgcttaagcg-agctgagccttagtcagcctctttctgaactttgctttgtgcactaggggacccttttgagtattt 11847439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 46044920 - 46045068
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  46044920 agcggtgagggctaatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctgt--tttggtaccacatgcataattgcatttat 46045015  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46045016 tgaggggtcttagtggtgtcatcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 46045068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8834327 - 8834198
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||   |||| || |||||||| | ||||||||    
T  8834327 ctgtaagccggtcgcttaa-caagccagccttcgcttaagcgaagaaggtcttagtcagccactttttgatttttgcttcatgcactagagaatcctttt 8834229  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||| || | | ||||| |||||||||||||    
T  8834228 gagcgttctaaaatgtttctttcaacttgta 8834198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 22726056 - 22726106
Alignment:
Q  580 tagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgag 630  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22726056 tagttgcatttgtcgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgag 22726106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 53483085 - 53483023
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagcc 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  53483085 tactgtaagctggtcgcttaagcgaacttgccgtcgcttaagcgaagtgaaccttagtcagcc 53483023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 603 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13444180 - 13444135
Alignment:
Q  603 tagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13444180 tagaggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 13444135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14486112 - 14486049
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccact 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14486112 ctgtaagccggtcgcttaagcgagccagccttcgcttaagcgaag-tgagccttagtcagccact 14486049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15244657 - 15244554
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttg--aaccttgcctcgtgcactaggggatccttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||   | || |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||   ||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  15244657 ctgtaagccggtcgcttaagcgagtcaaccgtcgcttaatcgaagaaggtcttagtcagccactttttgaaattttgcttcgtgcactagggaatccttt 15244558  T
Q  125 tgag 128  Q
    ||||    
T  15244557 tgag 15244554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 620
Target Start/End: Original strand, 16147934 - 16147990
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||    
T  16147934 tatggtaccacatgcatagttgcaattgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc 16147990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20889339 - 20889260
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| |||||  | | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  20889339 tggtaccacatgcataattgcatattttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagtcttagttgttggttg 20889260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12932049 - 12931958
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||   ||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  12932049 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagagctcttgccctggaatgccttgtcgttcaaagcgg 12931958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17176599 - 17176528
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    |||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  17176599 gtcatatacacatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 17176528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 36037527 - 36037462
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  36037527 tggtaccgcatgcatagttgcatttgtagaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 36037462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 30237714 - 30237673
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30237714 ggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 30237673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20894958 - 20894879
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| |||||  | | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||    
T  20894958 tggtaccacatgcataattgcatattttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgaatcttagttgttggttg 20894879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 31665024 - 31664945
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||  ||||  | | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  31665024 tggtaccacatgcataactgcatattttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagtcttagttgttggttg 31664945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Original strand, 41404825 - 41404904
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41404825 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtgtcgttatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 41404904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 42220396 - 42220317
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  42220396 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctctgtcgttggttg 42220317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Original strand, 49548702 - 49548781
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| |||||  | | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  49548702 tggtaccacatgcataattgcatattttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagttttagttgttggttg 49548781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 53905283 - 53905375
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  53905283 gagttgtatgtaaatatacacaagtggagtgagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 53905375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15318054 - 15318015
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15318054 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttggtgatggttga 15318015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 13899812 - 13899870
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  13899812 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcattgttgttggttg 13899870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15075225 - 15075187
Alignment:
Q  610 gttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15075225 gttgtcatgtcattgcatgagttgttgttgttgtttgaa 15075187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18261284 - 18261226
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  18261284 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcattgttgttggttg 18261226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18271249 - 18271191
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  18271249 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcattgttgttggttg 18271191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 13452161 - 13452121
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13452161 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 13452121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 417
Target Start/End: Original strand, 15360792 - 15360836
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  15360792 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 15360836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 16147733 - 16147781
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  16147733 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 16147781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Original strand, 18166228 - 18166280
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    ||||||||| || ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18166228 gtcatatacgtatatatgcatttgtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 18166280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18261546 - 18261483
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18261546 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtgg 18261483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18271511 - 18271448
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18271511 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtgg 18271448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 33097058 - 33096979
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  33097058 tggtaccacatgcatatctgcatttattgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctctgtcgttggttg 33096979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 33221334 - 33221256
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| |||| || || | |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  33221334 tggtaccacatgcatatttgc-atagttgaggagtcttggtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtcttagttgttggttg 33221256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 6)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 335 - 649
Target Start/End: Original strand, 15389 - 15701
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15389 atggagttgtatgtcatatacataaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagggggttagttgcacaagcataaaagtgggagagcttcg 15488  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
     || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15489 actctggaacgccttgtcattcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccatt 15588  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||    
T  15589 cgacaacggtgtgggtcacggccctg-aataaggtaccacatgcatagttgcatttatagaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgt 15686  T
Q  635 tgttgttggttgaat 649  Q
    | |||||| ||||||    
T  15687 tattgttgattgaat 15701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 347 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 71322 - 71154
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  71322 gtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagtgtgtcagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgc 71223  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctga 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  71222 cttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctga 71154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 15053 - 15261
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| |     
T  15053 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagtggaccttagtcagccacctttgaattttacctcgtgcactaggag- 15151  T
Q  119 tccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatat--gtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatag-t 215  Q
     ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |    
T  15152 cccttttgagtacttctaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatacataccctgaatcctactaaacacattgttaagt-gagttggtatagtt 15250  T
Q  216 ttaatgaattt 226  Q
    |||||||||||    
T  15251 ttaatgaattt 15261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 76728 - 76649
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||| || | | |||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||    
T  76728 tggtaccacatgcattgtcgta-ttgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtaattgcatgagtcattgttgttggttg 76649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 76928 - 76837
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcg 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||   |||||||||||| ||||||||||    
T  76928 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgcccgggaacgccttgtcgttcaaagcg 76837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 70
Target Start/End: Original strand, 14828 - 14862
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14828 ggtcgcttaagcgaagtagccatcgcttaagcgaa 14862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 373 - 645
Target Start/End: Original strand, 10229 - 10499
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10229 gagttgtatgtagatatacataagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcagctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 10328  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10329 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-aatatggtacc 10427  T
Q  573 acatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10428 acatgcatagttgcatttgt-gaggagtcttagatgtgtcgtcatgtctttgcatgagtcgttgtcgttggtt 10499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 335 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 10443 - 10150
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10443 atggagtcgtaagtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtggatatacacaaatgggttagtcgcataagcataaaagtgtgagagcttcg 10344  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10343 gctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtagaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccatt 10244  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagt 631  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10243 cgacagcggagtgggtcacggccctg-aatatggtaccacaagcatagttgc-attatcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagt 10150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10761 - 10623
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10761 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaagttgatcttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcattagggg 10662  T
Q  118 atccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||| ||  |||||||  | |||| ||||| ||||||||    
T  10661 atcccttgtagcatttaaacatgtcccttttaacttgta 10623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 8)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 336 - 632
Target Start/End: Original strand, 36751 - 37045
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcgg 435  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36751 tggagtcataagtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgagagagcttcgg 36850  T
Q  436 ctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc 535  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36851 ctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattc 36950  T
Q  536 gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  36951 gacagcggtgtgggtcatggccctg-attatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 37045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 439 - 665
Target Start/End: Original strand, 44054 - 44280
Alignment:
Q  439 tggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga 537  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  44054 tggaacactttgttgttcaaagcggtggaacactttgttgt-caaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcctaaaaagaatgctttaaccattcga 44152  T
Q  538 c-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttg 636  Q
      ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44153 ttagcggtgagggctctggccctgaa-tatggtaccacatggatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgctgtcatgtcattgcatgagtcgttg 44251  T
Q  637 ttgttggttgaatcgttatattgttgatg 665  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  44252 ttgttggttgaattgctatattattgatg 44280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 489
Target Start/End: Original strand, 43708 - 44080
Alignment:
Q  138 atgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatgaatttgtggattgaag 237  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||  |||||  ||    
T  43708 atgttcctttcaacttataagaccattatatataccttgaatcctactgaacacattgttaa-tcgaattggtgtaatttaatgaatttc-ggattagag 43805  T
Q  238 tgagtgtgaacc--aagtgaaaagatgttgcgttgaatga-cttgatgtattagtatgattgacattaattatacattttc--tgatgttggattggttg 332  Q
    |||||   || |  ||||||||| ||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||     
T  43806 tgagtacaaaactaaagtgaaaatatactatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattgttattaattatacatttttcttgatgttggattggttt 43905  T
Q  333 -------ag----------atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagc 414  Q
           ||          ||| |||||||||||||||| | | ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||    
T  43906 gtgatgaagttgttgaattatgaagtcgtatgtcatatatacatatatgcatt-gtcgagtggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagc 44004  T
Q  415 ataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtg 489  Q
    || |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44005 attaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtg 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 34935 - 35006
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34935 actttctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt 35006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 40664 - 40549
Alignment:
Q  414 cataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcct 513  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||||||||||||||    
T  40664 cataacagtggaagagcttcggctctggaatgcttggtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcct 40567  T
Q  514 gatgataatgctttaacc 531  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  40566 gttgagaatgctttaacc 40549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9463 - 9344
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggtt-agtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaa 443  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  |||||    
T  9463 gtcatatacatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggattcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaa 9364  T
Q  444 cgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  9363 cgccttgtcgttcaaagcgg 9344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 45105 - 45014
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  45105 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgctctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 45014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 535 - 580
Target Start/End: Original strand, 8493 - 8538
Alignment:
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  8493 cgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 8538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 101)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 364 - 649
Target Start/End: Original strand, 22439687 - 22439970
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  22439687 gcattagttgagttgtatgtagatatacataagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagctccggctctagaacgccttgtcgttcaaagcgg 22439786  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaa 563  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22439787 tgaaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-aa 22439885  T
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||    
T  22439886 tatggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgttattattgattgaat 22439970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 370 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 19511209 - 19510935
Alignment:
Q  370 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19511209 gtggagttgtatgtagagatacacaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaac 19511110  T
Q  470 actagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19511109 actagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggt 19511010  T
Q  570 accacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19511009 accacatgcatagttgcatttattgaggagtattagggggaaggtcatgtc-ttgcatgagtcgttgttgttggtt 19510935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 587
Target Start/End: Original strand, 1857448 - 1857687
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1857448 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcata-gcatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgc 1857546  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1857547 cttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtg 1857646  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1857647 tgggtcacggccctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 1857687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 587
Target Start/End: Original strand, 21675416 - 21675655
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21675416 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgc 21675514  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21675515 cttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtg 21675614  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21675615 tgggtcacggccctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 21675655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 368 - 632
Target Start/End: Original strand, 37805282 - 37805543
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  37805282 tagttgagttgtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctgtaacgccttgtcgttcaaagtggtgga 37805381  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
     ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||    
T  37805382 gcactagttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctg-attttg 37805479  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  37805480 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 37805543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 23527656 - 23527441
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcat-aagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23527656 gagttgtatgtagatatacacaggtggggtagttgcattaaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacac 23527557  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtac 571  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23527556 tagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctgaattatggtac 23527457  T
Q  572 cacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||| |||||    
T  23527456 cacatgcatatttgca 23527441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 376 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 9775669 - 9775416
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  9775669 ttgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagt 9775570  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    || |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  9775569 tgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctg-attttggtaccaca 9775472  T
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  9775471 tgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 9775416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 339 - 632
Target Start/End: Original strand, 23112673 - 23112965
Alignment:
Q  339 agtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggct 437  Q
    |||||||  ||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || ||  || ||||      
T  23112673 agtcgtaaatcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcatttgcataagcataaaagcggtgatggcctcggtc 23112772  T
Q  438 ttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcg 536  Q
     |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23112773 ctggaacaccttgtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcg 23112871  T
Q  537 acagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  23112872 acagcggtgagggtcacggccctg-attatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 23112965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Original strand, 18408550 - 18408843
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  18408550 actttctgtaagccggtcgcttaagcaaactagccgtcgcttaagcgaaaatgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcactaggggatt 18408649  T
Q  121 cttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaat 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |  | ||||||    
T  18408650 cttttgagcatttttaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctactgaacacattgttaa-tcgaattggtggaatttaat 18408748  T
Q  221 gaatttgtggattgaagtgagtgtgaa-ccaagtgaaaagatgttgcgttgaatga-cttgatgtattagtatgattgacattaattatacatttt 314  Q
    |||||| || |||  ||||||| |||| |||||| |||| ||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  18408749 gaattt-tgaatttgagtgagtatgaaaccaagttaaaatatactatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattgttattaattatacttttt 18408843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 20937827 - 20937594
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20937827 gtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctgtggaacgc 20937728  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||| |||||    
T  20937727 cttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcttgaaaatgaatgctttaaccattctacatcggtg 20937628  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
     |||  |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  20937627 agggctacggtcctg-attatggtaccacatgcat 20937594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 22312773 - 22313005
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22312773 gtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcgactctggaacgc 22312872  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  22312873 cttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtg-tcagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtg 22312971  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
     |||  |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  22312972 agggctacggtcctg-attatggtaccacatgcat 22313005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 758224 - 758427
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  758224 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 758323  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    ||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||    |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | |||||||||||    
T  758324 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttacgtcctgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtaccac 758421  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  758422 atgcat 758427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 17264770 - 17264971
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||| ||||||  |||||||     
T  17264770 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacatcacagtgggagagcttcggctctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtactagtta 17264869  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17264870 ctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 17264968  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  17264969 cat 17264971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22175216 - 22175014
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataag-cataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  22175216 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgcttggtcgttcaaagtggtggagtactagtt 22175117  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
      |||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  22175116 actcaaagtggtgtt-agtggttaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 22175018  T
Q  577 gcat 580  Q
    ||||    
T  22175017 gcat 22175014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 17271252 - 17271453
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||| ||||||  |||||||     
T  17271252 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacatcacagtgggagagcttcggctctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtactagtta 17271351  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17271352 ctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcaacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 17271450  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  17271451 cat 17271453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 22007865 - 22008102
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataa-aagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||    
T  22007865 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataatcataataagtgggagggcttcggccctggaacg 22007964  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga--taatgctttaaccattcga-cagc 541  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||| |  |||    
T  22007965 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcgatgtttagcggtgaggacttaggtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctattagc 22008064  T
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  22008065 ggtgagggctccggccctg-attatggtaccacatgcat 22008102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 375 - 545
Target Start/End: Original strand, 22509142 - 22509312
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||    
T  22509142 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggatctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagtactag 22509241  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  22509242 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtg 22509312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 373 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 23539009 - 23538736
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  23539009 gagttgtatgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgacttgtcgttcaaagtggtggagcac 23538910  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  23538909 tagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccatactacagcggtgagggctacggccctg-aatatggta 23538811  T
Q  571 ccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||||||    || ||||| | |||||||||| || || ||   ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23538810 ccacatgcat--gcgc-attgttgaggagtcttagtggagtcgttgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 23538736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 374 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 34829236 - 34828977
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34829236 agttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 34829137  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat---gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    | |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    | |||||||||||||||| | | ||||| |||   |||| |||  ||||||    
T  34829136 atgttgttcaaagcggtgtt-aatggtgaggactcatgtcctgataaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggctccggctctg--atatgg 34829040  T
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  34829039 taccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 34828977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Original strand, 21678242 - 21678443
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtggg-ttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  21678242 gtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 21678341  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  21678342 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 21678439  T
Q  577 gcat 580  Q
    ||||    
T  21678440 gcat 21678443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 373 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 10816982 - 10816709
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||   | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| |||    
T  10816982 gagttgtatgaatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaattggtggagcac 10816883  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||| |||||||||    
T  10816882 tagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacgacactg-aatatggta 10816784  T
Q  571 ccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||||||    || ||||| | |||||||||| || || ||   ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10816783 ccacatgcat--gcgc-attgttgaggagtcttagtggagtcgttgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 10816709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 511
Target Start/End: Original strand, 6728201 - 6728368
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||| ||| ||||  || |||    
T  6728201 gtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagcaggagggctccggccctgaaac 6728300  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtc 511  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6728301 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtc 6728368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 6404465 - 6404673
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6404465 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagagctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 6404564  T
Q  473 -agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
      |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   || ||||| |||||||||    
T  6404565 ctgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtccttaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccgaccctg-aatatggta 6404663  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  6404664 ccacatgcat 6404673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 28371393 - 28371653
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||| |||  | ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28371393 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcgttgcataagcataaaaatggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacac 28371492  T
Q  472 ta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat----gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    || |||||||||||||||||| |   | ||||||| ||||||||||     | |||||||||||||||| | | ||||| |||   |||| |||  ||||    
T  28371493 tatgttgttcaaagcggtgttaa--tgggaggactcatgtcctgataaaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggcttcggctctg--atat 28371588  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  28371589 ggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 28371653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 38145722 - 38145980
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||  | |||  | ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38145722 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcggtgcataagcataaaatggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 38145821  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat---gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    | |||||||||||||||||| |   | ||||||| ||||||||||    | |||||||||||||||| | | ||||| |||   |||| |||  ||||||    
T  38145822 atgttgttcaaagcggtgttaa--tgggaggactcatgtcctgataaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggcttcggctctg--atatgg 38145917  T
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  38145918 taccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 38145980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 580
Target Start/End: Original strand, 22232569 - 22232813
Alignment:
Q  337 ggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcgg 435  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   |    
T  22232569 ggagtcgtaagtcatatgaaaacatatgcatt-gttaagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttg 22232667  T
Q  436 ctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccatt 534  Q
    |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    |||||| ||||||||    
T  22232668 ccctggaacaccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtaaagacttatgtcctgaaatgaatgctataaccatt 22232767  T
Q  535 cga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    | |  ||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22232768 caattagcggtgagggctccggccctg-aatatggtaccacatgcat 22232813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 493 - 669
Target Start/End: Original strand, 18409124 - 18409299
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||| |  ||||||| | |   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18409124 agcggtgaggacctatgtcctgaacg-aatgctttaaccattcaattagcggtgagagcttcggccctgaa-tatggtaccacgtgcatagttgcatttg 18409221  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  18409222 tcgaggagtcttagaggtgttgtcatgaaattgcatgagtcgttgttgttggttgaatttttgtattattgatgatgt 18409299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 42960289 - 42960031
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||  | |||  | ||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42960289 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcggtgcataagcataaaatggtgaggacctcggtcctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 42960190  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataa---tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    | |||||||||||||||||| |  ||  |||||| |||||||||| | ||   |||||||||||||| | | ||||| |||   |||| ||||  |||||    
T  42960189 atgttgttcaaagcggtgttaatggg--aggactcatgtcctgataaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggcttcggctctga--tatgg 42960094  T
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  42960093 taccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 42960031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 22336316 - 22336056
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  | ||||   ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  22336316 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaaacgatggaaca 22336217  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  22336216 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 22336120  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22336119 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 22336056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 22339854 - 22339594
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  | ||||   |||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  22339854 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacctcggtcctggaacaccttgtcgttcaaaacgatggaaca 22339755  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  22339754 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 22339658  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22339657 gtacgacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 22339594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 485
Target Start/End: Original strand, 18408968 - 18409081
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || || |||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  18408968 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcggaagggctttggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtgaaactc 18409067  T
Q  472 tagttgttcaaagc 485  Q
    | ||||||||||||    
T  18409068 ttgttgttcaaagc 18409081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 22749963 - 22749702
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagag--cttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaac 469  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||   |  |||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  22749963 gagttgtatgtagatatccacaagtggagtcagttgcataagcataaaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgccttgtcgttcaaaacgatggagc 22749864  T
Q  470 acta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    |||| |||||||||| || |||| | || ||| |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  |||    
T  22749863 actatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaagactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tat 22749767  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22749766 ggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 22749702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 19801961 - 19802109
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  19801961 agcggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctgt--tttggtaccacatgcataattgcatttat 19802056  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19802057 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 19802109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 19236056 - 19235807
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  19236056 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 19235957  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || ||| |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| |||   ||||    
T  19235956 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgatgactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctgt--tatg 19235860  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  19235859 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 19235807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21829712 - 21829622
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21829712 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccttggaacgccttgtcgttcaaagcgg 21829622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 22466935 - 22466686
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  |||||| | |||||||| |||| |||||||  | |||||||    
T  22466935 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaatgatggaaca 22466836  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| |||   ||||    
T  22466835 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctgt--tatg 22466739  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| || |||||||||||    
T  22466738 gtaccacatgcatagttgcatttgttgatgagtcttagtggagttgtcatgtc 22466686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 20843381 - 20843263
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| ||||| |||   || |||||||    
T  20843381 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcaattgcataagcatataaagcgggagggctcttgccttggaac 20843282  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  20843281 gccttgtcgttcaaagcgg 20843263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 669
Target Start/End: Original strand, 21574219 - 21574292
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  21574219 ggagtcttagaggtgtagtcatgtcattgcatgagtcgctgtcgttggttgaattgccatattattgatgatgt 21574292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20819339 - 20819078
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  20819339 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 20819240  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||||  |||    
T  20819239 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctgaa--atg 20819143  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  20819142 gtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtctt-gtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 20819078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20826439 - 20826178
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  20826439 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 20826340  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||||  |||    
T  20826339 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctgaa--atg 20826243  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  20826242 gtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtctt-gtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 20826178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Original strand, 27635969 - 27636061
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27635969 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 27636061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 19362681 - 19362533
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||  ||||| || |    
T  19362681 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg--ttttggtaccacatgcatgattgcatttat 19362586  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  19362585 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtgtttgttgttggttg 19362533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 24057682 - 24057512
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| |||   || |||||||||||||||| ||||| || |    
T  24057682 agcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcct---atttggtaccacatgcataattgcatttat 24057588  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||    
T  24057587 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttgtaattgttataatgatgatgatg 24057512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 22460311 - 22460062
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  22460311 gagttgtatgcatatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 22460212  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| ||| |||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | |  || |||   |||| |||   ||||    
T  22460211 ctatgtttttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacaatgagggcttcggctctgt--tatg 22460115  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  22460114 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 22460062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 27635844 - 27635934
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| ||||  ||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  27635844 gagttgtatgtagatatacacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaagcgagagggcttttgccctggaacgccttatcgttcaaagcgg 27635934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 10035094 - 10035042
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10035094 ggagtcttagtggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 10035042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 21494931 - 21494871
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21494931 atagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 21494871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 463
Target Start/End: Original strand, 24668923 - 24669050
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||| || |||    
T  24668923 tggagtcataagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcataaaagcgggagggcctcg 24669021  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |   |||||| |||||| |||||||||||    
T  24669022 gtcctggaacaccttgtcgttcaaagcgg 24669050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 463
Target Start/End: Original strand, 24738692 - 24738819
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||| || |||    
T  24738692 tggagtcataagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcataaaagcgggagggcctcg 24738790  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |   |||||| |||||| |||||||||||    
T  24738791 gtcctggaacaccttgtcgttcaaagcgg 24738819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 463
Target Start/End: Original strand, 24751461 - 24751588
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||| || |||    
T  24751461 tggagtcataagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcataaaagcgggagggcctcg 24751559  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |   |||||| |||||| |||||||||||    
T  24751560 gtcctggaacaccttgtcgttcaaagcgg 24751588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19236350 - 19236299
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19236350 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaa 19236299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 132
Target Start/End: Original strand, 22439361 - 22439436
Alignment:
Q  58 tcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatt 132  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  22439361 tcgcttaagcaaagttgaccttagtcagccactttttgaacgttgcctcgcgtattaggggacccttttgagcatt 22439436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 22460606 - 22460555
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22460606 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaa 22460555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 23081815 - 23081963
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||| || |    
T  23081815 agcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctgt--tttggtaccacatgcataattgcatttat 23081910  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23081911 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 23081963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 520 - 587
Target Start/End: Original strand, 24751648 - 24751714
Alignment:
Q  520 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24751648 aatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 24751714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 25013572 - 25013521
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25013572 gagtcttagcggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 25013521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 427455 - 427337
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||| ||||| |||   ||  | ||||    
T  427455 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtttcataagcatataaagcgggagggctcttgccctcgaac 427356  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  427355 gccttgtcgttcaaagcgg 427337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23528013 - 23527967
Alignment:
Q  25 tactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23528013 tactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 23527967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 580 - 637
Target Start/End: Original strand, 24617894 - 24617951
Alignment:
Q  580 tagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 637  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24617894 tagttgcatttgtcgaggagtcttagtggtgttgtcatgtctttgcatgagtcattgt 24617951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 580 - 637
Target Start/End: Original strand, 24714125 - 24714182
Alignment:
Q  580 tagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 637  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24714125 tagttgcatttgtcgaggagtcttagtggtgttgtcatgtctttgcatgagtcattgt 24714182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 580 - 637
Target Start/End: Original strand, 24747153 - 24747210
Alignment:
Q  580 tagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgt 637  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24747153 tagttgcatttgtcgaggagtcttagtggtgttgtcatgtctttgcatgagtcattgt 24747210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 18941290 - 18941436
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| |||| ||| |    
T  18941290 agcggcgagggcttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttggtaccacatgcataattgc-attat 18941383  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  18941384 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctctgttgttggttg 18941436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 20772126 - 20772078
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20772126 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtcgcataagcataaaa 20772078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21888534 - 21888474
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21888534 attgtcgaggagtcttagcagtgttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 21888474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Original strand, 23076436 - 23076515
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23076436 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 23076515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 632
Target Start/End: Original strand, 37599454 - 37599521
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  37599454 tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgagaagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 37599521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Original strand, 17023086 - 17023137
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17023086 gagtcgtagtggagttgtcgtgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 17023137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 520 - 587
Target Start/End: Original strand, 24669110 - 24669176
Alignment:
Q  520 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24669110 aatgctttaaccattctacagcggtgagggctacgaccctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 24669176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 520 - 587
Target Start/End: Original strand, 24738879 - 24738945
Alignment:
Q  520 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24738879 aatgctttaaccattctacagcggtgagggctacgaccctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 24738945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 566 - 668
Target Start/End: Original strand, 39609017 - 39609119
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgat 664  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |   || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||    
T  39609017 tggtaccacatgcataattgcatttattaaggggtcttagtggtgtcgtcatgtcat-gcatgagtctttgttgttggttgtaattgttataatgatgat 39609115  T
Q  665 gatg 668  Q
    ||||    
T  39609116 gatg 39609119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 644
Target Start/End: Original strand, 5341795 - 5341940
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| || || || |    
T  5341795 agcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttggtaccacatgcataattacatttat 5341889  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggt 644  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5341890 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggt 5341940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25419903 - 25419732
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | ||||||||||||||||  |||| || |    
T  25419903 agcggtgagggctttggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctgt--tttggtaccacatgcataaatgcatttat 25419808  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
     | || ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||    
T  25419807 tgaggggtcttagtggtgacgtcatgtcat-gcatgagtctttgttgttggttgtaattgttataatgatgatgatg 25419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 634
Target Start/End: Original strand, 28890519 - 28890588
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  28890519 tatggtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 28890588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 634
Target Start/End: Original strand, 28897223 - 28897292
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  28897223 tatggtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 28897292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 634
Target Start/End: Original strand, 28910423 - 28910492
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  28910423 tatggtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 28910492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 634
Target Start/End: Original strand, 28925691 - 28925760
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  28925691 tatggtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 28925760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 634
Target Start/End: Original strand, 28932114 - 28932183
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  28932114 tatggtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 28932183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 634
Target Start/End: Original strand, 28933618 - 28933687
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  28933618 tatggtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 28933687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 634
Target Start/End: Original strand, 28946818 - 28946887
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgt 634  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  28946818 tatggtaccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtcgt 28946887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 495 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 37566118 - 37565973
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcg 594  Q
    |||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| |||||  | | |    
T  37566118 cggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tctggtaccacatgcataattgcatattttg 37566024  T
Q  595 gggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  37566023 aggagtcttagtggtgttatcatgtca-tgcatgagtcttagttgttggttg 37565973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 648
Target Start/End: Original strand, 15194241 - 15194282
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15194241 ggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 15194282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 18818885 - 18818836
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    ||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18818885 ggagttttagtggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggtt 18818836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22467230 - 22467181
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcg 68  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22467230 cagacctactgtaagctggtcggttaagcgaactagccgtcgcttaagcg 22467181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 20780901 - 20780853
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  20780901 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 20780853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Original strand, 23561550 - 23561602
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23561550 gtcatatacatatatatgcatttgtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 23561602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 26650416 - 26650339
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26650416 tggtaccacatgcatatctgca-ttattgaggagtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagtc-ttgttgttggttg 26650339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 26922001 - 26921924
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26922001 tggtaccacatgcatatctgca-ttattgaggagtcttagtggtgttgtcatgtca-tgcatgagtc-ttgttgttggttg 26921924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 37599254 - 37599302
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  37599254 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 37599302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 643
Target Start/End: Original strand, 7773725 - 7773867
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||     |||||||||||||||| |||| ||  |    
T  7773725 agcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctgt----tggtaccacatgcataattgc-atatt 7773817  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttgg 643  Q
     || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7773818 tggagagtcttagtggtgtagtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttgg 7773867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 599 - 645
Target Start/End: Original strand, 19800531 - 19800577
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19800531 gtcttagcagtgttgtcatgtcattgcatgagtcttggttgttggtt 19800577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 20831747 - 20831702
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttgg 643  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20831747 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttgg 20831702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 21902061 - 21902114
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgca-tgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21902061 ggagtcttagtggtgttgtcatgtagttgcattgagtcgttattgttggttgaa 21902114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 20780702 - 20780635
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  20780702 tatggtaccacatgcatagttgcatttgttcagaagtcttagtagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 20780635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 47
Target Start/End: Original strand, 22439342 - 22439370
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagc 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22439342 cagacttactgtaagccggtcgcttaagc 22439370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Original strand, 23545006 - 23545085
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || | | ||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23545006 tggtaccgcatgcataattgcatttattgagggatcttagtggtgtcgtcatgtcat-gcatgagtctttgttgttggttg 23545085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 28896999 - 28897047
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28896999 gagttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28897047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 28910247 - 28910295
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28910247 gagttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28910295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 28931939 - 28931987
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28931939 gagttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28931987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 28933442 - 28933490
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28933442 gagttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28933490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 28946642 - 28946690
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28946642 gagttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28946690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Original strand, 43243873 - 43243913
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43243873 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcgatgttgttggttg 43243913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 350 - 649
Target Start/End: Original strand, 41564 - 41862
Alignment:
Q  350 atatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgcctt 449  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41564 atatatatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgcctt 41663  T
Q  450 gttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 548  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||| | ||    
T  41664 gtcgttaaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcattagcgg-gagg 41762  T
Q  549 gtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41763 gcttcggccctg-aatatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattacatgagtagttgttgttggttgaa 41861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 337
Target Start/End: Original strand, 41192 - 41503
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttg 126  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41192 ctgtgagccgatcgcttaagcgaactagacgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagacacttttgaactttgcctcgtgcactaggggatccttttg 41291  T
Q  127 agcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatgaattt 226  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41292 agtatttctaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctactaaacacattgtt-aatcgagttggtatagtttaatgaattt 41390  T
Q  227 gtggattgaagtgagtgtg-aaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaattataca-ttttctgatgttg 323  Q
      ||||| |||||||| || ||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  41391 -aggattaaagtgagtatgaaaccaagtgaaaatatattatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattgatattaattatacatttttctgatgttg 41489  T
Q  324 gattggttgagatg 337  Q
    ||||||||| ||||    
T  41490 gattggttgtgatg 41503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 29979 - 29671
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29979 gtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggt-agttgtctaagcataaaagtgggagagctttggctctggaacgc 29881  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgt 546  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29880 cttgtcgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagtggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgt 29781  T
Q  547 gggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  29780 gggttacggccctg-attatggtaccacatgcatagttgcatttattgaggagtcttagagg-ggtgtcatgtcattacatgagttgtttttgttgattg 29683  T
Q  647 aatcgttatatt 658  Q
    ||| | ||||||    
T  29682 aattgctatatt 29671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30347 - 30212
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||     
T  30347 actttctgtaagccggtcgcttaagcgagccaaccttcgcttaagcgaag-tgagccttagtcagccactttctgaattttgcttcgtgcactaggggac 30249  T
Q  120 ccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  30248 ccttttgagcattctaaaatgtttctttcaacttgta 30212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30090 - 30044
Alignment:
Q  275 acttgatgtattagtatgattgacattaattatacattttctgatgt 321  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30090 acttaatgtattagtatgattgatagtaattatacattttctgatgt 30044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 366 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 2779 - 2516
Alignment:
Q  366 attagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  2779 attagttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataagcatcaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtg 2680  T
Q  466 gaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaata 565  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2679 gaacaccagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-atta 2581  T
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagt 631  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||    
T  2580 tggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtcttagtgg-ggtgtcatgtcatttcatgagt 2516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3123 - 3050
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt 92  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  3123 cagacctactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag-tgagccttagtcagcctcttt 3050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 489
Target Start/End: Original strand, 655 - 1142
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  655 actttctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcgtcgtgcactaggggatc 754  T
Q  121 cttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaat 220  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | || ||||||    
T  755 cttttgagcatttctaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctactgaacacattgtt-aatcgaattggtgtaatttaat 853  T
Q  221 gaatttgtggattgaagtgagtgtg-aaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaattataca-ttttctg 317  Q
    ||||||  |||||  |||||||  | ||| ||||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  854 gaattt-cggattagagtgagtacgaaactaagtgaaaatatactatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattgttattaattatacatttttctg 952  T
Q  318 atgttggattggt---tga--------------gatggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg- 399  Q
    |||||||||||||   |||               ||| |||||||||||||||| | | ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||     
T  953 atgttggattggtttgtgatgaagttgttgaattatgaagtcgtatgtcatatatacatatatgcatt-gtcgagtggtatgtagatatacacaagtgga 1051  T
Q  400 gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtg 489  Q
    ||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1052 gtcggttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtg 1142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 489
Target Start/End: Original strand, 7605 - 8078
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttt 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7605 ggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcgtcgtgcactaggggatccttttgagcatttc 7704  T
Q  135 tagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatgaatttgtggattg 234  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||  |||||     
T  7705 taaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctactgaacacattgtt-aatcgaattggtgtaatttaatgaattt-cggatta 7802  T
Q  235 aagtgagtgtg-aaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaattataca-ttttctgatgttggattggt- 330  Q
     |||||||  | ||| ||||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  7803 gagtgagtacgaaactaagtgaaaatatactatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattgttattaattatacatttttctgatgttggattggtt 7902  T
Q  331 --tga--------------gatggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataag 413  Q
      |||               ||| |||||||||||||||| | | ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    
T  7903 tgtgatgaagttgttgaattatgaagtcgtatgtcatatatacatatatgcatt-gtcgagtggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataag 8001  T
Q  414 cataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtg 489  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8002 cataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtg 8078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 439 - 665
Target Start/End: Original strand, 1116 - 1343
Alignment:
Q  439 tggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga 537  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  1116 tggaacactttgttgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagtggtgtttagcggtgaggacttatgtcctaaaaagaatgctttaaccattcga 1215  T
Q  538 c-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttg 636  Q
      ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1216 ttagcggtgagggctccggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgctgtcatgtcattgcatgagtcgttg 1314  T
Q  637 ttgttggttgaatcgttatattgttgatg 665  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  1315 ttgttggttgaattgctatattattgatg 1343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 439 - 665
Target Start/End: Original strand, 8052 - 8279
Alignment:
Q  439 tggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga 537  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  8052 tggaacactttgttgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagtggtgtttagcggtgaggacttatgtcctaaaaagaatgctttaaccattcga 8151  T
Q  538 c-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttg 636  Q
      ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8152 ttagcggtgagggctccggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgctgtcatgtcattgcatgagtcgttg 8250  T
Q  637 ttgttggttgaatcgttatattgttgatg 665  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  8251 ttgttggttgaattgctatattattgatg 8279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 375 - 665
Target Start/End: Original strand, 102900 - 103190
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggtta-gtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta 473  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  102900 gttgtatgtaggtatacaccagtggggtctgttgcataagcataaaagcgggagagcttcggccctggaacgagttgtcgttcaaagcggtggaacacta 102999  T
Q  474 gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||| |||   |||||||| ||||||||||||    
T  103000 gttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgaaagaagtgagggctccggccctg-aatatggtacca 103098  T
Q  574 catgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatg 665  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  103099 catgcatagttgcaattatcgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaattgttatattattgatg 103190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 102526 - 102661
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatc 120  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102526 actttctgtaagtcggtcgcttaagcgaaccagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcggccactttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatc 102625  T
Q  121 cttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||||||| ||||| | | ||| |||||||| ||||    
T  102626 cttttgagtattttaaaaggtttctttcaacctgta 102661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 177860 - 177809
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177860 gagtcgtagtggagttgtcatatcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 177809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Original strand, 15536 - 15853
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatc 120  Q
    |||| |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15536 actttctgtgagccagtcgcttaagtgagctagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaaatttgcctcgtgcactaggggatc 15635  T
Q  121 cttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaat 220  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||    
T  15636 cttttgagcatttctaaatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtaccctgaatcctactaaacacattgtt-aatcgagttggaataatttaat 15734  T
Q  221 gaatttgtggattgaagtgagtgtg-aaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaattataca-ttttctg 317  Q
    ||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||| || ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  15735 gaattt-cggattggagtgagtatgaaaccaagtgaaaatatattatgttgaatgaatttgatgtattagtatgattgttattaattgtacatttttctg 15833  T
Q  318 atgttggattggttgagatg 337  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  15834 atgttggattggttgtgatg 15853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 378 - 669
Target Start/End: Original strand, 16914 - 17203
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16914 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttg 17013  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||| | |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  17014 ttcaaaacggagtttagcggtgaggccttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcattagcgg-gagggcttcggccctg-aatatggtaccacat 17111  T
Q  577 gcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  17112 gcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgttgtcaagtcattacatgagtcgtggttgttggtcgaattgctatatt-ttgatgatgt 17203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 337
Target Start/End: Original strand, 14933 - 15162
Alignment:
Q  109 cactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14933 cactaggggatccttttgagcatttctaaatgttcctttcaacttgtaagatcattacatgtaccctgaatcctactaaacacattgtt-aatcgagttg 15031  T
Q  209 atatagtttaatgaatttgtggattgaagtgagtgtg-aaccaagtgaaaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaatta 306  Q
     |||| ||||||||||||  |||||| ||||| | || ||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  15032 gtataatttaatgaattt-cggattggagtgattatgaaaccaagtgaaaatatattatgttgaatgaacttgatgtattagtatgattgttattaattg 15130  T
Q  307 taca-ttttctgatgttggattggttgagatg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15131 tacatttttctgatgttggattggttgtgatg 15162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Original strand, 23253 - 23345
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcacta 113  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23253 actttctgtgagccggttgcctaagcgagctagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcacta 23345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 8)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 375 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 115941 - 115667
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta 473  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  115941 gttgtatgtagatatacaccagtggagtctgttgcataagcataaaagcgggagggcttcgaccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacaccc 115842  T
Q  474 gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||   ||||||| |||||||||||||    
T  115841 gttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagtggtgagggctccggccct-aaatatggtacca 115743  T
Q  574 catgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  115742 catgcatagttgcaattgtcgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtctttgttgttggttgaat 115667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 327007 - 326816
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||    
T  327007 gtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaaggggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggcttcggccctagaac 326908  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc 535  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  326907 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 326816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 321298 - 321062
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||    
T  321298 gtcataaaaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaaggggagtttgttgcataagcacaaaaatgggagggcttcggccctggaac 321199  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcg 542  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  ||||    
T  321198 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcg 321099  T
Q  543 gtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    ||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  321098 gtgagggctccggccctg-attatggtaccacatgcat 321062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 116308 - 116178
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagcca-cttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  116308 ctgtaagccggtcgcttaagcgaaccagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccattttttgaactttgcctcgtgcactaggggatcctttt 116209  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||| ||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  116208 gagtattttaaaatgtttctttcaacctgta 116178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 129244 - 129380
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatc 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  129244 actttctgtgagccggtcgcttaagcgagccagccgtcgcttaagcgaagaaggtcttagtcagccactttttgaattttgcttcgtgcactaggggatc 129343  T
Q  121 cttttgagcattttt-agatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  129344 cttttgagcatttttgaaatgtttccttcaacttgta 129380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 495 - 640
Target Start/End: Original strand, 129788 - 129932
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagc-ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtc 593  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | | |||| |||   | |||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||     
T  129788 cggtgagggcttatgccctgatga--atgctttaaccattcaatatccggtgagggcttctgccctgtaaattggtaccacatgcatagtcgcatttgtt 129885  T
Q  594 ggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgt 640  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  129886 gaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgtcgttgt 129932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 129659 - 129751
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  129659 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgctctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 129751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 383372 - 383332
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  383372 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttgaa 383332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 7)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 368 - 631
Target Start/End: Original strand, 12842 - 13104
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagt-gggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgg 466  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12842 tagttgagttgtatgtagatatacacaggttgggttagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtgg 12941  T
Q  467 aacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatat 566  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  12942 aacacaagttgttcaaagcggtgtagagcggtgaggacttaggtcctgataagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggacctg-attat 13040  T
Q  567 ggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagt 631  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || | |||||||||||| |||||||    
T  13041 ggtaccacatgcatagttgcatttatcgaggagtattag-ggggatgtcatgtcatttcatgagt 13104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 377 - 580
Target Start/End: Original strand, 63168 - 63370
Alignment:
Q  377 tgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||    
T  63168 tgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttatcgttcaaagtggtggagcactagtt 63267  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    | |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||||    
T  63268 gctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtaccaca 63365  T
Q  576 tgcat 580  Q
    |||||    
T  63366 tgcat 63370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 373 - 580
Target Start/End: Original strand, 124441 - 124649
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  124441 gagttgtatgtagatataaacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttctgacctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacact 124540  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| | |||||||    
T  124541 agttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgataagcggtgagggcttcggccctg-attatggta 124639  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  124640 ccacatgcat 124649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 110402 - 110142
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  110402 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 110303  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  110302 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 110206  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  110205 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 110142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 597 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 35529 - 35487
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35529 gagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 35487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 24659 - 24617
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24659 gagtcttagtggtgttgtcgtgtcattgcatgagtcgttgttg 24617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 607 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 118077 - 118045
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118077 ggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 118045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 110969 - 110751
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  110969 tagttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataaacatcaa-gtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 110871  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  110870 acactagttgttcaatgcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatg 110771  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  110770 gtaccacatgcataattgca 110751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 92102 - 92361
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  92102 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 92201  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat-gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||  ||||||    
T  92202 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctg--atatgg 92298  T
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  92299 taccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagaagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 92361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 97828 - 98087
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  97828 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 97927  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat-gataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| | | || || | |   |||| |||  ||||||    
T  97928 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaagaatgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctg--atatgg 98024  T
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  98025 taccacatgcataattgcatttgttgaggagtcttagaagagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 98087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 116853 - 116786
Alignment:
Q  520 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  116853 aatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcataattgca 116786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 91807 - 91858
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  91807 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaa 91858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 97533 - 97584
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa 70  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  97533 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaa 97584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 364 - 646
Target Start/End: Original strand, 46941 - 47234
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  46941 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 47039  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47040 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 47138  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgcaattgtcgggga------------gtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || | | |||            ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  47139 ttatggtaccacatgcatatttgcatttattgaggagtctagggtgttgtcttagcggtgttgtcatgtccttgcatgagtcggtgttgttggttg 47234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Original strand, 52355 - 52568
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52355 gagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacact 52453  T
Q  473 agttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtac 571  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  52454 agttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-attatggtac 52552  T
Q  572 cacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||| |||||    
T  52553 cacatgcatatttgca 52568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 65547 - 65417
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  65547 ctgtaagccggtcgcttaagcgaaccagccgtcacttaagcggagaagaccttagtcagccactttttgaattttgcctcgtgcactaggggatcctttt 65448  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    || |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  65447 gaacattttaaaatgtttctttcaacttgta 65417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1510 - 1388
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||| |  | |  ||||||||||||| ||||||||    
T  1510 ctgtcagccggtcgcttaagcgagccagccttcgcttaagcgaacaaggtcttagtcagccactttttggatgtcgtttcgtgcactagggaatcctttt 1411  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttc 148  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  1410 gagcattttaaaatgtttctttc 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 64938 - 64888
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  64938 gtcttagaggtgtcgtcatgtcattgcatgagtcgttgtcgttggtcgaat 64888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 65215 - 65086
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagctt 432  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||     
T  65215 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctc 65117  T
Q  433 cggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
      ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  65116 ttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 65086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 597 - 639
Target Start/End: Original strand, 92888 - 92930
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  92888 gagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 92930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 52592 - 52640
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  52592 gtcttagcggtgttgtcatgtcctttgcatgagtcggtgttgttggttg 52640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 38616 - 38394
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  38616 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 38518  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38517 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 38419  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  38418 ttatggtaccacatgcatatttgca 38394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 46728 - 46936
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  46728 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctatggctctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 46827  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||    |||| ||||||||||| |  |||| || |||   |||||||| |||||||||    
T  46828 ttgttgttcaaatcggtgattagcggtgaggacttattttctgaaatgaatgttttaaccattcaattagcgttgagggctccggccctg-aatatggta 46926  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  46927 ccacatgcat 46936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 51001 - 51209
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  51001 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctatggctctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 51100  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||    |||| ||||||||||| |  |||| || |||   |||||||| |||||||||    
T  51101 ttgttgttcaaatcggtgattagcggtgaggacttattttctgaaatgaatgttttaaccattcaattagcgttgagggctccggccctg-aatatggta 51199  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  51200 ccacatgcat 51209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 38362 - 38322
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38362 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 38322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 6)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Original strand, 30107 - 30329
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  30107 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcata-gcatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 30205  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30206 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 30304  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  30305 ttatggtaccacatgcatatttgca 30329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Original strand, 35508 - 35730
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  35508 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 35606  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35607 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 35705  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  35706 ttatggtaccacatgcatatttgca 35730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 347 - 574
Target Start/End: Original strand, 51644 - 51872
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51644 gtcatatacatatatatgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctttggaacg 51743  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggt 544  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||||    
T  51744 ccttgtcattcaaagcggtggaacagtagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagggcttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctatagcggt 51843  T
Q  545 gtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    | ||| | ||||||| || |||||||||||    
T  51844 gagggcctcggccct-aattatggtaccac 51872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 30353 - 30401
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30353 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 30401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 35754 - 35802
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35754 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 35802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 75 - 1
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgtt 641  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  75 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgtt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 11)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 364 - 587
Target Start/End: Original strand, 174523 - 174745
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  174523 gcatttgttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtgg 174621  T
Q  464 tggaacactagttgttcaaa-gcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaa 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  174622 tggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-a 174720  T
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  174721 ttatggtaccacatgcatatttgca 174745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 373 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 152567 - 152356
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  152567 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcact 152468  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtac 571  Q
    ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||| | || |||  |||| |||| | ||||||||    
T  152467 agttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgattgctttaaccattctacagtgttgagggctacggtcctg-attatggtac 152370  T
Q  572 cacatgcatagttg 585  Q
    ||||||||| ||||    
T  152369 cacatgcatggttg 152356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 258700 - 258491
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  258700 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggctcctgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 258601  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  258600 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctg-aatatggt 258502  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  258501 accacatgcat 258491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 197409 - 197618
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  197409 agttgtatgaagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagtgggagggctctggccctggaacaccttgtcgttcaaagcggtggaacact 197508  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  197509 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctg-aatatggt 197607  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  197608 accacatgcat 197618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 252094 - 252004
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  252094 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 252004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 154338 - 154248
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  154338 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggaggactatggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 154248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 147213 - 147127
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  147213 gtatgtagatatacacaagtggagtcatttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 147127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 608 - 648
Target Start/End: Original strand, 21986 - 22026
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21986 gtgttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttgtttgaa 22026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 174769 - 174817
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  174769 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 174817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 56861 - 57012
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagc-ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | | |||| |||   | |||||| ||  ||||||||||||||| || | | |||    
T  56861 agcggtgagggcttatgccctgatga--atgctttaaccattcaatatccggtgagggcttctgccctgtaaattggtaccacatgcattgtcgta-ttg 56957  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  56958 tcgaggagtcgtagcggtgttgtcgagttgttgcatgagtctttgttgttggttg 57012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 75342 - 75251
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtg-ggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  75342 agttgtatgtagatatacacaagtgcagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 75251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 368 - 587
Target Start/End: Original strand, 9598 - 9816
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9598 tagttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataaaaa-acaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 9696  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9697 acactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctattgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatg 9796  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  9797 gtaccacatgcataattgca 9816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Original strand, 9243 - 9295
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9243 cagacctactgtaagttggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaag 9295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 376 - 631
Target Start/End: Original strand, 174535 - 174790
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagt 475  Q
    ||||||||||| ||||| | || || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  174535 ttgtatgtagagatacaaaggttgggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 174634  T
Q  476 tgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccaca 575  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  174635 tgttaaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccaagaattatggtaccaca 174734  T
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagt 631  Q
    |||||||||||| || | | ||||  |||| || | |||||||||||| |||||||    
T  174735 tgcatagttgcatttattgaggagaattaggggggatgtcatgtcatttcatgagt 174790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 419 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 489288 - 489126
Alignment:
Q  419 aagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  489288 aagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttga 489189  T
Q  519 taatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcata 581  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  489188 gaatgctttaaccattcgacagtgttgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcata 489126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 96055 - 95848
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  96055 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagtgggagggctttggcccttgaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 95956  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |  ||||||| ||||  | |||||| ||||||||    
T  95955 ttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctgaatg--aatgctttaaccatttaattagcggtgagggtttctgccctg-aatatggt 95859  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  95858 accacatgcat 95848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Original strand, 493927 - 494174
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||  | |||  | ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  493927 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcggtgcataagcataaaatggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 494026  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataa---tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    | |||||||||||||||||| |  ||  |||||| |||||||||| | ||   |||||||||||||| | | ||||| ||| | |||||||||  |||||    
T  494027 atgttgttcaaagcggtgttaatggg--aggactcatgtcctgataaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggccccggccctga--tatgg 494122  T
Q  569 taccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  494123 taccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 494174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 179086 - 178938
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||  ||||| || |    
T  179086 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg--ttttggtaccacatgcatgattgcatttat 178991  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  178990 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 178938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 156
Target Start/End: Original strand, 493650 - 493771
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcattt 133  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  493650 ggtcgcttaagcgagctacccttcgcttaagcgaac-tgagccttagtcagcctttttctgaaccttgcttcgtgcactaggggacccttttgagtattt 493748  T
Q  134 ttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||| ||||| |||| | ||||||    
T  493749 ttaaatgtttcttttagcttgta 493771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 525204 - 525075
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttg 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||  |  |||  || |||||||||| |||| | ||    
T  525204 ctgtaagacggtcgcttaagcgaaccagccttcgcttaagcgaagaaggccttggtcagccacattttgattttgtttcctgcactagggaatccatctg 525105  T
Q  127 agcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  525104 agcattctgaaatgtttctttcaacttgta 525075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 576 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 524647 - 524575
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  524647 tgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgtcgtcatgtcatttcatgagtcgttgttgttggttgaa 524575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 336 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 5392 - 5148
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcgg 435  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5392 tggagtggtaagtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagagggttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcgg 5293  T
Q  436 ctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccatt 534  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5292 ctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtatagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccatt 5193  T
Q  535 cgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    | ||||||||| |||    |||||| || |||||||||||||||||    
T  5192 ctacagcggtgagggctttggccct-aattatggtaccacatgcat 5148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 378 - 669
Target Start/End: Original strand, 392 - 681
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  392 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcattaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaatcggtggaacactagttg 491  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacat 576  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||| | |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  492 ttcaaagcggagtttagcgatgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcattagcgg-gagggcttcggccctg-aatatggtaccacat 589  T
Q  577 gcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  590 gcatagttgcatttgccgaggggtcttagaggtgttgtcaagtcgttacatgagttgtggttcttggtcgaattgctatatt-ttgatgatgt 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 123; Significance: 8e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 439 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 2181 - 1953
Alignment:
Q  439 tggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta--gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcg 536  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  2181 tggaacactttgttgttcacagcggtggaacactattgttgttcaaagtggtgtttagcggtgaggacttatgtcctaaaaagaatgctttaaccattcg 2082  T
Q  537 ac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgtt 635  Q
    |  ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2081 attagcggtgagggctccggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttgtcgaggagtcttagaggtgctgtcatgtcattgcatgagtcgtt 1983  T
Q  636 gttgttggttgaatcgttatattgttgatg 665  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  1982 gttgttggttgaattgctatattattgatg 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16218 - 16041
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16218 actttctgtaagccggtcgcttaagcgagctaaccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcactaggggatc 16119  T
Q  121 cttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgtaagatcattatatgtattttgaatcctactaaacacattgtta 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  16118 cttttgagcatttttaaatgttcctttcaacttgtaagaccattatatataccctgaatcctactgaacacattgtta 16041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 4978 - 5184
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac-ta 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |     
T  4978 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggagcacttt 5077  T
Q  474 gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacc 572  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| | |||||||||    
T  5078 gttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctg-attatggtacc 5176  T
Q  573 acatgcat 580  Q
    ||||||||    
T  5177 acatgcat 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 566 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 28008 - 27935
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28008 tggtaccacatgcattgtcgcatttgttgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgtcgttg 27935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 14441 - 14673
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14441 gtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgc 14540  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  14541 cttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtg 14639  T
Q  546 tgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
     |||  |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  14640 agggctacggtcctg-attatggtaccacatgcat 14673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 375 - 545
Target Start/End: Original strand, 7186 - 7356
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  7186 gttgtatgtagatatacacaagtgggacagttggataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 7285  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    ||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  7286 ttgctcaaagtggtatt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtg 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 17682 - 17477
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17682 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggaaagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggagcactag 17583  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| || |||   |||||| | | ||||||||||    
T  17582 ttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcgatgagggcttcggccccg-attatggtacca 17484  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  17483 catgcat 17477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 373 - 580
Target Start/End: Original strand, 6001 - 6208
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  6001 gagttgtatgtagatatacataagtgggttagttacataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcact 6100  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtac 571  Q
    ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||    
T  6101 agttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtac 6199  T
Q  572 cacatgcat 580  Q
    |||||||||    
T  6200 cacatgcat 6208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 374 - 658
Target Start/End: Original strand, 7778 - 8064
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||  ||   |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7778 agttgtatgtagatatacacaattgggtcagttgcataaacatataaagcgggaggtctcttgtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 7877  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |  ||| ||| |||   |||||| ||| |||||||    
T  7878 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaatgaatgctttaaccattcaattagcagtgagggctccggcccagaa-tatggta 7976  T
Q  571 ccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaatcgttatatt 658  Q
    ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  7977 ccatatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttttttgttgaattgctatatt 8064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 347 - 632
Target Start/End: Original strand, 14741 - 15025
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  || |||  | ||||   ||||||    
T  14741 gtcatataagtacatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtcgcataa-cataaaaacggtgaggacctcggtcctggaac 14838  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatg---ataatgctttaaccattcgacag 540  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||  |||||| ||||||||||    | |||||||||||||||| | |     
T  14839 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgttaatggg--aggactcatgtcctgatataaagaatgctttaaccattctataa 14936  T
Q  541 cggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    ||||| |||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  14937 cggtgagggcttcggccctga--tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagaggagtcgtcatgtca-tgcatgagtc 15025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 577 - 648
Target Start/End: Original strand, 6968 - 7039
Alignment:
Q  577 gcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6968 gcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgatgttggttgaa 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 42135 - 41931
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  42135 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 42036  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  42035 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 41938  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  41937 catgcat 41931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 47790 - 47881
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  ||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  47790 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagtgggaggactctagccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 47881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 56418 - 56623
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  56418 gttgtatgtagatatacacaagagggtcagttgcataagcataaaagtgggagagattcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactag 56517  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  56518 ttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 56616  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  56617 catgcat 56623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 47384 - 47589
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  47384 gttgtatgtagatatacacaagcgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 47483  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  47484 ttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 47582  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  47583 catgcat 47589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 62804 - 63009
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  62804 gttgtatgtagatatacacaagcgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 62903  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  62904 ttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 63002  T
Q  574 catgcat 580  Q
    |||||||    
T  63003 catgcat 63009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 347 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 7482 - 7293
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7482 gtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgc 7383  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc 535  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  7382 cttgtcgttcatagcggtggaacactagatattcaaagcggtgtttagtggtaaggacttatatcctgaaaatgaatgctttaaccattc 7293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 28096 - 27861
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  28096 gtcatatgaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctagaacg 27997  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcgg 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| |  |||||    
T  27996 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcgg 27897  T
Q  544 tgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    || |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  27896 tgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcat 27861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 515
Target Start/End: Original strand, 20462 - 20630
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgc 446  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20462 gtcatatacatatatatgcataggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgc 20561  T
Q  447 cttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctga 515  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20562 cttgtcgttcaaagcggtggagtactagttgctcaacgcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctga 20630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 439 - 580
Target Start/End: Original strand, 156804 - 156944
Alignment:
Q  439 tggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga 537  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  156804 tggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacac--gttgttcaaagaggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcga 156901  T
Q  538 -cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
      ||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||||    
T  156902 ttagcggtgagggcttcgaccctg-aatatggtaccacatgcat 156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 427
Target Start/End: Original strand, 153285 - 153365
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggag 427  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||| |||||    
T  153285 gtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcacaaacatgaaagcgggag 153365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 453 - 587
Target Start/End: Original strand, 4 - 138
Alignment:
Q  453 gttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4 gttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgataatgctttaaccattcgacagcggtgtggatca 103  T
Q  553 cggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  104 cggccctggattatggtaccacatgcatatttgca 138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 373 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 3128 - 2907
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  3128 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttatcgttcaaagcggtggaacact 3029  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||| || |||||    
T  3028 ttgttgttcaaagaggtgtttagcggtgatgactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctg-aacatggt 2930  T
Q  570 accacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  2929 accacatgcatatttgtaattgt 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1904
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   |   |||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  1696 agttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcatgacctggaacaccttgtcgttcaaagcggtggaacact 1795  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  1796 ttgttgttcaaagcgctttttagcggtgaggacttatgtcttgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctg-aatatggta 1894  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  1895 ccacatgcat 1904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 15451 - 15641
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||               || |||||||| |||||| ||||||    
T  15451 gttgtatgtagatatacacgagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcga--------------gtcgttcaaagtggtggagcactag 15536  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  15537 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaacgattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 15634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 8513 - 8465
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  8513 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 8465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 7)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 373 - 587
Target Start/End: Original strand, 17371 - 17587
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca-c 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||      
T  17371 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttacataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagctgtggaacatt 17470  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  17471 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgttttaaccattcgatcagcggtgagggtttcggccctg-aatatggt 17569  T
Q  570 accacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||| |||||    
T  17570 accacatgcatatttgca 17587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 347 - 587
Target Start/End: Original strand, 10048 - 10291
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattag-tggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  10048 gtcatatacatatatatgcattgggttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttcagccctggaacg 10147  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcg 542  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||    
T  10148 ccttgtcgttcaaagatgtggaacactttgttgttaaaagcggtgtttagcggtgaagactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgattagcg 10247  T
Q  543 gtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    ||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10248 gtgagggcttcggccctg-aatatggtaccacatgcatatttgca 10291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 72464 - 72229
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| || ||||   ||||||    
T  72464 gtcatataaatacatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtttcataagcataaaagcggtgagggcctcggtcctggaac 72365  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattcgacagc 541  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| | |||    
T  72364 gccttgtcgtttaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtatt-agcggtgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctatagc 72266  T
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||| |||   ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  72265 ggtgagggcttcggccttg--atatggtaccacatgcat 72229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 625
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35947
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaatt 590  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||| |  ||||||| |||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  35816 agcggtgaggacttatgtcctga--atgaatgctttaacctttcaattagcggtgagggcttcggctctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcattt 35912  T
Q  591 gtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgc 625  Q
    || | ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  35913 gttgaggagtcttagaagtgtcgtcatgttattgc 35947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 400 - 489
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggtt-agtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |   |||||| | ||||||||||||||||    
T  400 agttgtatgtagatatacacaagtggggtcagttgcataagcataaa-gcgggagggctcctgtactggaacactttgttgttcaaagcgg 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 6559 - 6648
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgggtt-agtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |   |||||| | ||||||||||||||||    
T  6559 agttgtatgtagatatacacaagtggggtcagttgcataagcataaa-gcgggagggctcctgtactggaacactttgttgttcaaagcgg 6648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 10315 - 10363
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  10315 gtcttagcggtgttgtcatgtcatttgcatgagtctgtgttgttggttg 10363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 141529 - 141326
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  141529 gttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 141430  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    ||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||    |||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| |||| | |||||||||||    
T  141429 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttacgtcctgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggtcctg-attatggtaccac 141332  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  141331 atgcat 141326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 373 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 146775 - 146566
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  146775 gagttgtatgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggagagcttcgtctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcac 146676  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    |||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  ||||||| ||    |||||||| ||||||||    
T  146675 tagttgctcaaagtggtttttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgaggacttcggccctg-aatatggt 146577  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  146576 accacatgcat 146566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 16017 - 16225
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||  |||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16017 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcaggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 16116  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| | ||||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  16117 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaagcattcgaatagcggtgagggctacggccctg-aatatggta 16215  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  16216 ccacatgcat 16225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Original strand, 7997 - 8162
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||| ||||| ||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7997 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataaggacaaaagcgggagggctccggccctggaactccttgtcgttcaaagcggtggaacact 8096  T
Q  473 a-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga 537  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  8097 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctaaaaagaatgctttaaccattcga 8162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 373 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 529 - 298
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  529 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagtataaaagcgggagggctttggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 430  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  429 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctg-aatatggt 331  T
Q  570 accacatgcatagttgcaattgtcggggagtct 602  Q
    ||||||||||||  |||| |||| | |||||||    
T  330 accacatgcatatctgcatttgttgaggagtct 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 373 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 10548 - 10341
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  10548 gagttgtatgtagatatacacgagtcggtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgtcgttcaaagtggtggagcact 10449  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtac 571  Q
     |||| |||||| | |||| || | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| | ||||||||    
T  10448 ggttgctcaaagtgatgtttagtgatgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctg-attatggtac 10350  T
Q  572 cacatgcat 580  Q
    |||||||||    
T  10349 cacatgcat 10341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 379 - 580
Target Start/End: Original strand, 50948 - 51148
Alignment:
Q  379 tatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgt 478  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||     
T  50948 tatgtagatatacacaagtaggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttatcgttcaaagtggtggagcactagttgc 51047  T
Q  479 tcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga-taatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||||||    
T  51048 tcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaaacgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctg-attatggtaccacatg 51145  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  51146 cat 51148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 265300 - 265100
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  265300 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggggcactagttg 265201  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||| || |||||||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| |||| | ||||||||||||||    
T  265200 ctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcatgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaaggctacggtcctg-attatggtaccacatg 265103  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  265102 cat 265100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 378 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 258874 - 258674
Alignment:
Q  378 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  258874 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggggcactagttg 258775  T
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatg 577  Q
     |||||| |||||| || ||||||||| |||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| |||| | ||||||||||||||    
T  258774 ctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacatatgtcatgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaaggctacggtcctg-attatggtaccacatg 258677  T
Q  578 cat 580  Q
    |||    
T  258676 cat 258674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 566 - 639
Target Start/End: Original strand, 18339 - 18412
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18339 tggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtttttgcatgagtcgttgttg 18412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 8619 - 8410
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacact 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||| || |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8619 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 8520  T
Q  473 agttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg--atgataatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||   || ||||| | ||||||    
T  8519 agttgttcaaagctgtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgaacagcggtgagggctgcgaccctg-attatggt 8421  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  8420 accacatgcat 8410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 16834 - 17071
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||  ||||||    
T  16834 gtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaac 16933  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagc 541  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | |||| |||||||||||||  |||    
T  16934 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgttttaaccattcgattagc 17033  T
Q  542 ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17034 ggtgagggcttcggccctg-aatatggtaccacatgcat 17071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 1817 - 1198
Alignment:
Q  53 agccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttttagatgttcctttcaac 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  1817 agccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaattttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcattttaaaatgtttctttcaac 1718  T
Q  152 ttgtaagatcattatatgta-ttttgaatcctactaaacacattgttaaatcgagttgatatagtttaatgaatttgtggattgaagtgagtgtg-aacc 249  Q
    ||||| || | |||||| ||    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |  | |||| ||||||| |||||   ||||||| || ||||    
T  1717 ttgtatgacctttatatatacccctgaatcctactgaacacattggt-aatcgagttggttgaatttagtgaattt-tggatatcagtgagtatgaaacc 1620  T
Q  250 aagtgaaaagatgttgcgttgaatg-acttgatgtattagtatgattgacattaattatacattt-tct-gatgttggattggttgagatggagtcgtat 346  Q
    ||||||| | ||  |  |||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||| ||| || ||||  |||  |   ||||||| |||     
T  1619 aagtgaatatatactaggttgaatgaacctgatgcattagtatgattgttattaattgtgcatttgtctggacgttg--ttgaat--tatggagttgtaa 1524  T
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| | | ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||    
T  1523 gtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtacgtagatatacacaagtggagtcaattgcataagcatataaagcgggagggctcatgccctggaac 1425  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttg-----agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgaca 539  Q
    ||||||| ||| |||||||  | || |  ||  |  ||  |  |||||     |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | |    
T  1424 gccttgtcgtttaaagcgggaggactcatgtcctggaacaccttgttgttcaaagcggtgagggcttatgccctgatg--aatgctttaaccattcaata 1327  T
Q  540 -gcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgtt 638  Q
      ||||| |||   | ||| || ||  ||||||||||||||| || || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326 tacggtgagggcttctgccttgtaaattggtaccacatgcatcgtcgc-attgttgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgtt 1228  T
Q  639 gttggttgaatcgttatattgttgatgatg 668  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  1227 gttggttgaattgccatattattgatgatg 1198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 335 - 535
Target Start/End: Original strand, 171741 - 171945
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagctt 432  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |||     
T  171741 atggagtggtaagtcatataagtacatatgcatttgttggagttgtatgtagatataaacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctc 171840  T
Q  433 cggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttc-aaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaac 530  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  171841 cggccctggaacgccttatcgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaac 171940  T
Q  531 cattc 535  Q
    |||||    
T  171941 cattc 171945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 4217 - 4368
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  || |||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4217 agcggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaattagaggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttg 4313  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314 tcgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 4368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 597 - 646
Target Start/End: Original strand, 10151 - 10200
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10151 gagtcgtagtggtgttgtcatgtcattgcataagacgttgttgttggttg 10200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35013 - 34842
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||  ||||||    
T  35013 gtcatataaatacatatgcatttgttggagttgcatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 34914  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctga 515  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34913 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctga 34842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 639
Target Start/End: Original strand, 125118 - 125161
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  125118 ggagtcttagtggtgttgccatgtcattgcatgagttgttgttg 125161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 368 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 183 - 1
Alignment:
Q  368 tagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtgga 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||   | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  183 tagttgagttgtatgtagatatacacaggttgggtagttgcataatttttaa-gtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgga 85  T
Q  468 acactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 561  Q
    ||||||||||||||||||          |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  84 acactagttgttcaaagc----------ggtgaggacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcctga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 568 - 516
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaag 71  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  568 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccgtcgcttaagcgaag 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Original strand, 15604 - 15730
Alignment:
Q  30 taagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15604 taagacggtcgcttaagcgaaccaaccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaactttgcctcgtgcactaggagatccttttgagc 15703  T
Q  130 atttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||  | ||||| |||||||||||||    
T  15704 atttaaaaatgtttctttcaacttgta 15730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 493 - 645
Target Start/End: Original strand, 16137 - 16288
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaatt 590  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16137 agcggtgaggacttatgtcctga--atgaatgttttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcattt 16233  T
Q  591 gtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    || | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  16234 gttgaggagtcttagaagtgtcgtcatgtcagtgcatgagtcgtcgtcgttggtt 16288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 427
Target Start/End: Original strand, 15966 - 16021
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggag 427  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  15966 gagttgtatgtagatatacaaaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 16021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 347 - 516
Target Start/End: Original strand, 11884 - 12055
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||||   ||||||    
T  11884 gtcatataaatacatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcggtgagggcctcggtcctggaac 11983  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat 516  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11984 gccttgtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgtt-agcggtgaggactcatgtcctgat 12055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Original strand, 11631 - 11731
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccact-tttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcattt 133  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||| || | ||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11631 ggtcgcttaagcgaactacccttcgcttaagcg-agctgagccttagtcagcctctatctgaactttgcttcatgcactaggggacccttttgagtattt 11729  T
Q  134 tt 135  Q
    ||    
T  11730 tt 11731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6959 - 6825
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6959 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaagatgacctcagtcagccacttttgaactttgcctcgtgcactagggg- 6861  T
Q  119 tccttttgagcatttttagatgttcctttcaacttgt 155  Q
    ||||||| || |||| || ||||  ||||||||||||    
T  6860 tcctttt-agtatttctaaatgtcactttcaacttgt 6825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 535
Target Start/End: Original strand, 5845 - 6035
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||  ||||||    
T  5845 gtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgaagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 5944  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc 535  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  5945 gccttgccgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagcggtgtt-agcgatgaggacttatgtcctgaaaatgaattctttaaccattc 6035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 798 - 692
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  798 ctgtaagccggtcgcttaagcgaaccagccgtcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttttgaactttgcctcgtgcattaggggatcctttt 699  T
Q  126 gagcatt 132  Q
    |||||||    
T  698 gagcatt 692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 495 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 259 - 110
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  || |||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  259 cggttaggacttatgtcctga--atgaatgctttaaccattcaattagtggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttgt 163  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
     | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  162 tgaggagtcttagaagtgtcgtcatgtcattgcatgagtcgttgtcgttggtt 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 340
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtg-ggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttc 433  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || |||  |||||||||||||| ||||| |||      
T  468 atggagtcgtaagtcatatatacatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacgcaagtgaagtcagttacataagcataaaagagggagggctct 370  T
Q  434 ggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||  |||||||||| ||  ||||||||||    
T  369 ggccctggaacgcctcgtcattcaaagcgg 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Original strand, 14544 - 14747
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  14544 gttgtatgtagatatacataagtgagtcagttgaataagcataacagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactag 14643  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||| ||  ||  |||| |||| |||||| ||||||    
T  14644 ttgctcaaagtggtgtt-agtggtgaggacttatgtcctgaaatgaatgttttaaccattctacagcgatgatggctacggtcctg-aatatgataccac 14741  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  14742 atgcat 14747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 375 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 14212 - 14052
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  14212 gttgtatgtagatatacacaagggggttagttgcataaacatagaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactcg 14113  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattc 535  Q
    ||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  14112 ttgctcaaagtggtgtt-agtggcgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 14052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 375 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24413 - 24209
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactag 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||      
T  24413 gttgtatgtggatatacacaaggcggttagttgcataagcatagaagtggaagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactca 24314  T
Q  475 ttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtacca 573  Q
    ||  |||||| |||||| || || |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| |||| | ||||||||||    
T  24313 ttcctcaaagtggtgtt-agtggcgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagaggtgagggctacggtcctg-attatggtacca 24216  T
Q  574 catgcat 580  Q
     ||||||    
T  24215 gatgcat 24209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 24444 - 24680
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||||   ||||||    
T  24444 gtcatataaatacatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcggtgagggcctcggtcctggaac 24543  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat---gataatgctttaaccattcgacag 540  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    | |||||||||||||||| | |     
T  24544 gacttgtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgtt-aacggtgaggactcatgtcctgataaaaagaatgctttaaccattctataa 24642  T
Q  541 cggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    | ||| |||   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24643 cagtgcgggctccggccctg--atatggtaccacatgcat 24680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 24192 - 24285
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgag 128  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24192 ggtcgcttaagcgagctatccttcgcttaagcga-gatgagccttagtcagtctctttctgaactttgcttcgtgcactaggggacccttttgag 24285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Original strand, 10588 - 10651
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10588 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtgg 10651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Original strand, 18767 - 18830
Alignment:
Q  335 atggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18767 atggagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gttgagttgtatgtagatatacacaagtgg 18830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 364 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 1055 - 881
Alignment:
Q  364 gcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcg 462  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  1055 gcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcggtgagtgcctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcg 956  T
Q  463 gtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattc 535  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  955 gtggaacactatgttgttcaaagcggtgtt-agtggtgaggacgcatgtcttgataaaagaatgctttaaccattc 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 492 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 707 - 559
Alignment:
Q  492 gagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| |||||  |     
T  707 gagcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttggtaccacatgcataattgcatatt 613  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    | | |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  612 ttgaggagtcttagtgatgttgtcatgtca-tgcatgagtcttagttgttggttg 559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 13358 - 13593
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  | ||| |    
T  13358 gtcacataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacacaagcgggtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctagaatg 13457  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcgg 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |  |||||    
T  13458 ccttattgttcaaagcggtggaacacatgttgttcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattctattagcgg 13557  T
Q  544 tgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    || |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  13558 tgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcat 13593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3444 - 3326
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||    
T  3444 gtcatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 3345  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  3344 gccttgtcgtttaaagcgg 3326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 377 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17096 - 16972
Alignment:
Q  377 tgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 476  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  17096 tgtatgtagatatatacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggcgctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacatgtt 16997  T
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgagg 502  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16996 gttcaaagcagtgtt-agcggtgagg 16972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 44426 - 44282
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacg 445  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||   |||||||    
T  44426 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagcgggatggcttcggtcctggaacg 44327  T
Q  446 ccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtg 489  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44326 ccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtg 44282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 493 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1981 - 1830
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaatt 590  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1981 agcggtgaggacttatgtcctga--atgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcattt 1885  T
Q  591 gtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1884 gttgaggagtcttagaagtgtcgtcatgtcattgcatgagtcgttgtcgttggtt 1830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2153 - 2098
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggag 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  2153 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 2098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1260 - 1130
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1260 ctgtgagccggtcgcttaagcgagccagccgtcgcttaagcgaagagggtcttagtcagccactttttgaattttgcttcgtgcactaggggatcctttt 1161  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  1160 gagcattttaaaatgtttctttcaacttgta 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 374 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 56069 - 55939
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  56069 agttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacacaaaagcgggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 55970  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgagg 502  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55969 ttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 55939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 373 - 580
Target Start/End: Original strand, 27737 - 27945
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaa-agtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  27737 gagttgtatgtagatatacaagggtgggttggttgcatagtcattaacagcgggagagcttcggctctggaacggcttgtcgttcaaagtggtggaacac 27836  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcct-gatgataatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggt 569  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||||||| | ||||||    
T  27837 gagttgttcaaagcggtgtt-agcgatgaggacttatgtcctataaaagaatgctttaaccattcgaatagcggtgagggctccggccctg-attatggt 27934  T
Q  570 accacatgcat 580  Q
    |||||||||||    
T  27935 accacatgcat 27945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 375 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5753 - 5638
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  5753 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactt 5654  T
Q  474 gttgttcaaagcggtg 489  Q
    ||||||||||||||||    
T  5653 gttgttcaaagcggtg 5638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 394 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 94 - 4
Alignment:
Q  394 aagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaag 484  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  94 aagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgctttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaag 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 347 - 580
Target Start/End: Original strand, 3270 - 3496
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||  ||||||    
T  3270 gtcatataaatacatatgtatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 3369  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacac-tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcg 542  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||          ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||    
T  3370 accttgtcgttcaaagcggtggaacacgttgttgttcaa----------agcggtgaggacttatgtcctaaaaagaatgctttaaccattcgattagcg 3459  T
Q  543 gtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    |||||||   || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3460 gtgtgggctccgaccctg-aatatggtatcacatgcat 3496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 121343 - 121213
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  121343 ctgtaagccggttgcttaagcgagccagccttcgcttaagcgaagaaggtcttagtcagccactttttgacttttgcttcgtgcactagggaatcctttt 121244  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  121243 gagcattttaaaatgtttctttcaacttgta 121213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 132220 - 132090
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  132220 ctgtaagccggttgcttaagcgagccagccttcgcttaagcgaagaaggtcttagtcagccactttttgacttttgcttcgtgcactagggaatcctttt 132121  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  132120 gagcattttaaaatgtttctttcaacttgta 132090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 668
Target Start/End: Original strand, 74207 - 74377
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgt 592  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | || ||||||||||||| ||||| |  |    
T  74207 agcggtgagggcttcggtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttgataccacatgcataattgcattaat 74301  T
Q  593 cggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
     | || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||    
T  74302 tgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtcat-gcatgagtctttgttgttggtggtaattgttataatgatgatgatg 74377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 108834 - 108778
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggt 644  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  108834 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgtcgttgttggt 108778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 441 - 580
Target Start/End: Original strand, 2376 - 2516
Alignment:
Q  441 gaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgat-aatgctttaaccattcga-c 538  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| |      
T  2376 gaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaactattcaatt 2475  T
Q  539 agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcat 580  Q
    ||||||| |||   |||||||| | |||||||||||||||||    
T  2476 agcggtgagggctccggccctg-attatggtaccacatgcat 2516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Original strand, 17046 - 17190
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagt-ggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| ||| ||||  ||||| |||  |||  ||||||    
T  17046 gtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcaattgcataggcacaaaatcgggagggctctggccctggaac 17145  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtg 489  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17146 gccttgtcgttcaaagtggtggaacacttgttgttcaaagcggtg 17190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 44086 - 44294
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||| ||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  44086 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgtataagtataaaagcgggagggccctggccttggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacact 44185  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | ||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  44186 ttgttgttcaaagtggtgtttagcaatgacgacttatgtcttgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctg-aatatggta 44284  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  44285 ccacatgcat 44294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Original strand, 49152 - 49360
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||| ||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  49152 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgtataagtataaaagcgggagggccctggccttggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacact 49251  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | ||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  49252 ttgttgttcaaagtggtgtttagcaatgacgacttatgtcttgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctg-aatatggta 49350  T
Q  571 ccacatgcat 580  Q
    ||||||||||    
T  49351 ccacatgcat 49360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 7147 - 6939
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa-gtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||| | ||||| ||   |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7147 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgtataaccataaaaagcgggagggccctggccctggaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacac 7048  T
Q  472 ta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatgg 568  Q
    |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| || ||||    
T  7047 tttgttgttcaaagcggtgattagcggtgaggacttatgtcctgaatg--aatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctg-aacatgg 6951  T
Q  569 taccacatgcat 580  Q
    ||||||||||||    
T  6950 taccacatgcat 6939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19789 - 19730
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19789 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttg-tgttggttgaa 19730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 493 - 646
Target Start/End: Original strand, 39 - 190
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgac-agcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||| |  ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  39 agcggtgaggacttatgtctcgatga--atgctttaaccgttcaattagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatagttgcatttg 135  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |   |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  136 ttcaggagtcttattggtgttgtcctgtaattgcatgagtcgttgttgttggttg 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 373 - 632
Target Start/End: Original strand, 2817 - 3077
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  2817 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 2916  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--atgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatg 567  Q
    ||| |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||  ||||    
T  2917 ctatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattctataacgatgagggcttcggctctga--tatg 3013  T
Q  568 gtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  3014 gtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc-ttgcatgagtc 3077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 566 - 669
Target Start/End: Original strand, 4478 - 4584
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatga---gtcgttgttgttggttgaatcgttatattgttg 662  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||    
T  4478 tggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgtcgttgtcgttggttgaattgccatattattg 4577  T
Q  663 atgatgt 669  Q
    |||||||    
T  4578 atgatgt 4584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 555 - 639
Target Start/End: Original strand, 97493 - 97577
Alignment:
Q  555 gccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97493 gccctgtaaaatggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 97577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 576 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5929 - 5835
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatgt 669  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  5929 tgcatagtcgcaattgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgtcgttgttggttgaaattgccatattgttgatgatgt 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 6)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 81827 - 81957
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccac-ttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  81827 ctgtaagtcggtcgcttaagcgagccagccgtcgcttaagcgaagtaggtcttagtcagccactttttgaattttgcttcgtacaccagggaatcctttt 81926  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  81927 gagcattttaaaatgtttctttcaacttgta 81957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 80096 - 80224
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggg 116  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||   ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  80096 cagacctactgtaagatggtcgcttaagcgagctagccgtcgcttaagcgaa-ctgagtgttagtcagcctttttctgaaccttgcttcgtgcactaagg 80194  T
Q  117 gatccttttgagcatttttagatgttcctt 146  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||    
T  80195 gatccttttgagtacttctaggtgttcctt 80224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 648
Target Start/End: Original strand, 61297 - 61368
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  61297 tgcatagttgca-ttgttgaggagtcttagcggagttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 61368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 620
Target Start/End: Original strand, 80594 - 80650
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||    
T  80594 tatggtaccacatgcatagttgcaattgttgaggagtcttagtagagttgtcatgtc 80650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 648
Target Start/End: Original strand, 73085 - 73156
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  73085 tgcatagttgca-ttgttgaggagtcttagcggagttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttattggttgaa 73156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 80393 - 80441
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  80393 gagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 80441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 439 - 581
Target Start/End: Original strand, 52671 - 52815
Alignment:
Q  439 tggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcg 536  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  52671 tggaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacccatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcg 52770  T
Q  537 a-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcata 581  Q
    |  ||||||| |||   |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  52771 attagcggtgagggcttcggccctg-attatggtaccacatgcata 52815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 52846 - 52894
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52846 gtcttagcggtgttgacatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 52894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 51678 - 51557
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttt 134  Q
    |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51678 ggtcacttaagcgagccagccgtcgcttaagcgaagaaggtcttagtcagccactttttgaattttgctttgtgcactagggaatccttttgagcatttt 51579  T
Q  135 tagatgttcctttcaacttgta 156  Q
     | ||||| |||||||||||||    
T  51578 aaaatgtttctttcaacttgta 51557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 51145 - 51071
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgt 640  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  51145 tggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagaggtgtcgtcatatcattgcatgagtcgtcgttgt 51071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 51341 - 51252
Alignment:
Q  376 ttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  51341 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcaattgcataagcatataaagcgggagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 51252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 555 - 639
Target Start/End: Original strand, 43049 - 43133
Alignment:
Q  555 gccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43049 gccctgtaaaatggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagccgttgttg 43133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 153
Target Start/End: Original strand, 19023 - 19150
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatcctttt 125  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| | |||| || | |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19023 ctgtgagccagtcgcttaaccgagccagccgtctcctaagcgaagagggtcttagtcagccactttttgaattttgcttcgtgcactaggggatcctttt 19122  T
Q  126 gagcatttttagatgttcctttcaactt 153  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  19123 gagcattttaaaatgtttctttcaactt 19150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Original strand, 19565 - 19639
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgt 640  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19565 tggtaccacatgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagaggtgatgtcatgtcattgcatgagtcgtcgttgt 19639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 25821 - 25703
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| ||| | ||  ||||||    
T  25821 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcctgccctggaac 25722  T
Q  445 gccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  25721 gccttgtcgttcaaagcgg 25703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 124
Target Start/End: Original strand, 4277 - 4382
Alignment:
Q  19 cagacttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactagggg 117  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  4277 cagacctactgtaagctggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaa-ctgagcgttagtcagccttttctgaatcttgcttcgtgcactagggg 4375  T
Q  118 atccttt 124  Q
    | |||||    
T  4376 acccttt 4382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 483
Target Start/End: Original strand, 4571 - 4684
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |  |||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  4571 gagttgtatgaagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacgatgaggacttcggtcctggaacgccttgtcgttcaaaacgatggagca 4670  T
Q  471 cta-gttgttcaaa 483  Q
    ||| ||||||||||    
T  4671 ctatgttgttcaaa 4684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 370594 - 370396
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  370594 agttgtatgtagatatacacaagtggtgtcagttgcataagcacaaaagcgtgagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacact 370495  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggta 570  Q
    | |||||||||          || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  370494 ttgttgttcaa----------agtggtgaggacttatgtcctgaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctg-aatatggta 370406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 461
Target Start/End: Original strand, 4949 - 5065
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaac 444  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||| ||||| ||| | || |||||||    
T  4949 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataaacatataaagcgggagggctcctgccttggaac 5048  T
Q  445 gccttgttgttcaaagc 461  Q
    ||||||| |||||||||    
T  5049 gccttgtcgttcaaagc 5065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 10885 - 10833
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10885 ggagtcttagtggtgttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 10833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 435 - 344
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggt 464  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||  |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  435 gagttgtatgtaggtatacacaagtgagtaagtcgcatatgcataaaagcgggaggacttctgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggt 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 217
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgca 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  310 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccttg-attatggtaccacatgcatatttgca 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 350 - 463
Target Start/End: Original strand, 17373 - 17488
Alignment:
Q  350 atatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgcc 447  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  |||||||||    
T  17373 atatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgcc 17472  T
Q  448 ttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||| |||||||||||    
T  17473 ttgtcgttcaaagcgg 17488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 465
Target Start/End: Original strand, 57154 - 57245
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  57154 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 57245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 141479 - 141388
Alignment:
Q  375 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  141479 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 141388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6848 - 6758
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  6848 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 6758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20727 - 20676
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20727 gagtcgtagtggagttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 20676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31394 - 31343
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31394 gagtcgtagtggagttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 31343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1684 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1684
Description:

Target: scaffold1684; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 1472 - 1419
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1472 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattacatgagttgttgttgttggttgaat 1419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2365 - 2284
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggag 427  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  2365 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagcgggag 2284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0377
Description:

Target: scaffold0377; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7437 - 7344
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaa-agtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| | || ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7437 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcggttgcatagtcatatacagcgggagagcttcggctctggaacgccctgtcgttcaaagcggtg 7344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3398 - 3323
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgcc 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  3398 gagttgtatgtagatatacacaagtgggtcggttgcatagtcatatacagcgggagagcttcggctctggaacgcc 3323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 7356 - 7253
Alignment:
Q  477 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctg-atgataatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||||||| | |||||||||||    
T  7356 gttcaaagcggtgtt-agcggtgaggacttaggtcctgtaaaagaatgctttaaccattcgtatagcggtgagggctccggccctg-attatggtaccac 7259  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  7258 atgcat 7253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17614 - 17503
Alignment:
Q  22 acttactgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||| ||     
T  17614 actttctgtaagccggtcgcttaagcgagccagccttcgcttaagcgaag-tgagccttggtcagccactttctgaattttgtttcgtgcactaggcgag 17516  T
Q  120 ccttttgagcatt 132  Q
    |||||||||||||    
T  17515 ccttttgagcatt 17503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Original strand, 113 - 164
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113 gagtcatagaggagttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8475 - 8356
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaa 443  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||| |||||    
T  8475 gtcatatacatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgctctggaa 8376  T
Q  444 cgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  8375 cgccttgtcgttcaaagcgg 8356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18559 - 18440
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaa 443  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||| |||||    
T  18559 gtcatatacatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgctctggaa 18460  T
Q  444 cgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18459 cgccttgtcgttcaaagcgg 18440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 25503 - 25440
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25503 tgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 25440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 500 - 620
Target Start/End: Original strand, 4264 - 4385
Alignment:
Q  500 aggacttatgtcctgatgataa---tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggg 596  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||| | | ||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  4264 aggactcatgtcctgatgaaaagaatgctttaaccattctataacggtgagggcaacggccctga--tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgag 4361  T
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||| || || ||||||||    
T  4362 gagtcttagtggagtcgtcatgtc 4385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 3882 - 3975
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgacc-ttagtcagccactttt-gaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgag 128  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||| | ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3882 ggtcgcttaagcgagctacccttcgcttaagcgaac-tgagcattagtcagcctttttttgaaccttgcttcgtgcactaggggacccttttgag 3975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Original strand, 4161 - 4209
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  4161 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 4209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6211 - 6062
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagc-ggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | | |||| ||||  | |||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||    
T  6211 agcggtgagggcttatgccctgatga--atgctttaaccattcaatatccggtgagggtttctgccctgtaat-tggtaccacatgcattattgca-ttg 6116  T
Q  592 tcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggtt 645  Q
    ||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  6115 tcgaggagtcttagcggtgttgtcgagttgttgcatgagtcattgttgttggtt 6062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 597 - 647
Target Start/End: Original strand, 1718 - 1768
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1718 gagtcttagaggtgttgtcatgtcaatgcatgagtcgttgttgatggttga 1768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 597 - 647
Target Start/End: Original strand, 27126 - 27176
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27126 gagtcatagaggagttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 27176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 620
Target Start/End: Original strand, 9 - 66
Alignment:
Q  563 atatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  9 atatggtaccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagaggagttgtcatgtc 66  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 489
Target Start/End: Original strand, 38636 - 38752
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||     
T  38636 agttgtatgtagatatacacgagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgcctcgtcgttcaaagcggt-gaacact 38734  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtg 489  Q
    | |||||| |||||||||    
T  38735 ttgttgttaaaagcggtg 38752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 489
Target Start/End: Original strand, 136696 - 136812
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacac- 471  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||     
T  136696 agttgtatgtagatatacacgagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgcctcgtcgttcaaagcggt-gaacact 136794  T
Q  472 tagttgttcaaagcggtg 489  Q
    | |||||| |||||||||    
T  136795 ttgttgttaaaagcggtg 136812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 639
Target Start/End: Original strand, 193 - 236
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193 ggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8524 - 8473
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8524 gagtcgtagtggagttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 8473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 5)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 576 - 639
Target Start/End: Original strand, 41808 - 41871
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41808 tgcatagtcgcatttgttgaggagtcttagcggtgttgtcatgttattgcatgagtcgttgttg 41871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 26176 - 26069
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  26176 agcggtgagggcttatgccctaatga--atgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatatttgcatttg 26080  T
Q  592 tcggggagtct 602  Q
    | | |||||||    
T  26079 ttgaggagtct 26069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27558 - 27451
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattg 591  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27558 agcggtgagggcttatgccctaatga--atgctttaaccattcaaacagcggtgagggcttcggccctgaa-tatggtaccacatgcatatttgcatttg 27462  T
Q  592 tcggggagtct 602  Q
    | | |||||||    
T  27461 ttgaggagtct 27451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26302 - 26211
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtg-ggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||| ||||| |||   ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26302 agttgtatgtagatatacacaagtgaagttcattgcataagcatataaagcgggagggctcttgctctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 26211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27684 - 27593
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtg-ggttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||| ||||| |||   ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27684 agttgtatgtagatatacacaagtgaagttcattgcataagcatataaagcgggagggctcttgctctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 27593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 637 - 567
Alignment:
Q  348 tcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  637 tcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Original strand, 3267 - 3357
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||  |||| |||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  3267 agttgtatgtagatatacacaagcggagtcagttgcataagcataaaagcaggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 3357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 8710 - 8640
Alignment:
Q  348 tcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  8710 tcatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 8640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 495 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 41311 - 41168
Alignment:
Q  495 cggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcg 594  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||   | |||||||||||||||| |||| ||| | |    
T  41311 cggtgagggcttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg---tttggtaccacatgcataattgc-attattg 41218  T
Q  595 gggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
     || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41217 aggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtc-ttgttgttggttg 41168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 603 - 648
Target Start/End: Original strand, 4951 - 4996
Alignment:
Q  603 tagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4951 tagaggtgttgtcatgtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 608 - 649
Target Start/End: Original strand, 7320 - 7361
Alignment:
Q  608 gtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7320 gtgttgtcatgtcattgcatgggtcgttgttgttggttgaat 7361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 1105 - 1163
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1105 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 1163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3359
Alignment:
Q  27 ctgtaagccggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttttgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttg 126  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||  |  |||  || |||||||||| |||| | ||    
T  3230 ctgtaagacagtcgcttaagcgaaccagccttcgcttaagcaaagaaggccttggtcagccacattttgattttgtttcctgcactagggaatccatctg 3329  T
Q  127 agcatttttagatgttcctttcaacttgta 156  Q
    |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  3330 agcattctgaaatgtttctttcaacttgta 3359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 9493 - 9545
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  9493 ggagtcttagtggtgttgtcatgtcattgcatgaattgttgttcttggttgaa 9545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Original strand, 5004 - 5056
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5004 gtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtgg 5056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 5094 - 5186
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  5094 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 143976 - 143897
Alignment:
Q  566 tggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  143976 tggtaccacatgcataattgcatttattgaggggtcttagtggtgtcgtcatgtca-tgcatgagtctttgttgttggttg 143897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2016 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold2016
Description:

Target: scaffold2016; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 639
Target Start/End: Original strand, 952 - 995
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  952 ggagtcttagtggtgttgtcatgtaattgcatgagtcgttgttg 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1979 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1979
Description:

Target: scaffold1979; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 597 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 1040 - 989
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1040 gagtcgtagtggagttgtcatatcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0669 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0669
Description:

Target: scaffold0669; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 613 - 648
Target Start/End: Original strand, 1943 - 1978
Alignment:
Q  613 gtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1943 gtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 1978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27449 - 27358
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  27449 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 27358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9476 - 9357
Alignment:
Q  347 gtcatatacatacatacgcattagtgga-gttgtatgtagatatacacaagtgggtt-agtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaa 443  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||| |||   ||  |||||    
T  9476 gtcatatacatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggattcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaa 9377  T
Q  444 cgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  9376 cgccttgtcgttcatagcgg 9357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1290
Description:

Target: scaffold1290; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 1460 - 1518
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1460 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 1518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 399
Target Start/End: Original strand, 1189 - 1218
Alignment:
Q  370 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189 gtggagttgtatgtagatatacacaagtgg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1098
Description:

Target: scaffold1098; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 1843 - 1801
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1843 gagtcttagtggtgttgtcgtgtcattgcatgagtcgttgttg 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 2234 - 2176
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2234 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 2176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 2882 - 2844
Alignment:
Q  610 gttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2882 gttgtcatgtcattgcataagtcgttgttgttggttgaa 2844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 11174 - 11267
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgag 128  Q
    ||||||||||||||  || || |||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11174 ggtcgcttaagcgagatacccttcgcttaagcgaac-tgagccttagtcagcctttttctgaaccttgcttcgtgcactaggggacccttttgag 11267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 465
Target Start/End: Original strand, 11452 - 11546
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgg-gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtg 465  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  || |||  | ||||   ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11452 gagttatatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaaacggtgaggacctcggtcctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 22970 - 22920
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttga 647  Q
    ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22970 gagtcgtagtggagttgtcatttcattgcatgagtcgttgttgttggttga 22920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 599 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15071 - 15001
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg-aatcgttatattgttgatgatg 668  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  15071 gtcttagcagtgttgtcatgtcattgcatgagtcttgattgttggttgtagttgttatattgatgatgatg 15001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 45487 - 45429
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45487 attgtcgtggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 45429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 29786 - 29728
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29786 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 29728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 44792 - 44702
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||| ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  44792 agttgtatgaagatatacacaagtggagtccgttgcataagcatataagcgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 38508 - 38466
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcga 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  38508 agcggtgaggacttatgtcttgatg--aatgctttaaccattcga 38466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 207977 - 208035
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  207977 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 208035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 649
Target Start/End: Original strand, 5594 - 5665
Alignment:
Q  576 tgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaat 649  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5594 tgcatagttgca-ttgttgaggagtct-agcggtgttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaat 5665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 463
Target Start/End: Original strand, 323 - 450
Alignment:
Q  336 tggagtcgtatgtcatatacatacatacgcattagtggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcg 434  Q
    ||||||| || |||||||| | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||| || || || |||    
T  323 tggagtcataagtcatatatacatatatgcatt-gtcgagttgtatgtagatatacacaagaggagtcagttgcatgagcataaaagcggaagggcctcg 421  T
Q  435 gctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |   |||||| |||||| |||||||||||    
T  422 gtcctggaacaccttgtcgttcaaagcgg 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 581
Target Start/End: Original strand, 510 - 570
Alignment:
Q  520 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcata 581  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  510 aatgctttaatcattctacagtggtgagggctacggccctgaa-tatggtaccacatgcata 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 600 - 648
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  600 gtcttagcagtgttgtcatgtcagttgcatgagtcggtgttgttggttg 648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18121 - 18021
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatga-ccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcattt 133  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18121 ggtcgcttaagcgagctacctttcgcttaagcgaac-tgagccttagtcagcctttttctgaaccttgcttcgtgcactagaggacccttttgagtattt 18023  T
Q  134 tt 135  Q
    ||    
T  18022 tt 18021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1469 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold1469
Description:

Target: scaffold1469; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 425 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 448 - 242
Alignment:
Q  425 gagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacacta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgata--a 521  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||| || | |||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||| | |  |    
T  448 gagaacttcggttctggaacgccttgtcgttcaaaacgatggaatacgatgttgttcaaaacgatgttaa-cgatgaggactcatgtcctgataaaagaa 350  T
Q  522 tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtca 621  Q
    |||||||||||||| | | || || | |   |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||  | |||||||||||     
T  349 tgctttaaccattctataacgatgagagcttcggctctga--tatggtaccacatgcatagttgcatttgttgataagtcttagtagagttgtcatgtc- 253  T
Q  622 ttgcatgagtc 632  Q
    |||||||||||    
T  252 ttgcatgagtc 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1469; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 511 - 463
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  511 gagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1469; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 788 - 679
Alignment:
Q  36 ggtcgcttaagcgaactagccatcgcttaagcgaagatgaccttagtcagccacttt-tgaaccttgcctcgtgcactaggggatccttttgagcatttt 134  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||||   | ||||||| | ||  ||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  788 ggtcgcttaagcgagctgcccctcgcttaagcgaactgggccttagttaacctttttctgaacattacttcgtgcactaggggttccttttgagtatttc 689  T
Q  135 tagatgttcc 144  Q
    ||||||||||    
T  688 tagatgttcc 679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 620
Target Start/End: Original strand, 297 - 353
Alignment:
Q  564 tatggtaccacatgcatagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtc 620  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  297 tatggtcccacatgcatagttgcatttgttgaggagtcttagtggagttgtcatgtc 353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 26211 - 26159
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26211 ggagtcttagcggtgttgtcgggtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 26159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 179 - 13
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtg-ggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcggtggaaca 470  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||  |  |||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  179 gagttgtatgctgatatacacaagtggagtcagttgcattagcataaaaacgatgagaacttcggttctggaacgctttgtcgttcaaaacgatggaaca 80  T
Q  471 cta-gttgttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgat--gataatgctttaaccattc 535  Q
    | | |||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  79 cgatgttgttcaaaacgatgtt-aacgatgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattc 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 2178 - 2230
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2178 ggagtgttagcggtgttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 2230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 3957 - 4009
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  3957 ggagtcttagtggtgttgtcgtgtagttacatgagtcgttgttgttggttgaa 4009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 31540 - 31631
Alignment:
Q  373 gagttgtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagt-gggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||  || ||| |||||| |||||||||||    
T  31540 gagttgtatgtatatatgcacaagtgagtcagtcgcatatgcataaaaatcgggagagtttctgccctgcaacaccttgtcgttcaaagcgg 31631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 535
Target Start/End: Original strand, 31666 - 31706
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31666 agcggtgaggacttatgtcctgatg--aatgctttaaccattc 31706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 31782 - 31830
Alignment:
Q  599 gtcttagaggtgttgtcatgtca-ttgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31782 gtcttagcagtgttgtcatgtcagttgcatgagtcggtgttgttggttg 31830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3080 - 2989
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata-aaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgttgttcaaagcgg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  ||||| |||   ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  3080 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaaacgggagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaagcgg 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 1548 - 1606
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  1548 attgtcgaggagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgctgttgttggttg 1606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 478 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 20907 - 20803
Alignment:
Q  478 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatga--taatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgaaatatggtaccac 574  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||| |   |||||| |||   |||||||| |||||||||||||    
T  20907 ttcaaagcggtgtttagcgatgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctatttgcggtgagggctccggccctg-aatatggtaccac 20809  T
Q  575 atgcat 580  Q
    ||||||    
T  20808 atgcat 20803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 5859 - 5799
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| |||| |  || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5859 atagttgcatttgttgaagaatcttagtggtgtcgtcatgtcagtgcatgagtcgttgttg 5799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 8011 - 7951
Alignment:
Q  579 atagttgcaattgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttg 639  Q
    ||||||||| |||| |  || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8011 atagttgcatttgttgaagaatcttagtggtgtcgtcatgtcagtgcatgagtcgttgttg 7951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Original strand, 206 - 264
Alignment:
Q  588 attgtcggggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  206 attgtcgaggagtcttagcggagttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 597 - 646
Target Start/End: Original strand, 11818 - 11867
Alignment:
Q  597 gagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11818 gagtcttagcggtgttgtcgagtagttgcatgagtcgttgttgttggttg 11867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 247102 - 247052
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||    
T  247102 agcggtgagggcttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaagcggtg 247052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 253616 - 253566
Alignment:
Q  493 agcggtgaggacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtg 545  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||    
T  253616 agcggtgagggcttatgtcctgatg--aatgctttaaccattcaaaagcggtg 253566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Original strand, 553 - 593
Alignment:
Q  607 ggtgttgtcatgtcatt-gcatgagtcgttgttgttggttg 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  553 ggtgttgtcatgtcatttgcatgagtcggtgttgttggttg 593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 4721 - 4681
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttg 636  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4721 ggagtcttagtggtgtcgtcatgtcagtgcatgagtcgttg 4681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18712 - 18668
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  18712 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 18668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 9502 - 9451
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9502 ggagtcttagcggt-ttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 9451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13575 - 13524
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttgttgttggttgaa 648  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13575 ggagtcttagcggt-ttgtcaagtagttgcatgagtcgttgttgttggttgaa 13524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10655 - 10611
Alignment:
Q  374 agttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcata 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  10655 agttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 10611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 636
Target Start/End: Original strand, 81437 - 81477
Alignment:
Q  596 ggagtcttagaggtgttgtcatgtcattgcatgagtcgttg 636  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  81437 ggagtcttaatggtgttgtcaagtcattgcatgagtcgttg 81477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University