View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18164_low_1 (Length: 807)

Name: NF18164_low_1
Description: NF18164
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18164_low_1
NF18164_low_1
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (6-561)||(7747291-7747846)
chr3 (15-561)||(6725678-6726232)
chr3 (15-501)||(6858496-6858992)
chr3 (15-416)||(6412534-6412936)
chr3 (21-233)||(6595165-6595378)
chr3 (15-228)||(8572570-8572788)
chr3 (646-762)||(6725417-6725534)
chr3 (645-793)||(6852412-6852557)
chr3 (646-789)||(6594674-6594818)
chr3 (471-644)||(6594858-6595017)
chr3 (496-644)||(6412340-6412489)
chr3 (46-192)||(6255311-6255460)
chr3 (581-645)||(6852607-6852671)
chr3 (602-644)||(6725611-6725653)
chr3 (648-731)||(6412201-6412285)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (162-760)||(14878-15479)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 561
Target Start/End: Original strand, 7747291 - 7747846
Alignment:
Q  6 tagtcgactgaaatgaaaggcatgagaagctcgagaaaaggattagaaggcttgaaatgactggtttgtgaaggaaccttggagttacaatgggaggata 105  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7747291 tagtcgatagaaaggaaaggcatgagaagctcgagaaaaggattagaaggcttgaaatgactggtttgtgaaggaaccttggagttacaatgggaggata 7747390  T
Q  106 gaagcaactaacctattgcattgatatagtcgtaaatacaagtttaacgaaaaaactgattgttttcttgtctgctagagtgatagatcactcttttctg 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7747391 gaagcaactaatctattgcattgatatagtcgtaaatacaagtttaacgaagaaactgattgtttgcttgtctgctagagtgatagatcactcttttctc 7747490  T
Q  206 tatcggcccggaaattcaggagacgattcttgatatacttgctggaacatgaaagtcacaattagaagattttatgtcttcgtttactggattttcaaag 305  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7747491 tatcggccccgaaatttaggacacgattcttgatatacttgctggaatatgaaagtcacaattagaagattttatgtcttcgtttactggattttcaaag 7747590  T
Q  306 tgtttcaaagaagtnnnnnnntataaccttcttgtattgttgttaatgttaatatcaaatcatttccgttcgatatcttttagctcctacctttgttgaa 405  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  7747591 tgtttcaaagaagtaaaaaaatataaccttcttgtattgttgttaatgttaatatcaaatcatttccgttcaataacgtttagctcccacctttgttgaa 7747690  T
Q  406 atttgaaaatatgtcactgttcttagtttcataaatatattgcatgttagttgaagaatacgacgtgtatggaattggttaattaaaaggtgcatacaaa 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7747691 atttgaaaatatgtcactgttcttagtttcataaatatattgcatgttagttgaagaatacgatgtgtatggaattggttaattaaaaggtgcatacaaa 7747790  T
Q  506 gagtactcatacttgctatctaatattgaatatatatcccatgctgttttctgttc 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  7747791 gagtactcatacttgctatctaatattgaatatattgtccatgctgttttctgttc 7747846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 6726232 - 6725678
Alignment:
Q  15 gaaatgaaaggcatgagaagctcgagaaaaggattagaaggcttgaaatgactgg-tttgtgaaggaaccttggagttacaatgggaggatagaagcaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6726232 gaaaggaaaggcatgagaagctcgagaaatggattcgaaggcttgaaatgactggatttgtgaaggtgcctttgagttacaatgggaggatagaagcaac 6726133  T
Q  114 taacctattgcattgatatagtcgtaaatacaagtttaacgaaaaaactgattgttttcttgtctgctagagtgatagatcactcttttctgtatcggcc 213  Q
    ||| ||||||||  |||||||||  || ||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||| | || ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  6726132 taatctattgcagcgatatagtcacaagtacaagtttaaagaagaacatgattgtttgcttgtctgttggaatgacagaccactgttttctgtatcggcc 6726033  T
Q  214 cggaaattcaggagacgattcttgatatacttgctggaacatgaaagtcacaattagaagattttatgtcttcgtttactggattttcaaagtgtttcaa 313  Q
     ||||||| |||||| |||| || |||||| || |||||  |||   || | ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  6726032 tggaaatttaggagatgattattcatatacatggtggaatttgaggatcgccattagaagattttatgtttttgttttttggattttcaaagtgtttcaa 6725933  T
Q  314 agaagtnnnnnnntataaccttcttgtattgttgttaatgttaatatcaaatcatttccgttcgatatcttttagctcctacctttgttgaaatttgaaa 413  Q
    ||||||        ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6725932 agaagtaaaacaacatatccttcttgaattgttgttaatgttcatatcaattcatttctgtacaatattttttagctcccacctttgttgaaatatgaaa 6725833  T
Q  414 at-----------atgtcactgttcttagtttcataaatatattgcatgttagttgaagaatacgacgtgtatggaattggttaattaaaaggtgcatac 502  Q
    ||           ||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  6725832 ataaatgtctaaaatgtcactgctcatagtttcatagatacattgcatgctagttgaag---ccgacatgtatggaattggttaattaaaatatgcatgc 6725736  T
Q  503 aaagagtactcatacttgctatctaatattgaatatatatcccatgctgttttctgttc 561  Q
    || |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  6725735 aaggtatactcatacttgccatctaatattgaatatat-tgtcatgcggttttctgttc 6725678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 6858992 - 6858496
Alignment:
Q  15 gaaatgaaaggcatgagaagctcgagaaaaggattagaaggcttgaaatgactgg-tttgtgaaggaaccttggagttacaatgggaggatagaagcaac 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6858992 gaaaggaaaggcatgagaagctcgagcaatggattcaaagacttaaaatggctggatttgtgaaggtacctttgagttacaatgggaggatagaagcgac 6858893  T
Q  114 taacctattgcattgatatagtcgtaaatacaagtttaacgaaaaaactgattgttttcttgtctgctagagtgatagatcactcttttctgtatcggcc 213  Q
     || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  6858892 aaatctattgcagcgatatagtcataaatacaagtttaaagaagaaaatgattgtttacttgtttgttggagtgacagaccacttttttctgtatcggcc 6858793  T
Q  214 cggaaattcaggagacgattcttgatatacttgctggaacatgaaagtcacaattagaagattttatgtcttcgtttactggattttcaaagtgtttcaa 313  Q
     ||||||| ||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||  |||| ||  ||| |||||||||  |||||||||||    
T  6858792 tggaaatttaggtgatgattcttgatatacatgccggaatatgaaagtcaaagttagaagattaaatgtttttattttctggattttataagtgtttcaa 6858693  T
Q  314 agaagtnnnnnnntataaccttcttgtattgttgttaatgttaatatcaaatcatttccgttcgatatcttttagctcctacctttgttgaaatttgaaa 413  Q
    ||||||        ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||  |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6858692 agaagtaaaacaacatatccttattgtattgttgttaatgttaatatcaatttatttctgtataataaattttagctcccacctttgttgaaatatgaaa 6858593  T
Q  414 at---------atgtcactgttcttagtttcataaatatattgcatgttagttgaagaatacgacgtgtatggaattggttaattaaaaggtgcata 501  Q
    ||         |||| | || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6858592 attaatcacaaatgtgagtgctcttagtttcataaatatactgcatgctagttgaagtagatgacatgtatgaaattggttaattaaaaggtgcata 6858496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6412936 - 6412534
Alignment:
Q  15 gaaatgaaaggcatgagaagctcgagaaaaggattagaaggcttgaaatgactgg-tttgtgaaggaaccttggagttacaatgggaggatagaagcaac 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6412936 gaaaggaaaggcatgagaagctcgagaaatggattcgaaggcttgaaatgactggatttgagaaggtacctttgagttacaatgggaggatagaagcaac 6412837  T
Q  114 taacctattgcattgatatagtcgtaaatacaagtttaacgaaaaaactgattgttttcttgtctgctagagtgatagatcactcttttctgtatcggcc 213  Q
    ||| ||||||||  |||||||||  || ||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  6412836 taatctattgcagcgatatagtcacaagtacaagtttaaagaagaacatgattgtttgcttgtctgctggagtgacagaccactgttttctgtatcggcc 6412737  T
Q  214 cggaaattcaggagacgattcttgatatacttgctggaacatgaaagtcacaattagaagattttatgtcttcgtttactggattttcaaagtgtttcaa 313  Q
     ||||||| |||||| |||  || |||||| || |||||  |||   || | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6412736 tggaaatttaggagatgatgtttcatatacatggtggaatttgaggatcgccattagaagattttatgtttttgttttctggattttcaaagtatttcaa 6412637  T
Q  314 agaagtnnnnnnntataaccttcttgtattgttgttaatgttaatatcaaatcatttccgttcgatatcttttagctcctacctttgttgaaatttgaaa 413  Q
    ||||||        ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  6412636 agaagtaaaccaacatatccttcttgaattgttgttaatgttaatatcaattcatttctgcacaataatttttagctcccaccttcgttgaaatatgaaa 6412537  T
Q  414 ata 416  Q
    |||    
T  6412536 ata 6412534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6595378 - 6595165
Alignment:
Q  21 aaaggcatgagaagctcgagaaaaggattagaaggcttgaaatgactgg-tttgtgaaggaaccttggagttacaatgggaggatagaagcaactaacct 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6595378 aaaggcatgagaagctcgagaaatggattcgaaggcttgaaatgactggatttgtgaaggtgtctttgagttacaatgggaggatagaagcaactaatct 6595279  T
Q  120 attgcattgatatagtcgtaaatacaagtttaacgaaaaaactgattgttttcttgtctgctagagtgatagatcactcttttctgtatcggcccggaaa 219  Q
    ||||||  |||||||||  || ||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||||    
T  6595278 attgcagcgatatagtcacaagtacaagtttaaagaagaacatgattgtttgcttgtctgctggagtgacagaccactgttttctgtaccagcctggaaa 6595179  T
Q  220 ttcaggagacgatt 233  Q
    || |||||| ||||    
T  6595178 tttaggagatgatt 6595165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8572788 - 8572570
Alignment:
Q  15 gaaatgaaaggcatgagaagctcgagaaaaggattagaaggcttgaaatgactgg-tttgtgaaggaaccttggagttacaatgggaggatagaagcaac 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8572788 gaaaggaaagacatgagaagcttgagaaatagattcaaaggcttgaaatgactggatttgtgaaggtacctttgacttacaatgggaggatagaagcaac 8572689  T
Q  114 taac----ctattgcattgatatagtcgtaaatacaagtttaacgaaaaaactgattgttttcttgtctgctagagtgatagatcactcttttctgtatc 209  Q
    |||     ||||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8572688 taattaatctattgcagcgatatagtcacaaatacaagtttaaagaagagaatgattgtttgcttgtctgctggagtgatagaccactcttttctgtatc 8572589  T
Q  210 ggcccggaaattcaggaga 228  Q
     ||| ||||||| ||||||    
T  8572588 cgcctggaaatttaggaga 8572570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 646 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6725534 - 6725417
Alignment:
Q  646 attatgttacttgttactatttctgttgcctatt-actgtcctacttttatagataaagctatcagtttctcaaaaatatcattgttttcagaaaacatc 744  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6725534 attatgttacttgctagtatttatgttgcctatttactgtccaacttatatgcataaaactatcaatttctcgaaaatatcattgttttcagaagacatc 6725435  T
Q  745 ctcgttcagatatacttc 762  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6725434 ctcgttcaaatatacttc 6725417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 645 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 6852557 - 6852412
Alignment:
Q  645 aattatgttacttgttactatttctgttgcctat-tactgtcctacttttatagataaagctatcagtttctcaaaaatatcattgttttcagaaaacat 743  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  6852557 aattatgttactcgttagtatttctgttgcctatgtactgtcctt-tattatacataaagctatcaatttctcaaaaatatcattgttttcagaa---at 6852462  T
Q  744 cctcgttcagatatacttcgattcattgcatatattttgaaggttcatat 793  Q
    | ||||||||||||||| | ||  ||||  ||| | ||||||||||||||    
T  6852461 cttcgttcagatatactcctatgaattgtgtatctgttgaaggttcatat 6852412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 646 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 6594818 - 6594674
Alignment:
Q  646 attatgttacttgttactatttctgttgcctatt-actgtcctacttttatagataaagctatcagtttctcaaaaatatcattgttttcagaaaacatc 744  Q
    ||||||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||  |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6594818 attatgttactggctagtatttccgttgcctatttactgtccaacttttatgtataaaactatcgatttcttgaaaatatcaatgttttcagaagacatc 6594719  T
Q  745 ctcgttcagatatacttcgattcattgcatatattttgaaggttc 789  Q
    ||||||||||||||| || ||  ||||| | | ||||||||||||    
T  6594718 ctcgttcagatatacatctataaattgcgtctcttttgaaggttc 6594674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 471 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 6595017 - 6594858
Alignment:
Q  471 tgtatggaattggttaattaaaaggtgcatacaaagagtactcatacttgctatctaatattgaatatatatcccatgctgttttctgttcnnnnnnntc 570  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||||   |||| |||||||||||||       |     
T  6595017 tgtatggaattggttaattaaaatatgcatacaaggtctactcatacttgctatctaatatcgagtatattgtccatactgttttctgttcaaaaaaata 6594918  T
Q  571 tatctaatttctgtcaacacattgctgtctacaaaatcatatcagatgtaacagcatgcagttaatgttcaaac 644  Q
    ||||||              ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6594917 tatcta--------------attgctgtcaacaaaatcatatcagatgtaacagcatgcagttaacgttcaaac 6594858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 496 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 6412489 - 6412340
Alignment:
Q  496 tgcatacaaagagtactcatacttgctatctaatattgaatatatatcccatgctgttttctgttcnnnnnnntcta-tctaatttctgtcaacacattg 594  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||         | | |||| ||  ||| || ||||      
T  6412489 tgcatacaaggtgtactcatacttgctatataatattgaatatattgtccatactgttttctgttaaaaataaacaaatctagttgttgtgaagacatga 6412390  T
Q  595 ctgtctacaaaatcatatcagatgtaacagcatgcagttaatgttcaaac 644  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6412389 ctgtctacaaaatcatatcaaatgtaacagcatgcagttaatgttcaaac 6412340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 192
Target Start/End: Original strand, 6255311 - 6255460
Alignment:
Q  46 gattagaaggcttgaaatgact-ggtttgtgaaggaaccttggagttacaatgggaggatagaagcaactaacctattgca--ttgatatagtcgtaaat 142  Q
    |||||||||||||||||||  | || | ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||     |||||||| ||||     
T  6255311 gattagaaggcttgaaatggttggggtagtgaaggcacctttgagttacaacgggagaatcgaagcaacaaatctattgcagcaatatatagtcataaaa 6255410  T
Q  143 acaagtttaacgaaaaaactgattgttttcttgtctgctagagtgataga 192  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  6255411 acaagtttaaagaagaaaatgattgtttgcttgtctgttggagtgataga 6255460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 6852671 - 6852607
Alignment:
Q  581 ctgtcaacacattgctgtctacaaaatcatatcagatgtaacagcatgcagttaatgttcaaaca 645  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  6852671 ctgtcaaaacattgctgtctacaaaaccatatcagaagtaacaatacgcagttaatgttcaaaca 6852607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 6725653 - 6725611
Alignment:
Q  602 caaaatcatatcagatgtaacagcatgcagttaatgttcaaac 644  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6725653 caaaatcatttcagatgtaacagcatgcagttaatgttcaaac 6725611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 648 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 6412285 - 6412201
Alignment:
Q  648 tatgttacttgttactatttctgttgcctatt-actgtcctacttttatagataaagctatcagtttctcaaaaatatcattgtt 731  Q
    |||||||| || || ||| ||||||| ||||| | | ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6412285 tatgttacctgctagtatatctgttgtctatttaatatccaacttttatacatacagctatcaatttctcaaaaatatcattgtt 6412201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 162 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 15479 - 14878
Alignment:
Q  162 tgattgttttcttgtctgctagagtgatagatcactcttttctgtatcggcccggaaattcaggagacgattcttgatatacttgctggaacatgaaagt 261  Q
    ||||||||| ||| | || | |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  15479 tgattgtttacttctttgttggagtgacagaccacttttttctgtatcggcctggaaatttaggtgatgattcttgatatacatgccggaatatgaaagt 15380  T
Q  262 cacaattagaagattttatgtcttcgtttactggattttcaaagtgtttcaaagaagtnnnnnnntataaccttcttgtattgttgttaatgttaatatc 361  Q
    || | ||||||||||  |||| ||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||        ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15379 caaagttagaagattaaatgtttttattttctggattttataagtgtttcaaagaagtaaaacaacatatccttattgtattgttgttaatgttaatatc 15280  T
Q  362 aaatcatttccgttcgatatcttttagctcctacctttgttgaaatttgaaaat---------atgtcactgttcttagtttcataaatatattgcatgt 452  Q
    || | ||||| || | |||  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||         |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||     
T  15279 aatttatttctgtacaataaattttagttcccacctttgttgaaatatgaaaattaatctcaaatgtgagtgctcttagtttcataaatatactgcatgc 15180  T
Q  453 tagttgaagaatacgacgtgtatggaattggttaattaaaaggtgcatacaaagagtactcatacttgctatctaatattgaatatatatcccatgctgt 552  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||   | || ||||    
T  15179 tagttgaagaagatgacatgtatggaattggttaattaaaaggtgcataaaaggagtattcatacttgctatctaatgttaaataaattgtcaatactgt 15080  T
Q  553 tttctgttcnnnnnnntctatctaatttctgtcaacacattgctgtctacaaaatcatatcagatgtaacagcatgcagttaatgttcaaaca-attatg 651  Q
    |||||||||       | ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  | | ||||||||||  |||| ||  ||    
T  15079 tttctgttcaaaaatatatatctaagtcttgtcaaaacattgctgtctacaaaaccatatcagaagtaaaaatacgtagttaatgtt--aacatatattg 14982  T
Q  652 ttacttgttactatttctgttgcctat-tactgtcctacttttatagataaagctatcagtttctcaaaaatatcattgttttcagaaaacatcctcgtt 750  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  14981 tta--tgttagtatttctgttgcctatgtactgtcct-ttattatacataaagctatcaatttctcaaaaatatcattgttttcagaa---atcctcgtt 14888  T
Q  751 cagatatact 760  Q
    ||||||||||    
T  14887 cagatatact 14878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University