View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18168_high_19 (Length: 316)

Name: NF18168_high_19
Description: NF18168
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18168_high_19
NF18168_high_19
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (1-316)||(14892-15207)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-316)||(10684847-10685162)
chr8 (1-316)||(35744579-35744894)
chr8 (1-316)||(18853746-18854061)
chr8 (3-316)||(26300527-26300840)
chr8 (127-316)||(23800226-23800415)
chr8 (4-200)||(6812998-6813194)
chr8 (1-286)||(450767-451056)
chr8 (1-97)||(5591545-5591641)
chr8 (1-151)||(15069350-15069500)
chr8 (1-98)||(4732318-4732415)
chr8 (1-98)||(34255917-34256014)
chr8 (1-151)||(18811491-18811641)
chr8 (1-151)||(27827768-27827918)
chr8 (111-316)||(16756505-16756710)
chr8 (111-303)||(15945389-15945581)
chr8 (111-316)||(28328639-28328844)
chr8 (4-74)||(23800147-23800217)
chr8 (220-316)||(4819484-4819580)
chr8 (111-315)||(33033371-33033575)
chr8 (1-316)||(31577530-31577844)
chr8 (1-316)||(43080385-43080700)
chr8 (1-98)||(17848309-17848406)
chr8 (123-316)||(28891507-28891700)
chr8 (229-316)||(27827996-27828083)
chr8 (229-316)||(15069578-15069665)
chr8 (229-316)||(18811719-18811806)
chr8 (12-98)||(10380512-10380598)
chr8 (111-185)||(21034599-21034673)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (1-316)||(24261906-24262221)
chr7 (1-316)||(16884116-16884431)
chr7 (1-316)||(12405526-12405841)
chr7 (1-316)||(18412847-18413162)
chr7 (1-316)||(49090866-49091181)
chr7 (1-316)||(9185740-9186055)
chr7 (1-316)||(21645214-21645529)
chr7 (5-316)||(21988109-21988420)
chr7 (1-316)||(5817768-5818084)
chr7 (1-98)||(47675548-47675645)
chr7 (1-98)||(48490065-48490162)
chr7 (1-151)||(38394723-38394873)
chr7 (111-316)||(7070526-7070731)
chr7 (1-151)||(36187-36337)
chr7 (1-151)||(7093862-7094012)
chr7 (1-98)||(6570647-6570744)
chr7 (111-316)||(25352083-25352288)
chr7 (11-161)||(6047231-6047381)
chr7 (1-151)||(7351052-7351202)
chr7 (3-97)||(13289954-13290048)
chr7 (111-316)||(3324032-3324237)
chr7 (111-316)||(25406145-25406350)
chr7 (1-151)||(1048690-1048840)
chr7 (4-98)||(26213460-26213554)
chr7 (111-305)||(44015921-44016115)
chr7 (7-151)||(22135546-22135690)
chr7 (7-151)||(40550573-40550717)
chr7 (13-98)||(6593944-6594029)
chr7 (13-98)||(18391582-18391667)
chr7 (1-92)||(4295401-4295492)
chr7 (1-92)||(7471441-7471532)
chr7 (1-151)||(44725312-44725462)
chr7 (1-98)||(24749324-24749421)
chr7 (1-92)||(20298052-20298143)
chr7 (27-151)||(31159103-31159227)
chr7 (229-316)||(1048525-1048612)
chr7 (229-316)||(7093697-7093784)
chr7 (229-316)||(7350887-7350974)
chr7 (229-316)||(22135768-22135855)
chr7 (1-92)||(28486302-28486393)
chr7 (229-316)||(38394949-38395036)
chr7 (229-316)||(40550795-40550882)
chr7 (5-98)||(3890845-3890938)
chr7 (4-45)||(3903937-3903978)
chr7 (1-92)||(21678796-21678887)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-316)||(37557207-37557522)
chr5 (1-316)||(33790504-33790819)
chr5 (4-316)||(31397578-31397890)
chr5 (1-316)||(27449011-27449326)
chr5 (5-316)||(24556172-24556483)
chr5 (5-316)||(24597204-24597515)
chr5 (121-316)||(43596310-43596505)
chr5 (121-316)||(43629104-43629299)
chr5 (1-114)||(43598123-43598236)
chr5 (1-114)||(43603615-43603728)
chr5 (1-114)||(43609107-43609220)
chr5 (1-316)||(34841805-34842120)
chr5 (3-98)||(42427842-42427937)
chr5 (1-98)||(29721035-29721132)
chr5 (3-98)||(534421-534516)
chr5 (4-151)||(6745799-6745946)
chr5 (1-316)||(34478655-34478970)
chr5 (1-151)||(10750426-10750576)
chr5 (1-151)||(18467412-18467562)
chr5 (1-98)||(9788632-9788729)
chr5 (1-98)||(26171427-26171524)
chr5 (1-151)||(15356250-15356400)
chr5 (11-97)||(16408005-16408091)
chr5 (1-151)||(23665774-23665924)
chr5 (111-316)||(28788453-28788658)
chr5 (1-151)||(31543461-31543611)
chr5 (3-161)||(13694489-13694647)
chr5 (111-316)||(25446218-25446423)
chr5 (13-98)||(40380788-40380873)
chr5 (220-316)||(10628199-10628295)
chr5 (1-92)||(658746-658837)
chr5 (43-98)||(16545142-16545197)
chr5 (229-316)||(10750654-10750741)
chr5 (229-316)||(15356085-15356172)
chr5 (229-316)||(23666002-23666089)
chr5 (1-92)||(27911160-27911251)
chr5 (25-91)||(20043736-20043802)
chr5 (210-287)||(31336060-31336136)
chr5 (229-316)||(6746024-6746111)
chr5 (25-92)||(18510874-18510941)
chr5 (1-92)||(25806189-25806280)
chr5 (229-316)||(31543689-31543776)
chr5 (12-50)||(31304065-31304103)
chr5 (116-185)||(31781836-31781905)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-316)||(41397428-41397743)
chr1 (1-316)||(19359421-19359736)
chr1 (1-316)||(47099401-47099716)
chr1 (33-316)||(775765-776048)
chr1 (4-310)||(17346100-17346406)
chr1 (4-241)||(9024411-9024646)
chr1 (1-98)||(28222832-28222929)
chr1 (1-98)||(3157323-3157420)
chr1 (1-316)||(51750765-51751080)
chr1 (1-151)||(27338534-27338684)
chr1 (1-151)||(28841150-28841300)
chr1 (1-98)||(31657864-31657961)
chr1 (1-151)||(28203100-28203250)
chr1 (1-98)||(50168761-50168857)
chr1 (111-305)||(14997766-14997960)
chr1 (1-161)||(3805529-3805689)
chr1 (11-90)||(16456388-16456467)
chr1 (1-151)||(16226896-16227046)
chr1 (1-143)||(20300859-20301001)
chr1 (1-151)||(51758262-51758412)
chr1 (111-316)||(9522456-9522661)
chr1 (1-151)||(8348466-8348616)
chr1 (25-159)||(25250674-25250808)
chr1 (88-316)||(2400469-2400697)
chr1 (1-151)||(47178090-47178240)
chr1 (11-151)||(13127136-13127276)
chr1 (265-316)||(9024646-9024697)
chr1 (229-316)||(20301087-20301174)
chr1 (4-161)||(50078185-50078342)
chr1 (1-92)||(6996312-6996403)
chr1 (229-316)||(16227124-16227211)
chr1 (1-92)||(31736936-31737027)
chr1 (229-316)||(47178318-47178405)
chr1 (229-316)||(27338369-27338456)
chr1 (25-92)||(28997715-28997782)
chr1 (25-92)||(29003431-29003498)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (1-312)||(460-771)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-316)||(9224987-9225302)
chr4 (1-316)||(16624588-16624903)
chr4 (122-316)||(5147090-5147284)
chr4 (152-316)||(18241473-18241636)
chr4 (13-313)||(31480734-31481038)
chr4 (1-95)||(52094776-52094870)
chr4 (12-98)||(4588623-4588709)
chr4 (1-151)||(12402497-12402647)
chr4 (111-316)||(15313049-15313254)
chr4 (1-161)||(10113640-10113800)
chr4 (1-151)||(22134018-22134168)
chr4 (1-98)||(5872475-5872572)
chr4 (1-161)||(3578085-3578245)
chr4 (130-316)||(21549400-21549587)
chr4 (1-151)||(22046116-22046266)
chr4 (1-151)||(22782138-22782288)
chr4 (13-98)||(5136764-5136849)
chr4 (1-98)||(12743339-12743436)
chr4 (1-151)||(11007969-11008119)
chr4 (1-151)||(12395261-12395410)
chr4 (1-151)||(12400223-12400372)
chr4 (1-151)||(16933549-16933699)
chr4 (13-98)||(7123380-7123465)
chr4 (13-98)||(8394090-8394175)
chr4 (1-92)||(36920958-36921049)
chr4 (244-316)||(4559070-4559142)
chr4 (1-92)||(47563537-47563628)
chr4 (7-89)||(5207083-5207165)
chr4 (220-314)||(16633330-16633424)
chr4 (4-92)||(22802197-22802285)
chr4 (25-92)||(14788893-14788960)
chr4 (229-316)||(22781973-22782060)
chr4 (11-98)||(26558379-26558466)
chr4 (1-91)||(9175933-9176023)
chr4 (25-91)||(18536965-18537031)
chr4 (229-316)||(9175708-9175795)
chr4 (229-316)||(16933384-16933471)
chr4 (229-316)||(22133853-22133940)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (1-316)||(32479529-32479844)
chr3 (1-316)||(8516283-8516598)
chr3 (4-316)||(16263552-16263863)
chr3 (1-316)||(3324130-3324446)
chr3 (67-316)||(9602495-9602744)
chr3 (220-316)||(28489976-28490072)
chr3 (1-97)||(22834420-22834516)
chr3 (1-151)||(43226784-43226934)
chr3 (1-98)||(7762931-7763028)
chr3 (3-98)||(32891752-32891847)
chr3 (1-151)||(456614-456764)
chr3 (4-98)||(5259733-5259827)
chr3 (1-151)||(5898116-5898266)
chr3 (111-316)||(22625224-22625429)
chr3 (4-97)||(37407352-37407445)
chr3 (116-316)||(10897741-10897941)
chr3 (1-128)||(7769262-7769389)
chr3 (1-99)||(23409741-23409839)
chr3 (111-316)||(10204936-10205141)
chr3 (1-98)||(23199549-23199646)
chr3 (111-316)||(29913200-29913405)
chr3 (7-151)||(4309911-4310055)
chr3 (4-151)||(18098572-18098719)
chr3 (1-151)||(6065194-6065344)
chr3 (121-315)||(10098041-10098235)
chr3 (1-151)||(10957724-10957874)
chr3 (1-151)||(11168808-11168958)
chr3 (4-98)||(29811532-29811626)
chr3 (111-316)||(6304042-6304247)
chr3 (13-98)||(10209873-10209958)
chr3 (111-316)||(54189241-54189446)
chr3 (63-313)||(24933174-24933421)
chr3 (1-151)||(5192357-5192507)
chr3 (1-98)||(3315389-3315486)
chr3 (13-98)||(4600130-4600215)
chr3 (13-98)||(10056917-10057002)
chr3 (13-98)||(10061361-10061446)
chr3 (13-98)||(10063583-10063668)
chr3 (13-98)||(10065805-10065890)
chr3 (111-316)||(10612022-10612227)
chr3 (1-98)||(23634152-23634249)
chr3 (3-151)||(27421347-27421495)
chr3 (220-316)||(47882133-47882229)
chr3 (6-93)||(9635539-9635626)
chr3 (13-95)||(10059139-10059221)
chr3 (1-90)||(1619936-1620025)
chr3 (122-303)||(16458208-16458389)
chr3 (1-92)||(42991006-42991097)
chr3 (1-98)||(15830652-15830749)
chr3 (227-316)||(5192814-5192903)
chr3 (13-98)||(6717185-6717270)
chr3 (6-98)||(25634589-25634681)
chr3 (1-57)||(43422963-43423019)
chr3 (229-316)||(5192585-5192672)
chr3 (229-316)||(6065029-6065116)
chr3 (1-92)||(53917134-53917225)
chr3 (13-98)||(15822096-15822181)
chr3 (4-92)||(28101468-28101556)
chr3 (229-316)||(456842-456929)
chr3 (229-316)||(4309746-4309833)
chr3 (229-316)||(5898344-5898431)
chr3 (229-316)||(10957559-10957646)
chr3 (229-316)||(18098407-18098494)
chr3 (229-316)||(32891978-32892065)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (1-316)||(19348466-19348781)
chr2 (1-316)||(25402839-25403154)
chr2 (1-316)||(10446023-10446335)
chr2 (1-171)||(23079050-23079220)
chr2 (20-223)||(16387747-16387949)
chr2 (111-316)||(2736936-2737141)
chr2 (1-151)||(21520095-21520245)
chr2 (1-151)||(35217371-35217521)
chr2 (1-151)||(36560542-36560692)
chr2 (111-316)||(20054005-20054210)
chr2 (1-146)||(22405336-22405481)
chr2 (111-316)||(22716478-22716683)
chr2 (111-316)||(39680777-39680982)
chr2 (1-151)||(19503737-19503887)
chr2 (1-99)||(34574611-34574709)
chr2 (244-316)||(17932985-17933057)
chr2 (116-305)||(28456758-28456948)
chr2 (25-98)||(6263608-6263681)
chr2 (229-316)||(36560377-36560464)
chr2 (229-316)||(19503572-19503659)
chr2 (229-316)||(35217206-35217293)
chr2 (11-143)||(28569834-28569966)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (4-316)||(149541-149853)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (1-316)||(14738155-14738470)
chr6 (1-316)||(33331029-33331344)
chr6 (1-286)||(18232079-18232364)
chr6 (1-316)||(9035488-9035801)
chr6 (1-161)||(12157979-12158139)
chr6 (1-146)||(12936655-12936800)
chr6 (1-98)||(5408480-5408577)
chr6 (1-98)||(5412805-5412902)
chr6 (111-316)||(25942400-25942605)
chr6 (111-316)||(13879470-13879675)
chr6 (111-316)||(17694096-17694301)
chr6 (1-151)||(33309617-33309767)
chr6 (130-302)||(24078136-24078308)
chr6 (1-98)||(3395124-3395221)
chr6 (111-316)||(22350216-22350421)
chr6 (13-98)||(34165556-34165641)
chr6 (20-151)||(25462866-25462997)
chr6 (5-151)||(26931964-26932110)
chr6 (13-98)||(16553348-16553433)
chr6 (13-98)||(16629904-16629989)
chr6 (13-98)||(16651608-16651693)
chr6 (4-248)||(28301565-28301813)
chr6 (4-248)||(28510260-28510508)
chr6 (40-146)||(12910979-12911085)
chr6 (1-91)||(26067856-26067946)
chr6 (1-95)||(30444021-30444115)
chr6 (1-98)||(15534056-15534153)
chr6 (256-316)||(24432165-24432225)
chr6 (229-316)||(26067631-26067718)
chr6 (13-300)||(21198280-21198563)
chr6 (220-316)||(5165088-5165184)
chr6 (1-128)||(17012791-17012918)
chr6 (229-316)||(33309845-33309932)
chr6 (4-59)||(24078354-24078409)
chr6 (228-312)||(25462706-25462790)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-316)||(1696-2011)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (1-316)||(18527-18837)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (1-316)||(3775-4092)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (16-316)||(30081-30381)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (16-316)||(42463-42763)
[»] scaffold1991 (1 HSPs)
scaffold1991 (19-178)||(1022-1181)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (111-316)||(17056-17261)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (1-316)||(352-667)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (4-151)||(72918-73065)
scaffold0025 (229-316)||(72753-72840)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-151)||(34278-34428)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (1-151)||(22854-23004)
scaffold0140 (229-316)||(23082-23169)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-95)||(115263-115357)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (1-65)||(37410-37474)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (1-128)||(26314-26441)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (25-92)||(50770-50837)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-92)||(80594-80685)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (229-302)||(26623-26696)
scaffold0219 (5-98)||(26827-26920)


Alignment Details
Target: scaffold0197 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 14892 - 15207
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 14991  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14992 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 15091  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15092 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 15191  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  15192 aaagaattgaccaagt 15207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 10684847 - 10685162
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684847 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 10684946  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10684947 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 10685046  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10685047 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 10685146  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  10685147 aaagaattgaccaagt 10685162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35744894 - 35744579
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35744894 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcta 35744795  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35744794 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 35744695  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744694 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 35744595  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  35744594 aaagaattgaccaagt 35744579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 18853746 - 18854061
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853746 tcgatgtgggctaaattggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 18853845  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853846 aatcgatctcggagcaattggcggaatttaacaagattcttgatgatatggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataagactttgttgttact 18853945  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853946 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcagggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 18854045  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  18854046 aaggaattgaccaagt 18854061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26300840 - 26300527
Alignment:
Q  3 gatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaa 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26300840 gatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacaaaatctttggctcatagacaactcttgaaacaacaactctattcattcaaggtggtggaatctaaa 26300741  T
Q  103 tcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttacttt 202  Q
    || |||| |||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26300740 tcaatcttggagcaattggcggaatttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttacttt 26300641  T
Q  203 gttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26300640 gttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaa 26300541  T
Q  303 agaattgaccaagt 316  Q
     |||||||||||||    
T  26300540 tgaattgaccaagt 26300527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 127 - 316
Target Start/End: Original strand, 23800226 - 23800415
Alignment:
Q  127 tttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagc 226  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23800226 tttaacaaaattctagatgatttggccaacattgaagttaatatggaagataaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagc 23800325  T
Q  227 atttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23800326 atttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcaccactactttggaggaggtccaaacggctttgagaaccaagaaattgaccaagt 23800415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6813194 - 6812998
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6813194 atgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctactcattgaagatggtggagtctaaat 6813095  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    | ||| ||||| || | ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  6813094 caatcacggagcaattgacaaaatttaacaaaattcttgatgacttggccaacattgaagttaatatggaagatgaaaataaggctttgttgttact 6812998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 450767 - 451056
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  450767 tcgatgtcggctaaattggagtcattgtacataacgaaatctttggctcatagataacttttcaaacaacaactctactcatttaaaatggtggagtcca 450866  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgt---- 196  Q
    |||| ||| ||||| || |   ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||  |||||||||| || |||  |   ||||        
T  450867 aatctatcacggagcaattggtggaatttaacaagattcttgatgacttggtgaacatttaagtaaacgtggaagatgaagacaaggttagattgttacg 450966  T
Q  197 tactttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaag 286  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  450967 tactatgttcttcaccgaagtcttttgagcattttaaagataccatcctttacggaaaggaaatcaccactactttggaggaggtccaag 451056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 5591545 - 5591641
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5591545 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 5591641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 15069350 - 15069500
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  15069350 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaa 15069449  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  15069450 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 15069500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 4732318 - 4732415
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4732318 tcgatgtggtcaaagttggagacattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 4732415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 34256014 - 34255917
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34256014 tcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 34255917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 18811491 - 18811641
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  18811491 tcgatgtgggcaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 18811590  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  18811591 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 18811641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 27827768 - 27827918
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  27827768 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaa 27827867  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  27827868 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 27827918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16756710 - 16756505
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     || | ||| | |||    
T  16756710 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctattgtgtgcttta 16756611  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  16756610 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 16756511  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  16756510 ccaagt 16756505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 303
Target Start/End: Original strand, 15945389 - 15945581
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||| || || ||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| |||  ||||    
T  15945389 ggagaaactgacggagttcaataagattattgatgatttggagaacatagatgtgaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgaatta 15945488  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaa 303  Q
    || | ||| |||||| |||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15945489 cctaggtcctttgagaatttcaagaatacaatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagtccaagcggctttgagaaccaaa 15945581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 28328639 - 28328844
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||    ||     || | ||| | |||    
T  28328639 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagtcttacacctattgtgtgcttta 28328738  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  28328739 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 28328838  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  28328839 ccaagt 28328844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 23800147 - 23800217
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaact 74  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23800147 atgtgggctaagttggattcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaact 23800217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4819580 - 4819484
Alignment:
Q  220 tttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  4819580 tttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcggctttaagaaccaaagagttaaccaagt 4819484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 315
Target Start/End: Original strand, 33033371 - 33033575
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  33033371 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgtaaatctggaagatgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 33033470  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||  |||||| ||||||||||||| || |||||||| || || |||||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| || |    
T  33033471 cctaggttatttgagaatttcaaggatacaatgctttatggcaaagaaggcactatcactttggaggaagttcaagcagttttgagaaccaaagagttaa 33033570  T
Q  311 ccaag 315  Q
    |||||    
T  33033571 ccaag 33033575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31577844 - 31577530
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| | ||||| || | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  31577844 tcgatgtggtcaaagttggagtctgtgtatatgacaaagtctttggctcttcggcaattcctaaagcaacaactctact-attcaagatggtggagtcaa 31577746  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
       | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||  || ||||| ||  || | || ||||| ||||| ||| |  | ||  |    
T  31577745 tggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccatgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatgaagataaaactatactcttgtt 31577646  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
     ||| | ||||| |  ||||||||   |||||| ||||| || || ||||| || || ||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  31577645 gtgtgctttaccgagatcttttgaatctttcaaagatactatgctatatggcaaagaaggcactattaccttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 31577546  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || || || |||||||    
T  31577545 aatgagttaaccaagt 31577530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 43080385 - 43080700
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | || |||| |||||| ||||||| |||||  ||||| |    
T  43080385 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaa 43080484  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||  |  | || |||||||||||  || |  | ||  |    
T  43080485 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgtt 43080584  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
     ||| |  |||| || ||||||||    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  43080585 gtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 43080684  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || || ||||||||||    
T  43080685 aaggagttgaccaagt 43080700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 17848309 - 17848406
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| || || || | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  17848309 tcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaatctctttggctcatcggaaattcctaaagcaacaactctactcattgaagatgttggagtc 17848406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 316
Target Start/End: Original strand, 28891507 - 28891700
Alignment:
Q  123 ggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtctttt 222  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| || ||||| || |||||| |||||||  |||||||  | ||     |||| ||| | ||||| | ||| |||    
T  28891507 ggagttcaataagattattgatgatttcgcgaacatagatgttaatctggaagacaaggataaagccttacacctactgtgtgctttacctaggtccttt 28891606  T
Q  223 gagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  28891607 gagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagagcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaagt 28891700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 27827996 - 27828083
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27827996 ttcaaagataccatgctatatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 27828083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 15069578 - 15069665
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15069578 ttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 15069665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 18811719 - 18811806
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18811719 ttcaaagataccatggtctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 18811806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 10380598 - 10380512
Alignment:
Q  12 aaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |  |||||||||||  ||||||||||| | ||| | || ||||||  ||||||||||||    
T  10380598 aaagttggagtcattgtatatgatcaagttgttggctcatagataactcttgaagaatcaaatatactcattcgggatggtggagtc 10380512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 185
Target Start/End: Original strand, 21034599 - 21034673
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataa 185  Q
    |||| |||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  21034599 ggagcaactgacggagttcattaagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataa 21034673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 24261906 - 24262221
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261906 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 24262005  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24262006 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 24262105  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262106 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 24262205  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  24262206 aaagaattgaccaagt 24262221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16884431 - 16884116
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16884431 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtcta 16884332  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16884331 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 16884232  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884231 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 16884132  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  16884131 aaagaattgaccaagt 16884116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12405841 - 12405526
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12405841 tcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 12405742  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12405741 aatcaatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 12405642  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12405641 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcatttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 12405542  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12405541 aaaaaattgaccaagt 12405526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18413162 - 18412847
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413162 tcgatgtgagctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 18413063  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
     ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18413062 tatcaatctcggagcaattgacggaatttaacaagattcttgttgatttggccaacattgaagttaacacggaagatgaggataaggctttgttgttact 18412963  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18412962 ttgttcactaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 18412863  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  18412862 aaggaattgaccaagt 18412847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49091181 - 49090866
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49091181 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaattctattcattcaagatggtggagtcta 49091082  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| ||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49091081 aatcaatctcggagcaattgatggaatttaacaaaattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 49090982  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49090981 ttgttaattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcaccactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaac 49090882  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  49090881 aaggaattgaccaagt 49090866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 9185740 - 9186055
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185740 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacgtgatgaaatctttggctcataggcagctctcgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 9185839  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| |||||| || || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9185840 aatcaatctcgaagcaattggcggaatttaacaagattcttgatgatttggccaacattgatgttaatatggaagatgaggataaggctttgttgttact 9185939  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9185940 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggatatcatcctttatggtaaggagggcactactactttggagaaggtccaagcggctttgagaacc 9186039  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  9186040 aaggaattgaccaagt 9186055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21645529 - 21645214
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21645529 tcgatgtgggctaagttggagttattgtacatgacgaaatctttagctcataagcaactcttgaaacaacaactttattcattcaagatggtggagtcta 21645430  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| |||||||||  | | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21645429 aatcaatctcggagctattgacggaatttagcaagattcttgatgatttggtcaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 21645330  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645329 ttgttcattaccaaagtcttttgagcattttaaggataccatcatttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 21645230  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  21645229 aaggaattgaccaagt 21645214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21988420 - 21988109
Alignment:
Q  5 tgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatc 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21988420 tgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggatcataggcaactcttgaaacaacaactctactcattcaagatggtggagtctaaatc 21988321  T
Q  105 gatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgt 204  Q
     |||| |||| || |  || | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21988320 aatcttggagcaattggcgaaatttaacaaaattcttgataatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataaggctttgttgttactttgt 21988221  T
Q  205 tcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21988220 tcattaccaaagtcttttgagcatttcacggataccatcctttatggtaaagagggcactactactttgaaggaagtccaagcggctttgagaaccaagg 21988121  T
Q  305 aattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||    
T  21988120 aattgaccaagt 21988109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 5817768 - 5818084
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5817768 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtatatgacaaaatcgttgactcataggaaactcttgaaacaacaactctactcattcaagatggtggagtcta 5817867  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| ||||| ||| || | | ||| ||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5817868 aatcaatctcagagcaattgatggaatttaataaaattcttgatgatttaaccgacattgaagttaatatggaagatgaggataaggctttgttgctact 5817967  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatgg-taaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaac 299  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5817968 ttgttcattgccaatgtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggaaaaggagggcaccactactttggaggaggtacaagcggctttgagaac 5818067  T
Q  300 caaagaattgaccaagt 316  Q
    ||| |||||||||||||    
T  5818068 caaggaattgaccaagt 5818084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 47675645 - 47675548
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47675645 tcgatgtggtcaaagtttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaatcattcaagatggtggagtc 47675548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 48490065 - 48490162
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48490065 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatattacaaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 48490162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 38394723 - 38394873
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  38394723 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaa 38394822  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  38394823 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 38394873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 7070526 - 7070731
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  7070526 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 7070625  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  7070626 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcggctttgagaaccaaagagttaa 7070725  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  7070726 ccaagt 7070731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 36187 - 36337
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  36187 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttagctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaa 36286  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  36287 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 36337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7094012 - 7093862
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  7094012 tcgatgtgggcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 7093913  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  7093912 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 7093862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 6570647 - 6570744
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6570647 tcgatgtggtcaaagttgcagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctcctcattcaagattgtggagtc 6570744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 25352083 - 25352288
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  25352083 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 25352182  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  25352183 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 25352282  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  25352283 ccaagt 25352288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 6047231 - 6047381
Alignment:
Q  11 caaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctc 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||      
T  6047231 caaatttggagtcgttgtatatgaacaaatctttggctcatacgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagtccatcat 6047330  T
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 161  Q
      || ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  ||||||||    
T  6047331 tcagtaacttacggagttaaacaatatccttgatgacttggagaacattga 6047381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7351202 - 7351052
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  7351202 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaa 7351103  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |    |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  7351102 aggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 7351052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13290048 - 13289954
Alignment:
Q  3 gatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13290048 gatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagt 13289954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3324237 - 3324032
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     || | ||| | |||    
T  3324237 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctattgtgtgcttta 3324138  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  3324137 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 3324038  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  3324037 ccaagt 3324032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 25406145 - 25406350
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     || | ||| | |||    
T  25406145 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctattgtgtgcttta 25406244  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  25406245 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 25406344  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  25406345 ccaagt 25406350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 1048840 - 1048690
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  1048840 tcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggcgcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 1048741  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  1048740 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 1048690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 26213460 - 26213554
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26213460 atgtggtcaaatttggagtcattgtataggaccaaatctttggctcatttgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 26213554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44016115 - 44015921
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  44016115 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 44016016  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaaga 305  Q
    || ||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  44016015 cctaagttctttgagaatttcaaggatattatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaaga 44015921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 22135546 - 22135690
Alignment:
Q  7 tgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||  | |    
T  22135546 tgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggcca 22135645  T
Q  107 tctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    ||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  22135646 tcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 22135690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 40550573 - 40550717
Alignment:
Q  7 tgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||  | |    
T  40550573 tgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggcca 40550672  T
Q  107 tctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    ||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  40550673 tcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 40550717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 6594029 - 6593944
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6594029 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 6593944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18391667 - 18391582
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18391667 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 18391582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4295492 - 4295401
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4295492 tcgatgtgggaaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 4295401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7471532 - 7471441
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7471532 tcgatgtggtcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 7471441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 44725312 - 44725462
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| |    
T  44725312 tcgatttgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagtaacaactctacttattcaggatggtggagtcaa 44725411  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||   ||| |||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  44725412 aggccatcatagagcaacttatggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 44725462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24749324 - 24749421
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24749324 tcgatgtgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaataactctactcattcaggatggtggagtc 24749421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 20298052 - 20298143
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20298052 tcgatgtgggcaaagtcggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 20298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31159227 - 31159103
Alignment:
Q  27 gtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggagaaacttacggag 126  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||  | |||  |||| |||||||||||    
T  31159227 gtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggag 31159128  T
Q  127 tttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    || ||||| || || ||||| ||||    
T  31159127 ttcaacaaaatcctagatgacttgg 31159103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1048612 - 1048525
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1048612 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 1048525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7093784 - 7093697
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7093784 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 7093697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7350974 - 7350887
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7350974 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 7350887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 22135768 - 22135855
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22135768 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 22135855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 28486302 - 28486393
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| || || || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28486302 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 28486393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 38394949 - 38395036
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38394949 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 38395036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 40550795 - 40550882
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40550795 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 40550882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3890938 - 3890845
Alignment:
Q  5 tgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| || | || | | ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  3890938 tgtgggcaaagttgaagttattgtatatgaccaagcctttgactcataggcaattcctaaaaccaaaactctattcattaaatatgggggagtc 3890845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 3903978 - 3903937
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttg 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3903978 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttg 3903937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 21678796 - 21678887
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||| | || || |||||||||||| ||||  || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21678796 tcgatgtggtcaaagttcgaatctttgtattttacaaagtctttggctcatcggcagttcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 21678887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 37557207 - 37557522
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37557207 tcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 37557306  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37557307 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 37557406  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37557407 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 37557506  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  37557507 aaagaattgaccaagt 37557522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33790819 - 33790504
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33790819 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcta 33790720  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33790719 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 33790620  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33790619 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 33790520  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  33790519 aaagaattgaccaagt 33790504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 316
Target Start/End: Original strand, 31397578 - 31397890
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31397578 atgtgggaaaagttggagtcattctatatgacaaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtctaaat 31397677  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttg 203  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31397678 cgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttactttg 31397777  T
Q  204 ttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaa 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397778 ttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaa 31397877  T
Q  304 gaattgaccaagt 316  Q
    |||||||||||||    
T  31397878 gaattgaccaagt 31397890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27449326 - 27449011
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449326 tcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacaaaatctttagctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 27449227  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27449226 aatcaatctcggagcaattgacggagtttaacaagattcttgatgatttgaccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 27449127  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449126 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggaggacactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 27449027  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  27449026 aaggaattgaccaagt 27449011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 24556172 - 24556483
Alignment:
Q  5 tgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatc 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24556172 tgtgggctaagttggagtcattgtacatgactaaatcgttggctcatagacaactcttgaaataacaactctattcattcaagatggtggggtctaaatc 24556271  T
Q  105 gatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgt 204  Q
     ||||||||| || | ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24556272 aatctcggagcaattgacgaaatttaacgaaattcttgatgatttggccaacattgaagtttatatggaagacgaggataaggctttattgttactttgt 24556371  T
Q  205 tcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  24556372 tcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcaccactactttggaggaagtccaatcggctttgagaaccaaat 24556471  T
Q  305 aattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||    
T  24556472 aattgaccaagt 24556483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 24597204 - 24597515
Alignment:
Q  5 tgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatc 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24597204 tgtgggctaagttggagtcattgtacatgactaaatcgttggctcatagacaactcttgaaataacaactctattcattcaagatggtggggtctaaatc 24597303  T
Q  105 gatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgt 204  Q
     ||||||||| || | ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24597304 aatctcggagcaattgacgaaatttaacgaaattcttgatgatttggccaacattgaagtttatatggaagacgaggataaggctttattgttactttgt 24597403  T
Q  205 tcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  24597404 tcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcaccactactttggaggaagtccaatcggctttgagaaccaaat 24597503  T
Q  305 aattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||    
T  24597504 aattgaccaagt 24597515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 121 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43596505 - 43596310
Alignment:
Q  121 acggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43596505 acggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttactttgttcattaccaaagtcct 43596406  T
Q  221 ttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43596405 ttgagcatttcaagaataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 43596310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 121 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43629299 - 43629104
Alignment:
Q  121 acggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43629299 acggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttactttgttcattaccaaagtcct 43629200  T
Q  221 ttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43629199 ttgagcatttcaagaataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 43629104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43598236 - 43598123
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598236 tcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 43598137  T
Q  101 aatcgatctcggag 114  Q
    |||| |||||||||    
T  43598136 aatcaatctcggag 43598123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43603728 - 43603615
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43603728 tcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 43603629  T
Q  101 aatcgatctcggag 114  Q
    |||| |||||||||    
T  43603628 aatcaatctcggag 43603615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43609220 - 43609107
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609220 tcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 43609121  T
Q  101 aatcgatctcggag 114  Q
    |||| |||||||||    
T  43609120 aatcaatctcggag 43609107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34842120 - 34841805
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34842120 tcgatgtgggctaagttggagccattgtacatgacaaaatctttagctcgtagacaatttttgaaataacaactctactcattcaagatggtggagtcta 34842021  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    || | |||  |||| || | | ||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||| | || |||  ||||||||||||    
T  34842020 aacctatcatggagcaattgatggaatctaacatgattcttgatgacttggcaaacattgaaatgaatatcgaagataaagacaaggttttgttgttact 34841921  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
     ||||| ||||  |||||||||||||| || || |||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||||| || || ||| || ||| ||||||||||    
T  34841920 atgttccttactgaagtcttttgagcactttaaagatatcatcctttatagaaaggaagacaccactacttttgaagatgtctaaacggatttgagaacc 34841821  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || || || |||||||    
T  34841820 aaggagttaaccaagt 34841805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 42427937 - 42427842
Alignment:
Q  3 gatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42427937 gatgtggtcaaagttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 42427842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 29721035 - 29721132
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29721035 tcgatgtggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 29721132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Original strand, 534421 - 534516
Alignment:
Q  3 gatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  534421 gatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttggttgataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 534516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 6745799 - 6745946
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||      
T  6745799 atgtgggcaaagttgtaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagg 6745898  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  6745899 ccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 6745946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34478970 - 34478655
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  34478970 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 34478871  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||| ||  |  | || |||||||||||  || |  | ||  |    
T  34478870 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggaaaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgtt 34478771  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
     ||| |  ||||||| ||||||||    ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  34478770 gtgtgctctaccaaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcattgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 34478671  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || || ||||||||||    
T  34478670 aaggagttgaccaagt 34478655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 10750426 - 10750576
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  10750426 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 10750525  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  10750526 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 10750576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 18467412 - 18467562
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  18467412 tcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaa 18467511  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| || |||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  18467512 agaccatcatggagcaatttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 18467562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 9788729 - 9788632
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9788729 tcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 9788632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 26171427 - 26171524
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26171427 tcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 26171524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15356400 - 15356250
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  15356400 tcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 15356301  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  15356300 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 15356250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 16408005 - 16408091
Alignment:
Q  11 caaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 97  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16408005 caaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagt 16408091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 23665774 - 23665924
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  23665774 tcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 23665873  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  23665874 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 23665924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 28788453 - 28788658
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  28788453 ggagcaactgacggagtttaataagatttttgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 28788552  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||  ||||||||||||  || |||||||| || || | |||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28788553 cctaggtcctttgaaaatttcaaggatattatgctttatggcaaagaagacactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttga 28788652  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  28788653 ccaagt 28788658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 31543461 - 31543611
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |    
T  31543461 tcgatgtgggcaaagttagaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaa 31543560  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  31543561 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 31543611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13694647 - 13694489
Alignment:
Q  3 gatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaa 102  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  | ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||     
T  13694647 gatgtggtcaaatttggagtcgttgtatatgaccaaatctttggctcatatgcaattcctatatcaacaactctacttatttaagatggtggagtcaaat 13694548  T
Q  103 tcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 161  Q
       |||  |||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||  ||||||||    
T  13694547 gtcatcatggagcaactaacggagttcaacaaaatccttgatgagttggaaaacattga 13694489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 25446218 - 25446423
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  25446218 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctagaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 25446317  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| | || |    
T  25446318 cccaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaaacagctttaagaaccaaaaagttaa 25446417  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  25446418 ccaagt 25446423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 40380788 - 40380873
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40380788 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 40380873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 316
Target Start/End: Original strand, 10628199 - 10628295
Alignment:
Q  220 tttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  10628199 tttgagaatttcaaggatacaatcctttatggcaaagaggacactatcactttggaggaagttcaagcaactttgagaaccaaagagttaaccaagt 10628295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 658746 - 658837
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  658746 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 658837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 98
Target Start/End: Original strand, 16545142 - 16545197
Alignment:
Q  43 ttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16545142 ttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 16545197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 10750654 - 10750741
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10750654 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 10750741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15356172 - 15356085
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15356172 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 15356085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 23666002 - 23666089
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23666002 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 23666089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 27911160 - 27911251
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| || || || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27911160 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 27911251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 20043736 - 20043802
Alignment:
Q  25 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 91  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  20043736 ttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatgg 20043802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31336136 - 31336060
Alignment:
Q  210 accaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagc 287  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  31336136 accaaagtgttttgagaattttaaggataccatcctttatgg-atagaaggaaccactactttggaggaagtccaagc 31336060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 6746024 - 6746111
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6746024 ttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 6746111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18510941 - 18510874
Alignment:
Q  25 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||||| || ||||||||| || ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18510941 ttgtatatgacaaagtctttggcttatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 18510874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 25806189 - 25806280
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || |  |||||||| || || |||||||||||| || || || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25806189 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatattacaaagtctttggctcattggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 25806280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 31543689 - 31543776
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  31543689 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcagctttgagaaccaaggagttgaccaagt 31543776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 31304103 - 31304065
Alignment:
Q  12 aaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctca 50  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31304103 aaagtcggagtcattgtacatgacgaaatctttggctca 31304065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31781905 - 31781836
Alignment:
Q  116 aacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataa 185  Q
    |||| ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  31781905 aactgacggaattcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgtaaatatggaagacgaggataa 31781836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41397743 - 41397428
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41397743 tcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgatggagtcta 41397644  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41397643 aatcgatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 41397544  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41397543 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 41397444  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  41397443 aaagaattgaccaagt 41397428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 19359421 - 19359736
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19359421 tcgatgtgggctaagttgaagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaaggtggtggaatcta 19359520  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| |||| |||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19359521 aatcaatcttggagcaattggcggaatttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 19359620  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19359621 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggagttccaagcggctttgagaacc 19359720  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  19359721 aaggaattgaccaagt 19359736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 47099401 - 47099716
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47099401 tcgatgtgggctaagttggagtcattttacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcgtgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 47099500  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| |||||| || || |   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47099501 aatcaatctcgaagcaattggtggaatttaacaaaattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataaggctttgttgttact 47099600  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47099601 ttattcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcatttatggtaaggagggaaccactactctggaggaggtccaagcgactttgagaacc 47099700  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || ||||| |||||||    
T  47099701 aaggaattaaccaagt 47099716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 33 - 316
Target Start/End: Original strand, 775765 - 776048
Alignment:
Q  33 gacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggagaaacttacggagtttaac 132  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |  |||| ||||||    
T  775765 gacgaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatgctggagtctaaatcaatctcggagcaattggcggaatttaac 775864  T
Q  133 aagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagcatttca 232  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  775865 aaaattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataaggctttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagcatttca 775964  T
Q  233 aggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  775965 aggataccatcctttatggtaaggagggcaccactactttggaggagatccaatcggctttgagaaccaagaagttgaccaagt 776048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 17346100 - 17346406
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17346100 atgtgggctaaattggagtcattgtacatgacgaaatcgttggttgataggcaactcttgaaacaacaactctactcattcaagatggtagagtctaaat 17346199  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttg 203  Q
    | |||  |||| || | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||  ||||||| |||| ||    
T  17346200 caatcatggagcaattgatggaatttaacaaaattcttgatgatttggccaacattgcagttaatatggaatataaggttaaggatttgttgctactatg 17346299  T
Q  204 ttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaa 303  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17346300 ttcatttccaaagtcttttgagaatttcaaggataccatcctttatggaaaggagcgcaccattactttggaggaggtccaagcgactttgagaaccaat 17346399  T
Q  304 gaattga 310  Q
    |||||||    
T  17346400 gaattga 17346406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 9024411 - 9024646
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9024411 atgtgggctaagatggagttattgtacatgacgaaatcattggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcagtcaagatggtggagtctaaat 9024510  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttg 203  Q
    | ||| ||||| |  | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  9024511 caatcacggagcat-tgacgaaatttaacaaaattcttgatgatttggccaacattgaagttcatatggaagatgaggataagacttt-tttctactttg 9024608  T
Q  204 ttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggatacca 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9024609 ttcatttccaaagtcttttgagcatttcaaggatacca 9024646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 28222929 - 28222832
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28222929 tcgatgtggtcaaagttggtgtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 28222832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 3157323 - 3157420
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3157323 tcgatgtggtcaaagttggagtcattctatatgaccaagtctttggctcatagacaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 3157420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 51750765 - 51751080
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  51750765 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 51750864  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||| ||  |  | || |||||||||||  || |  | ||  |    
T  51750865 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatgaggataaagctatactcttgtt 51750964  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
     ||| |  |||| || ||||||||    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  51750965 gtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 51751064  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || || ||||||||||    
T  51751065 aaggagttgaccaagt 51751080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27338684 - 27338534
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  27338684 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttgactcattggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaa 27338585  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  27338584 agaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 27338534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 28841150 - 28841300
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  28841150 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 28841249  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  28841250 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 28841300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 31657864 - 31657961
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31657864 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggcttataggaaattccttaagcaacaactttactcattcaagatggtggagtc 31657961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28203250 - 28203100
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||| ||||| | ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28203250 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtataagacaaagtctttgactcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 28203151  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    || | |||  |||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  28203150 aagccatcatggagcaactgacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 28203100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 50168857 - 50168761
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168857 tcgatatggtcaaagttggagtc-ttgtatatgaccaagtttttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 50168761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 305
Target Start/End: Original strand, 14997766 - 14997960
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| |||||  | ||     || | ||| | |||    
T  14997766 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgtaaatctggaagatgaagataaagccttacacctattgtgtgcttta 14997865  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaaga 305  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14997866 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagtctaagcggctttgagaaccaaaga 14997960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3805689 - 3805529
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |    
T  3805689 tcgatgtggtcaacgttagagttgttgtttatgaccaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactgtaatcattcaagatggcagagtcaa 3805590  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 161  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  3805589 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaattcttgatgacttggagaacattga 3805529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 16456388 - 16456467
Alignment:
Q  11 caaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatg 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16456388 caaagttggagtcattgtatatgaccaagactttggctcataggcaaatcctaaagcaacaactctactcattcaagatg 16456467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 16226896 - 16227046
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||| |    
T  16226896 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagagtcaa 16226995  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  16226996 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 16227046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 20300859 - 20301001
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  20300859 tcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgtcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 20300958  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttga 143  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20300959 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttga 20301001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 51758262 - 51758412
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || |||||||||||| | ||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  51758262 tcgatgtgggcaaaattggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 51758361  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  51758362 aggccatcatggagtaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 51758412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 9522456 - 9522661
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| ||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  9522456 ggagcaactgacgaagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 9522555  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||  |||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  9522556 cctaggtcttttgagaatttcaaggatattatgctttatggcaaaaagggcactatcactttggaggaagtgcaagcagctttaagaaccaaagagttaa 9522655  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  9522656 ccaagt 9522661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8348616 - 8348466
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||  ||| | ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8348616 tcgatgtggtcaaagttagagtctttgtatatgacaaagtctttgggacatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 8348517  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  | || ||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  8348516 aggccatcatgtagcaacttacggagttcaacaaaatctttgatgacttgg 8348466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25250808 - 25250674
Alignment:
Q  25 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggagaaacttacgg 124  Q
    ||||||||| | || |||||||||| | || || || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  | |||  ||||||||||||||    
T  25250808 ttgtatatggcaaagtctttggctcttcggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttacgg 25250709  T
Q  125 agtttaacaagattcttgatgatttggccaacatt 159  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  25250708 agttcaacaaaatcattgatgatttggacaacatt 25250674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2400697 - 2400469
Alignment:
Q  88 atggtggagtctaaatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataaga 187  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |||| |||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| || |||||      
T  2400697 atggtggagtcaaaatctataatggagcaactgacagagttcaataaaattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgacgataaag 2400598  T
Q  188 ctttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagc 287  Q
    | ||     |||| ||| | ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || || |||||||  ||||||||||| || |||||    
T  2400597 ccttacacctactgtgtgctttacctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagatggcactatcactttggaggaagttcaagc 2400498  T
Q  288 ggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
     ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  2400497 agctttgaaaaccaaagagttaaccaagt 2400469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 47178090 - 47178240
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| ||||| || | || |||| |||||| ||||||| |||||  ||||| |    
T  47178090 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtcattggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaa 47178189  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  47178190 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 47178240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13127276 - 13127136
Alignment:
Q  11 caaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaa-atcgatct 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||| || |||||||| |||| |||||| || ||| |||     
T  13127276 caaagttggagtctttgtatatgacaaattctttggctcatcgacaattcttaaagaaacaactatactcattcaatatggcggagtcaaagatc-atca 13127178  T
Q  110 cggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
     | || |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  13127177 tgtagcaacttatggagtttaacaaaatccttgatgacttgg 13127136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 9024646 - 9024697
Alignment:
Q  265 actactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9024646 actactttggatgaggtctaagcgactttgagaaccaaagaattgaccaagt 9024697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 20301087 - 20301174
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20301087 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 20301174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 50078342 - 50078185
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    |||||| ||||||| || |  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||  | ||||| ||      
T  50078342 atgtggtcaaagtttgaatatttgtatatgacaaaatcttgggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagattatagagtcaaagg 50078243  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 161  Q
    | |||  |||| ||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||  ||||||||    
T  50078242 ccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattga 50078185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 6996312 - 6996403
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6996312 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggt 6996403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 16227124 - 16227211
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16227124 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 16227211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 31737027 - 31736936
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| || || || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31737027 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 31736936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 47178318 - 47178405
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47178318 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttacattggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 47178405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27338456 - 27338369
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27338456 ttcaaagataccatgctctatgggaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 27338369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 28997782 - 28997715
Alignment:
Q  25 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  28997782 ttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggt 28997715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29003498 - 29003431
Alignment:
Q  25 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  29003498 ttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggt 29003431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 460 - 771
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  460 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactttattcattcaagatggtggagtcta 559  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  560 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 659  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  660 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 759  T
Q  301 aaagaattgacc 312  Q
    ||||||||||||    
T  760 aaagaattgacc 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 9224987 - 9225302
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224987 tcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 9225086  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9225087 aatcaatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 9225186  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9225187 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 9225286  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  9225287 aaggaattgaccaagt 9225302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 16624588 - 16624903
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624588 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 16624687  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| |||||| || || |  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16624688 aatcaatctcgaagcaattggcggaatttaataaaattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataatgctttgttgttact 16624787  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16624788 ttgttcattaccaaagtctttcgagcatttcaaggataccatcctttatgataaggagggaaccactactttggaggaggtctaagcggctttgagagcc 16624887  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  16624888 aaggaattgaccaagt 16624903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5147284 - 5147090
Alignment:
Q  122 cggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttt 221  Q
    |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147284 cggaatttaacaaattttttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataaggctttgttgttactttgttcattaccaaagtcttt 5147185  T
Q  222 tgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5147184 tgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaagtccaagcggctttgagaaccaaacaattgaccaagt 5147090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Original strand, 18241473 - 18241636
Alignment:
Q  152 ccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatgg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18241473 ccaacattgaagttaatatggaagatgaggataaggctttgttgttactttgttcattaccaaattcttttgagcatttcaaggataccat-ctttatgg 18241571  T
Q  252 taaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||||    
T  18241572 taaggagggcaccactactttggaggaggtccaagtggctttgagaatgaaggaattgactaagt 18241636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31481038 - 31480734
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcgg 112  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||   |||||||||||||||| | ||| | |    
T  31481038 aagtttgagtcattatacatgacaaaatatttggctcataggcatctcttgaaacaacaattctactcattttggatggtggagtctaaacctatcacag 31480939  T
Q  113 agaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgt----tcat 208  Q
    |  || | | ||| || |||||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||| | |    || |    
T  31480938 atcaattcatggaattcaacaagatacttgatgacttgacaaacattgaggtgaatatggaatatgaagacaaggctttgttattactatatatattctt 31480839  T
Q  209 taccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaatt 308  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  31480838 taccaaaatcttttaagcattttaaggatgccatcctttatggtaaggagggcaccactactttggaggaagtccaaacggctttgagaaccaaggaaat 31480739  T
Q  309 gacca 313  Q
    |||||    
T  31480738 gacca 31480734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52094870 - 52094776
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgga 95  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52094870 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtgga 52094776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Original strand, 4588623 - 4588709
Alignment:
Q  12 aaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4588623 aaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaattctactcattcaagatggtggagtc 4588709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12402647 - 12402497
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  12402647 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcga 12402548  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  12402547 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttgg 12402497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 15313049 - 15313254
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  15313049 ggagcaacttacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 15313148  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  15313149 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcaactttgataaccaaagagttga 15313248  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  15313249 ccaagt 15313254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 10113640 - 10113800
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  10113640 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgactaagtctttggctcacaggcaattcctaaatcaacaactctactcattcaagacggtggagtcaa 10113739  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 161  Q
    |  | |||  ||||  ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  10113740 aggccatcatggagcgactaacagagttcaacaaaatccttgatgatttggaaaacattga 10113800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22134168 - 22134018
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  22134168 tcgatgtgggcaaagttggaatctttttatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 22134069  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  22134068 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 22134018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 5872475 - 5872572
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5872475 tcgatgtggtcaaagttggagtcgttgcatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcattcaagatggtggagtc 5872572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3578245 - 3578085
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  3578245 tcgatgtggtcaaagttggagtctttatatatgacaaagtctttggatcatcgccaacttttaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagacaa 3578146  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 161  Q
    | || |||  |||| ||||||| ||||| || || |||| |||| ||||||  ||||||||    
T  3578145 agtccatcatggagcaacttacagagttcaaaaatattcctgattatttggagaacattga 3578085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 316
Target Start/End: Original strand, 21549400 - 21549587
Alignment:
Q  130 aacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatg-aggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||  ||||||| ||  | ||||| || || ||||||||| | |||    
T  21549400 aacaagattcttgatgatttggcaaacattgaagtgaatgtggatgatggaggacaatgctttgttattgttatgttctttgccgaagtcttttaaccat 21549499  T
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    || || |||| |||||||||||| || ||  | || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || || |||||||    
T  21549500 tttaacgatatcatcctttatggaaatgaatgtaccactactttggaggaggttcaagcacctttgagaaccaaggagttaaccaagt 21549587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22046266 - 22046116
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  22046266 tcgatgtgggcaaatttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaa 22046167  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  22046166 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 22046116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22782288 - 22782138
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  22782288 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 22782189  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  22782188 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 22782138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 5136764 - 5136849
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5136764 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 5136849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12743436 - 12743339
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12743436 tcgatgtggtcaaagttgaaatcattgtatatgaccaagtctttggcttataggcaattccttaagaaacaactatactcattcaagatggtggagtc 12743339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11008119 - 11007969
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||| |||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  11008119 tcgatgtgggaaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgaatctactcattcaggatggtagagtcaa 11008020  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  11008019 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 11007969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12395410 - 12395261
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||  || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |    
T  12395410 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcga 12395312  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  12395311 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttgg 12395261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12400372 - 12400223
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||  || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |    
T  12400372 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcga 12400274  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  12400273 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttgg 12400223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16933699 - 16933549
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | || |||| |||||| ||||||| |||||  ||||| |    
T  16933699 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaa 16933600  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  16933599 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 16933549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 7123380 - 7123465
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7123380 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 7123465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 8394090 - 8394175
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8394090 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcctcaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 8394175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 36921049 - 36920958
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36921049 tcgatgtggtcaaagtttgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcttaaagcaacaactttactcattcaagatggt 36920958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 316
Target Start/End: Original strand, 4559070 - 4559142
Alignment:
Q  244 ctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4559070 ctttatggaaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcggctttgagaaccaaagagttaaccaagt 4559142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 47563537 - 47563628
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| | ||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47563537 tcgatgtgggaaaagttggaatctttgtatatgacaaagtcgttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 47563628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5207165 - 5207083
Alignment:
Q  7 tgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagat 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| || | || |||||| |||| ||||| |||||    
T  5207165 tgggcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatagacaaatcctaaatcaacaaatctactcatttaagat 5207083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 314
Target Start/End: Original strand, 16633330 - 16633424
Alignment:
Q  220 tttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaa 314  Q
    |||||| |||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  16633330 tttgagaatttcaagaatacaatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagtctaagcaactttgagaaccaaagagttaaccaa 16633424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22802285 - 22802197
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    |||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22802285 atgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 22802197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14788960 - 14788893
Alignment:
Q  25 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14788960 ttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 14788893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22782060 - 22781973
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22782060 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 22781973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 26558379 - 26558466
Alignment:
Q  11 caaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||| |||| |    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26558379 caaagttggagtcgttgtatatgaccatatccttggcttatatgcaatttcgaaagcatcaactctactcattcaagatggtggagtc 26558466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 9176023 - 9175933
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 91  Q
    |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  9176023 tcgatgtgggaaaagtgggaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatgg 9175933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18537031 - 18536965
Alignment:
Q  25 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 91  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  18537031 ttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatgg 18536965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9175795 - 9175708
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  9175795 ttcaaagataccatgctcaatggcaaggaaggcactgctaccttggaagaagttcaagcggctttgagaatcaaggagttgaccaagt 9175708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16933471 - 16933384
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16933471 ttcaaagatatcatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 16933384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22133940 - 22133853
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22133940 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaagcagttgaccaagt 22133853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32479844 - 32479529
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32479844 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtcta 32479745  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32479744 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 32479645  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32479644 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 32479545  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  32479544 aaagaattgaccaagt 32479529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8516598 - 8516283
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8516598 tcgatgtgggcaaagttagagtcattatatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtcta 8516499  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8516498 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 8516399  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8516398 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 8516299  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  8516298 aaagaattgaccaagt 8516283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16263863 - 16263552
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16263863 atgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttgg-tcataggcagctcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 16263765  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttg 203  Q
    | ||||||||| || |  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16263764 caatctcggagcaattggcggaatttaataaaattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataaggctttgttgttactttg 16263665  T
Q  204 ttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaa 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16263664 ttcattatcaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagagcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaag 16263565  T
Q  304 gaattgaccaagt 316  Q
    |||||||||||||    
T  16263564 gaattgaccaagt 16263552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 3324130 - 3324446
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaa-tctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtct 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3324130 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacaagacgaaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtct 3324229  T
Q  100 aaatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttac 199  Q
    ||||| ||||||||| || |  |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3324230 aaatcaatctcggagcaattggcggaatttaacaaaattcttgataatttggccaaaattgaagttaatatggaagatgaggataaggctttgttgttac 3324329  T
Q  200 tttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaac 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3324330 tttgttcattaccaaagtattttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggaaggcaccactactttggaggaggtccaagaggcgttgagaac 3324429  T
Q  300 caaagaattgaccaagt 316  Q
    ||| |||||||||||||    
T  3324430 caaggaattgaccaagt 3324446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Original strand, 9602495 - 9602744
Alignment:
Q  67 caacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagtta 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9602495 caacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcaatctcggagaaatgggcggaatttaaaaaaattcttgatgatttggccaacattgaagtca 9602594  T
Q  167 atatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactac 266  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9602595 atgtggaagatgaggataaggctttgttgttactttgtttattaccaaagtcttttaagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcaccac 9602694  T
Q  267 tactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9602695 tactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 9602744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 316
Target Start/End: Original strand, 28489976 - 28490072
Alignment:
Q  220 tttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28489976 tttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaggaattgaccaagt 28490072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22834516 - 22834420
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22834516 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 22834420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 43226784 - 43226934
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43226784 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 43226883  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| |||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||    
T  43226884 agaccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttgg 43226934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 7762931 - 7763028
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7762931 tcgatgtggtcaaagttggagtcattatatatgaccaagtctttggctcataagcaattctttaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtc 7763028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Original strand, 32891752 - 32891847
Alignment:
Q  3 gatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  32891752 gatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcatttaaggtggtggagtc 32891847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 456614 - 456764
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  456614 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaa 456713  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  456714 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 456764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5259827 - 5259733
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5259827 atgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 5259733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 5898116 - 5898266
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  5898116 tcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcttaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagtcga 5898215  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  5898216 agaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 5898266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22625429 - 22625224
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  22625429 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 22625330  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  22625329 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 22625230  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  22625229 ccaagt 22625224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Original strand, 37407352 - 37407445
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 97  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37407352 atgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagt 37407445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 316
Target Start/End: Original strand, 10897741 - 10897941
Alignment:
Q  116 aacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaa 215  Q
    |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | ||||| |     
T  10897741 aactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgctttacctag 10897840  T
Q  216 gtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaag 315  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  10897841 gtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagttttgagaaccaaagagttgaccaag 10897940  T
Q  316 t 316  Q
    |    
T  10897941 t 10897941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 7769262 - 7769389
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  7769262 tcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagaaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 7769361  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtt 128  Q
    |  | |||  |||| |||||||||||||    
T  7769362 aggctatcatggagcaacttacggagtt 7769389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23409839 - 23409741
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtct 99  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23409839 tcgatatggtcaaattttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaactccttaagcaacaactctacttatttaagatggtggagtct 23409741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10205141 - 10204936
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  10205141 ggagcaactgacggagttcaataagattattaatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 10205042  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  10205041 cccaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 10204942  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  10204941 ccaagt 10204936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23199646 - 23199549
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23199646 tcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaatcattcaagatggtggagtc 23199549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29913405 - 29913200
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||  ||| | |||    
T  29913405 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctaccgtgtgcttta 29913306  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29913305 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaatagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttga 29913206  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  29913205 ccaagt 29913200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4310055 - 4309911
Alignment:
Q  7 tgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcga 106  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  | |    
T  4310055 tgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagacca 4309956  T
Q  107 tctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    ||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  4309955 tcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 4309911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18098719 - 18098572
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||      
T  18098719 atgtgggcaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattcctaaagcaacaactctacttattcaggatggttgagtcaaagg 18098620  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  18098619 ccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 18098572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 6065344 - 6065194
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  6065344 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatcgtagagtcaa 6065245  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  6065244 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 6065194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10098235 - 10098041
Alignment:
Q  121 acggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtctt 220  Q
    |||||||| || |||||| || |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | ||||| | ||| |    
T  10098235 acggagttcaataagattattaatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgctttacccaggtcct 10098136  T
Q  221 ttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaag 315  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  10098135 ttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaaccaag 10098041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10957874 - 10957724
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  10957874 tcgatttgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 10957775  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| |||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||    
T  10957774 aggccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttgg 10957724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 11168808 - 11168958
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||| |    
T  11168808 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaactactctactcattctggatggtagagtcaa 11168907  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  11168908 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 11168958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 29811532 - 29811626
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29811532 atgtggtcaaagttggagtcattgtatataaccaggtctttggctcataagcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 29811626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 6304042 - 6304247
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     || | ||| | |||    
T  6304042 ggagcaactgacggagttcaataagattattgataatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctattgtgtgcttta 6304141  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  6304142 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 6304241  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  6304242 ccaagt 6304247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 10209873 - 10209958
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10209873 aagttggaatcattgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 10209958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 54189241 - 54189446
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |  | ||| | |||    
T  54189241 ggagcaactgacggagttcaataagattattgataatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctgttgtgtgcttta 54189340  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  54189341 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttga 54189440  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  54189441 ccaagt 54189446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 313
Target Start/End: Original strand, 24933174 - 24933421
Alignment:
Q  63 gaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaa 162  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||| |  |  || | ||| | || ||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  24933174 gaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaatctatcacaaaccaattgacgtaattcaacaagattcttgatgacttagcaaatattgaa 24933273  T
Q  163 gttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggca 262  Q
    || ||  ||||||| || || ||| |||||||   ||| ||||  ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||    
T  24933274 gtgaaagtggaagacgaagacaaggctttgtt---actatgtttgttatcgaaatcttttgatcattttaaggataccatcctttacggaaaggtaggca 24933370  T
Q  263 ctactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgacca 313  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||    
T  24933371 ccactgctttggaggaggtccaagcggatttaagaacaaaggaattaacca 24933421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 5192357 - 5192507
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||  |||| || | ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  5192357 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaa 5192456  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||   ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  5192457 aggccatcattgagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 5192507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 3315389 - 3315486
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3315389 tcgatgtgtgcaaagttggaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttattcattcaagatggtagagtc 3315486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 4600215 - 4600130
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4600215 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 4600130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 10056917 - 10057002
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10056917 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 10057002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 10061361 - 10061446
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10061361 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 10061446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 10063583 - 10063668
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10063583 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 10063668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 10065805 - 10065890
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10065805 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 10065890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10612227 - 10612022
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  10612227 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 10612128  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    ||   ||| |||||| |||| |||||||| || || ||||| || || |||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10612127 ccttggtcctttgagaatttaaaggatactatgctctatggcaaagacggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttga 10612028  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  10612027 ccaagt 10612022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 23634152 - 23634249
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23634152 tcgatgaggtcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatttctaaagcaacaactctagtcattcaagatggtggagtc 23634249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 27421347 - 27421495
Alignment:
Q  3 gatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaa 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  27421347 gatgtggtcaaagttggagtcgttgttattgacaaaatctttggctcatcggcaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaag 27421446  T
Q  103 tcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
       |||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27421447 gtcatcatggagcaacttacggagttcaacaagatccttgatgacttgg 27421495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47882229 - 47882133
Alignment:
Q  220 tttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47882229 tttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcaactttgagaaccaaagagttgaccaagt 47882133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 9635626 - 9635539
Alignment:
Q  6 gtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtg 93  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9635626 gtggtcaaagttggagccgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcattcaagatggtg 9635539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Original strand, 10059139 - 10059221
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgga 95  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10059139 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtgga 10059221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1620025 - 1619936
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatg 90  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| || || || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1620025 tcgatgtggtcaaagttggagtctttgcatatgacaaagtctttggctcattggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatg 1619936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 303
Target Start/End: Original strand, 16458208 - 16458389
Alignment:
Q  122 cggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttt 221  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| || |||||  | ||     |||| ||| | ||||| | ||| ||    
T  16458208 cggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaagataaatccttacacctactgtgtgctttacctaggtcctt 16458307  T
Q  222 tgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaa 303  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||    
T  16458308 tgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagttttgagaaccaaa 16458389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 42991006 - 42991097
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  42991006 tcgatgtgggcaaagttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaatatggt 42991097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15830749 - 15830652
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||| || | |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15830749 tcgaggtggtcaaagttggagttattgtatatgactaagtctatggttcataggcaattcctaaagcaagaactttactcatttaagatggtggagtc 15830652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Original strand, 5192814 - 5192903
Alignment:
Q  227 atttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5192814 atttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 5192903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 6717185 - 6717270
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||  || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6717185 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacatttccttaagcgacaactctactcattcaagatggtggagtc 6717270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 98
Target Start/End: Original strand, 25634589 - 25634681
Alignment:
Q  6 gtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||| || |||||||| || |||||| |||||  |||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25634589 gtggtcaaagttagagtctttatatatgacaaagtctttgactcatcagcaattcctaaagccacaactctactcattcaagatggtggagtc 25634681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 43423019 - 43422963
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaa 57  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  43423019 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaa 43422963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 5192585 - 5192672
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5192585 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 5192672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6065116 - 6065029
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6065116 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 6065029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 53917225 - 53917134
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  53917225 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggt 53917134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15822181 - 15822096
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| | || || | |||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  15822181 aagttggaggcattgtatatgactaagtctttagctcatatgtaattcctaaagcaacaactctactcgtttaaaatggtggagtc 15822096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 28101556 - 28101468
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    |||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| || || || | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28101556 atgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagtaacaactctactcattcaagatggt 28101468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 456842 - 456929
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || | |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  456842 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcgagcggctttgagaaccaatgagttgaccaagt 456929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4309833 - 4309746
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4309833 ttcaaagataccatgctatatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 4309746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 5898344 - 5898431
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5898344 ttcaaagataccattctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 5898431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10957646 - 10957559
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10957646 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcattgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 10957559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18098494 - 18098407
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18098494 ttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 18098407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 32891978 - 32892065
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||||| | || ||||| || || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32891978 ttcaaggataccatgctctatgggaaagaaggcactgccaccttggaagaagttcaaccggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 32892065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19348781 - 19348466
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19348781 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcta 19348682  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19348681 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 19348582  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348581 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 19348482  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  19348481 aaagaattgaccaagt 19348466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25403154 - 25402839
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403154 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 25403055  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  25403054 aatcaatctcggagcaattgacggaatttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatggggataaggctttgttattact 25402955  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25402954 ttgttcattaccaaagtcttttgagcattttaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaagaggtccaagcggctttaagaacc 25402855  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  25402854 aaggaattgaccaagt 25402839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 10446023 - 10446335
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10446023 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 10446122  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| ||||||||| || |  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10446123 aatcaatctcggagcaattggcgaaatttaacaaaattcttgatgatttggccaacat---agttaatatggaagatgaggataaggctttgttgttact 10446219  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10446220 ttgttcattaccaaagtcttttaagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcaccactactttgaaggaggtccaagcggctttgagaatc 10446319  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  10446320 aaggaattgaccaagt 10446335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 23079050 - 23079220
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079050 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 23079149  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatg 171  Q
    |||| ||||||||| || |  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079150 aatcaatctcggagcaattggcggaatttaacaaaattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatg 23079220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16387949 - 16387747
Alignment:
Q  20 agtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggagaaact 119  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||| || |    
T  16387949 agtcattgtacatgatgaaatctttgtctcataggcaactgttgaaacaacaactctattcattcaagat-gtggagtctaatcctatcacggagcaatt 16387851  T
Q  120 tacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtct 219  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||||| |    
T  16387850 gacggaatttaacaagattcttgatgactcagcgaacattgaagtgaatgtggaggatgaagacgagactttgttgttgctatgctcattaccaaagttt 16387751  T
Q  220 tttg 223  Q
    ||||    
T  16387750 tttg 16387747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 2736936 - 2737141
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  2736936 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 2737035  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || |    
T  2737036 cccaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagtttaagcagctttgagaaccaaagagttaa 2737135  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  2737136 ccaagt 2737141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21520245 - 21520095
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||    
T  21520245 tcgatgtggccaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaggatggtggagt-ta 21520147  T
Q  101 aat-cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    ||| | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  21520146 aatgccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 21520095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35217521 - 35217371
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  35217521 tcgatgtgggcaaagttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 35217422  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  35217421 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 35217371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36560692 - 36560542
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  36560692 tcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 36560593  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  36560592 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 36560542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20054210 - 20054005
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| ||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  20054210 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgagcataaagccttacacctactgtgtgcttta 20054111  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| || |    
T  20054110 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcaactttgagaaccaaagagttaa 20054011  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  20054010 ccaagt 20054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22405481 - 22405336
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||  |||| || | ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |    
T  22405481 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggcttatcagcaattcctaaagcaacgattctactcattcaagatggtggagtcaa 22405382  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatga 146  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  22405381 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatga 22405336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22716683 - 22716478
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  22716683 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 22716584  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| | || |    
T  22716583 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagttttgagaaccaaaaagttaa 22716484  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  22716483 ccaagt 22716478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 39680777 - 39680982
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     || | ||| | |||    
T  39680777 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttgacgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctattgtgtgcttta 39680876  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  39680877 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 39680976  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  39680977 ccaagt 39680982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19503887 - 19503737
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||| ||||| || | ||||||  |||||| ||||||| |||| | ||||| |    
T  19503887 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcaattcctaaagcaatgactctactcattcaggatgatagagtcaa 19503788  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  19503787 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttgg 19503737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 34574709 - 34574611
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtct 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||   | |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  34574709 tcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaagcctttggctcataggcaattccaaatgcaacaactctactcatttaagatgttggagtct 34574611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 316
Target Start/End: Original strand, 17932985 - 17933057
Alignment:
Q  244 ctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17932985 ctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcggctttgagaaccaaagagttgaccaagt 17933057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28456948 - 28456758
Alignment:
Q  116 aacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggat-aagactttgttgttactttgttcattaccaa 214  Q
    |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||| ||  |||      |||| |||   ||||| |    
T  28456948 aactgacggagttcaataagattattgatgatttggagaacatagatgtaaatatggaagatgaggataaatccttaccccctactgtgtgttttaccta 28456849  T
Q  215 agtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaaga 305  Q
     ||| |||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  28456848 ggtcctttgataatttcaaggatacaatgctttatggcaaagagggcactagcactttggaggatgtccaagtggttttgagaaccaaaga 28456758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 6263681 - 6263608
Alignment:
Q  25 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  6263681 ttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtc 6263608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36560464 - 36560377
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36560464 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 36560377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19503659 - 19503572
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19503659 ttcaaagataccatgctctatggcaagtaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 19503572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35217293 - 35217206
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  35217293 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcagctttgagaaccaaggatttgaccaagt 35217206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28569966 - 28569834
Alignment:
Q  11 caaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctc 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | ||  || | || ||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||  | |||      
T  28569966 caaagttggagtcgtggtatatgaccaaatctttagctcatcgacagatcctaaaacaaaaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcat 28569867  T
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttga 143  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  28569866 ggatcaacttacggagttcaacaaaatccttga 28569834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 316
Target Start/End: Original strand, 149541 - 149853
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  149541 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtctaaat 149640  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttg 203  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  149641 cgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaggttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttactttg 149740  T
Q  204 ttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaa 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  149741 ttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaactaaa 149840  T
Q  304 gaattgaccaagt 316  Q
    |||||||||||||    
T  149841 gaattgaccaagt 149853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 14738155 - 14738470
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14738155 tcgatgttggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgatggagtcta 14738254  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14738255 aatcgatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatgaggataaggctttgttgttact 14738354  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14738355 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactgctactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 14738454  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  14738455 aaggaattgaccaagt 14738470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 33331029 - 33331344
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33331029 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgatgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 33331128  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  33331129 aatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgataatttggccaacattaaatttaacatggaaaataaggataaggctttgttgttact 33331228  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33331229 ttgttcattaccaaagtcctttgagcatttcaaggataccattctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 33331328  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  33331329 aaagaattgaccaagt 33331344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18232364 - 18232079
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18232364 tcgatgtgggctacgttggagtcattgtacatgacaaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatgatggagtcta 18232265  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| |||||| || || |   ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18232264 aatcaatctcgaagcaattagaggaatttaacaaaattcttgatgatttggctaacattgaagttaatgtggaagatgaggacaaggctttgttgttact 18232165  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18232164 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcaccactactttggaggaggtccaag 18232079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9035801 - 9035488
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9035801 tcgatgtgggcaaagtcgaagtcattgtacatgatgaaatctttggcccataggaaactgttgaaacaacaactctactgattcaagatggtggagtcta 9035702  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    || | ||| |  || || | ||| | || ||||||||||||| ||||||||| || |||||| | | | ||||||| || ||  || |||||||||| ||    
T  9035701 aacctatcacaaagcaattgacgaaattcaacaagattcttg-tgatttggcgaaaattgaaatgattgtggaagacgaagacgagtctttgttgtttct 9035603  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
     |||||||| |  || ||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  9035602 atgttcattgctgaaatc-attgagaattttaaggatatcatcctttatggaaaggaggaaactactactttggaggagtttcaagtggctttgaaaacc 9035504  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || ||||| |||||||    
T  9035503 aaggaattaaccaagt 9035488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 12157979 - 12158139
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12157979 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaagcactctactcattcaagatggtggagtcaa 12158078  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 161  Q
    |  | | |  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  12158079 agaccaccatggagaaacttacagagttcaacaagatccttgatgatttggagaacattga 12158139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12936800 - 12936655
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |    
T  12936800 tcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagttaa 12936701  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatga 146  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12936700 aggccatcatggagcaacttacggagtttaacaaaatccttgatga 12936655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5408577 - 5408480
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5408577 tcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 5408480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5412902 - 5412805
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5412902 tcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 5412805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 25942400 - 25942605
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  25942400 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 25942499  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  25942500 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 25942599  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  25942600 ccaagt 25942605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 13879470 - 13879675
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     || | ||| | |||    
T  13879470 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctattgtgtgcttta 13879569  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  13879570 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttaa 13879669  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  13879670 ccaagt 13879675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17694301 - 17694096
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataa-gactttgttgttactttgttcatt 209  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||  ||||||| |||||     | ||| ||| | ||    
T  17694301 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctagaagacaaggataaagacttacacct-actgtgtgcttt 17694203  T
Q  210 accaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattg 309  Q
    ||| | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17694202 acctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctttatggcaaagagggcactatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttg 17694103  T
Q  310 accaagt 316  Q
    |||||||    
T  17694102 accaagt 17694096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 33309617 - 33309767
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  33309617 tcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 33309716  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  33309717 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 33309767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24078308 - 24078136
Alignment:
Q  130 aacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaagtcttttgagcatt 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| | || ||||| ||||  |||||||||||| |||    
T  24078308 aacaagattcttgatgacttggaaaaaactgaagtgaatgtggaagatgaagataagtctttgttgatgctatgttctttactcaagtcttttgagaatt 24078209  T
Q  230 tcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaa 302  Q
    | ||||| |  |||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  24078208 ttaaggaaagaatcctttacgaaaaggaaggaaccactactttagaggaggtccaagcaactttgacaaccaa 24078136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 3395124 - 3395221
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  3395124 tcgatgtgtgcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtc 3395221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22350421 - 22350216
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| | | | |||    
T  22350421 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggcgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtatgcttta 22350322  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||| || || |||| ||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22350321 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgatttatggcaaagatggcattatcactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagagttga 22350222  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  22350221 ccaagt 22350216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 34165556 - 34165641
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34165556 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 34165641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25462997 - 25462866
Alignment:
Q  20 agtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggagaaact 119  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||  |||| ||||    
T  25462997 agtctttgtatatgacaaagtcttaggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaact 25462898  T
Q  120 tacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  25462897 tacggagttcaacaaaatctttgatgacttgg 25462866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26932110 - 26931964
Alignment:
Q  5 tgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatc 104  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||  |    
T  26932110 tgtgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaaaggc 26932011  T
Q  105 gatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
     |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  26932010 catcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 26931964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 16553348 - 16553433
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16553348 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 16553433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 16629904 - 16629989
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16629904 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 16629989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 16651608 - 16651693
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16651608 aagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 16651693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Original strand, 28301565 - 28301813
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  28301565 atgttggctaagttggagtcattatacatgattaaatctttggctaataggacactattgaaacaacatctctagtcattcaagatgctggagtctaaac 28301664  T
Q  104 cgat----ctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttac 199  Q
    | ||    |  | || ||   ||| | || || | |||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| || ||   |||||||||||    
T  28301665 ctatcatgcatgcagcaatgaacgaaattcaatatgatttttgatgacttggtgaacattgaagtgaaggtggacgatgaagacaaagttttgttgttac 28301764  T
Q  200 tttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatccttta 248  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  28301765 tatgttctttaccgaagtcttttgagcattttatggatgccatccttta 28301813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28510508 - 28510260
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  28510508 atgttggctaagttggagtcattatacatgattaaatctttggctaataggacactattgaaacaacatctctagtcattcaagatgctggagtctaaac 28510409  T
Q  104 cgat----ctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttac 199  Q
    | ||    |  | || ||   ||| | || || | |||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| || ||   |||||||||||    
T  28510408 ctatcatgcatgcagcaatgaacgaaattcaatatgatttttgatgacttggtgaacattgaagtgaaggtggacgatgaagacaaagttttgttgttac 28510309  T
Q  200 tttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatccttta 248  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  28510308 tatgttctttaccgaagtcttttgagcattttatggatgccatccttta 28510260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12911085 - 12910979
Alignment:
Q  40 tctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattc 139  Q
    |||||||||||| || || || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  | |||  |||| ||||||||||||||||||| || |    
T  12911085 tctttggctcattgggaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaacaaaatcc 12910986  T
Q  140 ttgatga 146  Q
    |||||||    
T  12910985 ttgatga 12910979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26067946 - 26067856
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 91  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||  |||| || | ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  26067946 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatgg 26067856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 30444021 - 30444115
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgga 95  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |  | |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  30444021 tcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcatagacaatttctaaagccacaactctactcatttaagatgatgga 30444115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15534153 - 15534056
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  15534153 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtc 15534056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 316
Target Start/End: Original strand, 24432165 - 24432225
Alignment:
Q  256 gagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24432165 gagggcaccactattttggaggaggtccaatcggctttgagaaccaaggaatcgaccaagt 24432225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26067718 - 26067631
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26067718 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactattaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 26067631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21198563 - 21198280
Alignment:
Q  13 aagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcgg 112  Q
    |||||| |||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||  |||||||| | ||| ||     
T  21198563 aagttgaagtcattgtacataactaattattttgctcatagacaacttttgaaacaacacctacactcatttaagatggtatagtctaaaccaatcacga 21198464  T
Q  113 agaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattacc 212  Q
     |  | | ||||| |||||||||||| || |||| | ||| |||||||| |||||| | |||||  |    |||||||| ||||| || | ||| |||||    
T  21198463 ggcgattgacggaatttaacaagattttttatgactaggcaaacattgaggttaatgttgaagaaaac---aagactttcttgttgctatattctttacc 21198367  T
Q  213 aaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
     | ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |  ||||| || |||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||    
T  21198366 ga-gtcttttgagcattttaatgataccaacctttaagaaaaggaaggaactactactttggaggggctctaagcagatttgagaacc 21198280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5165184 - 5165088
Alignment:
Q  220 tttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||  ||||||||| | || |||||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  5165184 tttgagaatttcaaggatacaatgctttatggcaaagaggacactatcactttggagaaagttcaagcatctttgagaaccaaagagttaaccaagt 5165088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 17012791 - 17012918
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  17012791 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaa 17012890  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtt 128  Q
    |  | |||  |||||||||| |||||||    
T  17012891 aggccatcatggagaaacttgcggagtt 17012918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 33309845 - 33309932
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33309845 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 33309932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 24078409 - 24078354
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaact 59  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24078409 atgtgggctaatttggagtcattatacatgacgaaaactttggctcataggtaact 24078354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25462790 - 25462706
Alignment:
Q  228 tttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgacc 312  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||  ||| ||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  25462790 tttcaaagatatcatgctttatggtaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcgactttgagaaccaaggagttgacc 25462706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2011 - 1696
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2011 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaaaatggtggagtcta 1912  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| |||||| || || |  || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1911 aatcaatctcgaagtaattggcgaaatttaacaaaattcttgatgatttggccaacattgaagttaatgtggaagatgaggataaggctttgttgttact 1812  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1811 ttgtttattatcaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaagagggcaccactactttggaggaggtccaagcggcttagagaacc 1712  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  1711 aatgaattgaccaagt 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 18527 - 18837
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18527 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaacttttgaaacaacaactctatgcatccaagatggcggagtcta 18626  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |||| ||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |      |||||||||||||    
T  18627 aatcaatctcggagcaattggcggaatttaacaagattcttgatgatttggccaacattcaagttaacatggaagatgatgg-----ctttgttgttact 18721  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18722 ttgttcattaccaaagtcttttgagcattttaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 18821  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || |||||||||||||    
T  18822 aacgaattgaccaagt 18837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 3775 - 4092
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  3775 tcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaaactttcactcataggcaactcttgaaacaacaactctatttattcaagatggtgaggtcta 3874  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg--ccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgtta 198  Q
    |||| ||||||||| || |   ||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3875 aatcaatctcggagcaattggtggaatttaacaaaattcttgatgatttggggctaacattgaagttaatatggaagatgaggataaggctttgttgtta 3974  T
Q  199 ctttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaa 298  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3975 atttgttcattaccaaattcttttgagcatttcaaggataccatcttttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaa 4074  T
Q  299 ccaaagaattgaccaagt 316  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4075 ccaaggaattgaccaagt 4092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 30081 - 30381
Alignment:
Q  16 ttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggaga 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |  ||     
T  30081 ttggagtcattgtacatgacgaaattgttggctcattggcaactcttgaaacaacaactctactctttcaagatggtggagtctaaatcaatgacaaagc 30180  T
Q  116 aacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaa 215  Q
    || | ||  | |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||| ||||||||| ||    
T  30181 aattgacaaaatttaacaaaatacttgatgacttggccaatattgaagtaaatatggaagatgaggaaaatgctttgttgctaatttcttcattacccaa 30280  T
Q  216 gtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaag 315  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  30281 gtcttttgagcatttcaacgataacatcctttacagtaaggaggacaccattactttggaggaggtccaagtggctttgagaaccaagtaattgaccaag 30380  T
Q  316 t 316  Q
    |    
T  30381 t 30381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42763 - 42463
Alignment:
Q  16 ttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggaga 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |  ||     
T  42763 ttggagtcattgtacatgacgaaattgttggctcattggcaactcttgaaacaacaactctactctttcaagatggtggagtctaaatcaatgacaaagc 42664  T
Q  116 aacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcattaccaaa 215  Q
    || | ||  | |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||| ||||||||| ||    
T  42663 aattgacaaaatttaacaaaatacttgatgacttggccaatattgaagtaaatatggaagatgaggaaaatgctttgttgctaatttcttcattacccaa 42564  T
Q  216 gtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaag 315  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  42563 gtcttttgagcatttcaacgataacatcctttacagtaaggaggacaccattactttggaggaggtccaagtggctttgagaaccaagtaattgaccaag 42464  T
Q  316 t 316  Q
    |    
T  42463 t 42463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1991 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1991
Description:

Target: scaffold1991; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1181
Alignment:
Q  19 gagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcgatctcggagaaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||     
T  1022 gagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaatcaatctcaaagcaat 1121  T
Q  119 ttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatg 178  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1122 tgacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaacatggaagatg 1181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 316
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17261
Alignment:
Q  111 ggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttactttgttcatta 210  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  | ||     |||| ||| | |||    
T  17056 ggagcaactgacggagttcaataagattattgatgatttggtgaacatagatgttaatctggaagacgaggataaagccttacacctactgtgtgcttta 17155  T
Q  211 ccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattga 310  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17156 cctaggtcctttgagaatttcaaggatactatgctctatggcaaagagggcactattactttggaggaagttcaagcagctttgagaaccaaagaattga 17255  T
Q  311 ccaagt 316  Q
    ||||||    
T  17256 ccaagt 17261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 352 - 667
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  352 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagcctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaa 451  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgaagttaatatggaagatgaggataagactttgttgttact 200  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||| || ||  | || |||||||||||   | |  | ||  |    
T  452 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgaaacttgaggatgaggataaagttatactcttgtt 551  T
Q  201 ttgttcattaccaaagtcttttgagcatttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaacc 300  Q
     ||| |  |||| || ||||||||    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  552 gtgtgctctaccgaaatcttttgaatcgttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactattaccttggaagaagttcaagcggctttgagaacc 651  T
Q  301 aaagaattgaccaagt 316  Q
    || || ||||||||||    
T  652 aaggagttgaccaagt 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 73065 - 72918
Alignment:
Q  4 atgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtctaaat 103  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||      
T  73065 atgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaga 72966  T
Q  104 cgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    | |||  |||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  72965 ccatcatggagcaacttacagagttcaacaaaatccttgatgacttgg 72918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 72840 - 72753
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  72840 ttcaaagataccatgctctatggcaaagaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 72753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 34278 - 34428
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |    
T  34278 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactccactcattcaggatggtggagtcaa 34377  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  34378 aggccatcatggagcaactcacggagttaaacaaaatccttgatgacttgg 34428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22854 - 23004
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  22854 tcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaa 22953  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttgg 151  Q
    |  | |||  |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  22954 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttgg 23004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 23082 - 23169
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaaagaattgaccaagt 316  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23082 ttcaaagataccatgctctatggcaaggaaggcactgttaccttggaagaagttcaagcggctttgagaaccaaggagttgaccaagt 23169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 115263 - 115357
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgga 95  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  115263 tcgacgtggtcaaagttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtgga 115357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 37410 - 37474
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaa 65  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37410 tcgatgcgggctaagttggagtcattttacatgacgaaatcttctgctcataggcaactcttgaa 37474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26441 - 26314
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcta 100  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  26441 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaa 26342  T
Q  101 aatcgatctcggagaaacttacggagtt 128  Q
    |  | |||  |||||||||| |||||||    
T  26341 aggccatcatggagaaacttgcggagtt 26314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 50770 - 50837
Alignment:
Q  25 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50770 ttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 50837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 80594 - 80685
Alignment:
Q  1 tcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggt 92  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||  || || || | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  80594 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaacggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 80685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26696 - 26623
Alignment:
Q  229 ttcaaggataccatcctttatggtaaggagggcactactactttggaggaggtccaagcggctttgagaaccaa 302  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| || |||||| | || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26696 ttcaagggtaccatgctctatggtaaagaaggcactgccaccttgaaggacgtccaagcggatttgagaaccaa 26623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26920 - 26827
Alignment:
Q  5 tgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 98  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||  ||| || | || | ||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  26920 tgtggtcaaagttggagtcgttgtatgtgacaaattctttggctcatacacaattcctaaaactacatctctactcgtttaagatggtggagtc 26827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University