View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18168_high_31 (Length: 220)

Name: NF18168_high_31
Description: NF18168
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18168_high_31
NF18168_high_31
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (1-213)||(44725282-44725494)
chr7 (1-213)||(7093830-7094042)
chr7 (1-213)||(38394693-38394905)
chr7 (1-213)||(36157-36369)
chr7 (1-213)||(1048658-1048870)
chr7 (1-213)||(22135510-22135722)
chr7 (1-213)||(40550537-40550749)
chr7 (1-208)||(7351020-7351227)
chr7 (5-207)||(13289872-13290074)
chr7 (1-213)||(31159071-31159270)
chr7 (6-213)||(24749294-24749501)
chr7 (18-213)||(7471367-7471562)
chr7 (5-201)||(24816743-24816933)
chr7 (6-198)||(21678781-21678973)
chr7 (8-201)||(6593866-6594059)
chr7 (8-201)||(18391504-18391697)
chr7 (18-205)||(28486280-28486467)
chr7 (13-204)||(47675475-47675666)
chr7 (18-207)||(26213433-26213621)
chr7 (8-201)||(48490047-48490240)
chr7 (29-187)||(20298048-20298206)
chr7 (17-201)||(6047203-6047387)
chr7 (100-193)||(4295409-4295502)
chr7 (9-183)||(6570647-6570821)
chr7 (33-192)||(12405691-12405850)
chr7 (33-192)||(24261897-24262056)
chr7 (20-192)||(16884268-16884440)
chr7 (17-179)||(3890776-3890938)
chr7 (6-85)||(4294091-4294170)
chr7 (6-80)||(9679498-9679572)
chr7 (87-192)||(5817759-5817864)
chr7 (119-180)||(3903917-3903978)
chr7 (87-192)||(18413066-18413171)
chr7 (5-61)||(3903813-3903869)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (1-213)||(51750735-51750947)
chr1 (1-213)||(28841120-28841332)
chr1 (1-213)||(51758232-51758444)
chr1 (1-213)||(16226866-16227078)
chr1 (1-213)||(20300829-20301041)
chr1 (1-213)||(27338502-27338714)
chr1 (5-213)||(28203072-28203280)
chr1 (1-213)||(47178060-47178272)
chr1 (5-208)||(8348438-8348641)
chr1 (7-206)||(3805513-3805712)
chr1 (5-207)||(13127108-13127310)
chr1 (6-213)||(25250655-25250862)
chr1 (6-206)||(16429653-16429853)
chr1 (18-213)||(6996282-6996477)
chr1 (12-213)||(50078174-50078375)
chr1 (8-201)||(50168683-50168875)
chr1 (6-205)||(31736850-31737049)
chr1 (6-213)||(29003345-29003552)
chr1 (8-201)||(28222754-28222947)
chr1 (12-213)||(28997635-28997836)
chr1 (8-201)||(31657846-31658039)
chr1 (47-201)||(3157305-3157459)
chr1 (6-213)||(31424408-31424603)
chr1 (33-192)||(41397593-41397752)
chr1 (16-201)||(16456360-16456545)
chr1 (127-192)||(19359412-19359477)
chr1 (87-192)||(47099392-47099497)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (1-208)||(15069325-15069532)
chr8 (1-213)||(18811461-18811673)
chr8 (1-213)||(27827738-27827950)
chr8 (1-213)||(43080355-43080567)
chr8 (5-207)||(31577667-31577868)
chr8 (8-201)||(34255839-34256032)
chr8 (8-201)||(4732300-4732493)
chr8 (24-213)||(21481249-21481438)
chr8 (6-203)||(41383416-41383613)
chr8 (5-184)||(17848308-17848487)
chr8 (8-201)||(5591527-5591720)
chr8 (33-192)||(10684838-10684997)
chr8 (33-192)||(35744744-35744903)
chr8 (87-194)||(18853735-18853842)
chr8 (8-63)||(41366326-41366383)
chr8 (33-192)||(6813047-6813206)
chr8 (23-108)||(10380449-10380534)
chr8 (133-181)||(26300792-26300840)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (1-213)||(34478788-34479000)
chr5 (2-213)||(6745766-6745977)
chr5 (1-213)||(10750396-10750608)
chr5 (1-213)||(15356218-15356430)
chr5 (1-213)||(18467382-18467594)
chr5 (1-213)||(23665744-23665956)
chr5 (1-213)||(31543431-31543643)
chr5 (8-201)||(29721017-29721210)
chr5 (8-201)||(9788554-9788747)
chr5 (21-213)||(658716-658908)
chr5 (8-201)||(16407977-16408170)
chr5 (8-201)||(26171409-26171602)
chr5 (21-185)||(20043710-20043874)
chr5 (5-181)||(534421-534597)
chr5 (6-213)||(27911130-27911337)
chr5 (17-201)||(13694483-13694667)
chr5 (8-201)||(40380758-40380951)
chr5 (8-201)||(16545079-16545275)
chr5 (5-181)||(42427761-42427937)
chr5 (29-205)||(25806167-25806343)
chr5 (6-173)||(18510788-18510955)
chr5 (1-90)||(20505575-20505664)
chr5 (33-192)||(33790669-33790828)
chr5 (33-192)||(37557198-37557357)
chr5 (5-131)||(13294851-13294977)
chr5 (38-192)||(27449181-27449335)
chr5 (20-192)||(31397566-31397738)
chr5 (87-192)||(43598140-43598245)
chr5 (87-192)||(43603632-43603737)
chr5 (87-192)||(43609124-43609229)
chr5 (87-187)||(34842024-34842124)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (1-213)||(22133986-22134198)
chr4 (1-213)||(22782106-22782318)
chr4 (5-204)||(12402469-12402668)
chr4 (1-213)||(16933517-16933729)
chr4 (1-213)||(22046084-22046296)
chr4 (1-213)||(11007937-11008149)
chr4 (1-213)||(9175841-9176053)
chr4 (5-213)||(12395233-12395440)
chr4 (5-213)||(12400195-12400402)
chr4 (8-201)||(52094695-52094888)
chr4 (19-213)||(47563507-47563701)
chr4 (8-201)||(5872457-5872650)
chr4 (25-207)||(18536898-18537079)
chr4 (8-201)||(12743261-12743454)
chr4 (8-201)||(5136734-5136927)
chr4 (18-205)||(36920884-36921071)
chr4 (8-201)||(8394060-8394253)
chr4 (21-201)||(3578083-3578263)
chr4 (21-201)||(10113622-10113802)
chr4 (8-201)||(7123350-7123543)
chr4 (6-203)||(22802111-22802308)
chr4 (6-213)||(14788807-14789014)
chr4 (6-213)||(16454055-16454262)
chr4 (5-204)||(26558348-26558547)
chr4 (5-177)||(5206993-5207165)
chr4 (105-213)||(36379036-36379144)
chr4 (33-192)||(9224978-9225137)
chr4 (8-172)||(4588623-4588787)
chr4 (87-192)||(16624579-16624684)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (1-213)||(18098540-18098752)
chr3 (1-213)||(456584-456796)
chr3 (1-213)||(10957692-10957904)
chr3 (1-213)||(43226754-43226966)
chr3 (1-213)||(4309879-4310091)
chr3 (1-213)||(5192327-5192539)
chr3 (1-208)||(11168783-11168990)
chr3 (1-213)||(6065162-6065374)
chr3 (1-208)||(5898091-5898298)
chr3 (5-207)||(7769238-7769440)
chr3 (5-213)||(23634123-23634330)
chr3 (6-208)||(28101382-28101584)
chr3 (6-213)||(3315359-3315566)
chr3 (8-201)||(23199471-23199664)
chr3 (12-201)||(27421327-27421516)
chr3 (8-201)||(37407331-37407524)
chr3 (8-201)||(5259655-5259848)
chr3 (6-208)||(42990981-42991183)
chr3 (6-213)||(43422844-43423049)
chr3 (8-201)||(10209843-10210036)
chr3 (8-201)||(22834341-22834534)
chr3 (8-201)||(4600052-4600245)
chr3 (8-201)||(10056887-10057080)
chr3 (8-201)||(10059109-10059302)
chr3 (8-201)||(10061331-10061524)
chr3 (8-201)||(10063553-10063746)
chr3 (8-201)||(10065775-10065968)
chr3 (8-201)||(29811511-29811704)
chr3 (8-201)||(6717155-6717348)
chr3 (8-201)||(7762913-7763106)
chr3 (8-201)||(9635456-9635649)
chr3 (6-203)||(53917048-53917245)
chr3 (39-207)||(1619882-1620049)
chr3 (64-178)||(25634589-25634703)
chr3 (7-201)||(15830573-15830767)
chr3 (8-181)||(32891752-32891925)
chr3 (5-159)||(15822015-15822169)
chr3 (105-201)||(53597915-53598011)
chr3 (20-185)||(32479681-32479846)
chr3 (20-192)||(8516435-8516607)
chr3 (87-201)||(23409743-23409857)
chr3 (8-181)||(30844876-30845049)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (1-213)||(22824-23036)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (1-213)||(21520063-21520275)
chr2 (1-213)||(35217339-35217551)
chr2 (1-213)||(36560510-36560722)
chr2 (1-213)||(19503705-19503917)
chr2 (19-213)||(22405317-22405511)
chr2 (6-201)||(6263528-6263723)
chr2 (5-201)||(28569798-28569994)
chr2 (105-207)||(34574631-34574733)
chr2 (33-192)||(19348631-19348790)
chr2 (7-154)||(42019221-42019368)
chr2 (87-192)||(25403058-25403163)
chr2 (87-185)||(23079048-23079146)
chr2 (53-153)||(2736856-2736956)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (1-213)||(322-534)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-213)||(34248-34460)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-213)||(33309587-33309799)
chr6 (1-213)||(26931932-26932144)
chr6 (1-208)||(26067764-26067971)
chr6 (5-207)||(25462838-25463040)
chr6 (7-207)||(12936624-12936824)
chr6 (25-208)||(17012766-17012948)
chr6 (8-201)||(5408402-5408595)
chr6 (8-201)||(5412727-5412920)
chr6 (5-201)||(12157961-12158157)
chr6 (6-208)||(15533976-15534178)
chr6 (8-201)||(16553318-16553511)
chr6 (8-201)||(16629874-16630067)
chr6 (7-152)||(12910948-12911093)
chr6 (5-201)||(16651578-16651775)
chr6 (8-201)||(34165526-34165719)
chr6 (69-213)||(3395094-3395238)
chr6 (5-206)||(30443998-30444199)
chr6 (1-208)||(3631312-3631519)
chr6 (32-206)||(26944229-26944403)
chr6 (8-96)||(16567733-16567821)
chr6 (33-192)||(14738146-14738305)
chr6 (40-185)||(33331027-33331172)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-213)||(72886-73098)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (25-208)||(26284-26466)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (6-213)||(80564-80771)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (13-201)||(115245-115433)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (6-213)||(50716-50923)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (6-205)||(826-1025)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (33-192)||(14883-15042)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (33-189)||(454-610)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (5-179)||(26746-26920)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (8-72)||(137-201)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (20-192)||(149529-149701)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (127-192)||(18518-18583)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44725494 - 44725282
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  44725494 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccataagttgctctatgatggcctttgactccaccatcctg 44725395  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44725394 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatgccgcggttggttcct 44725295  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  44725294 ttgctacttctct 44725282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 7093830 - 7094042
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  7093830 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 7093929  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7093930 aatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcct 7094029  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  7094030 ttgctacttctct 7094042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38394905 - 38394693
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |    
T  38394905 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttg 38394806  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  38394805 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 38394706  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  38394705 ttgctacttctct 38394693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36369 - 36157
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  36369 atcctcatcctcaagttgtacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctg 36270  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  36269 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagctaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttcct 36170  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  36169 ttgctacttctct 36157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 1048658 - 1048870
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  1048658 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 1048757  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1048758 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgcgccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcct 1048857  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  1048858 ttgctacttctct 1048870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22135722 - 22135510
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  22135722 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 22135623  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  22135622 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttgcttcct 22135523  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  22135522 ttgctacttctct 22135510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40550749 - 40550537
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  40550749 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 40550650  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  40550649 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttgcttcct 40550550  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  40550549 ttgctacttctct 40550537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 7351020 - 7351227
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |    
T  7351020 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatgacctttgactctaccatcttg 7351119  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7351120 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 7351219  T
Q  201 ttgctact 208  Q
    ||||||||    
T  7351220 ttgctact 7351227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 13289872 - 13290074
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  13289872 tcatcgtcaagatgcacctccatattctccaagtcatcaaggaatttgttgaactccataagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttgaatg 13289971  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13289972 agtagagttgttgctttaggaattaccgatgagccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatcaatgtcccggttggttcctttgc 13290071  T
Q  205 tac 207  Q
    |||    
T  13290072 tac 13290074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 31159071 - 31159270
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  31159071 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 31159170  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31159171 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatac-------------ttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 31159257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24749501 - 24749294
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  24749501 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatga 24749402  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  24749401 gtagagttattgctttaggaattgccgatcagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccacatcgatgccatggttggttcttttgct 24749302  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  24749301 acttctct 24749294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 7471367 - 7471562
Alignment:
Q  18 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtta 117  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |||| |||||||     
T  7471367 gcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagccttttactttaccatcttgaatgagtaaagttgttg 7471466  T
Q  118 ctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  7471467 ctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgaccacatcgatgccgcggttgtatcctttgttacttctct 7471562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 24816743 - 24816933
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||     
T  24816743 tcatcttcaagatgcaccttaatcatctccaagtcatcaagaattttgttgaactccgtaagttgctccatgatgacctttgaatccaccatcttgaatg 24816842  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||      |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24816843 agtagagttgttgctttaggaattgtagatgagccaaagactttgt------caaaaattccaactttgaccgcatcgatgtcgcggttggttcctt 24816933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21678973 - 21678781
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| | |  ||||||  |||| |    
T  21678973 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgattgccttttattttaccatcttgaatga 21678874  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttc 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21678873 gtaaagttgttgctttaggaactgccgatgagccaaagactttgtaaaatacaaagattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttggttc 21678781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 6593866 - 6594059
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  6593866 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 6593965  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6593966 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 6594059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 18391504 - 18391697
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  18391504 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 18391603  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18391604 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 18391697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28486467 - 28486280
Alignment:
Q  18 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtta 117  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |||| |||||||     
T  28486467 gcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttg 28486368  T
Q  118 ctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  28486367 ctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcggttgtttccgttgct 28486280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 47675475 - 47675666
Alignment:
Q  13 aagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  | |||| |||||||||||  |||| | ||||||    
T  47675475 aagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacagtctttgactccaccatcttgaatgattagagt 47675574  T
Q  113 tgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  47675575 tgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactcaaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttcctttgc 47675666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26213621 - 26213433
Alignment:
Q  18 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||     
T  26213621 gcacctcaatattctccaagtcatcaaagattttgttgaactctgtaagtttctccatga-ggcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttg 26213523  T
Q  118 ctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||| || ||||| |||| |||||| |||  | || |||||||||| |||||    
T  26213522 ctttaggaattgcaaatgagccaaagatttggtcctatacaatgactccaaatttgaccacattgattccacgattggttccttcgctac 26213433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48490240 - 48490047
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  48490240 tcctcaagtttcacctcaatgttctccaaatcattaaggattttgttgaactccgttaaatgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 48490141  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||    
T  48490140 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagattttgtaatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcagtaggttcctt 48490047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20298206 - 20298048
Alignment:
Q  29 ttctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaatt 128  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||| |||  ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| ||    
T  20298206 ttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagcagctccatgaaggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactt 20298107  T
Q  129 gccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtc 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20298106 gtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccgactttgcccacatcgatgtc 20298048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6047387 - 6047203
Alignment:
Q  17 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtt 116  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  6047387 tgcatctcaatgttctccaagtcatcaaggatattgtttaactccgtaagttactgaatgatggactttgactccaccatcttgaatgagtagagttgtt 6047288  T
Q  117 actttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||| || ||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||    
T  6047287 gctttaggaattgcgtatgagccaaagatttgttcatatacaacgactccaaatttgatcgcattgatgccgcgattggttcctt 6047203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 4295409 - 4295502
Alignment:
Q  100 gaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggtt 193  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4295409 gaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaacttttcccacatcgatgccgcggtt 4295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6570821 - 6570647
Alignment:
Q  9 cctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagta 108  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||  | | || |||| ||||||| |||  |||| || |    
T  6570821 cctcaggtttcacctcaatgttctccaaatcatcaagtattttattgaactccgttaattgctctgttacggtctttgactccacaatcttgaatgagga 6570722  T
Q  109 gagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcga 183  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  6570721 gagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactgcaactttgaccacatcga 6570647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Original strand, 12405691 - 12405850
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  12405691 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 12405790  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12405791 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcggt 12405850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24262056 - 24261897
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  24262056 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 24261957  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24261956 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 24261897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 16884268 - 16884440
Alignment:
Q  20 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 119  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  16884268 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 16884367  T
Q  120 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    | | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16884368 tcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 16884440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 3890776 - 3890938
Alignment:
Q  17 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtt 116  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    ||| | ||||||| |     
T  3890776 tgcacctcaatgttctccatatcattaaggattttgttgaactctattagttgcttcatgatgacctttgactcccccatatttaatgaatagagttttg 3890875  T
Q  117 actttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaca 179  Q
      ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||||||    
T  3890876 gttttaggaattgcctatgagtcaaaggcttggtcatatacaataacttcaactttgcccaca 3890938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 4294091 - 4294170
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttt 85  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  4294091 catccccaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagtagctccatgaaggccttt 4294170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 9679572 - 9679498
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatgg 80  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9679572 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatgg 9679498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5817864 - 5817759
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||  || | || || || ||||| ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  5817864 actccaccatcttgaatgagtagagttgttgtttcaagagtttcctatgagtcaacgattttgtcatatacaatgactccaacttagcccacatcgatgc 5817765  T
Q  187 cgcggt 192  Q
    ||||||    
T  5817764 cgcggt 5817759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 180
Target Start/End: Original strand, 3903917 - 3903978
Alignment:
Q  119 tttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacat 180  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3903917 tttaggaattgtctaggagtcaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgcccacat 3903978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 18413066 - 18413171
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||     
T  18413066 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagctcacatcgatgc 18413165  T
Q  187 cgcggt 192  Q
    ||||||    
T  18413166 cgcggt 18413171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Original strand, 3903813 - 3903869
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactcc 61  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  3903813 tcatcttcaagatgcacctcaatgttctccaaattatcaagaattttgttgaactcc 3903869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51750947 - 51750735
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  51750947 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 51750848  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  51750847 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 51750748  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  51750747 ttgctacttctct 51750735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28841332 - 28841120
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  28841332 atcctcatcctcaagtttcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 28841233  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28841232 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 28841133  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  28841132 ttgctacttctct 28841120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51758444 - 51758232
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  51758444 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttactccatgatggcctttgactctaccatcctg 51758345  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51758344 aatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcgtatacaaagattccaattttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcct 51758245  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  51758244 ttgctacttctct 51758232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16227078 - 16226866
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  16227078 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctg 16226979  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16226978 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 16226879  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    ||| |||| ||||    
T  16226878 ttgttacttctct 16226866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20301041 - 20300829
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  20301041 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcttcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 20300942  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||    
T  20300941 aatgagtagagttgttgctttaggaattgacgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccacggtttgttcct 20300842  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  20300841 ttgctacttctct 20300829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 27338502 - 27338714
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  27338502 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattatccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctg 27338601  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  27338602 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccaatgagtcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcgattcattcct 27338701  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  27338702 ttgctacttctct 27338714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 28203072 - 28203280
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||     
T  28203072 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtcagttgctccatgatggcttttgactccaccatcttgaatg 28203171  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28203172 agtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagtcaaagactttgtcttatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttggttcctttgc 28203271  T
Q  205 tactcctct 213  Q
    |||| ||||    
T  28203272 tacttctct 28203280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47178272 - 47178060
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  47178272 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctg 47178173  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  47178172 aatgagtagagtcgttgttttaggaattgccgatgagccaatgactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcgattgcttcct 47178073  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  47178072 ttgctacttctct 47178060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 8348438 - 8348641
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  8348438 tcatcctcaagatgcacctcattattttccaagtcatcaaagattttgttgaactccgtaagttgctacatgatggcctttgactccaccatcttgaatg 8348537  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||| ||    
T  8348538 agtagagttgttgctttaggaattgtcgatgtcccaaagactttgtcatatacaaagactctaactttgaccacatcgacgccacggttggtttcttcgc 8348637  T
Q  205 tact 208  Q
    ||||    
T  8348638 tact 8348641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 3805513 - 3805712
Alignment:
Q  7 atcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataag 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||| |     
T  3805513 atcctcaagatgcacctcaatgttctccaagtcatcaagaattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctgccatcttgaatgat 3805612  T
Q  107 tagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgcta 206  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||  | || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3805613 tacagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagatttggtcataaacaacaactctaacgttgaccacatcgatgtcgcggttggttccttcgcta 3805712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 13127108 - 13127310
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||   ||||     
T  13127108 tcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttaaactccataagttgctacatgatgatctttgactccgccatattgaatg 13127207  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  13127208 agtatagttgtttctttaagaattgtcgatgagccaaagaatttgtcatatacaaagactccaactttgaagacatcgatgtcgcggttagttacttcgc 13127307  T
Q  205 tac 207  Q
    |||    
T  13127308 tac 13127310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Original strand, 25250655 - 25250862
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| |||| || ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  25250655 catcctcaaggtgcagcttaatgttgtccaaatcatcaatgattttgttgaactccgtaagtttctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatga 25250754  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  25250755 gtagagttgttgctttaggaattaccgaagagccaaagactttgccatatacaaatatttgaactttaaccacatcgataccgcggttgtttcctttgct 25250854  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  25250855 acttctct 25250862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16429853 - 16429653
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  16429853 catcctcaagatgcacctcaataatctccaaatcatcaagggttttgttgaactccacaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatga 16429754  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  ||||||||| | |||||| | |||||| |||    
T  16429753 gtaaagttgttactttaggaatttctgatgagccaaagactttgtcatatacaaacacttgaactttaaccacatcgacgccgcggtagattccttcgct 16429654  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  16429653 a 16429653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6996477 - 6996282
Alignment:
Q  18 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtta 117  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||   ||| |||| |||||||     
T  6996477 gcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggtctttgactttaccatcttaaatgagtaaagttgttg 6996378  T
Q  118 ctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  6996377 ctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttggatcctttgttacttctct 6996282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 50078174 - 50078375
Alignment:
Q  12 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagag 111  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||  |||| |||| ||    
T  50078174 caagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctataatcttgaatgagtaaag 50078273  T
Q  112 ttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcct 211  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||| |||||| ||    
T  50078274 ttgttgctttaggacttgccgatgagcccaagattttgtcatatacaaatattcaaactttgaccacattgatgccgcagttgtttccttcgctacttct 50078373  T
Q  212 ct 213  Q
    ||    
T  50078374 ct 50078375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 50168683 - 50168875
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| | |    
T  50168683 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccattaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgaat 50168782  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  50168783 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaaaacttggtcatatac-aagactccaactttgaccatatcgacgtcgtggttggttcctt 50168875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Original strand, 31736850 - 31737049
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  31736850 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 31736949  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31736950 gtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcggttcgttcctttgct 31737049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Original strand, 29003345 - 29003552
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  | | |||||| |||||| |||  |||||| ||||| |    
T  29003345 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagttgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 29003444  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  29003445 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgtggttgtatcctttgct 29003544  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  29003545 acttctct 29003552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 28222754 - 28222947
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||  | | || |||| |||||||||||  |||| | |    
T  28222754 tcctcaagtttcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactctgtcaattgctctgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgaat 28222853  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  28222854 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgacaccaactttgaccacatcgatgctgcggttggttcctt 28222947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 28997635 - 28997836
Alignment:
Q  12 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagag 111  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  | | |||||| |||||| |||  |||||| ||||| |||| ||    
T  28997635 caagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagttgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaag 28997734  T
Q  112 ttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcct 211  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||    
T  28997735 ttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgtggttgtatcctttgctacttct 28997834  T
Q  212 ct 213  Q
    ||    
T  28997835 ct 28997836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31658039 - 31657846
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  31658039 tcctcaagcttcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctctgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 31657940  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    | ||||||| ||| ||||||| || || ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  31657939 aaagttgttgcttaaggaatttcctataagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttggttcctt 31657846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3157459 - 3157305
Alignment:
Q  47 attttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagact 146  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | | || |||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  3157459 attttgttgaactccgtcaattgctccgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaaagact 3157360  T
Q  147 ttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    | |||||||| || || |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  3157359 tggtcatatagaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttcctt 3157305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Original strand, 31424408 - 31424603
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  31424408 catcctcaagacacacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagatccatgatggcctttgactctaccatcttgaatga 31424507  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| |  |||| |||||| |||||  ||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31424508 gtaaatatgttgctttagaaattgttgatgagccaaag------------acaaagattccaactttgcccacatctatgtcgtggttggttcctttgct 31424595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Original strand, 41397593 - 41397752
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||  |||||| ||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  41397593 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagatcgatttagactccatcatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 41397692  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41397693 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 41397752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16456545 - 16456360
Alignment:
Q  16 ttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgt 115  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||  | |||||||| | ||||||  | || | |||| |||| | ||||  |||| |||||||||||    
T  16456545 ttgcaactcaatgttctccaaatcattaagtattttaataaactccgttaattgctctgtcattgtctttgactctatcatcttgaatgagtagagttgt 16456446  T
Q  116 tactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||| | | ||| |||||||||||    
T  16456445 tgctttaggatttgcctatgagccaaagtcttggtcatatacaatgactccaactttgatcacatcaacgccgcagttggttcctt 16456360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19359477 - 19359412
Alignment:
Q  127 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19359477 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgacttcaacttagcccacatcgatgccgcggt 19359412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 47099497 - 47099392
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| ||||||||| || || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||     
T  47099497 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcacgagttgcctatgagccaacgatttcgtcatgtaaaatgactccaacttagcccacatcgatgc 47099398  T
Q  187 cgcggt 192  Q
    ||||||    
T  47099397 cgcggt 47099392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15069532 - 15069325
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15069532 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctg 15069433  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  15069432 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcagttggttcat 15069333  T
Q  201 ttgctact 208  Q
    ||||||||    
T  15069332 ttgctact 15069325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18811673 - 18811461
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  18811673 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 18811574  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18811573 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 18811474  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  18811473 ttgctacttctct 18811461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27827950 - 27827738
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  27827950 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 27827851  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27827850 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 27827751  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  27827750 ttgctacttctct 27827738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43080567 - 43080355
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  43080567 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctg 43080468  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43080467 aatgagtagagtcgttgttttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 43080368  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  43080367 ttgctacttctct 43080355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 31577667 - 31577868
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||     
T  31577667 tcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcatggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccattgactccaccatcttgaat- 31577765  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  31577766 agtagagttgttgctttaggaattgccgaagagccaaagactttgtcatatacacagactccaactttgaccacatcgatgacgcaattggttccttcgc 31577865  T
Q  205 tac 207  Q
    |||    
T  31577866 tac 31577868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 34255839 - 34256032
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  34255839 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 34255938  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34255939 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgttgcggttggttcctt 34256032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4732493 - 4732300
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  4732493 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 4732394  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||    
T  4732393 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgtctccaactttgaccacatcgacgccacggtaggttcctt 4732300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21481438 - 21481249
Alignment:
Q  24 caatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttag 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||  |||| |||| | ||||| ||||||    
T  21481438 caatatactccaagtcatcaaggattctgttgaactccgcaaggttctccatgatggtctttgactctaccatcttgaatgagtaaaattgtttctttag 21481339  T
Q  124 gaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  21481338 gaattggcgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcggttggttcattcgctacttctct 21481249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41383613 - 41383416
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  |||||| | ||| |    
T  41383613 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatctcaaatga 41383514  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttg 203  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41383513 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacatcgatgtcgcggttgtttcctttg 41383416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17848487 - 17848308
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||   |||     
T  17848487 tcatccttaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattgtattgaacttcgtaagttactccatgatgaactttgactccaacatcttcaatg 17848388  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgat 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17848387 agtagagttgttgctttaggaatttccgatgagccaaagagattgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgat 17848308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5591720 - 5591527
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  | | || ||||||||||||||||  |||| | |    
T  5591720 tcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactccgtcaattgctctgtcacggtctttaactccaccatcttgaatgaat 5591621  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  5591620 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttggttcctt 5591527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10684997 - 10684838
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  10684997 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 10684898  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10684897 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 10684838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Original strand, 35744744 - 35744903
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | || ||| |     
T  35744744 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtct 35744843  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35744844 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 35744903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18853842 - 18853735
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||     
T  18853842 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaatttagcccacatcgatgc 18853743  T
Q  187 cgcggttg 194  Q
    ||||||||    
T  18853742 cgcggttg 18853735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 41366326 - 41366383
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcat--caaggattttgttgaactccgt 63  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41366326 tcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatatcaaggattttgttgaactccgt 41366383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Original strand, 6813047 - 6813206
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  || | ||||||| |||| |  ||  |||||||||||   ||| ||||||||||||  || | || || ||     
T  6813047 ccaagtcatcaagaattttgttaaattttgtcaattgctccgtgattgatttagactccaccatcttcaatgagtagagttgttgtttcaagagtttcct 6813146  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6813147 atgagccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacattgatgtcgcggt 6813206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 10380449 - 10380534
Alignment:
Q  23 tcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagta 108  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| | ||  | |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10380449 tcaatgttcaccaaatcatcaaagattttgttgaattgcgccaattgctttatgatggcttttgactccaccatcccgaatgagta 10380534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 181
Target Start/End: Original strand, 26300792 - 26300840
Alignment:
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 181  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  26300792 atgagccaaagattttgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatc 26300840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34478788 - 34479000
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  34478788 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattttccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 34478887  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34478888 aatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcct 34478987  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  34478988 ttgctacttctct 34479000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6745977 - 6745766
Alignment:
Q  2 tcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6745977 tcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctga 6745878  T
Q  102 ataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  6745877 atgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattacaactttgcccacattgatgccgcggttcgttcctt 6745778  T
Q  202 tgctactcctct 213  Q
    ||||||| ||||    
T  6745777 tgctacttctct 6745766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10750608 - 10750396
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  10750608 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 10750509  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10750508 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 10750409  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    || ||||| ||||    
T  10750408 ttcctacttctct 10750396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15356218 - 15356430
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  15356218 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 15356317  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  15356318 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcct 15356417  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  15356418 ttgctacttctct 15356430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18467594 - 18467382
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  18467594 atccttatccacaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaaattgctccatgatggtctttgactccaccatcctg 18467495  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18467494 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggttcgttcct 18467395  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  18467394 ttgctacttctct 18467382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23665956 - 23665744
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  23665956 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 23665857  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  23665856 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcct 23665757  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  23665756 ttgctacttctct 23665744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31543643 - 31543431
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |    
T  31543643 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcttg 31543544  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31543543 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattctaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcct 31543444  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  31543443 ttgctacttctct 31543431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29721210 - 29721017
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  29721210 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 29721111  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29721110 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccacatcgatgccgcggttggttcctt 29721017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 9788554 - 9788747
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  9788554 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 9788653  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9788654 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgccgcggttggttcctt 9788747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 658908 - 658716
Alignment:
Q  21 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactt 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||| |||  ||||||  |||| |||| ||||||| |||    
T  658908 cctcaatattctccaaatcaccaatgattttgttgaactctacaagtaggtccatgatggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctt 658809  T
Q  121 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  658808 taggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctacttctct 658716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16408170 - 16407977
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  16408170 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtcttttactccaccatcttgaatgagt 16408071  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||    
T  16408070 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgatcatatcgattccgcggttggttcctt 16407977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26171602 - 26171409
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  26171602 tcctcaatttgcaccttaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 26171503  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  26171502 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgccacggttggttcctt 26171409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20043874 - 20043710
Alignment:
Q  21 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactt 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| ||||||| |||    
T  20043874 cctcaatgttctccaagtcatcaaggattgttttgaactccacaagttgctccatgatggcctttgactctgccatcttgaatgagtaaagttgttgctt 20043775  T
Q  121 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  20043774 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgactacatcgatg 20043710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 534597 - 534421
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||  ||||     
T  534597 tcatcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagtattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatg 534498  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 181  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  534497 agtagagttgttgcttaaggaattgcctatcaaccaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatc 534421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27911337 - 27911130
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  27911337 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 27911238  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  27911237 gtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcagttgattcctttgct 27911138  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  27911137 acttctct 27911130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Original strand, 13694483 - 13694667
Alignment:
Q  17 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtt 116  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13694483 tgcacctcaatgttttccaactcatcaaggattttgttgaactccgttagttgctccatgatgacatttgactccaccatcttaaataagtagagttgtt 13694582  T
Q  117 actttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
      | ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13694583 gatataggaattgcatatgagccaaagatttggtcatatacaacgactccaaatttgaccacatcaatatcgcggtaggttcctt 13694667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40380951 - 40380758
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  40380951 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaaccgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 40380852  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40380851 agagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 40380758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16545275 - 16545079
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  16545275 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 16545176  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagac---tttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||   || ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16545175 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttgttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 16545079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 181
Target Start/End: Original strand, 42427761 - 42427937
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | | || |||| |||||||||||  ||||     
T  42427761 tcatcctcaagttgcacctcaatgttctcaaaatcatcaaggattttgttgaactctgttaattgttccgtcacggtctttgactccaccatcttgaatg 42427860  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 181  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  42427861 aatagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactacaactttgaccacatc 42427937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25806343 - 25806167
Alignment:
Q  29 ttctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaatt 128  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| ||    
T  25806343 ttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactt 25806244  T
Q  129 gccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  25806243 tccaatgagccaaagactttgtaatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgctgcggttgtttccattgct 25806167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Original strand, 18510788 - 18510955
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  18510788 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactgcacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 18510887  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttg 173  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18510888 gtaaagttgttgctttaggacttgccgataagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttg 18510955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 20505575 - 20505664
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactc 90  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  20505575 atcctcatactcaagttgcaccttaatattctccaagtcattaaggattttgttaaactccgtaagttgctccataatgtcctttgactc 20505664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Original strand, 33790669 - 33790828
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | || ||| |     
T  33790669 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtct 33790768  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33790769 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 33790828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37557357 - 37557198
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  37557357 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 37557258  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37557257 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcggt 37557198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13294977 - 13294851
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| |||||||| ||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||     
T  13294977 tcatccttaagatgcactccaatgttctccaaatcatcaaggcttctactgaactcagtaagttgctccatgatgccctttgactccaccatcatgaatg 13294878  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgcc 131  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  13294877 agtagagttgttgctttctgaattgcc 13294851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Original strand, 27449181 - 27449335
Alignment:
Q  38 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgag 137  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| | |||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||    
T  27449181 tcatcaagaatcttgttaaactccgtcaattgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 27449280  T
Q  138 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27449281 ctaaagattttgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 27449335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31397738 - 31397566
Alignment:
Q  20 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 119  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  31397738 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 31397639  T
Q  120 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    | | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  31397638 tcaagagttgcctatgagccaaagattttgtcatatagaatgactccaacttttcccacattgatgccgcggt 31397566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 43598140 - 43598245
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  43598140 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgc 43598239  T
Q  187 cgcggt 192  Q
    ||||||    
T  43598240 cgcggt 43598245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 43603632 - 43603737
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  43603632 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgc 43603731  T
Q  187 cgcggt 192  Q
    ||||||    
T  43603732 cgcggt 43603737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 43609124 - 43609229
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  43609124 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgc 43609223  T
Q  187 cgcggt 192  Q
    ||||||    
T  43609224 cgcggt 43609229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 187
Target Start/End: Original strand, 34842024 - 34842124
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| || |  ||||| | | |||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  34842024 actccaccatcttgaatgagtagagttgttatttcaaaaattgtctacgagctaaagattttgtcatgtacaatggctccaacttagcccacatcgatgt 34842123  T
Q  187 c 187  Q
    |    
T  34842124 c 34842124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22133986 - 22134198
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  22133986 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 22134085  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22134086 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatataaaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 22134185  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  22134186 ttgctacttctct 22134198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22782106 - 22782318
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  22782106 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 22782205  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22782206 aatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 22782305  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  22782306 ttgctacttctct 22782318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 12402469 - 12402668
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  12402469 tcatccttaagttgcacctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgactccaccatcctgaatg 12402568  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12402569 agtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcacggttggttcctttgc 12402668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 16933517 - 16933729
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  16933517 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctg 16933616  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16933617 aatgagtagagtcgttgttttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 16933716  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  16933717 ttgctacttctct 16933729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22046084 - 22046296
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  22046084 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 22046183  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  22046184 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaaatttgcccacatcgatgccgaggttgcttact 22046283  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  22046284 ttgctacttctct 22046296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 11007937 - 11008149
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  11007937 atcctcatcctcaagtcgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 11008036  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  11008037 aatgagtagattcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatcttttcccacatcgatgccgcggttgcttcct 11008136  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  11008137 ttgctacttctct 11008149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 9175841 - 9176053
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |    
T  9175841 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgagtcttccatcctg 9175940  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9175941 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatcagccaaagactttgtcatatacaaagattcccacttttcccacatcgatgtcgtggttgcttcct 9176040  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  9176041 ttgctacttctct 9176053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 12395233 - 12395440
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||     
T  12395233 tcatcctcaagttactcctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgattccaccatcctgaatg 12395332  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12395333 agtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttttca-atacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcacggttggctcctttgc 12395431  T
Q  205 tactcctct 213  Q
    |||| ||||    
T  12395432 tacttctct 12395440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 12400195 - 12400402
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||     
T  12400195 tcatcctcaagttactcctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgattccaccatcctgaatg 12400294  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12400295 agtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttttca-atacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcacggttggctcctttgc 12400393  T
Q  205 tactcctct 213  Q
    |||| ||||    
T  12400394 tacttctct 12400402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 52094695 - 52094888
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| | |||||||||  |||| |||    
T  52094695 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgtcaattgctccatcacggtctttgaatccaccatcttgaatgagt 52094794  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  52094795 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgccgcggtaggttcctt 52094888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47563701 - 47563507
Alignment:
Q  19 cacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttac 118  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||||| |    
T  47563701 cacctcaatgctctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggcctttaaatttaccatcttgaatgagtaaagttgttgc 47563602  T
Q  119 tttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  47563601 tttaggaattgtcgatgagccaacgactttgtcatatacaaagattccaacttttcccacatcgatgtcgcggttgtatcctttgctacttctct 47563507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5872650 - 5872457
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||| |||    
T  5872650 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccattaattgctccatcatggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5872551  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  5872550 agatttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatgcaacgactccaactttgaccacatcgacggcgcggttggttcctt 5872457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Original strand, 18536898 - 18537079
Alignment:
Q  25 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagg 124  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||  |||| |||| ||||||| |||||||    
T  18536898 aatattttccaagtcatcaag-attctgttgaactccgcaagttgctccatgatggccttcgactcttccatcttgaatgagtaaagttgttgctttagg 18536996  T
Q  125 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  18536997 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatatacgaactttgaccacatcgatgccgcgattggttccttcgctac 18537079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 12743261 - 12743454
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  12743261 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaagattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 12743360  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    | ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12743361 atagttgtttcttaaggaattgcctataagccaaagacttggtcatatacaatgatttcaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttcctt 12743454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5136927 - 5136734
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  5136927 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5136828  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5136827 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 5136734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Original strand, 36920884 - 36921071
Alignment:
Q  18 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtta 117  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  |||| |||| |||||||     
T  36920884 gcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttg 36920983  T
Q  118 ctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  36920984 ctttaagacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcaaactttgaccacatcgatgccgcgattggatcctttgct 36921071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8394253 - 8394060
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  8394253 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 8394154  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8394153 agagttgttgcttgaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 8394060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 3578083 - 3578263
Alignment:
Q  21 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactt 120  Q
    ||||||| |||||||| | |||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| |||    
T  3578083 cctcaatgttctccaaataatcaggaatatttttgaactctgtaagttgctccatgatggactttgtctccaccatcttgaatgagtagagttgttgctt 3578182  T
Q  121 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3578183 taaaagttggcgatgatccaaagactttgtcatatataaagactccaactttgaccacatcgatgtcgcggttggttcctt 3578263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10113802 - 10113622
Alignment:
Q  21 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactt 120  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||  ||    
T  10113802 cctcaatgttttccaaatcatcaaggattttgttgaactctgttagtcgctccatgatggcctttgactccaccgtcttgaatgagtagagttgttgatt 10113703  T
Q  121 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||    
T  10113702 taggaattgcctgtgagccaaagacttagtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatattgcggaaggttcctt 10113622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7123543 - 7123350
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  7123543 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 7123444  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  7123443 agagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcgtttggttcctt 7123350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Original strand, 22802111 - 22802308
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||| || | ||||| |||  ||||||  |||| |    
T  22802111 catcctcaagatgcaacttaatgttctcaaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccacgacgacctttgactttaccatcttgaatga 22802210  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttg 203  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22802211 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtttcctttg 22802308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Original strand, 14788807 - 14789014
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  14788807 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 14788906  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| |  || ||||||    
T  14788907 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgatctttgaccacatcgatgccgcggtagtatcttttgct 14789006  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  14789007 acttctct 14789014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16454262 - 16454055
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  || | |||| ||| |||||||| |||  ||||||  |||| |    
T  16454262 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaattagctctatggtggcctttgactttaccatcttgaatta 16454163  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  16454162 gtaaagttgttgctttaggacttgtcgatgagccaaagtctttgtcgtatacaaatattcaaaatttgaccacatcgatgtcgcggttgtatactttgct 16454063  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  16454062 acttctct 16454055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26558547 - 26558348
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||  || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  26558547 tcatcctcaagatgcacctcaatattttccaaatcttcaaggaatttgttgaactatgtgagttgctcagtgatggcctttgactccaccatcttgaatg 26558448  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||  || |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26558447 agtagagttgatgctttcgaaattgcatataagccaaggatatggtcatatacaacgactccaactttgaccatatccatgccgcggttggttcctttgc 26558348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 5206993 - 5207165
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | || |||||||  ||| |||   |||     
T  5206993 tcatccttaagatgcacctcaatgttctctaaatcataaaggattttgttgaacgtcgttagttgctccattacggtctttaacctcactatcttaaatg 5207092  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgccca 177  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5207093 agtagatttgttgatttaggatttgtctatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgccca 5207165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36379144 - 36379036
Alignment:
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  36379144 agtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgactacatcgatgccacggttggttccttcgc 36379045  T
Q  205 tactcctct 213  Q
    |||| ||||    
T  36379044 tacttctct 36379036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9225137 - 9224978
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  9225137 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 9225038  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9225037 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 9224978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4588787 - 4588623
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||| | ||| | ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  | |  | |||| |||||||||||  |||| |||    
T  4588787 tcctcaagattcacttgaatgttctcctaatcatcaacgattttgttgaactctgttaattgctctgttacagtctttgactccaccatcttgaatgagt 4588688  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaacttt 172  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  4588687 agaattgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactccaacttt 4588623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16624684 - 16624579
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || || || ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  16624684 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagtttcctatgagccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgc 16624585  T
Q  187 cgcggt 192  Q
    ||||||    
T  16624584 cgcggt 16624579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18098540 - 18098752
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  18098540 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcaaccatcctg 18098639  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18098640 aataagtagagttgttgctttaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacattgatgccgcggttggttcct 18098739  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  18098740 ttgctacttctct 18098752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 456796 - 456584
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |    
T  456796 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttg 456697  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  456696 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcct 456597  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  456596 ttgctacttctct 456584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 10957692 - 10957904
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  10957692 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 10957791  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  10957792 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatgccacggttggttcct 10957891  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  10957892 ttgctacttctct 10957904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43226966 - 43226754
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  43226966 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcttg 43226867  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43226866 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttcgttcct 43226767  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  43226766 ttgctacttctct 43226754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 4309879 - 4310091
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  4309879 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctg 4309978  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  4309979 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccatattgatgccgcggttcgttcct 4310078  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  4310079 ttgctacttctct 4310091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5192539 - 5192327
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  5192539 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctcaatgatggcctttgactctaccatcctg 5192440  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5192439 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgctgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcagttgcttcct 5192340  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  5192339 ttgctacttctct 5192327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11168990 - 11168783
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  11168990 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatccag 11168891  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  11168890 aatgagtagagtagttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgctgcggttgcttcct 11168791  T
Q  201 ttgctact 208  Q
     |||||||    
T  11168790 ctgctact 11168783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 6065162 - 6065374
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |    
T  6065162 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctacgatcttg 6065261  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6065262 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcgtatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 6065361  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  6065362 ttgctacttctct 6065374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5898298 - 5898091
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||       
T  5898298 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtcttcgactccaccatctta 5898199  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5898198 aatgagtagagttgttgctttaagaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggttcgttcct 5898099  T
Q  201 ttgctact 208  Q
    ||||||||    
T  5898098 ttgctact 5898091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7769440 - 7769238
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||     
T  7769440 tcatcctcaagatgcacctcaatattctccacgtcatcaaggattttttagaactccgtaagttgctccatgatagcctttgactccaccatcttgaatg 7769341  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  7769340 agtagagttgtttctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatgtcgcaattggttccttttc 7769241  T
Q  205 tac 207  Q
    |||    
T  7769240 tac 7769238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23634330 - 23634123
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  23634330 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactctataaattgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatg 23634231  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||| ||    
T  23634230 actagagttgttgctttagaaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgacctcatcgatgatgc-gttggttccttcgc 23634132  T
Q  205 tactcctct 213  Q
    |||| ||||    
T  23634131 tacttctct 23634123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 28101382 - 28101584
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |    
T  28101382 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagtagctccatgatggcctttaactttaccatcttgaatga 28101481  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28101482 gtagagttgttactttaggaattaccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcggttggttcttttgct 28101581  T
Q  206 act 208  Q
    |||    
T  28101582 act 28101584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3315566 - 3315359
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  3315566 catcctcaagatgcacctcaatgttctctaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccgtgatggcctttgactctaccatcttgaatga 3315467  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315466 ataaagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattccaactttgcacacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 3315367  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  3315366 acttctct 3315359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 23199471 - 23199664
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||| | |    
T  23199471 tcctcaagttgcacctcaatgttctctaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcatggtctttgactccaccatcttgaatgatt 23199570  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23199571 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgtcgcggttggttcctt 23199664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27421516 - 27421327
Alignment:
Q  12 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagag 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||| ||    
T  27421516 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgtaagttgctccatgatgacctttgactctaccatcttgaatgagtaaag 27421417  T
Q  112 ttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27421416 ttgttgttttaggaattgccgatgagccaaagattttgtcaataacaacgactccaactttgaccacatcaatgtcgcggttggttcctt 27421327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37407524 - 37407331
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||||||||||  |||| |||    
T  37407524 tcctcaagttgcacctcaatgttttccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttaactccaccatcttgaatgagt 37407425  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  37407424 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacattgatgccgcggttggttcctt 37407331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 5259655 - 5259848
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  5259655 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactctgccaattgctccatcaaggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5259754  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  5259755 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatagatgccgcggttggttcctt 5259848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42991183 - 42990981
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||  |||||| || ||||||| |||  |||||   |||| |    
T  42991183 catcctcaagtcgcaacttaatgttctccaaatcagcaatgattttgttgaactccacaagcagctccaagaaggcctttgactttaccatattgaatga 42991084  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42991083 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatataaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttcgttcctttgct 42990984  T
Q  206 act 208  Q
    |||    
T  42990983 act 42990981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Original strand, 43422844 - 43423049
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||  ||| |    
T  43422844 catcctcaagatgcacctcaatgttcttcaaatcaccaatgattttgttgaactcgacaagtagctccatgatggcctttgactttacaatcc--aatga 43422941  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  43422942 gtaaagttgttgatttgggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgtaacctttgct 43423041  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  43423042 acttctct 43423049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10210036 - 10209843
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  10210036 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10209937  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10209936 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaatgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 10209843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 22834341 - 22834534
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  | | || ||||||||||||||||  |||| | |    
T  22834341 tcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactccgtcaattgctctgtcacggtctttaactccaccatcttgaatgaat 22834440  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  22834441 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttggttcctt 22834534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 4600052 - 4600245
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||| || | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  4600052 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctctatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 4600151  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4600152 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 4600245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10057080 - 10056887
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  10057080 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10056981  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10056980 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10056887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10059302 - 10059109
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||||| |||||||||  |||| |||    
T  10059302 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttaaatccaccatcttgaatgagt 10059203  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10059202 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10059109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10061524 - 10061331
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  10061524 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10061425  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10061424 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10061331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10063746 - 10063553
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  10063746 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10063647  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10063646 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10063553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10065968 - 10065775
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  10065968 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10065869  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10065868 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10065775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29811704 - 29811511
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  29811704 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 29811605  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |||||| || |  ||||| ||||||||    
T  29811604 agagttgttgcttaaggaattgcttatgagccaaagacctggttatatacaatgactccaactttgaccacatggacgctgcggtaggttcctt 29811511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6717348 - 6717155
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  6717348 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctctatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 6717249  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||  ||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6717248 agagttgtcgcttaaggaaatgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 6717155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7763106 - 7762913
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||   ||| | |    
T  7763106 tcctcaagttgcacctcaatgttctcaaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttaaatgaat 7763007  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  7763006 agagttgttgcttaaagaattgcttatgagccaaagacttggtcatatataatgactccaactttgaccacatcgattccgcggttagttcctt 7762913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 9635456 - 9635649
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| | || |||| | | |||||||  |||| |||    
T  9635456 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactacgccaattgctccatcacggtctttgaatgcaccatcttgaatgagt 9635555  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||    
T  9635556 agatttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacggctccaactttgaccacgtagatgccgcggttggttcctt 9635649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Original strand, 53917048 - 53917245
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||   ||| |    
T  53917048 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggtctttgactttaccatcttaaatga 53917147  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttg 203  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  53917148 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcagttgtttcctttg 53917245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Original strand, 1619882 - 1620049
Alignment:
Q  39 catcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   | |  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  1619882 catcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggattttgt-tgcttcatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattaccaatgagc 1619980  T
Q  139 caaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |||| |||||    
T  1619981 caaagactttgtcatatgcaaagactccaactttgaccacatcgatgccgcagtttgtaccttcgctac 1620049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25634703 - 25634589
Alignment:
Q  64 aagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagat 163  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  25634703 aagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgtggctttaggaattgctgatgagtcaaagactttgtcatatataaagac 25634604  T
Q  164 tccaactttgcccac 178  Q
    || ||||||| ||||    
T  25634603 tctaactttgaccac 25634589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 15830573 - 15830767
Alignment:
Q  7 atcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataag 106  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    | || |||| |||||||||||   ||| ||    
T  15830573 atcctcaagatgcgcctcaatgttctctaaatcatcaaggattttgttgaactctgttggttgctctgctacggtctttgactccaccatcttaaatgag 15830672  T
Q  107 tagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    || |||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  15830673 taaagttcttgctttaggaattgcctatgaaccatagacttagtcatatacaataactccaactttgaccacctcgatgtcgtggtaggttcctt 15830767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32891925 - 32891752
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||   | | || |||| ||||||||| |   ||| |||    
T  32891925 tcctcaagatccacctcaatgttctccaaatcatcatggattttgttgaaccccgttaattgctttgtcacggtctttgactccaccaccttaaatgagt 32891826  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 181  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  32891825 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatc 32891752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 15822015 - 15822169
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  | | || |||| ||||||||||    ||      
T  15822015 tcatcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcattaaggattttgttgaacttcgttagttgctctgttaaggtctttgactccaccattttaaacg 15822114  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaa 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  15822115 agtagagttgttgctttaggaattacatatgagctaaagacttagtcatatacaa 15822169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 53598011 - 53597915
Alignment:
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53598011 agtagagttcttgctttagaaattgccgatgaggtaaagactttgtcatatacaaagacttcaattttgaccacatcgatgccgcggttgattcctt 53597915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 32479681 - 32479846
Alignment:
Q  20 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 119  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  32479681 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 32479780  T
Q  120 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 185  Q
    | | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32479781 tcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 32479846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 8516435 - 8516607
Alignment:
Q  20 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 119  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  8516435 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 8516534  T
Q  120 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    | | || ||||| |||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8516535 tcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatataatgactctaactttgcccacatcgatgccgcggt 8516607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Original strand, 23409743 - 23409857
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || || || |||| ||| ||||| |     
T  23409743 actccaccatcttaaataagtagagttgttgcttaaggagttgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactcaaaatttgaccatatcgacgc 23409842  T
Q  187 cgcggttggttcctt 201  Q
    |||||| ||||||||    
T  23409843 cgcggtaggttcctt 23409857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Original strand, 30844876 - 30845049
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    ||||||| || ||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||  ||  | |||||||| | |||| |||    
T  30844876 tcctcaattttcacttcaatgtgcaccaaatcatcaaggattttgttgaactttgtcaattgctctatgatggttttagattccaccattctgaatgagt 30844975  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 181  Q
    |||||| ||   | | |||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| || |||||| || ||||||||    
T  30844976 agagtttttgtatgatgaattgtctatgagccaatgacttggttatatacaacgactccaacctttcccacatc 30845049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23036 - 22824
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  23036 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 22937  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  22936 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcct 22837  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  22836 ttgctacttctct 22824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 21520063 - 21520275
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  21520063 atcctcatccttaagttgcaccttaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcatttaactccaccatccta 21520162  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21520163 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttggccacatcgatgctgcggttggttcct 21520262  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  21520263 ttgctacttctct 21520275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 35217339 - 35217551
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  35217339 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 35217438  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35217439 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatataaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 35217538  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  35217539 ttgctacttctct 35217551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 36560510 - 36560722
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  36560510 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 36560609  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  36560610 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcct 36560709  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  36560710 ttgctacttctct 36560722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 19503705 - 19503917
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  19503705 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctatcatcctg 19503804  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19503805 aatgagtagagtcattgctttaggaattgccgatgaggcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 19503904  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  19503905 ttgctacttctct 19503917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 22405317 - 22405511
Alignment:
Q  19 cacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttac 118  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| | ||| |    
T  22405317 caccttaatattctctaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagaatcgttgc 22405416  T
Q  119 tttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 213  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22405417 tttaggaattgctgataagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttccttcgctacttctct 22405511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 6263528 - 6263723
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  6263528 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaactgttttgttgaactccataagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatga 6263627  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6263628 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatatctgaactttgaccacatcgatgccgcggttgtttcctt 6263723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 28569798 - 28569994
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||     
T  28569798 tcatcctcaagatgcaccttaatagtcttcatgtcttcaaggattttgttgaactccgtaagttgatccatgatggcctttgactctaccatcttgaatg 28569897  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    |||| |||| ||  |||||||  || |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||    
T  28569898 agtaaagtttttgttttaggatctgtcgatgagctaaagatttggtcatataccacgactccaactttgatcatatcgattccgcggttggttcctt 28569994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 34574631 - 34574733
Alignment:
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34574631 agtagagttgttgcatttggaattgcctatgagccaaaggctttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatgccgcggttggttcctttgc 34574730  T
Q  205 tac 207  Q
    |||    
T  34574731 tac 34574733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Original strand, 19348631 - 19348790
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | || ||| |     
T  19348631 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtct 19348730  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348731 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 19348790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 42019221 - 42019368
Alignment:
Q  7 atcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataag 106  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||   |||       
T  42019221 atccttaagatgcacctcaatgttctccaagtcatcatggattttgttgaactttgttagttactccacgatgacctttgactccaccatcttaaatgta 42019320  T
Q  107 tagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcata 154  Q
    || ||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  42019321 taaagttggtgttttaggaattgcctataagccaaagacttggtcata 42019368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 25403058 - 25403163
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 186  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  25403058 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgc 25403157  T
Q  187 cgcggt 192  Q
    ||||||    
T  25403158 cgcggt 25403163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23079146 - 23079048
Alignment:
Q  87 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 185  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  23079146 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatg 23079048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2736956 - 2736856
Alignment:
Q  53 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |  ||| |||||||||| |   | |||||||||||||  || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2736956 ttgaactccgtcagttgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaaattgcctatgtgccaaagacttggtca 2736857  T
Q  153 t 153  Q
    |    
T  2736856 t 2736856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 534 - 322
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  534 atcctcatcctcaagtttcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 435  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  434 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaaggctttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccacggttgcttcct 335  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  334 ttgctacttctct 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34460 - 34248
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  34460 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgtttaactccgtgagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctg 34361  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  34360 aatgagtggagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgttgttgtttcct 34261  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  34260 ttgctacttctct 34248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33309799 - 33309587
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  33309799 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctg 33309700  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||    
T  33309699 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgctgcggttgcttcct 33309600  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  33309599 ttgctacttctct 33309587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 26931932 - 26932144
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |    
T  26931932 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcttg 26932031  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26932032 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccacaacgatgccgcggttgcttcct 26932131  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  26932132 ttgctacttctct 26932144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 26067764 - 26067971
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |    
T  26067764 atcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggatttttttgaactccgtaagttgctcaatgatggcctttgactcttccatcctg 26067863  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26067864 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgctgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 26067963  T
Q  201 ttgctact 208  Q
    ||||||||    
T  26067964 ttgctact 26067971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 25462838 - 25463040
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  25462838 tcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaagattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatg 25462937  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||| |||| ||||||| || ||    
T  25462938 agtagagttgttgctttaggaattgccgatgagcctaagactttgtcatatacaaagactataactttaactacatcgatgccgcgtttggttctttcgc 25463037  T
Q  205 tac 207  Q
    |||    
T  25463038 tac 25463040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Original strand, 12936624 - 12936824
Alignment:
Q  7 atcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataag 106  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||    
T  12936624 atcctcaatatgcacctcaatagtctttaagtcatcaaggattttgttaaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttaaatgag 12936723  T
Q  107 tagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgcta 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  12936724 tagagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagattttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatggcgcggttggttctttcgcta 12936823  T
Q  207 c 207  Q
    |    
T  12936824 c 12936824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17012948 - 17012766
Alignment:
Q  25 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||| ||    
T  17012948 aatattctccaagtcatcaaggatttt-ttgaactccgcaagtttctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttttgg 17012850  T
Q  125 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17012849 aattgccgatgagccaaagactttatcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcagttggttcctttgctact 17012766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 5408402 - 5408595
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  5408402 tcctcaagttgcacctcaatgatctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5408501  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5408502 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgtcgcggttagttcctt 5408595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 5412727 - 5412920
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  5412727 tcctcaagttgcacctcaatgatctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5412826  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5412827 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgtcgcggttagttcctt 5412920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12158157 - 12157961
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||     
T  12158157 tcatccacaagatgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggatcttgttgaactctgtaagtttctccatggtggtctttgactccaccatcttgaatg 12158058  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12158057 agtagagtgcttgctttaggaattgccaatgagccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgtcgcgtttggttcctt 12157961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 15533976 - 15534178
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||  |||| |    
T  15533976 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgtcgaactccacaagtagctccatgatggtttttgactctaccatcttgaatga 15534075  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534076 gtaaagttgttgctttaggacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 15534175  T
Q  206 act 208  Q
    |||    
T  15534176 act 15534178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16553511 - 16553318
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  16553511 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 16553412  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16553411 agagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 16553318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16630067 - 16629874
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  16630067 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 16629968  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16629967 agagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 16629874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 12910948 - 12911093
Alignment:
Q  7 atcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataag 106  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  12910948 atcctcaatatgcacctcaatagtctttaagtcatcaaggattttgttaaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttgaatgag 12911047  T
Q  107 tagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 152  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12911048 tagagttgttgctttaggaattcccaatgagccaaagactttgtca 12911093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16651775 - 16651578
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatat-tctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  ||||    
T  16651775 tcatcctcaagttgcacctcaatgtgtctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaat 16651676  T
Q  104 aagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
     |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16651675 gagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 16651578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34165719 - 34165526
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||    
T  34165719 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 34165620  T
Q  108 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34165619 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 34165526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3395238 - 3395094
Alignment:
Q  69 gctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaa 168  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395238 gctccgtgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaa 3395139  T
Q  169 ctttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 213  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3395138 ctttgcacacatcgatgcggcggttggttcctttgccacttctct 3395094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30444199 - 30443998
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    |||| |||||| | ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||   |||     
T  30444199 tcatgctcaagatacacctcaatgttctccaaattataaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggtgtataaatccatcatcttaaatg 30444100  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 204  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  30444099 agtagagttgtggctttagaaattgtctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgccgtggttggttccttcgc 30444000  T
Q  205 ta 206  Q
    ||    
T  30443999 ta 30443998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 3631312 - 3631519
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  |    
T  3631312 atccacatcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttattgaactctacaagtagctccatgatggcctttgactttaccatcttg 3631411  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||| |||| || ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||    
T  3631412 aatgagtaaagttattgctttaggaattgttgatgagtcaaagactttgtcatatacaaagcttccaactttggccacatcgatgctgcggtggattcct 3631511  T
Q  201 ttgctact 208  Q
    | ||||||    
T  3631512 tcgctact 3631519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26944403 - 26944229
Alignment:
Q  32 tccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgcc 131  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  ||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||  |||| | || ||||||  |||||||||||| |    
T  26944403 tccaagttatcaaggattctgttgaactccacaaagttctctatgatggcctttgactctaccatcttgaattattaaagttgtcgctttaggaattgtc 26944304  T
Q  132 gatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgcta 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26944303 gataagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatggcgcggttggttccttcgcta 26944229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16567821 - 16567733
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccat 96  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  16567821 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccat 16567733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14738305 - 14738146
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||  |||||| ||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  14738305 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagatcgatttagactccatcatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 14738206  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  14738205 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgccaacatcgatgccgcggt 14738146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33331172 - 33331027
Alignment:
Q  40 atcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagcc 139  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||||    
T  33331172 atcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagcc 33331073  T
Q  140 aaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 185  Q
    ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33331072 aaagatttcatcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 33331027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 72886 - 73098
Alignment:
Q  1 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  72886 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactctgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctg 72985  T
Q  101 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  72986 aatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatagatgccgcagttcgttcct 73085  T
Q  201 ttgctactcctct 213  Q
    |||||||| ||||    
T  73086 ttgctacttctct 73098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Original strand, 26284 - 26466
Alignment:
Q  25 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||| ||    
T  26284 aatattctccaagtcatcaaggatttt-ttgaactccgcaagtttctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttttgg 26382  T
Q  125 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26383 aattgccgatgagccaaagactttatcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcagttggttcctttgctact 26466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 80771 - 80564
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  80771 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 80672  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  80671 gtaaagttgttgctttaggactttccgttgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatggcgcggttgtttcctttgct 80572  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  80571 acttctct 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 115433 - 115245
Alignment:
Q  13 aagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagt 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | || |||| | |||||||||  |||| ||||||||    
T  115433 aagtttcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactctgtcaattgctccatcacggtctttgaatccaccatcttgaatgagtagagt 115334  T
Q  113 tgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 201  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  115333 tgttgcttaaggaattgtctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactacaactttgaccacgtcgatgccgcggttggttcctt 115245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50923 - 50716
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  50923 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 50824  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| |  || ||||||    
T  50823 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgatctttgaccacatcgatgccgcggtagtatcttttgct 50724  T
Q  206 actcctct 213  Q
    ||| ||||    
T  50723 acttctct 50716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Original strand, 826 - 1025
Alignment:
Q  6 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 105  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  826 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagcaccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 925  T
Q  106 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 205  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  926 gtaaagttgttgctttaggactttccgataagccaaagactttgtcatatacaaaaattcaaaatttgaccacatcgatgacgcggttgtttcctttgct 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15042 - 14883
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  15042 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 14943  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14942 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 14883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 610 - 454
Alignment:
Q  33 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 132  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | || ||||||| ||| | || |||||     
T  610 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaataaagttgttgcttcaagagttgcct 511  T
Q  133 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgc 189  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  510 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgc 454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 26746 - 26920
Alignment:
Q  5 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 104  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||| ||   ||||| |||||||||||   ||      
T  26746 tcatcctcaagatgcacatcaatgttctccaaatcatcaagaatttgtttgaactccattagttgctccaagacaacctttgactccaccatcttaaacg 26845  T
Q  105 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaca 179  Q
    ||||||| |||   |||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  26846 agtagagatgtagttttaggaattgtgtatgagccaaagaatttgtcacatacaacgactccaactttgaccaca 26920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 137
Alignment:
Q  8 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctc 72  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  201 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctc 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 149701 - 149529
Alignment:
Q  20 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 119  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  149701 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 149602  T
Q  120 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    | | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  149601 tcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacattgatgccgcggt 149529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18583 - 18518
Alignment:
Q  127 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 192  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18583 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggt 18518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University