View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18170_high_18 (Length: 350)

Name: NF18170_high_18
Description: NF18170
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18170_high_18
NF18170_high_18
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (23-350)||(20394597-20394924)
chr8 (23-350)||(22375917-22376244)
chr8 (23-349)||(23887015-23887345)
chr8 (23-350)||(22246897-22247224)
chr8 (131-350)||(22988720-22988939)
chr8 (23-350)||(18858567-18858894)
chr8 (23-350)||(22422356-22422683)
chr8 (23-350)||(23652031-23652358)
chr8 (23-350)||(17672487-17672814)
chr8 (23-350)||(20016727-20017054)
chr8 (23-350)||(21920212-21920539)
chr8 (23-350)||(22118639-22118966)
chr8 (23-350)||(22127423-22127750)
chr8 (23-350)||(30311608-30311935)
chr8 (23-350)||(22131505-22131832)
chr8 (103-350)||(21252934-21253181)
chr8 (103-350)||(21392405-21392652)
chr8 (103-350)||(21782964-21783211)
chr8 (103-350)||(21786899-21787146)
chr8 (23-350)||(19482528-19482855)
chr8 (121-350)||(15535373-15535602)
chr8 (103-350)||(19864637-19864885)
chr8 (199-350)||(19114680-19114831)
chr8 (23-350)||(19979957-19980284)
chr8 (25-350)||(22052853-22053178)
chr8 (117-350)||(29301984-29302217)
chr8 (25-349)||(23656918-23657242)
chr8 (23-350)||(32602134-32602462)
chr8 (25-350)||(21927417-21927743)
chr8 (25-350)||(20008387-20008712)
chr8 (23-350)||(22041817-22042144)
chr8 (121-350)||(16875657-16875886)
chr8 (25-350)||(19861425-19861750)
chr8 (121-350)||(21848899-21849128)
chr8 (23-350)||(21165002-21165329)
chr8 (25-350)||(21323745-21324069)
chr8 (25-338)||(31414935-31415248)
chr8 (147-349)||(20390090-20390292)
chr8 (23-169)||(6605829-6605975)
chr8 (23-317)||(16269688-16269982)
chr8 (23-169)||(28983082-28983228)
chr8 (23-169)||(28988301-28988447)
chr8 (25-350)||(31569308-31569633)
chr8 (23-198)||(4984184-4984359)
chr8 (23-167)||(22522719-22522863)
chr8 (38-317)||(27356559-27356838)
chr8 (178-350)||(20650974-20651146)
chr8 (121-317)||(22372954-22373150)
chr8 (38-206)||(14567276-14567444)
chr8 (25-96)||(19984424-19984495)
chr8 (25-95)||(20390331-20390401)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (23-350)||(22210-22536)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (23-350)||(15626438-15626765)
chr7 (31-350)||(48813290-48813608)
chr7 (23-350)||(15146914-15147242)
chr7 (23-350)||(11235243-11235570)
chr7 (23-346)||(14041612-14041935)
chr7 (23-346)||(14351642-14351965)
chr7 (23-350)||(15159087-15159414)
chr7 (23-350)||(8709518-8709845)
chr7 (121-350)||(14334309-14334538)
chr7 (23-350)||(11551132-11551459)
chr7 (121-350)||(14956467-14956696)
chr7 (182-350)||(11770430-11770598)
chr7 (28-350)||(44789386-44789708)
chr7 (23-350)||(12689415-12689742)
chr7 (25-350)||(11386439-11386764)
chr7 (23-350)||(10872603-10872930)
chr7 (25-350)||(12204810-12205135)
chr7 (23-349)||(15380-15706)
chr7 (121-350)||(7825813-7826042)
chr7 (25-350)||(13675366-13675691)
chr7 (25-350)||(15342345-15342670)
chr7 (29-350)||(19149125-19149445)
chr7 (121-350)||(27105902-27106131)
chr7 (121-350)||(27172194-27172423)
chr7 (25-350)||(15100613-15100938)
chr7 (29-350)||(20748524-20748844)
chr7 (23-350)||(18179658-18179985)
chr7 (25-350)||(14262255-14262579)
chr7 (25-308)||(14139635-14139918)
chr7 (29-283)||(13688021-13688275)
chr7 (25-350)||(16070307-16070630)
chr7 (23-335)||(26092806-26093118)
chr7 (23-317)||(26116598-26116892)
chr7 (25-350)||(16948482-16948807)
chr7 (25-317)||(13966678-13966970)
chr7 (25-169)||(18051963-18052107)
chr7 (23-335)||(49154230-49154542)
chr7 (25-335)||(13023286-13023596)
chr7 (25-206)||(11301223-11301404)
chr7 (25-350)||(14284386-14284711)
chr7 (23-259)||(18588201-18588437)
chr7 (25-169)||(23503880-23504024)
chr7 (259-350)||(14213587-14213678)
chr7 (273-350)||(8200541-8200618)
chr7 (25-350)||(19614589-19614914)
chr7 (305-350)||(13687977-13688022)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (23-350)||(2854-3181)
scaffold0647 (23-350)||(7683-8010)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (49-350)||(9084-9385)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (23-350)||(20466302-20466629)
chr5 (23-350)||(23473083-23473410)
chr5 (23-350)||(26736930-26737257)
chr5 (23-350)||(21337497-21337824)
chr5 (38-350)||(21408993-21409302)
chr5 (23-350)||(37289699-37290026)
chr5 (23-349)||(19771817-19772143)
chr5 (23-350)||(14997942-14998269)
chr5 (23-350)||(22331090-22331417)
chr5 (23-350)||(41772698-41773025)
chr5 (23-350)||(22136524-22136851)
chr5 (23-350)||(27612210-27612537)
chr5 (23-350)||(40710636-40710963)
chr5 (103-350)||(25428289-25428536)
chr5 (23-350)||(27520262-27520589)
chr5 (23-350)||(16358358-16358685)
chr5 (23-350)||(34568350-34568677)
chr5 (23-349)||(22349776-22350102)
chr5 (23-347)||(27683603-27683927)
chr5 (23-350)||(29474276-29474603)
chr5 (121-350)||(27666791-27667020)
chr5 (23-350)||(18780970-18781297)
chr5 (121-350)||(21935489-21935718)
chr5 (121-350)||(23507522-23507751)
chr5 (25-350)||(28893147-28893472)
chr5 (25-350)||(28921973-28922298)
chr5 (28-308)||(21562232-21562512)
chr5 (23-350)||(20801253-20801580)
chr5 (25-346)||(20777755-20778076)
chr5 (25-350)||(22234125-22234450)
chr5 (121-350)||(24583048-24583277)
chr5 (23-335)||(25849928-25850240)
chr5 (23-167)||(37541584-37541728)
chr5 (25-350)||(22463789-22464114)
chr5 (47-350)||(28914640-28914943)
chr5 (47-350)||(28929908-28930211)
chr5 (23-317)||(20344153-20344447)
chr5 (25-350)||(20823291-20823616)
chr5 (23-335)||(22504532-22504844)
chr5 (23-207)||(24796600-24796784)
chr5 (23-169)||(14885194-14885340)
chr5 (25-306)||(17267539-17267820)
chr5 (254-350)||(21679212-21679308)
chr5 (310-350)||(23442064-23442104)
chr5 (225-348)||(24618700-24618823)
chr5 (225-348)||(24714931-24715054)
chr5 (225-348)||(24747959-24748082)
chr5 (282-350)||(23505082-23505150)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (50-350)||(1900-2200)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (23-350)||(14503-14830)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (23-350)||(5067-5393)
scaffold0074 (25-230)||(11196-11401)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (23-350)||(10765-11092)
scaffold0018 (28-350)||(16962-17284)
scaffold0018 (49-350)||(24348-24649)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (23-350)||(24818791-24819118)
chr2 (23-350)||(30010745-30011072)
chr2 (23-350)||(27372824-27373151)
chr2 (23-335)||(30209478-30209790)
chr2 (23-350)||(24711589-24711916)
chr2 (23-350)||(23073418-23073745)
chr2 (23-350)||(41606946-41607273)
chr2 (23-350)||(10870405-10870732)
chr2 (23-350)||(23106289-23106616)
chr2 (23-350)||(24875311-24875638)
chr2 (25-350)||(23112291-23112616)
chr2 (23-350)||(24263925-24264252)
chr2 (25-350)||(23098581-23098906)
chr2 (23-350)||(16926915-16927242)
chr2 (23-350)||(17000555-17000882)
chr2 (23-350)||(21143602-21143929)
chr2 (43-350)||(22734355-22734662)
chr2 (23-350)||(27219571-27219898)
chr2 (23-350)||(44384131-44384458)
chr2 (23-350)||(9485771-9486098)
chr2 (187-350)||(22323581-22323744)
chr2 (136-350)||(24706156-24706370)
chr2 (43-350)||(21323847-21324154)
chr2 (29-350)||(23189474-23189794)
chr2 (23-350)||(24677044-24677371)
chr2 (121-350)||(24829847-24830076)
chr2 (236-350)||(45534495-45534609)
chr2 (49-341)||(23278340-23278632)
chr2 (23-278)||(9337209-9337464)
chr2 (23-169)||(1065487-1065633)
chr2 (25-350)||(19650613-19650938)
chr2 (25-350)||(27789295-27789620)
chr2 (38-350)||(12575908-12576220)
chr2 (25-341)||(24950154-24950470)
chr2 (131-350)||(22279660-22279879)
chr2 (23-317)||(31832246-31832540)
chr2 (190-350)||(25264609-25264769)
chr2 (25-170)||(25255654-25255799)
chr2 (181-341)||(23295499-23295659)
chr2 (269-350)||(12639040-12639121)
chr2 (25-317)||(19717580-19717872)
chr2 (269-350)||(27208979-27209060)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (23-350)||(24557-24884)
scaffold0011 (25-350)||(150524-150849)
scaffold0011 (292-350)||(181879-181937)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (23-350)||(3869-4196)
scaffold0010 (23-335)||(40357-40669)
scaffold0010 (25-200)||(45453-45628)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (30-345)||(494978-495293)
scaffold0001 (25-350)||(453239-453564)
scaffold0001 (25-335)||(515379-515689)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (30-350)||(14423-14743)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (23-350)||(5913-6240)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (43-350)||(14849147-14849454)
chr4 (31-350)||(14696037-14696356)
chr4 (23-350)||(23957671-23957998)
chr4 (23-350)||(8051384-8051711)
chr4 (23-350)||(27713260-27713587)
chr4 (25-350)||(8707835-8708160)
chr4 (23-350)||(12478524-12478851)
chr4 (23-350)||(19776554-19776881)
chr4 (23-350)||(40474964-40475291)
chr4 (23-350)||(14301740-14302067)
chr4 (136-350)||(14682491-14682705)
chr4 (23-350)||(18225207-18225534)
chr4 (23-341)||(14161403-14161721)
chr4 (29-350)||(15145652-15145973)
chr4 (23-350)||(8388336-8388663)
chr4 (121-350)||(15323141-15323370)
chr4 (187-347)||(18613749-18613909)
chr4 (25-338)||(15072295-15072608)
chr4 (23-315)||(44659887-44660179)
chr4 (23-278)||(16234753-16235008)
chr4 (25-350)||(15001388-15001712)
chr4 (23-278)||(17092910-17093165)
chr4 (121-350)||(15291277-15291506)
chr4 (25-350)||(51604815-51605140)
chr4 (23-335)||(3262815-3263127)
chr4 (28-350)||(16149635-16149957)
chr4 (28-350)||(16153781-16154103)
chr4 (244-350)||(1640322-1640428)
chr4 (23-181)||(16218323-16218481)
chr4 (23-181)||(16221643-16221801)
chr4 (23-169)||(29451558-29451704)
chr4 (25-350)||(1647300-1647625)
chr4 (25-350)||(15357143-15357468)
chr4 (25-350)||(27902310-27902635)
chr4 (286-350)||(29037428-29037492)
chr4 (23-206)||(11205253-11205436)
chr4 (25-212)||(15257990-15258177)
chr4 (292-350)||(14999239-14999297)
chr4 (23-89)||(23443290-23443356)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (28-349)||(22661-22982)
scaffold0042 (23-350)||(37844-38171)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (23-350)||(15245-15572)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (23-350)||(16832-17158)
scaffold0040 (286-350)||(111775-111839)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (29-350)||(15261173-15261494)
chr3 (38-350)||(15014031-15014343)
chr3 (23-350)||(17491393-17491720)
chr3 (23-350)||(10007143-10007470)
chr3 (23-350)||(15346505-15346832)
chr3 (23-350)||(15723194-15723521)
chr3 (23-350)||(48426990-48427317)
chr3 (23-350)||(10907753-10908080)
chr3 (23-350)||(13254233-13254560)
chr3 (23-350)||(20060314-20060641)
chr3 (121-294)||(11889638-11889811)
chr3 (23-350)||(5108871-5109198)
chr3 (23-350)||(16805207-16805534)
chr3 (23-350)||(3687486-3687813)
chr3 (23-350)||(5423190-5423517)
chr3 (23-350)||(12888252-12888579)
chr3 (31-350)||(15400785-15401104)
chr3 (23-350)||(16637316-16637643)
chr3 (121-350)||(15340812-15341041)
chr3 (23-350)||(15587652-15587979)
chr3 (23-350)||(16754961-16755288)
chr3 (103-350)||(14874839-14875086)
chr3 (23-350)||(53383278-53383605)
chr3 (121-350)||(6602279-6602508)
chr3 (25-350)||(11950159-11950484)
chr3 (121-350)||(12499791-12500020)
chr3 (25-350)||(15229156-15229481)
chr3 (25-350)||(15235024-15235349)
chr3 (121-350)||(16693707-16693936)
chr3 (121-350)||(30139359-30139588)
chr3 (121-350)||(30148910-30149139)
chr3 (25-350)||(17187927-17188252)
chr3 (121-350)||(8272757-8272986)
chr3 (25-350)||(12358778-12359103)
chr3 (23-335)||(28755886-28756198)
chr3 (121-350)||(13965710-13965940)
chr3 (121-350)||(15611656-15611885)
chr3 (23-207)||(47125640-47125824)
chr3 (40-335)||(11959435-11959730)
chr3 (38-341)||(31693449-31693752)
chr3 (25-350)||(10418296-10418621)
chr3 (25-206)||(18132597-18132778)
chr3 (25-350)||(41179075-41179400)
chr3 (25-169)||(13943758-13943902)
chr3 (25-169)||(44778981-44779125)
chr3 (25-167)||(16379179-16379321)
chr3 (121-329)||(15948828-15949036)
chr3 (38-341)||(31940465-31940768)
chr3 (121-350)||(6151211-6151440)
chr3 (25-350)||(13970371-13970696)
chr3 (25-350)||(14088226-14088551)
chr3 (25-350)||(16834761-16835086)
chr3 (23-151)||(10407720-10407848)
chr3 (25-350)||(16327911-16328236)
chr3 (25-233)||(12269880-12270088)
chr3 (130-350)||(25767871-25768091)
chr3 (23-110)||(11888614-11888701)
chr3 (219-350)||(12179891-12180022)
chr3 (25-95)||(8745641-8745711)
chr3 (38-92)||(12510747-12510801)
chr3 (25-79)||(14291783-14291837)
chr3 (25-95)||(24189112-24189182)
chr3 (25-169)||(13318753-13318897)
chr3 (25-80)||(12180167-12180222)
chr3 (288-350)||(12795789-12795851)
chr3 (25-79)||(16826532-16826586)
chr3 (23-71)||(14579668-14579716)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (25-296)||(23085939-23086210)
chr6 (47-349)||(23080258-23080560)
chr6 (43-350)||(20634126-20634433)
chr6 (148-350)||(18196024-18196226)
chr6 (117-350)||(18406204-18406437)
chr6 (161-350)||(18965599-18965788)
chr6 (23-350)||(24293948-24294275)
chr6 (23-349)||(22760621-22760947)
chr6 (117-350)||(25608121-25608354)
chr6 (56-350)||(18450291-18450585)
chr6 (23-350)||(2872969-2873296)
chr6 (23-350)||(22828521-22828848)
chr6 (121-350)||(28261461-28261690)
chr6 (121-350)||(28284226-28284455)
chr6 (121-350)||(28340210-28340439)
chr6 (23-350)||(25114340-25114667)
chr6 (136-350)||(16961761-16961975)
chr6 (23-350)||(5837385-5837712)
chr6 (61-350)||(19487486-19487765)
chr6 (136-350)||(27564112-27564326)
chr6 (23-350)||(16925804-16926131)
chr6 (43-350)||(27189224-27189531)
chr6 (43-350)||(27259709-27260016)
chr6 (23-165)||(18963254-18963396)
chr6 (25-350)||(14378084-14378409)
chr6 (25-350)||(14379634-14379959)
chr6 (121-350)||(16380637-16380866)
chr6 (121-350)||(16648233-16648462)
chr6 (121-350)||(19866475-19866704)
chr6 (133-350)||(22435657-22435874)
chr6 (133-350)||(22444055-22444272)
chr6 (25-341)||(19454821-19455137)
chr6 (103-350)||(25763474-25763721)
chr6 (25-350)||(25769632-25769957)
chr6 (25-341)||(21473398-21473713)
chr6 (25-350)||(18796478-18796803)
chr6 (121-350)||(23998036-23998265)
chr6 (23-209)||(24366341-24366527)
chr6 (121-350)||(1647078-1647307)
chr6 (25-350)||(15461124-15461449)
chr6 (25-169)||(28280981-28281125)
chr6 (23-153)||(18183533-18183663)
chr6 (25-350)||(19436790-19437115)
chr6 (25-350)||(19881086-19881411)
chr6 (25-335)||(10467017-10467327)
chr6 (25-95)||(24516576-24516646)
chr6 (25-169)||(21568159-21568303)
chr6 (224-350)||(5295573-5295699)
chr6 (281-350)||(19985840-19985909)
chr6 (130-350)||(14130257-14130477)
chr6 (254-350)||(16099797-16099893)
chr6 (254-350)||(18577997-18578093)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (34-350)||(27283-27598)
scaffold0058 (25-290)||(21135-21400)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (23-350)||(7975-8302)
scaffold0120 (130-350)||(24131-24351)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (23-350)||(217444-217771)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (25-350)||(201494-201819)
scaffold0004 (25-350)||(324659-324984)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (38-350)||(84558-84870)
scaffold0007 (25-350)||(268563-268888)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (22-342)||(960-1280)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (31-350)||(3536-3855)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (29-350)||(839-1160)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (23-350)||(91-418)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (23-350)||(3387-3714)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (23-350)||(5826-6153)
scaffold0270 (23-350)||(12956-13283)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (23-350)||(103188-103515)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (22-350)||(21750879-21751207)
chr1 (23-350)||(33389122-33389449)
chr1 (23-350)||(51331586-51331913)
chr1 (118-350)||(20140022-20140254)
chr1 (23-350)||(50618491-50618818)
chr1 (103-350)||(430289-430536)
chr1 (23-350)||(21832241-21832568)
chr1 (23-350)||(21838889-21839216)
chr1 (23-349)||(21862466-21862792)
chr1 (23-350)||(22360337-22360664)
chr1 (23-350)||(16348688-16349016)
chr1 (23-350)||(17043108-17043435)
chr1 (23-350)||(41351755-41352082)
chr1 (121-350)||(19108307-19108536)
chr1 (23-350)||(21233824-21234151)
chr1 (23-350)||(24792709-24793036)
chr1 (29-234)||(16378150-16378355)
chr1 (121-350)||(20829583-20829812)
chr1 (25-350)||(20854855-20855180)
chr1 (25-350)||(21743647-21743972)
chr1 (25-350)||(20833995-20834320)
chr1 (23-335)||(31538090-31538402)
chr1 (187-350)||(21026112-21026275)
chr1 (23-349)||(22503382-22503708)
chr1 (23-335)||(48424858-48425170)
chr1 (23-335)||(52987726-52988038)
chr1 (187-350)||(41308612-41308775)
chr1 (23-169)||(38910919-38911065)
chr1 (25-350)||(19661231-19661556)
chr1 (23-209)||(37679160-37679346)
chr1 (25-317)||(21952881-21953173)
chr1 (121-338)||(20927005-20927222)
chr1 (25-317)||(20296384-20296676)
chr1 (275-350)||(16378081-16378156)
chr1 (25-350)||(20938158-20938483)
chr1 (25-95)||(24097698-24097768)
chr1 (25-80)||(19856514-19856569)
chr1 (25-80)||(41310766-41310821)
chr1 (254-341)||(23196573-23196660)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (23-350)||(16002-16328)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (23-350)||(42131-42458)
scaffold0035 (25-350)||(4704-5029)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (121-350)||(38070-38299)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (189-350)||(115171-115332)
scaffold0037 (23-124)||(115062-115163)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (23-349)||(803-1126)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (31-350)||(2537-2856)
scaffold0023 (23-350)||(86724-87050)
scaffold0023 (23-350)||(151065-151392)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (23-350)||(85254-85581)
scaffold0008 (23-347)||(85820-86144)
scaffold0008 (121-350)||(132611-132840)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (23-349)||(40588-40914)
scaffold0022 (23-349)||(74308-74634)
scaffold0022 (23-350)||(55710-56037)
scaffold0022 (121-350)||(8948-9177)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (23-350)||(7111-7438)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (29-349)||(176374-176694)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (23-350)||(8893-9220)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (103-350)||(14-261)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (25-342)||(10791-11108)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (23-350)||(17609-17931)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (23-350)||(16596-16923)
scaffold0309 (25-350)||(11748-12073)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (23-350)||(24969-25296)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (23-350)||(20193-20520)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (23-350)||(45106-45433)
scaffold0028 (23-350)||(10429-10756)
scaffold0028 (23-350)||(16891-17218)
scaffold0028 (25-350)||(48540-48865)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (23-350)||(30900-31227)
scaffold0026 (25-350)||(50765-51090)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (117-350)||(7176-7409)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (104-348)||(6436-6680)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (103-350)||(1486-1733)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (23-350)||(721-1048)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (23-350)||(16113-16440)
scaffold0044 (121-350)||(2375-2605)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (23-350)||(9321-9648)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (23-350)||(11263-11590)
scaffold0080 (136-350)||(50045-50259)
scaffold0080 (103-302)||(53638-53837)
scaffold0080 (103-350)||(30837-31084)
scaffold0080 (103-350)||(36302-36550)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (29-350)||(40108-40429)
scaffold0109 (136-350)||(14261-14476)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (103-350)||(406-652)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (103-350)||(20557-20804)
scaffold0081 (103-350)||(35981-36228)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (23-350)||(107835-108162)
scaffold0029 (25-350)||(114514-114839)
scaffold0029 (25-95)||(94920-94990)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (25-350)||(2671-2996)
scaffold0079 (23-350)||(35450-35778)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (103-350)||(8327-8574)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (103-350)||(8004-8251)
scaffold0358 (103-350)||(17200-17447)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (103-350)||(23178-23425)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (43-350)||(195531-195838)
scaffold0017 (23-350)||(57970-58297)
scaffold0017 (254-350)||(18321-18418)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (28-350)||(13240-13562)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (25-342)||(4139-4459)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (25-350)||(1824-2149)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (25-341)||(2298-2614)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (25-341)||(29311-29627)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (202-350)||(44846-44994)
scaffold0130 (67-350)||(8876-9159)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (25-349)||(50206-50530)
scaffold0067 (25-349)||(59240-59564)
scaffold0067 (25-349)||(65628-65952)
scaffold0067 (25-317)||(28610-28902)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (38-350)||(55886-56198)
scaffold0053 (25-350)||(47060-47385)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (25-349)||(5115-5439)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (25-350)||(6705-7030)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (121-350)||(25349-25578)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (121-350)||(14863-15092)
scaffold0162 (121-338)||(11296-11513)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (25-350)||(33289-33614)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (25-350)||(262179-262504)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (103-349)||(18445-18691)
scaffold0114 (25-77)||(22102-22154)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (25-350)||(19307-19632)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (25-342)||(49067-49384)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (29-350)||(49905-50226)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (25-350)||(2979-3304)
scaffold0034 (25-350)||(69325-69650)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (25-350)||(109585-109910)
scaffold0031 (28-350)||(55020-55342)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (25-350)||(99588-99913)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (23-267)||(2637-2881)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (25-349)||(16068-16392)
scaffold0266 (121-350)||(7983-8212)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (130-350)||(42213-42433)
scaffold0076 (25-95)||(54437-54507)
scaffold0076 (25-350)||(31703-32028)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (136-349)||(4150-4363)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (25-350)||(21541-21866)
scaffold0261 (25-350)||(13362-13687)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (25-341)||(1511-1827)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (103-350)||(444-691)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (25-341)||(5377-5692)
scaffold0149 (25-341)||(9808-10123)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (28-350)||(24169-24491)
scaffold0104 (25-340)||(44443-44758)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (25-335)||(250590-250900)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (25-350)||(880-1205)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (121-338)||(7120-7337)
scaffold0302 (121-338)||(178-395)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (25-350)||(10083-10408)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (145-350)||(7839-8044)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (25-350)||(53000-53325)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (25-349)||(28481-28805)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (202-350)||(3556-3704)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (130-350)||(64639-64859)
scaffold0054 (25-95)||(64545-64615)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (25-304)||(19660-19939)
scaffold0077 (121-350)||(26388-26617)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (25-350)||(182-506)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (198-350)||(28770-28922)
scaffold0215 (122-278)||(28586-28742)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (31-350)||(7969-8288)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (196-350)||(1007-1161)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (25-335)||(31345-31655)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (160-350)||(5969-6159)
scaffold0124 (219-350)||(14155-14286)
scaffold0124 (25-80)||(14431-14486)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (25-350)||(860-1185)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (29-182)||(3-156)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (157-350)||(33911-34104)
scaffold0180 (269-341)||(510-582)
scaffold0180 (269-341)||(4830-4902)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (121-350)||(34040-34269)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (25-350)||(9487-9808)
scaffold0235 (25-350)||(19701-20022)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (254-350)||(195195-195291)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (25-308)||(642-925)
scaffold0420 (25-95)||(7824-7894)
[»] scaffold2111 (2 HSPs)
scaffold2111 (31-209)||(619-797)
scaffold2111 (269-350)||(857-938)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (25-347)||(41655-41976)
scaffold0102 (43-278)||(51389-51624)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (130-350)||(949-1169)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (25-169)||(9900-10044)
scaffold0348 (25-95)||(18509-18579)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (121-349)||(2074-2302)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (25-349)||(79857-80181)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (25-308)||(10812-11095)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (25-350)||(25068-25393)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (242-349)||(3882-3989)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (121-252)||(21298-21429)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (38-350)||(40-352)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (25-233)||(572-780)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (259-350)||(23339-23430)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (248-350)||(1794-1896)
scaffold0476 (23-164)||(10307-10448)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (121-266)||(1743-1888)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (281-350)||(2219-2288)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (269-350)||(243-324)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (49-341)||(12349-12641)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (25-341)||(37612-37928)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (25-341)||(42881-43196)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (269-341)||(546-618)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (254-349)||(36069-36164)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (25-95)||(1515-1585)
scaffold0222 (25-350)||(9016-9341)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (273-350)||(20804-20881)
scaffold0090 (273-350)||(24966-25043)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (286-350)||(6940-7004)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (242-350)||(2118-2226)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (25-317)||(28921-29212)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (25-92)||(1165-1232)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (25-75)||(11188-11238)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (280-350)||(5974-6044)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (269-350)||(1838-1919)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (242-315)||(9215-9288)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (39-95)||(6185-6241)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (242-338)||(7172-7268)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (130-350)||(16013-16233)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 20394597 - 20394924
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  20394597 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcaatgatgccttttagtgctacaaa 20394696  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20394697 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgctttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 20394796  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||      
T  20394797 tctgaagaagaacatgccgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaata 20394896  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||    
T  20394897 aggtgagttttcttggccatattatttc 20394924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22375917 - 22376244
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||   || |||||||||||    ||||||    
T  22375917 atcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattattaatataaagtgatgcctttcagcattacaaa 22376016  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  22376017 tgcaccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatatttttatatactccaag 22376116  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | | ||||||||||||||     
T  22376117 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaactataaattctggttgaaat 22376216  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  22376217 agatgagttttcttggccatgttatttc 22376244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23887345 - 23887015
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  23887345 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacattacgagtattcagtgatgcctttcggtgttactaa 23887246  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23887245 tgcgccagatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaag 23887146  T
Q  223 tctgaagaagaa----aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttg 318  Q
    ||| ||||||||     |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  23887145 tctaaagaagaacatgtatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctagttg 23887046  T
Q  319 aaagacgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23887045 aatgaggtgagttttcttggccatgttattt 23887015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22246897 - 22247224
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  22246897 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 22246996  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22246997 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcctgcgtttttggatcgtttcatggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 22247096  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||||| |||| |||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||    
T  22247097 attgaaggagaacatgttgagcatttgtagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaag 22247196  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | | |||||||| |||||||||||||||    
T  22247197 aggcgagttttcatggccatgttatttc 22247224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22988939 - 22988720
Alignment:
Q  131 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22988939 gtgtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatattccaagactgaaga 22988840  T
Q  231 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 330  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22988839 agaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagt 22988740  T
Q  331 tttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22988739 tttcttggccatgttatttc 22988720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18858894 - 18858567
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  18858894 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 18858795  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  18858794 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 18858695  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18858694 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 18858595  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18858594 aagtgagttttcttggccatgttatttc 18858567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22422356 - 22422683
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  || || || || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  22422356 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 22422455  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  22422456 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactccaag 22422555  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    || ||||||||| |||   | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||| ||||||||||    
T  22422556 tccgaagaagaacatgttgaacatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattatggttgaaag 22422655  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  22422656 aggtgagtttccttggccatgttatttc 22422683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23652358 - 23652031
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  ||||||||   || ||||||    
T  23652358 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttggtgttacaaa 23652259  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  23652258 tgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatactttgatttactccaag 23652159  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23652158 actgaagaggaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaag 23652059  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||    
T  23652058 aggtaagttttcttggccatgtcatttc 23652031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 17672487 - 17672814
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  17672487 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 17672586  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  17672587 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 17672686  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17672687 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 17672786  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17672787 aagtgagttttctaggccatgttatttc 17672814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 20016727 - 20017054
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  20016727 atcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 20016826  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  20016827 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 20016926  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20016927 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 20017026  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20017027 aagtgagttttctaggccatgttatttc 20017054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 21920212 - 21920539
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||    | |||| | |||  || ||||||    
T  21920212 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgtcgttcggtgttacaaa 21920311  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  21920312 tgcacatggagtatttatggagtacatgaattgtatctttcaagcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttacttcaag 21920411  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21920412 actgaagaagaatatgctgagcatttgaagttagttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 21920511  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21920512 aagtgagctttcttggacatgttatttc 21920539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22118639 - 22118966
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22118639 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22118738  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  22118739 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 22118838  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||||||||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22118839 actgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaag 22118938  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22118939 aggtgagttttctaggccatgttatttc 22118966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22127423 - 22127750
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22127423 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22127522  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  22127523 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 22127622  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||||||||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22127623 actgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaag 22127722  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22127723 aggtgagttttctaggccatgttatttc 22127750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 30311608 - 30311935
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  30311608 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 30311707  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||    
T  30311708 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtgtttattgacgatattttaatttactccaag 30311807  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30311808 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 30311907  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  30311908 aagtaagttttcttggccatgttatttc 30311935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22131505 - 22131832
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || | |||||| || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  22131505 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 22131604  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||  |||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  22131605 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgatattttgatctactccaag 22131704  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22131705 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 22131804  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  22131805 aagtaagttttcttggccatgttatttc 22131832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21253181 - 21252934
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |  ||||| || || || |    
T  21253181 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgaggttgtttttatcgatg 21253082  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  21253081 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttctgcaagtattgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 21252982  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21252981 gtgagaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 21252934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 21392405 - 21392652
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21392405 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21392504  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  21392505 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaa 21392604  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21392605 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 21392652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 21782964 - 21783211
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21782964 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21783063  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  21783064 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaa 21783163  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21783164 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 21783211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 21786899 - 21787146
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21786899 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21786998  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  21786999 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaa 21787098  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21787099 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 21787146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 19482528 - 19482855
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  19482528 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaa 19482627  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  19482628 tgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 19482727  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19482728 actgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 19482827  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  19482828 aagtgagttttcttggtcatgttatttc 19482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15535602 - 15535373
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  15535602 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactcca 15535503  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  15535502 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 15535403  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15535402 agaagtaagttttcttggccatgttatttc 15535373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 19864637 - 19864885
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||| | ||  | ||||| |||||||| |    
T  19864637 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatctcatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatg 19864736  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttg-caagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcta 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||  | |||||  |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||    
T  19864737 atattttgatttactctaagtctgaagaagaacatattgagcatttgaaactggtttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtcta 19864836  T
Q  302 aatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19864837 agtgcgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggacatgttatttc 19864885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19114831 - 19114680
Alignment:
Q  199 gacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgt 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||    
T  19114831 gacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgt 19114732  T
Q  299 ctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19114731 ctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 19114680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19980284 - 19979957
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||  || || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  19980284 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgtagaagacaactttcagaacactgtatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 19980185  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||    
T  19980184 tgcgcctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaag 19980085  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  || || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  19980084 actgaagaagaacatgctgagaatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattatctaagtatgatttctggttgaaag 19979985  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  19979984 aggtaagttttcttggccatgttatttc 19979957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22053178 - 22052853
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  22053178 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaataccaggtgatgcctttcggtgttactaatg 22053079  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| | | | |||   ||||| | ||| |||||||| |||||  | || || |||||| |    
T  22053078 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtgggtgtattcattgatgatatcctaatttattctaagac 22052979  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |  ||     
T  22052978 tgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgttgaaatgtgaattctggttaagtgaa 22052879  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  22052878 gtgagttttcttggccacattatttc 22052853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 350
Target Start/End: Original strand, 29301984 - 29302217
Alignment:
Q  117 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 216  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |  |||||||  |||||||| || || ||||| || ||| |||| |||    
T  29301984 tacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggtatttattgatgacattctgatttac 29302083  T
Q  217 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggt 316  Q
    |||||| | |||||| || ||||  | || |||||| |||| || |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29302084 tctaagaccgaagaataacatgcagaacacttgaagattgtgttacaagtgttgaaagagaggaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggt 29302183  T
Q  317 tgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||  || || |||||||||||||| ||||||||    
T  29302184 tgagtgaagtaagttttcttggccacgttatttc 29302217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23657242 - 23656918
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  23657242 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 23657143  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||| | ||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||| |    
T  23657142 cgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctaatatattctaagac 23657043  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||     
T  23657042 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttatggttaagtgaa 23656943  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    || ||||||||||||||| ||||||    
T  23656942 gtaagttttcttggccatattattt 23656918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32602462 - 32602134
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  32602462 atcaccagattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 32602363  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  32602362 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 32602263  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattc-tggttgaaa 321  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  32602262 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattcttggttgaaa 32602163  T
Q  322 gacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||    
T  32602162 gaagtaagtttttttggccatgttatttc 32602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21927743 - 21927417
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||| || ||| ||||    
T  21927743 catcagattaaggtgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatg 21927644  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  21927643 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 21927544  T
Q  225 tgaagaagaaaatgcca-agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaaga 323  Q
    |||||||||  ||  || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||    
T  21927543 tgaagaagagcattgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtga 21927444  T
Q  324 cgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || || |||||||||||| |||||||    
T  21927443 agtaagatttcttggccatattatttc 21927417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 20008387 - 20008712
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  20008387 catcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 20008486  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| | ||| |||||  | || || ||||||      
T  20008487 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgatgatatcctaatttattctaagaa 20008586  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||     
T  20008587 tgaagaagagcatgcagagcatatgaagattgtgttgcaactgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaa 20008686  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  20008687 gtaagttttcttggccatattatttc 20008712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22042144 - 22041817
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  22042144 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 22042045  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    | |||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  22042044 ttcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatgtactccaag 22041945  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||    
T  22041944 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagcgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgagaattctggttgaaag 22041845  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||    
T  22041844 aaataagttttcttggccatgttatttc 22041817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 16875657 - 16875886
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16875657 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16875756  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16875757 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16875856  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16875857 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 16875886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19861750 - 19861425
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |  ||||| |||  || ||| ||||    
T  19861750 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatg 19861651  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||| | || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||      
T  19861650 cgcctggtgtgtttatgaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaa 19861551  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||     
T  19861550 tgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgagttgcaagtgttgaaataaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaa 19861451  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  19861450 gtaagttttcttggccatattatttc 19861425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 21848899 - 21849128
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  21848899 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 21848998  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  21848999 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgggagttttggttgaa 21849098  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21849099 ggaagtgagttttcttggtcatgtgatttc 21849128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 21165002 - 21165329
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  21165002 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaa 21165101  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  || ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| || ||||| |||    
T  21165102 tgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattcttggatcgattcgtggttgtttttatctatgatattttaatttactccaag 21165201  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || || ||||| |||||||||||||    
T  21165202 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatccaagtgtgagttctggttgaaag 21165301  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  21165302 aggtaagttttcttggccatgttatttc 21165329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 21323745 - 21324069
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  21323745 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaatgtgatgcctttcggtgttactaatg 21323844  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| || || || ||| |||| || || ||| |    
T  21323845 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttatcgatgacattctgatctattcaaagac 21323944  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  21323945 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattttgaaagag-aaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 21324043  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  21324044 gtgagttttcttggccacattatttc 21324069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 338
Target Start/End: Original strand, 31414935 - 31415248
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  31414935 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 31415034  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  31415035 cgcctggggtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagac 31415134  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
     ||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||| |  ||     
T  31415135 cgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggttaagtgaa 31415234  T
Q  325 gtgagttttcttgg 338  Q
    |||| |||||||||    
T  31415235 gtgaattttcttgg 31415248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20390292 - 20390090
Alignment:
Q  147 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 246  Q
    ||||||| | ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||||  |||||    
T  20390292 catgaatagaattttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcat 20390193  T
Q  247 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtta 346  Q
    || ||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| |  || |  ||||||||||||||| |||    
T  20390192 ttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaaaaagttgtatgccaagttgtccaaatttgaattctagttaagtgaagcaagttttcttggccatatta 20390093  T
Q  347 ttt 349  Q
    |||    
T  20390092 ttt 20390090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6605975 - 6605829
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  6605975 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 6605876  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  6605875 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 6605829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Original strand, 16269688 - 16269982
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  16269688 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 16269787  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     |  || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  16269788 cgggcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaag 16269887  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
      |||||| ||  ||||  ||||  |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16269888 aatgaagaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 16269982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28983228 - 28983082
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  28983228 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 28983129  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28983128 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 28983082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28988447 - 28988301
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  28988447 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 28988348  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28988347 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 28988301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 31569308 - 31569633
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  31569308 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 31569407  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  31569408 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagac 31569507  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| | |  ||     
T  31569508 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 31569607  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  31569608 gtgagtttccttggtcatattatttc 31569633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4984359 - 4984184
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  ||  || ||    
T  4984359 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgtaactaa 4984260  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcatt 198  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| | |||||   |||||||| |||||||||    
T  4984259 agcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcatt 4984184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22522863 - 22522719
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  22522863 atcaccagaataaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 22522764  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc 167  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22522763 tgcgccaggagtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgc 22522719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27356838 - 27356559
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  27356838 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 27356739  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 237  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||  ||    
T  27356738 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggagcat 27356639  T
Q  238 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  27356638 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttaaaagagaagaggttgtatgcgaagttgtcgaaatgtgagttctggtt 27356559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 350
Target Start/End: Original strand, 20650974 - 20651146
Alignment:
Q  178 cgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagaga 277  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || || ||||| || ||  ||||| ||||||||| | |||| ||||||||  |||| ||||    
T  20650974 cgttttgtagtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaatctgaggaggagcatgccgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggaga 20651073  T
Q  278 aaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |  |||||| ||| ||||||||||| |||||  | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20651074 accagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagatttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 20651146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22373150 - 22372954
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| | ||| |||||  | || || ||||    
T  22373150 aatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttactgatgatatcctaatttattcta 22373051  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
    ||  |||||||||  ||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  22373050 agaatgaagaagaccatgcagagcatcttaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagtggtccaaatgtgaattatggtt 22372954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14567444 - 14567276
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  14567444 tgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgtttt 14567345  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatat 206  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14567344 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatat 14567276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19984495 - 19984424
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataa 96  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  19984495 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaataa 19984424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20390401 - 20390331
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  20390401 catcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacaaata 20390331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22210 - 22536
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  22210 atcatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttcg-tgttactaa 22308  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22309 tgcaccgggtgtatttacggaatacatgaattgcatttctcatgcttatttagatcgcattgttgttgtgttcattgatgatattttgatatactctaag 22408  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  22409 tctgaagaagaacacgccaagcatttgaagattgttttgcaagtgctgcaagagaaaacgttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 22508  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  22509 aggtgagtttttttggccatattatttc 22536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15626765 - 15626438
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| || ||| ||    
T  15626765 atcaccagattaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacattacgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaa 15626666  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  15626665 tgcaccaggtgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgcgttcatcgatgatattttaatatactataag 15626566  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  15626565 tctgaagaagaacatgtcgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 15626466  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  15626465 aggtgagtttccttggccatattatttc 15626438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Original strand, 48813290 - 48813608
Alignment:
Q  31 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 130  Q
    |||||| |||| || || |||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| ||      
T  48813290 attaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaa 48813389  T
Q  131 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 230  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813390 gtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctgaaga 48813489  T
Q  231 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 330  Q
    |||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  48813490 agaacatgctgagcatttgaagattgtgttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaa-ttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 48813588  T
Q  331 tttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48813589 tttcttggccatgttatttc 48813608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 15146914 - 15147242
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || || ||||||||||| ||   ||  ||||||||   || ||||||    
T  15146914 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacattacgagtataaagttatgccttttggtgttacaaa 15147013  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc-ttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 221  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| || || ||| | |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  15147014 tgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgcattttttggatcggttcgtggtttttttcattgatgatatttttatctactccaa 15147113  T
Q  222 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaa 321  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15147114 gactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaa 15147213  T
Q  322 gacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  15147214 gaggtaagttttcttggccatgttatttc 15147242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 11235243 - 11235570
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  11235243 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 11235342  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  11235343 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 11235442  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11235443 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 11235542  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11235543 aagtgagttttctaggccatgttatttc 11235570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14041935 - 14041612
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  14041935 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaa 14041836  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  14041835 tgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatttactccaag 14041736  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||| |||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||| ||||||||    
T  14041735 actgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctagttgaaag 14041636  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgtta 346  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  14041635 aggtgagttttcttggacatgtta 14041612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14351965 - 14351642
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  14351965 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaa 14351866  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  14351865 tgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatttactccaag 14351766  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||| |||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||| ||||||||    
T  14351765 actgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctagttgaaag 14351666  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgtta 346  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  14351665 aggtgagttttcttggacatgtta 14351642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 15159087 - 15159414
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  15159087 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 15159186  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  15159187 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 15159286  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||| |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15159287 actgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 15159386  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15159387 aagtgagttttctaggccatgttatttc 15159414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8709845 - 8709518
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  8709845 atcaccagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 8709746  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  8709745 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttatggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 8709646  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8709645 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 8709546  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8709545 aagtgagttttctaggccatgttatttc 8709518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14334538 - 14334309
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  14334538 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 14334439  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14334438 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 14334339  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14334338 agaagtgagttttctaggccatgttatttc 14334309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 11551132 - 11551459
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  11551132 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 11551231  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || || |||    
T  11551232 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttattccaag 11551331  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11551332 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 11551431  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11551432 aagtgagttttcttggccatgttatttc 11551459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14956696 - 14956467
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  14956696 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 14956597  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14956596 agactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 14956497  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14956496 agaagtgagttttcttggccatgttatttc 14956467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 350
Target Start/End: Original strand, 11770430 - 11770598
Alignment:
Q  182 ttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaa 281  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11770430 ttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaa 11770529  T
Q  282 gttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11770530 gttatatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 11770598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 44789386 - 44789708
Alignment:
Q  28 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 127  Q
    ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||    
T  44789386 cagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcac 44789485  T
Q  128 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 227  Q
    | || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  44789486 ctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttgatctactccaagactga 44789585  T
Q  228 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtg 327  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44789586 agaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtg 44789685  T
Q  328 agttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  44789686 agtttccttggccatgttatttc 44789708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12689742 - 12689415
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||| | || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  12689742 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctctgagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 12689643  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  12689642 tgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaag 12689543  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12689542 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 12689443  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12689442 aagtgagttttcttggccatgttatttc 12689415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 11386439 - 11386764
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  11386439 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11386538  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || |||||||||||||| || | |||  | ||||||||||||| | | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |    
T  11386539 cgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattctaagac 11386638  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||| ||||| ||| | |||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  11386639 tgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaa 11386738  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||    
T  11386739 gtgagttttctcggccacattatttc 11386764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10872930 - 10872603
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  10872930 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 10872831  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  10872830 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggtcgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 10872731  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10872730 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 10872631  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10872630 aagtgagttttctaggccatgttatttc 10872603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 12204810 - 12205135
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  12204810 catcagattaaggtgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 12204909  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   | ||| || ||||| ||||| ||||| || || || | |||| |    
T  12204910 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggtcgtgtttattgatgatatcttaatttattttaagac 12205009  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  12205010 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 12205109  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  12205110 gtaagttttcttggccacattatttc 12205135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Original strand, 15380 - 15706
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  |  ||    
T  15380 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtaaacaa 15479  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| ||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  15480 tgcgcctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgcgtttatcgacgatattttgatttactccaag 15579  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15580 actgaagaagaacatgctgagcatctgatgattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 15679  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    | || ||||||||||||||||||||||    
T  15680 aagtaagttttcttggccatgttattt 15706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7826042 - 7825813
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  7826042 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 7825943  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  7825942 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 7825843  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7825842 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 7825813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13675691 - 13675366
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  13675691 catcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 13675592  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||| |    
T  13675591 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgacattctgatttattcaaagac 13675492  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  13675491 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaatgagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 13675392  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||    
T  13675391 gtgagttatcttggccacattatttc 13675366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15342670 - 15342345
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15342670 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15342571  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||||  | | | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || |||||| |    
T  15342570 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcctaatttattctaagac 15342471  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    | |||| ||  ||||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  15342470 taaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaa 15342371  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  15342370 gtgagttttcttggccacattatttc 15342345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19149445 - 19149125
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||    
T  19149445 agattaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 19149347  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     ||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||     
T  19149346 tggtgtgtttatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgat 19149247  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 328  Q
    |||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |  || || |    
T  19149246 gaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaa 19149147  T
Q  329 gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  19149146 gttttcttggccatattatttc 19149125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 27105902 - 27106131
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  27105902 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 27106001  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27106002 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 27106101  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27106102 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 27106131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27172423 - 27172194
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  27172423 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 27172324  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27172323 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 27172224  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27172223 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 27172194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 15100613 - 15100938
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||| ||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15100613 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15100712  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  15100713 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 15100812  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| | || ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  15100813 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 15100912  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  15100913 gtaagttttcttggccacattatttc 15100938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20748844 - 20748524
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||    
T  20748844 agattaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 20748746  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||     
T  20748745 tggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgat 20748646  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 328  Q
    |||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |  || || |    
T  20748645 gaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaa 20748546  T
Q  329 gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  20748545 gttttcttggccatattatttc 20748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18179985 - 18179658
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  18179985 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 18179886  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | || ||  ||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||    
T  18179885 tgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtaattgtgtttatcgaccatattttgatttactccaag 18179786  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa--aaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||| || |||||| |||| |||||  | | || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  18179785 actgaagaagaacatgccgagcatctcaagattgtcttacaagtgttgaa-gagaangacactt-tatgccaaattgtctaagtatgaattctggttgaa 18179688  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18179687 agaggtgagttttcttggccatgttatttc 18179658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 14262255 - 14262579
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||  || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14262255 catcatattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14262354  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||| | |    
T  14262355 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcta-gac 14262453  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||     
T  14262454 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaa 14262553  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  14262554 gtaagttttcttggccatattatttc 14262579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14139918 - 14139635
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  14139918 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 14139819  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  14139818 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaagac 14139719  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtga 308  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  14139718 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtga 14139635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13688275 - 13688021
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || |  || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||    
T  13688275 agattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacc 13688176  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  13688175 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgac 13688076  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagt 283  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13688075 gaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagt 13688021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 16070307 - 16070630
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  16070307 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16070406  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | ||  ||||  ||||||| || |||||  | ||||| ||||  ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |    
T  16070407 cgcctagtgt--ttatggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctcatttattctaagac 16070504  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  || || ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  16070505 tgaagaagagcatgcagagtatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaa 16070604  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || |||||||| || ||| |||||||    
T  16070605 gtaagttttctgggtcatattatttc 16070630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 26092806 - 26093118
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  26092806 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 26092905  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  26092906 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 26093005  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  26093006 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 26093105  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | || ||||||||    
T  26093106 aagtaagttttct 26093118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Original strand, 26116598 - 26116892
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  26116598 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 26116697  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   ||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  26116698 cgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattgacgatattttaatctattccaag 26116797  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  26116798 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggtt 26116892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 16948482 - 16948807
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   | ||||||||||  || ||| ||||    
T  16948482 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16948581  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||       
T  16948582 cgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaaaat 16948681  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
     ||||| ||  | ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||| |||| || ||||| || ||||| |  ||     
T  16948682 cgaagaggagcacgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagctgtcaaagtgtgagttttggttaagtgaa 16948781  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||    
T  16948782 gtgagttttctgggccacattatttc 16948807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 13966678 - 13966970
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  13966678 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 13966777  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||      
T  13966778 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaa 13966877  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  13966878 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 13966970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 18051963 - 18052107
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  18051963 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 18052062  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  18052063 cgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 18052107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49154542 - 49154230
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  49154542 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 49154443  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||  |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  49154442 tgcgcctggtgtttttatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 49154343  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  49154342 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 49154243  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | || ||||||||    
T  49154242 aagtaagttttct 49154230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13023596 - 13023286
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  13023596 catcagataaaggtgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 13023497  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||||| |    
T  13023496 cgcctggtgtttttatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgataatttgatttattctaagac 13023397  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |  ||     
T  13023396 tgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttgtggttaagtgaa 13023297  T
Q  325 gtgagttttct 335  Q
    |||||||||||    
T  13023296 gtgagttttct 13023286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 206
Target Start/End: Original strand, 11301223 - 11301404
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  11301223 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 11301322  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatat 206  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11301323 cgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatat 11301404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 14284386 - 14284711
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14284386 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14284485  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || || || || ||||| || || ||  | |||||||||||||   | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||| |    
T  14284486 cgcctggcgtgttcatggagtatataaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggttgtattcattgatgacattttgatttattctaagac 14284585  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  || |  | ||| ||| | || | ||||||||  |||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |  ||     
T  14284586 tgaagaggagcatacagaacatctgaggattatattgcaagtattgaaagagaagaagctgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctagttaagtgaa 14284685  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  14284686 gtgagttttcttggccacattatttc 14284711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Original strand, 18588201 - 18588437
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || ||| |   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  18588201 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaaaataaagttatgccttttggtgttaccaa 18588300  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  18588301 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 18588400  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttt 259  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  18588401 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttt 18588437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 23503880 - 23504024
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  23503880 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 23503979  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  23503980 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 23504024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14213678 - 14213587
Alignment:
Q  259 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14213678 ttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 14213587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8200618 - 8200541
Alignment:
Q  273 agagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8200618 agagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 8200541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19614914 - 19614589
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19614914 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19614815  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  19614814 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 19614715  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||     
T  19614714 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 19614615  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  19614614 gtgagttttcttggccatattatttc 19614589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13688022 - 13687977
Alignment:
Q  305 gtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13688022 gtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 13687977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3181 - 2854
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  3181 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttcggtgttactaa 3082  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  3081 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatataatctaag 2982  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  2981 tctgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctcaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 2882  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| | ||||||| |||||||    
T  2881 aggtgagtttccgtggccatattatttc 2854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 7683 - 8010
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  7683 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaa 7782  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  7783 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatagttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 7882  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  7883 tctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtatgaattctggttgaaag 7982  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
      ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7983 gagtgagctttcttggacatgttatttc 8010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 49 - 350
Target Start/End: Original strand, 9084 - 9385
Alignment:
Q  49 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  9084 gatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtaca 9183  T
Q  149 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  9184 tgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcattt 9283  T
Q  249 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatt 348  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  9284 gaggattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagctgtcaaagtgtgaattctggttggatgaggtgagttttcttggccatgttatt 9383  T
Q  349 tc 350  Q
    ||    
T  9384 tc 9385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 20466302 - 20466629
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||   || ||| ||    
T  20466302 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttttggtgttactaa 20466401  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  20466402 tgcaccgggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgatcatcgatgatattttgatatactctaag 20466501  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  20466502 tctgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatg 20466601  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20466602 aggtgagttttcttggccatgttatttc 20466629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23473410 - 23473083
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  23473410 atcatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 23473311  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  23473310 tgcgccaggtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatgtactcaaag 23473211  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| |    
T  23473210 tctgaagaagaacatgctgagcgtttaaaagttgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaatg 23473111  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23473110 aggtgagttttcttggccatgttatttc 23473083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 26736930 - 26737257
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  26736930 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 26737029  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  26737030 tgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgcatttttagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 26737129  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    || ||||||||| ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||    
T  26737130 tccgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagataagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 26737229  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  26737230 aggtaagttttcttggccatgttatttc 26737257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 21337497 - 21337824
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||| |||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  21337497 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacgaa 21337596  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  21337597 tgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatagcttagtggttgtattcatcgacgatattttgatttactccaag 21337696  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    | |||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||||||||    
T  21337697 tttgaagaagaacatgctgagcacttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 21337796  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21337797 aggtgagttttctcggccacgttatttc 21337824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21409302 - 21408993
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||||  || ||  ||||| || || |||||    
T  21409302 tgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacattacggacataacgaatattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgccaggagtatt 21409203  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 237  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||    
T  21409202 tatggaatatatgaattgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgaaatactctaagtctgaggaggaacat 21409103  T
Q  238 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 337  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21409102 gccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctga---agaagaatttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttg 21409006  T
Q  338 gccatgttatttc 350  Q
    | ||| |||||||    
T  21409005 gtcatattatttc 21408993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 37289699 - 37290026
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  37289699 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 37289798  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  37289799 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 37289898  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37289899 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 37289998  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37289999 aagtgagttttctaggccatgttatttc 37290026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19772143 - 19771817
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  19772143 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 19772044  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  19772043 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaag 19771944  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19771943 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 19771844  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||    
T  19771843 aagtgagttttctaggccatgttattt 19771817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 14997942 - 14998269
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  14997942 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 14998041  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  14998042 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 14998141  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14998142 actgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 14998241  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14998242 aagtgagttttctaggccatgttatttc 14998269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22331090 - 22331417
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22331090 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22331189  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  22331190 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 22331289  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22331290 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 22331389  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22331390 aagtgagttttctaggctatgttatttc 22331417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41773025 - 41772698
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  41773025 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 41772926  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  41772925 tgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaag 41772826  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41772825 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaatttttatgctaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaag 41772726  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41772725 aagtgagttttctaggccatgttatttc 41772698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22136851 - 22136524
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22136851 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttactaa 22136752  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  22136751 tgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 22136652  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22136651 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 22136552  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22136551 aagtgagttttctaggccatgttatttc 22136524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27612537 - 27612210
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  27612537 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 27612438  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  27612437 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 27612338  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27612337 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 27612238  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27612237 aagtgagttttctaggccatgttatttc 27612210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40710963 - 40710636
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  40710963 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 40710864  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  40710863 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 40710764  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40710763 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 40710664  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  40710663 aggtgagtttccttggccatgttatttc 40710636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25428536 - 25428289
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| || || || || ||||| || ||||| |    
T  25428536 atgcctttcggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggttgtttttattgatg 25428437  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  25428436 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaatctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 25428337  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25428336 gtgtgaattctagttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 25428289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27520589 - 27520262
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  27520589 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 27520490  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  27520489 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttaatttactccaag 27520390  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27520389 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 27520290  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27520289 aagtgagttttctaggccatgttatttc 27520262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16358685 - 16358358
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  16358685 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 16358586  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16358585 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 16358486  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16358485 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16358386  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16358385 aagtgagttttctaggccatgttatttc 16358358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34568677 - 34568350
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  34568677 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 34568578  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  34568577 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 34568478  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  34568477 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 34568378  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34568377 aagtgagttttctaggccatgttatttc 34568350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22350102 - 22349776
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22350102 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22350003  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  22350002 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaag 22349903  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22349902 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 22349803  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  22349802 aagtgagttttcttggccatgttattt 22349776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 347
Target Start/End: Original strand, 27683603 - 27683927
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  27683603 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 27683702  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || | |||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||    
T  27683703 tgcacctggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacaatattttgatttactccaag 27683802  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||| |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27683803 actgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgagagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttcaaag 27683902  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttat 347  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  27683903 aagtgagttttctaggccatgttat 27683927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 29474276 - 29474603
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  29474276 atcaccagattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 29474375  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||  ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  29474376 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 29474475  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||  || || || || |||||||||||||||||||    
T  29474476 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgataaattatcgaagtgtgaattctggttgaaag 29474575  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29474576 aagtgagttttctaggccatgttatttc 29474603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 27666791 - 27667020
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  27666791 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactcca 27666890  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27666891 agactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 27666990  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27666991 tgaagtgagtttccttggccatgttatttc 27667020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18781297 - 18780970
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  18781297 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 18781198  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     ||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  18781197 cgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 18781098  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | | ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  18781097 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgcgaaattgtctaagtgtgaattctgattgaagg 18780998  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  18780997 aagtaagttttcttggccatgttatttc 18780970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 21935489 - 21935718
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  21935489 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 21935588  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  21935589 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 21935688  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21935689 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 21935718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23507751 - 23507522
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  23507751 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 23507652  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  ||| || ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  23507651 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagtgatgtgcaaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 23507552  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23507551 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 23507522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 28893147 - 28893472
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  28893147 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 28893246  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  |    
T  28893247 cgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaac 28893346  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  ||     
T  28893347 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 28893446  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28893447 gtgagttttctaggccatgtcatttc 28893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 28921973 - 28922298
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  28921973 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 28922072  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  |    
T  28922073 cgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaac 28922172  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  ||     
T  28922173 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 28922272  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28922273 gtgagttttctaggccatgtcatttc 28922298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 308
Target Start/End: Original strand, 21562232 - 21562512
Alignment:
Q  28 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 127  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||| |||||      
T  21562232 cagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgt 21562331  T
Q  128 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 227  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||  |||| || |||||| ||||    
T  21562332 ctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcctatttagattggtttgtagttgtgtttatagatgacatcctgatttattctaagactga 21562431  T
Q  228 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtga 308  Q
    ||||||  ||||  ||||||| ||  |||| || |||||| |||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  21562432 agaagagcatgcagagcatttaaaaattgtgtttcaagtgttgaaggaaaaaaagctgtatgccaagttttccaaatgtga 21562512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20801580 - 20801253
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  20801580 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 20801481  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| | || || || |||||||| || ||||| |||    
T  20801480 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttctttatcgatgatattttaatttactccaag 20801381  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  20801380 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 20801281  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||    
T  20801280 aggtaagtttccttggccatgtcatttc 20801253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20778076 - 20777755
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  20778076 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20777977  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||       
T  20777976 cgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatattttgatctattctaaaat 20777877  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||| | ||||| ||  | ||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  ||     
T  20777876 tgaagaggaacacgccaaacacctaaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 20777777  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgtta 346  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  20777776 gtgagtttcctaggccatgtta 20777755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 22234125 - 22234450
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  22234125 catcagattaaggtgatggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 22234224  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| ||| |||| || |||||    ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  22234225 cgcctggtgtgtttgtggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 22234324  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |  ||     
T  22234325 tgaagaagagcatgcagatcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttatcaaaatgtgaattctggttaagtgaa 22234424  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  22234425 gtaagttttcttggccatattatttc 22234450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24583277 - 24583048
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  24583277 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 24583178  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||| ||| |||||  ||||  |||||||||   |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  24583177 agtttgaggaagagcatgctgagcatttgagaattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 24583078  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24583077 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 24583048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25850240 - 25849928
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  25850240 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 25850141  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     || || |||||||||||||| |||||||| |  || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  25850140 cgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtgttcattgatgatatcttgatttattcgaag 25850041  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      |||||| ||  ||||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |    
T  25850040 aatgaagaggagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtg 25849941  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | |||||||||||    
T  25849940 aagtgagttttct 25849928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Original strand, 37541584 - 37541728
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  37541584 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 37541683  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc 167  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37541684 tgcgcctggtgtttttatggaatacatgaatcgaattttccatgc 37541728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22464114 - 22463789
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  22464114 catcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 22464015  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||| | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||||||||| || |||||  |    
T  22464014 cgcctggtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaac 22463915  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  | || |||||| |||| |||||  |  |||| |||| |||||| |||||||||||||| || |  || |||||||| |  ||     
T  22463914 tgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtacgagttctggttaagtgaa 22463815  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22463814 gtgagttttctaggccatgttatttc 22463789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 350
Target Start/End: Original strand, 28914640 - 28914943
Alignment:
Q  47 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  28914640 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28914739  T
Q  147 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 246  Q
     ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||| | ||     
T  28914740 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28914839  T
Q  247 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtta 346  Q
     ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |    
T  28914840 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtca 28914939  T
Q  347 tttc 350  Q
    ||||    
T  28914940 tttc 28914943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 350
Target Start/End: Original strand, 28929908 - 28930211
Alignment:
Q  47 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  28929908 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28930007  T
Q  147 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 246  Q
     ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||| | ||     
T  28930008 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28930107  T
Q  247 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtta 346  Q
     ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |    
T  28930108 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtca 28930207  T
Q  347 tttc 350  Q
    ||||    
T  28930208 tttc 28930211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20344447 - 20344153
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  20344447 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 20344348  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     |  || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||    
T  20344347 cgtgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaag 20344248  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
      |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  20344247 aatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 20344153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20823616 - 20823291
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  20823616 catcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20823517  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || || ||  |    
T  20823516 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatattgatctattcaaaaac 20823417  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  ||     
T  20823416 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 20823317  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||    
T  20823316 gtgagtttcctcggccacgttatttc 20823291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22504844 - 22504532
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  22504844 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 22504745  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     |  || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  22504744 cgagcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattctaag 22504645  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
       ||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |    
T  22504644 aacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtg 22504545  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | |||||||||||    
T  22504544 aagtgagttttct 22504532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Original strand, 24796600 - 24796784
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  24796600 atcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 24796699  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatatt 207  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24796700 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatt 24796784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Original strand, 14885194 - 14885340
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  14885194 atcatcagataaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 14885293  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  14885294 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 14885340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Original strand, 17267539 - 17267820
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  17267539 catcaaattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 17267638  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| | | | |||   ||||| || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  17267639 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcaaagac 17267738  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgt 306  Q
    |||||||||  ||||  | ||  |||   |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17267739 tgaagaagagcatgcagaacacctgagaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgt 17267820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 350
Target Start/End: Original strand, 21679212 - 21679308
Alignment:
Q  254 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21679212 ttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttc 21679308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23442104 - 23442064
Alignment:
Q  310 ttctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23442104 ttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgtcatttc 23442064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 348
Target Start/End: Original strand, 24618700 - 24618823
Alignment:
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||     
T  24618700 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24618799  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatt 348  Q
    || |||||||| |||||| |||||    
T  24618800 gtaagttttctgggccatattatt 24618823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 348
Target Start/End: Original strand, 24714931 - 24715054
Alignment:
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||     
T  24714931 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24715030  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatt 348  Q
    || |||||||| |||||| |||||    
T  24715031 gtaagttttctgggccatattatt 24715054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 348
Target Start/End: Original strand, 24747959 - 24748082
Alignment:
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||     
T  24747959 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24748058  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatt 348  Q
    || |||||||| |||||| |||||    
T  24748059 gtaagttttctgggccatattatt 24748082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23505150 - 23505082
Alignment:
Q  282 gttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23505150 gttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 23505082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 50 - 350
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2200
Alignment:
Q  50 atatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacat 149  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||  || ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  150 gaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttg 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctcaagaagaacatgttgagcatttg 2099  T
Q  250 aagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2100 aagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttaaatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggtcatgttattt 2199  T
Q  350 c 350  Q
    |    
T  2200 c 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 14503 - 14830
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  14503 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 14602  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14603 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatagtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 14702  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      |||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  14703 attgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaaag 14802  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14803 aggtgagttttcttggccatgttatttc 14830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5393 - 5067
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  5393 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggctttatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacgaa 5294  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5293 tgcgccaggtgtgttcatg-agtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggttgtgttcattgacgatattttgatatactccaag 5195  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  5194 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgcaaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatg 5095  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5094 aggtgagttttcttggccatgttatttc 5067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11401 - 11196
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||| ||||||  |||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  11401 catctgattaaggtgaaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11302  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |    
T  11301 cacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagac 11202  T
Q  225 tgaaga 230  Q
    ||||||    
T  11201 tgaaga 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 10765 - 11092
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||    
T  10765 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 10864  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10865 tgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaag 10964  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |    
T  10965 actgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatg 11064  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  11065 aagtaagttttcttggccatgttatttc 11092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 16962 - 17284
Alignment:
Q  28 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 127  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| |    
T  16962 cagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgc 17061  T
Q  128 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 227  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17062 caggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactga 17161  T
Q  228 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtg 327  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| || |||||| |||||||||| || ||     
T  17162 agaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagta 17261  T
Q  328 agttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17262 agttttcttggccatgttatttc 17284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 350
Target Start/End: Original strand, 24348 - 24649
Alignment:
Q  49 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 148  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||  |||| |||| ||||||||||  || |||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  24348 gatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtaca 24447  T
Q  149 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 248  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||    ||||||    
T  24448 tgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgacattttgatatactctaagactgaagaagaacttgttgcgcattt 24547  T
Q  249 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatt 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  24548 gaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaaatgtgaattctggttgaatgaggtgagttttctaggccatgttatt 24647  T
Q  349 tc 350  Q
    ||    
T  24648 tc 24649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 24818791 - 24819118
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||    
T  24818791 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 24818890  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24818891 tgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaag 24818990  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |    
T  24818991 actgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatg 24819090  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  24819091 aagtaagttttcttggccatgttatttc 24819118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 30010745 - 30011072
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || ||| ||    
T  30010745 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgcctttcagtgttactaa 30010844  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || || || |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  30010845 tgcgccaggagtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgatattttgatatactccaag 30010944  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    || || || ||| ||| | |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||| |    
T  30010945 tccgaggaggaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgcaagagaagaagttatatgccaagttatcgatgtgcgaattctggttgaacg 30011044  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| || ||| |||||||    
T  30011045 aagtgagttttctcggtcatattatttc 30011072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27373151 - 27372824
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  27373151 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 27373052  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  27373051 tgcacctggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 27372952  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27372951 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 27372852  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27372851 aagtgagttttctaggccatgttatttc 27372824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 30209478 - 30209790
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||  || ||| ||    
T  30209478 atcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacattacaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaa 30209577  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| | ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  30209578 tgcgctgggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattttgatatactccaag 30209677  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    || || || ||| ||| | | |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||| |    
T  30209678 tccgaggaggaacatgtcgaacatttgagaattgtttttcaagtgctgaaagagaagaagttatctgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacg 30209777  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | |||||||||||    
T  30209778 aagtgagttttct 30209790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24711916 - 24711589
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  24711916 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 24711817  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  24711816 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 24711717  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24711716 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 24711617  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24711616 aagtgagttttctaggccatgttatttc 24711589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23073745 - 23073418
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| |||||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  23073745 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccattatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacaaa 23073646  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  23073645 tgcacctggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttggaatgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaag 23073546  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| || | |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23073545 tctgaagaagaacatactagccatttgaagttggttttccaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 23073446  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23073445 aagtgagctttcttggacatgttatttc 23073418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 41606946 - 41607273
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  41606946 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 41607045  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  41607046 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 41607145  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41607146 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 41607245  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41607246 aagtgagttttctaggccatgttatttc 41607273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10870732 - 10870405
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  10870732 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 10870633  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  10870632 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 10870533  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10870532 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 10870433  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10870432 aagtgagttttctaggccatgttatttc 10870405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 23106289 - 23106616
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || || || || ||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  23106289 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacgaa 23106388  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  23106389 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaag 23106488  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  23106489 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattatggttaaaag 23106588  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23106589 aagtgagctttcttggacatgttatttc 23106616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 24875311 - 24875638
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  24875311 atcatcagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 24875410  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  24875411 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcattgatgatattttgatttactccaag 24875510  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24875511 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 24875610  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24875611 aagtgagttttcttggccatgttatttc 24875638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23112616 - 23112291
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||| ||||    
T  23112616 catcagattaaggtgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatg 23112517  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | ||  |||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |    
T  23112516 cgcctagtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgtagttgtgtttattgatgatatcttgatttattctaagac 23112417  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  23112416 tgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 23112317  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  23112316 gtaagttttcttggccatattatttc 23112291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24264252 - 24263925
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  24264252 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 24264153  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  24264152 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 24264053  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||| ||| |||   ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24264052 actgaagaggaacatgttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 24263953  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24263952 aagtgagttttctaggccatgttatttc 24263925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 23098581 - 23098906
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  23098581 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatagaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 23098680  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| | | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |    
T  23098681 cgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattctaagac 23098780  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||| ||||| ||| | |||| || || || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  23098781 tgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaatgttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaa 23098880  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||    
T  23098881 gtgagttttctcggccacattatttc 23098906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16927242 - 16926915
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  16927242 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 16927143  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16927142 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 16927043  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16927042 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16926943  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  16926942 aggtgagtttccttggccatgttatttc 16926915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17000882 - 17000555
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  17000882 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 17000783  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  17000782 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 17000683  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17000682 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 17000583  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  17000582 aggtgagtttccttggccatgttatttc 17000555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 21143602 - 21143929
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  21143602 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatacagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 21143701  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  21143702 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 21143801  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21143802 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 21143901  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21143902 aagtgagttttcttggccatgttatttc 21143929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 350
Target Start/End: Original strand, 22734355 - 22734662
Alignment:
Q  43 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 142  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || || ||||||||| || |||||||||     
T  22734355 gatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttataaatgcacctggagtatttatgt 22734454  T
Q  143 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 242  Q
    | ||||||||||| || |||||||  | ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  22734455 agtacatgaatcgcatctttcatgaatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttactccaagtctgaagaagaacatgctga 22734554  T
Q  243 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccat 342  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  22734555 gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtaaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacat 22734654  T
Q  343 gttatttc 350  Q
    ||||||||    
T  22734655 gttatttc 22734662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27219898 - 27219571
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  27219898 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 27219799  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  27219798 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 27219699  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27219698 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 27219599  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27219598 aagtgagttttctaggccatgttatttc 27219571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 44384131 - 44384458
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  44384131 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 44384230  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  44384231 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatctactccaag 44384330  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44384331 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 44384430  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44384431 aagtgagttttctaggccatgttatttc 44384458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9486098 - 9485771
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  9486098 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 9485999  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  9485998 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 9485899  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9485898 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 9485799  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9485798 aagtgagttttctaggccatgttatttc 9485771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Original strand, 22323581 - 22323744
Alignment:
Q  187 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 286  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  22323581 gttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagcttt 22323680  T
Q  287 atgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22323681 atgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttgtttc 22323744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 350
Target Start/End: Original strand, 24706156 - 24706370
Alignment:
Q  136 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 235  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| || | ||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  24706156 tttatggagtacatgaatcatatctttcacgcatttttggatcggttcgtggctgttttcattgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 24706255  T
Q  236 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 335  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  24706256 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagttttct 24706355  T
Q  336 tggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||    
T  24706356 tggccatgttatttc 24706370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 350
Target Start/End: Original strand, 21323847 - 21324154
Alignment:
Q  43 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 142  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| ||| |||| || ||||||||||    
T  21323847 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttttggtgttaccaatacacctggagtatttatgg 21323946  T
Q  143 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 242  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  21323947 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgttttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctga 21324046  T
Q  243 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccat 342  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||  | ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21324047 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccat 21324146  T
Q  343 gttatttc 350  Q
    || |||||    
T  21324147 gtcatttc 21324154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23189794 - 23189474
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||    
T  23189794 agattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 23189695  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  23189694 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatagacgatattttgatttactccaagactgag 23189595  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 328  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||  | || |    
T  23189594 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg-attctggttgaagaaagtaa 23189496  T
Q  329 gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  23189495 gttttctgggccatgttatttc 23189474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24677371 - 24677044
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  24677371 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaa 24677272  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| |  || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| | ||||| || |||||||| || ||||| |||    
T  24677271 tgcacctgtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggtttttttcatcgatgatattttaatttactccaag 24677172  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24677171 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 24677072  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||    
T  24677071 aggtaagttttctgggccatgttatttc 24677044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 24829847 - 24830076
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  24829847 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 24829946  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| |||||| |  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  24829947 agtctgaggaagagcatgcggagcatttgaggattgtgttgcaattcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttcaa 24830046  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24830047 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 24830076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45534609 - 45534495
Alignment:
Q  236 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 335  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  45534609 atgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttct 45534510  T
Q  336 tggccatgttatttc 350  Q
     || ||| |||||||    
T  45534509 cggtcatattatttc 45534495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23278632 - 23278340
Alignment:
Q  49 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 148  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
T  23278632 gatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 23278533  T
Q  149 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 248  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | |||  ||| || ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||||||  ||||  | ||| |    
T  23278532 tgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattctgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatct 23278433  T
Q  249 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 341  Q
    |||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| |  || ||||||||||| |||||    
T  23278432 gaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggcca 23278340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9337464 - 9337209
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  9337464 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 9337365  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  9337364 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 9337265  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 278  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  9337264 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 9337209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1065633 - 1065487
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  1065633 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 1065534  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  1065533 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgctt 1065487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 19650613 - 19650938
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||||| ||    | ||||||||||  ||  || || |    
T  19650613 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgtcactaacg 19650712  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |    
T  19650713 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagac 19650812  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
     ||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |  ||     
T  19650813 cgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctagttaagtgaa 19650912  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  19650913 gtaagttttcttggccacattatttc 19650938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27789620 - 27789295
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  27789620 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 27789521  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  27789520 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagac 27789421  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| | |  ||     
T  27789420 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 27789321  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  27789320 gtgagtttccttggtcatattatttc 27789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12576220 - 12575908
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  12576220 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtatt 12576121  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 237  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  12576120 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 12576021  T
Q  238 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 337  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||| | |  || |||||||| ||||    
T  12576020 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgaattttggctaagtgaagtgagtttccttg 12575921  T
Q  338 gccatgttatttc 350  Q
    | ||| |||||||    
T  12575920 gtcatattatttc 12575908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24950470 - 24950154
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  24950470 catcagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 24950371  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||  ||||| ||  |||| |||||| |||| || || ||| |    
T  24950370 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgtatttgttgatgatattctgatttattcaaagac 24950271  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |  ||     
T  24950270 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttatggttaagtgaa 24950171  T
Q  325 gtgagttttcttggcca 341  Q
    |||||| ||||||||||    
T  24950170 gtgagtcttcttggcca 24950154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22279879 - 22279660
Alignment:
Q  131 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 230  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||| || ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || || ||  | ||    
T  22279879 gtgtctttatggaatacatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaatcgaagga 22279780  T
Q  231 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 330  Q
     ||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  22279779 ggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagt 22279680  T
Q  331 tttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  22279679 ttccttggtcatgtgatttc 22279660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31832540 - 31832246
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||    
T  31832540 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaa 31832441  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||    
T  31832440 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaag 31832341  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31832340 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggtt 31832246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25264769 - 25264609
Alignment:
Q  190 gtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatg 289  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  25264769 gtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatg 25264670  T
Q  290 ccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||  |||||||    
T  25264669 ccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttc 25264609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25255799 - 25255654
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  25255799 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 25255700  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctta 170  Q
    | |  ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  25255699 cgcttggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgctta 25255654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23295659 - 23295499
Alignment:
Q  181 tttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaa 280  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||  |||| || || ||| ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||||||||    
T  23295659 tttgtggttgtgtttattgatgacatcctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaa 23295560  T
Q  281 agttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 341  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||    
T  23295559 agttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaagtgagttttctgggcca 23295499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Original strand, 12639040 - 12639121
Alignment:
Q  269 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12639040 tgaaagagaatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 12639121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 19717580 - 19717872
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  19717580 catcagatcaagttgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaag 19717679  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||   |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |    
T  19717680 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagac 19717779  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
    ||||||  |  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  19717780 tgaagatcagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagctgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 19717872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Original strand, 27208979 - 27209060
Alignment:
Q  269 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27208979 tgaaagagagaaagttgtatgccaacttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttc 27209060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 24557 - 24884
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  24557 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 24656  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24657 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaag 24756  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||    
T  24757 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 24856  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  24857 aggtaagttttcttggccatgttatttc 24884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 150849 - 150524
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  150849 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 150750  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | ||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||  | ||||  || ||||| || |||||||| || |||||| |    
T  150749 cgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggttgaatttattgatgacattttgatttattctaagac 150650  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||     
T  150649 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttaagtgag 150550  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  150549 gtaagttttcttggccacattatttc 150524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 181937 - 181879
Alignment:
Q  292 aagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  181937 aagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 181879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4196 - 3869
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||    
T  4196 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 4097  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    | | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4096 tacgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 3997  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  3996 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtattgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaag 3897  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3896 aggtgagttttcttggcaatgttatttc 3869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 40357 - 40669
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  40357 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 40456  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  40457 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 40556  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  40557 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 40656  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | || ||||||||    
T  40657 aagtaagttttct 40669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Original strand, 45453 - 45628
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||||||  || ||| ||||    
T  45453 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattaagaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 45552  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattga 200  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||    
T  45553 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttacttggataaatttgtggttgtgtttattga 45628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 495293 - 494978
Alignment:
Q  30 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 129  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  495293 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 495194  T
Q  130 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 229  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  495193 ggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtctgaag 495094  T
Q  230 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgag 329  Q
    ||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||||| || |||||    
T  495093 aagaacatgctgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtctgagttctggttgaatgaggtgag 494994  T
Q  330 ttttcttggccatgtt 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  494993 ttttcttggccatgtt 494978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 453239 - 453564
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  453239 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 453338  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |  ||| |    
T  453339 cgcctggtgtgtttatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttatttgaagac 453438  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  453439 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagagaagaagttgtatgtcaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 453538  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || || |||||||||||  |||||||    
T  453539 gtaagatttcttggccacattatttc 453564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 335
Target Start/End: Original strand, 515379 - 515689
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  515379 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgattacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 515478  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || |||      
T  515479 cgcctggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaa 515578  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||| | ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  515579 tgaagaggaacacgcagagcatctgagaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 515678  T
Q  325 gtgagttttct 335  Q
    |||||||||||    
T  515679 gtgagttttct 515689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14743 - 14423
Alignment:
Q  30 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 129  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||||||| ||| |||||| |||||     
T  14743 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacct 14644  T
Q  130 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14643 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaag 14544  T
Q  230 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgag 329  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  14543 aagagcatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatattctaaattgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggttag 14444  T
Q  330 ttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14443 ttttcttggccatgttatttc 14423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 5913 - 6240
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| || | ||||||||||  || ||||||    
T  5913 atcaccagattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacattaggaatattcggtgatgcctttcggtgttacaaa 6012  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6013 cgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgcatatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactctaag 6112  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  6113 gctgaagaagaacatgctgagcaattgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 6212  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || | ||||||||| |||||||||||    
T  6213 aggtcatttttcttggtcatgttatttc 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 350
Target Start/End: Original strand, 14849147 - 14849454
Alignment:
Q  43 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| || ||||| |||||||    
T  14849147 gatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagagatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatgg 14849246  T
Q  143 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||   |    
T  14849247 agtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagtccgaagaagaacatgttga 14849346  T
Q  243 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccat 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  14849347 gcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccaa 14849446  T
Q  343 gttatttc 350  Q
    ||||||||    
T  14849447 gttatttc 14849454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14696356 - 14696037
Alignment:
Q  31 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 130  Q
    |||||| |||| ||| | |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||   || ||||||||| || |    
T  14696356 attaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacattattaatattcagtgatgccttttggtgttacaaatgcgccag 14696257  T
Q  131 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 230  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14696256 gtgtgtttatggagtacatgaactctatttttcatgcgtatttggattgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactcgaagtccgaaga 14696157  T
Q  231 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 330  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14696156 agaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaatttatatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgagt 14696057  T
Q  331 tttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14696056 tttcttggccatgttatttc 14696037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23957998 - 23957671
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  23957998 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 23957899  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  23957898 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 23957799  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23957798 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 23957699  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23957698 aagtgagttttctaggccatgttatttc 23957671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 8051384 - 8051711
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  8051384 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 8051483  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  8051484 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 8051583  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8051584 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 8051683  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8051684 aagtgagttttctaggccatgttatttc 8051711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27713587 - 27713260
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  27713587 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 27713488  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  27713487 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 27713388  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27713387 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctagttgaaag 27713288  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27713287 aagtgagttttctaggccatgttatttc 27713260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8708160 - 8707835
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| || |    
T  8708160 catcatattaaagtaaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacg 8708061  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  8708060 cgcggggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagtc 8707961  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||     
T  8707960 tgaagaagagcatgcagagcattagaaagttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaa 8707861  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || |||||| |||||||| |||||||    
T  8707860 gtaagttttattggccatattatttc 8707835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12478851 - 12478524
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  12478851 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 12478752  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  12478751 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 12478652  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12478651 accgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 12478552  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12478551 aagtgagttttctaggccatgttatttc 12478524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 19776554 - 19776881
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  19776554 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 19776653  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  19776654 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 19776753  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19776754 accgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 19776853  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19776854 aagtgagttttctaggccatgttatttc 19776881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40475291 - 40474964
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  40475291 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 40475192  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  40475191 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 40475092  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  40475091 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaag 40474992  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40474991 aagtgagttttctaggccatgttatttc 40474964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 14301740 - 14302067
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  14301740 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 14301839  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  14301840 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 14301939  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14301940 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 14302039  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14302040 aagtgagttttctaggccatgttatttc 14302067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14682705 - 14682491
Alignment:
Q  136 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 235  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||     
T  14682705 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaaaagaac 14682606  T
Q  236 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 335  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14682605 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttct 14682506  T
Q  336 tggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||    
T  14682505 tggccatgttatttc 14682491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 18225207 - 18225534
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  18225207 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 18225306  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| ||  | |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  18225307 tgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgacattttgatttactccaag 18225406  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18225407 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 18225506  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||   |||||||||||||||||||||    
T  18225507 aagtaccttttcttggccatgttatttc 18225534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14161721 - 14161403
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||| | | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||  || | | ||    
T  14161721 atcaccagattagagtaaagaatgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaattttcagtgatgcctttcggtgtttctaa 14161622  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| |||||  | || || ||| ||    
T  14161621 tgcacctggagtatttatggagtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtatttattgatgatatcctaatttattctgag 14161522  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     | ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| | || ||| |||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14161521 acagaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttctacaggtgttgaaggaaagtaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgaattctggttgaatg 14161422  T
Q  323 acgtgagttttcttggcca 341  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14161421 aggtgagttttcttggcca 14161403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Original strand, 15145652 - 15145973
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||    
T  15145652 agattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttaccaatgcacc 15145751  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  15145752 tggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagactgaa 15145851  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 328  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||  ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  15145852 gaagaacatgctgagcatctgaacattgtcttgcaagtgttgaaagagaggaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaa 15145951  T
Q  329 gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15145952 gttttcttggccatgttatttc 15145973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8388663 - 8388336
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  8388663 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 8388564  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8388563 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttaatttactccaag 8388464  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8388463 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatg 8388364  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  8388363 aggtgagtttccttggccatgttatttc 8388336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15323370 - 15323141
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||    
T  15323370 aatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattgtaatttattcta 15323271  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||  |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  15323270 agagtgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaag 15323171  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || || ||||||||||||||| |||||||    
T  15323170 tgaagtaagttttcttggccatattatttc 15323141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 347
Target Start/End: Original strand, 18613749 - 18613909
Alignment:
Q  187 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 286  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |    
T  18613749 gttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 18613848  T
Q  287 atgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttat 347  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||    
T  18613849 atgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaaaagtaagttttctaggccatgttat 18613909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15072608 - 15072295
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15072608 catcaaattaaggtgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15072509  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||      
T  15072508 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaa 15072409  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||| ||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  15072408 tgaataagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 15072309  T
Q  325 gtgagttttcttgg 338  Q
    || |||||||||||    
T  15072308 gtaagttttcttgg 15072295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 44659887 - 44660179
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  44659887 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 44659986  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  44659987 cgcgcctggtgtatttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgacgatattttaatctattccaag 44660086  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctgg 315  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  44660087 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctgg 44660179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Original strand, 16234753 - 16235008
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  16234753 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 16234852  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    | |||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  16234853 tacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 16234952  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 278  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16234953 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaa 16235008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 15001388 - 15001712
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15001388 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgatactaatg 15001487  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || | ||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||      
T  15001488 cgcctgttgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagat 15001587  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||     
T  15001588 tgaagaagagcatgcagaacatctgaggattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtttaaatgtg-agtctggttaagtgaa 15001686  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  15001687 gtaagttttcttggccacattatttc 15001712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Original strand, 17092910 - 17093165
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  17092910 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 17093009  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  17093010 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 17093109  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 278  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  17093110 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 17093165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 15291277 - 15291506
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | || | |||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15291277 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataaaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 15291376  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  15291377 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 15291476  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15291477 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 15291506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 51604815 - 51605140
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  51604815 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 51604914  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  51604915 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagac 51605014  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| | |  ||     
T  51605015 tgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 51605114  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  51605115 gtgagtttccttggtcatattatttc 51605140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 3262815 - 3263127
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  3262815 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 3262914  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  3262915 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 3263014  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  3263015 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 3263114  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | || ||||||||    
T  3263115 aagtaagttttct 3263127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16149957 - 16149635
Alignment:
Q  28 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 127  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||    
T  16149957 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcac 16149858  T
Q  128 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 227  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || || | | ||||    
T  16149857 ctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactga 16149758  T
Q  228 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtg 327  Q
    ||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |  || ||     
T  16149757 agaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggttaagtgaagta 16149658  T
Q  328 agttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||| ||||  |||||||    
T  16149657 agttttctttgccacattatttc 16149635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16154103 - 16153781
Alignment:
Q  28 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 127  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||    
T  16154103 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcac 16154004  T
Q  128 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 227  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || || | | ||||    
T  16154003 ctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactga 16153904  T
Q  228 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtg 327  Q
    ||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |  || ||     
T  16153903 agaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggttaagtgaagta 16153804  T
Q  328 agttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||| ||||  |||||||    
T  16153803 agttttcttagccacattatttc 16153781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 350
Target Start/End: Original strand, 1640322 - 1640428
Alignment:
Q  244 catttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  1640322 catttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttagccatg 1640421  T
Q  344 ttatttc 350  Q
    |||||||    
T  1640422 ttatttc 1640428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16218481 - 16218323
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||| |||  || ||||||    
T  16218481 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttacaaa 16218382  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgtt 181  Q
    ||   | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16218381 tgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtt 16218323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16221801 - 16221643
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||| |||  || ||||||    
T  16221801 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttacaaa 16221702  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgtt 181  Q
    ||   | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16221701 tgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtt 16221643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Original strand, 29451558 - 29451704
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  29451558 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 29451657  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  29451658 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 29451704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 1647300 - 1647625
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  1647300 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 1647399  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||||| | | |||   || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  1647400 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtattcattgatgatattttgatttattctaagac 1647499  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  | ||  ||||| |||| ||||   | |||||||| | |||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| |  ||     
T  1647500 tgaagaggagcatgcagaacacctgaagattgtgttgcggattctgaaagaaagaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 1647599  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||    
T  1647600 gtgagttttgttggccacgtgatttc 1647625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 15357143 - 15357468
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15357143 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15357242  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || |  ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  15357243 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtatttattgatgacattctgatttattctaagac 15357342  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  15357343 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaa 15357442  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     | ||||||||||||||  |||||||    
T  15357443 ttaagttttcttggccacattatttc 15357468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27902635 - 27902310
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  27902635 catcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaag 27902536  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||   | |||   || || || || || |||||  |||||||||| || |||||| |    
T  27902535 cgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggtatttattgatcatattttgatttattctaagac 27902436  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||| ||| || ||     
T  27902435 tgaagaggagcatgcagaacacatgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctagttaaatgaa 27902336  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||    
T  27902335 gtgagttttctaggccacattatttc 27902310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 29037428 - 29037492
Alignment:
Q  286 tatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29037428 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 29037492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 206
Target Start/End: Original strand, 11205253 - 11205436
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  11205253 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 11205352  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatat 206  Q
     || || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11205353 cgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatat 11205436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15258177 - 15257990
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  15258177 catcagatcaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15258078  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgat 212  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  ||   ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15258077 cgcctggtgtgttcatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttgat 15257990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14999297 - 14999239
Alignment:
Q  292 aagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14999297 aagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 14999239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23443356 - 23443290
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacatta 89  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  23443356 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcataagacaacttttagaacacgttatggacatta 23443290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22982 - 22661
Alignment:
Q  28 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 127  Q
    ||||||||| |||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  || ||||| ||| |    
T  22982 cagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcggtgatgcctttcgttgttacaactgcgc 22883  T
Q  128 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 227  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22882 caggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcacttcgtggttgtgttcatcaatgatattttgatatactctaagtctga 22783  T
Q  228 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtg 327  Q
    ||||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  22782 agaagaacacactgagcatttgaagattgttttgcaagtgccgaaggaaaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggta 22683  T
Q  328 agttttcttggccatgttattt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22682 agttttcttggccatgttattt 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 37844 - 38171
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  37844 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaa 37943  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || || ||||| || || ||||| | ||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  37944 tgcacctggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgcggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 38043  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  38044 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 38143  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  38144 aggtaagttttcttggccatgttatttc 38171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 15245 - 15572
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||   || ||| ||||||  || ||||||    
T  15245 atcatcggattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacattatgaatataaagtgattcctttcggtgttacaaa 15344  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15345 tgcgccaggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtgattgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 15444  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  15445 actgaagaagaacaagctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctaaaagagaaaaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaaag 15544  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||    
T  15545 aggtgagttttcttggccatgtaatttc 15572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17158 - 16832
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||  || ||| ||    
T  17158 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattcagtgat-cctttcggtgttaccaa 17060  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17059 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 16960  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  16959 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgccaaattgtcaaagtgtcaattctgattgaaag 16860  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||| || ||||| ||||||||||    
T  16859 aggtgagtgtttttggcaatgttatttc 16832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 111775 - 111839
Alignment:
Q  286 tatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  111775 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatattatttc 111839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15261494 - 15261173
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || || |||||| ||    
T  15261494 agattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttagaaatgcgcc 15261395  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| |||||    
T  15261394 aggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttgatatattccaagactgaa 15261295  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 328  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15261294 gaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaaattgtaaaagtgtgaattctggttgaaagaggtga 15261195  T
Q  329 gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15261194 gttttcttggccatgttatttc 15261173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 350
Target Start/End: Original strand, 15014031 - 15014343
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||||  || ||| || || || || || ||    
T  15014031 tgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggagtgtt 15014130  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||| | || || ||| ||    
T  15014131 tatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgttgtgtttatagatgatattctaatatactctaagaccgaggaggaacat 15014230  T
Q  238 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 337  Q
    ||| ||||||  |   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15014231 gccgagcattgtagaattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttg 15014330  T
Q  338 gccatgttatttc 350  Q
    ||||| |||||||    
T  15014331 gccatattatttc 15014343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17491720 - 17491393
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||| || ||||||    
T  17491720 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcagtgttacaaa 17491621  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||||| | | ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  17491620 tgcacctggagtatttatgaagtacatgaatcgcatctttcattcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttactccaag 17491521  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17491520 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 17491421  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17491420 aagtgagctttcttggacatgttatttc 17491393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10007470 - 10007143
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  10007470 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 10007371  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  10007370 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 10007271  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10007270 actgaagaagaacattctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 10007171  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10007170 aagtgagttttctaggccatgttatttc 10007143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 15346505 - 15346832
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  15346505 atcaccagcttaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 15346604  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  15346605 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 15346704  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15346705 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 15346804  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15346805 aagtgagttttctaggccatgttatttc 15346832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 15723194 - 15723521
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  15723194 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 15723293  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  15723294 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 15723393  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15723394 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaag 15723493  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15723494 aagtgagttttctaggccatgttatttc 15723521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48427317 - 48426990
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  48427317 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 48427218  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  48427217 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 48427118  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48427117 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 48427018  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48427017 aagtgagttttctaggccatgttatttc 48426990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10908080 - 10907753
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  10908080 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 10907981  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  10907980 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 10907881  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10907880 actgaagaagaacattttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 10907781  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10907780 aagtgagttttctaggccatgttatttc 10907753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13254560 - 13254233
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  13254560 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 13254461  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  13254460 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 13254361  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13254360 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 13254261  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13254260 aagtgagttttctaggccatgttatttc 13254233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 20060314 - 20060641
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  20060314 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 20060413  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  20060414 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 20060513  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20060514 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaag 20060613  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20060614 aagtgagttttctaggccatgttatttc 20060641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 294
Target Start/End: Original strand, 11889638 - 11889811
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11889638 aatgcgccaggtgtgttcatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactcta 11889737  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaag 294  Q
    ||| | | |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11889738 agtttaaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaag 11889811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 5108871 - 5109198
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  5108871 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 5108970  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  5108971 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaag 5109070  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5109071 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 5109170  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5109171 aagtgagttttctaggccatgttatttc 5109198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 16805207 - 16805534
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  16805207 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 16805306  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  16805307 tgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 16805406  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16805407 actgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16805506  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  16805507 aagtaagttttcttggccatgttatttc 16805534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3687813 - 3687486
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||    
T  3687813 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaa 3687714  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  3687713 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 3687614  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  3687613 actgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 3687514  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||    
T  3687513 aagtgagttttctaggtcatgttatttc 3687486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 5423190 - 5423517
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  5423190 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 5423289  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  5423290 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttatgttcatcgacgatatcttgatttactctaag 5423389  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||| |||||| |    
T  5423390 actgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattcttgttgaatg 5423489  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  5423490 aagtgagtttccttggccatgttatttc 5423517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12888579 - 12888252
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  12888579 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 12888480  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  12888479 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtagtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 12888380  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12888379 actgaagaagaacatgccgagcacctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 12888280  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  12888279 aagtgagtttacttggccatgttatttc 12888252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Original strand, 15400785 - 15401104
Alignment:
Q  31 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 130  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||  |    
T  15400785 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacttg 15400884  T
Q  131 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 230  Q
    | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15400885 gagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaaga 15400984  T
Q  231 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 330  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15400985 agaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagt 15401084  T
Q  331 tttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15401085 tttcttggccatgttatttc 15401104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16637643 - 16637316
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||| |||  ||  || ||    
T  16637643 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaa 16637544  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16637543 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 16637444  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16637443 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16637344  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16637343 aagtgagttttctaggccatgttatttc 16637316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15341041 - 15340812
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  15341041 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactcca 15340942  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  15340941 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 15340842  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15340841 agaagtgagttttcttggccatgttatttc 15340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 15587652 - 15587979
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  15587652 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 15587751  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  15587752 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaag 15587851  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15587852 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 15587951  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15587952 aagtgagttttctaggccatgttatttc 15587979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 16754961 - 16755288
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  16754961 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaa 16755060  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16755061 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttattgacgatattttgatttactccaag 16755160  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||| |   ||||||||||||||||| |    
T  16755161 actgaagaagaacatgcggaacatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtttgtgtgtgaattctggttgaatg 16755260  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  16755261 aagtgagtttccttggccatgttatttc 16755288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 14874839 - 14875086
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |    
T  14874839 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattcatggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatg 14874938  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||    
T  14874939 atattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaa 14875038  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  14875039 gtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggccttgttatttc 14875086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 53383278 - 53383605
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  53383278 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaa 53383377  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  53383378 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 53383477  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| || || ||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  53383478 actgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaggtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatg 53383577  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  53383578 aagtgagtttccttggccatgttatttc 53383605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6602508 - 6602279
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  6602508 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 6602409  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || | ||||||||| ||||  ||||| ||| | |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  6602408 agaccgaagaagaacatgctgagcatctgacgattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 6602309  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||    
T  6602308 tgaagtgagtttccttggccatgttatttc 6602279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 11950159 - 11950484
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  11950159 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggggatgcctttcggtgttactaatg 11950258  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  11950259 cgcctggtgtgttcatggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagac 11950358  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  11950359 tgaagaagagcatgcagaacatttgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 11950458  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  11950459 gtgagttttcttggccacattatttc 11950484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12500020 - 12499791
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  12500020 aatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactcca 12499921  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12499920 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaa 12499821  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12499820 agaggtaagttttcttggccatgttatttc 12499791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15229481 - 15229156
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||   | ||| ||||    
T  15229481 catcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatg 15229382  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | ||  |||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||| |    
T  15229381 cgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagac 15229282  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |  ||     
T  15229281 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaa 15229182  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  15229181 gtaagttttcttggccacattatttc 15229156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15235349 - 15235024
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||   | ||| ||||    
T  15235349 catcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatg 15235250  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | ||  |||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||| |    
T  15235249 cgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagac 15235150  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |  ||     
T  15235149 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaa 15235050  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  15235049 gtaagttttcttggccacattatttc 15235024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16693936 - 16693707
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  16693936 aatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatagacgaaattttgatatactcca 16693837  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  16693836 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 16693737  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  16693736 agaagtaagttttcttggtcatgttatttc 16693707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30139588 - 30139359
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  30139588 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 30139489  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  30139488 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 30139389  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  30139388 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 30139359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30149139 - 30148910
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  30149139 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 30149040  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  30149039 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 30148940  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  30148939 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 30148910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17188252 - 17187927
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  17188252 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 17188153  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| |||||||| || ||| |||| || || | | |    
T  17188152 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattcattgatgacattctgatttattcaaggac 17188053  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  17188052 tgaggaagagcatgcagaacatctgaaaattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 17187953  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  17187952 gtgagttttcttggccacattatttc 17187927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 8272757 - 8272986
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  8272757 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 8272856  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  8272857 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 8272956  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8272957 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 8272986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 12358778 - 12359103
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  12358778 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaag 12358877  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||| |    
T  12358878 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggttgtatttattgatgacattctgatttattcaaagac 12358977  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  12358978 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 12359077  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  12359078 gtgagttttcttggccacattatttc 12359103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28756198 - 28755886
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  28756198 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 28756099  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||    
T  28756098 tgcgccgggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaag 28755999  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  28755998 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 28755899  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | || ||||||||    
T  28755898 aagtaagttttct 28755886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 13965710 - 13965940
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  13965710 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 13965809  T
Q  221 agtctgaagaagaa-aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttga 319  Q
    ||||||| ||||||  ||||  ||||||||| | |||| |||||||   ||||||||||  |||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  13965810 agtctgaggaagaagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagacttgaaagagaaccagttgtctgccaatttgtctaagtgtgagttttggttga 13965909  T
Q  320 aagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  13965910 aggaagtgagttttcttggtcatgtgatttc 13965940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15611885 - 15611656
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15611885 aatgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 15611786  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||   ||| | |||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  15611785 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagttttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagcgtgagttttggttgaa 15611686  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15611685 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 15611656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47125824 - 47125640
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  47125824 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 47125725  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatatt 207  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  47125724 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatt 47125640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 335
Target Start/End: Original strand, 11959435 - 11959730
Alignment:
Q  40 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 139  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||||    
T  11959435 aaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttta 11959534  T
Q  140 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 239  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||||| | | |||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || || || |||  |||||| ||  ||||    
T  11959535 tggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagttgtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaagaggagcatgc 11959634  T
Q  240 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 335  Q
      ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  11959635 agagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttct 11959730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 341
Target Start/End: Original strand, 31693449 - 31693752
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31693449 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31693548  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 237  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||  |||| || |  ||| ||||||||||  ||    
T  31693549 tatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatactgatttatttaaagactgaagaagagcat 31693648  T
Q  238 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 337  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||||||||    
T  31693649 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 31693748  T
Q  338 gcca 341  Q
    ||||    
T  31693749 gcca 31693752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 10418296 - 10418621
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  10418296 catcaaattaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 10418395  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||  |    
T  10418396 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatcttgatctattcaaaaac 10418495  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||| |||| || || || |||||||| || ||     
T  10418496 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaggaagttgtatgccaagctgtcgaagtgcgagttctggttaaatgaa 10418595  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10418596 gtgagttttctaggccacgttatttc 10418621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 206
Target Start/End: Original strand, 18132597 - 18132778
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  18132597 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 18132696  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatat 206  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18132697 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatat 18132778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41179400 - 41179075
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  41179400 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 41179301  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  41179300 cacccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagac 41179201  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  || |  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| | |  ||     
T  41179200 tgaagaagagcattcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaa 41179101  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  41179100 gtgagtttccttggtcatattatttc 41179075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13943902 - 13943758
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  13943902 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 13943803  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  13943802 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 13943758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44779125 - 44778981
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  44779125 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 44779026  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    | || |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  44779025 cgcccggtgtattcatggagtttatgaatcgaatttttcatgctt 44778981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 16379179 - 16379321
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  16379179 catcaaattaaggtgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 16379278  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc 167  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  16379279 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgc 16379321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 15948828 - 15949036
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||||||| | || || |    
T  15948828 aatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttggtgtattcga 15948927  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  |||   ||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15948928 agtctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgagccaagttgtctaagtgtgaattttggttgaa 15949027  T
Q  321 agacgtgag 329  Q
     || |||||    
T  15949028 ggaagtgag 15949036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31940768 - 31940465
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| || | |||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31940768 tgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31940669  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 237  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||  |||| || || ||| |||||||| |  ||    
T  31940668 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatactgatttattcaaagactgaagaatagcat 31940569  T
Q  238 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 337  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||||||||    
T  31940568 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 31940469  T
Q  338 gcca 341  Q
    ||||    
T  31940468 gcca 31940465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 6151211 - 6151440
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || ||||||   || |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  6151211 aatgcgccaggtgtctttatggagtatatgaataaaatatttcatccttatctagaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 6151310  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    | ||||| || ||  ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| |||| |||||  |||||| ||| ||||||||||| || || || ||||||||    
T  6151311 aatctgaggaggagcatgctgagcatctgacgattgtgttgcaagtgttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgcgagttttggttgaa 6151410  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6151411 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 6151440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 13970371 - 13970696
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  13970371 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 13970470  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  13970471 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 13970570  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||     
T  13970571 tgaggaagagcatgcagaacatctgagggttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 13970670  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  13970671 gtgagttttcttggccatattatttc 13970696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14088551 - 14088226
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14088551 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14088452  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  14088451 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 14088352  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||     
T  14088351 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 14088252  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  14088251 gtgagttttcttggccatattatttc 14088226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 16834761 - 16835086
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  16834761 catcaaattaaggtgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgtatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16834860  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| | | | |||   ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || |||||| |    
T  16834861 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggttgtatttattgatgacatcctaatttattctaagac 16834960  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| || ||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| | |  ||     
T  16834961 tgacgaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaa 16835060  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16835061 gtgagtttccttggccatattatttc 16835086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10407848 - 10407720
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  10407848 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtaatgcctttctgtgttactaa 10407749  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatga 151  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  10407748 tgcgcctggtgtttttatggagtacatga 10407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 16327911 - 16328236
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || || |||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||      
T  16327911 catcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaaca 16328010  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |   |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||      
T  16328011 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattctaagaa 16328110  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| |||||||   |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  ||     
T  16328111 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagatttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttatggttaagtgaa 16328210  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||    
T  16328211 gtgagttttctgggtcatattatttc 16328236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12270088 - 12269880
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  12270088 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 12269989  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
      || | ||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||      
T  12269988 ttcctgatgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatcttgataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagat 12269889  T
Q  225 tgaagaaga 233  Q
    |||||||||    
T  12269888 tgaagaaga 12269880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25768091 - 25767871
Alignment:
Q  130 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 229  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || || |||||      
T  25768091 ggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcaaaatctgaga 25767992  T
Q  230 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgag 329  Q
    | ||  ||||  ||||||||| | || | ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  25767991 aggagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 25767892  T
Q  330 ttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||| ||||| |||||    
T  25767891 tttccttggtcatgtgatttc 25767871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 11888614 - 11888701
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgccttt 110  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  11888614 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacattatgaatattcggtgatgccttt 11888701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12180022 - 12179891
Alignment:
Q  219 taagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttg 318  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||     
T  12180022 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 12179923  T
Q  319 aaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |  || |||||||||||||||||  |||||||    
T  12179922 attgaagtgagttttcttggccacattatttc 12179891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Original strand, 8745641 - 8745711
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8745641 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcattacgaata 8745711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 92
Target Start/End: Original strand, 12510747 - 12510801
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacga 92  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  12510747 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacga 12510801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Original strand, 14291783 - 14291837
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtt 79  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14291783 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtt 14291837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24189182 - 24189112
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24189182 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaata 24189112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 13318753 - 13318897
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||    | |||||| |||  || ||| ||||    
T  13318753 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgccattcggtgttactaatg 13318852  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  13318853 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctt 13318897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12180222 - 12180167
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 80  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12180222 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 12180167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12795851 - 12795789
Alignment:
Q  288 tgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  12795851 tgccaagttgtctaagtgtgagtcttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgtgatttc 12795789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Original strand, 16826532 - 16826586
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtt 79  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  16826532 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgtt 16826586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 14579668 - 14579716
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttag 71  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14579668 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttag 14579716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 23085939 - 23086210
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||    
T  23085939 catcagattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatg 23086038  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  23086039 cgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagta 23086138  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt 296  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||| |||||    
T  23086139 tgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctggaggagaagaagctttatgctaagtt 23086210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23080560 - 23080258
Alignment:
Q  47 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 146  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || |||||||||||| || || |||||||| ||    
T  23080560 aagatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagta 23080461  T
Q  147 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 246  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||  |||||    
T  23080460 catgaatcgcatttttcatgcatttctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcat 23080361  T
Q  247 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgtta 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23080360 ttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtttgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtta 23080261  T
Q  347 ttt 349  Q
    |||    
T  23080260 ttt 23080258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 350
Target Start/End: Original strand, 20634126 - 20634433
Alignment:
Q  43 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 142  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||    
T  20634126 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatgg 20634225  T
Q  143 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 242  Q
    | ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  |    
T  20634226 agtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctaaagaagaacatgctga 20634325  T
Q  243 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccat 342  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  20634326 gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacat 20634425  T
Q  343 gttatttc 350  Q
    ||||||||    
T  20634426 gttatttc 20634433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 350
Target Start/End: Original strand, 18196024 - 18196226
Alignment:
Q  148 atgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  18196024 atgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatttatgatattttgatatactccaagtccgaagaagagcatgctaagcatt 18196123  T
Q  248 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttat 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18196124 tgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtatgaattttggttgaaagatgtgaattttcttggccatgttat 18196223  T
Q  348 ttc 350  Q
    |||    
T  18196224 ttc 18196226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 117 - 350
Target Start/End: Original strand, 18406204 - 18406437
Alignment:
Q  117 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 216  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  18406204 tacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttac 18406303  T
Q  217 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggt 316  Q
    || ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  18406304 tccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaaactggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactatatgctaaattgtttaagtgtgaattctggt 18406403  T
Q  317 tgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18406404 tgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 18406437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 161 - 350
Target Start/End: Original strand, 18965599 - 18965788
Alignment:
Q  161 ttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgtttt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  18965599 ttcatgcttatttagatcgctttgttgttttgttcattgatgatattttgatatatgctaagtctgaagaagaacattctgagcatttgaagattgtttt 18965698  T
Q  261 gcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  18965699 tcaagtgatgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatattatttc 18965788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 24293948 - 24294275
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  24293948 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 24294047  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  24294048 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 24294147  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24294148 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 24294247  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24294248 aagtgagttttctaggccatgttatttc 24294275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Original strand, 22760621 - 22760947
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  22760621 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaa 22760720  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||    
T  22760721 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattaatgatattttgatttactccaag 22760820  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22760821 tctgaagaagagcatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 22760920  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22760921 aagtgagctttcttggacatgttattt 22760947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 117 - 350
Target Start/End: Original strand, 25608121 - 25608354
Alignment:
Q  117 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 216  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  25608121 tacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagttgtttttattgatgatattttgatttac 25608220  T
Q  217 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggt 316  Q
    || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  25608221 tccaagtctgaagaagaagatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggt 25608320  T
Q  317 tgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25608321 tgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 25608354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18450585 - 18450291
Alignment:
Q  56 agaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcg 155  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || ||    
T  18450585 agaagacgacctttaggacacgttacagaaattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtatttatggaatatattaaccg 18450486  T
Q  156 tatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagttt 255  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |   | || ||| ||| | |||||||||   ||    
T  18450485 tatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgatatactctaaattcaaggaggaacatgtcgagcatttgagaatt 18450386  T
Q  256 gttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||||    
T  18450385 gttttgcaagtgctgaaggggaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagggagttttcttggtcatattatttc 18450291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 2872969 - 2873296
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  2872969 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 2873068  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  2873069 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttgatttactccaag 2873168  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2873169 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaggagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaag 2873268  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  2873269 aagtgagtttccttggccatgttatttc 2873296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22828521 - 22828848
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || ||| |||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  22828521 atcaccagattaaagtaaaagataaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 22828620  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  22828621 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgcgttcatcgatgatattttgatttactccaag 22828720  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22828721 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 22828820  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22828821 aagtgagttttcttggccatgttatttc 22828848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 28261461 - 28261690
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28261461 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28261560  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28261561 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28261660  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28261661 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28284455 - 28284226
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28284455 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28284356  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28284355 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28284256  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28284255 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28284226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 28340210 - 28340439
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28340210 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28340309  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28340310 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28340409  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28340410 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28340439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25114667 - 25114340
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  25114667 atcatcagattaaagtaaaggttgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactgtgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 25114568  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    | |||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  25114567 tacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttgttcatcgatgatattttgatctactccaag 25114468  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  25114467 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgtcaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 25114368  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25114367 aggtgagttttcttggccatgttatttc 25114340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 350
Target Start/End: Original strand, 16961761 - 16961975
Alignment:
Q  136 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 235  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  16961761 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 16961860  T
Q  236 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 335  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16961861 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagtcatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttct 16961960  T
Q  336 tggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||| |||||    
T  16961961 tggccatgtcatttc 16961975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 5837385 - 5837712
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  5837385 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttttggtgttaccaa 5837484  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || || |||    
T  5837485 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtcttcattgacgacattctgatttattccaag 5837584  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||| |||||| |||   ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5837585 actgaggaagaacatgttgagcatctgaagactgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgccaagttgtctaagtgtgagttctggttgaaag 5837684  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||    
T  5837685 aggtaagttttcttggccacgttatttc 5837712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 350
Target Start/End: Original strand, 19487486 - 19487765
Alignment:
Q  61 acggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtattt 160  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||           
T  19487486 acggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaat------- 19487578  T
Q  161 ttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgtttt 260  Q
       |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||    
T  19487579 ---atgcttatttggatcggtttgtggttgtttttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgtt 19487675  T
Q  261 gcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||| |||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||    
T  19487676 gcaagtgttgaaggtaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 19487765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 350
Target Start/End: Original strand, 27564112 - 27564326
Alignment:
Q  136 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 235  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  27564112 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtgttcatcgatgaaattttgatttactccaagactgaagaagaac 27564211  T
Q  236 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 335  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27564212 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttct 27564311  T
Q  336 tggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||    
T  27564312 tggccatgttatttc 27564326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 16925804 - 16926131
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || || || |||||    |  ||||| |||  ||  || ||    
T  16925804 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataatgttatgccgttcggtgtgaccaa 16925903  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || ||| |||| || ||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  16925904 tgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 16926003  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16926004 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagttatctaagtgtgaattctggttgaaag 16926103  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||    
T  16926104 aggtaagttttcttggccatgtcatttc 16926131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27189531 - 27189224
Alignment:
Q  43 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 142  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||    
T  27189531 gatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgg 27189432  T
Q  143 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 242  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  27189431 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgcgga 27189332  T
Q  243 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccat 342  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27189331 acatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccttggccat 27189232  T
Q  343 gttatttc 350  Q
    ||||||||    
T  27189231 gttatttc 27189224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 350
Target Start/End: Original strand, 27259709 - 27260016
Alignment:
Q  43 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 142  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||    
T  27259709 gatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgg 27259808  T
Q  143 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 242  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  27259809 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgcgga 27259908  T
Q  243 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccat 342  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27259909 acatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccttggccat 27260008  T
Q  343 gttatttc 350  Q
    ||||||||    
T  27260009 gttatttc 27260016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Original strand, 18963254 - 18963396
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||    
T  18963254 atcaccagattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaa 18963353  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcat 165  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18963354 tgcaccaggtgtatttatggagtacatgaatcatatttttcat 18963396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 14378084 - 14378409
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14378084 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14378183  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||||| |    
T  14378184 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagac 14378283  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |  ||     
T  14378284 tgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaa 14378383  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  14378384 gtaagttttcttggccacattatttc 14378409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 14379634 - 14379959
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  14379634 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14379733  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||||| |    
T  14379734 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagac 14379833  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |  ||     
T  14379834 tgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaa 14379933  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  14379934 gtaagttttcttggccacattatttc 14379959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 16380637 - 16380866
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16380637 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16380736  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16380737 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16380836  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16380837 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 16380866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 16648233 - 16648462
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16648233 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16648332  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16648333 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16648432  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16648433 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 16648462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19866704 - 19866475
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| |    
T  19866704 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactcca 19866605  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | |||||  |||| |||||||||||    
T  19866604 agactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagcgtgagttctggttgaa 19866505  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19866504 agaggtaagttttcttggccatgttatttc 19866475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22435874 - 22435657
Alignment:
Q  133 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  22435874 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaag 22435775  T
Q  233 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttt 332  Q
    || |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  22435774 aacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttt 22435675  T
Q  333 tcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22435674 tcttggccatgttatttc 22435657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22444272 - 22444055
Alignment:
Q  133 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  22444272 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaag 22444173  T
Q  233 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttt 332  Q
    || |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  22444172 aacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttt 22444073  T
Q  333 tcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22444072 tcttggccatgttatttc 22444055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19455137 - 19454821
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||| |||||  || ||| ||||    
T  19455137 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaatg 19455038  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||   ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  19455037 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggttgtatttattgatgacatcttgatttattcaaagac 19454938  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    | |||||||  ||||  ||||| ||||| | || ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  19454937 taaagaagagcatgcagagcatctgaagatagtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaa 19454838  T
Q  325 gtgagttttcttggcca 341  Q
    |||||||||||||||||    
T  19454837 gtgagttttcttggcca 19454821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 25763474 - 25763721
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||| || || | ||| | ||| ||||| ||| | ||||| || ||||| |    
T  25763474 atgcctttcggtgttacaaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatg 25763573  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    | ||||| || ||||| ||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||  | ||||| || || |||||    
T  25763574 acattttaatttactccaagactgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagataaaaatgtatgctaaattatctaa 25763673  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  25763674 ttgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttc 25763721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25769957 - 25769632
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||| || |||||||| || ||    | |||| |||||  || ||| ||||    
T  25769957 catcagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcggtgttactaatg 25769858  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||   |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || |||||||     
T  25769857 cgcctggtgtatttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagta 25769758  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | |  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  25769757 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaataaatgaagttgtatgctaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 25769658  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  25769657 gtaagttttcttggccacattatttc 25769632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21473713 - 21473398
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    | |||| ||||| ||| ||| ||||    
T  21473713 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcgatgttactaatg 21473614  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | | || ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||| | |||||  | || || ||||||      
T  21473613 cgctgg-tgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttatttatgatatcctaatttattctaagaa 21473515  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  21473514 tgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaggaagttgtatgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 21473415  T
Q  325 gtgagttttcttggcca 341  Q
    || ||||||||||||||    
T  21473414 gtaagttttcttggcca 21473398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18796803 - 18796478
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||| || ||| ||||    
T  18796803 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatg 18796704  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
      || ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||||| ||| | |||   ||||| ||||| ||||||||  | |||||||| || ||||   |    
T  18796703 tgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattcattgataacattttgatctattctagaac 18796604  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||     
T  18796603 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaaatgaa 18796504  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||    
T  18796503 gtgagttttcatggccacattatttc 18796478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23998265 - 23998036
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || |  |    
T  23998265 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattgaa 23998166  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    |||| || |||||  ||||  | ||||||| | |||| ||| ||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| |    
T  23998165 agtccgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaagagaaccagttatgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgga 23998066  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23998065 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 23998036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24366527 - 24366341
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  24366527 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 24366428  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatatttt 209  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24366427 tgtgccaggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 24366341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 1647078 - 1647307
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||| | || || |    
T  1647078 aatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgacattttggtgtattcga 1647177  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||| ||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||   ||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  1647178 agtttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 1647277  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1647278 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 1647307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15461449 - 15461124
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  15461449 catcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 15461350  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| | | |||||   ||||| || ||||| || || |||||| |||| || |||||  |    
T  15461349 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggtggtgtttatagatgatattctgatttattctaaaac 15461250  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||| | ||| | || |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  ||     
T  15461249 tgaagaggaacacgccgaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgatttctggttaagtgaa 15461150  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15461149 gtgagttttctaggccacgttatttc 15461124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 28280981 - 28281125
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  28280981 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 28281080  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    | |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  28281081 cgccgggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 28281125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Original strand, 18183533 - 18183663
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  18183533 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 18183632  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaat 153  Q
    ||| || ||||| |||||||  |||||||||    
T  18183633 tgcgcctggtgtgtttatggtgtacatgaat 18183663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19437115 - 19436790
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19437115 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19437016  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | ||  |||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||   |    
T  19437015 cgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattctagaac 19436916  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| | || ||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |  ||     
T  19436915 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaagagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctgcttaagtgaa 19436816  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||    
T  19436815 gtgagttttctgggccacattatttc 19436790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19881411 - 19881086
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||| ||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19881411 catcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19881312  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||  | |||   ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |   |    
T  19881311 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgttcattgatgacattttgatctattcgagaac 19881212  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||  | |||||||| ||||| || || || |||||||| |  ||     
T  19881211 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaaactgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttctggttaagtgaa 19881112  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  19881111 gtgagttttcttggccatattatttc 19881086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 335
Target Start/End: Original strand, 10467017 - 10467327
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  10467017 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 10467116  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||      
T  10467117 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatctattccaagaa 10467216  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  10467217 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagcgaa 10467316  T
Q  325 gtgagttttct 335  Q
    |||||||||||    
T  10467317 gtgagttttct 10467327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Original strand, 24516576 - 24516646
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24516576 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaata 24516646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 21568159 - 21568303
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||   || |||| |||||  || ||| || |    
T  21568159 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacgaatacaaagtgatgtctttcggtgttactaacg 21568258  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  21568259 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctt 21568303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 350
Target Start/End: Original strand, 5295573 - 5295699
Alignment:
Q  224 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaaga 323  Q
    ||||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| |  ||    
T  5295573 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgtgttctggttaagtga 5295672  T
Q  324 cgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || ||||||||||||||  |||||||    
T  5295673 agtaagttttcttggccacattatttc 5295699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 350
Target Start/End: Original strand, 19985840 - 19985909
Alignment:
Q  281 agttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || | |||||||||||| ||||| |||||    
T  19985840 agttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagcgagttttcttggtcatgtgatttc 19985909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14130477 - 14130257
Alignment:
Q  130 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 229  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | |  |||||| ||||||| || |||||||| || ||||| |  || ||||||||| | || || |||| ||| |    
T  14130477 ggtgtcttcatggaatatatgaatagaacatttcatccttatttggaccgttttgtggtggtgtttagagatgatattttggtgtattcgaagtttgagg 14130378  T
Q  230 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgag 329  Q
    | ||  ||||  ||||||||| | |||| || | |||  |||| |||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||  ||| |||||    
T  14130377 aggagcatgctgagcatttgaggattgtgttacgagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgtgagaagtgag 14130278  T
Q  330 ttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||| ||||| |||||    
T  14130277 tttccttggtcatgtgatttc 14130257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16099893 - 16099797
Alignment:
Q  254 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  16099893 ttgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcaggaagtgaatttccttggtcatgtgatttc 16099797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18578093 - 18577997
Alignment:
Q  254 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||| | ||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18578093 ttgtgttgcaagtcttgaaagagaaccaattatgtgctaagttgtctaagtatgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 18577997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 350
Target Start/End: Original strand, 27283 - 27598
Alignment:
Q  34 aaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtg 133  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||  || ||| ||||| ||||| |    
T  27283 aaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaattatgaatattctgtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggag 27382  T
Q  134 tatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaaga 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  27383 tatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatatcctgatatactctaagtctgaggagga 27482  T
Q  234 aaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagtttt 333  Q
    | ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  27483 acatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgagaattctggttgaacga-gtgagtttt 27581  T
Q  334 cttggccatgttatttc 350  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  27582 cttggtcatattatttc 27598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21400 - 21135
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||    | ||| ||||||  || ||| ||||    
T  21400 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcattatgaatagaaggtgatacctttcggtgttactaatg 21301  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||||| ||||| ||  |||| |||||| | || || |||||| |    
T  21300 cgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagttgtatttcttgatgatattctaatttattctaagac 21201  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgc 290  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||    
T  21200 tgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaataagttgtatgc 21135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8302 - 7975
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| ||| |||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  8302 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaa 8203  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  8202 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccatg 8103  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8102 tctgaagaagaacatgctaagcatttgaagctagttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 8003  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8002 aagtgagctttcttggacatgttatttc 7975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24351 - 24131
Alignment:
Q  130 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 229  Q
    ||||| ||| |||| || |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || || ||||| |    
T  24351 ggtgtctttgtggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtatattcgaaatctgagg 24252  T
Q  230 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgag 329  Q
    | ||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  |||| | |||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||    
T  24251 aggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaggggaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcaggaagtgag 24152  T
Q  330 ttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||| ||||| |||||    
T  24151 tttccttggtcatgtgatttc 24131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 217444 - 217771
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  217444 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 217543  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  217544 tgccccaggtgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcgttttttgatcgtttcgtggttgtgatcattgatgatattttgatatactcgaag 217643  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |  ||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||| || ||||| |||| |||||| |    
T  217644 ttcgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgttaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaatg 217743  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  217744 aggtgagttttcttggccacgttatttc 217771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 201494 - 201819
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||      
T  201494 catcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaaca 201593  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  201594 cgccgggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgatattttgatatactctaagac 201693  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||| ||||  | ||||||||| |||| ||||||||| |||| || || ||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  201694 tgaagaagaacatgcagaacatttgaaggttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagctgtatgccaaatggtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 201793  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || | ||||||||||||| |||||||    
T  201794 gtaaattttcttggccatattatttc 201819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 324984 - 324659
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  324984 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 324885  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||| |||| || || | | |    
T  324884 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacattctgatctattcaaggac 324785  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  |||   | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||| |  ||     
T  324784 tgaagaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagtcgtcgaagtgtgaattctggttaagtgaa 324685  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  324684 gtaagttttcttggccacattatttc 324659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 350
Target Start/End: Original strand, 84558 - 84870
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | | | |||||    
T  84558 tgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgagagtatt 84657  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| |  | || ||  ||    
T  84658 tatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccaaggaggagcat 84757  T
Q  238 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 337  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  84758 gccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgcgaattctggttgaacaaagtgagtttccttg 84857  T
Q  338 gccatgttatttc 350  Q
    | ||| |||||||    
T  84858 gtcatattatttc 84870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 268888 - 268563
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  268888 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 268789  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   || || || ||||| || || ||||||||||| || |||||  |    
T  268788 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtgtttatagatgatattttgatttattctaaaac 268689  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  ||     
T  268688 tgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 268589  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  268588 gtgagtttcctaggccatgttatttc 268563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1280 - 960
Alignment:
Q  22 catcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaa 121  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||  | ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||  || ||| |    
T  1280 catcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcataagacagcctttaggacacgttacagacattacaaatattcggtgatgcctttcggtgttacta 1181  T
Q  122 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 221  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  1180 acgcgccgggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcagtttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaa 1081  T
Q  222 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaa 321  Q
    | | ||||| ||| ||||  |||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||     
T  1080 gaccgaagaggaacatgcggagcatttgagaattgttttgcaagtactgaaggagaagaagttatatgccaaattatcgaagtgtgaattctggttgaac 981  T
Q  322 gacgtgagttttcttggccat 342  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  980 gaagtgacttttcttggccat 960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3855 - 3536
Alignment:
Q  31 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 130  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || |||||||||||| |    
T  3855 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctg 3756  T
Q  131 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 230  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  3755 ctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagga 3656  T
Q  231 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 330  Q
    |||| ||||  |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3655 agaacatgctgagcatttgaagactgttttggaagtgttgaaagagaaaaagttttatgctaaattgtcaaagtgtgaattatggttgaaagaggtgagt 3556  T
Q  331 tttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  3555 tttcttagacatgttatttc 3536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Original strand, 839 - 1160
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || || || |||||   || ||||||||||  || ||||||||||||    
T  839 agattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacc 938  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||  ||||| ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  939 tggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgttttcatagatggtattttgatttactccaagtctgaa 1038  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 328  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1039 gaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtga 1138  T
Q  329 gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  1139 gttttcttggacatgttatttc 1160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 91 - 418
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  91 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaa 190  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  191 tgcacctggtgtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaag 290  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||| |||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  291 actgaggaagaacatgctgagcatttgaagactgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 390  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  391 aggtgagttttcttggccatgttatttc 418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3714 - 3387
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || |  || |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  3714 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttactaa 3615  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  3614 ttcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaac 3515  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  3514 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaattgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 3415  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3414 aagtgagttttcttggccatgttatttc 3387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6153 - 5826
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||    
T  6153 atcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 6054  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  6053 tgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaag 5954  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  |||  || ||| |||||||||||||||    
T  5953 tccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaaag 5854  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||    
T  5853 aggtaagttttcttggccacgttatttc 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13283 - 12956
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||    
T  13283 atcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 13184  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  13183 tgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaag 13084  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  |||  || ||| |||||||||||||||    
T  13083 tccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaaag 12984  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||    
T  12983 aggtaagttttcttggccacgttatttc 12956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 103515 - 103188
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||| ||||| || || ||   || ||||||||||  || | ||||    
T  103515 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatgagtataaagtgatgcctttcggtgttgcaaa 103416  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  103415 tgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtagtattcatcgatgatattttgatttactccaag 103316  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || || ||||||||||| |||||||    
T  103315 tctgaggaagaacatgccgaacatttgaagactgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattatcaaagtgtgaattctgattgaaag 103216  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  103215 aggtgagttttcttggccatgttatttc 103188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21751207 - 21750879
Alignment:
Q  22 catcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaa 121  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||| || ||   ||  ||||||||   || ||| |    
T  21751207 catcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacattatgagtataaagttatgccttttggtgttacta 21751108  T
Q  122 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 221  Q
    |||| |  || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  21751107 atgctcttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttaatttactccaa 21751008  T
Q  222 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaa 321  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  21751007 gtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaaaagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttaaaa 21750908  T
Q  322 gacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || || | ||||||||| |||||||||||    
T  21750907 gaagtaatttttcttggacatgttatttc 21750879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 33389122 - 33389449
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  33389122 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 33389221  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  33389222 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 33389321  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  33389322 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 33389421  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33389422 aagtgagttttctaggccatgttatttc 33389449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 51331586 - 51331913
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  51331586 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 51331685  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  51331686 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 51331785  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  51331786 actgaagaagaacatgcggagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 51331885  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51331886 aagtgagttttctaggccatgttatttc 51331913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20140254 - 20140022
Alignment:
Q  118 acaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatact 217  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20140254 acaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttttggttgttttcattgatgatattttgatttact 20140155  T
Q  218 ctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
    | ||| ||||||||||| ||||  | || |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  20140154 ccaagactgaagaagaacatgctgatcacttgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctctatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 20140055  T
Q  318 gaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20140054 gaaaaaagtgagctttcttggccatgttatttc 20140022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 50618491 - 50618818
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  50618491 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 50618590  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  50618591 tgcccctggagtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaag 50618690  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||| |||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||||||||    
T  50618691 actgaggaagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 50618790  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  50618791 aggtgagttttcttggacatgttatttc 50618818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 430289 - 430536
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  430289 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatg 430388  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || |||||    
T  430389 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaa 430488  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  430489 gtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttc 430536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21832568 - 21832241
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  21832568 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 21832469  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||  || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  21832468 tgcacatggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 21832369  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21832368 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 21832269  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21832268 aagtgagttttctaggccatgttatttc 21832241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21839216 - 21838889
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  21839216 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 21839117  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  21839116 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 21839017  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21839016 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 21838917  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21838916 aagtgagttttctaggccatgttatttc 21838889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Original strand, 21862466 - 21862792
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || | |||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  21862466 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaa 21862565  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||    
T  21862566 tgcacctagtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttggaccgtttcgtggttgtttttattgatgacattttaatttactccaag 21862665  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||| |||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21862666 actgaggaagaacatgctgagcatttgaagatggttttgcaagtgttcaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 21862765  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21862766 aggtgagttttcttggacatgttattt 21862792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 22360337 - 22360664
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  22360337 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaa 22360436  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||  ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  22360437 tgcaccttgagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattttaggatcggttcgtcgttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 22360536  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||| | | | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22360537 tctgaagaagaacctgctgagcatttgaaactggttttgcaggtgttgaaagagaagatgatttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 22360636  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| | |||||| |||||||||||    
T  22360637 aagtgagctatcttggacatgttatttc 22360664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 16348688 - 16349016
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaat-gctacaa 121  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||     | ||| |    
T  16348688 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgggagttacca 16348787  T
Q  122 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 221  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  16348788 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaa 16348887  T
Q  222 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaa 321  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16348888 gactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaa 16348987  T
Q  322 gacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||    
T  16348988 gaagtgagttttctaggtcatgttatttc 16349016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 17043108 - 17043435
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  17043108 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 17043207  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  17043208 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 17043307  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     || |||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  17043308 actaaagaagaacatgctgagcatatgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaag 17043407  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  17043408 aagtaagttttcttggccatgttatttc 17043435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 41351755 - 41352082
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  41351755 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaa 41351854  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  41351855 tgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaag 41351954  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41351955 actgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 41352054  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  41352055 aagtgagttttcttggtcatgttatttc 41352082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19108536 - 19108307
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || || || | ||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  19108536 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgatattttgatttactcta 19108437  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  19108436 agactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 19108337  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19108336 agaagtgagttttcttggccatgttatttc 19108307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 21233824 - 21234151
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  |  ||    
T  21233824 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgatcaa 21233923  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  21233924 tgcacctcgagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaag 21234023  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21234024 actgaagaagaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 21234123  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  21234124 aagtaagttttcttggccatgttatttc 21234151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 24792709 - 24793036
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   ||  || ||    
T  24792709 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaa 24792808  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  24792809 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 24792908  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24792909 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 24793008  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  24793009 aagtaagttttcttggccatgttatttc 24793036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16378355 - 16378150
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||    
T  16378355 agattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcc 16378256  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| |||    
T  16378255 tggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtgtttattgatgacattttgatatacttcaagtccgaa 16378156  T
Q  229 gaagaa 234  Q
    ||||||    
T  16378155 gaagaa 16378150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 20829583 - 20829812
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  20829583 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 20829682  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  20829683 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 20829782  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20829783 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 20829812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 20854855 - 20855180
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  20854855 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20854954  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||||||||| || |||||  |    
T  20854955 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaac 20855054  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  | || |||||| |||| |||||  |  |||| |||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  ||     
T  20855055 tgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaa 20855154  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20855155 gtgagttttctaggccatgttatttc 20855180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 21743647 - 21743972
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  21743647 catcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 21743746  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| |||||  | || || || || |||||| |    
T  21743747 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttaatttattctaagac 21743846  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  21743847 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaa 21743946  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||| ||||||||||  |||||||    
T  21743947 gtaagtcttcttggccacattatttc 21743972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 20833995 - 20834320
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||||||||   || ||| ||||    
T  20833995 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatg 20834094  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | |  ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  20834095 cgcgtggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagac 20834194  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||| ||||  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    ||     
T  20834195 tgaagaagaacatgcagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaggttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttatgtgaa 20834294  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||||||||||  |||||||    
T  20834295 gcgagttttcttggccacattatttc 20834320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 31538090 - 31538402
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  31538090 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 31538189  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  31538190 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 31538289  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  31538290 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 31538389  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | || ||||||||    
T  31538390 aagtaagttttct 31538402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21026275 - 21026112
Alignment:
Q  187 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 286  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |    
T  21026275 gttgttttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 21026176  T
Q  287 atgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21026175 atgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagtttttttggccatgttatttc 21026112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Original strand, 22503382 - 22503708
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  ||| |||||  || ||| ||    
T  22503382 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtctttcggtgttaccaa 22503481  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  22503482 tgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcggggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 22503581  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22503582 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaag 22503681  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||    
T  22503682 aggtaagttttcttggccatgtcattt 22503708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48425170 - 48424858
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  48425170 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 48425071  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  48425070 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 48424971  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  48424970 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 48424871  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | || ||||||||    
T  48424870 aagtaagttttct 48424858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52988038 - 52987726
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  52988038 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 52987939  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||    
T  52987938 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaag 52987839  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  52987838 aatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatg 52987739  T
Q  323 acgtgagttttct 335  Q
    | || ||||||||    
T  52987738 aagtaagttttct 52987726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41308775 - 41308612
Alignment:
Q  187 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 286  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  41308775 gttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgt 41308676  T
Q  287 atgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||    
T  41308675 atgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 41308612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Original strand, 38910919 - 38911065
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||    
T  38910919 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaa 38911018  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||    
T  38911019 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccaaattttccatgctt 38911065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 19661231 - 19661556
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19661231 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19661330  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  |||||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || | | |    
T  19661331 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaggac 19661430  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  19661431 tgaagaagagcatgcatagcatctgaagattgtattgtaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 19661530  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||    
T  19661531 gtgagttttcctggccacattatttc 19661556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37679346 - 37679160
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||    
T  37679346 atcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 37679247  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatatttt 209  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  37679246 tgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 37679160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21953173 - 21952881
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  21953173 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 21953074  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||      
T  21953073 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaa 21952974  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
     ||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21952973 cgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 21952881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20927222 - 20927005
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | ||  ||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  20927222 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacagttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 20927123  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  |||   ||||||||| | |||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  20927122 agtctgaggaagagcatgatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaa 20927023  T
Q  321 agacgtgagttttcttgg 338  Q
     || |||| ||| |||||    
T  20927022 ggaagtgattttccttgg 20927005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20296676 - 20296384
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  20296676 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20296577  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||      
T  20296576 cgcctggtgtgttcatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattctaagaa 20296477  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| | |   |||| ||||||||| |||| || || |  || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  20296476 tgaagaggagcatgcagagcatctaagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 20296384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16378156 - 16378081
Alignment:
Q  275 agaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16378156 agaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggttagttttcttggccatgttatttc 16378081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 20938158 - 20938483
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  20938158 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 20938257  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || | | |||| || || ||| |    
T  20938258 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacagtctgatttattcgaagac 20938357  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  |||   ||||| |||   | || || |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  20938358 tgaagaagagcatgtagagcatctgagaatagtattacaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaa 20938457  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  20938458 gtaagttttcttggccacattatttc 20938483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Original strand, 24097698 - 24097768
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||    
T  24097698 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacgaata 24097768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19856569 - 19856514
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 80  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19856569 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 19856514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 41310821 - 41310766
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 80  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41310821 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 41310766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 341
Target Start/End: Original strand, 23196573 - 23196660
Alignment:
Q  254 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 341  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  || || ||||||||||||||    
T  23196573 ttgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 23196660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 16002 - 16328
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || || || |||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || || |||| |||||||||   || ||||||    
T  16002 atcaccagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacattatgagtattcagtgatgcctttgggtgttacaaa 16101  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     || || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16102 cgcgccaggtgtgtttatgtagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttatattcatcgatgatattttgatatactctaag 16201  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||| ||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  16202 actgaagaggaatatgctgagcatttgaagatt-ttttgcaagtgttcaaggagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 16300  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||| || |||||||||    
T  16301 aggtaagttttcttgaccgtgttatttc 16328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 42131 - 42458
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||  |||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||  || ||| ||    
T  42131 atcaccagatcaaagtgaaagatggggatattcagaagacggcctttaggacacattacgaacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaa 42230  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     || |  || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| |||    
T  42231 cgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgtgtttatagatgatattctgatatactccaag 42330  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     | || || ||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || || || || |||||||||||||| |    
T  42331 accgaggaggaacatgccgagcatttgagatttgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccagtttatcgaagtgcgaattctggttgaacg 42430  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||    
T  42431 aagtgagttttcttggtcatattatttc 42458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5029 - 4704
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||  | || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  5029 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 4930  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||||||| ||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  4929 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagttgtgtttattgatgacattctgatttattctaagac 4830  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  4829 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaattgtgagttctggttaagtgaa 4730  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  4729 gtcagttttcttggccacattatttc 4704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 38070 - 38299
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  38070 aatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactaca 38169  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  38170 agtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 38269  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  38270 agaagtgagctttcttggacatgttatttc 38299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 350
Target Start/End: Original strand, 115171 - 115332
Alignment:
Q  189 tgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatat 288  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  115171 tgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagtagttatat 115270  T
Q  289 gccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  115271 gccaagttgtcaaagtgtgaattttggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 115332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 124
Target Start/End: Original strand, 115062 - 115163
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| || || |||||  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||  || ||||||    
T  115062 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacattacgaatattgagtgatgcctttcggtgttacaaa 115161  T
Q  123 tg 124  Q
    ||    
T  115162 tg 115163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Original strand, 803 - 1126
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  803 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaa 902  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  903 tgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaag 1002  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    ||||||||| |   |||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1003 tctgaagaaca---tgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgagag 1099  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1100 aagtgagctttcttggacatgttattt 1126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Original strand, 2537 - 2856
Alignment:
Q  31 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 130  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||    || |||||| || |  |    
T  2537 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgccttctggtgttacaaacgcgcttg 2636  T
Q  131 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 230  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  2637 gtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactccaagtctgagga 2736  T
Q  231 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 330  Q
    |||| ||||  |||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || ||||||||||||||||||||  |||||    
T  2737 agaacatgctgagcatttgaagactagtttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagagatgagt 2836  T
Q  331 tttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2837 tttcttggccatgttatttc 2856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 87050 - 86724
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||  || ||| ||    
T  87050 atcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcgatgatgcctttcggtgttactaa 86951  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
     || || || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| || || || ||| | ||||||||||||    
T  86950 cgcccctggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgatttgttgttatgtttatagatgagattctaatatactctaag 86851  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     | || || ||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || || || |||||||||||||| |    
T  86850 accgaggaggaacatgccgagcattt-aagaatgttttgcaagtgctgaaggagaataagttatatgcctagttatcgaagtgcgaattctggttgaacg 86752  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||    
T  86751 aagtaagttttcttggccatattatttc 86724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 151392 - 151065
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||   ||  |||||||||  || ||  ||    
T  151392 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttatgaa 151293  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || ||  ||||||| || ||||| |||    
T  151292 tgcacttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgataatattttaatttactccaag 151193  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  151192 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggtgttgcaagtgttgaaagagaataagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaag 151093  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  151092 aagtgagctttctaggacatgtaatttc 151065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 85254 - 85581
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||   ||  |||||||||  || ||| ||    
T  85254 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacgaa 85353  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || | ||| |||    
T  85354 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttcctccaag 85453  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  85454 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagcttgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaag 85553  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  85554 aagtgagctttcttggacatgttatttc 85581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 347
Target Start/End: Original strand, 85820 - 86144
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  85820 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 85919  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || ||||| || || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  85920 tgcacctggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgttttcatcgatgacattttgatttactccaag 86019  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  86020 actgaagaagaacatattgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 86119  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttat 347  Q
    | || ||||||||||||||||||||    
T  86120 aggtaagttttcttggccatgttat 86144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 132611 - 132840
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || ||| || ||||| | ||  ||||||| || || || || || ||||||||  | || || |    
T  132611 aatgcgcccggtgtctttatggaatacatgaatagaatattttatccttatctggactgttttgtggtggtctttatagatgatattttagtgtattcga 132710  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||| ||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  132711 agtttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 132810  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  132811 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 132840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 40914 - 40588
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  40914 atcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 40815  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  40814 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaag 40715  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     | || |||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  40714 accgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 40615  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  40614 aggtgagttttcttggccatgttattt 40588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 74634 - 74308
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  74634 atcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 74535  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  74534 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaag 74435  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     | || |||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  74434 accgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 74335  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  74334 aggtgagttttcttggccatgttattt 74308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 56037 - 55710
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||    
T  56037 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 55938  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  55937 tgcccctggagtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaag 55838  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     |||| |||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||||||||    
T  55837 actgaggaagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaag 55738  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  55737 aggtgagttttcttggacatgttatttc 55710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 8948 - 9177
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | || |||||| ||||| | |||||||||||  | |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  8948 aatgcaccaggtgtctttatgggatacatgaatagaatatttcatccttatctggatcgttttgtgatggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 9047  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  9048 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaactagttatgtgttaagttatctaagtgtgagttttggttgaa 9147  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9148 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 9177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 7111 - 7438
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||   || |||| | |||  || ||||||    
T  7111 atcaccagattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgtcgttcggtgttacaaa 7210  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||  | ||||| ||||| || || |||||| | ||||| |||    
T  7211 tgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttggtttactccaag 7310  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  7311 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatg 7410  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7411 aggtgagttttcttggccatgttatttc 7438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 176374 - 176694
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||| | || |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||  || ||| ||||| ||    
T  176374 agattaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcc 176473  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  176474 tggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgttgtatttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaa 176573  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 328  Q
    |||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||| ||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || |    
T  176574 gaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgtaagtgttgaatgaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaa 176673  T
Q  329 gttttcttggccatgttattt 349  Q
     ||||||||||||| ||||||    
T  176674 attttcttggccatattattt 176694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9220 - 8893
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  9220 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 9121  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  9120 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 9021  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9020 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 8921  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8920 aagtgagttttctaggccatgttatttc 8893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 261 - 14
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  261 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatg 162  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || |||||    
T  161 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaa 62  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  61 gtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttc 14  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11108 - 10791
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  11108 catcagattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttaccaatg 11009  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  11008 cgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 10909  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  || |  ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  10908 tgaagaagagcatacagagcatttaaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 10809  T
Q  325 gtgagttttcttggccat 342  Q
    || |||||||||||||||    
T  10808 gtaagttttcttggccat 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17931 - 17609
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||    | ||||||||||  || ||||||    
T  17931 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaa 17832  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||     ||| ||||  ||     
T  17831 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcaatgatgat-----gatttacttcaat 17737  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  17736 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaatctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 17637  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17636 aagtgagttttcttggccatgttatttc 17609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16923 - 16596
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  16923 atcaccagattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaa 16824  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   ||| ||||| || || || || || || || ||||||||||| ||||| |||    
T  16823 tgcaccaggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcggttcgtggtggtttttatcgatgatattttgatttactccaag 16724  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16723 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaattgcgaattctggttgaaag 16624  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16623 aagtgagctttcttggacatgttatttc 16596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12073 - 11748
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  12073 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11974  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||      
T  11973 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaa 11874  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  11873 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttgagtgaa 11774  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     | ||||||||||||||| |||||||    
T  11773 ttaagttttcttggccatattatttc 11748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 24969 - 25296
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||||||    
T  24969 atcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 25068  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25069 tgcacctgaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttctttttattgacgatattttgatttactccaag 25168  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      ||| |||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  25169 attgaggaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagataagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaag 25268  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |  |||||||||||||  ||||||||||    
T  25269 aattgagttttcttggatatgttatttc 25296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20520 - 20193
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || || || |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  20520 atcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaa 20421  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20420 tgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 20321  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20320 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 20221  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  20220 aattgagctttcttggacatgctatttc 20193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45433 - 45106
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  45433 atcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 45334  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | ||||||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  45333 tgcacctagagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 45234  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  45233 actgaagaagaacatgctgatcatctgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaaaaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 45134  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  45133 aggtgagttttcttggccatgttatttc 45106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10756 - 10429
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| |||||||| |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  10756 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacgactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 10657  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  10656 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaag 10557  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||| ||||| ||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  10556 actgaaaaagaacatgctgagcatctaaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgagag 10457  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  10456 aagtgagtttccttggccatgttatttc 10429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17218 - 16891
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  17218 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 17119  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  17118 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaag 17019  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  17018 actgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgagag 16919  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  16918 aagtgagtttccttggccatgttatttc 16891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 48540 - 48865
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  48540 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 48639  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  48640 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 48739  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||     
T  48740 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 48839  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  48840 gtgagttttcttggccatattatttc 48865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31227 - 30900
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||||||    
T  31227 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacaaa 31128  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  31127 tgcacctagagtatttatggagtgcatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 31028  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    ||| || ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31027 tcttaataagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 30928  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  30927 aagtgagctttcttggacatgttatttc 30900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51090 - 50765
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  51090 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 50991  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| ||| | |||   ||| | |||||||| ||||| || || || || || |||| | |    
T  50990 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctatgac 50891  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||     
T  50890 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattcttgttaagtgaa 50791  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  50790 gtaagttttcttggccatattatttc 50765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7409 - 7176
Alignment:
Q  117 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 216  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  7409 tacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttac 7310  T
Q  217 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggt 316  Q
    || ||| | || |||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  7309 tccaagaccgaggaagaacatgttgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggt 7210  T
Q  317 tgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7209 taaaagaagtgagttttcttggacatgttatttc 7176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 348
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6680
Alignment:
Q  104 tgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacga 203  Q
    ||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||    
T  6436 tgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcgtttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatga 6535  T
Q  204 tattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaa 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||     
T  6536 tattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaag 6635  T
Q  304 tgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatt 348  Q
    || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  6636 tgcgaattctggttgaaagaagtgtgctttcttggacatgttatt 6680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 1486 - 1733
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||| | ||  | ||||| |||||||| |    
T  1486 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatg 1585  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  1586 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 1685  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  1686 gtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttgtacatgttatttc 1733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 721
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||    
T  1048 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaa 949  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| ||||  |||    
T  948 tgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttacttcaag 849  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  848 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaacctttatgcgaaattgtctaagggtgaattctggttgaaag 749  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  748 aagtgagctttcttggacatgttatttc 721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16440 - 16113
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||  || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  16440 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttgtggtcactatgaatataaagttatgcctttccgtgtgaccaa 16341  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16340 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgatattttgatttactccaag 16241  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16240 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaaatttatgctaacttgtctaagtgtgaattctggttgaaag 16141  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||    
T  16140 aattaagttttcttggccatgttatttc 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2605 - 2375
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  2605 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 2506  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt-gtctaaatgtgaattctggttga 319  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||| ||||||||||||||||    
T  2505 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaataacctttatgctaacttggtctaagtgtgaattctggttga 2406  T
Q  320 aagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  2405 aagaattaagttttcttggccatgttatttc 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9648 - 9321
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  9648 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 9549  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||    
T  9548 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatatttttatttactccaag 9449  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9448 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaag 9349  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9348 aagtgagttttcttggccatgttatttc 9321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 11263 - 11590
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  11263 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 11362  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  11363 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatattttgatttactccaag 11462  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11463 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 11562  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  11563 aagtaagttttcttggccatgttatttc 11590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 50259 - 50045
Alignment:
Q  136 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 235  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  50259 tttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 50160  T
Q  236 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 335  Q
    |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  50159 atgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattttggttgaaagaagtgggctttct 50060  T
Q  336 tggccatgttatttc 350  Q
    ||| |||||||||||    
T  50059 tggacatgttatttc 50045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 53837 - 53638
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||| ||| |    
T  53837 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatg 53738  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  53737 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 53638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31084 - 30837
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||| ||||| || |    
T  31084 atgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcatcgaag 30985  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||  | ||||| || || |||||    
T  30984 atattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaa 30885  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30884 gtgtgagttctggttgaaagaggtcagttttcttggccatgttatttc 30837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36550 - 36302
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| |||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  36550 atgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgatg 36451  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||  | ||||| || || |||||    
T  36450 atatttttatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaa 36351  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtga-gttttcttggccatgttatttc 350  Q
     ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  36350 gtgtgagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttc 36302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40429 - 40108
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||    
T  40429 agattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 40330  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| ||||| ||| |||||    
T  40329 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgacattttgatttactccaagactgaa 40230  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 328  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  40229 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaa 40130  T
Q  329 gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40129 gttttcttggccatgttatttc 40108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 350
Target Start/End: Original strand, 14261 - 14476
Alignment:
Q  136 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttg-atatactctaagtctgaagaagaa 234  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||  || ||||| | | |||||||||||    
T  14261 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatattttttatttactccatgactgaagaagaa 14360  T
Q  235 aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttc 334  Q
     ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  14361 tatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttctaagtgtgaattctgtttgaaggaagtaagttttc 14460  T
Q  335 ttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||||    
T  14461 ttggccatgttatttc 14476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 406
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||  || || ||||| || ||| | |    
T  652 atgcctttcagttttactaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtttttatttatg 553  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||    
T  552 atattttgatttactctaagtctgaagaagaacatatga-gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaagttatctaa 454  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  453 ctgtgaattttggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20804 - 20557
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  20804 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatg 20705  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||  | ||||| || || |||||    
T  20704 atattttaatttactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaagagagaagaaactttatgctaaattatctaa 20605  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20604 gtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 20557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36228 - 35981
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  36228 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatg 36129  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||  | ||||| || || |||||    
T  36128 atattttaatttactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaatagagaagaaactttatgctaaattatctaa 36029  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36028 gtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 35981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Original strand, 107835 - 108162
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||  ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  107835 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgtagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 107934  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||| ||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  107935 tgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 108034  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
      |||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  108035 attgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 108134  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  108135 aggtaagttttcttggccatgttatttc 108162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 114839 - 114514
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  114839 catcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 114740  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  114739 cgcctggtgtgttcatggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcaagaac 114640  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||||| || || || |||||||| || ||     
T  114639 tgaggaagagcatgcagaacatctgatgattgtattgcaagtattgaaagagaagaaattgtatgccaaattgtcgaagtgcgagttctggttaaatgaa 114540  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  114539 gtgagttttcttggccatattatttc 114514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Original strand, 94920 - 94990
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  94920 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcactacgaata 94990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2996 - 2671
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  2996 catcagattaagtcgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 2897  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  2896 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagac 2797  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||     
T  2796 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgagttctggttaagtgaa 2697  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  2696 gtaagttttcttggccacattatttc 2671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35778 - 35450
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||    
T  35778 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaa 35679  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||||| |||    
T  35678 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctcatcgatgatattttaatttactccaag 35579  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  35578 accgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 35479  T
Q  323 acgtga-gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||||    
T  35478 aggtaaggttttgttggccatgttatttc 35450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8574 - 8327
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| || || || |    
T  8574 atgcctttcggtgttacgaatgcacctgtagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgatg 8475  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||||| || |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||   ||||| || ||||||||    
T  8474 atattttgatttactccaagtctaaggaagaacattctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagaaaagaagcattatgcgaaattgtctaa 8375  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8374 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8251 - 8004
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  || |||||||| | ||| ||||| || ||  |||| |||||||| |    
T  8251 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtgcttgttttcattgatg 8152  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  8151 atattttgatttactccaagtttgaggaagaatatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 8052  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  8051 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttc 8004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17447 - 17200
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||  |  |||| |||||||| |    
T  17447 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcttgcttgttttcattgatg 17348  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  17347 atattttgatttactccaagtttgatgaagaatattttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 17248  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  17247 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttc 17200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 23178 - 23425
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||    
T  23178 atgcctttcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatcgacg 23277  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    | |||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||||||  |||||||    
T  23278 acattttgatttactccaaaactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaactgtctaa 23377  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23378 gtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 23425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 350
Target Start/End: Original strand, 195531 - 195838
Alignment:
Q  43 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||| |  ||||||||||    
T  195531 gatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatgg 195630  T
Q  143 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 242  Q
    | || |||||||| || || ||||| | | | ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  195631 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctga 195730  T
Q  243 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccat 342  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  195731 gcatctgaaggttgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccat 195830  T
Q  343 gttatttc 350  Q
    || |||||    
T  195831 gtcatttc 195838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 58297 - 57970
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||    
T  58297 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 58198  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||    
T  58197 tgcacctggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtgtttatcgatgacattttgatttactccaag 58098  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaag 322  Q
     ||||||||||| ||||   |||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  58097 actgaagaagaacatgctgtgcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaag 57998  T
Q  323 acgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  57997 aggtaagttttcttggccatgttatttc 57970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 350
Target Start/End: Original strand, 18321 - 18418
Alignment:
Q  254 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga-gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  18321 ttgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttc 18418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 13240 - 13562
Alignment:
Q  28 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 127  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || ||||| || || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| |||||||    
T  13240 cagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttttggtgttacgaatgcac 13339  T
Q  128 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 227  Q
      || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||  || |  || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13340 gtggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgatttaaaagatgatattttgatttactccaagtctga 13439  T
Q  228 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtg 327  Q
    ||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  13440 agaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttaaaagaagtg 13539  T
Q  328 agttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  13540 agctttcttggacatgttatttc 13562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4139
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata--atcagc-gatgcctttcaatgctacaa 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  || ||  ||||||||||  || ||| |    
T  4459 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataataaggtgatgcctttcggtgttacta 4360  T
Q  122 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 221  Q
    |||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| |||||  | || ||||| || | |||    
T  4359 atgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttgatttattataa 4260  T
Q  222 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaa 321  Q
    | ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |      
T  4259 gactgaagaagagcatgcataacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagt 4160  T
Q  322 gacgtgagttttcttggccat 342  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  4159 gaagtaagttttctgggccat 4139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2149 - 1824
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  |||||| ||||    
T  2149 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgctactaatg 2050  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | ||  |||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||    |||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  2049 cgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 1950  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||     
T  1949 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaa 1850  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || |||||||||| |||| |||||||    
T  1849 gtaagttttcttgaccatattatttc 1824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Original strand, 2298 - 2614
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||    
T  2298 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatg 2397  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||||      
T  2398 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaa 2497  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  2498 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttaagtgaa 2597  T
Q  325 gtgagttttcttggcca 341  Q
    || ||||||||||||||    
T  2598 gtaagttttcttggcca 2614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Original strand, 29311 - 29627
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||    
T  29311 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatg 29410  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||||      
T  29411 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaa 29510  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  29511 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttaagtgaa 29610  T
Q  325 gtgagttttcttggcca 341  Q
    || ||||||||||||||    
T  29611 gtaagttttcttggcca 29627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 350
Target Start/End: Original strand, 44846 - 44994
Alignment:
Q  202 gatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcta 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||| ||  | |||||||| |||||||    
T  44846 gatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaaatgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtcta 44945  T
Q  302 aatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44946 agtgtgacttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 44994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 350
Target Start/End: Original strand, 8876 - 9159
Alignment:
Q  67 tttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatg 166  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||    ||||| ||||    
T  8876 tttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttccatg 8975  T
Q  167 cttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagt 266  Q
    ||||| | |||   ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||  || | ||||||||    
T  8976 cttatctggataaatttgtggtcgtgtttattgatgatatctttatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagt 9075  T
Q  267 gctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    || ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  9076 gttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttatgtgaagtgtgttttcttcgccatattatttc 9159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Original strand, 50206 - 50530
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||      
T  50206 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaca 50305  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  50306 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagac 50405  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||| ||| |  ||     
T  50406 ggaagaagagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaa 50505  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    || || |||||||||||| ||||||    
T  50506 gttagctttcttggccatattattt 50530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Original strand, 59240 - 59564
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||      
T  59240 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaca 59339  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  59340 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagac 59439  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||| ||| |  ||     
T  59440 ggaagaagagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaa 59539  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    || || |||||||||||| ||||||    
T  59540 gttagctttcttggccatattattt 59564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Original strand, 65628 - 65952
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||      
T  65628 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaca 65727  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  65728 cgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagac 65827  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||| ||| |  ||     
T  65828 ggaagaagagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaa 65927  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    || || |||||||||||| ||||||    
T  65928 gttagctttcttggccatattattt 65952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28902 - 28610
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  28902 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 28803  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || |||||  ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  28802 cgcctggtgtgcttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 28703  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| | || ||| ||||| ||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28702 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgaaagtgttgaaagaaaagaagttgtctgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 28610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 350
Target Start/End: Original strand, 55886 - 56198
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||   |  ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  55886 tgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 55985  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 237  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||| | | |||   ||| | ||||| |||||||| || ||  | || || || ||| ||||||| ||  ||    
T  55986 catggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggttgtattcattgatgacatcctaatttattccaagactgaagaggagcat 56085  T
Q  238 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 337  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||     
T  56086 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctta 56185  T
Q  338 gccatgttatttc 350  Q
    ||||  |||||||    
T  56186 gccacattatttc 56198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 47060 - 47385
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  47060 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 47159  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| |  ||||| ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || | ||||      
T  47160 cgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccaaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattttaagaa 47259  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| || || |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |  ||     
T  47260 tgaagatgagcatgcagagcatctgcagattgtattgcaagtgttgaaagaaaaaaagttgtatgcgacgttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaa 47359  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||    
T  47360 gtaggttttcttggccatattatttc 47385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Original strand, 5115 - 5439
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagc-gatgcctttcaatgctacaaat 123  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || | ||  |||| |||||  || ||| |||    
T  5115 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagta-taagatgatgtctttcggtgttactaat 5213  T
Q  124 gcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagt 223  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||     
T  5214 gcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaaga 5313  T
Q  224 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaaga 323  Q
     |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |     
T  5314 atgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgg 5413  T
Q  324 cgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
     || ||||||||||||||| ||||||    
T  5414 agtaagttttcttggccatattattt 5439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7030 - 6705
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  7030 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 6931  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || | ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||| | |   |   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  6930 cgcctgatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 6831  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| |||||  |||   | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  6830 tgaggaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 6731  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  6730 gtgagttttcttggccacattatttc 6705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25578 - 25349
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  25578 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 25479  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  25478 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 25379  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  25378 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 25349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15092 - 14863
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15092 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 14993  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  14992 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 14893  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14892 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 14863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Original strand, 11296 - 11513
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  11296 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 11395  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||    ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||| | ||| ||||| || ||||||||    
T  11396 agtctgaggaagagcataatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttatataagtgtgagttttggttgaa 11495  T
Q  321 agacgtgagttttcttgg 338  Q
     || |||||||| |||||    
T  11496 ggaagtgagtttccttgg 11513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33614 - 33289
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  33614 catcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 33515  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||| |||   || || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |    
T  33514 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtggttgtgttcattgatgacatcttgatttattctaagac 33415  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| | ||| |||| || || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||| |  ||     
T  33414 tgaagaagagcatgcagaacatctaaagattgtattacaggtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgttaaaatgtgagttctagttaagtgaa 33315  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  33314 gtaagttttcttggccacattatttc 33289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 262504 - 262179
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  262504 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 262405  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||||  | | | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || |||||| |    
T  262404 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcctaatttattctaagac 262305  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    | |||| ||  ||||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  262304 taaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaa 262205  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  262204 gtgagttttcttggccacattatttc 262179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 349
Target Start/End: Original strand, 18445 - 18691
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||  || || ||||| || || || |    
T  18445 atgcctttcggtgttacgaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtttttatcgatg 18544  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  ||| | ||||| || ||||||||    
T  18545 atattttgatttaccccaagtttgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaagagatgaagctttatgcgaaattgtctaa 18644  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18645 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttattt 18691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22154 - 22102
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacg 77  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22154 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacg 22102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19632 - 19307
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  19632 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19533  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || || ||    ||||| ||||||||| |||||   ||||| ||| |||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  19532 cgcctggtgtgtttatggagtatataaacaaaattttccatgcttatctagataaatttgtggttatgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 19433  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
     ||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  19432 cgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaa 19333  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  19332 gtaagttttcttggccacattatttc 19307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49384 - 49067
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||   | ||| ||||    
T  49384 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatg 49285  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||    ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  49284 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 49185  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |   |     
T  49184 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtcaa 49085  T
Q  325 gtgagttttcttggccat 342  Q
    || |||||||||||||||    
T  49084 gtaagttttcttggccat 49067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Original strand, 49905 - 50226
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || || ||||| |||||    | |||||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  49905 agattaaggtgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcc 50004  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 228  Q
     ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |||||    
T  50005 tggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaa 50104  T
Q  229 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtga 328  Q
    |||||  ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || || |    
T  50105 gaagagcatgcagagcatctgaagattgtgtttcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaa 50204  T
Q  329 gttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  50205 gttttcttggccatattatttc 50226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 2979 - 3304
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  2979 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 3078  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   || || |||||||| ||||| || ||  | || || || ||| |    
T  3079 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcctaatttattcaaagac 3178  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  3179 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtttagtgaa 3278  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||  |||||||||||||  |||||||    
T  3279 gtttgttttcttggccacattatttc 3304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 69650 - 69325
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  69650 catcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 69551  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   || || || || || ||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  69550 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaagac 69451  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  | |  |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||| ||| |  ||     
T  69450 tgaagaggagcatgcagaacgcttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttcttgttaagtgaa 69351  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  69350 gtgagttttctaggccacgttatttc 69325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 109910 - 109585
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  109910 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 109811  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
      ||  |||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||||| || ||  |||| || |||||| |    
T  109810 tgcctagtgtgtttatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcgtgatttattctaagac 109711  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||     
T  109710 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgcgagttctggttaagtgaa 109611  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  109610 gtaagttttcttggccatattatttc 109585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 55020 - 55342
Alignment:
Q  28 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 127  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||    
T  55020 cagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcac 55119  T
Q  128 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 227  Q
    | || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||  ||||| ||||| ||  | || |||||||| || ||||| ||  ||||    
T  55120 ctggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggatccctttgtggttgtttttctggatgatatttttatttactccaatactga 55219  T
Q  228 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtg 327  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| | ||     
T  55220 agaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtttaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaaaaggta 55319  T
Q  328 agttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  55320 agttttcttggccatgttatttc 55342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 99588 - 99913
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  99588 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 99687  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||   |    
T  99688 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattctagaac 99787  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  99788 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaaaagttatatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 99887  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||    
T  99888 gtgagttttctgggccacattatttc 99913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2881 - 2637
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||  ||||||| || || || ||||| || ||||||  || |||||| |||| || ||||||    
T  2881 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgttcagtgttacaaa 2782  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaag 222  Q
    ||||||  | || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||  ||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  2781 tgcacctcgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactgcaag 2682  T
Q  223 tctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtg 267  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2681 tctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtg 2637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16392 - 16068
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  16392 catcagattaaggtgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16293  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||| | |    
T  16292 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctacgac 16193  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||     
T  16192 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaa 16093  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    || ||||||||||||||| ||||||    
T  16092 gtaagttttcttggccatattattt 16068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 7983 - 8212
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||| | || ||||| || || ||||||||  | || || |    
T  7983 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttttggtggtgtttatagatgatattttagtgtattcga 8082  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    |||| || |||||  |||   ||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8083 agtcggaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgtgttttggttgaa 8182  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8183 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 8212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42433 - 42213
Alignment:
Q  130 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |||||||| |    
T  42433 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 42334  T
Q  230 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgag 329  Q
    ||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  42333 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 42234  T
Q  330 ttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| ||||| ||||| |||||    
T  42233 tttccttggtcatgtgatttc 42213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Original strand, 54437 - 54507
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54437 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaata 54507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 31703 - 32028
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  31703 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 31802  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |    
T  31803 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaac 31902  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||| |||||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||     
T  31903 tgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaa 32002  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  32003 gtgagttttcttggccatattatttc 32028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4363 - 4150
Alignment:
Q  136 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 235  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||  |||  ||||||||||     
T  4363 tttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgatattctgatttacttcaagaatgaagaagaac 4264  T
Q  236 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttct 335  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  4263 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttct 4164  T
Q  336 tggccatgttattt 349  Q
    ||||||||||||||    
T  4163 tggccatgttattt 4150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 21541 - 21866
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    | ||||||||||  |  ||| ||||    
T  21541 catcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatg 21640  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  21641 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcgaagac 21740  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  21741 agaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 21840  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  21841 gtaagttttcttggccacattatttc 21866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 13362 - 13687
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    | ||||||||||  |  ||| ||||    
T  13362 catcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatg 13461  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  13462 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcgaagac 13561  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  13562 agaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcaaaattgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 13661  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  13662 gtaagttttcttggccacattatttc 13687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Original strand, 1511 - 1827
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| || | ||| || |||||    | |||  |||||  || ||| ||||    
T  1511 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacactatgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatg 1610  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  1611 cgcctggtgtgtttatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 1710  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  |  || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||     
T  1711 tgaagaagagcatgcagaagatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatgaa 1810  T
Q  325 gtgagttttcttggcca 341  Q
    || ||||||||||||||    
T  1811 gttagttttcttggcca 1827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 444 - 691
Alignment:
Q  103 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 202  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||  | ||||||||||| || |    
T  444 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcttagttgtgttcatcgatg 543  T
Q  203 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaa 302  Q
    ||| ||||||  |||| ||| || |||||||| ||||  ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  544 ataatttgattgactccaagactaaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcctgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaa 643  T
Q  303 atgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  644 gtgtgagttctggctgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Original strand, 5377 - 5692
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || || || |||||    | ||||| ||||  || ||| ||||    
T  5377 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaatg 5476  T
Q  125 c-accgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagt 223  Q
    | || | ||||  ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||     
T  5477 cgactgcgtgt--ttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaaga 5574  T
Q  224 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaaga 323  Q
    ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||    
T  5575 ctgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtga 5674  T
Q  324 cgtgagttttcttggcca 341  Q
     || ||||||||||||||    
T  5675 agtaagttttcttggcca 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Original strand, 9808 - 10123
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || || || |||||    | ||||| ||||  || ||| ||||    
T  9808 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaatg 9907  T
Q  125 c-accgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagt 223  Q
    | || | ||||  ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||     
T  9908 cgactgcgtgt--ttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaaga 10005  T
Q  224 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaaga 323  Q
    ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||    
T  10006 ctgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtga 10105  T
Q  324 cgtgagttttcttggcca 341  Q
     || ||||||||||||||    
T  10106 agtaagttttcttggcca 10123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24491 - 24169
Alignment:
Q  28 cagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcac 127  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| |    
T  24491 cagattaaggtgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgc 24392  T
Q  128 cgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctga 227  Q
    | || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| ||||    
T  24391 ctggggtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagactga 24292  T
Q  228 agaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtg 327  Q
    ||| ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  || ||     
T  24291 agaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagta 24192  T
Q  328 agttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||||  |||||||    
T  24191 agttttcttggccacattatttc 24169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 340
Target Start/End: Original strand, 44443 - 44758
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  44443 catcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 44542  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||    ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  44543 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 44642  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    | |||||||  || | || ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||     
T  44643 taaagaagagcatacaaaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaa 44742  T
Q  325 gtgagttttcttggcc 340  Q
    || |||||||||||||    
T  44743 gtaagttttcttggcc 44758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 250900 - 250590
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  250900 catcagattaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 250801  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |    
T  250800 cgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagac 250701  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  250700 tgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaa 250601  T
Q  325 gtgagttttct 335  Q
    |||||||||||    
T  250600 gtgagttttct 250590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 880 - 1205
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  880 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 979  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||      
T  980 cgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatgacatcttgatttattctaagaa 1079  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||||||||| |||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |  ||     
T  1080 tgaagaagagaatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattaaaggagaagaagttgtatgccaagttgtcgaagtgtgaattttggttaagtgaa 1179  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  1180 gtgagttttcttggccacattatttc 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7337 - 7120
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  7337 aatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 7238  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  7237 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 7138  T
Q  321 agacgtgagttttcttgg 338  Q
     || |||||||| |||||    
T  7137 ggaagtgagtttccttgg 7120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 178
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  395 aatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 296  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  295 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttttctaagtgtgagttttggttgaa 196  T
Q  321 agacgtgagttttcttgg 338  Q
     || |||||||| |||||    
T  195 ggaagtgagtttccttgg 178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 10083 - 10408
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  10083 catcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 10182  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | ||  |||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  |||||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  10183 cgcctagtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagac 10282  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  10283 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaa 10382  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  10383 gtaagttttcttggccatattatttc 10408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 350
Target Start/End: Original strand, 7839 - 8044
Alignment:
Q  145 tacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagc 244  Q
    |||| |||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||    
T  7839 tacacgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttgtcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagc 7938  T
Q  245 atttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgt 344  Q
    || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  7939 atctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttgcccatgt 8038  T
Q  345 tatttc 350  Q
    ||||||    
T  8039 tatttc 8044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 53325 - 53000
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    | ||| |||||| ||| ||| ||||    
T  53325 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaaggtgatacctttcgatgttactaatg 53226  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
      || ||| | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  53225 tgcctggtttgttcatggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgatattctgatttattctaagac 53126  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  53125 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgttaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 53026  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||    
T  53025 gtgagttttctgggccacattatttc 53000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28805 - 28481
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| || ||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  28805 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 28706  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || |||||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || |||| |      
T  28705 cgcctggtgtatttatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaggaa 28606  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    ||||||| |  ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||     
T  28605 tgaagaaaagcatgcagagcatctgatgattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaaattgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaa 28506  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    || ||||||||||||||| ||||||    
T  28505 gtaagttttcttggccatattattt 28481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 350
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3704
Alignment:
Q  202 gatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcta 301  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||    
T  3556 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattatcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 3655  T
Q  302 aatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3656 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 3704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 350
Target Start/End: Original strand, 64639 - 64859
Alignment:
Q  130 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 229  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||| ||||||    
T  64639 ggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaag 64738  T
Q  230 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgag 329  Q
    ||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || ||    
T  64739 aagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaaaagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaag 64838  T
Q  330 ttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||  |||||||    
T  64839 ttttcttggccacattatttc 64859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Original strand, 64545 - 64615
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||    
T  64545 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcattacgaata 64615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 304
Target Start/End: Original strand, 19660 - 19939
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||| || ||| ||||    
T  19660 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatg 19759  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    |  | |  || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||      
T  19760 cgtctgacgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagaa 19859  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaat 304  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19860 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattcaaagagaataagttgtatgccaagttgtctaaat 19939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 26388 - 26617
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||| ||||||| |  | |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  26388 aatgcgccaggtgtctttctggaatgcatgaatagagtatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 26487  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  | ||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  26488 agtctgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 26587  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26588 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 26617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 506 - 182
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  506 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaagaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 407  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||  | ||||| || ||||| || |||||||| || | || | |    
T  406 cgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggttgtatttattgatgacattttgat-tattttaggac 308  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  307 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgatttctggttaagtgat 208  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  207 gttagttttcttggccacattatttc 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 350
Target Start/End: Original strand, 28770 - 28922
Alignment:
Q  198 tgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttg 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||     
T  28770 tgangatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaatta 28869  T
Q  298 tctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28870 tctaagtgtaagttatggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 28922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 278
Target Start/End: Original strand, 28586 - 28742
Alignment:
Q  122 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 221  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||    
T  28586 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaa 28685  T
Q  222 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 278  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28686 gactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 28742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8288 - 7969
Alignment:
Q  31 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |  | ||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| |    
T  8288 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgctttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctg 8189  T
Q  131 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 230  Q
    | || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||  |||| ||    
T  8188 gagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcctttttggatcggttcattgttgtgtttatcgacgatattttgatttacttcaaaactgagga 8089  T
Q  231 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagt 330  Q
     ||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8088 ggaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagt 7989  T
Q  331 tttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  7988 tttatgggccatgttatttc 7969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1007
Alignment:
Q  196 attgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagt 295  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||  | ||||| ||      
T  1161 attgatgatattctgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaac 1062  T
Q  296 tgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1061 tatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 335
Target Start/End: Original strand, 31345 - 31655
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||      ||||||||||| || ||| ||||    
T  31345 catcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacattacgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatg 31444  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| | | | |   ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || |||||| |    
T  31445 cgcctggggtatttatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggtggtgtttattgatgatattctgatttattctaagac 31544  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| ||||| || | ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  31545 tgaagaggagcatgcagagcatctgaagattatattgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagctgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaa 31644  T
Q  325 gtgagttttct 335  Q
    |||||||||||    
T  31645 gtgagttttct 31655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Original strand, 5969 - 6159
Alignment:
Q  160 tttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttt 259  Q
    |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| |    
T  5969 tttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgt 6068  T
Q  260 tgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6069 tgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttc 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14286 - 14155
Alignment:
Q  219 taagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttg 318  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||     
T  14286 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 14187  T
Q  319 aaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |  || |||||||||||||||||  |||||||    
T  14186 attgaagtgagttttcttggccacattatttc 14155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14486 - 14431
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 80  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14486 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 14431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 860 - 1185
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  860 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 959  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| |||| || | | |||   ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||      
T  960 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtattcattgacgatattttaatctattccaagaa 1059  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||     
T  1060 tgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaa 1159  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||    
T  1160 gtgagttttctgggtcatattatttc 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 3
Alignment:
Q  29 agattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||| || ||   ||   ||||| ||| || ||||||||||||    
T  156 agattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacattatgagtataaagttttgcctctcagtgttacaaatgcacc 57  T
Q  129 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttt 182  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  56 tggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 350
Target Start/End: Original strand, 33911 - 34104
Alignment:
Q  157 atttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttg 256  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||  ||||  ||||||| ||| ||     
T  33911 attttccatgcttatttggattggttcgtggttgtatttattgatgacattttgatttattctaggtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagatta 34010  T
Q  257 ttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    | ||||||||| | || || || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||    
T  34011 tgttgcaagtgttaaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 34104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 341
Target Start/End: Original strand, 510 - 582
Alignment:
Q  269 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 341  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  510 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggcca 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 341
Target Start/End: Original strand, 4830 - 4902
Alignment:
Q  269 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 341  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  4830 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggcca 4902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34269 - 34040
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  34269 aatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 34170  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  34169 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgga 34070  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
     || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34069 ggaagtaagtttccttggtcatgtgatttc 34040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 9487 - 9808
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  9487 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 9586  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  || |    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||| | |    
T  9587 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctaaa----tttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttaagctaggac 9682  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  || |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  9683 tgaagaggagcatacagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 9782  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || || |||||||||||  |||||||    
T  9783 gtaagatttcttggccacattatttc 9808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Original strand, 19701 - 20022
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || |    
T  19701 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 19800  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  || |    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||| | |    
T  19801 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctaaa----tttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttaagctaggac 19896  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  || |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  19897 tgaagaggagcatacagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 19996  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    || || |||||||||||  |||||||    
T  19997 gtaagctttcttggccacattatttc 20022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 195291 - 195195
Alignment:
Q  254 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||    
T  195291 ttgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttc 195195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 925 - 642
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  925 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 826  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | |||||||| || ||| | || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| ||||| || ||| | || || |||||| |    
T  825 cgccgggtgtgttcatgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgacattctaatttattctaagac 726  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtga 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  725 tgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcgaaatgtga 642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7894 - 7824
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  7894 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 209
Target Start/End: Original strand, 619 - 797
Alignment:
Q  31 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 130  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||| |    
T  619 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctg 718  T
Q  131 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatatttt 209  Q
    |||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||  |||||   ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  719 gtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttacctagataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Original strand, 857 - 938
Alignment:
Q  269 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || || || |  |||||||| |  || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  857 tgaaagagaaaaagttgtatgccaagttttcgaagtgcgggttctggttaagggaagtgaattttcttggccatattatttc 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41976 - 41655
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||   | ||| ||||    
T  41976 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggagttactaatg 41877  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||      
T  41876 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagaa 41777  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || ||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||    ||     
T  41776 tgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaa-gaaaagaagttgtatgacaagctgtccaagtgtgaattctggttacgcgaa 41678  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttat 347  Q
    || ||||||||||||||| ||||    
T  41677 gtaagttttcttggccatattat 41655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 278
Target Start/End: Original strand, 51389 - 51624
Alignment:
Q  43 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 142  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||  | ||||||||||    
T  51389 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagtcatgccttttggtgttaccaatgcacctcgagtatttatgg 51488  T
Q  143 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 242  Q
    | || |||||||| || ||||||||   ||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  51489 agtatatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcactttgtggttgttttcatcgatgacattttgatttactccaagactgaagaagaagatgctga 51588  T
Q  243 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 278  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  51589 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 51624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 949
Alignment:
Q  130 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 229  Q
    ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||    
T  1169 ggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaag 1070  T
Q  230 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgag 329  Q
    ||||  ||||  | ||| ||||  |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| || || || ||    
T  1069 aagagcatgcagaacatctgaatattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctagttaaatgaagtaag 970  T
Q  330 ttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  969 ttttcttggccatattatttc 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 9900 - 10044
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  9900 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 9999  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 169  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  10000 cgccaggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctt 10044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Original strand, 18509 - 18579
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  18509 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaata 18579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 349
Target Start/End: Original strand, 2074 - 2302
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || | |||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  2074 aatgcaccaggtgtctttatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttaatagatgatattttggtgtattcaa 2173  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaa 320  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | || | ||||| ||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| |    
T  2174 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaggtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgga 2273  T
Q  321 agacgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
     || |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  2274 ggaagtgagtttccttggtcatgtgattt 2302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 349
Target Start/End: Original strand, 79857 - 80181
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||    
T  79857 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 79956  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||||||||   | |||   ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  79957 cgcttggtgtgttcatggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagtattcattgatgatattttaatttattctaagac 80056  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  |||| |||||| ||| | |||| || || ||  ||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |  ||     
T  80057 tgaagaggagcatgcaaagcatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggttaagtgaa 80156  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||    
T  80157 gtaagtttccttggccatattattt 80181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Original strand, 10812 - 11095
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  10812 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 10911  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||   | |||   || || || || || ||||| |||||||| || || |||||| |    
T  10912 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggtatttattgatgatattttaatttattctaagac 11011  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtga 308  Q
    |||||| ||  ||||  | ||| ||| | |||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  11012 tgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtatttaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtga 11095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25393 - 25068
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||  || |    
T  25393 catcaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttattaacg 25294  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||| | | | |||   || || || || || || || ||||||||||| || |||||| |    
T  25293 cgcctggcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaagac 25194  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||| ||  ||||  |||| |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  ||     
T  25193 tgaagaggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgggagttctggttaactgaa 25094  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25093 gtgagttttctaggccacgttatttc 25068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3989 - 3882
Alignment:
Q  242 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 341  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||    
T  3989 agcatttgaaggtgattttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctatgtgtgaattctggttaaaagaagtaagttttcttagaca 3890  T
Q  342 tgttattt 349  Q
    ||||||||    
T  3889 tgttattt 3882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21429 - 21298
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  21429 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 21330  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaag 252  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  21329 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaag 21298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 350
Target Start/End: Original strand, 40 - 352
Alignment:
Q  38 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 137  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  40 tgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 139  T
Q  138 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 237  Q
     ||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||   ||||| || |||| |||||| || |||||||| || || |   | || |||||  ||    
T  140 catggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattgatgacattttgatctattcgacaacggaggaagagcat 239  T
Q  238 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttg 337  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||    
T  240 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttccttg 339  T
Q  338 gccatgttatttc 350  Q
    ||||| |||||||    
T  340 gccatattatttc 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 780 - 572
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||    | |||||| |||  || ||| ||||    
T  780 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgccattcggtgttactaatg 681  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |    
T  680 cgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagac 581  T
Q  225 tgaagaaga 233  Q
    |||||||||    
T  580 tgaagaaga 572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Original strand, 23339 - 23430
Alignment:
Q  259 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||    
T  23339 ttgcaagtgttgaaggaaaagaaggtgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 23430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 1794 - 1896
Alignment:
Q  248 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttat 347  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||  ||||    
T  1794 tgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattat 1893  T
Q  348 ttc 350  Q
    |||    
T  1894 ttc 1896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10448 - 10307
Alignment:
Q  23 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaa 122  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||  | || ||||| || ||    | ||||||||||  || ||||||    
T  10448 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaa 10349  T
Q  123 tgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttca 164  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  10348 tgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttca 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 266
Target Start/End: Original strand, 1743 - 1888
Alignment:
Q  121 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 220  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  1743 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 1842  T
Q  221 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagt 266  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||    
T  1843 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2288 - 2219
Alignment:
Q  281 agttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  2288 agttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgttatttc 2219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Original strand, 243 - 324
Alignment:
Q  269 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||| |||||||    
T  243 tgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 341
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12641
Alignment:
Q  49 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 148  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 12448  T
Q  149 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 248  Q
     ||| || ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||| || |||||  ||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||||  | ||| |    
T  12449 cgaaccgaattttccatgcttacttggaaaaatttgtggttgtatttattgataatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatct 12548  T
Q  249 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 341  Q
    |||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||  |  || ||||||||||| |||||    
T  12549 gaagattgtgttgcaattattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggtaaagtgaagtgagttttctgggcca 12641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37928 - 37612
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    | |||||||| |  || ||| ||||    
T  37928 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgccttacggtgttactaatg 37829  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||  || ||||| || ||| |||| || || ||| |    
T  37828 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgaatttattgatgacattctgatttattcaaagac 37729  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||  ||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |   |     
T  37728 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattagaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttttggttaagtaaa 37629  T
Q  325 gtgagttttcttggcca 341  Q
    |||||||||||||||||    
T  37628 gtgagttttcttggcca 37612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43196 - 42881
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  |||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||    
T  43196 catcaaattaaggtgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 43097  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || || || || ||||| || |||| | |||||||  | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||| |    
T  43096 cgcctggtgtgttcatcgagtatatgaaccgaatttct-atgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatctattcaaagac 42998  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||  |||| |||||| |  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  ||     
T  42997 tgaagaagagcatgcagaacatctgaaaattgtgttgcaaatattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 42898  T
Q  325 gtgagttttcttggcca 341  Q
    || || |||||||||||    
T  42897 gtaagctttcttggcca 42881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 341
Target Start/End: Original strand, 546 - 618
Alignment:
Q  269 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 341  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  546 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggcca 618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 36164 - 36069
Alignment:
Q  254 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttattt 349  Q
    |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||| ||||||    
T  36164 ttgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattattt 36069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Original strand, 1515 - 1585
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  1515 catcagattaaggtaaaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 1585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9341 - 9016
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    ||||| |||||  ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||| |||||  || ||| || |    
T  9341 catcaaattaaggtgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaacg 9242  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||| | |||   ||||| ||||| || ||||| || || || || || || ||| |    
T  9241 cgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtatttattgatgacatcttaatttattcaaagac 9142  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagac 324  Q
    |||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||| ||| |  ||     
T  9141 tgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtgtgctaagttgtcgaagtgtgagttctagttaagtgaa 9042  T
Q  325 gtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||    
T  9041 gtgagttttctgggccacattatttc 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20881 - 20804
Alignment:
Q  273 agagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  20881 agagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttc 20804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25043 - 24966
Alignment:
Q  273 agagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  25043 agagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttc 24966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7004
Alignment:
Q  286 tatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  6940 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttaaaagaagtaatttttcttggacatgttatttc 7004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 350
Target Start/End: Original strand, 2118 - 2226
Alignment:
Q  242 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggcca 341  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||   || |||||||| ||||| ||    
T  2118 agcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgagttttggttgcgggaagtgagtttccttggtca 2217  T
Q  342 tgttatttc 350  Q
    ||| |||||    
T  2218 tgtgatttc 2226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29212 - 28921
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |    
T  29212 catcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 29113  T
Q  125 caccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtc 224  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||      
T  29112 cgcctggtgtgtttatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatctattctaagaa 29013  T
Q  225 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggtt 317  Q
    ||||| |||  ||||  ||||  |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  29012 tgaag-agagcatgcagagcacctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggtt 28921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1232 - 1165
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacga 92  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  1232 catcagattaaggtgaaggatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacga 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 11238 - 11188
Alignment:
Q  25 catcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggaca 75  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  11238 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggaca 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 350
Target Start/End: Original strand, 5974 - 6044
Alignment:
Q  280 aagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  5974 aagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttc 6044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1919 - 1838
Alignment:
Q  269 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  || ||||||||||| |||||  |||||||    
T  1919 tgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacattatttc 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9288 - 9215
Alignment:
Q  242 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctgg 315  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  9288 agcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctgg 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 95
Target Start/End: Original strand, 6185 - 6241
Alignment:
Q  39 gaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 95  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||    
T  6185 gaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcattacgaata 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 338
Target Start/End: Original strand, 7172 - 7268
Alignment:
Q  242 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgagttttcttgg 338  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| |||||    
T  7172 agcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcaggaagtgagtttccttgg 7268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16233 - 16013
Alignment:
Q  130 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | || |||||  ||||| | || |||||||| ||  |||| || || ||||||||| | || || |||||||| |    
T  16233 ggtgtcttcatggaatacatgaatagaatatttcaaccttatctggaccgttttgtggtgatgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgagg 16134  T
Q  230 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttgaaagacgtgag 329  Q
    | ||  |||   ||||||||| | |||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||||| ||  |||||||| |||||| | || |||||    
T  16133 aggagcatgttgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtttacgtgtgaattttggttgcaggaagtgag 16034  T
Q  330 ttttcttggccatgttatttc 350  Q
    ||| | ||| ||||| |||||    
T  16033 tttccctggtcatgtgatttc 16013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University