View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18176_high_15 (Length: 368)

Name: NF18176_high_15
Description: NF18176
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18176_high_15
NF18176_high_15
[»] chr7 (107 HSPs)
chr7 (20-357)||(20137086-20137423)
chr7 (19-355)||(44724553-44724889)
chr7 (21-355)||(39145965-39146300)
chr7 (20-357)||(4295911-4296249)
chr7 (20-354)||(11355233-11355567)
chr7 (19-354)||(24748568-24748904)
chr7 (30-355)||(13099453-13099780)
chr7 (20-357)||(31435023-31435361)
chr7 (54-357)||(38393996-38394299)
chr7 (54-357)||(48457663-48457966)
chr7 (19-357)||(21592120-21592458)
chr7 (54-355)||(9680829-9681130)
chr7 (30-356)||(37412103-37412432)
chr7 (19-357)||(21680001-21680342)
chr7 (30-355)||(443580-443906)
chr7 (54-349)||(7470007-7470301)
chr7 (54-357)||(20626048-20626350)
chr7 (54-357)||(20629939-20630241)
chr7 (54-357)||(20642358-20642660)
chr7 (20-357)||(27306209-27306543)
chr7 (31-354)||(42330977-42331302)
chr7 (54-357)||(1849991-1850294)
chr7 (54-357)||(18345551-18345854)
chr7 (19-357)||(21678040-21678376)
chr7 (58-357)||(40836719-40837017)
chr7 (32-357)||(35616-35942)
chr7 (54-349)||(20297372-20297666)
chr7 (30-355)||(21990136-21990460)
chr7 (32-357)||(44551-44877)
chr7 (60-349)||(20299475-20299764)
chr7 (54-357)||(3878587-3878890)
chr7 (20-357)||(24258438-24258780)
chr7 (54-357)||(42223167-42223470)
chr7 (54-349)||(7471965-7472259)
chr7 (32-347)||(1049283-1049597)
chr7 (73-355)||(9679088-9679369)
chr7 (54-349)||(40946338-40946632)
chr7 (66-354)||(25276163-25276439)
chr7 (54-340)||(27832631-27832912)
chr7 (54-347)||(1046912-1047203)
chr7 (54-357)||(3035731-3036037)
chr7 (54-349)||(28487563-28487857)
chr7 (54-359)||(7351628-7351931)
chr7 (54-357)||(43253493-43253795)
chr7 (113-357)||(7092189-7092432)
chr7 (32-349)||(31155896-31156213)
chr7 (54-347)||(28485576-28485867)
chr7 (54-347)||(25542540-25542830)
chr7 (54-359)||(7349253-7349552)
chr7 (29-310)||(24817377-24817653)
chr7 (20-294)||(22828672-22828947)
chr7 (113-357)||(7094436-7094679)
chr7 (73-355)||(24813477-24813755)
chr7 (60-277)||(11757245-11757462)
chr7 (20-294)||(7188518-7188789)
chr7 (30-277)||(22251602-22251846)
chr7 (30-234)||(26804554-26804762)
chr7 (30-300)||(20091581-20091845)
chr7 (122-357)||(38396713-38396947)
chr7 (150-359)||(2935374-2935581)
chr7 (150-359)||(22108173-22108379)
chr7 (150-359)||(40549933-40550139)
chr7 (150-359)||(22137184-22137390)
chr7 (200-354)||(22393878-22394032)
chr7 (81-337)||(24465578-24465829)
chr7 (150-359)||(40552211-40552417)
chr7 (150-337)||(9027191-9027376)
chr7 (150-359)||(1606486-1606692)
chr7 (106-337)||(6332283-6332514)
chr7 (177-340)||(26295580-26295743)
chr7 (20-161)||(18567588-18567730)
chr7 (54-354)||(11081522-11081819)
chr7 (174-282)||(6348912-6349020)
chr7 (136-337)||(16297018-16297222)
chr7 (81-191)||(22392502-22392608)
chr7 (296-366)||(26804761-26804831)
chr7 (54-283)||(6048885-6049111)
chr7 (287-349)||(11759369-11759431)
chr7 (151-340)||(25351353-25351539)
chr7 (218-310)||(6046668-6046759)
chr7 (163-349)||(6067183-6067370)
chr7 (151-340)||(25410130-25410318)
chr7 (105-192)||(11084438-11084523)
chr7 (139-354)||(40281363-40281572)
chr7 (96-354)||(13290454-13290710)
chr7 (151-334)||(21369642-21369824)
chr7 (151-310)||(2120899-2121056)
chr7 (151-340)||(25357047-25357233)
chr7 (151-310)||(3320076-3320232)
chr7 (151-310)||(3324824-3324980)
chr7 (151-310)||(25405393-25405549)
chr7 (54-105)||(38396326-38396377)
chr7 (112-192)||(12310157-12310236)
chr7 (314-355)||(22251564-22251605)
chr7 (264-340)||(34546874-34546951)
chr7 (151-310)||(42006663-42006820)
chr7 (297-340)||(6359946-6359989)
chr7 (151-310)||(7069780-7069936)
chr7 (151-310)||(7074787-7074943)
chr7 (105-192)||(26210603-26210688)
chr7 (151-189)||(8378648-8378686)
chr7 (151-189)||(15541139-15541177)
chr7 (264-310)||(44010775-44010821)
chr7 (264-340)||(2075226-2075303)
chr7 (264-340)||(7464513-7464590)
chr7 (286-334)||(9190053-9190101)
chr7 (290-334)||(30814560-30814604)
[»] chr6 (87 HSPs)
chr6 (19-354)||(13057193-13057529)
chr6 (19-354)||(13039753-13040089)
chr6 (19-355)||(3631918-3632253)
chr6 (19-354)||(25477273-25477616)
chr6 (19-353)||(3390378-3390713)
chr6 (19-357)||(3629842-3630179)
chr6 (54-355)||(9019961-9020261)
chr6 (66-357)||(11983006-11983296)
chr6 (54-355)||(32280031-32280332)
chr6 (32-349)||(1230234-1230551)
chr6 (54-357)||(4816207-4816510)
chr6 (32-357)||(14458743-14459067)
chr6 (54-357)||(28241297-28241600)
chr6 (54-357)||(30967236-30967539)
chr6 (32-357)||(14507152-14507477)
chr6 (20-355)||(3233704-3234045)
chr6 (54-357)||(19704543-19704848)
chr6 (54-357)||(2628862-2629164)
chr6 (19-357)||(24338425-24338763)
chr6 (54-347)||(30034590-30034882)
chr6 (31-354)||(15541120-15541443)
chr6 (20-355)||(30728803-30729142)
chr6 (54-339)||(20915351-20915635)
chr6 (57-291)||(15530166-15530398)
chr6 (54-357)||(26065021-26065318)
chr6 (54-357)||(26084990-26085287)
chr6 (139-357)||(1069695-1069913)
chr6 (31-342)||(15532674-15532984)
chr6 (96-354)||(14466399-14466658)
chr6 (19-355)||(12161537-12161869)
chr6 (32-359)||(12195491-12195817)
chr6 (54-349)||(26932546-26932841)
chr6 (69-292)||(3027895-3028114)
chr6 (81-354)||(15719708-15719977)
chr6 (20-337)||(16455421-16455738)
chr6 (28-275)||(22490647-22490896)
chr6 (118-337)||(5273213-5273431)
chr6 (135-354)||(12186051-12186271)
chr6 (54-227)||(19227514-19227687)
chr6 (106-354)||(15367121-15367365)
chr6 (150-359)||(26066100-26066307)
chr6 (150-359)||(29754685-29754892)
chr6 (150-359)||(33308988-33309194)
chr6 (150-359)||(26068371-26068578)
chr6 (150-359)||(33311257-33311463)
chr6 (81-273)||(17012105-17012294)
chr6 (85-354)||(19696508-19696775)
chr6 (134-337)||(26945258-26945463)
chr6 (105-354)||(22857933-22858181)
chr6 (20-145)||(32447503-32447630)
chr6 (106-357)||(25078535-25078783)
chr6 (214-354)||(25465571-25465710)
chr6 (32-145)||(13870610-13870723)
chr6 (251-355)||(10584227-10584331)
chr6 (96-297)||(20526885-20527083)
chr6 (213-354)||(15346541-15346680)
chr6 (218-310)||(30445723-30445815)
chr6 (137-337)||(28037722-28037927)
chr6 (54-143)||(1072067-1072156)
chr6 (151-354)||(12911426-12911629)
chr6 (151-354)||(12937174-12937376)
chr6 (218-314)||(28078215-28078310)
chr6 (30-127)||(17852552-17852650)
chr6 (54-110)||(8995514-8995570)
chr6 (238-362)||(11262678-11262801)
chr6 (224-282)||(3833481-3833540)
chr6 (150-192)||(7542525-7542567)
chr6 (19-111)||(10584125-10584213)
chr6 (154-310)||(22351877-22352031)
chr6 (151-310)||(13878727-13878883)
chr6 (151-310)||(16785919-16786075)
chr6 (154-340)||(17694846-17695030)
chr6 (81-157)||(15346445-15346517)
chr6 (136-208)||(11138423-11138496)
chr6 (264-340)||(25941780-25941857)
chr6 (264-340)||(33215938-33216015)
chr6 (151-310)||(13883475-13883631)
chr6 (151-310)||(31248740-31248896)
chr6 (151-189)||(3577658-3577696)
chr6 (163-213)||(5165936-5165985)
chr6 (154-208)||(19701988-19702041)
chr6 (151-189)||(26887368-26887406)
chr6 (264-353)||(30443532-30443622)
chr6 (151-189)||(35201470-35201508)
chr6 (264-340)||(3577484-3577560)
chr6 (70-129)||(4595046-4595102)
chr6 (238-336)||(22870100-22870196)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (19-357)||(14419167-14419506)
chr8 (19-354)||(27106877-27107212)
chr8 (19-353)||(27911035-27911367)
chr8 (19-353)||(27957454-27957786)
chr8 (19-357)||(30480480-30480818)
chr8 (19-357)||(1225186-1225525)
chr8 (30-357)||(28251544-28251871)
chr8 (54-357)||(32339365-32339668)
chr8 (32-354)||(25952554-25952876)
chr8 (32-357)||(14807784-14808119)
chr8 (31-357)||(15072742-15073069)
chr8 (20-350)||(13858469-13858798)
chr8 (54-357)||(15068037-15068339)
chr8 (19-354)||(5372156-5372492)
chr8 (29-354)||(36865568-36865892)
chr8 (54-349)||(3874066-3874360)
chr8 (39-357)||(22684629-22684951)
chr8 (54-357)||(15809275-15809577)
chr8 (54-357)||(27829353-27829655)
chr8 (32-357)||(4424051-4424377)
chr8 (54-357)||(608790-609094)
chr8 (54-355)||(41384800-41385100)
chr8 (54-357)||(27827042-27827344)
chr8 (20-354)||(15185694-15186024)
chr8 (54-357)||(28283197-28283498)
chr8 (54-357)||(18810764-18811066)
chr8 (30-355)||(41382704-41383018)
chr8 (54-349)||(43079658-43079952)
chr8 (32-357)||(44720876-44721202)
chr8 (54-359)||(43082029-43082332)
chr8 (96-357)||(43530213-43530474)
chr8 (94-357)||(15956057-15956316)
chr8 (39-357)||(18812933-18813240)
chr8 (32-244)||(14477309-14477522)
chr8 (54-337)||(24873178-24873460)
chr8 (19-355)||(33541389-33541703)
chr8 (81-354)||(21482397-21482665)
chr8 (81-328)||(21480589-21480832)
chr8 (106-337)||(31162319-31162551)
chr8 (29-340)||(3005624-3005932)
chr8 (31-193)||(5622878-5623041)
chr8 (136-354)||(31578257-31578476)
chr8 (133-354)||(31035252-31035475)
chr8 (32-175)||(26775234-26775378)
chr8 (19-161)||(35872555-35872693)
chr8 (121-295)||(181622-181795)
chr8 (96-265)||(31573794-31573961)
chr8 (204-354)||(2468110-2468259)
chr8 (94-216)||(37214317-37214430)
chr8 (150-354)||(17847677-17847875)
chr8 (96-337)||(3895920-3896162)
chr8 (151-353)||(6376141-6376343)
chr8 (220-357)||(35872430-35872553)
chr8 (286-355)||(37214243-37214312)
chr8 (92-178)||(2468261-2468343)
chr8 (73-170)||(31035144-31035238)
chr8 (297-357)||(14477548-14477609)
chr8 (54-109)||(12517248-12517303)
chr8 (238-335)||(16833789-16833886)
chr8 (151-310)||(28327908-28328064)
chr8 (319-357)||(181799-181837)
chr8 (241-295)||(14419732-14419786)
chr8 (28-85)||(37214458-37214516)
chr8 (150-353)||(33838902-33839105)
chr8 (151-340)||(17799418-17799606)
chr8 (32-98)||(3886153-3886220)
chr8 (151-310)||(16757293-16757449)
chr8 (151-279)||(13985135-13985262)
chr8 (265-334)||(4696620-4696689)
chr8 (151-340)||(9021101-9021289)
chr8 (151-340)||(21033870-21034057)
chr8 (151-189)||(16752666-16752704)
chr8 (271-360)||(28228635-28228724)
chr8 (151-189)||(28895502-28895540)
chr8 (265-334)||(7412345-7412414)
chr8 (264-340)||(23179555-23179632)
chr8 (290-334)||(6599096-6599140)
chr8 (290-334)||(6674549-6674593)
[»] chr1 (107 HSPs)
chr1 (19-357)||(50076651-50076989)
chr1 (54-366)||(16428653-16428965)
chr1 (54-355)||(25127872-25128173)
chr1 (29-357)||(18839561-18839890)
chr1 (20-357)||(31424994-31425335)
chr1 (54-356)||(17324616-17324917)
chr1 (19-355)||(18307073-18307409)
chr1 (20-344)||(13215046-13215375)
chr1 (20-357)||(38925460-38925794)
chr1 (19-357)||(11457454-11457792)
chr1 (54-357)||(12302484-12302786)
chr1 (61-354)||(9241067-9241360)
chr1 (54-357)||(15823546-15823848)
chr1 (54-357)||(10399806-10400109)
chr1 (54-357)||(51750039-51750342)
chr1 (32-354)||(17186109-17186432)
chr1 (19-357)||(50078799-50079138)
chr1 (30-354)||(50307527-50307853)
chr1 (19-357)||(6756491-6756830)
chr1 (20-357)||(39462484-39462821)
chr1 (39-357)||(15294812-15295131)
chr1 (20-355)||(25251255-25251591)
chr1 (54-357)||(47906270-47906572)
chr1 (54-355)||(3579598-3579897)
chr1 (38-357)||(31735499-31735819)
chr1 (54-357)||(39932073-39932377)
chr1 (54-357)||(28840680-28840982)
chr1 (30-356)||(6995680-6996006)
chr1 (30-357)||(17318868-17319189)
chr1 (30-355)||(17324040-17324362)
chr1 (32-347)||(6822992-6823306)
chr1 (20-355)||(41646885-41647220)
chr1 (19-357)||(31422839-31423191)
chr1 (54-357)||(40133944-40134247)
chr1 (54-355)||(27336921-27337219)
chr1 (32-349)||(20302436-20302752)
chr1 (30-354)||(28998235-28998559)
chr1 (30-354)||(29003951-29004275)
chr1 (32-347)||(2617493-2617808)
chr1 (32-355)||(2949213-2949535)
chr1 (39-357)||(13761821-13762139)
chr1 (54-357)||(46431684-46431988)
chr1 (54-355)||(27339112-27339411)
chr1 (19-354)||(31489879-31490211)
chr1 (54-357)||(28842495-28842797)
chr1 (19-355)||(50248551-50248889)
chr1 (54-355)||(14097950-14098251)
chr1 (54-357)||(4131354-4131660)
chr1 (54-357)||(16432405-16432698)
chr1 (54-346)||(24325664-24325954)
chr1 (54-357)||(51752365-51752666)
chr1 (54-349)||(2510312-2510605)
chr1 (31-357)||(28207047-28207371)
chr1 (54-349)||(9463231-9463525)
chr1 (54-357)||(20291457-20291759)
chr1 (54-359)||(16226167-16226470)
chr1 (54-349)||(9459404-9459698)
chr1 (121-347)||(25248540-25248766)
chr1 (54-281)||(48665177-48665404)
chr1 (54-295)||(21948229-21948468)
chr1 (21-352)||(14183574-14183901)
chr1 (147-357)||(16429050-16429260)
chr1 (54-359)||(47179713-47180015)
chr1 (54-359)||(47177362-47177664)
chr1 (20-332)||(47451613-47451919)
chr1 (20-354)||(42922199-42922530)
chr1 (29-310)||(8347298-8347576)
chr1 (78-354)||(15669374-15669648)
chr1 (134-357)||(6115081-6115304)
chr1 (54-253)||(6823885-6824091)
chr1 (20-308)||(18800600-18800885)
chr1 (32-354)||(8349033-8349352)
chr1 (121-359)||(16231630-16231865)
chr1 (147-357)||(51757624-51757833)
chr1 (195-359)||(23816027-23816190)
chr1 (150-359)||(23785935-23786142)
chr1 (81-354)||(49495192-49495461)
chr1 (54-354)||(13125439-13125737)
chr1 (133-354)||(16561545-16561767)
chr1 (134-335)||(30790401-30790602)
chr1 (136-354)||(26613221-26613440)
chr1 (136-354)||(30738609-30738830)
chr1 (96-337)||(27916539-27916780)
chr1 (96-353)||(28279309-28279567)
chr1 (136-312)||(155788-155963)
chr1 (226-354)||(15916562-15916690)
chr1 (20-336)||(26520119-26520434)
chr1 (269-357)||(13358787-13358876)
chr1 (140-283)||(43104245-43104390)
chr1 (154-340)||(21353342-21353525)
chr1 (136-280)||(14353047-14353190)
chr1 (241-354)||(13127669-13127782)
chr1 (20-89)||(25248760-25248830)
chr1 (96-198)||(26332699-26332798)
chr1 (136-208)||(26332616-26332688)
chr1 (308-357)||(13447251-13447301)
chr1 (151-213)||(14997040-14997101)
chr1 (151-213)||(4144804-4144865)
chr1 (257-295)||(11693351-11693389)
chr1 (264-309)||(9521826-9521871)
chr1 (20-129)||(13127837-13127944)
chr1 (246-282)||(8213579-8213615)
chr1 (218-337)||(46783212-46783331)
chr1 (151-189)||(2232597-2232635)
chr1 (264-310)||(9526577-9526623)
chr1 (290-334)||(3156989-3157033)
chr1 (290-334)||(28223421-28223465)
[»] chr4 (134 HSPs)
chr4 (54-357)||(40637128-40637430)
chr4 (30-357)||(38928154-38928482)
chr4 (30-357)||(40091392-40091719)
chr4 (29-355)||(12395824-12396150)
chr4 (29-355)||(12400786-12401112)
chr4 (31-357)||(36378322-36378649)
chr4 (20-357)||(33415465-33415801)
chr4 (20-355)||(24880470-24880806)
chr4 (20-357)||(22800839-22801176)
chr4 (20-355)||(48486338-48486673)
chr4 (54-357)||(24888850-24889152)
chr4 (54-357)||(8631395-8631698)
chr4 (20-357)||(22802711-22803048)
chr4 (20-355)||(24879008-24879344)
chr4 (54-357)||(36921470-36921773)
chr4 (20-357)||(14633339-14633675)
chr4 (54-349)||(24348272-24348566)
chr4 (30-352)||(37313047-37313370)
chr4 (19-354)||(19095900-19096236)
chr4 (76-357)||(36380425-36380706)
chr4 (39-347)||(47868439-47868747)
chr4 (54-357)||(37089348-37089650)
chr4 (54-357)||(16453363-16453666)
chr4 (20-357)||(22046662-22046999)
chr4 (31-349)||(47274757-47275073)
chr4 (54-355)||(36919563-36919864)
chr4 (20-354)||(19322716-19323048)
chr4 (54-357)||(2484849-2485151)
chr4 (57-349)||(9148310-9148600)
chr4 (54-357)||(22044367-22044669)
chr4 (20-354)||(619428-619761)
chr4 (32-349)||(5198451-5198768)
chr4 (54-357)||(17662222-17662513)
chr4 (54-357)||(38409259-38409561)
chr4 (54-357)||(51015300-51015602)
chr4 (54-349)||(11435009-11435302)
chr4 (54-349)||(11006222-11006516)
chr4 (54-349)||(18847207-18847500)
chr4 (114-352)||(16455355-16455591)
chr4 (54-349)||(7941375-7941671)
chr4 (20-337)||(41997511-41997828)
chr4 (54-357)||(6764893-6765201)
chr4 (54-357)||(31849575-31849878)
chr4 (54-357)||(11008544-11008845)
chr4 (20-337)||(18409344-18409660)
chr4 (54-340)||(14787423-14787710)
chr4 (54-359)||(18709140-18709442)
chr4 (73-357)||(26085953-26086236)
chr4 (54-337)||(22132389-22132669)
chr4 (32-359)||(44599814-44600140)
chr4 (19-218)||(6132891-6133090)
chr4 (32-357)||(16934119-16934445)
chr4 (54-347)||(9176461-9176753)
chr4 (83-355)||(27499128-27499396)
chr4 (54-357)||(9174122-9174425)
chr4 (32-357)||(16931765-16932091)
chr4 (20-354)||(18537454-18537785)
chr4 (73-314)||(13544032-13544272)
chr4 (20-330)||(56030463-56030770)
chr4 (54-357)||(22134594-22134894)
chr4 (54-359)||(22780349-22780652)
chr4 (54-359)||(22782714-22783017)
chr4 (142-355)||(2891433-2891646)
chr4 (54-268)||(5637530-5637744)
chr4 (148-355)||(13547302-13547508)
chr4 (61-277)||(3824627-3824842)
chr4 (20-354)||(8756231-8756564)
chr4 (80-354)||(38890205-38890476)
chr4 (54-357)||(53405184-53405490)
chr4 (81-354)||(18534812-18535082)
chr4 (106-354)||(30136657-30136903)
chr4 (54-330)||(47210756-47211019)
chr4 (177-351)||(4215483-4215656)
chr4 (30-228)||(3937314-3937513)
chr4 (54-255)||(52942537-52942725)
chr4 (195-357)||(5635452-5635614)
chr4 (135-337)||(12102221-12102425)
chr4 (97-354)||(28453782-28454036)
chr4 (19-161)||(38270158-38270301)
chr4 (195-349)||(11437558-11437710)
chr4 (30-310)||(15032572-15032840)
chr4 (135-308)||(31983554-31983727)
chr4 (105-310)||(3982200-3982411)
chr4 (201-353)||(5101130-5101280)
chr4 (262-357)||(6133098-6133193)
chr4 (19-161)||(24446756-24446894)
chr4 (136-357)||(25357772-25357999)
chr4 (151-354)||(16185815-16186018)
chr4 (73-293)||(40998990-40999208)
chr4 (96-354)||(9863805-9864065)
chr4 (94-279)||(47150948-47151131)
chr4 (248-355)||(47563009-47563115)
chr4 (96-328)||(10112966-10113198)
chr4 (54-308)||(9022362-9022613)
chr4 (151-350)||(5336764-5336964)
chr4 (28-110)||(2891344-2891427)
chr4 (30-136)||(5101026-5101133)
chr4 (220-357)||(24446631-24446754)
chr4 (222-341)||(49088791-49088911)
chr4 (297-357)||(52942465-52942525)
chr4 (268-340)||(14789422-14789496)
chr4 (106-195)||(10114435-10114522)
chr4 (218-283)||(54928699-54928764)
chr4 (218-337)||(3578668-3578786)
chr4 (302-354)||(3937254-3937306)
chr4 (248-355)||(22295412-22295519)
chr4 (238-337)||(26557823-26557922)
chr4 (151-353)||(55822265-55822465)
chr4 (154-310)||(31300427-31300580)
chr4 (151-310)||(7050282-7050439)
chr4 (154-340)||(8529270-8529455)
chr4 (154-300)||(4558314-4558458)
chr4 (314-357)||(3824587-3824630)
chr4 (151-300)||(4570094-4570241)
chr4 (151-310)||(11853549-11853705)
chr4 (136-264)||(54906722-54906852)
chr4 (264-340)||(4884985-4885062)
chr4 (151-208)||(16638827-16638883)
chr4 (154-340)||(16688934-16689119)
chr4 (151-310)||(36769479-36769636)
chr4 (105-192)||(38208825-38208911)
chr4 (154-213)||(16489352-16489410)
chr4 (264-310)||(15831252-15831298)
chr4 (151-189)||(36771396-36771434)
chr4 (185-223)||(38270120-38270158)
chr4 (151-192)||(4874620-4874661)
chr4 (265-334)||(10047383-10047452)
chr4 (264-340)||(18587077-18587154)
chr4 (265-334)||(39245998-39246067)
chr4 (154-198)||(4884877-4884921)
chr4 (290-334)||(12743925-12743969)
chr4 (290-334)||(12745314-12745358)
chr4 (154-190)||(25699752-25699788)
chr4 (150-198)||(29609606-29609654)
[»] chr3 (142 HSPs)
chr3 (32-357)||(4308256-4308581)
chr3 (19-355)||(3314628-3314965)
chr3 (19-355)||(1626660-1626996)
chr3 (30-357)||(1313365-1313691)
chr3 (19-357)||(43423438-43423776)
chr3 (19-357)||(43421390-43421728)
chr3 (31-357)||(53917639-53917965)
chr3 (54-357)||(38890020-38890323)
chr3 (38-356)||(45882902-45883221)
chr3 (20-357)||(24979652-24979990)
chr3 (30-355)||(28101979-28102304)
chr3 (19-351)||(5926746-5927077)
chr3 (54-357)||(10956001-10956304)
chr3 (39-355)||(27101158-27101474)
chr3 (54-357)||(18099145-18099447)
chr3 (54-357)||(30005821-30006123)
chr3 (54-357)||(10958297-10958600)
chr3 (30-352)||(28761407-28761730)
chr3 (30-357)||(53915471-53915798)
chr3 (54-349)||(25533422-25533716)
chr3 (54-353)||(42990284-42990582)
chr3 (61-359)||(9604580-9604877)
chr3 (54-355)||(43228271-43228571)
chr3 (19-357)||(880426-880765)
chr3 (54-357)||(51726981-51727283)
chr3 (54-349)||(3859508-3859801)
chr3 (54-357)||(18096875-18097177)
chr3 (32-349)||(11170361-11170678)
chr3 (54-357)||(18162643-18162945)
chr3 (19-355)||(53468430-53468768)
chr3 (30-356)||(51943326-51943651)
chr3 (54-357)||(4103870-4104172)
chr3 (37-355)||(32264015-32264334)
chr3 (78-357)||(1321483-1321762)
chr3 (95-357)||(4666535-4666796)
chr3 (55-357)||(10084363-10084665)
chr3 (54-359)||(746737-747040)
chr3 (54-355)||(43226066-43226363)
chr3 (54-355)||(47148872-47149172)
chr3 (20-291)||(6561755-6562028)
chr3 (54-357)||(5191633-5191934)
chr3 (19-357)||(36011771-36012109)
chr3 (54-357)||(25388886-25389188)
chr3 (19-354)||(39715414-39715744)
chr3 (73-356)||(48361647-48361929)
chr3 (96-365)||(6484381-6484650)
chr3 (20-357)||(12267950-12268278)
chr3 (54-349)||(22114288-22114582)
chr3 (54-359)||(458264-458567)
chr3 (54-359)||(10621504-10621807)
chr3 (96-349)||(7606571-7606822)
chr3 (58-357)||(26720532-26720830)
chr3 (54-349)||(38210350-38210644)
chr3 (20-357)||(51674741-51675067)
chr3 (20-357)||(15780805-15781161)
chr3 (54-359)||(455887-456190)
chr3 (31-357)||(32219051-32219367)
chr3 (20-354)||(23633405-23633732)
chr3 (54-349)||(6063429-6063723)
chr3 (55-337)||(10191305-10191585)
chr3 (54-359)||(50493979-50494282)
chr3 (54-349)||(6065779-6066073)
chr3 (66-359)||(28413005-28413297)
chr3 (20-355)||(54691551-54691885)
chr3 (54-357)||(5522601-5522892)
chr3 (122-357)||(6231849-6232082)
chr3 (19-326)||(889779-890084)
chr3 (29-357)||(31151302-31151627)
chr3 (125-355)||(25688137-25688367)
chr3 (54-295)||(29956666-29956906)
chr3 (81-298)||(13420219-13420432)
chr3 (37-332)||(35917944-35918244)
chr3 (94-354)||(17795282-17795538)
chr3 (94-354)||(19103722-19103978)
chr3 (54-353)||(42992266-42992548)
chr3 (19-357)||(53591139-53591467)
chr3 (32-239)||(35777378-35777587)
chr3 (135-357)||(5886261-5886480)
chr3 (135-357)||(5899734-5899953)
chr3 (20-229)||(28100143-28100353)
chr3 (81-337)||(561769-562024)
chr3 (138-357)||(11168165-11168384)
chr3 (30-356)||(27635634-27635929)
chr3 (20-310)||(53597186-53597472)
chr3 (81-337)||(25635391-25635644)
chr3 (29-282)||(54884111-54884362)
chr3 (20-251)||(23636972-23637200)
chr3 (73-354)||(36871279-36871557)
chr3 (19-234)||(28180968-28181182)
chr3 (201-351)||(47701652-47701801)
chr3 (152-355)||(3306839-3307040)
chr3 (74-262)||(1673975-1674160)
chr3 (20-222)||(28137415-28137607)
chr3 (180-354)||(24181486-24181660)
chr3 (54-166)||(41849132-41849244)
chr3 (106-282)||(14634491-14634665)
chr3 (19-127)||(6231393-6231502)
chr3 (258-357)||(41849243-41849341)
chr3 (269-349)||(35919098-35919178)
chr3 (136-310)||(1620483-1620657)
chr3 (32-142)||(11163107-11163218)
chr3 (217-352)||(25634030-25634164)
chr3 (19-128)||(47701798-47701908)
chr3 (68-300)||(13419878-13420106)
chr3 (118-271)||(4560352-4560497)
chr3 (73-178)||(24177278-24177380)
chr3 (162-310)||(11007545-11007684)
chr3 (280-359)||(53894031-53894109)
chr3 (81-178)||(25633930-25634024)
chr3 (154-340)||(29913949-29914132)
chr3 (154-340)||(10595028-10595213)
chr3 (154-340)||(27761980-27762165)
chr3 (154-340)||(47878165-47878350)
chr3 (19-110)||(3306743-3306835)
chr3 (297-353)||(42992608-42992664)
chr3 (151-310)||(10094100-10094256)
chr3 (264-353)||(10612761-10612849)
chr3 (263-349)||(16996987-16997074)
chr3 (136-328)||(7768632-7768825)
chr3 (154-340)||(10897008-10897193)
chr3 (151-310)||(22626009-22626166)
chr3 (246-338)||(27420822-27420915)
chr3 (321-357)||(880215-880251)
chr3 (151-198)||(7418064-7418111)
chr3 (118-161)||(7606830-7606873)
chr3 (319-354)||(8183112-8183147)
chr3 (151-310)||(10100117-10100273)
chr3 (151-310)||(10200980-10201136)
chr3 (151-310)||(10208026-10208182)
chr3 (218-340)||(15823641-15823763)
chr3 (151-189)||(6303310-6303348)
chr3 (264-310)||(11079628-11079674)
chr3 (164-198)||(13893475-13893509)
chr3 (151-189)||(16462203-16462241)
chr3 (151-189)||(27544273-27544311)
chr3 (151-189)||(47883026-47883064)
chr3 (264-310)||(48390327-48390373)
chr3 (265-334)||(1736319-1736388)
chr3 (265-334)||(18552897-18552966)
chr3 (265-334)||(30709804-30709873)
chr3 (113-176)||(31021300-31021362)
chr3 (313-357)||(28181242-28181286)
[»] chr5 (100 HSPs)
chr5 (19-359)||(31472587-31472928)
chr5 (54-355)||(1189586-1189888)
chr5 (54-357)||(16092176-16092479)
chr5 (30-355)||(40221497-40221823)
chr5 (19-355)||(25904067-25904403)
chr5 (19-354)||(17072847-17073183)
chr5 (54-357)||(18511189-18511491)
chr5 (23-354)||(24126824-24127155)
chr5 (54-349)||(25804025-25804318)
chr5 (19-355)||(10474302-10474638)
chr5 (32-357)||(25921449-25921775)
chr5 (54-355)||(21948026-21948326)
chr5 (54-355)||(39854483-39854783)
chr5 (54-357)||(6756494-6756794)
chr5 (54-349)||(2174919-2175212)
chr5 (20-357)||(2818312-2818650)
chr5 (54-357)||(10529074-10529378)
chr5 (54-357)||(27912536-27912839)
chr5 (54-357)||(18509295-18509597)
chr5 (54-351)||(6745069-6745364)
chr5 (54-349)||(38882106-38882399)
chr5 (19-354)||(695853-696177)
chr5 (19-351)||(17818475-17818804)
chr5 (54-357)||(34479394-34479698)
chr5 (54-357)||(18466684-18466987)
chr5 (30-348)||(18596622-18596939)
chr5 (54-349)||(4236629-4236922)
chr5 (54-357)||(34477029-34477333)
chr5 (20-357)||(2954381-2954718)
chr5 (32-350)||(16776135-16776452)
chr5 (68-349)||(27910464-27910744)
chr5 (76-357)||(658333-658610)
chr5 (19-340)||(37705774-37706095)
chr5 (54-351)||(6747306-6747600)
chr5 (19-353)||(39397974-39398307)
chr5 (30-355)||(26097708-26098031)
chr5 (54-359)||(31545080-31545383)
chr5 (54-357)||(18469011-18469312)
chr5 (30-357)||(36402305-36402632)
chr5 (132-354)||(20505823-20506042)
chr5 (30-278)||(34530721-34530970)
chr5 (54-349)||(21684437-21684730)
chr5 (32-349)||(31542712-31543028)
chr5 (54-337)||(31179368-31179650)
chr5 (54-359)||(15552245-15552548)
chr5 (121-353)||(41585725-41585956)
chr5 (20-356)||(12555901-12556237)
chr5 (20-337)||(6661181-6661496)
chr5 (116-355)||(2723964-2724193)
chr5 (133-349)||(39798126-39798341)
chr5 (96-349)||(10586873-10587126)
chr5 (78-357)||(31465966-31466233)
chr5 (32-208)||(20043027-20043204)
chr5 (32-216)||(20044987-20045172)
chr5 (121-349)||(4410090-4410316)
chr5 (135-354)||(36208656-36208874)
chr5 (54-354)||(20053847-20054136)
chr5 (30-354)||(21288739-21289060)
chr5 (78-353)||(9020246-9020518)
chr5 (150-359)||(10749796-10750002)
chr5 (150-349)||(38960117-38960314)
chr5 (150-359)||(15354551-15354757)
chr5 (96-300)||(17413200-17413402)
chr5 (150-359)||(23665140-23665346)
chr5 (150-359)||(23793241-23793447)
chr5 (30-193)||(26098391-26098555)
chr5 (150-359)||(3373113-3373320)
chr5 (150-359)||(10757273-10757478)
chr5 (150-359)||(15356827-15357033)
chr5 (167-359)||(23741835-23742023)
chr5 (136-310)||(15143547-15143722)
chr5 (154-348)||(4897828-4898023)
chr5 (242-355)||(26098267-26098380)
chr5 (180-268)||(42770936-42771024)
chr5 (184-337)||(15445263-15445417)
chr5 (105-337)||(34033563-34033797)
chr5 (96-295)||(2144601-2144801)
chr5 (91-222)||(42770808-42770934)
chr5 (20-136)||(20507659-20507776)
chr5 (287-354)||(20043222-20043289)
chr5 (96-213)||(4754198-4754312)
chr5 (136-282)||(35430259-35430408)
chr5 (154-340)||(22672837-22673022)
chr5 (151-310)||(1170811-1170967)
chr5 (151-198)||(10627364-10627411)
chr5 (54-208)||(29748352-29748502)
chr5 (151-213)||(2298122-2298183)
chr5 (265-334)||(11916996-11917065)
chr5 (264-340)||(28786515-28786592)
chr5 (264-340)||(42238371-42238448)
chr5 (224-284)||(20045210-20045270)
chr5 (150-213)||(32520533-32520597)
chr5 (54-89)||(4410061-4410096)
chr5 (105-205)||(15224897-15224997)
chr5 (156-340)||(25445501-25445684)
chr5 (264-310)||(1240539-1240585)
chr5 (151-193)||(31782597-31782639)
chr5 (151-189)||(35385596-35385634)
chr5 (290-334)||(533893-533937)
chr5 (290-334)||(42428430-42428474)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (30-357)||(79169-79496)
[»] chr2 (87 HSPs)
chr2 (19-357)||(11739536-11739875)
chr2 (39-357)||(42923486-42923804)
chr2 (30-357)||(17848394-17848718)
chr2 (19-355)||(17849057-17849393)
chr2 (19-353)||(34979558-34979894)
chr2 (31-355)||(6258796-6259118)
chr2 (20-357)||(28196578-28196913)
chr2 (20-355)||(40032032-40032372)
chr2 (30-351)||(19007591-19007912)
chr2 (54-355)||(21520672-21520972)
chr2 (54-357)||(19501987-19502290)
chr2 (32-357)||(27104752-27105076)
chr2 (19-355)||(14837213-14837544)
chr2 (30-355)||(22287315-22287640)
chr2 (31-355)||(6264127-6264448)
chr2 (54-357)||(23452213-23452516)
chr2 (54-349)||(42452759-42453050)
chr2 (32-349)||(45279969-45280287)
chr2 (54-355)||(44289046-44289347)
chr2 (54-357)||(19504322-19504624)
chr2 (54-349)||(42064491-42064785)
chr2 (54-357)||(43623557-43623847)
chr2 (20-355)||(3022104-3022448)
chr2 (54-357)||(13910021-13910323)
chr2 (30-338)||(31732772-31733069)
chr2 (19-255)||(15539553-15539790)
chr2 (128-357)||(5375323-5375550)
chr2 (54-349)||(35217948-35218242)
chr2 (32-357)||(24162199-24162514)
chr2 (54-349)||(35215571-35215865)
chr2 (94-354)||(28459170-28459429)
chr2 (30-306)||(11578136-11578408)
chr2 (81-354)||(22874137-22874406)
chr2 (66-311)||(45239000-45239243)
chr2 (84-357)||(18800290-18800559)
chr2 (54-337)||(20146604-20146884)
chr2 (55-354)||(17897226-17897519)
chr2 (150-359)||(36561117-36561324)
chr2 (150-349)||(36558849-36559047)
chr2 (202-355)||(22407433-22407585)
chr2 (54-178)||(38020178-38020302)
chr2 (150-359)||(45332157-45332364)
chr2 (214-355)||(22707730-22707872)
chr2 (73-354)||(35107294-35107571)
chr2 (134-354)||(40699429-40699650)
chr2 (244-357)||(22162999-22163111)
chr2 (19-175)||(22163106-22163262)
chr2 (151-283)||(20589763-20589896)
chr2 (213-355)||(23870951-23871092)
chr2 (91-263)||(27136195-27136365)
chr2 (54-151)||(22407591-22407688)
chr2 (163-337)||(37962938-37963109)
chr2 (204-356)||(7462925-7463077)
chr2 (96-310)||(43139395-43139606)
chr2 (96-354)||(35028595-35028848)
chr2 (135-283)||(15693958-15694109)
chr2 (54-133)||(5377629-5377708)
chr2 (121-220)||(38414194-38414291)
chr2 (151-300)||(33603994-33604143)
chr2 (96-200)||(27583472-27583573)
chr2 (150-310)||(17921769-17921927)
chr2 (174-279)||(13828397-13828503)
chr2 (310-355)||(15539508-15539553)
chr2 (154-310)||(17943540-17943692)
chr2 (19-89)||(38020083-38020154)
chr2 (151-310)||(39686983-39687139)
chr2 (135-208)||(26345661-26345735)
chr2 (154-310)||(27517664-27517818)
chr2 (151-310)||(2740941-2741097)
chr2 (151-310)||(39680045-39680201)
chr2 (151-213)||(28458949-28459011)
chr2 (248-310)||(39287262-39287324)
chr2 (151-340)||(20054759-20054947)
chr2 (151-310)||(2736205-2736361)
chr2 (150-208)||(7502990-7503049)
chr2 (151-310)||(17462436-17462592)
chr2 (264-310)||(12781246-12781292)
chr2 (154-277)||(17932637-17932756)
chr2 (151-189)||(22712660-22712698)
chr2 (151-189)||(22717369-22717407)
chr2 (151-189)||(38190997-38191035)
chr2 (151-189)||(45567409-45567447)
chr2 (265-334)||(8390174-8390243)
chr2 (265-334)||(14699031-14699100)
chr2 (246-279)||(41303088-41303121)
chr2 (290-334)||(17057369-17057413)
chr2 (290-334)||(17085352-17085396)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (54-357)||(69268-69570)
scaffold0025 (54-145)||(73211-73302)
scaffold0025 (117-160)||(73160-73203)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (20-357)||(183617-183953)
scaffold0005 (54-340)||(52020-52307)
scaffold0005 (268-340)||(50234-50308)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (54-355)||(14363-14661)
scaffold0131 (32-357)||(15005-15328)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (20-355)||(79833-80168)
scaffold0004 (151-189)||(188386-188424)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (54-357)||(41459-41762)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (31-349)||(3982-4298)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (30-357)||(11450-11777)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (30-357)||(85215-85542)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (32-359)||(6185-6511)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (54-349)||(50-344)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (54-349)||(29180-29473)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (32-357)||(2866-3191)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (114-357)||(1429-1671)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (20-354)||(15801-16132)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (20-354)||(16630-16961)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (29-354)||(1622-1936)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (54-295)||(2051-2290)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (54-225)||(35648-35819)
scaffold0011 (268-357)||(35816-35905)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (150-359)||(22221-22427)
scaffold0140 (150-359)||(24496-24702)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (81-310)||(4849-5076)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (54-110)||(1054-1110)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (280-347)||(4666-4733)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (151-310)||(57452-57613)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (302-346)||(1439-1483)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (151-189)||(224819-224857)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (264-340)||(16980-17057)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 107)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20137423 - 20137086
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  20137423 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 20137324  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  20137323 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 20137224  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  20137223 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggac 20137125  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137124 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 20137086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 44724553 - 44724889
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||    
T  44724553 attgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 44724652  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| ||||||||    
T  44724653 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcggg 44724752  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44724753 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 44724851  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724852 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 44724889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 39146300 - 39145965
Alignment:
Q  21 tgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaa 119  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39146300 tgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaa 39146201  T
Q  120 cactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggag 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  39146200 cactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggag 39146101  T
Q  220 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |  || | |||||||||||||| | |    
T  39146100 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtacc 39146001  T
Q  320 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146000 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39145965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4296249 - 4295911
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaaca 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  4296249 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaaca 4296150  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  4296149 aacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 4296050  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4296049 agacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttgga 4295951  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4295950 ccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctcttctt 4295911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Original strand, 11355233 - 11355567
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  11355233 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataa 11355332  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11355333 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 11355432  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| || | |||| |||||||||||     
T  11355433 gacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatca-tatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggac 11355531  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11355532 cgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctctt 11355567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Original strand, 24748568 - 24748904
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| |||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||    
T  24748568 attgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 24748667  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||    
T  24748668 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcagg 24748767  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  24748768 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaatttgga 24748867  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24748868 ccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24748904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13099780 - 13099453
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  13099780 gtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagt 13099681  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13099680 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattct 13099581  T
Q  229 tgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13099580 tgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 13099481  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099480 tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 13099453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31435361 - 31435023
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  31435361 ttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 31435262  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||| |||| || |    
T  31435261 acgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaa 31435162  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |     
T  31435161 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtac 31435062  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435061 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 31435023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 38393996 - 38394299
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38393996 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38394095  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38394096 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 38394195  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38394196 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 38394294  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  38394295 ttctt 38394299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 48457663 - 48457966
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  48457663 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaa 48457762  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48457763 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 48457862  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48457863 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 48457961  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  48457962 ttctt 48457966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21592458 - 21592120
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | ||||    
T  21592458 attgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaaca 21592359  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  21592358 aacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtggg 21592259  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21592258 agacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttgga 21592160  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592159 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 21592120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Original strand, 9680829 - 9681130
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaa 152  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9680829 aaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa 9680928  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9680929 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttg 9681028  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9681029 taaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctc 9681127  T
Q  353 ttc 355  Q
    |||    
T  9681128 ttc 9681130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37412432 - 37412103
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttg-gcaacaaacactaggg 127  Q
    |||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37412432 gtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactaggg 37412333  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37412332 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 37412233  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgg 326  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  37412232 ttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactgg 37412133  T
Q  327 gtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 356  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37412132 atcaataaattcttttgtgttctcccttct 37412103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 21680001 - 21680342
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  21680001 attgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaaca 21680100  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||    
T  21680101 aacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacggg 21680200  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  21680201 agatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaatttgga 21680299  T
Q  318 tcgaa---ctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     ||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21680300 ccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctcttctt 21680342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Original strand, 443580 - 443906
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  443580 gtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 443679  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  443680 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattct 443779  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct-cacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  443780 tgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactggg 443878  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  443879 tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 443906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7470301 - 7470007
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  7470301 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaa 7470202  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7470201 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 7470102  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470101 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 20626048 - 20626350
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20626048 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20626147  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20626148 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20626247  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20626248 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctca 20626346  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  20626347 tctt 20626350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 20629939 - 20630241
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20629939 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20630038  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20630039 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20630138  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20630139 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctca 20630237  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  20630238 tctt 20630241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 20642358 - 20642660
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20642358 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20642457  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20642458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20642557  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20642558 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctca 20642656  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  20642657 tctt 20642660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27306543 - 27306209
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  27306543 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaa 27306445  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||| || |||||||||    
T  27306444 aaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcggga 27306345  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||     
T  27306344 gacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggac 27306246  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27306245 caaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctcttctt 27306209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42331302 - 42330977
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42331302 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtt 42331203  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtt--acgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42331202 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 42331103  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||  |||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  42331102 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactggg 42331004  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  42331003 tcaacaaattcttttgtgttctctctt 42330977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 1849991 - 1850294
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  1849991 aaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 1850090  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1850091 cactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 1850190  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1850191 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 1850289  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  1850290 ttctt 1850294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 18345551 - 18345854
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18345551 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 18345650  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18345651 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 18345750  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18345751 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 18345849  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  18345850 ttctt 18345854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 21678040 - 21678376
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21678040 attgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 21678139  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  21678140 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcggg 21678239  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | || |||||||||| || | ||||||| ||||||||    
T  21678240 agacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatca-tatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaatttgga 21678338  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21678339 ccgaactgggacaacaaattc--ttgtgttctctcttctt 21678376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 58 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40837017 - 40836719
Alignment:
Q  58 aagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacact 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40837017 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 40836918  T
Q  158 attatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaagg 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |    
T  40836917 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacg 40836819  T
Q  258 ttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttct 356  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40836818 atactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttct 40836720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Original strand, 35616 - 35942
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  35616 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttt 35715  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35716 gagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 35815  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  35816 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatca 35914  T
Q  331 acaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35915 acaaatttttttgtgttcttctcttctt 35942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 20297372 - 20297666
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20297372 aaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 20297471  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20297472 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20297571  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297572 aacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Original strand, 21990136 - 21990460
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21990136 gtaaacctggagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 21990234  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  21990235 ttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttct 21990334  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21990335 tgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggt 21990433  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21990434 caacaaattcttttgtgttctctcttc 21990460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Original strand, 44551 - 44877
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  44551 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttt 44650  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  44651 gagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttg 44750  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44751 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 44849  T
Q  331 acaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44850 acaaattcttttgtgttcttctcttctt 44877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 60 - 349
Target Start/End: Original strand, 20299475 - 20299764
Alignment:
Q  60 gggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccctgggaaacacta 158  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20299475 gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 20299574  T
Q  159 ttatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggt 258  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  20299575 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 20299674  T
Q  259 tactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299675 tactcatca-tatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 3878587 - 3878890
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  3878587 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaa 3878686  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3878687 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 3878786  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3878787 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 3878885  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  3878886 ttctt 3878890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 24258438 - 24258780
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24258438 ttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 24258537  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |    
T  24258538 acactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaa 24258637  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatc---attatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttg 315  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||    
T  24258638 aacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttg 24258737  T
Q  316 gatcgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    || |||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24258738 gaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgttctctcttctt 24258780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 42223167 - 42223470
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaa 152  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  42223167 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 42223266  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  42223267 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttg 42223366  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42223367 taacgttactcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctc 42223465  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  42223466 ttctt 42223470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7472259 - 7471965
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7472259 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 7472160  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7472159 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 7472060  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472059 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1049597 - 1049283
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  1049597 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggttt 1049498  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1049497 gtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 1049398  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1049397 taacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 1049300  T
Q  331 acaaattcttttgtgtt 347  Q
    |||||||||||||||||    
T  1049299 acaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 73 - 355
Target Start/End: Original strand, 9679088 - 9679369
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtc 171  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9679088 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 9679186  T
Q  172 tcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 271  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9679187 tcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tat 9679285  T
Q  272 agtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9679286 agtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 9679369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 40946338 - 40946632
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||    
T  40946338 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaa 40946437  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  40946438 cactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgt 40946537  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946538 aacgttactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 66 - 354
Target Start/End: Original strand, 25276163 - 25276439
Alignment:
Q  66 agaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  25276163 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggat 25276262  T
Q  166 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25276263 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcat 25276362  T
Q  266 cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||||||       ||||     |||| |||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25276363 cattatagtggaacg-------gctc-----cccagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttctctctt 25276439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27832912 - 27832631
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27832912 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 27832813  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27832812 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgt 27832713  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    || ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||     ||||||||| |||||||||||    
T  27832712 aaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaattt-----gaactgggtaaacaaattctt 27832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1047203 - 1046912
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1047203 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 1047104  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  1047103 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 1047005  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047004 aacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 3035731 - 3036037
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3035731 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 3035830  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaaga---gattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttt 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |  || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3035831 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 3035930  T
Q  251 tgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt-ct 349  Q
    || || | |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3035931 tgcaacgatactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcct 3036029  T
Q  350 ctcttctt 357  Q
    ||||||||    
T  3036030 ctcttctt 3036037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 28487563 - 28487857
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||| | |||||    
T  28487563 aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaa 28487662  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28487663 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 28487762  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||| | | ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28487763 aacgttactcatca-tatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7351931 - 7351628
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7351931 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 7351832  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  7351831 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 7351733  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  7351732 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct-tc 7351635  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  7351634 ttcttct 7351628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43253795 - 43253493
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43253795 aaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaa 43253697  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43253696 cactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 43253597  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43253596 aacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctc 43253498  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  43253497 ttctt 43253493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 113 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7092432 - 7092189
Alignment:
Q  113 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||    
T  7092432 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  213 gcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaat 7092235  T
Q  313 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7092234 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 7092189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31156213 - 31155896
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||    
T  31156213 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggattt 31156114  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31156113 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 31156014  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  31156013 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc-ctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 31155916  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  31155915 aacaaatttctttgtgttct 31155896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 347
Target Start/End: Original strand, 28485576 - 28485867
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  28485576 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaa 28485675  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || || ||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  28485676 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgt 28485775  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    || ||||||||||| |||| || | | ||||  ||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485776 aacgttactcatca-tataatgaatcagagggttgctctctc-ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 347
Target Start/End: Original strand, 25542540 - 25542830
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  25542540 aaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaa 25542638  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  25542639 gactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 25542737  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542738 aacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7349552 - 7349253
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7349552 aaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 7349453  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  7349452 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 7349354  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||    |||||||||||  |||||||||| ||    
T  7349353 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttct-tc 7349260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24817653 - 24817377
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24817653 tgtaaaccttgagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactaggg 24817557  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    ||   ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24817556 tt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 24817460  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  24817459 ttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtca 24817377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22828947 - 22828672
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||  |||||    
T  22828947 ttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaa 22828848  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||   | | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22828847 acactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 22828748  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  22828747 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 113 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7094679 - 7094436
Alignment:
Q  113 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatag 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||||| |||    
T  7094679 caacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  213 gcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 7094482  T
Q  313 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7094481 ttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcttctt 7094436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813477
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 172  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  173 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 272  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  273 gtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||| |||| | ||||| |||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctcttc 24813477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 277
Target Start/End: Original strand, 11757245 - 11757462
Alignment:
Q  60 gggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccctgggaaacacta 158  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11757245 gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 11757344  T
Q  159 ttatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggt 258  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  11757345 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 11757444  T
Q  259 tactcatcattatagtgga 277  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11757445 tactcatca-tatagtgga 11757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Original strand, 7188518 - 7188789
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7188518 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaa 7188615  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  7188616 acactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcggga 7188713  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7188714 gacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctct 7188789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22251846 - 22251602
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  22251846 gtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggt 22251747  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    || |||||||||||||| |||||        || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22251746 ttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 22251655  T
Q  229 tgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 277  Q
    |||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22251654 tgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 26804554 - 26804762
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactag--- 125  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||       
T  26804554 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtag 26804653  T
Q  126 ggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttat 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26804654 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 26804753  T
Q  226 tcttgtaac 234  Q
    |||||||||    
T  26804754 tcttgtaac 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20091845 - 20091581
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||  | | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | |||||    
T  20091845 gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattaggg 20091749  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    || |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20091748 ttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 20091651  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20091650 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc---atagtggaacggagggctgctctctccccca 20091581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 357
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396947
Alignment:
Q  122 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagac 221  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  222 ttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcga 321  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | || |||||||||||||||| |||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatca-tatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccga 38396910  T
Q  322 actgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38396911 actgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 38396947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935581
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 2935472  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  2935473 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttc 2935571  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  2935572 t-tcttcttct 2935581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108379
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22108272 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22108369  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  22108370 t-tcttcttct 22108379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550139
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40550032 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 40550129  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  40550130 t-tcttcttct 40550139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137390
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22137283 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22137380  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  22137381 t-tcttcttct 22137390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 354
Target Start/End: Original strand, 22393878 - 22394032
Alignment:
Q  200 tgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||     
T  22393878 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcccct 22393977  T
Q  300 atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22393978 agactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 22394032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 337
Target Start/End: Original strand, 24465578 - 24465829
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  24465578 aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtca 24465673  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || ||||    
T  24465674 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacg 24465772  T
Q  281 gaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    |  |||||||||||| |||| ||||| ||||| || | ||||||| || ||||||||    
T  24465773 ggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552417
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40552310 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 40552407  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  40552408 t-tcttcttct 40552417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 9027279  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  9027278 tttgtaacgttactcatca-aatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606692
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 1606583  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  1606584 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttc 1606682  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  1606683 t-tcttcttct 1606692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 337
Target Start/End: Original strand, 6332283 - 6332514
Alignment:
Q  106 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 205  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||    
T  6332283 ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggta 6332380  T
Q  206 gaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatact 304  Q
    ||| |||||  || |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||    
T  6332381 gaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagact 6332480  T
Q  305 aggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  6332481 aggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 340
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295743
Alignment:
Q  177 gttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgg 276  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  277 aacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 18567588 - 18567730
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  18567588 ttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 18567687  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 161  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18567688 acgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 18567730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 354
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081819
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || || ||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacac--attgatatctcttt 250  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  || | || ||| || ||||   | ||||| ||||||||||| |   ||||||||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  251 tgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||| |||||||||| ||| | ||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttct 11081814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 282
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349020
Alignment:
Q  174 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 273  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattacag 6349011  T
Q  274 tggaacgga 282  Q
    |||||||||    
T  6349012 tggaacgga 6349020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatag-gcgggagacttattcttgtaac 234  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  235 ac-attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaac 332  Q
     |  || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || | |||| |||| | ||||| ||||||| || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  333 aaatt 337  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 22392502 - 22392608
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22392502 aaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 22392597  T
Q  181 cgggaagagat 191  Q
    |||||||||||    
T  22392598 cgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 366
Target Start/End: Original strand, 26804761 - 26804831
Alignment:
Q  296 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttctcactcga 366  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26804761 acccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcga 26804831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 283
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049111
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaa 152  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| || || ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 251  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||   | |||| ||||||| |||| | |||||||| | |||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatc-ccttt 6049077  T
Q  252 gtaaggttactcatcat--tatagtggaacggag 283  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6049078 gtaaagttactcatcattatatagtggaacggag 6049111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 287 - 349
Target Start/End: Original strand, 11759369 - 11759431
Alignment:
Q  287 tgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759369 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351539
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25351447  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 310
Target Start/End: Original strand, 6046668 - 6046759
Alignment:
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  6046668 agacttattcttgtaaacctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctctcccccagactaggtca 6046759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6067370 - 6067183
Alignment:
Q  163 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttac 261  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||   || |||| ||||||||||  |  ||||||||||||   || |  ||    
T  6067370 gatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaaggaac 6067272  T
Q  262 tcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  6067271 tcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttct 6067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410318
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25410225  T
Q  250 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25410226 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Original strand, 11084438 - 11084523
Alignment:
Q  105 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11084438 tctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagatt 11084523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281363
Alignment:
Q  139 attcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacaca 237  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||   | ||||||||||||||||| |     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaat 336  Q
    ||||       ||||||| |||||||||| || | |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| ||| | |||||  |||||| || |||||||    
T  40281472 ttga-------tttgtaaagttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaat 40281380  T
Q  337 tcttttgtgttctctctt 354  Q
    | || |||||||||||||    
T  40281379 t-ttgtgtgttctctctt 40281363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13290710 - 13290454
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||| | | ||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| |||      
T  13290710 tagagttt-tctcttggcaacaaacactaggcttgggag--tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatattag 13290614  T
Q  195 gactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 293  Q
     ||||||||||||| ||||   || || | |||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||  || | |||    
T  13290613 aactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactc 13290515  T
Q  294 tcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    || | || ||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  13290514 tccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 13290454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 334
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369824
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||   | ||||| |||| |||||| ||   ||||||| |    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggact-tgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctc-t 21369736  T
Q  250 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||    
T  21369737 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaa 21369824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2121056
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 2120993  T
Q  250 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  2120994 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2121056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357233
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25357141  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||| || ||   || |||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25357142 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25357233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320076
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 3320138  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  3320137 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3320076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324824
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 3324886  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  3324885 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3324824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405549
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 25405487  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  25405488 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25405549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Original strand, 38396326 - 38396377
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  38396326 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310157
Alignment:
Q  112 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctggg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 192  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251564
Alignment:
Q  314 tggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 22251564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34546951 - 34546874
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  34546951 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 34546874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006820
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||| ||||||| ||   ||||||| |    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctc-t 42006757  T
Q  250 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  42006758 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtca 42006820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 297 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6359989 - 6359946
Alignment:
Q  297 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6359989 cccatattaggtcaagttggatcgaactgggtcaacaatttctt 6359946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069936
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 7069874  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  7069875 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 7069936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074943
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 7074881  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||    
T  7074882 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtca 7074943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Original strand, 26210603 - 26210688
Alignment:
Q  105 tctcttggcaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26210603 tctcttggcaacaa-cactagggttgtga---ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagatt 26210688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378648
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagag 8378648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541139
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44010821 - 44010775
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  44010821 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 44010775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Original strand, 2075226 - 2075303
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  2075226 atcattatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2075303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7464590 - 7464513
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  7464590 atcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 7464513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 334
Target Start/End: Original strand, 9190053 - 9190101
Alignment:
Q  286 ctgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  9190053 ctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814604
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 87)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Original strand, 13057193 - 13057529
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  13057193 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 13057292  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  13057293 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 13057392  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13057393 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaatttgga 13057492  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057493 ccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 13057529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Original strand, 13039753 - 13040089
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  13039753 attgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 13039852  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||     
T  13039853 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcgga 13039952  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||    
T  13039953 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttaga 13040052  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13040053 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 13040089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3632253 - 3631918
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3632253 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 3632154  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||    
T  3632153 aacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcagg 3632054  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  3632053 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cccagactaggtcaatttgga 3631956  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3631955 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 3631918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Original strand, 25477273 - 25477616
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477273 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaaca 25477372  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||||    
T  25477373 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcggg 25477472  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaa-------ggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25477473 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtca 25477572  T
Q  311 atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25477573 atttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattctctctt 25477616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Original strand, 3390378 - 3390713
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||    
T  3390378 attgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaaca 3390477  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| ||||||||    
T  3390478 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcggg 3390577  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3390578 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttgga 3390677  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
     | || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3390678 ccaaattgggtcaacaaattcttttgtgatctctct 3390713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3630179 - 3629842
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||  |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  3630179 attgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaaca 3630080  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| |||    
T  3630079 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggaggg 3629980  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3629979 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaat-aatatagtgaaactgagggctgctctctc-cccatactaggtcaatttgga 3629882  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629881 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 3629842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Original strand, 9019961 - 9020261
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9019961 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 9020060  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9020061 cactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 9020160  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020161 aaagttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 9020259  T
Q  354 tc 355  Q
    ||    
T  9020260 tc 9020261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 66 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11983296 - 11983006
Alignment:
Q  66 agaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  11983296 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 11983197  T
Q  166 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11983196 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 11983097  T
Q  266 cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983096 ca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 11983006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Original strand, 32280031 - 32280332
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32280031 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaa 32280130  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32280131 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 32280230  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32280231 aaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctct 32280330  T
Q  354 tc 355  Q
    ||    
T  32280331 tc 32280332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1230551 - 1230234
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1230551 aaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 1230452  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1230451 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 1230352  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1230351 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 1230253  T
Q  331 acaaattcttttgtgttct 349  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1230252 acaaattcttttgtgttct 1230234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4816510 - 4816207
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  4816510 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 4816411  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4816410 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 4816311  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4816310 aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 4816212  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  4816211 ttctt 4816207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14459067 - 14458743
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14459067 aaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttt 14458968  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14458967 gagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 14458870  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14458869 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 14458771  T
Q  331 acaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14458770 acaaattcttttgtgttcttctcttctt 14458743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28241600 - 28241297
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28241600 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 28241501  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28241500 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 28241401  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28241400 aacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 28241302  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  28241301 ttctt 28241297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 30967236 - 30967539
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30967236 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 30967335  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30967336 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 30967435  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30967436 aacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 30967534  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  30967535 ttctt 30967539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14507477 - 14507152
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14507477 aaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 14507378  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14507377 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttg 14507278  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| | |||| |||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14507277 taacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 14507180  T
Q  331 acaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14507179 acaaattcttttgtgttcttctcttctt 14507152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3234045 - 3233704
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaaca 117  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||    
T  3234045 ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaaca 3233946  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||    
T  3233945 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcggg 3233846  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  3233845 agacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca-ccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttga 3233747  T
Q  318 tc-----gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233746 ccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3233704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19704848 - 19704543
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19704848 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaa 19704749  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct-ttt 251  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  19704748 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctcttt 19704649  T
Q  252 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tc 350  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19704648 gtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttc 19704550  T
Q  351 tcttctt 357  Q
    |||||||    
T  19704549 tcttctt 19704543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2629164 - 2628862
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  2629164 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaa 2629065  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  2629064 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 2628966  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2628965 aacggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 2628867  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  2628866 ttctt 2628862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24338763 - 24338425
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||| ||||||    
T  24338763 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaaca 24338664  T
Q  118 aacactaggg-tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||| | |    
T  24338663 aacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcag 24338564  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24338563 aagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaatttgg 24338466  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    | |||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  24338465 accgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctcttctt 24338425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30034882 - 30034590
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30034882 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 30034783  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30034782 cactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 30034683  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034682 aacgttactcatca-tatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15541443 - 15541120
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  15541443 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtt 15541344  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  15541343 tgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattctt 15541244  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  15541243 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca-tatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtc 15541145  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15541144 aacaaattcttttgtgttctctctt 15541120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30729142 - 30728803
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  30729142 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 30729043  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || | || ||||||||| |||||||||    
T  30729042 acactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcggga 30728943  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaattt 314  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| | || |||||||||||||    
T  30728942 gacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat-attatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaattt 30728844  T
Q  315 ggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30728843 ggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 30728803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20915635 - 20915351
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20915635 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 20915536  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  20915535 cactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 20915437  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattct 339  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20915436 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15530398 - 15530166
Alignment:
Q  57 caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacac 156  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15530398 caagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 15530299  T
Q  157 tattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaag 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15530298 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctcttttgtaac 15530200  T
Q  257 gttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15530199 gttactcatca-tatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 26065021 - 26065318
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26065021 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 26065117  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  26065118 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgt 26065216  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26065217 aacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctat 26065314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 26084990 - 26085287
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26084990 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 26085086  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  26085087 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgt 26085185  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26085186 aacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctat 26085283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 139 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069695
Alignment:
Q  139 attcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacat 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  239 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  339 ttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  1069713 ttttatgttctctcttctt 1069695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15532984 - 15532674
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||    
T  15532984 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtt 15532885  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15532884 tgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattctt 15532785  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || || | ||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  15532784 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctatc-cctagactaggtcaattttgactgaactaggtc 15532687  T
Q  330 aacaaattctttt 342  Q
    |||||||||||||    
T  15532686 aacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 96 - 354
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466658
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  195 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    || | || |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| | |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  295 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctctt 14466658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12161869 - 12161537
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  ||||    
T  12161869 attgtatcattgtaaaccttgagataaagg-ggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctgg--aaca 12161773  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || || | |||    
T  12161772 aacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtggg 12161673  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| | ||| |||||| || | ||||||| ||||||||    
T  12161672 agatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtaaaatggatggctgttctctc-cctaaactaggttaatttgga 12161575  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12161574 ccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctcttc 12161537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12195817 - 12195491
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  12195817 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 12195718  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12195717 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattctt 12195618  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  12195617 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 12195520  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
    ||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  12195519 aacaagtttctttgtgttct-tcttcttct 12195491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26932841 - 26932546
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  26932841 aaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaa 26932742  T
Q  154 cactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  26932741 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 26932643  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 349  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  |||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26932642 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttct 26932546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3028114 - 3027895
Alignment:
Q  69 aaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattga 168  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3028114 aaggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 3028019  T
Q  169 gtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 268  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3028018 gtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 3027919  T
Q  269 tatagtggaacggaggactgctct 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  3027918 tatagtggaacggagggctgctct 3027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 354
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719977
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtca 15719803  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15719804 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 15719903  T
Q  281 gaggactgctctct-cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||   |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  15719904 gagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatt-tcatgtgttctctctt 15719977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16455738 - 16455421
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||  ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||||    
T  16455738 ttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagaga-gtctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaa 16455642  T
Q  116 caaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg 215  Q
    | ||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16455641 cgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcg 16455544  T
Q  216 ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-tt 314  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  16455543 ggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtatt 16455444  T
Q  315 ggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||| ||||||| || ||||||||    
T  16455443 ggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 22490647 - 22490896
Alignment:
Q  28 gtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttca-gaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 125  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22490647 gtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactag 22490746  T
Q  126 ggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttat 225  Q
    |||||||||    || |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||    
T  22490747 ggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttat 22490846  T
Q  226 tcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22490847 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtg 22490896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 118 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc-ttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 5273234  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  5273233 accgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 135 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186051
Alignment:
Q  135 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgtaa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  234 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaaca 333  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |  |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  334 aattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  12186071 aattattttgtgttctctctt 12186051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19227687 - 19227514
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19227687 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 19227588  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19227587 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 354
Target Start/End: Original strand, 15367121 - 15367365
Alignment:
Q  106 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  15367121 ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggta 15367217  T
Q  206 gaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc-acccatact 304  Q
     || ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||  |||| |||    
T  15367218 aaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagact 15367316  T
Q  305 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  15367317 aggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 15367365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066100
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26066209  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26066208 tttgtaacgttacttatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 26066110  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  26066109 t-tcttcttct 26066100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754685
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc- 29754794  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29754793 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 29754695  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  29754694 t-tcttcttct 29754685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309194
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33309085  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33309086 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 33309184  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  33309185 t-tcttcttct 33309194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068371
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26068480  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| ||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26068479 tttgtaacgttgctcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 26068381  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  26068380 t-tcttcttct 26068371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311463
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33311354  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33311355 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 33311453  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  33311454 t-tcttcttct 33311463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Original strand, 17012105 - 17012294
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  17012105 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtca 17012201  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 273  Q
    || |||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17012202 cgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag 17012294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 354
Target Start/End: Original strand, 19696508 - 19696775
Alignment:
Q  85 tagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacggg 184  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |   |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |     
T  19696508 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactga 19696604  T
Q  185 aagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 283  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||   || |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  19696605 aagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagat 19696704  T
Q  284 gactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
      |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  19696705 agctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 19696775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 337
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  134 ggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgta 232  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  233 acacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaa 331  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| | |||| | || ||||  |||||| |||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  332 caaatt 337  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22858181 - 22857933
Alignment:
Q  105 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggt 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | |||    
T  22858181 tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggt 22858084  T
Q  205 agaaatagg-cgggagacttattcttgtaacac-attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccata 302  Q
    |||  ||||   | ||||| ||||||||||| |  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  22858083 agatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccaga 22857985  T
Q  303 ctaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||    
T  22857984 ctaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 22857933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32447630 - 32447503
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32447630 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 32447531  T
Q  119 acactag-ggtttgagggttgattcacc 145  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32447530 acactagagttttgagggttgattcacc 32447503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25078783 - 25078535
Alignment:
Q  106 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |  |||    
T  25078783 ctcttggcaacaaacattagggttgaaa--ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatt-taagta 25078687  T
Q  206 gaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatact 304  Q
    ||| ||||   || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||  ||    
T  25078686 gaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtct 25078588  T
Q  305 aggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  25078587 aggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctcttctt 25078535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465571
Alignment:
Q  214 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat- 312  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  313 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 25465571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13870723 - 13870610
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13870723 aaaccttgagatagagg-ggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggttt 13870625  T
Q  131 gagggttgattcacc 145  Q
    |||||||||||||||    
T  13870624 gagggttgattcacc 13870610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 251 - 355
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584331
Alignment:
Q  251 tgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctc 10584326  T
Q  351 tcttc 355  Q
    |||||    
T  10584327 tcttc 10584331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 297
Target Start/End: Original strand, 20526885 - 20527083
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  20526885 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaag 20526981  T
Q  196 actctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    ||| | ||||||| ||||   | ||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20526982 acttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctct 20527080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 15346541 - 15346680
Alignment:
Q  213 gcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||   |||||||||| |||| |||||||||||    
T  15346541 gcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcat-atagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcaat 15346639  T
Q  313 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  15346640 ttggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 15346680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 310
Target Start/End: Original strand, 30445723 - 30445815
Alignment:
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30445723 agactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccaccatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  137 tgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga-cttattcttgtaaca 235  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    | | ||||||||||||||     
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  236 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga---acggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaa 331  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||| | | |||||||||| ||||  ||||||||  |||||| ||| |||||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  332 caaatt 337  Q
    ||||||    
T  28037727 caaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1072156 - 1072067
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattca 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072156 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911426
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||| | ||||||  ||||   || | || |||||||||||   || |||||||||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12911530  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc-aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  12911529 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt-ttgtgtgttc 12911432  T
Q  349 tctctt 354  Q
    | ||||    
T  12911431 tatctt 12911426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937174
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||   || | || |||||||||||   || |||||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc-aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  12937276 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc-cccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt-ttgtgtgttc 12937180  T
Q  349 tctctt 354  Q
    | ||||    
T  12937179 tatctt 12937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078215
Alignment:
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaattt 314  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaac-ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattt 28078215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Original strand, 17852552 - 17852650
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17852552 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 8995514 - 8995570
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8995514 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 8995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 362
Target Start/End: Original strand, 11262678 - 11262801
Alignment:
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaat 336  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||    
T  11262678 ttgatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaat 11262776  T
Q  337 tcttttgtgttctctcttcttctcac 362  Q
    | |  ||||||||||||| |||||||    
T  11262777 t-tcgtgtgttctctctttttctcac 11262801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833540
Alignment:
Q  224 attcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggtt-actcatcattatagtggaacgga 282  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtggaacgga 3833540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7542567 - 7542525
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7542567 gaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatt 7542525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Original strand, 10584125 - 10584213
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttg 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||| | ||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  10584125 attgtatcagtgtaaaccttgagatagag--gg--aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351877
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||   || |||| |||| |||||| ||   |||||||||| |    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagatt-tgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctcttt-g 22351937  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||| |  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  22351936 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtca 22351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878883
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 13878821  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  13878822 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13878883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786075
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 16786013  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  16786014 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16786075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694846
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 17694936  T
Q  253 taaggttactc-atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| || | |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  17694935 taaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Original strand, 15346445 - 15346517
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacact 157  Q
    ||||||||| || |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  15346445 aaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacact 15346517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138496
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 208  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| | |||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaa 11138496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Original strand, 25941780 - 25941857
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25941780 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25941857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Original strand, 33215938 - 33216015
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  33215938 atcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 33216015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883631
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||  |||   |||||| |    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctc-t 13883569  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  13883570 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248740
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 31248802  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||| || |||||||||||    
T  31248801 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcccctatactaggtca 31248740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577658
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3577658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5165985 - 5165936
Alignment:
Q  163 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  5165985 gattgagtctcttggtcacgggaagagattgggact-tgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701988
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtagaa 19701988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887368
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 26887368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Original strand, 30443532 - 30443622
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||| || | ||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||| || |||||| |||||    
T  30443532 atcattatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttttctct 30443622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201470
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35201470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3577560 - 3577484
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  3577560 atcattatagtggaacggagagctgctctctc-cccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 3577484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 129
Target Start/End: Original strand, 4595046 - 4595102
Alignment:
Q  70 aggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4595046 aggcaacaacaaaactagggtttgta--gagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22870196 - 22870100
Alignment:
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaat 336  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||  | ||||||| | ||||| |||||||||| |||||||    
T  22870196 ttgatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctccc--agtaggtcagtattggaccgaactgggtgaacaaat 22870100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14419506 - 14419167
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||    
T  14419506 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagca 14419407  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  14419406 aacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 14419307  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14419306 agacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 14419207  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419206 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 14419167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27107212 - 27106877
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||    
T  27107212 attgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 27107113  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  27107112 aacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcggg 27107013  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27107012 agacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttgga 27106914  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27106913 ccaaactgggtcaacaaattattttgtgttttctctt 27106877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Original strand, 27911035 - 27911367
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27911035 attgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 27911133  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  27911134 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 27911233  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  27911234 agagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctc-cccagactaagtcaatttgga 27911331  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27911332 ccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctct 27911367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Original strand, 27957454 - 27957786
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27957454 attgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 27957552  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  27957553 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 27957652  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  27957653 agagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctc-cccagactaagtcaatttgga 27957750  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27957751 ccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctct 27957786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30480818 - 30480480
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||   || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| | ||||    
T  30480818 attgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaaca 30480719  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  30480718 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggg 30480619  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30480618 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 30480520  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480519 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 30480480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 1225186 - 1225525
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||    
T  1225186 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaaca 1225285  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||    
T  1225286 aacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacggg 1225385  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1225386 agacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttgg 1225484  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225485 accgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 1225525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28251871 - 28251544
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||| |||||||||||  || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  28251871 gtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtt 28251772  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  28251771 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattct 28251672  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28251671 tataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggt 28251573  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251572 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 28251544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 32339365 - 32339668
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  32339365 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaa 32339464  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32339465 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 32339564  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32339565 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttcttctc 32339663  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  32339664 ttctt 32339668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Original strand, 25952554 - 25952876
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25952554 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattaggg-ttgtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 25952652  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  25952653 gagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttg 25952752  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  25952753 taactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtca 25952852  T
Q  331 acaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25952853 acaaattcttttgtgttctctctt 25952876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Original strand, 14807784 - 14808119
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14807784 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 14807883  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14807884 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 14807983  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactg----------ctctctcacccatactaggtcaatttggatcg 320  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||          ||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  14807984 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 14808082  T
Q  321 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808083 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 14808119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 357
Target Start/End: Original strand, 15072742 - 15073069
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15072742 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 15072841  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga-gattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15072842 ttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattct 15072941  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  15072942 tgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggt 15073040  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15073041 caacaaattattttgtgttctctcttctt 15073069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13858798 - 13858469
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  13858798 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaa 13858699  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||    
T  13858698 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcggga 13858599  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  13858598 gacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 13858500  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 350  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13858499 agaactgggtaaacaaattc-tttgtgttctc 13858469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 15068037 - 15068339
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15068037 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaa 15068136  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15068137 tactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 15068236  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  15068237 aacgttactcatca-tataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttcaccct 15068335  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  15068336 tctt 15068339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5372492 - 5372156
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5372492 attgtatcagtgtaaatcttgagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaaca 5372394  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| || |||||||     
T  5372393 aacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggc 5372294  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct-cacccatactaggtcaatttgg 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| | |||| |||||||||||||||    
T  5372293 agacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttgg 5372194  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    | ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  5372193 accgaactgagtcaataaattattttctgttctttctt 5372156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Original strand, 36865568 - 36865892
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36865568 tgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattaggg 36865667  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36865668 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattc 36865764  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc-atactaggtcaatttggatcgaactgg 326  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  36865765 ttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgg 36865864  T
Q  327 gtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  36865865 gtaaacaaattctcttgtgttctgtctt 36865892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 3874066 - 3874360
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3874066 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 3874165  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3874166 cactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 3874265  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874266 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684629
Alignment:
Q  39 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 137  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  138 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac--- 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||       
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22684752  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    | |||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22684751 atattgatttctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22684653  T
Q  335 attcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  22684652 attcttttgtgttcttctcttctt 22684629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 15809275 - 15809577
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  15809275 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 15809373  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15809374 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 15809473  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15809474 aacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 15809572  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  15809573 ttctt 15809577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 27829353 - 27829655
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27829353 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 27829452  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  27829453 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 27829551  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27829552 aacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 27829650  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  27829651 ttctt 27829655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Original strand, 4424051 - 4424377
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4424051 aaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggttt 4424150  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4424151 gtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttg 4424250  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4424251 taacccattgatttatcttttgtaacattactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 4424349  T
Q  331 acaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4424350 acaaattcttttgtgttcttctcttctt 4424377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 608790 - 609094
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  608790 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaa 608889  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  608890 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 608989  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattc-ttttgtgttc-tct 351  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  608990 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttct 609088  T
Q  352 cttctt 357  Q
    ||||||    
T  609089 cttctt 609094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Original strand, 41384800 - 41385100
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41384800 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 41384899  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||| |||| |||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  41384900 caccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 41384999  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41385000 aacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctctct 41385098  T
Q  354 tc 355  Q
    ||    
T  41385099 tc 41385100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 27827042 - 27827344
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27827042 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 27827141  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  27827142 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 27827240  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27827241 aacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 27827339  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  27827340 ttctt 27827344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15186024 - 15185694
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15186024 ttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaa 15185925  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctct--tggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||     
T  15185924 acactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagagatt-------tgggtagaattaggcga 15185832  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  15185831 gagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttgg 15185732  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15185731 accgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctctt 15185694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28283498 - 28283197
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28283498 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaa 28283399  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  28283398 cactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgt 28283300  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28283299 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 28283202  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  28283201 ttctt 28283197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 18810764 - 18811066
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18810764 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 18810863  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  18810864 cactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 18810962  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    ||   ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18810963 aacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 18811061  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  18811062 ttctt 18811066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Original strand, 41382704 - 41383018
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41382704 gtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggt 41382803  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    |||||||||| ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41382804 ttgagggttgtttcacc-----------tattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttct 41382892  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  41382893 tgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 41382991  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41382992 caacaaattcttttgtgttctctcttc 41383018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 43079658 - 43079952
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43079658 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43079757  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43079758 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 43079856  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43079857 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 43079952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Original strand, 44720876 - 44721202
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  44720876 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggttt 44720975  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaa-cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44720976 gtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 44721075  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44721076 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 44721173  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  44721174 aacaaatttctttgtgttcttctcttctt 44721202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 43082029 - 43082332
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43082029 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43082128  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43082129 cactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 43082227  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  43082228 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct-tc 43082325  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  43082326 ttcttct 43082332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 96 - 357
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530474
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  196 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 295  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctgtctc 43530411  T
Q  296 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43530412 tcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 43530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 94 - 357
Target Start/End: Original strand, 15956057 - 15956316
Alignment:
Q  94 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  15956057 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagagattg 15956152  T
Q  194 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 293  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||    
T  15956153 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttctctc 15956252  T
Q  294 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    || | || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15956253 tccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttctt 15956316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 18812933 - 18813240
Alignment:
Q  39 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 137  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  18812933 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 18813021  T
Q  138 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18813022 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18813121  T
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18813122 ttgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 18813219  T
Q  338 cttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  18813220 cttttgtgttcttctcttctt 18813240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 14477309 - 14477522
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477309 aaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 14477408  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14477409 gagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 14477508  T
Q  231 taacacattgatat 244  Q
    |||  |||||||||    
T  14477509 taatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24873460 - 24873178
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  24873460 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaa 24873361  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  24873360 cactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-tttg 24873262  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||    
T  24873261 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33541703 - 33541389
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||    
T  33541703 attgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 33541604  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||        
T  33541603 aacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg---- 33541508  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
                      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33541507 ------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 33541427  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33541426 ccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttctctcttc 33541389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 81 - 354
Target Start/End: Original strand, 21482397 - 21482665
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21482397 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtta 21482492  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
     |||||||||||| | || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||    
T  21482493 tgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacg 21482592  T
Q  281 gaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  21482593 gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 21482665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480832
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtta 21480684  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
    |||||||| |||| |  | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  21480685 cgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 21480784  T
Q  281 gaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21480785 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 337
Target Start/End: Original strand, 31162319 - 31162551
Alignment:
Q  106 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||    
T  31162319 ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggta 31162416  T
Q  206 gaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct--cacccatac 303  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||| ||    
T  31162417 gaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagac 31162516  T
Q  304 taggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  31162517 taggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3005932 - 3005624
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 126  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||  |||  |  ||||||| | || ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  3005932 tgtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagg 3005836  T
Q  127 gtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttatt 226  Q
    ||| ||   |||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3005835 gttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 3005739  T
Q  227 cttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactg 325  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||  |||||| |||||||    
T  3005738 cttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactg 3005639  T
Q  326 ggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |||||||||||    
T  3005638 ggtaaacaaattctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5623041 - 5622878
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5623041 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtt 5622942  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5622941 tgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattg 5622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578257
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 234  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||   || |||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaaca 333  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | | ||| |||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  334 aattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||| || |||| ||||||||    
T  31578276 aatt-ttgtgtgctctctctt 31578257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 354
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035475
Alignment:
Q  133 gggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  232 aacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatac--taggtcaat-ttggatcgaactgggt 328  Q
    ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     |||||||| |  |||||||||||||    
T  31035451 aaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 31035475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 175
Target Start/End: Original strand, 26775234 - 26775378
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26775234 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 26775333  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 175  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  26775334 gagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35872693 - 35872555
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||     ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  35872693 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacg 35872599  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35872598 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 295
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181795
Alignment:
Q  121 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt-atgattgagtctcttggttacg--ggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| ||| || ||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc---atagtgaaacagatgactgctctctc 181795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573794
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31573961 tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 31573865  T
Q  196 actctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcat 265  Q
    ||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31573864 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468110
Alignment:
Q  204 tagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatac 303  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||| |     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  304 taggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 2468110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37214430 - 37214317
Alignment:
Q  94 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37214430 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattg 37214340  T
Q  194 agactctgggtagaaataggcgg 216  Q
      ||| ||||||||| |||||||    
T  37214339 gaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 354
Target Start/End: Original strand, 17847677 - 17847875
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  17847677 gaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac-ctttgatatctct 17847775  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    |||||||        ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| | |||||||  ||| |||| |  ||||||    
T  17847776 tttgtaa-------aatcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactgggaaaactaattttcatgtgtt 17847868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 337
Target Start/End: Original strand, 3895920 - 3896162
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 194  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||     
T  3895920 tagagtttg-cttttggcaacaaacaatagggttgg--gattgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgg 3896016  T
Q  195 gactctgggtagaaataggcgggagactta-ttcttgtaacacat-tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 292  Q
    |||| || ||| || ||||   || | ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||    
T  3896017 gactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctct 3896116  T
Q  293 ctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||| |||||| ||| ||| | |||||||||| || || ||||||||    
T  3896117 ctcccccatagtagatcagtattggatcgaattgagtaaacaaatt 3896162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 353
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376343
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||| ||||   || |||| |||||||| ||   ||||||||||||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctt 6376240  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | || ||||||||| | ||||| ||||||  || |||||||| || |||||||    
T  6376241 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt-ttgtgtgttc 6376338  T
Q  349 tctct 353  Q
    |||||    
T  6376339 tctct 6376343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872430
Alignment:
Q  220 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatc 319  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |             ||||||| |    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggacc 35872468  T
Q  320 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872467 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 35872430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37214312 - 37214243
Alignment:
Q  286 ctgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37214312 ctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctcttc 37214243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2468343 - 2468261
Alignment:
Q  92 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggt 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2468343 tatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 170
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035238
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagt 170  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 357
Target Start/End: Original strand, 14477548 - 14477609
Alignment:
Q  297 cccatactaggtcaatttggatcgaactg-ggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14477548 cccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctttcttctt 14477609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12517303 - 12517248
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctct 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12517303 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 335
Target Start/End: Original strand, 16833789 - 16833886
Alignment:
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| | || |||| |||| ||| |  |||||||||| ||||||    
T  16833789 ttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttggacgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328064
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 28328002  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  28328003 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 28328064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 357
Target Start/End: Original strand, 181799 - 181837
Alignment:
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181799 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 181837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 295
Target Start/End: Original strand, 14419732 - 14419786
Alignment:
Q  241 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||    
T  14419732 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctctc 14419786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 37214516 - 37214458
Alignment:
Q  28 gtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaact 85  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37214516 gtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 37214458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33839105 - 33838902
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctc 247  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| | |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| | |||  ||||     
T  33839105 gaaacactattaggattgagtctcttggtca--ggaagagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttggaatct- 33839009  T
Q  248 ttttgtaaggttactcatca-ttatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtg 345  Q
     ||||||| |||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| | || || |||| ||||| |||||||| |  ||||    
T  33839008 -tttgtaaagttacttaaaagttatagtggaacggagaactgctctctcccccataatatgtcagtattcgaccgaattgggtaaacaaattttcgtgtg 33838910  T
Q  346 ttctctct 353  Q
    ||||||||    
T  33838909 ttctctct 33838902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799418
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| || ||||   || |||| |||||| |||| ||   |||||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctt 17799511  T
Q  250 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  17799510 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3886220 - 3886153
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 98  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3886220 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757293
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 16757355  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  16757354 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16757293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985135
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| | |||  |||||      
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccctttggaatctc-- 13985165  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaac 279  Q
    || ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  13985164 ttataaagttacccctcattatagtggaac 13985135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 4696620 - 4696689
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4696620 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021101
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 9021195  T
Q  250 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||| || |||||  ||||||||||  ||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  9021194 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 9021101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21034057
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | | | |||| ||||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagggctgg-gact-tgggtagaaataggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctt 21033964  T
Q  250 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  21033965 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 21034057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752666
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16752666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 360
Target Start/End: Original strand, 28228635 - 28228724
Alignment:
Q  271 tagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttctc 360  Q
    |||||||||| || ||| || |||| |||| | ||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28228635 tagtggaacgaagaacttctttctcccccaaagtaggtcaatattggaccgaactaggtaaacacattcttttgtgttct-tcttcttctc 28228724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895540
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28895540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7412414 - 7412345
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  7412414 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23179632 - 23179555
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  23179632 atcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 23179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Original strand, 6599096 - 6599140
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6599096 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Original strand, 6674549 - 6674593
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6674549 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 107)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 50076989 - 50076651
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||    
T  50076989 attgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaaca 50076890  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  50076889 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggg 50076790  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  50076789 aaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc-cccagactatgtcaatttgga 50076691  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076690 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 50076651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 54 - 366
Target Start/End: Original strand, 16428653 - 16428965
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16428653 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaa 16428752  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16428753 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 16428852  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16428853 aaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctct 16428952  T
Q  354 tcttctcactcga 366  Q
    |||| || |||||    
T  16428953 tcttttctctcga 16428965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Original strand, 25127872 - 25128173
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25127872 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaa 25127971  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25127972 cactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgt 25128071  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25128072 aaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 25128171  T
Q  354 tc 355  Q
    ||    
T  25128172 tc 25128173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 357
Target Start/End: Original strand, 18839561 - 18839890
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| |||||    
T  18839561 tgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtaggg 18839660  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18839661 ttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 18839760  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18839761 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactggg 18839860  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18839861 tcaacaaattctttcgtgttctctcttctt 18839890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31424994
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaaca 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagt---ctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  215 gggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaattt 314  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctc-cccatactaggtcaattt 31425037  T
Q  315 ggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425036 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 31424994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17324917 - 17324616
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17324917 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 17324818  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17324817 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 17324718  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324717 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 17324619  T
Q  354 tct 356  Q
    |||    
T  17324618 tct 17324616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 18307073 - 18307409
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||    
T  18307073 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaaca 18307172  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |    
T  18307173 aacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgag 18307272  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18307273 agacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctc-cccagactaggtcaatttgga 18307371  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307372 ccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 18307409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Original strand, 13215046 - 13215375
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  13215046 ttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 13215145  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  13215146 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 13215245  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaattt 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13215246 gacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 13215345  T
Q  315 ggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 344  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215346 ggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38925794 - 38925460
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  38925794 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 38925695  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  38925694 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctgga 38925595  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  38925594 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtaaaacggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggac 38925499  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925498 cgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 38925460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11457792 - 11457454
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  11457792 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaaca 11457693  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  11457692 attactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcggg 11457593  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11457592 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 11457494  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457493 ccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 11457454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12302786 - 12302484
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12302786 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 12302687  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  12302686 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgt 12302587  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302586 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 12302488  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  12302487 tctt 12302484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 61 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9241360 - 9241067
Alignment:
Q  61 ggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  9241360 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattatt 9241261  T
Q  161 atgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggtta 260  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9241260 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagtta 9241161  T
Q  261 ctcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  9241160 ctcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctctt 9241067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 15823546 - 15823848
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15823546 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 15823645  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15823646 cactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgt 15823745  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823746 aacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 15823844  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  15823845 tctt 15823848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10400109 - 10399806
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10400109 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 10400010  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10400009 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 10399910  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10399909 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 10399811  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  10399810 ttctt 10399806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 51750039 - 51750342
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  51750039 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 51750138  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51750139 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 51750238  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51750239 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 51750337  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  51750338 ttctt 51750342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17186432 - 17186109
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17186432 aaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggttt 17186333  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  17186332 gagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttg 17186233  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  17186232 taacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaa 17186133  T
Q  331 acaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17186132 acaaattcttttgtgttctctctt 17186109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 50079138 - 50078799
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  50079138 attgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaaca 50079039  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||    
T  50079038 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggaggg 50078939  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50078938 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 50078839  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50078838 ccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctcttctt 50078799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50307853 - 50307527
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactaggg 127  Q
    ||||||||||||||| |   |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50307853 gtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggg 50307754  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50307753 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattc 50307654  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50307653 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 50307555  T
Q  328 tcaacaaattc-ttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50307554 tcaacaaattctttttgtgttctctctt 50307527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 6756491 - 6756830
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  6756491 attgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaac 6756590  T
Q  117 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  6756591 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 6756688  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct-cacccatactaggtcaatttg 315  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  6756689 gagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttg 6756788  T
Q  316 gatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6756789 gaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctcttctt 6756830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 39462484 - 39462821
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  39462484 ttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 39462583  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  39462584 acactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 39462683  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  39462684 gaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatca-tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 39462782  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462783 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 39462821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294812
Alignment:
Q  39 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 137  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  138 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  15295031 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccca 15294932  T
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15294931 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15294833  T
Q  338 cttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  15294832 cttttgtgttcttctcttctt 15294812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25251591 - 25251255
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| | |||||    
T  25251591 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaa 25251492  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |    
T  25251491 acactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaa 25251392  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  25251391 aacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaatttggac 25251292  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251291 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 25251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 47906270 - 47906572
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  47906270 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaa 47906369  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47906370 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 47906469  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906470 aacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 47906568  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  47906569 tctt 47906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3579897 - 3579598
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3579897 aaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaa 3579798  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3579797 cacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 3579698  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3579697 aaagttactcatcat--tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctct 3579600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 38 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31735819 - 31735499
Alignment:
Q  38 tgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 136  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  31735819 tgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 31735720  T
Q  137 tgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacac 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  31735719 tgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcc 31735620  T
Q  237 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaat 336  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31735619 attgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 31735521  T
Q  337 tcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  31735520 tcttttgtgttcttctcttctt 31735499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 39932073 - 39932377
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  39932073 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaa 39932172  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39932173 cactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgt 39932272  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc-tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 351  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39932273 aacgatactcatca-tatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 39932371  T
Q  352 cttctt 357  Q
    ||||||    
T  39932372 cttctt 39932377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 28840680 - 28840982
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28840680 aaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 28840779  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  28840780 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 28840878  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28840879 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 28840977  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  28840978 ttctt 28840982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6996006 - 6995680
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||| ||||||||||||  |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6996006 gtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 6995907  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  6995906 ttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttct 6995807  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  6995806 tgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 6995708  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttct 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6995707 caacaaattcttttgtgttctctcttct 6995680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Original strand, 17318868 - 17319189
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318868 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 17318967  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    | || |||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17318968 tggaaggttgattcaccttgggaaacag------gattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattct 17319061  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17319062 tgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctc-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 17319160  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319161 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 17319189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Original strand, 17324040 - 17324362
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324040 gtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 17324137  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  17324138 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattct 17324237  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccat-actaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  17324238 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctc-cccatgactaggtcaatttggaccgaactagg 17324336  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||    
T  17324337 tcaacaaattc--ttgtgttctctcttc 17324362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 347
Target Start/End: Original strand, 6822992 - 6823306
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  6822992 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggttt 6823090  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6823091 gtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 6823190  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6823191 taactcattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 6823289  T
Q  331 acaaattcttttgtgtt 347  Q
    |||||||||||||||||    
T  6823290 acaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 41646885 - 41647220
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  41646885 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 41646984  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||    
T  41646985 acacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctgga 41647084  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||   || |||| |||||||||||     
T  41647085 gacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggac 41647183  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41647184 cgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 41647220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31423191 - 31422839
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaac 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  31423191 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcatt 31423092  T
Q  117 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31423091 aaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 31422992  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata------------gtggaacggaggactgctctctcacccatact 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            ||| ||| |||| ||||||||||  ||| |||    
T  31422991 gagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagact 31422892  T
Q  305 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  31422891 aggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtgatatctcttctt 31422839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 40133944 - 40134247
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40133944 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 40134043  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40134044 tactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 40134143  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  40134144 aaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttctctat 40134243  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  40134244 tctt 40134247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27337219 - 27336921
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27337219 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 27337121  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  27337120 cactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 27337022  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337021 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 27336923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Original strand, 20302436 - 20302752
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  20302436 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggtttt 20302535  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20302536 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 20302635  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20302636 taacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-gatagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtca 20302733  T
Q  331 acaaattcttttgtgttct 349  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20302734 acaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28998559 - 28998235
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  28998559 gtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggt 28998460  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28998459 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttct 28998360  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||||  || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28998359 tgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 28998261  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28998260 caacaaattcttttgtgttctctctt 28998235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29004275 - 29003951
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  29004275 gtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggt 29004176  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29004175 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttct 29004076  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||||  || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29004075 tgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 29003977  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29003976 caacaaattcttttgtgttctctctt 29003951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 347
Target Start/End: Original strand, 2617493 - 2617808
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  2617493 aaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttt 2617592  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  2617593 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttg 2617692  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2617693 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtca 2617791  T
Q  331 acaaattcttttgtgtt 347  Q
    | ||||| |||||||||    
T  2617792 ataaattattttgtgtt 2617808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2949535 - 2949213
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2949535 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggtt 2949436  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2949435 gatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttg 2949336  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2949335 taactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctc-ccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtca 2949238  T
Q  331 acaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2949237 acaaattcttttgtgttctctcttc 2949213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 13761821 - 13762139
Alignment:
Q  39 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 137  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  13761821 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggtt 13761920  T
Q  138 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 237  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13761921 gattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 13762020  T
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13762021 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 13762118  T
Q  338 cttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  13762119 cttttgtgttcttctcttctt 13762139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 46431988 - 46431684
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  46431988 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 46431889  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  46431888 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 46431790  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct--cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tc 350  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46431789 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 46431691  T
Q  351 tcttctt 357  Q
    |||||||    
T  46431690 tcttctt 46431684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27339411 - 27339112
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27339411 aaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 27339312  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  27339311 tactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 27339213  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339212 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 27339114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Original strand, 31489879 - 31490211
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||  |||||||||| | ||||    
T  31489879 attgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaaca 31489976  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  31489977 aacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcgga 31490076  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  31490077 agacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatca-tatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtcaatttgga 31490174  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
      ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31490175 ctgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 31490211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 28842495 - 28842797
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  28842495 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaa 28842594  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  28842595 cactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 28842693  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28842694 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttcttctc 28842792  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  28842793 ttctt 28842797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50248889 - 50248551
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | ||||    
T  50248889 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaaca 50248790  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |    
T  50248789 aacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgag 50248690  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactg--ctctctcacccatactaggtcaatttg 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |  ||  ||||||| || | ||||||||||||||    
T  50248689 agacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaatttg 50248591  T
Q  316 gatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50248590 gtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 50248551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14098251 - 14097950
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14098251 aaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaa 14098152  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14098151 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag-ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 14098053  T
Q  253 t-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 351  Q
    | || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098052 taaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 14097954  T
Q  352 cttc 355  Q
    ||||    
T  14097953 cttc 14097950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4131660 - 4131354
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4131660 aaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaa 4131561  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgata----tctctt 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||    ||||||    
T  4131560 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctctt 4131462  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4131461 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaattcttttgtgttct 4131362  T
Q  350 ctcttctt 357  Q
    || |||||    
T  4131361 ctgttctt 4131354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 16432405 - 16432698
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16432405 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg-----------tttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 16432493  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16432494 cattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgt 16432593  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc-atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16432594 aatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 16432693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 346
Target Start/End: Original strand, 24325664 - 24325954
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  24325664 aaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaa 24325762  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24325763 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 24325862  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 346  Q
    || ||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325863 aatgttactcatca-tatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 51752365 - 51752666
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  51752365 aaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaa 51752464  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  51752465 cactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 51752562  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | |||||| || |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51752563 aacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 51752661  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  51752662 ttctt 51752666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2510605 - 2510312
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  2510605 aaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaa 2510506  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  2510505 cactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgt 2510407  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510406 aaagttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28207371 - 28207047
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28207371 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 28207272  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||  || || || ||||||||||| |||||    
T  28207271 tgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttctt 28207172  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28207171 gtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 28207075  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207074 aacaaattcttttgtgttctctcttctt 28207047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9463525 - 9463231
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9463525 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 9463426  T
Q  154 cactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  9463425 cactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttg 9463327  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9463326 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9463231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 20291457 - 20291759
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  20291457 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaa 20291556  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  20291557 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 20291655  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | | ||||||| ||||||||| ||||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20291656 aacgattctcatca-tatagtggatcggagggttgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttcttctc 20291754  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  20291755 ttctt 20291759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 16226167 - 16226470
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16226167 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 16226266  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  16226267 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 16226365  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  16226366 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tc 16226463  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  16226464 ttcttct 16226470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9459698 - 9459404
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9459698 aaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 9459599  T
Q  154 cactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  9459598 cactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttg 9459500  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9459499 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9459404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 121 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  121 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  221 cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcg 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  321 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 281
Target Start/End: Original strand, 48665177 - 48665404
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  48665177 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaa 48665276  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggtta-cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48665277 cactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 48665376  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacgg 281  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48665377 taacgttactcatca-tatagtggaacgg 48665404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21948468 - 21948229
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  21948468 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaa 21948370  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21948369 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 21948270  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 295  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21948269 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 21948229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14183901 - 14183574
Alignment:
Q  21 tgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaa 119  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||   ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14183901 tgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaa 14183806  T
Q  120 cactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggag 219  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||| ||||||| ||    
T  14183805 cactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaag 14183708  T
Q  220 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggat 318  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||     
T  14183707 acttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagttttggac 14183608  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  14183607 cgaactgggtaaacaaatttttttgtggtctctc 14183574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 147 - 357
Target Start/End: Original strand, 16429050 - 16429260
Alignment:
Q  147 tgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16429050 tgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatct 16429149  T
Q  247 cttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16429150 cttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgt 16429249  T
Q  347 tctctcttctt 357  Q
    |||||||||||    
T  16429250 tctctcttctt 16429260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 47179713 - 47180015
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  47179713 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 47179812  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  47179813 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 47179911  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  47179912 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc-cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tc 47180008  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  47180009 ttcttct 47180015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 47177362 - 47177664
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  47177362 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 47177461  T
Q  154 cactattatgat-tgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  47177462 cactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 47177560  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  47177561 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc-cccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tc 47177657  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  47177658 ttcttct 47177664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 332
Target Start/End: Original strand, 47451613 - 47451919
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  47451613 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaa 47451712  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||    
T  47451713 acactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcggga 47451806  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
     |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  47451807 aactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggac 47451905  T
Q  319 cgaactgggtcaac 332  Q
    ||||||||||||||    
T  47451906 cgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Original strand, 42922199 - 42922530
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||  || | ||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||    
T  42922199 ttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaa 42922296  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||    
T  42922297 acactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgaga 42922394  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttgga 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| | |||||    
T  42922395 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttgga 42922494  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||    
T  42922495 ccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttatctctt 42922530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8347576 - 8347298
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    |||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||    
T  8347576 tgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaagg 8347479  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  8347478 tt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattc 8347381  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || || | |||||||||    
T  8347380 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtca 8347298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669374
Alignment:
Q  78 acaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttgg 177  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  178 ttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 277  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||    
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgga 15669452  T
Q  278 acggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||| | |||||||||| || | |||||||||  ||| ||  |||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  15669451 acggatggctgctctctccccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctctt 15669374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 134 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115081
Alignment:
Q  134 ggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaa 233  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  234 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaaca 333  Q
    |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  334 aattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  6115104 aattattttgtgttctctcttctt 6115081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 6823885 - 6824091
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6823885 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 6823984  T
Q  154 cactattatgattgagtctctt-------ggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 246  Q
    |||||||| |||||| ||||||       |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6823985 cactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttct 6824084  T
Q  247 cttttgt 253  Q
    |||||||    
T  6824085 cttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18800885 - 18800600
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |   |||| |||||| |||| |||| | |||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  18800885 ttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaa 18800788  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    | ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||   ||| ||||||||| |||||||||    
T  18800787 atactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcggga 18800690  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggt 308  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  18800689 cacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8349352 - 8349033
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8349352 aaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg 8349255  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    |  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8349254 g--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttg 8349157  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtc 329  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||| || | |||| ||||  ||| || ||||||||||     
T  8349156 taactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggta 8349057  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  8349056 aacaaatt-ttgtgtgttctctctt 8349033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 121 - 359
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231865
Alignment:
Q  121 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggag 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  220 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatc 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggacc 16231827  T
Q  320 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  16231828 gaact-ggtcaacaaatatctttgtgttct-tcttcttct 16231865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 147 - 357
Target Start/End: Original strand, 51757624 - 51757833
Alignment:
Q  147 tgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| |||    
T  51757624 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttct 51757723  T
Q  247 cttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 346  Q
    | ||||||| | |||||| || |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51757724 c-tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T
Q  347 tc-tctcttctt 357  Q
    || |||||||||    
T  51757822 tcttctcttctt 51757833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 359
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816190
Alignment:
Q  195 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-ataatggatcggagggatgctctct 23816125  T
Q  295 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23816126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttttct 23816190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786142
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 23786033  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23786034 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttc 23786132  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  23786133 t-tcttcttct 23786142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 49495461 - 49495192
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |    
T  49495461 aaactagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtca 49495366  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
    ||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  49495365 cggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacg 49495266  T
Q  281 gaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     ||| ||  |||||| || | |||| |||||||| || |||||| ||| || |||||||| ||| ||| |||||    
T  49495265 aagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattcttatgtattccctctt 49495192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13125737 - 13125439
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta-tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaa 152  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  13125737 aaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaa 13125642  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctttt 251  Q
    || || ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||   || |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13125641 acgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 13125542  T
Q  252 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||| |||||||||| | | ||| |||||| ||| |||||||| |  |||||||||    
T  13125541 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatt-tcatgtgttctc 13125443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 354
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561767
Alignment:
Q  133 gggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  232 aacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtca 330  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| |  | ||||||||| | ||||| ||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  331 acaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||| |  |||||||||||||    
T  16561745 acaaatt-tcgtgtgttctctctt 16561767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790401
Alignment:
Q  134 ggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgta 232  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  233 acacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaa 331  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||  |||||| |||||||| | ||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 30790405  T
Q  332 caaa 335  Q
    ||||    
T  30790404 caaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613221
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||   || ||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaaca 333  Q
     | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||| |||| | ||||||| | || || |||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  334 aattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  26613240 aatt-ttgtgtgttctctctt 26613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738609
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaac 234  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| || | ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatc--attatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaa 331  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||| ||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaa 30738631  T
Q  332 caaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||| |  |||||||||||||    
T  30738630 caaatt-tcgtgtgttctctctt 30738609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 337
Target Start/End: Original strand, 27916539 - 27916780
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  27916539 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtg 27916635  T
Q  196 actctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaaca--cattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 292  Q
    ||| ||||| ||| ||||   || |||| |||||| ||||   | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27916636 actttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctct 27916734  T
Q  293 ctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||| |||| ||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  27916735 ctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 353
Target Start/End: Original strand, 28279309 - 28279567
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 194  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| || ||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  28279309 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgg 28279405  T
Q  195 gactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 293  Q
    |||| | ||||||| ||||   || |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||   || |||     
T  28279406 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaattgagagttgttctt 28279505  T
Q  294 tcaccc-atactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||| | ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  28279506 tccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctct 28279567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaac 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 312  Q
       ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc-cccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 354
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916690
Alignment:
Q  226 tcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaa-tttggatcgaact 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  325 gggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt-ttgtgcgttctctctt 15916690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26520434 - 26520119
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaagg-ct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaac 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  || ||  |||||| |||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  26520434 ttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaac 26520337  T
Q  117 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttg------gttacgggaagagattgagactctgggtagaaat 210  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  26520336 aaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaatt 26520239  T
Q  211 agg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc 309  Q
    |||   ||| ||||||||||||||| ||||||||        |||| ||| || || ||||||||||||||||||  |||||| || |||| | ||||||    
T  26520238 aggtttggaaacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccaaattaggtc 26520147  T
Q  310 a-atttggatcgaactgggtcaacaaat 336  Q
    |  |||||| | |||||||| |||||||    
T  26520146 agttttggaccaaactgggtaaacaaat 26520119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 357
Target Start/End: Original strand, 13358787 - 13358876
Alignment:
Q  269 tatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13358787 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 13358876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 283
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104390
Alignment:
Q  140 ttcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttatt-cttgtaacaca 237  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||   || || || || |||||||| |     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 43104390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353342
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 21353431  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 280
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353190
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaa 233  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  234 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
    | | |||| |  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14353146 ccctttgaaa--tcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacg 14353190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127669
Alignment:
Q  241 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattct 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||| ||||||| | | ||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt-t 13127684  T
Q  340 tttgtgttctctctt 354  Q
      |||||||||||||    
T  13127683 catgtgttctctctt 13127669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25248830 - 25248760
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 89  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25248830 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 25248760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26332798 - 26332699
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  || ||||||||    
T  26332798 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgaaaatagattgag 26332702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332616
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 208  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaa 26332616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447251
Alignment:
Q  308 tcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 13447251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 213  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagact-tgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggact-tgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11693389 - 11693351
Alignment:
Q  257 gttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11693389 gttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctc 11693351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 309
Target Start/End: Original strand, 9521826 - 9521871
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc 309  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  9521826 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtc 9521871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 13127944 - 13127837
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaa 119  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||  |   ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  13127944 ttgtatcggagtaaacctttagagagaggggttgaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaagtagggtttatatagagtttc-cttttggcaacaaa 13127847  T
Q  120 cactagggtt 129  Q
    ||||||||||    
T  13127846 cactagggtt 13127837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8213615 - 8213579
Alignment:
Q  246 tcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8213615 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 8213579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 337
Target Start/End: Original strand, 46783212 - 46783331
Alignment:
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttgg 316  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||  ||| | || |||||| ||||    
T  46783212 agactaattcttgtaaccctttgatatct-ttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaatattgg 46783310  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    |||||||||| | ||||||||    
T  46783311 atcgaactggataaacaaatt 46783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232635
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2232635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 310
Target Start/End: Original strand, 9526577 - 9526623
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  9526577 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 9526623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157033
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223421
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 134)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 40637128 - 40637430
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40637128 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 40637227  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40637228 cactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 40637327  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637328 aacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 40637426  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  40637427 tctt 40637430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38928482 - 38928154
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactaggg 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38928482 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggg 38928383  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38928382 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattc 38928283  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38928282 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 38928184  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928183 tcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 38928154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40091719 - 40091392
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  40091719 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggt 40091620  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40091619 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 40091520  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40091519 tgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggt 40091421  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091420 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 40091392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12396150 - 12395824
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12396150 tgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactaggg 12396051  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  12396050 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattg 12395951  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  12395950 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacaggg 12395852  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12395851 tcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12395824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12401112 - 12400786
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12401112 tgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactaggg 12401013  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  12401012 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattg 12400913  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  12400912 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacaggg 12400814  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12400813 tcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12400786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 31 - 357
Target Start/End: Original strand, 36378322 - 36378649
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378322 taaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 36378421  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36378422 tgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattctt 36378521  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  36378522 gtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggta 36378621  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36378622 aacaaattattttgtgttctctcttctt 36378649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33415801 - 33415465
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  33415801 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgg-aacaa 33415703  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  33415702 acactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggga 33415603  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||     
T  33415602 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggac 33415504  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33415503 cgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttctt 33415465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 24880470 - 24880806
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggc-taaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  24880470 ttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 24880569  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24880570 acactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 24880669  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24880670 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 24880768  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24880769 ccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24880806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22801176 - 22800839
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||    
T  22801176 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 22801077  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22801076 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 22800977  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  22800976 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 22800878  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800877 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 22800839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 48486338 - 48486673
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||    
T  48486338 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaa 48486437  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  48486438 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 48486537  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  48486538 gacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 48486636  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48486637 tgaactgggtcaacaaattattttgtgttttctcttc 48486673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 24888850 - 24889152
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24888850 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaa 24888949  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24888950 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgt 24889049  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24889050 aacgttacttatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctct 24889148  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  24889149 tctt 24889152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8631698 - 8631395
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8631698 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 8631599  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8631598 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 8631499  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8631498 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 8631400  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  8631399 ttctt 8631395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22803048 - 22802711
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  22803048 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 22802949  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||    
T  22802948 acattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga 22802849  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||| |     
T  22802848 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaac 22802750  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22802749 cgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctt 22802711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 24879008 - 24879344
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| | |||||||||  |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  24879008 ttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 24879107  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24879108 acaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 24879207  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24879208 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 24879306  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24879307 ccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24879344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36921773 - 36921470
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaa 152  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36921773 aaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 36921674  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36921673 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 36921574  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921573 taacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36921475  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  36921474 ttctt 36921470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 14633339 - 14633675
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||    
T  14633339 ttgtatcagagtaaactttgagataga-agggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 14633437  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  14633438 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 14633536  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  14633537 gacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggac 14633635  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14633636 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 14633675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 24348272 - 24348566
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24348272 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 24348371  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24348372 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 24348471  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348472 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 37313370 - 37313047
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313370 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 37313271  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37313270 ttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattct 37313171  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||| | || ||| |    
T  37313170 tgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggat 37313071  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  37313070 caacaaattcttttgttttctctc 37313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Original strand, 19095900 - 19096236
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaac 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  19095900 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaac 19095999  T
Q  117 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  19096000 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag-ctttgggtagaattaggcg 19096098  T
Q  216 ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttg 315  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19096099 ggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttg 19096197  T
Q  316 gatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19096198 gaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 19096236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 76 - 357
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380706
Alignment:
Q  76 caacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 175  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  176 ggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 275  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  276 gaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttctt 36380706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 347
Target Start/End: Original strand, 47868439 - 47868747
Alignment:
Q  39 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 137  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  47868439 gagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggtt 47868538  T
Q  138 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 237  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47868539 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 47868638  T
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47868639 ttgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 47868737  T
Q  338 cttttgtgtt 347  Q
    ||||||||||    
T  47868738 cttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37089650 - 37089348
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37089650 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 37089551  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  37089550 cactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 37089452  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37089451 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 37089353  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  37089352 ttctt 37089348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 16453363 - 16453666
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16453363 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 16453462  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16453463 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 16453562  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  16453563 aaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctct 16453662  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  16453663 tctt 16453666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22046999 - 22046662
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||||| | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||    
T  22046999 ttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaa 22046900  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||    
T  22046899 acactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga 22046800  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  22046799 gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggac 22046702  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22046701 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 22046662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 47274757 - 47275073
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  47274757 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtt 47274855  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47274856 tgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 47274955  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47274956 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtc 47275053  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47275054 aacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36919864 - 36919563
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaa 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36919864 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 36919765  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36919764 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 36919665  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919664 taacgttattcatca-tatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36919566  T
Q  353 ttc 355  Q
    |||    
T  36919565 ttc 36919563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Original strand, 19322716 - 19323048
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  19322716 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaa 19322813  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19322814 acactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 19322911  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttgga 317  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  19322912 gacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttgga 19323011  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  19323012 ccgaactggataaacaaattctttagtgttctctctt 19323048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2485151 - 2484849
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  2485151 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaa 2485052  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  2485051 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 2484953  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2484952 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttcttctc 2484854  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  2484853 ttctt 2484849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 57 - 349
Target Start/End: Original strand, 9148310 - 9148600
Alignment:
Q  57 caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacac 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9148310 caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 9148409  T
Q  157 tattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaag 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||     
T  9148410 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaac 9148508  T
Q  257 gttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148509 gttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22044669 - 22044367
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  22044669 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaa 22044570  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  22044569 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgt 22044471  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22044470 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 22044372  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  22044371 ttctt 22044367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 619761 - 619428
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  619761 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaa 619662  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||    
T  619661 acactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcggga 619562  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
     | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||     
T  619561 aaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctc-ccctaactaggtcaatttggac 619464  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  619463 cgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 619428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Original strand, 5198451 - 5198768
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  5198451 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttt 5198550  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5198551 gagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttg 5198650  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5198651 taacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtca 5198749  T
Q  331 acaaattcttttgtgttct 349  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5198750 acaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17662513 - 17662222
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17662513 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg-----------tttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 17662425  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17662424 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 17662325  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662324 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 17662226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 38409259 - 38409561
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38409259 aaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38409358  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  38409359 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 38409457  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38409458 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttcttctc 38409556  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  38409557 ttctt 38409561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 51015300 - 51015602
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  51015300 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 51015399  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  51015400 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 51015498  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51015499 aacaatactcatca-tatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 51015597  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  51015598 ttctt 51015602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 11435009 - 11435302
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11435009 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 11435108  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  11435109 cactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 11435207  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435208 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11006516 - 11006222
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11006516 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 11006417  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  11006416 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 11006318  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11006317 taatggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 18847207 - 18847500
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18847207 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaa 18847306  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18847307 cactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 18847405  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847406 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 352
Target Start/End: Original strand, 16455355 - 16455591
Alignment:
Q  114 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16455355 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 16455454  T
Q  214 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16455455 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatt 16455554  T
Q  314 tggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16455555 tggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 16455591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 7941375 - 7941671
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaa--cactagggtttgagggttgattcaccctggga 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7941375 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttggga 7941474  T
Q  152 aacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7941475 aacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 7941574  T
Q  252 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941575 gtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Original strand, 41997511 - 41997828
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  41997511 ttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 41997610  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  41997611 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtggga 41997710  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||     
T  41997711 gacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctc-cccagactaggttaatttggac 41997809  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  41997810 cgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 6764893 - 6765201
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttg-----gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctg 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||      | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6764893 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 6764992  T
Q  149 ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6764993 ggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 6765092  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765093 tttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 6765191  T
Q  349 -tctcttctt 357  Q
     |||||||||    
T  6765192 ttctcttctt 6765201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31849878 - 31849575
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccctgggaa 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  31849878 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaa 31849779  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31849778 acactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 31849680  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 351  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31849679 taacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 31849581  T
Q  352 cttctt 357  Q
    ||||||    
T  31849580 cttctt 31849575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11008845 - 11008544
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11008845 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 11008746  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||    
T  11008745 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc---tttg 11008649  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 351  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11008648 taatggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttct 11008550  T
Q  352 cttctt 357  Q
    ||||||    
T  11008549 cttctt 11008544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18409660 - 18409344
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18409660 ttgtatcagtgtaaacaatgagatagaga-ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaa 18409562  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  18409561 acactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcggga 18409462  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||   ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  18409461 gatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaatttggat 18409363  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaatt 337  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  18409362 tgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14787710 - 14787423
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14787710 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaa 14787611  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14787610 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 14787511  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactg--ctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14787510 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 14787423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18709442 - 18709140
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  18709442 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaa 18709343  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  18709342 cactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 18709244  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  18709243 aacgaaactcatca-tatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct-tct 18709146  T
Q  354 tcttct 359  Q
    ||||||    
T  18709145 tcttct 18709140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 73 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085953
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 172  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  173 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 272  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatca-tata 26086039  T
Q  273 gtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||| |||| | |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26086038 gtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 26085953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22132669 - 22132389
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22132669 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22132571  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  22132570 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 22132472  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22132471 aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44600140 - 44599814
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44600140 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 44600041  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44600040 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 44599941  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  44599940 gtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 44599843  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
    |||||||   |||||||||| |||||||||    
T  44599842 aacaaatatctttgtgttct-tcttcttct 44599814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 6132891 - 6133090
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6132891 attgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaa 6132990  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6132991 acactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16934445 - 16934119
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggctaa-acaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  16934445 aaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 16934346  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16934345 gtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 16934246  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  16934245 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 16934148  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  16934147 aacaaatttctttgtgttcttctcttctt 16934119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9176753 - 9176461
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9176753 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 9176654  T
Q  154 cactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  9176653 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 9176555  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  9176554 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgtt 9176461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 355
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499396
Alignment:
Q  83 actagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacg 182  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  183 ggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 282  Q
      ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaac---ctaatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  283 ggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    || ||||||| || |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499325 gggctgctctttc-cccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27499396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9174425 - 9174122
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  9174425 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaa 9174326  T
Q  154 cactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  9174325 cactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttg 9174227  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 351  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  9174226 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 9174128  T
Q  352 cttctt 357  Q
    ||||||    
T  9174127 cttctt 9174122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16932091 - 16931765
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggctaa-acaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||    
T  16932091 aaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggttt 16931992  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16931991 gtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 16931892  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  16931891 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 16931794  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  16931793 aacaaatttctttgtgttcttctcttctt 16931765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18537785 - 18537454
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||   ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  18537785 ttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaaca 18537689  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    | |||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18537688 accactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcggg 18537591  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttgg 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||| |    
T  18537590 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccataataggtcattttttg 18537491  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    | |||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  18537490 accgaactgggtaaacaaatt-ttgtgcgttctctctt 18537454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 73 - 314
Target Start/End: Original strand, 13544032 - 13544272
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtc 171  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13544032 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 13544130  T
Q  172 tcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 271  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13544131 tcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tat 13544229  T
Q  272 agtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaattt 314  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  13544230 agtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 330
Target Start/End: Original strand, 56030463 - 56030770
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||    
T  56030463 ttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaa 56030562  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||    
T  56030563 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggga 56030662  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||     || |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||     
T  56030663 gactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcat----atgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggac 56030758  T
Q  319 cgaactgggtca 330  Q
    ||||||||||||    
T  56030759 cgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22134894 - 22134594
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22134894 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22134796  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  22134795 cactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 22134697  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  22134696 aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtcttcttctc 22134599  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  22134598 ttctt 22134594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22780652 - 22780349
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22780652 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22780553  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22780552 cactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 22780454  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  22780453 taacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tc 22780356  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  22780355 ttcttct 22780349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22783017 - 22782714
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22783017 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22782918  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22782917 cactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 22782819  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||   |||||||||| ||    
T  22782818 taacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttct-tc 22782721  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  22782720 ttcttct 22782714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 142 - 355
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891646
Alignment:
Q  142 caccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattga 241  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  242 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  342 tgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||||||||||    
T  2891633 tgtgttctctcttc 2891646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5637744 - 5637530
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5637744 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 5637645  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5637644 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 5637545  T
Q  254 aaggttactcatcat 268  Q
    || ||||||||||||    
T  5637544 aacgttactcatcat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 148 - 355
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547508
Alignment:
Q  148 gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  248 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgtt 13547500  T
Q  348 ctctcttc 355  Q
    ||||||||    
T  13547501 ctctcttc 13547508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 61 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3824842 - 3824627
Alignment:
Q  61 ggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt 160  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3824842 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3824743  T
Q  161 atgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggtta 260  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  3824742 aggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 3824643  T
Q  261 ctcatcattatagtgga 277  Q
    ||||||| |||||||||    
T  3824642 ctcatca-tatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8756564 - 8756231
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  8756564 ttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaaca 8756467  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt-ggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  8756466 aacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgg 8756369  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc-aatttg 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| ||||||||   ||||    
T  8756368 gagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccagactaggtcggttttg 8756269  T
Q  316 gatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    || |||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  8756268 gagcgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 8756231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890205
Alignment:
Q  80 aaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtt 179  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  180 acgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaac 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  280 ggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     |||| |||||||||| || | | |||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 38890205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 53405184 - 53405490
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  53405184 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaa 53405282  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga------cttattcttgtaacacattgatatctc 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| || ||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  53405283 cactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctc 53405382  T
Q  248 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||  |||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  53405383 ttttgaaacgatactcatca-tatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgtt 53405479  T
Q  348 c-tctcttctt 357  Q
    | |||||||||    
T  53405480 cttctcttctt 53405490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18535082 - 18534812
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18535082 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtca 18534986  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  18534985 cgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacg 18534886  T
Q  281 gaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||  ||||||| | |||| ||||||| |  |||||| ||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  18534885 gaggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 18534812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 354
Target Start/End: Original strand, 30136657 - 30136903
Alignment:
Q  106 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  30136657 ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggta 30136754  T
Q  206 gaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatacta 305  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||||  | ||||||    
T  30136755 gaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatacta 30136854  T
Q  306 ggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30136855 ggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctctt 30136903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47211019 - 47210756
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |             |||||||    
T  47211019 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgt------------tgggaaa 47210932  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47210931 cactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 47210832  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  47210831 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 177 - 351
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215656
Alignment:
Q  177 gttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgg 276  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgg 4215581  T
Q  277 aacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 351  Q
    |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215582 aacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 4215656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3937513 - 3937314
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3937513 gtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggt 3937414  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3937413 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 52942725 - 52942537
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52942725 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaa 52942626  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||             | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52942625 cactattaggattgagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 52942539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635452
Alignment:
Q  195 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctct 5635516  T
Q  295 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5635515 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 5635452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 135 - 337
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  135 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgtaa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  234 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaac 332  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  333 aaatt 337  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 354
Target Start/End: Original strand, 28453782 - 28454036
Alignment:
Q  97 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 196  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28453782 agagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  197 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 296  Q
    |  ||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcc 28453978  T
Q  297 cccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||| ||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  28453979 cccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 28454036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38270301 - 38270158
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  38270301 attgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaaca 38270202  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38270201 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 195 - 349
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437710
Alignment:
Q  195 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctct 11437655  T
Q  295 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437656 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15032840 - 15032572
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||             
T  15032840 gtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa--------- 15032752  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
     ||||| ||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||  |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15032751 -tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattct 15032654  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  15032653 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtca 15032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983554
Alignment:
Q  135 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  234 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggt 308  Q
    | | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc-ccaatactaggt 31983554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3982411 - 3982200
Alignment:
Q  105 tctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttg--attcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||     
T  3982411 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactt 3982312  T
Q  200 tgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 298  Q
    ||||||||| || |   || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  3982311 tgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccct 3982212  T
Q  299 catactaggtca 310  Q
    ||||||||||||    
T  3982211 catactaggtca 3982200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 353
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101280
Alignment:
Q  201 gggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 300  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcat-atagtaaaacggagggctgctatctc-ccca 5101227  T
Q  301 tactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101228 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 5101280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 357
Target Start/End: Original strand, 6133098 - 6133193
Alignment:
Q  262 tcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6133098 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 6133193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24446894 - 24446756
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||     ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  24446894 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacg 24446800  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24446799 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 357
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357999
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtaga---aat--aggcgggagacttattcttg 230  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| || |   |||  ||   | |||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtc 329  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| || | ||||||||| | ||||| | ||||||||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  25357972 aacaaatttttgtgtgttctctcttctt 25357999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 151 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185815
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||   || |||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||    
T  16185918 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttc 16185821  T
Q  349 tctctt 354  Q
    ||||||    
T  16185820 tctctt 16185815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40999208 - 40998990
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 172  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||    
T  40999208 caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtct 40999112  T
Q  173 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 271  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   |||||||   | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40999111 cttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttat 40999012  T
Q  272 agtggaacggaggactgctctc 293  Q
    |||||||| ||||  |||||||    
T  40999011 agtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 354
Target Start/End: Original strand, 9863805 - 9864065
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9863805 tagagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgag 9863901  T
Q  196 actctgggtagaaat-aggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttac---tcatcattatagtggaacggaggactgctc 291  Q
    ||| ||||||||| | ||   | ||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9863902 actttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctc 9864000  T
Q  292 tct--cacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||  | |||| |||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  9864001 tctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 9864065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47151131 - 47150948
Alignment:
Q  94 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  47151131 tatagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattg 47151035  T
Q  194 agactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaac 279  Q
    ||| | ||||||||| ||||   || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47151034 agaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaac 47150948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 248 - 355
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563115
Alignment:
Q  248 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 47563107  T
Q  348 ctctcttc 355  Q
    ||||||||    
T  47563108 ctctcttc 47563115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 328
Target Start/End: Original strand, 10112966 - 10113198
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttac-gggaagagattga 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||      
T  10112966 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattag 10113062  T
Q  195 gactctgggtagaaatag-gcgggagacttattcttgtaa-cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 292  Q
    |||| ||||||||| |||    | ||||| |||||||||| |   |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  10113063 gactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctct 10113161  T
Q  293 ctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggt 328  Q
    ||| || | ||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  10113162 ctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 308
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022613
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaa 152  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| || || ||| ||   ||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaac--acattgatatctctt 249  Q
    ||| ||||| ||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||   | ||||| |||||||||||    ||||||||||| |    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctc-t 9022554  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggt 308  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  9022555 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccccatattaggt 9022613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336764
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||  |  | |||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggact-tgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    |   || |  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgttc 5336766  T
Q  349 tc 350  Q
    ||    
T  5336765 tc 5336764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Original strand, 2891344 - 2891427
Alignment:
Q  28 gtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt 110  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2891344 gtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 2891427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 136
Target Start/End: Original strand, 5101026 - 5101133
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5101026 gtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggt 5101125  T
Q  129 ttgagggt 136  Q
    ||||||||    
T  5101126 ttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446631
Alignment:
Q  220 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatc 319  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |             ||||||| |    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggacc 24446669  T
Q  320 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446668 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 24446631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 341
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  222 ttattcttgtaacacattgatatct-cttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc-atactaggtcaatttggatc 319  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||  |    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcat-atagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggcc 49088889  T
Q  320 gaactgggtcaacaaattcttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49088890 gaactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 52942525 - 52942465
Alignment:
Q  297 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942525 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 52942465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14789496 - 14789422
Alignment:
Q  268 ttatagtggaacggaggactgctctctcaccc--atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14789496 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Original strand, 10114435 - 10114522
Alignment:
Q  106 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  10114435 ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattgag 10114522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 54928764 - 54928699
Alignment:
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 283  Q
    ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  54928764 agactgattcttgtaacattttaatatctcttttgtaaagttactcatcactatagtggaacggag 54928699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578668
Alignment:
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttgg 316  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||| |||||| || | || |    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattag 3578689  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  3578688 accgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3937306 - 3937254
Alignment:
Q  302 actaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3937306 actagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctctt 3937254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 355
Target Start/End: Original strand, 22295412 - 22295519
Alignment:
Q  248 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 346  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||| || | |||||  ||||||||| |||||||| |  |||||    
T  22295412 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatt-tcatgtgt 22295510  T
Q  347 tctctcttc 355  Q
    |||||||||    
T  22295511 tctctcttc 22295519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 337
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557922
Alignment:
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaat 336  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||||    
T  26557823 ttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaat 26557921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 353
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822465
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 55822359  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaat-tcttttgtgt 346  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||   || || |||||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  55822360 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctc-cccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttt 55822458  T
Q  347 tctctct 353  Q
    |||||||    
T  55822459 tctctct 55822465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300580
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 31300521  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  31300522 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctc-cccagactaggtca 31300580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050282
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 7050345  T
Q  250 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  7050344 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529455
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||| ||| ||   |||||||||| |    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctcttt-g 8529364  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  8529365 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558458
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 4558408  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 300  Q
    ||| |  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4558409 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctccccca 4558458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824587
Alignment:
Q  314 tggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctattctt 3824587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 300
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570241
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 4570188  T
Q  250 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 300  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4570189 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccca 4570241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853705
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 11853643  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  11853644 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 11853705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906852
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgta 232  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | ||||||| ||||   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  233 acacattgatatctcttttgtaaggttactca 264  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54906822 actctttgatatctc-tttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Original strand, 4884985 - 4885062
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  4884985 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638883
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 208  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagact-tgggtagaa 16638883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688934
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 16689025  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  16689024 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 36769479 - 36769636
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| || ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||    
T  36769479 aaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 36769574  T
Q  250 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  36769575 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 36769636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208825
Alignment:
Q  105 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagatt 38208825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggact-tgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 310
Target Start/End: Original strand, 15831252 - 15831298
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  15831252 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771434
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagag 36771434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  185 aagagattgagactctgggtagaaataggcgggagactt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4874661 - 4874620
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 192  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4874661 aaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagatt 4874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10047452 - 10047383
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  10047452 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Original strand, 18587077 - 18587154
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  18587077 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39246067 - 39245998
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  39246067 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884921
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagact 4884921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743925
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745314
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 190
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699788
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 25699788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609606
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 198  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagact 29609606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 142)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4308581 - 4308256
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4308581 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 4308482  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4308481 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 4308382  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4308381 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 4308283  T
Q  331 acaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4308282 acaaattcttttgtgttctctcttctt 4308256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 3314628 - 3314965
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||    
T  3314628 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 3314727  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| || ||||||||    
T  3314728 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcggg 3314827  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3314828 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgga 3314927  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314928 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1626996 - 1626660
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||    
T  1626996 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaaca 1626897  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  1626896 aacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcggg 1626797  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  1626796 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtcgatttgga 1626698  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1626697 ccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1626660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Original strand, 1313365 - 1313691
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1313365 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggttt-acaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 1313463  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313464 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 1313563  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1313564 tgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 1313662  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313663 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 1313691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43423776 - 43423438
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  43423776 attgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 43423677  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||     
T  43423676 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggt 43423577  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  43423576 agacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaatttgga 43423478  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423477 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 43423438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43421728 - 43421390
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  43421728 attgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaaca 43421629  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||| ||| ||||    
T  43421628 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacggg 43421529  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43421528 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 43421430  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421429 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 43421390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 53917965 - 53917639
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53917965 taaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtt 53917866  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53917865 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattctt 53917766  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  53917765 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 53917667  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917666 aacaaattcttttgtgttctctcttctt 53917639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 38890020 - 38890323
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38890020 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38890119  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38890120 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 38890219  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38890220 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 38890318  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  38890319 ttctt 38890323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 38 - 356
Target Start/End: Original strand, 45882902 - 45883221
Alignment:
Q  38 tgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 136  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | |||||||| || |||||||||||    
T  45882902 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggt 45883001  T
Q  137 tgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacac 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  45883002 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 45883101  T
Q  237 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc-atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45883102 attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 45883200  T
Q  336 ttcttttgtgttctctcttct 356  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45883201 ttcttttgtgttctctcttct 45883221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 24979652 - 24979990
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  24979652 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 24979751  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  24979752 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcagga 24979851  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24979852 gacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgga 24979950  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979951 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 24979990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28102304 - 28101979
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28102304 gtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 28102205  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28102204 ttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 28102105  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| || |  ||||||||||||||| | |||| |||    
T  28102104 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatca-tatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggt 28102006  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28102005 caacaaattcttttgtgttctctcttc 28101979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5927077 - 5926746
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| || | ||||    
T  5927077 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaaca 5926978  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  5926977 aacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcggg 5926878  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  5926877 agacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatca-tataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttgga 5926779  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 351  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5926778 ccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttctct 5926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10956304 - 10956001
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10956304 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 10956205  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10956204 cattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 10956105  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10956104 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 10956006  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  10956005 ttctt 10956001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27101474 - 27101158
Alignment:
Q  39 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 137  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27101474 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27101375  T
Q  138 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27101374 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 27101275  T
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27101274 ttgatatctcttttgcaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 27101176  T
Q  338 cttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27101175 cttttgtgttctctcttc 27101158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18099447 - 18099145
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18099447 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18099348  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18099347 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 18099248  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18099247 aacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctcttt 18099149  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  18099148 tctt 18099145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 30005821 - 30006123
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30005821 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 30005920  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30005921 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 30006020  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006021 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 30006119  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  30006120 tctt 30006123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10958600 - 10958297
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10958600 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 10958501  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10958500 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 10958401  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10958400 aacgttactcttca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttcttctc 10958302  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  10958301 ttctt 10958297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28761730 - 28761407
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28761730 gtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggt 28761632  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28761631 ttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattct 28761532  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaa-tttggatcgaactggg 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28761531 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactggg 28761432  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  28761431 taaacaaattcttttgttttctctc 28761407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 53915798 - 53915471
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  53915798 gtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggt 53915699  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53915698 ttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 53915599  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  53915598 tgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggt 53915500  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915499 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 53915471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 25533422 - 25533716
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25533422 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 25533521  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25533522 cactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 25533621  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533622 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 353
Target Start/End: Original strand, 42990284 - 42990582
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  42990284 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 42990383  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42990384 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 42990483  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990484 aacgttactcatca-tatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 42990582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 61 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9604877 - 9604580
Alignment:
Q  61 ggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9604877 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 9604778  T
Q  161 atgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggtta 260  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  9604777 aggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 9604678  T
Q  261 ctcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604677 ctcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttct 9604580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Original strand, 43228271 - 43228571
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43228271 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43228370  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43228371 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 43228470  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43228471 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctct 43228569  T
Q  354 tc 355  Q
    ||    
T  43228570 tc 43228571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 880765 - 880426
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaac 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  880765 attgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaac 880666  T
Q  117 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||| |||    
T  880665 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgg 880566  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  880565 gagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgg 880467  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880466 accgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 880426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 51727283 - 51726981
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51727283 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaa 51727185  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51727184 cactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 51727085  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51727084 aacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 51726986  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  51726985 ttctt 51726981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 3859508 - 3859801
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3859508 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 3859607  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3859608 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgt 3859706  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859707 aacaatactcatca-tatagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18097177 - 18096875
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18097177 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18097078  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  18097077 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgt 18096978  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18096977 aacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttctctct 18096879  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  18096878 tctt 18096875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Original strand, 11170361 - 11170678
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11170361 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 11170460  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11170461 gcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttg 11170560  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11170561 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtca 11170659  T
Q  331 acaaattcttttgtgttct 349  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  11170660 acaaattcttttgttttct 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 18162643 - 18162945
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18162643 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaa 18162742  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  18162743 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgt 18162842  T
Q  254 -aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
     || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18162843 aaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctc 18162940  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  18162941 ttctt 18162945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 53468768 - 53468430
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| | || |    
T  53468768 attgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccaggt-ttgtatagagtttgtctctttggaaga 53468670  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  53468669 aacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcggg 53468570  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc--atactaggtcaatttg 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||  | ||||||||||||||    
T  53468569 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttg 53468470  T
Q  316 gatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468469 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 53468430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 356
Target Start/End: Original strand, 51943326 - 51943651
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||||| |||||||||   ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  51943326 gtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggt 51943425  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51943426 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttct 51943524  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51943525 tgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggt 51943623  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttct 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51943624 caacaaattctcttgtgttctctcttct 51943651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4104172 - 4103870
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4104172 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 4104073  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  4104072 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 4103974  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4103973 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 4103875  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  4103874 ttctt 4103870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32264334 - 32264015
Alignment:
Q  37 ttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaggg 135  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32264334 ttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 32264235  T
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaaca 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  32264234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacc 32264135  T
Q  236 cattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||| |    
T  32264134 cattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-a 32264036  T
Q  335 attcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32264035 attcttttgtgttctctcttc 32264015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321762
Alignment:
Q  78 acaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttgg 177  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  178 ttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 277  Q
    |||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 1321681  T
Q  278 acggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
     |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1321682 tcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 1321762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 95 - 357
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666796
Alignment:
Q  95 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 194  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  195 gactctgggtagaaataggcgggaga--cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 292  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  293 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |   |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4666735 c---cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 4666796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 55 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10084665 - 10084363
Alignment:
Q  55 aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10084665 aacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 10084566  T
Q  155 actattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgta 254  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  10084565 actattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgta 10084466  T
Q  255 aggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctct 353  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10084465 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttctct 10084367  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  10084366 tctt 10084363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 746737 - 747040
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  746737 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 746836  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  746837 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 746935  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  746936 taacgttactcatca-tatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct-tc 747033  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  747034 ttcttct 747040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Original strand, 43226066 - 43226363
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43226066 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacgt-ttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43226164  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43226165 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 43226264  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43226265 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctct 43226361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47149172 - 47148872
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaa 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  47149172 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aa 47149074  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47149073 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 47148974  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  47148973 tatcgttactcatca-tatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttctctc 47148875  T
Q  353 ttc 355  Q
    |||    
T  47148874 ttc 47148872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 291
Target Start/End: Original strand, 6561755 - 6562028
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  6561755 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 6561854  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  6561855 acactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 6561954  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 291  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6561955 gacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 5191633 - 5191934
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5191633 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 5191732  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  5191733 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 5191831  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5191832 aacgatactcatca-tatagtggatcagagggctgttctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 5191929  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  5191930 ttctt 5191934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 36011771 - 36012109
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||   ||||    
T  36011771 attgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaaca 36011870  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||    
T  36011871 aacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttggg 36011970  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||    
T  36011971 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttgga 36012069  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36012070 ccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 36012109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 25388886 - 25389188
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  25388886 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ccttggaaa 25388984  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  25388985 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttg 25389083  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 351  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  25389084 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 25389182  T
Q  352 cttctt 357  Q
    ||||||    
T  25389183 cttctt 25389188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Original strand, 39715414 - 39715744
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||    
T  39715414 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagg-ggctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaaca 39715512  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  39715513 aacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 39715612  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||| || |  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  39715613 agacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc---atagtgaaacagatggttg--ctctcccccatactagatcattttgga 39715707  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715708 ccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 39715744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 73 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48361929 - 48361647
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 172  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48361929 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtct 48361830  T
Q  173 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 272  Q
    ||| ||||||||||||||||| | || | ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||    
T  48361829 cttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcat-aatata 48361731  T
Q  273 gtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 356  Q
    ||  |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48361730 gtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 48361647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 96 - 365
Target Start/End: Original strand, 6484381 - 6484650
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6484381 tagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattgg 6484480  T
Q  195 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    |  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  6484481 ggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 6484579  T
Q  295 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttctcactcg 365  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6484580 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttattctctctcg 6484650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12268278 - 12267950
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaa-ctagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaac 116  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||   ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  12268278 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaac 12268179  T
Q  117 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  12268178 aaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgg 12268079  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
    |||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  12268078 gagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttgg 12267991  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12267990 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 12267950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22114582 - 22114288
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  22114582 aaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaa 22114483  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22114482 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 22114383  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| |||| || | ||||||  || |||||| |||| || | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114382 aacgttactcatca-tataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 458264 - 458567
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  458264 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 458363  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  458364 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 458462  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  458463 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tc 458560  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  458561 ttcttct 458567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10621807 - 10621504
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10621807 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 10621708  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  10621707 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 10621609  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  10621608 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct-tc 10621511  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  10621510 ttcttct 10621504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 96 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606571
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  196 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 295  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctc 7606625  T
Q  296 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606624 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 357
Target Start/End: Original strand, 26720532 - 26720830
Alignment:
Q  58 aagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacact 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||    
T  26720532 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-act 26720630  T
Q  158 attatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaagg 257  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |    
T  26720631 attaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacg 26720730  T
Q  258 ttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttct 356  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26720731 atactcatca-tatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttcttctcttct 26720829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 38210350 - 38210644
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38210350 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38210449  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  38210450 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttg 38210548  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  38210549 taacgaaactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 38210644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 51675067 - 51674741
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||           |||||| ||| | |||||    
T  51675067 ttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaagg-----------tttgtccctttggaacaa 51674979  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||| |||||||||    
T  51674978 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcggga 51674879  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  51674878 gacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggtcaatttggac 51674780  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674779 cgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 51674741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 15780805 - 15781161
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtt-----------tgtct 107  Q
    ||||||| | |||||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||           |||||    
T  15780805 ttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtct 15780904  T
Q  108 cttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtaga 207  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  15780905 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtaga 15781004  T
Q  208 aataggcgggagacttattcttgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag---gactgctctctcaccca 300  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||   | |||||||||| ||||    
T  15781005 attaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctccccca 15781104  T
Q  301 tactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15781105 cactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttctt 15781161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 455887 - 456190
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  455887 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 455986  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  455987 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 456085  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  456086 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tc 456183  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  456184 ttcttct 456190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 357
Target Start/End: Original strand, 32219051 - 32219367
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32219051 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtt 32219139  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||||||||| ||    
T  32219140 tgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttattttt 32219239  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  32219240 gtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggt 32219338  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219339 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 32219367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Original strand, 23633405 - 23633732
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| | |||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  23633405 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaa 23633502  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  23633503 acactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaa 23633598  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||     
T  23633599 gacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttagac 23633696  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23633697 cgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 23633732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6063723 - 6063429
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6063723 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 6063624  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  6063623 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 6063525  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6063524 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttct 6063429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10191585 - 10191305
Alignment:
Q  55 aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10191585 aacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 10191486  T
Q  155 actattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgta 254  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || || |||||||||||    
T  10191485 actattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgta 10191387  T
Q  255 aggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10191386 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 50493979 - 50494282
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  50493979 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 50494078  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  50494079 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 50494177  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  50494178 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tc 50494275  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  50494276 ttcttct 50494282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6066073 - 6065779
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6066073 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 6065974  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  6065973 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 6065875  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||| | |||||||||| || | |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6065874 taacgaaactcatca-tatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 6065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 66 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28413297 - 28413005
Alignment:
Q  66 agaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  28413297 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 28413198  T
Q  166 tg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactca 264  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||    
T  28413197 tgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactca 28413099  T
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28413098 tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttct-tcttcttct 28413005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 54691885 - 54691551
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaa 119  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  54691885 ttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggtaaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaa 54691786  T
Q  120 cactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||  | || || || ||| ||||||||||    
T  54691785 cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggag 54691686  T
Q  220 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatc 319  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||| || | |||| ||||||||| |      
T  54691685 acttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatca-tatagttaaacggagggctgctctctcccctagactatgtcaatttgaact 54691587  T
Q  320 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  54691586 gaactaggtcgacaaattcttttatgttttctcttc 54691551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5522892 - 5522601
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  5522892 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg-----------tttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaa 5522804  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  5522803 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 5522705  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5522704 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 5522606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 357
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232082
Alignment:
Q  122 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  222 ttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcga 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||  | |||||||||||||| |||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  322 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 6232082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 890084 - 889779
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaac 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||  || |||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  890084 attgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaac 889987  T
Q  117 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||| |    
T  889986 aaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattaggcag 889888  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||| | || |||||||||||||||    
T  889887 gagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttgg 889789  T
Q  317 atcgaactgg 326  Q
    | ||||||||    
T  889788 accgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 357
Target Start/End: Original strand, 31151302 - 31151627
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 126  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31151302 tgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagg 31151399  T
Q  127 gtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttatt 226  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31151400 gttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttatt 31151497  T
Q  227 cttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactg 325  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||   ||||||    
T  31151498 cttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactg 31151595  T
Q  326 ggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31151596 ggtaaacaaattctcatgtgttctctcttctt 31151627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 125 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688137
Alignment:
Q  125 gggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagactta 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  225 ttcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaac 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 25688169  T
Q  324 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25688168 tgggtcaaaaagttcttttgtgttctctcttc 25688137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 295
Target Start/End: Original strand, 29956666 - 29956906
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29956666 aaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 29956765  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29956766 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 29956865  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 295  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29956866 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 29956906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420219
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacg 13420237  T
Q  281 gaggactgctctctcacc 298  Q
    |||  |||||||||||||    
T  13420236 gagagctgctctctcacc 13420219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35918244 - 35917944
Alignment:
Q  37 ttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacac------tagggtt 129  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||      ||| |||    
T  35918244 ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtt 35918145  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || || | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35918144 tgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattctt 35918045  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| | || ||| ||||||||| || |||||||| ||    
T  35918044 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatta-tatagtggaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatc 35917947  T
Q  330 aac 332  Q
    |||    
T  35917946 aac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 354
Target Start/End: Original strand, 17795282 - 17795538
Alignment:
Q  94 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17795282 tatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattg 17795377  T
Q  194 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 293  Q
    || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||    
T  17795378 aggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctc 17795477  T
Q  294 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    || || | |||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17795478 tcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 17795538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 354
Target Start/End: Original strand, 19103722 - 19103978
Alignment:
Q  94 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19103722 tatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattg 19103817  T
Q  194 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 293  Q
    || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||    
T  19103818 aggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctc 19103917  T
Q  294 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    || || | |||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19103918 tcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 19103978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 353
Target Start/End: Original strand, 42992266 - 42992548
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  42992266 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaa 42992365  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||               ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42992366 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtg-gactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 42992449  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || |||| |||||| ||||||| | ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42992450 aacgttagtcatca-tatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttctctct 42992548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 53591139 - 53591467
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||           ||||||||||   ||||    
T  53591139 attgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactaggg-----------tttgtctctttagaaca 53591227  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||  || | ||||||||| ||||||||    
T  53591228 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcggg 53591327  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  53591328 agacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggatgctctctc-cccagactaggtcaatttgga 53591425  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaa--attcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||| |||||||||   || |||||| ||||||||||||    
T  53591426 tcgaactaggtcaacaattttttttttgtattctctcttctt 53591467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Original strand, 35777378 - 35777587
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35777378 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 35777477  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35777478 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 35777577  T
Q  230 gtaacacatt 239  Q
    ||||| ||||    
T  35777578 gtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 357
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886480
Alignment:
Q  135 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
     ||||||| | || |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5886457  T
Q  335 attcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  5886458 attcttttgtgttctctattctt 5886480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 357
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899953
Alignment:
Q  135 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
     ||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5899930  T
Q  335 attcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  5899931 attcttttgtgttctctattctt 5899953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28100353 - 28100143
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  28100353 ttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaa 28100254  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||    
T  28100253 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggga 28100154  T
Q  219 gacttattctt 229  Q
    |||||||||||    
T  28100153 gacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561769
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 561828  T
Q  281 gaggactgctctctcac-ccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
     ||| |||||||||| | ||| |||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  561827 aagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 357
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168384
Alignment:
Q  138 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaatt 11168363  T
Q  338 cttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  11168364 cttttgtgttcttctcttctt 11168384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27635929 - 27635634
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27635929 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
                       |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            || |||||| || |||||||||||||| ||||    
T  27635829 -------------------gggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttct 27635761  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27635760 tgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 27635662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Original strand, 53597186 - 53597472
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaa 119  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |   ||||||||||| | || | |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  53597186 ttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggatgaaacaagggtttataa-gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaa 53597283  T
Q  120 cactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggag 219  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||| | || |||||| |||||  |||    
T  53597284 cactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagag 53597381  T
Q  220 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | || |||||||||    
T  53597382 acttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcccacaaactaggtca 53597472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 337
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635644
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaaca 25635587  T
Q  281 gaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||  ||||||||| ||    ||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  25635588 gagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 54884111 - 54884362
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggcta-aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||  |||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  54884111 tgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactaggg 54884208  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||| |||| ||||||||||||     
T  54884209 tttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt- 54884307  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 282  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54884308 ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 54884362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 23636972 - 23637200
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  23636972 ttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaa 23637069  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  23637070 acactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcggga 23637167  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctctttt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23637168 gacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 36871557 - 36871279
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 172  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  36871557 caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtct 36871461  T
Q  173 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 271  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||   || |||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  36871460 cttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctcttt-gtaaagttaatcatcattat 36871362  T
Q  272 agtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||    
T  36871361 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt-tcgtgtgttctctctt 36871279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 28180968 - 28181182
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  28180968 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataggttt-agaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 28181066  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  28181067 acactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcggga 28181166  T
Q  219 gacttattcttgtaac 234  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  28181167 gacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 201 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701652
Alignment:
Q  201 gggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccca 47701703  T
Q  301 tactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 351  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47701702 gattaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctct 47701652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 355
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307040
Alignment:
Q  152 aacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  252 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 351  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||  || | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctct 3307036  T
Q  352 cttc 355  Q
    ||||    
T  3307037 cttc 3307040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 262
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674160
Alignment:
Q  74 aacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctc 173  Q
    ||||| |||||||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  174 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttact 262  Q
    ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28137607 - 28137415
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| |||||    
T  28137607 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttgggaacaa 28137519  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| |    
T  28137518 acactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggaa 28137419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 180 - 354
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181660
Alignment:
Q  180 acgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaac 279  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  280 ggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 24181660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 166
Target Start/End: Original strand, 41849132 - 41849244
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41849132 aaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 41849231  T
Q  154 cactattatgatt 166  Q
    | |||||| ||||    
T  41849232 ctctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14634665 - 14634491
Alignment:
Q  106 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 205  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14634665 ctcttggcaacaaacactggg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggta 14634569  T
Q  206 gaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 282  Q
    | | ||||   | ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14634568 gcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacgga 14634491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Original strand, 6231393 - 6231502
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6231393 attgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 6231492  T
Q  118 aacactaggg 127  Q
    ||||||||||    
T  6231493 aacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 357
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849341
Alignment:
Q  258 ttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 41849341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35919178 - 35919098
Alignment:
Q  269 tatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919178 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620483
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 234  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   || | ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
     | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  1620557 cctttgatatctcttt-gtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 1620483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 11163107 - 11163218
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11163107 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 11163206  T
Q  131 gagggttgattc 142  Q
    | || |||||||    
T  11163207 gtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 352
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634164
Alignment:
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||  ||| |||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    | |||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25634164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 47701908 - 47701798
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||    
T  47701908 attgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaaca 47701809  T
Q  118 aacactagggt 128  Q
    ||||| |||||    
T  47701808 aacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 300
Target Start/End: Original strand, 13419878 - 13420106
Alignment:
Q  68 aaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg 167  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| |||      
T  13419878 aaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatca 13419972  T
Q  168 agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaaca-cattgatatctcttttgtaaggttactcat 265  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | | | ||||||||| | ||  || ||| | ||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13419973 agtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctc-tttgtaaagttactcat 13420071  T
Q  266 cattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 300  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||    
T  13420072 cattatagtggaatagtggactcctctctccccca 13420106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560352
Alignment:
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||   || ||||||||| ||||| |     
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag- 4560399  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 271  Q
       |||    ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4560398 ---ctt----ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcattat 4560352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 178
Target Start/End: Original strand, 24177278 - 24177380
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 172  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24177278 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 24177374  T
Q  173 cttggt 178  Q
    ||||||    
T  24177375 cttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11007684 - 11007545
Alignment:
Q  162 tgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttac 261  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||         | |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    
T  11007684 tgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttac 11007594  T
Q  262 tcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||| || | |||||||||    
T  11007593 tcatcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 53894109 - 53894031
Alignment:
Q  280 ggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  53894109 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct-tcttcttct 53894031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 178
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggt 178  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913949
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 29914038  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595028
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||   || |||| |||||| |||| ||   |||||||||| |    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctcttt-g 10595119  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  10595118 taaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27761980
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 27762071  T
Q  253 taaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  ||||  |||||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  27762070 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 27761980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878165
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 47878256  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||| | || || |||||||||| |||||||||||    
T  47878255 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Original strand, 3306743 - 3306835
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  3306743 attgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctt 3306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 353
Target Start/End: Original strand, 42992608 - 42992664
Alignment:
Q  297 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42992608 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattctctct 42992664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094100
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10094162  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  10094161 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10094100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10612849 - 10612761
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  10612849 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctctct 10612761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 349
Target Start/End: Original strand, 16996987 - 16997074
Alignment:
Q  263 catcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| | | | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16996987 catcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaattctcttgtgttct 16997074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 328
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768825
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 234  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||   | ||||  ||| || |||||| ||||   || |||| |||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 7768731  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggt 328  Q
       || ||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  7768732 cttttaatataccttt-gtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtcagtattggatcgaattgggt 7768825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897193
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 10897102  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  10897103 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626009
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga-cttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || | || ||||||| ||| ||||   |||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcatt---atctctt 22626071  T
Q  250 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    | |||| |  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  22626070 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtca 22626009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 338
Target Start/End: Original strand, 27420822 - 27420915
Alignment:
Q  246 tcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattc 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||   ||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  27420822 tcttttgtaaagttactcatcattataatggaacatagagttgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaattc 27420915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 880251 - 880215
Alignment:
Q  321 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880251 aactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 880215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418111
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggact 7418111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606830
Alignment:
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 161  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 7606830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8183147 - 8183112
Alignment:
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8183147 cgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 8183112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100117
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||| || ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10100179  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  10100178 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10100117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200980
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10201042  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||| || |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  10201041 ttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10200980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208026
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10208088  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| | || |||||||||    
T  10208087 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtca 10208026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823641
Alignment:
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttgg 316  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||| |  |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || | | || |||||| ||||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctcttt-gtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattgg 15823665  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    | |||| ||||| |||||||||||    
T  15823664 accgaattgggtaaacaaattctt 15823641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303348
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 310
Target Start/End: Original strand, 11079628 - 11079674
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  11079628 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 198
Target Start/End: Original strand, 13893475 - 13893509
Alignment:
Q  164 attgagtctcttggttacgggaagagattgagact 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13893475 attgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 13893509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462241
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16462241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544311
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883026
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 47883026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48390373 - 48390327
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  48390373 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 48390327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 1736319 - 1736388
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1736319 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 18552897 - 18552966
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18552897 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 30709804 - 30709873
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  30709804 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31021362 - 31021300
Alignment:
Q  113 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttg 176  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31021362 caacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 357
Target Start/End: Original strand, 28181242 - 28181286
Alignment:
Q  313 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28181242 ttggaccgaactaggtcaacaaattctcctgtgttctctcttctt 28181286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 100)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31472928 - 31472587
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  31472928 attgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 31472829  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  31472828 aacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcggg 31472729  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    |  | | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31472728 atgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaatttgga 31472629  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472628 ccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttct 31472587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1189888 - 1189586
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1189888 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaa 1189789  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1189788 cactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt 1189689  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct-cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189688 aaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1189589  T
Q  353 ttc 355  Q
    |||    
T  1189588 ttc 1189586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16092479 - 16092176
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16092479 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 16092380  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16092379 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgt 16092280  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  | | ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16092279 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctct 16092180  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  16092179 tctt 16092176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Original strand, 40221497 - 40221823
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  40221497 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggat 40221596  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  40221597 ttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattct 40221696  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40221697 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 40221796  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40221797 caacaaattattttgtgctctctcttc 40221823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 25904067 - 25904403
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||    
T  25904067 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaaca 25904166  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||| || ||||||||    
T  25904167 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcggg 25904266  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25904267 agacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgga 25904365  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25904366 ccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 25904403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Original strand, 17072847 - 17073183
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||    
T  17072847 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 17072946  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | || | | ||||| |||||||     
T  17072947 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcgga 17073046  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17073047 agacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaatttgga 17073146  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17073147 ccgaactgggtcaacaaattcttttgctttctctctt 17073183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18511491 - 18511189
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18511491 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18511392  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18511391 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgt 18511292  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511291 aaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 18511193  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  18511192 tctt 18511189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 354
Target Start/End: Original strand, 24126824 - 24127155
Alignment:
Q  23 tatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaaca 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24126824 tatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaata 24126923  T
Q  122 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagac 221  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  24126924 ctagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagac 24127023  T
Q  222 ttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcga 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  24127024 ttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 24127122  T
Q  322 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127123 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24127155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 25804025 - 25804318
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25804025 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 25804124  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25804125 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 25804224  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25804225 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10474638 - 10474302
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||    
T  10474638 attgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 10474539  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  10474538 aacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcggg 10474439  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10474438 agacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttgga 10474340  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10474339 ccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 10474302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25921775 - 25921449
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25921775 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 25921676  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25921675 gtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttg 25921576  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25921575 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 25921477  T
Q  331 acaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25921476 acaaattcttttgtgttcttctcttctt 25921449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Original strand, 21948026 - 21948326
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21948026 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 21948125  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21948126 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgt 21948225  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948226 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 21948324  T
Q  354 tc 355  Q
    ||    
T  21948325 tc 21948326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Original strand, 39854483 - 39854783
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39854483 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 39854582  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39854583 cactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 39854682  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854683 aacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 39854781  T
Q  354 tc 355  Q
    ||    
T  39854782 tc 39854783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 6756494 - 6756794
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6756494 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaa 6756593  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  6756594 cactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta--acattgatatcttttttgt 6756691  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6756692 aaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctct 6756790  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  6756791 tctt 6756794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 2174919 - 2175212
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2174919 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 2175018  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  2175019 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 2175117  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175118 aacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2818650 - 2818312
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||    
T  2818650 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 2818551  T
Q  119 acactagggtttgagggtt-gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||| ||||||||    
T  2818550 acactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcggg 2818451  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2818450 agactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttgga 2818352  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818351 ccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 2818312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10529378 - 10529074
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10529378 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 10529279  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10529278 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 10529179  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattc-ttttgtgttc-tct 351  Q
    || ||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10529178 aacgttactcatca-tatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttct 10529080  T
Q  352 cttctt 357  Q
    ||||||    
T  10529079 cttctt 10529074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 27912536 - 27912839
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27912536 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaa 27912635  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27912636 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 27912735  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27912736 aacgatactcatca-tatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 27912834  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  27912835 ttctt 27912839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18509597 - 18509295
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18509597 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18509498  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  18509497 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgt 18509398  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| || | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509397 aaagttactcatca-tatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 18509299  T
Q  354 tctt 357  Q
    ||||    
T  18509298 tctt 18509295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 6745069 - 6745364
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6745069 aaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaa 6745167  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6745168 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6745267  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 351  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745268 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6745364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 38882106 - 38882399
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38882106 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38882205  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  38882206 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 38882304  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882305 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Original strand, 695853 - 696177
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||| |||| | ||||    
T  695853 attgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg-----------tttgtatctttggaaca 695941  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  695942 aacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 696040  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  696041 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttgga 696140  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  696141 ccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 696177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17818804 - 17818475
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| | ||||    
T  17818804 attgtatcagtgtaaaccttgagaaagagg-ggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaaca 17818706  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||    
T  17818705 aacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcggg 17818606  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17818605 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaatttgga 17818509  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 351  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818508 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17818475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34479698 - 34479394
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34479698 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 34479599  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  34479598 cactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 34479500  T
Q  252 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tc 350  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34479499 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 34479401  T
Q  351 tcttctt 357  Q
    |||||||    
T  34479400 tcttctt 34479394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 18466684 - 18466987
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18466684 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 18466783  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18466784 cactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 18466883  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18466884 aacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttcttctc 18466982  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  18466983 ttctt 18466987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 348
Target Start/End: Original strand, 18596622 - 18596939
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || |||    
T  18596622 gtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggt--ataaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggt 18596719  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  18596720 ttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttt 18596819  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18596820 tgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 18596919  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  18596920 caacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 4236629 - 4236922
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  4236629 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 4236728  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4236729 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 4236828  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4236829 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34477333 - 34477029
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34477333 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 34477234  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  34477233 cactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 34477135  T
Q  252 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tc 350  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  34477134 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttcttc 34477036  T
Q  351 tcttctt 357  Q
    |||||||    
T  34477035 tcttctt 34477029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 2954381 - 2954718
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaaca 117  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || | || | |||||||||| |||||||    
T  2954381 ttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaaca 2954480  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2954481 aacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 2954580  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  2954581 agacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaattttga 2954678  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2954679 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 2954718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 350
Target Start/End: Original strand, 16776135 - 16776452
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  16776135 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggttt 16776234  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16776235 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 16776334  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  16776335 taac-cattgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtca 16776432  T
Q  331 acaaattcttttgtgttctc 350  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16776433 acaaattcttttgtgttctc 16776452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 68 - 349
Target Start/End: Original strand, 27910464 - 27910744
Alignment:
Q  68 aaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg 167  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27910464 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 27910563  T
Q  168 agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatca 267  Q
    | ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  27910564 aatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca 27910663  T
Q  268 ttatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
     |||| ||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910664 -tataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 76 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658333
Alignment:
Q  76 caacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 175  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  176 ggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 275  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtg 658412  T
Q  276 gaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||| | ||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctctc---cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 658333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37706095 - 37705774
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  37706095 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaaca 37705996  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||| |||| |||    
T  37705995 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtggg 37705896  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37705895 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttgga 37705797  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
     |||||| |||||||||||||||    
T  37705796 ccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 6747306 - 6747600
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || |||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6747306 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaa 6747404  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  6747405 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgt 6747503  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 351  Q
    || ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747504 aacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6747600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39398307 - 39397974
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaac 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  39398307 attgtaccggtgtaaaccttgagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaac 39398209  T
Q  117 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  39398208 aaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcag 39398110  T
Q  217 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  || | ||||||  |||||| | |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  39398109 tagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaatta-tatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttgg 39398011  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    | |||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  39398010 accgaactaggtcaaaacattcttttgtgttctctct 39397974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Original strand, 26097708 - 26098031
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26097708 gtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 26097807  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26097808 tagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 26097906  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  26097907 tgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagg-ctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggt 26098004  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26098005 caacaaattcttttgtgttctctcttc 26098031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 31545080 - 31545383
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31545080 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 31545179  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31545180 cactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 31545278  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    |||   ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  31545279 taacagtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct-tc 31545376  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  31545377 ttcttct 31545383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Original strand, 18469011 - 18469312
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18469011 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 18469110  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18469111 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgt 18469210  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| | |||||||||| ||  |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  18469211 aacgatactcatca-tctagtggaacgaagagctgctctct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttcttctc 18469307  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  18469308 ttctt 18469312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36402632 - 36402305
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||  || ||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36402632 gtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 36402533  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  36402532 ttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattat 36402433  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36402432 tgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggt 36402334  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402333 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 36402305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 132 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505823
Alignment:
Q  132 agggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgt 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  232 aacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20505846  T
Q  332 caaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20505845 caaattcttttgtgttctctctt 20505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34530970 - 34530721
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34530970 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 34530871  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||| |||||||    
T  34530870 ttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattct 34530771  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaa 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34530770 tgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaa 34530721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21684730 - 21684437
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |    
T  21684730 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggata 21684631  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  21684630 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgt 21684532  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21684531 aacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Original strand, 31542712 - 31543028
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31542712 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 31542811  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  31542812 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctc 31542911  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    | ||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  31542912 g-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 31543008  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  31543009 aacaaatttctttgtgttct 31543028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31179650 - 31179368
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31179650 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 31179551  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||    
T  31179550 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttg 31179452  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31179451 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 359
Target Start/End: Original strand, 15552245 - 15552548
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15552245 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 15552344  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  15552345 cactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 15552443  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  15552444 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct-tc 15552541  T
Q  353 ttcttct 359  Q
    |||||||    
T  15552542 ttcttct 15552548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585725
Alignment:
Q  121 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  221 cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcg 320  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 41585758  T
Q  321 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41585757 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 41585725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12556237 - 12555901
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||    
T  12556237 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaa 12556138  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||| ||| |  ||    
T  12556137 acactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattg-gagttttggtagaattagacaaga 12556039  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| || | |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  12556038 gactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc-ttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttgga 12555940  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 356  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12555939 ctgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttct 12555901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6661496 - 6661181
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||||    
T  6661496 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaa 6661399  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| || ||||| |||    
T  6661398 acactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcagga 6661301  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttgga 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  6661300 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttgga 6661201  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
     |||||||| | ||||||||    
T  6661200 ccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 116 - 355
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724193
Alignment:
Q  116 caaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg---------gtagaattaggcg 2724054  T
Q  216 ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttg 315  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 2724153  T
Q  316 gatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724154 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2724193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 133 - 349
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798341
Alignment:
Q  133 gggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgta 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  233 acacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaac 332  Q
    || ||||||| |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatc-gtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaac 39798324  T
Q  333 aaattcttttgtgttct 349  Q
    |||||||||||||||||    
T  39798325 aaattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 349
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587126
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 194  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattga 10586972  T
Q  195 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  10586973 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 10587070  T
Q  295 -cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
     | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10587071 ccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31466233 - 31465966
Alignment:
Q  78 acaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttgg 177  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31466233 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttgg 31466134  T
Q  178 ttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 277  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||          
T  31466133 ttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatca-tat------ 31466042  T
Q  278 acggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
        ||| |||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31466041 ----agggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctctcttctt 31465966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 20043027 - 20043204
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20043027 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggttt 20043126  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20043127 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaa 20043204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Original strand, 20044987 - 20045172
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20044987 aaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 20045086  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  20045087 gagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 121 - 349
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  121 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  221 cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcg 320  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 4410287  T
Q  321 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410288 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 135 - 354
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208874
Alignment:
Q  135 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg-agacttattcttgtaa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  234 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaaca 333  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttc-cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 36208854  T
Q  334 aattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  36208855 aattcttttgt-ttctctctt 36208874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 354
Target Start/End: Original strand, 20053847 - 20054136
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  20053847 aaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgggaaa 20053942  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |     |||||| |||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  20053943 cactattaggattgagtctcttggtttgg-----agattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---gatatctcttttgt 20054034  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 352  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20054035 aaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttctctc 20054134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Original strand, 21288739 - 21289060
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||| ||||||| ||||  ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21288739 gtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 21288838  T
Q  129 t------tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagact 222  Q
    |      |||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| || |||||||| |    
T  21288839 tagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagatt 21288937  T
Q  223 tattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaa 322  Q
    | |||||||||| |||        ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||    
T  21288938 ttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaa 21289028  T
Q  323 ctgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21289029 ctgggtcaacaaattcttttgttttctctctt 21289060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 353
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020518
Alignment:
Q  78 acaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttgg 177  Q
    |||||| ||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttgg 9020341  T
Q  178 ttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 277  Q
    | ||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9020342 tcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 9020441  T
Q  278 acggaggactgctctctcacccatactaggtc-aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
     |||| | ||||||||||  ||| | ||||||   |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  9020442 tcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttctctct 9020518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10750002
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 10749894  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10749895 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttc 10749992  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  10749993 t-tcttcttct 10750002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960117
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38960215 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 38960118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354551
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| ||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15354658 tt-gtaacgttactcattaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 15354561  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  15354560 t-tcttcttct 15354551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413200
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  196 actctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    ||| | ||||||| ||||   | | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctct 17413206  T
Q  295 caccca 300  Q
    | ||||    
T  17413205 ccccca 17413200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665346
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23665239 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 23665336  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  23665337 t-tcttcttct 23665346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793241
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23793348 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 23793251  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  23793250 t-tcttcttct 23793241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26098555 - 26098391
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||| |||| |||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26098555 gtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 26098456  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26098455 ttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattg 26098391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373113
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattga-gtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 3373222  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3373221 tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 3373123  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  3373122 t-tcttcttct 3373113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757478
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||     
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc- 10757370  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10757371 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttc 10757468  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  10757469 t-tcttcttct 10757478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356827
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| ||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15356934 tt-gtaacgttactcattaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 15356837  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  15356836 t-tcttcttct 15356827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 167 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741835
Alignment:
Q  167 gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatc 266  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23741926  T
Q  267 attatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
    |  |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23741925 aa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct-tcttcttct 23741835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 310
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143722
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 234  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||| ||||   || ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  235 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| || | |||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898023
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  || |||| |||||||||||   ||||||||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||| |||||||||||||| | || ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt-ttttgtgttc 4898023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098267
Alignment:
Q  242 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc-atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcat-atggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 26098282  T
Q  341 ttgtgttctctcttc 355  Q
    || ||||||||||||    
T  26098281 ttatgttctctcttc 26098267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 268
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771024
Alignment:
Q  180 acgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15445417 - 15445263
Alignment:
Q  184 gaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 282  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||   || || | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15445417 gaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaa 15445318  T
Q  283 ggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||    
T  15445317 gggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 34033797 - 34033563
Alignment:
Q  105 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag-actctgg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||    
T  34033797 tctcttggcaacaaacactagcgttgg--gattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgg 34033700  T
Q  203 gtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacatt-gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 300  Q
    |||||| || |   || ||||| || | ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||     
T  34033699 gtagaattaagtttgaagacttgttatggtaaccccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcattactgtggaacatagaactgctctctc-ccct 34033601  T
Q  301 tactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  34033600 gactaggtcagtattggatcgaactgggtaaacaaatt 34033563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2144801 - 2144601
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  2144801 tagagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattc 2144705  T
Q  194 ag-actctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattg-atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 290  Q
    || ||| ||||| ||| ||||   || |||| |||||||||||   ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2144704 aggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 2144606  T
Q  291 ctctc 295  Q
    |||||    
T  2144605 ctctc 2144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Original strand, 42770808 - 42770934
Alignment:
Q  91 ttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 190  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  42770808 ttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagaga 42770902  T
Q  191 ttgagactctgggtagaaataggcgggagact 222  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  42770903 ttgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20507776 - 20507659
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| || || || ||||||||||||||||| | |||||    
T  20507776 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 20507677  T
Q  119 acactagggtttgagggt 136  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  20507676 acacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 287 - 354
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043289
Alignment:
Q  287 tgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 20043289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 213
Target Start/End: Original strand, 4754198 - 4754312
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||  |||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  4754198 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtg 4754294  T
Q  196 actctgggtagaaatagg 213  Q
    ||| ||| ||||| ||||    
T  4754295 actttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 282
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430408
Alignment:
Q  136 ttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgta 232  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| | | || ||||||||| ||||   || |||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  233 acacatt-gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 282  Q
    |  | || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35430359 attcttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacgga 35430408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673022
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 22672931  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  22672932 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170967
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 1170905  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  1170906 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 1170967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627411
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 198  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 10627411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 208
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748502
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaa 152  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || || ||| ||   |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  | ||| |||    
T  29748352 aaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  153 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaa 208  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  29748446 acactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 11916996 - 11917065
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11916996 tcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Original strand, 28786515 - 28786592
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  28786515 atcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 28786592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Original strand, 42238371 - 42238448
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  42238371 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 284
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045270
Alignment:
Q  224 attcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggagg 284  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatcttttttgtaaagttacttatcattatagagaaacggagg 20045270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactctgggtagaaatagg 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 89
Target Start/End: Original strand, 4410061 - 4410096
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 89  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410061 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 4410096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224897
Alignment:
Q  105 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctg-ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||  |||||||||||| |||  ||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgg 15224900  T
Q  203 gta 205  Q
    |||    
T  15224899 gta 15224897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445684
Alignment:
Q  156 ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgta 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| |||||||| || ||   |||||||||| |||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctcttt-gta 25445595  T
Q  255 aggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    | |  ||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25445596 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 310
Target Start/End: Original strand, 1240539 - 1240585
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  1240539 atcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtca 1240585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782597
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 31782597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385596
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35385596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Original strand, 533893 - 533937
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42428474 - 42428430
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Original strand, 79169 - 79496
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  79169 gtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 79268  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  79269 ttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattct 79368  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  79369 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggt 79467  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  79468 caacaaattattttgtgttctctcttctt 79496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 87)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11739875 - 11739536
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggcta-aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| | ||||    
T  11739875 attgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaaca 11739776  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  11739775 aacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 11739676  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11739675 agaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgga 11739576  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739575 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 11739536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42923804 - 42923486
Alignment:
Q  39 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 137  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42923804 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 42923705  T
Q  138 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 237  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  42923704 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcca 42923605  T
Q  238 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42923604 ttgatatctcttttgtaaagttactcgtca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42923506  T
Q  338 cttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42923505 cttttgtgttctctcttctt 42923486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Original strand, 17848394 - 17848718
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactaggg 127  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17848394 gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttggg 17848493  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||    
T  17848494 tttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattc 17848590  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17848591 ttgtaac-cattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactggg 17848688  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848689 tcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 17848718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 17849057 - 17849393
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||| | || |    
T  17849057 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaaga 17849156  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17849157 aacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 17849256  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17849257 agacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcccacatactaggtcaatttgga 17849355  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849356 caagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17849393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34979894 - 34979558
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||    
T  34979894 attgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaaca 34979795  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||    
T  34979794 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcggg 34979695  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct-ctcacccatactaggtcaatttgg 316  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| | | |||| |||||||||||||||    
T  34979694 agacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttgg 34979595  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979594 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 34979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6259118 - 6258796
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  6259118 taaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtt 6259019  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6259018 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggggctttgggtagaattaggtgggagacttattctt 6258921  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6258920 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctc-cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtc 6258822  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6258821 aacaaattcttttgtgttctctcttc 6258796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 28196578 - 28196913
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28196578 ttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 28196677  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |    
T  28196678 acattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaa 28196777  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||| |||| ||||||||||||  ||     
T  28196778 gatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gac 28196874  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196875 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 28196913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40032372 - 40032032
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  40032372 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 40032273  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||| |||||| ||    
T  40032272 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtga 40032173  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaattt 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| | || |||||||||||||    
T  40032172 gacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaattt 40032073  T
Q  315 ggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40032072 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttc 40032032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 19007591 - 19007912
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19007591 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 19007690  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19007691 ttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 19007790  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  19007791 tgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 19007889  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctct 351  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19007890 caacaaattcttttgtgttctct 19007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21520972 - 21520672
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  21520972 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaa 21520873  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21520872 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgt 21520773  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21520772 aacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctct 21520674  T
Q  354 tc 355  Q
    ||    
T  21520673 tc 21520672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19502290 - 19501987
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19502290 aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 19502191  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19502190 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 19502091  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19502090 aacgatactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 19501992  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  19501991 ttctt 19501987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Original strand, 27104752 - 27105076
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  27104752 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggttt 27104850  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27104851 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 27104950  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27104951 taacccattgatttctc-tttgtaacattactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 27105048  T
Q  331 acaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27105049 acaaattcttttgtgttcttctcttctt 27105076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 14837213 - 14837544
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||| | ||||    
T  14837213 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaaca 14837312  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  14837313 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcggg 14837406  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14837407 ggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttgga 14837506  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837507 ccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22287640 - 22287315
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  22287640 gtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggt 22287541  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||    
T  22287540 ttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattct 22287441  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22287440 tgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 22287342  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22287341 caacaaattcttttgtgttctctcttc 22287315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6264448 - 6264127
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  6264448 taaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtt 6264353  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||| | || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6264352 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattctt 6264253  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6264252 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 6264153  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6264152 aacaaattcttttgtgttctctcttc 6264127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23452516 - 23452213
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  23452516 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaa 23452417  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23452416 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 23452317  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23452316 aacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 23452218  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  23452217 ttctt 23452213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 42452759 - 42453050
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42452759 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaa 42452856  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42452857 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 42452956  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452957 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 45280287 - 45279969
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaag-gcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  45280287 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttt 45280188  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45280187 agagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 45280088  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  45280087 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtc 45279989  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45279988 aacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 44289347 - 44289046
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44289347 aaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 44289248  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44289247 cactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgt 44289148  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| || |  |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289147 aagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 44289048  T
Q  354 tc 355  Q
    ||    
T  44289047 tc 44289046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19504624 - 19504322
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  19504624 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaa 19504525  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19504524 cactattaggattgagtctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 19504426  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19504425 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 19504327  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  19504326 ttctt 19504322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 42064491 - 42064785
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42064491 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 42064590  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  42064591 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 42064689  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc-aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064690 aacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43623847 - 43623557
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||            |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43623847 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 43623760  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43623759 caatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 43623660  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623659 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctct 43623561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 3022104 - 3022448
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  3022104 ttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 3022203  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||| |||||||||    
T  3022204 acactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcggga 3022303  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatca---------ttatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc 309  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||         ||||| || ||| || | |||||||||| |||| ||||||||    
T  3022304 gacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtc 3022402  T
Q  310 aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022403 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3022448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13910323 - 13910021
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  13910323 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaa 13910224  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13910223 caatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 13910125  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| | || | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13910124 aacaatactcatca-tatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 13910026  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  13910025 ttctt 13910021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31733069 - 31732772
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31733069 gtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggt 31732970  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||            || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31732969 ttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattct 31732882  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31732881 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggt 31732782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15539790 - 15539553
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15539790 attgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 15539691  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15539690 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 15539591  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaa 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15539590 agacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375323
Alignment:
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcat-atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 5375353  T
Q  328 tcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375352 tcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 5375323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35218242 - 35217948
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35218242 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 35218143  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  35218142 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctc-tttg 35218044  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  35218043 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 35217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24162514 - 24162199
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24162514 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 24162415  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24162414 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 24162325  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24162324 taacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatca-tatagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtca 24162227  T
Q  331 acaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24162226 acaaattcttttgtgttcttctcttctt 24162199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35215865 - 35215571
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35215865 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 35215766  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  35215765 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttg 35215667  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  35215666 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 35215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28459429 - 28459170
Alignment:
Q  94 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28459429 tatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttg 28459330  T
Q  194 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 293  Q
     | ||   |||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  28459329 gggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcttctctc 28459230  T
Q  294 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  28459229 t-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctctt 28459170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11578408 - 11578136
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  11578408 gtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggt 11578312  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    | |  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11578311 tgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 11578214  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactag 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  11578213 tgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagactag 11578136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 81 - 354
Target Start/End: Original strand, 22874137 - 22874406
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |    
T  22874137 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtca 22874232  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 280  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22874233 cgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaact 22874332  T
Q  281 gaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22874333 gagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 22874406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45239243 - 45239000
Alignment:
Q  66 agaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgat 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  45239243 agaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 45239145  T
Q  166 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  | | ||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45239144 tgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 45239045  T
Q  266 cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaa 311  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  45239044 ca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 84 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18800559 - 18800290
Alignment:
Q  84 ctagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgg 183  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  18800559 ctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacag 18800464  T
Q  184 gaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 283  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18800463 gaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggag 18800364  T
Q  284 gactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    | || ||||||| |||| || ||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800363 ggctactctctc-cccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttctt 18800290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20146884 - 20146604
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||| |||||||    
T  20146884 aaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 20146789  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    || || || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20146788 caatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgt 20146689  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||| | ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  20146688 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17897519 - 17897226
Alignment:
Q  55 aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaac 154  Q
    |||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||    
T  17897519 aacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaac 17897425  T
Q  155 actattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgta 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  17897424 actattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgta 17897325  T
Q  255 aggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  17897324 aagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctctc-cccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctct 17897227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561117
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36561226  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36561225 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 36561127  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  36561126 t-tcttcttct 36561117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558849
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36558949  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36558948 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 36558850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22407585 - 22407433
Alignment:
Q  202 ggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccat 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||     
T  22407585 ggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccag 22407487  T
Q  302 actaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407486 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22407433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Original strand, 38020178 - 38020302
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  38020178 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaa 38020277  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggt 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  38020278 cactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332157
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc- 45332266  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||    
T  45332265 tttgtaaaggtactcatca-tatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 45332167  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  45332166 t-tcttcttct 45332157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707730
Alignment:
Q  214 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac--ccatactaggtcaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaa 22707774  T
Q  312 tttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22707773 tttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22707730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 354
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107571
Alignment:
Q  73 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 172  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    || ||| || |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtct 35107387  T
Q  173 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg--ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 270  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||     | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35107388 cttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaac-ctttgttatctcttttgtaatgttactcatcatta 35107486  T
Q  271 tagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||||||||| |  || |||||  |||| ||||||||| | ||||| |||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  35107487 tagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctctt 35107571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 354
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699650
Alignment:
Q  134 ggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgta 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  233 acacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaa 331  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || |||| ||||||||| | || || |||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  332 caaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    |||||| |  |||||||||||||    
T  40699629 caaatt-tcgtgtgttctctctt 40699650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 244 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22162999
Alignment:
Q  244 tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttg 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttg 22163013  T
Q  344 tgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||    
T  22163012 tgttctctcttctt 22162999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22163262 - 22163106
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||   ||||    
T  22163262 attgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaaca 22163163  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  22163162 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta-ggttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 151 - 283
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589896
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 283  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcattatagtgtaacggag 20589896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871092
Alignment:
Q  213 gcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |  | | |||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaat 23871049  T
Q  313 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23871050 ttggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctcttc 23871092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27136365 - 27136195
Alignment:
Q  91 ttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 190  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |    
T  27136365 ttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaa 27136269  T
Q  191 ttgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactc 263  Q
    ||| |||| || |||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27136268 ttgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22407688 - 22407591
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctggga 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22407688 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37963109 - 37962938
Alignment:
Q  163 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttact 262  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||| |   |||||||| |||| |    
T  37963109 gattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgattt---ttttgtaaagttatt 37963013  T
Q  263 catcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 337  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37963012 catcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462925
Alignment:
Q  204 tagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatac 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccatta-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 7462979  T
Q  304 taggtcaa-tttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 356  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||     ||||||||||||||||    
T  7462978 taggtcaattttggaccgaactgggtcaaaaaaaaaaattgtgttctctcttct 7462925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 310
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139606
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43139395 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgag 43139491  T
Q  196 actctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    ||| | ||||||| |||| |   ||||| ||| |||||||   ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |    
T  43139492 actttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggtacagaggactgttcttt 43139590  T
Q  295 cacccatactaggtca 310  Q
      || |||||||||||    
T  43139591 tccctatactaggtca 43139606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 354
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028848
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgac 35028691  T
Q  196 actctgggtagaaata-ggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 294  Q
    ||| ||||||||| || |   | | ||| |||||||||||   || ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  35028692 actttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatcattgcagtggaacggagagctgctctct 35028791  T
Q  295 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    | ||| |||||||||| | |  |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  35028792 cccccttactaggtcagtat--atcgaactggctaaacaaatt-ttttgtattctctctt 35028848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 283
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694109
Alignment:
Q  135 gttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgt 231  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  232 aacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 283  Q
    |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattttagtggaacggag 15694109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5377708 - 5377629
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgag 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  5377708 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  121 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 300
Target Start/End: Original strand, 33603994 - 33604143
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| | || |||| ||||   || |||| |||||| ||||   ||||||| ||||    
T  33603994 aaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatctt 33604093  T
Q  250 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 300  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33604094 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccca 33604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27583573 - 27583472
Alignment:
Q  96 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 195  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27583573 tagagttt-tctcttggcaacgaacactaaggttgggag--tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T
Q  196 actct 200  Q
     ||||    
T  27583476 tctct 27583472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 310
Target Start/End: Original strand, 17921769 - 17921927
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctc 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||     | ||| ||||||| ||| | |||||   ||    
T  17921769 gaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgcaaccctttgat---tc 17921865  T
Q  248 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  17921866 tttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctct-acccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828397
Alignment:
Q  174 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 272  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |   || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  273 gtggaac 279  Q
    |||||||    
T  13828403 gtggaac 13828397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539508
Alignment:
Q  310 aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 15539508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943692
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 17943634  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 17943692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 38020083 - 38020154
Alignment:
Q  19 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggcta-aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38020083 attgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 38020154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687139
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 39687077  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  39687078 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39687139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 208
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345735
Alignment:
Q  135 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaa 208  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaa 26345735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517664
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 27517724  T
Q  253 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  27517723 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 27517664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741097
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||     ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggact-tgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 2741035  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  2741036 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2741097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680201
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||   | ||| | ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagact-tgggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcat---tatctc-t 39680139  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  39680140 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 310
Target Start/End: Original strand, 39287262 - 39287324
Alignment:
Q  248 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  39287262 ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacgaagagctgctctctccctcatactaggtca 39287324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054759
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 20054853  T
Q  250 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||| || |||||  ||||||||||  ||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  20054852 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 20054759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736361
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| | ||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-ttggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 2736299  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  2736300 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2736361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Original strand, 7502990 - 7503049
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgagactctgggtagaa 208  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7502990 gaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaa 7503049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462592
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| | |   |||||| |    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctc-t 17462530  T
Q  250 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  17462531 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17462592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12781292 - 12781246
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  12781292 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 12781246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932756
Alignment:
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 17932731  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtgga 277  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||    
T  17932732 taaagaaactcatcattatagtgga 17932756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712660
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22712660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717369
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22717369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191035
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagag 38191035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567447
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 45567447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 8390174 - 8390243
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8390174 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 14699031 - 14699100
Alignment:
Q  265 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14699031 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41303121 - 41303088
Alignment:
Q  246 tcttttgtaaggttactcatcattatagtggaac 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41303121 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 41303088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  290 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 334  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 69570 - 69268
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  69570 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 69471  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  69470 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 69372  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  69371 aacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 69273  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  69272 ttctt 69268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 73302 - 73211
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73302 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 73211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 73203 - 73160
Alignment:
Q  117 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  73203 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 183953 - 183617
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||    
T  183953 ttgtatcagagtaaactttgagataga-agggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 183855  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  183854 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 183756  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  183755 gacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggac 183657  T
Q  319 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  183656 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 183617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 340
Target Start/End: Original strand, 52020 - 52307
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52020 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaa 52119  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52120 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 52219  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactg--ctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52220 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 52307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 340
Target Start/End: Original strand, 50234 - 50308
Alignment:
Q  268 ttatagtggaacggaggactgctctctcaccc--atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  50234 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14661 - 14363
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14661 aaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 14562  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14561 cactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 14462  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 353  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14461 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctct 14365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Original strand, 15005 - 15328
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  15005 aaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagttt 15104  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15105 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttg 15204  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  15205 taacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactca 15303  T
Q  331 acaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    
T  15304 acaaattc--ttgtgttctctcttctt 15328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 79833 - 80168
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaaca 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  79833 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaaca 79932  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||| ||    
T  79933 aaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcagg 80031  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 317  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  80032 agacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 80130  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 355  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  80131 ttgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctctcttc 80168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188386
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 188386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41459
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41762 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 41663  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41662 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 41563  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctc 352  Q
    || ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41562 aacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 41464  T
Q  353 ttctt 357  Q
    |||||    
T  41463 ttctt 41459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 3982 - 4298
Alignment:
Q  31 taaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  3982 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtt 4080  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4081 tgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 4180  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4181 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtc 4278  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4279 aacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11777 - 11450
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 128  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||| || || |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  11777 gtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggt 11678  T
Q  129 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattct 228  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11677 ttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattct 11578  T
Q  229 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 328  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11577 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggt 11479  T
Q  329 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11478 caacaaattcttttgtgttctctcttctt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 357
Target Start/End: Original strand, 85215 - 85542
Alignment:
Q  30 gtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 129  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||| || | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  85215 gtaaaccttgagatagaagaggagaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtt 85314  T
Q  130 tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  85315 tgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattctt 85414  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||  |||     
T  85415 gtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggta 85514  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  85515 aacaaattcttttgtgttctctcttctt 85542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 359
Target Start/End: Original strand, 6185 - 6511
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6185 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 6284  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattctt 229  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6285 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattctt 6384  T
Q  230 gtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtc 329  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||| |||    
T  6385 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtc 6482  T
Q  330 aacaaattcttttgtgttctctcttcttct 359  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  6483 aacaaatttctttgtgttct-tcttcttct 6511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 50 - 344
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  50 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 149  T
Q  154 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  150 cactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 248  T
Q  253 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  249 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 29180 - 29473
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |    
T  29180 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggata 29279  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  29280 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgt 29378  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 349  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29379 aacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 357
Target Start/End: Original strand, 2866 - 3191
Alignment:
Q  32 aaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2866 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 2965  T
Q  131 gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttg 230  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2966 gtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 3065  T
Q  231 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 330  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3066 taacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtca 3163  T
Q  331 acaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  3164 acaaaatattttgtgttcttctcttctt 3191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 114 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1671 - 1429
Alignment:
Q  114 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||    
T  1671 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 1572  T
Q  214 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatt 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1571 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 1474  T
Q  314 tggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1473 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 1429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16132 - 15801
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 118  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||  || | ||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||    
T  16132 ttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaa 16035  T
Q  119 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 218  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||    
T  16034 acactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgaga 15937  T
Q  219 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttgga 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| | |||||    
T  15936 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttgga 15837  T
Q  318 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
     |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||    
T  15836 ccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttatctctt 15801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16961 - 16630
Alignment:
Q  20 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 117  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  16961 ttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaaca 16865  T
Q  118 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 217  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  16864 aacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccag 16767  T
Q  218 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttgg 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||  |  |||||| |||| || ||||||  |||||    
T  16766 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagaccaggtcagttttgg 16667  T
Q  317 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    | |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||    
T  16666 accgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttttctctt 16630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1936 - 1622
Alignment:
Q  29 tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 127  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||         |||||||||||||||    
T  1936 tgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt---------caacaaacactaggg 1847  T
Q  128 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 227  Q
    ||    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1846 ttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattc 1749  T
Q  228 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgg 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  1748 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgg 1649  T
Q  327 gtcaacaaattcttttgtgttctctctt 354  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||    
T  1648 gtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 1622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 295
Target Start/End: Original strand, 2051 - 2290
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2051 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 2149  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  2150 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgt 2249  T
Q  254 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 295  Q
    || ||| ||||||| ||||||| | |||||| || |||||||    
T  2250 aacgttcctcatca-tatagtgaatcggagggctactctctc 2290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 225
Target Start/End: Original strand, 35648 - 35819
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  35648 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaa 35747  T
Q  154 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttat 225  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35748 cactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 357
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35905
Alignment:
Q  268 ttatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |  | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35816 ttatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctcttctt 35905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22427
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22320 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22417  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  22418 t-tcttcttct 22427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24702
Alignment:
Q  150 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 348  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24595 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 24692  T
Q  349 tctcttcttct 359  Q
    | |||||||||    
T  24693 t-tcttcttct 24702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 310
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5076
Alignment:
Q  81 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 180  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4849 aaactagggtttatatagcgttt-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 4945  T
Q  181 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaac 279  Q
     | |||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4946 tgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaac 5045  T
Q  280 ggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
      || ||||||||||  |||| |||||||||    
T  5046 atagaactgctctctgccccagactaggtca 5076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 1110 - 1054
Alignment:
Q  54 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1110 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 1054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4666
Alignment:
Q  280 ggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 347  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57452
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctct 248  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||| | |||| ||||| ||| ||||   || ||  |||||||||||| | ||||||||| |    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  249 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 310  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  57513 tttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 57452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1483 - 1439
Alignment:
Q  302 actaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 346  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1483 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224857
Alignment:
Q  151 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17057 - 16980
Alignment:
Q  264 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 340  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  17057 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University