View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18176_low_33 (Length: 238)

Name: NF18176_low_33
Description: NF18176
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18176_low_33
NF18176_low_33
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (2-222)||(4930317-4930537)
chr7 (2-220)||(12799494-12799712)
chr7 (2-222)||(44422928-44423148)
chr7 (2-221)||(42626383-42626602)
chr7 (2-222)||(13314028-13314247)
chr7 (2-222)||(30258184-30258404)
chr7 (5-222)||(27238329-27238546)
chr7 (2-222)||(10388159-10388378)
chr7 (5-222)||(8268380-8268598)
chr7 (2-222)||(13142692-13142912)
chr7 (2-187)||(44510503-44510688)
chr7 (42-222)||(3045679-3045859)
chr7 (6-222)||(21671283-21671499)
chr7 (2-184)||(26286975-26287156)
chr7 (21-187)||(3880098-3880264)
chr7 (2-168)||(26341283-26341449)
chr7 (8-168)||(3284818-3284978)
chr7 (2-138)||(25543237-25543373)
chr7 (2-162)||(12254163-12254322)
chr7 (8-175)||(3357469-3357636)
chr7 (2-187)||(23866152-23866331)
chr7 (70-187)||(40865185-40865297)
chr7 (2-188)||(4579592-4579782)
chr7 (70-198)||(27256393-27256516)
chr7 (2-187)||(9650795-9650978)
chr7 (70-187)||(19640449-19640561)
chr7 (74-191)||(23318140-23318257)
chr7 (2-187)||(8076134-8076308)
chr7 (2-85)||(23246861-23246944)
chr7 (2-79)||(9008247-9008324)
chr7 (1-204)||(6590787-6590995)
chr7 (30-187)||(16372505-16372666)
chr7 (109-222)||(15642368-15642482)
chr7 (150-222)||(3356887-3356959)
chr7 (145-187)||(9008377-9008419)
chr7 (155-188)||(10498380-10498413)
chr7 (155-188)||(10503409-10503442)
chr7 (2-55)||(15642318-15642371)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (2-214)||(47244332-47244544)
chr4 (2-216)||(19102061-19102275)
chr4 (2-221)||(37259669-37259888)
chr4 (2-221)||(37264356-37264575)
chr4 (2-222)||(31729182-31729398)
chr4 (2-222)||(16421113-16421333)
chr4 (30-222)||(19106720-19106912)
chr4 (6-222)||(13059498-13059713)
chr4 (2-222)||(51698001-51698220)
chr4 (2-222)||(31273605-31273817)
chr4 (3-222)||(8693796-8694015)
chr4 (2-172)||(31269118-31269288)
chr4 (30-222)||(12823692-12823884)
chr4 (2-183)||(55251803-55251984)
chr4 (3-215)||(19540959-19541171)
chr4 (2-203)||(5928029-5928230)
chr4 (2-222)||(5271214-5271430)
chr4 (2-187)||(48276475-48276660)
chr4 (2-187)||(8030302-8030487)
chr4 (2-187)||(33463182-33463367)
chr4 (63-222)||(13065608-13065766)
chr4 (50-220)||(15134284-15134455)
chr4 (5-187)||(33468799-33468981)
chr4 (3-214)||(40408284-40408498)
chr4 (2-187)||(19906335-19906519)
chr4 (109-222)||(31766001-31766114)
chr4 (121-222)||(32081923-32082024)
chr4 (70-198)||(7902927-7903050)
chr4 (2-179)||(8649469-8649641)
chr4 (2-179)||(8661276-8661448)
chr4 (2-187)||(13521820-13522003)
chr4 (81-198)||(34560588-34560700)
chr4 (70-198)||(3997878-3998001)
chr4 (6-183)||(12878327-12878503)
chr4 (2-128)||(4551081-4551203)
chr4 (70-187)||(31298220-31298332)
chr4 (137-221)||(6942987-6943071)
chr4 (2-74)||(47574709-47574781)
chr4 (23-85)||(42758683-42758745)
chr4 (79-187)||(47574817-47574921)
chr4 (2-125)||(12874623-12874746)
chr4 (75-198)||(39319730-39319848)
chr4 (2-87)||(32082017-32082102)
chr4 (144-222)||(39217201-39217280)
chr4 (2-84)||(2819928-2820010)
chr4 (70-184)||(41816935-41817044)
chr4 (3-52)||(9362416-9362465)
chr4 (110-219)||(23093293-23093403)
chr4 (79-152)||(55810140-55810213)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (2-222)||(25497117-25497336)
chr2 (2-222)||(12797009-12797229)
chr2 (6-222)||(25478089-25478304)
chr2 (2-222)||(9189598-9189814)
chr2 (2-222)||(9180519-9180735)
chr2 (2-222)||(1934784-1935004)
chr2 (2-222)||(31326823-31327053)
chr2 (2-187)||(29677851-29678036)
chr2 (2-203)||(19892276-19892477)
chr2 (8-222)||(28603393-28603607)
chr2 (5-187)||(30651016-30651197)
chr2 (2-222)||(18344515-18344726)
chr2 (3-215)||(17545097-17545308)
chr2 (4-203)||(40847409-40847604)
chr2 (2-187)||(7737677-7737862)
chr2 (2-187)||(35602006-35602186)
chr2 (2-187)||(10160556-10160735)
chr2 (28-187)||(17453413-17453564)
chr2 (2-89)||(29677465-29677552)
chr2 (2-115)||(30658347-30658460)
chr2 (70-198)||(6297707-6297830)
chr2 (7-171)||(21523571-21523726)
chr2 (8-191)||(19094315-19094499)
chr2 (70-215)||(28855156-28855295)
chr2 (2-128)||(19578300-19578425)
chr2 (2-115)||(30631663-30631780)
chr2 (144-188)||(30643409-30643453)
chr2 (2-53)||(35638957-35639008)
chr2 (2-57)||(42926715-42926770)
chr2 (70-187)||(19538536-19538648)
chr2 (18-85)||(32079479-32079546)
chr2 (100-166)||(38591447-38591515)
chr2 (144-188)||(30629076-30629120)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (5-222)||(2207540-2207757)
chr3 (2-222)||(758159-758379)
chr3 (2-222)||(55431397-55431617)
chr3 (2-222)||(29350322-29350542)
chr3 (2-222)||(23661255-23661475)
chr3 (2-222)||(23665914-23666134)
chr3 (2-222)||(24038162-24038382)
chr3 (2-222)||(14438490-14438706)
chr3 (5-222)||(20520139-20520356)
chr3 (2-222)||(55325858-55326078)
chr3 (2-222)||(7571009-7571229)
chr3 (2-222)||(27709018-27709234)
chr3 (5-222)||(3657031-3657248)
chr3 (3-196)||(46964098-46964291)
chr3 (2-222)||(18472089-18472309)
chr3 (1-218)||(3419076-3419291)
chr3 (2-222)||(18467307-18467527)
chr3 (2-222)||(39775519-39775739)
chr3 (2-174)||(32474518-32474691)
chr3 (2-187)||(3672668-3672848)
chr3 (2-187)||(3692700-3692880)
chr3 (2-187)||(8069761-8069941)
chr3 (2-187)||(8883252-8883432)
chr3 (9-222)||(25726581-25726792)
chr3 (2-187)||(8888012-8888192)
chr3 (2-154)||(49971287-49971435)
chr3 (3-187)||(3033727-3033906)
chr3 (2-187)||(12965699-12965884)
chr3 (3-168)||(12971478-12971643)
chr3 (2-188)||(6596187-6596368)
chr3 (80-222)||(10708468-10708613)
chr3 (70-198)||(10586004-10586127)
chr3 (3-184)||(17025936-17026115)
chr3 (70-198)||(31002847-31002970)
chr3 (120-198)||(45904359-45904437)
chr3 (120-198)||(45904815-45904893)
chr3 (21-187)||(28125244-28125404)
chr3 (2-138)||(12112516-12112652)
chr3 (3-48)||(29715727-29715772)
chr3 (155-191)||(13156223-13156259)
chr3 (63-187)||(16013846-16013969)
chr3 (155-188)||(35457635-35457668)
chr3 (155-191)||(13166963-13166999)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (6-222)||(25843844-25844060)
chr1 (2-222)||(19798804-19799024)
chr1 (5-222)||(38620779-38620996)
chr1 (3-222)||(10140174-10140396)
chr1 (6-222)||(26927513-26927729)
chr1 (2-222)||(39588158-39588378)
chr1 (3-222)||(40166065-40166284)
chr1 (2-183)||(33301010-33301191)
chr1 (2-170)||(8138023-8138191)
chr1 (5-193)||(51041283-51041471)
chr1 (2-202)||(28434384-28434585)
chr1 (2-187)||(16833568-16833753)
chr1 (2-187)||(23192644-23192828)
chr1 (2-222)||(16035692-16035911)
chr1 (5-214)||(47451025-47451233)
chr1 (4-116)||(16649510-16649622)
chr1 (16-187)||(3094186-3094352)
chr1 (30-203)||(18784371-18784540)
chr1 (74-198)||(41097773-41097892)
chr1 (3-85)||(10135541-10135623)
chr1 (3-187)||(12260081-12260258)
chr1 (70-198)||(8267651-8267774)
chr1 (144-214)||(16649436-16649506)
chr1 (70-187)||(33055189-33055301)
chr1 (21-151)||(11806462-11806592)
chr1 (63-172)||(25779155-25779268)
chr1 (2-46)||(47455353-47455397)
chr1 (122-165)||(40233186-40233229)
chr1 (176-222)||(39200557-39200603)
chr1 (177-222)||(11806596-11806641)
chr1 (155-188)||(25779080-25779113)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-222)||(443737-443957)
scaffold0002 (2-187)||(4158-4342)
scaffold0002 (155-191)||(150729-150765)
scaffold0002 (155-191)||(139989-140025)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (2-220)||(11534504-11534722)
chr6 (2-222)||(11560012-11560232)
chr6 (2-220)||(12689055-12689273)
chr6 (2-214)||(11570548-11570760)
chr6 (2-222)||(17964350-17964570)
chr6 (2-222)||(16835951-16836167)
chr6 (33-222)||(11428124-11428313)
chr6 (2-222)||(2699898-2700117)
chr6 (2-222)||(6407652-6407871)
chr6 (77-222)||(25314248-25314393)
chr6 (77-222)||(26201742-26201887)
chr6 (2-222)||(29892052-29892272)
chr6 (3-214)||(4157168-4157379)
chr6 (4-222)||(19995194-19995412)
chr6 (5-222)||(12406144-12406361)
chr6 (2-186)||(33687430-33687614)
chr6 (5-179)||(14509071-14509245)
chr6 (68-222)||(5856158-5856311)
chr6 (2-187)||(8747866-8748046)
chr6 (2-160)||(24589022-24589175)
chr6 (75-213)||(11613565-11613705)
chr6 (91-198)||(17913770-17913877)
chr6 (6-128)||(20748169-20748291)
chr6 (2-190)||(22609652-22609841)
chr6 (2-142)||(21309115-21309238)
chr6 (3-191)||(15991560-15991750)
chr6 (3-191)||(15999222-15999412)
chr6 (2-83)||(25316494-25316574)
chr6 (2-83)||(26203988-26204068)
chr6 (2-74)||(13736617-13736689)
chr6 (100-191)||(2863288-2863379)
chr6 (3-188)||(9751633-9751818)
chr6 (134-191)||(2882592-2882649)
chr6 (70-187)||(6112787-6112898)
chr6 (2-66)||(11614039-11614103)
chr6 (5-57)||(22695227-22695279)
chr6 (86-127)||(22695165-22695206)
chr6 (120-188)||(5495983-5496050)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (2-219)||(12103109-12103326)
chr5 (2-222)||(35679667-35679886)
chr5 (2-222)||(10759612-10759831)
chr5 (2-222)||(7451842-7452058)
chr5 (2-221)||(40147979-40148198)
chr5 (5-222)||(20180854-20181071)
chr5 (2-222)||(29167764-29167984)
chr5 (2-183)||(6155249-6155430)
chr5 (2-215)||(36428793-36429006)
chr5 (2-203)||(26667356-26667557)
chr5 (2-203)||(26938953-26939154)
chr5 (2-222)||(37248595-37248806)
chr5 (6-222)||(36423725-36423941)
chr5 (2-187)||(39523133-39523317)
chr5 (2-174)||(12501738-12501910)
chr5 (2-187)||(39518494-39518678)
chr5 (2-187)||(556779-556959)
chr5 (2-187)||(561551-561731)
chr5 (2-187)||(36937342-36937522)
chr5 (2-187)||(36942096-36942276)
chr5 (6-186)||(11981107-11981287)
chr5 (5-187)||(4872009-4872191)
chr5 (2-203)||(12102639-12102842)
chr5 (2-187)||(32461380-32461560)
chr5 (2-127)||(41587048-41587171)
chr5 (2-187)||(42001518-42001693)
chr5 (22-183)||(9726518-9726678)
chr5 (2-169)||(6514444-6514612)
chr5 (2-173)||(12041772-12041943)
chr5 (2-187)||(41996749-41996924)
chr5 (28-222)||(15414672-15414866)
chr5 (2-187)||(12044970-12045150)
chr5 (5-221)||(16116040-16116257)
chr5 (70-198)||(13301303-13301426)
chr5 (37-214)||(34707337-34707513)
chr5 (70-187)||(21323798-21323910)
chr5 (3-115)||(3666017-3666129)
chr5 (70-198)||(31731694-31731817)
chr5 (70-187)||(1429827-1429938)
chr5 (148-222)||(37652742-37652816)
chr5 (5-187)||(9911239-9911413)
chr5 (149-222)||(37549944-37550017)
chr5 (152-188)||(3666139-3666175)
chr5 (171-222)||(6513717-6513768)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (2-222)||(7188-7408)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (2-222)||(36683663-36683883)
chr8 (5-222)||(33416634-33416850)
chr8 (2-222)||(44925715-44925934)
chr8 (2-222)||(19166718-19166938)
chr8 (6-222)||(1910760-1910976)
chr8 (5-222)||(15951346-15951564)
chr8 (3-198)||(2965715-2965910)
chr8 (5-187)||(40125712-40125893)
chr8 (3-220)||(23548423-23548642)
chr8 (6-222)||(28564612-28564826)
chr8 (6-222)||(28572235-28572449)
chr8 (2-187)||(17026019-17026204)
chr8 (2-187)||(17556511-17556696)
chr8 (2-187)||(31449697-31449877)
chr8 (2-222)||(38182047-38182248)
chr8 (2-221)||(18876181-18876378)
chr8 (5-183)||(24090714-24090887)
chr8 (48-220)||(17020468-17020640)
chr8 (48-220)||(17550905-17551077)
chr8 (3-139)||(34118551-34118687)
chr8 (2-222)||(28559457-28559665)
chr8 (16-187)||(4238172-4238338)
chr8 (16-187)||(4242911-4243077)
chr8 (8-116)||(1807563-1807671)
chr8 (2-187)||(43302519-43302702)
chr8 (70-198)||(25367801-25367924)
chr8 (70-198)||(34818520-34818643)
chr8 (70-198)||(8331178-8331301)
chr8 (70-198)||(37771862-37771985)
chr8 (2-85)||(15875596-15875679)
chr8 (99-222)||(26779281-26779403)
chr8 (100-187)||(12820504-12820591)
chr8 (156-218)||(1807685-1807747)
chr8 (5-85)||(17953800-17953881)
chr8 (24-222)||(24673125-24673320)
chr8 (122-191)||(29220550-29220619)
chr8 (100-199)||(7001871-7001971)
chr8 (98-215)||(22714805-22714923)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (2-187)||(9713-9898)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (1-198)||(29238-29439)
scaffold0054 (2-135)||(25483-25616)
scaffold0054 (112-222)||(25637-25747)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (37-203)||(4092-4259)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (2-187)||(83150-83327)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (70-198)||(45935-46058)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (70-198)||(152729-152852)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (50-203)||(5422-5570)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (103-221)||(148197-148316)
scaffold0009 (2-108)||(164928-165040)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (2-84)||(255901-255983)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (70-184)||(47692-47801)
scaffold0060 (70-192)||(52727-52844)
[»] scaffold2020 (1 HSPs)
scaffold2020 (2-108)||(455-567)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (2-74)||(166025-166097)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (2-56)||(35718-35772)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (41-187)||(146256-146406)
scaffold0011 (3-45)||(155486-155528)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (70-157)||(1088-1170)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (8-88)||(1230-1309)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (6-84)||(2396-2474)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (152-222)||(42184-42255)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (148-198)||(35519-35569)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (151-222)||(3001-3073)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 4930317 - 4930537
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  4930317 caggataaaacaagcccaactacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcatatatggtactaagaccactctt 4930416  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  4930417 taatactgaaaccaccttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgctgtcaccattctaactttaatttctcca 4930516  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  4930517 aaacattaatatggcactacg 4930537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 12799494 - 12799712
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12799494 caggataaaataagtccagctacaactgtgcggttaactactgcattgcagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 12799593  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12799594 taatactgaaatcactttaatatggtattgttaccactttgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 12799693  T
Q  202 aaacatcaatatggcacta 220  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  12799694 aaatatcaatatagcacta 12799712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44423148 - 44422928
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44423148 caggataaaacaagtccatctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 44423049  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  44423048 taatactgaaactaccttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgaaaccaatcaaatatggtgttgtcacaattctaactttaatttctcca 44422949  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  44422948 aaacatcaatgtggcactacg 44422928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42626602 - 42626383
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  42626602 caggataaaataagtccagctacaactgtgcggttaattactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagatcactctt 42626503  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42626502 taatattaaaaccaccttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 42626403  T
Q  202 aaacatcaatatggcactac 221  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  42626402 aaacattaatatggcactac 42626383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13314247 - 13314028
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  13314247 caggataaaacaagctcagctacaactgttcaattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 13314148  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  13314147 -aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatattgtgttaccactattctaactttaatttctcca 13314049  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13314048 aaacatcaatatggcactacg 13314028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 30258184 - 30258404
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| || | ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  30258184 caggataaaacaagtccagctacaacagtgcggttaactactgcactgtagaaaattgttcgaaatttacaccttcaaatatggtactaagaccactctt 30258283  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30258284 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactatgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttcttta 30258383  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  30258384 aagtatcaatatggcactacg 30258404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 27238329 - 27238546
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  27238329 gataaaacaagtccagctacaactgcgtgcttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagatttacaccctcaaatatgatactaagaccactctttaa 27238428  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  27238429 ttctgaaaccactttaatatgataatgttaccactttgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaattgtaatttctccaaaa 27238528  T
Q  205 catcaatatggcactacg 222  Q
     |||||||||||||||||    
T  27238529 tatcaatatggcactacg 27238546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10388378 - 10388159
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||    
T  10388378 caggataaaacaaactcaactacaactgtgcgattaactactgcactctaaaaaattgttcgagatttacaccctcaaataaggtactaataccactctt 10388279  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||    
T  10388278 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctattatggtgctgagaccactcaaat-tggtgttaccacaactttaactttaatttctcca 10388180  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  10388179 aaatatcaatatggcactacg 10388159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 8268380 - 8268598
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaa-cagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttta 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| | ||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  8268380 gataaaacaagtccagctacaactgttcgattaactactgcaccgtagaaaaaccgttcgataattacacctccaaatatggtactaagatcactcttta 8268479  T
Q  104 atactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaa 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8268480 gtactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatgttgttaacaccattctaactttaagttctccaaa 8268579  T
Q  204 acatcaatatggcactacg 222  Q
      ||| |||||| ||||||    
T  8268580 ctatctatatggtactacg 8268598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13142912 - 13142692
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||| || ||||    
T  13142912 caggataaaacaagttcagctacaactgtaaggctaactattgcactatagaaaactgttcgagatttacaccgttaaatatggtactaagatcactctt 13142813  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| || |||| ||    
T  13142812 taatattgaaaccactttaatatggtattgttaccactttgttatggtgctgagaccacttaaatatggtgttaccaccattctttcttcaagttctaca 13142713  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  13142712 aaatatcaatatggaactacg 13142692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44510688 - 44510503
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||    
T  44510688 caggataaaacaagctcagctgcaactgtgcggttaacttctgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtactaagaccacactt 44510590  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44510589 ttaatactgaaaccactttaatatgacattgttaccattctgttatgttgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 44510503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Original strand, 3045679 - 3045859
Alignment:
Q  42 ctgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactct 141  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3045679 ctgcactgtagaaaatcgttcgagatttacaccctcaaatatggtactaagaccgctctttaatattgaaaccattttaatatggtattgttaccactct 3045778  T
Q  142 ggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||| |||||||    
T  3045779 gttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaagttttctaaaatatcaatatgacactacg 3045859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 21671283 - 21671499
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-aa 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||| ||| ||| || ||||||| ||  |||||||||||| ||    
T  21671283 ataaaacaagctcacctacaactgtgcggttaactactgcagtgtagaaaatcgttcgagatttaaacc-tccaatatgggacaaagaccattcttttaa 21671381  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||    
T  21671382 taatgaaaccactttaatatggtattattaccactttaatatggtgttgagataactcaaatatggtgttaccaccattataactttaatttttccaaaa 21671481  T
Q  205 catcaatatggcactacg 222  Q
     ||||||||| |||||||    
T  21671482 tatcaatatgacactacg 21671499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26287156 - 26286975
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |    
T  26287156 caggataaaacaaatccagctacaactgtgcagttaactactgcactatagaaaatcgttcgagctttaca-cctccaatatggtaccaagaccattctt 26287058  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattc 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26287057 ttaatactgaaaccactttaatatggtactgttaccactctattatcgtg-tgagaccactcaaatatggtgttaccaccattc 26286975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 3880098 - 3880264
Alignment:
Q  21 ctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccacttta 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3880098 ctacaactatgtggttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacactctcaaatatgatactaagaccactctttaatattgaaaccacttta 3880197  T
Q  121 atatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3880198 atatgatactgttaccactctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgttatcaccattctaa 3880264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 26341283 - 26341449
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||   ||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  26341283 caggataaaacaagtccagctacaactgttcgattaactactacactgtagaaaatcattcaagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 26341382  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  26341383 taatactgaaaccactttaatatgatattgttaccactctgttatgatgctgagaccactcaaatat 26341449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Original strand, 3284818 - 3284978
Alignment:
Q  8 aaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatac 107  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  3284818 aaaacaaactcagctacaaccgtgcggttaactaccgcacaatagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactgagaccactctttaatgt 3284917  T
Q  108 tgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatat 168  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  3284918 cgaaaccactttaataaggtatttttactactctgttatggtgctgagaccaatcaaatat 3284978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25543373 - 25543237
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  25543373 caggataaaacaagtctagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactctt 25543275  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25543274 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccac 25543237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Original strand, 12254163 - 12254322
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||    
T  12254163 caggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactaatgctgtgtagaaaaccgtttgagatttacacc-tcaaatatggtactaagtccagtctt 12254261  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactc 162  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12254262 tcctactgaaaccactttaatatgatattgctaccactctgttatggtgttgagaccactc 12254322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3357636 - 3357469
Alignment:
Q  8 aaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatac 107  Q
    ||||||| | || |||||| |||| ||||||| | |||||| |||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  3357636 aaaacaaacacaactacaattgtgtggttaaccattgcactgtagaaaatcgttcaagatttacaccctaaaatatggtactaagatcactctttaatac 3357537  T
Q  108 tgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttg 175  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3357536 cgaaaccactttaatatggtactgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatagtgttg 3357469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 23866152 - 23866331
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  23866152 caggataaaacaagctcagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactctt 23866250  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| ||||||||     ||||||||| | | ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23866251 ttaatgctgaaacc-----aatatggtactatgaccactctattattgtgttgagaccact-aaatatggtgttaccaccattctaa 23866331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40865297 - 40865185
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40865297 acaccctctaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacca-----atatggtattgttaccattctattatggtgttaagaccactcaaatatg 40865203  T
Q  170 gtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  40865202 gtgttaccaccattctaa 40865185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 4579592 - 4579782
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg-tactgagaccattc- 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || | || ||| ||     
T  4579592 caggataaaacaagtccagctacaactgtgcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcaagaattacaccctcaaatatggctattaaggccactcg 4579691  T
Q  100 --tttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
       |||||| |||||||||  | |||||||||||| |||| |||  ||| ||  | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4579692 aaattaataatgaaaccacgattatatggtattgtgaccattctattatagtactaagaccgttcaaatatggtgttaccaccattctaac 4579782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Original strand, 27256393 - 27256516
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||     |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27256393 acaccctctaatatggtactaagaccactatttaatactgaaacca-----atatggtattattaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatg 27256487  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  27256488 gtgttaccaccattctaattttaacttct 27256516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9650978 - 9650795
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctac---aactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccatt 98  Q
    |||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  | || ||||||||| |||||| |    
T  9650978 caggataaaacaagtccagctgctgcaactgtacggttgactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacttttaa-tatggtactaagaccact 9650880  T
Q  99 cttt-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||| |||||||||||||     |||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9650879 cttttaatactgaaacca-----atatggtactatgaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatgatgttaccaccattctaa 9650795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Original strand, 19640449 - 19640561
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||     |||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19640449 acaccctcaaatatggtactaacaccactctttaatactaaaacca-----atatggtattgtgaacactctattatggtgctgagaccactaaaatatg 19640543  T
Q  170 gtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  19640544 gtgttaccaccattctaa 19640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Original strand, 23318140 - 23318257
Alignment:
Q  74 cctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgt 173  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||  ||| ||| |||| ||| ||||||||| |||    
T  23318140 cctccaatatggtactaagaccactctttaatactgaaaccactctaatatggcattgtgatcactctattatagtgatgaggccattcaaatatgatgt 23318239  T
Q  174 tgccaccattctaacttt 191  Q
    |  |||||||||||||||    
T  23318240 tatcaccattctaacttt 23318257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 8076134 - 8076308
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||     |||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  8076134 caggataaaacaagctcagctgcaactgtgcgattaactactg-----tagaaaactgttcgaga-ttacaccttcaa-tatggtactaagaccactctt 8076226  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||  ||||||||     |||||||| | | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8076227 ttaatgttgaaacca-----atatggtactatgaccactctattacggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccgttctaa 8076308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23246944 - 23246861
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg 85  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||    
T  23246944 caggataaaacaagctcacctacaactgtgcgattaactactgttttatagaaaaccgttccaaaattacaccctcaaatatgg 23246861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 9008247 - 9008324
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaa 79  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  9008247 caggataaaacaagtccaactacaactgtgtgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccttcaa 9008324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6590995 - 6590787
Alignment:
Q  1 tcaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg-tactgagaccattc 99  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||| | ||||||||| || | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||    
T  6590995 tcaggataaaacaagttcagttataactgtgtgattaactactacattgtagaaaatcgtttgagaattacaccctcaaatatggctattaaggccactc 6590896  T
Q  100 ---tttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac-tttaatt 195  Q
       |||||||||||||||| | | |||||||| | | |||| |||  ||||||    |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||    
T  6590895 gaatttaatactgaaaccattattatatggtactataaccattctattatggtaccaagaccattcaaatatggtgtttcgactattctgacttttaatt 6590796  T
Q  196 tcttcaaaa 204  Q
    ||| |||||    
T  6590795 tctccaaaa 6590787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 16372505 - 16372666
Alignment:
Q  30 tgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg-tactgagaccattc---tttaatactgaaaccactttaatatg 125  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||| || | || ||| ||   |||||||||||||||||| | |||||    
T  16372505 tgcgattaactacttcactgtagaaaatcgtttgagaattaaaccatcaaatatggctattaaggccactcgaatttaatactgaaaccactattatatg 16372604  T
Q  126 gtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||| |||   || |||  ||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  16372605 gtactgtggtcattctactatggtactgagaccactcaaatatgcttttaccaccattctaa 16372666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Original strand, 15642368 - 15642482
Alignment:
Q  109 gaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa-ctttaatttcttcaaaacat 207  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  15642368 gaaaccactcaaatatggtactgtgaccactctcttatggtgctaagaccattcagatatggtattatcaccattctaacctttaagttctccaaaatat 15642467  T
Q  208 caatatggcactacg 222  Q
    ||| |||| ||||||    
T  15642468 caagatggtactacg 15642482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3356959 - 3356887
Alignment:
Q  150 gttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| || ||||||    
T  3356959 gttgagaccactcaaatatggtgttatcacaattctaactgtaagttctccaaactatcaatacggtactacg 3356887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 187
Target Start/End: Original strand, 9008377 - 9008419
Alignment:
Q  145 atggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9008377 atggtgttgggaccactcaaatatggtgctaccaccattctaa 9008419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 188
Target Start/End: Original strand, 10498380 - 10498413
Alignment:
Q  155 gaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10498380 gaccactcaaatatggtgttaccaccattctaac 10498413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 188
Target Start/End: Original strand, 10503409 - 10503442
Alignment:
Q  155 gaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10503409 gaccactcaaatatggtgttaccaccattctaac 10503442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Original strand, 15642318 - 15642371
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaa 55  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  15642318 caggacaaaacaggctcagctacaacggcacggttaactactgcactatagaaa 15642371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 47244332 - 47244544
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  47244332 caggataaaacaagcacaactacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattaaacccccaaatatggtactaagaccactctt 47244431  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47244432 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 47244531  T
Q  202 aaacatcaatatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  47244532 aaacatcaatatg 47244544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 19102061 - 19102275
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19102061 caggataaaacaagtccaactacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 19102160  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19102161 taatactaaaaccattttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatgatgttgccaccattctaactttaatttctcca 19102260  T
Q  202 aaacatcaatatggc 216  Q
    |||||||||||||||    
T  19102261 aaacatcaatatggc 19102275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37259888 - 37259669
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37259888 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 37259789  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  37259788 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctcca 37259689  T
Q  202 aaacatcaatatggcactac 221  Q
    ||  |||||||||| |||||    
T  37259688 aactatcaatatggtactac 37259669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37264575 - 37264356
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37264575 caggataaaacaagcccagctacaattgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 37264476  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  37264475 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctcca 37264376  T
Q  202 aaacatcaatatggcactac 221  Q
    ||  |||||||||| |||||    
T  37264375 aactatcaatatggtactac 37264356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31729398 - 31729182
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31729398 caggataaaacaagtccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 31729299  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31729298 taatactgaaaccac----ctatggtattgtaaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgcaaccattctaactttaatttctcca 31729203  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  31729202 aaacttcaatatggcactacg 31729182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 16421113 - 16421333
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  16421113 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgtccgagatttacaccttcgaatatggtactaagaccactctt 16421212  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16421213 taatattgaaaccactttaatattgtattgttatcactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttctcca 16421312  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  16421313 aagtatcaatatggcactacg 16421333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 19106720 - 19106912
Alignment:
Q  30 tgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtat 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19106720 tgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtattaagatcactctttaatacagaaaccattttaatatggtat 19106819  T
Q  130 tgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19106820 tgttaccactctgttatggtgttgagaacactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctccaaaacatcaatatggcactacg 19106912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 13059498 - 13059713
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  13059498 ataaaacaagctcagctacaactgtgtggttaactactgcattgtagaaaaccgttcgaga-ttacaccttcaaatatggttctaagaccactctttaat 13059596  T
Q  106 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac 205  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      
T  13059597 attgaaaccactttaatatggtattgttaccactctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgttgtcaccattctaactttaatttctccaaagt 13059696  T
Q  206 atcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  13059697 atcaatatggcactacg 13059713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 51698001 - 51698220
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  51698001 caggataaaacaagctcaactacaattgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagatcactctt 51698099  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  51698100 taatattgaaactactttaatatggtattgtcaccactctgttagggtgttgagaccactcaaatatggttttaccaccatcctaactttaatttctcca 51698199  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  51698200 aaacatcaatatgacactacg 51698220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 31273605 - 31273817
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31273605 caggataaaacaagcccagctacaactgtgtggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 31273704  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||| ||    
T  31273705 taatactgaaaccactttaatatggtattgtaaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtg--------attctaactttaagttctcca 31273796  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  31273797 aactatcaatatggtactacg 31273817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 8693796 - 8694015
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  8693796 aggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactcttt 8693895  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||    
T  8693896 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggttctgagaccactcaaatatggtgttaataccattctaactttaagttctccaa 8693995  T
Q  203 aacatcaatatggcactacg 222  Q
    |  |||||||||| ||||||    
T  8693996 actatcaatatggtactacg 8694015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Original strand, 31269118 - 31269288
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31269118 caggataaaacaagtccagctacaaccgtgtggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 31269217  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31269218 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtg 31269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12823884 - 12823692
Alignment:
Q  30 tgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtat 129  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12823884 tgcggctaactactgcactgtagaaaaccgttcgagatttacaccttcgaatatggtactaagaccactctttaatactgaaaccactttaaaatggtat 12823785  T
Q  130 tgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  12823784 tgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttctccaaaatatcaatatgacactacg 12823692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 55251803 - 55251984
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  55251803 caggataaaacaagcccaactacaactgtacggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagatttacacctttgaatatggtactaagaccactctt 55251902  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55251903 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccatt 55251984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19541171 - 19540959
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  19541171 aggataaaacaagtccagctacaacagttcgattaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactcttt 19541072  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaa 202  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  19541071 aatattgaaaccactttaatatgatattgttaccactctgctatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaacactattctaactttaagttctccaa 19540972  T
Q  203 aacatcaatatgg 215  Q
    |  ||||||||||    
T  19540971 actatcaatatgg 19540959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5928230 - 5928029
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  5928230 caggataaaacaagcccagctgcaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcaagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 5928131  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| || ||||    
T  5928130 taatacttaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccgttctaattttaagtttttca 5928031  T
Q  202 aa 203  Q
    ||    
T  5928030 aa 5928029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5271430 - 5271214
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  | || |||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||    
T  5271430 caggataaaacaagtccaactacaactgtttgattcactattgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtgctaagaccactctt 5271331  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5271330 taatactgaaaccac----ctatggtattgtaaccactctgttatggtgttcagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 5271235  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  5271234 aaacttcaatatggcactacg 5271214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48276660 - 48276475
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  48276660 caggataaaacaagttcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccattcgagaattacacc-tccaatatggtaccaagaccattctt 48276562  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48276561 ttaatactgaaaccactttaatatggtactgttaccactctattatggtgttgagaccactcgaatatggtgttaccaccattctaa 48276475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8030487 - 8030302
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| || |||||| |||  ||| |||||||    
T  8030487 caggataaaacaagcccagctacaaatgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgaaaattacacc-tccaatatgataccaagatcattctt 8030389  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8030388 ttaatactaaaaccattttaatatggtactgttaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 8030302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33463367 - 33463182
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||    
T  33463367 caggataaaacaagcacaactacaactgttcgattaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtaccaaaaccattctt 33463269  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33463268 ttaatactgaaaccactttaatattgtactattacaactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 33463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13065766 - 13065608
Alignment:
Q  63 gagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactc 162  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||| ||| || ||||    
T  13065766 gagatttacaccctcaaatatggtactaaaaccactctttaataccgaaaccactttaatatgttattgttatcagtctgttatagtgctgatactactc 13065667  T
Q  163 aaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  13065666 aaatatggtgttaccaccattctaactttaagttc-tcaaaatatcaatataacactacg 13065608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Original strand, 15134284 - 15134455
Alignment:
Q  50 tagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggt 149  Q
    |||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||  ||||||    
T  15134284 tagaaaactgttcgagatttatacccttaaatatggtactaaggctattctttaatactaaaaccactctaatatcgtattgtgactactctattatggt 15134383  T
Q  150 gttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac-tttaatttcttcaaaacatcaatatggcacta 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  15134384 gttaagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaacatttaagttctccaaaatatcaatatgccacta 15134455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33468981 - 33468799
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-a 103  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||| |  ||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| |    
T  33468981 gataaaacaagctcagctacaattgttcgattaactactgcactgttgaataaggtttgagaattacacc-tccaatatggtaccaagaccattctttta 33468883  T
Q  104 atactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  33468882 atactgaaaccactttaatatggtactattacaactctattatgatgttgagaccactcaaatttggtgttaccatcattctaa 33468799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 40408284 - 40408498
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttag--agaattacaccctcaaatatggtactgagaccattct 100  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||    ||| |||||  || |||||||||||| |||||| | |    
T  40408284 aggataaaacaagttcaactacaattgtgtggttaattactgtactgtagaaaaccgttctcaagatttacattcttaaatatggtactaagaccacttt 40408383  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctg-gtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctt 199  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||     
T  40408384 ttaatattgaaatcactttaatatggtattgttagcactctgtttatggtgctgggaccactcaaatatggtgccaccaccattctaactttaagttctc 40408483  T
Q  200 caaaacatcaatatg 214  Q
    ||||| |||||||||    
T  40408484 caaaatatcaatatg 40408498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 19906335 - 19906519
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||  | | ||||||||| || |||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  19906335 caggataaaacaagctcaactacaactgtttgat-aactactgcgctttagaaaaccgttcgaaaattacacc-tccaatatggtaccaagaccattctt 19906432  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  19906433 ttaatacttaaaccactctaatatggtattgttaccactctattatggtgccgagatcactcaaatatggtgctatcaccattctaa 19906519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Original strand, 31766001 - 31766114
Alignment:
Q  109 gaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||  |||    
T  31766001 gaaaccactttaatatggtattgttaccactctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaataccattctaactttaagttctccaaactatc 31766100  T
Q  209 aatatggcactacg 222  Q
    ||||||| ||||||    
T  31766101 aatatggtactacg 31766114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32082024 - 32081923
Alignment:
Q  121 atatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcacta 220  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  32082024 atatggtattgttaccgctctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttctccaaagtatcaatatggcacta 32081925  T
Q  221 cg 222  Q
    ||    
T  32081924 cg 32081923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7903050 - 7902927
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7903050 acactctctaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacca-----atatggtattgttaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatg 7902956  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  7902955 gtgttaccaccattctaattttaacttct 7902927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8649641 - 8649469
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||| || |    
T  8649641 caggataaaacaagcctaactacaactgtgcggttaactactacactgtagaaaactgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaacaccactctt 8649543  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccac 179  Q
    ||||||||||||||     ||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||| | | |||||||||| ||||    
T  8649542 ttaatactgaaacc-----aatatggtactgtgaccactctattatgatgttgagaccatttagatatggtgttaccac 8649469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8661448 - 8661276
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||| || |    
T  8661448 caggataaaacaagcctaactacaactgtgcggttaactactacactgtagaaaactgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaacaccactctt 8661350  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccac 179  Q
    ||||||||||||||     ||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||| | | |||||||||| ||||    
T  8661349 ttaatactgaaacc-----aatatggtactgtgaccactctattatgatgttgagaccatttagatatggtgttaccac 8661276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13522003 - 13521820
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctac---aactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccatt 98  Q
    |||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  | || ||||||||| |||||| |    
T  13522003 caggataaaacaagtccagctgctgcaactgtacggttgactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacttttaa-tatggtactaagaccact 13521905  T
Q  99 cttt-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||| |||||||||||||     |||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13521904 cttttaatactgaaacca-----atatggtactatgaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatgttgttaccaccattctaa 13521820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 198
Target Start/End: Original strand, 34560588 - 34560700
Alignment:
Q  81 tatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccacc 180  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34560588 tatggtactaagaccactctttaatattgaaacca-----atatggtattgttaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccacc 34560682  T
Q  181 attctaactttaatttct 198  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  34560683 attctaattttaacttct 34560700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3998001 - 3997878
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3998001 acaccctataatatggtactaaaaccattctttaatactgaaacca-----atatggtattgctaccattttattatggtgttgagaccactcaaatatg 3997907  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  3997906 gtgttaccaccattctaattttaacttct 3997878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 12878327 - 12878503
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-aa 104  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  12878327 ataaaacaagttcagctacaactgtgttgttaattactgcacg-tagaaaaccgttcgagaattacacc-tccaatatgatactaagaccactcttttaa 12878424  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccatt 183  Q
    |  |||||| ||| || |||||||  || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12878425 tgttgaaacgactctagtatggtacggtgaccactcagttatggtgttgagaacactcaaatatggtgttaccaccatt 12878503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 4551081 - 4551203
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  4551081 caggataaaacaaactcaattacaactctgcgattaactactgcactgtagaaaaccgtttaagatttacaccatcaaatatggtactaagaccattct- 4551179  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggta 128  Q
       ||||||||||||| ||||||||||    
T  4551180 ---tactgaaaccactctaatatggta 4551203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31298332 - 31298220
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||     |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31298332 acaccatcaaatatggtactataaccactctttaatattgaaacca-----atatggtattgtgaccactctactatggtgttgagaccactcaaatatg 31298238  T
Q  170 gtgttgccaccattctaa 187  Q
    || || ||||||||||||    
T  31298237 gttttaccaccattctaa 31298220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 221
Target Start/End: Original strand, 6942987 - 6943071
Alignment:
Q  137 actctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac-atcaatatggcactac 221  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  6942987 actctgttatggtgctgagactactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttc-tcaaaactatcaatatggtactac 6943071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Original strand, 47574709 - 47574781
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacacc 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  47574709 caggataaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactactgccatgtagaaaactgttcgagaattacacc 47574781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42758745 - 42758683
Alignment:
Q  23 acaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42758745 acaactgtgcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatgg 42758683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 187
Target Start/End: Original strand, 47574817 - 47574921
Alignment:
Q  79 aatatggtactgagaccattcttt-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgcc 177  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||     |||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47574817 aatatggtactatgaccactcttttaatactgaaacca-----atatggtactatgaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttacc 47574911  T
Q  178 accattctaa 187  Q
    ||||||||||    
T  47574912 accattctaa 47574921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 12874623 - 12874746
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||| | || ||||||||| | ||||||  | |    
T  12874623 caggataaaacaagctcagctaaaattgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttaatgaattaca-cttccaatatggtagtaagaccaccctt 12874721  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatg 125  Q
    |||||||||||| || | |||||||    
T  12874722 ttaatactgaaatcattctaatatg 12874746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 198
Target Start/End: Original strand, 39319730 - 39319848
Alignment:
Q  75 ctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgtt 174  Q
    |||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||     |||| ||||||| |||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39319730 ctcagatatggtactaagatcactcttcaatactgaaacca-----atatagtattgtgaccattctattatggtgctgagaacactcaaatatggtgtt 39319824  T
Q  175 gccaccattctaactttaatttct 198  Q
     |||||||| ||| ||||| ||||    
T  39319825 accaccattttaattttaacttct 39319848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 32082102 - 32082017
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggta 87  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||| ||||||| ||  ||||||||    
T  32082102 caggataaaacaagctcagttacaattgtgcggttaactactgcagtgtagaaaaccattcgagatttacaccttcggatatggta 32082017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39217280 - 39217201
Alignment:
Q  144 tatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattct-aactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39217280 tatggtattgagaccactcaaatatggtgtttcgatcattctgaattttaacttctccaaaatatcaatatggtactacg 39217201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Original strand, 2819928 - 2820010
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatg 84  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  2819928 caggataaaacaagtttagctacaactatgcaattaactgttgcactatagaaaatcgttcgagatttacaccctcaaatatg 2820010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Original strand, 41816935 - 41817044
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||     || |||| || ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||    
T  41816935 acaccctctaatatggtactaagaccactctttaatgttgaaacca-----atgtggtgttattaccactctattatggtgttgagaccattaaaatatg 41817029  T
Q  170 gtgttgccaccattc 184  Q
     |||| ||| |||||    
T  41817030 atgttaccatcattc 41817044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Original strand, 9362416 - 9362465
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatag 52  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9362416 aggataaaataagtccagctaaaactgtgcgattaactactgcactatag 9362465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 219
Target Start/End: Original strand, 23093293 - 23093403
Alignment:
Q  110 aaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa-ctttaatttcttcaaaacatc 208  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||   ||||| |||||  || |||||||| |||||| ||||  |||| |||    
T  23093293 aaactactttaatatggtattgtaaccactctattatggtgctaagaccaccagaatatagtgttatcatcattctaacctttaagttctctaaaatatc 23093392  T
Q  209 aatatggcact 219  Q
    |||||| ||||    
T  23093393 aatatgacact 23093403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 55810213 - 55810140
Alignment:
Q  79 aatatggtactgagaccattcttt-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgtt 152  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  55810213 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca-tttaagatagtattgttaccacactcttatggtgtt 55810140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25497336 - 25497117
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  25497336 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatgatactaagaccactctt 25497238  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25497237 taatattgaaaccactttaatatggtattattaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttctcca 25497138  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25497137 aaacatcaatatggcactacg 25497117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 12797009 - 12797229
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12797009 caggataaaacaagtccggctacaactgtgcggttaactactgcaccgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 12797108  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  12797109 taatactgaaaccaccttaatatggtattgtaaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtattgccaccattctaatattaatttctcca 12797208  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12797209 aaacatcaatatggcactacg 12797229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25478304 - 25478089
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  25478304 ataaaacaagcccagctacaactgtgcgaataacta-tgcactgtagaaaaccgttcaagaattacaccctcaaatatagtactaagaccactctttaat 25478206  T
Q  106 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25478205 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagactactcaaatatgatgttaccaccattctaactttaatttctccaaaac 25478106  T
Q  206 atcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  25478105 atcaatatggcactacg 25478089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9189814 - 9189598
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9189814 caggataaaacaagcccagctacaactgtttgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 9189715  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9189714 taatactgaaaccac----ctatggtattgtaaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 9189619  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9189618 aaacatcaatatggcactacg 9189598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9180735 - 9180519
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9180735 caggataaaacaagcccagctacaactgtttgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 9180636  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9180635 taatactgaaaccac----ctatggtattgtaaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 9180540  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  9180539 aaacatcaatatagcactacg 9180519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1935004 - 1934784
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1935004 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactaatgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 1934905  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  1934904 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttaaggttctgagaccactcaaatatggtgttcataccattctaactttaagttctcca 1934805  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  1934804 aactatcaatatggtactacg 1934784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 31326823 - 31327053
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  31326823 caggataaaacaagcccaactacaactgtgcgattaactactgcact-tagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactatt 31326921  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttg-----------agaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31326922 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctattatggtgttgccaccgttctacaaccactcaaatatggtgttgtcaccattctaactt 31327021  T
Q  191 taatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31327022 taatttctccaaaacatcaatatggcactacg 31327053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 29677851 - 29678036
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  29677851 caggataaaaaaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacccacaaatatggtactaagaccactctt 29677950  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29677951 taatattgataccactttaatatggtactgttaccactctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 29678036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19892477 - 19892276
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  19892477 caggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 19892378  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  19892377 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctaagaccactcaaatatggtgttaataccattctaactttaaattctcca 19892278  T
Q  202 aa 203  Q
    ||    
T  19892277 aa 19892276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 28603393 - 28603607
Alignment:
Q  8 aaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatac 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||||     
T  28603393 aaaacaagttcagctacaactgttcgattaactactgcactgtaaaaaaccgttcaagaattacacctccaaatatggtactaagaccactttttaatat 28603492  T
Q  108 tgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||  ||    
T  28603493 tgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgatgagaccacttaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctccaaactat 28603592  T
Q  208 caatatggcactacg 222  Q
     ||||||| ||||||    
T  28603593 taatatggtactacg 28603607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 30651016 - 30651197
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30651016 gataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcaccgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctttaa 30651115  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30651116 tactgaaaccactttaatatggcactgttaccactct-atatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 30651197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 18344515 - 18344726
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | ||    
T  18344515 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactatt 18344614  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  18344615 taatactgaaaccac---------atattgttaccactctgttatggcgctgagaccactcaaatatggtgttaataccattctaactttaagttctcca 18344705  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  18344706 aactatcaatatggtactacg 18344726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17545308 - 17545097
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||   || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  17545308 aggataaaacaagcacatctacaacagtgcggttaactaacgcattgtagaaaatcattcgagatttacaccctcaaatatgatactaagaccactcttt 17545209  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaa 202  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||    
T  17545208 aatacggaaaccactttaatct-atattgttaccactttgttatggtgctgagaccactaaaatatggtgttaccaccattctaactttaagttctctaa 17545110  T
Q  203 aacatcaatatgg 215  Q
    |  ||||||||||    
T  17545109 actatcaatatgg 17545097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40847604 - 40847409
Alignment:
Q  4 ggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggt-actgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  40847604 ggataaaacaagtccaactacaactgtgtggttaactact-----atagaaaaccgttcgagatttacactctcaaatatggttaccaagaccactcttt 40847510  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaa 202  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  40847509 aatattgaaaccactttaatatgatattgttaccactttgtaatggtgttgagaccactcaaatatgatgttacgtccattctaactttaagttctccaa 40847410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7737862 - 7737677
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||  | |||||||||    
T  7737862 caggataaaacaagcccaactacaattgttcgattaactattgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc-tccaatatgataccaaaaccattctt 7737764  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  7737763 ttaatactgaaatcactttaatatgatattgtcaccactctattatggtgttgagaccactcaaacatggtgttaccaccatgctaa 7737677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 35602006 - 35602186
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||    
T  35602006 caggataaaacaaacccagctacaattgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacatccaaatatggtactaagaccactctt 35602105  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| |||||||     ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  35602106 taatattgaaacc-----aatatggtactatgaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaaaattctaa 35602186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10160735 - 10160556
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |    
T  10160735 caggataaaacaagctcagctgcaactgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccattctt 10160638  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||     | ||||||||| | | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10160637 ttaatactgaaa-----tcaatatggtactatgaccactctattttggtgttgagaccactcaaatatggtattaccaccattctaa 10160556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17453564 - 17453413
Alignment:
Q  28 tgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||     |||||||||    
T  17453564 tgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccattctataat--tgaaac-----taatatggt 17453473  T
Q  128 attgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  17453472 attgtaaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttatcatcattctaa 17453413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 29677465 - 29677552
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtact 89  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29677465 caggataaaataagtccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtact 29677552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Original strand, 30658347 - 30658460
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagacca-ttct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| | || |    
T  30658347 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagacaactttt 30658445  T
Q  101 ttaatactgaaacca 115  Q
    |||||||||||||||    
T  30658446 ttaatactgaaacca 30658460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6297830 - 6297707
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  6297830 acaccctctaatatgttactaagaccattctttaatactgaaacca-----atatggtattgttaccattctattatgttgttgagaccactcaaatatg 6297736  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
     |||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  6297735 atgttaccaccattctaattttaacttct 6297707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21523726 - 21523571
Alignment:
Q  7 taaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaata 106  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  21523726 taaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactg-----tagaaaatcgttcgagatttacaccctcaaatatggtactaagaccactctttaaaa 21523632  T
Q  107 ctgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggt 171  Q
    || |||| ||||||||||||||     ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21523631 cttaaactactttaatatggta----caccactctattatcgtgttaagaccactcaaatatggt 21523571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19094499 - 19094315
Alignment:
Q  8 aaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg-tactgagaccattc---ttta 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||   ||||    
T  19094499 aaaacaagctcagctacaactgtgcgattaattactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggctattaaggccactccaattta 19094400  T
Q  104 atactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    |||||||||||| | | |||||||| | | |||| ||   ||||||   ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19094399 atactgaaaccattattatatggtactatgaccattc---tatggtaacgagaccatttaaatatgatgttaccaccattctaacttt 19094315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Original strand, 28855156 - 28855295
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||     |||||||||||| |||| |||  ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  28855156 acaccctcagatatggtactaagatcactctt-aatactgaaacca-----atatggtattgtgaccattctactatggtgctgcaaccactcaaatatg 28855249  T
Q  170 gtgttgccaccattctaacttt-aatttcttcaaaacatcaatatgg 215  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||    
T  28855250 gtgttaccaccattctaattttgaacttc-tcaaaatatcaatatgg 28855295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19578425 - 19578300
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||  ||| |||| ||||||| || ||||||||| | | | || ||||    
T  19578425 cagggtaaaacaagtccaactacaattgggcggttaactattgcactgtagaaaatcgttcgagatttacaccttc-aatatggtattaaaatcactctt 19578327  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggta 128  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  19578326 taatactaaaatcactctaatatggta 19578300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Original strand, 30631663 - 30631780
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaac---tgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaa-ttacaccctcaaatatggtactgagaccat 97  Q
    |||||||||||||||||| || ||||   |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |     
T  30631663 caggataaaacaagcccaactgcaactgttgtgcggttatctactgcactgtagaaaaccgttcgagaatttacaccttc-aatatggtactaagacaac 30631761  T
Q  98 tc-tttaatactgaaacca 115  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  30631762 tcttttaatattgaaacca 30631780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 188
Target Start/End: Original strand, 30643409 - 30643453
Alignment:
Q  144 tatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30643409 tatggtgttgagaccactcaaatatgatgttaccaccattctaac 30643453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 35639008 - 35638957
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactataga 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  35639008 caggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtaga 35638957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 42926770 - 42926715
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaac 57  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42926770 caggataatacaagctcaactacaactgtgcggttaactactgcaccgtagaaaac 42926715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Original strand, 19538536 - 19538648
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||| ||| ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||     ||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| | ||||    
T  19538536 acactctctaatatggtattaagatcactctttaatactgaaacc-----aatatggtaatgtgaccactctattatggtgctaagaccactctattatg 19538630  T
Q  170 gtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  19538631 gtgttactaccattctaa 19538648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Original strand, 32079479 - 32079546
Alignment:
Q  18 cagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg 85  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||  ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32079479 cagctacaactgtgcgattaactattgcattatagctaatcgttcgagaattacacccttaaatatgg 32079546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 166
Target Start/End: Original strand, 38591447 - 38591515
Alignment:
Q  100 tttaatactgaaaccactttaatat--ggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaat 166  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  38591447 tttaatactaaaaccactctaatatatggtattgtgaccactttattatggtattgagaccactcaaat 38591515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 188
Target Start/End: Original strand, 30629076 - 30629120
Alignment:
Q  144 tatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30629076 tatggtattgtgaccactcaaatatggtgttaccaccattgtaac 30629120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2207757 - 2207540
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2207757 gataaaacaagcccatctacaattgtgcggttaactactgtactgtagaaaacccttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctttaa 2207658  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2207657 tactgaaaccacttttatatggtattgttaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccgttctaactttaatttcttcaaaa 2207558  T
Q  205 catcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2207557 catcaatatggcactacg 2207540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 758379 - 758159
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  758379 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 758280  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  758279 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctcca 758180  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  758179 aactatcaatatggtactacg 758159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 55431397 - 55431617
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  55431397 caggataaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaactgttcgagaattgcaccctcaaatatggtactaagaccactctt 55431496  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  55431497 tgatacttaaaccaccttaatatggcattgttatcactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgtcaccattctaactttaatttctcca 55431596  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  55431597 aaacatcaatatgacactacg 55431617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 29350322 - 29350542
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29350322 caggataaaacaagctcaactacaactgtgtggttaattactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 29350421  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29350422 taatactaaaatcactttaatatgatattgttaccactctgttatagtgttgagagcactcaaatatggtgttgccaccattctaattttaatttctcca 29350521  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29350522 aaacatcaatatggcactacg 29350542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23661475 - 23661255
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23661475 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactaatgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 23661376  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  23661375 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttaaggtgctgagaccactcaaatatggtgttcataccattctaactttaagttctcca 23661276  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  23661275 aactatcaatatggtactacg 23661255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23666134 - 23665914
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23666134 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactaatgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 23666035  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  23666034 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttaaggtgctgagaccactcaaatatggtgttcataccattctaactttaagttctcca 23665935  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  23665934 aactatcaatatggtactacg 23665914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24038382 - 24038162
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24038382 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactaatgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 24038283  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  24038282 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttaaggtgctgagaccactcaaatatggtgttcataccattctaactttaagttctcca 24038183  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  24038182 aactatcaatatggtactacg 24038162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14438706 - 14438490
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14438706 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 14438607  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| |||||||||     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14438606 taatattgaaaccac----ctatggtattgtaaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggttttgctaccattctaactttaatttctcca 14438511  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  14438510 aaacttcaatatggcactacg 14438490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 20520139 - 20520356
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  20520139 gataaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactactgtactgtagaaaactgttcgagatttacaccttcaaatatagtactaagaccactctttaa 20520238  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20520239 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgaaaccactaaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttctccaaag 20520338  T
Q  205 catcaatatggcactacg 222  Q
     |||||||| ||||||||    
T  20520339 tatcaatattgcactacg 20520356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 55325858 - 55326078
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaaca-gttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||    
T  55325858 caggataaaacaagcccagttacaactgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaacccgatcgagaattacacccttaaatacggtactaagaccactct 55325956  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  55325957 ttaatactgaaaccactttaatatgatattgttatcattctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttttcc 55326056  T
Q  201 aaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55326057 aaaacatcaatatggcactacg 55326078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7571229 - 7571009
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||    
T  7571229 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccacgctt 7571130  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||| ||    
T  7571129 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaataccattataactttaagttctcca 7571030  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  7571029 aactatcaatatggtactacg 7571009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 27709018 - 27709234
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  27709018 caggataaaacaagcccagcttcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagatcactctt 27709117  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
     ||||||||||||||     ||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27709118 caatactgaaaccac----ctatagtattgtaaccactctattatggtgttgcgaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttctcca 27709213  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27709214 aaacatcaatatggcactacg 27709234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3657248 - 3657031
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  3657248 gataaaacaagtccagctacaactgttagattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacccttaaatatggtactaagaccactctttaa 3657149  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3657148 tgctgaaaccactttaatatgatattgttaccactctgttacggtgctgagaccaatcaaatatgatgttaccaccattctaactttaatttctccaaaa 3657049  T
Q  205 catcaatatggcactacg 222  Q
     |||||||||||||||||    
T  3657048 tatcaatatggcactacg 3657031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 46964098 - 46964291
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  46964098 aggataaaacaaactcagatacaactatgtggttaactattgcactatagaaaaccgttcgagatttacaccctcaaatatggtattaagaccactcttt 46964197  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaattt 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46964198 aatactgaaaccactttgatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaattt 46964291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 18472089 - 18472309
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  18472089 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcattgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 18472188  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||| ||    
T  18472189 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactttgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaatatcattctaactttaagttctcca 18472288  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  18472289 aactatcaatatggtactacg 18472309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 3419076 - 3419291
Alignment:
Q  1 tcaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattct 100  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  3419076 tcaggataaaacaagctcaactgcaactgtgcggttaactattgcatcgtagaaaaccgtttgagatttacaccctcaaatatggtactaagaccactc- 3419174  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3419175 ttaatactgaaaccactttaatattgtattgttaccgctctgttatggcgctgtgaccactc-aatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcc 3419273  T
Q  201 aaaacatcaatatggcac 218  Q
    |||| |||||||||||||    
T  3419274 aaaatatcaatatggcac 3419291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 18467307 - 18467527
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||    
T  18467307 caggataaaacaagtccaactacaattgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacttccaaatatggtactaagaccactctt 18467406  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  18467407 taatactgaaaccattttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaataccattctaactttaagttctcca 18467506  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  18467507 aactatcaatatggtactacg 18467527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39775739 - 39775519
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||    
T  39775739 caggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgaaaattacacctccaaatatggtactaagacaactctt 39775640  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  39775639 tactactgaaaccactttaatatggtattgttactactctgttatgatgctgagaccactcaaatatggtgttaataccattctaactttaagttctcca 39775540  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  39775539 aactatcaatatggtactacg 39775519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32474691 - 32474518
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactga-gaccattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||   |||||||||||| | ||||| |||    
T  32474691 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattatacctctaaatatggtactaaagaccactct 32474592  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgtt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32474591 ttaatactgaaaccactttaatatgatattgttaccactctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgtt 32474518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 3672668 - 3672848
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  3672668 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccaatctt 3672766  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3672767 ttaatactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatgatgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 3672848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 3692700 - 3692880
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  3692700 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccaatctt 3692798  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3692799 ttaatactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatgatgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 3692880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 8069761 - 8069941
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  8069761 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagataaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccaatctt 8069859  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||| |||||||||     ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8069860 ttaacactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 8069941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 8883252 - 8883432
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagacc-attct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||  |    
T  8883252 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtacaaagaccaatatt 8883350  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8883351 ttaatactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 8883432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25726792 - 25726581
Alignment:
Q  9 aaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatact 108  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  25726792 aaacaagtgcagttacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagatttaca-cctccaatatggtactaagaccactcttaaatact 25726694  T
Q  109 gaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa-ctttaatttcttcaaaacat 207  Q
    |||| || | |||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  25726693 gaaatcattctaatatggtattgtgaccactat--tatggtgttaagaccactcaaatatggtgttatcatcattctaacctttaagttctccaaaatat 25726596  T
Q  208 caatatggcactacg 222  Q
    |||||||| ||||||    
T  25726595 caatatggtactacg 25726581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 8888012 - 8888192
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  8888012 caggataaaacaaatccagctgcaactgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtactaagaccaatctt 8888110  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||||||||||||     |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8888111 ttaatactgaaacca-----atatggtattgtaaccactcaattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 8888192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 49971435 - 49971287
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49971435 caggataaaacaagtccagctgcaactgtgcagttaactacttcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactgagaccactctt 49971336  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttga 154  Q
    ||||||||||||||||    |||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  49971335 taatactgaaaccact----tatgatattgtaaccactatgttatggtgttga 49971287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 3033727 - 3033906
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-tt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| || || ||    
T  3033727 aggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagatcaatcttt 3033825  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||||||||||||     ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3033826 taatactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatgatgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 3033906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12965884 - 12965699
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  12965884 caggataaaacaagtccaactacaattgttcgattaactaatgcactgtagaaaactgttcaagaattacacc-tccaatatggtaccaagaccattctt 12965786  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12965785 ttaatactgaaaccactttaatatggtaatattaccactctattatggaactgagacaactcaaatatggtgttaccaccattctaa 12965699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12971643 - 12971478
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||  |||| | |||||    
T  12971643 aggataaaacaagcccaactacaactgttcaattaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacacc-tccaatatggtaccaagactaatcttt 12971545  T
Q  103 -aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatat 168  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  12971544 taatactaaaaccactttaatatggtactgttaccactctattatggtgctgagaccactcaaatat 12971478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6596368 - 6596187
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  6596368 caggataaaacaagctcagctacaattatgtggttaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactctt 6596270  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    ||||||||||||||     ||||||||  ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6596269 ttaatactgaaacc-----aatatggtgctgtgaccactctattatggtgctgagaccactcaaatattgtgttaccaccattctaac 6596187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10708613 - 10708468
Alignment:
Q  80 atatggtactgagaccattcttt-aatactgaaaccactttaatatgg--tattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgc 176  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10708613 atatgggactaagaccattcttttaatactgaaaccactttaatatgtgatattgttaacactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttac 10708514  T
Q  177 caccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||    
T  10708513 caccattctaactttaagttctccgaactatcaatatggtactacg 10708468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10586127 - 10586004
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  10586127 acaccctctaatatggtactaagaccattctttaatactgaaacca-----atatggtattgttaccattctattttggtgttgagaccactcaaatatg 10586033  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  10586032 gtgttaccaccattctaattttaacttct 10586004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17026115 - 17025936
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || || |  |||| |||  |||||||| || | |||| |||||    
T  17026115 aggataaaacaagttcagctacaattgtgcgg-taactactgcacggtagaaaacaatttgacacataca-cctttaatatggtcctaataccactcttt 17026018  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattc 184  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  17026017 aatattgaaatcactctaatatggtgctgtgaccactctagtatggtgctaagaccacttaaatatggtgttatcaccattc 17025936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Original strand, 31002847 - 31002970
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| || |||||||     ||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  31002847 acaccctctaatatgttactaagaccactctttaacaccgaaacca-----atatgatattgttaccattctattatggtattgagaccactcaaatatg 31002941  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  31002942 gtgttaccaccattctaattttaacttct 31002970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45904437 - 45904359
Alignment:
Q  120 aatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  45904437 aatatggtattgttactattctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaattttaacttct 45904359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45904893 - 45904815
Alignment:
Q  120 aatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  45904893 aatatggtattgttaccatcctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaattttaacttct 45904815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 28125244 - 28125404
Alignment:
Q  21 ctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-aatactgaaaccacttt 119  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| | |||| | ||||| |||| ||||||     |    
T  28125244 ctacaattgtgcggtcaactactg-actgtagaaaacagttcgagtattacacc-tccaatatggtattaagacaactcttttaatattgaaac-----t 28125336  T
Q  120 aatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
     |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28125337 catatggtactgtgaccactctattatagtgttgaaaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 28125404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12112652 - 12112516
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || | |||||||| || |||| ||||||||  || |||| ||||| |||| |||||||| |  |||| |||| |    
T  12112652 caggataaaacaagctcaactacaaatgggtggttaactgctacactgtagaaaaccattcgagatttaca-cctccaatatggtgcaaagactattctt 12112554  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccac 138  Q
    |||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  12112553 ttaatacttaaaccactttaaaaatgtattattaccac 12112516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 29715727 - 29715772
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcact 48  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29715727 aggataaaacaagtccagctacagctgtgcggttaactattgcact 29715772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13156259 - 13156223
Alignment:
Q  155 gaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13156259 gaccactcaaatatggtgttaccaccattctaacttt 13156223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 187
Target Start/End: Original strand, 16013846 - 16013969
Alignment:
Q  63 gagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactc 162  Q
    |||||||||||| || ||||||||| | | |||||  ||||||| |||||||| |  | ||||||| | | ||||||||  |||||| ||| ||||| ||    
T  16013846 gagaattacacc-tccaatatggtagtaacaccatattttaatattgaaaccaatcaattatggtactatgaccactctattatggtattgtgaccattc 16013944  T
Q  163 aaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16013945 aaatatgatgttaccaccattctaa 16013969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 188
Target Start/End: Original strand, 35457635 - 35457668
Alignment:
Q  155 gaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35457635 gaccactcaaatatggtgttaccaccattctaac 35457668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13166999 - 13166963
Alignment:
Q  155 gaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13166999 gaccactcaaatatggtgttaccactattctaacttt 13166963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 25843844 - 25844060
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  25843844 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcatatatggtactaagaccactctttaat 25843943  T
Q  106 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25843944 actgaaaccaccttaatatggtattgttaccactctcttatggtgttgagaccactcaaatatgatgctgtcaccattctaactttaatttctccaaaac 25844043  T
Q  206 atcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  25844044 atcaatatggcactacg 25844060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19799024 - 19798804
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||    
T  19799024 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagatttacaccttcaaatatggcactaagaccactctt 19798925  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  19798924 taatactaaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagacaactcaaatatggtgttacccccattctaactttaatttctcca 19798825  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  19798824 aagtatcaatatggcactacg 19798804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 38620779 - 38620996
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||    
T  38620779 gataaaacaagtccaactacaactgtgcggttaactactgcattgtagaaaactgtttgagatttacaccctaaaatatggtattaagaccactctttaa 38620878  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38620879 tactgaaatcactttaatatggtatcgtcaccactctgttatgatgttaagaccactcaaatatggtgttttcaccattctaactttaatttctccaaaa 38620978  T
Q  205 catcaatatggcactacg 222  Q
     |||||||||||||||||    
T  38620979 tatcaatatggcactacg 38620996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 10140174 - 10140396
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacag-------ttagagaattacaccctcaaatatggtactgagacc 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10140174 aggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagacc 10140273  T
Q  96 attctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatt 195  Q
    ||||||||||| |||||||||     ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10140274 attctttaatattgaaaccac----ctatggtattgtaaccactttgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatt 10140369  T
Q  196 tcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||    
T  10140370 tctccaaaacttcaatatgccactacg 10140396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26927729 - 26927513
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26927729 ataaaacaagcccagctacaactgtacacttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctttaat 26927630  T
Q  106 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||      
T  26927629 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggcgctgagaccactcaaatatggtgttaataccattctaactttaagttctccaaact 26927530  T
Q  206 atcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26927529 atcaatatggtactacg 26927513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39588378 - 39588158
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  39588378 caggataaagcaagctcatctacaattgttcgattaactactgcagtgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactgagaccaatctt 39588279  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  39588278 taatactaaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctcca 39588179  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  39588178 aactatcaatatggtactacg 39588158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 40166065 - 40166284
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||  || ||||||||||| |||||| |||||    
T  40166065 aggataaaacaagcacaactacaactatacgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgaaatttacacattcgaatatggtactaagaccactcttt 40166164  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40166165 aatactgaaaccactttaatatgatattgttaccactctcttatggtattgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttctccaa 40166264  T
Q  203 aacatcaatatggcactacg 222  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  40166265 agtatcaatatggcactacg 40166284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33301191 - 33301010
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  33301191 caggataaaacaatttcatctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaactgttcgagaattacaccttcaaatatggtactaagaccactcgt 33301092  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccatt 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33301091 taatacttaaaccactttaatatgatattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccatt 33301010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Original strand, 8138023 - 8138191
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  8138023 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcaatgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccaccctt 8138122  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatgg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8138123 taatactgaaaccactttaatatgatactcttaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatgg 8138191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 51041471 - 51041283
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||| ||||| || |||  ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  51041471 gataaaacaagcccagctacaactgttcgattaattactgcactgtagaaaatcgttcgagaactatacctccaaatatggtactaagatcactctttaa 51041372  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaa 193  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  51041371 tattgaaaccactttaatatggaattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaatatcattctaactttaa 51041283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28434585 - 28434384
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||  ||| |||||||    
T  28434585 caggataaaacaagttcaactacaattgtgcagttaactactttactatagaaaaccgttcgagatttacacc-tccaatatggtacaaagatcattctt 28434487  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa-ctttaatttctt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  28434486 ttaatactgaaaccactttaatatggtactgttaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaacctttaacttctt 28434387  T
Q  200 caa 202  Q
    |||    
T  28434386 caa 28434384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 16833568 - 16833753
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  16833568 caggataaaacagcctcagctacaactgttcgattaactactgcattgtagaaaaccgttcgaaaattacacc-tccaatatggtaccaagaccattctt 16833666  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16833667 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccattctattttggtgttgaaaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 16833753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23192828 - 23192644
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  23192828 caggataaaacaagcc-agctacaattgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc-tccaatatggtaccaagaccattctt 23192731  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  23192730 ttaatactgaaaccactttaatatgatactgttaccactctattatggtgttgagaccactcgaatataatgttaccaccattctaa 23192644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 16035692 - 16035911
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattct- 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||| || ||||||||||  |||||||| |     
T  16035692 caggataaaacaagctcatctacaaatgtgtggttaactactgcactttagaaaaccattcgaga-ttacacc-tccaatatggtaccaagaccattatg 16035789  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttc 200  Q
    |||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |    
T  16035790 ttaatattaaaatgactttaatatggtattgttaccactctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgttatcaccattctaactttaagttctcc 16035889  T
Q  201 aaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||  |||||||||| ||||||    
T  16035890 aaactatcaatatggtactacg 16035911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47451233 - 47451025
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |  |  || |||||    
T  47451233 gataaaacaagctcaactacaactgttcgattaactactgtactgcagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaattctttt-tttaa 47451135  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| |||| ||||     
T  47451134 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatgacgctgagaccactcaaatatgatattaactccattctaactttaagttctccaaac 47451035  T
Q  205 catcaatatg 214  Q
     |||||||||    
T  47451034 tatcaatatg 47451025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16649622 - 16649510
Alignment:
Q  4 ggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttta 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  16649622 ggataaaacaagtccagctacaactgtgtggttaactactgcactgtagaaaactgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaataccactcttta 16649523  T
Q  104 atactgaaaccac 116  Q
    |||||||||||||    
T  16649522 atactgaaaccac 16649510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 3094186 - 3094352
Alignment:
Q  16 cccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-aatactgaaacc 114  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  3094186 cccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtattaagaccaatcttttaatactgaaacc 3094284  T
Q  115 actttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |     |||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3094285 a-----atatggtattgtaaccactcaattatgatgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 3094352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18784540 - 18784371
Alignment:
Q  30 tgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||      |||||||||    
T  18784540 tgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaac-----aaatatggta 18784447  T
Q  129 ttgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa-ctttaatttcttcaaa 203  Q
     |||  |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  18784446 ctgtagccactctattatggtattgagaccactcaaatctggtgttaccaccattctaatttttaacttcttcaaa 18784371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41097892 - 41097773
Alignment:
Q  74 cctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgt 173  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  41097892 cctctaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacca-----atatggtattgttaccattctattatggtgttgagaccacgcaaatatggtat 41097798  T
Q  174 tgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||    
T  41097797 taccaccattctaattttaacttct 41097773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Original strand, 10135541 - 10135623
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg 85  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  10135541 aggataaaacaagcccagttgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcaagaattacaccctcaaatatgg 10135623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 12260081 - 12260258
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||  |||      |||| |||||| ||||     
T  12260081 aggataaaacaaacacatgtacaactatgcggttaactactgcataatagaaaacaatttgaaaattacacctccaa------tactaagaccactctt- 12260173  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12260174 aatactgaaactattataatatggtattgtgaccactctattattgtgctgagaccactcaaatatggtgttaccatcattctaa 12260258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8267774 - 8267651
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||     |||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8267774 acaccctctaatatggtactaagaccactcttaaatactgaaacca-----atatggtattgtgatcactctattatggtgttgagaccactcaaatatg 8267680  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
     ||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  8267679 ttgttatcaccattctaattttaacttct 8267651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16649506 - 16649436
Alignment:
Q  144 tatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatg 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16649506 tatggtgttgaaaccactcaaatatggtgttaccacgattctaactttaatttctccaaaacatcaatatg 16649436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Original strand, 33055189 - 33055301
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||     |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33055189 acaccctctaatatggtactaatgccactctttaatactaaaac-----taatatggtattgtgaccactctactatggtgttgagaccactcaaatatg 33055283  T
Q  170 gtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||||  |||||||||||    
T  33055284 gtgttatcaccattctaa 33055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Original strand, 11806462 - 11806592
Alignment:
Q  21 ctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccacttta 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||| |||| ||||||  |||||||||| ||| ||| || ||||||||||| || | ||||||    
T  11806462 ctacaattgtgcggttaaatactgcagtgcagaaaatcgtttgagatttacactttcaaatatggcactaagatcactctttaatacttaagcaacttta 11806561  T
Q  121 atatggtattgttaccactctggtatggtgt 151  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11806562 atatggtattattaccactcttttatggtgt 11806592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25779268 - 25779155
Alignment:
Q  63 gagaattacaccctcaaatatgg-tactgagaccattc---tttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagacc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||  |||||| || ||| |    
T  25779268 gagaattacaccctcaaatatggcttttaagaccactcaaatttaatactgaaaccactataatatagtattatgaccactctattatggtattaagatc 25779169  T
Q  159 actcaaatatggtg 172  Q
    ||||||||||||||    
T  25779168 actcaaatatggtg 25779155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 47455397 - 47455353
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgca 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  47455397 caggataaaacaagcctagctacaactgttcgattaactactgca 47455353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40233229 - 40233186
Alignment:
Q  122 tatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaa 165  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  40233229 tatggtattgttaccattctattatggtgttgagaccactcaaa 40233186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39200603 - 39200557
Alignment:
Q  176 ccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  39200603 ccaccattctaactttaatttctccaaagtatcaatatggcattacg 39200557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 11806596 - 11806641
Alignment:
Q  177 caccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11806596 caccattataactttaagttctccaaaatatcaatatggcactacg 11806641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25779113 - 25779080
Alignment:
Q  155 gaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25779113 gaccactcaaatatggtgttaccaccattctaac 25779080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 443957 - 443737
Alignment:
Q  1 tcaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  443957 tcaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaacta-tgcactatagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactct 443859  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttc 200  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  443858 ttaatactgaaatcaccttaatatgatattgtaaccactctattatggtgttgagaccactaaaatatggtgtttccaccattctaactttaatttctcc 443759  T
Q  201 aaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  443758 aaaacatcaatatggcactacg 443737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 4158 - 4342
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  4158 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 4257  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4258 taatactgaaaccactttaatatggcactgttaccactct-atatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 4342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 191
Target Start/End: Original strand, 150729 - 150765
Alignment:
Q  155 gaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  150729 gaccactcaaatatggtgttaccaccattctaacttt 150765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 191
Target Start/End: Original strand, 139989 - 140025
Alignment:
Q  155 gaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  139989 gaccactcaaatatggtgttaccactattctaacttt 140025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11534722 - 11534504
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11534722 caggataaaacaagctcaactacaactgtgcggtgaactactgcattgtagaaaaccgttccagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 11534623  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11534622 taatattgaaaccactttaatatggtattgtaaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttagtttctcca 11534523  T
Q  202 aaacatcaatatggcacta 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11534522 aaacatcaatatggcacta 11534504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11560232 - 11560012
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11560232 caggataaaacaagctcaactacaactgtgcggtgaactactgcattgtagaaaaccgttccagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 11560133  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  11560132 taatattgaaaccactttaatatggtattgtaaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgtcaccattctaactttagtttctcca 11560033  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11560032 aaacatcaatatggcactacg 11560012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 12689055 - 12689273
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||    
T  12689055 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttcgacaattacaccctcaattatggtattaagacgactctt 12689154  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12689155 taatattgaaaccactttaatatcgtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 12689254  T
Q  202 aaacatcaatatggcacta 220  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  12689255 aaacatcaatatgacacta 12689273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11570760 - 11570548
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11570760 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcggtgaactactccgctgtagaaaaccgttccagaattataccctcaaatatggtactaagaccactctt 11570661  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11570660 taatactgaaaccactttaatatggtattgtaaccactctgttatggtgttaagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 11570561  T
Q  202 aaacatcaatatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  11570560 aaacatcaatatg 11570548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17964570 - 17964350
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  17964570 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaaatatggtactaagaccactctt 17964471  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  17964470 taatactgaaaccactttaatatgaaattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctcca 17964371  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  17964370 aactatcaatatggtactacg 17964350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16836167 - 16835951
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  16836167 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttagttactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcatatttggtactaagaccactctt 16836068  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16836067 taatactgaaaccac----ctatggtattgtaaccacactgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaacttctcca 16835972  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  16835971 aaacattaatatggcactacg 16835951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Original strand, 11428124 - 11428313
Alignment:
Q  33 ggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgt 132  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11428124 ggttaagtactgcactgtagaaaaccgttcgagatttacaccatcaaatatggtactaagactactctttaatactgaaaccactttaatatggtattgt 11428223  T
Q  133 taccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11428224 taccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttcatttctccaaaacatcaatatggcactacg 11428313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2700117 - 2699898
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||    
T  2700117 caggataaaacaagcccaactacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgtc-gagaattacacctccaaatatggtactaagatcactctt 2700019  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  2700018 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactatgttatggtgctgagaccactcaaatacggtgttgccaccattctaactttaatttttcta 2699919  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  2699918 aaatatcaatatgacactacg 2699898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6407871 - 6407652
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  6407871 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactact-cactgtagaaaaccgttcaagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 6407773  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || | ||    
T  6407772 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaataccattctaactttaagttttcca 6407673  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  ||||||| || ||||||    
T  6407672 aactatcaatacggtactacg 6407652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25314393 - 25314248
Alignment:
Q  77 caaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgc 176  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25314393 caaatatggtactaagaccactctttaatactgaaatcactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttac 25314294  T
Q  177 caccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25314293 caccattctaactttaatttctccaaaacatcaatatggcactacg 25314248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26201887 - 26201742
Alignment:
Q  77 caaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgc 176  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26201887 caaatatggtactaagaccactctttaatactgaaatcactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttac 26201788  T
Q  177 caccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26201787 caccattctaactttaatttctccaaaacatcaatatggcactacg 26201742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29892272 - 29892052
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||  || || | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  29892272 caggataaaacaagtccagctacaactgtgtggttaactattgcattgtagaaaacctttcgatatttacaccctcaaatatggtactaagatcactctt 29892173  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  29892172 taatactgaaatcgctttaatatggtattgttaccactctgttatggtactaagagcactcaaatatggtgttaccaccattctaaatttaatttctcca 29892073  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  29892072 aactatcaatatggtactacg 29892052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4157379 - 4157168
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| || | ||||||||| ||||||||| || | | || |||||    
T  4157379 aggataaaacaaactcagctacaacggtgcggttaactactgcactgtagaaaatcgttcgaaatttacacccttaaatatggtgctaatatcactcttt 4157280  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaa 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4157279 aatactgaaatcactttaatatgttattgttaccgctctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgtcaccaccattcaaactttaatttctccaa 4157180  T
Q  203 aacatcaatatg 214  Q
    ||||||||||||    
T  4157179 aacatcaatatg 4157168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19995412 - 19995194
Alignment:
Q  4 ggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||  || |||| |||||||||||||||| ||||| | | || | ||||    
T  19995412 ggataaaacaagcccagctacaactatgcggttaactactacaccgtagaaaacctttcgagatttacaccctcaaatatcgtactaaaaacactattta 19995313  T
Q  104 atactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  19995312 atactgaaaccactttaatatggtattgttaccactttgttatggttatgagacccctcaactacggtgttaccatcattctaactttaagttctccaaa 19995213  T
Q  204 acatcaatatggcactacg 222  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  19995212 atatcaatatggtactacg 19995194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12406361 - 12406144
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||| | | || | |||||    
T  12406361 gataaaacatgctcaactacaactgtgtggttaactactgcaccgtagaaaaccgtgagagatttataccctcaaatatgatactaaaatcactttttaa 12406262  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||     
T  12406261 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgataccactcaaatatgatgttaccactattttaactttaatttctccaaac 12406162  T
Q  205 catcaatatggcactacg 222  Q
     |||||||||| ||||||    
T  12406161 tatcaatatggtactacg 12406144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33687614 - 33687430
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||   || |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  33687614 caggataaaacaaactcaactacaactgtgcggttaactactgcattgtagaaaatccttcgagatttacaccctcaaatatggtactaaaaccactctt 33687515  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattcta 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33687514 taatattgaaaccactttaatatgatattgtcaccactctgttatggtgccgagaccactcaaatatgatgttaccaccattcta 33687430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 14509071 - 14509245
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-a 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| |    
T  14509071 gataaaacaagctcatctacaactgttcgattaactactgcattgtagaaaatcgttcgagaattacacc-tccaatatggtaccaagaccattctttta 14509169  T
Q  104 atactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccac 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14509170 atactgaaaccactttaatatggtactgttatcactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccac 14509245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Original strand, 5856158 - 5856311
Alignment:
Q  68 ttacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaata 167  Q
    ||||||| |||||||||||| | | | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  5856158 ttacaccttcaaatatggtagtaaaatcactctataatactgaaaccactt-aatatggtattgttaccactctattatggtgttaagaccactcaaata 5856256  T
Q  168 tggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||    
T  5856257 tggtgttaccaccattctaactttaatttttccaaagtatcaatatggcattacg 5856311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 8747866 - 8748046
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  8747866 caggataaaacaagctcagctgcaactatgtggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgaaaattacaccttcaa-tatggtactaagaccactctt 8747964  T
Q  102 taat-actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | || ||||||||||     |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8747965 ttattactgaaacca-----atatggtattgtaaccactcaattatggtgttgagaccattcaaatatggtgttaccaccattctaa 8748046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24589175 - 24589022
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  24589175 caggataaaacaagtccaactacaactgtgcggttaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactctt 24589077  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccac 160  Q
    ||||||||||||||     ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  24589076 ttaatactgaaacc-----aatatggtaatgtaaccactctattatggtgttgagaccac 24589022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11613705 - 11613565
Alignment:
Q  75 ctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatat--ggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtg 172  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  11613705 ctcaaatatggtactaagatcactatttaatactgaaaccactttaatatatggtattattaccactctattatggtgctaagacctctcaaatatggtg 11613606  T
Q  173 ttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatat 213  Q
    || |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||    
T  11613605 ttaccaccattctaactttgagttctccaaaatatcaatat 11613565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Original strand, 17913770 - 17913877
Alignment:
Q  91 agaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactt 190  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||    
T  17913770 agaccactctttaatactgaaactactttaatacagtattgttaccactctgttatggtgttgagaccacttaaatatagtgttattaccattctaactt 17913869  T
Q  191 taatttct 198  Q
    ||| ||||    
T  17913870 taagttct 17913877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20748291 - 20748169
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-tttaa 104  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |||| || |||||    
T  20748291 ataaaacaagtccatctacaactgtgcggttaactactgcaccgtagaaaacggttcgagaattaca-ccttaaatatggtactaaaaccactcttttaa 20748193  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggta 128  Q
    |||| |||| |||  |||||||||    
T  20748192 tactaaaactactccaatatggta 20748169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 22609652 - 22609841
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | | ||||| |||||||  ||||||||  || |||||||||||| || ||||||||| |  ||||| ||||    
T  22609652 caggataaaacaagctcaactacaactgcgtgattaacaactgcacggtagaaaactattcgagaattacacc-tccaatatggtaatatgaccactctt 22609750  T
Q  102 --taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactt 190  Q
      ||||  | |||||||||| ||||||| ||||  | ||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22609751 attaatttttaaaccactttgatatggtgttgtgccaacattattatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactt 22609841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 21309115 - 21309238
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||                 ||| ||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  21309115 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcacgat-----------------ttataccttcaaatacggtactaagaccactctt 21309197  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctg 142  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21309198 taatactgaaatcacattaatatggtattgttaccactctg 21309238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15991750 - 15991560
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatat-ggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| | |  ||| || |    
T  15991750 aggataaaacaagttcagctgcaattgtgcagttaactactgcactgtcgaaaaccgtttgagaattacacaatcaaatatgggtattaatgccactctt 15991651  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    |||| |||||||||| |  | ||||||| | | ||||||||  |||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15991650 ttaaaactgaaaccaatcaattatggtactatgaccactctactatggtattatgaccattcaaatatggtgttaccaccactctaacttt 15991560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15999412 - 15999222
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatat-ggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| | |  ||| || |    
T  15999412 aggataaaacaagttcagctgcaattgtgcagttaactactgcactgtcgaaaaccgtttgagaattacacaatcaaatatgggtattaatgccactctt 15999313  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    |||| |||||||||| |  | ||||||| | | ||||||||  |||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15999312 ttaaaactgaaaccaatcaattatggtactatgaccactctactatggtattatgaccattcaaatatggtgttaccaccactctaacttt 15999222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 25316574 - 25316494
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatat 83  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25316574 caggataaaacaagttcatctacaaccgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaactgttcgagaattgcaccctcaaatat 25316494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 26204068 - 26203988
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatat 83  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26204068 caggataaaacaagttcatctacaaccgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaactgttcgagaattgcaccctcaaatat 26203988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13736689 - 13736617
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacacc 74  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  13736689 caggataaaacaagcacatctacaaatgtgcgaataactactgcactgtagaaaactgttcgagatttacacc 13736617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2863379 - 2863288
Alignment:
Q  100 tttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    |||| ||||||||||| |  | ||||||| | | ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2863379 tttagtactgaaaccaatcaattatggtactatgaccactctactatggtattgtgaccactcaaatatgatgttaccaccattctaacttt 2863288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9751818 - 9751633
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagacca-ttctt 101  Q
    ||||||||| ||| | | |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||  || |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| |  ||    
T  9751818 aggataaaataagtctaactacaattgtgcgattaactactgcactgtagaacaccattcgagaattaca-cctccaatatggcactaagaccactattt 9751720  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    |||||  ||||||| |  | ||||||| | | ||||||||  |||| | ||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  9751719 taatagcgaaaccaatcaattatggtactatgaccactctactatgatattttgaccactcaaatatgatgttaccatcattctaac 9751633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2882649 - 2882592
Alignment:
Q  134 accactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2882649 accactctactatggtattgtgaccactcaaatatgatgttaccaccattctaacttt 2882592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6112898 - 6112787
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||     |||||  |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6112898 acaccctttaatatggtactaagactaatttttaatattgaaacc-----aatataatattgttaccactctattat-gtgttaagaccactcaaatatg 6112805  T
Q  170 gtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||||  |||||||||||    
T  6112804 gtgttatcaccattctaa 6112787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 11614103 - 11614039
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagaga 66  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  11614103 caggataaaacaagcacaattacaattgtgcggttaactaatgcactttagaaaactgtttgaga 11614039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22695279 - 22695227
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaac 57  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  22695279 gataaaacaagtacagctacaactgtgcggttaaccactgcattgtagaaaac 22695227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22695206 - 22695165
Alignment:
Q  86 tactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggt 127  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22695206 tactgaaaccactctttaaaactgaaaccactttaatatggt 22695165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 188
Target Start/End: Original strand, 5495983 - 5496050
Alignment:
Q  120 aatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  5495983 aatatggtatttctaccactctattatggtaatgagaccactctaatatggtgtt-ccaccattgtaac 5496050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 12103109 - 12103326
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||    
T  12103109 caggataaaacaagcccaactacaaatgtgcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacccttaaatatggtactaagatcactctt 12103208  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12103209 taatactgaaaccactttaaaatggtattgttaccactctgttatggtattgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 12103308  T
Q  202 aaacatcaatatggcact 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12103309 aaacatcaatatggcact 12103326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35679886 - 35679667
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35679886 caggataaaacaagctcaactacaactgtgcagttaacta-tgcattgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 35679788  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35679787 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttcagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatttctcca 35679688  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35679687 aaacatcaatatggcactacg 35679667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10759831 - 10759612
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     
T  10759831 caggataaaacaagcccatttacaactgtgcggttaacta-tgcacggtagaaaaccgttcgagaattataccctcaaatatggtactaagaccactctg 10759733  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10759732 tcatactgaaaccactttaatgtggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatgatgttaccaccattctaactttaatttctcca 10759633  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10759632 aaacatcaatatggcactacg 10759612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 7451842 - 7452058
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  7451842 caggataaaacaagctcagctgcaactgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 7451941  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7451942 taatactgaaaccac----ctatggtattgtaaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctcca 7452037  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  7452038 aaacttcaatatggcactacg 7452058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 40147979 - 40148198
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||    
T  40147979 caggataaaataagctcagcttcaattgttcaattaactactacactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactacgaccactctt 40148078  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  40148079 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccacttaaatatggtgttgcccccattctaactttaatttctcca 40148178  T
Q  202 aaacatcaatatggcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40148179 aaacatcaatatggcactac 40148198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20181071 - 20180854
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  20181071 gataaaacaagctcaactacaattgtgcggttaactactgcactgtagaaaactgttcgagatttacaccctcaaatatgataccaagaccactctttaa 20180972  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20180971 tattgaaaccactttaatacggtattgctaccattctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttctccaaaa 20180872  T
Q  205 catcaatatggcactacg 222  Q
     |||||||||| ||||||    
T  20180871 tatcaatatggtactacg 20180854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29167984 - 29167764
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  29167984 caggataaaacaagcccaactacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 29167885  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  29167884 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccgctcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctcca 29167785  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  29167784 aactatcaatatggtactacg 29167764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6155430 - 6155249
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  6155430 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 6155331  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6155330 taatactgaaaccactttaatttggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaacatt 6155249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 36428793 - 36429006
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||    
T  36428793 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgctcgagaattacacctccaaatatggttctaagaccactctt 36428892  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  36428893 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatagtgttgagaccactcaaatatgatgttaacaccattctaactttaagttctcca 36428992  T
Q  202 aaacatcaatatgg 215  Q
    ||  ||||||||||    
T  36428993 aactatcaatatgg 36429006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 26667356 - 26667557
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  26667356 caggataaaacaagtccagctgcaactgttcgattaactactgcactctagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 26667455  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  26667456 taatactgaaaccactttaatatggtattgttatcactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctaca 26667555  T
Q  202 aa 203  Q
    ||    
T  26667556 aa 26667557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 26938953 - 26939154
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  26938953 caggataaaacaagtccagctgcaactgttcgattaactactgcactctagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 26939052  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  26939053 taatactgaaaccactttaatatggtattgttatcactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctaca 26939152  T
Q  202 aa 203  Q
    ||    
T  26939153 aa 26939154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37248806 - 37248595
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37248806 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaa-tactgtactatagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 37248708  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  37248707 taatactgaaaccactttaata--------ttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctcca 37248616  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||| ||||||    
T  37248615 aactatcaatatggtactacg 37248595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 36423725 - 36423941
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  36423725 ataaaacaagcccagctactactgtttgattaactaatgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtgctaagaccactctttaat 36423824  T
Q  106 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||      
T  36423825 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtattaacaccattctaactttaagttctccaaact 36423924  T
Q  206 atcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||| ||||||    
T  36423925 atcaatatggtactacg 36423941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 39523133 - 39523317
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  39523133 caggataaaacaagtccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcaagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 39523232  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39523233 taatactgaaaccactttaatatggcactgttaccactct-atatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 39523317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12501910 - 12501738
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||| | ||    
T  12501910 caggataaaacaagcccagctacaactgttcggttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatgatactaagaccactatt 12501811  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgtt 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12501810 taataccgaaaccactttaatatggtactgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgtt 12501738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 39518494 - 39518678
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  39518494 caggataaaacaagtccagctgcaactgtgcggttaactactgcagtgtagaaaaccgttcaagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctt 39518593  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39518594 taatactgaaaccactttaatatggcactgttaccactct-atatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 39518678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 556779 - 556959
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||     
T  556779 caggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactcta 556878  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||||||||||||     ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  556879 taatactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 556959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 561551 - 561731
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||     
T  561551 caggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactcta 561650  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||||||||||||     ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  561651 taatactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 561731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36937522 - 36937342
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  36937522 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccaatctt 36937424  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36937423 ttaatactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatgatgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 36937342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36942276 - 36942096
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  36942276 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccaatctt 36942178  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36942177 ttaatactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatgatgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 36942096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11981287 - 11981107
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-aa 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| ||    
T  11981287 ataaaacaagcacatctacaactgttcgattaactattgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc-tctaatatggtaccaagaccattcttttaa 11981189  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattcta 186  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11981188 taccgaaaccactttaatatggtattgttaccactctattgtggtgatgagaccactcaaatatggtgttaccatcattcta 11981107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 4872009 - 4872191
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-a 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  4872009 gataaaacaagctcaactacaactgttcgattaactactgtactgtagaaaaccgtttgagaattataccttcaa-tatggtacaaagaccattctttta 4872107  T
Q  104 atactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4872108 ataatgaaaccactttaatatggtactgttaccactctattatggtgctaagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 4872191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12102842 - 12102639
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggta----ctgagaccat 97  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||| | || || |||||||||||||||||    || ||||||     
T  12102842 caggataaaacaagaccaactacaactgtgcggttaactactacg---tagaaaaccgtttgggattttcaccctcaaatatggtatgtactaagaccac 12102746  T
Q  98 tctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatgg-tgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaattt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12102745 tctttaatactgaaaccactttaatatgacattgttaccactctgttatggtttttgagaccacttaaatatggtgttaccaccattctaactttaagtt 12102646  T
Q  197 cttcaaa 203  Q
    || ||||    
T  12102645 ctccaaa 12102639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32461560 - 32461380
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  32461560 caggataaaacaagttcagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactctt 32461462  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| ||||||||     ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32461461 ttaatgctgaaacc-----aatatggtactatgaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 32461380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41587171 - 41587048
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41587171 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcga--attacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 41587074  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggt 127  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41587073 taacactgaaaccactttaatatggt 41587048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 42001518 - 42001693
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  42001518 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactg-----tagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtactaagaccaatctt 42001611  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | || ||||||||||     |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42001612 ttaacactgaaacca-----atatggtattgtaaccactcaattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 42001693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9726678 - 9726518
Alignment:
Q  22 tacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||  ||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9726678 tacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcaaggtttacacttt-aaatatggtattaagaccattctttaatactgaaaccattttca 9726580  T
Q  122 tatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9726579 tatggtattgttaccactctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgattccaccatt 9726518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6514612 - 6514444
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||   || |||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||    
T  6514612 caggataaaacaagcttagctacaactgtgtggttaactactgcattgtagaaaatcattcgagatttacaccttcaaatatggtactaaaaccactctt 6514513  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6514512 ttaatattgaaaccactttgatattgtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatg 6514444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12041943 - 12041772
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||  ||||| |    
T  12041943 caggataaaacaagtccagctacaactgttcgattaactactgcactataaaaaactgttcgagaattaca-cctccaatatggtaccaagtacattctt 12041845  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgt 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  12041844 ttaatactgaaaccacattaatatggtactgttaccactctattatggtgctaagactactcaaatatggtgt 12041772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 41996749 - 41996924
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  41996749 caggataaaacaagcccaactacaactgtgcggttaactactg-----tagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtactaagaccaatctt 41996842  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | || ||||||||||     |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41996843 ttaacactgaaacca-----atatggtattgtaaccactcaattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 41996924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15414866 - 15414672
Alignment:
Q  28 tgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||    
T  15414866 tgtgcggttaactactgcactatagaaaacctttcgaaatttacacc-tccaatatgctactaagaccaatctttaatactagaatcactctaatatggt 15414768  T
Q  128 attgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac-tttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |   | ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15414767 accttgaccactctgttatggtgttatgaccactaaaatatggtgttatcaccattctaacatttaagttcttcaaaatatcaatatggtactacg 15414672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12045150 - 12044970
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  12045150 caggataaaacaagcatagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagactaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactctt 12045052  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||     ||||||||| | |  |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12045051 ttaatactgaaacc-----aatatggtactatggccactctattatggtgttgagaccaatcaaatatggtgttaccacctttctaa 12044970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16116257 - 16116040
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    |||||||||||  || ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||| |||| |   || |||||||    
T  16116257 gataaaacaagttcaactacaacagtactgttaactactgcactatagaaaaccgttcgagaattacaca-tccaatatgatactaat--cactctttaa 16116161  T
Q  105 tactgaaaccacttt--aatatggtattgttac--cactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttc 200  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  16116160 tactgaaaccgctttctaatatggtattgtgacaccactctattatggtgttaagaccactcaaatatgatgttatcaccattctacctttaagttcttc 16116061  T
Q  201 aaaacatcaatatggcactac 221  Q
    |||  |||||||||| |||||    
T  16116060 aaactatcaatatggtactac 16116040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13301426 - 13301303
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13301426 acaccctctaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacca-----atatggtattggtaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatg 13301332  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13301331 gtgttaccaccattctaattttaacttct 13301303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34707513 - 34707337
Alignment:
Q  37 aactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttacc 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |    
T  34707513 aactattgcaccatagaaaaccgttcgagatttacacctt-aaatatggtactaagaccactctttaatactgaaatcattttaatatgttattgttatc 34707415  T
Q  137 actctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac-atcaatatg 214  Q
    | |||| ||||||| | | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  34707414 attctgttatggtgctaaaatcactcaaatatggtgttatcactattctaactttaagttc-tcaaaactatcaatatg 34707337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21323910 - 21323798
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21323910 acaccctctaatatggtactaagaccagtctttaatactgaaacca-----atatggtattgttaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatg 21323816  T
Q  170 gtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| ||||| ||||||    
T  21323815 gtgttaccaccgttctaa 21323798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 115
Target Start/End: Original strand, 3666017 - 3666129
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-tt 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||| | |||| || ||    
T  3666017 aggataaaacaagtccaactacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgggaattacaccttc-aatatggtactaataccactcttt 3666115  T
Q  102 taatactgaaacca 115  Q
    ||||||||||||||    
T  3666116 taatactgaaacca 3666129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Original strand, 31731694 - 31731817
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31731694 acaccctctaatatggtaccaagactactctttaatacttaaacca-----atatggtattgttaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatg 31731788  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    || || |||||||||||| ||||| ||||    
T  31731789 gtattaccaccattctaattttaacttct 31731817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1429938 - 1429827
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     ||| ||||||||| |||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1429938 acaccctcaaatatggtactaagaccattctttaatattgaaacc-----aatgtggtattgtgaccattat-ttatggtgctgagaccactcaaatatg 1429845  T
Q  170 gtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  1429844 gtgttaccaccattctaa 1429827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37652816 - 37652742
Alignment:
Q  148 gtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||  |||  |||||||||| ||||||    
T  37652816 gtgttgagaccactcaaatatggtgttaatatcattctaactttaagttctctaaactatcaatatggtactacg 37652742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 9911239 - 9911413
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-ttta 103  Q
    |||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  | |   |||   | |||||||||||| |||||| || ||||    
T  9911239 gataaaacaagttcaactacaattgtgcggttaattactgcactgtagaaaaccgttcaaaagacaca---ttaaatatggtactaagaccactctttta 9911335  T
Q  104 atactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||||||||     | ||||||||||||| || ||| |  ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9911336 atactgaaa-----tcaatatggtattgtgacaact-ttatatggtgctaagaccactcaaatatgatgttaccaccattctaa 9911413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37550017 - 37549944
Alignment:
Q  149 tgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||  |||  |||||||||| ||||||    
T  37550017 tgttgagaccactcaaatatggtgttaatatcattctaactttaagttctctaaactatcaatatggtactacg 37549944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 188
Target Start/End: Original strand, 3666139 - 3666175
Alignment:
Q  152 tgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3666139 tgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaac 3666175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6513768 - 6513717
Alignment:
Q  171 tgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  6513768 tgttaccaccattctaactttcatttctccaaagtatcaatatggcactacg 6513717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 7188 - 7408
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  7188 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacgccctcaaatattgtattaagaccactctt 7287  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7288 taatactgaaaccaccttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgataccacttaaatattgtgttgccaccattctaactttaatttctcca 7387  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  7388 aaacatcaatatgacactacg 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 36683663 - 36683883
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36683663 caggataaaacaaggtcagctacatctgtgcgattaactactgcactgtagaaaatcgtttgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 36683762  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36683763 taatactgaaatcactttaatatggtattgttaccactatgttatggtgttgagaccactcaaatatggtcttgccaccattctaactttaatttctcca 36683862  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  36683863 aaagatcaatatggcactacg 36683883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 33416634 - 33416850
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  33416634 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatacggtactaagaccgctctttaa 33416732  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33416733 tactgaaaccactttaatatgatattgttatcattctgttatggtgttgagaccactcaaatatgatgttaccaccattctaactttaatttctccaaaa 33416832  T
Q  205 catcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33416833 catcaatatggcactacg 33416850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44925934 - 44925715
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  44925934 caggataaaacaaggtcatctacaactatgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaaaaccactctt 44925836  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  44925835 taatactgaaaccactttaatatgatactgttaccactctgttatggtgtcgagaccactcaaatatggttttaccaccattctaactttaatttctcca 44925736  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44925735 aaacatcaatatggcactacg 44925715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 19166718 - 19166938
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19166718 caggataaaacaagctcaactacaactgtgctgttaactactgcactatagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagatcattctt 19166817  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19166818 taaaacttaaatcactttaatatggtgtggttaccactctattatggtgttgagaccactcatatatggtgttaccaccattctaactttaatttctcca 19166917  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||  |||||||||| ||||    
T  19166918 aaactacaatatggcattacg 19166938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1910976 - 1910760
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaat 105  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1910976 ataaaacaagctcaactacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccattcgagatttacacattcaaatatggtattaagaccactctttaat 1910877  T
Q  106 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||      
T  1910876 actgaaaccactttaatatggtactgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatgatgttaccaccattctgactttaatttctccaaagt 1910777  T
Q  206 atcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||| |||||||    
T  1910776 atcaatatgacactacg 1910760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15951564 - 15951346
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactat--agaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||||||  || | ||||||||| |||||| |||||    
T  15951564 gataaaacaagcccagctacaactgtgcagttaactactgcactctgtagaaaaccgttcgagatttacacgttcga-tatggtactaagaccactcttt 15951466  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaa 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  15951465 aatactgaaatcactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaacaccattctaactttaagttctccaa 15951366  T
Q  203 aacatcaatatggcactacg 222  Q
    |  |||||| ||| ||||||    
T  15951365 actatcaatttggtactacg 15951346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 2965715 - 2965910
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2965715 aggataaaacaagtccagctacaactatgcagttaactactgcactgtagaaaaccatttgagatttacaccctcaaatatggtactaagaccactcttt 2965814  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  2965815 aatactaaaactactttaatatagtattgttaccactctgttatggtgttgagactactcaaatatgatgttaccaccattttaacgttaagttct 2965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40125893 - 40125712
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40125893 gataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcaccgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactctttaa 40125794  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40125793 tactgaaaccactttaatatggcactgttaccactct-atatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 40125712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23548642 - 23548423
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||  ||| || |||||| ||||||| |||| |||||| | |||    
T  23548642 aggataaaacaagttcagctacaactgcgcggttaactactgcattgtagaaaaccgttcaagattttcacccttaaatatgatactaagaccactattt 23548543  T
Q  103 a--atactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttc 200  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |    
T  23548542 ataatactgaaatcactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagatcactcaaatatggtgttaccaccattcgaactttaagttctcc 23548443  T
Q  201 aaaacatcaatatggcacta 220  Q
    | || |||||||| ||||||    
T  23548442 ataatatcaatatcgcacta 23548423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28564826 - 28564612
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaat 105  Q
    ||||||||||||| | || |||||| || ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| || | |||||| ||||||||    
T  28564826 ataaaacaagcccggttagaactgttcgattaactattgcagtgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatgatagtaagaccactctttaat 28564728  T
Q  106 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac 205  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||     
T  28564727 gttgaaaccactttaatatggtattgttaccactctcttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattttaactttaa-ttctccaaaat 28564629  T
Q  206 atcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  28564628 atcaatatggcactacg 28564612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28572449 - 28572235
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaat 105  Q
    ||||||||||||| | || |||||| || ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| || | |||||| ||||||||    
T  28572449 ataaaacaagcccggttagaactgttcgattaactattgcagtgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatgatagtaagaccactctttaat 28572351  T
Q  106 actgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaac 205  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||     
T  28572350 gttgaaaccactttaatatggtattgttaccactctcttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattttaactttaa-ttctccaaaat 28572252  T
Q  206 atcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  28572251 atcaatatggcactacg 28572235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 17026019 - 17026204
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  17026019 caggataaaacaagtctagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc-tccaatatggtaccaagaccattctt 17026117  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17026118 ttaatattgaaaccactttaatatggtactattaccactctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 17026204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 17556511 - 17556696
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  17556511 caggataaaacaagtctagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc-tccaatatggtaccaagaccattctt 17556609  T
Q  102 t-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17556610 ttaatattgaaaccactttaatatggtactattaccactctattatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 17556696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31449877 - 31449697
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |    
T  31449877 caggataaaacaagtccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccaatctt 31449779  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31449778 ttaatactgaaacc-----aatatggtattgtaaccactcaattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 31449697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38182248 - 38182047
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |              
T  38182248 caggataaaacaagcacagctacaactgtgctgttaactactgcactataaaaaaccgttcgagatttacaccttcaaatatggtactaa---------- 38182159  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
             ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||    
T  38182158 ---------aaccactttaatatgatattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccactattcaaactttaatttctcca 38182068  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  38182067 aagtatcaatatggcactacg 38182047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18876378 - 18876181
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  18876378 caggataaaacaaactcatctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatgatactaataccactctt 18876279  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||                      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18876278 taatattgaaaccaccttaatatggt----------------------gttgagaccactcaaatatgttgttgccaccattctaactttaatttctcca 18876201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Original strand, 24090714 - 24090887
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaa 104  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||     |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24090714 gataaaacaagcttatctacaactgtgcggttaactattg-----tagaaaaccgttcgagatttacatcctcaaatattgtactaagaccactctttaa 24090808  T
Q  105 tactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccatt 183  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24090809 tattgaaaccactttaatatgatattgttaccactctgttatggtgctgagaccactcaaatatggtgataccaccatt 24090887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Original strand, 17020468 - 17020640
Alignment:
Q  48 tatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatg 147  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||||    
T  17020468 tatagaaaaccgtttgagatttacacattcgaatatggtactaagaccactctttaatattgaaaccactttcatatgatattgttacaattctcttatg 17020567  T
Q  148 gtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcacta 220  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17020568 gcgctgagaccactcaaacatggtgttaccaccattctaactttaatttcttcaaagtatcaatatggcacta 17020640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Original strand, 17550905 - 17551077
Alignment:
Q  48 tatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatg 147  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||||    
T  17550905 tatagaaaaccgtttgagatttacacattcgaatatggtactaagaccactctttaatattgaaaccactttcatatgatattgttacaattctcttatg 17551004  T
Q  148 gtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcacta 220  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17551005 gcgctgagaccactcaaacatggtgttaccaccattctaactttaatttcttcaaagtatcaatatggcacta 17551077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 34118551 - 34118687
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  34118551 aggataaaacaagcccagctacaactgtgctgttaactactgcaccgtagaaaactgttcgagatttacaccttcgaatatggtactaaggccactcttt 34118650  T
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccact 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34118651 aataatgaaaccactttaatatggtattgttaccact 34118687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28559665 - 28559457
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||| || ||||||| |||||| || ||||| ||| |||||||||||| |||| || |||| | ||||||         
T  28559665 caggataaaataagcccagttagaactgttcgattaactattgcactgtaaaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tacggtagtaagacca----- 28559572  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttca 201  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  28559571 -----ctgaaaccactttaatatggtattgttaccactctcttatggtgctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaa-ttctcca 28559478  T
Q  202 aaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  28559477 aaatatcaatatgacactacg 28559457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4238338 - 4238172
Alignment:
Q  16 cccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-aatactgaaacc 114  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  4238338 cccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtactaagaccaatcttttaatactgaaacc 4238240  T
Q  115 actttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |     |||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4238239 a-----atatggtattgtaaccactcaattatgatgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 4238172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4243077 - 4242911
Alignment:
Q  16 cccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattcttt-aatactgaaacc 114  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  4243077 cccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtactaagaccaatcttttaatactgaaacc 4242979  T
Q  115 actttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |     |||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4242978 a-----atatggtattgtaaccactcaattatgatgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 4242911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Original strand, 1807563 - 1807671
Alignment:
Q  8 aaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatac 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  1807563 aaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactagtgcactgtagaaaaccgttcgagatttacaccttcaaatatggtactaagatcactctttaatac 1807662  T
Q  108 tgaaaccac 116  Q
    |||||||||    
T  1807663 tgaaaccac 1807671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43302702 - 43302519
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattc-t 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||| | || |    
T  43302702 caggataaaacaagcccagctgcacctgtgcggttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccttc-aatgtggtactaagactactctt 43302604  T
Q  101 ttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgag---accactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||||| |||||||     ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43302603 ttaatattgaaacc-----aatatggtactatgaccactctattatggtgttgagaccaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 43302519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25367924 - 25367801
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25367924 acaccctctaatatggtactaagtccactctttaatactgaaatca-----atatggtattgttaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatg 25367830  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  25367829 gtgttaccaccattctaattttaacttct 25367801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34818643 - 34818520
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     |||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  34818643 acaccctctaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacca-----atatggtactgttaccattctattatggtgttgtgaccactcaaatatg 34818549  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  34818548 gtgctaccaccattctaactttaacttct 34818520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8331301 - 8331178
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |     ||||| ||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  8331301 acaccctctaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacaa-----atatgttattgttaccattctattatggtggtaagaccactcaaatatg 8331207  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  8331206 gtgttaccaccattctaattttaacttct 8331178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Original strand, 37771862 - 37771985
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37771862 acaccctctaatatggtaccaagactactctttaatactgaaacca-----atatggtattgttaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatg 37771956  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
     | || |||||||||||| ||||| ||||    
T  37771957 atattaccaccattctaattttaacttct 37771985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15875679 - 15875596
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg 85  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  15875679 caggataaaacaagctcagctacaattgtacgattaactactgcactatagaaaaccgttcaagaattacactctcaaatatgg 15875596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 26779281 - 26779403
Alignment:
Q  99 ctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||    
T  26779281 ctttaatactgaaacca-tttaatatgatattgatatcactctgttatgttgctgagaccactcaaatatggtgct-acaccattttaactttaacttct 26779378  T
Q  199 tc-aaaacatcaatatggcactacg 222  Q
     | |||| || ||||||||||||||    
T  26779379 gcaaaaatattaatatggcactacg 26779403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 187
Target Start/End: Original strand, 12820504 - 12820591
Alignment:
Q  100 tttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  12820504 tttagtactgaaaccactctaatatggtattgtgaccactctgctatgatattgtgaccactcaaatatggtgttatcgccattctaa 12820591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Original strand, 1807685 - 1807747
Alignment:
Q  156 accactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaatatggcac 218  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1807685 accactctattatggtgttgccaccattctaactttaatttatccaaaacatcaatatggcac 1807747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17953881 - 17953800
Alignment:
Q  5 gataaaacaagcccagctacaa-ctgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg 85  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17953881 gataaaacaagctcacctacaaactgtgtgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaaatatgg 17953800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24673320 - 24673125
Alignment:
Q  24 caactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaata 123  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||  ||| ||||  ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||| |||||    
T  24673320 caactgtgcggttaaccactacactgta--aaagagttcaagatttacacc-tccaatatggtactaagaccactttttaatgttgaaaccactctaata 24673224  T
Q  124 tggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa-ctttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||| | | || |||||    ||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  24673223 tggtactatgac-actctatagtggtgctaagaccactcaaatatgatgttatcaccattccaacctttaagttcttcaaaataacaatatggtactacg 24673125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 191
Target Start/End: Original strand, 29220550 - 29220619
Alignment:
Q  122 tatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaacttt 191  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29220550 tatggtattatgaccactctattatgctattgtgaccactcaaatatgatgttaccaccattctaacttt 29220619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 7001871 - 7001971
Alignment:
Q  100 tttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac-tttaatttct 198  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| || | | |||||||| || ||||||||||    
T  7001871 tttaatactgaaatcactctaatatgatgatgtgaccactctattatagttttgagaccactcaaatatgatgatacgaccattctgacttttaatttct 7001970  T
Q  199 t 199  Q
    |    
T  7001971 t 7001971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22714923 - 22714805
Alignment:
Q  98 tctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac-tttaattt 196  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| || | | | ||||||  ||||||| | ||| || ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  22714923 tctttaatactgaaatcactctaatatgatactttgatcactcttttatggtgctaagatcattcaaatatgatgttatgaccattctaacatttaactt 22714824  T
Q  197 cttcaaaacatcaatatgg 215  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  22714823 cttcaatatatcaatatgg 22714805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9898 - 9713
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||     
T  9898 caggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactcta 9799  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9798 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctgttatggtgttgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaa 9713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 29238 - 29439
Alignment:
Q  1 tcaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactga----gacca 96  Q
    ||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||| |    || |     
T  29238 tcaggataaaataagtctaactataactgtgcggttaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatgatactaattaagatcg 29336  T
Q  97 ttcttt-aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatt 195  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29337 ttcttttaatactgaaaccattttagtatagtattgttaccactctgttatggttctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaactttaatt 29436  T
Q  196 tct 198  Q
    |||    
T  29437 tct 29439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 25483 - 25616
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  25483 caggataaaacaagcccaactacaactgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttcgagacttacatcttcaaatatggtactaagaccactctt 25582  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttac 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25583 taatattgaaaccactttaatatgatattattac 25616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Original strand, 25637 - 25747
Alignment:
Q  112 accactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaaacatcaat 211  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||    
T  25637 accactttaatatgatattattaccactctgttatggttctgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaattttaatttctccaaagtatcaat 25736  T
Q  212 atggcactacg 222  Q
    ||| |||||||    
T  25737 atgacactacg 25747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 203
Target Start/End: Original strand, 4092 - 4259
Alignment:
Q  37 aactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttacc 136  Q
    |||||||||| | ||||||||  || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  4092 aactactgcattgtagaaaaccattcgagatttatacccttaaatatggtactaagaccactctttaatacttaaatcacttttttatggtaatgttacc 4191  T
Q  137 actctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa-ctttaatttcttcaaa 203  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4192 actctattatggtactgagaccactcaaatatggtgttaccaccattctaatttttaatttctccaaa 4259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 83150 - 83327
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||||    
T  83150 caggataaaacaagctcagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaacctttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagatcactctt 83248  T
Q  102 taatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
      |||||||||||     |||||  || | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  83249 --atactgaaacc-----aatataatactataaccactctattatggtgttgagaccactcaaatatggtgttactaccattctaa 83327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Original strand, 45935 - 46058
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     ||| |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45935 acaccctcaaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacca-----atacggtactgttaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatg 46029  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  46030 gtgttaccaccattctaattttaacttct 46058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 152852 - 152729
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     ||| |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  152852 acaccctcaaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacca-----atacggtactgttaccattctattatggtgttgagaccactcaaatatg 152758  T
Q  170 gtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  152757 gtgttaccaccattctaattttaacttct 152729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 203
Target Start/End: Original strand, 5422 - 5570
Alignment:
Q  50 tagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggt 149  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    |||||||||||||||||| ||||||||| | | || ||||||    
T  5422 tagaaaactgtttgagatttacaccctcaaatatggtactaagaccactcttaa----tgaaaccactttaatatg-tattgttacaattatgttatggt 5516  T
Q  150 gttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttcttcaaa 203  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||    
T  5517 gctgataccactcaaatatggtgttaccactattcttactttaagttctccaaa 5570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 148316 - 148197
Alignment:
Q  103 aatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaac-tttaatttcttca 201  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  148316 aatactaaaaccacattaatatggtattgttatcactctattatgatgttgagaccactcaaatatagtgttaccaccattctaacttttaagttctcca 148217  T
Q  202 aaacatcaatatggcactac 221  Q
    ||  |||||||||| |||||    
T  148216 aactatcaatatggtactac 148197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 165040 - 164928
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcg------gttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagacc 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  165040 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcgcgcgcggttaactactgcactgtagaaaaccgtttgagatttacaccctcaaatacggtactaagacc 164941  T
Q  96 attctttaatact 108  Q
    | ||||| |||||    
T  164940 actctttcatact 164928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Original strand, 255901 - 255983
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatg 84  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  255901 caggataaaacaagtccagctacaactgtgtggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgaggattacaccctcaaatatg 255983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47801 - 47692
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47801 acaccctctaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacca-----atatggtattgttatttttctattatggtgttgagaccactcaaatatg 47707  T
Q  170 gtgttgccaccattc 184  Q
    ||||| |||||||||    
T  47706 gtgttaccaccattc 47692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52844 - 52727
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagaccactcaaatatg 169  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     ||||| |||| ||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  52844 acaccctctaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacca-----atatgatatttttatcattctattatggtgttgagaccgctcaaatatg 52750  T
Q  170 gtgttgccaccattctaacttta 192  Q
    || || |||||||||||| ||||    
T  52749 gttttaccaccattctaatttta 52727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2020 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold2020
Description:

Target: scaffold2020; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Original strand, 455 - 567
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcg------gttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtactgagacc 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  455 caggataaaacaagctcagctacaactgtgcgcgcgcggttaactactgcactgtagaaaaccgtttgagatttacaccctcaaatacggtactaagacc 554  T
Q  96 attctttaatact 108  Q
    | ||||| |||||    
T  555 actctttcatact 567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 166097 - 166025
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacacc 74  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  166097 caggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaattactgcactgtaaaaaaccgttcgagaattacacc 166025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Original strand, 35718 - 35772
Alignment:
Q  2 caggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaa 56  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35718 caggataaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaa 35772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 146406 - 146256
Alignment:
Q  41 actgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatgg-tactgagaccattc---tttaatactgaaaccactttaatatggtattgttacc 136  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||  || ||   ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||    
T  146406 actgcactgtagaaaattgttcgagaattacactctcaaatatggctagtaaggacactcgaatttaataatgaaaccactattatatggtattgtgacc 146307  T
Q  137 actctggtatggtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa 187  Q
    | |||  ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  146306 attctattatggtactgagaccattcaaatatggtgttaccaccattctaa 146256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 155528 - 155486
Alignment:
Q  3 aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgc 45  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  155528 aggataaaacaagttcagctacaactgtgcgattaactactgc 155486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1088
Alignment:
Q  70 acaccctcaaatatggtactgagaccattctttaatactgaaaccactttaatatggtattgttaccactctggtatggtgttgagac 157  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  1170 acaccctctaatatggtactaagaccactctttaatactgaaacc-----aatatggtattgttaccattctattatggtgttgagac 1088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 88
Target Start/End: Original strand, 1230 - 1309
Alignment:
Q  8 aaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatggtac 88  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  1230 aaaacaagttcagctacgactgtgcggttaactactgcactatagaaaatcgttcgagatttacaccttc-aatatggtac 1309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Original strand, 2396 - 2474
Alignment:
Q  6 ataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactatagaaaacagttagagaattacaccctcaaatatg 84  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||    
T  2396 ataaaacaaactcaggtacaactgtgagattaactactgcaccgtagaaaattgttggagaattacacccttaaatatg 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 42184 - 42255
Alignment:
Q  152 tgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa-ctttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  42184 tgagaccactcaagtatggtgttctcaccattctaacctttaacttctccaaaatatcaatattgtactacg 42255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35569 - 35519
Alignment:
Q  148 gtgttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaactttaatttct 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  35569 gtgttgagactgctcaaatatggtgttaccaccattctaattttaacttct 35519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 222
Target Start/End: Original strand, 3001 - 3073
Alignment:
Q  151 ttgagaccactcaaatatggtgttgccaccattctaa-ctttaatttcttcaaaacatcaatatggcactacg 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  3001 ttgagaccactcaagtacggtgttctcaccattctaacctttaacttctccaaaatatcaatattgtactacg 3073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University