View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18187_low_7 (Length: 373)

Name: NF18187_low_7
Description: NF18187
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18187_low_7
NF18187_low_7
[»] scaffold0080 (6 HSPs)
scaffold0080 (15-373)||(11150-11508)
scaffold0080 (19-373)||(30919-31273)
scaffold0080 (19-373)||(36385-36739)
scaffold0080 (16-373)||(53672-54029)
scaffold0080 (15-101)||(13805-13891)
scaffold0080 (241-373)||(50127-50259)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (15-373)||(30311495-30311853)
chr8 (15-373)||(15535455-15535813)
chr8 (15-370)||(22041902-22042257)
chr8 (15-373)||(32602217-32602575)
chr8 (16-373)||(17672375-17672732)
chr8 (15-373)||(22131392-22131750)
chr8 (16-373)||(20016615-20016972)
chr8 (16-373)||(18858649-18859006)
chr8 (16-373)||(22118527-22118884)
chr8 (16-373)||(22127311-22127668)
chr8 (15-373)||(21164889-21165247)
chr8 (15-373)||(19980039-19980397)
chr8 (16-373)||(19482424-19482773)
chr8 (16-357)||(21253032-21253373)
chr8 (16-373)||(21392213-21392570)
chr8 (16-373)||(21782772-21783129)
chr8 (16-373)||(21786707-21787064)
chr8 (37-373)||(23652113-23652449)
chr8 (17-356)||(19864446-19864785)
chr8 (16-373)||(22422244-22422601)
chr8 (17-372)||(22375806-22376161)
chr8 (19-372)||(22246788-22247141)
chr8 (15-373)||(31414820-31415178)
chr8 (101-373)||(21920185-21920457)
chr8 (16-280)||(22522711-22522975)
chr8 (16-168)||(21781539-21781691)
chr8 (19-371)||(23657001-23657353)
chr8 (18-216)||(22989274-22989472)
chr8 (15-369)||(21323630-21323984)
chr8 (15-373)||(16269575-16269933)
chr8 (15-373)||(29301777-29302135)
chr8 (37-369)||(20008294-20008626)
chr8 (16-372)||(23887097-23887457)
chr8 (15-373)||(28982983-28983341)
chr8 (15-373)||(28988202-28988560)
chr8 (37-373)||(21927499-21927836)
chr8 (15-373)||(4984114-4984472)
chr8 (19-372)||(20394488-20394841)
chr8 (15-371)||(27356610-27356966)
chr8 (19-355)||(31569198-31569533)
chr8 (15-371)||(22052937-22053293)
chr8 (98-373)||(6605730-6606005)
chr8 (37-221)||(19984404-19984588)
chr8 (46-373)||(19861507-19861834)
chr8 (15-230)||(22061030-22061245)
chr8 (15-221)||(20390310-20390516)
chr8 (211-372)||(22988803-22988964)
chr8 (15-78)||(22030470-22030533)
chr8 (299-373)||(19114762-19114836)
chr8 (16-371)||(16875447-16875802)
chr8 (16-146)||(23155394-23155524)
chr8 (16-123)||(20650707-20650814)
chr8 (16-139)||(21848689-21848812)
chr8 (15-145)||(22373168-22373298)
chr8 (142-373)||(14567214-14567445)
chr8 (16-123)||(16414413-16414520)
chr8 (16-158)||(22436590-22436732)
chr8 (16-122)||(23902487-23902593)
chr8 (265-373)||(20390171-20390279)
chr8 (16-123)||(21194892-21194999)
chr8 (16-123)||(24932176-24932283)
chr8 (162-253)||(19869885-19869976)
chr8 (292-371)||(21848965-21849044)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (15-373)||(18225094-18225452)
chr4 (16-373)||(8388418-8388775)
chr4 (16-373)||(8051272-8051629)
chr4 (16-373)||(27713342-27713699)
chr4 (16-373)||(14301628-14301985)
chr4 (16-373)||(17092798-17093155)
chr4 (16-373)||(23957753-23958110)
chr4 (16-373)||(12478606-12478963)
chr4 (16-373)||(14682573-14682930)
chr4 (16-373)||(16234641-16234998)
chr4 (16-373)||(19776442-19776799)
chr4 (16-373)||(40475046-40475403)
chr4 (15-373)||(15145541-15145891)
chr4 (101-373)||(16353241-16353513)
chr4 (16-372)||(14849015-14849371)
chr4 (17-284)||(16218325-16218592)
chr4 (17-284)||(16221645-16221912)
chr4 (15-373)||(44659774-44660132)
chr4 (15-371)||(15357028-15357384)
chr4 (15-369)||(16149721-16150075)
chr4 (15-369)||(16153867-16154221)
chr4 (16-173)||(22631910-22632067)
chr4 (16-372)||(14696120-14696476)
chr4 (16-362)||(14161487-14161833)
chr4 (17-248)||(23443237-23443467)
chr4 (37-367)||(1647207-1647537)
chr4 (15-373)||(3262702-3263060)
chr4 (15-373)||(15001273-15001631)
chr4 (15-373)||(29451445-29451803)
chr4 (19-355)||(51604704-51605040)
chr4 (15-119)||(16251498-16251602)
chr4 (15-368)||(27902397-27902750)
chr4 (15-373)||(11205140-11205498)
chr4 (37-373)||(15072365-15072701)
chr4 (15-373)||(8707917-8708271)
chr4 (16-371)||(15257936-15258290)
chr4 (285-373)||(18613742-18613830)
chr4 (11-81)||(16353174-16353244)
chr4 (16-139)||(15291067-15291190)
chr4 (19-121)||(12340777-12340879)
chr4 (211-373)||(15323223-15323385)
chr4 (292-371)||(15291343-15291422)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (15-373)||(16805094-16805452)
chr3 (16-373)||(5108759-5109116)
chr3 (16-373)||(16637398-16637755)
chr3 (16-373)||(48427072-48427429)
chr3 (16-373)||(15346393-15346750)
chr3 (16-373)||(6602361-6602718)
chr3 (16-373)||(10007225-10007582)
chr3 (16-373)||(12888334-12888691)
chr3 (16-373)||(13254315-13254672)
chr3 (16-373)||(15400665-15401022)
chr3 (16-373)||(15587540-15587897)
chr3 (16-373)||(3687568-3687925)
chr3 (16-373)||(5423078-5423435)
chr3 (16-373)||(10907835-10908192)
chr3 (16-373)||(20060202-20060559)
chr3 (18-365)||(53383168-53383515)
chr3 (15-373)||(16693789-16694147)
chr3 (16-373)||(16754849-16755206)
chr3 (45-373)||(14874676-14875004)
chr3 (19-373)||(17491475-17491829)
chr3 (104-373)||(15723170-15723439)
chr3 (154-373)||(12499873-12500092)
chr3 (16-372)||(15261256-15261612)
chr3 (16-195)||(15357886-15358065)
chr3 (191-373)||(15340894-15341076)
chr3 (17-237)||(14579557-14579777)
chr3 (15-371)||(11959305-11959661)
chr3 (16-153)||(24185035-24185172)
chr3 (15-373)||(47125579-47125937)
chr3 (11-369)||(13318634-13318992)
chr3 (19-373)||(28755953-28756307)
chr3 (19-355)||(13943677-13944013)
chr3 (15-371)||(31693321-31693677)
chr3 (15-371)||(31940540-31940896)
chr3 (15-371)||(12358663-12359019)
chr3 (19-371)||(16379068-16379420)
chr3 (37-357)||(16826439-16826754)
chr3 (37-371)||(17188011-17188345)
chr3 (40-201)||(11888526-11888687)
chr3 (15-371)||(11950044-11950400)
chr3 (19-355)||(41179175-41179511)
chr3 (19-371)||(44778884-44779236)
chr3 (16-351)||(15013904-15014239)
chr3 (15-369)||(10418181-10418535)
chr3 (15-369)||(12179977-12180337)
chr3 (37-373)||(15229238-15229574)
chr3 (37-373)||(15235106-15235442)
chr3 (37-253)||(18132504-18132720)
chr3 (16-123)||(43164550-43164657)
chr3 (15-320)||(12510619-12510924)
chr3 (15-251)||(10407725-10407961)
chr3 (37-246)||(14291690-14291899)
chr3 (16-93)||(15714204-15714281)
chr3 (15-236)||(24189076-24189297)
chr3 (15-371)||(16834651-16835002)
chr3 (16-371)||(15611740-15612095)
chr3 (16-371)||(30139443-30139798)
chr3 (16-371)||(30148994-30149349)
chr3 (15-253)||(14088428-14088666)
chr3 (100-272)||(12269946-12270118)
chr3 (15-370)||(16327796-16328151)
chr3 (17-371)||(8272548-8272902)
chr3 (37-253)||(13970278-13970494)
chr3 (16-116)||(18437022-18437122)
chr3 (16-371)||(15948618-15948973)
chr3 (19-221)||(8745530-8745732)
chr3 (16-139)||(13965500-13965623)
chr3 (16-146)||(6151001-6151131)
chr3 (16-68)||(26791561-26791613)
chr3 (15-146)||(17200496-17200627)
chr3 (211-372)||(11889623-11889784)
chr3 (22-92)||(12272254-12272324)
chr3 (16-148)||(25768178-25768310)
chr3 (255-373)||(10385306-10385424)
chr3 (292-373)||(6151277-6151358)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (15-373)||(21233711-21234069)
chr1 (15-371)||(17042995-17043351)
chr1 (16-373)||(33389010-33389367)
chr1 (16-373)||(51331474-51331831)
chr1 (16-373)||(21838971-21839328)
chr1 (16-373)||(21832323-21832680)
chr1 (28-373)||(24792609-24792954)
chr1 (16-373)||(16348576-16348934)
chr1 (16-373)||(19108389-19108746)
chr1 (28-373)||(22503282-22503627)
chr1 (16-373)||(41351649-41352000)
chr1 (15-356)||(22360224-22360565)
chr1 (16-373)||(430097-430454)
chr1 (15-373)||(20140104-20140462)
chr1 (37-373)||(50618400-50618736)
chr1 (16-373)||(21750961-21751318)
chr1 (16-373)||(21862354-21862711)
chr1 (16-327)||(16378162-16378473)
chr1 (15-373)||(19661116-19661474)
chr1 (37-373)||(21743554-21743890)
chr1 (11-369)||(19856330-19856688)
chr1 (15-373)||(37679101-37679459)
chr1 (15-373)||(48424925-48425283)
chr1 (15-373)||(52987793-52988151)
chr1 (15-373)||(20296433-20296791)
chr1 (15-368)||(20854740-20855093)
chr1 (184-305)||(20944119-20944240)
chr1 (37-369)||(20833902-20834234)
chr1 (15-373)||(38910806-38911164)
chr1 (19-371)||(24097587-24097939)
chr1 (15-373)||(31537977-31538335)
chr1 (13-253)||(41310698-41310938)
chr1 (15-355)||(20938043-20938383)
chr1 (15-371)||(21952932-21953288)
chr1 (16-371)||(20829373-20829728)
chr1 (301-373)||(21026194-21026266)
chr1 (16-146)||(35930806-35930936)
chr1 (16-146)||(41215837-41215967)
chr1 (16-146)||(20527301-20527431)
chr1 (16-139)||(20927309-20927432)
chr1 (295-373)||(41308694-41308772)
chr1 (16-137)||(22133735-22133856)
chr1 (16-77)||(21200935-21200996)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (16-373)||(18781052-18781409)
chr5 (16-373)||(16358440-16358797)
chr5 (16-373)||(34568432-34568789)
chr5 (16-373)||(40710718-40711075)
chr5 (16-373)||(27520344-27520701)
chr5 (16-373)||(27612292-27612649)
chr5 (16-373)||(41772780-41773137)
chr5 (19-373)||(22330981-22331335)
chr5 (16-373)||(14997830-14998187)
chr5 (16-373)||(27666581-27666938)
chr5 (16-373)||(22349857-22350214)
chr5 (16-373)||(27683491-27683848)
chr5 (16-373)||(19771898-19772255)
chr5 (16-373)||(37289587-37289944)
chr5 (16-373)||(22136606-22136963)
chr5 (16-373)||(29474164-29474521)
chr5 (39-372)||(20801336-20801669)
chr5 (16-373)||(25428371-25428728)
chr5 (16-372)||(26736818-26737174)
chr5 (19-349)||(23473189-23473519)
chr5 (16-372)||(21337385-21337741)
chr5 (16-372)||(20466190-20466546)
chr5 (15-373)||(21562115-21562472)
chr5 (15-373)||(24796487-24796845)
chr5 (15-368)||(20823378-20823731)
chr5 (15-371)||(20344204-20344560)
chr5 (15-373)||(14885081-14885439)
chr5 (15-368)||(28893032-28893385)
chr5 (15-368)||(28921858-28922211)
chr5 (37-373)||(22234032-22234368)
chr5 (19-373)||(17267428-17267782)
chr5 (15-373)||(25849995-25850353)
chr5 (15-373)||(37541471-37541829)
chr5 (15-368)||(22463876-22464229)
chr5 (15-317)||(20777889-20778191)
chr5 (15-371)||(22504601-22504957)
chr5 (16-371)||(23507606-23507961)
chr5 (16-371)||(21935279-21935634)
chr5 (16-139)||(24583364-24583487)
chr5 (152-368)||(28914640-28914856)
chr5 (152-368)||(28929908-28930124)
chr5 (37-152)||(21676946-21677061)
chr5 (157-253)||(21679010-21679106)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (15-373)||(16195-16553)
scaffold0044 (16-373)||(2458-2816)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (16-373)||(40190-40547)
scaffold0109 (11-373)||(14031-14394)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (16-373)||(16926997-16927354)
chr2 (16-373)||(17000637-17000994)
chr2 (16-373)||(9485853-9486210)
chr2 (17-373)||(24711671-24712027)
chr2 (16-373)||(44384019-44384376)
chr2 (16-373)||(9337219-9337576)
chr2 (16-373)||(21143490-21143847)
chr2 (16-373)||(27219653-27220010)
chr2 (16-373)||(10870487-10870844)
chr2 (16-373)||(41606834-41607191)
chr2 (15-373)||(24677126-24677484)
chr2 (16-373)||(24264007-24264364)
chr2 (16-373)||(27372906-27373263)
chr2 (49-373)||(23189555-23189879)
chr2 (16-373)||(24875199-24875556)
chr2 (16-373)||(21323715-21324072)
chr2 (16-373)||(24705931-24706288)
chr2 (16-373)||(23106177-23106534)
chr2 (19-373)||(22734226-22734580)
chr2 (16-342)||(23073531-23073857)
chr2 (16-372)||(24818679-24819035)
chr2 (37-373)||(23112373-23112712)
chr2 (15-373)||(1065388-1065746)
chr2 (15-371)||(19650498-19650854)
chr2 (15-362)||(23098466-23098813)
chr2 (15-272)||(25255657-25255914)
chr2 (19-371)||(12575992-12576344)
chr2 (15-373)||(31832295-31832653)
chr2 (19-355)||(27789395-27789731)
chr2 (15-369)||(23278417-23278771)
chr2 (15-371)||(19717465-19717821)
chr2 (37-372)||(30010654-30010989)
chr2 (37-343)||(30209387-30209693)
chr2 (295-373)||(22323584-22323662)
chr2 (49-114)||(23611069-23611134)
chr2 (97-369)||(24950231-24950503)
chr2 (19-122)||(22279993-22280096)
chr2 (16-123)||(24829637-24829744)
chr2 (197-368)||(27208802-27208973)
chr2 (16-146)||(25130473-25130603)
chr2 (295-373)||(25264691-25264769)
chr2 (37-146)||(22760039-22760148)
chr2 (15-51)||(23204273-23204309)
chr2 (16-146)||(24568117-24568247)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (15-373)||(15267-15625)
chr7 (16-373)||(10872685-10873042)
chr7 (16-373)||(11235131-11235488)
chr7 (16-373)||(14334391-14334748)
chr7 (16-373)||(15158975-15159332)
chr7 (16-373)||(44789269-44789626)
chr7 (16-373)||(11551020-11551377)
chr7 (16-373)||(14956549-14956906)
chr7 (16-373)||(12689497-12689854)
chr7 (16-373)||(13688036-13688393)
chr7 (16-373)||(8709600-8709957)
chr7 (16-373)||(18179740-18180097)
chr7 (16-362)||(18588089-18588435)
chr7 (15-253)||(9590483-9590721)
chr7 (15-373)||(15146801-15147160)
chr7 (19-373)||(14041690-14042044)
chr7 (19-373)||(14351720-14352074)
chr7 (16-372)||(48813170-48813526)
chr7 (15-373)||(15100498-15100856)
chr7 (15-373)||(26116485-26116843)
chr7 (15-371)||(13966563-13966919)
chr7 (15-373)||(26092693-26093051)
chr7 (37-373)||(12204717-12205053)
chr7 (19-371)||(14139677-14140029)
chr7 (37-372)||(15626521-15626856)
chr7 (37-371)||(16948389-16948723)
chr7 (15-371)||(13675450-13675806)
chr7 (19-371)||(23503769-23504121)
chr7 (15-373)||(49154297-49154655)
chr7 (15-371)||(13023355-13023711)
chr7 (37-373)||(14262162-14262497)
chr7 (15-362)||(11386324-11386671)
chr7 (15-371)||(12458638-12458994)
chr7 (15-373)||(11301108-11301466)
chr7 (37-373)||(19149207-19149541)
chr7 (19-371)||(18051852-18052204)
chr7 (37-373)||(20748606-20748940)
chr7 (45-373)||(16070222-16070548)
chr7 (15-371)||(15342429-15342785)
chr7 (16-371)||(7825897-7826252)
chr7 (16-371)||(27105692-27106047)
chr7 (16-371)||(27172278-27172633)
chr7 (15-253)||(19614791-19615029)
chr7 (16-122)||(11770320-11770426)
chr7 (15-75)||(16727300-16727360)
chr7 (15-75)||(17704372-17704432)
chr7 (16-139)||(4442157-4442280)
chr7 (295-373)||(11770438-11770516)
chr7 (15-253)||(14284271-14284509)
chr7 (16-146)||(13379105-13379235)
chr7 (17-146)||(17925872-17926001)
chr7 (162-344)||(39210-39392)
chr7 (16-146)||(13458257-13458387)
chr7 (20-137)||(15716825-15716942)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (15-373)||(58052-58410)
scaffold0017 (13-373)||(17975-18335)
scaffold0017 (61-373)||(195444-195756)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (16-373)||(8975-9332)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (16-373)||(28261251-28261608)
chr6 (16-373)||(28284308-28284665)
chr6 (16-373)||(28340000-28340357)
chr6 (16-373)||(22828409-22828766)
chr6 (17-373)||(16961537-16961893)
chr6 (16-373)||(2872857-2873214)
chr6 (17-373)||(24293837-24294193)
chr6 (16-373)||(27189306-27189663)
chr6 (16-373)||(27259577-27259934)
chr6 (15-373)||(16925692-16926049)
chr6 (15-373)||(19866557-19866915)
chr6 (15-373)||(27563886-27564244)
chr6 (16-373)||(25114422-25114779)
chr6 (15-373)||(22435739-22436097)
chr6 (15-373)||(5837272-5837630)
chr6 (31-373)||(25763297-25763639)
chr6 (16-373)||(20633994-20634351)
chr6 (11-357)||(22760504-22760850)
chr6 (19-373)||(25607918-25608272)
chr6 (16-373)||(18405998-18406355)
chr6 (97-373)||(22444137-22444413)
chr6 (16-253)||(16573880-16574117)
chr6 (16-253)||(16621263-16621500)
chr6 (17-247)||(18183422-18183652)
chr6 (152-372)||(23080340-23080560)
chr6 (16-372)||(23085825-23086181)
chr6 (15-174)||(21755002-21755160)
chr6 (16-251)||(18963142-18963377)
chr6 (15-371)||(10466902-10467258)
chr6 (16-368)||(15461211-15461563)
chr6 (37-371)||(14377991-14378325)
chr6 (37-371)||(14379541-14379875)
chr6 (15-373)||(24366282-24366640)
chr6 (19-371)||(28280870-28281222)
chr6 (15-221)||(24516461-24516667)
chr6 (15-373)||(25769714-25770072)
chr6 (16-170)||(30679061-30679215)
chr6 (15-369)||(19436876-19437230)
chr6 (15-371)||(19454896-19455251)
chr6 (16-371)||(16380427-16380782)
chr6 (16-371)||(16648023-16648378)
chr6 (40-371)||(19881170-19881501)
chr6 (16-139)||(23998352-23998475)
chr6 (15-258)||(34643639-34643882)
chr6 (15-373)||(21473471-21473828)
chr6 (17-282)||(21568046-21568311)
chr6 (37-253)||(18796680-18796896)
chr6 (16-146)||(1646868-1646998)
chr6 (15-140)||(8761805-8761930)
chr6 (16-146)||(14130566-14130696)
chr6 (16-146)||(16100112-16100242)
chr6 (16-146)||(23025800-23025930)
chr6 (16-93)||(23080573-23080650)
chr6 (16-54)||(28311819-28311857)
chr6 (255-372)||(18196026-18196143)
chr6 (15-51)||(23496245-23496281)
chr6 (44-167)||(18450579-18450702)
chr6 (208-373)||(19487528-19487683)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (16-373)||(107723-108080)
scaffold0029 (15-253)||(94805-95043)
scaffold0029 (13-258)||(114711-114956)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (15-373)||(37731-38089)
scaffold0042 (16-372)||(22743-23099)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (16-373)||(9403-9760)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (15-373)||(35533-35891)
scaffold0079 (101-287)||(28222-28408)
scaffold0079 (15-373)||(2753-3111)
scaffold0079 (11-81)||(28405-28475)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (19-373)||(10511-10865)
scaffold0028 (19-373)||(16973-17327)
scaffold0028 (20-371)||(45190-45541)
scaffold0028 (37-253)||(48447-48663)
[»] scaffold0008 (5 HSPs)
scaffold0008 (17-373)||(85709-86065)
scaffold0008 (16-373)||(85142-85499)
scaffold0008 (16-158)||(132401-132543)
scaffold0008 (15-146)||(26031-26162)
scaffold0008 (329-370)||(25866-25907)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (16-359)||(21296-21639)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (15-373)||(54902-55260)
scaffold0031 (17-371)||(109669-110023)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (17-373)||(51258-51614)
scaffold0102 (15-373)||(41733-42091)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (16-357)||(16694-17035)
scaffold0309 (37-373)||(11830-12167)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (19-373)||(36063-36417)
scaffold0081 (19-373)||(20639-20993)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (16-373)||(151147-151504)
scaffold0023 (16-358)||(2417-2759)
scaffold0023 (100-372)||(86807-87078)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (16-373)||(24857-25214)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (16-373)||(7571-7928)
scaffold0647 (16-372)||(2937-3293)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (93-373)||(8051-8331)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (17-373)||(803-1157)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (16-373)||(8409-8765)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (16-373)||(8086-8443)
scaffold0358 (16-373)||(17282-17639)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (16-373)||(96-453)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (16-373)||(18253-18610)
scaffold0114 (11-282)||(22002-22273)
scaffold0114 (19-159)||(39307-39447)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (17-373)||(3618-3974)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (16-357)||(3485-3826)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (16-373)||(691-1045)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (16-373)||(20275-20632)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (16-373)||(725-1078)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (127-373)||(23097-23343)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (17-287)||(29828-30098)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (16-373)||(8057-8414)
scaffold0120 (16-146)||(24440-24570)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (16-373)||(7258-7615)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (16-373)||(1294-1651)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (16-373)||(40669-41026)
scaffold0022 (16-373)||(74389-74746)
scaffold0022 (37-373)||(55792-56128)
scaffold0022 (16-137)||(8738-8859)
scaffold0022 (293-371)||(9015-9093)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (38-373)||(1-336)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (68-373)||(28446-28732)
scaffold0215 (307-373)||(28774-28840)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (16-373)||(6999-7356)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (16-373)||(24445-24802)
scaffold0011 (15-371)||(150608-150964)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (19-372)||(14394-14747)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (16-373)||(2636-2993)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (16-373)||(13123-13480)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (28-372)||(3952-4296)
scaffold0010 (15-373)||(40244-40602)
scaffold0010 (19-253)||(45342-45576)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (81-373)||(30982-31274)
scaffold0026 (37-373)||(50847-51183)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (16-237)||(15906-16128)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (17-372)||(103271-103618)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (16-372)||(495056-495412)
scaffold0001 (37-371)||(453146-453480)
scaffold0001 (15-373)||(515264-515622)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (16-373)||(16914-17270)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (130-373)||(4231-4474)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (127-373)||(6354-6600)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (18-372)||(15135-15489)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (16-373)||(17691-18042)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (28-373)||(488-832)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (19-236)||(1-218)
scaffold0149 (15-373)||(5262-5619)
scaffold0149 (15-373)||(9693-10050)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (16-372)||(10653-11009)
scaffold0018 (16-372)||(24210-24566)
scaffold0018 (129-372)||(16958-17201)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (37-372)||(14506-14841)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (17-372)||(5150-5504)
scaffold0074 (45-359)||(11172-11486)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (17-373)||(5908-6264)
scaffold0270 (17-373)||(13038-13394)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (62-292)||(10284-10514)
scaffold0476 (55-253)||(1496-1694)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (15-289)||(1-275)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (19-372)||(217335-217688)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (171-373)||(407-609)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (19-184)||(8657-8822)
scaffold0560 (178-239)||(10914-10975)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (16-373)||(15890-16246)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (15-371)||(24253-24609)
scaffold0104 (37-371)||(44350-44684)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (28-372)||(8958-9302)
scaffold0083 (28-118)||(1324-1414)
scaffold0083 (28-118)||(6628-6718)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (15-373)||(10865-11223)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (15-373)||(250657-251015)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (15-373)||(201379-201737)
scaffold0004 (45-369)||(324745-325069)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (19-372)||(5804-6157)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (16-373)||(28659-29016)
scaffold0067 (37-373)||(50113-50449)
scaffold0067 (37-373)||(59147-59483)
scaffold0067 (37-373)||(65535-65871)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (15-371)||(9969-10324)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (43-371)||(2892-3220)
scaffold0034 (15-332)||(69448-69765)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (15-373)||(2183-2541)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (15-373)||(29196-29554)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (15-368)||(25155-25508)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (15-371)||(19545-19901)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (15-373)||(1906-2264)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (37-253)||(19509-19725)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (37-373)||(49141-49477)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (16-371)||(4788-5143)
scaffold0035 (16-372)||(42019-42375)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (37-371)||(31252-31586)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (15-371)||(766-1121)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (37-373)||(16149-16485)
scaffold0266 (11-139)||(7768-7896)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (15-253)||(657-895)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (15-368)||(268650-269003)
scaffold0007 (16-372)||(84432-84787)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (15-371)||(266-621)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (253-373)||(7842-7962)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (15-362)||(37696-38043)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (17-372)||(22099-22453)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (15-369)||(99473-99827)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (37-373)||(4213-4552)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (15-362)||(33382-33730)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (37-373)||(49808-50144)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (16-221)||(114950-115155)
scaffold0037 (295-372)||(115172-115249)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (37-373)||(5022-5358)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (15-371)||(13247-13603)
scaffold0261 (15-371)||(21426-21782)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (37-373)||(176277-176613)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (15-362)||(79742-80089)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (15-249)||(1400-1634)
scaffold0222 (15-371)||(9100-9456)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (15-221)||(54322-54528)
scaffold0076 (15-253)||(31588-31826)
scaffold0076 (16-139)||(42529-42652)
scaffold0076 (292-371)||(42297-42376)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (256-369)||(44795-44908)
scaffold0130 (37-170)||(4822-4955)
scaffold0130 (184-373)||(8888-9077)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (15-369)||(14241-14601)
scaffold0124 (16-139)||(5718-5841)
scaffold0124 (292-371)||(5996-6075)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (15-371)||(10697-11053)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (43-371)||(1036-1364)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (15-371)||(21159-21515)
scaffold0058 (16-372)||(27160-27516)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (15-373)||(682-1038)
scaffold0420 (15-215)||(7809-8007)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (13-134)||(11067-11189)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (37-258)||(520-741)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (15-371)||(262263-262619)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (15-221)||(18394-18600)
scaffold0348 (61-253)||(9831-10023)
scaffold0348 (15-101)||(5760-5846)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (15-369)||(42958-43311)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (37-373)||(1418-1754)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (37-373)||(28562-28898)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (37-253)||(46967-47183)
scaffold0053 (37-371)||(55780-56114)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (226-373)||(38070-38217)
scaffold0122 (16-81)||(41417-41482)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (70-371)||(6789-7090)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (15-272)||(9372-9629)
scaffold0235 (15-272)||(19586-19843)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (15-253)||(21006-21244)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (15-369)||(53086-53440)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (15-83)||(12267-12335)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (15-311)||(29031-29327)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (16-371)||(25433-25788)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (16-371)||(14947-15302)
scaffold0162 (19-146)||(11089-11216)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (37-167)||(11201-11331)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (37-373)||(64452-64777)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (15-371)||(991-1347)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (16-371)||(34124-34479)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (17-371)||(747-1101)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (15-368)||(6056-6409)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (181-373)||(14790-14982)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (298-373)||(1089-1164)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (307-373)||(3556-3622)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (17-146)||(859-988)
scaffold0876 (292-371)||(1134-1213)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (155-372)||(1900-2117)
[»] scaffold0302 (4 HSPs)
scaffold0302 (15-139)||(482-606)
scaffold0302 (15-139)||(7424-7548)
scaffold0302 (292-371)||(250-329)
scaffold0302 (292-371)||(7192-7271)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (16-146)||(715-845)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (17-139)||(1797-1919)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (17-123)||(16345-16451)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (16-146)||(13537-13667)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (17-122)||(1865-1970)
scaffold0218 (16-116)||(26621-26721)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (142-258)||(39-155)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (19-139)||(7015-7135)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (16-118)||(1533-1635)
scaffold0467 (292-371)||(1809-1888)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (37-146)||(89764-89873)
scaffold0021 (16-120)||(7445-7549)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (154-369)||(12349-12564)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (16-146)||(6917-7047)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (15-92)||(9865-9942)
scaffold0146 (15-92)||(17532-17609)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (16-83)||(4838-4905)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (16-139)||(7152-7275)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (16-122)||(380-486)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (208-373)||(44820-44985)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (241-373)||(8920-9052)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (232-371)||(1033-1172)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (15-50)||(2838-2873)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (163-249)||(1748-1834)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (37-81)||(2267-2311)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (345-373)||(9262-9290)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (265-373)||(33914-34022)


Alignment Details
Target: scaffold0080 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 11150 - 11508
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11150 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 11249  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 11349  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11350 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatatttt 11449  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 11508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31273 - 30919
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  31273 ttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatatgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattaatttga 31174  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  31173 gattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcga 31074  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  31073 tgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcatcgaagatattttaatt 30974  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30973 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgt 30919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36739 - 36385
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  36739 ttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattaatttga 36640  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36639 gattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcga 36540  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  36539 tgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgatgatatttttatt 36440  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36439 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgt 36385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54029 - 53672
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54029 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 53930  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  53929 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttctgaacacggtatggtccctatgagtacaaagttatgccttt 53830  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |  || |||||||||    
T  53829 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttg 53730  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  53729 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 53672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Original strand, 13805 - 13891
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13805 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttt 13891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 241 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50259 - 50127
Alignment:
Q  241 tttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaac 340  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50259 tttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 50160  T
Q  341 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  50159 atgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 50127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 30311495 - 30311853
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311495 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 30311594  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311595 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 30311694  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  30311695 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtgtttattgacgatatttt 30311794  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311795 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 30311853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15535813 - 15535455
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535813 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 15535714  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535713 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagttatcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15535614  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15535613 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 15535514  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535513 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 15535455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22042257 - 22041902
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22042257 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgat 22042158  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042157 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 22042058  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22042057 tcggtgtgaccaattcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatatttt 22041958  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaag 370  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22041957 gatgtactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaag 22041902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32602575 - 32602217
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602575 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagagggtgcaaaagttttcagcaagattgat 32602476  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602475 ttgagatcagggtatcaccagattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 32602376  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  32602375 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatatttt 32602276  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602275 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 32602217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 17672375 - 17672732
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17672375 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17672474  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672475 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17672574  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17672575 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 17672674  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17672675 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 17672732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 22131392 - 22131750
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131392 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 22131491  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131492 ttgagaacagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcctt 22131591  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  22131592 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgatatttt 22131691  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22131692 gatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgt 22131750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 20016615 - 20016972
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20016615 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 20016714  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016715 tgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 20016814  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  20016815 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 20016914  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20016915 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 20016972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18859006 - 18858649
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  18859006 cagtggaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 18858907  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858906 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 18858807  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  18858806 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttg 18858707  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18858706 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 18858649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 22118527 - 22118884
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  22118527 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22118626  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22118627 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttt 22118726  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22118727 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 22118826  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22118827 atttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 22118884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 22127311 - 22127668
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  22127311 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22127410  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22127411 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttt 22127510  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22127511 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 22127610  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22127611 atttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 22127668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 21164889 - 21165247
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  21164889 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcattttcagcaagattgat 21164988  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21164989 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 21165088  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||| | ||||||||    
T  21165089 tcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattcttggatcgattcgtggttgtttttatctatgatatttt 21165188  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21165189 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 21165247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19980397 - 19980039
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19980397 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 19980298  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980297 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgtagaagacaactttcagaacactgtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 19980198  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  19980197 ttggtgttaccaatgcgcctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatatttt 19980098  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19980097 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagaatctgaagattgtcttgcaagtgt 19980039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 19482424 - 19482773
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19482424 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattga--------tggatcagttagtgggtgcgcgagttttcagcaagattgatt 19482515  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19482516 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 19482615  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19482616 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 19482715  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  19482716 atttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgt 19482773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21253373 - 21253032
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21253373 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21253274  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21253273 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21253174  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||    
T  21253173 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgaggttgtttttatcgatgatattttg 21253074  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaag 357  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21253073 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaag 21253032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 21392213 - 21392570
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21392213 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21392312  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21392313 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21392412  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  21392413 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21392512  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  21392513 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 21392570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 21782772 - 21783129
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21782772 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21782871  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21782872 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21782971  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  21782972 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21783071  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  21783072 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 21783129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 21786707 - 21787064
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21786707 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21786806  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21786807 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21786906  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  21786907 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21787006  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  21787007 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 21787064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23652449 - 23652113
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  23652449 aagaataggtatctacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttaagatcaggttatcaccaga 23652350  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23652349 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttggtgttacaaatgcacctgg 23652250  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  23652249 tgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatactttgatttactccaagactgaagag 23652150  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  23652149 gaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgt 23652113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 19864446 - 19864785
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19864446 agttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctaaatttttcagcaagatagattt 19864545  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19864546 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaatatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtagaaagttatgcctttc 19864645  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | || || || || || ||||||||||    
T  19864646 ggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatctcatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatgatattttga 19864745  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaa 356  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  19864746 tttactctaagtctgaagaagaacatattgagcatttgaa 19864785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 22422244 - 22422601
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |    
T  22422244 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtattcacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 22422343  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  22422344 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 22422443  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||    
T  22422444 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttg 22422543  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22422544 atttactccaagtccgaagaagaacatgttgaacatttgaagattgttttgcaagtgt 22422601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 22375806 - 22376161
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  22375806 agttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgattt 22375905  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  22375906 gagatcgggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattattaatataaagtgatgcctttc 22376005  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
     |  | || |||||||| || |||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |    
T  22376006 agcattacaaatgcaccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttta 22376105  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22376106 tatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 22376161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 372
Target Start/End: Original strand, 22246788 - 22247141
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  22246788 ttgaataaggtaacgataaagaatgggtatccacttccaagaattgatgctttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaagattgatttga 22246887  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  22246888 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 22246987  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| | |||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||     
T  22246988 tgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcctgcgtttttggatcgtttcatggttgtgttcatcgacgatattttgata 22247087  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  22247088 tactccaagattgaaggagaacatgttgagcatttgtagattgttttgcaagtg 22247141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 31414820 - 31415178
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  31414820 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgac 31414919  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  31414920 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 31415019  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  31415020 tcggtgttactaatgcgcctggggtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 31415119  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31415120 gatttattctaagaccgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgt 31415178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 101 - 373
Target Start/End: Original strand, 21920185 - 21920457
Alignment:
Q  101 tcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 200  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  21920185 tcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagta 21920284  T
Q  201 taaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgttt 300  Q
    ||| || ||| | |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| | |||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||    
T  21920285 taaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacatggagtatttatggagtacatgaattgtatctttcaagcatttttggatcggttcgtggttgttttt 21920384  T
Q  301 atcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  21920385 attgatgatattttgatttacttcaagactgaagaagaatatgctgagcatttgaagttagttttgcaagtgt 21920457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22522975 - 22522711
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || |||||||||||||    
T  22522975 cagttgaacaaagtaacgataaagaacaggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgatt 22522876  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||||||    
T  22522875 tgagatcgggttatcaccagaataaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagtataaagtgatgccttt 22522776  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttgg 280  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||    
T  22522775 cggtgttacaaatgcgccaggagtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttgg 22522711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 21781539 - 21781691
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21781539 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21781638  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaca 168  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21781639 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagaca 21781691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23657353 - 23657001
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23657353 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttcgtaggtgcaaaagttttcagcaagattgacttga 23657254  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  23657253 ggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcgg 23657154  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   ||  | || || ||||| || |||||| | ||     
T  23657153 tgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctaata 23657054  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  23657053 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 23657001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22989472 - 22989274
Alignment:
Q  18 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttg 117  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||    
T  22989472 gttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttagtggctgcaagtgtgtttagcaagattgatttg 22989373  T
Q  118 agatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  22989372 agatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagctttcagaacgcgttatgggtattatgaatataaagtgatgcctttc 22989274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 21323630 - 21323984
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  21323630 tcagttgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 21323729  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || || || || || |||||||    
T  21323730 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaatgtgatgcctt 21323829  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || ||||||||||| || ||| |    
T  21323830 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttatcgatgacattct 21323929  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    ||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  21323930 gatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaa 21323984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 16269575 - 16269933
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  16269575 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 16269674  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  16269675 ttgaggtctagttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 16269774  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || || ||||| ||    
T  16269775 tcggtgttactaacgggcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttcattgatgatatctt 16269874  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  16269875 gatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgt 16269933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 29301777 - 29302135
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||| || |||||     
T  29301777 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgatctgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgac 29301876  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  29301877 ttgaggtcgggttatcactagattaaggtgaaagatgagaatatgcagaagacggcattcagaacacgttatgggcattatgagtataaggtgatgcctt 29301976  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | |||  | || || |||||||| || |||| ||| || ||||| ||||| || || ||| |    
T  29301977 ttggtgttacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggtatttattgatgacattct 29302076  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||| ||||| || ||| ||||||| || ||  |||||||||| || |||||||    
T  29302077 gatttactctaagaccgaagaataacatgcagaacacttgaagattgtgttacaagtgt 29302135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 369
Target Start/End: Original strand, 20008294 - 20008626
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||| ||| | || || ||||    
T  20008294 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcaattagtgggtgcacgcgtgttcagtaagattgatttgagctcaggttaccatcaga 20008393  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20008394 ttaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20008493  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||  || |||||  | ||||| || |||| ||| |||    
T  20008494 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaa 20008593  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  20008594 gagcatgcagagcatatgaagattgtgttgcaa 20008626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23887457 - 23887097
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  23887457 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcgaagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 23887358  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| |   | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || || |||||||| || || || |||  ||| ||||||||    
T  23887357 tgaggttgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacattacgagtattcagtgatgccttt 23887258  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || |  |||||||||||||| | |||||  || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  23887257 cggtgttactaatgcgccagatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 23887158  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaac----atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| ||| || | |||||||    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23887157 atatactctaagtctaaagaagaacatgtatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtg 23887097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28983341 - 28982983
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  28983341 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 28983242  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    |||||  |  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28983241 ttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 28983142  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || |||||| |    
T  28983141 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattct 28983042  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||    
T  28983041 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgt 28982983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28988560 - 28988202
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  28988560 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 28988461  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    |||||  |  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28988460 ttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 28988361  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || |||||| |    
T  28988360 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattct 28988261  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||    
T  28988260 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgt 28988202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21927836 - 21927499
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    || ||||| || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  21927836 aagaataggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 21927737  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||  | || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  21927736 ttaaggtgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgcctgg 21927637  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  21927636 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 21927537  T
Q  337 gaaca-tgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21927536 gagcattgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgt 21927499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4984472 - 4984114
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  4984472 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaagtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 4984373  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4984372 ttgaggtctggttatcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 4984273  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| | |||  ||| || |||||||| ||  | ||||  ||    
T  4984272 tcggtgtaactaaagcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattaatgatacctt 4984173  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||  || || ||||||||||    
T  4984172 gatttattccaagaacgaggaagagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgt 4984114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 372
Target Start/End: Original strand, 20394488 - 20394841
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || || |  |||||||||||||    
T  20394488 ttgaacaaagtgacaataaagaatagggatccacttctaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttattaagattgatttga 20394587  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   | | ||||||||  |    
T  20394588 gatcgggctatcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcaatgatgccttttag 20394687  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||  || |||||||| || || |||||||| || | |||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || ||||||||||||||     
T  20394688 tgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgctttgttgttgtgttcattgacgatattttgata 20394787  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  20394788 tactctaagtctgaagaagaacatgccgagcatttgaagattgttttgcaagtg 20394841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27356966 - 27356610
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  27356966 tcagttgaacaaagtttcgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 27356867  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||  | ||  | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  27356866 ttgagatctggttactatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 27356767  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  27356766 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 27356667  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  27356666 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagt 27356610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 31569198 - 31569533
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  31569198 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 31569297  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31569298 ggtca-gttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 31569396  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  31569397 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 31569496  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctga 355  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  31569497 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctga 31569533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22053293 - 22052937
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||  ||||||  ||||||||     
T  22053293 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgagaattgatgacttgatggatcagctggttggtgcaaagattttcaataagattgac 22053194  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||  | || |||||||    
T  22053193 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaataccaggtgatgcctt 22053094  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || |  || || || || |||||  |    
T  22053093 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtgggtgtattcattgatgatatcct 22052994  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  22052993 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagt 22052937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6606005 - 6605730
Alignment:
Q  98 ttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 197  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  6606005 ttttcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 6605906  T
Q  198 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtg 297  Q
     || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||     
T  6605905 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggta 6605806  T
Q  298 tttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  6605805 tttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaggtgt 6605730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19984588 - 19984404
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||| || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  19984588 aagaataggtatccacttctgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 19984489  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 221  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  19984488 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaataaaaggtgatgcctttcggtgt 19984404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19861834 - 19861507
Alignment:
Q  46 tatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtga 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || ||||   | ||| ||||||| ||| | || || |||||||| ||||    
T  19861834 tatcgacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtggtcgtgtgttcatgtaaattaatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 19861735  T
Q  146 aagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttat 245  Q
    | |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  19861734 aggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttat 19861635  T
Q  246 ggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgct 345  Q
    | |||||| |||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || |||| ||| |||||||||||     
T  19861634 gaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagaacatgca 19861535  T
Q  346 gagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19861534 gagcatctgaagattgagttgcaagtgt 19861507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 22061030 - 22061245
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22061030 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttcccaggattgatgacttaatgaatcagttggtgggtgcaaaagttttcagtaagattgac 22061129  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || || || || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22061130 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggaaatgcagaagaaggcctttaggacacgatatggtcattatgaatacaaggtgatgcctt 22061229  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgc 230  Q
    ||||||| || |||||    
T  22061230 tcggtgttactaatgc 22061245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20390516 - 20390310
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || || ||||||||||||    
T  20390516 tcagttgaataaagtgacgataaataataggtatccacttccgagaattgatgattttatggatcagttagtgggttcacgtgtgtttagcaagattgat 20390417  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||  |||||||||| ||| |||    
T  20390416 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacaaatataaagtgatgtctt 20390317  T
Q  215 tcggtgt 221  Q
    |||||||    
T  20390316 tcggtgt 20390310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22988964 - 22988803
Alignment:
Q  211 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 310  Q
    ||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||| || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  22988964 cctttcggtgtcaccaatacgccacgtgtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgata 22988865  T
Q  311 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22988864 ttttgatatattccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 22988803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22030533 - 22030470
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggat 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22030533 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggat 22030470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19114836 - 19114762
Alignment:
Q  299 ttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19114836 ttatcgacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 19114762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 16875447 - 16875802
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  16875447 cagttgaacaaggtgacgattaagaattggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16875546  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16875547 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16875646  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  16875647 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16875746  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  16875747 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 16875802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 23155394 - 23155524
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| || || ||||||||||    
T  23155394 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgatt 23155493  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  23155494 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 23155524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 20650707 - 20650814
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  20650707 cagttgaacaaggtgacaattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 20650806  T
Q  116 tgagatca 123  Q
    ||||||||    
T  20650807 tgagatca 20650814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 21848689 - 21848812
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  21848689 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccatttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21848788  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  21848789 tgagatcaggatatcatcagatta 21848812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22373298 - 22373168
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  22373298 tcagttgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgat 22373199  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtga 145  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||    
T  22373198 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 22373168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14567445 - 14567214
Alignment:
Q  142 gtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgt 241  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |    
T  14567445 gtgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgttt 14567346  T
Q  242 ttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaaca 341  Q
    |||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||    
T  14567345 ttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagca 14567246  T
Q  342 tgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||  |||| || || || || ||||||||||    
T  14567245 tgcaaagcacctaaaaatagtgttgcaagtgt 14567214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16414520 - 16414413
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  16414520 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16414421  T
Q  116 tgagatca 123  Q
    ||||||||    
T  16414420 tgagatca 16414413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22436732 - 22436590
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| | | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  22436732 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttatgaggattgatgatttgatggatcggctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 22436633  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatat 158  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||||  ||||||||    
T  22436632 tgagatcaggatatcatcatattagagtgaaagcggaagatat 22436590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23902593 - 23902487
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  23902593 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcagtatccgcttctgaggattgatgatttaatggatcagctggttggtgcggaagtgttcagtaagattgatt 23902494  T
Q  116 tgagatc 122  Q
    |||||||    
T  23902493 tgagatc 23902487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20390279 - 20390171
Alignment:
Q  265 ttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtct 364  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| |    
T  20390279 ttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcatttaaagattgtgt 20390180  T
Q  365 tgcaagtgt 373  Q
    |||||||||    
T  20390179 tgcaagtgt 20390171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 21194892 - 21194999
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  21194892 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttaatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21194991  T
Q  116 tgagatca 123  Q
    | ||||||    
T  21194992 tcagatca 21194999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 24932176 - 24932283
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  24932176 cagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaatgattgatgatttgatggatcagctggtcggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24932275  T
Q  116 tgagatca 123  Q
    ||||||||    
T  24932276 tgagatca 24932283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19869976 - 19869885
Alignment:
Q  162 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  19869976 gaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcagtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtgtttatggagtata 19869885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Original strand, 21848965 - 21849044
Alignment:
Q  292 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||||| || || ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21848965 gtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 21849044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 18225094 - 18225452
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225094 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 18225193  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225194 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 18225293  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18225294 tcggtgtgaccaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgacatttt 18225393  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225394 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 18225452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8388775 - 8388418
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8388775 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 8388676  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388675 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8388576  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8388575 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatatttta 8388476  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8388475 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 8388418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 8051272 - 8051629
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8051272 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 8051371  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051372 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8051471  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8051472 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 8051571  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8051572 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 8051629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27713699 - 27713342
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27713699 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgggtcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27713600  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713599 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27713500  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27713499 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27713400  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27713399 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 27713342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 14301628 - 14301985
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14301628 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 14301727  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301728 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14301827  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  14301828 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 14301927  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14301928 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 14301985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 17092798 - 17093155
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17092798 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17092897  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092898 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17092997  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17092998 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 17093097  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17093098 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 17093155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23958110 - 23957753
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  23958110 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 23958011  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958010 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 23957911  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  23957910 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 23957811  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23957810 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 23957753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12478963 - 12478606
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12478963 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 12478864  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478863 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12478764  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12478763 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 12478664  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12478663 atttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 12478606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14682930 - 14682573
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  14682930 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatc 14682831  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14682830 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgacgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaggttatgccttt 14682731  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14682730 tggtgttaccaatgcacctggagagtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 14682631  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682630 atttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 14682573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 16234641 - 16234998
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16234641 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16234740  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234741 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16234840  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16234841 tggagttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 16234940  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16234941 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 16234998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 19776442 - 19776799
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19776442 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 19776541  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776542 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 19776641  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19776642 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 19776741  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19776742 atttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 19776799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40475403 - 40475046
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  40475403 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 40475304  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475303 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40475204  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  40475203 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgatgatattttg 40475104  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40475103 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 40475046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 15145541 - 15145891
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  15145541 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattga--------tggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaacattgat 15145632  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15145633 ttgagatcgggttatcactagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15145732  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  15145733 tcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgatgatatttt 15145832  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15145833 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaacattgtcttgcaagtgt 15145891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 101 - 373
Target Start/End: Original strand, 16353241 - 16353513
Alignment:
Q  101 tcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353241 tcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 16353340  T
Q  201 taaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgttt 300  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |     
T  16353341 caaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctc 16353440  T
Q  301 atcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353441 atcgatgatattttaatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 16353513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 14849015 - 14849371
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || |||||| ||||||    
T  14849015 cagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaaaaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgcgtgtatttagcaaggttgatt 14849114  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  14849115 tgagatcgggttatcaccaaattaaagtgagagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagagatgccttt 14849214  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  14849215 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 14849314  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14849315 atatactccaagtccgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtg 14849371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16218592 - 16218325
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||   || || ||||||||||| ||    
T  16218592 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgactt 16218493  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16218492 gaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttc 16218393  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 284  Q
    ||||| || ||||   | || |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16218392 ggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcg 16218325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16221912 - 16221645
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||   || || ||||||||||| ||    
T  16221912 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgactt 16221813  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16221812 gaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttc 16221713  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 284  Q
    ||||| || ||||   | || |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16221712 ggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcg 16221645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 44659774 - 44660132
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  44659774 tcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgctccctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 44659873  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  44659874 ttgaggtcaggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 44659973  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  44659974 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgacgatatttt 44660073  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  44660074 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgt 44660132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 15357028 - 15357384
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15357028 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 15357127  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    || || ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15357128 ttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatacaaggtgatgcctt 15357227  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||  |||||  || || ||||| || || ||| |    
T  15357228 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtatttattgatgacattct 15357327  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  15357328 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagt 15357384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16150075 - 16149721
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  16150075 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 16149976  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  16149975 ttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 16149876  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   || || || |||||||| ||||||||| |    
T  16149875 tcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattct 16149776  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  16149775 gatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaa 16149721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16154221 - 16153867
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  16154221 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 16154122  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  16154121 ttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 16154022  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   || || || |||||||| ||||||||| |    
T  16154021 tcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattct 16153922  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  16153921 gatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaa 16153867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22632067 - 22631910
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  22632067 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 22631968  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttt 173  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22631967 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttt 22631910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14696476 - 14696120
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   || || |||||||||||||    
T  14696476 cagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatctacttccaagaattgatgattttatggatcagttagtgggtgtacgtgtgtttagcaagattgatt 14696377  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||  ||| ||||||||    
T  14696376 tgagatcgggttaacaccaaattaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacattattaatattcagtgatgccttt 14696277  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| || ||||| || || |||||||||||||| | |||    || || ||||| | ||||||| | ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  14696276 tggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaactctatttttcatgcgtatttggattgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttg 14696177  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14696176 atatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 14696120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14161833 - 14161487
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||    
T  14161833 cagttgaacaaggtaacgatacagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgatt 14161734  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| || || |||||  | || ||||||| |  ||| ||||||||    
T  14161733 tgagatcgggttatcaccagattagagtaaagaatgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaattttcagtgatgccttt 14161634  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| |||  | || || ||||| | | |||||  ||||||||| || ||||| || |||||  |     
T  14161633 cggtgtttctaatgcacctggagtatttatggagtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtatttattgatgatatccta 14161534  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgt 362  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14161533 atttattctgagacagaagaagaacatgctgagcatttgaagattgt 14161487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23443467 - 23443237
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||    
T  23443467 agttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgtgtttaccaagattgattt 23443368  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  23443367 gagattgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcataagacaacttttagaacacgttatggacattatgagtataaagtgatgcctttc 23443268  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 248  Q
    ||| | || ||||| || || |||||||||||    
T  23443267 ggt-ttacgaatgcgccaggtgtgtttatgga 23443237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 367
Target Start/End: Original strand, 1647207 - 1647537
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| | || || || |    
T  1647207 aagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 1647306  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1647307 ttaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 1647406  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||| ||     
T  1647407 tgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtattcattgatgatattttgatttattctaagactgaagag 1647506  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 367  Q
    || ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  1647507 gagcatgcagaacacctgaagattgtgttgc 1647537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 3262702 - 3263060
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  3262702 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 3262801  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3262802 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 3262901  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  3262902 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 3263001  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  3263002 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 3263060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 15001273 - 15001631
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||    
T  15001273 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 15001372  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15001373 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 15001472  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||  || ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  15001473 tcggtgatactaatgcgcctgttgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 15001572  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || |||| ||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  15001573 gatttattctaagattgaagaagagcatgcagaacatctgaggattgtgttgcaagtgt 15001631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 29451445 - 29451803
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  29451445 tcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 29451544  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29451545 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 29451644  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  29451645 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatatttt 29451744  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||    
T  29451745 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagatcatctgagaattgtattgcaagtgt 29451803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 51604704 - 51605040
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  51604704 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 51604803  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  51604804 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 51604903  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  51604904 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 51605003  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctga 355  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  51605004 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctga 51605040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 16251498 - 16251602
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251498 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16251597  T
Q  115 ttgag 119  Q
    |||||    
T  16251598 ttgag 16251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27902750 - 27902397
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||| || || |||||     
T  27902750 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaaatggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 27902651  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  27902650 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 27902551  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||  |||||   ||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  27902550 tcggtgttactaaagcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggtatttattgatcatatttt 27902451  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| |||||    
T  27902450 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacacatgaagattgtgttgca 27902397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 11205140 - 11205498
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  | || |||||||||||     
T  11205140 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatctttagcaagattgac 11205239  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  11205240 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 11205339  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  11205340 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 11205439  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||    
T  11205440 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagaacacctgagaattgtattgcaagtgt 11205498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15072701 - 15072365
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||| | || || || |    
T  15072701 aagaacagatatccacttccgataattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaa 15072602  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || || || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15072601 ttaaggtgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 15072502  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||| | |||| |  | |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || |||| |||  ||    
T  15072501 tgtgtttatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaataa 15072402  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15072401 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgt 15072365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8708271 - 8707917
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || || ||    |||    
T  8708271 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagtaa----gat 8708176  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || |||||||| ||||||||||||||| |||| || || || || || || ||||| || || ||||||  ||| |||||||    
T  8708175 ttgaggtcgggttaccatcatattaaagtaaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctt 8708076  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || |  || |||||||||||||| | |||| | || |||||||| | |||||||||||| || || |||||||| || || || ||    
T  8708075 tcggtgttactaacgcgcggggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatctt 8707976  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||||  |||  |||| ||||||||||    
T  8707975 gatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcattagaaagttgtgttgcaagtgt 8707917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15258290 - 15257936
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    || || ||||||||||| |    
T  15258290 cagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgatta-atcgatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgact 15258192  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  15258191 tgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccttt 15258092  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| || || |||||||| | | || ||   || || || |||||||| || ||||| |||    
T  15258091 cggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttg 15257992  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    ||||| || | ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15257991 atttattcaaggaccgaagaagagcatgcagagcatctaaagattgtattgcaagt 15257936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 285 - 373
Target Start/End: Original strand, 18613742 - 18613830
Alignment:
Q  285 gttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613742 gttcgtagttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 18613830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Original strand, 16353174 - 16353244
Alignment:
Q  11 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 81  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353174 atcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 16353244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 15291067 - 15291190
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  15291067 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15291166  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  15291167 tgagatcaggatatcatcagatta 15291190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 12340777 - 12340879
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||||||||| || || || ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  12340777 ttgaacaaggtgacgattaacaattggtatccgctcccgaggattgatgatttgatggatcaattggttggtgcagaagtgttcagtaagattgatttaa 12340876  T
Q  119 gat 121  Q
    |||    
T  12340877 gat 12340879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15323385 - 15323223
Alignment:
Q  211 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 310  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || | |||| | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || ||||    
T  15323385 cctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgata 15323286  T
Q  311 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || | ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15323285 ttgtaatttattctaagagtgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgt 15323223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Original strand, 15291343 - 15291422
Alignment:
Q  292 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||||| || || ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15291343 gtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 15291422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 16805094 - 16805452
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805094 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16805193  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805194 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 16805293  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16805294 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 16805393  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805394 gatttactccaagactgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 16805452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 5108759 - 5109116
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5108759 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 5108858  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5108859 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 5108958  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  5108959 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatcttg 5109058  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5109059 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 5109116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16637755 - 16637398
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16637755 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16637656  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16637655 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 16637556  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16637555 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16637456  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16637455 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 16637398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48427429 - 48427072
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48427429 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 48427330  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427329 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 48427230  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48427229 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 48427130  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48427129 atctactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 48427072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 15346393 - 15346750
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15346393 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 15346492  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346493 tgaggtcaggttatcaccagcttaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15346592  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15346593 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15346692  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15346693 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 15346750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6602718 - 6602361
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6602718 cagttgagcaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 6602619  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6602618 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcaaaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 6602519  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6602518 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 6602419  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6602418 atttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgacgattgtcttacaagtgt 6602361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10007582 - 10007225
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10007582 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10007483  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007482 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10007383  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10007382 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 10007283  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10007282 atttactccaagactgaagaagaacattctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 10007225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12888691 - 12888334
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12888691 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 12888592  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888591 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12888492  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  12888491 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtagtgttcatcgatgatattttg 12888392  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12888391 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcacctgaagattgtcttacaagtgt 12888334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13254672 - 13254315
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13254672 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 13254573  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254572 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 13254473  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13254472 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 13254373  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13254372 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 13254315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 15400665 - 15401022
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15400665 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 15400764  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400765 tgaggtcaggttatcaccaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15400864  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  15400865 tggtgttaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 15400964  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15400965 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgt 15401022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 15587540 - 15587897
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15587540 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 15587639  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587640 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15587739  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15587740 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15587839  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15587840 atctactccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 15587897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3687925 - 3687568
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  3687925 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacgagttttcagcaagattgatt 3687826  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687825 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 3687726  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3687725 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 3687626  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3687625 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgt 3687568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 5423078 - 5423435
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5423078 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 5423177  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423178 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 5423277  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  5423278 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttatgttcatcgacgatatcttg 5423377  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5423378 atttactctaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 5423435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10908192 - 10907835
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10908192 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10908093  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908092 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10907993  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10907992 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 10907893  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10907892 atttactccaagactgaagaagaacattttgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 10907835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 20060202 - 20060559
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20060202 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 20060301  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060302 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 20060401  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  20060402 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 20060501  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20060502 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 20060559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 18 - 365
Target Start/End: Original strand, 53383168 - 53383515
Alignment:
Q  18 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttg 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  53383168 gttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatttg 53383267  T
Q  118 agatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcg 217  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53383268 agatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcg 53383367  T
Q  218 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  53383368 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgat 53383467  T
Q  318 ttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtctt 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  53383468 ttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtctt 53383515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16694147 - 16693789
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16694147 tcagttgaataaggtaactatcaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaagtcttcagcaagattgat 16694048  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16694047 ttgagatcaggttatcaccagattaatgtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatataaagttatgccat 16693948  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16693947 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatagacgaaatttt 16693848  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16693847 gatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 16693789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 16754849 - 16755206
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16754849 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16754948  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16754949 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 16755048  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  16755049 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttattgacgatattttg 16755148  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| || |||||||    
T  16755149 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatttgaagattgttttacaagtgt 16755206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 45 - 373
Target Start/End: Original strand, 14874676 - 14875004
Alignment:
Q  45 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  14874676 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagta 14874775  T
Q  145 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 244  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  14874776 aaagacgaagatttgcagaagacatctttcagaacgcggtatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattca 14874875  T
Q  245 tggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 344  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14874876 tggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 14874975  T
Q  345 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874976 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 14875004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17491829 - 17491475
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  17491829 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgattatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatttga 17491730  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |    
T  17491729 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcag 17491630  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  17491629 tgttacaaatgcacctggagtatttatgaagtacatgaatcgcatctttcattcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatt 17491530  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  17491529 tactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 17491475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 104 - 373
Target Start/End: Original strand, 15723170 - 15723439
Alignment:
Q  104 gcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 203  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15723170 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataa 15723269  T
Q  204 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatc 303  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  15723270 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 15723369  T
Q  304 gacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15723370 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 15723439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 154 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12500092 - 12499873
Alignment:
Q  154 gatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12500092 gatatgcataagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaca 12499993  T
Q  254 cgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatct 353  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12499992 tgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatct 12499893  T
Q  354 gaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12499892 gaagattgtcttgcaagtgt 12499873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15261612 - 15261256
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  15261612 cagttaaacaaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgaattgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 15261513  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15261512 tgagatcgggttatcactagattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 15261413  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| |  ||||| || || |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  15261412 cggtgttagaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttg 15261313  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15261312 atatattccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 15261256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15358065 - 15357886
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15358065 cagttgaacaaggttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 15357966  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 195  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357965 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 15357886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 191 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15341076 - 15340894
Alignment:
Q  191 actatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15341076 actatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgt 15340977  T
Q  291 agtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15340976 ggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgt 15340894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 14579557 - 14579777
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14579557 agttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 14579656  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | |||    
T  14579657 gaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaatgcggtatggacattatgagtataaggtgatgtcgttc 14579756  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctgga 237  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  14579757 ggtgttacaaatgcacctgga 14579777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 11959305 - 11959661
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||    
T  11959305 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgagtgcaaaggtgttcagtaagattgat 11959404  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||  |||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  11959405 ttgaggtctggttaccatcagatgaaggtcaaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 11959504  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| | || |||||||| ||| |||||   ||  |||| |||||||| || ||||||||    
T  11959505 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagttgtgtttattgatgatatttt 11959604  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  11959605 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagt 11959661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24185172 - 24185035
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24185172 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24185073  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaa 153  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24185072 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaa 24185035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47125937 - 47125579
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  47125937 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagtaagattgat 47125838  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  47125837 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 47125738  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  47125737 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 47125638  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||    
T  47125637 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgt 47125579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 369
Target Start/End: Original strand, 13318634 - 13318992
Alignment:
Q  11 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 110  Q
    ||||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  13318634 atcatcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactcccgaggattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagtttttagtaaaat 13318733  T
Q  111 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 210  Q
    ||| ||||| ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||| || || |||    
T  13318734 tgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatg 13318833  T
Q  211 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 310  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||    
T  13318834 ccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggtatttattgatgata 13318933  T
Q  311 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || || ||||| || |||||||||||| | ||||||    
T  13318934 ttttaatttattccaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaagattatgttgcaa 13318992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28756307 - 28755953
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||  |||| || |||||||||||||    
T  28756307 ttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgttaagatttttagtaagattgatttga 28756208  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28756207 ggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 28756108  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || ||||| || || || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  28756107 tgttactaatgcgccgggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatt 28756008  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  28756007 tattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgt 28755953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13944013 - 13943677
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  13944013 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 13943914  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  13943913 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 13943814  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  13943813 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 13943714  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctga 355  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  13943713 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctga 13943677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 31693321 - 31693677
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31693321 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagggttgacgacttgatggaccagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 31693420  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| || || |||||||    
T  31693421 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattatgaatacaaggtgatgcctt 31693520  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  | || |||||||| | | |||||   ||||| || || ||||| || || ||  |    
T  31693521 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatact 31693620  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| |  |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  31693621 gatttatttaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 31693677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31940896 - 31940540
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31940896 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggaccagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 31940797  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||  || |||||||| || || |||||||    
T  31940796 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacattatgaatacaaggtgatgcctt 31940697  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   ||||| || || ||||| || || ||  |    
T  31940696 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatact 31940597  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  31940596 gatttattcaaagactgaagaatagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 31940540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 12358663 - 12359019
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||| |||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||     
T  12358663 tcagttgcacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagaatgac 12358762  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  12358763 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 12358862  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   || || || || ||||| || || ||| |    
T  12358863 tcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggttgtatttattgatgacattct 12358962  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  12358963 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 12359019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Original strand, 16379068 - 16379420
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16379068 ttgaacaaagttacaattaagaataggcatccacttccgaggattgatgacttgatggaccacctagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgatttga 16379167  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16379168 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 16379267  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||| | ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  16379268 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggtggtatttattgatgatattctgatt 16379367  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || |||||| | ||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  16379368 tattctaagacttaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagt 16379420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 357
Target Start/End: Original strand, 16826439 - 16826754
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  16826439 aagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 16826538  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  ||||    
T  16826539 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttttggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgtctgg 16826638  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| ||| || || ||||||||     |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| ||  ||||||| |||    
T  16826639 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc-----tggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctgagactgaagaa 16826733  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaag 357  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  16826734 gagcatgcagagcatctgaag 16826754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17188345 - 17188011
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  17188345 aagaacaggtatccacttccgaggatggatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaga 17188246  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  17188245 tcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 17188146  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||| |||||||||| |||  | || || ||||| | |||||||   || || || || || || || || ||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17188145 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattcattgatgacattctgatttattcaaggactgaggaa 17188046  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  17188045 gagcatgcagaacatctgaaaattgtattgcaagt 17188011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 201
Target Start/End: Original strand, 11888526 - 11888687
Alignment:
Q  40 aataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  11888526 aataggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagatta 11888625  T
Q  140 aagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatat 201  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||||    
T  11888626 aagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacattatgaatat 11888687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 11950044 - 11950400
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||  ||||| || ||||||||     
T  11950044 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcatttggtgggtgcaagggtttttagtaagattgac 11950143  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || |  |||||||    
T  11950144 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggggatgcctt 11950243  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| || |||||| |    
T  11950244 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattct 11950343  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||    
T  11950344 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatttgaagattgtgttgcaagt 11950400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41179511 - 41179175
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  41179511 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 41179412  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  41179411 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcgg 41179312  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || ||||| || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  41179311 tgttactaacgcacccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 41179212  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctga 355  Q
    || || |||||||| ||||| ||| | || |||||||    
T  41179211 tattcgaagactgaagaagagcattcagaacatctga 41179175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44779236 - 44778884
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  44779236 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 44779137  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  44779136 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 44779037  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || || || ||||||| || |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| |||||    
T  44779036 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtttatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 44778937  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  44778936 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagt 44778884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 15013904 - 15014239
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||| ||||   || ||||| ||||||||||    
T  15013904 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatccacgatttgatggattagttagtggatgcacgtgtgttcagtaagattgatt 15014003  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    | |||||  | |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||  | || || ||  ||||||| || || ||||||   || ||||||||    
T  15014004 taagatcgggctatcaccatatcagagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacattacgaatattcggtgatgccttt 15014103  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| | ||||||||| || || || |||||||| || |||||| |     
T  15014104 cggtgttactaacgcgcctggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgttgtgtttatagatgatattcta 15014203  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcat 351  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  15014204 atatactctaagaccgaggaggaacatgccgagcat 15014239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 10418181 - 10418535
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  10418181 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 10418280  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || || || ||||| |||||||    
T  10418281 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 10418380  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  10418381 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatctt 10418480  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    ||| || || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||||    
T  10418481 gatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcaa 10418535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12180337 - 12179977
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||     
T  12180337 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagattgac 12180238  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcac------tatgaatataaagtta 208  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||      ||||||||||| || |    
T  12180237 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatatatatgaatataaggtga 12180138  T
Q  209 tgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacga 308  Q
    || |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   || ||   ||||| || |||| ||| || ||    
T  12180137 tgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaattcgtggttgtgtctattgatga 12180038  T
Q  309 tattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
     ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12180037 cattctaatttattataagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaa 12179977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15229574 - 15229238
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  15229574 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 15229475  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| |  ||||||||| |||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| |    
T  15229474 ttaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctag 15229375  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||||||||| || | |||| | |  |||||||| | | | |||   || || || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  15229374 tgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaa 15229275  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  15229274 gagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgt 15229238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15235442 - 15235106
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  15235442 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 15235343  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| |  ||||||||| |||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| |    
T  15235342 ttaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctag 15235243  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||||||||| || | |||| | |  |||||||| | | | |||   || || || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| |||    
T  15235242 tgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaa 15235143  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  15235142 gagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgt 15235106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Original strand, 18132504 - 18132720
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  18132504 aagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaga 18132603  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18132604 ttaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 18132703  T
Q  237 agtgtttatggagtata 253  Q
     ||||| ||||||||||    
T  18132704 tgtgttcatggagtata 18132720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43164657 - 43164550
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||  ||    
T  43164657 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaatatttttt 43164558  T
Q  116 tgagatca 123  Q
    ||||||||    
T  43164557 tgagatca 43164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 320
Target Start/End: Original strand, 12510619 - 12510924
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||     
T  12510619 tcagttgaaaaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgac 12510718  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || ||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||| | |||||||    
T  12510719 ttgaggtctggttaccattagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacgagtacaaaatgatgcctt 12510818  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  12510819 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 12510918  T
Q  315 gattta 320  Q
     |||||    
T  12510919 aattta 12510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10407961 - 10407725
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  10407961 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 10407862  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  10407861 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtaatgcctt 10407762  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 251  Q
    || |||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  10407761 tctgtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagta 10407725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 14291690 - 14291899
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  14291690 aagaacaggtatccacttctgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 14291789  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  14291790 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttttggtcactatgaatataagatgatgcatttcggtgttactaatgcgcctgg 14291889  T
Q  237 agtgtttatg 246  Q
     |||||||||    
T  14291890 tgtgtttatg 14291899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Original strand, 15714204 - 15714281
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714204 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 15714281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24189297 - 24189076
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  24189297 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 24189198  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  24189197 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgtctt 24189098  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  24189097 tcggtgttactaatgcgcctgg 24189076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 16834651 - 16835002
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||     ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  16834651 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaga-----tgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 16834745  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || | ||| || || |||||||    
T  16834746 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgtatacaaggtgatgcctt 16834845  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || || ||||||||| |||||  ||| || || || ||||| || || ||  |    
T  16834846 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggttgtatttattgatgacatcct 16834945  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  16834946 aatttattctaagactgacgaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagt 16835002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15612095 - 15611740
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  15612095 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 15611996  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15611995 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15611896  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| |||| |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  15611895 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15611796  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15611795 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagt 15611740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30139798 - 30139443
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  30139798 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 30139699  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  30139698 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 30139599  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  30139598 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 30139499  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  30139498 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 30139443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30149349 - 30148994
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  30149349 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 30149250  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  30149249 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 30149150  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  30149149 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 30149050  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  30149049 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 30148994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14088666 - 14088428
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  14088666 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 14088567  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  14088566 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 14088467  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14088466 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 14088428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12270118 - 12269946
Alignment:
Q  100 ttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaat 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||    
T  12270118 ttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaat 12270019  T
Q  200 ataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgc 272  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||| ||| || || ||||||||    
T  12270018 ataaggtgatgcctttcggtgttactaatgttcctgatgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc 12269946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 16327796 - 16328151
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| ||||| |  || ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  16327796 tcagttgaataaggtcatgataaagaacaggtatccactttcgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 16327895  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||  ||  | || || |||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||  |||| || || || |||||||| || || || || || |||||||    
T  16327896 ttgatgtctggttaccatcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 16327995  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||  ||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  16327996 tcggtgttactaacacgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 16328095  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaag 370  Q
     || || || |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  16328096 aatctattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaag 16328151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Original strand, 8272548 - 8272902
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || |||||||||||    
T  8272548 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgattt 8272647  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||     
T  8272648 gagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccattt 8272747  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    || ||  | ||||| || || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||     
T  8272748 ggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttgg 8272847  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  8272848 tgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 8272902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Original strand, 13970278 - 13970494
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||| | || || ||||    
T  13970278 aagaacagatatccgcttccgaggattgacgacctgatggatcagttggttggtgcgaagatttttagtaaaattgacttgagatcaggttaccatcaga 13970377  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  13970378 tcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 13970477  T
Q  237 agtgtttatggagtata 253  Q
     ||||| ||||||||||    
T  13970478 tgtgttcatggagtata 13970494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18437122 - 18437022
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18437122 cagtttaacaaagtgacaataaagaatatgtatccactcccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 18437023  T
Q  116 t 116  Q
    |    
T  18437022 t 18437022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 15948618 - 15948973
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  15948618 cagttgaacaaagtaacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15948717  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||| | | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15948718 tgagattaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattccgtgatgccatt 15948817  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  ||||||| || || || |||||||| |||| |||| | || || ||| | | |||||| || || || ||||| || || || |||||||||    
T  15948818 tggagtatccaatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttg 15948917  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15948918 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagt 15948973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Original strand, 8745530 - 8745732
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  8745530 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 8745629  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    |  || | || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  8745630 ggacaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 8745729  T
Q  219 tgt 221  Q
    |||    
T  8745730 tgt 8745732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 13965500 - 13965623
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  13965500 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 13965599  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
     ||||||| | ||||| |||||||    
T  13965600 cgagatcaggatatcatcagatta 13965623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 6151001 - 6151131
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  6151001 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 6151100  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  6151101 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 6151131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Original strand, 26791561 - 26791613
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791561 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 26791613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17200627 - 17200496
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || |||||||||    
T  17200627 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgctcccgaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 17200528  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  17200527 ttgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 17200496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 372
Target Start/End: Original strand, 11889623 - 11889784
Alignment:
Q  211 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 310  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || | |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||    
T  11889623 cctttcggtgtcactaatgcgccaggtgtgttcatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgata 11889722  T
Q  311 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11889723 ttttgatatactctaagtttaaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 11889784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12272324 - 12272254
Alignment:
Q  22 aacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 92  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12272324 aacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgc 12272254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25768310 - 25768178
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || || |||||||    
T  25768310 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccgcttctaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaacattgatt 25768211  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaag 148  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  25768210 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaag 25768178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10385424 - 10385306
Alignment:
Q  255 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctg 354  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |||  ||| || |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||| | |||||||    
T  10385424 gaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaacgaggaagagcatgcagggcatctg 10385325  T
Q  355 aagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |  ||||| ||||||||||    
T  10385324 agaattgtattgcaagtgt 10385306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Original strand, 6151277 - 6151358
Alignment:
Q  292 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || || ||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6151277 gtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaaatctgaggaggagcatgctgagcatctgacgattgtgttgcaagtgt 6151358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 21233711 - 21234069
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233711 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 21233810  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233811 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 21233910  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21233911 tcggtgtgatcaatgcacctcgagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 21234010  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21234011 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgt 21234069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 17042995 - 17043351
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042995 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 17043094  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043095 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 17043194  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17043195 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatatttt 17043294  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17043295 gatttactccaagactaaagaagaacatgctgagcatatgaagattgtcttgcaagt 17043351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 33389010 - 33389367
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33389010 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 33389109  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389110 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 33389209  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  33389210 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 33389309  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33389310 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 33389367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 51331474 - 51331831
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  51331474 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 51331573  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331574 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 51331673  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  51331674 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 51331773  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51331774 atttactccaagactgaagaagaacatgcggagcatctgaagattgttttgcaagtgt 51331831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21839328 - 21838971
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21839328 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21839229  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839228 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21839129  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  21839128 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 21839029  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21839028 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 21838971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21832680 - 21832323
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21832680 cagttgaacaaggtaactatcaagattaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 21832581  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832580 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21832481  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21832480 cggtgtgaccaatgcacatggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 21832381  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21832380 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 21832323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 24792609 - 24792954
Alignment:
Q  28 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  24792609 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggtt 24792708  T
Q  128 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24792709 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaa 24792808  T
Q  228 tgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24792809 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 24792908  T
Q  328 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792909 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 24792954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 16348576 - 16348934
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16348576 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16348675  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc-tt 214  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16348676 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16348775  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16348776 tgggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatttt 16348875  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16348876 gatttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgt 16348934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19108746 - 19108389
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19108746 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 19108647  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19108646 tgaggtcaggttatcaccagataaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcaccatgaatataaagttatgccttt 19108547  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19108546 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgatattttg 19108447  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19108446 atttactctaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttccaagtgt 19108389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 22503282 - 22503627
Alignment:
Q  28 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22503282 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggtt 22503381  T
Q  128 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22503382 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtctttcggtgttaccaa 22503481  T
Q  228 tgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22503482 tgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcggggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 22503581  T
Q  328 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503582 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 22503627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 41351649 - 41352000
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaa-taggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41351649 cagttgaacaaggtaactatcaagaaataggtatccacttccgagaaat-------tgatggatcagttagtgggtgcgcgagttttcagcaagattgat 41351741  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41351742 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 41351841  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  41351842 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatatttt 41351941  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  41351942 gatttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgt 41352000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Original strand, 22360224 - 22360565
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  22360224 tcagttgaacaaggtgacaataaagaatagatatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcaacaagatagat 22360323  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  22360324 ttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctt 22360423  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  22360424 tcggtgttacaaatgcaccttgagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattttaggatcggttcgtcgttgtttttattgatgatatttt 22360523  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaa 356  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  22360524 gatttactccaagtctgaagaagaacctgctgagcatttgaa 22360565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 430097 - 430454
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  430097 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 430196  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  430197 tgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgccttt 430296  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||||    
T  430297 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatattttg 430396  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  430397 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 430454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20140462 - 20140104
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20140462 tcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 20140363  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || ||| | |    
T  20140362 ttgagttcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaggtaatgtcgt 20140263  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || || || || ||||||||    
T  20140262 tcggtgtcacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttttggttgttttcattgatgatatttt 20140163  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  20140162 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgatcacttgaagattgttttgcaagtgt 20140104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 50618400 - 50618736
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  50618400 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgatttgagatcgggttatcaccaga 50618499  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  50618500 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccctgg 50618599  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  50618600 agtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaa 50618699  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  50618700 gaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgt 50618736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21751318 - 21750961
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  21751318 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtaggtgcaagtgttttcaacaagatagatt 21751219  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  21751218 tgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacattatgagtataaagttatgccttt 21751119  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| || ||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||     
T  21751118 tggtgttactaatgctcttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatatttta 21751019  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  21751018 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgt 21750961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 21862354 - 21862711
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||  |||    
T  21862354 cagttgaacaaagtaacgagaaagaataggtatccacttccaagaatagatgacttgatggatcagttggtgggtgcacgtgtgttcagcaagatacatt 21862453  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  21862454 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatgagtataaagttatgccttt 21862553  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || || |||||     
T  21862554 cggtgttacaaatgcacctagtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttggaccgtttcgtggttgtttttattgatgacatttta 21862653  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  21862654 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagatggttttgcaagtgt 21862711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16378473 - 16378162
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||    
T  16378473 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgatt 16378374  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16378373 tgagatcaggttatcactagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 16378274  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| || || ||||  ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||    
T  16378273 cggtgttacaaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtgtttattgatgacattttg 16378174  T
Q  316 atttactccaag 327  Q
    || |||| ||||    
T  16378173 atatacttcaag 16378162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 19661116 - 19661474
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  19661116 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaatgttttcagtaagattgac 19661215  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19661216 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 19661315  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| |   | |||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  19661316 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 19661415  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || | |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19661416 gatttattcaaggactgaagaagagcatgcatagcatctgaagattgtattgtaagtgt 19661474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 21743554 - 21743890
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  21743554 aagaataggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 21743653  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| |||||  |||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21743654 ttaaggtgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 21743753  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| ||  | || || ||||| || |||||||| |||    
T  21743754 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttaatttattctaagactgaagaa 21743853  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21743854 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgt 21743890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19856688 - 19856330
Alignment:
Q  11 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 110  Q
    ||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19856688 atcatcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcaaaggttttcagtaagat 19856589  T
Q  111 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 210  Q
    ||| || || ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  19856588 tgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttactatgaatataaggtgatg 19856489  T
Q  211 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 310  Q
    ||||||| ||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| |  || |    
T  19856488 cctttcgttgttactcatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgtgtttattggtgaca 19856389  T
Q  311 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||  || ||||||||||| || ||||||    
T  19856388 ttttgatttattctaagactgaagaagagcatgaagaacatctgaagatagtattgcaa 19856330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37679459 - 37679101
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  37679459 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatatttagtaagattgat 37679360  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37679359 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 37679260  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  37679259 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 37679160  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  37679159 aatctattccaagaatgaggagaagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 37679101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48425283 - 48424925
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  48425283 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 48425184  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  48425183 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 48425084  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  48425083 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 48424984  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  48424983 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 48424925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52988151 - 52987793
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  52988151 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 52988052  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  52988051 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 52987952  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  52987951 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 52987852  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  52987851 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 52987793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20296791 - 20296433
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  20296791 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgaggatttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 20296692  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20296691 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 20296592  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  20296591 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 20296492  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| || |||| ||| || || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  20296491 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctaagaattgtattgcaagtgt 20296433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Original strand, 20854740 - 20855093
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  20854740 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20854839  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20854840 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 20854939  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  20854940 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatttt 20855039  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    |||||| || || ||||| || || ||||| || ||  |||||||||| |||||    
T  20855040 gatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgca 20855093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20944240 - 20944119
Alignment:
Q  184 tatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 283  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20944240 tatggtcattatgaataaaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 20944141  T
Q  284 ggttcgtagtggtgtttatcga 305  Q
    |||||||||| ||||| |||||    
T  20944140 ggttcgtagttgtgttcatcga 20944119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 369
Target Start/End: Original strand, 20833902 - 20834234
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||| | || || || |    
T  20833902 aagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggttttcagtatgattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 20834001  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| | |||    
T  20834002 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatgcgcgtgg 20834101  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| |||    
T  20834102 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaagaa 20834201  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  20834202 gaacatgcagaacatttgaagattgtgttgcaa 20834234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 38910806 - 38911164
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  38910806 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 38910905  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  38910906 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 38911005  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |  || |||||||| ||  |||||  ||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  38911006 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgatgatatttt 38911105  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  38911106 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 38911164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Original strand, 24097587 - 24097939
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  24097587 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagatcgacttga 24097686  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||  || || ||||| || || |||||||||||    
T  24097687 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacgaatacaaggtgatgcctttcgg 24097786  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||     
T  24097787 tgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatc 24097886  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  24097887 tattctaagactgaagaggagcatgcagaaaatctgaagattgtattgtaagt 24097939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 31537977 - 31538335
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||  | || ||||| ||  | || || ||||| |||    
T  31537977 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaactggttggtgctaagatatttagtaagatagat 31538076  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31538077 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 31538176  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  31538177 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 31538276  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  31538277 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 31538335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41310938 - 41310698
Alignment:
Q  13 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 112  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||  | || | ||    
T  41310938 catcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttcgtaaaactg 41310839  T
Q  113 atttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 212  Q
    ||||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  41310838 atttgaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataacgtgatgtc 41310739  T
Q  213 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  41310738 tttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtata 41310698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 20938043 - 20938383
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  20938043 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 20938142  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  20938143 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 20938242  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |  ||||||   ||||| || |||||||| || || | | |    
T  20938243 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacagtct 20938342  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctga 355  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  20938343 gatttattcgaagactgaagaagagcatgtagagcatctga 20938383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21953288 - 21952932
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  21953288 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttcctggaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 21953189  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  21953188 ttgaggtcgggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 21953089  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  21953088 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 21952989  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| |||||||  || || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21952988 aatttattccaagaacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagt 21952932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 20829373 - 20829728
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  20829373 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 20829472  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  20829473 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 20829572  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  20829573 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 20829672  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  20829673 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 20829728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21026266 - 21026194
Alignment:
Q  301 atcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026266 atcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 21026194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 35930806 - 35930936
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  35930806 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 35930905  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  35930906 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 35930936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 41215837 - 41215967
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  41215837 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 41215936  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  41215937 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 41215967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20527431 - 20527301
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  | | |||| || || || ||||||||||    
T  20527431 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagaagatacaaaggtgtttagtaagattgatt 20527332  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| | ||||| ||||||    
T  20527331 tgagatcaggatatcatctgattagagtgaa 20527301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20927432 - 20927309
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || |||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || ||||||||||||     
T  20927432 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccacttcaaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagcaagattgata 20927333  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  20927332 tgagatcaggatatcatcagatta 20927309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41308772 - 41308694
Alignment:
Q  295 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||| || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41308772 gtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgt 41308694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 22133735 - 22133856
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||| || | ||| |  || | || || ||||||||||    
T  22133735 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaagggttgatgatctgatggatcagctatttggtactgaaatgtttagtaagattgatt 22133834  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagat 137  Q
    |||||||| | ||||| |||||    
T  22133835 tgagatcaggatatcatcagat 22133856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Original strand, 21200935 - 21200996
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgga 77  Q
    |||||||| |||||||  || |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21200935 cagttgaataaggtaatgattaagaatcgatatccactcccgaggattgatgatttgatgga 21200996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18781409 - 18781052
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781409 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 18781310  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781309 tgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 18781210  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18781209 cggtgtgaccaacgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttg 18781110  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781109 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 18781052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16358797 - 16358440
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16358797 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16358698  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16358697 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 16358598  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16358597 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16358498  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16358497 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 16358440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34568789 - 34568432
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34568789 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 34568690  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34568689 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 34568590  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34568589 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 34568490  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34568489 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 34568432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40711075 - 40710718
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40711075 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 40710976  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710975 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40710876  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  40710875 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 40710776  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40710775 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 40710718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27520701 - 27520344
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27520701 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27520602  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520601 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27520502  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  27520501 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatttta 27520402  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27520401 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 27520344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27612649 - 27612292
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27612649 cagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggaccagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27612550  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612549 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27612450  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27612449 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27612350  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612349 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 27612292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41773137 - 41772780
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41773137 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 41773038  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773037 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 41772938  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  41772937 tggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatcttg 41772838  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41772837 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 41772780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Original strand, 22330981 - 22331335
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  22330981 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatttga 22331080  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22331081 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 22331180  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  22331181 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatt 22331280  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22331281 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 22331335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 14997830 - 14998187
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  14997830 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 14997929  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997930 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14998029  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14998030 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 14998129  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14998130 atttactccaagactgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 14998187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 27666581 - 27666938
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  27666581 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactttcgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagatagatt 27666680  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27666681 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttttgccttt 27666780  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  27666781 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatatcttg 27666880  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27666881 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 27666938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22350214 - 22349857
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22350214 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccatttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 22350115  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350114 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22350015  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  22350014 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttg 22349915  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349914 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 22349857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 27683491 - 27683848
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27683491 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 27683590  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683591 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27683690  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  27683691 tggtgttaccaatgcacctggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacaatattttg 27683790  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27683791 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 27683848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19772255 - 19771898
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  19772255 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 19772156  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772155 tgaggtgaggatatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 19772056  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  19772055 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgacgatatcttg 19771956  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19771955 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 19771898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 37289587 - 37289944
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  37289587 cagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 37289686  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37289687 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaagttatgccttt 37289786  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  37289787 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 37289886  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37289887 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 37289944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22136963 - 22136606
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  22136963 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22136864  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136863 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22136764  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  22136763 tggtgttactaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttg 22136664  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22136663 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 22136606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 29474164 - 29474521
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  29474164 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 29474263  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474264 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 29474363  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  29474364 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 29474463  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29474464 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 29474521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 39 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20801669 - 20801336
Alignment:
Q  39 gaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagatt 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20801669 gaataggtatcctcttccgagaattgatgatttcatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagatt 20801570  T
Q  139 aaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggag 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20801569 aaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggag 20801470  T
Q  239 tgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaaga 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20801469 tgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttctttatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaaga 20801370  T
Q  339 acatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801369 acatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 20801336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25428728 - 25428371
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  25428728 cagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatc 25428629  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25428628 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggccactatgaatacaaagttatgccttt 25428529  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||    
T  25428528 cggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggttgtttttattgatgatattttg 25428429  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||    
T  25428428 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaatctggttttgcaagtgt 25428371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 26736818 - 26737174
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  26736818 cagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatgtatttagcaagattgatt 26736917  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  26736918 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatgaatataaagtgatgccttt 26737017  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  26737018 cggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgcatttttagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 26737117  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  26737118 atttactccaagtccgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtg 26737174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23473519 - 23473189
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||    
T  23473519 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttga 23473420  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  23473419 gatcggtttatcatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 23473320  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || ||||| || || |||| ||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  23473319 tgttacaaatgcgccaggtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatg 23473220  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagc 349  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  23473219 tactcaaagtctgaagaagaacatgctgagc 23473189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 21337385 - 21337741
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   || || |||||||||||||    
T  21337385 cagttgaccaaagtaacgataaagaataggtatccaattccaagaattgatgacttgatggatcagttattgggtgcatgtgtgtttagcaagattgatt 21337484  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  21337485 tgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatgaatataaagtgatgccttt 21337584  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||| || | |||||| || || ||||| ||||||||| | || || || || || |||||||||||||||    
T  21337585 cggtgttacgaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatagcttagtggttgtattcatcgacgatattttg 21337684  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  21337685 atttactccaagtttgaagaagaacatgctgagcacttgaagattgttttgcaagtg 21337741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 20466190 - 20466546
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| ||  |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || || |||||||||||||    
T  20466190 cagttgaataaactaacaataaagaataagtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttactgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 20466289  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  20466290 taagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 20466389  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| | |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||    
T  20466390 tggtgttactaatgcaccgggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgatcatcgatgatattttg 20466489  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20466490 atatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtg 20466546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 21562115 - 21562472
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||    
T  21562115 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatggtttaatggatcagttagtgg-tgcacgcgtgttcagcaagattgat 21562213  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || |||||||||||||| ||| |||    
T  21562214 ttgaggtcgggttaccaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtgatgtctt 21562313  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || |||||  |||| |||||||||||||| | |||| | || |||||||| | ||| ||| |||| ||||| |||||||| || || ||  |    
T  21562314 tcggtgttactaatgcgtctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcctatttagattggtttgtagttgtgtttatagatgacatcct 21562413  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| | || ||||| || |||||||    
T  21562414 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatttaaaaattgtgtttcaagtgt 21562472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 24796487 - 24796845
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  24796487 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 24796586  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  24796587 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 24796686  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  24796687 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 24796786  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||    
T  24796787 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgt 24796845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20823731 - 20823378
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  20823731 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20823632  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20823631 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 20823532  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||||||| || ||||| ||    
T  20823531 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatatt 20823432  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    ||| || || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  20823431 gatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgca 20823378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20344560 - 20344204
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||     
T  20344560 tcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagcaagattgac 20344461  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20344460 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 20344361  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  20344360 tcggtgttactaacgtgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 20344261  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  20344260 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagt 20344204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 14885081 - 14885439
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  14885081 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 14885180  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  14885181 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 14885280  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  14885281 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatctt 14885380  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||  || || ||||||||||    
T  14885381 aatttattccaagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgt 14885439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Original strand, 28893032 - 28893385
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  28893032 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 28893131  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  28893132 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 28893231  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || || || ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  28893232 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatatt 28893331  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    ||| || || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  28893332 gatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgca 28893385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Original strand, 28921858 - 28922211
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  28921858 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 28921957  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  28921958 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 28922057  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || || || ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  28922058 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatatt 28922157  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    ||| || || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  28922158 gatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgca 28922211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 22234032 - 22234368
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||| | | | || || ||||    
T  22234032 aagaataggtatccacttccgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggttaggttaccatcaga 22234131  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| || || || ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  22234132 ttaaggtgatggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 22234231  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||| ||||||||| |||    || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  22234232 tgtgtttgtggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 22234331  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22234332 gagcatgcagatcatctgaagattgtattgcaagtgt 22234368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Original strand, 17267428 - 17267782
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  17267428 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 17267527  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  17267528 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 17267627  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  17267628 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattctgatt 17267727  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||    
T  17267728 tattcaaagactgaagaagagcatgcagaacacctgagaattgtgttgcaagtgt 17267782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25850353 - 25849995
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  25850353 tcagttgaacaaggttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaatttttagtaagattgat 25850254  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  25850253 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 25850154  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| | ||| |  ||||||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || || ||||| ||    
T  25850153 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtgttcattgatgatatctt 25850054  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || |||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||    
T  25850053 gatttattcgaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgt 25849995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 37541471 - 37541829
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  37541471 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagtaagattgat 37541570  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37541571 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 37541670  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || | |||||| || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || |||||| |    
T  37541671 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattct 37541770  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||  || || ||||||||||    
T  37541771 aatctattccaagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgt 37541829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22464229 - 22463876
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  22464229 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 22464130  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
     |||| ||  | || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  22464129 ctgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 22464030  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || |||||  |||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22464029 tcggtgttactaacgcgcctggtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatttt 22463930  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    |||||| || || ||||| || || ||||| || ||  |||||||||| |||||    
T  22463929 gatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgca 22463876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20778191 - 20777889
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  20778191 tcagttgaacaaggttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgacgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20778092  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  20778091 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctt 20777992  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| || || |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||||||| || ||||||||    
T  20777991 tcggtgttactaacgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatttt 20777892  T
Q  315 gat 317  Q
    |||    
T  20777891 gat 20777889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22504957 - 22504601
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |   ||||||| ||||||||     
T  22504957 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcatagaattgatgacttgatgaatcagttggttggtgctaggattttcagtaagattgac 22504858  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  22504857 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 22504758  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  22504757 tcggtgttactaacgagcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 22504658  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || ||||  || || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  22504657 aatttattctaagaacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagt 22504601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23507961 - 23507606
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  23507961 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 23507862  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  23507861 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 23507762  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  23507761 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 23507662  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  23507661 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 23507606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 21935279 - 21935634
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  21935279 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21935378  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||  | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  21935379 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 21935478  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  21935479 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 21935578  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21935579 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 21935634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24583487 - 24583364
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  24583487 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24583388  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  24583387 tgagatcaggatatcatcagatta 24583364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 368
Target Start/End: Original strand, 28914640 - 28914856
Alignment:
Q  152 aagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 251  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  28914640 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28914739  T
Q  252 tacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcat 351  Q
    || ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || || ||     
T  28914740 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28914839  T
Q  352 ctgaagattgtcttgca 368  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28914840 ctgaagattgtgttgca 28914856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 368
Target Start/End: Original strand, 28929908 - 28930124
Alignment:
Q  152 aagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 251  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  28929908 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28930007  T
Q  252 tacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcat 351  Q
    || ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || || ||     
T  28930008 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28930107  T
Q  352 ctgaagattgtcttgca 368  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28930108 ctgaagattgtgttgca 28930124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Original strand, 21676946 - 21677061
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  21676946 aagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 21677045  T
Q  137 ttaaagtgaaagatga 152  Q
    | || |||||||||||    
T  21677046 tcaaggtgaaagatga 21677061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 253
Target Start/End: Original strand, 21679010 - 21679106
Alignment:
Q  157 atgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||||||| || || || || || |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21679010 atgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacggatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 21679106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16553 - 16195
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16553 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16454  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttgtggtcactatgaatataaagttatgcctt 16354  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16353 tccgtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgatatttt 16254  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16253 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 16195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2816 - 2458
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  2816 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgaacgtgtttttagcaagattgatt 2717  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 2617  T
Q  216 -cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2616 ccggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatatttt 2517  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2516 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40547 - 40190
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  40547 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 40448  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40447 tgagatcagggtatcactagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40348  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  40347 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgacattttg 40248  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40247 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 40190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Original strand, 14031 - 14394
Alignment:
Q  11 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14031 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 14130  T
Q  111 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 210  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14131 tgatttgagatcggggtatcactagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 14230  T
Q  211 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14231 cctttcggtgtgaccaatgcacctggaatgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgata 14330  T
Q  311 -ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14331 ttttttatttactccatgactgaagaagaatatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 14394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16927354 - 16926997
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16927354 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16927255  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927254 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16927155  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16927154 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16927055  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16927054 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 16926997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17000994 - 17000637
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17000994 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17000895  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000894 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17000795  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17000794 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 17000695  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17000694 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 17000637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9486210 - 9485853
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9486210 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 9486111  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9486110 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 9486011  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9486010 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 9485911  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9485910 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 9485853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24712027 - 24711671
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24712027 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgattt 24711928  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711927 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 24711828  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  24711827 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttga 24711728  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24711727 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 24711671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 44384019 - 44384376
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44384019 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 44384118  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384119 tgagattaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 44384218  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  44384219 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 44384318  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44384319 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 44384376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9337576 - 9337219
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9337576 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 9337477  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9337476 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 9337377  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  9337376 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 9337277  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9337276 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 9337219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 21143490 - 21143847
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21143490 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21143589  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143590 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatacagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21143689  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21143690 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 21143789  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143790 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 21143847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27220010 - 27219653
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27220010 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27219911  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219910 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27219811  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27219810 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27219711  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27219710 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 27219653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10870844 - 10870487
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  10870844 cagttgaacaaggtaactatcaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacgagttttcagcaagattgatt 10870745  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870744 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10870645  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  10870644 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 10870545  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10870544 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 10870487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 41606834 - 41607191
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  41606834 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 41606933  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606934 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 41607033  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  41607034 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 41607133  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41607134 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 41607191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24677484 - 24677126
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24677484 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagatttcagcaagattgat 24677385  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24677384 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 24677285  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||    
T  24677284 tcggtgttacgaatgcacctgtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggtttttttcatcgatgatatttt 24677185  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24677184 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 24677126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24264364 - 24264007
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24264364 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24264265  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264264 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24264165  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||    
T  24264164 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 24264065  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24264064 atttactccaagactgaagaggaacatgttgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 24264007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27373263 - 27372906
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27373263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 27373164  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373163 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27373064  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27373063 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27372964  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27372963 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 27372906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 49 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23189879 - 23189555
Alignment:
Q  49 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | |||||| |||||||||| ||||    
T  23189879 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgacttgaggttaggttatcactagattaaagtaaaag 23189780  T
Q  149 atgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189779 atgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 23189680  T
Q  249 gtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgag 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189679 gtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatagacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgag 23189580  T
Q  349 catctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  23189579 catctgaagattgtcttacaagtgt 23189555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 24875199 - 24875556
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24875199 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcgattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24875298  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875299 tgaggtcaggttatcatcagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24875398  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  24875399 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcattgatgatattttg 24875498  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875499 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 24875556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 21323715 - 21324072
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21323715 cagttaaacaaggtaactatcaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21323814  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21323815 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttt 21323914  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||    
T  21323915 tggtgttaccaatacacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgttttcatcgacgatattttg 21324014  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21324015 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 21324072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 24705931 - 24706288
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24705931 cagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgatt 24706030  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706031 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaaaagaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24706130  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |  || || || || |||||||||    
T  24706131 tggtgttaccaatgtacctggagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcacgcatttttggatcggttcgtggctgttttcattgatgatattttg 24706230  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706231 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 24706288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 23106177 - 23106534
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23106177 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 23106276  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23106277 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 23106376  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || || || || || |||||||||    
T  23106377 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcattgatgatattttg 23106476  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  23106477 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 23106534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Original strand, 22734226 - 22734580
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||    
T  22734226 ttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaagtgttttcaacaagatagatttga 22734325  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  22734326 gatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcgg 22734425  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  22734426 tgttataaatgcacctggagtatttatgtagtacatgaatcgcatctttcatgaatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatt 22734525  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  22734526 tactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 22734580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23073857 - 23073531
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||     
T  23073857 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtattttcagcaagatagatc 23073758  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  23073757 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccattatgaatacaaagttatgccttt 23073658  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| || || || || || |||||||||    
T  23073657 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttggaatgtttcgtggttgttttcattgatgatattttg 23073558  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacat 342  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||    
T  23073557 atttactccaagtctgaagaagaacat 23073531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 24818679 - 24819035
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  24818679 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgatt 24818778  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  24818779 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 24818878  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||   |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || || |||||||||    
T  24818879 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttg 24818978  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24818979 atatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtg 24819035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23112712 - 23112373
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat---ttgagatcaaggtatcacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||   ||||| ||  | || || |    
T  23112712 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcatattcagcaagattgatgatttgaggtcgggttaccatc 23112613  T
Q  134 agattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||    
T  23112612 agattaaggtgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcc 23112513  T
Q  234 tggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgag 333  Q
    | | |||||||||||||| | |||| | || |||||||| | | |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  23112512 tagtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgtagttgtgtttattgatgatatcttgatttattctaagactgaa 23112413  T
Q  334 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  23112412 gaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgt 23112373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1065746 - 1065388
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  1065746 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 1065647  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  1065646 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 1065547  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  1065546 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatttt 1065447  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||    
T  1065446 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgt 1065388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 19650498 - 19650854
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  19650498 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 19650597  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||  ||| | || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || || || |||||||| || || || || || |||||||    
T  19650598 ttgaagtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 19650697  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |||||||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  19650698 tcggtgtcactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 19650797  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19650798 aatttattctaagaccgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagt 19650854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Original strand, 23098466 - 23098813
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||||     
T  23098466 tcagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagattgac 23098565  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  23098566 ttgaggtcaggataccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatagaaggtgatgcctt 23098665  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||| |||| | || || ||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23098666 tcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatatttt 23098765  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgt 362  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23098766 aatttattctaagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgt 23098813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25255914 - 25255657
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||    
T  25255914 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaaaattgat 25255815  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  25255814 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 25255715  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgc 272  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||    
T  25255714 tcggtgttactaatgcgcttggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc 25255657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12576344 - 12575992
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  12576344 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 12576245  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12576244 ggtcaggttaccaccaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 12576145  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || || || |||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| |||||    
T  12576144 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 12576045  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  12576044 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagt 12575992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31832653 - 31832295
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  31832653 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagtaagattgat 31832554  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || || |||||||    
T  31832553 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 31832454  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  31832453 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 31832354  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  31832353 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 31832295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27789731 - 27789395
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  27789731 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 27789632  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27789631 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 27789532  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  27789531 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 27789432  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctga 355  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  27789431 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctga 27789395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23278771 - 23278417
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  23278771 tcagttgaacaaagttacaatcaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 23278672  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||  ||| | || || || ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||  | || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  23278671 ttgaagtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacaaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 23278572  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   ||||| || || ||||| || || ||| |    
T  23278571 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattct 23278472  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  23278471 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaa 23278417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 19717465 - 19717821
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  19717465 tcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttctgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttaacaagattgac 19717564  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| ||  |||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  19717565 ttgaggtcaggttaccatcagatcaagttgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 19717664  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   ||    || |||||||| || |||||| |    
T  19717665 tcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggttgtgtttattgatgatattct 19717764  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || |||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  19717765 aatttattctaagactgaagatcagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 19717821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 372
Target Start/End: Original strand, 30010654 - 30010989
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||    || ||||| || || || || |||| | | ||||||||||    
T  30010654 aagaataagtatccacttccgaggatcgacgatttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaatggacttaagattaggctatcaccaga 30010753  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || || ||||| || || || ||||||   || ||||||||| |||| || ||||| || ||    
T  30010754 ttaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgcctttcagtgttactaatgcgccagg 30010853  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
    |||||||||| | |||| |||||| || || ||| | | | ||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||     
T  30010854 agtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggag 30010953  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    |||||||  |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  30010954 gaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtg 30010989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 343
Target Start/End: Original strand, 30209387 - 30209693
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    || ||||| || ||||| || || ||| | ||||||||||    
T  30209387 aagaataagtatccacttccgaggatcgaagatttgatggatcagttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaattgagttaaggtcaggctatcaccaga 30209486  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||  | || ||  |||||   || |||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  30209487 tcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacattacaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctggg 30209586  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
    |||||||||||| |||| |||||  || || ||| | | | ||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||     
T  30209587 agtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggag 30209686  T
Q  337 gaacatg 343  Q
    |||||||    
T  30209687 gaacatg 30209693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Original strand, 22323584 - 22323662
Alignment:
Q  295 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22323584 gtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 22323662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23611134 - 23611069
Alignment:
Q  49 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23611134 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 23611069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24950503 - 24950231
Alignment:
Q  97 gttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatg 196  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||| | || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || |    
T  24950503 gtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacg 24950404  T
Q  197 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggt 296  Q
    |||| || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   || |  || ||    
T  24950403 aatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgt 24950304  T
Q  297 gtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
     ||| | || |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  24950303 atttgttgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaa 24950231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22280096 - 22279993
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || |||||||||||||    
T  22280096 ttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatttga 22279997  T
Q  119 gatc 122  Q
    ||||    
T  22279996 gatc 22279993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 24829637 - 24829744
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  24829637 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24829736  T
Q  116 tgagatca 123  Q
     |||||||    
T  24829737 agagatca 24829744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 368
Target Start/End: Original strand, 27208802 - 27208973
Alignment:
Q  197 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggt 296  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| || || || ||| | ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||    
T  27208802 aatacaaagtgatgtctttcggtgttactaaagcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggt 27208901  T
Q  297 gtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27208902 gtttatagatgatattttgatttattctaagactgaagaggtgcatgcagagcacctgaagattgtgttgca 27208973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25130603 - 25130473
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||| |||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  25130603 cagttgaactaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgattttatggatcaactggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 25130504  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  25130503 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 25130473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25264769 - 25264691
Alignment:
Q  295 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25264769 gtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtcttgcaagtgt 25264691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 146
Target Start/End: Original strand, 22760039 - 22760148
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  22760039 aagaatcggtacccgcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgcttagtaagattgatttgagatcaagatatcatcata 22760138  T
Q  137 ttaaagtgaa 146  Q
    ||| ||||||    
T  22760139 ttagagtgaa 22760148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 23204309 - 23204273
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204309 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23204273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 24568117 - 24568247
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||  ||||| || ||||||||||| |||||| || | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  24568117 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatctgcttccaaggattgatgatttaatggattagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24568216  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||    
T  24568217 tgagatcaggatatcatcatattagagtgaa 24568247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 15267 - 15625
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15267 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgaggatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 15366  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15466  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15467 tcggtgtaaacaatgcgcctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgcgtttatcgacgatatttt 15566  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15567 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgatgattgtcttgcaagtgt 15625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10873042 - 10872685
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10873042 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10872943  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872942 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10872843  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  10872842 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggtcgtgtttatcgacgatattttg 10872743  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10872742 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 10872685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 11235131 - 11235488
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11235131 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 11235230  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235231 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 11235330  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  11235331 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 11235430  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11235431 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 11235488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14334748 - 14334391
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14334748 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 14334649  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334648 tgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14334549  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14334548 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 14334449  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14334448 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 14334391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 15158975 - 15159332
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  15158975 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 15159074  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159075 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15159174  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15159175 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15159274  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15159275 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 15159332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 44789269 - 44789626
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44789269 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 44789368  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789369 tgagatcaggttgtcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 44789468  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  44789469 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttg 44789568  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44789569 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 44789626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 11551020 - 11551377
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11551020 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 11551119  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551120 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 11551219  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  11551220 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 11551319  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551320 atttattccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 11551377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14956906 - 14956549
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14956906 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 14956807  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956806 tgaggtcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaaaatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14956707  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14956706 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 14956607  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956606 atttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 14956549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12689854 - 12689497
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  12689854 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 12689755  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689754 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctctgagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12689655  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  12689654 tggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttg 12689555  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689554 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 12689497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13688393 - 13688036
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  13688393 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 13688294  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13688293 tgaggtcaggttatcactagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataaagttatgccttt 13688194  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13688193 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 13688094  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13688093 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 13688036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8709957 - 8709600
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  8709957 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 8709858  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709857 tgaggtcaggatatcaccagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8709758  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
T  8709757 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttatggttgtgtttatcgacgatattttg 8709658  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8709657 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 8709600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18180097 - 18179740
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18180097 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttcagagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 18179998  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18179997 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataaagttatgccttt 18179898  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  18179897 cggtgtgaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtaattgtgtttatcgaccatattttg 18179798  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18179797 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctcaagattgtcttacaagtgt 18179740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 362
Target Start/End: Original strand, 18588089 - 18588435
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  18588089 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 18588188  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18588189 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaaaataaagttatgccttt 18588288  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  18588289 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 18588388  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgt 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18588389 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgt 18588435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9590721 - 9590483
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9590721 tcagttgaacaaggtaactatcaagtataggtatccacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaatttttcagcaagattgat 9590622  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9590621 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 9590522  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9590521 ttggtgtgaccaatgcacttggagtgtttatggagtata 9590483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 15146801 - 15147160
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  15146801 tcagttgaataaagtaactatgaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagat 15146900  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  15146901 ttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacattacgagtataaagttatgcctt 15147000  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgca-tttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattt 313  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || || |||||||    
T  15147001 ttggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgcattttttggatcggttcgtggtttttttcattgatgatattt 15147100  T
Q  314 tgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15147101 ttatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgt 15147160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14042044 - 14041690
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  14042044 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgacttga 14041945  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  14041944 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcgg 14041845  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || ||||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | || || || ||||||||||||    
T  14041844 tgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatt 14041745  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14041744 tactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgt 14041690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14352074 - 14351720
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  14352074 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgacttga 14351975  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  14351974 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcgg 14351875  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || ||||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | || || || ||||||||||||    
T  14351874 tgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatt 14351775  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14351774 tactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgt 14351720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 48813170 - 48813526
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || || |||||||||||||    
T  48813170 cagttgaataaagtaacgataaagtattggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggcgcacgtgtgtttagcaagattgatt 48813269  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  48813270 tgagatcaggttatcaccaaattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 48813369  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| ||  | |||||||||||||| | |||| | || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  48813370 cggtgttactaatgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttg 48813469  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48813470 atatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtgttgcaagtg 48813526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 15100498 - 15100856
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  15100498 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgat 15100597  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||| ||  ||||||| || |||||||    
T  15100598 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctt 15100697  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  15100698 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 15100797  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15100798 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgcaagtgt 15100856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 26116485 - 26116843
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  26116485 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 26116584  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || | ||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  26116585 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 26116684  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| |||||  |||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  26116685 tcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattgacgatatttt 26116784  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  26116785 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgt 26116843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 13966563 - 13966919
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  13966563 tcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaatttttagtaagattgat 13966662  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  13966663 ttgagatctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 13966762  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  13966763 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 13966862  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  13966863 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagt 13966919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 26092693 - 26093051
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  26092693 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 26092792  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  26092793 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 26092892  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  26092893 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 26092992  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  26092993 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 26093051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 12204717 - 12205053
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  12204717 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcatgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 12204816  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||| || || || || |  || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  12204817 ttaaggtgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 12204916  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||| | |||| | || |||||||| | | |||||   |  || || |||||||| || ||||| || ||||| |  |||||||| |||    
T  12204917 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggtcgtgtttattgatgatatcttaatttattttaagactgaagaa 12205016  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12205017 gagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgt 12205053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14140029 - 14139677
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  14140029 ttgaacaaagttacaattaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtgggtgcaaaggtttttagtaatattgacttga 14139930  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  14139929 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 14139830  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  14139829 tgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatt 14139730  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  14139729 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagt 14139677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15626856 - 15626521
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15626856 aagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccaga 15626757  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| || || |||||  | || || ||||||   || ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  15626756 ttaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacattacgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaatgcaccagg 15626657  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     || ||||||||||| | ||| || || || ||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| || ||||  ||| |||| |||    
T  15626656 tgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgcgttcatcgatgatattttaatatactataagtctgaagaa 15626557  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    |||||||  ||| || |||||||||| |||||||||    
T  15626556 gaacatgtcgagtatttgaagattgttttgcaagtg 15626521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 16948389 - 16948723
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | || || || |    
T  16948389 aagaataggtatccactcccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 16948488  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16948489 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 16948588  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| || |||||| ||||||| || || |  || ||     
T  16948589 cgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaaaatcgaagag 16948688  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16948689 gagcacgcagagcatctgaagattgtgttgcaagt 16948723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13675806 - 13675450
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  13675806 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacataatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcaacaagattgac 13675707  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  13675706 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 13675607  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   || || || || ||||| || || ||| |    
T  13675606 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgacattct 13675507  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13675506 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagt 13675450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Original strand, 23503769 - 23504121
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  23503769 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 23503868  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23503869 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 23503968  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||    
T  23503969 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 23504068  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  23504069 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagt 23504121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49154655 - 49154297
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  49154655 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 49154556  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  49154555 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 49154456  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  49154455 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 49154356  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  49154355 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 49154297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13023711 - 13023355
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||     
T  13023711 tcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattggtgggtgcgaaggtgtttagcaagattgac 13023612  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  13023611 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 13023512  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||| | |||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||||||| || |||| |||    
T  13023511 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgataattt 13023412  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  13023411 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcaagt 13023355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 14262162 - 14262497
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||| | || || || |    
T  14262162 aagaataggtatccacttccgaggtttgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcata 14262261  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14262262 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14262361  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||| | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| | | ||||||| |||    
T  14262362 tgtgtttatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaattta-ttctagactgaagaa 14262460  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14262461 gagcatgcagagcatctgaagattatgttgcaagtgt 14262497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Original strand, 11386324 - 11386671
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||||     
T  11386324 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagattgac 11386423  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  || || || |||| |||||| || ||||| || || |||||||    
T  11386424 ttgaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 11386523  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| || || || ||||||||||||| |||  | || || ||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11386524 tcggtgttactaatgcgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatatttt 11386623  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgt 362  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11386624 aatttattctaagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgt 11386671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12458994 - 12458638
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  12458994 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgacctaatggatcagttagtaggtgcgaaagtgttcagtaagatcgat 12458895  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  12458894 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 12458795  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||  |||    ||||||||||| ||| |||||   ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  12458794 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatttgaacataatcttccatgcttttctggataatttcgttgttgtgtttattgatgatatttt 12458695  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  12458694 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagt 12458638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 11301108 - 11301466
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  11301108 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 11301207  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  11301208 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 11301307  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  11301308 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 11301407  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||    
T  11301408 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgt 11301466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19149541 - 19149207
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    | || || || ||||||||||| ||| | || |   |||    
T  19149541 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccta-aga 19149443  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19149442 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19149344  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||| | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  19149343 tgtgtttatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaa 19149244  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19149243 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgt 19149207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Original strand, 18051852 - 18052204
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  18051852 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 18051951  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  18051952 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 18052051  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || || || |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| |||||    
T  18052052 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 18052151  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  18052152 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagt 18052204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20748940 - 20748606
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    | || || || ||||||||||| ||| | || |   |||    
T  20748940 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccta-aga 20748842  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20748841 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20748743  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  20748742 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaa 20748643  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20748642 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgt 20748606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 373
Target Start/End: Original strand, 16070222 - 16070548
Alignment:
Q  45 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    ||  | || || ||||||||||| ||| | || || |||||||| |||    
T  16070222 gtatccacttccgagaattgatgacttgatggaccagttagtgggtgctcgtgtgcttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtg 16070321  T
Q  145 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 244  Q
    || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||    
T  16070322 aaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct--agtgttta 16070419  T
Q  245 tggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 344  Q
    ||||||||| |||  | || |||||||  | | |||||   || || || |||||||| || |||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  16070420 tggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctcatttattctaagactgaagaagagcatgc 16070519  T
Q  345 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16070520 agagtatctgaagattgtattgcaagtgt 16070548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15342785 - 15342429
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  15342785 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 15342686  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  15342685 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 15342586  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||  | || |||||||  ||| |||||  ||| || || || || || ||||||||  |    
T  15342585 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcct 15342486  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || |||||| | || || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  15342485 aatttattctaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagt 15342429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7826252 - 7825897
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  7826252 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 7826153  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  7826152 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 7826053  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  7826052 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 7825953  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  7825952 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 7825897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 27105692 - 27106047
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  27105692 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 27105791  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  27105792 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 27105891  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  27105892 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 27105991  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  27105992 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 27106047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27172633 - 27172278
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  27172633 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 27172534  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  27172533 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 27172434  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  27172433 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 27172334  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  27172333 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 27172278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19615029 - 19614791
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  19615029 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 19614930  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  19614929 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 19614830  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  19614829 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 19614791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 11770320 - 11770426
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || ||||||||| |||    
T  11770320 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattaatt 11770419  T
Q  116 tgagatc 122  Q
    |||||||    
T  11770420 tgagatc 11770426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Original strand, 16727300 - 16727360
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16727300 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 16727360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Original strand, 17704372 - 17704432
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17704372 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 17704432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4442280 - 4442157
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  4442280 cagttgaagaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 4442181  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  4442180 tgagatcaggatatcatcagatta 4442157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Original strand, 11770438 - 11770516
Alignment:
Q  295 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11770438 gtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgt 11770516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 14284271 - 14284509
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||| ||  |||||||  |||| || || || ||     
T  14284271 tcagttgaacaaagttgcgataaagaacaggtatccgcttccgaagattggcgacttgatggatcagttggtttgtgcaaagatttttagtaatatcgac 14284370  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| |   | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||| |||| || |||||||| || |||||||    
T  14284371 ttgaggtatggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggtgatgcctt 14284470  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14284471 tcggtgttactaatgcgcctggcgtgttcatggagtata 14284509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13379235 - 13379105
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  13379235 cagttgaacaaggtgactattaagaatctttatcctcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 13379136  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||| | ||||||    
T  13379135 tgagatcaggatatcatcagatcagagtgaa 13379105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17926001 - 17925872
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||||||||| || || ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||||   |||| || || || ||||||||    
T  17926001 agttgaacaaggtgacgattaagaatcagtatccgcttccgaggattgatgatttgagggatcagctggttggtgtggaagtatttagtaaaattgattt 17925902  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17925901 gagatcaagatatcatcagattagagtgaa 17925872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 344
Target Start/End: Original strand, 39210 - 39392
Alignment:
Q  162 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgc 261  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||   || |||||||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||  |     
T  39210 gaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcggtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtttttatggagtatatgaacaga 39309  T
Q  262 atcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 344  Q
    || |||||| ||| ||| |||| |||||| || || || || || ||||||||| | ||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  39310 attttccatccatatttagatcagttcgttgtagtattcattgatgatattttggtgtactctaaatcagaggaggaacatgc 39392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13458387 - 13458257
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||| | ||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||  | || |||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  13458387 cagttaaacaaggcaacgattaagaatcgatatccgcttcaaaggattgatgatttgatggaccaactggttggtgcggaagtgttcagtaagattgatt 13458288  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    | |||||| | |||||  |||||| ||||||    
T  13458287 tcagatcaggatatcattagattagagtgaa 13458257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 15716825 - 15716942
Alignment:
Q  20 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgag 119  Q
    |||||||||| || || ||||||  |||| | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15716825 tgaacaaggtgacgattaagaatcagtattcgctcccgaggattgaggatatgatggatcagttggttggtgcggaagtgttcagtaagattgatttaag 15716924  T
Q  120 atcaaggtatcaccagat 137  Q
     ||| | ||||| |||||    
T  15716925 gtcacgatatcagcagat 15716942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 58410 - 58052
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  58410 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagtttttagcaagattgat 58311  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58310 ttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 58211  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  58210 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtgtttatcgatgacatttt 58111  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  58110 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgtgcatctgaagattgtcttccaagtgt 58052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 17975 - 18335
Alignment:
Q  13 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17975 catcagttgaacaaagtaactatcaaaaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 18074  T
Q  113 atttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 212  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18075 atttgagatcatgttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatatctttcagtacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 18174  T
Q  213 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || || || |||    
T  18175 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgtagtacatgaatcgcatcttccaagcatttttggagcggttcgtggttgttttcattgatgacatt 18274  T
Q  313 ttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatct-gaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  18275 tt-atttactccaagtattaagaagaacatgctgaacatctaaaaaattgtcttgcaagtgt 18335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 61 - 373
Target Start/End: Original strand, 195444 - 195756
Alignment:
Q  61 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgc 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  195444 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaagataaatgatgaagatatgc 195543  T
Q  161 agaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcg 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  195544 agaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatggagtatatgaatcg 195643  T
Q  261 catcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagatt 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  195644 catcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatctgaaggtt 195743  T
Q  361 gtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||    
T  195744 gtcttgcaagtgt 195756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9332 - 8975
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9332 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 9233  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9232 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 9133  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  9132 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 9033  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9032 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 8975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 28261251 - 28261608
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28261251 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28261350  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28261351 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28261450  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28261451 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28261550  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28261551 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgt 28261608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28284665 - 28284308
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28284665 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28284566  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28284565 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28284466  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28284465 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28284366  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28284365 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgt 28284308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 28340000 - 28340357
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28340000 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28340099  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28340100 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28340199  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28340200 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28340299  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28340300 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgt 28340357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 22828409 - 22828766
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22828409 cagttgaataaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 22828508  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828509 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagataaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22828608  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  22828609 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgcgttcatcgatgatattttg 22828708  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828709 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 22828766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Original strand, 16961537 - 16961893
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16961537 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtcggtgcgaaagtttttagcaagattgattt 16961636  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16961637 gaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtcgttc 16961736  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||    
T  16961737 ggtgtgaccaatgcacctgaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgacgatattttga 16961836  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16961837 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 16961893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 2872857 - 2873214
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  2872857 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 2872956  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872957 tgaggtcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 2873056  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  2873057 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttg 2873156  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2873157 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 2873214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Original strand, 24293837 - 24294193
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  24293837 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgattt 24293936  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24293937 gaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 24294036  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  24294037 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttga 24294136  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24294137 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgt 24294193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27189663 - 27189306
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27189663 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 27189564  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27189563 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgccttt 27189464  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |||    
T  27189463 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttg 27189364  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  27189363 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgt 27189306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 27259577 - 27259934
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27259577 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 27259676  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27259677 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgccttt 27259776  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |||    
T  27259777 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttg 27259876  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  27259877 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgt 27259934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 16925692 - 16926049
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16925692 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatctacttc-gagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttttagcaagattgat 16925790  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16925791 ttgaggtaaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataatgttatgccgt 16925890  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  16925891 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcatcgatgatatttt 16925990  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925991 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 16926049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19866915 - 19866557
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19866915 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 19866816  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    || |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866815 ttaagatcaggttatcacgagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 19866716  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||    
T  19866715 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgatgatatttt 19866616  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866615 gatttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 19866557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 27563886 - 27564244
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27563886 tcagttgaacaaagttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 27563985  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    || |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27563986 ttaagatcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaggcagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 27564085  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  27564086 tcggtgtgaccattgcacctaaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtgttcatcgatgaaatttt 27564185  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27564186 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 27564244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25114779 - 25114422
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25114779 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 25114680  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    || |  || | ||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25114679 tggggccaggttatcatcagattaaagtaaaggttgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactgtgaatataaagttatgccttt 25114580  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  25114579 tggtgttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttgttcatcgatgatattttg 25114480  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114479 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 25114422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22436097 - 22435739
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22436097 tcagttaaacaaagtaactatcaataataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagattgat 22435998  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22435997 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgtgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 22435898  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  22435897 ttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatatttt 22435798  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435797 aatttactccaagactaaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 22435739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 5837272 - 5837630
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  5837272 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcttttgttttcagcaagattgat 5837371  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5837372 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctt 5837471  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| ||| |    
T  5837472 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtcttcattgacgacattct 5837571  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5837572 gatttattccaagactgaggaagaacatgttgagcatctgaagactgttttgcaagtgt 5837630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 373
Target Start/End: Original strand, 25763297 - 25763639
Alignment:
Q  31 actatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25763297 actatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatc 25763396  T
Q  131 accagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgc 230  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25763397 accagaaaaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgc 25763496  T
Q  231 acctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagact 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  25763497 acctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatgacattttaatttactccaagact 25763596  T
Q  331 gaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25763597 gaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 25763639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 20633994 - 20634351
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20633994 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 20634093  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  20634094 tgagatctggttatcaccagattaaagtagaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttt 20634193  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||    
T  20634194 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 20634293  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  20634294 atttactccaagtctaaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 20634351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 357
Target Start/End: Original strand, 22760504 - 22760850
Alignment:
Q  11 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  22760504 atcaacagttgaacaatgtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacgtgttgtcagcaagat 22760603  T
Q  111 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 210  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  22760604 tgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaagttatg 22760703  T
Q  211 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgata 310  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  22760704 cctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattaatgata 22760803  T
Q  311 ttttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaag 357  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  22760804 ttttgatttactccaagtctgaagaagagcatgctgagcatttgaag 22760850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Original strand, 25607918 - 25608272
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  25607918 ttgaacaaggtgactataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttga 25608017  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||  |||||    
T  25608018 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaggtaatgctgttcgg 25608117  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  25608118 tgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagttgtttttattgatgatattttgatt 25608217  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  25608218 tactccaagtctgaagaagaagatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgt 25608272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 18405998 - 18406355
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18405998 cagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 18406097  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  18406098 tgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagattaagatatgcagaagacagccttcagaacgtattatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 18406197  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||||    
T  18406198 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 18406297  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||    
T  18406298 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaaactggttttgcaagtgt 18406355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 97 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22444413 - 22444137
Alignment:
Q  97 gttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22444413 gttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcataacgtgttatggtcactatg 22444314  T
Q  197 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggt 296  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22444313 aatacaaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgt 22444214  T
Q  297 gtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22444213 ttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 22444137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16574117 - 16573880
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  16574117 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16574018  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574017 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16573918  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16573917 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 16573880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 253
Target Start/End: Original strand, 16621263 - 16621500
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  16621263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16621362  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621363 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16621462  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621463 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 16621500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Original strand, 18183422 - 18183652
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  18183422 agttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatgcatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 18183521  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  18183522 gaggtccggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttc 18183621  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgg 247  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  18183622 ggtgttacaaatgcgcctggtgtgtttatgg 18183652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23080560 - 23080340
Alignment:
Q  152 aagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 251  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23080560 aagatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagta 23080461  T
Q  252 tacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcat 351  Q
     | ||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23080460 catgaatcgcatttttcatgcatttctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcat 23080361  T
Q  352 ctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  23080360 ttgaagattgttttgcaagtg 23080340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 23085825 - 23086181
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |    
T  23085825 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtattcccttccaagaattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 23085924  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||  | || || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || || || |||||||| || |||||||||  ||| ||||||||    
T  23085925 tgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgccttt 23086024  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| | |||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  23086025 cggtgttacaaatgcgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 23086124  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23086125 atatactctaagtatgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 23086181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21755160 - 21755002
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  21755160 tcagttgaacaag-taactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatttgttttcagcaagatagat 21755062  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttc 174  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755061 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttc 21755002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Original strand, 18963142 - 18963377
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  18963142 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 18963241  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  18963242 tgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 18963341  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 251  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  18963342 cggtgttactaatgcaccaggtgtatttatggagta 18963377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 10466902 - 10467258
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  10466902 tcagttgaacaaagttacagtaaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgac 10467001  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  |||| || ||||| ||||| |||||||    
T  10467002 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcattacgaatacaaagtgatgcctt 10467101  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  10467102 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 10467201  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  10467202 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagt 10467258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15461563 - 15461211
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  15461563 cagttgaacaaagttacaatcaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgact 15461464  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  15461463 tgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgccttt 15461364  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| | |||   || || ||||||||||| || |||||| ||    
T  15461363 cggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggtggtgtttatagatgatattctg 15461264  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    ||||| || || ||||| || ||||| || || ||  |||||||||| |||||    
T  15461263 atttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacttgaagattgtgttgca 15461211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 14377991 - 14378325
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || || || |    
T  14377991 aagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaa 14378090  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14378091 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14378190  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||   || || || || ||||| || |||| | ||||||| || |||||||| ||     
T  14378191 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagag 14378290  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14378291 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagt 14378325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 14379541 - 14379875
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || || || |    
T  14379541 aagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaa 14379640  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14379641 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14379740  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||   || || || || ||||| || |||| | ||||||| || |||||||| ||     
T  14379741 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagag 14379840  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14379841 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagt 14379875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24366640 - 24366282
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  24366640 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 24366541  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  24366540 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 24366441  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||  || || || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  24366440 tcggtgttactaatgtgccaggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 24366341  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  24366340 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgt 24366282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Original strand, 28280870 - 28281222
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  28280870 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtaggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 28280969  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28280970 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 28281069  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || || ||| |||||    
T  28281070 tgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 28281169  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  28281170 tattcgaagactgaaggagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagt 28281222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 24516461 - 24516667
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  24516461 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 24516560  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  24516561 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 24516660  T
Q  215 tcggtgt 221  Q
    |||||||    
T  24516661 tcggtgt 24516667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25770072 - 25769714
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  25770072 tcagttgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgat 25769973  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || || || ||||| || ||||| ||||| || ||| |||    
T  25769972 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctt 25769873  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| | |  ||||   || || || |||||||| || |||||  |    
T  25769872 tcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcct 25769773  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| || |||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25769772 aatttattctaagtatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgt 25769714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 30679061 - 30679215
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||    
T  30679061 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatctacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacacgtgtgtttagcaagattgatt 30679160  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagc 170  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  30679161 tgagatcaggctatcatcagattaaagtgacggatgaggatatgcagaagacagc 30679215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19437230 - 19436876
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||     
T  19437230 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggatttatgacttgatggatcagttggtgggtgcagaggtttttagtaagattgac 19437131  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  19437130 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 19437031  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || ||| |    
T  19437030 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattct 19436931  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  19436930 gatctattctagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaa 19436876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19455251 - 19454896
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || |||||| |     
T  19455251 tcagttgaacaaagttacgataacgaacaggaatccact-ccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagatttac 19455153  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || ||| |||    
T  19455152 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctt 19455053  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |  ||||||   || || || || ||||| || || || ||    
T  19455052 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggttgtatttattgatgacatctt 19454953  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  19454952 gatttattcaaagactaaagaagagcatgcagagcatctgaagatagtattgcaagt 19454896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 16380427 - 16380782
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  16380427 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16380526  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16380527 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16380626  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  16380627 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16380726  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  16380727 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 16380782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 16648023 - 16648378
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  16648023 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaaaggtgtttagtaagattgatt 16648122  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16648123 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16648222  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  16648223 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16648322  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  16648323 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 16648378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19881501 - 19881170
Alignment:
Q  40 aataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||| |    
T  19881501 aatagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatca 19881402  T
Q  140 aagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 239  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19881401 aggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgt 19881302  T
Q  240 gtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaa 339  Q
    ||| |||||||||| |||| | || || ||||| |   |||||   || || || ||||| || || || |||||||| || || |  |||||||||||     
T  19881301 gttcatggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgttcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagag 19881202  T
Q  340 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  19881201 catgcagaacatctgaggattgtattgcaagt 19881170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23998475 - 23998352
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  23998475 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagcaagattgatt 23998376  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  23998375 tgagatcaggatatcatcagatta 23998352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 34643639 - 34643882
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || || |||||     
T  34643639 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagtaaaattgac 34643738  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  34643739 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 34643838  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaat 258  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  34643839 tcggtgttactaacgcgcctggggtgttcatggagtatatgaat 34643882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21473828 - 21473471
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    || |||| ||| ||||||    
T  21473828 tcagttgaataaagtgacgataaagaacatgtatcgacttcctagaattgatgatttaatgaatcagttagtgggtgctcgtgtgttcaacaaaattgat 21473729  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| || ||| |||    
T  21473728 ttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctt 21473629  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||| ||| || |||||  |||| |||||||||||||||| ||| || || || ||||| | | |||||   || || || ||||||||  | |||||  |    
T  21473628 tcgatgttactaatgc-gctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttatttatgatatcct 21473530  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| || |||| ||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  21473529 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgt 21473471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Original strand, 21568046 - 21568311
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||  |||| || |||||||| ||    
T  21568046 agttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgctgccgaggattgacgacttgatggatcaattgtttggtgcaaagatttttagtaagattgactt 21568145  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  21568146 gaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacgaatacaaagtgatgtctttc 21568245  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggat 282  Q
    ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||    
T  21568246 ggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggat 21568311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18796896 - 18796680
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  18796896 aagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggctaccatcaga 18796797  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||  |||||    
T  18796796 tcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgtgcctgg 18796697  T
Q  237 agtgtttatggagtata 253  Q
     ||||| ||||||||||    
T  18796696 tgtgttcatggagtata 18796680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 1646868 - 1646998
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  1646868 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 1646967  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  1646968 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 1646998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 140
Target Start/End: Original strand, 8761805 - 8761930
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| |  || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8761805 tcagttgaacaaaggtacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgac 8761904  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaa 140  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||    
T  8761905 ttgaggtcaggttaccatcagattaa 8761930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14130696 - 14130566
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || |||||||||||||    
T  14130696 cagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagcaagattgatt 14130597  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14130596 tgaggtcaagatatcatcagattagagtgaa 14130566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16100242 - 16100112
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  16100242 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccactaccaaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16100143  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  16100142 tgagatcaggatatcatcagattatagtgaa 16100112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 23025800 - 23025930
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||   | || || || ||||||||||    
T  23025800 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgtggaggtgtttagtaagattgatt 23025899  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23025900 tgaggtcaagatatcatcagattagagtgaa 23025930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23080650 - 23080573
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 93  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23080650 cagttgaataaagtaacgataaagaatagatattcacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 23080573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 28311857 - 28311819
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28311857 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 28311819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 372
Target Start/End: Original strand, 18196026 - 18196143
Alignment:
Q  255 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctg 354  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||| ||||| ||    
T  18196026 gaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatttatgatattttgatatactccaagtccgaagaagagcatgctaagcatttg 18196125  T
Q  355 aagattgtcttgcaagtg 372  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18196126 aagattgttttgcaagtg 18196143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 51
Target Start/End: Original strand, 23496245 - 23496281
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23496245 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23496281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18450702 - 18450579
Alignment:
Q  44 ggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagt 143  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||    || ||||| || ||||| || || ||  | |||||| |||| |||||    
T  18450702 ggtatccacttccgaggatcaacgatttgatggatcaattagtgggtgcgcttgtgttcagtaaaattgacttaagctcgggctatcactagatcaaagt 18450603  T
Q  144 gaaagatgaagatatgcagaagac 167  Q
    |||||| || ||||| ||||||||    
T  18450602 gaaagaagaggatattcagaagac 18450579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 373
Target Start/End: Original strand, 19487528 - 19487683
Alignment:
Q  208 atgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacg 307  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||          |||| | |||||||||||| || || || ||||| || |    
T  19487528 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaat----------atgcttatttggatcggtttgtggttgtttttattgatg 19487617  T
Q  308 atattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    | || |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  19487618 acatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgt 19487683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 107723 - 108080
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  107723 cagttgaacaagataactatcaagaataggtatccacttccgagaatggatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagagttttcagcaagattgatt 107822  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107823 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgtagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 107922  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  107923 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 108022  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108023 atttactccaagattgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 108080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 94805 - 95043
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  94805 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 94904  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  94905 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcactacgaatacaaagtgatgcctt 95004  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||| || || || || || ||||| ||||||||||    
T  95005 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtata 95043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 114956 - 114711
Alignment:
Q  13 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 112  Q
    ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||    
T  114956 catcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattg 114857  T
Q  113 atttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 212  Q
    | ||| | ||| | || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||    
T  114856 acttgtggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcc 114757  T
Q  213 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaat 258  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  114756 tttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaat 114711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 37731 - 38089
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37731 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacatgttttcagcaagattgat 37830  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37831 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 37930  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || || ||||| ||||||||    
T  37931 tcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgcggttgttttcatcgatgatatttt 38030  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38031 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 38089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23099 - 22743
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    | || |||||||||||||    
T  23099 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaatagatgatttgatggatcagttagtgggtgaatgtctgtttagcaagattgatt 23000  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||   || ||||||||    
T  22999 tgagatcgggctaccaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcggtgatgccttt 22900  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    || ||| || | ||| || || |||||||||||||| | |||||| || || ||||| | ||||||||  ||||| || ||||| ||| | |||||||||    
T  22899 cgttgttacaactgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcacttcgtggttgtgttcatcaatgatattttg 22800  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22799 atatactctaagtctgaagaagaacacactgagcatttgaagattgttttgcaagtg 22743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9760 - 9403
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  9760 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatctgatggatcagttagtgggtacacgtgttttcagcaagattgatt 9661  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9660 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 9561  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  9560 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttt 9461  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9460 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 9403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35891 - 35533
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  35891 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 35792  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 35692  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||    
T  35691 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctcatcgatgatatttt 35592  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35591 aatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 35533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 101 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28408 - 28222
Alignment:
Q  101 tcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28408 tcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 28309  T
Q  201 taaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtt 287  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28308 caaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtt 28222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3111 - 2753
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||    
T  3111 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgacgattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 3012  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||  | ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  3011 ttgaggtcaggttaccatcagattaagtcgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaatataaagtgatgcctt 2912  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  2911 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 2812  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2811 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgt 2753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28475 - 28405
Alignment:
Q  11 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 81  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28475 atcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 28405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10865 - 10511
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10865 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 10766  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10765 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacgactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 10666  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  10665 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatt 10566  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10565 tactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctaaagattgtcttgcaagtgt 10511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17327 - 16973
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17327 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 17228  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17227 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 17128  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  17127 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatt 17028  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17027 tactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 16973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 45541 - 45190
Alignment:
Q  20 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  45541 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccgcttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgag 45442  T
Q  120 atcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggt 219  Q
     ||| | |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45441 gtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggt 45342  T
Q  220 gtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgattt 319  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  45341 gttaccaatgcacctagagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgattt 45242  T
Q  320 actccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45241 actccaagactgaagaagaacatgctgatcatctgaagattgtcttgcaagt 45190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Original strand, 48447 - 48663
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  48447 aagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 48546  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  48547 tcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 48646  T
Q  237 agtgtttatggagtata 253  Q
     ||||| ||||||||||    
T  48647 tgtgttcatggagtata 48663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 5)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Original strand, 85709 - 86065
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  85709 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttacgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagtaagattgattt 85808  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  85809 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 85908  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || |||||||    
T  85909 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgttttcatcgatgacattttga 86008  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  86009 tttactccaagactgaagaagaacatattgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 86065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 85142 - 85499
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  85142 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttacgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaaaagttttcagcaagatagatt 85241  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  85242 tgagataaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 85341  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||     
T  85342 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatatttta 85441  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  85442 atttcctccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagcttgttttgcaagtgt 85499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 158
Target Start/End: Original strand, 132401 - 132543
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  132401 cagttgaacaaagtggcgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 132500  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatat 158  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || | |||||||||    
T  132501 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggctgaagatat 132543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26162 - 26031
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||  || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | || |||||| | || || || |||||||||    
T  26162 tcagttgaacattgtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatgtatcatcttgttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 26063  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    ||||||||| | ||||| | ||||| ||||||    
T  26062 ttgagatcaggatatcatccgattagagtgaa 26031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25907 - 25866
Alignment:
Q  329 ctgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  25907 ctgaggaagaacatgctgagcatttgaggattgtgttgcaag 25866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21639 - 21296
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  21639 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 21540  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21539 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatggagagatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggttactatgaatataaagttatgccttt 21440  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21439 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 21340  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagat 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21339 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagat 21296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 54902 - 55260
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  54902 tcagttgaacaaagtaactatcaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 55001  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55002 ttgagatcaggttataaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataaagttatgcctt 55101  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || || || || ||| | || ||||||||    
T  55102 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggatccctttgtggttgtttttctggatgatatttt 55201  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55202 tatttactccaatactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 55260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 110023 - 109669
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||||| ||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||    
T  110023 agttgaacatggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgattt 109924  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  109923 gaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttc 109824  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| || ||||  ||| | ||||||||||||| || ||| || || |||||||| | | | |||   || || || |||||||| || || ||  |||    
T  109823 ggtgttactaatgtgcctagtgtgtttatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcgtga 109724  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  109723 tttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 109669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Original strand, 51258 - 51614
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  51258 agttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 51357  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  51358 gagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagtcatgcctttt 51457  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||  || || || || || ||||| || |||||||    
T  51458 ggtgttaccaatgcacctcgagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcactttgtggttgttttcatcgatgacattttga 51557  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51558 tttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 51614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42091 - 41733
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || || || || ||||||    
T  42091 tcagttgaataaagtgacgattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagtaaaattgat 41992  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41991 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 41892  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    |||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  | || || ||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  41891 tcggagttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 41792  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41791 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgt 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17035 - 16694
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17035 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 16936  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16935 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgccttt 16836  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  16835 cggtgttacaaatgcaccaggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcggttcgtggtggtttttatcgatgatattttg 16736  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaag 357  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16735 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaag 16694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12167 - 11830
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga-tttgagatcaaggtatcaccag 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || || || ||||| |||||| ||| | || || |||    
T  12167 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgaatttgaggtcaggttaccatcag 12068  T
Q  136 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctg 235  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12067 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctg 11968  T
Q  236 gagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgagga 335  Q
    | |||||||||||||||| |||  | || || ||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || |||| ||| ||    
T  11967 gtgtgtttatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaaga 11868  T
Q  336 agaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11867 agagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgt 11830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36417 - 36063
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  36417 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaagttttcagcaagatagatttga 36318  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36317 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtataaagttatgcctttcgg 36218  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| |||    
T  36217 tgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatt 36118  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36117 tactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 36063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20993 - 20639
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  20993 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaagttttcagcaagatagatttga 20894  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  20893 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagatatgcctttcgg 20794  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| |||    
T  20793 tgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatt 20694  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20693 tactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 20639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 151504 - 151147
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  151504 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 151405  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  151404 tgagatctggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 151305  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||     
T  151304 cggtgttatgaatgcacttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgataatatttta 151205  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  151204 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggtgttgcaagtgt 151147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Original strand, 2417 - 2759
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  2417 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatgaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 2516  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||     
T  2517 tgagatccggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgccttc 2616  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| || || || | ||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||    
T  2617 tggtgttacaaacgcgcttggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttg 2716  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaaga 358  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2717 atttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcatttgaaga 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 87078 - 86807
Alignment:
Q  100 ttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaat 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| || || ||  |||    
T  87078 ttcagtaagattgatttaagatcgggctatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaat 86979  T
Q  200 ataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtt 299  Q
    ||    | |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| |||||  || || ||||| | |||| |||| || || ||  ||||    
T  86978 attcgatgatgcctttcggtgttactaacgcccctggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgatttgttgttatgtt 86879  T
Q  300 tatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  86878 tatagatgagattctaatatactctaagaccgaggaggaacatgccgagcat-ttaagaatgttttgcaagtg 86807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 24857 - 25214
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  24857 cagttgaacaaaataacgataaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagattgact 24956  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24957 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatgaatataaagtgatgccttt 25056  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||||    
T  25057 cggtgttacaaatgcacctgaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttctttttattgacgatattttg 25156  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  25157 atttactccaagattgaggaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 25214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 7571 - 7928
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7571 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccactttcaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaatgttttcagcaagatagatt 7670  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  7671 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatgagtacaaagttatgccttt 7770  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||    
T  7771 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatagttgtttttattgatgatattttg 7870  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  7871 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 7928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3293 - 2937
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  3293 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtacccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 3194  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || || || ||||| || || ||  |||||  ||| ||||||||    
T  3193 tgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgccttt 3094  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||| || | |||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  3093 cggtgttactaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 2994  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || || || ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  2993 atataatctaagtctgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtg 2937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 93 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8331 - 8051
Alignment:
Q  93 aaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcac 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8331 aaaagttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccatattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgctttatggtcac 8232  T
Q  193 tatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtag 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  8231 tatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcctttttggatcggttcattg 8132  T
Q  293 tggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8131 ttgtgtttatcgacgatattttgatttacttcaaaactgaggaggaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgt 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 803
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1157 agttgaacaaggtgacaatcaagaataggtatccacttccgagtattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagattt 1058  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||    
T  1057 gagatc--gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttc 960  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  959 ggtgttacaaatgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttga 860  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  859 tttacttcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8765 - 8409
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8765 cagttgaaaaaggtgacaataaagaataggtattcacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttt-cagcaagatagatt 8667  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8666 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacatctttcataacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8567  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||    
T  8566 cggtgttacgaatgcacctgtagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgatgatattttg 8467  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  8466 atttactccaagtctaaggaagaacattctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 8409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8086
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8443 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 8344  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8343 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8244  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | || || || || |||||||||    
T  8243 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtgcttgttttcattgatgatattttg 8144  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  8143 atttactccaagtttgaggaagaatatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 8086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17639 - 17282
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17639 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 17540  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17539 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 17440  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  | || || || || |||||||||    
T  17439 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcttgcttgttttcattgatgatattttg 17340  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  17339 atttactccaagtttgatgaagaatattttgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 17282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 453 - 96
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  453 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 354  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  353 tgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgccttt 254  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||||    
T  253 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatattttg 154  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  153 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 18253 - 18610
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18253 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttctgaggattgatgatttgatggatcagttagtgagtgcaaaagttttcagcaagatagatt 18352  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  18353 tgagatcaggttatcactagattatagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatgatcactatgagtacaaagttatgccttt 18452  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||    
T  18453 cggtgttacgaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtttttatcgatgatattttg 18552  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  18553 atttaccccaagtttgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 18610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22273 - 22002
Alignment:
Q  11 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 110  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  22273 atcatcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgaaaaagtttttagtaagat 22174  T
Q  111 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 210  Q
     || ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| ||||| || || || |||    
T  22173 cgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgagtacaaggtgatg 22074  T
Q  211 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggat 282  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22073 cctttcggtgttactaacgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 22002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39447 - 39307
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  39447 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttcatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttga 39348  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatg 159  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  39347 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatg 39307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3974 - 3618
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  3974 agttgaacaaagtaacgataaaaaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagattt 3875  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3874 gagatcgggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttc 3775  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || || |||||||    
T  3774 ggtgttacaaatgcacctgctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttga 3675  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||    
T  3674 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagactgttttggaagtgt 3618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3826 - 3485
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  3826 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatc 3727  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  3726 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacattatgagtataaagttatgccttt 3627  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||||    
T  3626 cggtgttactaattcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 3527  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaag 357  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3526 atttactccaactctgaagaagaacatgctgagcatttgaag 3485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 691 - 1045
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  691 cagttgaataaggtaacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgaacgtgttttcagcaagattgatt 790  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  791 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 890  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||    
T  891 cggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttg 990  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  991 atttactccaagtct---gaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20632 - 20275
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  20632 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctagtgttttcagcaagattgact 20533  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  20532 tgagatcaggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 20433  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||    
T  20432 cggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 20333  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  20332 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgt 20275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 725 - 1078
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  725 cagttgaaaaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 824  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||   | ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  825 tgaga---aagtg-cagaagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgccttt 920  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || || || || || || | |||||||    
T  921 cggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgttttcatagatggtattttg 1020  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  1021 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 1078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 127 - 373
Target Start/End: Original strand, 23097 - 23343
Alignment:
Q  127 tatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgacca 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23097 tatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacca 23196  T
Q  227 atgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23197 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaa 23296  T
Q  327 gactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23297 aactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgt 23343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Original strand, 29828 - 30098
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29828 agttgaacaaagttagtatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacaagttttcagcaagattgattt 29927  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29928 gagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgtagaagacagctttcaaaacccgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 30027  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtt 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ggtgttaccaatgcacctggagtaattatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtt 30098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8414 - 8057
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8414 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 8315  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||    
T  8314 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagattatgagtataaggtgatgccgtt 8215  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||||    
T  8214 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 8115  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||    
T  8114 atttactccatgtctgaagaagaacatgctaagcatttgaagctagttttgcaagtgt 8057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24570 - 24440
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  24570 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24471  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    | |||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  24470 taagatcaggatatcatcagattagagtgaa 24440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7615 - 7258
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  7615 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctaatgttttcagcaagattgact 7516  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| || ||| | ||    
T  7515 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgtggtatggacattatgagtataaggtgatgtcgtt 7416  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||    
T  7415 cggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 7316  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  7315 atttactccaagaccgaggaagaacatgttgagcatttgaagttggttttgcaagtgt 7258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 1294 - 1651
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1294 cagttaaacaaggtgacaataaagaaaaggtatccacttccgaggattgatgattttatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagctt 1393  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  1394 tgagatcgggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggccattatgagtacaaagttatgccttt 1493  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | || || || || || |||||||||    
T  1494 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatgatattttg 1593  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  1594 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 1651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41026 - 40669
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41026 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 40927  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  40926 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgccttt 40827  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  | || || || || |||||     
T  40826 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacatttta 40727  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  40726 atttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgt 40669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 74746 - 74389
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  74746 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 74647  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  74646 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgccttt 74547  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  | || || || || |||||     
T  74546 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacatttta 74447  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  74446 atttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgt 74389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 56128 - 55792
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  56128 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgatttgagatcgggttatcaccaga 56029  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  56028 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccctgg 55929  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  55928 agtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaa 55829  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  55828 gaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgt 55792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 8738 - 8859
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  8738 cagttgaacaatttgactattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 8837  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagat 137  Q
    |||||||| | ||||| |||||    
T  8838 tgagatcaggatatcatcagat 8859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 371
Target Start/End: Original strand, 9015 - 9093
Alignment:
Q  293 tggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    ||||||| || || ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  9015 tggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 9093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 38 - 373
Target Start/End: Original strand, 1 - 336
Alignment:
Q  38 agaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagat 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  1 agaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagat 100  T
Q  138 taaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||     
T  101 taaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggt 200  T
Q  238 gtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaag 337  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 gtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaag 300  T
Q  338 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  301 aacatgctgagcatttgaagactgtgttgcaagtgt 336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 68 - 373
Target Start/End: Original strand, 28446 - 28732
Alignment:
Q  68 atttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28446 atttaatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 28545  T
Q  168 agctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28546 agctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgc-------------------acctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttc 28626  T
Q  268 catgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28627 catgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 28726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 307 - 373
Target Start/End: Original strand, 28774 - 28840
Alignment:
Q  307 gatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28774 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 28840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 6999 - 7356
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  6999 cagttaaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 7098  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  7099 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgtcgtt 7198  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || ||||| || ||||||    
T  7199 cggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttg 7298  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  7299 gtttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgt 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 24445 - 24802
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  24445 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 24544  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24545 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 24644  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  24645 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 24744  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24745 atatactcgaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgt 24802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 150964 - 150608
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||     
T  150964 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagattgac 150865  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  150864 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacactatgaatataaagtgatgcctt 150765  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   ||| | || |  ||||| || || |||||    
T  150764 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggttgaatttattgatgacatttt 150665  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  150664 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 150608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 372
Target Start/End: Original strand, 14394 - 14747
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  14394 ttgaataaagtaacgataaagaataaatatccacttccaagaattaatgattttatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaagattgatttga 14493  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14494 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 14593  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  14594 tgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatagtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgata 14693  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14694 tactccaagattgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtg 14747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2993 - 2636
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| ||||    
T  2993 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccatgaattgatgacttgatggatcagttagtggatgcacgtgttttcatcaagatagatt 2894  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2893 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgtt 2794  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    | |||| || ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || || ||||| || |||||||||    
T  2793 cagtgttacaaatgcacctcgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgatattttg 2694  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  2693 atttactgcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 2636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 13123 - 13480
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  || ||||    
T  13123 cagttgaacaaagtaacgataaagaataagtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagaagaatagatt 13222  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13223 tgagatcgggttatctccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 13322  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |  || |||||||||    
T  13323 tggtgttacgaatgcacgtggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgatttaaaagatgatattttg 13422  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  13423 atttactccaagtctgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4296 - 3952
Alignment:
Q  28 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 127  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||   || || |||||||||||||| |||||  | |    
T  4296 gtaacgataaagaataggtatccgcttccaagaattgatgatttgatggatcattttgtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttaagatcgggtt 4197  T
Q  128 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||    
T  4196 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 4097  T
Q  228 tgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 327  Q
    | | || || |||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4096 tacgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 3997  T
Q  328 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3996 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtattgcaagtg 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 40244 - 40602
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  40244 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 40343  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  40344 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 40443  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  40444 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 40543  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  40544 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 40602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 45342 - 45576
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  45342 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttga 45441  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    | ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  45442 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattaagaataaaaggtgatgcctttcgg 45541  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  45542 tgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 45576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 81 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31274 - 30982
Alignment:
Q  81 gttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacg 180  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31274 gttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatctgagatcgagttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacg 31175  T
Q  181 cgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttgg 280  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  31174 cggtatggccactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtgcatgaatcgcatctttcatgcatttttgg 31075  T
Q  281 atcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||| | || || ||||| || ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  31074 atcggttcatggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtcttaataagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 30982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51183 - 50847
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || || || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  51183 aagaataggtatccactttcgagaattgaagatttaatggatcagttagtgggtgctcttgtatttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 51084  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  51083 ttaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 50984  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||| | || || ||||| | | |||||   ||  | || |||||||| || || || || ||||| || | |||||| |||    
T  50983 tgtgtttatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctatgactgaagaa 50884  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50883 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgt 50847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Original strand, 15906 - 16128
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15906 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 16005  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagt-gaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  16006 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaggttatgcgtt 16105  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctgga 237  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  16106 ttggtgttaccaatgcacctgga 16128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 103618 - 103271
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  103618 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatg--------gatcaattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 103527  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  103526 gagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatgagtataaagtgatgcctttc 103427  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    |||||  | ||||| || || |||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  103426 ggtgttgcaaatgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtagtattcatcgatgatattttga 103327  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||    
T  103326 tttactccaagtctgaggaagaacatgccgaacatttgaagactgttttgcaagtg 103271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 495412 - 495056
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || || ||||| ||| |||    
T  495412 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggttcacgtgtgtttagcaatatttatt 495313  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  495312 tgagatctggttatcacctgattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 495213  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||    
T  495212 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttg 495113  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  495112 atatactcgaagtctgaagaagaacatgctgagtatttgaagattgttttgcaagtg 495056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 453146 - 453480
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  453146 aagaataggtatccacttccgaggatcgatgatttaatggatcagttagtgggtgctagtgtattcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 453245  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  453246 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 453345  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||||||||| |||| ||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| |  |||||||| |||    
T  453346 tgtgtttatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttatttgaagactgaagaa 453445  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  453446 gagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagt 453480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 515264 - 515622
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  515264 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccgcttcctagaattgatgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 515363  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  515364 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgattacaaagtgatgcctt 515463  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  515464 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgtttattgatgatatctt 515563  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  515564 aatttattccaagaatgaagaggaacacgcagagcatctgagaattgtcttgcaagtgt 515622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17270 - 16914
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || || || |||||| |||    
T  17270 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaagattaatt 17171  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||| || |||||    
T  17170 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattcagtgat-ccttt 17072  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||| | |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  17071 cggtgttaccaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 16972  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16971 atatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgt 16914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 130 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4474 - 4231
Alignment:
Q  130 caccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4474 caccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatg 4375  T
Q  230 cacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagac 329  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || || || || ||||| || |||||| ||||||||| |||||     
T  4374 cacttggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgatattctgatttacttcaagaa 4275  T
Q  330 tgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4274 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 4231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 127 - 373
Target Start/End: Original strand, 6354 - 6600
Alignment:
Q  127 tatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgacca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |    
T  6354 tatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttttgcctttcggtgttacga 6453  T
Q  227 atgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaa 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6454 atgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcgtttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaa 6553  T
Q  327 gactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  6554 gtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 6600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Original strand, 15135 - 15489
Alignment:
Q  18 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttg 117  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||| ||||    
T  15135 gttgaagaaagtaacaataaagaataggtatacacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgctttg 15234  T
Q  118 agatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcg 217  Q
    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| | || |||||||||||||| || |||||||    
T  15235 agatcgggttatcatcggattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacattatgaatataaagtgattcctttcg 15334  T
Q  218 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgat 317  Q
    |||| || ||||| || ||  | ||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  15335 gtgttacaaatgcgccaggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtgattgtgttcatcgacgatattttgat 15434  T
Q  318 ttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15435 atactccaagactgaagaagaacaagctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 15489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18042 - 17691
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| ||||    
T  18042 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttggtgggtg-acgtgttttcagcaagatagatt 17944  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  17943 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccttt 17844  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |  || ||     ||    
T  17843 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcaatgatga-----tg 17749  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  17748 atttacttcaatactgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 17691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 488
Alignment:
Q  28 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 127  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| |||||||||||  | |    
T  832 gtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgataacttgatggatcagttagtgagtgcacgtgttttccgcaagatagatttgagatcgggtt 733  T
Q  128 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||  ||||| || ||||| ||||| || ||||||||| || | || ||    
T  732 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatgtccagaagacagcttttagaatgcagtatggacattatgagtataaggtaatgcctttcagttttactaa 633  T
Q  228 tgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  632 tgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtttttatttatgatattttgatttactctaag 533  T
Q  328 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     |||| |||||||||  ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  532 tctgaagaagaacat-atgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 218 - 1
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  218 ttgaacaatgtgactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtttgtgggtgcacgcgttttcagcaagattgatttga 119  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  118 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagatttcagaacacggtatggtcactatgtatataaagttatgccttttgg 19  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  18 tgttaccaatgcacctgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 5262 - 5619
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||    
T  5262 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgctcgtgtattcagcaagattgat 5361  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  5362 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatt 5461  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || |||||  || | |||||||||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  5462 tcggtgttactaatgcgact-gcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 5560  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5561 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgt 5619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 9693 - 10050
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||    
T  9693 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgctcgtgtattcagcaagattgat 9792  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  9793 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatt 9892  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || |||||  || | |||||||||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  9893 tcggtgttactaatgcgact-gcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 9991  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  9992 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgt 10050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 10653 - 11009
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  10653 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgatt 10752  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  10753 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 10852  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||   |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || || |||||||||    
T  10853 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttg 10952  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10953 atatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtg 11009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 24210 - 24566
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |    
T  24210 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 24309  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    ||||||   | |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||  ||| ||||||||    
T  24310 tgagattgggttatcactagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattcagtgatgccttt 24409  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || || || ||  | |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | | | ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  24410 cggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgacattttg 24509  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| |||||||| ||||||| || || |||| |||||||||| |||||||||    
T  24510 atatactctaagactgaagaagaacttgttgcgcatttgaagattgttttgcaagtg 24566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 372
Target Start/End: Original strand, 16958 - 17201
Alignment:
Q  129 tcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| |||||||||||||| || |||    
T  16958 tcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaat 17057  T
Q  229 gcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaaga 328  Q
    || || || ||||||||||||||   |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||    
T  17058 gcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaaga 17157  T
Q  329 ctgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17158 ctgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtg 17201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14841 - 14506
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || || ||||| ||  ||||||||||| | ||||||| ||    
T  14841 aagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtacacgtgtgtttagcaacatcaatttgagatcaggttatcacccga 14742  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||    
T  14741 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacctgg 14642  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||||||||| || | |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||    
T  14641 tgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaagaa 14542  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14541 gagcatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 14506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5504 - 5150
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  5504 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcctataattgatgatttgttggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 5405  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    |||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  |||||||||  ||| |||||||||    
T  5404 gagattgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggctttatgaatattcagtgatgcctttc 5305  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| | |||||| || || ||||| | ||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||    
T  5304 ggtgttacgaatgcgccaggtgtgttcat-gagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggttgtgttcattgacgatattttga 5206  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5205 tatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 5150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11486 - 11172
Alignment:
Q  45 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | || || | |||||| |||    
T  11486 gtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatctgattaaggtg 11387  T
Q  145 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 244  Q
    || ||| | |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  11386 aaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttca 11287  T
Q  245 tggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 344  Q
    ||||||||| ||| || || |||||||| | |||||||   || || || |||||||| || |||||| | ||||| || |||||||| || || |||||    
T  11286 tggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagactgaagaggagcatgc 11187  T
Q  345 tgagcatctgaagat 359  Q
     || |||||||||||    
T  11186 agaacatctgaagat 11172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6264 - 5908
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||   || || ||||||||||||||    
T  6264 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 6165  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  6164 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 6065  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || | |||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  6064 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttga 5965  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    | ||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  5964 tatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgt 5908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13394 - 13038
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||   || || ||||||||||||||    
T  13394 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 13295  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  13294 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 13195  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || | |||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  13194 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttga 13095  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    | ||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  13094 tatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgt 13038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10514 - 10284
Alignment:
Q  62 ttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgca 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10514 ttgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgca 10415  T
Q  162 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgc 261  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  10414 gaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgc 10315  T
Q  262 atcttccatgcatttttggatcggttcgtag 292  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10314 atctttcaagcatttttggatcggttcgtag 10284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 253
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1694
Alignment:
Q  55 ccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaag 154  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||| | |    
T  1496 ccgaggattgatgacttgatggatcagctagtgggtgcgagggttttcagtaagattgacttgaggtcaggctaccatcagatcaaggtgaaggataagg 1595  T
Q  155 atatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||| |||||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  1596 atatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgtctttcgttgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 1694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 275 - 1
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||| |||    
T  275 tcagttgaaaaaagtaactataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgttttcaacaagatagat 176  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||     
T  175 ttgagatcgggttatcactagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacattatgagtataaagttttgcctc 76  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcg 289  Q
    || |||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  75 tcagtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 372
Target Start/End: Original strand, 217335 - 217688
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||||||||||||||    
T  217335 ttgaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttttgcaagattgatttga 217434  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  217435 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 217534  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| | |||||  || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| | || || |||||||||||     
T  217535 tgttacaaatgccccaggtgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcgttttttgatcgtttcgtggttgtgatcattgatgatattttgata 217634  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||| |||   || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  217635 tactcgaagttcgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtg 217688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 171 - 373
Target Start/End: Original strand, 407 - 609
Alignment:
Q  171 tttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccat 270  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  407 tttcagaacacggtatggtcactattaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatcttccat 506  T
Q  271 gcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaag 370  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  507 gcatttttggatcggttcttagttgtgttcatcgatgataatttgattgactccaagactaaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcctgcaag 606  T
Q  371 tgt 373  Q
    |||    
T  607 tgt 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 8657 - 8822
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8657 ttgaagaaggtaactatcaagaataggaatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 8756  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgtt 184  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8757 ggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgtt 8822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 239
Target Start/End: Original strand, 10914 - 10975
Alignment:
Q  178 acgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914 acgcgttatggtcactatgagtataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 15890 - 16246
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15890 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacatgtgttcagcaagattgatt 15989  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| || ||||| |||  ||| ||||||||    
T  15990 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacattatgagtattcagtgatgccttt 16089  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     ||||| || || || || || ||||||||| |||| | ||||||||| || ||||| | | | ||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  16090 gggtgttacaaacgcgccaggtgtgtttatgtagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttatattcatcgatgatattttg 16189  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  16190 atatactctaagactgaagaggaatatgctgagcatttgaagatt-ttttgcaagtgt 16246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24609 - 24253
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||     
T  24609 tcagttaaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaagggtgttcagtaagattgac 24510  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  24509 ttgaggtcaagttaccaccagattaaggtgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 24410  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  24409 tcggtgttactaatgcgcctggggtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 24310  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24309 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagt 24253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 44350 - 44684
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || ||||| || ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  44350 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 44449  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  44450 ttaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 44549  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||    || |||||||||| | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||| | |||    
T  44550 tgtgtttatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactaaagaa 44649  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || ||| |  | |||||||||||||| ||||||||    
T  44650 gagcatacaaaacatctgaagattgtattgcaagt 44684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 372
Target Start/End: Original strand, 8958 - 9302
Alignment:
Q  28 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 127  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||  | |    
T  8958 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttgagatcgggtt 9057  T
Q  128 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 227  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| || ||    
T  9058 atcaccagattaaggtgaaagacggggatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 9157  T
Q  228 tgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaag 327  Q
    ||| || || |||||||||||||| | |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  9158 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactctaag 9257  T
Q  328 actgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
     |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  9258 tctgaagaagaacatgttgagcatttgaggattgttttgcaagtg 9302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 1324
Alignment:
Q  28 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||    
T  1414 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttga 1324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6718 - 6628
Alignment:
Q  28 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||    
T  6718 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttga 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11223 - 10865
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||     
T  11223 tcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgac 11124  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |  || || || || || |||||||||||||| |||||||    
T  11123 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatgaatataaagtgatgcctt 11024  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| | || |||||||| | ||||||||  || ||||| |||||||| || || || ||    
T  11023 tcggtgttaccaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtgtttattgatgacatctt 10924  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||| | |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  10923 gatttattctaagactgaagaagagcatacagagcatttaaagattgtattgcaagtgt 10865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 251015 - 250657
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  251015 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcaattggtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgac 250916  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  250915 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 250816  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  250815 tcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgacatctt 250716  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  250715 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgt 250657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 201379 - 201737
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||    
T  201379 tcagttgaataaagtgacgataaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtacacgagtgtttagcaagattgat 201478  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || || ||||||  ||| |||||||    
T  201479 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctt 201578  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||  | || || |||||||||||||| | |||| | || |||||||| | |||||||||||| || || |||||||| || ||||||||    
T  201579 tcggtgttactaacacgccgggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgatatttt 201678  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  201679 gatatactctaagactgaagaagaacatgcagaacatttgaaggttgtgttgcaagtgt 201737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 325069 - 324745
Alignment:
Q  45 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 144  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||| | || || |||||||| |||    
T  325069 gtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaggtttttagtaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtg 324970  T
Q  145 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 244  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  324969 aaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttca 324870  T
Q  245 tggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgc 344  Q
    ||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   ||||| || || ||||| || || ||| |||| || || | |||||| ||||| ||||     
T  324869 tggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaagagcatgt 324770  T
Q  345 tgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
     || |||||||||||||| ||||||    
T  324769 agaacatctgaagattgtattgcaa 324745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 372
Target Start/End: Original strand, 5804 - 6157
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||   || || ||||||||||| ||||    
T  5804 ttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttgatggaccagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgacttga 5903  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 218  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||| || || ||||||   || |||||||||||    
T  5904 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacattaggaatattcggtgatgcctttcgg 6003  T
Q  219 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatt 318  Q
    ||| || || || || || |||||||||||||| | |||||| || |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  6004 tgttacaaacgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgcatatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgata 6103  T
Q  319 tactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  6104 tactctaaggctgaagaagaacatgctgagcaattgaagattgttttgcaagtg 6157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29016 - 28659
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    || |||| ||| |||||||    
T  29016 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcaacaaaattgatt 28917  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  28916 tgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccttt 28817  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   || || || |||||||| || || || |||    
T  28816 cggtgttactaatgcgcctggtgtgcttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttg 28717  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  28716 atttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgaaagtgt 28659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 50113 - 50449
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || |    
T  50113 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 50212  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||    
T  50213 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 50312  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| |||||||||   ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  50313 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 50412  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  50413 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgt 50449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 59147 - 59483
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || |    
T  59147 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 59246  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||    
T  59247 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 59346  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| |||||||||   ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  59347 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 59446  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  59447 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgt 59483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 65535 - 65871
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || |    
T  65535 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 65634  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||    
T  65635 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 65734  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| |||||||||   ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  65735 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 65834  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  65835 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgt 65871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 9969 - 10324
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9969 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 10068  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    || || || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||  | || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  10069 ttaaggtc-aggtaccatcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 10167  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||| ||| || || |||||||| |   | |||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  10168 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 10267  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  10268 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 10324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 371
Target Start/End: Original strand, 2892 - 3220
Alignment:
Q  43 aggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaag 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||| |    
T  2892 aggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaagg 2991  T
Q  143 tgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtt 242  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  2992 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 3091  T
Q  243 tatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacat 342  Q
     |||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   ||||| || |||||||| || || ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  3092 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcctaatttattcaaagactgaagaagagcat 3191  T
Q  343 gctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3192 gcagagcatctgaagattgtattgcaagt 3220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 69765 - 69448
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||     
T  69765 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaattggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 69666  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  69665 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 69566  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  69565 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatatttt 69466  T
Q  315 gatttactccaagactga 332  Q
    |||||| || ||||||||    
T  69465 gatttattctaagactga 69448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 2183 - 2541
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||| ||| ||||||    
T  2183 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtattcaacaaaattgat 2282  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  2283 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctt 2382  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| | |||||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  2383 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 2482  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2483 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgt 2541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 29196 - 29554
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||| ||| ||||||    
T  29196 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtattcaacaaaattgat 29295  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  29296 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctt 29395  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| | |||||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  29396 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 29495  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29496 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgt 29554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25508 - 25155
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||     
T  25508 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgagatttgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 25409  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  25408 ttgaggtctggttaccatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 25309  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  25308 tcggtgttattaacgcgcctggcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggtatttatagatgatatttt 25209  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  25208 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgca 25155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 19545 - 19901
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19545 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 19644  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  19645 ttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 19744  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    || |||| || |||||  |||  |||||||||||||||| ||| || || |||||||| |  ||||||   ||||| || |||||||| || || || ||    
T  19745 tcagtgttactaatgcgtctgacgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 19844  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  19845 gatttattctaagaatgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 19901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2264 - 1906
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || || || ||||||    
T  2264 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 2165  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2164 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 2065  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||  || ||||| ||| | |||||||||||||||| |||  | || |||||||| | | |||||    | || || |||||||| || || || ||    
T  2064 tcggtgctactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggttgtgtttattgatgacatctt 1965  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1964 aatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgt 1906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19725 - 19509
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||    
T  19725 aagaataggtatccacttccgaggattgatgatctaatggatcaattagtgggtgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcaga 19626  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19625 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19526  T
Q  237 agtgtttatggagtata 253  Q
     ||||||||||||||||    
T  19525 tgtgtttatggagtata 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49477 - 49141
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  49477 aagattaggtatccacttctgaggatcgatggtttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 49378  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  49377 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctgg 49278  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||    || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| || |||||||| |||    
T  49277 tgtgtttatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaa 49178  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  49177 gagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgt 49141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5143 - 4788
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || || || ||||| |    
T  5143 cagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgact 5044  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || || ||  | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  5043 tgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttactatgaatataaggtgatgccttt 4944  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   |||||||| |||||||| || || ||| ||    
T  4943 cggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagttgtgtttattgatgacattctg 4844  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  4843 atttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagt 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 42019 - 42375
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||   || |||   |||||||| |    
T  42019 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttctgaggatcgacgatttgatggatcagttagtgggtgcatttgtgttctttaagattgact 42118  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| || || || || | ||| |  || || ||||||   || ||||||||    
T  42119 taagatcaggctatcaccagatcaaagtgaaagatggggatattcagaagacggcctttaggacacattacgaacattacgaatattcggtgatgccttt 42218  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || || || |  |||||||||||||| |||| |||||  || || ||||| | ||||||||| || ||  | |||||||| || |||||| ||    
T  42219 cggtgttactaacgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgtgtttatagatgatattctg 42318  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||   |||| |||||||||    
T  42319 atatactccaagaccgaggaggaacatgccgagcatttgagatttgttttgcaagtg 42375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 31252 - 31586
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || || ||||    
T  31252 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaga 31351  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| ||  | ||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  31352 taaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacattacgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatgcgcctgg 31451  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     || |||||||| |||| ||| || || |||||||| ||| ||| |   || || ||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| ||     
T  31452 ggtatttatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggtggtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagag 31551  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  31552 gagcatgcagagcatctgaagattatattgcaagt 31586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 766 - 1121
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  766 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgc-aaaggtttcagcaagattgac 864  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  865 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 964  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   ||||| || | |||||| || || || ||    
T  965 tcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatgacatctt 1064  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || |||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  1065 gatttattctaagaatgaagaagagaatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 1121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16485 - 16149
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || || || || ||| ||||||| ||| | || || ||||    
T  16485 aagaacaggtatccagttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtgtttagtaaaatttatttgaggtcaggttaccatcaga 16386  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16385 ttaaggtgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 16286  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| |||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || | |||||| |||    
T  16285 tgtgtttatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctacgactgaagaa 16186  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16185 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgt 16149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 7768 - 7896
Alignment:
Q  11 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 110  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || |||||    
T  7768 atcaacagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccacggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagat 7867  T
Q  111 tgatttgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    ||||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  7868 tgatttgaggtcaggatatcatcagatta 7896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 895 - 657
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || || ||||| |||| |    
T  895 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaaaattggt 796  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  795 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgccat 696  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  695 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtata 657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 269003 - 268650
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  269003 tcagttgaacaaagttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 268904  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || | |||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  268903 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 268804  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  268803 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtgtttatagatgatatttt 268704  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
    |||||| || || ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  268703 gatttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgca 268650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 84432 - 84787
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    || ||||  || ||||| |    
T  84432 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatcgacttccgaggattaacgatttgatggat-agttagtgggtgcgcgtgtgttcaataaaattgact 84530  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || || ||||| || || || ||||||   || ||||||||    
T  84531 tgagatcgggctatcaccggatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgccttt 84630  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||| |||||| || || ||| | | | | ||||| || || || |||||||| || |||||| ||    
T  84631 cggtgttactaatgcgctgagagtatttatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattatg 84730  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| |||||  |||| || ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  84731 atatactctaagaccaaggaggagcatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtg 84787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 621 - 266
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  621 tcagttgaacaaagttacaataaagaacgggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 522  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| |||   || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  521 ttgaggtcagcttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaagaatacaaagtgatgcctt 422  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||||| | | |||||   ||| | || || ||||| || || |||||    
T  421 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggttgtatttattgatgacatttt 322  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || ||| |  | |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  321 ga-ttattttaggactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 7842 - 7962
Alignment:
Q  253 acgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatc 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7842 acgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttgtcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatc 7941  T
Q  353 tgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7942 tgaagattgtcttgcaagtgt 7962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38043 - 37696
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  38043 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 37944  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  37943 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 37844  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   || || || |  ||||| || || ||| |    
T  37843 acggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgaatttattgatgacattct 37744  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgt 362  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  37743 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgt 37696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 22099 - 22453
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  22099 agttgaacaaagtgacaataaagaatagttatccacttccaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 22198  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || || ||  |||||  ||| |||||||||    
T  22199 gagatcgagctatcatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttc 22298  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
     |||| || |||||||| || || |||| ||| || | |||| |||| |  ||||| | ||| |||||  | || || ||||| || || ||||||||||    
T  22299 -gtgttactaatgcaccgggtgtatttacggaatacatgaattgcatttctcatgcttatttagatcgcattgttgttgtgttcattgatgatattttga 22397  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    | ||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  22398 tatactctaagtctgaagaagaacacgccaagcatttgaagattgttttgcaagtg 22453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 99473 - 99827
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  99473 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgaa 99572  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  99573 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 99672  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || ||| |    
T  99673 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattct 99772  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  99773 gatctattctagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaa 99827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4552 - 4213
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||   || || || || ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  4552 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagtttgtgggtgcacctgtgtttagtaaaattgatttgaggtccggttaccatcaga 4453  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaat---ataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||   |||| || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  4452 ttaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 4353  T
Q  234 tggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgag 333  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| ||  | || |||||||| |  ||||||||     
T  4352 tggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttgatttattataagactgaa 4253  T
Q  334 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  4252 gaagagcatgcataacatctgaagattgtattgcaagtgt 4213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33730 - 33382
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaa-gaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga 113  Q
    ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||   || || | |||||||||    
T  33730 tcagttgaacaaggttaccattaaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattga 33631  T
Q  114 tttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcct 213  Q
     ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || |||||||| || ||||||    
T  33630 cttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcct 33531  T
Q  214 ttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattt 313  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |  || |||||||| | |||||||   ||||| || ||||| || || || || |    
T  33530 ttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtggttgtgttcattgatgacatct 33431  T
Q  314 tgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgt 362  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  33430 tgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctaaagattgt 33382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 49808 - 50144
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || ||| |||||||||||||||| ||| | || ||  |||    
T  49808 aagaacaggtatctactttcgagaattgacgatttcatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttctgcaagattgatttgaggtcaggttaccattaga 49907  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  49908 ttaaggtgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcctgg 50007  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  50008 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 50107  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  50108 gagcatgcagagcatctgaagattgtgtttcaagtgt 50144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 114950 - 115155
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  114950 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 115049  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  115050 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacattacgaatattgagtgatgccttt 115149  T
Q  216 cggtgt 221  Q
    ||||||    
T  115150 cggtgt 115155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 372
Target Start/End: Original strand, 115172 - 115249
Alignment:
Q  295 gtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  115172 gtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtg 115249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 5022 - 5358
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||  | ||||||||||| ||| | || || || |    
T  5022 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagacaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaa 5121  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| |||||  | ||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  5122 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataagatgatgtctttcggtgttactaatgcgcctgg 5221  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||| | |||| | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || |||| ||| |||    
T  5222 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaa 5321  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5322 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgt 5358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 13247 - 13603
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||    || || ||||||||||||    
T  13247 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgat 13346  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  13347 ttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 13446  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  13447 tcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 13546  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  13547 gatttattcgaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 13603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 21426 - 21782
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||    || || ||||||||||||    
T  21426 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgat 21525  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  21526 ttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 21625  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | | |||||   || || || |||||||| || || || ||    
T  21626 tcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 21725  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  21726 gatttattcgaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 21782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 176277 - 176613
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || |||| |||||||||||| ||  | || ||  |||    
T  176277 aagaataggtatccacttccgcgaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcatgattgatttgaggtcgggttaccattaga 176376  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||  | || || || || ||||| || || ||||||  ||| ||  |||||||||| || ||||| |||||    
T  176377 ttaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcctgg 176476  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||| | |||| | || |||||||| | |||||||||||| || || || ||||| || || || |||||||| || ||| |||| |||    
T  176477 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgttgtatttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaa 176576  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||    
T  176577 gagcatgcagagcatttaaagattgtgttgtaagtgt 176613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Original strand, 79742 - 80089
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  79742 tcagttgaacaaagttaccataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 79841  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  79842 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 79941  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||||| |||  | || || ||||| ||  |||||  ||| || || || || || || ||||||||    
T  79942 tcggtgttactaatgcgcttggtgtgttcatggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagtattcattgatgatatttt 80041  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgt 362  Q
     ||||| || |||||||| || || |||||  ||||||||| ||||||    
T  80042 aatttattctaagactgaagaggagcatgcaaagcatctgaggattgt 80089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Original strand, 1400 - 1634
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  1400 tcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 1499  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| || || ||||| |||||| ||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  1500 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 1599  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggag 249  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1600 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggag 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9456 - 9100
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||     
T  9456 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtggatgcaaaggtttttagtaagattgac 9357  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||||||| | || || || ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || ||| |||    
T  9356 ttgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctt 9257  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| | | |||||   || || || || ||||| || || || ||    
T  9256 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtatttattgatgacatctt 9157  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  9156 aatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagt 9100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 54322 - 54528
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  54322 tcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgac 54421  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  54422 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 54521  T
Q  215 tcggtgt 221  Q
    |||||||    
T  54522 tcggtgt 54528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 31588 - 31826
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  31588 tcagttgaataaagttacaataaagaaaagatatccacttccgagaattgacgacatgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 31687  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  31688 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 31787  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  31788 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 31826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42652 - 42529
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  42652 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcataggtgtttagtaagattgatt 42553  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  42552 tgagatcaggatatcatcagatta 42529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42376 - 42297
Alignment:
Q  292 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||||| || || ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  42376 gtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 42297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 44795 - 44908
Alignment:
Q  256 aatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctga 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44795 aatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgaattaatcgaagatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctga 44894  T
Q  356 agattgtcttgcaa 369  Q
    ||||||||||||||    
T  44895 agattgtcttgcaa 44908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Original strand, 4822 - 4955
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||| | | | || || | ||    
T  4822 aagaatagatatccacttctgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaatttatttgaggttaggttaccatctga 4921  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagc 170  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4922 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacagc 4955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 373
Target Start/End: Original strand, 8888 - 9077
Alignment:
Q  184 tatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 283  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| | |||    || |||||||| | | |||||     
T  8888 tatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttccatgcttatctggata 8987  T
Q  284 ggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
      || || || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8988 aatttgtggtcgtgtttattgatgatatctttatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgt 9077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14601 - 14241
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||     
T  14601 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaagattgac 14502  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcac------tatgaatataaagtta 208  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||      ||||||||||| || |    
T  14501 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatatatatgaatataaggtga 14402  T
Q  209 tgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacga 308  Q
    || |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   || ||   ||||| || |||| ||| || ||    
T  14401 tgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaattcgtggttgtgtctattgatga 14302  T
Q  309 tattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
     ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14301 cattctaatttattataagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaa 14241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 5718 - 5841
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  5718 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 5817  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  5818 tgagatcaggatatcatcagatta 5841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Original strand, 5996 - 6075
Alignment:
Q  292 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    |||||||| || || ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  5996 gtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 6075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 10697 - 11053
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||  |||| ||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||     
T  10697 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatctgcttctgaagattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaatatttttagtaagatcgac 10796  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  10797 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 10896  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| ||  |||||   ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  10897 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggtatttattgatgatatttt 10996  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  10997 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagt 11053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1364 - 1036
Alignment:
Q  43 aggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaag 142  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||  |  |||||||||| ||||    
T  1364 aggtatccacttccgaggatcgacaatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaagattgatttaagatcgggccatcaccagatcaaag 1265  T
Q  143 tgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtt 242  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||  | || ||  |||||   || |||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  1264 tgaaagatgaggatattcataagacagcctttaggacacgttacagacattacaaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggagtgtt 1165  T
Q  243 tatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacat 342  Q
    |||||| |||| |||||| || || ||||| | |||||||| ||| || || |||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  1164 tatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcagtttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccgaagaggaacat 1065  T
Q  343 gctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || |||||| |||  ||||| ||||||||    
T  1064 gcggagcatttgagaattgttttgcaagt 1036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21515 - 21159
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  21515 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttggtggatcaagtggtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 21416  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||  | ||||| |||||||| || || || ||||    
T  21415 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcattatgaatagaaggtgatacctt 21316  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||   || ||||| || ||| | || |||||| |    
T  21315 tcggtgttactaatgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagttgtatttcttgatgatattct 21216  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  21215 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 21159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 27160 - 27516
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||| || ||||| |    
T  27160 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatcaatgatttgatgtatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgact 27259  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    | |||||  | ||||||| ||| ||| |||||||||| || || |||||||  |  || || |  ||||| ||  | |||||||||   || ||||||||    
T  27260 taagatcgggctatcaccggatcaaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaattatgaatattctgtgatgccttt 27359  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||| |||| |||| |||||| || || ||| | | | | ||||| || || || |||||||| || |||||  ||    
T  27360 cggtgttactaatgcgccgggagtatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatatcctg 27459  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtg 372  Q
    || ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  27460 atatactctaagtctgaggaggaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtg 27516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1038 - 682
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||  |||| || || |||||     
T  1038 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgag--caaagttttttagtaatattgac 941  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  940 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 841  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| ||| |||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||||||| || || ||| |    
T  840 tcggtgttactaatgcgccgggtgtgttcatgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgacattct 741  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  740 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgt 682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8007 - 7809
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||  |||| || || |||||     
T  8007 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggt--gagcaaagttttttagtaatattgac 7910  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  7909 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 7810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 11067 - 11189
Alignment:
Q  13 catcagttgaacaag-gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatt 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  11067 catcagttgaacaaaagtaactattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatgttttcagcaagata 11166  T
Q  112 gatttgagatcaaggtatcacca 134  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  11167 gatttgagatcaggttatcacca 11189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 258
Target Start/End: Original strand, 520 - 741
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  | || ||  | |    
T  520 aagaacagatatccgcttccgagaactgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatgaaa 619  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  620 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctgg 719  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaat 258  Q
     ||||| |||||||||| ||||    
T  720 tgtgttcatggagtatatgaat 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 262619 - 262263
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  262619 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 262520  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  262519 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 262420  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||  | || |||||||  ||| |||||  ||| || || || || || ||||||||  |    
T  262419 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcct 262320  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || |||||| | || || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  262319 aatttattctaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagt 262263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 18394 - 18600
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  18394 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacatccgaggattgatgacttgatggaccaattggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgac 18493  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  18494 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 18593  T
Q  215 tcggtgt 221  Q
    |||||||    
T  18594 tcggtgt 18600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 253
Target Start/End: Original strand, 9831 - 10023
Alignment:
Q  61 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgc 160  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9831 attgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgc 9930  T
Q  161 agaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  9931 agaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtgttcatggagtata 10023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Original strand, 5760 - 5846
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttt 101  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5760 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttt 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43311 - 42958
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  43311 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 43212  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||  || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  43211 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 43112  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||| |||| |   |||||   || || || |||||||| || |||||| |    
T  43111 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatcgagtatatgaaccgaat-ttctatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 43013  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    ||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  43012 gatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaaaattgtgttgcaa 42958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 1418 - 1754
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    || |  || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  1418 aagaacaggtatccatttccgaggattgatgatttaatggatcagtcagtgggtgctcgtgtgtatagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 1517  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || ||||  |||||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| |||||    
T  1518 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacactatgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatgcgcctgg 1617  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     ||||||||||||||||  || || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| || |||||||| |||    
T  1618 tgtgtttatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaa 1717  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  1718 gagcatgcagaagatctgaagattgtattgcaagtgt 1754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28898 - 28562
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   || ||||| || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  28898 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatagatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 28799  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28798 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 28699  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     || ||||||||||||| |||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || |||||  | ||||| || | || ||| |||    
T  28698 tgtatttatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaggaatgaagaa 28599  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
     | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28598 aagcatgcagagcatctgatgattgtgttgcaagtgt 28562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Original strand, 46967 - 47183
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||   || || || || ||||||| ||| ||  | || || ||||    
T  46967 aagaataggtatccacttccgagaattaacgatttaatggatcagctagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgattggaggtccggttaccatcaga 47066  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  47067 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 47166  T
Q  237 agtgtttatggagtata 253  Q
     ||||||||| ||||||    
T  47167 tgtgtttatgaagtata 47183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 55780 - 56114
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||  |||||||| ||||| ||| | || || || |    
T  55780 aagaacagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggaccagttggtcggtgcaaagattttcaataagattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 55879  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  55880 ttcaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 55979  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     || || |||||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||  |||  | || || || || || || ||  | ||||| ||||||||||| ||     
T  55980 tgtattcatggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggttgtattcattgatgacatcctaatttattccaagactgaagag 56079  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  56080 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagt 56114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 373
Target Start/End: Original strand, 38070 - 38217
Alignment:
Q  226 aatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactcca 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||| ||    
T  38070 aatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactaca 38169  T
Q  326 agactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  38170 agtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgt 38217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 41417 - 41482
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 81  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41417 cagttgaacaaggtgaccataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 41482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7090 - 6789
Alignment:
Q  70 ttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacag 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||    || ||| | |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  7090 ttgatggatcggttagtgggtgctcgtgtattccgtaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacgg 6991  T
Q  170 ctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttcca 269  Q
    | || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| || || || ||    
T  6990 cctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttca 6891  T
Q  270 tgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    ||| ||| ||  |   || || || |||||||| || || || |||||||| || |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6890 tgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaggaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaa 6791  T
Q  370 gt 371  Q
    ||    
T  6790 gt 6789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 9372 - 9629
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |  | |||||     
T  9372 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaaggttttttgttaaattgac 9471  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  9472 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 9571  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgc 272  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||||||    
T  9572 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 9629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 19586 - 19843
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |  | |||||     
T  19586 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaaggttttttgttaaattgac 19685  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  19686 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 19785  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgc 272  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||||||    
T  19786 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 19843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21244 - 21006
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  21244 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 21145  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || ||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| || |||| ||    
T  21144 ttgaggtcaggttaccattagattaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcactacgaatataaggtgatgcttt 21045  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21044 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 21006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 53440 - 53086
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  53440 tcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactttctaggattgatgacttgatggatcaattagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 53341  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || || || || || || ||||    
T  53340 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaaggtgatacctt 53241  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||| ||| || ||||  |||||  |||| |||||||||| ||| || || |||||||| |   |||||   || || || || ||||| || |||||| |    
T  53240 tcgatgttactaatgtgcctggtttgttcatggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgatattct 53141  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 369  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  53140 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaa 53086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 83
Target Start/End: Original strand, 12267 - 12335
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12267 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 12335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29327 - 29031
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |   ||||||| ||||||||     
T  29327 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcaattggttggtgctaggattttcagtaagattgac 29228  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| |   | || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29227 ttgaggtttggttaccatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 29128  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatat 311  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||| |||||| ||| |  || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || |||||    
T  29127 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatat 29031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25788 - 25433
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  25788 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 25689  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  25688 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 25589  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  25588 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 25489  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  25488 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 25433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15302 - 14947
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  15302 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15203  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15202 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15103  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || | |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  15102 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15003  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15002 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 14947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 11089 - 11216
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    |||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | || ||| || | || ||||| |||||||||||||    
T  11089 ttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggttcagaggtgttcagtaagattgatttga 11188  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    ||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  11189 gatcaggatatcatcagattagagtgaa 11216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11331 - 11201
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  11331 aagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 11232  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 167  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11231 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 11201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Original strand, 64452 - 64777
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||| |||    || |||||||||||||||||||| ||  | || || ||||    
T  64452 aagaataggtatccacttacgaggattgatggtttaattgatcagttagtggatgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtccggttaccatcaga 64551  T
Q  137 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 236  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||           || |||||    
T  64552 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccgttcg-----------gcgcctgg 64640  T
Q  237 agtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaa 336  Q
     |||||||||||||||| ||| || || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||    
T  64641 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaagaa 64740  T
Q  337 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  64741 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgt 64777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1347 - 991
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| ||     
T  1347 tcagttgaacaaggttacgataaagaacatatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagatcgac 1248  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  1247 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtaatgcctt 1148  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| ||||    || || || || ||||| || ||||||||    
T  1147 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggacaaatttgttgttgtatttattgatgatatttt 1048  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     ||||| || |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  1047 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34479 - 34124
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  34479 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatgcacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggtcggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 34380  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  |||||||| |  || || || ||  ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  34379 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatacccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 34280  T
Q  216 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttg 315  Q
     || ||  ||||||| || || || || |||||||||| |||| | || || ||| | | | |||| || || || |||||||| || || |||||||||    
T  34279 tggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 34180  T
Q  316 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
     | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  34179 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 34124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Original strand, 747 - 1101
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| || || || |||||  ||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||| ||    
T  747 agttgaacaaagttacgataaagaaccggtatctgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgactt 846  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 216  Q
    ||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  847 gaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttc 946  T
Q  217 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttga 316  Q
    ||||| || || || ||||| |||||||||||||||| ||| |  || |||||||  ||| |||||   || || || || || || ||||||||||| |    
T  947 ggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtattcattgacgatattttaa 1046  T
Q  317 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    | || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  1047 tctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagt 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Original strand, 6056 - 6409
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||     
T  6056 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagatcgac 6155  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 214  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  6156 ttgaggtctggttaccatcagataaaggggaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 6255  T
Q  215 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatatttt 314  Q
    ||||||| || || || | ||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||  |||||   ||| | ||||| ||||| || ||||||||    
T  6256 tcggtgttactaacgcgcatggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcatggtggtatttattgatgatatttt 6355  T
Q  315 gatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 368  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| || |||||||  ||||| |||||    
T  6356 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgca 6409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 373
Target Start/End: Original strand, 14790 - 14982
Alignment:
Q  181 cgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttgg 280  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||| |||    
T  14790 cgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgcttttctgg 14889  T
Q  281 atcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||  ||| || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  14890 ataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 14982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1164 - 1089
Alignment:
Q  298 tttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1164 tttattgatgatattctgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 1089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 373
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3622
Alignment:
Q  307 gatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3556 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattatcttgcaagtgt 3622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Original strand, 859 - 988
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| || || |||||||||||    
T  859 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 958  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    ||||||  | ||||| ||||||| ||||||    
T  959 gagatcgggatatcatcagattagagtgaa 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Original strand, 1134 - 1213
Alignment:
Q  292 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || || ||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  1134 gtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2117
Alignment:
Q  155 atatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatac 254  Q
    ||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |     
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  255 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctg 354  Q
    |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||| ||||||| ||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctcaagaagaacatgttgagcatttg 2099  T
Q  355 aagattgtcttgcaagtg 372  Q
    |||||||| |||||||||    
T  2100 aagattgttttgcaagtg 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 482
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | || |||||| | || || || |||||||||    
T  606 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatctgctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 507  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  506 ttgagatcaggatatcaccagatta 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7548 - 7424
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 114  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || |||||| | || || || |||||||||    
T  7548 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatatgatggatcagctggttggtgcataggtgtttagtaagattgat 7449  T
Q  115 ttgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||    
T  7448 ttgagatcaggatatcatcagatta 7424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 250
Alignment:
Q  292 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  329 gtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7271 - 7192
Alignment:
Q  292 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  7271 gtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 7192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 715 - 845
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  || | || || ||||||||||    
T  715 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgattccgaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcggaaatgtttagtaagattgatt 814  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  815 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 1797 - 1919
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| || || || | |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||    
T  1797 agttgaacaaagtgacgattatgaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcagaggtgtttagcaagattgattt 1896  T
Q  117 gagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    ||||||| | ||||| |||||||    
T  1897 gagatcaggatatcatcagatta 1919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16451 - 16345
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || || |||||||||||    
T  16451 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgattt 16352  T
Q  117 gagatca 123  Q
    |||||||    
T  16351 gagatca 16345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 13537 - 13667
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || |||||||| |    
T  13537 cagttgaacaaagtgacgattaagaatgagtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgaat 13636  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  13637 tgagatcaggatatcatcagattacagtgaa 13667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Original strand, 1865 - 1970
Alignment:
Q  17 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 116  Q
    |||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| || || |||||||||||    
T  1865 agttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 1964  T
Q  117 gagatc 122  Q
    ||||||    
T  1965 gagatc 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26721 - 26621
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||  |  | ||||||||||||||||    
T  26721 cagttgaacatggtgactataaagaattggtatccgcttccgaggattgattatttgatggatcagttagttagtgcggagatattcagcaagattgatt 26622  T
Q  116 t 116  Q
    |    
T  26621 t 26621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 258
Target Start/End: Original strand, 39 - 155
Alignment:
Q  142 gtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  39 gtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgt 138  T
Q  242 ttatggagtatacgaat 258  Q
    | |||||||||| ||||    
T  139 tcatggagtatatgaat 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7135 - 7015
Alignment:
Q  19 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 118  Q
    ||||||||||| || || || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || |||||||||||||    
T  7135 ttgaacaaggtgacgattaaaaatcggtatccacttcagaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatttga 7036  T
Q  119 gatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  7035 gatcaggatatcatcagatta 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Original strand, 1533 - 1635
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| | || || || ||||||||||    
T  1533 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 1632  T
Q  116 tga 118  Q
    |||    
T  1633 tga 1635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Original strand, 1809 - 1888
Alignment:
Q  292 gtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  1809 gtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 89873 - 89764
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 136  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  89873 aagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttcatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcaga 89774  T
Q  137 ttaaagtgaa 146  Q
    ||| ||||||    
T  89773 ttagagtgaa 89764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 7549 - 7445
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| | || ||| || | || || ||||| |||||||    
T  7549 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccgcttccaaggactgatgatttgatggatcagctggttggtacagaggtgtttagcaaaattgatt 7450  T
Q  116 tgaga 120  Q
    |||||    
T  7449 tgaga 7445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 369
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12564
Alignment:
Q  154 gatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 253  Q
    |||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 12448  T
Q  254 cgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatct 353  Q
    |||| || || |||||||| |  |||||    || || || || ||||| ||  ||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  12449 cgaaccgaattttccatgcttacttggaaaaatttgtggttgtatttattgataatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatct 12548  T
Q  354 gaagattgtcttgcaa 369  Q
    ||||||||| ||||||    
T  12549 gaagattgtgttgcaa 12564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 6917 - 7047
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    |||| ||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  6917 cagtcgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatggtttgatggattagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 7016  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 146  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||    
T  7017 tgagatcaggatatcatcatattagagtgaa 7047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Original strand, 9865 - 9942
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 92  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  9865 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgc 9942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Original strand, 17532 - 17609
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 92  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  17532 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgc 17609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 4838 - 4905
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 83  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4838 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatctgcttccgaggattgatgatttgatggatcagtt 4905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 7152 - 7275
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  7152 cagttgaacaaagtgacaattaagaatcggtatccgcttccaaggatttatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 7251  T
Q  116 tgagatcaaggtatcaccagatta 139  Q
    | |||||| | ||||| |||||||    
T  7252 taagatcaggatatcatcagatta 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 380
Alignment:
Q  16 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || ||||| ||||    
T  486 cagttgaacaaagtaacgattaagaatcggaatccacttccgaagattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagatagatt 387  T
Q  116 tgagatc 122  Q
    |||||||    
T  386 tgagatc 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44985 - 44820
Alignment:
Q  208 atgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacg 307  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| || |    
T  44985 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatg 44886  T
Q  308 atattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    | || |||||||| ||||||| ||| || || |||||  | |||||||  ||| | ||||||||||    
T  44885 acatcttgatttattccaagaatgaagaggagcatgcaaaacatctgagaattatattgcaagtgt 44820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 373
Target Start/End: Original strand, 8920 - 9052
Alignment:
Q  241 tttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaac 340  Q
    ||||||||||| | ||| |  || |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||| |||||| || |    
T  8920 tttatggagtacatgaaccaaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatattaatatattccaagaatgaggaggagc 9019  T
Q  341 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  9020 atgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 9052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1172 - 1033
Alignment:
Q  232 cctggagtgtttatggagtatacgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  | || |||||||| | | |||||   || || || |||||||| || || || |||||||| || |||||||    
T  1172 cctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactg 1073  T
Q  332 aggaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 371  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  1072 aagaagagcatgcagaacatctgaatattgtattgcaagt 1033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 50
Target Start/End: Original strand, 2838 - 2873
Alignment:
Q  15 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcc 50  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2838 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatcc 2873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 249
Target Start/End: Original strand, 1748 - 1834
Alignment:
Q  163 aagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggag 249  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  1748 aagactgcttttaggacccgatatggtcactacgaatatttggttatgccttttggggtgactaatgcaccaggagtgttcatggag 1834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2311 - 2267
Alignment:
Q  37 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 81  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  2311 aagaatcggtatccactcccaaggattgatgatttgatggatcag 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9290 - 9262
Alignment:
Q  345 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9290 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 9262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Original strand, 33914 - 34022
Alignment:
Q  265 ttccatgcatttttggatcggttcgtagtggtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatctgaagattgtct 364  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| || || ||||| || || ||||||||||| || | | |||| ||||| ||||| |||||| | |||||| | |    
T  33914 ttccatgcttatttggattggttcgtggttgtatttattgatgacattttgatttattctaggtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattatgt 34013  T
Q  365 tgcaagtgt 373  Q
    |||||||||    
T  34014 tgcaagtgt 34022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University