View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18187_low_8 (Length: 363)

Name: NF18187_low_8
Description: NF18187
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18187_low_8
NF18187_low_8
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (9-360)||(12497799-12498150)
chr3 (9-358)||(14876729-14877078)
chr3 (9-360)||(16370964-16371315)
chr3 (9-360)||(17489401-17489752)
chr3 (9-360)||(9522270-9522621)
chr3 (9-360)||(16492409-16492760)
chr3 (9-360)||(16807154-16807505)
chr3 (9-358)||(16691711-16692060)
chr3 (21-360)||(10905773-10906112)
chr3 (9-357)||(15348476-15348824)
chr3 (21-360)||(10005163-10005502)
chr3 (21-359)||(48425010-48425348)
chr3 (21-360)||(13252253-13252592)
chr3 (21-360)||(15589620-15589959)
chr3 (21-360)||(16635336-16635675)
chr3 (21-360)||(43162660-43162999)
chr3 (9-360)||(15402738-15403089)
chr3 (9-360)||(15725162-15725512)
chr3 (21-360)||(20062282-20062621)
chr3 (9-360)||(53385246-53385597)
chr3 (16-360)||(26792627-26792971)
chr3 (9-360)||(5425158-5425508)
chr3 (9-360)||(15338820-15339171)
chr3 (9-360)||(16412510-16412861)
chr3 (9-360)||(6600298-6600649)
chr3 (9-360)||(15208442-15208793)
chr3 (9-360)||(16756813-16757164)
chr3 (36-360)||(15247725-15248049)
chr3 (27-317)||(15227228-15227518)
chr3 (36-310)||(13972387-13972661)
chr3 (45-352)||(15953193-15953500)
chr3 (10-345)||(47123506-47123841)
chr3 (27-352)||(13322877-13323202)
chr3 (10-345)||(10383531-10383866)
chr3 (9-352)||(14571409-14571752)
chr3 (27-352)||(18134571-18134896)
chr3 (148-360)||(15015972-15016184)
chr3 (24-310)||(16329926-16330212)
chr3 (9-337)||(10420285-10420613)
chr3 (45-352)||(8759307-8759614)
chr3 (45-352)||(13941621-13941928)
chr3 (45-352)||(41177119-41177426)
chr3 (75-298)||(12850558-12850781)
chr3 (36-310)||(14086261-14086535)
chr3 (9-351)||(11303999-11304341)
chr3 (27-344)||(12360775-12361092)
chr3 (24-298)||(11961313-11961587)
chr3 (168-331)||(8274656-8274819)
chr3 (9-352)||(44776808-44777151)
chr3 (9-151)||(31689049-31689191)
chr3 (168-345)||(16742946-16743123)
chr3 (146-310)||(16836777-16836941)
chr3 (9-153)||(31945033-31945177)
chr3 (168-331)||(13975302-13975465)
chr3 (45-317)||(16381190-16381459)
chr3 (168-345)||(15576470-15576647)
chr3 (246-331)||(17192892-17192977)
chr3 (184-345)||(18748401-18748562)
chr3 (168-286)||(6153141-6153259)
chr3 (269-331)||(6712666-6712728)
chr3 (6-62)||(320781-320836)
chr3 (184-286)||(21686681-21686783)
chr3 (9-70)||(12854365-12854426)
chr3 (318-355)||(14183145-14183182)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (9-360)||(24675052-24675403)
chr2 (9-360)||(22756992-22757343)
chr2 (9-360)||(24708011-24708362)
chr2 (9-360)||(21325795-21326146)
chr2 (9-360)||(23188571-23188922)
chr2 (21-360)||(16924835-16925174)
chr2 (21-360)||(16998575-16998914)
chr2 (21-360)||(16981727-16982066)
chr2 (21-360)||(17063292-17063631)
chr2 (9-320)||(23138600-23138911)
chr2 (9-320)||(23550390-23550701)
chr2 (9-360)||(24709596-24709947)
chr2 (9-360)||(44386098-44386449)
chr2 (15-357)||(21145562-21145904)
chr2 (21-360)||(9609711-9610050)
chr2 (9-360)||(22325385-22325736)
chr2 (33-360)||(23063664-23063991)
chr2 (9-360)||(24261933-24262284)
chr2 (9-360)||(24878524-24878875)
chr2 (9-360)||(27370832-27371183)
chr2 (21-360)||(27217591-27217930)
chr2 (21-360)||(10868425-10868764)
chr2 (9-259)||(27377101-27377351)
chr2 (21-360)||(17066953-17067289)
chr2 (111-360)||(24825811-24826060)
chr2 (9-317)||(23087013-23087321)
chr2 (24-351)||(30211455-30211782)
chr2 (29-355)||(45529100-45529420)
chr2 (10-345)||(31830222-31830557)
chr2 (36-310)||(27365658-27365932)
chr2 (24-345)||(11358418-11358739)
chr2 (27-352)||(23293539-23293864)
chr2 (9-186)||(41609047-41609224)
chr2 (10-310)||(20832549-20832849)
chr2 (9-352)||(23276339-23276682)
chr2 (10-345)||(1063315-1063650)
chr2 (45-352)||(27787340-27787647)
chr2 (47-286)||(24653946-24654185)
chr2 (186-345)||(25128387-25128546)
chr2 (45-352)||(12573952-12574259)
chr2 (24-102)||(24833360-24833438)
chr2 (168-331)||(22276001-22276164)
chr2 (45-210)||(24944966-24945131)
chr2 (269-330)||(27368391-27368452)
chr2 (184-345)||(24570212-24570373)
chr2 (9-53)||(45676685-45676729)
chr2 (168-331)||(12640477-12640640)
chr2 (246-345)||(23817597-23817696)
chr2 (184-331)||(22762127-22762274)
chr2 (9-52)||(23599834-23599877)
chr2 (168-331)||(24831745-24831908)
chr2 (267-331)||(14708908-14708972)
chr2 (30-70)||(17967577-17967617)
chr2 (184-232)||(23817750-23817798)
chr2 (184-232)||(28144701-28144749)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (9-360)||(23573606-23573957)
chr5 (9-360)||(23440089-23440440)
chr5 (9-360)||(23516405-23516756)
chr5 (9-358)||(18775641-18775990)
chr5 (44-357)||(20798659-20798972)
chr5 (9-360)||(21984476-21984827)
chr5 (9-357)||(25423053-25423401)
chr5 (9-360)||(14999910-15000261)
chr5 (9-360)||(22333058-22333409)
chr5 (9-360)||(22134532-22134883)
chr5 (9-360)||(19769824-19770175)
chr5 (9-360)||(27610218-27610569)
chr5 (21-360)||(40708656-40708995)
chr5 (9-360)||(41770706-41771057)
chr5 (23-360)||(26738876-26739213)
chr5 (9-360)||(27668661-27669012)
chr5 (9-360)||(27685571-27685922)
chr5 (21-360)||(34566370-34566709)
chr5 (21-360)||(16356378-16356717)
chr5 (9-360)||(27518271-27518622)
chr5 (9-360)||(37291667-37292018)
chr5 (9-355)||(23471093-23471439)
chr5 (9-360)||(29476244-29476595)
chr5 (34-360)||(22348314-22348638)
chr5 (9-352)||(20468275-20468618)
chr5 (88-358)||(21498209-21498479)
chr5 (21-223)||(21343666-21343868)
chr5 (9-250)||(20573385-20573626)
chr5 (36-352)||(23442472-23442788)
chr5 (46-295)||(21564202-21564451)
chr5 (27-352)||(21890938-21891263)
chr5 (27-343)||(22461816-22462132)
chr5 (10-310)||(25847922-25848222)
chr5 (9-317)||(28923982-28924290)
chr5 (10-345)||(14887177-14887512)
chr5 (6-352)||(22236099-22236445)
chr5 (27-352)||(24735790-24736115)
chr5 (27-352)||(24749733-24750058)
chr5 (9-345)||(20773606-20773942)
chr5 (9-317)||(28895156-28895464)
chr5 (10-345)||(37545682-37546018)
chr5 (10-345)||(20342129-20342464)
chr5 (27-298)||(24737018-24737289)
chr5 (9-271)||(21662300-21662561)
chr5 (24-310)||(22381060-22381346)
chr5 (24-298)||(24798630-24798904)
chr5 (24-345)||(23080275-23080596)
chr5 (24-360)||(21404715-21405035)
chr5 (27-345)||(20821317-20821635)
chr5 (24-310)||(22502540-22502826)
chr5 (221-360)||(21339457-21339596)
chr5 (45-271)||(21665761-21665986)
chr5 (168-345)||(11210880-11211057)
chr5 (45-352)||(17269512-17269819)
chr5 (168-331)||(27011089-27011252)
chr5 (184-345)||(23503464-23503625)
chr5 (168-331)||(21937388-21937551)
chr5 (168-331)||(24581216-24581379)
chr5 (9-97)||(21625382-21625470)
chr5 (188-285)||(25244598-25244695)
chr5 (188-285)||(25308750-25308847)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (9-360)||(65369-65719)
scaffold0042 (9-217)||(39924-40132)
scaffold0042 (265-360)||(39811-39906)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (11-359)||(278823-279171)
scaffold0005 (9-352)||(164709-165052)
scaffold0005 (9-360)||(308622-308973)
scaffold0005 (9-352)||(260271-260614)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (9-360)||(16355174-16355525)
chr4 (9-360)||(16252174-16252525)
chr4 (9-360)||(12523608-12523959)
chr4 (9-360)||(14680499-14680850)
chr4 (42-355)||(15149740-15150053)
chr4 (9-358)||(18227177-18227526)
chr4 (9-360)||(7090365-7090715)
chr4 (9-352)||(14652240-14652583)
chr4 (21-360)||(23955691-23956030)
chr4 (21-360)||(18297149-18297488)
chr4 (9-360)||(19778522-19778873)
chr4 (9-358)||(14159424-14159773)
chr4 (21-360)||(8386356-8386695)
chr4 (9-360)||(14303707-14304057)
chr4 (9-360)||(27711268-27711619)
chr4 (21-360)||(12476544-12476883)
chr4 (21-360)||(29039133-29039472)
chr4 (9-358)||(40472972-40473321)
chr4 (9-360)||(14266628-14266979)
chr4 (9-360)||(14851095-14851446)
chr4 (9-360)||(8053352-8053703)
chr4 (21-274)||(15364330-15364583)
chr4 (27-352)||(15003361-15003686)
chr4 (9-197)||(14927151-14927339)
chr4 (10-345)||(3264798-3265133)
chr4 (214-360)||(16676432-16676578)
chr4 (10-345)||(11207235-11207570)
chr4 (27-352)||(16145862-16146187)
chr4 (24-352)||(15070360-15070688)
chr4 (10-345)||(29453541-29453876)
chr4 (9-352)||(15245856-15246199)
chr4 (24-343)||(33222865-33223184)
chr4 (24-345)||(44661870-44662191)
chr4 (27-310)||(1649316-1649599)
chr4 (177-316)||(15415059-15415198)
chr4 (45-352)||(51606178-51606485)
chr4 (24-310)||(20890930-20891215)
chr4 (221-358)||(1640156-1640293)
chr4 (9-96)||(18607823-18607910)
chr4 (138-352)||(15359087-15359301)
chr4 (168-331)||(13247736-13247899)
chr4 (146-354)||(9849473-9849681)
chr4 (184-345)||(12132413-12132574)
chr4 (45-210)||(42702871-42703036)
chr4 (170-331)||(55375376-55375537)
chr4 (168-331)||(14997407-14997570)
chr4 (150-345)||(27900459-27900654)
chr4 (64-206)||(18164332-18164474)
chr4 (168-331)||(16445230-16445393)
chr4 (149-310)||(16752665-16752826)
chr4 (168-331)||(9290926-9291089)
chr4 (168-331)||(15293175-15293338)
chr4 (177-360)||(18550049-18550234)
chr4 (27-102)||(15415226-15415301)
chr4 (9-41)||(15351934-15351966)
chr4 (267-352)||(15077825-15077910)
chr4 (27-80)||(15359326-15359379)
chr4 (184-345)||(16685361-16685522)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (9-358)||(30313578-30313927)
chr8 (9-360)||(21166969-21167320)
chr8 (9-360)||(19977965-19978316)
chr8 (9-358)||(16408479-16408828)
chr8 (9-360)||(15533378-15533729)
chr8 (9-358)||(22164625-22164974)
chr8 (9-360)||(32600142-32600493)
chr8 (9-358)||(22133475-22133824)
chr8 (9-360)||(22046372-22046722)
chr8 (9-360)||(21250940-21251290)
chr8 (9-360)||(23650039-23650390)
chr8 (9-360)||(21394297-21394648)
chr8 (9-360)||(21788790-21789141)
chr8 (9-360)||(21922167-21922518)
chr8 (9-360)||(17674455-17674806)
chr8 (21-360)||(19112700-19113039)
chr8 (9-318)||(22032030-22032339)
chr8 (9-360)||(20018182-20018533)
chr8 (9-363)||(22120603-22120957)
chr8 (9-360)||(19485302-19485653)
chr8 (9-355)||(22987199-22987545)
chr8 (9-250)||(15441179-15441420)
chr8 (9-284)||(23948887-23949162)
chr8 (24-352)||(20396565-20396893)
chr8 (156-360)||(22377885-22378089)
chr8 (156-360)||(22384060-22384264)
chr8 (9-352)||(21681910-21682253)
chr8 (45-317)||(20388133-20388405)
chr8 (10-345)||(6679110-6679445)
chr8 (27-310)||(20010382-20010665)
chr8 (27-310)||(1266255-1266538)
chr8 (9-352)||(23654925-23655268)
chr8 (27-352)||(21324849-21325175)
chr8 (10-310)||(804155-804455)
chr8 (9-345)||(22061880-22062216)
chr8 (27-310)||(19851427-19851710)
chr8 (27-310)||(19857463-19857746)
chr8 (27-352)||(20007866-20008191)
chr8 (27-346)||(31416920-31417239)
chr8 (45-352)||(31571282-31571589)
chr8 (10-310)||(14565141-14565441)
chr8 (10-345)||(6603657-6603992)
chr8 (9-352)||(21840415-21840758)
chr8 (24-310)||(29303908-29304194)
chr8 (9-283)||(16265127-16265401)
chr8 (10-286)||(28982356-28982632)
chr8 (10-286)||(28987576-28987852)
chr8 (24-310)||(12304771-12305057)
chr8 (168-345)||(20652780-20652957)
chr8 (249-348)||(23949158-23949257)
chr8 (10-221)||(27347225-27347436)
chr8 (168-334)||(21196960-21197126)
chr8 (168-331)||(22982593-22982756)
chr8 (287-360)||(18856853-18856926)
chr8 (314-360)||(22040162-22040208)
chr8 (177-358)||(19863223-19863404)
chr8 (177-358)||(19867860-19868041)
chr8 (166-310)||(22051018-22051162)
chr8 (168-331)||(16877556-16877719)
chr8 (168-331)||(21850798-21850961)
chr8 (184-331)||(22315364-22315511)
chr8 (269-331)||(23157472-23157534)
chr8 (171-354)||(24818054-24818237)
chr8 (9-41)||(22179309-22179341)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (9-360)||(14323-14674)
scaffold0044 (9-360)||(583-934)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (9-360)||(19864483-19864834)
chr6 (11-358)||(12497824-12498171)
chr6 (11-358)||(12510730-12511077)
chr6 (9-360)||(25765424-25765774)
chr6 (11-358)||(12505153-12505500)
chr6 (9-360)||(16963501-16963852)
chr6 (9-360)||(25609995-25610346)
chr6 (9-360)||(16927774-16928125)
chr6 (15-360)||(1543218-1543563)
chr6 (9-360)||(5839353-5839704)
chr6 (9-358)||(27331569-27331918)
chr6 (9-358)||(27392309-27392658)
chr6 (9-360)||(16626851-16627202)
chr6 (9-360)||(23078265-23078616)
chr6 (9-297)||(21833178-21833466)
chr6 (9-360)||(18408077-18408428)
chr6 (9-360)||(24313302-24313653)
chr6 (9-360)||(28263331-28263682)
chr6 (9-360)||(28342080-28342431)
chr6 (21-360)||(29592054-29592393)
chr6 (9-359)||(22078823-22079173)
chr6 (9-352)||(25112348-25112691)
chr6 (9-360)||(2874937-2875288)
chr6 (9-360)||(27187232-27187583)
chr6 (9-360)||(27261657-27262008)
chr6 (9-360)||(28292506-28292857)
chr6 (9-360)||(22762589-22762940)
chr6 (9-233)||(17032358-17032582)
chr6 (35-356)||(18197685-18198006)
chr6 (24-310)||(21471412-21471698)
chr6 (9-298)||(25750605-25750894)
chr6 (9-144)||(22433793-22433928)
chr6 (27-345)||(15459150-15459468)
chr6 (45-310)||(25768023-25768288)
chr6 (36-363)||(14131310-14131637)
chr6 (24-345)||(10468998-10469319)
chr6 (9-352)||(22796774-22797117)
chr6 (24-345)||(24364223-24364544)
chr6 (63-310)||(34645770-34646017)
chr6 (219-319)||(11291818-11291918)
chr6 (27-310)||(18794504-18794787)
chr6 (27-298)||(19879112-19879383)
chr6 (36-310)||(21564316-21564590)
chr6 (271-360)||(22433927-22434016)
chr6 (27-345)||(8766297-8766615)
chr6 (45-352)||(27560759-27561066)
chr6 (156-317)||(1640715-1640876)
chr6 (38-310)||(11287782-11288054)
chr6 (92-352)||(17415365-17415625)
chr6 (38-310)||(11280689-11280961)
chr6 (167-291)||(25750900-25751024)
chr6 (168-345)||(25743236-25743413)
chr6 (138-352)||(18800867-18801081)
chr6 (168-331)||(16098005-16098168)
chr6 (184-331)||(18571622-18571769)
chr6 (45-352)||(28282955-28283262)
chr6 (120-352)||(14381609-14381841)
chr6 (168-331)||(16382536-16382699)
chr6 (186-334)||(25655456-25655604)
chr6 (168-331)||(23996203-23996366)
chr6 (168-345)||(18838057-18838234)
chr6 (27-102)||(1640613-1640688)
chr6 (184-331)||(1648947-1649094)
chr6 (27-93)||(18787702-18787768)
chr6 (168-345)||(15078513-15078690)
chr6 (184-331)||(21413101-21413248)
chr6 (171-345)||(16233167-16233341)
chr6 (270-353)||(26276987-26277071)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (9-360)||(64023-64374)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (9-360)||(17045076-17045427)
chr1 (9-360)||(19106314-19106665)
chr1 (9-360)||(20249797-20250148)
chr1 (9-360)||(20136725-20137076)
chr1 (9-358)||(50620307-50620656)
chr1 (9-360)||(16350660-16351011)
chr1 (9-360)||(33391090-33391441)
chr1 (9-360)||(16078713-16079045)
chr1 (9-360)||(21747482-21747832)
chr1 (9-360)||(51333554-51333905)
chr1 (9-360)||(21830250-21830601)
chr1 (9-352)||(19760935-19761278)
chr1 (9-360)||(21836897-21837248)
chr1 (9-360)||(41354530-41354881)
chr1 (32-360)||(16369267-16369595)
chr1 (9-235)||(50612602-50612828)
chr1 (27-352)||(19664945-19665270)
chr1 (45-337)||(20940147-20940439)
chr1 (9-163)||(21163227-21163381)
chr1 (10-310)||(37677027-37677328)
chr1 (27-352)||(19854279-19854604)
chr1 (27-343)||(20856839-20857155)
chr1 (24-310)||(31550292-31550578)
chr1 (24-310)||(20294374-20294660)
chr1 (9-345)||(22433192-22433528)
chr1 (24-310)||(20075170-20075456)
chr1 (146-310)||(11382678-11382842)
chr1 (141-352)||(41307904-41308115)
chr1 (75-352)||(20835957-20836237)
chr1 (45-298)||(20244183-20244436)
chr1 (10-220)||(20395194-20395404)
chr1 (168-331)||(20831482-20831645)
chr1 (168-345)||(20914316-20914493)
chr1 (184-337)||(21202371-21202524)
chr1 (9-102)||(24476927-24477020)
chr1 (168-331)||(46518827-46518990)
chr1 (168-230)||(22142232-22142294)
chr1 (269-334)||(22135645-22135710)
chr1 (244-336)||(20184364-20184456)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (9-355)||(17319-17665)
chr7 (9-358)||(15154652-15155001)
chr7 (9-360)||(11553100-11553451)
chr7 (9-360)||(12687422-12687773)
chr7 (9-360)||(14954541-14954892)
chr7 (21-360)||(8198561-8198900)
chr7 (9-360)||(8707526-8707877)
chr7 (9-360)||(10870916-10871267)
chr7 (9-360)||(14332318-14332669)
chr7 (9-360)||(15161055-15161406)
chr7 (9-360)||(11237211-11237562)
chr7 (9-360)||(14037728-14038079)
chr7 (9-360)||(14347758-14348109)
chr7 (9-360)||(18551756-18552107)
chr7 (9-359)||(23516768-23517118)
chr7 (9-360)||(18177663-18178014)
chr7 (9-360)||(13685984-13686336)
chr7 (21-360)||(44791349-44791688)
chr7 (9-354)||(15203800-15204145)
chr7 (75-352)||(15624539-15624816)
chr7 (27-352)||(12206784-12207109)
chr7 (9-351)||(15102586-15102928)
chr7 (27-352)||(19147151-19147476)
chr7 (27-352)||(20746550-20746875)
chr7 (27-310)||(8212154-8212437)
chr7 (9-310)||(14264270-14264571)
chr7 (10-310)||(11306289-11306589)
chr7 (10-345)||(49152224-49152559)
chr7 (24-360)||(21661900-21662233)
chr7 (27-310)||(16072320-16072603)
chr7 (27-352)||(11388412-11388736)
chr7 (27-352)||(13665493-13665813)
chr7 (45-352)||(16950455-16950762)
chr7 (267-360)||(9596236-9596329)
chr7 (192-360)||(35964848-35965016)
chr7 (45-352)||(18053937-18054244)
chr7 (6-352)||(6413430-6413776)
chr7 (45-316)||(23199763-23200034)
chr7 (45-316)||(23505890-23506161)
chr7 (24-345)||(13021294-13021615)
chr7 (45-352)||(14286360-14286667)
chr7 (241-355)||(11772244-11772358)
chr7 (24-345)||(12455640-12455960)
chr7 (184-331)||(14936443-14936590)
chr7 (9-310)||(14129795-14130096)
chr7 (9-310)||(14433613-14433914)
chr7 (45-352)||(1391-1698)
chr7 (9-70)||(12254326-12254387)
chr7 (177-360)||(41144-41327)
chr7 (168-331)||(12368603-12368766)
chr7 (168-345)||(4440008-4440185)
chr7 (45-310)||(26288063-26288327)
chr7 (168-331)||(7823980-7824143)
chr7 (184-331)||(15364036-15364183)
chr7 (168-331)||(27107801-27107964)
chr7 (131-345)||(26118596-26118810)
chr7 (168-329)||(21674562-21674723)
chr7 (184-345)||(45146652-45146812)
chr7 (45-160)||(15340454-15340569)
chr7 (183-348)||(20466877-20467041)
chr7 (269-345)||(17923862-17923938)
chr7 (24-102)||(26118818-26118896)
chr7 (269-345)||(13378879-13378955)
chr7 (188-328)||(17145288-17145428)
chr7 (267-353)||(5764672-5764758)
chr7 (269-343)||(12193737-12193811)
chr7 (27-136)||(15479338-15479447)
chr7 (246-310)||(15340590-15340654)
chr7 (184-331)||(13353247-13353394)
chr7 (248-310)||(12456940-12457002)
chr7 (9-41)||(13634038-13634070)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (9-360)||(5977-6328)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (9-360)||(33565-33916)
scaffold0109 (9-360)||(8559-8910)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (9-360)||(639-990)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (9-360)||(4397-4748)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (9-360)||(180180-180531)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (9-360)||(815-1165)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (9-360)||(127191-127542)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (9-352)||(219417-219760)
scaffold0012 (9-360)||(229006-229357)
scaffold0012 (168-331)||(33016-33179)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (9-357)||(5986-6334)
scaffold0120 (45-352)||(1524-1831)
scaffold0120 (168-345)||(22816-22993)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (9-360)||(32744-33095)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (9-360)||(6335-6686)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (9-360)||(686-1036)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (15-360)||(109803-110148)
scaffold0029 (27-310)||(112540-112823)
scaffold0029 (9-345)||(96009-96345)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (15-360)||(43123-43468)
scaffold0028 (9-358)||(8448-8797)
scaffold0028 (214-346)||(13834-13966)
scaffold0028 (36-310)||(50556-50830)
scaffold0028 (168-331)||(106594-106757)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (9-360)||(5184-5535)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (9-359)||(1102-1452)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (9-358)||(7340-7689)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (9-360)||(377-728)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (9-360)||(14840-15191)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (9-310)||(27930-28231)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (9-360)||(9306-9657)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (9-343)||(16950-17284)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (9-358)||(15456-15804)
scaffold0333 (223-358)||(15832-15967)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (9-357)||(14002-14350)
scaffold0106 (9-336)||(31373-31700)
scaffold0106 (264-360)||(17660-17756)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (9-329)||(162076-162396)
scaffold0001 (9-360)||(448022-448373)
scaffold0001 (45-352)||(90932-91239)
scaffold0001 (168-345)||(78636-78813)
scaffold0001 (135-210)||(175352-175427)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (9-308)||(26-325)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (9-352)||(15079-15422)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (9-352)||(111984-112327)
scaffold0004 (9-310)||(203510-203811)
scaffold0004 (45-352)||(322703-323010)
scaffold0004 (10-352)||(117532-117874)
scaffold0004 (24-345)||(385797-386118)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (9-360)||(6900-7253)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (9-343)||(3995-4329)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (21-355)||(26530-26864)
scaffold0011 (9-352)||(195703-196045)
scaffold0011 (27-310)||(148551-148834)
scaffold0011 (9-210)||(68582-68783)
scaffold0011 (168-331)||(121971-122134)
scaffold0011 (269-331)||(180147-180209)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (45-355)||(1-311)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (9-355)||(16462-16808)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (22-360)||(252-590)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (21-343)||(3115-3437)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (111-360)||(7855-8104)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (9-343)||(968-1301)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (111-360)||(21932-22181)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (24-352)||(116905-117233)
scaffold0037 (168-331)||(98137-98300)
scaffold0037 (168-232)||(23586-23650)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (59-358)||(49506-49805)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (9-360)||(12969-13320)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (9-360)||(16408-16759)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (9-231)||(16920-17142)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (24-352)||(886-1214)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (24-352)||(25719-26047)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (171-357)||(7522-7708)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (147-360)||(772-985)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (123-360)||(9047-9284)
scaffold0507 (168-334)||(351-517)
scaffold0507 (9-102)||(6940-7033)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (24-355)||(5588-5918)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (24-355)||(25068-25399)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (24-360)||(86496-86832)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (27-317)||(10774-11064)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (36-352)||(26132-26448)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (9-352)||(18537-18880)
scaffold0326 (9-70)||(3637-3698)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (45-316)||(28805-29076)
scaffold0064 (45-316)||(40796-41067)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (9-352)||(13901-14244)
scaffold0034 (81-345)||(4960-5224)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (45-352)||(47123-47430)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (27-345)||(10090-10408)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (27-352)||(79-404)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (27-352)||(27500-27825)
scaffold0139 (9-352)||(1149-1491)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (45-352)||(3874-4181)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (36-310)||(7078-7352)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (36-310)||(19973-20247)
scaffold0298 (9-351)||(13362-13704)
scaffold0298 (9-351)||(17132-17474)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (90-310)||(58448-58668)
scaffold0058 (46-345)||(19120-19419)
scaffold0058 (184-337)||(74038-74191)
scaffold0058 (24-82)||(59042-59100)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (9-352)||(9761-10099)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (9-352)||(14049-14391)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (45-352)||(51863-52170)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (36-352)||(21671-21987)
scaffold0235 (244-331)||(26004-26091)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (27-346)||(3872-4191)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (45-352)||(2750-3057)
scaffold0035 (183-358)||(13189-13364)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (45-352)||(37201-37508)
scaffold0026 (141-346)||(38180-38385)
scaffold0026 (141-298)||(27391-27548)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (36-310)||(1211-1485)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (60-210)||(4567-4717)
scaffold0023 (9-124)||(36974-37089)
scaffold0023 (246-360)||(4446-4560)
scaffold0023 (45-97)||(18993-19045)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (56-352)||(4760-5056)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (27-345)||(6164-6483)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (9-352)||(49033-49376)
scaffold0053 (9-310)||(57859-58159)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (9-352)||(42333-42676)
scaffold0010 (9-352)||(47399-47742)
scaffold0010 (148-226)||(2252-2330)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (27-317)||(172-462)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (9-351)||(10851-11193)
scaffold0124 (36-351)||(400-715)
scaffold0124 (168-331)||(7831-7994)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (45-298)||(5968-6220)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (27-352)||(27207-27531)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (45-352)||(5002-5309)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (27-346)||(14257-14576)
scaffold0203 (27-190)||(9039-9202)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (27-310)||(25907-26190)
scaffold0113 (24-310)||(16654-16940)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (9-352)||(39702-40045)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (36-254)||(1167-1385)
scaffold0165 (9-70)||(26203-26264)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (27-345)||(49214-49532)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (9-345)||(61220-61556)
scaffold0067 (9-345)||(52186-52522)
scaffold0067 (45-345)||(67608-67908)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (27-310)||(509-792)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (27-310)||(18830-19113)
scaffold0090 (131-310)||(23096-23275)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (10-310)||(38929-39229)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (27-334)||(20103-20410)
scaffold0114 (12-345)||(43471-43804)
scaffold0114 (12-345)||(44483-44816)
scaffold0114 (27-210)||(36036-36219)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (24-310)||(16755-17041)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (24-345)||(26239-26560)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (36-310)||(33719-33993)
scaffold0076 (168-331)||(40380-40543)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (9-256)||(4235-4482)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (261-360)||(3711-3810)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (45-352)||(12781-13088)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (45-352)||(7238-7543)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (151-331)||(28287-28467)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (9-205)||(136082-136278)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (45-345)||(248612-248912)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (45-195)||(2023-2173)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (11-102)||(6238-6329)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (168-345)||(8217-8394)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (184-345)||(14661-14822)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (170-331)||(23518-23679)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (45-225)||(13380-13560)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (168-331)||(3896-4059)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (168-331)||(46276-46439)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (168-298)||(1916-2046)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (47-345)||(42784-43082)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (303-360)||(12744-12801)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (9-70)||(7498-7559)
scaffold0101 (261-337)||(5467-5543)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (168-331)||(3281-3444)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (177-352)||(1-176)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (168-331)||(14758-14921)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (168-331)||(24002-24165)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (184-345)||(1061-1222)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (168-345)||(393-570)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (168-345)||(13030-13207)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (168-322)||(940-1094)
scaffold1710 (264-352)||(107-195)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (184-345)||(8898-9059)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (184-345)||(9125-9286)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (168-345)||(14779-14956)
scaffold0132 (245-345)||(43737-43837)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (146-310)||(5313-5477)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (241-345)||(1241-1345)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (184-316)||(10493-10625)
scaffold0447 (184-316)||(5879-6011)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (264-352)||(3355-3443)
scaffold0222 (9-102)||(3518-3611)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (36-144)||(45835-45943)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (184-331)||(3965-4112)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (244-345)||(1431-1532)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (184-316)||(8488-8620)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (269-345)||(71442-71518)
scaffold0021 (192-345)||(13397-13550)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (279-334)||(14370-14425)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (244-331)||(26178-26265)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (27-102)||(887-962)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (9-96)||(9182-9269)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (244-334)||(820-910)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (269-331)||(18332-18394)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498150
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12498098  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498099 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 12498150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876729
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14876779  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14876778 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctc 14876729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 16370964 - 16371315
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16370964 acatcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16371063  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16371064 ccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16371163  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16371164 cacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16371263  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371264 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 16371315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 17489401 - 17489752
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17489401 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 17489500  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489501 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 17489600  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17489601 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17489700  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17489701 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctg 17489752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 9522270 - 9522621
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  9522270 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaac 9522369  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9522370 ccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9522469  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9522470 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 9522569  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  9522570 atcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctg 9522621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16492760 - 16492409
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  16492760 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16492661  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16492660 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagt 16492561  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16492560 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16492461  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16492460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctg 16492409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16807154
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || | |||  |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttc 16807206  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807205 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 16807154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 16691711 - 16692060
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16691711 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16691810  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || || || |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16691811 ccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16691910  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  16691911 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 16692010  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16692011 attttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaacaatctc 16692060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 10905773 - 10906112
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10905773 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10905872  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10905873 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10905972  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  10905973 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10906072  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10906073 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 10906112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15348824 - 15348476
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  15348824 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 15348725  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15348724 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15348625  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15348624 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15348525  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 357  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15348524 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 15348476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 10005163 - 10005502
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10005163 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10005262  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10005263 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10005362  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  10005363 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10005462  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10005463 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 10005502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Original strand, 48425010 - 48425348
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  48425010 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 48425109  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  48425110 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 48425209  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  48425210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 48425309  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48425310 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctct 48425348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 13252253 - 13252592
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  13252253 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 13252352  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  13252353 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 13252452  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||     
T  13252453 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttgg 13252552  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13252553 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 13252592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15589959 - 15589620
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15589959 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15589860  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15589859 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15589760  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  15589759 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 15589660  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15589659 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 15589620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 16635336 - 16635675
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16635336 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16635435  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16635436 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16635535  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  16635536 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16635635  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16635636 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 16635675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 43162660 - 43162999
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  43162660 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 43162759  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  43162760 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 43162859  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  43162860 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 43162959  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43162960 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 43162999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15403089 - 15402738
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  15403089 acatcgtcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15402990  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15402989 ccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15402890  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15402889 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15402790  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15402789 attttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctg 15402738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15725512 - 15725162
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15725512 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15725413  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15725412 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 15725313  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  15725312 cataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 15725213  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725212 attttctcttggatcatccgaa-tttctcagtagtctgctgaacaatctctg 15725162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20062621 - 20062282
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  20062621 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 20062522  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  20062521 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 20062422  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  20062421 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 20062322  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20062321 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 20062282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 53385597 - 53385246
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  53385597 acatcgtcgctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 53385498  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53385497 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 53385398  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53385397 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 53385298  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53385297 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 53385246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792627
Alignment:
Q  16 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcg 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | |||  | |||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  116 gtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatga 215  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  216 gtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttct 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 26792672  T
Q  316 cttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26792671 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 26792627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5425158
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  5425308 cataggagtgactctc-aaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 5425210  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5425209 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 5425158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 15338820 - 15339171
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  15338820 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15338919  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| || ||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15338920 ccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15339019  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15339020 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15339119  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  15339120 atttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctg 15339171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16412861 - 16412510
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| | ||| |    
T  16412861 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16412762  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16412761 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16412662  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  16412661 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttc 16412562  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16412561 attttctcttggatcatctgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctg 16412510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6600649
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||| | |||| ||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 6600597  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6600598 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 6600649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15208793
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||  ||| |    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 15208741  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15208742 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 15208793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756813
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | |  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttc 16756865  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16756864 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 16756813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 360
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15248049
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| || ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    |||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 335  Q
     ||| ||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttc 15248024  T
Q  336 tcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||| || |||||||| ||||    
T  15248025 tcagtagtttgttgaacaatttctg 15248049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 317
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227518
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctct 317  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctct 15227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972387
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 13972387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953193
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| | ||||| ||| || || ||| | ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 15953201  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  15953200 tgatgaac 15953193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47123841
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 47123805  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  47123806 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 47123841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322877
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||  |  || ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||  || ||  ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| |||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||   ||||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatc 13322903  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  13322902 ttgactttctctgtagtctgatgaac 13322877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 10383531 - 10383866
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||  || ||    
T  10383531 catcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaacc 10383630  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  10383631 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 10383730  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10383731 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 10383830  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  10383831 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 10383866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571752
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttc 14571708  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  14571709 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtggtctgatgaac 14571752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134571
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| ||  | ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   |||||     
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcatt 18134597  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || ||||| || |||||||| |||||    
T  18134596 ttgactttatctgtagtctgatgaac 18134571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15015972
Alignment:
Q  148 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttg 247  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  248 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgc 347  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||   ||||| |||||| ||||| ||||| ||     
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgt 15015985  T
Q  348 tgaacaatctctg 360  Q
    |||||||| ||||    
T  15015984 tgaacaatttctg 15015972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329926
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcat 16329926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10420285
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 10420314  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctc 337  Q
    || ||||||  ||||||| | ||||||||    
T  10420313 atcttctctctaatcatcctgactttctc 10420285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759307
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 8759315  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  8759314 tcctgaac 8759307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941928
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 13941920  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  13941921 tcctgaac 13941928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177426
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 41177418  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  41177419 tcctgaac 41177426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850558
Alignment:
Q  75 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  175 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 274  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  275 atgataactcttttgtcgactctg 298  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  12850581 atggtaactcttctgtcgactctg 12850558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086535
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14086535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11303999
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || |||||  ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |    ||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttc 11304042  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 351  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  11304041 atcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcctgatgaa 11303999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360775
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||  | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||  |||| |  ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||    ||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 12360793  T
Q  327 ttaactttctcagtagtc 344  Q
    || |||||||| ||||||    
T  12360792 ttgactttctctgtagtc 12360775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961313
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |  ||  ||||||  || ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    |  ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||  |||| | ||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 298  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11961313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274656
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 8274656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777151
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||||||||  |  || ||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||   |||||||||| | ||| || || ||  | ||||| ||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  44777008 catcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 44777107  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || ||||||   |||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  44777108 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaac 44777151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689049
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgata 151  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742946
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 16742946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16836941 - 16836777
Alignment:
Q  146 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 245  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||     
T  16836941 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 16836842  T
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16836841 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcat 16836777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945177
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacg 153  Q
    |||||   || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13975465 - 13975302
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  13975465 ggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 13975366  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13975365 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 13975302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381190
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| | ||  || ||||| |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| ||||| || || ||  | ||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatc 16381260  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctct 317  Q
      ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||   ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  16381259 ccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactc---tgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 16381190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576647
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 15576647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 331
Target Start/End: Original strand, 17192892 - 17192977
Alignment:
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17192892 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 17192977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748562
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| |||||||| || ||  |  ||||||||||||  |  || || | |||||||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| |||| |||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 18748562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6153259 - 6153141
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||  |  ||||||||| || ||| ||||| |    
T  6153259 ggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatgatcaccaacttgaaacttaatatcctttctcc 6153160  T
Q  268 gcttatcatgataactctt 286  Q
     ||||||||||||||||||    
T  6153159 tcttatcatgataactctt 6153141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6712728 - 6712666
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6712728 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaac 6712666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 320781 - 320836
Alignment:
Q  6 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgc 62  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  320781 tggacatcatctctttggatcacg-gagatggatccggagcatacttccgaagttgc 320836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 286
Target Start/End: Original strand, 21686681 - 21686783
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||| ||||| || || ||  |  ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21686681 acttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaatatcttttctcctcttataatgataact 21686780  T
Q  284 ctt 286  Q
    |||    
T  21686781 ctt 21686783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12854426 - 12854365
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12854426 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 12854365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14183182 - 14183145
Alignment:
Q  318 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14183182 tgaatcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaat 14183145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 24675052 - 24675403
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24675052 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 24675151  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675152 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24675251  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  24675252 cacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 24675351  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675352 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 24675403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22756992
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22757044  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22757043 atcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatctctg 22756992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24708362 - 24708011
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24708362 acatcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 24708263  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708262 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24708163  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  24708162 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttc 24708063  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24708062 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctg 24708011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325795
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21325847  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21325846 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctctg 21325795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 23188571 - 23188922
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23188571 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23188670  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188671 tcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23188770  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23188771 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23188870  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188871 attttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctg 23188922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 16924835 - 16925174
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16924835 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16924934  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16924935 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16925034  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  16925035 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16925134  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16925135 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 16925174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 16998575 - 16998914
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16998575 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16998674  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16998675 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16998774  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  16998775 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16998874  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16998875 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 16998914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 16981727 - 16982066
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16981727 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16981826  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16981827 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16981926  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  16981927 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16982026  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16982027 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 16982066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 17063292 - 17063631
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  17063292 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 17063391  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17063392 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17063491  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  17063492 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17063591  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17063592 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 17063631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Original strand, 23138600 - 23138911
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23138600 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23138699  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23138700 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23138799  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23138800 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23138899  T
Q  309 attttctcttga 320  Q
    || || ||||||    
T  23138900 atcttttcttga 23138911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Original strand, 23550390 - 23550701
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23550390 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23550489  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23550490 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23550589  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23550590 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23550689  T
Q  309 attttctcttga 320  Q
    || || ||||||    
T  23550690 atcttttcttga 23550701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 24709596 - 24709947
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||||||| | ||| |    
T  24709596 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaac 24709695  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24709696 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24709795  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24709796 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24709895  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24709896 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 24709947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44386098
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 44386150  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44386149 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 44386098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145562
Alignment:
Q  15 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  115 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 214  Q
    | || |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  215 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 21145605  T
Q  315 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21145604 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctggacaatct 21145562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 9609711 - 9610050
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  9609711 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 9609810  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  9609811 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 9609910  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  9609911 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 9610010  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9610011 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 9610050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22325736 - 22325385
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  22325736 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 22325637  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22325636 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22325537  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  22325536 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22325437  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22325436 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 22325385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 33 - 360
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063991
Alignment:
Q  33 gatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaa 132  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  133 ctctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 232  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  233 gtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaact 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacc 23063963  T
Q  333 ttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||    
T  23063964 ttctcggtagtttgttcaacaatctctg 23063991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 24261933 - 24262284
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  24261933 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 24262032  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24262033 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24262132  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24262133 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24262232  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24262233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 24262284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24878875 - 24878524
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24878875 acatcgtcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 24878776  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24878775 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 24878676  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24878675 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24878576  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24878575 attttctcttgaatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 24878524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27370832 - 27371183
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | |||      
T  27370832 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaat 27370931  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27370932 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagt 27371031  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  27371032 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 27371131  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27371132 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 27371183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 27217591 - 27217930
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  27217591 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27217690  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  27217691 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgac 27217790  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  27217791 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgt 27217890  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27217891 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctg 27217930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 10868425 - 10868764
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  10868425 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 10868524  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10868525 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10868624  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||     
T  10868625 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttgg 10868724  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10868725 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 10868764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27377351 - 27377101
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27377351 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 27377252  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27377251 caacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 27377152  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatc 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27377151 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 17066953 - 17067289
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||  | |    
T  17066953 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgtg-tgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaag 17067049  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17067050 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17067149  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  17067150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17067249  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17067250 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 17067289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24826060 - 24825811
Alignment:
Q  111 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24826060 actcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtca 24825961  T
Q  211 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || |||||||||| ||||| || |  ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  24825960 caggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgctttcat 24825861  T
Q  311 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24825860 cttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctg 24825811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087321
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
      ||||  |||||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 23087312  T
Q  309 attttctct 317  Q
    || ||||||    
T  23087313 atcttctct 23087321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211455
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||   ||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    ||   | |||| |||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||| || |||  ||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatc 30211483  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaa 351  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  30211482 aacttaaccttctcagtagtctgttgaa 30211455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529420
Alignment:
Q  29 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgtt 128  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||| ||| || ||||  ||||| |||||     
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  129 cgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaa 228  Q
    | ||||||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  229 acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatctt 328  Q
    |||| ||||||||      |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||  ||||| |||    
T  45529300 acacatggtcttc------aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaactt 45529393  T
Q  329 aactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  45529394 aaccttcttagtagtctgttgaacaat 45529420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830557
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 31830521  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  31830522 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 31830557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365658
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| ||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 27365658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358418
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | || | |||| | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 11358440  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  11358439 aacctgactttctcagtagtct 11358418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 23293539 - 23293864
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  23293539 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23293638  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  23293639 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23293738  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| || |||   ||||||    
T  23293739 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 23293838  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || ||||||||  ||||||| |||||    
T  23293839 ttgactttctctatagtctgatgaac 23293864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||   ||| |    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgact 186  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20832849
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttca 20832848  T
Q  310 t 310  Q
    |    
T  20832849 t 20832849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23276682
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| | ||||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 23276638  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || ||||||   |||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  23276639 atcttctctctgatcatcatgactttctccgtagtctgatgaac 23276682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1063650
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||  |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctca 1063614  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  1063615 tcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 1063650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787647
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||| ||| ||||| || ||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtc 27787639  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  27787640 tcctgaac 27787647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 286
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  47 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataac 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||  |  |||| | |    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  147 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 246  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  247 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 286  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 345
Target Start/End: Original strand, 25128387 - 25128546
Alignment:
Q  186 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||  || || || |  | ||||||||||||||    
T  25128387 ttcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactct 25128486  T
Q  286 tttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25128487 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 25128546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574259
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| | ||  || ||||| |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   | || || || | ||| || || ||  | ||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctc 12574151  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  12574152 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 12574251  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  12574252 tcctgaac 12574259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833360
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 24833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276164
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 22276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945131
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || | ||| |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 24945131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 269 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaa 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24570212
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| | || |||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtct 24570212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 45676729 - 45676685
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676729 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640477
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||  || | || ||||| ||||| || ||| |  | |||||||||| ||| || || |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 12640477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23817696 - 23817597
Alignment:
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23817696 tgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggatcatcttaactttttccgtagtct 23817597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22762274 - 22762127
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||||||  | | ||| |||||||||||    
T  22762274 acttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataact 22762175  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |  | |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22762174 cttcttcctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaac 22762127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Original strand, 23599834 - 23599877
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatactt 52  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599834 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831745
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| | || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaac 24831745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 331
Target Start/End: Original strand, 14708908 - 14708972
Alignment:
Q  267 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||| ||||  || |||||||||||    
T  14708908 cgcttatcatgataactcttctgtctactccacgatgctttcatcttcttctggatcatcttaac 14708972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967577
Alignment:
Q  30 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatg 17967577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23817798 - 23817750
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 232  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  23817798 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacac 23817750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 28144701 - 28144749
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 232  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||    
T  28144701 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacac 28144749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 23573606 - 23573957
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23573606 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23573705  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573706 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23573805  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23573806 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23573905  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573906 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 23573957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440440
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23440388  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23440389 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 23440440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23516756
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23516704  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  23516705 atcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctctg 23516756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 18775641 - 18775990
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18775641 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 18775740  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| |||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18775741 ccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagt 18775840  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  18775841 cacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 18775940  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775941 attctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 18775990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 44 - 357
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798972
Alignment:
Q  44 aacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  144 aactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttctt 243  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 20798958  T
Q  344 ctgctgaacaatct 357  Q
    ||||||||||||||    
T  20798959 ctgctgaacaatct 20798972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21984827 - 21984476
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  21984827 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatc 21984728  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21984727 ccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaat 21984628  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21984627 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 21984528  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  21984527 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctg 21984476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 357
Target Start/End: Original strand, 25423053 - 25423401
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25423053 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25423152  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25423153 ccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagt 25423252  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25423253 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 25423352  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 357  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  25423353 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 25423401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15000261 - 14999910
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15000261 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15000162  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15000161 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15000062  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15000061 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14999962  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14999961 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 14999910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22333409 - 22333058
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22333409 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 22333310  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22333309 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22333210  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  22333209 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22333110  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333109 attttctcttggatcatccggactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 22333058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 22134532 - 22134883
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22134532 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22134631  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22134632 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 22134731  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22134732 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22134831  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134832 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 22134883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770175
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19770123  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19770124 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 19770175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610569
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttc 27610517  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27610518 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 27610569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 40708656 - 40708995
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  40708656 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 40708755  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  40708756 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 40708855  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  40708856 tctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 40708955  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40708956 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 40708995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 41770706 - 41771057
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  41770706 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 41770805  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41770806 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41770905  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  41770906 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttc 41771005  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41771006 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 41771057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26739213 - 26738876
Alignment:
Q  23 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||    
T  26739213 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcc 26739114  T
Q  123 accgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 222  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  26739113 accgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccc 26739014  T
Q  223 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaat 322  Q
    ||||||| |  || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  26739013 tcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 26738914  T
Q  323 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26738913 catcttaactttctcagtagtttgttgtacaatttctg 26738876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668661
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27668713  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27668712 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 27668661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27685922 - 27685571
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  27685922 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27685823  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27685822 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 27685723  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27685722 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 27685623  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27685622 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 27685571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 34566370 - 34566709
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  34566370 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 34566469  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  34566470 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 34566569  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  34566570 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 34566669  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34566670 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 34566709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 16356378 - 16356717
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16356378 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16356477  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16356478 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16356577  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  16356578 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16356677  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16356678 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 16356717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27518271 - 27518622
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  27518271 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27518370  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27518371 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27518470  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27518471 cataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27518570  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27518571 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 27518622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37292018 - 37291667
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  37292018 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 37291919  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37291918 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 37291819  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  37291818 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 37291719  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291718 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 37291667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471439
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttc 23471392  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  23471393 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaat 23471439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29476595 - 29476244
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  29476595 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 29476496  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  29476495 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgt 29476396  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  29476395 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttc 29476296  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29476295 attttctcttggatcatccgaactttttcagtagtctgttgaacaatctctg 29476244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348638
Alignment:
Q  34 atggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaac 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  134 tctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacg 233  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  234 tggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactt 333  Q
    |||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactt 22348611  T
Q  334 tctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22348612 tctcagtagtttgctgaacaatctctg 22348638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468275
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  |||||||| |||   | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttc 20468319  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20468318 atcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgctgaac 20468275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498209
Alignment:
Q  88 tcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 187  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  188 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 287  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || || ||| | ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  288 tgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctc 21498209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21343868 - 21343666
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  21343868 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 21343769  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21343768 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21343669  T
Q  221 tct 223  Q
    |||    
T  21343668 tct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 250  Q
    ||   |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442472
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  | |||  ||| ||||| |||| ||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 335  Q
     ||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||||||| ||||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttc 23442489  T
Q  336 tcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||    
T  23442488 tctgtagtctgatgaac 23442472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564202
Alignment:
Q  46 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| || | |||||| || ||||     
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  146 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 245  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 295  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgact 21564202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890938
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| | | || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| || |||   ||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  21890963 ttgactttctctgtagtctgatgaac 21890938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462132
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||   |||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatc 22462115  T
Q  327 ttaactttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| |||||    
T  22462116 ttgactttctctgtagt 22462132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848222
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | |||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 25848221  T
Q  310 t 310  Q
    |    
T  25848222 t 25848222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28923982
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28923991  T
Q  309 attttctct 317  Q
    || ||||||    
T  28923990 atcttctct 28923982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14887177
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 14887213  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  14887212 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 14887177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236099
Alignment:
Q  6 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgata 105  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  106 atccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 205  Q
    | |||||||  || | ||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  206 agtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 305  Q
     |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgct 22236146  T
Q  306 ttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||| ||||||   | |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  22236145 ttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtctgatgaac 22236099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735790
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |  |||   |||| |    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24735816  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  24735815 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 24735790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749733
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |  |||   |||| |    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24749759  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  24749758 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 24749733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20773942
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| || || ||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || |||| ||| || ||| |  |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 20773905  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    || ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||    
T  20773906 atcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtct 20773942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28895156
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  |||||||  |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28895165  T
Q  309 attttctct 317  Q
    || ||||||    
T  28895164 atcttctct 28895156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545682
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| || || | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  210 acatgagtgactctca-aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    | | ||||||| |||| |||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttc 37545719  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    || || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  37545718 atcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 37545682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342464
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | | |||||||||| ||| || || ||    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 20342428  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  20342429 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 20342464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737018
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 298  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24737018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662300
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  |||| ||  |||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 271  Q
    || | |||||||||| | |||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381346
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    |||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 22381346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798630
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 298  Q
    || ||| || || ||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 24798630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080275
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  || ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || ||    |||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatc 23080297  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  23080296 atcttgactttctcagtagtct 23080275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 360
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21405035
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||||  ||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | || | ||||||||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
     |||||||| || ||| |||                 || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| || |||  ||||    
T  21404915 aaaaaacacatgatctcctt----------------gttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatc 21404998  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21404999 aacttaaccttctcagtagtctgttgaacaatgtctg 21405035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Original strand, 20821317 - 20821635
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||  |||||||| |    
T  20821317 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 20821416  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20821417 ttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 20821516  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || ||  |||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||   ||||||    
T  20821517 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 20821616  T
Q  327 ttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||| |||||||    
T  20821617 ctaactttctctgtagtct 20821635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502826
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcat 22502826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339457
Alignment:
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 21339457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||  |||| ||  |||| ||||||||| ||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| | |||||||||| | |||||| || ||| ||||    
T  21665886 tctgataca-accaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgctt 271  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210880
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| |||||| || |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtct 11210880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269512
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| |  |  || ||||| |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 17269520  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  17269519 tcctgaac 17269512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011252
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 27011252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 23503464 - 23503625
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  23503464 acttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 23503563  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| |||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  23503564 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 23503625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937388
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 21937388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581379
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || | ||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 24581379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625470
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 97  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25244695 - 25244598
Alignment:
Q  188 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 285  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| |||||||||||    
T  25244695 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactct 25244598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25308847 - 25308750
Alignment:
Q  188 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 285  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| |||||||||||    
T  25308847 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactct 25308750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 65369 - 65719
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  65369 acatcatcact-tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 65467  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  65468 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagt 65567  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  65568 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 65667  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65668 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 65719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39924
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  209 cacatgagt 217  Q
    |||| ||||    
T  39932 cacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39811
Alignment:
Q  265 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctg 39811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278823
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  111 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  211 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 278872  T
Q  311 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278871 tttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 278823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164709
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | |    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 164753  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  164752 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 164709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 308622 - 308973
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  308622 acatcgtcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 308721  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  308722 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 308821  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  308822 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 308921  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308922 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 308973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260614
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||  || |    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
     |||||  || |||||||||| ||  || ||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||   |||| ||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 260570  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||    |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  260571 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaac 260614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16355174
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttc 16355226  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355225 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 16355174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16252525 - 16252174
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16252525 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatc 16252426  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252425 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16252326  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  16252325 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttt 16252226  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16252225 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctctg 16252174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 12523608 - 12523959
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12523608 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 12523707  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12523708 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12523807  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12523808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12523907  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12523908 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 12523959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 14680499 - 14680850
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680499 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14680598  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14680599 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14680698  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  14680699 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 14680798  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680799 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 14680850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149740
Alignment:
Q  42 ggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  142 ataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttc 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  242 ttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagta 341  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaata 15149754  T
Q  342 gtctgctgaacaat 355  Q
    ||||||||||||||    
T  15149753 gtctgctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18227526 - 18227177
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18227526 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatc 18227427  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18227426 ccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18227327  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18227326 cacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18227227  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18227226 attttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtcttctgaacaatctc 18227177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 7090365 - 7090715
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7090365 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 7090464  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7090465 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagt 7090563  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||    
T  7090564 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttc 7090663  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7090664 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctg 7090715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652583
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | |    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14652539  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14652540 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 14652583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 23955691 - 23956030
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  23955691 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 23955790  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  23955791 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 23955890  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23955891 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgg 23955990  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23955991 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 23956030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 18297149 - 18297488
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  18297149 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 18297248  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18297249 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 18297348  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  18297349 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 18297448  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18297449 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 18297488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778522
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19778574  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19778573 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 19778522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159773
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||   |||| |||||||  ||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 14159723  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  14159724 atcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctc 14159773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 8386356 - 8386695
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8386356 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8386455  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8386456 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8386555  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  8386556 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8386655  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8386656 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 8386695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14304057 - 14303707
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  14304057 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14303958  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14303957 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 14303859  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  14303858 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 14303759  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303758 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 14303707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27711268 - 27711619
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  27711268 acatcgtcactttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27711367  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27711368 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27711467  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27711468 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27711567  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27711568 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 27711619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 12476544 - 12476883
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  12476544 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 12476643  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  12476644 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12476743  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  12476744 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 12476843  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12476844 atcatctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctg 12476883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29039472 - 29039133
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29039472 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29039373  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  29039372 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 29039273  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  29039272 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29039173  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29039172 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 29039133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 40472972 - 40473321
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  40472972 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 40473071  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40473072 ccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 40473171  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  40473172 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 40473271  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40473272 attttctcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 40473321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266628
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14266680  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||   ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14266679 attttctctcagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctg 14266628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14851095
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14851147  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||    
T  14851146 atcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttctg 14851095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8053703 - 8053352
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  8053703 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 8053604  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || ||||| |||| ||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8053603 ccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8053504  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8053503 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8053404  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8053403 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctg 8053352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 15364330 - 15364583
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15364330 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15364429  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15364430 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15364529  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15364530 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003361
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| ||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||   ||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15003387  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  15003386 ttgactttctccgtagtctgatgaac 15003361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14927339 - 14927151
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14927339 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14927240  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 197  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927239 ccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264798
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 3264834  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  3264833 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 3264798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 214 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16676578 - 16676432
Alignment:
Q  214 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  16676578 gagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatttt 16676479  T
Q  314 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676478 ctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 16676432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11207570 - 11207235
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  11207570 catcatccctcggtatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 11207471  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11207470 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11207371  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  11207370 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11207271  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  11207270 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 11207235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146187
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |||| |    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcacc 16146161  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  16146162 ttgactttctccgtagtctgatgaac 16146187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 352
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070688
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || || | ||| ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| ||  ||| ||| || |||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||| || ||||| |||| | ||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 15070659  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15070660 atcttgaccttctccgtagtctgatgaac 15070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453541
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 29453577  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  29453576 tcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 29453541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246199
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
      |||| ||| ||||| |||| ||| || |||| || ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | | || ||||||| ||| || || ||| | || ||||||||||   | || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15246155  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| || ||||  |||||||| |||||    
T  15246156 atcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtctgatgaac 15246199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223184
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || || ||  | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 33223164  T
Q  324 atcttaactttctcagtagt 343  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  33223165 aacttgactttctcagtagt 33223184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661870
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | |||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 44661892  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  44661891 aacctgactttctcagtagtct 44661870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649316
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||  || ||||||| ||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |     
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    ||| || || ||  | || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcat 1649316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15415059
Alignment:
Q  177 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  277 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  15415098 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 15415059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606178
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 51606186  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  51606185 tcctgaac 51606178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891215
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||  || ||| | |  || ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaacccatc-ctatatgcca 20891028  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| ||| || ||||| | |||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 20891215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640156
Alignment:
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttga 1640194  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1640193 atcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 1640156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 18607910 - 18607823
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 96  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18607910 acatcttcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15359301 - 15359087
Alignment:
Q  138 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 237  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  ||| || || |    
T  15359301 tctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgat 15359202  T
Q  238 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 337  Q
    || | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||||||| || |||||    
T  15359201 ctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctc 15359102  T
Q  338 agtagtctgctgaac 352  Q
     |||||||| |||||    
T  15359101 cgtagtctgatgaac 15359087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 13247736 - 13247899
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  |||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||||||||| |    
T  13247736 ggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcc 13247835  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13247836 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 13247899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9849681 - 9849473
Alignment:
Q  146 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 245  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |    |||||||||||||  || ||| |  ||    
T  9849681 ctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccgact 9849582  T
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||||| |||| ||| || ||  | ||||||||| ||||||| |  | |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||    
T  9849581 tgaaattcaatatccttcctctgtttatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttctccatagtct 9849482  T
Q  346 gctgaacaa 354  Q
    |||||||||    
T  9849481 gctgaacaa 9849473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132413
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  ||||||||||||  || || || | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| || | ||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 12132413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703036
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 42703036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375376
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  270 ttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  55375437 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaac 55375376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997570
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     ||||||||||| |||||| |||| |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaac 14997570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900654
Alignment:
Q  150 tacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaa 249  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||  |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || ||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  250 actcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 27900654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  64 acacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaa 163  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  164 tctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacca 206  Q
      | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445230
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16445230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 310
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752826
Alignment:
Q  149 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttga 248  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  249 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 16752826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 9290926 - 9291089
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||| | |||||| || | || |||||||| || || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  9290926 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 9291025  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9291026 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 9291089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293175
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| ||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 15293175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18550234 - 18550049
Alignment:
Q  177 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||| |||||||  || |    ||| |||||||| |    ||| || ||||||||||    
T  18550234 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaacaaatgatacctttcctgaaactccaatgatttccttcgcttatcat 18550135  T
Q  277 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat--tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||| |||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||| ||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  18550134 gatagctcttttgtctattttgtgatgctttcattctctctctcgaatcattttgactttttctgtcgtctgctgaacaatctctg 18550049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415226
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 102  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtg 15415226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 15351966 - 15351934
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351966 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 352
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15077910
Alignment:
Q  267 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 15077910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15359379 - 15359326
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatca 80  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15359379 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 16685361 - 16685522
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||| | |||||||||||| | || ||  |  ||||||| | || ||| ||  | | ||||||||||||| |    
T  16685361 acttcaaagcacacccaacaccggttacatgattcactctcaaaaacccatgatcaccaacttgaaattaaatatccttcatcctcttatcatgataaat 16685460  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     || || | |||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  16685461 tttctgcctactctgagacgctctcatcttctcctgaatcatcttaactttcttcgtagtct 16685522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30313927 - 30313578
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30313927 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 30313828  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313827 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 30313728  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  30313727 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 30313628  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313627 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 30313578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21166969
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21167021  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21167020 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctg 21166969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 19977965 - 19978316
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19977965 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 19978064  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978065 ccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 19978164  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19978165 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19978264  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978265 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 19978316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16408828 - 16408479
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16408828 acatcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16408729  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408728 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16408629  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  16408628 cacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 16408529  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408528 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 16408479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 15533378 - 15533729
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15533378 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 15533477  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15533478 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15533577  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  15533578 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 15533677  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533678 atcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 15533729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22164974 - 22164625
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22164974 acatcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22164875  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22164874 ccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22164775  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  22164774 cacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22164675  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22164674 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22164625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 32600142 - 32600493
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  32600142 acatcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatc 32600241  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32600242 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 32600341  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  32600342 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 32600441  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32600442 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctactgaacaatctctg 32600493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22133824 - 22133475
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  22133824 acatcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattc 22133725  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22133724 cgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22133625  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  22133624 cacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22133525  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22133524 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22133475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 22046372 - 22046722
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22046372 acatcatcactttg-atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22046470  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046471 ctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22046570  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  22046571 cactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttc 22046670  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046671 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 22046722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 21250940 - 21251290
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21250940 acatcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21251039  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21251040 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21251139  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  21251140 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 21251239  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    | | |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21251240 a-tctctctttaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctg 21251290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 23650039 - 23650390
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23650039 acattatcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23650138  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23650139 caactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 23650238  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23650239 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttt 23650338  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23650339 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctg 23650390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21394648 - 21394297
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21394648 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21394549  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21394548 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21394449  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  21394448 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21394349  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  21394348 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctg 21394297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21789141 - 21788790
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21789141 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21789042  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21789041 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21788942  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  21788941 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21788842  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  21788841 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctg 21788790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21922518 - 21922167
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21922518 acatcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21922419  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21922418 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagt 21922319  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||    
T  21922318 cacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttc 21922219  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  21922218 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctg 21922167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674455
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 17674507  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17674506 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 17674455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 19112700 - 19113039
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  19112700 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 19112799  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  19112800 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 19112899  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  19112900 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 19112999  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19113000 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaataatctctg 19113039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Original strand, 22032030 - 22032339
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  22032030 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22032129  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032130 ctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22032229  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22032230 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22032329  T
Q  309 attttctctt 318  Q
    ||||||||||    
T  22032330 attttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20018533 - 20018182
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  20018533 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 20018434  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20018433 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 20018334  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  20018333 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 20018234  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20018233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctg 20018182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22120957 - 22120603
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  | |||||| ||||||||||||| ||| |    
T  22120957 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 22120858  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22120857 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 22120758  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  22120757 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22120658  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatc 363  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120657 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatc 22120603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19485302
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19485354  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19485353 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctg 19485302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987545
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||  |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 22987498  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  22987499 atcttctcttgaatcatattatctttctcaatagtttgttgaacaat 22987545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 15441179 - 15441420
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15441179 acatcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15441278  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
     ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15441279 aaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15441378  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 250  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  15441379 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949162
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396565
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    |  ||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatc 20396594  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  20396593 aacttaaccttctcagtagtttgttgaac 20396565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377885
Alignment:
Q  156 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  256 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaat 22377890  T
Q  356 ctctg 360  Q
     ||||    
T  22377889 ttctg 22377885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384060
Alignment:
Q  156 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  256 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaat 22384065  T
Q  356 ctctg 360  Q
     ||||    
T  22384064 ttctg 22384060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21681910
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || |    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 21681954  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21681953 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaac 21681910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388405
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||  || || ||||  || | ||| || | |||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     || ||| ||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctct 317  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctct 20388405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679445
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6679409  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  6679410 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010382
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||   ||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 20010382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266538
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||   |||| |||||||     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 1266538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655268
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | | |   ||  |||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||||| |||||  || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttc 23655224  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23655225 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 23655268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324849
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa-gatgcggtgataatccaactcggtacgccacc 125  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||  || |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  126 gttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 225  Q
    |||| ||| || | ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  226 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcat 325  Q
     ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || |||   |||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcat 21324876  T
Q  326 cttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21324875 cttgactttctctgtagtctgatgaac 21324849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 804155
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 804156  T
Q  310 t 310  Q
    |    
T  804155 t 804155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061880
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22061917  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    || || | |   |||||||| |||||||| |||||||    
T  22061916 atcttttttctgatcatcttgactttctctgtagtct 22061880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851710
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 19851710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857746
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 19857746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008191
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   || || ||||  || ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||| ||  | ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||| | ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||   ||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20008165  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  20008166 tttaccttctccgtagtctgatgaac 20008191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416920
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  ||||||  || ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| |||||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca--ttttctcttgaatca 324  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| |||  ||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttccctt--atca 31416942  T
Q  325 tcttaactttctcagtagtctg 346  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31416941 tcttgactttctcagtagtctg 31416920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571282
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 31571290  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  31571289 tcctgaac 31571282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565441
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 14565440  T
Q  310 t 310  Q
    |    
T  14565441 t 14565441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6603992
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| |  |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6603956  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  6603957 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6603992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21840758
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || |    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
      |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
     | | |||| ||||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||     
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttt 21840714  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  21840715 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 21840758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303908
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| || ||| ||||| | |||||||||||| || |   | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcat 29303908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265127
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    || | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 286
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982632
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 286  Q
    |   ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 286
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987852
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 286  Q
    |   ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305057
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||  ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 12305057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652780
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| || || ||  |  |||||||||| | ||| ||||| |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtct 20652780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 249 - 348
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949257
Alignment:
Q  249 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 348  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347436
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    ||||   || ||||| || | ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  210 acatgagtgact 221  Q
    | | ||||||||    
T  27347425 aaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21197126 - 21196960
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| || | |||||||||||||| || ||  || | |||||||||| ||| ||||| |    
T  21197126 ggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcc 21197027  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 334  Q
     |||||||||||||||| | || | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21197026 tcttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 21196960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982756
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||| | || ||  |  | |||||||||| ||||||||  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaac 22982756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 287 - 360
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18856926
Alignment:
Q  287 ttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctg 18856926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 360
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040208
Alignment:
Q  314 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 22040208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 358
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863404
Alignment:
Q  177 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| |    ||| || |  |||||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19863322  T
Q  277 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || || || || || |||||||||||||||||    
T  19863323 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctc 19863404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 358
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19868041
Alignment:
Q  177 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| |    ||| || |  |||||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19867959  T
Q  277 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || || || || || |||||||||||||||||    
T  19867960 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctc 19868041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 310
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051162
Alignment:
Q  166 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttct 265  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||| ||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | || ||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  266 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  22051118 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 22051162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877556
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||  || | || ||||| ||||| || ||| |  | |||||||||| ||| || || |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16877556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850798
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 21850798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315511
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 22315511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23157534 - 23157472
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||||||||| | | || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23157534 cttatcatgataactcctctatctattctgagatgctttcatattctcttgaatcatcttaac 23157472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24818237 - 24818054
Alignment:
Q  171 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 270  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| | ||||| |||||  |  | ||||| |||||||| || |||||  |||||||||||  |||||| || | ||    
T  24818237 gtcaacttcctacacttcaaagcacgttcgacaccggtcacgaggttcactcttaaaaacacatgatcttcaacttgaaactcagtatctttccttctct 24818138  T
Q  271 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaa 354  Q
     |||||| |||||||| |  | |||||| || | |||||| || || |||||||||||||| || |  |||||||| |||||||    
T  24818137 catcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttatgtagtctgttgaacaa 24818054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 22179341 - 22179309
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 41  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22179341 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 22179309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14674
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14323 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14422  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14423 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 14522  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14523 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14622  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14623 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 14674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 583 - 934
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  583 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 682  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||  |||  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  683 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 782  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  783 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 882  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  883 attttctcttggatcatctgaactttcttactagtctgctgaacaatctctg 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19864834
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19864782  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19864783 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctctg 19864834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 358
Target Start/End: Original strand, 12497824 - 12498171
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12497824 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12497923  T
Q  111 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12497924 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12498023  T
Q  211 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12498024 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12498123  T
Q  311 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12498124 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12498171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12511077 - 12510730
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12511077 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12510978  T
Q  111 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12510977 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12510878  T
Q  211 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12510877 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12510778  T
Q  311 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12510777 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12510730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765424
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  25765574 caca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 25765476  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765475 attttctcttgaatcatctttactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 25765424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 358
Target Start/End: Original strand, 12505153 - 12505500
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||     
T  12505153 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccc 12505252  T
Q  111 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12505253 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12505352  T
Q  211 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12505353 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12505452  T
Q  311 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12505453 attctcttgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaacaatctc 12505500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963501
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| || ||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16963553  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16963552 atcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatctctg 16963501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25610346 - 25609995
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25610346 acatcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25610247  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25610246 caacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggt 25610147  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25610146 cacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 25610047  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25610046 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctg 25609995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927774
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttc 16927826  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16927825 atcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaacaatctctg 16927774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543218
Alignment:
Q  15 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  115 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 214  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  215 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttc 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttc 1543264  T
Q  315 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1543263 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 1543218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5839353
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 5839405  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5839404 attttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatctctg 5839353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27331918 - 27331569
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27331918 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27331819  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27331818 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27331719  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  27331718 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27331619  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  27331618 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27331569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27392658 - 27392309
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27392658 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27392559  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27392558 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27392459  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  27392458 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27392359  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  27392358 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27392309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16627202 - 16626851
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  16627202 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 16627103  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16627102 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16627003  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16627002 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16626903  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16626902 attttctcttggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctg 16626851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 23078265 - 23078616
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23078265 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23078364  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23078365 ccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagt 23078464  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23078465 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttc 23078564  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  23078565 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctg 23078616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21833466 - 21833178
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833466 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21833367  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21833366 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagt 21833267  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 297  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833266 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 21833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18408428 - 18408077
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18408428 acatcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 18408329  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18408328 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18408229  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  18408228 cacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttc 18408129  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  18408128 atcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctg 18408077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24313653 - 24313302
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  24313653 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 24313554  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24313553 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24313454  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  24313453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 24313354  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24313353 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 24313302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28263331
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28263383  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28263382 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 28263331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28342080
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28342132  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28342131 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 28342080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29592393 - 29592054
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29592393 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29592294  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  29592293 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 29592194  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  29592193 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29592094  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29592093 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 29592054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22079173 - 22078823
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22079173 acatcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22079074  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22079073 ccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaat 22078974  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  22078973 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 22078874  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 359  Q
    || || ||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  22078873 atcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatctct 22078823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 25112348 - 25112691
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  25112348 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 25112447  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25112448 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 25112547  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||     
T  25112548 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgcttta 25112647  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25112648 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 25112691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2875288 - 2874937
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  2875288 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 2875189  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2875188 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 2875089  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  2875088 cataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 2874989  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2874988 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 2874937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187583
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| |    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27187531  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27187532 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 27187583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261657
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| |    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27261709  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27261708 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 27261657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292506
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28292558  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28292557 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 28292506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22762940 - 22762589
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22762940 acatcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22762841  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22762840 ccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 22762741  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||  |||||    
T  22762740 cacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttc 22762641  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||||    
T  22762640 atcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctg 22762589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 17032358 - 17032582
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17032358 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17032457  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17032458 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagt 17032557  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacg 233  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  17032558 cataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197685
Alignment:
Q  35 tggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaact 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| |||  || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  135 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgt 234  Q
    ||||| |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| ||| || |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  235 ggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 334  Q
    | | | | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| || ||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttacctt 18197707  T
Q  335 ctcagtagtctgctgaacaatc 356  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  18197706 ctcagtagtctgttaaacaatc 18197685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471698
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| || |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| | ||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 21471698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750894
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 298  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25750894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 144
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433928
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22433928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Original strand, 15459150 - 15459468
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |    
T  15459150 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacag 15459249  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  15459250 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 15459349  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  15459350 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 15459449  T
Q  327 ttaactttctcagtagtct 345  Q
     | |||||||| |||||||    
T  15459450 ctgactttctccgtagtct 15459468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768288
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||| ||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 25768288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131310
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  || || ||||  || ||||| |||| |||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||| |||| |||||| ||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 335  Q
     ||| |||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |  |||   ||||  || || ||     
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcatatcaatttgaccttt 14131338  T
Q  336 tcagtagtctgctgaacaatctctgatc 363  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||    
T  14131337 tctgtagtctgctgaactatctctgatc 14131310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10468998
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 10469020  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  10469019 aacctgactttctcagtagtct 10468998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796774
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || ||||  |||||| ||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || ||||||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttc 22796818  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  22796817 atcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtctgatgaac 22796774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364544
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 24364522  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  24364523 aacctgactttctcagtagtct 24364544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645770
Alignment:
Q  63 gacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataa 162  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||| || |||| |||||| || |||||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  163 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttt 262  Q
    |  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  263 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 34645770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 319
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  219 actctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctctt 318  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  319 g 319  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794787
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || |  |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||||| || ||| | |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 18794787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 298
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879383
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | || | |||||||||||||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 298  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 19879383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564316
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| || |  || || ||||  |||||||| |||| ||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||| | |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcat 21564316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 271 - 360
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22434016
Alignment:
Q  271 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 22434016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766297
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |  |||| |  ||| || ||||     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || || ||||| || |||   ||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatc 8766316  T
Q  327 ttaactttctcagtagtct 345  Q
    || |||||||| |||||||    
T  8766315 ttgactttctctgtagtct 8766297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560759
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||||| ||  || ||||| |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    |||||||| ||||| || ||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtc 27560767  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  27560766 tcctgaac 27560759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640876
Alignment:
Q  156 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 255  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |||||| || ||| |||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  256 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctct 317  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 1640876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11288054 - 11287782
Alignment:
Q  38 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctt 137  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||| ||||||     
T  11288054 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11287955  T
Q  138 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 237  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | | ||||||||||| ||||| || |    
T  11287954 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgat 11287855  T
Q  238 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11287854 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11287782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 352
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415625
Alignment:
Q  92 aagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaa 191  Q
    |||||||||||  || || ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  192 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 291  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  292 gactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||||  || |||||||| || ||    |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 17415625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11280961 - 11280689
Alignment:
Q  38 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctt 137  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||| ||||||     
T  11280961 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11280862  T
Q  138 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 237  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||| | | |||| |||||| ||||| || |    
T  11280861 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgat 11280762  T
Q  238 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11280761 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11280689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751024
Alignment:
Q  167 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttcta 266  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  267 cgcttatcatgataactcttttgtc 291  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743236
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25743313 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 25743236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 352
Target Start/End: Original strand, 18800867 - 18801081
Alignment:
Q  138 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 237  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |    
T  18800867 tctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgat 18800966  T
Q  238 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 337  Q
    |  | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||  ||||||||| ||||||||    
T  18800967 ccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctc 18801066  T
Q  338 agtagtctgctgaac 352  Q
     |||||||| |||||    
T  18801067 cgtagtctgatgaac 18801081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098168
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaac 16098168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 18571622 - 18571769
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18571622 acttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 18571721  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |||| |||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18571722 cttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaac 18571769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28283262 - 28282955
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| |  |  || ||||| |    
T  28283262 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 28283163  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  28283162 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 28283063  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  28283062 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 28282963  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  28282962 tcctgaac 28282955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14381841 - 14381609
Alignment:
Q  120 gccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtga 219  Q
    ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |    
T  14381841 gccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 14381742  T
Q  220 ctctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttg 319  Q
    | |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||| || |||||||| || |||      
T  14381741 ccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcatcttttctct 14381642  T
Q  320 aatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
     |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  14381641 tatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 14381609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382536
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16382536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 334
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655604
Alignment:
Q  186 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |   || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | ||||| |||||||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  286 tttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 334  Q
    | |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 25655604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996366
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 23996366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18838057
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| |||||| || | || | ||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| | |  |||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  18838134 tcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 18838057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640688
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 102  Q
    ||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 1640688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648947
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 1648947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787768
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa 93  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaa 18787768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15078690 - 15078513
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  || | | ||||||||| || || ||  |  | |||||||| | ||| |||||      
T  15078690 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctct 15078591  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| || ||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtct 15078513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21413101
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||| ||| ||||  || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||  ||| |||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaac 21413101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 345
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233341
Alignment:
Q  171 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 270  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  271 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16233267 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtct 16233341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 353
Target Start/End: Original strand, 26276987 - 26277071
Alignment:
Q  270 ttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgc-tttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaaca 353  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || || ||| |||||||||||    
T  26276987 ttatcatgataactcttctgcctactcagtgatgcctttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttctgtaatctgctgaaca 26277071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 64023
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 64075  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  64074 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctg 64023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17045427 - 17045076
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17045427 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17045328  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17045327 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggt 17045228  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17045227 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17045128  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045127 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 17045076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 19106314 - 19106665
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  19106314 acatcgtcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 19106413  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19106414 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagt 19106513  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19106514 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19106613  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19106614 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 19106665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 20249797 - 20250148
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  20249797 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 20249896  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20249897 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagt 20249996  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20249997 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 20250096  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  20250097 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacgatctctg 20250148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 20136725 - 20137076
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  20136725 acatcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaac 20136824  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20136825 caacacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 20136924  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  20136925 cacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 20137024  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20137025 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctg 20137076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50620656 - 50620307
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  50620656 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50620557  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50620556 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50620457  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  50620456 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 50620357  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  50620356 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacaatctc 50620307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16351011 - 16350660
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  16351011 acatcgtcattctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16350912  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16350911 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16350812  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  16350811 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 16350712  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16350711 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctg 16350660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33391441 - 33391090
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  33391441 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 33391342  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33391341 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 33391242  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33391241 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 33391142  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33391141 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 33391090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16079045 - 16078713
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16079045 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16078946  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16078945 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16078846  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||                   || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16078845 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc-------------------ctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16078765  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078764 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 16078713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 21747482 - 21747832
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  21747482 acatcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 21747581  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21747582 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 21747681  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21747682 cacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21747780  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  21747781 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctg 21747832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 51333905 - 51333554
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  51333905 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 51333806  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51333805 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 51333706  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  51333705 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 51333606  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51333605 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 51333554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 21830250 - 21830601
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  21830250 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 21830349  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21830350 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21830449  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21830450 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21830549  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21830550 attttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctg 21830601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19760935
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 19760979  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19760978 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaac 19760935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 21836897 - 21837248
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  21836897 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 21836996  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21836997 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21837096  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||    
T  21837097 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttc 21837196  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  21837197 attttctcttggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctg 21837248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354530
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 41354582  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41354581 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctg 41354530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 360
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369595
Alignment:
Q  32 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  132 actctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 231  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  232 cgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    | || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttac 16369566  T
Q  332 tttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
     || ||| |||| || |||||||||||||    
T  16369567 cttttcaatagtttgttgaacaatctctg 16369595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50612828 - 50612602
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  50612828 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50612729  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50612728 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50612629  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  50612628 cacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664945
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   ||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19664971  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  19664970 ttgactttctctgtagtctgatgaac 19664945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940147
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || |||||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 337  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 20940147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163381
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaa 163  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677328
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    ||||| ||| ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  210 acatgagtgactctcaa-aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    | | ||||||| ||||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 37677326  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  37677327 at 37677328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854604
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||   ||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19854578  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  19854579 ttgactttctctgtagtctgatgaac 19854604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856839
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || |||||  |||| |||||| |||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||   |||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatc 20856856  T
Q  327 ttaactttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| |||||    
T  20856855 ttgactttctccgtagt 20856839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550292
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcat 31550292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294660
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | || | |||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 20294660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22433192
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||  || |    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||  ||| || ||||| | |||||||| ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || ||||  ||||| || ||  | || |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  22433328 cataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22433229  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    || || |||   |||||||||||||| || |||||||    
T  22433228 atcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 22433192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075170
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | ||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| || || ||||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcat 20075170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 310
Target Start/End: Original strand, 11382678 - 11382842
Alignment:
Q  146 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 245  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| || || ||  | ||     
T  11382678 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11382777  T
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11382778 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11382842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 352
Target Start/End: Original strand, 41307904 - 41308115
Alignment:
Q  141 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||||||     
T  41307904 gatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctc 41308003  T
Q  241 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagt 340  Q
    | ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   || || || |||||||| ||    
T  41308004 cctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattttgactttctccgt 41308103  T
Q  341 agtctgctgaac 352  Q
    |||||| |||||    
T  41308104 agtctgatgaac 41308115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20835957
Alignment:
Q  75 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  175 acttcttt---gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 271  Q
    |||||||    ||||| || | |||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | || | ||||| |||  | || | ||||||    
T  20836137 acttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgctt 20836038  T
Q  272 atcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  20836037 gtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 20835957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244436
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 298  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20244436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395194
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || |||||  ||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  210 acatgagtgac 220  Q
    | | |||||||    
T  20395204 aaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831482
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20831545 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 20831482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914493
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
      |||| |||||||||||| | || |||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  20914416 atttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 20914493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202371
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | | || | |||||||||||||  || ||  |  | |||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 337  Q
    ||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 21202371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477020
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 102  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtg 24477020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518990
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || |  || || ||||| ||||||||||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaac 46518990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22142294 - 22142232
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 230  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  22142294 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22135710 - 22135645
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 334  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22135710 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaatcatcttaacttt 22135645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 336
Target Start/End: Original strand, 20184364 - 20184456
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttct 336  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||| || | |||||| ||  ||  ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  20184364 cttgaaactcaatatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatcatcttcactttct 20184456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17665 - 17319
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17665 acatcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17566  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17565 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17466  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  17465 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 17366  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17365 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 17319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15155001 - 15154652
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  15155001 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaac 15154902  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15154901 ccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15154802  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  15154801 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttc 15154702  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15154701 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15154652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11553451 - 11553100
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  11553451 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 11553352  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11553351 ccactcgataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 11553252  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11553251 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 11553152  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11553151 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 11553100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 12687422 - 12687773
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  12687422 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 12687521  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12687522 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12687621  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12687622 cataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12687721  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12687722 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttggacaatctctg 12687773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 14954541 - 14954892
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14954541 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14954640  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
      ||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14954641 tcactcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14954740  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14954741 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14954840  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14954841 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctggacaatctctg 14954892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 8198561 - 8198900
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8198561 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8198660  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8198661 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8198760  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  8198761 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8198860  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8198861 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 8198900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 8707526 - 8707877
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  8707526 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8707625  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8707626 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8707725  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8707726 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8707825  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8707826 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctg 8707877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871267
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 10871215  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10871216 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 10871267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 14332318 - 14332669
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  14332318 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 14332417  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14332418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 14332517  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14332518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14332617  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14332618 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctg 14332669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15161406 - 15161055
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15161406 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15161307  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15161306 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15161207  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15161206 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15161107  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15161106 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 15161055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11237562 - 11237211
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  11237562 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 11237463  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11237462 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 11237363  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  11237362 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 11237263  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11237262 attctctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 11237211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 14037728 - 14038079
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14037728 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14037827  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14037828 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14037927  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14037928 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14038027  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  14038028 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctg 14038079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 14347758 - 14348109
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14347758 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14347857  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14347858 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14347957  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14347958 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14348057  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  14348058 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctg 14348109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18552107 - 18551756
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  18552107 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 18552008  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18552007 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 18551908  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18551907 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18551808  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18551807 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 18551756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516768
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttc 23516819  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 359  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23516818 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctct 23516768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 18177663 - 18178014
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  18177663 acatcgtcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 18177762  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18177763 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagt 18177862  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
     | | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  18177863 tataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 18177962  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18177963 attttctctcgaatcatctaaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 18178014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 13685984 - 13686336
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaga-catcatgcaaattcgaaagatgcggtgataat 107  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||  | |||     
T  13685984 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaa 13686083  T
Q  108 ccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 207  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13686084 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 13686183  T
Q  208 tcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgcttt 307  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13686184 tcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgcttt 13686283  T
Q  308 cattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13686284 cattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 13686336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44791688 - 44791349
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  44791688 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 44791589  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  44791588 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 44791489  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  44791488 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 44791389  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44791388 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 44791349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 354
Target Start/End: Original strand, 15203800 - 15204145
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15203800 acatcatctctttcgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15203899  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||| | ||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  15203900 ccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagt 15203999  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15204000 cacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15204099  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaa 354  Q
    || || || || |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15204100 atcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagtttgctgaacaa 15204145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 352
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624816
Alignment:
Q  75 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  175 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 274  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  275 atgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||| || |||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaac 15624816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206784
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||  |||||| || |||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||      
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaat 12206810  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || || || ||||||||||||||    
T  12206809 ttgaccttttctgtagtctgctgaac 12206784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102586
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 15102629  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 351  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15102628 attttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaa 15102586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147476
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   ||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 19147450  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  19147451 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 19147476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20746875
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   ||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20746849  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  20746850 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 20746875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212154
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    | | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 8212154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14264270
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || |    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14264272  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  14264271 at 14264270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11306289
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11306290  T
Q  310 t 310  Q
    |    
T  11306289 t 11306289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152559
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 49152523  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  49152524 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 49152559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 360
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662233
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||    ||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    |||  | ||||||||  || | ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |  || ||||||||||| || | | | ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    ||||||||| |||||| |||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||  ||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatc 21662196  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    | |||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  21662197 aacttaacattttcattagtctgttgaacaatgtctg 21662233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072320
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  | | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 16072320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388412
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
     ||||| || || || |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |  |||   |||| |    
T  11388536 gaacacatgatc-tcctcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 11388438  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  11388437 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 11388412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665813
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||||     | ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   ||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 13665787  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| ||||| || |||||    
T  13665788 ttgactttctctgtagtttgatgaac 13665813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950455
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
     ||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||    |||||||| |||||||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtc 16950463  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  16950462 tgatgaac 16950455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 267 - 360
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596329
Alignment:
Q  267 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctg 9596329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964848
Alignment:
Q  192 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 291  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  292 gactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
     |||||| || || ||||| || |||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctg 35964848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053937
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 18053945  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    | ||||||    
T  18053944 tcctgaac 18053937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 352
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6413776
Alignment:
Q  6 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgata 105  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  106 atccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 205  Q
    | |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| | ||||| || |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  206 agtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 305  Q
     |||| | |||| || |||| |||||| || ||  | || ||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 6413729  T
Q  306 ttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||| || ||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6413730 ttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 6413776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199763
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||  |  || ||||| |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctc 316  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505890
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||  |  || ||||| |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctc 316  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23505890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021615
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||| ||||| | |||||||| ||||||   || || |||| | ||||||| ||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccct 13021493  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || || ||  | ||||||||||| ||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |||    
T  13021494 cagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 13021593  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  13021594 atcttgaccttctcagtagtct 13021615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286360
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||  || | ||| |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
     |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||    |||||||| || |||||||| |||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtc 14286368  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  14286367 tgatgaac 14286360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11772358 - 11772244
Alignment:
Q  241 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagt 340  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11772358 cttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttctcagt 11772259  T
Q  341 agtctgctgaacaat 355  Q
    ||| || ||||||||    
T  11772258 agtttgttgaacaat 11772244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455960
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| ||  || ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 12455938  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | ||| ||||||||||||||||    
T  12455939 accttgactttctcagtagtct 12455960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936590
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 14936590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14130096
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || |||| ||||| ||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14129994  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||   |||| ||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  14129995 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14130094  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  14130095 at 14130096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14433914
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || |||| ||||| ||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14433812  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||   |||| ||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  14433813 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14433912  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  14433913 at 14433914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1391
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||| ||| |||||| | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |  ||| ||| ||| ||| || || ||  | ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||    |||||||| || ||||||||||||    
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtc 1399  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  1398 tgatgaac 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12254387 - 12254326
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12254387 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41144
Alignment:
Q  177 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| |  | |||||| || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  277 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||| ||||| |||| | | |||||||||||||||| |||  ||||| | || || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctg 41144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12368766 - 12368603
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  12368766 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcc 12368667  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  12368666 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctcttggatcatcttaac 12368603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440185
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| | |  | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 4440185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288063
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctc 26288128  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||||| || ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26288127 ctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcat 26288063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824143
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7824080 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 7824143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364183
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 15364183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107801
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27107864 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 27107801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26118810 - 26118596
Alignment:
Q  131 aactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 230  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||| |||| |||     
T  26118810 aactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaa 26118711  T
Q  231 acgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat--tttctcttgaatcatctt 328  Q
    || || ||  | || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||||  |||| | |    
T  26118710 acatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctctt--atcaacct 26118613  T
Q  329 aactttctcagtagtct 345  Q
     ||||||||||||||||    
T  26118612 gactttctcagtagtct 26118596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674562
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  ||||||| ||||  || || || |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatctta 329  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21674623 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatctta 21674562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146812
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||  |  |||||||| |||  || || |||| ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| | |  |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  45146751 cttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtct 45146812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340569
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||||||| ||  || ||||| |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  145 actgatacggaccaat 160  Q
     |||||||||||||||    
T  15340554 tctgatacggaccaat 15340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 348
Target Start/End: Original strand, 20466877 - 20467041
Alignment:
Q  183 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataac 282  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  |  | ||||| |||||||| |  |||||  || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  20466877 gacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataac 20466976  T
Q  283 tcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 348  Q
    | || || | |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  20466977 tattctgcctactctgagattctttcatcttctcctgaatcatcataacctt-tctgtagtctgct 20467041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 345
Target Start/End: Original strand, 17923862 - 17923938
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    |||||||||| ||||||| || | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17923862 cttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 17923938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118818
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 102  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtg 26118818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 345
Target Start/End: Original strand, 13378879 - 13378955
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  13378879 cttatcataataacgcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 13378955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17145428 - 17145288
Alignment:
Q  188 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 287  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| | | ||||| |||||||| ||  || |  |||||||||||| ||| ||  | | ||||||||||||||||||     
T  17145428 caaaacacgtccaacaccggttacattattcactcttaaaaacacatgagctccaacttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttc 17145329  T
Q  288 tgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatctt 328  Q
    || | |||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  17145328 tgcctactctgagaagctttcatattttcttgaatcatctt 17145288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 353
Target Start/End: Original strand, 5764672 - 5764758
Alignment:
Q  267 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaaca 353  Q
    |||||| ||||||||||||| || |   | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5764672 cgcttaccatgataactcttctgcctgatttgcgatgccttcatcctctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgttgaaca 5764758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 12193737 - 12193811
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 343  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12193737 cttaacatgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagt 12193811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15479447 - 15479338
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |    
T  15479447 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacag 15479348  T
Q  127 ttcgaactct 136  Q
    ||| ||||||    
T  15479347 ttccaactct 15479338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 15340590 - 15340654
Alignment:
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15340590 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcat 15340654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353394
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||  | ||  |   ||| |||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcactctcagaaacacaagatcaccaatttggaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 13353346  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| ||   |||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||    
T  13353347 cttctgcgtactctgagatgctctcgtcttctcttaaatcatcttaac 13353394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 310
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457002
Alignment:
Q  248 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 12457002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 13634070 - 13634038
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 41  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13634070 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 13634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6328
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6276  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6277 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctctg 6328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33565
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 33617  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33616 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctg 33565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8910
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8559 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 8658  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8659 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 8758  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  8759 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 8858  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8859 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctg 8910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 639 - 990
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  639 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagc 738  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| || ||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739 caacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 838  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  839 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 938  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  939 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctctg 990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4397
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4748 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 4649  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4648 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 4549  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  4548 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 4449  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4448 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctg 4397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 180180 - 180531
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  180180 acatcaacactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagc 180279  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  180280 caactcgatacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagt 180379  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||  |||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  180380 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 180479  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  180480 atcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctg 180531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 815
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||  ||||| ||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  965 cacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttcc 867  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  866 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctg 815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 127542 - 127191
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  127542 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 127443  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  127442 ccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 127343  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||    
T  127342 cacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttc 127243  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  127242 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 127191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219417
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 219461  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  219460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 219417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 229006 - 229357
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  229006 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacc 229105  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  229106 ctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 229205  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
     | | |||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  229206 aataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 229305  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  229306 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctg 229357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33016
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 357
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6334
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5986 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 6085  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6086 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 6185  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6186 cacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttc 6285  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 357  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  6286 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 6334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1524
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  ||| || || |||||  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
     |||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |||||||| ||||||||  |||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtc 1532  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  1531 tgatgaac 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Original strand, 22816 - 22993
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 22993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32744
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33095 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 32996  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  32995 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagt 32896  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  32895 cacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttc 32796  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||    
T  32795 atcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttctg 32744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6686
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6335 acatcatcacctaggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 6434  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||  ||||| | | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435 ccactcgatataccaccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 6534  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6535 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6634  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6635 atctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctctg 6686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 686
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1036 acatcaccactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 937  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  936 ccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 837  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  836 cacacgagggactctc-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 738  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  737 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctg 686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 110148 - 109803
Alignment:
Q  15 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  110148 tcactctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 110049  T
Q  115 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 214  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  110048 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 109949  T
Q  215 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttc 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  109948 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttc 109849  T
Q  315 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  109848 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 109803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112823
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 112823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 96009
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||| ||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || |||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 96046  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    || |||||    |||| | |||||||||| |||||||    
T  96045 atcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtct 96009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43468
Alignment:
Q  15 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  115 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 214  Q
     ||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  215 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttc 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttc 43422  T
Q  315 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43423 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 43468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8797
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  8448 acatcgtcactctagatttcatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 8547  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8548 ccactcggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 8647  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8648 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8747  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8748 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 346
Target Start/End: Original strand, 13834 - 13966
Alignment:
Q  214 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatttt 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13834 gagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttt 13933  T
Q  314 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 346  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13934 ctcttgaatcatctgaactttcttagtagtctg 13966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50556
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| | |||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 50556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106594
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||| | |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  106757 ggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 106658  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  106657 tcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaac 106594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5535
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5184 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 5283  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5284 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 5383  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5384 cacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 5483  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  5484 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctg 5535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1452
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| |||      
T  1102 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 1201  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1202 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagt 1301  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  1302 cacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttc 1401  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 359  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1402 atcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctct 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7689
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  7340 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 7439  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7440 ccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 7539  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7540 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 7639  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7640 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgttgaacagtctc 7689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 377 - 728
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 676  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  677 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15191
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttc 15139  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15140 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 15191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28231
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||  |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 28229  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  28230 at 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9657
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9306 acatcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 9405  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9406 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9505  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||    
T  9506 cacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttc 9605  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| || | |||||||||||    
T  9606 atcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagtttgttaaacaatctctg 9657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 16950 - 17284
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16950 acatcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17049  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  17050 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaat 17149  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||    
T  17150 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttc 17249  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 343  Q
    || || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17250 atcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagt 17284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15804
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  15456 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaac 15554  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15555 ctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 15654  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15655 cacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15754  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15755 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15967
Alignment:
Q  223 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaat 322  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  323 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 357
Target Start/End: Original strand, 14002 - 14350
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||| | |||||||||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  14002 acatcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14101  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
      ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102 tcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14201  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14202 cacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14301  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 357  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  14302 atcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatct 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 336
Target Start/End: Original strand, 31373 - 31700
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||  || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || |  ||| ||||||| |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttc 31672  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttct 336  Q
    || || |||   |||||||| |||||||    
T  31673 atcttttctctgatcatcttgactttct 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 264 - 360
Target Start/End: Original strand, 17660 - 17756
Alignment:
Q  264 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17660 ctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctg 17756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 162076 - 162396
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  162076 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 162175  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  162176 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagt 162275  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  162276 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 162375  T
Q  309 attttctcttgaatcatctta 329  Q
    | | | |||| ||||||||||    
T  162376 actctttcttaaatcatctta 162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448373
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||| | | ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
     ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttc 448321  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  448322 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 448373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90932
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     || ||| |||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 90940  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  90939 tgatgaac 90932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78636
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||| |||| || || |||||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttctactgaatcatcataaccttttccgtagtct 78636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  135 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 26
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  325 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 226  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
      ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  225 tcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 126  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  125 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15079
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||| | || || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttc 15123  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  15122 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaac 15079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112327
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatc 112283  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||||| |||| |||||| |||||| |||| || |||||    
T  112284 atcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagtttgttgaac 112327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203510
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttc 203512  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  203511 at 203510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Original strand, 322703 - 323010
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||| ||| || |||||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
     |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtc 323002  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  323003 tgatgaac 323010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 352
Target Start/End: Original strand, 117532 - 117874
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttca 117831  T
Q  310 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    | ||||||   |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  117832 tcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtatgatgaac 117874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386118
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| || |||| ||| || | ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||| |||  | ||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| |  || ||| | ||||||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || |||||||| || |||   |||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 386096  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtct 345  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  386097 atcttaaccttctccgtagtct 386118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 6900 - 7253
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaaga-tgcggtgataat 107  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||| | |||     
T  6900 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaa 6999  T
Q  108 ccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 207  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7000 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 7099  T
Q  208 tcacatgagtgactctcaaaa-acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctt 306  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7100 tcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 7199  T
Q  307 tcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7200 tcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctg 7253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4329
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 4294  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4295 atcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26864 - 26530
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  26864 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 26765  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||  ||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  26764 ccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaac 26665  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  26664 tctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 26565  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26564 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaat 26530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195703
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||  | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||    
T  195845 cataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttc 195747  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  195746 atcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 195703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148834
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 148750  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    ||| || || ||  | ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  148751 aaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcat 148834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68582
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  209 ca 210  Q
    ||    
T  68583 ca 68582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 121971
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaac 121971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Original strand, 180147 - 180209
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  180147 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaac 180209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 45 - 355
Target Start/End: Original strand, 1 - 311
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||  ||| ||||||||| ||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || |   | ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtc 300  T
Q  345 tgctgaacaat 355  Q
    |||||||||||    
T  301 tgctgaacaat 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16808 - 16462
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16808 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16709  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16708 ccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagt 16609  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  16608 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 16509  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16508 atcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaat 16462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 252
Alignment:
Q  22 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 121  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  122 caccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 221  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  222 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaa 321  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgga 291  T
Q  322 tcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  290 tcatcttaaccttctcagtagtttgctgtacaatttctg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3437
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 120  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||    
T  3115 tggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacg 3214  T
Q  121 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 220  Q
    ||||||||| || ||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  3215 ccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 3314  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttga 320  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || |||||     
T  3315 tctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgg 3414  T
Q  321 atcatcttaactttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  3415 atcatcttaaccttctcagtagt 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Original strand, 7855 - 8104
Alignment:
Q  111 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7855 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtca 7954  T
Q  211 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  7955 ccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 8054  T
Q  311 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055 tttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctg 8104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 968 - 1301
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  968 acatcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 1067  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1068 ccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 1167  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| | ||||||||||| || || || ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||    
T  1168 cacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttc 1267  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 343  Q
    | ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  1268 actttttctt-aatcgtcttaaccttctcagtagt 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22181
Alignment:
Q  111 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  211 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  311 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctg 22181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116905
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    |||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    |||||| || || |||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatc 116934  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  116933 aacttaaccttctcagtagtttgctgaac 116905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98300
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 98300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23586
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 232  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacac 23586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 59 - 358
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49805
Alignment:
Q  59 ttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggacca 158  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  159 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagat 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  259 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13320 - 12969
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||| ||| |    
T  13320 acatcatctcttaggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaac 13221  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  ||||| ||| |||  | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13220 ccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagt 13121  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13120 cacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13021  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13020 atcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttgctgaagaatttctg 12969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16408
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||| |    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||  | ||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    |||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||   |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttc 16460  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  16459 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 16920 - 17142
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16920 acatcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17019  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17020 caactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17119  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaaca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17120 cacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 352
Target Start/End: Original strand, 886 - 1214
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| || ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| || || ||||| |||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatc 1185  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
      |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  1186 cacttaatcttctcagtagtttgctgaac 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25719
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
     ||||| || |||| | |||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||     
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatt 25748  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25747 aacttaaccttctcagtagtttgctgaac 25719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 171 - 357
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7708
Alignment:
Q  171 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  271 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 7708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 772
Alignment:
Q  147 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 246  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  247 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 346  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  347 ctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||    
T  785 ctgaacaatctctg 772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 360
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9284
Alignment:
Q  123 accgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 222  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  223 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaat 322  Q
    ||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  323 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
     |||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctg 9284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 351
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| || | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| || || |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 334  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7033
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 102  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtg 7033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5588
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||  ||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | || | |||||||| ||| |  ||||||| |||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||  ||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatc 5620  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
    | |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  5619 aacttaaccttctctgttgtttgttgaacaat 5588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 25068
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
     | |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   ||     
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatt 25100  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 355  Q
    | |||||| || || |||||||| ||||||||    
T  25099 agcttaaccttttctgtagtctggtgaacaat 25068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86496
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||| ||| || ||||  ||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    |||  | ||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
     |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||   |||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatc 86533  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  86532 aacttaaccttctcagtagtctgttgaaaaatgtctg 86496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10774
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  ||  | ||||  || ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||| | || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctct 317  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 10774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 352
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26448
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 335  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||   |||||||| || |||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttc 26431  T
Q  336 tcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||    
T  26432 tccgtagtctgatgaac 26448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18537
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  18880 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaac 18781  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||| |||||||  |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  18780 ccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgt 18681  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18680 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 18581  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  18580 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaac 18537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3698 - 3637
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3698 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28805
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || | |||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctc 316  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 28805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40796
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || | |||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctc 316  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 40796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 13901
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13945  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || ||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13944 atcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 13901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4960
Alignment:
Q  81 tgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 180  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  181 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 280  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  281 actcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 4960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47430
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | | |||| || |||| |||||| || ||| | ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 47422  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  47423 tgatgaac 47430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10090
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||||||||||||   |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatc 10109  T
Q  327 ttaactttctcagtagtct 345  Q
    || |||||||| |||||||    
T  10108 ttgactttctctgtagtct 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 79 - 404
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||| ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||    ||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatc 378  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  379 ttgactttctctgtagtctgatgaac 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27825
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||||| || |||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||| | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 27799  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  27800 ttgactttctctgtagtctgatgaac 27825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 1149
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||   || |    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||   || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | || ||| ||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 1193  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  1192 atcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtctgatgaac 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4181
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||| ||| |||||| || ||| | ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||  || |||||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtc 4173  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  4174 tgatgaac 4181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7078
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 7078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20247
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcat 20247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13362
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||| | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 13405  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 351  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13404 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaa 13362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17132
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || || | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  17274 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 17175  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 351  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17174 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaa 17132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58448
Alignment:
Q  90 gaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttca 189  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||  ||||| ||||| | || ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  190 aagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttg 289  Q
      ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  290 tcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||||||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcat 58448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 345
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19419
Alignment:
Q  46 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || || ||||     
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  146 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 245  Q
    |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||    |||||||| |||||||| |||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtct 19419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 337
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74191
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||| |||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 337  Q
    ||| || | |||||| |||||| || | ||||   ||||||||||||| |||||    
T  74138 cttatgcctactctgagatgctctcgtcttcttgagaatcatcttaaccttctc 74191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59042
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatg 82  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10099
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | |||||||||||| |     | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 10055  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  10056 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 10099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14391
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||  ||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14347  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  14348 atcttttctcttatcatcttgacattctccgtagtctgatgaac 14391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51863
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||     
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtt 51871  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  51870 tgatgaac 51863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21671
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||| || |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 335  Q
    ||   | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |||||||| ||||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttc 21688  T
Q  336 tcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21687 tcagtagtctgatgaac 21671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 331
Target Start/End: Original strand, 26004 - 26091
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26004 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 26091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 346
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4191
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |  ||  |||||  ||| ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || || |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||| || |||   ||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatc 4171  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctg 346  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  4172 ttgactttctccgtagtctg 4191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3057
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || |||||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || | | | ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||    |||||||| |||||||| || |||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtc 3049  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  3050 tgatgaac 3057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13364 - 13189
Alignment:
Q  183 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataac 282  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||  || ||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| |    ||| || || ||||||||||| |    
T  13364 gacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggattgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaatgatttccttcgtttatcatgatagc 13265  T
Q  283 tcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 358  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || || || || || || ||||||||||||||    
T  13264 tcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtttgctgaacaatctc 13189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37508
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | | |||||||| | |||||| || |||    |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    |||||||||||   | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtc 37500  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  37501 tgatgaac 37508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38385 - 38180
Alignment:
Q  141 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 240  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |||     
T  38385 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 38286  T
Q  241 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagt 340  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||| || |||  ||||||||| |||||||| ||    
T  38285 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgt 38186  T
Q  341 agtctg 346  Q
    ||||||    
T  38185 agtctg 38180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27548 - 27391
Alignment:
Q  141 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 240  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |||     
T  27548 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 27449  T
Q  241 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 298  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  27448 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctg 27391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1211
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || || | |   || ||||| |||| ||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 1211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  60 tgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaa 159  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  160 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36974
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  37089 acatcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatc 36990  T
Q  109 caactcggtacgccac 124  Q
    ||||| | ||||||||    
T  36989 caactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4446
Alignment:
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagttt 4461  T
Q  346 gctgaacaatctctg 360  Q
    | |||||||| ||||    
T  4460 gttgaacaatttctg 4446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 352
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5056
Alignment:
Q  56 aagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacgga 155  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| || |||||||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  156 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 255  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||| | |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  256 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    |  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 5056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6483
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||  || |||| ||  || ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| || ||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  227 -aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcat 325  Q
     ||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||   |||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcat 6463  T
Q  326 cttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6464 cttgactttctcagtagtct 6483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 49033
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||  || |    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||  ||| ||| | |||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | | || ||||||| |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttc 49077  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  49076 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 49033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57859
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || |||||||||| ||  || ||||| | ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    ||   |||| ||||||||||| || || ||  | |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttc 57861  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  57860 at 57859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42333
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||| |    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 42377  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  42376 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 42333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47399
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||  ||| ||||| ||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||| |    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 47443  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  47442 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 47399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2330
Alignment:
Q  148 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 317
Target Start/End: Original strand, 172 - 462
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||  || ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| | ||| |||| | |||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctct 317  Q
    ||| || |||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 351
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11193
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || || | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11051 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 11150  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 351  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11151 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaa 11193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 400
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || || | ||| || ||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 335  Q
     ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   |||||||| ||||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttc 416  T
Q  336 tcagtagtctgctgaa 351  Q
    || |||||||| ||||    
T  415 tctgtagtctgatgaa 400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7831
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 7831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5968
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||| |||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||  || | ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 298  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 5968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27531
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || | |||| |||||||     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || | | | |||||||| |||||  | || |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||| || |||   ||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatc 27505  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  27506 ttgactttctccgtagtctgatgaac 27531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5002
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||  |||| ||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| || ||| | ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||||||| || ||||| || |||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtc 5010  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  5009 tgatgaac 5002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14257
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || || ||  | || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 14277  T
Q  327 ttaactttctcagtagtctg 346  Q
    || ||| ||||  |||||||    
T  14276 ttgactatctctatagtctg 14257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 190  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25907
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    ||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 25907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16940
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| |  || ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    |  ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcat 16940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 39702 - 40045
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| | ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || ||| | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 40001  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    || || |||   || ||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  40002 atcttttctcttataatcttgactttctcgttagtctgatgaac 40045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 254
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | |  |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactca 254  Q
     ||| | ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26264 - 26203
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26264 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatg 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49214
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | || |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   ||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 49233  T
Q  327 ttaactttctcagtagtct 345  Q
    || ||||| || |||||||    
T  49232 ttgactttttctgtagtct 49214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 61220
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 61257  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  61256 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 61220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 52186
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 308  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 52223  T
Q  309 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  52222 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 52186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67608
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||| ||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtc 67609  T
Q  345 t 345  Q
    |    
T  67608 t 67608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 509 - 792
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || || || ||||  || ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcat 792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19113
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  |||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    | | |||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||||| |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcat 19113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 310
Target Start/End: Original strand, 23096 - 23275
Alignment:
Q  131 aactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 230  Q
    |||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| |||    
T  23096 aactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaac 23195  T
Q  231 acgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  23196 acatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcat 23275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38929
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||  || ||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  110 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    |||||  || ||||| | || |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  210 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 309  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttca 38930  T
Q  310 t 310  Q
    |    
T  38929 t 38929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20410
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 226  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  227 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||  |||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatc 20402  T
Q  327 ttaacttt 334  Q
    || |||||    
T  20403 ttgacttt 20410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43804
Alignment:
Q  12 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  112 ctcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 211  Q
    |||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  212 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatt 311  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||  || ||||||||     
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 43770  T
Q  312 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    || |||   |||||||||||||| || |||||||    
T  43771 ttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 43804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44816
Alignment:
Q  12 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  112 ctcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 211  Q
    |||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  212 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatt 311  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||  || ||||||||     
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 44782  T
Q  312 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    || |||   |||||||||||||| || |||||||    
T  44783 ttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 44816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  127 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16755
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| ||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcat 16755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26560
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 123  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||  || ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  124 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 223  Q
    | ||||  || || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  224 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 26538  T
Q  324 atcttaactttctcagtagtct 345  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  26539 aacctaactttctcagtagtct 26560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33719
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  136 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  236 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 33719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40543
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40480 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 40543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4235
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || | ||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  209 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaag 256  Q
    || | |||| ||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3711
Alignment:
Q  261 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctg 3711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12781
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| |||||||||| ||  || ||||| |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     || |||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||  || |||||||| || ||    |||||||| || |||||||| |||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtc 12789  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  12788 tgatgaac 12781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7238
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||  | |||||| |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaa--ccttctgaaa 7446  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||| |  ||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
     ||||||| |||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||| |    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagac 7246  T
Q  345 tgctgaac 352  Q
    || |||||    
T  7245 tgatgaac 7238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28467 - 28287
Alignment:
Q  151 acggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 250  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || ||  || |||| ||    
T  28467 acggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaa 28368  T
Q  251 ctcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28367 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 28287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 136082 - 136278
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 108  Q
    |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  136082 acatcatctctcgggataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 136181  T
Q  109 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 205  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  136182 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 345
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248912
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||  ||| |||| | ||||| |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 244  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| |||| ||| || || ||  | ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
     |||||||| ||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |||||||| ||||||| |||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtc 248911  T
Q  345 t 345  Q
    |    
T  248912 t 248912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2023
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcac 195  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6329
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 102  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6238 atcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtg 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8394
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  8317 tcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 8394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14822
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| |||| |||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtct 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23679
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| ||     |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  270 ttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| | ||| |||| ||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  145 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 225  Q
     |||||||  |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3896
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 3896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46439
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 46439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 298
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2046
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||     
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 2046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 345
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43082
Alignment:
Q  47 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataac 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||  | ||||| | |    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  147 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 246  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| || | ||| || || ||  | || |    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  247 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||||||| ||    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtct 43082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 303 - 360
Target Start/End: Original strand, 12744 - 12801
Alignment:
Q  303 gctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744 gctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 12801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7559 - 7498
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7559 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5467
Alignment:
Q  261 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 337  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||   |||||||| ||||||||    
T  5543 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3444
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||| |  || ||||| |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 3444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 352
Target Start/End: Original strand, 1 - 176
Alignment:
Q  177 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  277 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    | |||||||| || ||||||| ||| |||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14758
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 14758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24165
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||| |||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaac 24165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1061
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||| || || ||  |  |  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtct 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 393
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| ||  |  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13207
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtct 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 940
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaat 322  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 352
Target Start/End: Original strand, 107 - 195
Alignment:
Q  264 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  107 ctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9059 - 8898
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||||  || ||  |  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  9059 acttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaaacagatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 8960  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  8959 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 8898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9286
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||  |  | |||||||||| ||| |||||   |||||||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    ||| | || |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtct 9286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14956
Alignment:
Q  168 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  268 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||||| ||  | ||||| ||||| | |||||||||||| || || |||||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtct 14956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 345
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43837
Alignment:
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 344  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtc 43836  T
Q  345 t 345  Q
    |    
T  43837 t 43837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 310
Target Start/End: Original strand, 5313 - 5477
Alignment:
Q  146 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 245  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||     
T  5313 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 5412  T
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 310  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  5413 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1345 - 1241
Alignment:
Q  241 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagt 340  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||   ||||||||| |||||||| ||    
T  1345 cttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgt 1246  T
Q  341 agtct 345  Q
    |||||    
T  1245 agtct 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctc 316  Q
    ||| |||| |||||| || |||||||| |||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctc 316  Q
    ||| |||| |||||| || |||||||| |||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 3355
Alignment:
Q  264 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 352  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3443 ctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaac 3355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3518
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 102  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtg 3518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 144
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45943
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 45934  T
Q  136 tttctgata 144  Q
    | |||||||    
T  45935 tctctgata 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 3965
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   | | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |||| ||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4012 cttatgtctactttgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 3965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1532 - 1431
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  1532 cttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 1433  T
Q  344 ct 345  Q
    ||    
T  1432 ct 1431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  184 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  284 cttttgtcgactctgtgatgctttcattttctc 316  Q
    ||| |||| |||||| || |||||||| |||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 345
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71518
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 71518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 345
Target Start/End: Original strand, 13397 - 13550
Alignment:
Q  192 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || ||||| ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| ||||| | ||    
T  13397 gcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatc 13496  T
Q  292 gactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 345  Q
     |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  13497 tactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttctgtagtct 13550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 334
Target Start/End: Original strand, 14370 - 14425
Alignment:
Q  279 taactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 334  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14370 taactcttctgtctactctgagatgctttcattttctcttgattcatcttaacttt 14425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26178
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 26178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 887
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 102  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtg 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9269
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 96  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagat 9269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 820
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 334  Q
    |||||||||||| ||| || || | ||||||||||||| |||| || | |||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||||||    
T  910 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatcttctgcctactctgagatgcattcatcttttcctaaatcatcttaacttt 820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Original strand, 18332 - 18394
Alignment:
Q  269 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcattttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18332 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 18394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University