View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18188_low_16 (Length: 233)

Name: NF18188_low_16
Description: NF18188
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18188_low_16
NF18188_low_16
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (11-233)||(22907253-22907476)
chr8 (107-233)||(5238184-5238311)
chr8 (107-233)||(24661287-24661414)
chr8 (107-233)||(43685643-43685770)
chr8 (10-233)||(16193755-16193980)
chr8 (11-229)||(43373511-43373731)
chr8 (15-232)||(6774286-6774505)
chr8 (15-232)||(24548986-24549205)
chr8 (11-233)||(16405014-16405235)
chr8 (22-233)||(24928830-24929043)
chr8 (22-232)||(17345581-17345792)
chr8 (140-232)||(21844600-21844692)
chr8 (140-232)||(21851993-21852085)
chr8 (140-232)||(30120854-30120946)
chr8 (28-122)||(23837214-23837308)
chr8 (140-232)||(16674420-16674512)
chr8 (11-197)||(222754-222943)
chr8 (11-197)||(736377-736566)
chr8 (11-197)||(860272-860461)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (11-233)||(26680201-26680424)
chr4 (11-233)||(15675128-15675352)
chr4 (11-233)||(31115629-31115853)
chr4 (107-233)||(10488659-10488786)
chr4 (107-233)||(16327965-16328092)
chr4 (11-233)||(13246430-13246654)
chr4 (11-233)||(54118283-54118507)
chr4 (75-233)||(10104289-10104449)
chr4 (140-233)||(122020-122113)
chr4 (11-232)||(10644219-10644443)
chr4 (140-233)||(13048260-13048353)
chr4 (11-109)||(111395-111493)
chr4 (11-232)||(47357654-47357878)
chr4 (28-122)||(41166083-41166177)
chr4 (11-56)||(10104449-10104494)
chr4 (75-232)||(40885594-40885753)
chr4 (35-122)||(15044851-15044938)
chr4 (10-122)||(52265645-52265758)
chr4 (58-122)||(13809647-13809711)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (11-233)||(37105-37328)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (11-233)||(7293017-7293240)
chr7 (107-233)||(11516324-11516451)
chr7 (107-233)||(15441603-15441730)
chr7 (107-233)||(30262168-30262295)
chr7 (11-232)||(47481071-47481294)
chr7 (16-233)||(11580778-11580997)
chr7 (11-233)||(18253874-18254098)
chr7 (11-232)||(16478990-16479213)
chr7 (11-229)||(36052667-36052884)
chr7 (11-233)||(13037053-13037277)
chr7 (13-233)||(16211768-16211990)
chr7 (11-232)||(13321014-13321239)
chr7 (11-233)||(3059966-3060190)
chr7 (140-232)||(13572808-13572900)
chr7 (140-233)||(25292377-25292470)
chr7 (140-232)||(10989541-10989633)
chr7 (148-232)||(13911052-13911136)
chr7 (141-232)||(2437590-2437681)
chr7 (144-232)||(296006-296094)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (11-233)||(16744154-16744377)
chr3 (11-233)||(17912521-17912744)
chr3 (11-233)||(15859063-15859287)
chr3 (107-233)||(2449277-2449404)
chr3 (10-233)||(51158057-51158282)
chr3 (22-233)||(13838905-13839118)
chr3 (11-233)||(15936666-15936890)
chr3 (11-233)||(14842600-14842824)
chr3 (14-233)||(15938508-15938729)
chr3 (11-233)||(2049810-2050034)
chr3 (11-233)||(12030186-12030410)
chr3 (15-228)||(15614838-15615053)
chr3 (11-232)||(16821139-16821363)
chr3 (11-120)||(47984650-47984759)
chr3 (11-120)||(48003224-48003333)
chr3 (11-120)||(47993937-47994046)
chr3 (11-120)||(48012510-48012619)
chr3 (140-232)||(55316351-55316443)
chr3 (140-227)||(13975766-13975853)
chr3 (140-227)||(45860937-45861024)
chr3 (140-232)||(41270207-41270299)
chr3 (140-227)||(13954934-13955021)
chr3 (11-128)||(12264932-12265049)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (11-233)||(19206-19430)
scaffold0195 (11-233)||(21290-21514)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (11-233)||(19794743-19794967)
chr2 (11-233)||(36982480-36982704)
chr2 (107-233)||(19689440-19689567)
chr2 (107-233)||(23820168-23820295)
chr2 (107-233)||(14906479-14906606)
chr2 (11-233)||(24341428-24341652)
chr2 (107-233)||(20015108-20015235)
chr2 (11-233)||(43642996-43643220)
chr2 (11-232)||(25265430-25265653)
chr2 (11-233)||(8891242-8891466)
chr2 (16-233)||(462743-462962)
chr2 (11-222)||(7507894-7508107)
chr2 (11-233)||(20627352-20627576)
chr2 (140-227)||(17396697-17396784)
chr2 (11-232)||(19886689-19886913)
chr2 (28-88)||(9636761-9636821)
chr2 (44-88)||(24884718-24884762)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (107-233)||(20623066-20623193)
chr5 (107-233)||(21233567-21233694)
chr5 (11-233)||(18531106-18531330)
chr5 (110-233)||(37052844-37052968)
chr5 (11-233)||(22053872-22054096)
chr5 (107-233)||(16536294-16536421)
chr5 (11-233)||(23506965-23507189)
chr5 (107-233)||(25900445-25900571)
chr5 (11-233)||(27182586-27182810)
chr5 (22-232)||(34939289-34939500)
chr5 (140-232)||(29188312-29188404)
chr5 (142-232)||(27009975-27010065)
chr5 (11-232)||(4200013-4200237)
chr5 (11-232)||(18778020-18778244)
chr5 (11-232)||(22366509-22366733)
chr5 (11-232)||(25426628-25426852)
chr5 (140-232)||(43443423-43443515)
chr5 (11-232)||(12374-12598)
chr5 (140-232)||(19500031-19500123)
chr5 (11-232)||(21073623-21073847)
chr5 (11-122)||(23493917-23494029)
chr5 (58-122)||(7728466-7728530)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (107-233)||(51452589-51452716)
chr1 (11-233)||(20445679-20445903)
chr1 (11-233)||(20531444-20531668)
chr1 (11-233)||(20893665-20893889)
chr1 (11-233)||(20931345-20931569)
chr1 (11-233)||(41394222-41394446)
chr1 (11-222)||(22227809-22228022)
chr1 (11-222)||(22232506-22232719)
chr1 (15-232)||(2116258-2116478)
chr1 (11-233)||(20913037-20913254)
chr1 (11-233)||(37844489-37844714)
chr1 (140-229)||(45051554-45051643)
chr1 (140-232)||(18601146-18601238)
chr1 (140-232)||(5072416-5072508)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (11-233)||(8849-9073)
scaffold0025 (11-233)||(148721-148945)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (107-233)||(22637-22764)
scaffold0141 (107-233)||(26892-27019)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (107-233)||(1621-1748)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (15-232)||(14626158-14626377)
chr6 (11-229)||(35009482-35009702)
chr6 (22-233)||(23153458-23153671)
chr6 (22-232)||(1657788-1657999)
chr6 (15-229)||(1650136-1650352)
chr6 (22-232)||(15862484-15862694)
chr6 (11-232)||(25175563-25175787)
chr6 (11-114)||(27740838-27740941)
chr6 (28-121)||(18381821-18381914)
chr6 (11-232)||(27654011-27654235)
chr6 (189-232)||(27751605-27751648)
chr6 (11-98)||(22361926-22362014)
chr6 (58-122)||(25367374-25367438)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (11-233)||(36952-37176)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-233)||(48187-48411)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (11-233)||(1124-1348)
scaffold0266 (13-233)||(3621-3843)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (11-233)||(107747-107971)
scaffold0026 (140-203)||(64585-64648)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (11-232)||(13506-13729)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (11-233)||(12115-12337)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (11-232)||(41648-41871)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (22-233)||(171916-172129)
scaffold0001 (22-233)||(177619-177832)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (11-233)||(995-1218)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (11-233)||(48598-48822)
scaffold0023 (140-232)||(36225-36317)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (11-233)||(123203-123427)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (15-232)||(9377-9596)
scaffold0215 (15-232)||(16275-16494)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (17-233)||(272031-272249)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (11-233)||(5100-5324)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (11-232)||(8878-9101)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (15-232)||(2966-3186)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (11-233)||(6103-6326)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (11-232)||(34500-34724)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (22-233)||(247481-247694)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (11-233)||(128208-128431)
scaffold0008 (148-232)||(31703-31787)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (15-233)||(41733-41953)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-222)||(5254-5466)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (11-233)||(573-797)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (140-232)||(5660-5752)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (140-232)||(13353-13445)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-233)||(26454-26678)
scaffold0162 (11-232)||(8220-8440)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (140-232)||(167-259)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (11-109)||(9382-9480)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (11-222)||(3722-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (11-232)||(42997-43221)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (140-233)||(51221-51314)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (140-232)||(14089-14181)
scaffold0139 (143-232)||(21144-21233)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (11-222)||(54416-54630)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (140-233)||(89493-89586)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (140-232)||(1332-1424)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (11-100)||(48514-48603)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (35-122)||(197390-197477)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (11-88)||(104793-104871)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (28-89)||(2471-2532)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (35-99)||(2548-2612)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (13-65)||(3210-3262)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907253
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22907376 caactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 22907277  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22907276 atcaattcatgcatacaaacatat 22907253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238311
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatat 5238311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661287
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatat 24661287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685770
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatat 43685770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193755
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | |||||     
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  110 tcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |||    
T  16193880 ttaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatta 16193781  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  16193780 tcatcaattcatgcatacaaacatat 16193755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373511
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | | | ||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| | ||||    
T  43373631 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattat 43373532  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaac 229  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  43373531 catcaattcatgcatacaaac 43373511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774286
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  6774405 aataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 6774306  T
Q  213 aattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6774305 aattcatgcatacaaacata 6774286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549205
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| | | ||| | |||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  24549086 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 24549185  T
Q  213 aattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24549186 aattcatgcatacaaacata 24549205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16405014
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  16405135 taac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 16405039  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  16405038 catcaattcatgcatacaaacatat 16405014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928830
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | | ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||     
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  122 tgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24928943 tagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 24928844  T
Q  220 gcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||    
T  24928843 gcatacaaacatat 24928830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345792
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact 17345679  T
Q  122 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17345680 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 17345779  T
Q  220 gcatacaaacata 232  Q
    ||||| |||||||    
T  17345780 gcatataaacata 17345792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21844692 - 21844600
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  21844692 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacata 21844600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21852085 - 21851993
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  21852085 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacata 21851993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 30120854 - 30120946
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||    
T  30120854 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacata 30120946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Original strand, 23837214 - 23837308
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  23837214 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16674512 - 16674420
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| |||||||    
T  16674512 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacata 16674420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222754
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  111 caactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 197  Q
     ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736377
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  111 caactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 197  Q
     ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860272
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  111 caactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 197  Q
     ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680424
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26680301 caactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 26680400  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26680401 atcaattcatgcatacaaacatat 26680424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675128
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15675252 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15675153  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  15675152 catcaattcatgcatacaaacatat 15675128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115853
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31115729 caacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 31115828  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  31115829 catcaattcatgcatacaaacatat 31115853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488786
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatat 10488786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327965
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatat 16327965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246654
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13246530 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 13246629  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  13246630 cattaattcatgcatacaaacatat 13246654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118283
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||     
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| || | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  54118407 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 54118308  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  54118307 catcaattcatgcatacaaacatat 54118283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10104449 - 10104289
Alignment:
Q  75 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 172  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  10104449 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataa 10104350  T
Q  173 ttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10104349 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatat 10104289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122113
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatat 122113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644443
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| |||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacata 10644443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13048353 - 13048260
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  13048353 gcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatat 13048260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111493
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357878
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||| ||||||||||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacata 47357878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41166177 - 41166083
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
T  41166177 tatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104449
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaac 56  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885594
Alignment:
Q  75 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 171  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
T  40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
Q  172 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | |||||||||||||||||||||    
T  40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacata 40885594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Original strand, 15044851 - 15044938
Alignment:
Q  35 acccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  15044851 acccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 52265758 - 52265645
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaa 108  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| ||||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | |||    
T  52265758 acatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaa 52265659  T
Q  109 ttcaactacaacat 122  Q
    |||||| |||||||    
T  52265658 ttcaacaacaacat 52265645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13809711 - 13809647
Alignment:
Q  58 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  13809711 acaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 13809647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37105
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37228 caactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 37129  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37128 atcaattcatgcatacaaacatat 37105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293240
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7293117 caacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 7293216  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  7293217 attaattcatgcatacaaacatat 7293240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516451
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatat 11516451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441603
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatat 15441603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262168
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatat 30262168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481071
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| |||    
T  47481194 caacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacata 47481071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580778
Alignment:
Q  16 tcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaact 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||     
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  116 acaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatca 213  Q
    ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  11580897 acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 11580798  T
Q  214 attcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11580797 attcatgcatacaaacatat 11580778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253874
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  18253998 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 18253899  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  18253898 catcaattcatgcatacaaacatat 18253874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478990
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| |    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||  | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  16479113 taaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 16479014  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  16479013 catcaattcatgcatacaaacata 16478990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052884
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| | ||||    
T  36052767 taac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattat 36052863  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaac 229  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  36052864 catcaattcatgcatacaaac 36052884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13037053
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||     
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||    
T  13037177 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattat 13037078  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  13037077 catcaattcatgcatacaaacatat 13037053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16211990
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 112  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  113 actacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatta 210  Q
    || ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| |    
T  16211868 acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatca 16211967  T
Q  211 tcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16211968 tcaattcatgcatacaaacatat 16211990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321239
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  111 caacta-caacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||| | |||| | |  ||||||| | |||  |||||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||||||||||||||| |    
T  13321114 caacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat 13321212  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13321213 tatcatcaattcatgcatacaaacata 13321239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060190
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  111 caactacaacatgtc-aaattcatccattt--gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  | ||||||| ||||||  ||| |||||||| || || |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||    
T  3060066 taacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatat 3060190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 13572808 - 13572900
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  13572808 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacata 13572900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25292470 - 25292377
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||    
T  25292470 gcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatat 25292377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 10989541 - 10989633
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  10989541 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 10989633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13911136 - 13911052
Alignment:
Q  148 ttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  13911136 ttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacata 13911052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 232
Target Start/End: Original strand, 2437590 - 2437681
Alignment:
Q  141 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  2437590 cacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 2437681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 296094 - 296006
Alignment:
Q  144 aattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  296094 aatttttataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacata 296006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744154
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16744277 caactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttatt 16744178  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16744177 atcaattcatggatacaaacatat 16744154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912521
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||     
T  17912644 caactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 17912545  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17912544 atcaattcatgcatacaaacatat 17912521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15859063
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15859187 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15859088  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  15859087 catcaattcatgcatacaaacatat 15859063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449277
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatat 2449277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158057
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  110 tcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
      ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  51158182 ctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 51158083  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  51158082 tcatcaattcatgcatacaaacatat 51158057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839118
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||     
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  122 t-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  13839005 tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 13839104  T
Q  220 gcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||    
T  13839105 gcatacaaacatat 13839118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936666
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15936790 taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15936691  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  15936690 catcaattcatgcatacaaacatat 15936666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842600
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  14842724 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattat 14842625  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  14842624 cttcaattcatgcatacaaacatat 14842600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938508
Alignment:
Q  14 catcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaa 113  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  114 ctacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 211  Q
    | ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
T  15938629 caacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 15938530  T
Q  212 caattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  15938529 caattcatgattacaaacatat 15938508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050034
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | | ||||||||| |||| ||||| | ||||| |    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  2049910 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 2050009  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||| ||||||||||||||    
T  2050010 catcaattcaggcatacaaacatat 2050034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030186
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| || | | | ||||||||| |||||||||| |  |||| |    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  12030310 taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 12030211  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  12030210 catcaattcatgcatacaaacatat 12030186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615053
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| | | ||| | |||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  115 tacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||    
T  15614938 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatc 15615037  T
Q  213 aattcatgcatacaaa 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  15615038 aattcatgcatacaaa 15615053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821363
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacata 16821363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984759
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  111 caactacaac 120  Q
    |||| |||||    
T  47984750 caacaacaac 47984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003333
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  111 caactacaac 120  Q
    |||| |||||    
T  48003324 caacaacaac 48003333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994046
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  111 caactacaac 120  Q
    |||| |||||    
T  47994037 caacaacaac 47994046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012619
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  111 caactacaac 120  Q
    |||| |||||    
T  48012610 caacaacaac 48012619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 55316351 - 55316443
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  55316351 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 55316443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13975853 - 13975766
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaa 227  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  13975853 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa 13975766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 227
Target Start/End: Original strand, 45860937 - 45861024
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaa 227  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  45860937 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa 45861024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 41270207 - 41270299
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| |||   |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  41270207 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 41270299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13955021 - 13954934
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaa 227  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  13955021 gcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa 13954934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12265049 - 12264932
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||    
T  12265049 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 12264950  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa 128  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  12264949 caacaacaacatatcaaa 12264932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19430
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  19306 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 19405  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  19406 catcaattcatgcatacaaacatat 19430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21514
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  21390 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 21489  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  21490 catcaattcatgcatacaaacatat 21514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794743
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  19794867 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 19794768  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19794767 tatcaattcatgcatacaaacatat 19794743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982480
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  111 caactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| || | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||    
T  36982604 caacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattat 36982505  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||| ||||||||||||    
T  36982504 catcaattcatgaatacaaacatat 36982480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689440
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatat 19689440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820295
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatat 23820295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906479
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatat 14906479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341428
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||  ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  24341552 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattat 24341453  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24341452 catcaattcatgcatacaaacatat 24341428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015235
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatat 20015235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642996
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  111 caactacaac-atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  43643120 taataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 43643021  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  43643020 catcaattcatgcatacaaacatat 43642996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265430
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  25265553 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 25265454  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  25265453 catcaattcatgcatacaaacata 25265430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891466
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| ||||    
T  8891342 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattat 8891441  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  8891442 catcaattcatgcatacaaacatat 8891466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 462743 - 462962
Alignment:
Q  16 tcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaact 115  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  || ||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||     
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  116 acaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
    ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||    
T  462843 acaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatat 462962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgca-caagaatcatagctcaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||    
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 7508008  T
Q  110 tcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactt 206  Q
    | ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||    
T  7508007 t-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  207 attatcaattcatgca 222  Q
    || |||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627352
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| || | | || |||||||| |||||||| | | ||||| |    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20627476 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20627377  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  20627376 catcaattcgtgcatacaaacatat 20627352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17396784 - 17396697
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaa 227  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  17396784 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa 17396697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886689
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacata 19886689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Original strand, 9636761 - 9636821
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 88  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  9636761 tatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 9636821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 24884718 - 24884762
Alignment:
Q  44 atgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 88  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24884718 atgaatcatcaacaacaatatctattagcaacaacaacatcaatt 24884762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623193
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatat 20623193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233567
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatat 21233567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531106
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  18531230 caacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatat 18531106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37052968
Alignment:
Q  110 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37052944 tatcaattcatgcatacaaacatat 37052968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053872
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||  |||    
T  22053996 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactat 22053897  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
T  22053896 catcaattcatacatacaaacatat 22053872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536421
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16536394 tattataaattcatgcatacaaacatat 16536421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507189
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  23507065 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 23507164  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  23507165 catcaattcatgcatacaaacatat 23507189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900445
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatat 25900445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182586
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||    
T  27182710 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattat 27182611  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  27182610 catcagttcatgcatacaaacatat 27182586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939500
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| | |  ||     
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgact 34939387  T
Q  122 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34939388 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 34939487  T
Q  220 gcatacaaacata 232  Q
    |||||||||||||    
T  34939488 gcatacaaacata 34939500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188312
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata 29188312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Original strand, 27009975 - 27010065
Alignment:
Q  142 acaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  27009975 acaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacata 27010065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200013
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacata 4200013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778020
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | ||  ||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacata 18778020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366509
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| |    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacata 22366509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426852
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacata 25426852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43443515 - 43443423
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  43443515 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 43443423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12598
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacata 12598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 19500031 - 19500123
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  19500031 gcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 19500123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073623
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  111 caactacaacatgtca--aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |   |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      ||| |||||||||||||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacata 21073623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 23493917 - 23494029
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    |||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||    
T  23493917 catcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaat 23494016  T
Q  110 tcaactacaacat 122  Q
    ||||| |||||||    
T  23494017 tcaacaacaacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Original strand, 7728466 - 7728530
Alignment:
Q  58 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  7728466 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 7728530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452716
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatat 51452716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445903
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||||| | |||||    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20445779 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20445878  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  20445879 catcaattcatgcatacaaacatat 20445903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531668
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||||| | |||||    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20531544 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20531643  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  20531644 catcaattcatgcatacaaacatat 20531668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893665
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||     
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||    
T  20893789 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattat 20893690  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  20893689 catcaattcatgcatacaaacatat 20893665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931569
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  20931445 taacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 20931544  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  20931545 catcaattcatgcatacaaacatat 20931569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394446
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | |||||      
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||| ||||    
T  41394322 taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattat 41394421  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  41394422 catcaatttatgcatacaaacatat 41394446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
T  22227909 taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat 22228008  T
Q  209 tatcaattcatgca 222  Q
     |||||||||||||    
T  22228009 catcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
T  22232606 taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat 22232705  T
Q  209 tatcaattcatgca 222  Q
     |||||||||||||    
T  22232706 catcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116478
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagc-tcaattcaa 113  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| |   |||| | ||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  114 ctacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 211  Q
    | | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
T  2116358 caataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 2116457  T
Q  212 caattcatgcatacaaacata 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2116458 caattcatgcatacaaacata 2116478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913254
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||||      ||||    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca------aatt 20913130  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  20913131 -aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 20913229  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  20913230 catcaattcatgcatacaaacatat 20913254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844489
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttca-taacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| | |  ||||||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  37844614 taacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 37844515  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  37844514 tcatcaattcatgcatacaaacatat 37844489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051643
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaac 229  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaac 45051643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18601238 - 18601146
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  18601238 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 18601146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5072508 - 5072416
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  5072508 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacata 5072416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9073
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | ||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  8949 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 9048  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  9049 catcaattcatgcatacaaacatat 9073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 148721 - 148945
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  148821 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 148920  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  148921 catcaattcatgcatacaaacatat 148945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22764
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22737 tattatcaattcatgcatacaaacatat 22764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27019
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26992 tattatcaattcatgcatacaaacatat 27019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1621
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648 tattatcaattcatgcatacaaacatat 1621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626158
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  115 tacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 211  Q
     ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
T  14626277 aacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  212 caattcatgcatacaaacata 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacata 14626158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009482
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  35009602 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 35009503  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaac 229  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  35009502 catcaattcatgcatacaaac 35009482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153671
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  122 tgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23153558 tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 23153657  T
Q  220 gcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||    
T  23153658 gcatacaaacatat 23153671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657788
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact 1657901  T
Q  122 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1657900 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 1657801  T
Q  220 gcatacaaacata 232  Q
    |||| ||||||||    
T  1657800 gcatccaaacata 1657788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650136
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  1650252 cataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 1650153  T
Q  213 aattcatgcatacaaac 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  1650152 aattcatgcatacaaac 1650136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862694
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataact 15862581  T
Q  122 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15862582 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 15862681  T
Q  220 gcatacaaacata 232  Q
    |||||||||||||    
T  15862682 gcatacaaacata 15862694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175787
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacata 25175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 27740838 - 27740941
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||   ||  | |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  27740838 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 27740937  T
Q  111 caac 114  Q
    ||||    
T  27740938 caac 27740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18381914 - 18381821
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
T  18381914 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27654011
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| | | |||||||||| | ||||| |    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||||||||||||||| ||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcata 27654011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 232
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751648
Alignment:
Q  189 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacata 27751648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22362014 - 22361926
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 98  Q
    |||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  22362014 catcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaat 22361926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25367438 - 25367374
Alignment:
Q  58 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  25367438 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 25367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36952
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||| | |||| ||||    
T  37076 caaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattat 36977  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36976 catcaattcatgcatacaaacatat 36952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48411
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  48287 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 48386  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  48387 catcaattcatgcatacaaacatat 48411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1348
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  1224 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 1323  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  1324 tatcaattcatgcatactaacatat 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3621
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 112  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||| ||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | |    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  113 actacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatta 210  Q
    || ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  3743 acaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3644  T
Q  211 tcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3643 tcaattcatgcatacaaacatat 3621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 107747 - 107971
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  107847 taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 107946  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  107947 catcaattcatgcatacaaacatat 107971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 64648 - 64585
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcataca 203  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  64648 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca 64585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13729
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13606 caacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 13705  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  13706 catcaattcatgcatacaaacata 13729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12337
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||  | |||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
      || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||    
T  12215 --acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattat 12312  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  12313 catcaattcatgcatacaaacatat 12337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41871
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| |||||||  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  41748 caacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacata 41871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172129
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||     
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  122 t-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  172016 tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 172115  T
Q  220 gcatacaaacatat 233  Q
     |||||||||||||    
T  172116 ccatacaaacatat 172129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177832
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||     
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  122 t-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  177719 tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 177818  T
Q  220 gcatacaaacatat 233  Q
     |||||||||||||    
T  177819 ccatacaaacatat 177832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 995
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | |||||  |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| | | |||||||    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt 1119  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  1118 -aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 1020  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  1019 catcaattcatgcatacaaacatat 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48822
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  48698 tagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 48797  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  48798 catcaattcatgcatacaaacatat 48822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 36225 - 36317
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  36225 gcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacata 36317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123203
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||     
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  123327 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 123228  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  123227 catcaattcatgcatacaaacatat 123203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9377
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||| |||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  9496 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 9397  T
Q  213 aattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9396 aattcatgcatacaaacata 9377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16275
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||| |||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  16394 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 16295  T
Q  213 aattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16294 aattcatgcatacaaacata 16275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272249
Alignment:
Q  17 caatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta 116  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  117 caacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaa 214  Q
    |||| | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||    
T  272131 caacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaa 272230  T
Q  215 ttcatgcatacaaacatat 233  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  272231 ttcattcatacaaacatat 272249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5100
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||| |     
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| | | | |||||||||| |||| ||||    
T  5224 taacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattat 5125  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||| ||||||||||||||    
T  5124 catcaattcacgcatacaaacatat 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9101
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  111 caactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  8978 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 9077  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  9078 catcgattcatgcatacaaacata 9101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3186
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgca-caagaatcatagctcaattcaa 113  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||||||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  114 ctacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 211  Q
    | ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
T  3066 caacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 3165  T
Q  212 caattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  3166 caattcatggatacaaacata 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6103
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | ||||   |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt 6227  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  6226 -aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 6128  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  6127 catcaattcatgcatacaaacatat 6103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34500
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgca-caagaatcatagctcaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||    
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  110 tcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    ||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  34624 tcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 34525  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  34524 tcatcaattcatgcatacaaacata 34500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247481
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  122 tgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  247594 tagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcat 247495  T
Q  220 gcatacaaacatat 233  Q
    ||||||||||||||    
T  247494 gcatacaaacatat 247481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128208
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 128332  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatccattt--gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |   ||| ||  |||||||||||| |||||  ||  | |||| |||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  128331 -aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 128233  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  128232 catcaattcatgcatacaaacatat 128208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31787 - 31703
Alignment:
Q  148 ttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  31787 ttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacata 31703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Original strand, 41733 - 41953
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| | |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  115 tacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| || || |||||| ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| |||    
T  41833 aacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatc 41932  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41933 aattcatgcatacaaacatat 41953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  |||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| |||||    |||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  5367 taacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  208 ttatcaattcatgca 222  Q
    | |||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 573
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||  |||||||||||| || |||     
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  697 taacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 598  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  597 catcaattcatgcatacaaacatat 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5752
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacata 5752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13353
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata 13353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26454
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||| |     
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| | | | ||||| |||| |||| ||||    
T  26578 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattat 26479  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
     ||||||||| ||||||||||||||    
T  26478 catcaattcacgcatacaaacatat 26454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8440 - 8220
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  8440 catcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 8341  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    ||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| || ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  8340 caac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattat 8244  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
     | |||||||||||||||||||||    
T  8243 caccaattcatgcatacaaacata 8220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 167 - 259
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  167 gcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacata 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9480
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||  | |||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttct-acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | ||| | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  3822 taacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 3921  T
Q  208 ttatcaattcatgca 222  Q
    | |||||||||||||    
T  3922 tcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43221
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacata 43221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51221
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatat 51221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14181 - 14089
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14181 gcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacata 14089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21233 - 21144
Alignment:
Q  143 caattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  21233 caatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacata 21144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 54416 - 54630
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||    
T  54416 catcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 54515  T
Q  111 caactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactt 206  Q
    |||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||    
T  54516 caacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaatt 54614  T
Q  207 attatcaattcatgca 222  Q
    || |||||||||||||    
T  54615 atcatcaattcatgca 54630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89493
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatat 233  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatat 89493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1332
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48603
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| | |||||||| || ||||||||||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 197477 - 197390
Alignment:
Q  35 acccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  197477 acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 197390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 104871 - 104793
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 88  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  104871 catcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 104793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 2471 - 2532
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 89  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2471 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 2548 - 2612
Alignment:
Q  35 acccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatc 99  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  2548 acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatc 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3262
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 65  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatc 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University