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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18192_low_5 (Length: 469)

Name: NF18192_low_5
Description: NF18192
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18192_low_5
NF18192_low_5
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (1-452)||(31961995-31962452)
chr5 (17-341)||(38932228-38932552)
chr5 (23-344)||(27892169-27892490)
chr5 (23-334)||(29323257-29323568)
chr5 (23-344)||(11266490-11266811)
chr5 (210-341)||(38932766-38932897)
chr5 (188-334)||(22113592-22113737)
chr5 (70-201)||(6678157-6678288)
chr5 (188-334)||(27524905-27525051)
chr5 (223-344)||(6678030-6678151)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (13-344)||(1258916-1259247)
chr2 (70-344)||(21965105-21965379)
chr2 (95-344)||(30276423-30276672)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (23-340)||(10754528-10754845)
chr3 (55-344)||(42458738-42459029)
chr3 (23-334)||(16664441-16664752)
chr3 (38-344)||(23603742-23604048)
chr3 (70-344)||(8595769-8596043)
chr3 (70-344)||(17153243-17153517)
chr3 (70-344)||(3515196-3515470)
chr3 (70-321)||(9819572-9819823)
chr3 (23-177)||(48548019-48548173)
chr3 (23-123)||(52196750-52196850)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (23-334)||(36951666-36951977)
chr4 (23-334)||(17468574-17468885)
chr4 (23-344)||(17826217-17826538)
chr4 (23-344)||(29122874-29123195)
chr4 (55-342)||(25135801-25136087)
chr4 (70-344)||(51873197-51873471)
chr4 (20-344)||(23157586-23157910)
chr4 (23-237)||(22341044-22341258)
chr4 (79-344)||(15648503-15648768)
chr4 (20-201)||(36278782-36278963)
chr4 (24-132)||(3621974-3622082)
chr4 (269-312)||(51738650-51738693)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (19-344)||(29532827-29533150)
chr8 (23-334)||(10801126-10801437)
chr8 (70-344)||(26077174-26077448)
chr8 (269-309)||(15223628-15223668)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (42-344)||(57837-58136)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (23-327)||(28604340-28604644)
chr6 (23-334)||(5390963-5391274)
chr6 (77-344)||(7217786-7218053)
chr6 (70-344)||(18294832-18295106)
chr6 (80-336)||(2894725-2894981)
chr6 (73-234)||(17228450-17228601)
chr6 (282-342)||(17228614-17228674)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (23-344)||(20704928-20705249)
chr7 (23-344)||(20872972-20873293)
chr7 (23-334)||(47553754-47554065)
chr7 (23-334)||(22865194-22865505)
chr7 (23-344)||(40891200-40891521)
chr7 (20-344)||(587246-587570)
chr7 (188-330)||(18814884-18815026)
chr7 (70-344)||(12122098-12122372)
chr7 (70-344)||(37075026-37075300)
chr7 (79-344)||(34982368-34982633)
chr7 (70-282)||(9402628-9402840)
chr7 (23-204)||(47549311-47549492)
chr7 (70-236)||(24820209-24820375)
chr7 (26-144)||(25056431-25056548)
chr7 (284-334)||(47549550-47549600)
chr7 (268-330)||(5778511-5778573)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (70-344)||(224162-224436)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (23-344)||(74763-75084)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (26-344)||(49370235-49370553)
chr1 (26-296)||(28520323-28520592)
chr1 (73-330)||(26996476-26996731)
chr1 (70-306)||(27030464-27030700)
chr1 (70-336)||(10004443-10004709)
chr1 (158-334)||(48710596-48710771)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (269-333)||(19944-20008)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 31962452 - 31961995
Alignment:
Q  1 caccgtggacattttgtaatctgacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31962452 caccgtggacattttgtaatctgacaactcaaatagcctagaaaaagacacagctaacggaacgtcatccaaccacgggtcctccaaaaacaaagtggtg 31962353  T
Q  101 ctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31962352 ctcccatctcctaccttctgaacaatattatccaacaaccacctagcatccaccaatcccacaccaaatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcg 31962253  T
Q  201 atcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctcca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  31962252 atcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatattccacaaactctccctctcctccaaccctctcca 31962153  T
Q  301 cacccatttccccaat-aaagaaatattaaattcccgcaaccttta---------tcaactcttgattttaaaatcactacatatatatataataacctg 390  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||    
T  31962152 cacccatttccccaataaaaaaaatattaaattcccgcaacctttataagataattcaactcttgattttaaaaacactac----atatataataacctg 31962057  T
Q  391 tttataggataacaactaatttatcaacaatctcctataaattcaaccactatatattagat 452  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31962056 tttataggataacaactagtttatcaactatctcctataaattcaaccactatatattagat 31961995  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Original strand, 38932228 - 38932552
Alignment:
Q  17 taatctgacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctacct 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||    | |||||| || ||||    
T  38932228 taatttgacaactcaaatagcctagaaaaagatacagctaacggaacattatccagccacggatcctcccaaaacagagtatgacacccatcacccacct 38932327  T
Q  117 tccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcact 216  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  38932328 tccgcacaatattgtccaacaaccacctagagtccaacaaccccacaccagatcgaatttggtttatgtgacgccaccaaagcgatcccaccccctcaca 38932427  T
Q  217 aaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaat 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  38932428 aaaccgcaccctccctccaacctcaccatacttcgcacgtaacaccacattccacaaactctccctatcctccatcaccctccacacccatttatccaat 38932527  T
Q  317 aaagaaatattaaattcccgcaacc 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  38932528 aaagaaatattaaattccctcaacc 38932552  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 27892169 - 27892490
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  27892169 gacaacgcaaaaagtctagaaaaagacacagctaacggaacatcaagcagccaaggatcctcccaaaacatggtggtgcacccatctccgaccttcctaa 27892268  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    | || ||||    ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  27892269 ctatgttatgaatcaaccacgtagcatctgccaaccccacacctgatctaatatggtttaaatgacgccaccaaatcgacccaactccctcacaaaaccg 27892368  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27892369 caccctccctccaacctctccgtacttcgcgcgcaacaccacattccacaaactctccctatcctccaacaccctccatacccatttccccaataaagaa 27892468  T
Q  323 atattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  27892469 atattgaattcccgcaaccttt 27892490  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Original strand, 29323257 - 29323568
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||   | ||||||||| |||||||| |    
T  29323257 gacaactcaaaaagcctaggaaaagacacagctaacggaacatcatccaaccacgtatcctcccaaaaaagagtgtgacacccatctcccaccttccgca 29323356  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29323357 caatattgtccaccaaccacctagaatccatcaaccccacacctgatcgaatttggtttatatgacgccaccaaatcgatcccaccccctcacaaaaccg 29323456  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||    || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29323457 caccctccctccaacctctccatacttcgcacttaacaccgccttccacagactctccccatcctccaacactctccacacccattttcccaataaagaa 29323556  T
Q  323 atattaaattcc 334  Q
    ||||||||||||    
T  29323557 atattaaattcc 29323568  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 11266490 - 11266811
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||   || ||| ||||| ||   |||||| ||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||  |    
T  11266490 gacaactcaaaaagtctagaaaaagatgtagctaaaggaacatctaacaaccaaggatcctcccaaaacatggtggtacgcccatctcctaccttcctca 11266589  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    | || |||||   ||||||| |||  |||||||  |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| | || || || || ||||||| ||||||    
T  11266590 ctatgttatcaaccaaccacgtagactccgccacccccacaccagctctaatttggtttaaatgacgccactagatagacccaactccctcacaaaaccg 11266689  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    ||||||||| |||| ||| || || || || || | ||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11266690 caccctcccaccaacctctccgtattttgcacgcaacaccacattccacaaactatccctatcctccaacaccctccaaacccattttcccaataaagaa 11266789  T
Q  323 atattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  11266790 atattaaattcccgtaaccttt 11266811  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 341
Target Start/End: Original strand, 38932766 - 38932897
Alignment:
Q  210 cctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccattt 309  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  38932766 cctcacaaaaccgcaccctctctccaacctcaccatacttcgcacgtaacaccacattccacaaactctccctatcctccatcacccttcacacccattt 38932865  T
Q  310 ccccaataaagaaatattaaattcccgcaacc 341  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38932866 atccaataaagaaatattaaattccctcaacc 38932897  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22113737 - 22113592
Alignment:
Q  188 cgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcct 287  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||   |||||||||||| ||||| |  || | ||| |||||||||||||||||||    
T  22113737 cgccaccaaaccgatcctactccctccctaaatcgaaccctgccccctc-ctcaccatactttgctcgcataacaacattccacaaactctccctctcct 22113639  T
Q  288 ccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcc 334  Q
    |||||| |||||||||||| || || || | ||||||||||||||||    
T  22113638 ccaacaacctccacacccacttacctaaaagagaaatattaaattcc 22113592  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6678288 - 6678157
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||   ||||||| | |  || ||||| |||||||||  |    
T  6678288 caaccaggaatcctcccaaaacatggtggtactcccatcgcctaccttcctgactatgttatcaaccaaccacgttgattctgccaaccccacaccaatt 6678189  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcga 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6678188 ctaatttgatttaactgacgccaccaaatcga 6678157  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 334
Target Start/End: Original strand, 27524905 - 27525051
Alignment:
Q  188 cgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcct 287  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||| ||||  |  || | ||| |||||||||||||||||||    
T  27524905 cgccaccaaaccgattatactccctccctaaaccgaaccctgcccccctcctcaccatactttgctcagataacaacattccacaaactctccctctcct 27525004  T
Q  288 ccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcc 334  Q
    ||| || |||||||||||| || || || | | ||||||||||||||    
T  27525005 ccagcaacctccacacccacttacctaaaagaaaaatattaaattcc 27525051  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6678151 - 6678030
Alignment:
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||| | ||| | ||| || | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||     
T  6678151 caccctccctccaaactcactgtatttcgctcgcaacaccacattccaaagactctccctatcctccaaaaccctccaaacccacttacctaataaagag 6678052  T
Q  323 atattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||| || |||| ||| ||||    
T  6678051 atattgaactccctcaatcttt 6678030  T

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Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 344
Target Start/End: Original strand, 1258916 - 1259247
Alignment:
Q  13 tttgtaatctgacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcct 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||     
T  1258916 tttgtaatttgacaactcaaatagcctagaaaaagacacaactaacgggacgtcatccaaccacggatcctcccaaaacaaagtgtgacacccatctccc 1259015  T
Q  113 accttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1259016 accttccgcacaatattgtccaacaaccacctagtatccgccaaccccacaccagatcaaatttggtttatgtgacgccaccaaatcgatcccaccccct 1259115  T
Q  213 cactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1259116 cactaaaccgcaccctccctccaacctctccatacttcgcacgaagcaccacattccacaaactctccctgtcctccaacatcctccacacccattttcc 1259215  T
Q  313 caataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1259216 caataaagaaatattaaatttccgcaaccttt 1259247  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Original strand, 21965105 - 21965379
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||   ||||||| | |  || | ||| |||||||||  |    
T  21965105 caaccagggatcctcccaaaacaaggtggtactcccatcacctaccttcctgactatgttatcaaccaaccacgttgattctggcaaccccacaccaatt 21965204  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||| | ||| | ||| |    
T  21965205 ctaatttgatttaactgacgccaccaaatcgacccaacaccctcacaaaatcgcaccctccctccaaactcaccgtatttcgctcgcaacaccacattcc 21965304  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    | | ||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21965305 aaagactctccctatcctccaaaatcctccatacccacttgcctaataaagaaatattgaattcccgcaatcttt 21965379  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 344
Target Start/End: Original strand, 30276423 - 30276672
Alignment:
Q  95 gtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccacc 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||   ||||||| |||  ||  |||| | |||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  30276423 gtggtactcccatcacctaccttcctgactatgttatcaaccaaccacgtagactcaaccaacctcacaccagctctaatttggtttaactgacgccacc 30276522  T
Q  195 aaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacac 294  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || | ||| | ||| || ||||| ||| | |||||||| ||    
T  30276523 aaatcgacccaacaccctcacaaaaccgcaccctccctccaaactcaccgtatttcgcacgcaacaccacattccataaactttccttatcctccaaaac 30276622  T
Q  295 cctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  30276623 cctccacacccactttcctaataaagacatattaaactcccgcaatcttt 30276672  T

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Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 10754528 - 10754845
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||    | |||||| || |||||||  |    
T  10754528 gacaactcataaagcctagaaaaagacacagctaacggaacgtcctccaaccaagggtcctcccaaaacaaagtatgacacccatcacccaccttcctca 10754627  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  10754628 caatattgtccaacaaccacctaggatccaccaaccccacaccggatcgaatttggtttatgtgacgccaccaaaccgatcccaccccctcacaaaaccg 10754727  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10754728 caccctccctccaacctctccatacttcgcacgaagcactacattccacaaactctccctatcctccaacaccctccacacccatttacccaataaagaa 10754827  T
Q  323 atattaaattcccgcaac 340  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10754828 atattaaattcccgcaac 10754845  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42459029 - 42458738
Alignment:
Q  55 taacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaa--gtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccg 152  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||   ||||||||||||| |||    
T  42459029 taacggaacatcaaacaaccacggatcctcccaaaacatatggtggtgctcccgtctcctaccttcataacaaagttatcaaccaaccacctagcacccg 42458930  T
Q  153 ccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgc 252  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  42458929 ccacacccacaccagatcgaatttggtttaaatgacgccaccaaatcgactcgacaccctcactaaaccgcaccctccctcctacctccccatactttgc 42458830  T
Q  253 tcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||| | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  42458829 tcgcaacaccacattccacaaactctccctctcctccaacaccctccacacctatttccccgataaagaggtattaaactccctcaaccttt 42458738  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Original strand, 16664441 - 16664752
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| | ||||   | ||||||||| |||||||| |    
T  16664441 gacaactcaaaaagcctaggaaaagacacatctaacggaacatcatccaaccatgtatcctcccaaaaaagagtgtgacacccatctcccaccttccgca 16664540  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  16664541 caatattgtccaccaaccacctagtatccatcaaccccacaccaaatcgaatttagtttatatggcgccaccaaatctatcccaccccgtcacaaaaccg 16664640  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | ||| |  || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16664641 caccctccctccaacctctccatacttcgcacttaacaccaccttccacagactctccccatcctccaacactctccacacccattttcccaataaagaa 16664740  T
Q  323 atattaaattcc 334  Q
    ||||||||||||    
T  16664741 atattaaattcc 16664752  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 344
Target Start/End: Original strand, 23603742 - 23604048
Alignment:
Q  38 ctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccaca 137  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||||||| | ||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||| | ||  || |||||   ||    
T  23603742 ctagaaaacgacactgctaacggaacatctaccaaccaagcatcctcccaaaacaaggtattactcccatctcctacctttctaaatatgttatcaacca 23603841  T
Q  138 accacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaat 237  Q
    ||||  |||  |||||||| |||||||||| || ||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23603842 accaagtaggctccgccaaccccacaccagctctaatatggttaaactgacgccaccaaatcgaccctactccctcaccaaaccgcaccctccctccaac 23603941  T
Q  238 ctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgc 337  Q
     || || || ||||| || | |||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23603942 ttctccgtatttcgcgcgcaacacctcattccacaaactctcccgctcctccaacaccctccacacccatttccctaataaagaaatattaaactcccgc 23604041  T
Q  338 aaccttt 344  Q
    |||||||    
T  23604042 aaccttt 23604048  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Original strand, 8595769 - 8596043
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||| ||| || |||||   ||||||  ||   |||||||  |||||||||| |    
T  8595769 caaccaagcatcctcccaaaacatggtagtactcccatctcctaccttcctaactatgttatcaaccaaccaagtattctccgccacacccacaccagct 8595868  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||  ||| ||| || || ||||| || | ||| | ||| |    
T  8595869 ctaatttggtttaactgacgccaccaaatcgacccaactccctcaccaaaccgcaccctcccatcaacctctccgtatttcgcgcgcaacaccacattcc 8595968  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  8595969 acaaactttccttctcctccaacaccctccacacccatttccctaataaagaaatattgaactcccgcagccttt 8596043  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17153517 - 17153243
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||   ||||||| | |  || ||||| |||||||||  |    
T  17153517 caaccaggaatcctcccaaaacatggtggtactcccatcacctaccttcctgactatgttatcaaccaaccacgttgactctgccaaccccacaccattt 17153418  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || || ||||| | ||| | ||| |    
T  17153417 ctaatttgatttaactgacgccaccatatcgacccaacaccctcacaaaagcgcaccctccctccaaactctccgtattttgctcgcaacaccacattcc 17153318  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||  || |||||||| ||||    
T  17153317 ataaactctccctatcctccaagaccctccacacccactttcctaataaagagatatcgaactcccgcaatcttt 17153243  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Original strand, 3515196 - 3515470
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||   | || |||||   ||||||| ||   || ||||| |||||||||| |    
T  3515196 caaccaagaatcctcccaaaacaaagtggtactcccatcacctactttcctgcctatgttatcaaccaaccacgtattctcagccaaccccacaccagct 3515295  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || ||||| | ||| |    
T  3515296 ctaatttggtttaactgacgccaccaaatcgacccaacaccctcacaaaaccgcaccctccctccaaactctccgtatttcgcacgcagcaccacattcc 3515395  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    | || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||| |||| ||||    
T  3515396 ataagctttccttatcctccaaaaccctccatacccacttgcctaataaagacatattgaactccagcaatcttt 3515470  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 321
Target Start/End: Original strand, 9819572 - 9819823
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||   ||||||| |||  ||  |||| |||||||||  |    
T  9819572 caaccaagaatcctcccaaaacaatgtggtactcccatcacctaccttcctgactatgttatcaaccaaccacgtagactcaaccaaccccacaccatct 9819671  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || || ||||| || | ||| |  || |    
T  9819672 ctaacttggtttaactgacaccaccaaatcgatccaacaccctcacaaaaccgcaccctccccccaaactctccgtatttcgcacgcaacaccacgttcc 9819771  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaaga 321  Q
    | |||||  |||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||    
T  9819772 ataaacttcccctatcctcgaaaaccctccacacccactttcctaataaaga 9819823  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 48548019 - 48548173
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||  || ||| ||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||| ||||||| ||    
T  48548019 gacaactcaaaaagtctagaaaaagacacagctaacgaaacatcagacatccaaggatcctcccaaaacatggtggtgtgcccatctccgaccttcctaa 48548118  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttg 177  Q
    | || |||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  48548119 ctatgttatcaatcaaccacgtagcatccgccaaccccacacctgatctaatttg 48548173  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 52196750 - 52196850
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| | ||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  52196750 gacaactcaaaaagcctaggaaaagacacagctaacggaacatcttccaaccacgtatcctcccaaaaaagagtgtgactcccatctcccaccttccgaa 52196849  T
Q  123 c 123  Q
    |    
T  52196850 c 52196850  T

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Target: chr4 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Original strand, 36951666 - 36951977
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||   | ||||||||| |||||||| |    
T  36951666 gacaactcaaaaagcctaggaaaagacacagctaacggaacatcatccaaccacgtatcctcccaaaaaagagtgtgacacccatctcccaccttccgca 36951765  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  36951766 caatattgtccaccaaccacctagaatccatcaaccccacacctgatcgaatttggtttaaatgacgccaccaaatcgatcccaccccctcataaaaccg 36951865  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |  | ||||   || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36951866 caccctcccaccaacctctccatacttcgcacttaacactgccttccacagactctccccatcctccaacactctccacacccattttcccaataaagaa 36951965  T
Q  323 atattaaattcc 334  Q
    ||||||||||||    
T  36951966 atattaaattcc 36951977  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17468885 - 17468574
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||   | ||||||||| |||||||| |    
T  17468885 gacaactcaaaaagcctagggaaagacacagctaacagaacatcatccaaccacggatcctcccaaaaaagagtgtgacacccatctcccaccttccgca 17468786  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| | ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17468785 caatattgtccaacaaccacctagtatccatcaaccccacatcggatcgaatttggtttatgtggcgccaccaaatcgatcccaccccctcacaaaaccg 17468686  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | ||| |  || |||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17468685 caccctccctccaacctctccatacttcgcacttaacaccaccttccacatactctccccttcctccatcactctccacacccattttcccaataaagaa 17468586  T
Q  323 atattaaattcc 334  Q
    ||||||||||||    
T  17468585 atattaaattcc 17468574  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17826538 - 17826217
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||| ||   |||||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  17826538 gacaactcaaaaagtctagaaaacgacacagctaacagaacatctaacaaccaaggatcctcccaaaacatggtagtgctcccatctcctaccttcctaa 17826439  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    | || |||||   ||||||  |||  |||||||| |||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  17826438 ctatgttatcaaccaaccatgtagtctccgccaaacccacaccaactctaatctggtttaactgacgccaccaaatcgacccaactccctcacaaaaccg 17826339  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    ||||||||||||||  || || || ||||| || | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17826338 caccctccctccaacttctccgtatttcgcgcgcaacaccacattccacaaactctccctctcctccaacaccctacacacccatttccctaataaagaa 17826239  T
Q  323 atattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  17826238 atattgaactcccgcaaccttt 17826217  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29123195 - 29122874
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||||||| | ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||  |    
T  29123195 gacaactcaaaaagtctagaaaacgacactgctaacggaacatctaccaaccaagcatcctcccaaaacaaggtattactcccatctcctaccttcctga 29123096  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    | || |||||   ||||||  |||  |||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  29123095 ctatgttatcaaccaaccaagtaggctccgccaaccccacaccagctctaatatggtttaactgacgccaccaaatcgaccctactccctcaccaaacag 29122996  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    ||| ||||||||||  || || || ||||| || | ||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29122995 cactctccctccaacttctccgtatttcgcacgcaacaccacattccacaaactcttccgctcctccaacaccctccacacccatttccctaataaagaa 29122896  T
Q  323 atattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  29122895 atattaaactcccgcaaccttt 29122874  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 342
Target Start/End: Original strand, 25135801 - 25136087
Alignment:
Q  55 taacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgcc 154  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||||| || |  || || ||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||  |    
T  25135801 taacgaaacatcatctagccacggatcctcccaaaatagagtggtacttctgtccccaaccttcctaacaatgttatcgaccaaccacctagcatccttc 25135900  T
Q  155 aatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctc 254  Q
    |  ||||| ||  ||||| || | ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |    
T  25135901 atccccacccccaatcgacttgg-tttaagtgacgccaccaaatagaaccaaccctctcgcaaaaccgcaccctccctccctcctctccatacttcgcac 25135999  T
Q  255 gaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaacct 342  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25136000 gaagcactaaactccacaaactctccctctcctccgacaccttccacacccatttccccattaaagaaatattaaactccctcaacct 25136087  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Original strand, 51873197 - 51873471
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  || || |||||   ||||||| |||  || ||||| |||||||||| |    
T  51873197 caaccaagaatcctcccaaaacaatgtggtactcccatcacctactttcctgactatgttatcaaccaaccacgtagactcagccaaccccacaccagct 51873296  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || | ||| | ||| |    
T  51873297 ctaatttggtttaactgacgccaccaaatcgacccaacaccttcacaaaaccgcaccctccctccaaactctccgtatttcgcacgcaacaccacattcc 51873396  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  51873397 ataaactttccctatcctccaaaaccctccacacccacttccctaataaagacatattgaactcccgcaatcttt 51873471  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23157910 - 23157586
Alignment:
Q  20 tctgacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttcc 119  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  | |||||| ||   |||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  23157910 tctgacaactcaaaaagtctagagaaagacactgccagcggaacatctaacaaccaagaatcctcctaaaacatggtggtactcccatctcctaccttcc 23157811  T
Q  120 gaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaa 219  Q
      || || |||||   ||||||| |||  || ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||||| |||    
T  23157810 tgactatgttatcaaccaaccacgtagactcagccaaccccacaccagctctaatttggtttaactgacgccaccaaatcaacccaacaccctcacaaaa 23157711  T
Q  220 ccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaa 319  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  || ||||  || | ||| | ||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  23157710 ccgcaccctccctccaaactctctgtatttcggacgcaacaccacattccataaactttccttatcctccaaaaccctccacacccactttcctaataaa 23157611  T
Q  320 gaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
     | ||||| || |||||||| ||||    
T  23157610 aacatattgaactcccgcaatcttt 23157586  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Original strand, 22341044 - 22341258
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| | ||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||    
T  22341044 gacaactcaaaaagtctagaaaacgacactgctaacggaacatctaacaaccaagcatcctcccaaaacaaggtattactcccatctcctaccttcctaa 22341143  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    | || |||||   ||||||  |||  |||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22341144 ctatgttatcaaccaaccaagtaggctccgccaaacccacaccagctctaatatggtttaactgacgccaccaaatcgaccctactccctcaccaaaccg 22341243  T
Q  223 caccctccctccaat 237  Q
    ||| |||||||||||    
T  22341244 cactctccctccaat 22341258  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15648768 - 15648503
Alignment:
Q  79 atcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttga 178  Q
    ||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  || | ||||||   ||||||| | |  || ||||| |||||||||   |  ||||||    
T  15648768 atcctcccaaaacatggtggtactcccatcacctaccttcctgactaaattatcaaccaaccacgtcgattcggccaaccccacaccactcctgatttga 15648669  T
Q  179 tttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactct 278  Q
    |||||||| |||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||| | ||| || | |||||    
T  15648668 tttaactgccgccaccaaatctacccaaccccctcacaaaatcgcaccctccctccaaactcaccatatttcgcacgcaacaccacattccaaagactct 15648569  T
Q  279 ccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    |||| |||||||| |||||||| | |||||| || || ||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  15648568 ccctatcctccaaaaccctccaaatccatttacctaacaaagaaatattgaactccctcaatcttt 15648503  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36278963 - 36278782
Alignment:
Q  20 tctgacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttcc 119  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  | |||||| |    |||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  36278963 tctgacaactcaaaaagtctagagaaagacactgccagcggaacatttaacaaccaagaatcctcctaaaacatggtggtactcccatctcctaccttcc 36278864  T
Q  120 gaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcga 201  Q
      || || |||||   ||||||| |||  || ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36278863 tgactatgttatcaaccaaccacgtagactcagccaaccccacaccagctctaatttggtttaactgacgccaccaaatcga 36278782  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Original strand, 3621974 - 3622082
Alignment:
Q  24 acaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaac 123  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  3621974 acaacgcaaaaagtctagaaaaagacacagctaacggaacatcaagcaaccaaggatcctcccaaaacatggtggtacacccatctccgaccttcctaac 3622073  T
Q  124 aatattatc 132  Q
    ||| |||||    
T  3622074 aatgttatc 3622082  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 51738693 - 51738650
Alignment:
Q  269 cacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccc 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  51738693 cacaaactctccctctcctccagcaccctccaaacccacttccc 51738650  T

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Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 29532827 - 29533150
Alignment:
Q  19 atctgacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||   || ||| ||||||||| ||||||  || |  |  |||||||||||||||    
T  29532827 atctgacaactcaaatagcctaggataagacacaactaacggaacatctaacagccatggatcctcccaaaacatggttgaacgaccatctcctaccttc 29532926  T
Q  119 cgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaa 218  Q
    | |||||| |||||   ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  29532927 ctaacaatgttatcaagcaacc-cctagcatccgcaaa-cccacaccagatcgaatttggtttaagtgacgccaccaaatcgatccgactccctcaccaa 29533024  T
Q  219 accgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataa 318  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  29533025 accgcaccctccctccaaccacaccgtacttcacttgaagcaccacattccacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaaaag 29533124  T
Q  319 agaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||    
T  29533125 agaaatgttaaactctcgcaatcttt 29533150  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10801437 - 10801126
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||    | |||||| || |||||||| |    
T  10801437 gacaactcaaagagcctaggaaaaaacacagctaacggaacatcatccaaccacgtatcctcccaaaaaagagtatgacacccatcgcccaccttccgca 10801338  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  10801337 caatattgtccaccaaccacctagaatccatcattcccacacctgaacgaatttggtttaaatgacgccaccaaatcgatccctccccctcacaaaaccg 10801238  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||    || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10801237 caccctccctccaacctctccatacttcgcacttaacaccgccttccacaaactctccccatcctccaacactctccacacccattttcccaataaagaa 10801138  T
Q  323 atattaaattcc 334  Q
    || |||||||||    
T  10801137 atgttaaattcc 10801126  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26077448 - 26077174
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||   | || |||||   ||||||| ||   || ||||| |||||||||| |    
T  26077448 caaccaaggatcctcccaaaacaaagtggtactcccatctcctactttcctgcctatgttatcaaccaaccacgtattctcagccaaccccacaccagct 26077349  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || | ||| | ||| |    
T  26077348 ctaatttggtttaactgacaccaccaaatcgacccaacaccctcacaaaaccgcaccctccctccaaactctccgtatttcgcacgcaacaccacattcc 26077249  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    | || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| || |||||||| ||||    
T  26077248 ataagctttccctatcctccaaaaccctccatacccacttgcctaatagagacatattgaactcccgcaatcttt 26077174  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15223668 - 15223628
Alignment:
Q  269 cacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccattt 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15223668 cacaaacgctccctctcctccaacaccctccaaacccattt 15223628  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 58136 - 57837
Alignment:
Q  42 aaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaacca 141  Q
    |||||||||||| ||||| |||   ||| | ||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||   ||||||    
T  58136 aaaaagacacagctaacgaaac---atctagccaaggatcctcccaaaacatggtggtgcgcccatctcataccttcctaactatgttatcaaccaacca 58040  T
Q  142 cctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctca 241  Q
    | |||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  58039 cgtagactccgccaaacccacaccagatctaatttggtttaaatgacgccaccaaatcgacccaactccctcacaaaaccgcaccctccctccaacctct 57940  T
Q  242 ccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaacc 341  Q
    || |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  57939 ccgtacttcgcgcgcagcactacattccacaaactctccctatcctccaacaccctccacacccatttccctaataaagaaatattgaactcccgcaacc 57840  T

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Target: chr6 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28604644 - 28604340
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||| | |||||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  28604644 gacaacgcaaaaagtctagaaaaagacacagttaacggaacatcaagcaaccaaggatcctcccaaaatatagtggtacacccatctccgaccttcctaa 28604545  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    |||| |||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||| |    
T  28604544 caatgttatcaatcaaccacgtagcatccgccaaccccacacctgatctaatatggtttaaatgacgccaccaaatcgacccaactccctcacaaaactg 28604445  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28604444 caccctccctccaatctctccgtacttcgcgcgtaacaccacattccacaaactctccctatcctccaacaccctccatacccatttccccaacaaagaa 28604345  T
Q  323 atatt 327  Q
    |||||    
T  28604344 atatt 28604340  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5391274 - 5390963
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || || |||||||||| ||||||| |||| | ||||   ||||||||||| |||||||| |    
T  5391274 gacaactcaaaaagcctaggaaaagacacagctaacgggacctcttccaaccacgcatcctcccaaaaaagagtgtgactcccatctcccaccttccgca 5391175  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||  ||| | |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5391174 caatattgtccaccaaccacctagaatccatcaacctcacacctgatcgaatttggtttatatgacgtcaccaaatcgatcccaccccctcacaaaaccg 5391075  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||| |  | |||    || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  5391074 caccttcccaccaacctcaccatacttcgcacttaacaccgccttccacagactctccccatcctccaacactctccacacccattttcccaataacgaa 5390975  T
Q  323 atattaaattcc 334  Q
    ||||||||||||    
T  5390974 atattaaattcc 5390963  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7218053 - 7217786
Alignment:
Q  77 ggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaattt 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||  |||||   ||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||    
T  7218053 ggatcctcccaaaacaaagtggcactcccatcgcctaccttcctaacaacgttatcaaccaaccacctagcatctgttacacccacaccagatcgaattt 7217954  T
Q  177 gatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaact 276  Q
    | ||||  |||||||||||||  || || || || ||||||||||||||||| || || | ||| |||||||| ||||| | ||| | ||| |||||| |    
T  7217953 ggtttagttgacgccaccaaactgacccaacaccatcactaaaccgcacccttccacctacctccccatacttagctcgcaacaccacattccacaaaat 7217854  T
Q  277 ctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  7217853 ctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaacaaagaagtattaaattccttcaaccttt 7217786  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18295106 - 18294832
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  || || |||||   ||||||  |||  || ||||| |||||||||| |    
T  18295106 caaccaagaatcctcccaaaacaatgtggtactcccatcacctactttcctgactatgttatcaaccaaccatgtagactcagccaaccccacaccagct 18295007  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||| ||||| || | ||| | ||| |    
T  18295006 ctaatttggtttaactgacgccgccaaatcgacccaacaccctcacaaaaccgcaccctccctccaaacacttcatatttcgcacgcaacaccacattcc 18294907  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  18294906 ataaactttccctatcctccaaaaccctccacacccaccttcctaataaagacatattgaactcccgcaatcttt 18294832  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 336
Target Start/End: Original strand, 2894725 - 2894981
Alignment:
Q  80 tcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgat 179  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||   | || |||||   ||||||| |||  ||  |||| |||||||||| || || ||| |    
T  2894725 tcctcccaaaacaaagtagtactcccatcacctaccttcctgcctatgttatcaaccaaccacgtagactcaaccaaccccacaccagctctaacttggt 2894824  T
Q  180 ttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || || || || || | ||| | ||| || ||||| ||    
T  2894825 ttaactgacgccaccaaatcgatccaacaccctcacaaaaccgcaccctccccccaaactctccgtatttagcacgcaacaccacattccataaactttc 2894924  T
Q  280 cctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccg 336  Q
    | | |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||| |||||    
T  2894925 cttatcctccaaaaccctccacacccactttcctaataaagacaaattaaactcccg 2894981  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Original strand, 17228450 - 17228601
Alignment:
Q  73 ccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcga 172  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||| || ||||||| ||||||||| ||   |||||||||   ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  17228450 ccacggatcctcccaaaacatagtggttcgcccatcccccaccttcctaacaatattgtcaaccaaccacct---atctgccaaccccaccccagatcga 17228546  T
Q  173 atttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctcc 234  Q
    ||||| || |  |  |||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17228547 atttggttaatgttgcgccaccaaatcg-------cccctcacaaaaccgcaccctccctcc 17228601  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Original strand, 17228614 - 17228674
Alignment:
Q  282 tctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaacct 342  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  17228614 tctcgtccaacaccctccaaacccatttccctaacaaagaaatattaaactccctcaacct 17228674  T

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Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20705249 - 20704928
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||   || || | ||||||||| ||||||| ||    
T  20705249 gacaacccaaaaagtctagaaaaagacactgctaacggaacatcaagcaaccaaggatcctcccaaaacgtggttgtacacccatctccaaccttcctaa 20705150  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||     
T  20705149 caatattatccaacaaccaagtagcatccaccaaccccacacctgatcgaatatggtttaaatgacgccaccatatcgacccgactccctcacaaaacca 20705050  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20705049 caccctccctccaacctctccgtacttcgcgcgtaacacgacattccacaaactctccctatcctccaacaccctccacacccatttccccaacaaagaa 20704950  T
Q  323 atattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||| || |||  ||||||||    
T  20704949 atattgaactccttcaaccttt 20704928  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20873293 - 20872972
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||   || || | ||||||||| ||||||| ||    
T  20873293 gacaacccaaaaagtctagaaaaagacactgctaacggaacatcaagcaaccaaggatcctcccaaaacgtggttgtacacccatctccaaccttcctaa 20873194  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||     
T  20873193 caatattatccaacaaccaagtagcatccaccaaccccacacctgatcgaatatggtttaaatgacgccaccatatcgacccgactccctcacaaaacca 20873094  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20873093 caccctccctccaacctctccgtacttcgcgcgtaacacgacattccacaaactctccctatcctccaacaccctccacacccatttccccaacaaagaa 20872994  T
Q  323 atattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||| || |||  ||||||||    
T  20872993 atattgaactccttcaaccttt 20872972  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Original strand, 47553754 - 47554065
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||    | |||||| || |||||||| |    
T  47553754 gacaactcaaagagcctaggaaaaaacacagctaacggaacatcatccaaccacgtatcctcccaaaaaagagtatgacacccatcgcccaccttccgca 47553853  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  47553854 caatattgtccaccaaccacctagaatccatcattcccacacctgaacgaatttggtttaaatgacgccaccaaatcgatccctccccctcacaaaaccg 47553953  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||    || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47553954 caccctccctccaacctctccatacttcgcacttaacaccgccttccacaaactctccccatcctccaacactctccacacccattttcccaataaagaa 47554053  T
Q  323 atattaaattcc 334  Q
    || |||||||||    
T  47554054 atgttaaattcc 47554065  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22865505 - 22865194
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||   | ||||||||| |||||||| |    
T  22865505 gacaactcaaaaagcctaggaaaagacacagctaacggaacatcatccaaccacgtatcctcccaaaaaagagtgtgacacccatctcccaccttccgca 22865406  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
     |||||| |||  ||||||||||| ||||  ||  ||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  22865405 taatattgtccaccaaccacctagaatccaacagccccacacctaatcgaatttggtttatatgacgccaccaaaccgatcccaccccctcacaaaaccg 22865306  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||    | |||    || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22865305 caccctccctccaacctctccatacttcgcagttaacaccgccttccacagactctccccatcctccaacactctccacacccattttcccaataaagaa 22865206  T
Q  323 atattaaattcc 334  Q
    ||||||||||||    
T  22865205 atattaaattcc 22865194  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40891521 - 40891200
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||| ||   |||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||| ||||||| | ||    
T  40891521 gacaactcaaaaagtctagaaaaagacactgccaacggaacatctaacaaccaaggatcctcccaaaacatggtggtactctcatcttctacctttctaa 40891422  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    | || |||||   ||||||| |||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || || || ||||||| ||| ||    
T  40891421 ctatgttatcaaccaaccacgtagtctctgccaaccccacaccagatctaatttgatttaaatgactccaccaaattgacccaactccctcacaaaagcg 40891322  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||| || | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40891321 caccctccctccaacctctccgtatttcgcgcgcaacactacattccacaaactctccctatcctccaacaccctccacacccattttcccaacaaagaa 40891222  T
Q  323 atattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||| || |||||||| ||||    
T  40891221 atattgaactcccgcaatcttt 40891200  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Original strand, 587246 - 587570
Alignment:
Q  20 tctgacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttcc 119  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||     | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  587246 tctgccaactcaaaaagtctagaaaaagacactgccaacggaacgtttaaaagccaaggatcctcccaaaacaaggtggtactcccatctccgaccttcc 587345  T
Q  120 gaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaa 219  Q
     ||| || |||||   |||||||  |   ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||  |||    
T  587346 taactatgttatcaaccaaccacgcattctccgctaaacccacaccacatctaatttgatttaactgacgccaccaaatcggcccaacaccctcagaaaa 587445  T
Q  220 ccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaa 319  Q
      ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |  | ||| | ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  587446 ttgcaccctccctccgacctctccatatttcgcacacaacaccacattccacaggctctccctatcctccaacaccctccacacccatttacctaataaa 587545  T
Q  320 gaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  587546 gaaatattaaactcccgcaatcttt 587570  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18815026 - 18814884
Alignment:
Q  188 cgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcct 287  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  18815026 cgccaccaaatcgagcagaccccctcagcaaaccgcaccctccctccctcctcaccatacttcgcccgaagcactaaactccacaaactctccttctcct 18814927  T
Q  288 ccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaa 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18814926 ccaacaccctccacactcatttccccattaaagaaatattaaa 18814884  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Original strand, 12122098 - 12122372
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  || || |||||   ||||||| |||  || ||||| |||||||||| |    
T  12122098 caaccaagaatcctcccaaaacaatgtggtactcccatcccctactttcctgactatgttatcaaccaaccacgtagactcagccaaccccacaccagct 12122197  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||  | | ||| | ||| |    
T  12122198 ctaatttggtttaactgacgccaccaaatcgacccaacaccctcacaaaaccgcaccctccctccaaactctccgtatttcgcatgcaacaccacattcc 12122297  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||| |||| ||||    
T  12122298 ataaactttccctatcctccaaaaccctccacacccactttcctaataaagacatattgaactcctgcaatcttt 12122372  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37075300 - 37075026
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||   ||||||| | |  || ||||| |||||||||  |    
T  37075300 caaccaggaatcctcccaaaacatggtggtactcccatcgcctaccttcctgactatgttatcaaccaaccacgttgattctgccaaccccacaccaatt 37075201  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||| | ||| || || |    
T  37075200 ctaatttgatttaactgacgccaccaaatcgacccaacaccctcacaaaatcgcaccctccctccaaactcaccgtatttcgctcgcaacaccatgttcc 37075101  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    | | ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||  ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  37075100 aaagactctccctatcctccaaaacccgccaaacccacttacctgataaagagatattgaactccctcaatcttt 37075026  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 344
Target Start/End: Original strand, 34982368 - 34982633
Alignment:
Q  79 atcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttga 178  Q
    ||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  || | ||||||   ||||||| | |  || ||||| |||||||||   |  ||||||    
T  34982368 atcctcccaaaacatggtggtactcccatcacctaccttcctgactaaattatcaaccaaccacgtcgattcggccaaccccacaccactcctgatttga 34982467  T
Q  179 tttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactct 278  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||| | ||| || | |||||    
T  34982468 tttaactgccgccaccaaatcgacccaaccccctcacaaaatcgcaccctccctccaaactcaccatatttcgcacgcaacaccacattccaaagactct 34982567  T
Q  279 ccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||| || || || ||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  34982568 ccctatcctccaaaaccctccaaatccagttacctaacaaagaaatattgaactccctcaatcttt 34982633  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9402840 - 9402628
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||   ||||||| | |  || ||||| |||||||||  |    
T  9402840 caaccaggaatcctcccaaaacatggtggtactcccatcacctaccttcctgactatgttatcaaccaaccacgttgattctgccaaccccacaccaatt 9402741  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||| | ||| | ||| |    
T  9402740 ctaatttgatttaactgacgccaccaaatcgacccaacaccctcacaaaatcgcaccctccctccaaactcaccgtatttcgctcgcaacaccacattcc 9402641  T
Q  270 acaaactctccct 282  Q
    | |||||||||||    
T  9402640 ataaactctccct 9402628  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 47549311 - 47549492
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||    | |||||| || | |||||| |    
T  47549311 gacaactcgaagagcctaggaaaagacacaactaacggaacatcatccaaccacgtatcctcccaaaaaagagtatgacacccatcgcccatcttccgca 47549410  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcc 204  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  47549411 caatattgtccaccaaccacctagaatccaacattcccacacctgaacgaatttggtttaaatgacgccaccaaatcgatcc 47549492  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 24820209 - 24820375
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||    |||||| |||  ||  |||| |||||||||| |    
T  24820209 caaccaagaatcctcccaaaacaatgtggtactcccatcacctaccttcctgactatgttatcaactaaccacgtagactcaaccaaccccacaccagct 24820308  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaa 236  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24820309 ctaacttggtttaactgacgccaccaaatcgatccaacaccctcacaaaaccgcaccctccccccaa 24820375  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25056548 - 25056431
Alignment:
Q  26 aactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaa 125  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||   | ||||| || ||||||| || ||    
T  25056548 aactcaaacagcctacaaaaagacctagctaaaggaacgtcatcaagccacggatcctcccaaaataaagtggactttccatc-ccaaccttcctaataa 25056450  T
Q  126 tattatcccacaaccacct 144  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  25056449 tattatcctccaaccacct 25056431  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 334
Target Start/End: Original strand, 47549550 - 47549600
Alignment:
Q  284 tcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcc 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  47549550 tcctccaacactctccacacccattttcccaataaagaaatgttagattcc 47549600  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5778573 - 5778511
Alignment:
Q  268 tcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaa 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | |||||||| | ||||||    
T  5778573 tcacaaactctccctctcctccaacactctcgagacccatttatctaataaagataaattaaa 5778511  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 224436 - 224162
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||  |||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  224436 caaccaaggatcctcccaaaaaaaagtggtactcccatcgcctaccttccttacaacgttatcaaccaaccacctagcatccgttactcccacaccagat 224337  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| | | ||| | ||| |    
T  224336 cgaatttggtttagttgacgccaccaaattgacccaacaccatcactaaaccgcaccctccctcctacctccctatacttagcttgcaacaccacattcc 224237  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  224236 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaacaaagatgtattaaattccctcaaccttt 224162  T

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Target: scaffold0041 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 74763 - 75084
Alignment:
Q  23 gacaactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||| ||   |||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||| ||||||| | ||    
T  74763 gacaactcaaaaagtctagaaaaagacactgccaacggaacatctaacaaccaaggatcctcccaaaacatggtggtactctcatcttctacctttctaa 74862  T
Q  123 caatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccg 222  Q
    | || |||||   ||||||| |||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || || || ||||||| ||| ||    
T  74863 ctatgttatcaaccaaccacgtagtctctgccaaccccacaccagatctaatttgatttaaatgactccaccaaattgacccaactccctcacaaaagcg 74962  T
Q  223 caccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||| || | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  74963 caccctccctccaacctctccgtatttcgcgcgcaacactacattccacaaactctccctatcctccaacaccctccacacccattttcccaacaaagaa 75062  T
Q  323 atattaaattcccgcaaccttt 344  Q
    ||||| || |||||||| ||||    
T  75063 atattgaactcccgcaatcttt 75084  T

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Target: chr1 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 344
Target Start/End: Original strand, 49370235 - 49370553
Alignment:
Q  26 aactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaa 125  Q
    |||||||| || |||||||| ||| | | ||||||||| ||   |||||| | ||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  49370235 aactcaaaaagtctagaaaacgacgctgctaacggaacatctaacaaccaagcatccttccaaaacatagtagtactcccatctcctaccttcctaacta 49370334  T
Q  126 tattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcac 225  Q
    | |||||   ||||||  ||   |||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  49370335 tgttatcaaccaaccaagtattctccgccaaacccacaccagctctaatttggcttaactgacgccatcaaatcgacccaactccctcaccaaaccgcac 49370434  T
Q  226 cctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaata 325  Q
    |||||| ||||  || || || |||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  49370435 cctcccaccaacttctccgtatttcgctcgcagcaccacattccacaaactttccttctcctccaacaccctccacactcatttccctaataaagaaata 49370534  T
Q  326 ttaaattcccgcaaccttt 344  Q
    || || |||||||||||||    
T  49370535 ttgaactcccgcaaccttt 49370553  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28520592 - 28520323
Alignment:
Q  26 aactcaaatagcctagaaaaagacacagataacggaacgtcatccaaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaa 125  Q
    |||||||||||||||| | |||||   | ||||||||  ||||| | |||| |||||||  ||||||  ||||| | |||||| || ||||||| |||||    
T  28520592 aactcaaatagcctagcataagacgttgctaacggaaaatcatctagccacagatcctctcaaaacagtgtggtccacccatcccccaccttcctaacaa 28520493  T
Q  126 tattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaa-ccgca 224  Q
    |||| ||   ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  28520492 tattgtctaccaaccacctagcatccgccatccccacccc-gatcgaatttggtttaagttacgccaccaaatcgatccaacccc-tcacaaaaaccgca 28520395  T
Q  225 ccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccc 296  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28520394 ccctccctccctcctccccatacttcgctcgaagcactaaatttcacaaactctccctctcctccaacaccc 28520323  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 330
Target Start/End: Original strand, 26996476 - 26996731
Alignment:
Q  73 ccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagatcga 172  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| || |||| || |||||| |||||  | |||||   ||| ||  ||||||| |||||   |||     
T  26996476 ccacggatccacccaaaacaaagttgtgctaccatccccgacctgcctaacaatgttatcaaataaccatgaagcgtctaccaatccaacacctactcgg 26996575  T
Q  173 atttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttcaca 272  Q
    ||||| ||||   | |||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||| ||   | |||||||||| ||  ||||||||| | | ||||    
T  26996576 atttggtttagaagtcgccaccaaatcgacccaaccccctcggaaaaccgcaccctcccaccctccccaccatactttgcctgaagcactaaactccaca 26996675  T
Q  273 aactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaa 330  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  26996676 aattctccctctcctccaacaccctccacaccca--tccccattaaagagatattaaa 26996731  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 306
Target Start/End: Original strand, 27030464 - 27030700
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||   ||||||| |||  ||  |||| |||||||||| |    
T  27030464 caaccaagaatcctcccaaaacaatgtggtactcccatcacctaccttcctgactatgttatcaaccaaccacgtagactcaaccaaccccacaccagct 27030563  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | || ||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| || | ||| || || ||||| || | ||| |  || |    
T  27030564 ctaacttggtttaactgacgccaccaaatcgaaccaacaccctcacaaaaccacaccctcccccccaactctccgtatttcgcacgcaacaccacgttcc 27030663  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacaccca 306  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27030664 ataaactttccctatcctccaaaaccctccacaccca 27030700  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 336
Target Start/End: Original strand, 10004443 - 10004709
Alignment:
Q  70 caaccacggatcctccaaaaacaaagtggtgctcccatctcctaccttccgaacaatattatcccacaaccacctagcatccgccaatcccacaccagat 169  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || |||||   ||||||  |||  ||  |||| |||||||||| |    
T  10004443 caaccaagaatcctcccaaaacaatgtggtacacccatcacctaccttcctgactatgttatcaaccaaccatgtagactcaaccaaccccacaccagct 10004542  T
Q  170 cgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaagcactatatttc 269  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || || || || || | ||| |  || |    
T  10004543 ctaacctgatttaactgacgccaccaaatcgatccaataccctcacaaaaccgcaccctccccccaacctctccgtattttgcacgcaacaccacgttcc 10004642  T
Q  270 acaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcccg 336  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || | |||||| | ||| ||||||||    
T  10004643 ataaactttccctatcctccaaaaccctccacacccactttcctagtaaagacaaattgaattcccg 10004709  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 334
Target Start/End: Original strand, 48710596 - 48710771
Alignment:
Q  158 cccacaccagatcgaatttgatttaactgacgccaccaaatcgatcctaccccctcactaaaccgcaccctccctccaatctcaccatacttcgctcgaa 257  Q
    |||||||| || || ||||| ||||  | ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||| |||||||    
T  48710596 cccacacccgaccggatttggtttaggttacgccaccaaaccgatccaactccctccctaaaccgaaccctgccccctc-ctcaccatactttgctcgaa 48710694  T
Q  258 gcactatatttcacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattcc 334  Q
      || | ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || | ||||||||||||||||    
T  48710695 taacaacattccacaaactctccctctcctccaataacctccacacccacttacctaaaagagaaatattaaattcc 48710771  T

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Target: scaffold0250 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 333
Target Start/End: Original strand, 19944 - 20008
Alignment:
Q  269 cacaaactctccctctcctccaacaccctccacacccatttccccaataaagaaatattaaattc 333  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| | |||||| | |||||||||    
T  19944 cacagactctccctctcctccagaaccctccaaatccatttcccaagtaaagataaattaaattc 20008  T

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