View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18194_high_8 (Length: 257)

Name: NF18194_high_8
Description: NF18194
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18194_high_8
NF18194_high_8
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (1-245)||(22192121-22192365)
chr7 (1-245)||(22657588-22657832)
chr7 (1-245)||(26813049-26813293)
chr7 (1-245)||(36519420-36519664)
chr7 (1-245)||(32129158-32129402)
chr7 (1-245)||(40301403-40301647)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (1-245)||(35100345-35100589)
chr8 (1-245)||(30531461-30531705)
chr8 (1-245)||(38205907-38206151)
chr8 (1-245)||(1957134-1957378)
chr8 (1-245)||(17742617-17742860)
chr8 (1-245)||(13815849-13816093)
chr8 (1-245)||(15054547-15054791)
chr8 (1-145)||(5213193-5213337)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (1-245)||(6379414-6379658)
chr6 (1-245)||(632428-632672)
chr6 (1-245)||(17960175-17960419)
chr6 (1-245)||(24932175-24932419)
chr6 (1-245)||(34839496-34839739)
chr6 (1-245)||(8219857-8220102)
chr6 (1-234)||(7539890-7540122)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (1-245)||(31012771-31013015)
chr5 (1-245)||(32975481-32975725)
chr5 (1-245)||(40889811-40890055)
chr5 (1-239)||(4577907-4578145)
chr5 (1-245)||(27943407-27943650)
chr5 (107-245)||(29618513-29618650)
chr5 (132-245)||(9274185-9274298)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (1-245)||(2214200-2214444)
chr4 (1-245)||(46916427-46916671)
chr4 (1-245)||(3532220-3532464)
chr4 (1-245)||(3617365-3617609)
chr4 (1-245)||(8992700-8992944)
chr4 (1-245)||(13111478-13111722)
chr4 (1-245)||(16173931-16174175)
chr4 (7-245)||(53183022-53183260)
chr4 (1-245)||(28445885-28446130)
chr4 (3-245)||(34437055-34437294)
chr4 (1-245)||(28900246-28900489)
chr4 (1-241)||(33605047-33605287)
chr4 (1-107)||(36657418-36657524)
chr4 (1-93)||(12159037-12159129)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (1-245)||(17467428-17467672)
chr3 (1-245)||(25789692-25789936)
chr3 (1-245)||(25831649-25831893)
chr3 (1-245)||(47145079-47145323)
chr3 (1-245)||(33749594-33749838)
chr3 (1-245)||(30417341-30417585)
chr3 (1-245)||(42561815-42562059)
chr3 (1-239)||(42600436-42600674)
chr3 (1-245)||(6047607-6047851)
chr3 (1-245)||(51428004-51428248)
chr3 (1-245)||(30691189-30691434)
chr3 (1-245)||(50017905-50018147)
chr3 (1-245)||(21226201-21226445)
chr3 (1-250)||(21231326-21231571)
chr3 (132-245)||(33189757-33189870)
chr3 (1-93)||(43474802-43474894)
chr3 (1-100)||(49027655-49027754)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (1-245)||(31469039-31469283)
chr1 (1-245)||(17784275-17784519)
chr1 (1-245)||(2477240-2477484)
chr1 (1-245)||(45240052-45240296)
chr1 (1-245)||(48387019-48387263)
chr1 (1-245)||(48405242-48405486)
chr1 (1-245)||(33165283-33165526)
chr1 (1-245)||(51521106-51521349)
chr1 (1-245)||(47299412-47299657)
chr1 (1-245)||(17680177-17680421)
chr1 (1-245)||(8469233-8469476)
chr1 (1-132)||(10265986-10266117)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (1-245)||(12855931-12856175)
chr2 (1-245)||(8852969-8853213)
chr2 (1-245)||(7587414-7587658)
chr2 (1-245)||(30821494-30821738)
chr2 (1-245)||(22350525-22350769)
chr2 (1-245)||(31206822-31207064)
chr2 (1-245)||(2779713-2779957)
chr2 (1-245)||(40880650-40880899)
chr2 (1-245)||(39432910-39433152)
[»] scaffold1240 (1 HSPs)
scaffold1240 (1-245)||(1684-1928)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-245)||(29460-29705)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-188)||(169499-169686)
scaffold0007 (184-245)||(168154-168215)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22192121 - 22192365
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22192121 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 22192220  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22192221 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 22192320  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22192321 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 22192365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22657588 - 22657832
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22657588 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 22657687  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22657688 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 22657787  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22657788 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 22657832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26813049 - 26813293
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26813049 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttgtatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 26813148  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26813149 cttcaagaataactggtgtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatcctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 26813248  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26813249 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 26813293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 36519420 - 36519664
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36519420 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 36519519  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36519520 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatatttccactcccagtgcatgcagtcaatact 36519619  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36519620 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 36519664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32129402 - 32129158
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32129402 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacattcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 32129303  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32129302 cttcaagaataactgttgtggttcccttatccccccaggtgaattgacattcccatcctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 32129203  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32129202 cccgatcatccctaggaacccctgcatttcactaacatgtagtat 32129158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40301647 - 40301403
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40301647 tcatcaaacatcggtgacgggtctagaacattgatatcattcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 40301548  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40301547 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 40301448  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40301447 ctcgatcatccctgagaacccccacatttcactaacatgtggtat 40301403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 35100345 - 35100589
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35100345 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 35100444  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35100445 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 35100544  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35100545 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 35100589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30531705 - 30531461
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30531705 tcatcaaacactggtgactggtctagaacgtttatatcgttcaacattcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactg 30531606  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30531605 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggataatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 30531506  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30531505 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 30531461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38206151 - 38205907
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38206151 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactg 38206052  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38206051 cttcaagaataactgttgtggttcccttatcccccctgttgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 38205952  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38205951 ccggatcatccctggaaacccccgcatttcactaacatgtagtat 38205907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1957378 - 1957134
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1957378 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 1957279  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1957278 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 1957179  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1957178 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 1957134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 17742617 - 17742860
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17742617 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcattcaacattcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 17742716  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17742717 cttcaagaataattgtggtggttcccttat-ccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggaaaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 17742815  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17742816 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 17742860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 13815849 - 13816093
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13815849 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaatgcatgctagatccatagatcatgagatgcaactg 13815948  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13815949 cttccagaataactgtggtggttcccttatcccccttggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 13816048  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13816049 gccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 13816093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 15054547 - 15054791
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15054547 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactg 15054646  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15054647 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccttggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcaatcaatact 15054746  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15054747 cccgatcatccctgggaacccctgcatttcactaacatgtagtat 15054791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 5213193 - 5213337
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5213193 tcatcaaacactgatgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacattcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagacgcaactg 5213292  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaatt 145  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5213293 cttccagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaatt 5213337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6379658 - 6379414
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6379658 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 6379559  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6379558 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 6379459  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6379458 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 6379414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 632428 - 632672
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  632428 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 632527  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  632528 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctgatgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 632627  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  632628 cccgatcatccctgggaaccctcgcatttcactaacatgtagtat 632672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17960419 - 17960175
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17960419 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 17960320  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17960319 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 17960220  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960219 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 17960175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24932419 - 24932175
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24932419 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgctagatccatagatcatgagatgcaactg 24932320  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24932319 cttcaagaataactgttgtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatcctttaggacaatttttccactcccaatgcatgcagtcaatact 24932220  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24932219 cccgatcatccctgggaatccccgcatttcactaacatgtagtat 24932175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 34839496 - 34839739
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  34839496 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaact- 34839594  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34839595 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 34839694  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34839695 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 34839739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8219857 - 8220102
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8219857 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaagcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactg 8219956  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatccccc-ctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatac 199  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  8219957 cttcaagaataactgaggtggttcccttatccccctctggtaaattgaccttcccatgttttaggacaatttttccactcccaatgcatgcaatcaatac 8220056  T
Q  200 tcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8220057 tcccgatcatccttaggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 8220102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 7539890 - 7540122
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7539890 tcattaaacactggtgactggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatctaaaaaaggcatgccagatctatagatcatgagatgcaactg 7539989  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||  | |||||| ||| ||||||    
T  7539990 cttcaagaataaccgtggtggttccctta-cccccctattaaattgaccttcccatgctttaggacaaattttccactcacaatgcatgtagttaatact 7540088  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcacta 234  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7540089 cccgatcatccctgggaatccccgcatttcacta 7540122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31013015 - 31012771
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31013015 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 31012916  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31012915 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 31012816  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012815 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 31012771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32975725 - 32975481
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32975725 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 32975626  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32975625 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 32975526  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32975525 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 32975481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 40889811 - 40890055
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40889811 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 40889910  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40889911 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 40890010  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40890011 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 40890055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 4577907 - 4578145
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4577907 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 4578006  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4578007 cttctagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 4578106  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatg 239  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4578107 gccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatg 4578145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27943407 - 27943650
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27943407 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 27943506  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27943507 cttcaagaataactgtggtggttcccttat-ccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 27943605  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27943606 cccgatcatccctgggaacccctgcatttcactaacatgtagtat 27943650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29618650 - 29618513
Alignment:
Q  107 gaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatactcccgat 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29618650 gaataactgtggtggttcccttatccccc-tggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatactcccgat 29618552  T
Q  207 catccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29618551 cattcctgggaacccccacatttcactaacatgtagtat 29618513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9274298 - 9274185
Alignment:
Q  132 ccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgagaacccccgcatttca 231  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9274298 ccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactcctgatcatccctgggaacccccgcatttca 9274199  T
Q  232 ctaacatgtagtat 245  Q
    ||||||||||||||    
T  9274198 ctaacatgtagtat 9274185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2214444 - 2214200
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2214444 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 2214345  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2214344 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 2214245  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214244 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 2214200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46916671 - 46916427
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  46916671 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagaggcaactg 46916572  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46916571 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 46916472  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46916471 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 46916427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3532464 - 3532220
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3532464 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 3532365  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3532364 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 3532265  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532264 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 3532220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3617609 - 3617365
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3617609 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 3617510  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3617509 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 3617410  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617409 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 3617365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8992700 - 8992944
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8992700 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 8992799  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8992800 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 8992899  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8992900 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 8992944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 13111478 - 13111722
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13111478 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 13111577  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13111578 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 13111677  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111678 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 13111722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16174175 - 16173931
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16174175 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 16174076  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16174075 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 16173976  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16173975 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 16173931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53183260 - 53183022
Alignment:
Q  7 aacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactgcttcaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  53183260 aacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactgcttcca 53183161  T
Q  107 gaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatactcccgat 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  53183160 gaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatactgccgat 53183061  T
Q  207 catccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53183060 catccctgggaacccccgcatttcactaacatgcagtat 53183022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28445885 - 28446130
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28445885 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgtttccggacatccaaaaaaggcatgctagatccatagatcatgagatgcaattg 28445984  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttat-cccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatac 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28445985 cttcaagaataattgtagtggttcccttatccccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatac 28446084  T
Q  200 tcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28446085 tcccgatcattcatgggaacccgcgcatttcactaacatgtagtat 28446130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34437294 - 34437055
Alignment:
Q  3 atcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34437294 atcaaacactggtgaccggtctagaacatttatatcgttcaacattcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactact 34437195  T
Q  103 tcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatactcc 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  34437194 tcaagaataactgtggtggttcccttatctcccctggtgaattgaccttcacatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaata---c 34437098  T
Q  203 cgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||  |||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  34437097 cgatcatccctcggaactcttgcatttcacttacatgtagtat 34437055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28900246 - 28900489
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaa-ggcatgtcagatccatagatcatgagatacaact 99  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28900246 tcatcaaacaccagtgaccggtctagcacgttgatatctttcaacgttcctggacatccaaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaact 28900345  T
Q  100 gcttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatac 199  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28900346 gcttcaagaataactgtggttgttcccttatcccc--tggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactctcagtgcatgcagtcaatac 28900443  T
Q  200 tcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28900444 tcccgatcatccctaggaacccctgcatttcactaacatgtagtat 28900489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 33605047 - 33605287
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  33605047 tcatcaaagactcgtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaactttcctggacatccaaaaaaggcatgtcaaatccatagatcatgagatgcaactt 33605146  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| | || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33605147 ctttaagaataactgttgtgtttcccttatcccccccggtgaattgaccttcacatgctgtaggataatttttccacttccagtgcatgcagtcaatact 33605246  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgta 241  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33605247 cccgatcatccctgggaacccccacatttcactaacatgta 33605287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 36657418 - 36657524
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  36657418 tcatcaaacactggtgaccgatctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccaaatccatagatcatgagatgcaactg 36657517  T
Q  101 cttcaag 107  Q
    |||||||    
T  36657518 cttcaag 36657524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 12159037 - 12159129
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12159037 tcatcaaacactggtgaccggtctaaaacgtttatatcgttcaacgttcccgaacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagat 12159129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 17467428 - 17467672
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17467428 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 17467527  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17467528 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 17467627  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17467628 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 17467672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25789936 - 25789692
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25789936 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 25789837  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25789836 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 25789737  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25789736 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 25789692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25831893 - 25831649
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25831893 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 25831794  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25831793 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 25831694  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831693 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 25831649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 47145079 - 47145323
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47145079 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 47145178  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47145179 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 47145278  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47145279 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 47145323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 33749594 - 33749838
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33749594 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 33749693  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33749694 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagttaatact 33749793  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33749794 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 33749838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30417585 - 30417341
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30417585 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 30417486  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30417485 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 30417386  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30417385 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 30417341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 42561815 - 42562059
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42561815 tcatcaaacaccggtgatcggactagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcataagatgcaactg 42561914  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  42561915 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatgct 42562014  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42562015 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 42562059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42600674 - 42600436
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42600674 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 42600575  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42600574 cttctagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 42600475  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatg 239  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42600474 gccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatg 42600436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6047851 - 6047607
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6047851 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 6047752  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  6047751 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccaatgcatgcagtcaatgct 6047652  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6047651 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgcagtat 6047607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 51428004 - 51428248
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  51428004 tcatcaaacactggtgatcggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccgaacatccgaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagacgcaactg 51428103  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  51428104 cttccagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgaccttcccatgctttgggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatatt 51428203  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51428204 gccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 51428248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30691434 - 30691189
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30691434 tcatcaaacattggtgaccggtctagaacatttatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatctatagatcatgagatgcaactg 30691335  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcc-cccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatac 199  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30691334 cttcaacaataactgtggtggttcccttatccccccctggtaaattgaccttcccatgctttatgacaatttttctactcccagtgcatgcagtcaatac 30691235  T
Q  200 tcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30691234 tcccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgcagtat 30691189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 50017905 - 50018147
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50017905 tcatcaaacactattgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccagacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactg 50018004  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50018005 cttcaagaataactgtggcggttccctta--ccccctgataaattgaccttcccatgctttaggacaatttttctactcccagtgcatgcagtcaatact 50018102  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50018103 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaatatgtagtat 50018147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21226201 - 21226445
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||    
T  21226201 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatattgttaaacattcacggacatccaaaaaaggcatgccaaatccatagatcatgagatgaaactg 21226300  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21226301 cttcaagaataactgtgatggttcccttatcccccttagtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactctcagtgcatgcagtcaatact 21226400  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21226401 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 21226445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21231571 - 21231326
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |    
T  21231571 tcatcaaacaccggtgaccgatctagaacgtttatattgttcaacattcacgatcatccaaaaaaggcatgtcaaatacatagatcatgagatgcaaccg 21231472  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||   ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21231471 cttcaag-ataattgtggtggtt-ccttat-ccccctagtaaattgagattcccatgctttaggacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 21231375  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtataatat 250  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21231374 ctcgatcatccctgggaa-ccccgcatttcactaacatgtagtattatat 21231326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33189870 - 33189757
Alignment:
Q  132 ccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgagaacccccgcatttca 231  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33189870 ccccctggtaaattgactttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatacagtcaatactcccgatcatccctgggaacccccgcatttca 33189771  T
Q  232 ctaacatgtagtat 245  Q
    ||||||||||||||    
T  33189770 ctaacatgtagtat 33189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 43474802 - 43474894
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagat 93  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43474802 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacgttgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcgtgagat 43474894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 49027754 - 49027655
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49027754 tcatgaaagactggtgaccggtctataacgtttatatcgttcaacgttcccgaacatccaagaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 49027655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 31469039 - 31469283
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31469039 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 31469138  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31469139 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 31469238  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31469239 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 31469283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 17784275 - 17784519
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17784275 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaagacatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 17784374  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17784375 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggataatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 17784474  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17784475 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcagtaacatgtagtat 17784519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2477484 - 2477240
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2477484 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 2477385  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2477384 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 2477285  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477284 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 2477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 45240052 - 45240296
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45240052 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 45240151  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45240152 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 45240251  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45240252 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 45240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48387263 - 48387019
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48387263 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 48387164  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48387163 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 48387064  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48387063 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 48387019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 48405242 - 48405486
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48405242 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaatgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 48405341  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48405342 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 48405441  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48405442 cccgatcatccctgggaacccacgcatttcactaacatgtagtat 48405486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 33165283 - 33165526
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  33165283 tcatcaaacaaaggtgatcggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccaaatccatagatcatgagatgcaactg 33165382  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33165383 cttcaagaataactgtggtggctcccttat-ccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 33165481  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33165482 cccgatcatccctaggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 33165526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 51521106 - 51521349
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51521106 tcatcaaacactggtgaccggtctagaatgtttttatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagttgcaactg 51521205  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51521206 cttcaagaataactgtggtggttctcttat-tcccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 51521304  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51521305 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 51521349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47299657 - 47299412
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47299657 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacgttgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagattatgagatgcaactg 47299558  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcc-cccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatac 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  47299557 cttcaagaataactgtggtggttcccttatccccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatggaatcaatac 47299458  T
Q  200 tcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47299457 tcccgatcatccctgtgaaaccccgcatttcactaacatgtagtat 47299412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17680421 - 17680177
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17680421 tcatcaaacaccgatgaccggtctagaactttgatatcgtttaacgttcttggacatccaaaaaaggcatgttagagccatagatcatgagatgcaactg 17680322  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17680321 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctagtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgtagtcaatact 17680222  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17680221 cccgatcatccctgggaaccctcgcatttcactaacatgtagtat 17680177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8469233 - 8469476
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaa-ggcatgtcagatccatagatcatgagatacaact 99  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  8469233 tcatcaaacaccagtgaccggtctagaacgttgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaaggcatgtcagattcatagatcatgagatgcagct 8469332  T
Q  100 gcttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatac 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8469333 gcttcaagaataactgtggtggttcccctatccccc-tggtaaattgaccttcccatgttttaggacaatttt-ccactcccagtgcatgcagtcaatac 8469430  T
Q  200 tcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469431 ttccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 8469476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10266117 - 10265986
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10266117 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacgttgatatcgtttaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaacta 10266018  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcc 132  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10266017 ctttaagaataactgtggtggttcccttatcc 10265986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12855931 - 12856175
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12855931 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 12856030  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12856031 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 12856130  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12856131 cccgatcatccctgggaaccctcgcatttcactaacatgtagtat 12856175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8852969 - 8853213
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  8852969 tcatcgaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcatctg 8853068  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8853069 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 8853168  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8853169 cccgatcatccctaggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 8853213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7587658 - 7587414
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7587658 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 7587559  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7587558 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 7587459  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7587458 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 7587414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30821738 - 30821494
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30821738 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 30821639  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30821638 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 30821539  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30821538 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgtagtat 30821494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22350769 - 22350525
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22350769 tcatcaaacaccggtgaccggtctagaacattgatatcgttcaacgttcctggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 22350670  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  22350669 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccaatgcatgcagtcaatgct 22350570  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22350569 cccgatcatccctgggaacccccgcatttcactaacatgcagtat 22350525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31207064 - 31206822
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31207064 tcatcaaacactggtgaccagtctacaacgtttatatcgttcaacgttcccgaacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaactg 31206965  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31206964 cttcaagaataattgtggtggttcccttat-ccccttgataaattgaccttcccatgctttaggacaa-ttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 31206867  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31206866 cccgatcatccctgtgaatccccgcatttcactaacatgtagtat 31206822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2779957 - 2779713
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2779957 tcatcaaacactggtggccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccgggcatctaagaaagacatgccagatccataaatcatgagatgcaactg 2779858  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2779857 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccttggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccacttccagtgcatgcagtcaatact 2779758  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779757 cctgatcatccctaggaatccccgcatttcactaacatgtagtat 2779713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40880899 - 40880650
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  40880899 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatattgttcaacgttcccggacatccgaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatgcaacta 40880800  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattga-----ccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtca 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||     || ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40880799 cttcaagaataactgtggtggttccctcatcccctctggtgaattgaccttcccttcccatgctttaggataatttttccactcccagtgcatgcagtca 40880700  T
Q  196 atactcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  40880699 atactcccgatcatccatgggaaccctcgcgtttcactaacatgttgtat 40880650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39433152 - 39432910
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||     
T  39433152 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttctcgggcatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcaagagatgcaacta 39433053  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39433052 cttctaaaataattgtggtgg-tcccttat-ccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggaaaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 39432955  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
     ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39432954 gccgatcatccccgggaacccccacatttcactaacatgtagtat 39432910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1240 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1240
Description:

Target: scaffold1240; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1928 - 1684
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1928 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaatgcatgccagatccatagatcatgagatgcaactg 1829  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatact 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1828 cttcaagaataactgtggtggttcccttatcccccctggttaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactcccagtgcatgcagtcaatact 1729  T
Q  201 cccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1728 cccgatcatccctgggaacccccacatttcattaacatgtagtat 1684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29705 - 29460
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29705 tcatctaacacttgtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgccagatccatagatcataagatgcaactg 29606  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttat-cccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcatgcagtcaatac 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29605 cttcaagaataactgtggtggttccatcatccccccctggtaaattgaccttcccatgctttaggacaatttttccactccaagtgcatgcagttaatac 29506  T
Q  200 tcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29505 tcccgatcatccctgggaacccctgcatttcactaacatgtagtat 29460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 169686 - 169499
Alignment:
Q  1 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaacgttcccggacatccaaaaaaggcatgtcagatccatagatcatgagatacaactg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  169686 tcatcaaacactggtgaccggtctagaacgtttatatcgttcaatgttatcgaacatccaaaaaatgcatgtcaaatccatagatcatgagatgcaactg 169587  T
Q  101 cttcaagaataattgtggtggttcccttatcccccctggtgaattgaccctcccatgatttatgacaatttttccactcctagtgcat 188  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| | || |||||||||| |||||| |||||||    
T  169586 tttcaagaataactgtggtgcttcccttatcccccctagtaaattgaccttctcatgctctaggacaattttttcactcccagtgcat 169499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 168215 - 168154
Alignment:
Q  184 tgcatgcagtcaatactcccgatcatccctgagaacccccgcatttcactaacatgtagtat 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  168215 tgcatgcagtgaatactcccgatcatccctatgaacccttgcatttcactaacatgcagtat 168154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University