View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18196_low_25 (Length: 389)

Name: NF18196_low_25
Description: NF18196
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18196_low_25
NF18196_low_25
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (9-379)||(27286961-27287331)
chr6 (7-379)||(27179685-27180057)
chr6 (7-379)||(27269182-27269554)
chr6 (9-379)||(27022365-27022735)
chr6 (9-379)||(13295548-13295918)
chr6 (13-379)||(15420921-15421287)
chr6 (1-379)||(16677369-16677747)
chr6 (9-379)||(22931481-22931851)
chr6 (9-379)||(23853926-23854296)
chr6 (7-379)||(24866945-24867317)
chr6 (7-379)||(29552786-29553158)
chr6 (1-375)||(27626300-27626674)
chr6 (1-379)||(34461095-34461473)
chr6 (1-379)||(29504645-29505023)
chr6 (7-379)||(16753050-16753422)
chr6 (1-379)||(4760992-4761370)
chr6 (1-379)||(30554605-30554983)
chr6 (7-379)||(27060735-27061107)
chr6 (7-379)||(26921606-26921978)
chr6 (9-379)||(3699312-3699682)
chr6 (7-375)||(17089038-17089406)
chr6 (1-379)||(27010960-27011338)
chr6 (7-379)||(27488362-27488734)
chr6 (1-379)||(26113001-26113379)
chr6 (1-379)||(28210683-28211061)
chr6 (1-379)||(4542363-4542741)
chr6 (1-379)||(4720724-4721102)
chr6 (1-379)||(29576243-29576621)
chr6 (1-379)||(4528514-4528892)
chr6 (1-379)||(4776109-4776487)
chr6 (9-379)||(16940624-16940994)
chr6 (7-307)||(26992096-26992396)
chr6 (1-269)||(14141983-14142251)
chr6 (1-269)||(26789155-26789423)
chr6 (1-269)||(27197524-27197792)
chr6 (1-269)||(27251443-27251711)
chr6 (7-377)||(20171778-20172148)
chr6 (7-377)||(22163843-22164213)
chr6 (1-269)||(13520781-13521048)
chr6 (1-269)||(28163830-28164098)
chr6 (1-269)||(27358699-27358967)
chr6 (1-269)||(27449042-27449310)
chr6 (1-269)||(22455703-22455971)
chr6 (7-269)||(26775222-26775484)
chr6 (1-287)||(33373020-33373306)
chr6 (7-269)||(8902298-8902560)
chr6 (7-86)||(24302352-24302431)
chr6 (4-134)||(23971362-23971492)
chr6 (13-333)||(27545177-27545497)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (1-371)||(13933182-13933552)
chr2 (9-379)||(23125211-23125581)
chr2 (7-379)||(12658767-12659139)
chr2 (7-379)||(20841144-20841516)
chr2 (1-371)||(27806942-27807312)
chr2 (1-379)||(34294385-34294763)
chr2 (1-379)||(11631819-11632197)
chr2 (9-379)||(37948505-37948875)
chr2 (1-379)||(39048454-39048832)
chr2 (1-379)||(39893300-39893678)
chr2 (9-377)||(27431084-27431452)
chr2 (1-371)||(257288-257658)
chr2 (1-371)||(12590047-12590417)
chr2 (1-379)||(19413136-19413514)
chr2 (9-379)||(28885438-28885808)
chr2 (1-379)||(31879517-31879895)
chr2 (1-379)||(32053034-32053412)
chr2 (1-379)||(37682530-37682908)
chr2 (1-379)||(37697795-37698173)
chr2 (1-379)||(37928600-37928978)
chr2 (1-379)||(40236739-40237117)
chr2 (1-379)||(16825973-16826351)
chr2 (1-379)||(16895129-16895507)
chr2 (7-377)||(21699812-21700181)
chr2 (1-379)||(34864915-34865293)
chr2 (8-377)||(19453065-19453434)
chr2 (1-371)||(9346621-9346991)
chr2 (1-371)||(21673810-21674180)
chr2 (9-379)||(12713244-12713614)
chr2 (9-379)||(37380908-37381278)
chr2 (1-269)||(27119865-27120133)
chr2 (1-379)||(27394793-27395171)
chr2 (1-269)||(27779575-27779843)
chr2 (1-269)||(27819332-27819600)
chr2 (1-269)||(3785834-3786102)
chr2 (1-269)||(31890126-31890394)
chr2 (1-269)||(22924783-22925051)
chr2 (1-269)||(34158185-34158453)
chr2 (9-269)||(16164821-16165081)
chr2 (1-229)||(27827841-27828069)
chr2 (7-75)||(34271561-34271629)
chr2 (9-68)||(28885821-28885880)
chr2 (1-116)||(34701570-34701685)
chr2 (13-176)||(34534090-34534253)
chr2 (88-333)||(26723998-26724243)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (9-377)||(8286167-8286535)
chr3 (1-379)||(21677896-21678274)
chr3 (9-378)||(4793332-4793701)
chr3 (1-379)||(6205096-6205474)
chr3 (9-379)||(15737791-15738161)
chr3 (9-379)||(29145453-29145823)
chr3 (7-385)||(35883953-35884331)
chr3 (9-385)||(18333817-18334193)
chr3 (9-379)||(8299164-8299534)
chr3 (9-379)||(18304351-18304721)
chr3 (7-379)||(18054455-18054827)
chr3 (1-379)||(5593046-5593424)
chr3 (9-379)||(18273749-18274119)
chr3 (9-379)||(18289050-18289420)
chr3 (9-379)||(22384275-22384645)
chr3 (7-379)||(7076399-7076771)
chr3 (7-379)||(15889400-15889772)
chr3 (7-379)||(20069233-20069605)
chr3 (9-379)||(4686848-4687218)
chr3 (9-379)||(4724824-4725194)
chr3 (1-379)||(29661659-29662037)
chr3 (9-372)||(32442351-32442714)
chr3 (1-379)||(5016907-5017285)
chr3 (9-379)||(10399337-10399707)
chr3 (7-377)||(16621185-16621555)
chr3 (1-371)||(20573532-20573902)
chr3 (1-379)||(28112643-28113021)
chr3 (7-375)||(19697687-19698055)
chr3 (1-379)||(8214928-8215306)
chr3 (9-379)||(28342370-28342740)
chr3 (1-379)||(47026646-47027024)
chr3 (1-379)||(5606003-5606381)
chr3 (1-379)||(28024475-28024853)
chr3 (1-379)||(24331356-24331734)
chr3 (1-379)||(51785216-51785594)
chr3 (4-379)||(5470181-5470556)
chr3 (1-379)||(4420108-4420486)
chr3 (1-379)||(6539431-6539809)
chr3 (1-371)||(18245942-18246312)
chr3 (9-379)||(48469120-48469490)
chr3 (4-379)||(4343368-4343743)
chr3 (1-379)||(7999753-8000131)
chr3 (1-379)||(31961144-31961522)
chr3 (1-379)||(10646266-10646644)
chr3 (1-379)||(18228389-18228767)
chr3 (1-379)||(22867537-22867915)
chr3 (1-379)||(22882596-22882974)
chr3 (9-379)||(11107056-11107419)
chr3 (9-379)||(17981646-17982016)
chr3 (1-269)||(32293931-32294199)
chr3 (1-269)||(5714376-5714644)
chr3 (1-269)||(5725286-5725554)
chr3 (1-269)||(5766814-5767082)
chr3 (1-269)||(17992620-17992888)
chr3 (1-269)||(4627088-4627356)
chr3 (9-269)||(31032933-31033193)
chr3 (7-84)||(5653573-5653650)
chr3 (13-176)||(6963134-6963297)
chr3 (9-134)||(6571792-6571917)
chr3 (46-134)||(15704911-15704999)
chr3 (1-116)||(11925047-11925162)
chr3 (4-116)||(7088719-7088831)
chr3 (4-68)||(15592603-15592667)
chr3 (9-116)||(22959909-22960016)
chr3 (4-70)||(20443619-20443685)
chr3 (7-68)||(15919021-15919082)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (7-377)||(3301-3671)
scaffold0089 (235-379)||(43871-44015)
scaffold0089 (306-377)||(32096-32167)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (9-379)||(10913408-10913778)
chr7 (9-379)||(2157803-2158173)
chr7 (7-379)||(5131225-5131597)
chr7 (7-379)||(11421316-11421688)
chr7 (7-377)||(10844851-10845221)
chr7 (7-377)||(16514967-16515337)
chr7 (9-379)||(2106702-2107072)
chr7 (1-379)||(5143871-5144249)
chr7 (1-379)||(26271617-26271995)
chr7 (1-379)||(4202618-4202996)
chr7 (9-379)||(22145424-22145794)
chr7 (9-379)||(26534412-26534782)
chr7 (1-379)||(26316379-26316757)
chr7 (9-371)||(26516029-26516391)
chr7 (1-379)||(45390449-45390827)
chr7 (9-379)||(4141785-4142155)
chr7 (7-377)||(16446543-16446913)
chr7 (9-379)||(26438486-26438856)
chr7 (1-371)||(16748048-16748418)
chr7 (1-379)||(26666445-26666823)
chr7 (9-379)||(3448535-3448905)
chr7 (7-377)||(10842531-10842901)
chr7 (15-377)||(16044550-16044911)
chr7 (1-371)||(31560921-31561291)
chr7 (9-379)||(11444116-11444486)
chr7 (9-379)||(24589073-24589443)
chr7 (1-269)||(2776593-2776861)
chr7 (1-269)||(31127246-31127514)
chr7 (1-269)||(26512227-26512495)
chr7 (1-269)||(26681637-26681905)
chr7 (1-269)||(39209670-39209938)
chr7 (9-269)||(45734652-45734912)
chr7 (9-269)||(31087161-31087421)
chr7 (230-379)||(9621879-9622028)
chr7 (7-84)||(5161907-5161984)
chr7 (46-176)||(25726929-25727059)
chr7 (1-116)||(16127349-16127464)
chr7 (1-116)||(29090008-29090123)
chr7 (4-114)||(16237975-16238085)
chr7 (88-333)||(1893193-1893438)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (1-379)||(43081494-43081872)
chr5 (7-379)||(33295767-33296139)
chr5 (7-379)||(33780728-33781100)
chr5 (7-379)||(11552594-11552966)
chr5 (9-379)||(23629209-23629579)
chr5 (10-379)||(24684697-24685066)
chr5 (7-379)||(15655307-15655679)
chr5 (9-379)||(22995668-22996038)
chr5 (1-379)||(18497268-18497646)
chr5 (12-379)||(24973145-24973512)
chr5 (1-379)||(3792780-3793158)
chr5 (1-379)||(28652481-28652859)
chr5 (9-379)||(41677944-41678314)
chr5 (1-379)||(34619757-34620135)
chr5 (1-371)||(40470093-40470463)
chr5 (7-374)||(22891707-22892074)
chr5 (1-379)||(8662018-8662396)
chr5 (1-379)||(9320715-9321093)
chr5 (1-379)||(12135414-12135792)
chr5 (1-379)||(30032667-30033045)
chr5 (1-379)||(30155270-30155648)
chr5 (9-379)||(30937874-30938244)
chr5 (1-379)||(33519619-33519997)
chr5 (1-379)||(24586613-24586991)
chr5 (7-377)||(25203519-25203889)
chr5 (7-377)||(25267674-25268044)
chr5 (1-379)||(26483633-26484011)
chr5 (9-379)||(30171708-30172078)
chr5 (1-379)||(31434703-31435081)
chr5 (1-379)||(24727208-24727586)
chr5 (13-379)||(28956340-28956706)
chr5 (1-379)||(32592817-32593195)
chr5 (1-379)||(37668029-37668407)
chr5 (9-379)||(37758222-37758592)
chr5 (1-379)||(31822950-31823328)
chr5 (1-379)||(37355186-37355564)
chr5 (9-379)||(2514301-2514671)
chr5 (1-371)||(15755395-15755765)
chr5 (1-379)||(18372077-18372455)
chr5 (1-379)||(37767534-37767912)
chr5 (9-379)||(6877544-6877914)
chr5 (1-379)||(13321373-13321751)
chr5 (9-379)||(5641027-5641397)
chr5 (4-269)||(29887743-29888008)
chr5 (1-269)||(33878480-33878747)
chr5 (9-269)||(13439234-13439494)
chr5 (10-269)||(18124968-18125227)
chr5 (7-269)||(9547258-9547520)
chr5 (1-269)||(11326986-11327254)
chr5 (7-287)||(13183342-13183622)
chr5 (132-377)||(23895447-23895692)
chr5 (13-176)||(351770-351933)
chr5 (4-338)||(15784271-15784605)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (7-379)||(30525-30897)
scaffold0143 (7-377)||(19304-19674)
scaffold0143 (1-269)||(7302-7570)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (7-379)||(27605518-27605890)
chr8 (9-379)||(18793935-18794305)
chr8 (9-379)||(14560855-14561225)
chr8 (1-379)||(18712715-18713093)
chr8 (9-379)||(19691329-19691699)
chr8 (7-379)||(2133873-2134245)
chr8 (1-379)||(29832557-29832935)
chr8 (1-379)||(9357856-9358234)
chr8 (1-371)||(19204969-19205339)
chr8 (1-371)||(28358559-28358929)
chr8 (1-379)||(31357759-31358137)
chr8 (1-379)||(33261965-33262343)
chr8 (1-379)||(12089330-12089708)
chr8 (9-379)||(19677678-19678048)
chr8 (9-379)||(31486486-31486856)
chr8 (9-265)||(21344786-21345042)
chr8 (1-269)||(44564325-44564593)
chr8 (1-379)||(22077518-22077896)
chr8 (1-269)||(15770915-15771183)
chr8 (9-86)||(33245893-33245970)
chr8 (7-84)||(19657954-19658031)
chr8 (318-379)||(16286632-16286694)
chr8 (46-173)||(19844604-19844731)
chr8 (1-116)||(22412432-22412547)
chr8 (88-176)||(16768757-16768845)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (7-379)||(14668261-14668633)
chr4 (7-379)||(34185612-34185984)
chr4 (9-379)||(14759960-14760330)
chr4 (7-379)||(17016291-17016663)
chr4 (9-379)||(24115907-24116277)
chr4 (1-379)||(54836636-54837014)
chr4 (1-379)||(5009120-5009498)
chr4 (9-379)||(6573103-6573473)
chr4 (9-375)||(20335075-20335441)
chr4 (9-379)||(24589015-24589385)
chr4 (1-379)||(36341163-36341541)
chr4 (7-379)||(18313830-18314202)
chr4 (7-378)||(1903500-1903871)
chr4 (1-379)||(27159963-27160341)
chr4 (13-377)||(15281595-15281959)
chr4 (1-379)||(31123158-31123536)
chr4 (7-379)||(15231117-15231489)
chr4 (1-379)||(21972946-21973324)
chr4 (1-371)||(39853890-39854260)
chr4 (1-371)||(18797260-18797630)
chr4 (1-379)||(30757005-30757383)
chr4 (1-379)||(40102283-40102661)
chr4 (1-379)||(14101788-14102166)
chr4 (9-379)||(33670454-33670824)
chr4 (1-379)||(15388024-15388402)
chr4 (13-333)||(22146227-22146547)
chr4 (236-287)||(24459636-24459687)
chr4 (1-116)||(14725445-14725560)
chr4 (1-116)||(19767847-19767962)
chr4 (13-176)||(1881757-1881920)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-379)||(9268-9646)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (7-379)||(15813-16185)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (7-376)||(16204686-16205055)
chr1 (1-379)||(10948311-10948689)
chr1 (7-371)||(21894400-21894765)
chr1 (1-379)||(3644366-3644748)
chr1 (1-371)||(41789956-41790326)
chr1 (1-379)||(51641452-51641830)
chr1 (1-371)||(10965907-10966277)
chr1 (7-377)||(20464212-20464582)
chr1 (1-379)||(28588219-28588597)
chr1 (1-269)||(28153080-28153348)
chr1 (78-374)||(20339024-20339320)
chr1 (7-81)||(20337068-20337142)
chr1 (11-176)||(22489458-22489623)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-379)||(22837-23215)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-379)||(9254-9632)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (4-379)||(12803-13178)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-379)||(11574-11952)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-379)||(11181-11559)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (7-377)||(9279-9649)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (9-379)||(5833-6203)
scaffold0159 (307-379)||(23111-23183)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (78-374)||(1347-1643)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (4-377)||(5320-5693)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (14-376)||(43384-43762)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (271-379)||(1155-1263)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (304-372)||(33699-33770)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (13-176)||(4573-4736)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (4-74)||(34889-34959)
scaffold0094 (283-365)||(35168-35250)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 27286961 - 27287331
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27286961 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 27287060  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287061 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagca 27287160  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287161 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 27287260  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287261 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 27287331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27180057 - 27179685
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27180057 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 27179958  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179957 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccag 27179858  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27179857 caggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 27179758  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179757 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 27179685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 27269182 - 27269554
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27269182 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 27269281  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269282 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccag 27269381  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27269382 caggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 27269481  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269482 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 27269554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27022735 - 27022365
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  27022735 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcc 27022636  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27022635 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 27022536  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27022535 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 27022436  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022435 catgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 27022365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 13295548 - 13295918
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  13295548 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcc 13295647  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13295648 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 13295747  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13295748 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 13295847  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295848 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 13295918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 13 - 379
Target Start/End: Original strand, 15420921 - 15421287
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15420921 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgtt 15421020  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggta 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15421021 gaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggta 15421120  T
Q  213 attcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15421121 attcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatg 15421220  T
Q  313 tgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421221 tgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 15421287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16677747 - 16677369
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||    
T  16677747 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcagtgaacttcttgctcaggtagtagatagcatgctctttctttccag 16677648  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16677647 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 16677548  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16677547 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 16677448  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16677447 attgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtg 16677369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 22931481 - 22931851
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22931481 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatct 22931580  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22931581 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagca 22931680  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22931681 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 22931780  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931781 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 22931851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 23853926 - 23854296
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23853926 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatct 23854025  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23854026 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagca 23854125  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23854126 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 23854225  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854226 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 23854296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24867317 - 24866945
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24867317 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 24867218  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24867217 cttgttgacaaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 24867118  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24867117 caggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcg 24867018  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867017 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 24866945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29553158 - 29552786
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  29553158 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcat 29553059  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29553058 cttgttgaccaagtacacagcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 29552959  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29552958 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 29552859  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29552858 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtg 29552786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 27626300 - 27626674
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  27626300 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccag 27626399  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27626400 tctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 27626499  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27626500 tttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 27626599  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 375  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626600 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 27626674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 34461095 - 34461473
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  34461095 caagctagagcacaacaagtcctctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 34461194  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34461195 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 34461294  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  34461295 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcag 34461394  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34461395 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtg 34461473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29505023 - 29504645
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  29505023 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 29504924  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29504923 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 29504824  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  29504823 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcag 29504724  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29504723 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 29504645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16753422 - 16753050
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16753422 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcat 16753323  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16753322 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcag 16753223  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16753222 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 16753123  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16753122 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtg 16753050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4761370 - 4760992
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  4761370 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccgg 4761271  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4761270 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 4761171  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4761170 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcag 4761071  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4761070 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 4760992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 30554605 - 30554983
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  30554605 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccag 30554704  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30554705 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 30554804  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30554805 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 30554904  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30554905 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 30554983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27061107 - 27060735
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27061107 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 27061008  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27061007 cttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 27060908  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27060907 cagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 27060808  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27060807 gtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 27060735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26921978 - 26921606
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26921978 agagcacaacaggtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 26921879  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  26921878 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcag 26921779  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26921778 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 26921679  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921678 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 26921606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3699682 - 3699312
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  3699682 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatct 3699583  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3699582 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagca 3699483  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3699482 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 3699383  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3699382 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtg 3699312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 7 - 375
Target Start/End: Original strand, 17089038 - 17089406
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||    
T  17089038 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtcccat 17089137  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17089138 cttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcgaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccag 17089237  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  17089238 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccacacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcg 17089337  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089338 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 17089406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27011338 - 27010960
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  27011338 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 27011239  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27011238 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 27011139  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27011138 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcag 27011039  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27011038 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 27010960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27488734 - 27488362
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||    
T  27488734 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcat 27488635  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27488634 cttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 27488535  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27488534 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgca 27488435  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27488434 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 27488362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 26113001 - 26113379
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  26113001 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 26113100  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26113101 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 26113200  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26113201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 26113300  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26113301 gttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 26113379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28211061 - 28210683
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  28211061 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 28210962  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28210961 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 28210862  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28210861 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 28210762  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28210761 gttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 28210683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4542363 - 4542741
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  4542363 caagctaaagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 4542462  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4542463 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 4542562  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4542563 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcag 4542662  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4542663 gttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 4542741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4720724 - 4721102
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  4720724 caagctaaagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 4720823  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4720824 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 4720923  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4720924 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcag 4721023  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4721024 gttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 4721102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29576621 - 29576243
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  29576621 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccag 29576522  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29576521 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 29576422  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29576421 ttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 29576322  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29576321 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 29576243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4528892 - 4528514
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  4528892 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 4528793  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4528792 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 4528693  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  4528692 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcag 4528593  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4528592 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 4528514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4776487 - 4776109
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  4776487 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 4776388  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4776387 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 4776288  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  4776287 ttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacag 4776188  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4776187 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 4776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 16940624 - 16940994
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||    
T  16940624 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatct 16940723  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16940724 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 16940823  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16940824 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagt 16940923  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16940924 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 16940994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26992396 - 26992096
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26992396 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 26992297  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26992296 cctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 26992197  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26992196 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 26992097  T
Q  307 g 307  Q
    |    
T  26992096 g 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 14141983 - 14142251
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  14141983 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccag 14142082  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14142083 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 14142182  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14142183 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 14142251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26789423 - 26789155
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26789423 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 26789324  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26789323 tctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 26789224  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26789223 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 26789155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27197792 - 27197524
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27197792 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 27197693  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27197692 tctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 27197593  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27197592 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 27197524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 27251443 - 27251711
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27251443 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 27251542  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27251543 tctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 27251642  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27251643 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 27251711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20172148 - 20171778
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  20172148 agagcacaacaagtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcat 20172049  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||  || ||||| | | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20172048 cttgttgaccaattacacatcctacgaattcgtcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctg 20171949  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20171948 cagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcg 20171849  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20171848 gtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctaacttgtttctcagtctg 20171778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Original strand, 22163843 - 22164213
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  22163843 agagcacaacaagtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcat 22163942  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||  || ||||| | | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22163943 cttgttgaccaattacacatcctacgaattcgtcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctg 22164042  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22164043 cagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcg 22164142  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22164143 gtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctaacttgtttctcagtctg 22164213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 13520781 - 13521048
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13520781 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 13520880  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13520881 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 13520980  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13520981 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcattcatcgttccatacaataggctgatt 13521048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28164098 - 28163830
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  28164098 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 28163999  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28163998 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 28163899  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28163898 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggccgatt 28163830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 27358699 - 27358967
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  27358699 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 27358798  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27358799 tttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 27358898  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27358899 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 27358967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 27449042 - 27449310
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  27449042 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 27449141  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27449142 tttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 27449241  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27449242 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 27449310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 22455703 - 22455971
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22455703 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccag 22455802  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22455803 tctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcaccaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtgg 22455902  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  22455903 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggttgatt 22455971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Original strand, 26775222 - 26775484
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||    
T  26775222 agagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcat 26775321  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26775322 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 26775421  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26775422 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 26775484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 33373020 - 33373306
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33373020 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcagtgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccag 33373119  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33373120 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 33373219  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  33373220 ttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaa 33373306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Original strand, 8902298 - 8902560
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8902298 agagcacaacaagttttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 8902397  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8902398 cttgttgaccaagcacgcatcccacagatgcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccag 8902497  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8902498 caggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaataggccgatt 8902560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 24302352 - 24302431
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatt 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24302352 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatt 24302431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 23971362 - 23971492
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtct 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||  || |    
T  23971362 gctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatatcatgctctttctttccggttt 23971461  T
Q  104 catcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 134  Q
    ||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  23971462 catcttgttgacccaacacacagcccatgga 23971492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27545497 - 27545177
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| || || |  |||||||||| |||||| |||||||    
T  27545497 caacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgtt 27545398  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggta 212  Q
    |||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || ||||| | ||  ||    
T  27545397 gacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcctcccttcgaccggagggacaagaatcggaggttctaacaaata 27545298  T
Q  213 attcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatg 312  Q
        |||||||| ||||||||||  ||||| || ||  |||| |||||    |||| ||| | ||||| |||||| |||||||| || || || |||||     
T  27545297 ccctttgatgctgtcaaaagctttctggcaatcttccgtccaaacaatcccttgatctttacggagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcata 27545198  T
Q  313 tgagatatgaatcgggagatg 333  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  27545197 tgagagatgaatctggagatg 27545177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 13933182 - 13933552
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13933182 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 13933281  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13933282 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 13933381  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  13933382 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcag 13933481  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933482 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 13933552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 23125211 - 23125581
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  23125211 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcc 23125310  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23125311 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagca 23125410  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23125411 ggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 23125510  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125511 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 23125581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12659139 - 12658767
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12659139 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 12659040  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12659039 cttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 12658940  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12658939 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 12658840  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12658839 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtg 12658767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20841516 - 20841144
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20841516 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 20841417  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20841416 cttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaagtacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccag 20841317  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20841316 taggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 20841217  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841216 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 20841144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27807312 - 27806942
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  27807312 caagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 27807213  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27807212 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 27807113  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27807112 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcag 27807013  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807012 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 27806942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34294763 - 34294385
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||| ||    
T  34294763 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaagtagtagatagcatgctctttctttccag 34294664  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34294663 tctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 34294564  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34294563 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 34294464  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294463 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 34294385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 11631819 - 11632197
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  11631819 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccag 11631918  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11631919 tttcatcttgttgaccaagtaaacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 11632018  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11632019 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcag 11632118  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11632119 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 11632197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 37948505 - 37948875
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  37948505 agcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttcaagtttcatct 37948604  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37948605 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 37948704  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948705 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 37948804  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948805 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 37948875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 39048454 - 39048832
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||||| ||    
T  39048454 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttaggtagtagatagcatgctctttctttccag 39048553  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39048554 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 39048653  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  39048654 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcag 39048753  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39048754 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcttacttgcttctcagtctgtg 39048832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39893678 - 39893300
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  39893678 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 39893579  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39893578 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 39893479  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  39893478 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacag 39893379  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39893378 gttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 39893300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 377
Target Start/End: Original strand, 27431084 - 27431452
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  27431084 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcgcct 27431183  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27431184 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactaccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 27431283  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27431284 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 27431383  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431384 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 257288 - 257658
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  257288 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccag 257387  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  257388 tttcatcttgctgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 257487  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  257488 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcag 257587  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257588 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 257658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12590417 - 12590047
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  12590417 caagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 12590318  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12590317 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 12590218  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12590217 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 12590118  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12590117 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctc 12590047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 19413136 - 19413514
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  19413136 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 19413235  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19413236 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 19413335  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19413336 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 19413435  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19413436 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 19413514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28885808 - 28885438
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28885808 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 28885709  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28885708 tgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataaccaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 28885609  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28885608 ggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggt 28885509  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885508 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 28885438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31879895 - 31879517
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  31879895 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 31879796  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31879795 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 31879696  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  31879695 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacag 31879596  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31879595 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 31879517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32053412 - 32053034
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  32053412 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 32053313  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32053312 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 32053213  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32053212 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 32053113  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32053112 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 32053034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 37682530 - 37682908
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  37682530 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 37682629  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37682630 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 37682729  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37682730 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 37682829  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37682830 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 37682908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 37697795 - 37698173
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  37697795 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 37697894  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37697895 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 37697994  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37697995 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 37698094  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37698095 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 37698173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37928978 - 37928600
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  37928978 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 37928879  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37928878 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 37928779  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37928778 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 37928679  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37928678 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 37928600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40237117 - 40236739
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  40237117 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccg 40237018  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40237017 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 40236918  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  40236917 ttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcag 40236818  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40236817 gttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 40236739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 16825973 - 16826351
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  16825973 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccag 16826072  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16826073 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcctatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 16826172  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16826173 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 16826272  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16826273 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 16826351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16895507 - 16895129
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  16895507 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccag 16895408  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16895407 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcctatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 16895308  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16895307 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 16895208  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16895207 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 16895129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Original strand, 21699812 - 21700181
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21699812 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 21699911  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21699912 cttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaatactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccag 21700011  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21700012 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 21700111  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21700112 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctga-ttgtttctcggtctg 21700181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34865293 - 34864915
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  34865293 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 34865194  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34865193 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 34865094  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34865093 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 34864994  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34864993 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 34864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 377
Target Start/End: Original strand, 19453065 - 19453434
Alignment:
Q  8 gagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatc 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19453065 gagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagataatagatagcatgttctttctttccagtctcatc 19453164  T
Q  108 ttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagc 207  Q
    | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19453165 tcgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaac 19453264  T
Q  208 aggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcgg 307  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19453265 aagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 19453364  T
Q  308 tcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19453365 tcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 9346621 - 9346991
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9346621 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccag 9346720  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9346721 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 9346820  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9346821 ttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 9346920  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9346921 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctc 9346991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 21673810 - 21674180
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  21673810 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 21673909  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21673910 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 21674009  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21674010 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 21674109  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  21674110 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctc 21674180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 12713244 - 12713614
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  12713244 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatct 12713343  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  12713344 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagta 12713443  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12713444 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagt 12713543  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12713544 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 12713614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37381278 - 37380908
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  37381278 agcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatct 37381179  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37381178 tgttgaccaagtacacatcccattgattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 37381079  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37381078 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 37380979  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37380978 catgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtg 37380908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27120133 - 27119865
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27120133 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 27120034  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27120033 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 27119934  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119933 ttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 27119865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27395171 - 27394793
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  27395171 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccag 27395072  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  27395071 tctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtgg 27394972  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  27394971 ttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcag 27394872  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27394871 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 27394793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27779843 - 27779575
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27779843 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 27779744  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27779743 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 27779644  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27779643 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 27779575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27819600 - 27819332
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27819600 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 27819501  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27819500 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 27819401  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27819400 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 27819332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3786102 - 3785834
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3786102 caagctagaccacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 3786003  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3786002 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 3785903  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3785902 ttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 3785834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 31890126 - 31890394
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31890126 caagctagaacacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 31890225  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31890226 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 31890325  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31890326 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaataggctgatt 31890394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 22924783 - 22925051
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22924783 caagctagaccacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 22924882  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22924883 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtgg 22924982  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22924983 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggttgatt 22925051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34158453 - 34158185
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34158453 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 34158354  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34158353 tctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacatatacaaaatcagaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 34158254  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34158253 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 34158185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16165081 - 16164821
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16165081 agcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 16164982  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16164981 tgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagca 16164882  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16164881 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 16164821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27828069 - 27827841
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  27828069 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccag 27827970  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27827969 tctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 27827870  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaa 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27827869 ttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 34271561 - 34271629
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34271561 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatag 34271629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 28885880 - 28885821
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgct 68  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28885880 agcacaacaagttttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgct 28885821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34701685 - 34701570
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  |    
T  34701685 caagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccgg 34701586  T
Q  101 tctcatcttgttgacc 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  34701585 tttcatcttgttgacc 34701570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 34534090 - 34534253
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| || || |  |||||||||| |||||| |||||||    
T  34534090 caacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgtt 34534189  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 176  Q
    |||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  34534190 gacccaacacacaacccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcctcccttc 34534253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 333
Target Start/End: Original strand, 26723998 - 26724243
Alignment:
Q  88 tctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtggga 187  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  26723998 tctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcctcccttcgaccggaggga 26724097  T
Q  188 cgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaa 287  Q
    | || || || ||||| | ||  ||    |||||||| ||||||||||  ||||| || ||  |||| |||||    |||| ||| | ||||| ||||||    
T  26724098 caagaatcgggggttctaacaaataccctttgatgctgtcaaaagctttctggcaatcttccgtccaaacaatcccttgatctttacggagtaacttgaa 26724197  T
Q  288 aatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatg 333  Q
     |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  26724198 tatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatg 26724243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 377
Target Start/End: Original strand, 8286167 - 8286535
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8286167 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 8286266  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8286267 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 8286366  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8286367 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 8286466  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286467 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21678274 - 21677896
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  21678274 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccg 21678175  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21678174 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 21678075  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21678074 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 21677975  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677974 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 21677896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 4793332 - 4793701
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  4793332 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcc 4793431  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4793432 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 4793531  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4793532 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 4793631  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793632 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6205474 - 6205096
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6205474 caagccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccag 6205375  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6205374 tctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 6205275  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6205274 tttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 6205175  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6205174 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtg 6205096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 15737791 - 15738161
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15737791 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 15737890  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15737891 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 15737990  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15737991 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 15738090  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738091 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 15738161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 29145453 - 29145823
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29145453 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 29145552  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29145553 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 29145652  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29145653 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 29145752  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29145753 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctaacttgcttctcggtctgtg 29145823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 7 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35884331 - 35883953
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35884331 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 35884232  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35884231 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 35884132  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35884131 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 35884032  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgatgctg 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35884031 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 35883953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18334193 - 18333817
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18334193 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 18334094  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18334093 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagca 18333994  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18333993 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 18333894  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgatgctg 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18333893 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 18333817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8299534 - 8299164
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  8299534 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccaatctcatct 8299435  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8299434 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 8299335  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8299334 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 8299235  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299234 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 8299164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 18304351 - 18304721
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18304351 agcacaacaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 18304450  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18304451 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 18304550  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18304551 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggt 18304650  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304651 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 18304721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18054827 - 18054455
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18054827 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 18054728  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18054727 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 18054628  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18054627 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 18054528  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054527 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 18054455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5593046 - 5593424
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  5593046 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 5593145  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5593146 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 5593245  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5593246 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcag 5593345  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5593346 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 5593424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 18273749 - 18274119
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  18273749 agcacaacaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatct 18273848  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18273849 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 18273948  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18273949 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggt 18274048  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18274049 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 18274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 18289050 - 18289420
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  18289050 agcacaacaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatct 18289149  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18289150 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 18289249  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18289250 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggt 18289349  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289350 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 18289420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 22384275 - 22384645
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22384275 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 22384374  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22384375 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 22384474  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22384475 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 22384574  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384575 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 22384645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7076771 - 7076399
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7076771 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 7076672  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7076671 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 7076572  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7076571 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcg 7076472  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7076471 gtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtg 7076399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 15889400 - 15889772
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15889400 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttatatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 15889499  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15889500 cctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 15889599  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15889600 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 15889699  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889700 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 15889772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20069605 - 20069233
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20069605 agagcacaacaagtcttctcaagcattgcataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 20069506  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20069505 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctag 20069406  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20069405 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 20069306  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20069305 gtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtg 20069233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4687218 - 4686848
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4687218 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatct 4687119  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  4687118 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagca 4687019  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4687018 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 4686919  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4686918 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtg 4686848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4725194 - 4724824
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4725194 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatct 4725095  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  4725094 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagca 4724995  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4724994 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 4724895  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4724894 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtg 4724824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 29661659 - 29662037
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  29661659 caagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccag 29661758  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29661759 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 29661858  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  29661859 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcag 29661958  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661959 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 29662037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 32442714 - 32442351
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32442714 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 32442615  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32442614 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagca 32442515  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32442514 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 32442415  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32442414 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcg 32442351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5017285 - 5016907
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  5017285 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 5017186  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5017185 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 5017086  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  5017085 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacag 5016986  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5016985 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 5016907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10399707 - 10399337
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10399707 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatct 10399608  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10399607 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagca 10399508  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10399507 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 10399408  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10399407 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtg 10399337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Original strand, 16621185 - 16621555
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16621185 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcagtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 16621284  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16621285 cttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctag 16621384  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16621385 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 16621484  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16621485 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 20573532 - 20573902
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  20573532 caagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 20573631  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20573632 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 20573731  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  20573732 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcag 20573831  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573832 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 20573902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 28112643 - 28113021
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  28112643 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccag 28112742  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28112743 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 28112842  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28112843 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 28112942  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28112943 gttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 28113021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 7 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19698055 - 19697687
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19698055 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 19697956  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19697955 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcgaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 19697856  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19697855 caggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 19697756  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19697755 gtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8215306 - 8214928
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| | ||    
T  8215306 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtaggtagcatgctctttcttcccag 8215207  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8215206 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 8215107  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8215106 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcag 8215007  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8215006 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 8214928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28342740 - 28342370
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  28342740 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatct 28342641  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28342640 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 28342541  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  28342540 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagt 28342441  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28342440 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 28342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47027024 - 47026646
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  47027024 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 47026925  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47026924 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 47026825  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||     
T  47026824 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaa 47026725  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47026724 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 47026646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5606003 - 5606381
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5606003 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccag 5606102  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5606103 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 5606202  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5606203 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 5606302  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5606303 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 5606381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28024853 - 28024475
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28024853 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccag 28024754  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28024753 tctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 28024654  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28024653 ttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 28024554  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28024553 gttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 28024475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24331734 - 24331356
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  24331734 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 24331635  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24331634 tttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 24331535  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24331534 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 24331435  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24331434 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 24331356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51785594 - 51785216
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51785594 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccag 51785495  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  51785494 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 51785395  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51785394 ttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 51785295  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51785294 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 51785216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5470556 - 5470181
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || |    
T  5470556 gctagagcacaacaagtcttctctagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggttt 5470457  T
Q  104 catcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttc 203  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5470456 catcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttc 5470357  T
Q  204 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggtt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5470356 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagtt 5470257  T
Q  304 gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5470256 gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 5470181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4420486 - 4420108
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||    
T  4420486 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagatagcatgctctttctttccag 4420387  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4420386 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 4420287  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4420286 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 4420187  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4420186 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 4420108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 6539431 - 6539809
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  6539431 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 6539530  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6539531 tttcatcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 6539630  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6539631 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 6539730  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6539731 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 6539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18246312 - 18245942
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  18246312 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 18246213  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18246212 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 18246113  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18246112 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcag 18246013  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  18246012 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctc 18245942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48469490 - 48469120
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  48469490 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatct 48469391  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48469390 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 48469291  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48469290 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 48469191  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  48469190 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctatgacttgtttctctgtctgtg 48469120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Original strand, 4343368 - 4343743
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtct 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || |    
T  4343368 gctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggttt 4343467  T
Q  104 catcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttc 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4343468 catcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactaccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttc 4343567  T
Q  204 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggtt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4343568 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggtt 4343667  T
Q  304 gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4343668 gcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 4343743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8000131 - 7999753
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  8000131 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 8000032  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8000031 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcgtcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 7999932  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7999931 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 7999832  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7999831 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 7999753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 31961144 - 31961522
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  31961144 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 31961243  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  31961244 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtgg 31961343  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31961344 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 31961443  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31961444 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 31961522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10646644 - 10646266
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  10646644 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 10646545  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10646544 tttcatcttgttgaccaagtacacatctcatggattcgtcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 10646445  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10646444 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 10646345  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10646344 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 10646266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18228767 - 18228389
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  18228767 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccag 18228668  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18228667 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 18228568  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18228567 ttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 18228468  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18228467 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 18228389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 22867537 - 22867915
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||  |    
T  22867537 caagctagtgcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccgg 22867636  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22867637 ttttatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 22867736  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22867737 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 22867836  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22867837 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 22867915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 22882596 - 22882974
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||  |    
T  22882596 caagctagtgcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccgg 22882695  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22882696 ttttatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 22882795  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22882796 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 22882895  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22882896 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 22882974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 11107056 - 11107419
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  11107056 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatct 11107155  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||       ||| |||||||||||||||| ||    
T  11107156 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttcca-------gacaaggataggtggttccaaca 11107248  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11107249 agtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggt 11107348  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107349 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 11107419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 17981646 - 17982016
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  17981646 agcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatct 17981745  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17981746 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaaca 17981845  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17981846 agtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagt 17981945  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17981946 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 17982016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32294199 - 32293931
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32294199 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 32294100  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  32294099 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 32294000  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32293999 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 32293931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5714644 - 5714376
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  5714644 caagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccag 5714545  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5714544 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 5714445  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5714444 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgatt 5714376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5725554 - 5725286
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  5725554 caagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccag 5725455  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5725454 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 5725355  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5725354 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgatt 5725286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 5766814 - 5767082
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  5766814 caagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccag 5766913  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5766914 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 5767013  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5767014 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgatt 5767082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 17992620 - 17992888
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17992620 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 17992719  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17992720 tctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 17992819  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17992820 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggttgatt 17992888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4627356 - 4627088
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  4627356 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 4627257  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4627256 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcgaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 4627157  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627156 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 4627088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Original strand, 31032933 - 31033193
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31032933 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 31033032  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31033033 tgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagca 31033132  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31033133 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataataggctgatt 31033193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 5653650 - 5653573
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 84  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5653650 agagcataacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgagcttcttgcttagatagtagatagca 5653573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 6963134 - 6963297
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||  |||||||||| ||| || |||||||    
T  6963134 caacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgtt 6963233  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 176  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  6963234 gaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtcaagtacatgatcaaaggccttccttc 6963297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6571917 - 6571792
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||    
T  6571917 agcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgagactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatct 6571818  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatgga 134  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||    
T  6571817 tgttgacctaacacacagcccatgga 6571792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15704999 - 15704911
Alignment:
Q  46 tcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 134  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  15704999 tcacaatcagtgaatttcttactcaaatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgacctaacacacagcccatgga 15704911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 11925047 - 11925162
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  |    
T  11925047 caagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccgg 11925146  T
Q  101 tctcatcttgttgacc 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  11925147 tttcatcttgttgacc 11925162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Original strand, 7088719 - 7088831
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtct 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  || |    
T  7088719 gctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggttt 7088818  T
Q  104 catcttgttgacc 116  Q
    |||||||||||||    
T  7088819 catcttgttgacc 7088831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 15592603 - 15592667
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgct 68  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  15592603 gctagagcacaacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcaccgtcagtaaacttcttgct 15592667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22960016 - 22959909
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  || ||||||    
T  22960016 agcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatct 22959917  T
Q  109 tgttgacc 116  Q
    ||||||||    
T  22959916 tgttgacc 22959909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 20443685 - 20443619
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctca 70  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  20443685 gctagtgcgcaacaagtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgctca 20443619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15919082 - 15919021
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgct 68  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  15919082 agagcacaacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaactttttgct 15919021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3671 - 3301
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3671 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 3572  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3571 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 3472  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3471 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 3372  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3371 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 235 - 379
Target Start/End: Original strand, 43871 - 44015
Alignment:
Q  235 tcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgc 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  43871 tcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgt 43970  T
Q  335 aattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43971 aattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtg 44015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  306 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 10913408 - 10913778
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10913408 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 10913507  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10913508 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 10913607  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10913608 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 10913707  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913708 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 10913778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2158173 - 2157803
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2158173 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatct 2158074  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2158073 tgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 2157974  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2157973 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 2157874  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157873 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 2157803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5131597 - 5131225
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5131597 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 5131498  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5131497 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 5131398  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5131397 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 5131298  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5131297 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 5131225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 11421316 - 11421688
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11421316 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 11421415  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11421416 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 11421515  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11421516 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 11421615  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11421616 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaccctctgacttgcttctcggtctgtg 11421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10845221 - 10844851
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10845221 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 10845122  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10845121 cttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacag 10845022  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10845021 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 10844922  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10844921 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Original strand, 16514967 - 16515337
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16514967 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 16515066  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16515067 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 16515166  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16515167 caggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcg 16515266  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16515267 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 2106702 - 2107072
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2106702 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 2106801  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2106802 tgttgaccaattacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 2106901  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2106902 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 2107001  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2107002 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtatgtg 2107072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5143871 - 5144249
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  5143871 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 5143970  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5143971 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 5144070  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5144071 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 5144170  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144171 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 5144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 26271617 - 26271995
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  26271617 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccag 26271716  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26271717 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 26271816  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26271817 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 26271916  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26271917 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 26271995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4202996 - 4202618
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  4202996 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgctctttctttccag 4202897  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4202896 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 4202797  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4202796 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaa 4202697  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4202696 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctaacttgcttctctgtctgtg 4202618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22145794 - 22145424
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  22145794 agcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatct 22145695  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22145694 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 22145595  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22145594 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 22145495  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22145494 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctaacttgtttctcggtctgtg 22145424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 26534412 - 26534782
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||    
T  26534412 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaatttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatct 26534511  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26534512 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 26534611  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26534612 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 26534711  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26534712 catgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtg 26534782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 26316379 - 26316757
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  26316379 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccag 26316478  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26316479 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 26316578  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  26316579 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaa 26316678  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26316679 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 26316757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26516391 - 26516029
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  26516391 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatct 26516292  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26516291 tgttgaccgagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaaca 26516192  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26516191 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 26516092  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516091 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 26516029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45390827 - 45390449
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  45390827 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 45390728  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45390727 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 45390628  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  45390627 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcag 45390528  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45390527 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 45390449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 4141785 - 4142155
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  4141785 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatct 4141884  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4141885 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 4141984  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4141985 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagt 4142084  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4142085 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 4142155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Original strand, 16446543 - 16446913
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16446543 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 16446642  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16446643 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 16446742  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16446743 caggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttccatacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcg 16446842  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  16446843 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaacctcttacttgtgtctcggtctg 16446913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26438856 - 26438486
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26438856 agcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatct 26438757  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438756 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 26438657  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438656 gataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 26438557  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26438556 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtg 26438486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 16748048 - 16748418
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16748048 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 16748147  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748148 tctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 16748247  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||     
T  16748248 ttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaa 16748347  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16748348 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctc 16748418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 26666445 - 26666823
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  26666445 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 26666544  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26666545 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtgg 26666644  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26666645 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 26666744  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26666745 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 26666823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3448905 - 3448535
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||     
T  3448905 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcc 3448806  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3448805 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 3448706  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3448705 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagt 3448606  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3448605 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 3448535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Original strand, 10842531 - 10842901
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10842531 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 10842630  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10842631 cttgttgacctattacgcaccccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaa 10842730  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10842731 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 10842830  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10842831 gtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaacctctaacttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16044911 - 16044550
Alignment:
Q  15 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgttga 114  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16044911 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttga 16044812  T
Q  115 ccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaat 214  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16044811 ccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggc-ttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaat 16044713  T
Q  215 tcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtg 314  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16044712 tcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtg 16044613  T
Q  315 agatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16044612 agatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 31560921 - 31561291
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  31560921 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 31561020  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31561021 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 31561120  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  31561121 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcag 31561220  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  31561221 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctc 31561291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11444486 - 11444116
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||  || ||||||    
T  11444486 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggtttcatct 11444387  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11444386 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 11444287  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11444286 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagt 11444187  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11444186 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 11444116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 24589073 - 24589443
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  24589073 agcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatct 24589172  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  24589173 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaaca 24589272  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24589273 agtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagt 24589372  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24589373 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 24589443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2776861 - 2776593
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2776861 caagctagagcacaacaagtcttcgcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 2776762  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2776761 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 2776662  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2776661 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 2776593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31127514 - 31127246
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31127514 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 31127415  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31127414 tctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 31127315  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31127314 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 31127246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 26512227 - 26512495
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26512227 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 26512326  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26512327 tctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 26512426  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26512427 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 26512495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 26681637 - 26681905
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26681637 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 26681736  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26681737 tctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 26681836  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26681837 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 26681905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 39209670 - 39209938
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39209670 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 39209769  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39209770 tctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 39209869  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39209870 ttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggttgatt 39209938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 45734912 - 45734652
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45734912 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 45734813  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45734812 tgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagca 45734713  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45734712 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggccgatt 45734652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Original strand, 31087161 - 31087421
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||    
T  31087161 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatct 31087260  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  31087261 tgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagca 31087360  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31087361 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgatt 31087421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 230 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621879
Alignment:
Q  230 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcggga 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  330 gatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 9621879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 5161984 - 5161907
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5161984 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 5161907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25727059 - 25726929
Alignment:
Q  46 tcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaaca 145  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| || ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  25727059 tcacaatcagtgaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccaagcacacagcccatagaatcatctaaca 25726960  T
Q  146 ctgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 176  Q
    | | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  25726959 cagtcaaatacatgatcaacggccttccttc 25726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 16127349 - 16127464
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  |    
T  16127349 caagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccgg 16127448  T
Q  101 tctcatcttgttgacc 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  16127449 tttcatcttgttgacc 16127464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 29090123 - 29090008
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  |    
T  29090123 caagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccgg 29090024  T
Q  101 tctcatcttgttgacc 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  29090023 tttcatcttgttgacc 29090008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16238085 - 16237975
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtct 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||||||||  || |    
T  16238085 gctaaagcacaacaagttttctcaagtatagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaataggagatagcgtgctctttctttccggttt 16237986  T
Q  104 catcttgttga 114  Q
    |||||||||||    
T  16237985 catcttgttga 16237975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 333
Target Start/End: Original strand, 1893193 - 1893438
Alignment:
Q  88 tctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtggga 187  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  1893193 tctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcctcccttcgaccggaggga 1893292  T
Q  188 cgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaa 287  Q
    | || || || ||||| | ||  ||    |||||||| ||||||||||  ||||| || ||  |||| |||||    |||| ||| | ||||| ||||||    
T  1893293 caagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctgtcaaaagctttctggcaatcttccgtccaaacaatcccttgatctttacggagtaacttgaa 1893392  T
Q  288 aatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatg 333  Q
     |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  1893393 tatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatg 1893438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43081872 - 43081494
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  43081872 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 43081773  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43081772 tctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 43081673  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43081672 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 43081573  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43081572 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtg 43081494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33296139 - 33295767
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33296139 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 33296040  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33296039 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 33295940  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33295939 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 33295840  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295839 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 33295767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33781100 - 33780728
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33781100 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 33781001  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33781000 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccag 33780901  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33780900 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 33780801  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780800 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 33780728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11552966 - 11552594
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11552966 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 11552867  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11552866 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 11552767  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11552766 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 11552667  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11552666 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtg 11552594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23629579 - 23629209
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23629579 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 23629480  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23629479 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 23629380  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23629379 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggt 23629280  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629279 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 23629209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 379
Target Start/End: Original strand, 24684697 - 24685066
Alignment:
Q  10 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24684697 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctt 24684796  T
Q  110 gttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcag 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24684797 gttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcag 24684896  T
Q  210 gtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24684897 gtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtc 24684996  T
Q  310 atgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24684997 atgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 24685066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 15655307 - 15655679
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  15655307 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcat 15655406  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15655407 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccag 15655506  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15655507 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 15655606  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655607 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 15655679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 22995668 - 22996038
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22995668 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 22995767  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22995768 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 22995867  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22995868 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 22995967  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22995968 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtg 22996038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18497268 - 18497646
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  18497268 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 18497367  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18497368 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 18497467  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18497468 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcag 18497567  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18497568 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtg 18497646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24973512 - 24973145
Alignment:
Q  12 acaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24973512 acaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgt 24973413  T
Q  112 tgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggt 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24973412 tgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggt 24973313  T
Q  212 aattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24973312 aattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcat 24973213  T
Q  312 gtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973212 gtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 24973145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3793158 - 3792780
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3793158 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 3793059  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3793058 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggggg 3792959  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  3792958 ctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacag 3792859  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3792858 gttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 3792780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28652859 - 28652481
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  28652859 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 28652760  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28652759 tctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 28652660  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28652659 ttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 28652560  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28652559 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtg 28652481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41678314 - 41677944
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41678314 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 41678215  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41678214 tgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 41678115  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41678114 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggt 41678015  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41678014 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctaacttgcttctcggtctgtg 41677944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34620135 - 34619757
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  34620135 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 34620036  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34620035 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcattaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 34619936  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34619935 ttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 34619836  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34619835 gttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 34619757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 40470093 - 40470463
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40470093 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 40470192  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40470193 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggggg 40470292  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40470293 ctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcag 40470392  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470393 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 40470463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22892074 - 22891707
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22892074 agagcacaacaagtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 22891975  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22891974 cttgttgaccaagtacgcatcccacggattcgtcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 22891875  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22891874 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcg 22891775  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggt 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22891774 gtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 8662018 - 8662396
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  8662018 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 8662117  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8662118 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 8662217  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8662218 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 8662317  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8662318 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 8662396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9321093 - 9320715
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  9321093 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccag 9320994  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9320993 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 9320894  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  9320893 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaa 9320794  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9320793 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 9320715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12135792 - 12135414
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  12135792 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccag 12135693  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12135692 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 12135593  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  12135592 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaa 12135493  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12135492 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 12135414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30033045 - 30032667
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  30033045 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 30032946  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30032945 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 30032846  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  30032845 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcag 30032746  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30032745 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 30032667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30155648 - 30155270
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  30155648 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 30155549  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30155548 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 30155449  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30155448 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 30155349  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30155348 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 30155270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30938244 - 30937874
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  30938244 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatct 30938145  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30938144 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagca 30938045  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30938044 ggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 30937945  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937944 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 30937874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33519997 - 33519619
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  33519997 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccag 33519898  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33519897 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 33519798  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33519797 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 33519698  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33519697 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 33519619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24586991 - 24586613
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24586991 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccag 24586892  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24586891 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 24586792  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24586791 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 24586692  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24586691 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 24586613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25203889 - 25203519
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||    
T  25203889 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcat 25203790  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25203789 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 25203690  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  25203689 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgca 25203590  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25203589 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25268044 - 25267674
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||    
T  25268044 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcat 25267945  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25267944 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 25267845  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  25267844 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgca 25267745  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25267744 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26484011 - 26483633
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  26484011 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccag 26483912  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26483911 tttcatcctgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 26483812  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  26483811 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaa 26483712  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26483711 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 26483633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30172078 - 30171708
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  30172078 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatct 30171979  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30171978 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 30171879  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30171878 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattccatacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggt 30171779  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30171778 catgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 30171708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31435081 - 31434703
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  31435081 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 31434982  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31434981 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 31434882  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31434881 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcag 31434782  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31434781 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 31434703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24727586 - 24727208
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24727586 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccag 24727487  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24727486 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 24727387  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24727386 ttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 24727287  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24727286 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 24727208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 379
Target Start/End: Original strand, 28956340 - 28956706
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  28956340 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgtt 28956439  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggta 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  28956440 gaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagta 28956539  T
Q  213 attcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatg 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28956540 attcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatg 28956639  T
Q  313 tgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28956640 tgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 28956706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 32592817 - 32593195
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  |    
T  32592817 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccgg 32592916  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32592917 tctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 32593016  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32593017 ttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 32593116  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32593117 gttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 32593195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 37668029 - 37668407
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  37668029 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 37668128  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37668129 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 37668228  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37668229 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 37668328  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37668329 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 37668407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37758592 - 37758222
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  37758592 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatct 37758493  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37758492 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 37758393  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  37758392 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagt 37758293  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37758292 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 37758222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 31822950 - 31823328
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  31822950 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 31823049  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31823050 tttcatcttgttgcccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 31823149  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31823150 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 31823249  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31823250 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 31823328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 37355186 - 37355564
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  37355186 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 37355285  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37355286 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 37355385  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37355386 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcag 37355485  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37355486 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 37355564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2514671 - 2514301
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  2514671 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatct 2514572  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  2514571 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaaca 2514472  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2514471 agtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 2514372  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2514371 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 2514301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 15755395 - 15755765
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  15755395 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgctctttctttccgg 15755494  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15755495 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgctaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 15755594  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15755595 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 15755694  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  15755695 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctc 15755765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18372077 - 18372455
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  18372077 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 18372176  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18372177 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 18372276  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  18372277 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaa 18372376  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18372377 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 18372455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 37767534 - 37767912
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  37767534 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 37767633  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37767634 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccagatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 37767733  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  37767734 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcag 37767833  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37767834 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 37767912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6877914 - 6877544
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||     
T  6877914 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcc 6877815  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6877814 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 6877715  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6877714 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagt 6877615  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6877614 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 6877544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 13321373 - 13321751
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||| ||    
T  13321373 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagataacatgctctttctttccag 13321472  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13321473 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 13321572  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  13321573 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcag 13321672  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13321673 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 13321751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5641397 - 5641027
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  5641397 agcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatct 5641298  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5641297 tgttgacccagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaaca 5641198  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5641197 agtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagt 5641098  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5641097 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 5641027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Original strand, 29887743 - 29888008
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29887743 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtct 29887842  T
Q  104 catcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttc 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  29887843 catcttattgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttc 29887942  T
Q  204 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29887943 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 29888008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33878747 - 33878480
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33878747 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 33878648  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33878647 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 33878548  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33878547 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcattcatcgttccatacaataggctgatt 33878480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Original strand, 13439234 - 13439494
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13439234 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 13439333  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13439334 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 13439433  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13439434 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 269
Target Start/End: Original strand, 18124968 - 18125227
Alignment:
Q  10 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18124968 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctt 18125067  T
Q  110 gttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcag 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18125068 gttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcag 18125167  T
Q  210 gtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18125168 gtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 18125227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Original strand, 9547258 - 9547520
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9547258 agagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 9547357  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9547358 cttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccag 9547457  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9547458 caggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 9547520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11327254 - 11326986
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11327254 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccag 11327155  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  11327154 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacaggttcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtgg 11327055  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11327054 ttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggttgatt 11326986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Original strand, 13183342 - 13183622
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||    
T  13183342 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgatctttctttccagtttcat 13183441  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13183442 cttgttgaccaattacacatcccacggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaa 13183541  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13183542 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaa 13183622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 132 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23895692 - 23895447
Alignment:
Q  132 ggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaa 231  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23895692 ggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataa 23895593  T
Q  232 gcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaga 331  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895592 gcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaga 23895493  T
Q  332 tgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23895492 tgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 351770 - 351933
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||  |||||||||| ||| || |||||||    
T  351770 caacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgtt 351869  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 176  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  351870 gaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtcaaatacatgatcaaaggccttccttc 351933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 15784271 - 15784605
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtct 103  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | ||| || || || |  |||||  |||  || |    
T  15784271 gctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggttt 15784370  T
Q  104 catcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttc 203  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||| |  || |||||||  |  ||||  |||||||| || ||||| || || |||| ||| || ||||||||    
T  15784371 catcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtacatgatcaaaggtctcccttcaactggagggatgagaatcggtggttc 15784470  T
Q  204 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggtt 303  Q
     |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||  |||||||||||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || |||    
T  15784471 tagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcattcttcggtccatacaataccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagtt 15784570  T
Q  304 gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaatt 338  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  15784571 gcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30897 - 30525
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30897 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 30798  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30797 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 30698  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30697 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 30598  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 30525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19674 - 19304
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19674 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 19575  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  19574 cttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaa 19475  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19474 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 19375  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19374 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctaacttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7570 - 7302
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7570 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 7471  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7470 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 7371  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7370 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 7302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 27605518 - 27605890
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27605518 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 27605617  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27605618 cctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 27605717  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27605718 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 27605817  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605818 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 27605890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18794305 - 18793935
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  18794305 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcc 18794206  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18794205 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 18794106  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18794105 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 18794006  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794005 catgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 18793935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14561225 - 14560855
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14561225 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 14561126  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14561125 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 14561026  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14561025 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 14560926  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14560925 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 14560855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18713093 - 18712715
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  18713093 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccag 18712994  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18712993 tctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 18712894  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18712893 ttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtag 18712794  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18712793 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtg 18712715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19691699 - 19691329
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19691699 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 19691600  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19691599 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagca 19691500  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19691499 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 19691400  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19691399 catatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtg 19691329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 2133873 - 2134245
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  2133873 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttccttccagtctcat 2133972  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2133973 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 2134072  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2134073 taggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcg 2134172  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2134173 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 2134245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29832935 - 29832557
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  29832935 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 29832836  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29832835 tttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 29832736  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29832735 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 29832636  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29832635 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 29832557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9358234 - 9357856
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  9358234 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 9358135  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9358134 tttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 9358035  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9358034 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcag 9357935  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9357934 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 9357856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 19204969 - 19205339
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  19204969 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccag 19205068  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19205069 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 19205168  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  19205169 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaa 19205268  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19205269 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctc 19205339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 28358559 - 28358929
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |  |    
T  28358559 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccgg 28358658  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  28358659 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtgg 28358758  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28358759 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 28358858  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28358859 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctc 28358929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31358137 - 31357759
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  31358137 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 31358038  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31358037 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 31357938  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  31357937 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcag 31357838  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31357837 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 31357759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33262343 - 33261965
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  33262343 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccgg 33262244  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33262243 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 33262144  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33262143 ttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacag 33262044  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33262043 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 33261965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 12089330 - 12089708
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  12089330 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 12089429  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12089430 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 12089529  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12089530 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 12089629  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12089630 gttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 12089708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19678048 - 19677678
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  19678048 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatct 19677949  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19677948 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 19677849  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19677848 gataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 19677749  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19677748 catgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 19677678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 31486486 - 31486856
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  31486486 agcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatct 31486585  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31486586 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaaca 31486685  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31486686 agtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggt 31486785  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31486786 catgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 31486856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 21344786 - 21345042
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21344786 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 21344885  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21344886 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcgaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 21344985  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggct 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  21344986 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccctacaagaggct 21345042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44564593 - 44564325
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44564593 caagctagaccacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 44564494  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44564493 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 44564394  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44564393 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttctatacaataggctgatt 44564325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 22077518 - 22077896
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  22077518 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcatcgtatattgggcttcgcagtcggtaaagttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccag 22077617  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  22077618 tctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtgg 22077717  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  22077718 ttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcag 22077817  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22077818 gttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 22077896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15771183 - 15770915
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15771183 caagctagagcacaacaagtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccag 15771084  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15771083 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 15770984  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15770983 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 15770915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33245970 - 33245893
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatt 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33245970 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatt 33245893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 19657954 - 19658031
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 84  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19657954 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 19658031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286632
Alignment:
Q  318 tatgaatcgggagatgcaattcaaacgcc-cgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 16286632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19844731 - 19844604
Alignment:
Q  46 tcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaaca 145  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || |||||||| || || || |    
T  19844731 tcacaatcggtgaacttcttactcaaatagtagatagcttgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaacacacagcccatggaatcttccaata 19844632  T
Q  146 ctgacaaatacaaaatcaaaggccttcc 173  Q
    |||  |||||||  |||||||| |||||    
T  19844631 ctgttaaatacatgatcaaaggtcttcc 19844604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22412547 - 22412432
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  |    
T  22412547 caagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccgg 22412448  T
Q  101 tctcatcttgttgacc 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  22412447 tttcatcttgttgacc 22412432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16768845 - 16768757
Alignment:
Q  88 tctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 176  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  16768845 tctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcctcccttc 16768757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14668633 - 14668261
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14668633 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 14668534  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14668533 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatacttccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 14668434  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14668433 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 14668334  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14668333 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaatctctgacttgcttctcggtctgtg 14668261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 34185612 - 34185984
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34185612 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 34185711  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34185712 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 34185811  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34185812 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcg 34185911  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185912 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 34185984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 14759960 - 14760330
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14759960 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 14760059  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14760060 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 14760159  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14760160 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggt 14760259  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760260 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 14760330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17016663 - 17016291
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17016663 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 17016564  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17016563 cctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 17016464  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17016463 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 17016364  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016363 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 17016291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24116277 - 24115907
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24116277 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 24116178  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24116177 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagca 24116078  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24116077 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 24115978  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24115977 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 24115907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54837014 - 54836636
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  54837014 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccag 54836915  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54836914 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 54836815  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54836814 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 54836715  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836714 gttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 54836636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5009498 - 5009120
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  5009498 caagccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 5009399  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5009398 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 5009299  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5009298 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcag 5009199  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5009198 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 5009120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6573473 - 6573103
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  6573473 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatct 6573374  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6573373 tgttgaccaagtacacaacccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 6573274  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6573273 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 6573174  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6573173 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 6573103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 20335075 - 20335441
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  20335075 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatct 20335174  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20335175 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagca 20335274  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20335275 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 20335374  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335375 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 20335441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 24589015 - 24589385
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24589015 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagttatcatgttctttctttccagtctcatct 24589114  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24589115 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagca 24589214  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24589215 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 24589314  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24589315 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtg 24589385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 36341163 - 36341541
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  36341163 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgttctttctttccag 36341262  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36341263 tttcatcttgttgacccagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 36341362  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36341363 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattccatacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 36341462  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36341463 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtg 36341541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 18313830 - 18314202
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||    
T  18313830 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcat 18313929  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18313930 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 18314029  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18314030 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 18314129  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18314130 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 18314202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 7 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1903871 - 1903500
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1903871 agagcacaacaagtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 1903772  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1903771 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 1903672  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  1903671 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttccatacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcg 1903572  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1903571 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27159963 - 27160341
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  27159963 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 27160062  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27160063 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 27160162  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  27160163 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcag 27160262  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27160263 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 27160341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 15281595 - 15281959
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15281595 caacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgtt 15281694  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggta 212  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15281695 gaccaagtacgcatcccacgaattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggta 15281794  T
Q  213 attcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatg 312  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15281795 aatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatg 15281894  T
Q  313 tgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15281895 tgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 31123158 - 31123536
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  31123158 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccag 31123257  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31123258 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 31123357  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31123358 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 31123457  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31123458 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 31123536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15231489 - 15231117
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15231489 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataacgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccagtctcat 15231390  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15231389 cttgttgaccaagtacgcatcccacggattcattaaacactgacaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 15231290  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15231289 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 15231190  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15231189 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtg 15231117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21973324 - 21972946
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  21973324 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccag 21973225  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21973224 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 21973125  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21973124 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 21973025  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21973024 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 21972946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39854260 - 39853890
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  39854260 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 39854161  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854160 tttcatcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 39854061  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||    
T  39854060 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcag 39853961  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39853960 gttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 39853890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 18797260 - 18797630
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18797260 caagctagagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 18797359  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18797360 tctcatcttgttgtccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 18797459  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18797460 ttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcag 18797559  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797560 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 18797630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30757383 - 30757005
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  30757383 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccgg 30757284  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30757283 tttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 30757184  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30757183 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 30757084  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30757083 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 30757005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 40102283 - 40102661
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  40102283 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 40102382  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40102383 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 40102482  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  40102483 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcag 40102582  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40102583 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 40102661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14102166 - 14101788
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  14102166 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 14102067  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14102066 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 14101967  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  14101966 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaa 14101867  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14101866 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 14101788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 33670454 - 33670824
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  33670454 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagataacatgttctttctttccagtttcatct 33670553  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33670554 tgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 33670653  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33670654 gataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 33670753  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33670754 catgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 33670824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 15388024 - 15388402
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  15388024 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcatcgtatatcgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcaaatagtagatagcatgctctttctttccag 15388123  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    |||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  15388124 tcttgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactatcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtgg 15388223  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  15388224 ttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcag 15388323  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15388324 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 15388402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 333
Target Start/End: Original strand, 22146227 - 22146547
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||  |||||||||| ||| || |||||||    
T  22146227 caacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgtt 22146326  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggta 212  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| | ||  ||    
T  22146327 gaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtcaagtacatgatcaaaggccttccttcaactggagggaccagaatcggaggttctaacaaata 22146426  T
Q  213 attcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatg 312  Q
        |||||||||||||||||||  ||||| || ||  |||| || ||   ||||| ||| | ||||| |||||| |||||||| || || || |||||     
T  22146427 ccctttgatgctatcaaaagctttctggcaatcttccgtccaaacgatcccctgatctttacggagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcata 22146526  T
Q  313 tgagatatgaatcgggagatg 333  Q
    || || ||||||| |||||||    
T  22146527 tgggagatgaatctggagatg 22146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 287
Target Start/End: Original strand, 24459636 - 24459687
Alignment:
Q  236 cttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24459636 cttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaa 24459687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 14725445 - 14725560
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  |    
T  14725445 caagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccgg 14725544  T
Q  101 tctcatcttgttgacc 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  14725545 tttcatcttgttgacc 14725560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19767962 - 19767847
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||  |    
T  19767962 caagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccgg 19767863  T
Q  101 tctcatcttgttgacc 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  19767862 tttcatcttgttgacc 19767847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 1881757 - 1881920
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| || || |  |||||||||| |||||| |||||||    
T  1881757 caacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgtt 1881856  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 176  Q
    |||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  1881857 gacccaacacacaacccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcctcccttc 1881920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9646 - 9268
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  9646 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccag 9547  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9546 tctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 9447  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9446 ttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcag 9347  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346 gttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16185 - 15813
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16185 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 16086  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16085 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 15986  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15985 cagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcg 15886  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15885 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 7 - 376
Target Start/End: Original strand, 16204686 - 16205055
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16204686 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 16204785  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16204786 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 16204885  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16204886 caggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcg 16204985  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtct 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204986 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaacctctgacttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10948689 - 10948311
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  10948689 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 10948590  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10948589 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 10948490  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10948489 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 10948390  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10948389 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 10948311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 7 - 371
Target Start/End: Original strand, 21894400 - 21894765
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattt-tctttctttctagtctca 105  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||  || |||    
T  21894400 agagcacaacaagtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcagtgctctttctttccggtttca 21894499  T
Q  106 tcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttcca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21894500 tcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 21894599  T
Q  206 gcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21894600 gcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgc 21894699  T
Q  306 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894700 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 21894765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3644748 - 3644366
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagttt-cacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttcta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3644748 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagttttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttcca 3644649  T
Q  100 gtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtg 199  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3644648 gtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtg 3644549  T
Q  200 gttccagcaggtaattc-ttgatgctatcaaaagcttc-ttggcattcatcattccatacaataggctgatt-ttttctgagtagcttgaaaatcggccc 296  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||    
T  3644548 gttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattccatacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggccc 3644449  T
Q  297 gcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3644448 gcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 3644366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 41789956 - 41790326
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  41789956 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccag 41790055  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41790056 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 41790155  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  41790156 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacag 41790255  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41790256 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctc 41790326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51641830 - 51641452
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  51641830 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccag 51641731  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51641730 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 51641631  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  51641630 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaa 51641531  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  51641530 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 51641452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10966277 - 10965907
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  10966277 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccag 10966178  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10966177 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 10966078  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||    
T  10966077 ttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacag 10965978  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10965977 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgcttctc 10965907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20464582 - 20464212
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20464582 agagcacaacaagtcttttcaagtatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 20464483  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20464482 cttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaacactgacaaatacataattaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccag 20464383  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20464382 caggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcg 20464283  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20464282 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagacttgtttctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28588597 - 28588219
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  28588597 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccgg 28588498  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28588497 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 28588398  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  28588397 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacag 28588298  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28588297 gttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 28588219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28153348 - 28153080
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28153348 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccag 28153249  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28153248 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtgg 28153149  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28153148 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggctgatt 28153080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 78 - 374
Target Start/End: Original strand, 20339024 - 20339320
Alignment:
Q  78 gatagcattttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttcc 177  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20339024 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttccttcc 20339123  T
Q  178 acgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctga 277  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20339124 acgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctga 20339223  T
Q  278 gtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggt 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20339224 gtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 20337068 - 20337142
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagata 81  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20337068 agagcacaacaagttttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagata 20337142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22489623 - 22489458
Alignment:
Q  11 cacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttg 110  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||    
T  22489623 cacaacaagttttctcaagtactgaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttg 22489524  T
Q  111 ttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 176  Q
    ||| || | ||| || |||||||| ||  | || ||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  22489523 ttggcccaacacacagcccatggaatctcccaatactgttaaatacatgatcaaaggtcttccttc 22489458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 22837 - 23215
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  22837 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccag 22936  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22937 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 23036  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||     
T  23037 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaa 23136  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23137 gttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 23215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9632 - 9254
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  9632 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 9533  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9532 tttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 9433  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9432 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 9333  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9332 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13178 - 12803
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtct 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  13178 gctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagttt 13079  T
Q  104 catcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttc 203  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13078 catcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttc 12979  T
Q  204 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggtt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12978 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggtt 12879  T
Q  304 gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12878 gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 11574 - 11952
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  11574 caagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccag 11673  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11674 tttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 11773  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11774 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 11873  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11874 gttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 11952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11559 - 11181
Alignment:
Q  1 caagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  11559 caagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccgg 11460  T
Q  101 tctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtgg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11459 tttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 11360  T
Q  201 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11359 ttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcag 11260  T
Q  301 gttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11259 gttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 11181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9649 - 9279
Alignment:
Q  7 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9649 agagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 9550  T
Q  107 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  9549 cttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacagatacataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccag 9450  T
Q  207 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcg 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9449 caggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttccatacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcg 9350  T
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9349 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaagcctctgacttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 5833 - 6203
Alignment:
Q  9 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||     
T  5833 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcc 5932  T
Q  109 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5933 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaaca 6032  T
Q  209 ggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggt 308  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6033 agtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggt 6132  T
Q  309 catgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6133 catgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 6203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23111
Alignment:
Q  307 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 23111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 78 - 374
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1643
Alignment:
Q  78 gatagcattttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttcc 177  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1347 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttccttcc 1446  T
Q  178 acgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctga 277  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1447 acgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctga 1546  T
Q  278 gtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggt 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1547 gtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 377
Target Start/End: Original strand, 5320 - 5693
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtct 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  5320 gctagagcacagcaagtcttctcaagcatcgtataccgaatttcgcagtcggtaaacttcttgcttagatagtagatggcatgctctttctttccagtct 5419  T
Q  104 catcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttc 203  Q
    | ||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  5420 cgtcttgttgacccaatacacatcccatagattcatcaaacactgatagatacatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctc 5519  T
Q  204 cagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggtt 303  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5520 taacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttcataccacaggttgatttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtg 5619  T
Q  304 gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 377  Q
    || ||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5620 gcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaacctctgacttgcttctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 43384 - 43762
Alignment:
Q  14 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttc-acagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttcttt-ctagtctcat-cttg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||    
T  43384 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttctacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttcttttccagtctcattcttg 43483  T
Q  111 ttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaataca-aaatc-aaaggccttccttccacgggtgggacgaggat-aggtggttccagc 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43484 ttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataaatcaaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagc 43583  T
Q  208 aggtaa-ttcttgatgctat--caaaagcttcttggcattca--tcattccatacaatagg-ctgattttttct-gagtagcttgaaaatcggcccgcag 300  Q
    |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  43584 aggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatacaataggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcag 43683  T
Q  301 g-ttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaa-ttcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc-ttctcggtct 376  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43684 gtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaacctctgacttgctttctcggtct 43762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 271 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1155
Alignment:
Q  271 tttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttct 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1263 tttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttct 1164  T
Q  371 cggtctgtg 379  Q
    |||||||||    
T  1163 cggtctgtg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33699
Alignment:
Q  304 gcggtcatgtgagatat-gaa-tcgggagatgcaattcaaacgccc-gaggaaacctctgacttgcttctcg 372  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttgtttctcg 33699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 4573 - 4736
Alignment:
Q  13 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcattttctttctttctagtctcatcttgtt 112  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||  |||||||||| ||| || |||||||    
T  4573 caacaagttttctcaagcatagagtatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgtt 4672  T
Q  113 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 176  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  4673 gaccaagcacgcaacccatagaatcatccaacacagtcaagtacatgatcaaaggcattccttc 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 34889 - 34959
Alignment:
Q  4 gctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagata 74  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  34889 gctagagcacaacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgcttagata 34959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 365
Target Start/End: Original strand, 35168 - 35250
Alignment:
Q  283 ttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgcaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttg 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  35168 ttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaaccctcttacttg 35250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University