View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18198_high_4 (Length: 391)

Name: NF18198_high_4
Description: NF18198
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18198_high_4
NF18198_high_4
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-372)||(9218297-9218668)
chr1 (1-372)||(9199781-9200152)
chr1 (1-369)||(9170217-9170585)
chr1 (1-369)||(9118693-9119061)
chr1 (12-369)||(9161391-9161748)
chr1 (1-369)||(9155479-9155847)
chr1 (15-369)||(9229185-9229539)
chr1 (12-361)||(1843107-1843456)
chr1 (12-361)||(1857118-1857467)
chr1 (12-361)||(1868716-1869065)
chr1 (12-235)||(1815703-1815926)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (108-145)||(41703820-41703857)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (108-169)||(40573369-40573430)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9218668 - 9218297
Alignment:
Q  1 tttccgacttcggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9218668 tttccgacttcggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcgacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgca 9218569  T
Q  101 aacacatcaattaaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9218568 aacacatcaattaaccgaaaaaagtgatgtgtatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaa 9218469  T
Q  201 gagaccattagtcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9218468 gagaccattagtcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaag 9218369  T
Q  301 agattaaggaggtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacctagtatgaggg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9218368 agattaaggaggtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacctagtatgaggg 9218297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9200152 - 9199781
Alignment:
Q  1 tttccgacttcggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgca 100  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9200152 tttctgactttggagcttccagattggttccacttgatcaaacagagatagcaacaatggtgcaaggaacacttggatacttagatcccgagtatatgca 9200053  T
Q  101 aacacatcaattaaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaa 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9200052 aacacatcaactaaccgagaaaagtgatgtttatagctttggagtggttcttgcagagcttctaacaggtgacaaacctctttcttttaacaggcaagaa 9199953  T
Q  201 gagaccattagtcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaag 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9199952 gaaaccattagtcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttggatgatgaaaacaagaaag 9199853  T
Q  301 agattaaggaggtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacctagtatgaggg 372  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9199852 agattaaggaggttgctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacctagtatgaggg 9199781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9170585 - 9170217
Alignment:
Q  1 tttccgacttcggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9170585 tttccgacttcggagcttcaagattggttccacttgatcaaacagagatagcaacaatggtgcaaggaacacttggatacttagatcccgagtatatgca 9170486  T
Q  101 aacacatcaattaaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9170485 aacacataaattaaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgacaaacctctttcttttaataggccagaa 9170386  T
Q  201 gagaccattagtcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||    
T  9170385 gagaccattagtcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaattttttgaagctattcaagttggatttgtgaacgatgataacaagaaag 9170286  T
Q  301 agattaaggaggtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacctagtatga 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9170285 agattaaggaggttgctattcttgcttcaaggtgtttaagacttagaggggatgaaagaccttgtatga 9170217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 9118693 - 9119061
Alignment:
Q  1 tttccgacttcggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgca 100  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9118693 tttccgatttcggagcttccaaattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacagtggtacaaggaacacttggatacttagacccagagtacatgca 9118792  T
Q  101 aacacatcaattaaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaa 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9118793 aacgcatcaattaaccgagaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgacaaacctcttgattttaacaggccagaa 9118892  T
Q  201 gagaccattagtcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  9118893 gagaccattagtcttgctatgcacttcttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgaagctattcaagttggaattttgaatgatgataacaaggaag 9118992  T
Q  301 agattaaggaggtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacctagtatga 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  9118993 agattaaggaggttgctattcttgcagcaaggtgtttgagacttcgaggagaggaaagacctagtatga 9119061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9161748 - 9161391
Alignment:
Q  12 ggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgcaaacacatcaat 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  9161748 ggagcttcgaggttggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggttacttagatccggagtatatgcaaacacatcaac 9161649  T
Q  112 taaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaagagaccattag 211  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  9161648 taacagagaaaagtgatgtttatagctttggtgtagttcttgcagagcttcttacgggagacaaacctctttcttttaataggccagaagagaatatcag 9161549  T
Q  212 tcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaagagattaaggag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9161548 tcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagatagaatttttgaagctattcaagttggtattttaaatgatgaaaacaaggaggagattaaggag 9161449  T
Q  312 gtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacctagtatga 369  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9161448 gttgctattcttgcagcaaggtgtttgagactaagaggggatgaaaggcctagcatga 9161391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9155847 - 9155479
Alignment:
Q  1 tttccgacttcggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgca 100  Q
    ||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9155847 tttccgattttggagcttcgaggttagttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggttcaaggaactcttggatacctagatccagagtatatgca 9155748  T
Q  101 aacacatcaattaaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaa 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||    
T  9155747 aactcatcaattaaccgagaaaagtgatgtctatagctttggagtagtgcttgcggagcttctgacaggagataaacctctatcttttaataggccagaa 9155648  T
Q  201 gagaccattagtcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaag 300  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |    
T  9155647 gagagtattagtcttgcaatgcactttttgtcttgtttaaaacaagatagaatttttgaagctattcaagttggtatcttaaatgatgaaaacaaggagg 9155548  T
Q  301 agattaaggaggtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacctagtatga 369  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9155547 agattaaagaggttgctattctggcagcacggtgtttacgacttcgaggtgaggaaagacctagtatga 9155479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9229539 - 9229185
Alignment:
Q  15 gcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgcaaacacatcaattaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  9229539 gcttcaagattggttccacttgatcatactatgatagccactgtggtacaaggaactcttggctatttagatccagaatatatgcaaacacaccaactaa 9229440  T
Q  115 ccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaagagaccattagtct 214  Q
    | || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || |  |||||| |||||||||| || |||||||| | ||  || ||    
T  9229439 cagagaaaagtgatgtttatagcttcggggtagtactggcagagctcctaacgggggagaaacctatttcttttaatagaccagaagaaaacagaagcct 9229340  T
Q  215 tgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaagagattaaggaggtt 314  Q
    ||| || ||||| || |||||||||| | |  || |  | | ||| | | |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  9229339 tgcaattcacttcttatcttgtttaagagagaatcatgtgtctgaagttcttcaagttggtattttgaatgatgagaacaaggaggagattaaggaagtt 9229240  T
Q  315 tctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacctagtatga 369  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  9229239 gctattcttgctgcaaggtgcttgagacttaaaggcgaggaaagacctagcatga 9229185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 361
Target Start/End: Original strand, 1843107 - 1843456
Alignment:
Q  12 ggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgcaaacacatcaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1843107 ggagcttcaagattggttccaattgatcaaactgaaatagccacaatggtgcaaggaactattggctacttagatccagagtatatgcaaacaagtcaat 1843206  T
Q  112 taaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaagagaccattag 211  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |  |||||| ||| ||||   ||||| |||||||  |  ||    
T  1843207 taactgaaaaaagtgatgtctatagctttggagtagttcttgtagagttgctaacgggggagaaacctttttgttttggtaggccggaagagagaagaag 1843306  T
Q  212 tcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaagagattaaggag 311  Q
    |||||| ||| | ||  | ||||| || ||| |||||||  | ||||| | |||||||| |||  | |  ||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  1843307 tcttgcaatgaatttactatcttgattgaaaaaagataatgtgtttgaagttattcaagatggtttgtggaatgaagaaaacaaacaagagatcaaggag 1843406  T
Q  312 gtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacc 361  Q
    ||  || ||||||| || | |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  1843407 gtggctgttcttgcggcgaagtgtttgagacttagaggggaagaaagacc 1843456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 361
Target Start/End: Original strand, 1857118 - 1857467
Alignment:
Q  12 ggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgcaaacacatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1857118 ggagcttcaagattggttccacttgatcaaactgaaatagccacaatggtgcaaggaactattggctacttagatccagagtatatgcaaacaagtcaat 1857217  T
Q  112 taaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaagagaccattag 211  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | || || || |  |||||| ||| ||||   ||||| ||||| |  |  ||    
T  1857218 taactgaaaaaagtgatgtctatagctttggagtagttcttgtggagttgctgacgggggagaaacctttttgttttggtaggccggaagaaagaagaag 1857317  T
Q  212 tcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaagagattaaggag 311  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| || ||| | |||||  | ||||| | |||||||| |||  | |  ||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  1857318 tcttgctatgcattttctatcttgcttgaaaaaggataatgtatttgaagttattcaagatggtttgtggaatgaagaaaacaaacaagagatcaaggag 1857417  T
Q  312 gtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacc 361  Q
    ||  || ||||||| || | |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  1857418 gtggctgttcttgcggcgaagtgtttgagacttagaggggaagaaagacc 1857467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 361
Target Start/End: Original strand, 1868716 - 1869065
Alignment:
Q  12 ggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgcaaacacatcaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1868716 ggagcttcaagattggttccacttgatcaaactgaaatagccacaatggtgcaaggaactattggctacttagatccagagtatatgcaaacaagtcaat 1868815  T
Q  112 taaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaagagaccattag 211  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || || || |  |||||| ||| ||||   ||||| ||||| |  |  ||    
T  1868816 taactgaaaaaagtgatgtctatagctttggagtagttcttgtagagttgctgacgggggagaaacctttttgttttggtaggccggaagaaagaagaag 1868915  T
Q  212 tcttgctatgcactttttgtcttgtttaaaacaagataaactttttgatgctattcaagttggaattttcaatgatgaaaacaagaaagagattaaggag 311  Q
    |||||| ||||| ||  | ||||| || ||| |||||||  | ||||| | |||||||| |||  | |  ||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  1868916 tcttgcaatgcatttactatcttgattgaaaaaagataatgtatttgaagttattcaagatggtttgtggaatgaagaaaacaaacaagagatcaaggag 1869015  T
Q  312 gtttctattcttgctgcaaggtgtttaagacttagaggtgatgaaagacc 361  Q
    ||  || ||||||| || | |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  1869016 gtggctgttcttgcggcgaagtgtttgagacttagaggggaagaaagacc 1869065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1815926 - 1815703
Alignment:
Q  12 ggagcttcaagattggttccacttgatcaaaccgagatagcaacaatggtacaaggaactcttggatacttagatccagagtatatgcaaacacatcaat 111  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||    
T  1815926 ggagcatcaaggttgattccacttgatcaaactgaagtagccacaatggtgcaaggaactattggctacttggatccagagtatatgcaaacaagccaat 1815827  T
Q  112 taaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacaggtgccaaacctctttcttttaacaggccagaagagaccattag 211  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||| ||| ||||   ||||| |||||||  |  ||    
T  1815826 taactgagaaaagtgatgtatatagctttggagtagttcttgtggagctgctaacgggggagaaacctttttgttttggtaggccggaagagagaagaag 1815727  T
Q  212 tcttgctatgcactttttgtcttg 235  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  1815726 tcttgctacgcactttttatcttg 1815703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41703857 - 41703820
Alignment:
Q  108 caattaaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagt 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41703857 caattaaccgataaaagtgatgtttatagctatggagt 41703820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 40573369 - 40573430
Alignment:
Q  108 caattaaccgaaaaaagtgatgtttatagctttggagtagttcttgcagagcttctaacagg 169  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  40573369 caattaacagagaagagtgatgtttatagatttggagtagtcctagcagagctactgacagg 40573430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University