View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18205_low_1 (Length: 735)

Name: NF18205_low_1
Description: NF18205
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18205_low_1
NF18205_low_1
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (234-721)||(2041-2528)
scaffold0234 (234-721)||(10932-11419)
scaffold0234 (142-198)||(2564-2620)
scaffold0234 (142-198)||(11455-11511)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (234-721)||(24695186-24695673)
chr5 (236-721)||(19714218-19714703)
chr5 (234-721)||(18569581-18570070)
chr5 (240-721)||(19706939-19707419)
chr5 (354-599)||(39538708-39538953)
chr5 (238-721)||(17285470-17285935)
chr5 (300-634)||(18806843-18807175)
chr5 (238-721)||(17298621-17299088)
chr5 (240-545)||(22546912-22547217)
chr5 (239-494)||(27347425-27347679)
chr5 (559-725)||(27347252-27347417)
chr5 (614-721)||(24701950-24702057)
chr5 (405-721)||(20941018-20941329)
chr5 (405-721)||(25805385-25805696)
chr5 (405-721)||(31890-32201)
chr5 (405-721)||(12789663-12789974)
chr5 (405-721)||(22941241-22941552)
chr5 (405-721)||(23545913-23546224)
chr5 (405-721)||(24933306-24933617)
chr5 (416-709)||(20100255-20100543)
chr5 (405-721)||(31096807-31097118)
chr5 (361-721)||(5097598-5097953)
chr5 (234-343)||(39537962-39538071)
chr5 (405-721)||(12764990-12765305)
chr5 (405-721)||(7865430-7865745)
chr5 (405-721)||(9811733-9812048)
chr5 (405-721)||(12703874-12704189)
chr5 (496-634)||(18806483-18806619)
chr5 (496-634)||(18806663-18806799)
chr5 (142-198)||(24695709-24695765)
chr5 (240-343)||(31886537-31886640)
chr5 (405-721)||(26245093-26245404)
chr5 (636-725)||(28719471-28719558)
chr5 (472-721)||(18829281-18829530)
chr5 (142-198)||(19714742-19714798)
chr5 (142-198)||(19707462-19707518)
chr5 (482-725)||(26129689-26129928)
chr5 (142-198)||(27347722-27347778)
chr5 (260-546)||(33477193-33477479)
chr5 (640-721)||(39538954-39539035)
chr5 (139-197)||(39537867-39537925)
chr5 (150-198)||(18570108-18570156)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (234-721)||(18252030-18252517)
chr1 (234-721)||(18532234-18532721)
chr1 (234-721)||(27131130-27131616)
chr1 (236-721)||(27310297-27310782)
chr1 (236-721)||(16358755-16359240)
chr1 (234-721)||(3855639-3856126)
chr1 (240-721)||(36816354-36816834)
chr1 (236-593)||(21171081-21171438)
chr1 (240-721)||(27277278-27277756)
chr1 (440-721)||(22641594-22641871)
chr1 (234-554)||(22657108-22657429)
chr1 (268-643)||(12014084-12014457)
chr1 (371-721)||(23507037-23507385)
chr1 (246-523)||(9917837-9918106)
chr1 (405-721)||(19706439-19706750)
chr1 (405-721)||(43802365-43802676)
chr1 (405-721)||(28134723-28135034)
chr1 (405-721)||(9456107-9456418)
chr1 (405-721)||(20391239-20391550)
chr1 (405-721)||(20779645-20779956)
chr1 (405-721)||(22670257-22670568)
chr1 (405-721)||(42816989-42817300)
chr1 (528-721)||(9916497-9916689)
chr1 (268-519)||(12006461-12006712)
chr1 (405-721)||(22612483-22612794)
chr1 (414-701)||(633934-634216)
chr1 (405-721)||(8727658-8727969)
chr1 (405-721)||(47667485-47667785)
chr1 (142-198)||(18251936-18251992)
chr1 (142-198)||(18532757-18532813)
chr1 (405-546)||(35930573-35930713)
chr1 (142-198)||(27310821-27310877)
chr1 (482-705)||(29096789-29097008)
chr1 (608-721)||(28145723-28145835)
chr1 (142-198)||(16359280-16359336)
chr1 (489-621)||(21881475-21881604)
chr1 (142-198)||(21171479-21171535)
chr1 (469-634)||(24301691-24301855)
chr1 (422-548)||(26923553-26923678)
chr1 (240-309)||(30720625-30720694)
chr1 (150-195)||(36816881-36816926)
chr1 (489-542)||(51997353-51997406)
chr1 (142-198)||(3856164-3856220)
chr1 (142-194)||(22657469-22657521)
chr1 (142-198)||(27131652-27131704)
chr1 (264-341)||(3403248-3403325)
chr1 (264-341)||(3443494-3443571)
chr1 (574-654)||(12006332-12006413)
chr1 (141-198)||(27277800-27277857)
chr1 (560-619)||(10852402-10852461)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (234-721)||(7107-7594)
scaffold0433 (142-198)||(7015-7071)
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (234-721)||(26970463-26970950)
chr4 (234-721)||(55612683-55613170)
chr4 (234-721)||(19926480-19926967)
chr4 (234-721)||(26963640-26964127)
chr4 (234-721)||(10621053-10621540)
chr4 (236-721)||(18262214-18262699)
chr4 (234-721)||(5707320-5707807)
chr4 (234-721)||(10628132-10628619)
chr4 (234-721)||(868597-869084)
chr4 (234-721)||(5713948-5714435)
chr4 (236-721)||(28392854-28393339)
chr4 (236-721)||(18269070-18269560)
chr4 (246-721)||(8858179-8858654)
chr4 (246-721)||(8845215-8845690)
chr4 (236-721)||(4426336-4426808)
chr4 (240-721)||(5667849-5668327)
chr4 (240-721)||(35223576-35224047)
chr4 (242-725)||(20311299-20311781)
chr4 (1-141)||(27497478-27497618)
chr4 (489-721)||(10677303-10677534)
chr4 (489-721)||(10890943-10891174)
chr4 (234-349)||(12357136-12357251)
chr4 (405-721)||(15461488-15461799)
chr4 (405-721)||(34975542-34975853)
chr4 (236-705)||(5616215-5616681)
chr4 (260-620)||(21453961-21454319)
chr4 (405-721)||(2677004-2677315)
chr4 (405-721)||(15815012-15815323)
chr4 (405-721)||(18111043-18111354)
chr4 (272-546)||(56516094-56516368)
chr4 (405-721)||(3369023-3369334)
chr4 (405-721)||(17299959-17300270)
chr4 (405-721)||(18163153-18163464)
chr4 (405-721)||(20243928-20244239)
chr4 (405-721)||(26531604-26531915)
chr4 (240-458)||(10677538-10677753)
chr4 (240-458)||(10891178-10891393)
chr4 (405-721)||(4675983-4676294)
chr4 (415-721)||(5870419-5870720)
chr4 (405-721)||(1941715-1942026)
chr4 (414-705)||(19365519-19365806)
chr4 (396-721)||(32646523-32646846)
chr4 (482-704)||(19362477-19362695)
chr4 (489-721)||(9487625-9487853)
chr4 (405-619)||(32636475-32636685)
chr4 (405-705)||(5528495-5528790)
chr4 (142-198)||(5713856-5713912)
chr4 (142-198)||(19927003-19927059)
chr4 (142-198)||(26963548-26963604)
chr4 (142-198)||(26970371-26970427)
chr4 (139-198)||(12357041-12357100)
chr4 (418-496)||(24700213-24700291)
chr4 (3-139)||(27475737-27475870)
chr4 (3-127)||(27514752-27514873)
chr4 (501-721)||(30040489-30040705)
chr4 (142-198)||(5707228-5707284)
chr4 (142-198)||(10621576-10621632)
chr4 (144-198)||(868507-868561)
chr4 (489-705)||(9538033-9538244)
chr4 (141-198)||(10628655-10628712)
chr4 (405-636)||(4546071-4546298)
chr4 (142-198)||(17142372-17142428)
chr4 (142-198)||(55612594-55612650)
chr4 (142-196)||(28393380-28393434)
chr4 (3-126)||(27524386-27524506)
chr4 (142-198)||(4426847-4426903)
chr4 (142-198)||(18268976-18269032)
chr4 (3-127)||(27468485-27468607)
chr4 (504-721)||(11421096-11421309)
chr4 (283-349)||(39074279-39074346)
chr4 (593-643)||(24701361-24701411)
chr4 (3-80)||(27503827-27503904)
chr4 (470-624)||(33888594-33888743)
chr4 (382-451)||(39074190-39074259)
chr4 (149-198)||(55992680-55992729)
chr4 (272-450)||(30040740-30040919)
chr4 (461-588)||(34777850-34777975)
chr4 (390-472)||(9937933-9938015)
chr4 (157-198)||(5668371-5668412)
chr4 (612-693)||(9937745-9937826)
chr4 (150-198)||(8845118-8845166)
chr4 (150-198)||(8858082-8858130)
chr4 (158-198)||(18262136-18262176)
chr4 (284-343)||(11161913-11161972)
chr4 (144-198)||(20311207-20311261)
chr4 (405-450)||(11421007-11421052)
chr4 (289-409)||(38643968-38644089)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (234-721)||(6110064-6110551)
chr3 (236-721)||(16482203-16482688)
chr3 (234-721)||(10572312-10572799)
chr3 (234-721)||(15600604-15601091)
chr3 (234-721)||(15607149-15607636)
chr3 (236-717)||(18522665-18523146)
chr3 (240-721)||(10579075-10579556)
chr3 (240-721)||(17780838-17781319)
chr3 (234-721)||(8490488-8490982)
chr3 (234-721)||(15357306-15357793)
chr3 (237-721)||(13211305-13211789)
chr3 (234-721)||(13248607-13249094)
chr3 (236-721)||(18519980-18520462)
chr3 (253-721)||(15341939-15342407)
chr3 (236-725)||(17199900-17200389)
chr3 (240-721)||(32056619-32057101)
chr3 (236-721)||(13516813-13517294)
chr3 (240-721)||(1647241-1647726)
chr3 (234-721)||(29924971-29925458)
chr3 (234-721)||(29974124-29974611)
chr3 (340-721)||(17136465-17136840)
chr3 (236-721)||(16200434-16200917)
chr3 (240-452)||(19089734-19089946)
chr3 (241-703)||(24253130-24253589)
chr3 (236-473)||(16200128-16200363)
chr3 (234-395)||(18640792-18640953)
chr3 (405-721)||(21034229-21034540)
chr3 (405-721)||(15846536-15846847)
chr3 (405-721)||(20147554-20147865)
chr3 (414-721)||(21398792-21399094)
chr3 (405-721)||(55427012-55427323)
chr3 (414-721)||(14890391-14890693)
chr3 (405-721)||(12299902-12300212)
chr3 (405-721)||(25978728-25979039)
chr3 (358-623)||(14146965-14147226)
chr3 (489-687)||(15526827-15527021)
chr3 (236-298)||(18534758-18534820)
chr3 (142-198)||(6109972-6110028)
chr3 (142-198)||(8490396-8490452)
chr3 (142-198)||(13248515-13248571)
chr3 (361-721)||(11787534-11787889)
chr3 (142-198)||(13211211-13211267)
chr3 (142-198)||(18640989-18641045)
chr3 (563-721)||(28088251-28088408)
chr3 (141-198)||(17136136-17136193)
chr3 (417-721)||(15317176-15317472)
chr3 (453-582)||(28953965-28954093)
chr3 (397-499)||(9504446-9504548)
chr3 (142-192)||(10579603-10579653)
chr3 (142-198)||(15607672-15607729)
chr3 (236-281)||(18510924-18510969)
chr3 (141-198)||(18519884-18519941)
chr3 (142-198)||(15351237-15351293)
chr3 (142-198)||(15357829-15357885)
chr3 (142-198)||(16482727-16482782)
chr3 (142-198)||(17200427-17200483)
chr3 (455-647)||(32280313-32280507)
chr3 (142-192)||(10572840-10572890)
chr3 (142-198)||(15601127-15601184)
chr3 (141-198)||(32057144-32057201)
chr3 (142-198)||(1647768-1647824)
chr3 (142-198)||(13516719-13516775)
chr3 (142-198)||(17781358-17781414)
chr3 (142-198)||(19089985-19090041)
chr3 (410-525)||(8251933-8252048)
chr3 (568-683)||(30464147-30464261)
chr3 (142-198)||(18510829-18510885)
chr3 (142-198)||(18522570-18522626)
chr3 (150-198)||(18534671-18534719)
chr3 (141-198)||(29924878-29924935)
chr3 (141-198)||(29974031-29974088)
chr3 (560-624)||(36138033-36138097)
chr3 (385-460)||(19345720-19345795)
chr3 (361-451)||(27432532-27432622)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (234-721)||(29327784-29328271)
chr7 (236-717)||(15152445-15152926)
chr7 (234-721)||(11535782-11536269)
chr7 (234-721)||(11542700-11543187)
chr7 (236-721)||(12750828-12751313)
chr7 (240-721)||(12738542-12739023)
chr7 (236-721)||(18561009-18561485)
chr7 (236-727)||(18257559-18258047)
chr7 (240-721)||(13392157-13392637)
chr7 (236-455)||(15148144-15148363)
chr7 (405-721)||(2204543-2204854)
chr7 (405-721)||(18400095-18400406)
chr7 (405-721)||(18407079-18407390)
chr7 (405-721)||(48808496-48808807)
chr7 (414-721)||(8464999-8465301)
chr7 (405-721)||(15729742-15730053)
chr7 (405-721)||(18139338-18139649)
chr7 (405-721)||(19230879-19231190)
chr7 (405-709)||(30254129-30254428)
chr7 (481-721)||(2365169-2365407)
chr7 (482-721)||(41680968-41681203)
chr7 (256-452)||(2364917-2365112)
chr7 (267-492)||(7396221-7396450)
chr7 (240-710)||(39111819-39112275)
chr7 (405-721)||(10668901-10669213)
chr7 (405-709)||(47166871-47167170)
chr7 (308-547)||(3132748-3132986)
chr7 (415-699)||(24443349-24443628)
chr7 (489-721)||(34128647-34128875)
chr7 (406-636)||(19388544-19388774)
chr7 (405-721)||(28130552-28130863)
chr7 (433-523)||(10235361-10235451)
chr7 (412-699)||(25845498-25845780)
chr7 (412-699)||(25845917-25846199)
chr7 (405-683)||(19393462-19393735)
chr7 (371-537)||(7662569-7662734)
chr7 (142-198)||(2653275-2653331)
chr7 (142-198)||(11543223-11543279)
chr7 (142-198)||(12738443-12738499)
chr7 (482-721)||(18259124-18259359)
chr7 (415-523)||(47833875-47833983)
chr7 (142-198)||(11536305-11536361)
chr7 (142-198)||(12750733-12750789)
chr7 (142-198)||(15152350-15152406)
chr7 (414-514)||(19859122-19859221)
chr7 (142-197)||(29327690-29327745)
chr7 (140-198)||(15148047-15148105)
chr7 (489-721)||(14591924-14592153)
chr7 (489-721)||(16011515-16011744)
chr7 (496-635)||(31190524-31190660)
chr7 (489-621)||(22969024-22969153)
chr7 (142-197)||(13392030-13392085)
chr7 (572-647)||(22948499-22948574)
chr7 (284-349)||(10234179-10234244)
chr7 (142-198)||(18258087-18258143)
chr7 (479-537)||(7396469-7396527)
chr7 (141-198)||(18560912-18560969)
chr7 (234-266)||(2653207-2653239)
chr7 (371-450)||(27906074-27906153)
chr7 (448-503)||(29983179-29983234)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (234-720)||(21940665-21941151)
chr8 (236-721)||(22171491-22171974)
chr8 (240-721)||(6094129-6094610)
chr8 (240-721)||(24642655-24643135)
chr8 (458-721)||(15326422-15326685)
chr8 (458-721)||(15506791-15507054)
chr8 (236-435)||(28554885-28555084)
chr8 (580-721)||(28548393-28548534)
chr8 (356-654)||(14983710-14984004)
chr8 (246-705)||(38232115-38232570)
chr8 (240-367)||(24636860-24636987)
chr8 (405-721)||(8371253-8371564)
chr8 (405-721)||(21969324-21969635)
chr8 (405-721)||(12562114-12562425)
chr8 (409-606)||(24797224-24797419)
chr8 (405-721)||(27007517-27007828)
chr8 (405-721)||(27014660-27014971)
chr8 (405-721)||(27880487-27880798)
chr8 (405-721)||(28020668-28020979)
chr8 (264-541)||(32872741-32873019)
chr8 (405-721)||(22130609-22130920)
chr8 (405-721)||(25611186-25611497)
chr8 (415-721)||(22659494-22659795)
chr8 (405-721)||(21916667-21916978)
chr8 (405-721)||(45534273-45534584)
chr8 (405-721)||(26240475-26240786)
chr8 (405-624)||(18835341-18835556)
chr8 (255-523)||(2375027-2375300)
chr8 (482-721)||(6430953-6431188)
chr8 (490-636)||(8781959-8782102)
chr8 (142-198)||(21940573-21940629)
chr8 (142-198)||(22070108-22070164)
chr8 (614-711)||(24796731-24796826)
chr8 (142-198)||(6094031-6094087)
chr8 (142-198)||(22171396-22171452)
chr8 (142-194)||(24642556-24642608)
chr8 (405-721)||(2962932-2963247)
chr8 (559-705)||(20535226-20535371)
chr8 (142-198)||(28554791-28554847)
chr8 (417-511)||(29645537-29645631)
chr8 (608-726)||(36970439-36970556)
chr8 (608-725)||(2375411-2375528)
chr8 (272-335)||(10920234-10920297)
chr8 (414-521)||(36970265-36970371)
chr8 (390-488)||(24535471-24535569)
chr8 (572-694)||(29645675-29645797)
chr8 (461-513)||(10920427-10920479)
chr8 (142-195)||(2374947-2375000)
chr8 (660-721)||(8968015-8968076)
chr8 (142-179)||(24636605-24636642)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (234-721)||(6654-7141)
scaffold0390 (234-721)||(13670-14157)
scaffold0390 (142-198)||(7177-7233)
scaffold0390 (142-198)||(14193-14249)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (234-721)||(27380972-27381459)
chr6 (234-721)||(27471355-27471842)
chr6 (236-721)||(17684189-17684674)
chr6 (234-721)||(17691160-17691647)
chr6 (234-721)||(29308890-29309377)
chr6 (234-721)||(29315850-29316336)
chr6 (236-721)||(11651725-11652210)
chr6 (236-721)||(188697-189182)
chr6 (236-504)||(16566257-16566525)
chr6 (482-721)||(27296877-27297116)
chr6 (448-721)||(16394165-16394438)
chr6 (480-717)||(25536915-25537152)
chr6 (236-704)||(13359010-13359474)
chr6 (499-720)||(16559193-16559414)
chr6 (236-452)||(25537148-25537364)
chr6 (273-538)||(20553492-20553755)
chr6 (257-543)||(27925772-27926062)
chr6 (405-721)||(16789062-16789373)
chr6 (405-721)||(22859888-22860199)
chr6 (405-721)||(27508347-27508658)
chr6 (417-711)||(2669476-2669768)
chr6 (405-721)||(1586108-1586419)
chr6 (405-707)||(27527947-27528244)
chr6 (272-618)||(17850321-17850663)
chr6 (272-636)||(20736413-20736773)
chr6 (405-721)||(14074471-14074782)
chr6 (405-677)||(18019885-18020152)
chr6 (253-652)||(8509941-8510338)
chr6 (405-699)||(10359073-10359360)
chr6 (405-721)||(8612906-8613221)
chr6 (376-537)||(28172698-28172859)
chr6 (144-198)||(17691683-17691737)
chr6 (142-198)||(27381495-27381551)
chr6 (142-198)||(27471878-27471934)
chr6 (142-198)||(29308798-29308854)
chr6 (142-198)||(29315758-29315814)
chr6 (142-198)||(17684712-17684768)
chr6 (142-196)||(11651630-11651684)
chr6 (608-721)||(33317055-33317167)
chr6 (405-509)||(13995151-13995254)
chr6 (482-721)||(17120505-17120740)
chr6 (142-198)||(25537405-25537461)
chr6 (482-624)||(21994655-21994794)
chr6 (412-624)||(19218427-19218630)
chr6 (428-549)||(19347092-19347212)
chr6 (413-593)||(22560311-22560487)
chr6 (580-643)||(28172899-28172963)
chr6 (565-704)||(28756145-28756283)
chr6 (241-296)||(31258065-31258120)
chr6 (489-636)||(5758565-5758709)
chr6 (150-198)||(13359512-13359560)
chr6 (150-198)||(16566563-16566611)
chr6 (412-624)||(4073574-4073781)
chr6 (142-198)||(189221-189280)
chr6 (156-198)||(16394484-16394526)
chr6 (250-315)||(22259925-22259990)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (234-721)||(18288-18774)
scaffold0220 (142-198)||(18196-18252)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (234-721)||(21329968-21330455)
chr2 (234-721)||(18796506-18796993)
chr2 (236-727)||(18619807-18620296)
chr2 (268-721)||(36270199-36270650)
chr2 (268-709)||(18822115-18822556)
chr2 (299-721)||(20977957-20978360)
chr2 (371-721)||(22183206-22183553)
chr2 (409-707)||(6991847-6992146)
chr2 (405-721)||(30174368-30174679)
chr2 (405-721)||(24250032-24250343)
chr2 (354-523)||(18851977-18852146)
chr2 (391-546)||(19279445-19279600)
chr2 (405-721)||(24229215-24229526)
chr2 (240-450)||(19692525-19692737)
chr2 (482-709)||(15342014-15342237)
chr2 (415-723)||(29800468-29800775)
chr2 (558-721)||(17241034-17241196)
chr2 (142-198)||(21330493-21330549)
chr2 (420-523)||(36801899-36802003)
chr2 (414-636)||(19616435-19616653)
chr2 (574-654)||(36799745-36799826)
chr2 (489-623)||(40301034-40301164)
chr2 (416-523)||(28741220-28741326)
chr2 (654-721)||(41661694-41661761)
chr2 (491-696)||(41316305-41316506)
chr2 (354-450)||(12098609-12098705)
chr2 (489-624)||(21626824-21626955)
chr2 (560-636)||(28740910-28740986)
chr2 (485-548)||(28718943-28719006)
chr2 (405-523)||(24763751-24763868)
chr2 (142-198)||(19692773-19692829)
chr2 (270-425)||(36802664-36802820)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (234-725)||(25706-26197)
scaffold0186 (142-197)||(26231-26286)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (234-702)||(993-1461)
scaffold0657 (142-198)||(901-957)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (236-725)||(5531-6013)
scaffold0063 (150-198)||(5444-5492)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (465-721)||(230111-230367)
scaffold0008 (236-417)||(230365-230545)
scaffold0008 (142-198)||(230584-230640)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (405-721)||(174-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (405-721)||(3675-3986)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (405-721)||(119721-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (405-709)||(12961-13260)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (405-683)||(130262-130535)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (405-721)||(67374-67685)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (405-624)||(8296-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (414-721)||(39988-40290)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (482-721)||(26609-26844)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (391-523)||(90033-90166)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (361-693)||(8678-9005)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (234-298)||(8446-8510)
scaffold0176 (142-198)||(8546-8602)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (142-198)||(23769-23825)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (531-721)||(102-288)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (142-198)||(16523-16579)
scaffold0326 (234-267)||(16615-16648)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (489-721)||(11526-11758)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (142-198)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (142-198)||(8944-9000)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (489-624)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (415-721)||(53766-54066)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (144-198)||(10202-10256)
scaffold0565 (253-284)||(10127-10158)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (142-178)||(1-37)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (263-499)||(92194-92432)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (142-194)||(5878-5930)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (453-544)||(45956-46051)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (405-450)||(15089-15134)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 2528 - 2041
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2528 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 2429  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 2329  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2328 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 2229  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2228 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 2129  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2128 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 11419 - 10932
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 11320  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11220  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11219 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11120  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11119 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11020  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11019 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2620 - 2564
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2620 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 2564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11511 - 11455
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11511 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 11455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 24695673 - 24695186
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695673 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 24695574  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695573 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcaataaagcatagagactattatgtaggtaga 24695474  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24695473 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 24695374  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695373 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 24695274  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695273 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 19714703 - 19714218
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714703 aaggcatttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 19714604  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714603 cccgttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 19714504  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714503 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 19714404  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714403 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 19714304  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19714303 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 18570070 - 18569581
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18570070 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18569971  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18569970 accccgttaaacataaggaaactactcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcataaagactattatgttggtaga 18569871  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcat 531  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18569870 ctgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccat 18569771  T
Q  532 gagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569770 gagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 18569671  T
Q  632 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569670 catgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 19707419 - 19706939
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19707419 catttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 19707320  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19707319 ttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatg 19707220  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19707219 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 19707120  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  19707119 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattgg 19707021  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707020 agtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 354 - 599
Target Start/End: Original strand, 39538708 - 39538953
Alignment:
Q  354 actattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacag 453  Q
    |||||||| ||| ||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||    
T  39538708 actattcttaaaatatccatagttaagctttattgtgaagtgggatatcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacag 39538807  T
Q  454 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagt 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  39538808 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagt 39538907  T
Q  554 tataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 599  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538908 tatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 238 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17285935 - 17285470
Alignment:
Q  238 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  17285935 ggcatttatttattgattttgttatgtttcaaaataataatctccagagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgaaaccc 17285836  T
Q  338 cattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 437  Q
     | |||||  ||||| | |||||| |||||||   ||||| |  ||||||| ||| |||||||  |||||||||||                ||||||||    
T  17285835 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgtgaattgggatagtattaaagcata----------------tagactga 17285752  T
Q  438 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 537  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  17285751 tgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaat 17285652  T
Q  538 actacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 636  Q
    |||||||||  ||||||||  | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  17285651 actacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggttt 17285555  T
Q  637 tggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
     ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285554 aggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 300 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 18807175 - 18806843
Alignment:
Q  300 tttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaa-actattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtggga 398  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||  |||||| |||||  ||    
T  18807175 tttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgagacaccattaaa-ataatggacattattcttaaagtatctatagtcaagcgttattgtgaagtaaga 18807077  T
Q  399 tatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 498  Q
    || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807076 taacaataaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 18806977  T
Q  499 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtat 597  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  18806976 agaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagtt-ttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtat 18806880  T
Q  598 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806879 tccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 238 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17299088 - 17298621
Alignment:
Q  238 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||    
T  17299088 ggcatttatttattgattttgttatgtttataaataataatatccagagaatagttagtccgattaatggaacattaagtgcgacttaatcgtgaaaccc 17298989  T
Q  338 cattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 437  Q
     | |||||  ||||| | |||||| |||||||   ||||| |  |||||||  ||||||||||  |||||||||||                ||||||||    
T  17298988 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgttaagtgggatagtattaaagcata----------------tagactga 17298905  T
Q  438 tgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    ||||||||  | |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  17298904 tgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgaga 17298805  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 634  Q
    ||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  17298804 atactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggt 17298708  T
Q  635 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
     | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298707 ttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 240 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22547217 - 22546912
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22547217 catttatttattcattttgttttattttaaaataataaaaccgctataatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaatcgtgagatctca 22547118  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    ||||| |||  || | |||| | |||||||  | ||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22547117 ttaaatatatggacattatttttaaagtattcgcagtcaaactttattgtgaagtgagataacattaaaatatagagactattatgtggatagaccgatg 22547018  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  22547017 atcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatac 22546918  T
Q  540 tacata 545  Q
    ||||||    
T  22546917 tacata 22546912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 239 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 27347679 - 27347425
Alignment:
Q  239 gcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccc 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||     
T  27347679 gcatttctttgttgattttgttttgattcaaaataataaagtccttagaataattaatctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc- 27347581  T
Q  339 attaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgat 438  Q
    |||||||  || || | |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||    
T  27347580 attaaacgaaaggacattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattttgtggataggccgat 27347481  T
Q  439 gatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 494  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347480 gatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 559 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 27347417 - 27347252
Alignment:
Q  559 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27347417 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgttttgtcacc 27347318  T
Q  659 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 725  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347317 attcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 614 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  614 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  714 gaatcatg 721  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 20941018 - 20941329
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20941018 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20941116  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  20941117 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 20941213  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  20941214 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 20941312  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20941313 gtacttgatgaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 25805696 - 25805385
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25805696 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25805598  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  25805597 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 25805501  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  25805500 ttacacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 25805402  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  25805401 gtacttgatgaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 31890 - 32201
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31890 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 31988  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  31989 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 32085  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  32086 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 32184  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  32185 gcacttgatgaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 12789974 - 12789663
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  12789974 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagt 12789876  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | |    
T  12789875 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctc 12789779  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  12789778 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 12789680  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12789679 gtacttgatgaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 22941241 - 22941552
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22941241 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagt 22941339  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22941340 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22941436  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  22941437 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 22941535  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  22941536 gtacttgatgaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 23545913 - 23546224
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23545913 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 23546011  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  23546012 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 23546108  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  23546109 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 23546207  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  23546208 gcacttgatgaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 24933617 - 24933306
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  24933617 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 24933519  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  24933518 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 24933422  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  24933421 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 24933323  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  24933322 gtacttgatgaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 416 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  416 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  516 tggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 615  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  616 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 709  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 31096807 - 31097118
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||    
T  31096807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagt 31096905  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  31096906 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 31097002  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  31097003 ttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 31097101  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  31097102 gtacttgatgaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 721
Target Start/End: Original strand, 5097598 - 5097953
Alignment:
Q  361 taaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 460  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||  | |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| |    
T  5097598 taaatgtatttgtagtcaagttttaatatgaattaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatag 5097697  T
Q  461 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 560  Q
    |||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||  | |||||  ||    
T  5097698 atat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-gaa 5097793  T
Q  561 agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccat 660  Q
    | ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  ||||    
T  5097794 attgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccat 5097892  T
Q  661 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    || ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  5097893 tctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtacatgatgaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 39537962 - 39538071
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39537962 acaagccatttctttaatgattttgttttgtttcaaaatggttaagtccttagaatagttggttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 39538061  T
Q  334 accccattaa 343  Q
    ||| ||||||    
T  39538062 acctcattaa 39538071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 12765305 - 12764990
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12765305 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12765207  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 601  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||   |  || |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  12765206 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcg 12765109  T
Q  602 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 701  Q
    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||    
T  12765108 ctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttga 12765010  T
Q  702 tgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  12765009 tgggtacttgatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 7865745 - 7865430
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7865745 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 7865647  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 601  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  7865646 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcg 7865549  T
Q  602 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 701  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  7865548 ctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttga 7865450  T
Q  702 tgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  7865449 tgggtacttgatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 9812048 - 9811733
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  9812048 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 9811950  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 601  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  |     
T  9811949 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcg 9811852  T
Q  602 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 701  Q
    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||    
T  9811851 ctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttga 9811753  T
Q  702 tgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  9811752 tgggtacttgatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 12704189 - 12703874
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12704189 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12704091  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 601  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  |     
T  12704090 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcg 12703993  T
Q  602 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 701  Q
    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||    
T  12703992 ctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttga 12703894  T
Q  702 tgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  12703893 tgggtacttgatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 496 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  496 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 594  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  595 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 634  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 496 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  496 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 594  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  595 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 634  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24695765 - 24695709
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695765 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 24695709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 343
Target Start/End: Original strand, 31886537 - 31886640
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||    
T  31886537 catttctttagtgattttgttttgtttcaaattaataaagtccttagaataattagttcatttaattgaacatcaagtacgacttaatcgtgagactcca 31886636  T
Q  340 ttaa 343  Q
    ||||    
T  31886637 ttaa 31886640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 26245093 - 26245404
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  26245093 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagt 26245191  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| | |||||||||    | |||||||| ||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | |    
T  26245192 aatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctc 26245288  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||    
T  26245289 ttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgg 26245387  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  26245388 gtacttgatgaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 636 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 725  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829281
Alignment:
Q  472 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataag 571  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  ||||||||   ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttat-gtaagttccataag 18829434  T
Q  572 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 670  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  671 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19714798 - 19714742
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714798 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 19714742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19707518 - 19707462
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19707518 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 19707462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| |||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  682 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 725  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27347778 - 27347722
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347778 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgcgtttggctttgtatcatg 27347722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 33477479 - 33477193
Alignment:
Q  260 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaac-tat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||| |||||||| | |  |||| |||||||| |||||| |||||  |  | | |    
T  33477479 tttgtttcaaaataataaagtccttacaatagttaggctgattaatggatcattaagtgtgatctaatcgtgagacctcattaatcataagcacgcttgt 33477380  T
Q  359 tctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 458  Q
    ||| ||| ||| |||| ||||||||||    ||||||| ||| || ||| || || | ||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||| || ||||    
T  33477379 tcttaaactatatgtattcaagttttacgatgaagtggaataacaataatgcgtaaaaactattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcat 33477280  T
Q  459 ggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 546  Q
    |||| | ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  33477279 ggat-atgaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttatacataattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 721
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Original strand, 39537867 - 39537925
Alignment:
Q  139 aggtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  39537867 aggtgttggattaagccctaatagccaatctatgttgactgagtttagctttgtatcat 39537925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18570156 - 18570108
Alignment:
Q  150 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18570156 taagctctaatagctaatctatattaattgggtttggctttgtatcatg 18570108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 18252030 - 18252517
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252030 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18252129  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252130 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18252229  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18252230 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18252329  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252330 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18252429  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252430 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 18532721 - 18532234
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532721 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18532622  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18532621 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtagataga 18532522  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18532521 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18532422  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532421 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18532322  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532321 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27131616 - 27131130
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131616 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27131517  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27131516 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 27131417  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131416 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27131317  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27131316 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta-cctaga 27131218  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131217 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27310782 - 27310297
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310782 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 27310683  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    | | || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27310682 cacgttgaacataaggaaactattcttaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 27310583  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310582 gatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 27310483  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310482 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 27310383  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310382 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 16359240 - 16358755
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16359240 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagaataacttaattgtgagac 16359141  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16359140 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtaaccctagtcaagctttattgagaaatggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 16359041  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359040 gatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16358941  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16358940 atactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatg 16358841  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358840 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 3856126 - 3855639
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3856126 acaaggcatttctttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagcccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 3856027  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| ||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  3856026 accccattaaacataaggacattattcttaaaatatttgtagtcaaactttattgtgaagtgggatattattaaagcatggagactattacgtgggtaga 3855927  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  3855926 ctgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatga 3855827  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3855826 gaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccattcgacccgaaaccactatgtaccctaga 3855727  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3855726 tgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggtactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 36816834 - 36816354
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  36816834 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaatagttcgtctgtttaatggaacattaagtataaattaattgtgagactccg 36816735  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36816734 ttaaacataaggacattattcttaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggataccattaaagcatagagactattatgtggatagactgatg 36816635  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  36816634 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 36816535  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816534 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttgg 36816436  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  36816435 agtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggtactccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 236 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21171438 - 21171081
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21171438 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttcatggaacattaaatataacttaattgtgagac 21171339  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21171338 cccgttgaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 21171239  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21171238 gatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 21171139  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171138 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27277756 - 27277278
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| || | ||||||| | ||||||       
T  27277756 catttctttgttgtttttgttttgtttcaaaataataacgtccctagaataattagtccatttaacggagcatta-gtgtgacttaatcgcgagacctt- 27277659  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||| |  ||||| | |||||| |||||||| ||||||| | ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27277658 ttaaccgaaatgacattattcttaaagtatccgtagtcaggctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattatgtgggtagaccgatg 27277559  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||| ||||||     
T  27277558 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatat 27277459  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27277458 tgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttgg 27277360  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27277359 agtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggtactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 440 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641594
Alignment:
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 234 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22657429 - 22657108
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgatttt-gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtga 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22657429 acaagacatttctttattgatttttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtctgtttaatggaacattaaatataacttaattgtga 22657330  T
Q  333 gaccccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtag 432  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  22657329 gacccctttaaacataaggacacaattcttaaagtgtctctagtcaagctttattctgaaatgagatatcattaaagcatagagactatcatgtggatag 22657230  T
Q  433 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatg 532  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  22657229 actgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatg 22657130  T
Q  533 agaatactacatagtaaaagtt 554  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  22657129 tgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 268 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 12014457 - 12014084
Alignment:
Q  268 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaagt 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||   |||||| |||      
T  12014457 aaaataataaagtcactagaatacatagtccgtttaatggaatattaagtgtaaattaatcgttagatcccattaaacataatgatgttattcttaaaac 12014358  T
Q  368 atctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 467  Q
    ||| ||||| ||| |||| || |||| ||||||  |||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  12014357 atccgtagttaagctttagtgtgaagagggatacgattaaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataagga 12014258  T
Q  468 gttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 567  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | ||||||   |||    
T  12014257 gttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tca 12014161  T
Q  568 taagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 643  Q
     |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014160 caagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 721
Target Start/End: Original strand, 23507037 - 23507385
Alignment:
Q  371 tgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 470  Q
    |||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23507037 tgtagtcatgatttagtgtgaagtgggatagcattaaagtatatagaatataaggtggatagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagtt 23507136  T
Q  471 atcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataa 570  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||| ||||| || |     | |||||||   |||||    
T  23507137 atcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagagaacgttgtgtaaaaag---cataa 23507233  T
Q  571 gatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 669  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| |||||| | ||| ||||        
T  23507234 gttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaatacc 23507333  T
Q  670 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507334 gtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 9918106 - 9917837
Alignment:
Q  246 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||       |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||  ||||||||     
T  9918106 tttattgattttgttttgttacaaaataataaagtcactt------ttagtttgtttaatcgaacattaagtataacttgatcacgaga-tccattaaat 9918014  T
Q  346 ataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 445  Q
    |||| || | |||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||    
T  9918013 ataaggacattattcttaaaatatctatagttaagctttattgttaagtgggatagcattgaagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcaca 9917914  T
Q  446 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 523  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917913 tctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 19706750 - 19706439
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19706750 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19706652  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  19706651 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 19706555  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  19706554 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 19706456  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  19706455 gtacttgatgaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 43802676 - 43802365
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43802676 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 43802578  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  43802577 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 43802481  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  43802480 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 43802382  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  43802381 gtacttgatgaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 28135034 - 28134723
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28135034 taaagcgtcgagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28134936  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  28134935 aatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 28134839  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  28134838 ttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 28134740  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  28134739 gtacttgatgaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 9456107 - 9456418
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9456107 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 9456205  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  9456206 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 9456302  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  9456303 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 9456401  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  9456402 gcacttgatgaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 20391550 - 20391239
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  20391550 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagt 20391452  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | |    
T  20391451 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctc 20391355  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20391354 ttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20391256  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20391255 gtacttgatgaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 20779956 - 20779645
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20779956 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20779858  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  20779857 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 20779761  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20779760 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20779662  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  20779661 gcacttgatgaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 22670568 - 22670257
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22670568 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22670470  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22670469 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22670373  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  22670372 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 22670274  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  22670273 gcacttgatgaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 42817300 - 42816989
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42817300 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 42817202  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  42817201 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 42817105  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  42817104 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 42817006  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  42817005 gcacttgatgaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 528 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 9916689 - 9916497
Alignment:
Q  528 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgt 625  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916689 tcatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgt 9916593  T
Q  626 accctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916592 accctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 268 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 12006712 - 12006461
Alignment:
Q  268 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||| || | |||| | |||      
T  12006712 aaaataataaagtccctagaatagttagtctatttaatggaatattaagtgtgccttaatcgtgagaccccatgaaacataaggacattattattaaaac 12006613  T
Q  368 atctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 467  Q
    ||  |||||||||  ||| || |||| |||||| ||||||| | |||||| | ||||||   |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||    
T  12006612 attcgtagtcaagccttagtgtgaagagggataacattaaaacttagagattgttatgtgcatagactgatgatcacaacttacgaatcattgataagga 12006513  T
Q  468 gttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 519  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006512 gttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 22612483 - 22612794
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22612483 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagt 22612581  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22612582 aatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22612678  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  22612679 ttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatgg 22612777  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
     ||||  ||||||||||    
T  22612778 ctacttgatgaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 414 - 701
Target Start/End: Original strand, 633934 - 634216
Alignment:
Q  414 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  633934 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 634032  T
Q  514 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 613  Q
    | |||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  634033 actggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 634129  T
Q  614 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 701  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  634130 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 8727658 - 8727969
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||| |||    
T  8727658 taaagcgtcgagactattatctatgtagactgatgactacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattagaagt 8727756  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||| |    
T  8727757 aatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataagagtgtatatcactc 8727853  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||| | ||||    
T  8727854 ttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatgg 8727952  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  8727953 gtacttgatgaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 47667785 - 47667485
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  47667785 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagt 47667687  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||           |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  47667686 aatatttatattggattgacccaccgtga-----------agt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 47667601  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  47667600 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 47667502  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  47667501 gtacttgatgaatcatg 47667485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 18251936 - 18251992
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251936 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18251992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18532813 - 18532757
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532813 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18532757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 546
Target Start/End: Original strand, 35930573 - 35930713
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  35930573 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 35930671  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 546  Q
    ||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  35930672 aatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27310877 - 27310821
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27310877 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 27310821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 705
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  682 atgactataaagttggttgatggg 705  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 608 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  608 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 707  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  708 ctccatgaatcatg 721  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16359336 - 16359280
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16359336 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggttaggatttgtatcatg 16359280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 621  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21171535 - 21171479
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21171535 tgttggagtaagctctaatagccaatctatatggattgagtttggctttgtatcatg 21171479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  469 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 567  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| |||||||| ||||||| |  |||||   |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  568 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 634  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  422 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 521  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  522 gatccgtcatgagaatactacatagta 548  Q
    || ||  | ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30720694 - 30720625
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaa 309  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  30720694 catttttttattggttttattttgttttaaaataataaagttcctggaataattagttcgtttaatggaa 30720625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36816926 - 36816881
Alignment:
Q  150 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatc 195  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816926 taagccctaatattcaatctatattgattgggtttggctttgtatc 36816881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 489 - 542
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactac 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3856220 - 3856164
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3856220 tgttggagtaggccctaatagccaatccatcttgattgggtttgactttgtatcatg 3856164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22657521 - 22657469
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 194  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22657521 tgttggagtaagccttaatagccaatatatattgattgagtttggctttgtat 22657469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27131704 - 27131652
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  27131704 tgttggaataagccctaatagccaatctat----gttgggtttggctttgtatcatg 27131652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 341
Target Start/End: Original strand, 3403248 - 3403325
Alignment:
Q  264 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 341  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3403248 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3403325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3443571 - 3443494
Alignment:
Q  264 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 341  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3443571 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3443494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  574 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 654  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27277857 - 27277800
Alignment:
Q  141 gtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||    
T  27277857 gtgttggagtaagccctaatagccaatctatgttaattatgtttgactttgtatcatg 27277800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  560 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 619  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 7107 - 7594
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7107 acaaggtatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatagaacattaagtataacttaattgtgag 7206  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7207 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 7306  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7307 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 7406  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7407 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacaactatgtaccctaga 7506  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 7015 - 7071
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7015 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgcatcatg 7071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 26970463 - 26970950
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970463 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 26970562  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970563 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26970662  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26970663 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26970762  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970763 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 26970862  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970863 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 55612683 - 55613170
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612683 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 55612782  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612783 accccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 55612882  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55612883 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 55612982  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612983 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 55613082  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613083 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 19926967 - 19926480
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926967 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 19926868  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926867 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 19926768  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19926767 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 19926668  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926667 gaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 19926568  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926567 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 26963640 - 26964127
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26963640 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26963739  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963740 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26963839  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26963840 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26963939  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963940 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 26964039  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964040 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 10621540 - 10621053
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621540 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10621441  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621440 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10621341  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10621340 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10621241  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621240 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 10621141  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621140 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Original strand, 18262214 - 18262699
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262214 aaggcatttctttattgattttgtttcgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18262313  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262314 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18262413  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18262414 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 18262513  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262514 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 18262613  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262614 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 5707320 - 5707807
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707320 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5707419  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707420 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5707519  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5707520 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5707619  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707620 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 5707719  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707720 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 10628619 - 10628132
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628619 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10628520  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628519 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatattattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10628420  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10628419 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10628320  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628319 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 10628220  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628219 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 868597 - 869084
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868597 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 868696  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868697 accccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 868796  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  868797 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 868896  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 868996  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868997 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 5713948 - 5714435
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713948 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagcccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5714047  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714048 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5714147  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5714148 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5714247  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714248 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 5714347  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714348 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 28393339 - 28392854
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393339 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28393240  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28393239 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 28393140  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393139 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 28393040  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28393039 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatg 28392940  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28392939 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Original strand, 18269070 - 18269560
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgatttt-----gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269070 aaggcatttctttattgattttgttttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgt 18269169  T
Q  331 gagaccccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggt 430  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269170 gagaccccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggt 18269269  T
Q  431 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtca 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18269270 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcca 18269369  T
Q  531 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269370 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 18269469  T
Q  631 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269470 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 246 - 721
Target Start/End: Original strand, 8858179 - 8858654
Alignment:
Q  246 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8858179 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8858278  T
Q  346 ataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 445  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8858279 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8858378  T
Q  446 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8858379 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 8858478  T
Q  546 gtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 645  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858479 gtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 8858578  T
Q  646 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858579 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 246 - 721
Target Start/End: Original strand, 8845215 - 8845690
Alignment:
Q  246 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8845215 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8845314  T
Q  346 ataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 445  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8845315 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8845414  T
Q  446 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8845415 tctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 8845514  T
Q  546 gtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 645  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845515 gtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 8845614  T
Q  646 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845615 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 4426808 - 4426336
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426808 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 4426709  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4426708 cccgttaaacataaggaa-ctattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 4426610  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4426609 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 4426510  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426509 atactacatagtaaaatctatgaaaag------------ttctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 4426422  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426421 ttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 5668327 - 5667849
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||| |    
T  5668327 catttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctatttaatggagcattaagtgtgatttaatcgtgagaccc-a 5668229  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatct--gtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 437  Q
    |||||   || || | |||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||| |||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  5668228 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatatttgtagtcaagctttattgtgaaaagagataacattaaatcatagagactattatgtggatagaccga 5668129  T
Q  438 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 537  Q
    ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  5668128 tgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaat 5668031  T
Q  538 actacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgtt 637  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5668030 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacctgaaaccactatgtaccctagatgtt 5667931  T
Q  638 ggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5667930 g--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Original strand, 35223576 - 35224047
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| || |           
T  35223576 catttctttgttgattttgttttgttttaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtaa------- 35223668  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
       |||  || || | |||||| |||||||  ||||||||| |||||||  ||   ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  35223669 ---aacgaaaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgtaaaaaaggataacattaaagcatatagactattatgtgggtagacggatg 35223765  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  35223766 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatac 35223865  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35223866 tatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttgg 35223965  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35223966 agtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgtactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 242 - 725
Target Start/End: Original strand, 20311299 - 20311781
Alignment:
Q  242 tttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20311299 tttctttattgattttgttttgttttaaaataataaagtacttataatagttaatatgttcaatggagcattaaggtataacttaattgtgagaccccat 20311398  T
Q  341 taaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatga 440  Q
    ||||||||| || ||| || | ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  20311399 taaacataaggacactgtttttaaagtatttgttgtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatga 20311498  T
Q  441 tcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatact 540  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20311499 tcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatact 20311598  T
Q  541 acatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    ||||||  | ||||||   || | |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20311599 acatag--acagttat-gtaactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtagg 20311695  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 725  Q
    | |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311696 attcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 27497478 - 27497618
Alignment:
Q  1 gaacttctacagattttgatgatgcttgtctagcagttactgatgcccttagagtagcatgtaaacggaaacccatttttagttcttgtttgagagaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27497478 gaacttctacagattttgatgatgcttgtctagcagttactgatgcccttagagtagcatgtaaacggaaacccatttttagttcttgtttgagagaaga 27497577  T
Q  101 agaataaagaaaaaatctcaaatgtaactaaatacttgagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27497578 agaataaagaaaaaatctcaaatgtaactaaatacttgagg 27497618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 489 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 688  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  689 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 489 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 688  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  689 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 349
Target Start/End: Original strand, 12357136 - 12357251
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357136 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 12357235  T
Q  334 accccattaaacataa 349  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357236 accccattaaacataa 12357251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 15461488 - 15461799
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15461488 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15461586  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  15461587 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 15461683  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  15461684 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 15461782  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15461783 gtacttgatgaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 34975542 - 34975853
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34975542 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 34975640  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  34975641 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 34975737  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  34975738 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 34975836  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  34975837 gtacttgatgaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 705
Target Start/End: Original strand, 5616215 - 5616681
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||| | ||| |||  |||||     
T  5616215 aaggcatttctttattcattttgttttgtttcaaaataataaagttcctaaaataattagtctatttcttggaacattaagtctgactaaatcatgagat 5616314  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaa--gttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    ||| ||||||   | || | |||||| |||||||| || |||||  ||||||||  ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5616315 cccgttaaactagaggacattattcttaaagtatccgttgtcaaaggttttattatgaattgggatattaataaagcattgagactattatgtatgtaga 5616414  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
     |||||| |||||||||  | ||||  || | ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   | |||    
T  5616415 ttgatgaccacatctcatgggtcataaat-atgagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtga 5616513  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    |||||||||| |||  |  ||||  |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  5616514 gaatactacagagttta--ttat-gaaagtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctaga 5616610  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 705  Q
    || |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  5616611 tg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 260 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 21454319 - 21453961
Alignment:
Q  260 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactat 358  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  21454319 tttgtttcaaagtaataaagttcttagaatagttagtttgattaatggaacattaaaatgtgacttaatattgagaccccattaattataatgacattat 21454220  T
Q  359 tctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 458  Q
    | | ||| ||||| |||||||  ||||||| ||| || |||| || ||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||  ||||   ||| ||    
T  21454219 ttttaaaatatctatagtcaaactttattgtgaaatgagataacaataatgcataaagattattatgtgagtagattgatgatcatctctcgg-gataat 21454121  T
Q  459 ggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa 558  Q
    |||    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||      
T  21454120 ggactt-gagatatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgt 21454023  T
Q  559 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 620  Q
    ||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454022 aaaatatcataagatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 2677004 - 2677315
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2677004 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2677102  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  2677103 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 2677199  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  2677200 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 2677298  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  2677299 gcacttgatgaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 15815012 - 15815323
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15815012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15815110  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  15815111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 15815207  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  15815208 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 15815306  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  15815307 gcacttgatgaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 18111354 - 18111043
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18111354 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18111256  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18111255 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18111159  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18111158 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18111060  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  18111059 gcacttgatgaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 272 - 546
Target Start/End: Original strand, 56516094 - 56516368
Alignment:
Q  272 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaa-actattctaaaagtatc 370  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||  |  ||||| |||||||| | | |||||||||||||||  |||||| ||||  ||| | ||||||  |||||||    
T  56516094 taataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaa-catatagaacattattcttgaagtatc 56516192  T
Q  371 tgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 470  Q
    | |||||||| ||||||| |||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  56516193 tatagtcaagctttattgtgaataacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagtt 56516292  T
Q  471 atcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 546  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  56516293 atcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 3369334 - 3369023
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3369334 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3369236  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  3369235 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 3369139  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  3369138 ttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 3369040  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  3369039 gtacttgatgaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17300270 - 17299959
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17300270 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 17300172  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  17300171 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 17300075  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||     
T  17300074 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatga 17299976  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  17299975 gcacttgatgaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 18163153 - 18163464
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  18163153 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 18163251  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||| | ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  18163252 aatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 18163348  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18163349 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18163447  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  18163448 gtacttgatgaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 20243928 - 20244239
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  20243928 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 20244026  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  20244027 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 20244123  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20244124 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20244222  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20244223 gtacttgatgaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 26531604 - 26531915
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  26531604 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagt 26531702  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  26531703 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 26531799  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  26531800 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 26531898  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  26531899 gcacttgatgaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 10677753 - 10677538
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10677753 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10677655  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    ||||||  ||||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||||  | ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10677654 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagcttta--gtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10677557  T
Q  440 atcacatctcacagatcat 458  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10677556 atcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 10891393 - 10891178
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10891393 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10891295  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    ||||||  ||||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||||  | ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10891294 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagcttta--gtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10891197  T
Q  440 atcacatctcacagatcat 458  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10891196 atcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 4676294 - 4675983
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  4676294 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 4676196  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  4676195 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 4676099  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  4676098 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 4676000  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  4675999 gtacttgatgaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 415 - 721
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870720
Alignment:
Q  415 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  515 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 614  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 5870614  T
Q  615 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 714  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  5870615 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatg 5870713  T
Q  715 aatcatg 721  Q
    |||||||    
T  5870714 aatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 1941715 - 1942026
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1941715 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 1941813  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  1941814 aatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 1941910  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  1941911 ttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 1942009  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  1942010 gtacttgatgaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 414 - 705
Target Start/End: Original strand, 19365519 - 19365806
Alignment:
Q  414 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||  ||  ||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19365519 gagactattatatacgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgagtat-gagatattaaatctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19365617  T
Q  514 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca-tagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 612  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  19365618 actggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgtataccactcttagacct 19365714  T
Q  613 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 705  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365715 gaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 396 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 32646846 - 32646523
Alignment:
Q  396 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 495  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  32646846 ggataacattaaagaatgaagactattatgtggatatgttgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaat 32646747  T
Q  496 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 594  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||| ||||| |||||||  ||| |||||  | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||    
T  32646746 attaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtg 32646650  T
Q  595 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 694  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  32646649 tattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggatgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagt 32646550  T
Q  695 tggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
     |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646549 cggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 482 - 704
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  682 atgactataaagttggttgatgg 704  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 489 - 721
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 688  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  689 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 619
Target Start/End: Original strand, 32636475 - 32636685
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| ||||    
T  32636475 taaagcgtggagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagt 32636573  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |    
T  32636574 aatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactc 32636670  T
Q  605 ttcgacctgaaacca 619  Q
    | |||| ||||||||    
T  32636671 tccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 405 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 5528790 - 5528495
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| || ||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||| | ||||| |||  ||| ||| | || |  |||||| ||||||||||||||||    
T  5528790 taaagcgtatagactattatgtttgtagaattatgaccacatctcacgggtcatgaatac-gagatattatgtatatacataggtataaatattaggagt 5528692  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
     |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |    
T  5528691 gatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcataatgataatggtgtataacactc 5528595  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    ||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||| ||||    
T  5528594 ttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacaggataaccataatgttggttaatgg 5528496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 5713856 - 5713912
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713856 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 5713912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19927059 - 19927003
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927059 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 19927003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 26963548 - 26963604
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963548 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 26963604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 26970371 - 26970427
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970371 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 26970427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 198
Target Start/End: Original strand, 12357041 - 12357100
Alignment:
Q  139 aggtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12357041 aggtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggatttggctttgtatcatg 12357100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 418 - 496
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  418 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 496  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 27475737 - 27475870
Alignment:
Q  3 acttctacagattttgatgatgcttgtctagcagttactgatgcccttagagtagcatgtaaacggaaacccatttttagttcttgtttgagagaagaag 102  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| ||| | |||||| |||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||     
T  27475737 acttctactgattttgatgttgtttgtctagctgttaccgatcctcttagaatagagtttaaacggaaacccattttttgttattgtttgag---agaaa 27475833  T
Q  103 aataaagaaaaaatctcaaatgtaactaaatacttga 139  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27475834 aacaaataaaaaatctcaaatgtaactaaatatttga 27475870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27514873 - 27514752
Alignment:
Q  3 acttctacagattttgatgatgcttgtctagcagttactgatgcccttagagtagcatgtaaacggaaacccatttttagttcttgtttgagagaagaag 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||  | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||   ||    
T  27514873 acttctacagattttgatgttgcttgtctagctgttaccgatcctcttagaatagagtttaaacgaaaacccattttttgttattgtttgagaga---ag 27514777  T
Q  103 aataaagaaaaaatctcaaatgtaa 127  Q
    || ||| ||||||||||||||||||    
T  27514776 aacaaataaaaaatctcaaatgtaa 27514752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  501 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 600  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  601 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 700  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  701 atgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 5707228 - 5707284
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5707228 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgtgtttggctttgtatcatg 5707284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10621632 - 10621576
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10621632 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 10621576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Original strand, 868507 - 868561
Alignment:
Q  144 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868507 ttggaataaaccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 868561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 705
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttat-gaaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 688  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  689 taaagttggttgatggg 705  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10628712 - 10628655
Alignment:
Q  141 gtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10628712 gtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttgactttgtatcatg 10628655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 636
Target Start/End: Original strand, 4546071 - 4546298
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4546071 taaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 4546169  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| ||||  || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  4546170 aatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 4546266  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 636  Q
    || ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4546267 tttgacctaaaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17142428 - 17142372
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17142428 tgttggaaaaagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgtatcatg 17142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 55612594 - 55612650
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612594 tgttagaataagccctaataaccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 55612650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28393434 - 28393380
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatca 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28393434 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgtatca 28393380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27524506 - 27524386
Alignment:
Q  3 acttctacagattttgatgatgcttgtctagcagttactgatgcccttagagtagcatgtaaacggaaacccatttttagttcttgtttgagagaagaag 102  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||  || ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||     
T  27524506 acttctacagattttgattttgcttgactagacgttactgaaccctttagaatagtgtgtaaacggaaacccattttttgttatagtttgagagaagaac 27524407  T
Q  103 aataaagaaaaaatctcaaatgta 126  Q
    |    |||||||||||||||||||    
T  27524406 ag---agaaaaaatctcaaatgta 27524386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4426903 - 4426847
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4426903 tgttggagtaagtcctaatagccaatctatattgattgggtttggctctgtatcatg 4426847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 18268976 - 18269032
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18268976 tgttggaataagcccaaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 18269032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 27468485 - 27468607
Alignment:
Q  3 acttctacagattttgatgatgcttgtctagcagttactgatgcccttagagtagcatgtaaacggaaaccca-tttttagttcttgtttgagagaagaa 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||  |  ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||   ||||    
T  27468485 acttctacagattttgatgttgcttgtctagctgttaccgatcctcttagaatagagttgaaatggaaacccatttttttgttattgtttgag---agaa 27468581  T
Q  102 gaataaagaaaaaatctcaaatgtaa 127  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27468582 gaacaaataaaaaatctcaaatgtaa 27468607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 504 - 721
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  504 taatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 603  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  604 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 703  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  704 ggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39074346 - 39074279
Alignment:
Q  283 ctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa 349  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39074346 ctagaataattagtccgtttaaattgaacattaagtatgacttaatcatgagaccccattaaacataa 39074279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 643
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  593 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 643  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27503904 - 27503827
Alignment:
Q  3 acttctacagattttgatgatgcttgtctagcagttactgatgcccttagagtagcatgtaaacggaaacccattttt 80  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||  || ||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  27503904 acttctactgattttgatgttgtttgtctagctgttactgaaccctttagaatagtgtgtaaacggaaacccattttt 27503827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 624
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  470 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 569  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| ||  ||||| ||||| |||||  |  | ||||  ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  570 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 624  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 39074259 - 39074190
Alignment:
Q  382 tttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcac 451  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||    
T  39074259 tttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggagactattacgtgggttgattgttgatcacatctcac 39074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Original strand, 55992680 - 55992729
Alignment:
Q  149 ataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55992680 ataagccctaatagccaatttgtattgattgggtttgactttgtatcatg 55992729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 30040919 - 30040740
Alignment:
Q  272 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaa-actattctaaaa-gtat 369  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| | | ||||||| | |||||||  |||||   |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  30040919 taataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaa-cataaagaacactattcttaaatgtat 30040821  T
Q  370 ctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 450  Q
    || ||||||||  ||| |  ||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  30040820 ctatagtcaagcgttaatatgaattgggataataataaagcatcgagactattatgtatatagactgatgaccacatctca 30040740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  461 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 560  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |   | ||||  ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  561 agtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9938015 - 9937933
Alignment:
Q  390 gaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 472  Q
    |||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938015 gaagtgagatagcatcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5668412 - 5668371
Alignment:
Q  157 taatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5668412 taatagccaatctatattgattgtgtttggttttgtatcatg 5668371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 612 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  612 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 693  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Original strand, 8845118 - 8845166
Alignment:
Q  150 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8845118 taagtcctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 8845166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Original strand, 8858082 - 8858130
Alignment:
Q  150 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8858082 taagtcctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 8858130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 198
Target Start/End: Original strand, 18262136 - 18262176
Alignment:
Q  158 aatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18262136 aatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 18262176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11161972 - 11161913
Alignment:
Q  284 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaa 343  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  11161972 tagaatagttaatcagtttaatggaacacaaagtgtgacttaattgtgagactccattaa 11161913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Original strand, 20311207 - 20311261
Alignment:
Q  144 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20311207 ttggagtaagctgtaatagccaatctgtattcattggatttggctttgtatcatg 20311261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 450
Target Start/End: Original strand, 11421007 - 11421052
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 450  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421007 taaagcttcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 409
Target Start/End: Original strand, 38643968 - 38644089
Alignment:
Q  289 tagttagtccgtttaatggaacattaagta-taacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttatt 387  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||  ||| || ||||  | |||||| | ||||||| | ||||||| |||||||    
T  38643968 tagttagtccgttcaatgaaatattaagtaatgacttaattgtgagaccttattgaatataagaacactattattaaagtatttatagtcaaattttatt 38644067  T
Q  388 gagaagtgggatatcattaaag 409  Q
    | ||| |  |||| ||||||||    
T  38644068 gtgaactatgatagcattaaag 38644089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 6110064 - 6110551
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110064 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 6110163  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110164 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6110263  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6110264 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6110363  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110364 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 6110463  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110464 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 16482688 - 16482203
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482688 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16482589  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482588 cccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16482489  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16482488 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16482389  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482388 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 16482289  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482288 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 10572799 - 10572312
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572799 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10572700  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572699 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10572600  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10572599 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10572500  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10572499 gaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtaga 10572400  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572399 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 15601091 - 15600604
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601091 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15600992  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600991 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15600892  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15600891 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15600792  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600791 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15600692  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15600691 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 15607636 - 15607149
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607636 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15607537  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607536 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15607437  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15607436 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15607337  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607336 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15607237  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15607236 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 717
Target Start/End: Original strand, 18522665 - 18523146
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522665 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18522764  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522765 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcatttaagcatagagactattatgtaggtagact 18522864  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18522865 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaa 18522964  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522965 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 18523064  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523065 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 10579556 - 10579075
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579556 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgttaaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 10579457  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579456 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 10579357  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10579356 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 10579257  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579256 tacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 10579157  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579156 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17781319 - 17780838
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781319 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 17781220  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781219 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 17781120  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17781119 atcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 17781020  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781019 tacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 17780920  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780919 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 8490488 - 8490982
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490488 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 8490587  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagacta-------ttatgt 426  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  8490588 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactacagacgattatgt 8490687  T
Q  427 aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcc 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490688 aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcc 8490787  T
Q  527 gtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 626  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490788 gccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 8490887  T
Q  627 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490888 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 15357793 - 15357306
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357793 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15357694  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15357693 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtaga 15357594  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15357593 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatga 15357494  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357493 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15357394  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357393 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 237 - 721
Target Start/End: Original strand, 13211305 - 13211789
Alignment:
Q  237 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211305 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 13211404  T
Q  337 ccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactg 436  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211405 ccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactg 13211504  T
Q  437 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaa 536  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13211505 atgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 13211604  T
Q  537 tactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 636  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13211605 tattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgt 13211704  T
Q  637 tggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211705 tggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 13248607 - 13249094
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248607 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 13248706  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248707 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtattcgtagtcaagctttgttgagaagtgggataacattaaagcatagagactattatgtaggtaga 13248806  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13248807 ctgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatga 13248906  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13248907 gaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaacctaga 13249006  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249007 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Original strand, 18519980 - 18520462
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18519980 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18520079  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||   || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520080 cccgttaaacataaggaaactattcttaaa---tccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18520176  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18520177 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgaga 18520276  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18520277 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatg 18520376  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520377 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 253 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 15342407 - 15341939
Alignment:
Q  253 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatga 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15342407 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagtttgttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataagga 15342308  T
Q  353 aactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 452  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342307 acctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 15342208  T
Q  453 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 552  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15342207 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaa 15342108  T
Q  553 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 652  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342107 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 15342008  T
Q  653 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342007 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 17200389 - 17199900
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17200389 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgatac 17200290  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17200289 ccctttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagttaagctttattgagatgtgtgatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 17200190  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  17200189 gatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgaga 17200090  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17200089 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatg 17199990  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 725  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199989 ttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 32057101 - 32056619
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  32057101 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacatcaagtataactttattgtaagaccccg 32057002  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  32057001 ttaaacataaagaaactattcttaaagtgtccgtagtcaaactttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatg 32056902  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaata 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32056901 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 32056802  T
Q  539 ctacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttg 638  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056801 ctacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttg 32056702  T
Q  639 gagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32056701 gagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Original strand, 13516813 - 13517294
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516813 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttcatggaacattaagtataacttaattgtgagac 13516912  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13516913 cccgttaaacataaggaaacgattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcacagagactattatgtgggtagact 13517012  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13517013 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgaga 13517112  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517113 atactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 13517208  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13517209 ttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 1647726 - 1647241
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataa----cttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  1647726 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataattaacttaattgtgagac 1647627  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1647626 cccgttaaacataaggaaactatttttaaagtatccgtaatcaagctttattgagaaaagggatataattaaagcatagagactattatgtggatagact 1647527  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||    
T  1647526 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgaga 1647427  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1647426 atactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctaaaaccactatataccctagatg 1647327  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1647326 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagtactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 29924971 - 29925458
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29924971 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29925070  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  29925071 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29925170  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||    
T  29925171 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29925270  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  29925271 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctaga 29925370  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29925371 cgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 29974124 - 29974611
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29974124 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29974223  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  29974224 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29974323  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||    
T  29974324 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29974423  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  29974424 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctaga 29974523  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29974524 cgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 340 - 721
Target Start/End: Original strand, 17136465 - 17136840
Alignment:
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17136465 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatg 17136564  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17136565 atcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 17136658  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136659 tacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttgg 17136758  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17136759 agtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Original strand, 16200434 - 16200917
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200434 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200532  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
     ||| ||||||||| || | |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||    
T  16200533 tccaataaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatgtcattaaagcatgaagactatt-tgtggagagact 16200631  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||    
T  16200632 gatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgaga 16200731  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    |||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200732 atactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatg 16200831  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200832 ttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 240 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19089946 - 19089734
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19089946 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccct 19089847  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089846 ttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatg 19089747  T
Q  440 atcacatctcaca 452  Q
    |||||||||||||    
T  19089746 atcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 241 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 24253589 - 24253130
Alignment:
Q  241 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgaga-cccca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  24253589 atttctttattgattttgttttacttcaaaataataaagtccttagaatagctcgttcgtttgatggaacattaagtatgacttaatcgtgagatcccca 24253490  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24253489 tcaaacataaggacactattcttaaagtatatgtggtcaaaatttattgtaaagtgaggtaacattaaagcatagagactattatgtcggtagactaatg 24253390  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||     
T  24253389 atcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaataa 24253290  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |    
T  24253289 tgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cattcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatg 24253194  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 703  Q
    | |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253193 actcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 473
Target Start/End: Original strand, 16200128 - 16200363
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200128 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagttcgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200226  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||    
T  16200227 cccattaaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatatcattaaagcatggagactatt-tgtggagagact 16200325  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 473  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200326 gatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18640953 - 18640792
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640953 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18640854  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtg 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18640853 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtg 18640792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 21034229 - 21034540
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21034229 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21034327  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  21034328 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 21034424  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  21034425 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 21034523  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  21034524 gtacttgatgaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 15846847 - 15846536
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15846847 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15846749  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  15846748 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 15846652  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  15846651 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 15846553  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15846552 gtacttgatgaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 20147865 - 20147554
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20147865 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20147767  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  20147766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 20147670  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20147669 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20147571  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  20147570 gcacttgatgaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 414 - 721
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399094
Alignment:
Q  414 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  514 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 613  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21398987  T
Q  614 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 713  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21398988 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21399086  T
Q  714 gaatcatg 721  Q
    ||||||||    
T  21399087 gaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 55427012 - 55427323
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  55427012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 55427110  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  55427111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 55427207  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  55427208 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 55427306  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  55427307 gtacttgatgaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 414 - 721
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890693
Alignment:
Q  414 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  514 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 613  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  614 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 713  Q
    ||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  714 gaatcatg 721  Q
    ||||||||    
T  14890686 gaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 12299902 - 12300212
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  12299902 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagt 12299999  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  12300000 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 12300096  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  12300097 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 12300195  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12300196 gtacttgatgaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 25979039 - 25978728
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||| | | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  25979039 taaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataattattaggagt 25978941  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  25978940 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 25978844  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  25978843 ttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 25978745  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  25978744 gtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 623
Target Start/End: Original strand, 14146965 - 14147226
Alignment:
Q  358 ttctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatca 457  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||     || |||||||  | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||    
T  14146965 ttctaaatgtatctgtagtcaagctttaacataaattgggataataataaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtca 14147064  T
Q  458 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 557  Q
    ||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||  | |||||     
T  14147065 tggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggaggaatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatg 14147161  T
Q  558 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 623  Q
    |||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  14147162 aaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactcttagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 489 - 687
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||   | ||| |||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 687  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 298
Target Start/End: Original strand, 18534758 - 18534820
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18534758 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccatagaatagttagtcc 18534820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 6109972 - 6110028
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6109972 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 6110028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 8490396 - 8490452
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490396 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 8490452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 13248515 - 13248571
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248515 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 13248571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 721
Target Start/End: Original strand, 11787534 - 11787889
Alignment:
Q  361 taaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 460  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |  ||| | |||||  | |||||| | |||||||||||||| || ||||||| | | |||||||  | | || |    
T  11787534 taaatgtatctgtagtcaagctttaatatgaattaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataaccgcatctcattggttatag 11787633  T
Q  461 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 560  Q
    |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  |     
T  11787634 atat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gat 11787729  T
Q  561 agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccat 660  Q
    | | |||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  ||||    
T  11787730 attttcataagatattctcacaatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccat 11787828  T
Q  661 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    || ||||||||| ||||  |||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787829 tctaacgttgtctgtaaatggataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 13211211 - 13211267
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13211211 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 13211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18641045 - 18640989
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18641045 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgtgtttggctttgtatcatg 18640989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 563 - 721
Target Start/End: Original strand, 28088251 - 28088408
Alignment:
Q  563 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 662  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || || |||||||  ||||||    
T  28088251 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagggctttgttgccattc 28088349  T
Q  663 aaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
     ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088350 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 17136136 - 17136193
Alignment:
Q  141 gtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17136136 gtgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 17136193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 417 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 15317472 - 15317176
Alignment:
Q  417 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 516  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15317472 actattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatact 15317374  T
Q  517 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 616  Q
     ||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||    
T  15317373 agatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaa 15317277  T
Q  617 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 716  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  |||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  15317276 ccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacggataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaa 15317181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 453 - 582
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  453 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 551  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  552 gttataaaaagtgtcataagatattctcata 582  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 499
Target Start/End: Original strand, 9504446 - 9504548
Alignment:
Q  397 gatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 496  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  9504446 gatatctttaaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaata 9504545  T
Q  497 tta 499  Q
    |||    
T  9504546 tta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10579653 - 10579603
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10579653 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgt 10579603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15607729 - 15607672
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctata-ttgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15607729 tgttggaataagccctaatagccaatctatattttattgggtttggctttgtatcatg 15607672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 281
Target Start/End: Original strand, 18510924 - 18510969
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510924 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 18510969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 18519884 - 18519941
Alignment:
Q  141 gtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18519884 gtgttggagtaagtcctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 18519941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15351293 - 15351237
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15351293 tgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 15351237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15357885 - 15357829
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15357885 tgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 15357829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16482782 - 16482727
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482782 tgttagaataagccctaata-ccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 16482727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17200483 - 17200427
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17200483 tgttggagtaagccctaatagccaatctatgttgattgggtttggctttgtagcatg 17200427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 455 - 647
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  455 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 554  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| ||   ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  555 ataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 647  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10572890 - 10572840
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10572890 tgttggaataagccctaatagccaacctatattgattgggtttgactttgt 10572840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15601184 - 15601127
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctata-ttgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15601184 tgttggaataagccctaatagccaatctatattttattgggtttggatttgtatcatg 15601127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32057201 - 32057144
Alignment:
Q  141 gtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32057201 gtgttggagtaagctctaatagccaatctatgttgattgggtttgactttgtatcatg 32057144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1647824 - 1647768
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647824 tgttggagtaagccctaatagctggtctatattgattgggtttggctttgtatcatg 1647768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 13516719 - 13516775
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  13516719 tgttggagtaagccctaatagccaatctatgttgattgagtttggctgtgtatcatg 13516775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17781414 - 17781358
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  17781414 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttatatcatg 17781358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19090041 - 19089985
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  19090041 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttatatcatg 19089985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  410 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 509  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  510 ttatattggattgatc 525  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 683
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  568 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 667  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  668 ttgtccgtaacaggat 683  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 18510829 - 18510885
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18510829 tgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgagtttgattttgtatcatg 18510885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 18522570 - 18522626
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18522570 tgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgagtttgattttgtatcatg 18522626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Original strand, 18534671 - 18534719
Alignment:
Q  150 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18534671 taagccctaatagtcaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 18534719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 29924878 - 29924935
Alignment:
Q  141 gtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  29924878 gtgttggagtaagccctaatagtcgatctatattgattgagtttgacattgtatcatg 29924935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 29974031 - 29974088
Alignment:
Q  141 gtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  29974031 gtgttggagtaagccctaatagtcgatctatattgattgagtttgacattgtatcatg 29974088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 560 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  560 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 624  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 460
Target Start/End: Original strand, 19345720 - 19345795
Alignment:
Q  385 attgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 460  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||| || |||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19345720 attgtgaagtggtataacattaaagcgtaaagatcattatgtgggtatactgatgatcacgtctcatagatcatgg 19345795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 451
Target Start/End: Original strand, 27432532 - 27432622
Alignment:
Q  361 taaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcac 451  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||   || |||||||  | |||||| | |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27432532 taaaagtatccgtagtcgagttttattataaattgggataataataaagcgtggaggttattatgtatgtagattgatgatcacatctcac 27432622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 29327784 - 29328271
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327784 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29327883  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327884 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29327983  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29327984 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29328083  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328084 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29328183  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29328184 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 717
Target Start/End: Original strand, 15152445 - 15152926
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152445 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 15152544  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152545 cccgttaaacatacggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15152644  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152645 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 15152744  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152745 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 15152844  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152845 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 11536269 - 11535782
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11536269 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtacaacttaattgtgag 11536170  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536169 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11536070  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11536069 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11535970  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535969 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacattcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11535870  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535869 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 11543187 - 11542700
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11543187 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtcag 11543088  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543087 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11542988  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11542987 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11542888  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542887 gaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11542788  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542787 tgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Original strand, 12750828 - 12751313
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750828 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgagac 12750927  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    | | |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12750928 ctcgttaaacataaagaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagttggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagact 12751027  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12751028 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 12751127  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12751128 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatg 12751227  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12751228 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Original strand, 12738542 - 12739023
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||       
T  12738542 catttctttattgattttattttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtttgtttaatgaaacattaattataacttaattgtgagaccttg 12738641  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12738642 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaag 12738741  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12738742 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatac 12738841  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12738842 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgt 12738941  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738942 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Original strand, 18561009 - 18561485
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561009 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgagac 18561108  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561109 cccgttaaacattaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaggtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 18561208  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||    
T  18561209 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgaga 18561308  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18561309 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatg 18561399  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  18561400 ttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 236 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 18258047 - 18257559
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18258047 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgacttaattgtgagac 18257948  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||||||||||| || || | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||| |    
T  18257947 cccattaaacacaaggacattattcttaaagtatccgtagtcaagtttttttgttaagtaggataacaataatgcataaagactattatgtggatagatt 18257848  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||    
T  18257847 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcaga 18257748  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||| ||||||||  | || || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  18257747 atattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 18257650  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 727  Q
     |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  18257649 -tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtacttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Original strand, 13392157 - 13392637
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |    
T  13392157 catttctttgttgactttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaacaattagtctgcttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc-a 13392255  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||   || || | |||||| ||||||||  |||||||  ||||||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||  ||||    
T  13392256 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatcaatagtcaaactttattgtgaaaagggataacattaaaacatagagactattgtattggtagatcgatg 13392355  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||     
T  13392356 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatat 13392455  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13392456 tacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttgg 13392555  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392556 agtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 236 - 455
Target Start/End: Original strand, 15148144 - 15148363
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148144 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttgattgaacattaagtataacttaattgtgagac 15148243  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148244 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15148343  T
Q  436 gatgatcacatctcacagat 455  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15148344 gatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 2204543 - 2204854
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2204543 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2204641  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  2204642 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 2204738  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  2204739 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 2204837  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  2204838 gcacttgatgaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 18400095 - 18400406
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18400095 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18400193  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18400194 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18400290  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18400291 ttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18400389  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  18400390 gcacttgatgaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 18407079 - 18407390
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18407079 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18407177  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18407178 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18407274  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18407275 ttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18407373  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  18407374 gcacttgatgaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 48808807 - 48808496
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48808807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 48808709  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  48808708 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 48808612  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  48808611 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 48808513  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  48808512 gcacttgatgaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 414 - 721
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465301
Alignment:
Q  414 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  514 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 613  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  614 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 713  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  714 gaatcatg 721  Q
    ||||||||    
T  8465294 gaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 15729742 - 15730053
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  15729742 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 15729840  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  15729841 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 15729937  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  15729938 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 15730036  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15730037 gtacttgatgaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 18139649 - 18139338
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18139649 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagt 18139551  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18139550 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18139454  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  18139453 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgg 18139355  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  18139354 gtacttgatgaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 19230879 - 19231190
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19230879 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19230977  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  19230978 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 19231074  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  19231075 ttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 19231173  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  19231174 gtacttgatgaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 709
Target Start/End: Original strand, 30254129 - 30254428
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30254129 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30254227  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || |    
T  30254228 aatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactc 30254324  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  30254325 ttagacttgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 30254423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 481 - 721
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  481 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 580  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||   |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  581 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 679  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  680 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  682 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 452
Target Start/End: Original strand, 2364917 - 2365112
Alignment:
Q  256 ttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaac 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||  ||||| |     
T  2364917 ttgttatgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctttctaatggaacattaagtgtggcttaatcgtgagaacccattaaactaaatgacat 2365016  T
Q  356 tattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 452  Q
    |||||| ||| |||  ||||||||   |||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365017 tattcttaaaatattcgtagtcaa-ccttattgtgaaatgagataacattaaaacatagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 267 - 492
Target Start/End: Original strand, 7396221 - 7396450
Alignment:
Q  267 caaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaa 365  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||    
T  7396221 caaaataaaaatgtcgctagaatagttagttcatttaaatggaacattaagtatgacttaatcttgagaccctattaaacataagaaaattattcttaaa 7396320  T
Q  366 gtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgt---aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat 462  Q
      || ||||||||||  ||| || ||| |  |||   ||||||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7396321 acatatgtagtcaagccttagtgtgaaatacgatgatattaaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaat 7396420  T
Q  463 aaagagttatcaagtcttcacatagatata 492  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396421 aaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 710
Target Start/End: Original strand, 39111819 - 39112275
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    ||||  |     
T  39111819 catttctttattaattttgttttatttcaaaa-aataaagtccctagaatagcgagtccgtttaatgaaacattaagtacgacttaatcacaagacatct 39111917  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| || ||||||  |||| |||    |||| || ||||||| |||  |  ||| |||||||  ||||||||||||||   |||||||| |||    
T  39111918 ttaaacataaggacactatttcaaaaatattcacagtccagctttattgtgaaacgaaataacattaaaatatagagactattataagggtagactaatg 39112017  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
     | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||  |     | || ||||||||| ||    
T  39112018 gtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatttataccg----aacccatcatgagaaaac 39112113  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    |||||||  |  |||||| ||   || ||    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  39112114 tacatag--agtgttatacaa---gtgat----tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtagg 39112204  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 710  Q
    | || |||  |||||   | ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112205 aatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtctgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 10669213 - 10668901
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  10669213 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 10669115  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacc 603  Q
    |||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | |     
T  10669114 aatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgct 10669018  T
Q  604 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 703  Q
    ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||    
T  10669017 cttagacctgaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatg 10668919  T
Q  704 ggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  10668918 ggtacttgatgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 405 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 47167170 - 47166871
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  47167170 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagt 47167072  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  47167071 aatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 47166975  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  47166974 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 47166876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 308 - 547
Target Start/End: Original strand, 3132748 - 3132986
Alignment:
Q  308 aacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaa 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||| | ||||||| |||| || ||||||| |  ||| ||| | |  | |||    
T  3132748 aacattaagtgtaacttaattgtgagaccccattaaacataaggtcattattatgaaagtatttgtaatctagttttacttggaattggaaaaatagtaa 3132847  T
Q  408 agcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaat 507  Q
     ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  3132848 tgcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taat 3132946  T
Q  508 atttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 547  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3132947 atttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 415 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  415 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  515 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 614  Q
     | |||| | ||  | ||||| ||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttga 24443433  T
Q  615 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 699  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443432 aaccattatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 489 - 721
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||   ||||| | |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 688  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  689 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 406 - 636
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388774
Alignment:
Q  406 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 505  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  506 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 603  Q
    ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||   |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||     
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttat-gaaagtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccact 19388741  T
Q  604 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 636  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388742 cttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 28130552 - 28130863
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  28130552 taaagcgtcgagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagt 28130650  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| |||||||| ||    |||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||  ||  |    
T  28130651 aatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattc 28130747  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || ||||||||| |||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  28130748 ttagacctgaaatcactatgatccgtagatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 28130846  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  28130847 gtacttaatgaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 433 - 523
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235451
Alignment:
Q  433 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattga 10235451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  412 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 511  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  512 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 611  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25845585  T
Q  612 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 699  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845584 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  412 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 511  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  512 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 611  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25846004  T
Q  612 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 699  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846003 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19393735 - 19393462
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19393735 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 19393637  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| | |||||| |   | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| |    
T  19393636 aatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactc 19393540  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 683  Q
    || |||||||| ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  19393539 ttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggat 19393462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 7662734 - 7662569
Alignment:
Q  371 tgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 470  Q
    |||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| | |  || |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | ||    
T  7662734 tgtagtcaagatttagtgtgaagtaggatagcattaaagtacattgattattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaactt 7662635  T
Q  471 atcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  7662634 atcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2653331 - 2653275
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2653331 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggattggctttgtatcatg 2653275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11543279 - 11543223
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11543279 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 11543223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 12738443 - 12738499
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738443 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 12738499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||| ||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  682 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  415 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 514  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  515 ttggattga 523  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11536361 - 11536305
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11536361 tgttggaataagccctaatagccactctatattgattggttttggctttgtatcatg 11536305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 12750733 - 12750789
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750733 tgttggagtaagccctaatagctaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 12750789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 15152350 - 15152406
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15152350 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 15152406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 414 - 514
Target Start/End: Original strand, 19859122 - 19859221
Alignment:
Q  414 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859122 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19859220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 197
Target Start/End: Original strand, 29327690 - 29327745
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29327690 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcat 29327745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Original strand, 15148047 - 15148105
Alignment:
Q  140 ggtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15148047 ggtgttggagtaagccctaatagccaatctatattaattgggtttggttttgtatcatg 15148105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 721
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592153
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 688  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 14592120  T
Q  689 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  14592121 taacgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 14592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 721
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011744
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 688  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 16011711  T
Q  689 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  16011712 taatgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 16011744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 496 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  496 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 595  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||   ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  596 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 621
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 621  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 197
Target Start/End: Original strand, 13392030 - 13392085
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 197  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13392030 tgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgtgtttgactttgtatcat 13392085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 572 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  572 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 647  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 349
Target Start/End: Original strand, 10234179 - 10234244
Alignment:
Q  284 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  10234179 tagaatagttagtccgtttaatgaaccattaaatataacttaatcatgagattccattaaacataa 10234244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18258143 - 18258087
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18258143 tgttggagtaagccctgatagccaatctagattgattggttttggccttgtatcatg 18258087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 479 - 537
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396527
Alignment:
Q  479 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 537  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggattaacccgtcataagaat 7396527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 18560912 - 18560969
Alignment:
Q  141 gtgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18560912 gtgttggagtaagcccttaaaggcaatctatgttgattgggcttggctttgtatcatg 18560969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2653239 - 2653207
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653239 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 2653207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 450
Target Start/End: Original strand, 27906074 - 27906153
Alignment:
Q  371 tgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 450  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  27906074 tgtagtcaagttttatcgtgaagaggtataacactaaaccatagagactgttatgtaagtagattgatggtcatatctca 27906153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 503
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  448 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 503  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 455; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 720
Target Start/End: Original strand, 21940665 - 21941151
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940665 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21940764  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940765 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 21940864  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21940865 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 21940964  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940965 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 21941064  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941065 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Original strand, 22171491 - 22171974
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171491 aaggcatttccttattgattttgttttatttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 22171590  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171591 cccattaaacata--gaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 22171688  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22171689 gatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 22171788  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171789 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 22171888  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171889 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Original strand, 6094129 - 6094610
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6094129 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 6094228  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  6094229 ttaaacataaggaaactatttttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatg 6094328  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6094329 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 6094428  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6094429 tatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttgg 6094528  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094529 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 721
Target Start/End: Original strand, 24642655 - 24643135
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24642655 catttctttattgattttgttttgtttcaaaatcataaagtccctagaattgttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24642754  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642755 ttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatg 24642854  T
Q  440 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24642855 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatac 24642954  T
Q  540 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 639  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642955 tacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttgg 24643053  T
Q  640 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643054 agtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 458 - 721
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  458 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 557  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  558 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  658 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 458 - 721
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  458 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 557  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  558 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  658 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 236 - 435
Target Start/End: Original strand, 28554885 - 28555084
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554885 aaggcatttctttattgattttgtttagtttcaaaataataaaatacctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28554984  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554985 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 580 - 721
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  580 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  680 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 356 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 14984004 - 14983710
Alignment:
Q  356 tattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 455  Q
    |||||| ||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  14984004 tattcttaaagtatctataatcaaaatttattgtgaagtgggataacattaa-gaatagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggat 14983906  T
Q  456 catggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtta 555  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  14983905 catggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagtta 14983809  T
Q  556 taaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 654  Q
    |  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983808 tgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgacctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 246 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 38232570 - 38232115
Alignment:
Q  246 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  |   ||| ||||||||||||  ||| || |||||||||    
T  38232570 tttattgattttgttttatttcaaaataataaa-tctctagaatagttagtctgtttaataaatttttaggtataacttaatcatgacactccattaaac 38232472  T
Q  346 ataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 445  Q
     |||  | | |||||| ||||||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||   |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  38232471 gtaaa-atagtattcttaaagtatttgtagtcaaactttattgtaaagtgagatagtcttaaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcaca 38232373  T
Q  446 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 545  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  38232372 tctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacata 38232273  T
Q  546 gtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcg 644  Q
    |  ||||||||  ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||    
T  38232272 g--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcctcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcg 38232176  T
Q  645 agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 705  Q
    ||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38232175 agtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 240 - 367
Target Start/End: Original strand, 24636860 - 24636987
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24636860 catttctttcttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccttttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24636959  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24636960 ttaaacataaggaaactattcttaaagt 24636987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 8371564 - 8371253
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  8371564 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagt 8371466  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  8371465 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 8371369  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  8371368 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgg 8371270  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  8371269 gtacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 21969324 - 21969635
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21969324 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21969422  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  21969423 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 21969519  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  21969520 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 21969618  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  21969619 gtacttgatgaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 12562114 - 12562425
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12562114 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 12562212  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  12562213 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 12562309  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  12562310 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 12562408  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12562409 gtacttgatgaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 409 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  409 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 508  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  509 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 606  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27007828 - 27007517
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27007828 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27007730  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27007729 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27007633  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27007632 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 27007534  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  27007533 gcacttgatgaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27014971 - 27014660
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27014971 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27014873  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27014872 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27014776  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27014775 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 27014677  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  27014676 gcacttgatgaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27880798 - 27880487
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27880798 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27880700  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27880699 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27880603  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27880602 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 27880504  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  27880503 gcacttgatgaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 28020979 - 28020668
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28020979 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28020881  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  28020880 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 28020784  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  28020783 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 28020685  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  28020684 gcacttgatgaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 264 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 32873019 - 32872741
Alignment:
Q  264 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgttta-atggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattcta 362  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || | | ||| | || | |     
T  32873019 tttcaaaataataaagtccttataatagttcatccatttatatagaacattaagtatgacttaattgtgagatctcattgaaaagagtgacaatactatt 32872920  T
Q  363 aaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat 462  Q
    ||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| ||    
T  32872919 aaaatatttgtagttaagatttattgtgaagtgggataacatcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaat 32872820  T
Q  463 aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatacta 541  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32872819 aaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 22130920 - 22130609
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22130920 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22130822  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22130821 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22130725  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  22130724 ttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgg 22130626  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  22130625 gcacttgatgaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 25611186 - 25611497
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25611186 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25611284  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| |    
T  25611285 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactc 25611381  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||    
T  25611382 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgg 25611480  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  25611481 gcacttgatgaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 415 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659494
Alignment:
Q  415 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 514  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  515 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 614  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 22659600  T
Q  615 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 714  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22659599 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 22659501  T
Q  715 aatcatg 721  Q
    |||||||    
T  22659500 aatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 21916667 - 21916978
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21916667 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagt 21916765  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  21916766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 21916862  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||    
T  21916863 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgg 21916961  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  21916962 gcacttgatgaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 45534584 - 45534273
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  45534584 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 45534486  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  45534485 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 45534389  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  45534388 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgg 45534290  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  45534289 gtacttgatgaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 26240475 - 26240786
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  26240475 taaagcgtcgagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagt 26240573  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||  | | |    
T  26240574 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctc 26240670  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  26240671 ttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 26240769  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  26240770 gtacttgatgaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 405 - 624
Target Start/End: Original strand, 18835341 - 18835556
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  18835341 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagt 18835439  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |    
T  18835440 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttttaaaaa-tgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactc 18835536  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatg 624  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  18835537 ttagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 255 - 523
Target Start/End: Original strand, 2375027 - 2375300
Alignment:
Q  255 tttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |  || |||||||  ||| |||| ||||||||||   | |    
T  2375027 tttgttttgtttcaaaataataaactccctataataattagtcaatttaatggaacatttatgatgacttaatcatgaaaccc-attaaacatacgaata 2375125  T
Q  355 ctattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgat-------gatcacatc 447  Q
     |||| | ||||||| |||||||| | ||||||| || ||| |||| |||||||| |||   ||||||| || |||||| ||||       |||||||||    
T  2375126 ttatttttaaagtatatgtagtcacgatttattgcga-gtgagataacattaaagtatatgaactattaagtgggtagattgatcactcatgatcacatc 2375224  T
Q  448 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 523  Q
     |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2375225 acacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattga 2375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 482 - 721
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  682 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 490 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  490 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  590 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 636  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 21940573 - 21940629
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21940573 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 21940629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 22070108 - 22070164
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22070108 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 22070164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 614 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  614 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 711  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 6094031 - 6094087
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6094031 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 6094087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 22171396 - 22171452
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22171396 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttgattttgtatcatg 22171452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 24642556 - 24642608
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642556 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 24642608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 2963247 - 2962932
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | | ||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  2963247 taaagcgtagagactattatgtatgtagactaatgaccgtatctcatgggttataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 2963149  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 601  Q
    |||||||||| ||||| || |   |  ||||||||||||||||| |  |||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | | ||||  |     
T  2963148 aatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagcgtatatcc 2963051  T
Q  602 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 701  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | || ||||| || |||| |||||||||    
T  2963050 ctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaaaggataaccataacgttggttga 2962952  T
Q  702 tgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||| ||||  ||||||||||    
T  2962951 tggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 559 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535226
Alignment:
Q  559 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 658  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  659 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 705  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 28554791 - 28554847
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554791 tgttggagtaagccctaatagccaatctttgttgattgggtttggctttgtatcatg 28554847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 511
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  417 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 511  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 726
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  608 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 707  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  708 ctccatgaatcatgatgat 726  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 608 - 725
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  608 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 707  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  708 ctccatgaatcatgatga 725  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 335
Target Start/End: Original strand, 10920234 - 10920297
Alignment:
Q  272 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  10920234 taataaaattcctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgagttaatcgtgagac 10920297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 521
Target Start/End: Original strand, 36970265 - 36970371
Alignment:
Q  414 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36970265 gagactatcatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 36970363  T
Q  514 attggatt 521  Q
    | ||||||    
T  36970364 actggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 488
Target Start/End: Original strand, 24535471 - 24535569
Alignment:
Q  390 gaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 488  Q
    |||||| |||| |||| || ||| |||| |||| |||  ||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535471 gaagtgagataacattgaaacatcgagattattttgtgagtacactgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 572 - 694
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  572 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 671  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  672 ccgtaacaggatgactataaagt 694  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 513
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  461 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 195
Target Start/End: Original strand, 2374947 - 2375000
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatc 195  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2374947 tgttggaataagccctaataataaatatgtattgattggatttggctttgtatc 2375000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 660 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  660 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Original strand, 24636605 - 24636642
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattg 179  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24636605 tgttggagtaagccataatagccaatctatattgattg 24636642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 7141 - 6654
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7141 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 7042  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7041 accctattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6942  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6941 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6842  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6841 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 6742  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 14157 - 13670
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14157 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctacaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 14058  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14057 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 13958  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13957 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 13858  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13857 gaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 13758  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13757 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7233 - 7177
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7233 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 7177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14249 - 14193
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14249 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 14193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27381459 - 27380972
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381459 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27381360  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381359 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27381260  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27381259 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27381160  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381159 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27381060  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381059 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27471842 - 27471355
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471842 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27471743  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471742 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27471643  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27471642 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27471543  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471542 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27471443  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471442 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17684674 - 17684189
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684674 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 17684575  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684574 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 17684475  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17684474 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 17684375  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684374 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 17684275  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684274 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17691647 - 17691160
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691647 acaaggcatttctttattgattttgttttctttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 17691548  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17691547 accccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttagtgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 17691448  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17691447 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 17691348  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691347 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 17691248  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691247 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 29308890 - 29309377
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308890 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29308989  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308990 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29309089  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29309090 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29309189  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309190 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29309289  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309290 tgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 29315850 - 29316336
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315850 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29315949  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315950 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29316049  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29316050 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29316149  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316150 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29316249  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316250 tgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Original strand, 11651725 - 11652210
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651725 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 11651824  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11651825 cccattaaaaataaggaaactattctaaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 11651924  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651925 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 11652024  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652025 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 11652124  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652125 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 189182 - 188697
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189182 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 189083  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  189082 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 188983  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  188982 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 188883  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188882 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 188783  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  188782 ttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 236 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16566525 - 16566257
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566525 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16566426  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566425 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16566326  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566325 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 482 - 721
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  682 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 448 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394165
Alignment:
Q  448 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 547  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  548 aaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 647  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  648 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 480 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  480 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc 579  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  580 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 679  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  680 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 717  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 236 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 13359474 - 13359010
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13359474 aaggcatttatttatttattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgcttaatggagcattaagtataacttaatcgtgaaac 13359375  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
     |||||||||||||  | | |||| | |||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||    
T  13359374 tccattaaacataaaaacattatttttaaagtatccgtagtcaacctttattgtgaaatgggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagact 13359275  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||   |  |||  ||    
T  13359274 gatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccat--ga 13359177  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 634  Q
    |||||||||  | ||| ||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13359176 atactacat--tgaaaattatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagat 13359080  T
Q  635 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || ||||||||||  |||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13359079 gtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 499 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  499 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  599 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 698  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  699 tgatgggtactccatgaatcat 720  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 236 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 25537364 - 25537148
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537364 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtccgtttaatggaacattaagtataactttattgtgagac 25537265  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25537264 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtagact 25537165  T
Q  436 gatgatcacatctcaca 452  Q
    |||||||||||||||||    
T  25537164 gatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 273 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20553755 - 20553492
Alignment:
Q  273 aataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctg 372  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||  | | |||||| |||| ||| |    
T  20553755 aataaagtctctaggatagctagtccgtttaatgaaatattaagtacgacttaatcgtgagatcccattaaatataagaatattattcttaaagcatccg 20553656  T
Q  373 tagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 472  Q
    |||| || |||||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  20553655 tagtgaatttttattgtgaagtgagataaaattaaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatat 20553556  T
Q  473 caagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaata 538  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20553555 caaacattcacatagatat-aatattaagaataatatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 27925772 - 27926062
Alignment:
Q  257 tgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacat---taagtata--acttaattgtgagaccccattaaacataatg 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| |||||||   ||||| |   ||||||| ||||||| |||||||||  ||      
T  27925772 tgttttgtttcaaaataataaagtccttagaataactagtatgtttaacggaacataattaagtgtgtgacttaatcgtgagactccattaaactaaaga 27925871  T
Q  352 aaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcac 451  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  27925872 aaattattcttaaagtatctctagtcaaactttatttggaagtggtatagcattgaagcacaaagactattatgtggataaactgatgatctcatctcac 27925971  T
Q  452 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca 543  Q
     ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||    
T  27925972 ggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 16789062 - 16789373
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16789062 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 16789160  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  16789161 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 16789257  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  16789258 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 16789356  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  16789357 gcacttgatgaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 22860199 - 22859888
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22860199 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22860101  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22860100 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22860004  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  22860003 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 22859905  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  22859904 gcacttgatgaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 27508658 - 27508347
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27508658 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27508560  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27508559 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27508463  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  27508462 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgg 27508364  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  27508363 gtacttgatgaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 417 - 711
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  417 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 516  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  517 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaa 615  Q
     ||||||  | |||||| ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaa 2669672  T
Q  616 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 711  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669673 atcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 1586419 - 1586108
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  1586419 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 1586321  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  1586320 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 1586224  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  1586223 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 1586125  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  1586124 gtacttgatgaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 405 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 27528244 - 27527947
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27528244 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27528146  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27528145 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27528049  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  27528048 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgg 27527950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 272 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17850663 - 17850321
Alignment:
Q  272 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaagtatct 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||| |||  |||||||||||| | || |||||| | || || |||||||| ||| ||||     
T  17850663 taataaagtccctataatagctagtttgtttgttggaacattatgtaagacttaattgtgatatccaattaaaaacaaggacactattcttaaattatcc 17850564  T
Q  372 gtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 471  Q
     |||||||| ||| ||| |||||   ||| |||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||    
T  17850563 atagtcaagcttt-ttgtgaagtcaaataacattcaagtatatagactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagtta 17850465  T
Q  472 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata-aaaagtgtcataa 570  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |     ||| ||   |||| ||||||    
T  17850464 tcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacattg----ggttttatgtaagtatcataa 17850369  T
Q  571 gatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 618  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17850368 gttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 272 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 20736773 - 20736413
Alignment:
Q  272 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaa-actattctaaaa-gtat 369  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||| | |||||||  |||||   |||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||||    
T  20736773 taataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaagtttgacttaatcatgagattacattaa-cataaagaacattattcttaaatgtat 20736675  T
Q  370 ctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagt 469  Q
    ||||||||||| |||| | |||| |||||||  | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    | || ||||  |||     
T  20736674 ctgtagtcaagctttaataagaactgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgtgttatagatat-gaga 20736576  T
Q  470 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 569  Q
    ||| |||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | | ||| |||| |||||||    
T  20736575 tattaagtttata-ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcata 20736480  T
Q  570 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 636  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736479 agatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 14074471 - 14074782
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  14074471 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagt 14074569  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | |    
T  14074570 aatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctc 14074666  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  14074667 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 14074765  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  14074766 gtacttgatgaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 405 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18020152 - 18019885
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18020152 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18020054  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18020053 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18019957  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 677  Q
    || ||||||||| |||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  18019956 ttagacctgaaatcactatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 253 - 652
Target Start/End: Original strand, 8509941 - 8510338
Alignment:
Q  253 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgaga-ccccattaaacataatg 351  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||| || | |    
T  8509941 attttattttgttttaaaataataaagtctatagaataattagtctatttgatggaacattatgtacgacttaattatgagacccccattaaatatgagg 8510040  T
Q  352 aaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg-atcacatctca 450  Q
    |   |||| | ||||||| |||||| ||| ||||||  ||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |  |||| || |||||  |    
T  8510041 atgatattattaaagtatatgtagttaagctttattatgaaatgagatagcattaaaacataaagactattatgtgcgtaaa--gatgtataacatcgta 8510138  T
Q  451 cagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagat-ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 549  Q
    || |||| || |||  ||||||||  |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||  |    
T  8510139 catatcacgggtaagtagttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--a 8510236  T
Q  550 aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc 649  Q
    | |||||   ||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  8510237 atgttat-gtaagtgtcattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtac 8510335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 405 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 10359360 - 10359073
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||    
T  10359360 taaagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggt 10359263  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | ||| ||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |    
T  10359262 aatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactc 10359167  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 699  Q
    || ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  10359166 ttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 8612906 - 8613221
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  8612906 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 8613004  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 601  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  8613005 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcg 8613102  T
Q  602 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 701  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  8613103 ctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttga 8613201  T
Q  702 tgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  8613202 tgggtacttgatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 376 - 537
Target Start/End: Original strand, 28172698 - 28172859
Alignment:
Q  376 tcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaa 475  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||| | ||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||    
T  28172698 tcaagttttagtgtgaagtgggataacactgaagaatagaaattattatgtgaatggactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaa 28172797  T
Q  476 gtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 537  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  28172798 gtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17691737 - 17691683
Alignment:
Q  144 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691737 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 17691683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27381551 - 27381495
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27381551 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtttcatg 27381495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27471934 - 27471878
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27471934 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtttcatg 27471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 29308798 - 29308854
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29308798 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 29308854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 29315758 - 29315814
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29315758 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 29315814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17684768 - 17684712
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17684768 tgttggaataagccctaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 17684712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 196
Target Start/End: Original strand, 11651630 - 11651684
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatca 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651630 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatca 11651684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 608 - 721
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  608 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 707  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  708 ctccatgaatcatg 721  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13995254 - 13995151
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13995254 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 13995156  T
Q  505 aatat 509  Q
    |||||    
T  13995155 aatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||| ||| ||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  682 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25537461 - 25537405
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25537461 tgttggattaagccctaatagccaatctatattgactgagtttggctttgtatcatg 25537405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 624
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 624  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 624
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  412 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 511  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| || | ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaat-atgagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  512 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 611  Q
    ||     ||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| ||||    
T  19218526 at-----attgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tttcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  612 tgaaaccactatg 624  Q
    |||||||||||||    
T  19218618 tgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  428 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 527  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  528 tcatgagaatactacatagtaa 549  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560311
Alignment:
Q  413 agagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 512  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  513 tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 593  Q
    || || ||||| |    ||||||| ||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  580 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  565 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 664  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  665 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31258120 - 31258065
Alignment:
Q  241 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagt 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  31258120 atttctttattgcttttgttttgtttcaaaataataaagtctctaaaataattagt 31258065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||||  | |||||  | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 636  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13359560 - 13359512
Alignment:
Q  150 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13359560 taagtcctaatagccaatctatattcattgggtttgactttgtatcatg 13359512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16566611 - 16566563
Alignment:
Q  150 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16566611 taagccctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 16566563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 624
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073781
Alignment:
Q  412 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 511  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  512 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 611  Q
    ||||| |||||| |   | |||||||||||||||  | | ||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||  ||| ||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataacgatgtataccaatcttagacc 4073768  T
Q  612 tgaaaccactatg 624  Q
    | |||||||||||    
T  4073769 taaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 189280 - 189221
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatcta---tattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  189280 tgttggagtaagccctaataatcaatctagtatattgattgggtttggctttgtatcatg 189221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16394526 - 16394484
Alignment:
Q  156 ctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16394526 ctaatagacaatctatattgattgagtttgactttgtatcatg 16394484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22259990 - 22259925
Alignment:
Q  250 ttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaa 315  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||    
T  22259990 ttgattttgttatgttgcaaaataataaactccctaaaataactagtccatttaatataacattaa 22259925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 444; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 18288 - 18774
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18288 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18387  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18487  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18488 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18587  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18588 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18687  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18688 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 18196 - 18252
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18196 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 444; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 21330455 - 21329968
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330455 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21330356  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21330355 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtgga 21330256  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21330255 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 21330156  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330155 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 21330056  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21330055 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 721
Target Start/End: Original strand, 18796506 - 18796993
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796506 acaaggaatttatttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18796605  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    ||| | || ||||||| || | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18796606 acctcttttaacataaggatattattcttaaattatctgtagtcaagctttattgtgaagtggtatatcattaaagcattgagactattatgtgggtaga 18796705  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  18796706 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatga 18796805  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18796806 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaa 18796905  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18796906 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 236 - 727
Target Start/End: Original strand, 18619807 - 18620296
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18619807 aaggaatttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctataataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaattatgagac 18619906  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    || |||||||| || || | |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| |     
T  18619907 cc-attaaacaaaaggatattattcttaaagtatctgtggtcaaactttattgtgaaaagggataatattaaagcatatagactattatgtgggtaggcc 18620005  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||    
T  18620006 gatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgaga 18620105  T
Q  536 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18620106 atactacatagtaaaagttat-gaaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaaatg 18620204  T
Q  636 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 727  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18620205 ttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggtactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 268 - 721
Target Start/End: Original strand, 36270199 - 36270650
Alignment:
Q  268 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaag 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||| || ||  |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  36270199 aaaataataaagtccctagaatagttagtttacttaaatgaaatgttaagtgtgacttaatcgtgagacatcattaaacacaatgacactattcttaaaa 36270298  T
Q  367 tatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaag 466  Q
     ||| ||| ||||| |||| || |||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||    
T  36270299 catccgtaatcaagctttagtgtgaagagggataacattaaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaag 36270398  T
Q  467 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtc 566  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||  ||| ||||  |||| |||    
T  36270399 agttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtc 36270495  T
Q  567 ataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaa 665  Q
    | |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | ||||    
T  36270496 acaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-cacccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaa 36270594  T
Q  666 cgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
     || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36270595 agtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 268 - 709
Target Start/End: Original strand, 18822115 - 18822556
Alignment:
Q  268 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaaca-ttaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaa 365  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||| |||    
T  18822115 aaaataataaagtctatagaattgttagttcgtttaaatggaaaaattaagtgtggcttaatcgtgagacaccattaaacacaaggacactattcttaaa 18822214  T
Q  366 gtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa 465  Q
      || |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||     
T  18822215 acatatgtaatcaagctttagtttgaagtgggatatcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataag 18822314  T
Q  466 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 565  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||  ||| |||||  ||||  |    
T  18822315 gagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaag-at 18822411  T
Q  566 cataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 664  Q
    |  |||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||    
T  18822412 ctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataa 18822511  T
Q  665 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 709  Q
    ||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822512 acgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 721
Target Start/End: Original strand, 20977957 - 20978360
Alignment:
Q  299 gtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtggga 398  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||  ||| ||||||||| |||| || |||||| ||    
T  20977957 gtttaatggaacattaagaataatttaatcatgagatcccattaaaaataaggaaattattcttaaaacatccgtagtcaagctttaatgtgaagtgaga 20978056  T
Q  399 tatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  20978057 tatcactaaagcatagagactattatgtggatagac-----------------agatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattatt 20978139  T
Q  499 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtat 597  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |  ||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20978140 atgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--aaaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtat 20978236  T
Q  598 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 697  Q
    ||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |     
T  20978237 tccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagtactttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcga 20978336  T
Q  698 ttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978337 ttgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 22183553 - 22183206
Alignment:
Q  371 tgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 470  Q
    |||||||||| |||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  22183553 tgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtt 22183454  T
Q  471 atcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataa 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||   || |||||  |||  |||| |     
T  22183453 atcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacag 22183358  T
Q  571 gatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 669  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||    
T  22183357 gtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgtt 22183258  T
Q  670 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||    
T  22183257 gtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 409 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  409 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 506  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  507 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 605  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||  ||| ||||   ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattat-gtaagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 6991950  T
Q  606 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6991949 tcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgg 6991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 30174368 - 30174679
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30174368 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30174466  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  30174467 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 30174563  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  30174564 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 30174662  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  30174663 gcacttgatgaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 24250343 - 24250032
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24250343 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 24250245  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  24250244 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 24250148  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  24250147 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 24250049  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  24250048 gcacttgatgaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 354 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 18852146 - 18851977
Alignment:
Q  354 actattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacag 453  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||||   || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |    
T  18852146 actattcttaaagtatatgtagtccaactttattgtgaagtaggataacattaaattgtatagactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacgg 18852047  T
Q  454 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18852046 atcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 391 - 546
Target Start/End: Original strand, 19279445 - 19279600
Alignment:
Q  391 aagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagata 490  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19279445 aagtgggataactttaaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagata 19279544  T
Q  491 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 546  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19279545 tagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 24229526 - 24229215
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  24229526 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 24229428  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  24229427 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 24229331  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || | | |||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| ||    
T  24229330 ttagccttgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagg 24229232  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  24229231 gtacttgatgaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 240 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19692737 - 19692525
Alignment:
Q  240 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||| | ||    
T  19692737 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagcctgacttaatcatgagatctca 19692638  T
Q  340 ttaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtc--aagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 437  Q
    ||||||  || |||| |||||| ||||||||  |||||  |||||||| |  ||| || ||||  | |||  |||| ||||||||||||  ||||||||     
T  19692637 ttaaactaaaggaaattattcttaaagtatccttagtcaaaagttttactatgaaatgagataataataagacataaagactattatgtgagtagactgt 19692538  T
Q  438 tgatcacatctca 450  Q
    ||| |||||||||    
T  19692537 tgaccacatctca 19692525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 482 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||| |||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  682 atgactataaagttggttgatgggtact 709  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 415 - 723
Target Start/End: Original strand, 29800468 - 29800775
Alignment:
Q  415 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat---aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 511  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||   | | | | || |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29800468 agactattatgtatgtagactgatgatcacatcccatgggtcatggatgtgagatattaattaagtatatacatgggtataaatattaggagtaatattt 29800567  T
Q  512 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 611  Q
    ||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| |||     
T  29800568 atactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgtataccactcttagact 29800664  T
Q  612 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 711  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||      
T  29800665 tgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttggttaatgggcacttg 29800763  T
Q  712 atgaatcatgat 723  Q
    | ||||||||||    
T  29800764 acgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 558 - 721
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  558 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 657  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  658 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21330549 - 21330493
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330549 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 21330493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 420 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  420 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 518  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  519 attga 523  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 414 - 636
Target Start/End: Original strand, 19616435 - 19616653
Alignment:
Q  414 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||  |||   || ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19616435 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgagtcataaatatt-agatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaacatttat 19616533  T
Q  514 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 613  Q
      || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19616534 tctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctg 19616630  T
Q  614 aaaccactatgtaccctagatgt 636  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  19616631 aaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  574 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 654  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 489 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||  | | ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatgaa--gtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 623  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  416 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  516 tggattga 523  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 721
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  654 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  491 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 590  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || ||  |||||||||| || ||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  591 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 690  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  691 aagttg 696  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12098705 - 12098609
Alignment:
Q  354 actattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 450  Q
    |||||| | |||||||  |||||||||||||| |  ||| | |||||  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098705 actatttttaaagtattcgtagtcaagttttaatatgaaattggatagtaataaaacatagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 624
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||   ||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 624  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  560 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 636  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 485 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  485 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 24763868 - 24763751
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  24763868 taaagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagt 24763770  T
Q  505 aatatttatattggattga 523  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24763769 aatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19692829 - 19692773
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  19692829 tgttggagtaagccttaatagccaatctgtatttattaggtttggttttgtatcatg 19692773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36802820 - 36802664
Alignment:
Q  270 aataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattctaaaagta 368  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||| ||||| | | |||||||||  |||   ||||||||| ||||| | |||||| |||  |    
T  36802820 aataataaagtcctttgaatagttaattcgtttaaatggaatattaaatgttacttaattgcaagatatcattaaacacaatgacattattcttaaaaca 36802721  T
Q  369 tctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatg 425  Q
    || ||| ||||| || | ||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  36802720 tccgtaatcaagattcagtgtaaagtgggataacattaaagcatatagattattatg 36802664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 26197 - 25706
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26197 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccatttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26098  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgaaaagtgggatatcattaaagcatagcgactattatgtaggtaga 25998  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25997 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 25898  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 25798  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 725  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25797 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26286 - 26231
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26286 tgttggaataagccctaatagtcaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 26231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 702
Target Start/End: Original strand, 993 - 1461
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  993 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgag 1092  T
Q  334 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1093 accccattaaacataaagaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 1192  T
Q  434 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1193 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatga 1292  T
Q  534 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 1392  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1393 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 901 - 957
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  901 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 725
Target Start/End: Original strand, 5531 - 6013
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5531 aaggcatttctttattgatttatttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 5630  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 435  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5631 cccgttaaacataaggaaattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 5730  T
Q  436 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 535  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5731 gatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtga 5830  T
Q  536 atactacatagtaaaagttat-aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 633  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5831 atactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcattccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctaga 5921  T
Q  634 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 725  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5922 tgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Original strand, 5444 - 5492
Alignment:
Q  150 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5444 taagccctaatagccaatctatattgtttgggtttggctttgtatcatg 5492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 465 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  465 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtg 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  565 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  665 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 230545 - 230365
Alignment:
Q  236 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230545 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcttataatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 230446  T
Q  336 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagaga 417  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230445 ccc-ttaaacataaggaaaccattcttaaagtatttgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagaga 230365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 230640 - 230584
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230640 tgttggagtaagcaataatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 230584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 174 - 485
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  174 taaagcgtcgagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 272  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  273 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 369  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  370 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 468  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  469 gtacttgatgaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 3986 - 3675
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3986 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3888  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  3887 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 3791  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  3790 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 3692  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  3691 gcacttgatgaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Original strand, 119721 - 120032
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  119721 taaagcgtcgagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 119819  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  119820 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 119916  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  119917 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 120015  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||  ||||||||||    
T  120016 gcacttgatgaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 405 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 13260 - 12961
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13260 taaagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 13162  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |    
T  13161 aatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactc 13065  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  13064 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgg 12966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 405 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 130535 - 130262
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  130535 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 130437  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  130436 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 130340  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 683  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130339 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 405 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 67685 - 67374
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  67685 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 67587  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  67586 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 67490  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 704  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  67489 ttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 67391  T
Q  705 gtactccatgaatcatg 721  Q
    |||||  ||||||||||    
T  67390 gtacttgatgaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 405 - 624
Target Start/End: Original strand, 8296 - 8511
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 504  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8296 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 8394  T
Q  505 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  8395 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 8491  T
Q  605 ttcgacctgaaaccactatg 624  Q
    || |||||||||||||||||    
T  8492 ttagacctgaaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 414 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39988
Alignment:
Q  414 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  514 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 613  Q
    |  ||||||| ||    ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  614 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 713  Q
    |||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  714 gaatcatg 721  Q
    ||||||||    
T  39995 gaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 482 - 721
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  482 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 581  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  582 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 681  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  682 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 391 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 90166 - 90033
Alignment:
Q  391 aagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat-aaagagttatcaagtcttcacatagat 489  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  90166 aagtgggataatattaaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagat 90067  T
Q  490 ataaatattaggagtaatatttatattggattga 523  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  90066 ataaatattacgtataacatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 693
Target Start/End: Original strand, 8678 - 9005
Alignment:
Q  361 taaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |   || || ||||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||| |    
T  8678 taaaagtatttgtagtcaagttttaatataaattgagatagtaataaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatgatcacgtctcacatgtcatag 8777  T
Q  461 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 560  Q
    |||  ||| ||| |||  |   ||||  | |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| |||||   ||||| ||     
T  8778 atat-gagatattaaggatatgcatatgtgtaaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaag 8874  T
Q  561 agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccat 660  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||    
T  8875 a-tgtcataagatattctcatagtgataatggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcat 8972  T
Q  661 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 693  Q
    ||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  8973 tcaaacgttctctgtaacatgataactataaag 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8510 - 8446
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8510 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 8446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8602 - 8546
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8602 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggttcggctttgtatcatg 8546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23825 - 23769
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23825 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 531 - 721
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  531 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  631 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 16523 - 16579
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16523 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttatatcatg 16579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 267
Target Start/End: Original strand, 16615 - 16648
Alignment:
Q  234 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16615 acaaggcatttctttattgattttgttttgnttc 16648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||||   |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  586 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 685  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  686 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 721  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 97 - 41
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  97 tgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 8944 - 9000
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8944 tgttggaataagcccaaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 9000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  489 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 588  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagtat--gttacgaag-gtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  589 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 624  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 721
Target Start/End: Original strand, 53766 - 54066
Alignment:
Q  415 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 514  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  53766 agactattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gaggtattaattctatacataggtataaatattaagagtaatattcaca 53864  T
Q  515 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 614  Q
     ||| |||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||   || || | || |||    | ||| |||||||    
T  53865 ctgggttgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcaacatgttaatagtttatattgctcttagacctga 53961  T
Q  615 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 714  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  53962 aaccactatgatccctaggtgt-ggactcaagtgctttatg-ccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 54059  T
Q  715 aatcatg 721  Q
    |||||||    
T  54060 aatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10256 - 10202
Alignment:
Q  144 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10256 ttggagtaagctctaatagccaatctatattgattgagtttgactttgtatcatg 10202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10158 - 10127
Alignment:
Q  253 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10158 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 10127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37 - 1
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgatt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 499
Target Start/End: Original strand, 92194 - 92432
Alignment:
Q  263 gtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataatgaaactattct 361  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||  | |  | ||||||    
T  92194 gttttaaagtaataaagtctctagaatatctagttattttaaatggaacattaagtataacttaatcgtgagacagcaataaacagcaaggcattattct 92293  T
Q  362 aaaagtatctgtagtcaagttttattgagaagtgggatatcatt-aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 460  Q
     |||  ||  ||||||||| |||| || | || |||||| | || ||| | |||| |||||||| | | |||||||||||| |||| ||||   ||||||    
T  92294 taaaacattcgtagtcaagctttagtgtggagagggataactttaaaatcttagaaactattatatggctagactgatgattacatgtcacgagtcatgg 92393  T
Q  461 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 499  Q
    |||| || |||||||||| || || | ||||||||||||    
T  92394 ataaggaattatcaagtcatcgcacatatataaatatta 92432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 5878 - 5930
Alignment:
Q  142 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 194  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5878 tgttggagtaagtcataatagccaatctatattgattgagtttgactttgtat 5930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 544
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  453 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataa----atattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacat 544  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15134 - 15089
Alignment:
Q  405 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 450  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15134 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctca 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University