View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18205_low_17 (Length: 204)

Name: NF18205_low_17
Description: NF18205
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18205_low_17
NF18205_low_17
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-204)||(6564-6767)
scaffold0621 (1-204)||(8495-8702)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-204)||(5672-5875)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-204)||(19293-19497)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (1-204)||(18005675-18005879)
chr7 (1-204)||(67774-67977)
chr7 (1-204)||(44014207-44014407)
chr7 (1-204)||(16219605-16219809)
chr7 (10-204)||(47831836-47832030)
chr7 (10-204)||(811029-811223)
chr7 (1-201)||(16056360-16056560)
chr7 (1-202)||(22072944-22073148)
chr7 (1-204)||(12901352-12901557)
chr7 (66-204)||(34200815-34200951)
chr7 (1-204)||(15754777-15754979)
chr7 (66-204)||(16495431-16495567)
chr7 (66-204)||(11995983-11996119)
chr7 (110-204)||(12255789-12255885)
chr7 (66-204)||(28505254-28505390)
chr7 (56-204)||(2280061-2280211)
chr7 (14-125)||(9389599-9389709)
chr7 (73-204)||(13647354-13647487)
chr7 (1-204)||(20220077-20220280)
chr7 (43-204)||(1867924-1868087)
chr7 (107-204)||(38227510-38227606)
chr7 (47-204)||(14044775-14044935)
chr7 (47-204)||(14354805-14354965)
chr7 (56-204)||(19486686-19486836)
chr7 (107-204)||(10063813-10063910)
chr7 (107-204)||(18456408-18456504)
chr7 (73-204)||(18430738-18430870)
chr7 (111-204)||(3564363-3564456)
chr7 (107-204)||(26212025-26212122)
chr7 (107-204)||(12698860-12698958)
chr7 (56-204)||(15008441-15008591)
chr7 (73-204)||(456347-456479)
chr7 (73-204)||(11393291-11393423)
chr7 (73-204)||(11972522-11972654)
chr7 (73-204)||(14949126-14949258)
chr7 (73-204)||(15376717-15376849)
chr7 (73-204)||(16232546-16232678)
chr7 (73-204)||(18640298-18640430)
chr7 (73-204)||(20385127-20385259)
chr7 (73-204)||(21189599-21189731)
chr7 (73-204)||(24702264-24702396)
chr7 (73-204)||(27216886-27217018)
chr7 (73-204)||(32125517-32125649)
chr7 (73-204)||(41522943-41523075)
chr7 (73-204)||(41525405-41525537)
chr7 (111-201)||(48273421-48273511)
chr7 (107-204)||(9509218-9509315)
chr7 (73-204)||(17061919-17062051)
chr7 (1-64)||(16324175-16324238)
chr7 (114-204)||(10589068-10589158)
chr7 (73-204)||(16410085-16410217)
chr7 (73-204)||(24704714-24704843)
chr7 (111-204)||(24275197-24275289)
chr7 (73-204)||(44116535-44116667)
chr7 (111-204)||(15144037-15144129)
chr7 (107-204)||(16386242-16386340)
chr7 (114-200)||(40443424-40443509)
chr7 (112-148)||(16324135-16324171)
chr7 (163-203)||(27847881-27847921)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (1-204)||(22921757-22921961)
chr1 (56-204)||(33681036-33681185)
chr1 (72-204)||(22237656-22237789)
chr1 (79-204)||(21754074-21754198)
chr1 (1-204)||(21861457-21861662)
chr1 (1-204)||(52927870-52928062)
chr1 (56-204)||(20248308-20248454)
chr1 (19-204)||(21896162-21896348)
chr1 (66-204)||(14295507-14295643)
chr1 (66-204)||(20918633-20918769)
chr1 (1-152)||(50686694-50686846)
chr1 (20-204)||(50614023-50614209)
chr1 (20-204)||(50621851-50622037)
chr1 (10-125)||(35981586-35981700)
chr1 (55-204)||(21161745-21161892)
chr1 (10-204)||(16368184-16368378)
chr1 (10-204)||(41049933-41050128)
chr1 (52-125)||(49261448-49261521)
chr1 (44-204)||(16758678-16758841)
chr1 (120-204)||(35261086-35261170)
chr1 (14-125)||(20636957-20637067)
chr1 (73-204)||(45574846-45574979)
chr1 (66-181)||(22130863-22130976)
chr1 (111-204)||(50210212-50210305)
chr1 (66-165)||(51130632-51130729)
chr1 (73-204)||(13988892-13989024)
chr1 (73-204)||(21475091-21475223)
chr1 (73-204)||(21923295-21923427)
chr1 (114-204)||(34509809-34509899)
chr1 (55-204)||(16093825-16093977)
chr1 (107-204)||(21026709-21026806)
chr1 (111-204)||(21840793-21840885)
chr1 (107-204)||(22532298-22532395)
chr1 (107-204)||(27250724-27250821)
chr1 (73-204)||(23593739-23593871)
chr1 (73-204)||(29298163-29298294)
chr1 (157-204)||(38801433-38801480)
chr1 (73-204)||(433038-433168)
chr1 (73-204)||(26064967-26065100)
chr1 (162-204)||(20847205-20847246)
chr1 (168-204)||(20454610-20454645)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (1-203)||(25175880-25176083)
chr2 (1-204)||(28406005-28406210)
chr2 (1-203)||(7620-7824)
chr2 (1-204)||(18786790-18786995)
chr2 (72-204)||(7679614-7679746)
chr2 (79-204)||(22134175-22134298)
chr2 (1-204)||(23207306-23207511)
chr2 (66-204)||(23071905-23072041)
chr2 (1-152)||(23791356-23791508)
chr2 (73-204)||(19671859-19671991)
chr2 (73-204)||(22105438-22105571)
chr2 (56-204)||(23708561-23708711)
chr2 (107-204)||(298809-298907)
chr2 (1-152)||(25108970-25109122)
chr2 (44-152)||(24697536-24697645)
chr2 (73-204)||(20520152-20520285)
chr2 (107-204)||(23060542-23060639)
chr2 (73-204)||(18808969-18809101)
chr2 (73-204)||(23130888-23131020)
chr2 (73-204)||(23133355-23133487)
chr2 (73-204)||(23709536-23709668)
chr2 (73-204)||(23712017-23712149)
chr2 (73-204)||(24367800-24367932)
chr2 (73-204)||(34402526-34402658)
chr2 (73-204)||(39682339-39682471)
chr2 (107-204)||(23076471-23076568)
chr2 (107-204)||(23654381-23654478)
chr2 (135-204)||(38138-38206)
chr2 (76-204)||(23135616-23135745)
chr2 (73-204)||(571423-571555)
chr2 (73-204)||(6726021-6726153)
chr2 (114-204)||(20309137-20309225)
chr2 (73-204)||(21155064-21155196)
chr2 (56-204)||(22413078-22413230)
chr2 (73-204)||(28577125-28577257)
chr2 (73-204)||(32039502-32039634)
chr2 (107-204)||(22731229-22731326)
chr2 (107-204)||(23285894-23285987)
chr2 (79-204)||(23004777-23004905)
chr2 (111-204)||(23103396-23103487)
chr2 (107-204)||(23660052-23660148)
chr2 (73-204)||(24898199-24898332)
chr2 (73-204)||(24900682-24900815)
chr2 (73-204)||(24903159-24903292)
chr2 (73-204)||(24905636-24905769)
chr2 (73-204)||(24908111-24908244)
chr2 (73-204)||(32214925-32215057)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-204)||(40062-40266)
scaffold0023 (1-204)||(100403-100607)
scaffold0023 (73-204)||(94437-94569)
scaffold0023 (73-204)||(44480-44613)
scaffold0023 (160-204)||(119904-119948)
scaffold0023 (73-204)||(17444-17576)
scaffold0023 (156-203)||(101529-101576)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (10-204)||(2543-2737)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (1-204)||(38855140-38855343)
chr8 (19-204)||(23760751-23760936)
chr8 (1-204)||(21673733-21673936)
chr8 (10-204)||(6520397-6520590)
chr8 (10-204)||(21285626-21285820)
chr8 (56-204)||(26355643-26355790)
chr8 (19-204)||(983312-983498)
chr8 (66-204)||(5866230-5866366)
chr8 (1-204)||(37116376-37116582)
chr8 (66-204)||(21491024-21491160)
chr8 (1-204)||(17266880-17267086)
chr8 (38-204)||(13508009-13508177)
chr8 (66-204)||(17140945-17141081)
chr8 (1-204)||(20498591-20498796)
chr8 (38-204)||(13597541-13597709)
chr8 (19-204)||(24353049-24353235)
chr8 (44-204)||(17439436-17439599)
chr8 (66-204)||(21249413-21249550)
chr8 (66-204)||(21255251-21255388)
chr8 (73-204)||(17612069-17612202)
chr8 (1-152)||(22364744-22364895)
chr8 (107-204)||(22626765-22626861)
chr8 (107-204)||(16092337-16092434)
chr8 (107-204)||(21918995-21919092)
chr8 (107-204)||(22875094-22875190)
chr8 (114-204)||(16199647-16199736)
chr8 (114-204)||(31971286-31971375)
chr8 (73-204)||(1484428-1484560)
chr8 (73-204)||(5853296-5853428)
chr8 (73-204)||(14409448-14409580)
chr8 (73-204)||(20046199-20046331)
chr8 (73-204)||(20403253-20403385)
chr8 (73-204)||(22001779-22001911)
chr8 (114-204)||(28649046-28649136)
chr8 (107-204)||(7372807-7372904)
chr8 (107-204)||(20536237-20536334)
chr8 (74-204)||(19801387-19801517)
chr8 (107-204)||(26219743-26219838)
chr8 (73-204)||(15203235-15203367)
chr8 (73-204)||(16413320-16413452)
chr8 (114-204)||(21395984-21396072)
chr8 (114-204)||(21790477-21790565)
chr8 (105-152)||(40492844-40492891)
chr8 (107-204)||(18818404-18818501)
chr8 (107-204)||(21923923-21924020)
chr8 (120-204)||(6759287-6759371)
chr8 (120-204)||(23406408-23406492)
chr8 (107-204)||(26225288-26225383)
chr8 (156-204)||(18879276-18879323)
chr8 (73-204)||(4483307-4483438)
chr8 (114-204)||(21389454-21389542)
chr8 (114-204)||(21778780-21778868)
chr8 (162-204)||(45131047-45131088)
chr8 (66-157)||(21383887-21383978)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-204)||(14585-14789)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (10-175)||(2116-2281)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-204)||(21502043-21502248)
chr5 (1-204)||(21329385-21329589)
chr5 (1-204)||(26011923-26012127)
chr5 (56-204)||(21565571-21565720)
chr5 (1-204)||(20026828-20027033)
chr5 (67-204)||(22959489-22959624)
chr5 (56-200)||(19668931-19669073)
chr5 (66-204)||(19660791-19660927)
chr5 (1-204)||(22178107-22178313)
chr5 (73-204)||(22144078-22144211)
chr5 (66-125)||(21741486-21741545)
chr5 (132-204)||(36314606-36314678)
chr5 (107-204)||(21729059-21729156)
chr5 (107-204)||(21808384-21808481)
chr5 (107-204)||(23390491-23390588)
chr5 (79-181)||(29448054-29448159)
chr5 (56-204)||(40725882-40726032)
chr5 (107-204)||(22075048-22075145)
chr5 (107-204)||(22412213-22412309)
chr5 (107-204)||(24493598-24493694)
chr5 (111-202)||(9077983-9078074)
chr5 (73-204)||(264772-264904)
chr5 (108-204)||(8286838-8286935)
chr5 (73-204)||(10732944-10733076)
chr5 (73-204)||(11581203-11581335)
chr5 (73-204)||(29329960-29330092)
chr5 (73-204)||(39363410-39363542)
chr5 (107-204)||(1096496-1096593)
chr5 (107-204)||(13025340-13025436)
chr5 (107-204)||(13095524-13095620)
chr5 (73-204)||(20902012-20902145)
chr5 (109-204)||(25431423-25431518)
chr5 (73-204)||(20909038-20909170)
chr5 (114-204)||(24529249-24529339)
chr5 (73-204)||(42245369-42245501)
chr5 (127-204)||(21997549-21997626)
chr5 (107-204)||(25421561-25421658)
chr5 (107-167)||(20766115-20766175)
chr5 (73-204)||(29346006-29346138)
chr5 (161-204)||(37723932-37723975)
chr5 (162-203)||(21293020-21293060)
chr5 (163-204)||(26740697-26740737)
chr5 (73-204)||(18319037-18319170)
chr5 (76-204)||(39245162-39245291)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (1-204)||(15470953-15471156)
chr3 (1-204)||(16103809-16104012)
chr3 (10-203)||(14234517-14234712)
chr3 (1-204)||(16097357-16097561)
chr3 (14-204)||(12174164-12174351)
chr3 (79-204)||(32307706-32307830)
chr3 (80-204)||(49668044-49668168)
chr3 (82-204)||(9512949-9513067)
chr3 (82-204)||(9520924-9521042)
chr3 (66-204)||(13210283-13210419)
chr3 (79-196)||(1644642-1644757)
chr3 (56-204)||(52523669-52523821)
chr3 (1-203)||(37251055-37251259)
chr3 (107-204)||(27165276-27165373)
chr3 (56-204)||(24340665-24340815)
chr3 (107-204)||(23274716-23274813)
chr3 (107-204)||(12399238-12399335)
chr3 (107-204)||(53301545-53301643)
chr3 (52-125)||(1465350-1465423)
chr3 (1-204)||(22110239-22110444)
chr3 (73-204)||(43925987-43926121)
chr3 (56-204)||(37642207-37642357)
chr3 (107-204)||(42386439-42386536)
chr3 (107-204)||(14572618-14572714)
chr3 (107-204)||(21618475-21618570)
chr3 (107-204)||(36166624-36166719)
chr3 (1-124)||(49389518-49389642)
chr3 (111-204)||(606324-606418)
chr3 (114-204)||(18438563-18438653)
chr3 (73-204)||(43550482-43550615)
chr3 (107-204)||(14972883-14972980)
chr3 (107-204)||(17487885-17487982)
chr3 (107-204)||(17499367-17499464)
chr3 (135-204)||(11424783-11424851)
chr3 (56-203)||(22147467-22147616)
chr3 (107-204)||(24153204-24153300)
chr3 (56-171)||(2051141-2051260)
chr3 (73-204)||(7781351-7781483)
chr3 (73-204)||(8899120-8899252)
chr3 (73-204)||(16282815-16282947)
chr3 (73-204)||(17446659-17446791)
chr3 (73-204)||(17463204-17463336)
chr3 (73-204)||(17672652-17672784)
chr3 (73-204)||(29172587-29172719)
chr3 (73-204)||(34159352-34159484)
chr3 (73-204)||(38961895-38962027)
chr3 (73-204)||(45606911-45607043)
chr3 (73-204)||(53070657-53070789)
chr3 (73-204)||(55476517-55476649)
chr3 (107-204)||(13442303-13442400)
chr3 (107-204)||(43840961-43841058)
chr3 (107-204)||(14576828-14576924)
chr3 (164-204)||(28194719-28194759)
chr3 (76-204)||(28848618-28848747)
chr3 (73-204)||(9707611-9707743)
chr3 (73-204)||(12567586-12567718)
chr3 (73-204)||(13544051-13544183)
chr3 (73-204)||(16454285-16454417)
chr3 (114-204)||(20698437-20698527)
chr3 (111-204)||(6469178-6469270)
chr3 (107-204)||(23083356-23083453)
chr3 (107-204)||(26686916-26687013)
chr3 (111-204)||(40213720-40213812)
chr3 (116-204)||(55500968-55501055)
chr3 (73-204)||(13151794-13151927)
chr3 (73-204)||(13154259-13154392)
chr3 (73-204)||(10247727-10247859)
chr3 (1-63)||(43927304-43927366)
chr3 (111-204)||(25476384-25476477)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-204)||(62227-62428)
scaffold0028 (82-204)||(132687-132809)
scaffold0028 (73-204)||(134237-134369)
scaffold0028 (73-204)||(136706-136838)
scaffold0028 (73-204)||(139175-139307)
scaffold0028 (73-204)||(144113-144245)
scaffold0028 (73-204)||(141644-141776)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (10-204)||(39706187-39706380)
chr4 (1-204)||(12288097-12288302)
chr4 (79-204)||(12774036-12774160)
chr4 (47-204)||(13784-13943)
chr4 (110-204)||(52243192-52243288)
chr4 (66-204)||(15551846-15551982)
chr4 (56-204)||(43198495-43198647)
chr4 (1-204)||(53082039-53082244)
chr4 (14-125)||(15099457-15099567)
chr4 (14-125)||(15190424-15190534)
chr4 (56-198)||(8846391-8846550)
chr4 (1-204)||(46640343-46640548)
chr4 (66-195)||(16596686-16596813)
chr4 (111-204)||(16377522-16377613)
chr4 (107-204)||(23374354-23374451)
chr4 (107-204)||(8574864-8574959)
chr4 (73-204)||(44615314-44615446)
chr4 (107-204)||(16270231-16270327)
chr4 (73-204)||(12311-12443)
chr4 (114-204)||(7088906-7088996)
chr4 (73-204)||(15118356-15118488)
chr4 (73-204)||(18215278-18215410)
chr4 (73-204)||(19618176-19618308)
chr4 (73-204)||(44773091-44773223)
chr4 (73-204)||(52312536-52312668)
chr4 (107-204)||(7798803-7798900)
chr4 (107-204)||(12902786-12902883)
chr4 (107-204)||(14280342-14280438)
chr4 (107-204)||(22636464-22636561)
chr4 (107-204)||(54798749-54798846)
chr4 (107-204)||(6899920-6900016)
chr4 (107-204)||(16239965-16240061)
chr4 (108-204)||(52873363-52873459)
chr4 (73-204)||(44928883-44929016)
chr4 (111-204)||(14038677-14038770)
chr4 (107-204)||(44052858-44052955)
chr4 (107-203)||(7893733-7893829)
chr4 (110-151)||(15464929-15464970)
chr4 (156-204)||(3096322-3096369)
chr4 (116-204)||(14053306-14053393)
chr4 (168-204)||(17046516-17046552)
chr4 (76-204)||(18239426-18239555)
chr4 (73-204)||(1837513-1837645)
chr4 (73-204)||(19242725-19242857)
chr4 (162-204)||(17333306-17333347)
chr4 (73-204)||(15355328-15355461)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-204)||(10556-10760)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-204)||(2692-2898)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (10-204)||(12795-12989)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (10-204)||(6021-6215)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (1-201)||(23019438-23019639)
chr6 (1-204)||(19652224-19652426)
chr6 (1-174)||(22080627-22080800)
chr6 (1-204)||(19668400-19668605)
chr6 (66-204)||(28496427-28496563)
chr6 (66-204)||(29808838-29808974)
chr6 (1-204)||(1561332-1561534)
chr6 (65-204)||(9098465-9098606)
chr6 (132-204)||(27333238-27333310)
chr6 (132-204)||(27393978-27394050)
chr6 (78-204)||(20109167-20109295)
chr6 (118-204)||(4185827-4185913)
chr6 (118-204)||(4186396-4186482)
chr6 (60-204)||(31155346-31155489)
chr6 (107-204)||(16496273-16496370)
chr6 (118-178)||(4668217-4668277)
chr6 (118-178)||(4675064-4675124)
chr6 (73-204)||(1595575-1595707)
chr6 (110-204)||(25644349-25644444)
chr6 (56-204)||(8227453-8227603)
chr6 (111-204)||(29060569-29060662)
chr6 (73-204)||(22782253-22782385)
chr6 (111-204)||(19303540-19303632)
chr6 (120-204)||(20076729-20076812)
chr6 (10-102)||(28103796-28103887)
chr6 (73-204)||(2291184-2291316)
chr6 (73-204)||(12742343-12742475)
chr6 (73-204)||(18334596-18334728)
chr6 (73-204)||(19005072-19005204)
chr6 (73-204)||(19858923-19859055)
chr6 (73-204)||(24422573-24422705)
chr6 (73-204)||(30676714-30676846)
chr6 (73-204)||(33861820-33861952)
chr6 (73-204)||(33864304-33864436)
chr6 (111-204)||(18409826-18409919)
chr6 (107-204)||(20360955-20361052)
chr6 (114-204)||(16920634-16920722)
chr6 (46-152)||(18696569-18696675)
chr6 (107-204)||(17287791-17287888)
chr6 (111-204)||(25629354-25629447)
chr6 (111-204)||(25688528-25688620)
chr6 (44-152)||(18706387-18706495)
chr6 (73-204)||(20556898-20557028)
chr6 (76-204)||(1540918-1541047)
chr6 (168-204)||(22831532-22831568)
chr6 (114-204)||(20638285-20638375)
chr6 (73-204)||(34963399-34963531)
chr6 (114-204)||(35245615-35245703)
chr6 (10-204)||(23076759-23076955)
chr6 (127-204)||(25656655-25656731)
chr6 (111-203)||(20593803-20593895)
chr6 (73-204)||(16448530-16448663)
chr6 (54-102)||(18896256-18896304)
chr6 (135-204)||(33443076-33443146)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (2-204)||(6640-6843)
scaffold0333 (2-204)||(14020-14223)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-201)||(10429-10630)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (56-204)||(22613-22762)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-204)||(32565-32768)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-204)||(129934-130138)
scaffold0010 (110-204)||(60713-60808)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (5-203)||(159-357)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (10-204)||(12968-13162)
scaffold0138 (1-152)||(18125-18277)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (10-204)||(933-1126)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-204)||(6841-7042)
scaffold0556 (1-151)||(8097-8248)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (10-204)||(1111-1305)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-204)||(160713-160916)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (56-204)||(45735-45884)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-204)||(7964-8166)
scaffold0218 (72-186)||(29242-29354)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (1-204)||(136255-136461)
scaffold0021 (1-204)||(144963-145169)
scaffold0021 (111-204)||(174795-174886)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-204)||(6170-6376)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-204)||(38345-38551)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-204)||(128857-129062)
scaffold0022 (1-204)||(78351-78555)
scaffold0022 (107-204)||(116456-116551)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (47-203)||(53482-53640)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (66-204)||(1025-1161)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (66-204)||(11321-11457)
scaffold0046 (66-204)||(2026-2162)
scaffold0046 (114-204)||(28443-28533)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-204)||(12597-12801)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (126-204)||(23897-23975)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (66-200)||(15694-15826)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (107-204)||(38697-38794)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (10-201)||(103536-103720)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (107-204)||(1061-1158)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (127-204)||(15792-15869)
scaffold0020 (1-45)||(15720-15765)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-204)||(97034-97240)
scaffold0006 (1-204)||(106312-106518)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (82-204)||(32127-32249)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (11-152)||(87-228)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (56-204)||(11493-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (56-204)||(38198-38348)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (107-204)||(3146-3242)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-204)||(19772-19977)
scaffold0080 (107-204)||(39942-40038)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-202)||(7946-8151)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (56-204)||(17969-18119)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (73-204)||(25135-25268)
scaffold0123 (44-152)||(619-727)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (114-204)||(13157-13247)
scaffold0357 (110-204)||(16098-16192)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (107-204)||(39506-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (107-204)||(75210-75306)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (111-204)||(3185-3278)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (110-204)||(27747-27841)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (66-204)||(34152-34288)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (118-178)||(9133-9193)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (114-204)||(4878-4968)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (107-204)||(44702-44799)
scaffold0122 (111-204)||(26064-26157)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (107-204)||(1880-1977)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (107-204)||(32952-33048)
scaffold0120 (107-204)||(45957-46053)
scaffold0120 (111-204)||(16142-16235)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (107-204)||(25925-26021)
scaffold0026 (107-204)||(39887-39983)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (11-152)||(1696-1836)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (107-204)||(13240-13337)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (111-204)||(17214-17309)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (73-204)||(20383-20514)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (107-204)||(32971-33067)
scaffold0145 (107-203)||(38791-38886)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-204)||(579-783)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (66-175)||(2398-2505)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (107-204)||(24297-24395)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-204)||(267689-267894)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (73-204)||(20773-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (73-204)||(37847-37979)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (114-204)||(1318-1406)
scaffold0106 (114-204)||(7295-7383)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (114-204)||(51611-51699)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (73-204)||(158454-158586)
scaffold0003 (111-204)||(339949-340039)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (107-204)||(1981-2078)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (111-204)||(10799-10891)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (114-204)||(15466-15555)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (56-175)||(225465-225585)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (76-204)||(13418-13547)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (73-204)||(4720-4852)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (114-204)||(10427-10515)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (73-204)||(13973-14105)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (107-204)||(1043-1140)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (114-204)||(13526-13615)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (111-204)||(9268-9360)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (107-204)||(3499-3596)
scaffold0292 (107-204)||(372-468)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (114-204)||(32096-32184)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (107-204)||(51942-52039)
scaffold0011 (107-204)||(167973-168070)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (116-204)||(16311-16397)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (149-204)||(28806-28862)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (107-204)||(8528-8621)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (114-197)||(20946-21030)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (114-204)||(5132-5220)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (73-204)||(29958-30090)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (73-200)||(40430-40558)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (73-204)||(11314-11446)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (79-121)||(2261-2303)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (107-196)||(4544-4633)
scaffold0228 (107-196)||(12126-12215)
scaffold0228 (107-196)||(22078-22167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (111-204)||(16599-16692)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (107-204)||(4553-4650)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (107-204)||(6116-6216)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (126-204)||(2704-2784)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (156-204)||(4741-4788)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (107-151)||(27912-27956)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (73-204)||(161093-161226)


Alignment Details
Target: scaffold0621 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6767 - 6564
Alignment:
Q  1 actaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6767 actaagttgttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 6668  T
Q  101 atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6667 atgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 6568  T
Q  201 tgag 204  Q
    ||||    
T  6567 tgag 6564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8702 - 8495
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata--attgtatatacattatatga 97  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  |||||  |||||  |||||||||||||||  |||    
T  8702 actaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactg-atgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttga 8604  T
Q  98 attatgt-tg-atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8603 attatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 8504  T
Q  196 ctgcatgag 204  Q
    |||||||||    
T  8503 ctgcatgag 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5875 - 5672
Alignment:
Q  1 actaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5875 actaagtttttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 5776  T
Q  101 atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5775 atgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgca 5676  T
Q  201 tgag 204  Q
    ||||    
T  5675 tgag 5672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19497 - 19293
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19497 actaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 19398  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19397 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 19298  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  19297 atgag 19293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18005879 - 18005675
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005879 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 18005780  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18005779 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 18005680  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  18005679 atgag 18005675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 67977 - 67774
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  67977 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaat 67878  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  67877 tatgttgata-ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 67779  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  67778 atgag 67774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44014407 - 44014207
Alignment:
Q  1 actaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44014407 actaagttgttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaatt 44014308  T
Q  101 atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44014307 atgttgatatttgagat---gttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 44014211  T
Q  201 tgag 204  Q
    ||||    
T  44014210 tgag 44014207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16219605 - 16219809
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16219605 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 16219703  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  16219704 tatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagcta 16219803  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  16219804 catgag 16219809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47832030 - 47831836
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47832030 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgat 47831932  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47831931 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 47831836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 811029 - 811223
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  811029 ttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 811127  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  811128 gtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgag 811223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16056560 - 16056360
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16056560 actaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatga-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 16056462  T
Q  100 tatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16056461 tatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtg 16056363  T
Q  199 cat 201  Q
    |||    
T  16056362 cat 16056360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22073148 - 22072944
Alignment:
Q  1 actaagttgtta-tcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga-a 98  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||      
T  22073148 actaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagt 22073050  T
Q  99 ttatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22073049 ttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 22072950  T
Q  197 tgcatg 202  Q
    ||||||    
T  22072949 tgcatg 22072944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12901557 - 12901352
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12901557 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaatta-tatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaat 12901459  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  12901458 tatgtatgat-gttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 12901360  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  12901359 tgcatgag 12901352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34200951 - 34200815
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34200951 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 34200855  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34200854 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 34200815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15754777 - 15754979
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| |  |||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  15754777 actaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactga-tgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 15754875  T
Q  99 ttatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  15754876 ttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagct 15754972  T
Q  198 gcatgag 204  Q
    |||||||    
T  15754973 gcatgag 15754979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495431
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 16495431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 11995983 - 11996119
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||   ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11995983 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatac 11996079  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  11996080 tgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgag 11996119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 12255789 - 12255885
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12255789 tttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 12255885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 28505254 - 28505390
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28505254 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatac 28505350  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28505351 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 28505390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 2280061 - 2280211
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||| |||||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2280061 atgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgct 2280160  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  2280161 gttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 2280211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Original strand, 9389599 - 9389709
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 113  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  9389599 cttgatgttgtcattccagtaagcctggattg-tatattctaatattgatgataatgttatataattgtatatacattgtatgaattatgttgatatatg 9389697  T
Q  114 agatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||    
T  9389698 agatgttgttga 9389709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13647487 - 13647354
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  13647487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 13647388  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13647387 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 13647354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20220077 - 20220280
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20220077 actaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaat 20220175  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  20220176 tatatatgatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 20220272  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    || |||||    
T  20220273 tgtatgag 20220280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Original strand, 1867924 - 1868087
Alignment:
Q  43 ttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattg 141  Q
    |||| ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  1867924 ttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattg 1868022  T
Q  142 ttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||  || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  1868023 ttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgag 1868087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38227606 - 38227510
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38227606 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgag 38227510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044775
Alignment:
Q  47 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14044837  T
Q  145 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  14044836 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgag 14044775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354805
Alignment:
Q  47 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14354867  T
Q  145 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  14354866 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgag 14354805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486836
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 19486785  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  19486786 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 19486836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10063910
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgag 10063910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 18456408 - 18456504
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  18456408 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgag 18456504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18430870 - 18430738
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||  |||  ||||||| |    
T  18430870 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-t 18430772  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18430771 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 18430738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564456
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 3564456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26212122 - 26212025
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  26212122 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgag 26212025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12698958 - 12698860
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12698958 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12698860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008591
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga-- 152  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  153 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||  |||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 15008591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 456479 - 456347
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  456479 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 456381  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  456380 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 456347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 11393291 - 11393423
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11393291 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11393389  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11393390 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 11393423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11972654 - 11972522
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11972654 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11972556  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11972555 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 11972522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 14949126 - 14949258
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14949126 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14949224  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14949225 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 14949258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 15376717 - 15376849
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15376717 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15376815  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15376816 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 15376849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16232678 - 16232546
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16232678 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16232580  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16232579 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 16232546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18640430 - 18640298
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18640430 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18640332  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18640331 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 18640298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 20385127 - 20385259
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20385127 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20385225  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20385226 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20385259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 21189599 - 21189731
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21189599 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21189697  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21189698 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 21189731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24702396 - 24702264
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24702396 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 24702298  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24702297 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24702264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27217018 - 27216886
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  27217018 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 27216920  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27216919 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 27216886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32125649 - 32125517
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32125649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32125551  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32125550 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 32125517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41523075 - 41522943
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41523075 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41522977  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41522976 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 41522943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41525537 - 41525405
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  41525537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41525439  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41525438 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 41525405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273421
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcat 48273421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9509315 - 9509218
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9509315 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgag 9509218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062051
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||||| ||     
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactg-ctg 17062017  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17062018 agttgctgattgttatttaactaagctgcatgag 17062051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16324238 - 16324175
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 64  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  16324238 actaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttg 16324175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589068
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| || ||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 10589068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16410217 - 16410085
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16410217 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16410119  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16410118 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 16410085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24704843 - 24704714
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |  |||| ||||||| |     
T  24704843 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt--tttgtatactgt-tg 24704747  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24704746 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24704714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275197
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24275197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44116667 - 44116535
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  44116667 atataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 44116569  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  44116568 gtgttgctgttg-ttatttaaccaagctgcatgag 44116535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144129
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || || | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 15144129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 16386242 - 16386340
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| |||| | || | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16386242 atatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 16386340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40443509 - 40443424
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 40443424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  112 tgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatc 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847921
Alignment:
Q  163 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatga 27847921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22921757 - 22921961
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921757 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaat 22921856  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22921857 tttgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 22921956  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  22921957 atgag 22921961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33681185 - 33681036
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681185 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 33681086  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33681085 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgag 33681036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22237789 - 22237656
Alignment:
Q  72 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22237789 tatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgccta 22237690  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22237689 tgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgag 22237656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21754198 - 21754074
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21754198 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 21754100  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  21754099 tttgttatttaactaagctgcatgag 21754074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21861457 - 21861662
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  21861457 actaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaat-attatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaat 21861555  T
Q  100 tatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  21861556 tatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagct 21861655  T
Q  198 gcatgag 204  Q
    |||||||    
T  21861656 gcatgag 21861662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 52927870 - 52928062
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52927870 actaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 52927968  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  52927969 tatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 52928056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20248454 - 20248308
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248454 atgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg 20248358  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  20248357 atttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgag 20248308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 21896162 - 21896348
Alignment:
Q  19 tgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgaga 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||    
T  21896162 tgttgttgtttcagtaagcctgaat-attatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgaga 21896260  T
Q  117 tgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  21896261 tgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgag 21896348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295643
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 14295643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20918769 - 20918633
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20918769 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 20918673  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20918672 tgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgag 20918633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 50686846 - 50686694
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  50686846 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 50686748  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  50686747 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatga 50686694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 50614023 - 50614209
Alignment:
Q  20 gttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||||    
T  50614023 gttgttacttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatg 50614121  T
Q  119 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  50614122 ttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 50614209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 50621851 - 50622037
Alignment:
Q  20 gttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||||    
T  50621851 gttgttacttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatg 50621949  T
Q  119 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  50621950 ttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 50622037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 35981586 - 35981700
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35981586 ttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattg-tatattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaattatgttgata 35981684  T
Q  110 tttgagatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||||||    
T  35981685 tttgagatgttgttga 35981700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21161892 - 21161745
Alignment:
Q  55 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21161892 aatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgat 21161795  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  21161794 gatttgcatactgt-tttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgag 21161745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 16368184 - 16368378
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgat 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    |||    
T  16368184 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat 16368282  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
      ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  16368283 -gttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 16368378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 41049933 - 41050128
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | ||||    
T  41049933 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgat 41050031  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  41050032 gtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgag 41050128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 49261521 - 49261448
Alignment:
Q  52 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 125  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49261521 tctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatataaattatgttgatatttgagatgttgttga 49261448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16758841 - 16758678
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| |  |||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16758841 taatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgt 16758742  T
Q  143 tatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16758741 tatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgag 16758678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261170
Alignment:
Q  120 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 35261170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20637067 - 20636957
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 113  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20637067 cttgatgttgtcattccagtaagcctgaattg-tattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgtatttg 20636969  T
Q  114 agatgttgttga 125  Q
     |||||||||||    
T  20636968 ggatgttgttga 20636957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45574979
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 45574945  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45574946 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 45574979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130976
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttggatac 22130959  T
Q  165 tgtctatgttgctgttg 181  Q
    || ||||||||||||||    
T  22130960 tgcctatgttgctgttg 22130976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210305
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 50210305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130632
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13989024 - 13988892
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  13989024 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13988926  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13988925 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 13988892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 21475091 - 21475223
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21475091 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21475189  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21475190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 21475223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 21923295 - 21923427
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21923295 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21923393  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21923394 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 21923427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509809
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 34509809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093977
Alignment:
Q  55 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatga 16093923  T
Q  153 --tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
      || |||  |||||| |||||||||| || |||  ||||||| | ||||||||    
T  16093924 gctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgag 16093977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21026806 - 21026709
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21026806 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 21026709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840793
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 21840793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22532395 - 22532298
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  22532395 atatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgag 22532298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 27250724 - 27250821
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27250724 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgag 27250821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 23593739 - 23593871
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23593739 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23593837  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23593838 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23593871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29298294 - 29298163
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29298294 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-t 29298197  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29298196 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 29298163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 204
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801480
Alignment:
Q  157 ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 38801480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 433168 - 433038
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||  |||| |||||| ||    
T  433168 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcct 433069  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  433068 gtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgag 433038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26065100 - 26064967
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 169  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||   ||||| ||    
T  26065100 atatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcatt-ggtattgttatatcatgaattattttatgtactgcct 26065002  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  26065001 atgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgag 26064967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 204
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847246
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20847246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 20454610 - 20454645
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20454610 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20454645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25176083 - 25175880
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25176083 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatgaat 25175984  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25175983 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 25175884  T
Q  200 atga 203  Q
    ||||    
T  25175883 atga 25175880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28406210 - 28406005
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28406210 actaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaat 28406111  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28406110 taagttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttg 28406011  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  28406010 catgag 28406005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 7620 - 7824
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  7620 actaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaat 7718  T
Q  100 tatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  7719 tatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct 7818  T
Q  198 gcatga 203  Q
    ||||||    
T  7819 gcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18786790 - 18786995
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18786790 actaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaatta-tatgattgaatgttattgataatgttatatagttgtatatacattacatgaat 18786888  T
Q  100 tatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    |||| |||||  ||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18786889 tatgtttgat-gttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagc 18786987  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  18786988 tgcatgag 18786995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7679746 - 7679614
Alignment:
Q  72 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7679746 tatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 7679648  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 7679614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Original strand, 22134175 - 22134298
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22134175 ttgtatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 22134273  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || | |||||||||||||||||||||    
T  22134274 tt-gatatttaactaagctgcatgag 22134298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23207511 - 23207306
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  23207511 actaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 23207413  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| |  |   ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23207412 tatttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct 23207313  T
Q  198 gcatgag 204  Q
    |||||||    
T  23207312 gcatgag 23207306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072041
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 23072001  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23072002 tgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgag 23072041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23791508 - 23791356
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  23791508 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 23791410  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||| | | || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  23791409 tatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatga 23791356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19671991 - 19671859
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 171  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19671991 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctat 19671892  T
Q  172 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  19671891 gttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 19671859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22105571 - 22105438
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||    
T  22105571 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 22105472  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22105471 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 22105438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708711
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttg--atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||   || |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| |    
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgtt 23708660  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||    
T  23708661 gttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgag 23708711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 298809 - 298907
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  298809 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 298907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25109122 - 25108970
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  25109122 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaat 25109024  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||| | |||| |||||||| ||||||| ||   || ||||||||||||||||||    
T  25109023 tatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatga 25108970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Original strand, 24697536 - 24697645
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24697536 taatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgt 24697635  T
Q  143 tatatcatga 152  Q
    ||||||||||    
T  24697636 tatatcatga 24697645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 20520152 - 20520285
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 169  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||  |    
T  20520152 atatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcat 20520250  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20520251 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 20520285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23060639 - 23060542
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23060639 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23060542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18809101 - 18808969
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18809101 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18809003  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18809002 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 18808969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23131020 - 23130888
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23131020 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23130922  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23130921 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23130888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23133487 - 23133355
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23133487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23133389  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23133388 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23133355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 23709536 - 23709668
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23709536 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23709634  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23709635 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23709668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 23712017 - 23712149
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  23712017 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23712115  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23712116 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23712149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24367932 - 24367800
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24367932 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24367834  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24367833 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24367800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 34402526 - 34402658
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34402526 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34402624  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34402625 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 34402658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39682471 - 39682339
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  39682471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39682373  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39682372 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 39682339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23076568 - 23076471
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23076568 atatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23076471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 23654381 - 23654478
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23654381 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23654478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38206
Alignment:
Q  135 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 38206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23135745 - 23135616
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  23135745 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 23135647  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23135646 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23135616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 571555 - 571423
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  571555 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 571457  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  571456 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 571423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6726153 - 6726021
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6726153 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 6726055  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6726054 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 6726021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309137
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgag 20309137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 21155064 - 21155196
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  21155064 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21155162  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21155163 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 21155196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413230
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcg--atattgttatatcatga 152  Q
    ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatga 22413176  T
Q  153 --tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
      || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  22413177 gctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgag 22413230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28577257 - 28577125
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  28577257 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-t 28577159  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28577158 gcgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 28577125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 32039502 - 32039634
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32039502 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32039600  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32039601 gtgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgag 32039634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 22731229 - 22731326
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22731229 atatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 22731326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23285987 - 23285894
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| || || |  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23285987 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23285894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23004905 - 23004777
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    |||||||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |  |||   ||||  ||||||||    
T  23004905 ttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttg 23004806  T
Q  176 ctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23004805 ctgtttgtttattaactaagctgcatgag 23004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103487
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||  | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgag 23103487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23660148 - 23660052
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  23660148 atatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgag 23660052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 24898199 - 24898332
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  24898199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24898297  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgag 204  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24898298 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24898332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 24900682 - 24900815
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  24900682 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24900780  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgag 204  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24900781 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24900815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 24903159 - 24903292
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  24903159 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24903257  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgag 204  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24903258 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24903292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 24905636 - 24905769
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  24905636 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24905734  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgag 204  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24905735 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24905769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 24908111 - 24908244
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  24908111 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24908209  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgag 204  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24908210 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24908244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 32214925 - 32215057
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  32214925 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 32215023  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32215024 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 32215057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 40062 - 40266
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40062 actaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 40161  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40162 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgc 40261  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  40262 atgag 40266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 100607 - 100403
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  100607 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaat 100508  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 100408  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  100407 atgag 100403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 94569 - 94437
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  94569 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 94471  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  94470 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 94437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44613 - 44480
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg--atttgcatactgtc 168  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||||     
T  44613 atataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt- 44515  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 44480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119904
Alignment:
Q  160 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 119904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 17444 - 17576
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  17444 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 17542  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17543 gtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgag 17576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101529
Alignment:
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatga 101529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 159; Significance: 7e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 2543 - 2737
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2543 ttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 2642  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2643 tttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgag 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 38855140 - 38855343
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855140 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatgaat 38855238  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38855239 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 38855338  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  38855339 atgag 38855343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 23760751 - 23760936
Alignment:
Q  19 tgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760751 tgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg 23760850  T
Q  119 ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23760851 ttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 23760936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21673936 - 21673733
Alignment:
Q  1 actaagttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21673936 actaagttgttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaatt 21673837  T
Q  101 atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||    
T  21673836 atattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgca 21673737  T
Q  201 tgag 204  Q
    ||||    
T  21673736 tgag 21673733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6520590 - 6520397
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6520590 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatg 6520492  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 6520397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21285820 - 21285626
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  21285820 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgat 21285722  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21285721 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgag 21285626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 26355643 - 26355790
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga 155  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26355643 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatggaatatgttgatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatga 26355741  T
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgag 26355790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 983312 - 983498
Alignment:
Q  19 tgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagat 117  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||    
T  983312 tgttgttgtttcagtaagtctgaatta-tatgattgaatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgat 983409  T
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgag 983498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 5866230 - 5866366
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5866230 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 5866326  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5866327 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 5866366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37116582 - 37116376
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  37116582 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaat 37116484  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  37116483 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 37116384  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  37116383 tgcatgag 37116376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21491160 - 21491024
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21491160 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatac 21491064  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21491063 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 21491024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17266880 - 17267086
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||    
T  17266880 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaat 17266978  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   | |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  17266979 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 17267078  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  17267079 tgcatgag 17267086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 13508009 - 13508177
Alignment:
Q  38 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcg 135  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  13508009 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcg 13508108  T
Q  136 atattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13508109 atattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 13508177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17141081 - 17140945
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  17141081 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatac 17140985  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17140984 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 17140945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20498796 - 20498591
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| ||||  || |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  20498796 actaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgta-tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaat 20498698  T
Q  100 tatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |    
T  20498697 tatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagtt 20498598  T
Q  198 gcatgag 204  Q
    |||||||    
T  20498597 gcatgag 20498591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 13597541 - 13597709
Alignment:
Q  38 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcg 135  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||| ||||||||| | |||| ||||    
T  13597541 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcg 13597640  T
Q  136 atattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13597641 atattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 13597709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24353235 - 24353049
Alignment:
Q  19 tgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagat 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||| | |  ||| ||||||||    
T  24353235 tgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagat 24353137  T
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  24353136 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 24353049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Original strand, 17439436 - 17439599
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17439436 taatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgt 17439535  T
Q  143 tatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17439536 tatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 17439599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21249550 - 21249413
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21249550 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21249454  T
Q  165 tgtctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  21249453 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgag 21249413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21255388 - 21255251
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21255388 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21255292  T
Q  165 tgtctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  21255291 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgag 21255251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 17612069 - 17612202
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17612069 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 17612168  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  17612169 tgttgttgattgttaattaactaagctgcatgag 17612202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22364895 - 22364744
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22364895 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaat 22364797  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  22364796 tatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22626861 - 22626765
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22626861 atatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 22626765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092434
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 16092434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 21918995 - 21919092
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21918995 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 21919092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22875190 - 22875094
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  22875190 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgag 22875094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 16199647 - 16199736
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| | ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 16199736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31971375 - 31971286
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 31971286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1484560 - 1484428
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1484560 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1484462  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1484461 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 1484428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 5853296 - 5853428
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  5853296 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 5853394  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5853395 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 5853428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 14409448 - 14409580
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  14409448 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 14409546  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14409547 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 14409580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 20046199 - 20046331
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20046199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 20046297  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20046298 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20046331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20403385 - 20403253
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20403385 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20403287  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20403286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20403253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22001911 - 22001779
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  22001911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 22001813  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22001812 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 22001779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 28649046 - 28649136
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28649046 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgag 28649136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7372904 - 7372807
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7372904 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 7372807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20536334 - 20536237
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20536334 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20536237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 204
Target Start/End: Original strand, 19801387 - 19801517
Alignment:
Q  74 tataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctat 171  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | |    
T  19801387 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgt 19801485  T
Q  172 gttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19801486 gttgctattg-ttatttaactaagctgcatgag 19801517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219743
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactg-ctgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 26219743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 15203235 - 15203367
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15203235 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15203333  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203334 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 15203367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 16413320 - 16413452
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  16413320 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 16413418  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16413419 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 16413452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396072
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 21396072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790565
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 21790565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 152
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492891
Alignment:
Q  105 tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 18818404 - 18818501
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| |||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18818404 atatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 18818501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 21923923 - 21924020
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21923923 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 21924020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759287
Alignment:
Q  120 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 6759287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406408
Alignment:
Q  120 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23406408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225383
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||  || |||| ||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 26225383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879323
Alignment:
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 18879323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4483438 - 4483307
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  4483438 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 4483340  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4483339 gtgttgctgttg-ttatt-aactaagctgcatgag 4483307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389542
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 21389542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778868
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 21778868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 204
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131088
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 45131088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383887
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt 157  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14585 - 14789
Alignment:
Q  1 actaagttgt-tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14585 actaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaat 14684  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14685 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgc 14784  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  14785 atgag 14789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 2116 - 2281
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2116 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgctgata 2215  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2216 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21502043 - 21502248
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21502043 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 21502142  T
Q  100 tatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  21502143 tatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctg 21502242  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  21502243 catgag 21502248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21329385 - 21329589
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21329385 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaat 21329483  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21329484 tatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 21329583  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  21329584 catgag 21329589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 26011923 - 26012127
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26011923 actaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaacta-tataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatgaat 26012021  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  26012022 tatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctg 26012121  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  26012122 catgag 26012127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21565720 - 21565571
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565720 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 21565621  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21565620 atttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgag 21565571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20026828 - 20027033
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20026828 actaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaatta-tatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaat 20026926  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    |||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20026927 tatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 20027025  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  20027026 tgcatgag 20027033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 204
Target Start/End: Original strand, 22959489 - 22959624
Alignment:
Q  67 aatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959489 aatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatact 22959585  T
Q  166 gtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22959586 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 22959624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19669073 - 19668931
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19669073 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatg 19668977  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  19668976 atttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgca 19668931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 19660791 - 19660927
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| ||  |||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  19660791 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatac 19660887  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19660888 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 19660927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22178107 - 22178313
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22178107 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaatta-tatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 22178205  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| |||||||| |||| |||  |||||||||     
T  22178206 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagt 22178305  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  22178306 tgcatgag 22178313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22144211 - 22144078
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  22144211 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactaccta 22144112  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  22144111 tgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgag 22144078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741545
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 21741545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314606
Alignment:
Q  132 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 36314606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729156
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 21729156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 21808384 - 21808481
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21808384 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 21808481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 23390491 - 23390588
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23390491 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 23390588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448054
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttg 29448060  T
Q  176 ctgttg 181  Q
    ||||||    
T  29448059 ctgttg 29448054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725882
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 40725933  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  40725932 gctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 40725882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22075145 - 22075048
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22075145 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgag 22075048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412213
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||    
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgag 22412213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24493694 - 24493598
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  24493694 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgag 24493598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077983
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatg 202  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatg 9077983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 264772 - 264904
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  264772 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 264870  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  264871 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 264904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 204
Target Start/End: Original strand, 8286838 - 8286935
Alignment:
Q  108 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8286838 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 8286935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733076
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10733043 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 10733076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 11581203 - 11581335
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11581203 atataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 11581301  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11581302 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 11581335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29330092 - 29329960
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29330092 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 29329994  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29329993 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 29329960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39363542 - 39363410
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  39363542 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39363444  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39363443 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 39363410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1096593 - 1096496
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||| || ||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1096593 atatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 1096496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13025436 - 13025340
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  13025436 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgag 13025340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13095620 - 13095524
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  13095620 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgag 13095524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 20902012 - 20902145
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  20902012 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 20902110  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20902111 tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20902145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25431518 - 25431423
Alignment:
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25431518 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagatgcatgag 25431423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20909170 - 20909038
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20909170 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20909072  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20909071 gtgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgag 20909038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529249
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24529249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 42245369 - 42245501
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  42245369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 42245467  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42245468 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgag 42245501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 204
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997626
Alignment:
Q  127 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 21997626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25421658 - 25421561
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25421658 atatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 25421561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766175
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt 20766175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29346138 - 29346006
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29346138 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29346040  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29346039 gtgatgctgttg-ttatttaactaagctgtatgag 29346006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723932
Alignment:
Q  161 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgag 37723932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 203
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293060
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatga 21293060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 204
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740737
Alignment:
Q  163 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgag 26740737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 18319037 - 18319170
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 18319135  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18319136 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 18319170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39245291 - 39245162
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||| || ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  39245291 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 39245193  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39245192 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 39245162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15471156 - 15470953
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15471156 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 15471059  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15471058 tatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctg 15470959  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  15470958 catgag 15470953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16104012 - 16103809
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16104012 actaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagact-aatccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaat 16103914  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16103913 tatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctg 16103815  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  16103814 catgag 16103809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14234712 - 14234517
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatt--tcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-g 106  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14234712 ttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtt-taatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg 14234614  T
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    || |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14234613 atgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatga 14234517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16097561 - 16097357
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16097561 actaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 16097463  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16097462 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 16097363  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  16097362 catgag 16097357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 12174164 - 12174351
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatattt 112  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  12174164 cttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatattt 12174262  T
Q  113 gagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12174263 gagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 12174351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32307830 - 32307706
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32307830 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 32307732  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  32307731 tttgttatttaactaagctgcatgag 32307706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Original strand, 49668044 - 49668168
Alignment:
Q  80 tgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg-ttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49668044 tgtatatactttaaatggattatgttgataaatgagatgtttgttg-attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 49668142  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  49668143 tttgttatttaactaagctgcatgag 49668168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9513067 - 9512949
Alignment:
Q  82 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg 181  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9513067 tatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttt 9512972  T
Q  182 gttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  9512971 gttgtttaactaagctgcatgag 9512949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9521042 - 9520924
Alignment:
Q  82 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg 181  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9521042 tatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttg----attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttt 9520947  T
Q  182 gttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  9520946 gttgtttaactaagctgcatgag 9520924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 13210283 - 13210419
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13210283 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 13210379  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13210380 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgag 13210419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 1644642 - 1644757
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1644642 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 1644740  T
Q  179 ttggttatttaactaagc 196  Q
    || |||||||||||||||    
T  1644741 tt-gttatttaactaagc 1644757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523821
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 152  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaa 52523768  T
Q  153 -tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  52523769 ctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 52523821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 37251055 - 37251259
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  37251055 actaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaatta-tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 37251153  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  37251154 tatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 37251252  T
Q  197 tgcatga 203  Q
    |||||||    
T  37251253 tgcatga 37251259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27165373 - 27165276
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27165373 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 27165276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340815
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 24340764  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | | |||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  24340765 gttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 24340815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23274813 - 23274716
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  23274813 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgag 23274716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399238
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 12399238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 53301545 - 53301643
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgt-tgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  53301545 atatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgag 53301643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Original strand, 1465350 - 1465423
Alignment:
Q  52 tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 125  Q
    |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1465350 tctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatgttgatatttgagatgttgttga 1465423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22110239 - 22110444
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||  |||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  22110239 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaat 22110337  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    | | | ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22110338 tctatatgat-gttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 22110436  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  22110437 tgcatgag 22110444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925987
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 169  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcct 43926022  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  43926021 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 43925987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642357
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 37642306  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  37642307 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 37642357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42386536 - 42386439
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42386536 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgag 42386439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14572714 - 14572618
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| |  || | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14572714 atatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 14572618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618475
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 21618475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166624
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 36166624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 49389518 - 49389642
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49389518 actaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaat 49389616  T
Q  100 tatg-ttgatatttgagatgttgttg 124  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||    
T  49389617 tatgtttgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606418
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 606418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438563
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgag 18438563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550615
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||||||||||  |    
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcat 43550581  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  43550582 atgttgctg-tcattatttaactaagctgcatgag 43550615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14972980 - 14972883
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14972980 atatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 14972883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17487982 - 17487885
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17487982 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 17487885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17499464 - 17499367
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17499464 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 17499367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424851
Alignment:
Q  135 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 11424851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147616
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    | ||||||||| | ||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatga 22147616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 24153204 - 24153300
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  24153204 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgag 24153300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 171
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 152  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaa 2051240  T
Q  153 -tgatttgcatactgtctat 171  Q
     || ||||||||||| ||||    
T  2051241 ctgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 7781351 - 7781483
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  7781351 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 7781449  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7781450 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 7781483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8899252 - 8899120
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  8899252 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 8899154  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8899153 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 8899120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 16282815 - 16282947
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16282815 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16282913  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16282914 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 16282947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 17446659 - 17446791
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17446659 atataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17446757  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17446758 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 17446791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17463336 - 17463204
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17463336 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17463238  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17463237 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 17463204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17672784 - 17672652
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  17672784 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 17672686  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17672685 atgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 17672652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172719
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 29172685  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29172686 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 29172719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34159484 - 34159352
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34159484 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34159386  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34159385 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 34159352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 38961895 - 38962027
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38961895 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 38961993  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961994 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 38962027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 45606911 - 45607043
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  45606911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 45607009  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45607010 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 45607043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 53070657 - 53070789
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||| |    
T  53070657 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-t 53070755  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53070756 atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 53070789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 55476649 - 55476517
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  55476649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 55476551  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55476550 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 55476517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13442400 - 13442303
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13442400 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttg-ttatttaactaagctgcatgag 13442303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43841058 - 43840961
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43841058 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 43840961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 14576828 - 14576924
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  14576828 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgag 14576924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28194759 - 28194719
Alignment:
Q  164 ctgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28194759 ctgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 28194719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Original strand, 28848618 - 28848747
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  28848618 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 28848716  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28848717 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 28848747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 9707611 - 9707743
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  9707611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 9707709  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9707710 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 9707743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12567718 - 12567586
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  12567718 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 12567620  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12567619 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12567586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13544183 - 13544051
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || ||    
T  13544183 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ct 13544085  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13544084 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 13544051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 16454285 - 16454417
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16454285 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16454383  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16454384 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgag 16454417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698527
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20698527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469270
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 6469270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 23083356 - 23083453
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23083356 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgag 23083453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26687013 - 26686916
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26687013 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 26686916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213812
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgag 40213812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500968
Alignment:
Q  116 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 55500968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 13151794 - 13151927
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  13151794 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13151892  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgag 204  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13151893 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 13151927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 13154259 - 13154392
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  13154259 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13154357  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaact-aagctgcatgag 204  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13154358 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 13154392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 10247727 - 10247859
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10247727 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10247825  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10247826 gtgctgctgttg-ttatttaactaagctgtatgag 10247859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 43927366 - 43927304
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 63  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  43927366 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtt 43927304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476477
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  || |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgag 25476477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 62428 - 62227
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  62428 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaat 62329  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  62328 tatgttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgc 62232  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  62231 atgag 62227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 132809 - 132687
Alignment:
Q  82 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgtt 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  132809 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 132711  T
Q  181 ggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  132710 tgttatttatctaagctgcatgag 132687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 134369 - 134237
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  134369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 134271  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  134270 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 134237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 136838 - 136706
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  136838 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 136740  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  136739 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 136706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 139307 - 139175
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  139307 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 139209  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  139208 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 139175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 144245 - 144113
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  144245 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 144147  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  144146 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 144113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 141776 - 141644
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  141776 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 141678  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  141677 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgag 141644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 39706187 - 39706380
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39706187 ttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaatta-tatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatg 39706285  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39706286 tttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 39706380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 12288097 - 12288302
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12288097 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatgaat 12288195  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    |||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12288196 tatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 12288294  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  12288295 tgcatgag 12288302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12774160 - 12774036
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12774160 ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 12774062  T
Q  179 ttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  12774061 tttgttatttaactaagctgcatgag 12774036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Original strand, 13784 - 13943
Alignment:
Q  47 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  13784 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 13883  T
Q  145 tatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  13884 tatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 13943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 52243192 - 52243288
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52243192 tttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 52243288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15551982 - 15551846
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15551982 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatac 15551886  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15551885 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 15551846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 43198495 - 43198647
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga- 152  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||     
T  43198495 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaa 43198594  T
Q  153 -tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43198595 ttgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 43198647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 53082039 - 53082244
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  53082039 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 53082137  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||  || |||   |||||  |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  53082138 tatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagc 53082236  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  53082237 tgcatgag 53082244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15099567 - 15099457
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 113  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099567 cttgatgttgtcattccagtaagcctggattg-tatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 15099469  T
Q  114 agatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||    
T  15099468 agatgttgttga 15099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15190534 - 15190424
Alignment:
Q  14 cttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 113  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190534 cttgatgttgtcattccagtaagcctggattg-tatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttg 15190436  T
Q  114 agatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||    
T  15190435 agatgttgttga 15190424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8846550 - 8846391
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta---------- 144  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||              
T  8846550 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgata 8846451  T
Q  145 ------tatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
          | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8846450 ttgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 8846391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 46640343 - 46640548
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||  | |||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  46640343 actaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaatta-tatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 46640441  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| || |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  46640442 tatatatgatgtt-gagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagc 46640540  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  46640541 tgcatgag 46640548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16596813 - 16596686
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16596813 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16596717  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16596716 tacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377613
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 16377613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 23374354 - 23374451
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23374354 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 23374451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574959
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 8574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44615446 - 44615314
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  44615446 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 44615348  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44615347 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 44615314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 16270231 - 16270327
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16270231 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgag 16270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 12311 - 12443
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12311 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12409  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12410 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088906
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 7088906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 15118356 - 15118488
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15118356 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15118454  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15118455 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 15118488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 18215278 - 18215410
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  18215278 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 18215376  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18215377 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 18215410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 19618176 - 19618308
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| ||    
T  19618176 atataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ct 19618274  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19618275 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 19618308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 44773091 - 44773223
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  44773091 atataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 44773189  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44773190 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 44773223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52312668 - 52312536
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  52312668 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 52312570  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52312569 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 52312536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7798900 - 7798803
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7798900 atatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 7798803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12902883 - 12902786
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12902883 atatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12902786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280342
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ccgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 14280342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22636561 - 22636464
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22636561 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 22636464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798846
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgag 54798846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6900016 - 6899920
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  6900016 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgag 6899920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 16239965 - 16240061
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  16239965 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgag 16240061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 204
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873459
Alignment:
Q  108 tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 52873459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 44928883 - 44929016
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  44928883 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgctt 44928982  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44928983 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 44929016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038677
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 14038677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44052955 - 44052858
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44052955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttg-ttatttaactgagctgcatgag 44052858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7893829 - 7893733
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7893829 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatga 7893733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 15464929 - 15464970
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 151  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15464929 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096322
Alignment:
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 3096322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 204
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053393
Alignment:
Q  116 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgag 14053393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17046552 - 17046516
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17046552 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 17046516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Original strand, 18239426 - 18239555
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  18239426 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 18239524  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18239525 ctgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 18239555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 1837513 - 1837645
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  1837513 atataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1837611  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1837612 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 1837645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19242857 - 19242725
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19242857 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19242759  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19242758 gtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 19242725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333306
Alignment:
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgag 17333306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 15355328 - 15355461
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  15355328 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 15355426  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15355427 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 15355461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10760 - 10556
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10760 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatgaat 10662  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  10661 tatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctg 10562  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  10561 catgag 10556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 2692 - 2898
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatata----cattatat 95  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    |||| |||    
T  2692 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtata--attgtatatatatacattttat 2789  T
Q  96 gaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2790 gaattaagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaag 2889  T
Q  196 ctgcatgag 204  Q
    |||||||||    
T  2890 ctgcatgag 2898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12989 - 12795
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12989 ttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaatta-tatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 12891  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12890 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgag 12795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 6021 - 6215
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6021 ttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 6119  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6120 gtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgag 6215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23019639 - 23019438
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23019639 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaacta-tataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 23019541  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  23019540 tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctg 23019441  T
Q  199 cat 201  Q
    |||    
T  23019440 cat 23019438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19652426 - 19652224
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  19652426 actaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatggat 19652328  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19652327 tatgttgatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgc 19652229  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  19652228 atgag 19652224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 22080627 - 22080800
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22080627 actaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatattaat 22080726  T
Q  100 tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtt 174  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22080727 tatgacgatgtttgagatgttgtt-ctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19668605 - 19668400
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19668605 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgta-tatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaat 19668507  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    || || |||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19668506 tacgtatgatgtt-gtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagc 19668408  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  19668407 tgcatgag 19668400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 28496427 - 28496563
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28496427 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 28496523  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  28496524 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgag 28496563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 29808838 - 29808974
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29808838 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 29808934  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  29808935 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgag 29808974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1561534 - 1561332
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| |  |||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  1561534 actaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactga-tgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 1561436  T
Q  99 ttatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  1561435 ttatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagct 1561339  T
Q  198 gcatgag 204  Q
    |||||||    
T  1561338 gcatgag 1561332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 204
Target Start/End: Original strand, 9098465 - 9098606
Alignment:
Q  65 ttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 161  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||    
T  9098465 ttaatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgca 9098563  T
Q  162 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9098564 tactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 9098606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333310
Alignment:
Q  132 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 27333310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394050
Alignment:
Q  132 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 27394050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20109295 - 20109167
Alignment:
Q  78 attgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20109295 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttg 20109196  T
Q  176 ctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20109195 ctgtttgtttattaactaagctgcatgag 20109167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185913
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgag 4185913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186396
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgag 4186396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 204
Target Start/End: Original strand, 31155346 - 31155489
Alignment:
Q  60 tgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt 158  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31155346 tgttgttgatgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatatgaa--gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgactt 31155443  T
Q  159 gcatactgtctatgttgctg-ttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  31155444 gcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgag 31155489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496273
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 16496273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 4668217 - 4668277
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4668217 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 4675064 - 4675124
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4675064 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1595707 - 1595575
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |    
T  1595707 atataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 1595609  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1595608 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 1595575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25644444 - 25644349
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25644444 tttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgag 25644349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227603
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 8227552  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||    
T  8227553 gttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgag 8227603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060569
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 29060569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782253
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 22782287  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22782286 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 22782253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303632
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgag 19303632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076729
Alignment:
Q  120 tgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 20076729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103887
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 102  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattat 28103887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 2291184 - 2291316
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  2291184 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 2291282  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2291283 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 2291316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12742475 - 12742343
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12742475 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12742377  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12742376 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12742343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 18334596 - 18334728
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18334596 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18334694  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18334695 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 18334728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19005204 - 19005072
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19005204 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19005106  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19005105 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 19005072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 19858923 - 19859055
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19858923 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19859021  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19859022 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 19859055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24422705 - 24422573
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  24422705 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24422607  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24422606 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24422573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 30676714 - 30676846
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| ||    
T  30676714 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ct 30676812  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30676813 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 30676846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33861952 - 33861820
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33861952 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33861854  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33861853 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 33861820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33864436 - 33864304
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  33864436 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33864338  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33864337 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 33864304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 18409826 - 18409919
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18409826 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgag 18409919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 20360955 - 20361052
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20360955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20361052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 16920634 - 16920722
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 16920722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18696675 - 18696569
Alignment:
Q  46 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  18696675 atatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgtta 18696577  T
Q  145 tatcatga 152  Q
    ||||||||    
T  18696576 tatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 17287791 - 17287888
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17287791 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 17287888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629447
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgag 25629447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688528
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 25688528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18706495 - 18706387
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  18706495 taatatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgcttt-gatattgt 18706397  T
Q  143 tatatcatga 152  Q
    ||||||||||    
T  18706396 tatatcatga 18706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 20556898 - 20557028
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||| |     
T  20556898 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaatt-gagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tg 20556995  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20556996 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20557028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Original strand, 1540918 - 1541047
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||    
T  1540918 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtg 1541016  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1541017 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 1541047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22831568 - 22831532
Alignment:
Q  168 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22831568 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 22831532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 20638285 - 20638375
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20638285 agatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20638375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34963531 - 34963399
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  34963531 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34963433  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34963432 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgag 34963399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35245703 - 35245615
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35245703 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgag 35245615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23076955 - 23076759
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||    
T  23076955 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg-atatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgat 23076857  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg--atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||| || ||||||||| |  || | |||||| |||||||  |  ||| |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23076856 gtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 23076759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25656731 - 25656655
Alignment:
Q  127 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 25656655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593803
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtt-tttatttaactgagctgcatga 20593803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 16448530 - 16448663
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |    
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 16448628  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16448629 tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 16448663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Original strand, 18896256 - 18896304
Alignment:
Q  54 taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 102  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18896256 taatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattat 18896304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443076
Alignment:
Q  135 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgag 33443076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6843 - 6640
Alignment:
Q  2 ctaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6843 ctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatta-tatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatt 6745  T
Q  101 atg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    ||| ||||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6744 atgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 6645  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  6644 atgag 6640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14223 - 14020
Alignment:
Q  2 ctaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14223 ctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatta-tatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatt 14125  T
Q  101 atg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgc 199  Q
    ||| ||||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14124 atgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 14025  T
Q  200 atgag 204  Q
    |||||    
T  14024 atgag 14020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10429 - 10630
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10429 actaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 10527  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10528 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 10627  T
Q  199 cat 201  Q
    |||    
T  10628 cat 10630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 22613 - 22762
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22613 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 22712  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22713 atttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 22762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32768 - 32565
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32768 actaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaat 32670  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  32669 tatgtttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctg 32571  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  32570 catgag 32565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 130138 - 129934
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  130138 actaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaat 130040  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  130039 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatg 129940  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  129939 catgag 129934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 60713 - 60808
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  60713 tttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 60808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 357 - 159
Alignment:
Q  5 agttgttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  357 agttgttatcttgctgttgttgttctagtgagactga-tacatatgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgt 259  T
Q  105 t-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  258 ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatga 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13162 - 12968
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  13162 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgg-ataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgat 13064  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  13063 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgag 12968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 18125 - 18277
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  18125 actaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 18223  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18224 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 933 - 1126
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  933 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtaa--atctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 1030  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1031 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 1126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7042 - 6841
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7042 actaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgact 6944  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6943 tatgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctg 6847  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  6846 catgag 6841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8248 - 8097
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8248 actaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaat 8150  T
Q  100 tatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 151  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8149 tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1305 - 1111
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 108  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||  || |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  1305 ttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgta-tatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgat 1207  T
Q  109 atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1206 gtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 1111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 160916 - 160713
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||| |    
T  160916 actaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgact 160818  T
Q  100 tatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctg 198  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  160817 tatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctg 160719  T
Q  199 catgag 204  Q
    ||||||    
T  160718 catgag 160713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 45735 - 45884
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg 154  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45735 atgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatg 45834  T
Q  155 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45835 atttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgag 45884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 7964 - 8166
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7964 actaagttgtttatcttgctgttgtt---tcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaat 8059  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | ||||  ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  8060 tatatatgat-gttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagc 8158  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  8159 tgcatgag 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 29242 - 29354
Alignment:
Q  72 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  |||    
T  29242 tatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactaccta 29338  T
Q  171 tgttgctgttggttat 186  Q
    |||||||||| |||||    
T  29339 tgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 136255 - 136461
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatct-aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  136255 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaa 136353  T
Q  99 ttatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    ||||||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||    
T  136354 ttatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaag 136452  T
Q  196 ctgcatgag 204  Q
     ||||||||    
T  136453 ttgcatgag 136461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 144963 - 145169
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatct-aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  144963 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaa 145061  T
Q  99 ttatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    ||||||  |||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||    
T  145062 ttatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaag 145160  T
Q  196 ctgcatgag 204  Q
     ||||||||    
T  145161 ttgcatgag 145169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 174886 - 174795
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  | || ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 174795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 6170 - 6376
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  6170 actaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 6268  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||     
T  6269 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagt 6368  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  6369 tgcatgag 6376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38551 - 38345
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||   ||||||  |||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  38551 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaat 38453  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  38452 tatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagc 38353  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  38352 tgcatgag 38345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 73; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 128857 - 129062
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  128857 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaat 128955  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  128956 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagc 129054  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  129055 tgcatgag 129062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 78555 - 78351
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  78555 actaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 78457  T
Q  100 tat-gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    |||    |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  78456 tataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 78359  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  78358 tgcatgag 78351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116456
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 116456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 53482 - 53640
Alignment:
Q  47 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgtta 144  Q
    |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  53482 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 53581  T
Q  145 tatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  53582 tatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1161
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 1161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11457 - 11321
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11457 taatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 11361  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11360 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 11321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 2026
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2162 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2066  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2065 tgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgag 2026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28443
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 28443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12801 - 12597
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||   ||| || | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  12801 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtct-aatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaat 12704  T
Q  100 tatgttga--tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    ||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  12703 tatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct 12604  T
Q  198 gcatgag 204  Q
     ||||||    
T  12603 acatgag 12597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 23897 - 23975
Alignment:
Q  126 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23897 attgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgag 23975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15826 - 15694
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  15826 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatac 15730  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15729 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 15694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 38697 - 38794
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38697 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgag 38794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 103536 - 103720
Alignment:
Q  10 ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgata 109  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  103536 ttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagttgtatatacattacatgaattatgt--at- 103631  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 201  Q
         ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||  |||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  103632 -----gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcat 103720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 62; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1061
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 62; Significance: 5e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 204
Target Start/End: Original strand, 15792 - 15869
Alignment:
Q  127 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15792 ttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 15869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 15720 - 15765
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaatta 45  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15720 actaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta 15765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 97240 - 97034
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  97240 actaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaat 97142  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  97141 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagc 97042  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  97041 tgcatgag 97034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 106518 - 106312
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  106518 actaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaat 106420  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  106419 tatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagc 106320  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  106319 tgcatgag 106312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32249 - 32127
Alignment:
Q  82 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgtt 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||    
T  32249 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtt 32151  T
Q  181 ggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  32150 tgttatttatctaagctgcatgag 32127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 228 - 87
Alignment:
Q  11 tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgata 109  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||     
T  228 tatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaa-atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 130  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  129 tttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatga 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11493
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 11493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38348
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 38348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 3146 - 3242
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3146 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 3242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19772 - 19977
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||| |    
T  19772 actaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaatta-tatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgagt 19870  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||    
T  19871 tatttatgatgct-gagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagc 19969  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  19970 tgcatgag 19977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40038 - 39942
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  40038 atatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgag 39942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 7946 - 8151
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |||| || ||||  || |||||| | ||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||  |||||    
T  7946 actaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgta-tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaat 8044  T
Q  100 tatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 195  Q
    ||| | ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||    
T  8045 tatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaag 8144  T
Q  196 ctgcatg 202  Q
    |||||||    
T  8145 ctgcatg 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18119
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 18068  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | | |||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  18069 gttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgag 18119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25268 - 25135
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtct 169  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |||||| ||    
T  25268 atatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttatatactgcct 25170  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  25169 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 25135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 727 - 619
Alignment:
Q  44 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgt 142  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  727 taatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgt 629  T
Q  143 tatatcatga 152  Q
    ||||||||||    
T  628 tatatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13157
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 16098 - 16192
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  16098 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 16192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39602 - 39506
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39602 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgag 39506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 75210 - 75306
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  75210 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgag 75306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3278
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 3278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 27747 - 27841
Alignment:
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  27747 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 27841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34288 - 34152
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||| | |||||| ||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  34288 taatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatac 34192  T
Q  165 tgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34191 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgag 34152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9193 - 9133
Alignment:
Q  118 gttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9193 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4878
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgag 4878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44799
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 44799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26157
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 26157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1977 - 1880
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1977 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 1880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 32952 - 33048
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32952 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgag 33048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46053 - 45957
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  46053 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgag 45957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16142
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||| | ||||| || || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 16142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26021 - 25925
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  26021 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgag 25925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39983 - 39887
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgag 39887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1836
Alignment:
Q  11 tatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgata 109  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||| | | ||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| || |||||| | ||||     
T  1696 tatcttactattgttgttccagtaagcctgaatta-tatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg 1794  T
Q  110 tttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga 152  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1795 tt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13337 - 13240
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13337 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 13240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17309
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg---atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 17309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 20383 - 20514
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtcta 170  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  |     
T  20383 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tg 20481  T
Q  171 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20482 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33067 - 32971
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  33067 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgag 32971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38886 - 38791
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 203  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  38886 atatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatga 38791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 783 - 579
Alignment:
Q  1 actaagttgtt-atcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || |   ||||   |||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  783 actaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattacatgaat 685  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  684 tatatatgatgttgg-gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 587  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  586 tgcatgag 579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 175
Target Start/End: Original strand, 2398 - 2505
Alignment:
Q  66 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2398 taatgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2494  T
Q  165 tgtctatgttg 175  Q
     ||||| ||||    
T  2495 ggtctaagttg 2505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 24297 - 24395
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24297 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 267894 - 267689
Alignment:
Q  1 actaagttg-ttatcttgctgttgttatttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaat 99  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||| | ||| ||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  267894 actaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatga-tatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 267796  T
Q  100 tatgt-tgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||| | |||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||  ||||||| |||| |||  |||||||||     
T  267795 tatatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagt 267697  T
Q  197 tgcatgag 204  Q
    ||||||||    
T  267696 tgcatgag 267689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20905 - 20773
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  20905 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20807  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20806 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 20773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37979 - 37847
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  37979 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 37881  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37880 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 37847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1318
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7295
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51611
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 51611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 158454 - 158586
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  158454 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 158552  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  158553 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 158586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340039
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgag 340039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1981
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| ||| |||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2078 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgag 1981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10799
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 10799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 15466 - 15555
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15466 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttg-ttatttaactaagctgcatgag 15555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  56 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgat 153  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgct 225487  T
Q  154 gatttgcatactgtctatgttg 175  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  225486 gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13547 - 13418
Alignment:
Q  76 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatg 172  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||    
T  13547 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 13449  T
Q  173 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13448 ttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 13418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4852 - 4720
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  4852 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ct 4754  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4753 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 4720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10515
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  10427 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgag 10515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14105 - 13973
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14105 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14007  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14006 gtgttgctgttg-ttatttatctaagctgcatgag 13973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 1043 - 1140
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1043 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 1140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13526
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||| | | | |||||| | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 13526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9268
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3499
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  3596 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgag 3499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 372
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||| || || | |||||| |||  ||||| |  |||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  468 atatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgag 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 32096
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 32096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52039 - 51942
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52039 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 51942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 167973 - 168070
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  167973 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 168070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16311
Alignment:
Q  116 atgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgag 16311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 204
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28862
Alignment:
Q  149 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgt-tggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgag 28862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8621
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  |||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  8528 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgct----gttatttaactaagctgcatgag 8621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20946
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagct 197  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagct 20946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5220
Alignment:
Q  114 agatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgag 5220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30090 - 29958
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  30090 atataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29992  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29991 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 29958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40558 - 40430
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaatt--atgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  40558 atataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-t 40460  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgca 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40459 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgca 40430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11446 - 11314
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 169  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  11446 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 11348  T
Q  170 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11347 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgag 11314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 121
Target Start/End: Original strand, 2261 - 2303
Alignment:
Q  79 ttgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttg 121  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2261 ttgtatatacattaaatggattatgttgatattcgagatgttg 2303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4633 - 4544
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  4633 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc 4544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12215 - 12126
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  12215 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc 12126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22167 - 22078
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  22167 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc 22078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16692
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| |||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 16692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4650 - 4553
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||| || || | |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4650 atatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagttgcatgag 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6216
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttg--gttatttaactaagctgcatga 203  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6116 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 6215  T
Q  204 g 204  Q
    |    
T  6216 g 6216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2704
Alignment:
Q  126 attgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||    
T  2784 attgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgag 2704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4741
Alignment:
Q  156 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgag 4741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27912
Alignment:
Q  107 atatttgagatgttgttgaattgcattcgatattgttatatcatg 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||    
T  27956 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 161093 - 161226
Alignment:
Q  73 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgaattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtc 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | |||||| |    
T  161093 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactg-c 161191  T
Q  169 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 204  Q
    | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  161192 tgtgtcgctgttgat-atttaactaagctgcatgag 161226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University